Микроорганизмы для получения орнитина и способ получения орнитина с использованием указанных микроорганизмов - RU2721852C1

Чертежи

Описание

ОБЛАСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Настоящее изобретение относится к рекомбинантному микроорганизму, продуцирующему путресцин или орнитин, и к способу получения путресцина или орнитина с использованием указанного микроорганизма.

ПРЕДШЕСТВУЮЩИЙ УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ

Биогенные амины (БА) представляют собой соединения азота, получаемые, главным образом, посредством декарбоксилирования аминокислот или аминирования и трансаминирования альдегидов и кетонов. Эти биогенные амины имеют малую молекулярную массу и синтезируются во время метаболических процессов у микроорганизмов, растений и животных, поэтому они известны как составные элементы, часто обнаруживаемые в их клетках.

Среди них, путресцин обнаруживают у грамотрицательных бактерий или грибов, и он присутствует в высокой концентрации у различных видов, и поэтому полагают, что путресцин играет важную роль в метаболизме микроорганизмов. В целом, путресцин является важным сырьем для синтеза полиамина нейлона-4,6, и его получают преимущественно химическим синтезом. Химический синтез представляет собой 3-хстадийный процесс, включающий реакцию каталитического окисления, реакцию с использованием цианидного соединения и реакцию гидрогенизации с использованием высокого давления водорода. Соответственно, существует потребность в разработке более экологически безопасного и энергоэффективного способа, включающего использование биомассы.

С учетом этих обстоятельств были описаны различные способы получения путресцина в высокой концентрации трансформацией E. coli и микроорганизма рода Corynebacterium (публикация международной заявки на патент № WO 06/005603; публикация международной заявки на патент № WO 09/125924; Qian ZD et al., Biotechnol. Bioeng. 104 (4): 651 - 662, 2009; Schneider et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 88 (4): 859 - 868, 2010; Schneider et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 95: 169 - 178, 2012).

С другой стороны орнитин представляет собой вещество, часто обнаруживаемое у растений, животных и микроорганизмов, и является предшественником для биосинтеза аргинина, пролина и полиамина. Кроме того, орнитин играет важную роль в метаболическом пути образования мочевины из аминокислот или аммиака и ее выведения посредством орнитинового цикла в процессе метаболизма у высших организмов in vivo. Орнитин эффективен при наращивании мышечной массы и уменьшении жировой массы тела, и поэтому его используют в качестве пищевой добавки, а также в качестве фармацевтического лекарственного средства для лечения цирроза печени и печеночной недостаточности. Способы получения орнитина включают способ с использованием казеина молока и пищеварительного фермента и способ с использованием E. coli или микроорганизма рода Corynebacterium (патент Кореи № 10-1372635; T. Gotoh et al., Bioprocess Biosyst. Eng., 33: 773 - 777, 2010).

Биосинтетические пути образования путресцина и орнитина у E. coli и микроорганизма рода Corynebacterium сходны, но также имеют следующие различия. Во-первых, микроорганизм рода Corynebacterium имеет «циклический путь» с превращением глутаминовой кислоты в N-ацетил-L-глутаминовую кислоту и превращением N-ацетил-L-орнитина в L-орнитин посредством argJ (бифункциональной орнитинацетилтрансферазы/N-ацетилглутаматсинтазы, EC 2.3.1.35). В отличие от этого, у E. coli биосинтез путресцина или орнитина проходит по «линейному пути», где функцию argJ микроорганизма рода Corynebacterium выполняют argA (N-ацетилглутаматсинтаза, EC 2.3.1.1) и argE (ацетилорнитиндезацетилаза, EC 3.5.1.16).

Известно, что в ArgJ микроорганизма рода Corynebacterium происходит повторный обмен ацетильной группой между орнитином и глутаминовой кислотой. Однако у E. coli ArgA присоединяет ацетильную группу ацетил-КоА к глутамату с образованием N-ацетилглутамата и ArgE обеспечивает распад N-ацетилорнитина с образованием орнитина и ацетата (Schneider et al., Appl. Microbiol. Biotechnol. 91, 17 - 30., 2011).

В частности, известно, что оперон pta-ackA (pta, фосфотрансацетилаза; ackA, ацетаткиназа) и ацетилкоэнзим-А-синтетаза (acs) являются генами, обеспечивающими синтез ацетил-КоА с использованием ацетата.

ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Техническая проблема

Авторы настоящего изобретения приложили значительные усилия для улучшения способности микроорганизма рода Corynebacterium продуцировать орнитин и путресцин и, в результате, обнаружили, что введение argA и argE, имеющих происхождение от E. coli, в микроорганизм рода Corynebacterium может улучшить его способность продуцировать орнитин и путресцин, завершив посредством этого настоящее изобретение.

Техническое решение

Задачей настоящего изобретения является обеспечение рекомбинантного микроорганизма, продуцирующего путресцин или орнитин с высоким выходом.

Другой задачей настоящего изобретения является обеспечение способа получения путресцина или орнитина с использованием указанного выше микроорганизма.

Полезные эффекты изобретения

Была подтверждена возможность увеличения количества путресцина или орнитина, продуцируемого микроорганизмом рода Corynebacterium по настоящему изобретению, продуцирующим путресцин или орнитин, при введении в микроорганизм argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, а также при усилении пути утилизации ацетата. Соответственно, микроорганизм по настоящему изобретению может быть широко использован для получения путресцина или орнитина, а также может быть широко использован в качестве эффективного и желательного, с экономической и экологической точек зрения, средства получения сырья для получения различных полимерных продуктов, где путресцин или орнитин используют в качестве сырья.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ

На ФИГ. 1 представлена схематическая диаграмма, на которой показан биосинтетический путь (циклический путь) образования путресцина и орнитина у микроорганизма рода Corynebacterium (A) и биосинтетический путь (линейный путь) образования путресцина и орнитина у E. coli (B).

На ФИГ. 2 представлена схематическая диаграмма, на которой показан биосинтетический путь с улучшением способности к продукции путрецина и орнитина посредством введения argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в микроорганизм рода Corynebacterium, находящийся в состоянии экспрессии argJ.

НАИЛУЧШИЙ ВАРИАНТ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Согласно одному аспекту настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, в который введена активность N-ацетилглутаматсинтазы из E. coli и ацетилорнитиндезацетилазы из E. coli.

Согласно типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где N-ацетилглутаматсинтаза, имеющая происхождение от E. coli, состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:1.

Согласно другому типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где ацетилорнитиндезацетилаза, имеющая происхождение от E. coli, состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:3.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, выбранный из группы, состоящей из Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium thermoaminogenes, Brevibacterium flavum и Brevibacterium lactofermentum.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность фосфотрансацетилазного и ацетаткиназного оперона (оперона pta-ackA) дополнительно усилена по сравнению с его эндогенной активностью.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где фосфотрансацетилазный и ацетаткиназный оперон состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:5 или 7.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, в который дополнительно введена активность ацетил-КоА-синтетазы (acs), имеющей происхождение от E. coli.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где ацетил-КоА-синтетаза (acs), имеющая происхождение от E. coli, состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:9.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, в который дополнительно введена активность орнитиндекарбоксилазы (ODC).

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность (1) орнитинкарбамоилтрансферазы (ArgF), (2) экспортера глутамата или (3) орнитинкарбамоилтрансферазы и экспортера глутамата дополнительно ослаблена по сравнению с их эндогенной активностью.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность по меньшей мере одного, выбранного из группы, состоящей из ацетил-гамма-глутамилфосфатредуктазы (ArgC), ацетилглутаматсинтазы или орнитинацетилтрансферазы (ArgJ), ацетилглутаматкиназы (ArgB) и ацетилорнитинаминотрансферазы (ArgD), дополнительно усилена по сравнению с их эндогенной активностью.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность ацетилтрансферазы дополнительно ослаблена по сравнению с ее эндогенной активностью.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где ацетилтрансфераза состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:30 или 31.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность экспортера путресцина дополнительно усилена по сравнению с его эндогенной активностью.

Согласно еще одному типичному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где экспортер путресцина состоит из аминокислотной последовательности SEQ ID NO:26 или 28.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложен способ получения путресцина или орнитина, включающий:

(1) культивирование модифицированного микроорганизма рода Corynebacterium, продуцирующего путресцин или орнитин, в среде; и

(2) выделение путресцина или орнитина из культивированного микроорганизма или среды.

В типичном воплощении настоящего изобретения модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium представляет собой Corynebacterium glutamicum.

Далее настоящее изобретение будет описано подробно.

Согласно одному воплощению настоящего изобретения предложен модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, в который введены активности N-ацетилглутаматсинтазы, имеющей происхождение от E. coli, и ацетилорнитиндезацетилазы, имеющей происхождение от E. coli.

При использовании здесь термин «N-ацетилглутаматсинтаза» относится к ферменту, опосредующему реакцию образования N-ацетилглутамата из глутамата и ацетил-КоА, и образованный таким образом N-ацетилглутамат может быть использован как предшественник орнитина и аргинина.

В настоящем изобретении N-ацетилглутаматсинтаза может включать, например, без ограничения, белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1, и любой белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанной выше аминокислотной последовательности, при условии, что белок обладает существенной N-ацетилглутаматсинтазной активностью.

Кроме того, аминокислотные последовательности белков, демонстрирующих указанную выше активность, могут различаться у разных видов и штаммов микроорганизмов. Соответственно, N-ацетилглутаматсинтаза по настоящему изобретению может представлять собой, например, без ограничения, N-ацетилглутаматсинтазу из E. coli.

Очевидно, что в качестве последовательностей, гомологичных указанной выше последовательности, в объем настоящего изобретения также следует включать аминокислотные последовательности с делецией, модификацией, заменой или добавлением части последовательности, если биологическая активность этих аминокислотных последовательностей идентична или соответствует биологической активности белка по SEQ ID NO:1.

Полинуклеотид, кодирующий N-ацетилглутаматсинтазу по настоящему изобретению, может включать, без ограничения, полинуклеотид, кодирующий белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1, и любой белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанной выше аминокислотной последовательности, при условии, что полинуклеотид обладает активностью, сходной с активностью N-ацетилглутаматсинтазы, и, например, может быть включена полинуклеотидная последовательность SEQ ID NO:2.

При использовании здесь термин «ацетилорнитиндезацетилаза» относится к ферменту, опосредующему реакцию, вовлеченную в образование уксусной кислоты и орнитина, путем опосредования гидролиза ацетилорнитина.

В настоящем изобретении ацетилорнитиндезацетилаза может включать, без ограничения, белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3, и любой белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанной выше аминокислотной последовательности, при условии, что белок обладает существенной активностью по разделению ацетилорнитина на ацетильную группу и орнитин.

Кроме того, аминокислотные последовательности белков, демонстрирующих указанную выше активность, могут различаться у разных видов и штаммов микроорганизмов. Соответственно, ацетилорнитиндезацетилаза по настоящему изобретению может представлять собой, без ограничения, ацетилорнитиндезацетилазу из E. coli. Очевидно, что в качестве гомологичных последовательностей в объем настоящего изобретения также следует включать аминокислотные последовательности с делецией, модификацией, заменой или добавлением части последовательности, если биологическая активность этих аминокислотных последовательностей идентична или соответствует биологической активности белка по SEQ ID NO:3.

Полинуклеотид, кодирующий ацетилорнитиндезацетилазу по настоящему изобретению, может включать, при условии, что полинуклеотид обладает активностью, сходной с активностью белка ацетилорнитиндезацетилазы, белок, имеющий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:3, или полинуклеотид, кодирующий белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанной выше аминокислотной последовательности, например, полинуклеотидную последовательность SEQ ID NO:4.

Кроме того, полинуклеотид, кодирующий N-ацетилглутаматсинтазу или ацетилорнитиндезацетилазу по настоящему изобретению, можно гибридизовать с полинуклеотидной последовательностью SEQ ID NO:2 или SEQ ID NO:4 или зондом, имеющим происхождение от указанной полинуклеотидной последовательности, в жестких условиях, и он может представлять собой модифицированный тип N-ацетилглутаматсинтазы или ацетилорнитиндезацетилазы, обладающий нормальной функцией. Использованный выше термин «жесткие условия» относится к условиям, обеспечивающим специфичность гибридизации полинуклеотидов. Например, конкретные жесткие условия описаны в литературе (например, J. Sambrook et al., supra).

Использованный выше термин «гомология» относится к степени идентичности данной аминокислотной последовательности или полинуклеотидной последовательности и может быть указан в процентах. При использовании здесь гомологичная последовательность, обладающая такой же активностью, что данная полипептидная последовательность или полинуклеотидная последовательность, или сходной активностью, может быть обозначена посредством термина «% гомологии». Например, % гомологии может быть подтвержден с применением стандартного программного обеспечения, то есть BLAST 2.0, для расчета таких параметров, как показатель, идентичность и сходство, или сравнением последовательностей посредством гибридизационных экспериментов по Саузерну, и подходящие условия гибридизации могут быть определены способом, известным специалисту в данной области (например, J. Sambrook et al., Molecular Cloning, A Laboratory Manual, 2nd Edition, Cold Spring Harbor Laboratory press, Cold Spring Harbor, New York, 1989; F.M. Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York).

С другой стороны, микроорганизм по настоящему изобретению может включать как микроорганизмы естественного типа, так и микроорганизмы модифицированного типа, например, микроорганизмы, принадлежащие к роду Escherichia, роду Shigella, роду Citrobacter, роду Salmonella, роду Enterobacter, роду Yersinia, роду Klebsiella, роду Erwinia, роду Corynebacterium, роду Brevibacterium, роду Lactobacillus, роду Selenomanas, роду Vibrio, роду Pseudomonas, роду Streptomyces, роду Arcanobacterium, роду Alcaligenes и так далее. Конкретно, микроорганизм по настоящему изобретению может представлять собой, без ограничения, микроорганизм, принадлежащий к роду Corynebacterium, конкретнее, микроорганизм, выбранный из группы, состоящей из Corynebacterium glutamicum, Corynebacterium ammoniagenes, Corynebacterium thermoaminogenes, Brevibacterium flavum и Brevibacterium lactofermentum, и, конкретнее, Corynebacterium glutamicum.

Конкретно, при использовании здесь термин микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, относится к микроорганизму рода Corynebacterium, продуцирующему путресцин или орнитин в естественном состоянии, или микроорганизму рода Corynebacterium, продуцирующему путресцин или орнитин, полученному приданием способности продуцировать путресцин или орнитин его исходному штамму, неспособному продуцировать путресцин или орнитин.

Микроорганизм, которому придана способность продуцировать путресцин или орнитин, или способный продуцировать путресцин или орнитин, может обладать улучшенной способностью продуцировать орнитин, используемый в качестве исходного вещества для биосинтеза путресцина, благодаря, без ограничения, модификации активности ацетилглутаматсинтазы (превращающей глутамат в N-ацетилглутамат), орнитинацетилтрансферазы (ArgJ, превращающей ацетилорнитин в орнитин), ацетилглутаматкиназы (ArgB, превращающей ацетилглутамат в N-ацетилглутамилфосфат), гамма-глутамилфосфатредуктазы (ArgC, превращающей N-ацетилглутамилфосфат в N-ацетилглутаматполуальдегид) и ацетилорнитинаминотрансферазы (ArgD, превращающей ацетилглутаматполуальдегид в N-ацетилорнитин) в сторону повышения, по сравнению с их эндогенной активностью, для усиления биосинтетического пути от глутамата до орнитина.

Кроме того, микроорганизм может быть модифицирован для ослабления активности орнитинкарбамоилтрансферазы (ArgF, вовлеченной в синтез аргинина из орнитина), белка (белков), вовлеченного в экспорт глутамата, и/или белка (белков), ацетилирующего путресцин, по сравнению с их эндогенной активностью, и/или введения активности орнитиндекарбоксилазы (ODC).

При использовании здесь термин «введение активности» может относиться к активности белка, отсутствующей или слабой у микроорганизма, вводимой впервые или усиленной у соответствующего микроорганизма. Конкретно, он может включать, без ограничения, введение или доставку гена, кодирующего белок, отсутствующий у микроорганизма, в микроорганизм для экспрессии в нем или введение модификации белка для усиления экспрессии белка, не экспрессируемого или почти не экспрессируемого у микроорганизма.

С другой стороны, в настоящем изобретении модификации, такие как введение активности, усиление активности, ослабление активности и так далее, могут быть проведены способом, называемым трансформацией. При использовании здесь термин «трансформация» относится к процессу введения вектора, содержащего полинуклеотид, кодирующий определенный белок, или промоторную последовательность с сильной или слабой активностью и так далее в клетку-хозяина, что обеспечивает экспрессию белка, кодируемого полинуклеотидом, или приводит к модификации хромосомы клетки-хозяина. Кроме того, полинуклеотид включает ДНК и РНК, кодирующие целевой белок. Полинуклеотид может быть введен в любой форме, при условии, что он может быть введен в клетку-хозяина и обеспечить экспрессию или привести к модификации в ней. Например, полинуклеотид может быть введен в клетку-хозяина в форме экспрессионной кассеты, представляющей собой генную конструкцию, содержащую все обязательные элементы, необходимые для самостоятельной экспрессии. Экспрессионная кассета может обычно содержать промотор, функционально связанный с полинуклеотидом, сигнал терминации транскрипции, домен связывания рибосом и сигнал терминации трансляции и может иметь форму вектора экспрессии, способного к самостоятельной репликации. Кроме того, полинуклеотид может, без ограничения, быть введен в клетку-хозяина сам по себе и функционально связан с последовательностью, необходимой для его экспрессии в клетке-хозяине.

Кроме того, при использовании здесь термин «функционально связанный» относится к функциональной связи промоторной последовательности, инициирующей и опосредующей транскрипцию полинуклеотида, кодирующего определенный белок по настоящему изобретению, с последовательностью гена.

При использовании здесь термин «вектор» относится к ДНК-конструкции, содержащей нуклеотидную последовательность полинуклеотида, кодирующего интересующий белок, где интересующий белок функционально связан с подходящей регуляторной последовательностью, таким образом, что интересующий белок может быть экспрессирован у подходящего хозяина.Регуляторная последовательность включает промотор, способный инициировать транскрипцию, любую операторную последовательность для регуляции транскрипции, последовательность, кодирующую подходящий домен связывания рибосом на мРНК, и последовательность для регуляции транскрипции и трансляции. После трансформации в подходящую клетку-хозяина вектор может быть реплицирован или функционировать независимо от генома хозяина, или может быть интегрирован в сам геном хозяина.

Относительно вектора, используемого в настоящем изобретении, может не быть существенных ограничений, при условии, что вектор реплицирован в клетке-хозяине, и может быть использован любой вектор, известный в данной области. Примеры вектора могут включать естественные или рекомбинантные плазмиды, космиды, вирусы и бактериофаги. Например, в качестве фагового вектора или космидного вектора могут быть использованы pWE15, M13, MBL3, MBL4, IXII, ASHII, APII, t10, t11, Charon4A, Charon21A и так далее; и в качестве плазмидного вектора могут быть использованы векторы на основе pBR, pUC, pBluescriptII, pGEM, pTZ, pCL, pET и так далее. Относительно вектора для использования в настоящем изобретении, может не быть существенных ограничений, и может быть использован любой вектор, известный в данной области. Конкретно, могут быть использованы векторы pDZTn, pACYC177, pACYC184, pCL, pECCG117, pUC19, pBR322, pMW118, pCC1BAC и так далее.

Как таковой, полинуклеотид, кодирующий белок-мишень, может быть заменен модифицированным полинуклеотидом с использованием вектора для введения в хромосомы бактерий. Введение полинуклеотида в хромосому может быть проведено, без ограничения, любым способом, известным в данной области, например, гомологичной рекомбинацией. Поскольку вектор по настоящему изобретению может быть введен в хромосому гомологичной рекомбинацией, может быть дополнительно включен селективный маркер для подтверждения введения в хромосому. Селективный маркер используют для отбора трансформированных клеток, то есть для подтверждения введения целевого полинуклеотида, и могут быть использованы маркеры, обеспечивающие селектируемые фенотипы, такие как резистентность к лекарственным средствам, потребность в питательных веществах, резистентность к цитотоксическим агентам и экспрессия поверхностных белков. При обработке селективными агентами только клетки, экспрессирующие селективные маркеры, могут выжить или проявлять другие фенотипические признаки, что позволяет легко отбирать трансформированные клетки.

Микроорганизм рода Corynebacterium по настоящему изобретению может представлять собой модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность фосфотрансацетилазного и ацетаткиназного оперона (оперона pta-ackA) дополнительно усилена по сравнению с его эндогенными ферментами.

В настоящем изобретении фосфотрансацетилазный и ацетаткиназный оперон (оперон pta-ackA) представляет собой опероны, содержащие гены, обратно опосредующие метаболический путь, в котором происходит превращение ацетил-КоА, полученного из глюкозы или пирувата, в уксусную кислоту через ацетилфосфат, и метаболический путь противоположного направления.

В настоящем изобретении фосфотрансацетилазный и ацетаткиназный оперон может включать, без ограничения, белки, содержащие аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5 или SEQ ID NO:7, или любой белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, или, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанным выше аминокислотным последовательностям, при условии, что белок существенным образом опосредует реакцию образования ацетил-КоА из уксусной кислоты.

Кроме того, поскольку аминокислотные последовательности белков, демонстрирующих указанные активности, могут различаться у разных видов или штаммов данного микроорганизма, фосфотрансацетилазный и ацетаткиназный оперон в настоящем изобретении может не быть ограничен теми источниками, от которых он имеет происхождение. Очевидно, что объем настоящего изобретения может также включать любую аминокислотную последовательность, гомологичную указанным выше последовательностям и обладающую биологической активностью, по существу идентичной или соответствующей белку по SEQ ID NO:5 или SEQ ID NO:7, несмотря на то, что аминокислотная последовательность может иметь делецию, модификацию, замену или добавление части последовательности.

Полинуклеотид, кодирующий фосфотрансацетилазный и ацетаткиназный оперон по настоящему изобретению, может включать полинуклеотид, кодирующий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:5 или SEQ ID NO:7, или полинуклеотид, кодирующий белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанным выше аминокислотным последовательностям, и, наиболее конкретно, может включать полинуклеотидную последовательность SEQ ID NO:6 или SEQ ID NO:8.

При использовании здесь термин «усиление активности» включает не только оказание эффекта, превосходящего исходную функцию, благодаря введению новой активности или повышению активности самого белка, но также включает повышение его активности посредством повышения активности эндогенного гена, амплификации эндогенного гена под действием внутреннего или внешнего фактора (факторов), устранения регуляторного фактора (факторов), ингибирующего экспрессию гена, увеличения числа копий гена, введения гена извне, модификации последовательности регуляции экспрессии и, конкретно, повышение ферментативной активности, благодаря замене или модификации промотора и мутации гена, и так далее.

Конкретно, в настоящем изобретении повышение активности может быть осуществлено посредством:

1) увеличения числа копий полинуклеотида, кодирующего фермент;

2) модификации последовательности регуляции экспрессии для повышения экспрессии полинуклеотида;

3) модификации полинуклеотидной последовательности в хромосоме для усиления активности фермента; или

4) модификации комбинацией указанного выше;

но способ повышения активности не ограничен указанными вариантами.

Увеличение числа копий полинуклеотида (способ 1) может быть осуществлено в форме функционального связывания полинуклеотида с вектором или введением полинуклеотида в хромосому клетки-хозяина, однако способ не ограничен указанными вариантами. Конкретно, число копий полинуклеотида в хромосоме клетки-хозяина может быть увеличено введением вектора, способного проходить репликацию и функционировать независимо от клетки-хозяина, с которым функционально связан полинуклеотид, кодирующий белок по настоящему изобретению; или оно может быть увеличено введением в вектора, способного интегрировать полинуклеотид в хромосому клетки-хозяина, с которым функционально связан полинуклеотид, в клетку-хозяина.

Далее, модификация последовательности регуляции экспрессии для повышения экспрессии полинуклеотида (способ 2) может быть осуществлена модификацией последовательности посредством делеции, вставки, неконсервативной или консервативной замены в полинуклеотидной последовательности или их комбинации для дополнительного усиления активности последовательности регуляции экспрессии или заменой полинуклеотидной последовательности на полинуклеотидную последовательность, обладающую более сильной активностью, однако способ не ограничен указанными вариантами. Последовательность регуляции экспрессии включает, без ограничения, промотор, последовательность оператора, последовательность, кодирующую сайт связывания рибосом, и последовательность, регулирующую терминацию транскрипции и трансляции.

Вместо исходного промотора с начальной областью экспрессионной единицы полинуклеотида может быть связан сильный экзогенный промотор. Примерами сильных промоторов могут быть, без ограничения, промотор CJ7, промотор lysCP1, промотор EF-Tu, промотор groEL, промотор aceA или промотор aceB и так далее, и, конкретнее, интенсивность экспрессии может быть улучшена функциональным связыванием с промотором lysCP1 (WO 2009/096689) или промотором CJ7 (патент Кореи № 10-0620092 и WO 2006/065095), имеющими происхождение от Corynebacterium.

Кроме того, модификация полинуклеотидной последовательности в хромосоме (способ 3) может быть осуществлена модификацией последовательности регуляции экспрессии посредством делеции, вставки, неконсервативной или консервативной замены в полинуклеотидной последовательности или их комбинации для дополнительного усиления активности полинуклеотидной последовательности или заменой полинуклеотидной последовательности на улучшенную полинуклеотидную последовательность, обладающую более сильной активностью, однако способ не ограничен указанными вариантами.

Конкретно, в настоящем изобретении активность фосфотрансацетилазного и ацетаткиназного оперона (оперона pta-ackA) может быть усилена по сравнению с его эндогенной активностью любым способом, выбранным из группы, состоящей из способа увеличения числа копий оперона в клетке, способа модификации последовательности регуляции экспрессии оперона, способа замены последовательности регуляции экспрессии гена в опероне на последовательность, обладающую более сильной активностью, способа замены генов, кодирующих ферменты в хромосоме, мутантными генами для повышения активности ферментов, составляющих оперон, и способа модификации гена в хромосоме для повышения активности ферментов, составляющих оперон. Конкретно, способ замены последовательности регуляции экспрессии гена в опероне на последовательность, обладающую более сильной активностью, может быть осуществлен, без ограничения, заменой эндогенного промотора ацетилазного и ацетаткиназного оперона на промотор CJ7, промотор lysCP1, промотор EF-Tu, промотор groEL, промотор aceA или промотор aceB и так далее.

При использовании здесь термин «эндогенная активность» относится к активному состоянию фермента в немодифицированном состоянии, исходно присутствующего у микроорганизма, и термин «усиление по сравнению с эндогенной активностью» относится к состоянию повышенной активности фермента, присутствующего у микроорганизма после манипуляции, такой как введение гена, демонстрирующего активность, или увеличение числа копий соответствующего гена, делеция регуляторного фактора, ингибирующего экспрессию гена, или модификация последовательности регуляции экспрессии, например, использование промотора, улучшенного по сравнению с активностью у микроорганизма до манипуляции.

В настоящем изобретении в микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, может быть дополнительно введена активность ацетил-КоА-синтетазы (acs), имеющей происхождение от E. coli.

В настоящем изобретении ацетил-КоА-синтетаза (acs) представляет собой фермент, опосредующий реакцию образования ацетил-КоА из АТФ, уксусной кислоты и КоА.

В настоящем изобретении ацетил-КоА-синтетаза может включать, без ограничения, белки, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9, или любой белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанной выше аминокислотной последовательности, при условии, что белок обладает существенной активностью по опосредованию синтеза ацетил-КоА.

Кроме того, поскольку аминокислотные последовательности белков, демонстрирующих указанную активность, могут различаться у разных видов или штаммов данного микроорганизма, ацетил-КоА-синтетаза (acs) в настоящем изобретении может не быть ограничена источником, от которого она имеет происхождение, и, например, она может иметь происхождение от E. coli. Очевидно, что объем настоящего изобретения может также включать любую аминокислотную последовательность, гомологичную указанной выше последовательности и обладающую биологической активностью, по существу идентичной или соответствующей белку по SEQ ID NO:9, несмотря на то, что аминокислотная последовательность может иметь делецию, модификацию, замену или добавление части последовательности.

Полинуклеотид, кодирующий ацетил-КоА-синтетазу (acs) по настоящему изобретению, может включать полинуклеотид, кодирующий белок, содержащий аминокислотную последовательность SEQ ID NO:9, или любой белок, на 70% или более, конкретно, на 80% или более, конкретнее, на 90% или более, еще конкретнее, на 95% или более, еще конкретнее, на 98% или более, и, наиболее конкретно, на 99% или более гомологичный указанной выше аминокислотной последовательности, и, наиболее конкретно, он может включать полинуклеотидную последовательность SEQ ID NO:10.

Микроорганизм рода Corynebacterium по настоящему изобретению может представлять собой модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, в который дополнительно введена активность орнитиндекарбоксилазы (ODC), имеющей происхождение от E. coli.

При использовании здесь термин «орнитиндекарбоксилаза» относится к ферменту, обеспечивающему образование путресцина, опосредуя декарбоксилирование орнитина. Несмотря на то, что у микроорганизма рода Corynebacterium нет фермента биосинтеза путресцина, при введении орнитиндекарбоксилазы (ODC) извне происходит экспорт путресцина из клеток по мере его синтеза. Орнитиндекарбоксилаза, которая может быть введена извне, может быть использована в настоящем изобретении при условии наличия у нее указанной выше активности, независимо от источника, от которого микроорганизм имеет происхождение, и, конкретно, может быть введена орнитиндекарбоксилаза из E. coli.

Микроорганизм рода Corynebacterium по настоящему изобретению может представлять собой модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность (1) орнитинкарбамоилтрансферазы (ArgF), (2) экспортера глутамата или (3) орнитинкарбамоилтрансферазы и экспортера глутамата дополнительно ослаблена по сравнению с их эндогенной активностью. Экспортер глутамата рода Corynebacterium может представлять собой NCgl1221.

Микроорганизм рода Corynebacterium по настоящему изобретению может представлять собой модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность по меньшей мере одного, выбранного из группы, состоящей из ацетил-гамма-глутамилфосфатредуктазы (ArgC), ацетилглутаматсинтазы или орнитинацетилтрансферазы (ArgJ), ацетилглутаматкиназы (ArgB) и ацетилорнитинаминотрансферазы (ArgD), дополнительно усилена по сравнению с их эндогенной активностью.

Кроме того, микроорганизм рода Corynebacterium может представлять собой модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность ацетилтрансферазы, конкретно, активность NCgl1469, дополнительно ослаблена по сравнению с ее эндогенной активностью.

В заключение, микроорганизм рода Corynebacterium может представлять собой модифицированный микроорганизм рода Corynebacterium, продуцирующий путресцин или орнитин, где активность экспортера путресцина, конкретно, активность NCgl2522, дополнительно усилена по сравнению с его эндогенной активностью.

При использовании здесь «ослабление активности» включает не только оказание эффекта, уступающего исходной функции, ввиду снижения или устранения активности самого белка, но также включает снижение его активности посредством снижения активности эндогенного гена, активации регуляторного фактора (факторов), ингибирующего экспрессию гена, уменьшения числа копий гена, модификации последовательности регуляции экспрессии и, конкретно, устранение или снижение ферментативной активности, ввиду замены или модификации промотора и мутации гена, и так далее.

Конкретно, в настоящем изобретении ослабление активности может быть осуществлено посредством:

1) частичного или полного удаления полинуклеотида, кодирующего белок;

2) модификации последовательности регуляции экспрессии для снижения экспрессии полинуклеотида;

3) модификации полинуклеотидной последовательности в хромосомах для ослабления активности белка; и

4) способа, выбранного из комбинации указанного выше;

но способ ослабления активности не ограничен указанными вариантами.

Конкретно, способ частичного или полного удаления полинуклеотида, кодирующего белок, может быть осуществлен заменой полинуклеотида, кодирующего эндогенный целевой белок, в хромосоме на полинуклеотид с частичной делецией полинуклеотидной последовательности или маркерный ген с использованием вектора для введения в хромосомы бактерий. При использовании здесь термин «часть» может варьировать в зависимости от типа полинуклеотида и, конкретно, может относиться к 1-300, конкретнее, 1-100, и, еще конкретнее, 1-50.

Кроме того, способ модификации последовательности регуляции экспрессии может быть осуществлен модификацией последовательности регуляции экспрессии посредством делеции, вставки, неконсервативной или консервативной замены в полинуклеотидной последовательности или их комбинации для дополнительного ослабления активности последовательности регуляции экспрессии или заменой полинуклеотидной последовательности на полинуклеотидную последовательность, обладающую более слабой активностью. Последовательность регуляции экспрессии включает промотор, последовательность оператора, последовательность, кодирующую сайт связывания рибосом, и последовательность, регулирующую терминацию транскрипции и трансляции.

Кроме того, способ модификации полинуклеотидной последовательности в хромосоме может быть осуществлен модификацией последовательности посредством делеции, вставки, неконсервативной или консервативной замены в полинуклеотидной последовательности или их комбинации для дополнительного ослабления активности фермента или заменой полинуклеотидной последовательности на улучшенную полинуклеотидную последовательность, обладающую более сильной активностью.

Кроме того, способ удаления регуляторного фактора, ингибирующего экспрессию полинуклеотида фермента, может быть осуществлен заменой полинуклеотида фактора, ингибирующего экспрессию, на полинуклеотид с частичной делецией полинуклеотидной последовательности или маркерный ген. При использовании здесь термин «часть» может варьировать в зависимости от типа полинуклеотида и, конкретно, может относиться к 1-300, конкретнее, 1-100, и, еще конкретнее, 1-50.

В частности, ацетил-гамма-глутамилфосфатредуктаза (ArgC), ацетилглутаматсинтаза или орнитинацетилтрансфераза (ArgJ), ацетилглутаматкиназа (ArgB), ацетилорнитинаминотрансфераза (ArgD), орнитинкарбамоилтрансфераза (ArgF), белки, вовлеченные в экспорт глутамата, и орнитиндекарбоксилаза (ODC) могут, соответственно, без ограничения, содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO:32, 33, 34, 35, 36, 37 или 38 или, конкретно, любую аминокислотную последовательность, на 70% или более, конкретнее, на 80% или более, и, еще конкретнее, на 90% или более гомологичную указанным выше аминокислотным последовательностям. Кроме того, белок, ацетилирующий путресцин, может, без ограничения, содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO:30 или 31 или, конкретно, любую аминокислотную последовательность, на 70% или более, конкретнее, на 80% или более, и, еще конкретнее, на 90% или более гомологичную указанным выше аминокислотным последовательностям.

Кроме того, в настоящем изобретении экспортер путресцина может содержать аминокислотную последовательность SEQ ID NO:26 или 28 или, конкретно, любую аминокислотную последовательность, на 70% или более, конкретнее, на 80% или более, и, еще конкретнее, на 90% или более гомологичную указанным выше аминокислотным последовательностям.

Среди описанных выше белков, усиление активности ацетил-гамма-глутамилфосфатредуктазы (ArgC), ацетилглутаматсинтазы или орнитинацетилтрансферазы (ArgJ), ацетилглутаматкиназы (ArgB), ацетилорнитинаминотрансферазы (ArgD), орнитиндекарбоксилазы (ODC) и экспортера путресцина может быть осуществлено, например, способом, выбранным из увеличения числа копий полинуклеотидов, кодирующих белки, модификации последовательности регуляции экспрессии для повышения экспрессии полинуклеотидов, модификации полинуклеотидных последовательностей в хромосоме для усиления активности указанных выше ферментов, удаления регуляторного фактора (факторов), ингибирующего экспрессию полинуклеотидов указанных выше ферментов, или их комбинаций.

Кроме того, ослабление активности орнитинкарбамоилтрансферазы (ArgF), белков, вовлеченных в экспорт глутамата, и белков, ацетилирующих путресцин, может быть осуществлено способом, выбранным из частичного или полного удаления полинуклеотидов, кодирующих белки, модификации последовательности регуляции экспрессии для снижения экспрессии полинуклеотидов, модификации полинуклеотидных последовательностей в хромосоме для ослабления активности белков и их комбинаций.

Согласно другому аспекту настоящего изобретения предложен способ получения путресцина или орнитина, включающий:

(1) культивирование микроорганизма рода Corynebacterium, продуцирующего путресцин или орнитин, в среде; и

(2) выделение путресцина или орнитина из культивированного микроорганизма или среды.

В указанном выше способе микроорганизм можно культивировать, без ограничения, в периодической культуре, непрерывной культуре, подпитываемой культуре и так далее, как известно в данной области. В частности, применительно к условиям культивирования, надлежащий pH (то есть оптимальный pH от 5 до 9, конкретно, pH 6-8, и, наиболее конкретно, pH 6,8) можно поддерживать с использованием, без ограничения, основного соединения (например, гидроксид натрия, гидроксид калия или аммиак) или кислого соединения (например, фосфорная кислота или серная кислота). Кроме того, можно поддерживать аэробные условия, добавляя в клеточную культуру кислород или кислород-содержащую смесь газов. В культуре можно поддерживать температуру от 20°C до 45°C и, конкретно, от 25°C до 40°C, и микроорганизм можно культивировать в течение приблизительно 10-160 часов. Путресцин или орнитин, продуцируемый посредством описанного выше культивировании, может секретироваться в культуральную среду или оставаться внутри клеток.

Кроме того, в культуральной среде могут быть использованы источники углерода, такие как, без ограничения, сахара и углеводы (например, глюкоза, сахароза, лактоза, фруктоза, мальтоза, меласса, крахмал и целлюлоза), масла и жиры (например, соевое масло, подсолнечное масло, арахисовое масло и кокосовое масло), жирные кислоты (например, пальмитиновая кислота, стеариновая кислота и линолевая кислота), спирты (например, глицерин и этанол) и органические кислоты (например, уксусная кислота), по отдельности или в комбинации; источники азота, такие как, без ограничения, азотсодержащие органические соединения (например, пептон, дрожжевой экстракт, мясной сок, солодовый экстракт, жидкий кукурузный экстракт, соевая мука и мочевина) или неорганические соединения (например, сульфат аммония, хлорид аммония, фосфат аммония, карбонат аммония и нитрат аммония), по отдельности или в комбинации; и источники калия, такие как, без ограничения, дигидрофосфат калия, гидрофосфат калия или соответствующие натрийсодержащие соли, по отдельности или в комбинации. Кроме того, среда может дополнительно содержать, без ограничения, другие необходимые ростостимулирующие вещества, включая соли металлов (например, сульфат магния или сульфат железа), аминокислоты и витамины.

Способ выделения путресцина или орнитина, полученного при культивировании по настоящему изобретению, может быть осуществлен подходящим методом культивирования, известным в данной области, например, таким как периодическая культура, непрерывная культура или подпитываемая культура, и, посредством этого, целевая аминокислота может быть выделена из культуры.

ВАРИАНТ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Далее настоящее изобретение будет описано более подробно со ссылкой на следующие Примеры. Тем не менее, эти Примеры приведены лишь в целях наглядности, и изобретение не следует ограничивать этими Примерами.

Пример 1: Введение argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в штамм, продуцирующий путресцин, и подтверждение способности полученного штамма продуцировать путресцин

1-1. Получение штамма с одновременным введением argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в ген транспозона штамма, продуцирующего путресцин, на основе ATCC13032

Для подтверждения того, что введение гена argA, имеющего происхождение от E. coli, и гена argE, имеющего происхождение от E. coli, в штамм, продуцирующий путресцин, на основе ATCC13032 может улучшить способность продуцировать путресцин, гены argA и argE вводили в ген транспозона указанного штамма.

В качестве вектора для трансформации, позволяющего осуществлять введение генной области транспозона микроорганизма рода Corynebacterium в хромосому, использовали pDZTn (WO 2009/125992) и в качестве промотора использовали промотор lysCP1 (публикация международной заявки на патент № WO 2009/096689, SEQ ID NO:39).

Конкретно, на основе полинуклеотидной последовательности (SEQ ID NO:2) гена argA, имеющего происхождение от E. coli, кодирующего N-ацетилглутаматсинтазу, получали пару праймеров SEQ ID NO:11 и 12 для получения гомологичных рекомбинантных фрагментов открытой рамки считывания (ORF) argA. Кроме того, на основе полинуклеотидной последовательности (SEQ ID NO:4) гена argE, имеющего происхождение от E. coli, кодирующего ацетилорнитиндезацетилазу, получали пару праймеров SEQ ID NO:15 и 16 для получения гомологичных рекомбинантных фрагментов ORF argE, и на основе полинуклеотидной последовательности (SEQ ID NO:39) lysCP1 получали пару праймеров SEQ ID NO:13 и 14 для получения гомологичных рекомбинантных фрагментов области lysCP1 (Таблица 1).

Таблица 1

Сначала для получения гена argA амплифицировали фрагмент гена размером приблизительно 1,6 тысячи пар оснований (т.п.о.) с использованием хромосомы штамма E. coli W3110 в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:11 и 12. В частности, полимеразную цепную реакцию (ПЦР) проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 1 минуты и 30 секунд. Полученные таким образом фрагменты подвергали электрофорезу в 0,8%-м агарозном геле и проводили элюирование и очистку полос желаемого размера.

Кроме того, амплифицировали промоторную область lysCP1, проводя ПЦР с использованием хромосомы штамма KCCM10919P (публикация международной заявки на патент № WO 2009/096689) в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:13 и 14, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 30 секунд.

Вектор pDZTn обрабатывали XhoI, после чего каждый из полученных ПЦР-продуктов подвергали клонированию посредством слияния. Клонирование посредством слияния проводили с использованием набора In-Fusion^® HD Cloning Kit (Clontech), и полученная таким образом плазмида была названа pDZTn-lysCP1-argA.

Затем получали ПЦР-продукты для получения гена argE, амплифицируя фрагмент гена размером приблизительно 1,4 т.п.о. таким же образом, как описано выше, с использованием хромосомы штамма E. coli W3110 в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:15 и 16, и подвергали их клонированию посредством слияния вместе с промоторной областью lysCP1. Полученная таким образом плазмида была названа pDZTn-lysCP1-argE.

Затем плазмиду pDZTn-lysCP1-argA вводили в штамм KCCM11240P (публикация заявки на патент Кореи № 10-2013-0082478) электропорацией с получением трансформантов и трансформантов высевали на твердую среду BHIS (сердечно-мозговой экстракт (37 г/л), сорбит (91 г/л) и агар (2%)), содержащую канамицин (25 мкг/мл) и X-gal (5-бром-4-хлор-3-индолин-D-галактозид), и культивировали с образованием колоний. Из полученных колоний отбирали синие колонии, проводя посредством этого отбор трансформированных штаммов с введенной плазмидой pDZTn-lysCP1-argA.

Отобранные штаммы культивировали с покачиванием (30°C, 8 часов) в среде CM (глюкоза (10 г/л), полипептон (10 г/л), дрожжевой экстракт (5 г/л), мясной экстракт (5 г/л), NaCl (2,5 г/л), мочевина (2 г/л), pH 6,8) и последовательно разводили от 10^-4 до 10^-10, высевали на твердую среду, содержащую X-gal, и культивировали с образованием колоний. Из полученных таким образом колоний отбирали белые колонии, встречавшиеся со сравнительно низкой частотой, проводя окончательный отбор штамма с геном, кодирующим argA, введенным посредством вторичного кроссинговера. Отобранный в итоге штамм подвергали ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:12 и 13, подтвердив введение гена, кодирующего argA, и модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван KCCM11240P Tn:lysCP1-argA.

Для введения в штамм с введенным argA, полученный выше, KCCM11240P Tn:lysCP1-argA трансформировали полученной выше pDZTn-lysCP1-argE таким же образом, как описано выше, и введение argE в транспозон отобранного в итоге штамма было подтверждено проведением ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:13 и 16. Отобранный таким образом модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE.

1-2. Получение штамма с одновременным введением argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в ген транспозона штамма, продуцирующего путресцин, на основе ATCC13869

DAB12-a ΔNCgl1469 (публикация заявки на патент Кореи № 10-2013-0082478), представляющий собой штамм, продуцирующий путресцин, на основе Corynebacterium glutamicum ATCC13869, был назван DAB12-b, и в ген его транспозона вводили argA и argE для подтверждения того, что введение генов argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, может быть связано с улучшением способности полученного штамма продуцировать путресцин.

Сначала pDZTn-lysCP1-argA, полученной ранее, трансформировали Corynebacterium glutamicum DAB12-b таким же образом, как в Примере 1-1, и подтверждали введение argA в транспозон. Отобранный таким образом модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван DAB12-b Tn:lysCP1-argA.

Затем, для введения argE в штамм с уже введенным argA, DAB12-b Tn:lysCP1-argA трансформировали полученной ранее pDZTn-lysCP1-argE таким же образом, как в Примере 1-1, и подтверждали введение argE в транспозон. Отобранный таким образом модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван DAB12-b Tn:lysCP1-argE.

1-3. Оценка способности штамма Corynebacterium, продуцирующего путресцин, с введенным геном argA, имеющим происхождение от E. coli, и геном argE, имеющим происхождение от E. coli, продуцировать путресцин

Проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примерах 1-1 и 1-2, продуцировать путресцин для подтверждения эффекта введения argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в штамм, продуцирующий путресцин, на продукцию путресцина.

Конкретно, модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum двух разных типов (то есть KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE; DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), полученные в Примерах 1-1 и 1-2, и исходные штаммы двух разных типов (то есть KCCM11240P и DAB12-b), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов.

Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄⋅7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного путресцина, и результаты показаны в Таблице 2 ниже.

Таблица 2

Как показано в Таблице 2 выше, оба модифицированных штамма Corynebacterium glutamicum с одновременным введением генов argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, продемонстрировали повышение продукции путресцина на 9,8% или более.

Пример 2: Усиление pta-ackA у штамма, продуцирующего путресцин, с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, и подтверждение способности полученного штамма продуцировать путресцин

2-1. Получение штамма с заменой промотора pta-ackA из штамма Corynebacterium, продуцирующего путресцин, на основе ATCC13032

У штамма, продуцирующего путресцин, с введенными генами argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, полученного в Примере 1, проводили дополнительное усиление активности фосфотрансацетилазы и ацетаткиназы (pta-ackA) и оценивали эффект такого усиления на способность штамма продуцировать путресцин.

С этой целью промотор оперона pta-ackA в хромосоме заменяли на промотор, обладающий более сильной активностью, по сравнению с его эндогенным промотором, конкретно перед инициирующим кодоном оперона pta-ackA вводили промотор lysCP1 (публикация международной заявки на патент № WO 2009/096689).

Сначала получали гомологичный рекомбинантный фрагмент, содержащий промотор lysCP1, где оба конца промотора имеют оригинальную хромосомную последовательность pta-ackA. Конкретно, 5’-концевую область промотора lysCP1 получали, проводя ПЦР с использованием геномной ДНК Corynebacterium glutamicum ATCC13032 с парой праймеров SEQ ID NO:17 и 18. В частности, ПЦР проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 30 секунд.

Кроме того, промоторную область lysCP1 получали, проводя ПЦР в таких же условиях с использованием пары праймеров SEQ ID NO:14 и 19, и 3’-концевую область промотора lysCP1 получали, проводя ПЦР с использованием геномной ДНК Corynebacterium glutamicum ATCC13032 в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:20 и 21. Праймеры, использованные при получении промотора lysCP1, показаны в Таблице 1 выше и в Таблице 3 ниже.

Таблица 3

Каждый из полученных выше ПЦР-продуктов подвергали клонированию посредством слияния с использованием вектора pDZ, обработанного XbaI. Клонирование посредством слияния проводили с использованием набора In-Fusion^® HD Cloning Kit (Clontech), и полученная таким образом плазмида была названа pDZ-lysCP1-1’pta-ackA.

Полученную выше плазмиду pDZ-lysCP1-1’pta-ackA вводили, соответственно, в штаммы KCCM11240P и KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, являющийся модифицированным штаммом Corynebacterium glutamicum, полученным в Примере 1-1, электропорацией с получением трансформантов и трансформантов высевали на твердую среду BHIS (сердечно-мозговой экстракт (37 г/л), сорбит (91 г/л) и агар (2%)), содержащую канамицин (25 мкг/мл) и X-gal (5-бром-4-хлор-3-индолин-D-галактозид), и культивировали с образованием колоний. Из полученных колоний отбирали синие колонии, проводя посредством этого отбор трансформированных штаммов с введенной плазмидой pDZ-lysCP1-1’pta-ackA.

Отобранные штаммы культивировали с покачиванием (30°C, 8 часов) в среде CM (глюкоза (10 г/л), полипептон (10 г/л), дрожжевой экстракт (5 г/л), мясной экстракт (5 г/л), NaCl (2,5 г/л), мочевина (2 г/л), pH 6,8) и последовательно разводили от 10^-4 до 10^-10, высевали на твердую среду, содержащую X-gal, и культивировали с образованием колоний. Из полученных таким образом колоний отбирали белые колонии, встречавшиеся со сравнительно низкой частотой, проводя окончательный отбор штамма, в котором промотор pta-ackA был заменен на промотор lysCP1 посредством вторичного кроссинговера.

Отобранный в итоге штамм подвергали ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:19 и 21, подтвердив введение промотора lysCP1 в хромосому перед инициирующим кодоном pta-ackA. В частности, ПЦР проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 1 минуты.

Отобранные таким образом модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum были названы KCCM11240P lysCP1-1’pta-ackA и KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-1’pta-ackA, соответственно.

2-2. Получение штамма с заменой промотора pta-ackA из штамма Corynebacterium, продуцирующего путресцин, на основе ATCC13869

Для подтверждения последовательности гена, кодирующего pta-ackA, имеющего происхождение от Corynebacterium glutamicum ATCC13869, и экспрессированного с него белка, полученного методом, раскрытым в Примере 2-1, проводили ПЦР с использованием геномной ДНК Corynebacterium glutamicum ATCC13869 в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:17 и 22 (Таблицы 3 и 4). В частности, ПЦР проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 3 минут.

Полученные таким образом ПЦР-продукты разделяли электрофорезом и анализировали их последовательности. В результате, было подтверждено, что ген, кодирующий pta-ackA, имеющий происхождение от Corynebacterium glutamicum ATCC13869, содержит полинуклеотидную последовательность, описываемую SEQ ID NO:8, и что белок, кодируемый этим геном, содержит аминокислотную последовательность, описываемую SEQ ID NO:7.

С другой стороны, в результате сравнения аминокислотной последовательности pta-ackA, имеющей происхождение от Corynebacterium glutamicum ATCC13032 (SEQ ID NO:5), и аминокислотной последовательности pta-ackA, имеющей происхождение от Corynebacterium glutamicum ATCC13869, было подтверждено, что эти последовательности гомологичны на 99,4%.

Таблица 4

Сначала получали гомологичный рекомбинантный фрагмент, содержащий промотор lysCP1, где оба конца промотора имеют оригинальную хромосомную последовательность pta-ackA. Конкретно, 5’-концевую область промотора lysCP1 получали, проводя ПЦР с использованием геномной ДНК Corynebacterium glutamicum ATCC13869 с парой праймеров SEQ ID NO:17 и 23. В частности, ПЦР проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 30 секунд. Кроме того, промоторную область lysCP1 получали, проводя ПЦР в таких же условиях с использованием пары праймеров SEQ ID NO:14 и 19, и 3’-концевую область промотора lysCP1 получали, проводя ПЦР с использованием геномной ДНК Corynebacterium glutamicum ATCC13869 в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:20 и 21. Праймеры, использованные при замене промотора, показаны в Таблицах 1, 3 и 4.

Каждый из полученных ПЦР-продуктов подвергали клонированию посредством слияния с использованием вектора pDZTn, обработанного XhoI. Клонирование посредством слияния проводили с использованием набора In-Fusion^® HD Cloning Kit (Clontech), и полученная таким образом плазмида была названа pDZ-lysCP1-2’pta-ackA.

Плазмидой pDZ-lysCP1-2’pta-ackA, полученной выше, трансформировали, соответственно, DAB12-b и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, являющийся модифицированным штаммом Corynebacterium glutamicum, полученным в Примере 1-2, таким же образом, как в Примере 2-1. В результате, было подтверждено, что промотор lysCP1 был введен в хромосому перед инициирующим кодоном pta-ackA. Модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum были названы DAB12-b lysCP1-2’pta-ackA и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-2’pta-ackA, соответственно.

2-3. Оценка способности штамма с усилением pta-ackA продуцировать путресцин

Для подтверждения эффекта усиления pta-ackA у штамма, продуцирующего путресцин, с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примерах 2-1 и 2-2, продуцировать путресцин.

Конкретно, модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum четырех типов (KCCM11240P lysCP1-1’pta-ackA; KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-1’pta-ackA; DAB12-b lysCP1-2’pta-ackA; и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-2’pta-ackA) и исходные штаммы четырех типов (KCCM11240P; KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE; DAB12-b; и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов. Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄⋅7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного путресцина, и результаты показаны в Таблице 5 ниже.

Таблица 5

Как показано в Таблице 5, при усилении pta-ackA у KCCM11240P и DAB12-b, соответственно, количество продуцируемого путресцина оставалось на том же уровне. Тем не менее, при усилении pta-ackA у модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum двух разных типов с одновременным введением генов argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli (KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE; DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), соответственно, количество продуцируемого путресцина увеличивалось на 14,3% или более по сравнению с исходным штаммом. Кроме того, количество продуцируемого путресцина увеличивалось на 4% или более по сравнению с модифицированными штаммами.

Как таковой, полученный микроорганизм рода Corynebacterium (Corynebacterium glutamicum KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE :lysCP1-1’pta-ackA), обладающий улучшенной способностью продуцировать путресцин, полученный из штамма Corynebacterium glutamicum KCCM11240P, продуцирующего путресцин, введением активности argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli и усилением активности pta-ackA у штамма Corynebacterium glutamicum KCCM11240P, был назван авторами настоящего изобретения CC01-1145 и депонирован в Корейском центре культур микроорганизмов (Korean Culture Center of Microorganisms, KCCM) 21 ноября 2014 г. под регистрационным номером KCCM11606P в соответствии с Будапештским соглашением.

Пример 3: Введение acs, имеющего происхождение от E. coli, в штамм, продуцирующий путресцин, с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, и подтверждение способности полученного штамма продуцировать путресцин

3-1. Получение штамма с введением acs, имеющего происхождение от E. coli, в ген транспозона штамма, продуцирующего путресцин, на основе ATCC13032

acs вводили в ген транспозона с использованием промотора lysCP1 для подтверждения того, что введение гена ацетил-КоА-синтетазы (acs), имеющего происхождение от E. coli, в штамм, продуцирующий путресцин, на основе ATCC13032 с уже введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, может улучшить способность продуцировать путресцин.

Конкретно, на основе полинуклеотидной последовательности гена, кодирующего acs, описываемой SEQ ID NO:10, получали пару праймеров SEQ ID NO:24 и 25 для получения гомологичного рекомбинантного фрагмента вокруг ORF-области acs и пару праймеров SEQ ID NO:13 и 14 для получения гомологичного рекомбинантного фрагмента вокруг промоторной области lysCP1, как показано в Таблице 1 выше и в Таблице 6 ниже.

Таблица 6

Конкретно, для получения гена acs амплифицировали фрагмент гена размером приблизительно 2 т.п.о. с использованием хромосомы штамма E. coli W3110 в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:24 и 25. В частности, ПЦР проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 1 минуты и 30 секунд. Затем полученные таким образом ПЦР-продукты подвергали электрофорезу в 0,8%-м агарозном геле и проводили элюирование и очистку полос желаемого размера.

Кроме того, получали промоторную область lysCP1, проводя ПЦР с использованием хромосомы штамма KCCM10919P (публикация международной заявки на патент № WO 2009/096689) в качестве матрицы с парой праймеров SEQ ID NO:13 и 14, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 30 секунд.

Вектор pDZ обрабатывали XhoI и каждый из полученных таким образом ПЦР-продуктов подвергали клонированию посредством слияния. Клонирование посредством слияния проводили с использованием набора In-Fusion^® HD Cloning Kit (Clontech). Полученная таким образом плазмида была названа pDZTn-lysCP1-acs.

Затем плазмиду pDZTn-lysCP1-acs вводили, соответственно, в KCCM11240P и KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, являющийся модифицированным штаммом Corynebacterium glutamicum, полученным в Примере 1-1, электропорацией с получением трансформантов и трансформантов высевали на твердую среду BHIS (сердечно-мозговой экстракт (37 г/л), сорбит (91 г/л) и агар (2%)), содержащую канамицин (25 мкг/мл) и X-gal (5-бром-4-хлор-3-индолин-D-галактозид), и культивировали с образованием колоний. Из полученных колоний отбирали синие колонии, проводя посредством этого отбор трансформированных штаммов с введенной плазмидой pDZTn-lysCP1-acs.

Отобранные штаммы культивировали с покачиванием (30°C, 8 часов) в среде CM (глюкоза (10 г/л), полипептон (10 г/л), дрожжевой экстракт (5 г/л), мясной экстракт (5 г/л), NaCl (2,5 г/л), мочевина (2 г/л), pH 6,8) и последовательно разводили от 10^-4 до 10^-10, высевали на твердую среду, содержащую X-gal, и культивировали с образованием колоний. Из полученных таким образом колоний отбирали белые колонии, встречавшиеся со сравнительно низкой частотой, проводя окончательный отбор штаммов с геном, кодирующим acs, введенным посредством вторичного кроссинговера. Отобранные в итоге штаммы подвергали ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:13 и 25, подтвердив введение гена, кодирующего acs, и модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum были названы KCCM11240P Tn:lysCP1-acs и KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE Tn:lysCP1-acs, соответственно.

3-2. Получение штамма с введением acs, имеющего происхождение от E. coli, в ген транспозона штамма, продуцирующего путресцин, на основе ATCC13869

Как в Примере 3-1, pDZTn-lysCP1-acs, полученной выше, трансформировали DAB12-b и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, являющийся модифицированным штаммом Corynebacterium glutamicum, полученным в Примере 1-2, соответственно, таким же образом, как в Примере 3-1, подтвердив введение acs в ген транспозона.

Отобранные таким образом модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum были названы DAB12-b Tn:lysCP1-acs и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE Tn:lysCP1-acs, соответственно.

3-3. Оценка способности штамма с введенным acs, имеющим происхождение от E. coli, продуцировать путресцин

Для подтверждения эффекта введения acs в штамм, продуцирующий путресцин, с уже введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примерах 3-1 и 3-2, продуцировать путресцин.

Конкретно, модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum четырех типов (KCCM11240P Tn:lysCP1-acs; KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE Tn:lysCP1-acs; DAB12-b Tn:lysCP1-acs; и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE Tn:lysCP1-acs) и исходные штаммы четырех типов (KCCM11240P; KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE; DAB12-b; и DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов. Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄·7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного путресцина, и результаты показаны в Таблице 7 ниже.

Таблица 7

Как показано в Таблице 7, при введении acs в KCCM11240P и DAB12-b, соответственно, количество продуцируемого путресцина оставалось на том же уровне. Тем не менее, при введении acs в модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum двух разных типов с одновременным введением генов argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli (KCCM11240P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE; DAB12-b Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), соответственно, количество продуцируемого путресцина увеличивалось на 13,5% или более по сравнению с исходным штаммом. Кроме того, количество продуцируемого путресцина увеличивалось на 3,4% или более по сравнению с указанными выше модифицированными штаммами.

Пример 4: Штамм с введением argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, и заменой промотора pta-ackA из штамма, продуцирующего путресцин, с улучшенной способностью к экспорту путресцина и способность штамма продуцировать путресцин

4-1. Получение штамма с введением argA и argE, имеющих происхождение от E. coli, и заменой промотора pta-ackA из штамма с улучшенной способностью к экспорту путресцина

На основе штамма KCCM11401P (публикация заявки на патент Кореи № 10-2014-0115244) с улучшенной способностью к экспорту путресцина получали штамм для определения того, может ли введение argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, и усиление активности pta-ackA Corynebacterium улучшить способность продуцировать путресцин.

Конкретно, pDZTn-lysCP1-argA, полученной в Примере 1-1, трансформировали KCCM11401P таким же образом, как в Примере 1-1, и, в результате, введение argA в ген транспозона было подтверждено. Отобранный таким образом модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван KCCM11401P Tn:lysCP1-argA.

Кроме того, для введения argE в штамм с уже введенным argA, как в Примере 1-1, pDZTn-lysCP1-argE, полученной в Примере 1-1, трансформировали KCCM11401P Tn:lysCP1-argA таким же образом, как в Примере 1-1, и введение argE в ген транспозона было подтверждено. Отобранный таким образом модифицированный штамм был назван KCCM11401P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE.

Затем pDZ-lysCP1-1’pta-ackA, полученной в Примере 2-1, трансформировали KCCM11401P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE таким же образом, как в Примере 2-1, и было подтверждено, что промотор lysCP1 был введен в хромосому перед инициирующим кодоном pta-ackA. Полученный выше модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван KCCM11401P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-1’pta-ackA.

4-2. Оценка штамма с введением argA, имеющего происхождение от E. coli, argE, имеющего происхождение от E. coli, и заменой промотора pta-ackA из штамма с улучшенной способностью к экспорту путресцина

Для подтверждения эффекта введения argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, и усиления активности pta-ackA у штамма Corynebacterium glutamicum, продуцирующего путресцин, с улучшенной способностью к экспорту путресцина проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примере 4-1, продуцировать путресцин.

Конкретно, модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum (KCCM11401P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, KCCM11401P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-1’pta-ackA) и исходный штамм (KCCM11401P), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов. Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄⋅7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного путресцина, и результаты показаны в Таблице 8 ниже.

Таблица 8

Как показано в Таблице 8, было подтверждено, что при введении гена argA, имеющего происхождение от E. coli, и гена argE, имеющего происхождение от E. coli, в KCCM11401P с улучшенной способностью к экспорту путресцина количество продуцируемого путресцина увеличивалось на 11,9% по сравнению с исходным штаммом, а при дополнительном усилении штамма посредством pta-ackA количество продуцируемого путресцина увеличивалось на 16,1% по сравнению с исходным штаммом.

Пример 5: Введение argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в штамм, продуцирующий орнитин, и подтверждение способности штамма продуцировать орнитин

5-1. Получение штамма с одновременным введением argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в ген транспозона штамма, продуцирующего орнитин, на основе KCCM11137P

Для подтверждения того, что введение гена argA, имеющего происхождение от E. coli, и гена argE, имеющего происхождение от E. coli, в штамм KCCM11137P (публикация заявки на патент Кореи № 10-1372635), представляющий собой штамм, продуцирующий орнитин, на основе Corynebacterium glutamicum ATCC13032, может улучшать способность продуцировать орнитин, ген argA и ген argE вводили в ген транспозона указанного штамма с использованием вектора, полученного в Примере 1-1.

Сначала плазмиду pDZTn-lysCP1-argA вводили в штамм KCCM11137P электропорацией с получением трансформантов и трансформантов высевали на твердую среду BHIS (сердечно-мозговой экстракт (37 г/л), сорбит (91 г/л) и агар (2%)), содержащую канамицин (25 мкг/мл) и X-gal (5-бром-4-хлор-3-индолин-D-галактозид), и культивировали с образованием колоний. Из полученных колоний отбирали синие колонии, проводя посредством этого отбор штаммов с введенной плазмидой pDZTn-lysCP1-argA.

Отобранные штаммы культивировали с покачиванием (30°C, 8 часов) в среде CM (глюкоза (10 г/л), полипептон (10 г/л), дрожжевой экстракт (5 г/л), мясной экстракт (5 г/л), NaCl (2,5 г/л), мочевина (2 г/л), pH 6,8) и последовательно разводили от 10^-4 до 10^-10, высевали на твердую среду, содержащую X-gal, и культивировали с образованием колоний. Из полученных таким образом колоний отбирали белые колонии, встречавшиеся со сравнительно низкой частотой, проводя окончательный отбор штамма с геном, кодирующим argA, введенным посредством вторичного кроссинговера. Отобранный в итоге штамм подвергали ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:12 и 13, подтвердив введение гена, кодирующего argA, и модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван KCCM11137P Tn:lysCP1-argA.

Для введения argE в штамм с уже введенным argA, полученный выше, pDZTn-lysCP1-argE, полученной в Примере 1-1, трансформировали KCCM11137P Tn:lysCP1-argA таким же образом, как в Примере 1-1, и, таким образом, введение argE в ген транспозона было подтверждено.

Отобранный таким образом модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum был назван KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE.

5-2. Оценка способности штамма Corynebacterium, продуцирующего орнитин, с введенным argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, продуцировать орнитин

Для подтверждения эффекта введения argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, на продукцию орнитина штаммом, продуцирующим орнитин, проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примере 5-1, продуцировать орнитин.

Конкретно, модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum одного типа (KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE) и исходный штамм одного типа (KCCM11137P), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов. Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄⋅7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного путресцина, и результаты показаны в Таблице 9 ниже.

Таблица 9

Как показано в Таблице 9, было подтверждено, что при введение гена argA, имеющего происхождение от E. coli, и гена argE, имеющего происхождение от E. coli, в модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum продемонстрировало увеличение количества продуцируемого орнитина на 14,1% по сравнению с исходным штаммом.

Пример 6: Усиление pta-ackA у штамма с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, и подтверждение способности штамма продуцировать орнитин

6-1. Получение штамма с заменой промотора pta-ackA из штамма, продуцирующего орнитин, на основе ATCC13032

Для подтверждения того, что усиление pta-ackA у штамма, продуцирующего орнитин, на основе ATCC13032 с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, может улучшить способность продуцировать орнитин, перед инициирующим кодоном оперона pta-ackA в хромосому вводили промотор lysCP1 (WO 2009/096689).

Сначала плазмиду pDZ-lysCP1-1’pta-ackA, полученную в Примере 2-1, вводили в штаммы KCCM11137P и KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, соответственно, электропорацией с получением трансформантов и трансформантов высевали на твердую среду BHIS (сердечно-мозговой экстракт (37 г/л), сорбит (91 г/л) и агар (2%)), содержащую канамицин (25 мкг/мл) и X-gal (5-бром-4-хлор-3-индолин-D-галактозид), и культивировали с образованием колоний. Из полученных колоний отбирали синие колонии, проводя посредством этого отбор трансформированных штаммов с введенной плазмидой pDZ-lysCP1-1’pta-ackA.

Отобранные штаммы культивировали с покачиванием (30°C, 8 часов) в среде CM (глюкоза (10 г/л), полипептон (10 г/л), дрожжевой экстракт (5 г/л), мясной экстракт (5 г/л), NaCl (2,5 г/л), мочевина (2 г/л), pH 6,8) и последовательно разводили от 10^-4 до 10^-10, высевали на твердую среду, содержащую X-gal, и культивировали с образованием колоний. Из полученных таким образом колоний отбирали белые колонии, встречавшиеся со сравнительно низкой частотой, проводя окончательный отбор штамма, в котором промотор pta-ackA был заменен на промотор lysCP1 посредством вторичного кроссинговера. Отобранный в итоге штамм подвергали ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:19 и 21, подтвердив введение промотора lysCP1 в хромосому перед инициирующим кодоном оперона pta-ackA. В частности, ПЦР проводили, повторяя 30 циклов денатурации при 95°C в течение 30 секунд, отжига при 55°C в течение 30 секунд и удлинения при 72°C в течение 1 минуты.

Отобранные таким образом модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum были названы KCCM11137P lysCP1-1’pta-ackA и KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-1’pta-ackA, соответственно.

6-2. Оценка способности штамма с усилением активности pta-ackA продуцировать орнитин

Для подтверждения эффекта усиления активности pta-ackA у штамма, продуцирующего орнитин, с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примере 6-1, продуцировать орнитин.

Конкретно, модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum двух разных типов (KCCM11137P lysCP1-1’pta-ackA; KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE lysCP1-1’pta-ackA) и исходные штаммы двух разных типов (KCCM11137P; KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов. Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄⋅7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного орнитина, и результаты показаны в Таблице 10 ниже.

Таблица 10

Как показано в Таблице 10, было подтверждено, что при усилении активности pta-ackA у штамма KCCM11137P количество продуцируемого орнитина не увеличивалось, в то время как в случае штамма KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, представляющего собой модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum с одновременным введением гена argA, имеющего происхождение от E. coli, и гена argE, имеющего происхождение от E. coli, количество продуцируемого орнитина увеличивалось на 20,5% по сравнению со штаммом KCCM11137P и на 5,6% по сравнению со штаммом KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE.

Пример 7: Введение acs, имеющего происхождение от E. coli, в штамм с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, и подтверждение способности штамма продуцировать орнитин

7-1. Получение штамма с введением acs, имеющего происхождение от E. coli, в ген транспозона штамма, продуцирующего орнитин, на основе KCCM11137

Для подтверждения того, что введение acs, имеющего происхождение от E. coli, в штамм KCCM11137P (патент Кореи № 10-1372635), представляющий собой штамм, продуцирующий орнитин, на основе Corynebacterium glutamicum ATCC13032, может улучшить способность продуцировать орнитин, acs вводили в ген транспозона с использованием промотора lysCP1.

Сначала плазмиду pDZTn-lysCP1-acs, полученную в Примере 3-1, вводили в штаммы KCCM11137P и KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, соответственно, электропорацией с получением трансформантов и трансформантов высевали на твердую среду BHIS (сердечно-мозговой экстракт (37 г/л), сорбит (91 г/л) и агар (2%)), содержащую канамицин (25 мкг/мл) и X-gal (5-бром-4-хлор-3-индолин-D-галактозид), и культивировали с образованием колоний. Из полученных колоний отбирали синие колонии, проводя посредством этого отбор трансформированных штаммов с введенной плазмидой pDZTn-lysCP1-acs.

Отобранные штаммы культивировали с покачиванием (30°C, 8 часов) в среде CM (глюкоза (10 г/л), полипептон (10 г/л), дрожжевой экстракт (5 г/л), мясной экстракт (5 г/л), NaCl (2,5 г/л), мочевина (2 г/л), pH 6,8) и последовательно разводили от 10^-4 до 10^-10, высевали на твердую среду, содержащую X-gal, и культивировали с образованием колоний. Из полученных таким образом колоний отбирали белые колонии, встречавшиеся со сравнительно низкой частотой, проводя окончательный отбор штамма с геном, кодирующим acs, введенным посредством вторичного кроссинговера.

Отобранные в итоге штаммы подвергали ПЦР с использованием пары праймеров SEQ ID NO:13 и 25, подтвердив введение гена, кодирующего acs. Отобранные таким образом модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum были названы KCCM11137P Tn:lysCP1-acs и KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE Tn:lysCP1-acs, соответственно.

7-2. Оценка способности штамма с введенным acs, имеющим происхождение от E. coli, продуцировать орнитин

Для подтверждения эффекта введения acs в штамм, продуцирующий орнитин, с введенными argA, имеющим происхождение от E. coli, и argE, имеющим происхождение от E. coli, проводили сравнение способности модифицированных штаммов Corynebacterium glutamicum, полученных в Примере 7-1, продуцировать орнитин.

Конкретно, модифицированные штаммы Corynebacterium glutamicum двух разных типов (KCCM11137P Tn:lysCP1-acs; KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE Tn:lysCP1-acs) и исходные штаммы двух разных типов (KCCM11137P; KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE), соответственно, высевали на твердую среду CM (1% глюкозы, 1% полипептона, 0,5% дрожжевого экстракта, 0,5% мясного экстракта, 0,25% NaCl, 0,2% мочевины, 100 мкл 50%-го NaOH, 2% агара, pH 6,8, на основе 1 л), содержащую 1 мМ аргинина, и культивировали при 30°C в течение 24 часов. Каждый из культивированных штаммов в количестве приблизительно одной платиновой петли засевали в 25 мл титрационной среды (8% глюкозы, 0,25% соевого белка, 0,50% сухого кукурузного экстракта, 4% (NH₄)₂SO₄, 0,1% KH₂PO₄, 0,05% MgSO₄⋅7H₂O, 0,15% мочевины, биотин (100 мг), тиамин-HCl (3 мг), пантотенат кальция (3 мг), никотинамид (3 мг), 5% CaCO₃, на основе 1 л) и культивировали с покачиванием при 30°C и частоте 200 об/мин в течение 98 часов. Во всех культурах штаммов в среду добавляли 1 мМ аргинина. По завершении культивирования в каждой культуральной среде измеряли концентрацию полученного орнитина, и результаты показаны в Таблице 11 ниже.

Таблица 11

Как показано в Таблице 11, было подтверждено, что при введении acs в штамм KCCM11137P количество продуцируемого орнитина не увеличивалось, в то время как в случае штамма KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE, представляющего собой модифицированный штамм Corynebacterium glutamicum с одновременным введением гена argA, имеющего происхождение от E. coli, и гена argE, имеющего происхождение от E. coli, количество продуцируемого орнитина увеличивалось на 17,9% по сравнению со штаммом KCCM11137P и на 3,4% по сравнению со штаммом KCCM11137P Tn:lysCP1-argA Tn:lysCP1-argE.

Суммируя вышеизложенное, было подтверждено, что введение argA, имеющего происхождение от E. coli, и argE, имеющего происхождение от E. coli, в штамм Corynebacterium может увеличить количество продуцируемого путресцина и орнитина, и, кроме того, было подтверждено, что усиление активности гена pta-ackA у штамма Corynebacterium или введение acs, имеющего происхождение от E. coli, может дополнительно увеличить количество продуцируемого путресцина и орнитина.

Исходя из изложенного выше, специалисту в области, к которой относится настоящее изобретение, будет ясно, что настоящее изобретение может быть воплощено в других конкретных формах без изменения технической концепции или существенных характеристик настоящего изобретения. В этом отношении, типичные воплощения раскрыты здесь исключительно в целях наглядности, и их не следует толковать как ограничение объема настоящего изобретения. Наоборот, подразумевают, что настоящее изобретение охватывает не только типичные воплощения, но также различные альтернативы, модификации, эквиваленты и другие воплощения, которые могут быть включены в сущность и объем настоящего изобретения, как определено приложенной формулой изобретения.

--->

<110> CJ CHEILJEDANG CORPORATION

<120> MICROORGANISMS FOR PRODUCING PUTRESCINE OR ORNITHINE AND PROCESS

FOR PRODUCING PUTRESCINE OR ORNITHINE USING THEM

<130> OPA16079

<150> KR10-2015-0102624

<151> 2015-07-20

<160> 39

<170> KopatentIn 2.0

<210> 1

<211> 443

<212> PRT

<213> E.coli N-acetylglutamate synthase

<400> 1

Val Val Lys Glu Arg Lys Thr Glu Leu Val Glu Gly Phe Arg His Ser

1 5 10 15

Val Pro Tyr Ile Asn Thr His Arg Gly Lys Thr Phe Val Ile Met Leu

20 25 30

Gly Gly Glu Ala Ile Glu His Glu Asn Phe Ser Ser Ile Val Asn Asp

35 40 45

Ile Gly Leu Leu His Ser Leu Gly Ile Arg Leu Val Val Val Tyr Gly

50 55 60

Ala Arg Pro Gln Ile Asp Ala Asn Leu Ala Ala His His His Glu Pro

65 70 75 80

Leu Tyr His Lys Asn Ile Arg Val Thr Asp Ala Lys Thr Leu Glu Leu

85 90 95

Val Lys Gln Ala Ala Gly Thr Leu Gln Leu Asp Ile Thr Ala Arg Leu

100 105 110

Ser Met Ser Leu Asn Asn Thr Pro Leu Gln Gly Ala His Ile Asn Val

115 120 125

Val Ser Gly Asn Phe Ile Ile Ala Gln Pro Leu Gly Val Asp Asp Gly

130 135 140

Val Asp Tyr Cys His Ser Gly Arg Ile Arg Arg Ile Asp Glu Asp Ala

145 150 155 160

Ile His Arg Gln Leu Asp Ser Gly Ala Ile Val Leu Met Gly Pro Val

165 170 175

Ala Val Ser Val Thr Gly Glu Ser Phe Asn Leu Thr Ser Glu Glu Ile

180 185 190

Ala Thr Gln Leu Ala Ile Lys Leu Lys Ala Glu Lys Met Ile Gly Phe

195 200 205

Cys Ser Ser Gln Gly Val Thr Asn Asp Asp Gly Asp Ile Val Ser Glu

210 215 220

Leu Phe Pro Asn Glu Ala Gln Ala Arg Val Glu Ala Gln Glu Glu Lys

225 230 235 240

Gly Asp Tyr Asn Ser Gly Thr Val Arg Phe Leu Arg Gly Ala Val Lys

245 250 255

Ala Cys Arg Ser Gly Val Arg Arg Cys His Leu Ile Ser Tyr Gln Glu

260 265 270

Asp Gly Ala Leu Leu Gln Glu Leu Phe Ser Arg Asp Gly Ile Gly Thr

275 280 285

Gln Ile Val Met Glu Ser Ala Glu Gln Ile Arg Arg Ala Thr Ile Asn

290 295 300

Asp Ile Gly Gly Ile Leu Glu Leu Ile Arg Pro Leu Glu Gln Gln Gly

305 310 315 320

Ile Leu Val Arg Arg Ser Arg Glu Gln Leu Glu Met Glu Ile Asp Lys

325 330 335

Phe Thr Ile Ile Gln Arg Asp Asn Thr Thr Ile Ala Cys Ala Ala Leu

340 345 350

Tyr Pro Phe Pro Glu Glu Lys Ile Gly Glu Met Ala Cys Val Ala Val

355 360 365

His Pro Asp Tyr Arg Ser Ser Ser Arg Gly Glu Val Leu Leu Glu Arg

370 375 380

Ile Ala Ala Gln Ala Lys Gln Ser Gly Leu Ser Lys Leu Phe Val Leu

385 390 395 400

Thr Thr Arg Ser Ile His Trp Phe Gln Glu Arg Gly Phe Thr Pro Val

405 410 415

Asp Ile Asp Leu Leu Pro Glu Ser Lys Lys Gln Leu Tyr Asn Tyr Gln

420 425 430

Arg Lys Ser Lys Val Leu Met Ala Asp Leu Gly

435 440

<210> 2

<211> 1332

<212> DNA

<213> E.coli N-acetylglutamate synthase

<400> 2

gtggtaaagg aacgtaaaac cgagttggtc gagggattcc gccattcggt tccctatatc 60

aatacccacc ggggaaaaac gtttgtcatc atgctcggcg gtgaagccat tgagcatgag 120

aatttctcca gtatcgttaa tgatatcggg ttgttgcaca gcctcggcat ccgtctggtg 180

gtggtctatg gcgcacgtcc gcagatcgac gcaaatctgg ctgcgcatca ccacgaaccg 240

ctgtatcaca agaatatacg tgtgaccgac gccaaaacac tggaactggt gaagcaggct 300

gcgggaacat tgcaactgga tattactgct cgcctgtcga tgagtctcaa taacacgccg 360

ctgcagggcg cgcatatcaa cgtcgtcagt ggcaatttta ttattgccca gccgctgggc 420

gtcgatgacg gcgtggatta ctgccatagc gggcgtatcc ggcggattga tgaagacgcg 480

atccatcgtc aactggacag cggtgcaata gtgctaatgg ggccggtcgc tgtttcagtc 540

actggcgaga gctttaacct gacctcggaa gagattgcca ctcaactggc catcaaactg 600

aaagctgaaa agatgattgg tttttgctct tcccagggcg tcactaatga cgacggtgat 660

attgtctccg aacttttccc taacgaagcg caagcgcggg tagaagccca ggaagagaaa 720

ggcgattaca actccggtac ggtgcgcttt ttgcgtggcg cagtgaaagc ctgccgcagc 780

ggcgtgcgtc gctgtcattt aatcagttat caggaagatg gcgcgctgtt gcaagagttg 840

ttctcacgcg acggtatcgg tacgcagatt gtgatggaaa gcgccgagca gattcgtcgc 900

gcaacaatca acgatattgg cggtattctg gagttgattc gcccactgga gcagcaaggt 960

attctggtac gccgttctcg cgagcagctg gagatggaaa tcgacaaatt caccattatt 1020

cagcgcgata acacgactat tgcctgcgcc gcgctctatc cgttcccgga agagaagatt 1080

ggggaaatgg cctgtgtggc agttcacccg gattaccgca gttcatcaag gggtgaagtt 1140

ctgctggaac gcattgccgc tcaggcgaag cagagcggct taagcaaatt gtttgtgctg 1200

accacgcgca gtattcactg gttccaggaa cgtggattta ccccagtgga tattgattta 1260

ctgcccgaga gcaaaaagca gttgtacaac taccagcgta aatccaaagt gttgatggcg 1320

gatttagggt aa 1332

<210> 3

<211> 408

<212> PRT

<213> E.coli Acetylornithine deacetylase

<400> 3

Met Asp Lys Leu Leu Glu Arg Phe Leu Asn Tyr Val Ser Leu Asp Thr

1 5 10 15

Gln Ser Lys Ala Gly Val Arg Gln Val Pro Ser Thr Glu Gly Gln Trp

20 25 30

Lys Leu Leu His Leu Leu Lys Glu Gln Leu Glu Glu Met Gly Leu Ile

35 40 45

Asn Val Thr Leu Ser Glu Lys Gly Thr Leu Met Ala Thr Leu Pro Ala

50 55 60

Asn Val Pro Gly Asp Ile Pro Ala Ile Gly Phe Ile Ser His Val Asp

65 70 75 80

Thr Ser Pro Asp Cys Ser Gly Lys Asn Val Asn Pro Gln Ile Val Glu

85 90 95

Asn Tyr Arg Gly Gly Asp Ile Ala Leu Gly Ile Gly Asp Glu Val Leu

100 105 110

Ser Pro Val Met Phe Pro Val Leu His Gln Leu Leu Gly Gln Thr Leu

115 120 125

Ile Thr Thr Asp Gly Lys Thr Leu Leu Gly Ala Asp Asp Lys Ala Gly

130 135 140

Ile Ala Glu Ile Met Thr Ala Leu Ala Val Leu Gln Gln Lys Lys Ile

145 150 155 160

Pro His Gly Asp Ile Arg Val Ala Phe Thr Pro Asp Glu Glu Val Gly

165 170 175

Lys Gly Ala Lys His Phe Asp Val Asp Ala Phe Asp Ala Arg Trp Ala

180 185 190

Tyr Thr Val Asp Gly Gly Gly Val Gly Glu Leu Glu Phe Glu Asn Phe

195 200 205

Asn Ala Ala Ser Val Asn Ile Lys Ile Val Gly Asn Asn Val His Pro

210 215 220

Gly Thr Ala Lys Gly Val Met Val Asn Ala Leu Ser Leu Ala Ala Arg

225 230 235 240

Ile His Ala Glu Val Pro Ala Asp Glu Ser Pro Glu Met Thr Glu Gly

245 250 255

Tyr Glu Gly Phe Tyr His Leu Ala Ser Met Lys Gly Thr Val Glu Arg

260 265 270

Ala Asp Met His Tyr Ile Ile Arg Asp Phe Asp Arg Lys Gln Phe Glu

275 280 285

Ala Arg Lys Arg Lys Met Met Glu Ile Ala Lys Lys Val Gly Lys Gly

290 295 300

Leu His Pro Asp Cys Tyr Ile Glu Leu Val Ile Glu Asp Ser Tyr Tyr

305 310 315 320

Asn Met Arg Glu Lys Val Val Glu His Pro His Ile Leu Asp Ile Ala

325 330 335

Gln Gln Ala Met Arg Asp Cys Asp Ile Glu Pro Glu Leu Lys Pro Ile

340 345 350

Arg Gly Gly Thr Asp Gly Ala Gln Leu Ser Phe Met Gly Leu Pro Cys

355 360 365

Pro Asn Leu Phe Thr Gly Gly Tyr Asn Tyr His Gly Lys His Glu Phe

370 375 380

Val Thr Leu Glu Gly Met Glu Lys Ala Val Gln Val Ile Val Arg Ile

385 390 395 400

Ala Glu Leu Thr Ala Gln Arg Lys

405

<210> 4

<211> 1227

<212> DNA

<213> E.coli Acetylornithine deacetylase

<400> 4

atggataaac tacttgagcg atttttgaac tacgtgtctc tggataccca atcaaaagca 60

ggggtgagac aggttcccag cacggaaggc caatggaagt tattgcatct gctgaaagag 120

cagctcgaag agatggggct tatcaatgtg accttaagtg agaagggcac tttgatggcg 180

acgttaccgg ctaacgtccc tggcgatatc ccggcgattg gctttatttc tcatgtggat 240

acctcaccgg attgcagcgg caaaaatgtg aatccgcaaa ttgttgaaaa ctatcgcggt 300

ggcgatattg cgctgggtat cggcgatgaa gttttatcac cggttatgtt cccggtgctg 360

catcagctac tgggtcagac gctgattacc accgatggta aaaccttgtt aggtgccgat 420

gacaaagcag gtattgcaga aatcatgacc gcgctggcgg tattgcaaca gaaaaaaatt 480

ccgcatggtg atattcgcgt cgcctttacc ccggatgaag aagtgggcaa aggggcgaaa 540

cattttgatg ttgacgcctt cgatgcccgc tgggcttaca ctgttgatgg tggtggcgta 600

ggcgaactgg agtttgaaaa cttcaacgcc gcgtcggtca atatcaaaat tgtcggtaac 660

aatgttcatc cgggcacggc gaaaggagtg atggtaaatg cgctgtcgct ggcggcacgt 720

attcatgcgg aagttccggc ggatgaaagc ccggaaatga cagaaggcta tgaaggtttc 780

tatcatctgg cgagcatgaa aggcaccgtt gaacgggccg atatgcacta catcatccgt 840

gatttcgacc gtaaacagtt tgaagcgcgt aaacgtaaaa tgatggagat cgccaaaaaa 900

gtgggcaaag ggttacatcc tgattgctac attgaactgg tgattgaaga cagttactac 960

aatatgcgcg agaaagtggt tgagcatccg catattctcg atatcgccca gcaggcgatg 1020

cgcgattgcg atattgaacc ggaactgaaa ccgatccgcg gtggtaccga cggcgcgcag 1080

ttgtcgttta tgggattacc gtgcccgaac ctgttcactg gcggttacaa ctatcatggt 1140

aagcatgagt ttgtgactct ggaaggtatg gaaaaagcgg tgcaggtgat cgtccgtatt 1200

gccgagttaa cggcgcaacg gaagtaa 1227

<210> 5

<211> 858

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 pta-ackA

<400> 5

Met Ser Asp Thr Pro Thr Ser Ala Leu Ile Thr Thr Val Asn Arg Ser

1 5 10 15

Phe Asp Gly Phe Asp Leu Glu Glu Val Ala Ala Asp Leu Gly Val Arg

20 25 30

Leu Thr Tyr Leu Pro Asp Glu Glu Leu Glu Val Ser Lys Val Leu Ala

35 40 45

Ala Asp Leu Leu Ala Glu Gly Pro Ala Leu Ile Ile Gly Val Gly Asn

50 55 60

Thr Phe Phe Asp Ala Gln Val Ala Ala Ala Leu Gly Val Pro Val Leu

65 70 75 80

Leu Leu Val Asp Lys Gln Gly Lys His Val Ala Leu Ala Arg Thr Gln

85 90 95

Val Asn Asn Ala Gly Ala Val Val Ala Ala Ala Phe Thr Ala Glu Gln

100 105 110

Glu Pro Met Pro Asp Lys Leu Arg Lys Ala Val Arg Asn His Ser Asn

115 120 125

Leu Glu Pro Val Met Ser Ala Glu Leu Phe Glu Asn Trp Leu Leu Lys

130 135 140

Arg Ala Arg Ala Glu His Ser His Ile Val Leu Pro Glu Gly Asp Asp

145 150 155 160

Asp Arg Ile Leu Met Ala Ala His Gln Leu Leu Asp Gln Asp Ile Cys

165 170 175

Asp Ile Thr Ile Leu Gly Asp Pro Val Lys Ile Lys Glu Arg Ala Thr

180 185 190

Glu Leu Gly Leu His Leu Asn Thr Ala Tyr Leu Val Asn Pro Leu Thr

195 200 205

Asp Pro Arg Leu Glu Glu Phe Ala Glu Gln Phe Ala Glu Leu Arg Lys

210 215 220

Ser Lys Ser Val Thr Ile Asp Glu Ala Arg Glu Ile Met Lys Asp Ile

225 230 235 240

Ser Tyr Phe Gly Thr Met Met Val His Asn Gly Asp Ala Asp Gly Met

245 250 255

Val Ser Gly Ala Ala Asn Thr Thr Ala His Thr Ile Lys Pro Ser Phe

260 265 270

Gln Ile Ile Lys Thr Val Pro Glu Ala Ser Val Val Ser Ser Ile Phe

275 280 285

Leu Met Val Leu Arg Gly Arg Leu Trp Ala Phe Gly Asp Cys Ala Val

290 295 300

Asn Pro Asn Pro Thr Ala Glu Gln Leu Gly Glu Ile Ala Val Val Ser

305 310 315 320

Ala Lys Thr Ala Ala Gln Phe Gly Ile Asp Pro Arg Val Ala Ile Leu

325 330 335

Ser Tyr Ser Thr Gly Asn Ser Gly Gly Gly Ser Asp Val Asp Arg Ala

340 345 350

Ile Asp Ala Leu Ala Glu Ala Arg Arg Leu Asn Pro Glu Leu Cys Val

355 360 365

Asp Gly Pro Leu Gln Phe Asp Ala Ala Val Asp Pro Gly Val Ala Arg

370 375 380

Lys Lys Met Pro Asp Ser Asp Val Ala Gly Gln Ala Asn Val Phe Ile

385 390 395 400

Phe Pro Asp Leu Glu Ala Gly Asn Ile Gly Tyr Lys Thr Ala Gln Arg

405 410 415

Thr Gly His Ala Leu Ala Val Gly Pro Ile Leu Gln Gly Leu Asn Lys

420 425 430

Pro Val Asn Asp Leu Ser Arg Gly Ala Thr Val Pro Asp Ile Val Asn

435 440 445

Thr Val Ala Ile Thr Ala Ile Gln Ala Gly Gly Arg Ser Met Ala

450 455 460

Leu Ala Leu Val Leu Asn Ser Gly Ser Ser Ser Ile Lys Phe Gln Leu

465 470 475 480

Val Asn Pro Glu Asn Ser Ala Ile Asp Glu Pro Tyr Val Ser Gly Leu

485 490 495

Val Glu Gln Ile Gly Glu Pro Asn Gly Arg Ile Val Leu Lys Ile Glu

500 505 510

Gly Glu Lys Tyr Thr Leu Glu Thr Pro Ile Ala Asp His Ser Glu Gly

515 520 525

Leu Asn Leu Ala Phe Asp Leu Met Asp Gln His Asn Cys Gly Pro Ser

530 535 540

Gln Leu Glu Ile Thr Ala Val Gly His Arg Val Val His Gly Gly Ile

545 550 555 560

Leu Phe Ser Ala Pro Glu Leu Ile Thr Asp Glu Ile Val Glu Met Ile

565 570 575

Arg Asp Leu Ile Pro Leu Ala Pro Leu His Asn Pro Ala Asn Val Asp

580 585 590

Gly Ile Asp Val Ala Arg Lys Ile Leu Pro Asp Val Pro His Val Ala

595 600 605

Val Phe Asp Thr Gly Phe Phe His Ser Leu Pro Pro Ala Ala Ala Leu

610 615 620

Tyr Ala Ile Asn Lys Asp Val Ala Ala Glu His Gly Ile Arg Arg Tyr

625 630 635 640

Gly Phe His Gly Thr Ser His Glu Phe Val Ser Lys Arg Val Val Glu

645 650 655

Ile Leu Glu Lys Pro Thr Glu Asp Ile Asn Thr Ile Thr Phe His Leu

660 665 670

Gly Asn Gly Ala Ser Met Ala Ala Val Gln Gly Gly Arg Ala Val Asp

675 680 685

Thr Ser Met Gly Met Thr Pro Leu Ala Gly Leu Val Met Gly Thr Arg

690 695 700

Ser Gly Asp Ile Asp Pro Gly Ile Val Phe His Leu Ser Arg Thr Ala

705 710 715 720

Gly Met Ser Ile Asp Glu Ile Asp Asn Leu Leu Asn Lys Lys Ser Gly

725 730 735

Val Lys Gly Leu Ser Gly Val Asn Asp Phe Arg Glu Leu Arg Glu Met

740 745 750

Ile Asp Asn Asn Asp Gln Asp Ala Trp Ser Ala Tyr Asn Ile Tyr Ile

755 760 765

His Gln Leu Arg Arg Tyr Leu Gly Ser Tyr Met Val Ala Leu Gly Arg

770 775 780

Val Asp Thr Ile Val Phe Thr Ala Gly Val Gly Glu Asn Ala Gln Phe

785 790 795 800

Val Arg Glu Asp Ala Leu Ala Gly Leu Glu Met Tyr Gly Ile Glu Ile

805 810 815

Asp Pro Glu Arg Asn Ala Leu Pro Asn Asp Gly Pro Arg Leu Ile Ser

820 825 830

Thr Asp Ala Ser Lys Val Lys Val Phe Val Ile Pro Thr Asn Glu Glu

835 840 845

Leu Ala Ile Ala Arg Tyr Ala Val Lys Phe Ala

850 855

<210> 6

<211> 2579

<212> DNA

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 pta-ackA

<400> 6

atgtctgaca caccgacctc agctctgatc accacggtca accgcagctt cgatggattc 60

gatttggaag aagtagcagc agaccttgga gttcggctca cctacctgcc cgacgaagaa 120

ctagaagtat ccaaagttct cgcggcggac ctcctcgctg aggggccagc tctcatcatc 180

ggtgtaggaa acacgttttt cgacgcccag gtcgccgctg ccctcggcgt cccagtgcta 240

ctgctggtag acaagcaagg caagcacgtt gctcttgctc gcacccaggt aaacaatgcc 300

ggcgcagttg ttgcagcagc atttaccgct gaacaagagc caatgccgga taagctgcgc 360

aaggctgtgc gcaaccacag caacctcgaa ccagtcatga gcgccgaact ctttgaaaac 420

tggctgctca agcgcgcacg cgcagagcac tcccacattg tgctgccaga aggtgacgac 480

gaccgcatct tgatggctgc ccaccagctg cttgatcaag acatctgtga catcacgatc 540

ctgggcgatc cagtaaagat caaggagcgc gctaccgaac ttggcctgca ccttaacact 600

gcatacctgg tcaatccgct gacagatcct cgcctggagg aattcgccga acaattcgcg 660

gagctgcgca agtcaaagag cgtcactatc gatgaagccc gcgaaatcat gaaggatatt 720

tcctacttcg gcaccatgat ggtccacaac ggcgacgccg acggaatggt atccggtgca 780

gcaaacacca ccgcacacac cattaagcca agcttccaga tcatcaaaac tgttccagaa 840

gcatccgtcg tttcttccat cttcctcatg gtgctgcgcg ggcgactgtg ggcattcggc 900

gactgtgctg ttaacccgaa cccaactgct gaacagcttg gtgaaatcgc cgttgtgtca 960

gcaaaaactg cagcacaatt tggcattgat cctcgcgtag ccatcttgtc ctactccact 1020

ggcaactccg gcggaggctc agatgtggat cgcgccatcg acgctcttgc agaagcacgc 1080

cgacttaacc cagaactatg cgtcgatgga ccacttcagt tcgacgccgc cgtcgacccg 1140

ggtgtggcgc gcaagaagat gccagactct gacgtcgctg gccaggcaaa tgtgtttatc 1200

ttccctgacc tggaagccgg aaacatcggc tacaaaactg cacaacgcac cggtcacgcc 1260

ctggcagttg gtccgattct gcagggccta aacaaaccag tcaacgacct ttcccgtggc 1320

gcaacagtcc ctgacatcgt caacacagta gccatcacag caattcaggc aggaggacgc 1380

agctaatggc attggcactt gttttgaact ccggttcatc ttccatcaaa ttccagctgg 1440

tcaaccccga aaactctgcc atcgacgagc catatgtttc tggtcttgtg gagcagattg 1500

gtgagccaaa cggccgcatc gtactcaaaa tagagggtga aaaatatacc ctagagacac 1560

ccatcgcaga tcactccgaa ggcctaaacc tggcgttcga tctcatggac cagcacaact 1620

gtggtccttc ccaactggaa atcaccgcag ttggacaccg cgtggtccac ggcggaatct 1680

tgttctccgc accggaactt atcactgatg aaatcgtgga aatgatccgc gatctcattc 1740

cactcgcacc actgcacaac cctgcaaacg ttgacggcat tgatgttgct cgaaaaattc 1800

tccccgatgt cccacacgta gctgtctttg acaccggttt cttccactca cttccaccag 1860

cagctgcgct gtatgccatc aacaaggatg tcgcagctga acacggaatc aggcgctatg 1920

gtttccacgg cacctcccat gaatttgtgt ccaagcgcgt ggtggaaatt ctggaaaagc 1980

ccaccgaaga catcaacacc atcaccttcc acctgggcaa cggcgcatcc atggctgctg 2040

ttcaaggtgg ccgtgcggta gatacttcca tgggtatgac acctctcgcg ggccttgtca 2100

tgggtacccg aagcggtgac attgatccag gtatcgtctt ccacctttcc cgcaccgctg 2160

gcatgagcat cgatgagatc gataatctgc tgaacaaaaa gtcgggtgta aagggacttt 2220

ccggtgttaa tgatttccgt gaactgcggg aaatgatcga caacaatgat caagatgcct 2280

ggtccgcgta caacatttac atacaccaac tccgccgcta cctcggttcc tacatggtgg 2340

cactgggacg ggtagacacc atcgtgttca ccgccggtgt cggtgaaaat gcccagtttg 2400

tccgtgagga tgccttggca ggtttggaaa tgtacggaat tgagatcgat ccagagcgta 2460

acgcattgcc aaacgatggt cctcgattga tttccaccga tgcctccaag gtgaaggtgt 2520

ttgttattcc aactaatgaa gagttagcta tcgctaggta cgcggtgaag ttcgcttag 2579

<210> 7

<211> 858

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13869 pta-ackA

<400> 7

Met Ser Asp Thr Pro Thr Ser Ala Leu Ile Thr Thr Val Asn Arg Ser

1 5 10 15

Phe Asp Gly Phe Asp Leu Glu Glu Val Ala Ala Asp Leu Gly Val Arg

20 25 30

Leu Thr Asp Leu Pro Asp Glu Glu Leu Glu Val Ser Lys Val Leu Ala

35 40 45

Ala Asp Leu Leu Ala Glu Gly Pro Ala Leu Ile Ile Gly Val Gly Asn

50 55 60

Thr Phe Phe Asp Ala Gln Val Ala Ala Ala Leu Gly Val Pro Val Leu

65 70 75 80

Leu Leu Val Asp Lys Gln Gly Lys His Val Ala Leu Ala Arg Thr Gln

85 90 95

Val Asn Asn Ala Gly Ala Val Val Ala Ala Ala Phe Thr Ala Glu Gln

100 105 110

Glu Pro Met Pro Asp Lys Leu Arg Lys Ala Val Arg Asn His Ser Asn

115 120 125

Leu Glu Pro Val Met Ser Ala Glu Leu Phe Glu Asn Trp Leu Leu Lys

130 135 140

Arg Ala Arg Ala Glu His Ser His Ile Val Leu Pro Glu Gly Asp Asp

145 150 155 160

Asp Arg Ile Leu Met Ala Ala His Gln Leu Leu Asp Gln Asp Ile Cys

165 170 175

Asp Ile Thr Ile Leu Gly Asp Pro Val Gln Ile Lys Glu Arg Ala Thr

180 185 190

Glu Leu Gly Leu His Leu Asn Thr Ala Tyr Leu Val Asn Pro Leu Thr

195 200 205

Asp Pro Arg Leu Glu Glu Phe Ala Glu Gln Phe Ala Glu Leu Arg Lys

210 215 220

Ser Lys Ser Val Thr Ile Asp Glu Ala Arg Glu Ile Met Lys Asp Ile

225 230 235 240

Cys Tyr Phe Gly Thr Met Met Val His Asn Gly Asp Ala Asp Gly Met

245 250 255

Val Ser Gly Ala Ala Asn Thr Thr Ala His Thr Ile Lys Pro Ser Phe

260 265 270

Gln Ile Ile Lys Thr Val Pro Glu Ala Ser Val Val Ser Ser Ile Phe

275 280 285

Leu Met Val Leu Arg Gly Arg Leu Trp Ala Phe Gly Asp Cys Ala Val

290 295 300

Asn Pro Asn Pro Thr Ala Glu Gln Leu Gly Glu Ile Ala Val Val Ser

305 310 315 320

Ala Lys Thr Ala Ala Gln Phe Gly Ile Asp Pro Arg Val Ala Ile Leu

325 330 335

Ser Tyr Ser Thr Gly Asn Ser Gly Gly Gly Ser Asp Val Asp Arg Ala

340 345 350

Ile Asp Ala Leu Ala Glu Ala Arg Arg Leu Asn Pro Glu Leu Cys Val

355 360 365

Asp Gly Pro Leu Gln Phe Asp Ala Ala Val Asp Pro Gly Val Ala Arg

370 375 380

Lys Lys Met Pro Asp Ser Asp Val Ala Gly Gln Ala Asn Val Phe Ile

385 390 395 400

Phe Pro Asp Leu Glu Ala Gly Asn Ile Gly Tyr Lys Thr Ala Gln Arg

405 410 415

Thr Gly His Ala Leu Ala Val Gly Pro Ile Leu Gln Gly Leu Asn Lys

420 425 430

Pro Val Asn Asp Leu Ser Arg Gly Ala Thr Val Pro Asp Ile Val Asn

435 440 445

Thr Val Ala Ile Thr Ala Ile Gln Ala Gly Gly Arg Ser Met Ala

450 455 460

Leu Ala Leu Val Leu Asn Ser Gly Ser Ser Ser Ile Lys Phe Gln Leu

465 470 475 480

Val Asn Pro Glu Asn Ser Ala Ile Asp Glu Pro Tyr Val Ser Gly Leu

485 490 495

Val Glu Gln Ile Gly Glu Pro Asn Gly Arg Ile Val Leu Lys Val Glu

500 505 510

Gly Glu Lys Tyr Thr Leu Glu Thr Pro Ile Ala Asp His Ser Glu Gly

515 520 525

Leu Asn Leu Ala Phe Asp Leu Met Asp Gln His Asn Cys Gly Pro Ser

530 535 540

Gln Leu Glu Ile Thr Ala Val Gly His Arg Val Val His Gly Gly Ile

545 550 555 560

Leu Phe Ser Ala Pro Glu Leu Ile Thr Asp Glu Ile Val Glu Met Ile

565 570 575

Arg Asp Leu Ile Pro Leu Ala Pro Leu His Asn Pro Ala Asn Val Asp

580 585 590

Gly Ile Asp Val Ala Arg Lys Ile Leu Pro Asp Val Pro His Val Ala

595 600 605

Val Phe Asp Thr Gly Phe Phe His Ser Leu Pro Pro Ala Ala Ala Leu

610 615 620

Tyr Ala Ile Asn Lys Asp Val Ala Ala Glu His Gly Ile Arg Arg Tyr

625 630 635 640

Gly Phe His Gly Thr Ser His Glu Phe Val Ser Lys Arg Val Val Glu

645 650 655

Ile Leu Glu Lys Pro Thr Glu Asp Ile Asn Thr Ile Thr Phe His Leu

660 665 670

Gly Asn Gly Ala Ser Met Ala Ala Val Gln Gly Gly Arg Ala Val Asp

675 680 685

Thr Ser Met Gly Met Thr Pro Leu Ala Gly Leu Val Met Gly Thr Arg

690 695 700

Ser Gly Asp Ile Asp Pro Gly Val Val Phe His Leu Ser Arg Thr Ala

705 710 715 720

Gly Met Ser Ile Asp Glu Ile Asp Asn Leu Leu Asn Lys Lys Ser Gly

725 730 735

Val Lys Gly Leu Ser Gly Val Asn Asp Phe Arg Glu Leu Arg Glu Met

740 745 750

Ile Asp Asn Asn Asp Gln Asp Ala Trp Ser Ala Tyr Asn Ile Tyr Ile

755 760 765

His Gln Leu Arg Arg Tyr Leu Gly Ser Tyr Met Val Ala Leu Gly Arg

770 775 780

Val Asp Thr Ile Val Phe Thr Ala Gly Val Gly Glu Asn Ala Gln Phe

785 790 795 800

Val Arg Glu Asp Ala Leu Ala Gly Leu Glu Met Tyr Gly Ile Glu Ile

805 810 815

Asp Pro Glu Arg Asn Ala Leu Pro Asn Asp Gly Pro Arg Leu Ile Ser

820 825 830

Thr Asp Ala Ser Lys Val Lys Val Phe Val Ile Pro Thr Asn Glu Glu

835 840 845

Leu Ala Ile Ala Arg Tyr Ala Val Lys Phe Ala

850 855

<210> 8

<211> 2579

<212> DNA

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13869 pta-ackA

<400> 8

atgtctgaca caccgacctc agctctgatc accacggtca accgcagctt cgatggattc 60

gatttggaag aagtagcagc agaccttgga gttcggctca ccgacctgcc cgacgaagaa 120

ctagaagtat ccaaagttct cgcggcggac ctcctcgctg aggggccagc tctcatcatc 180

ggtgtaggaa acacgttttt cgacgcccag gtcgccgctg ccctcggcgt cccagtgcta 240

ctgctggtag acaagcaagg caagcacgtt gctcttgctc gcacccaggt aaacaatgcc 300

ggcgcagttg ttgcagcagc atttaccgct gaacaagagc caatgccgga taagctgcgc 360

aaggctgtgc gcaaccacag caacctcgaa ccagtcatga gcgccgaact ctttgaaaac 420

tggctgctca agcgcgcacg cgcagagcac tcccacattg tgctgccaga aggtgacgac 480

gaccgcatct tgatggctgc ccaccagctg cttgatcaag acatctgtga catcacgatc 540

ctgggcgatc cagtacagat caaggagcgc gctaccgaac ttggcctgca ccttaacact 600

gcatacctgg tcaatccgct gacagatcct cgcctggagg aattcgccga acaattcgcg 660

gagctgcgca agtcaaagag cgtcactatc gatgaagccc gcgaaatcat gaaggatatt 720

tgctacttcg gcaccatgat ggtccacaac ggcgacgccg acggaatggt atccggtgca 780

gcaaacacca ccgcacacac cattaagcca agcttccaga tcatcaaaac tgttccagaa 840

gcatccgtcg tttcttccat cttcctcatg gtgctgcgcg ggcgactgtg ggcattcggc 900

gactgtgctg ttaacccgaa cccaactgct gaacagcttg gtgaaatcgc cgttgtgtca 960

gcaaaaactg cagcacaatt tggcattgat cctcgcgtag ccatcttgtc ctactccact 1020

ggcaactccg gcggaggctc agatgtggat cgcgccatcg acgctcttgc agaagcacgc 1080

cgactcaacc cagaactatg cgtcgatgga ccacttcagt tcgacgccgc cgtcgacccg 1140

ggtgtggcgc gcaagaagat gccagactct gacgtcgctg gccaggcaaa tgtgtttatc 1200

ttccctgacc tggaagccgg aaacatcggc tacaaaactg cacaacgcac cggtcacgcc 1260

ctggcagttg gtccgattct gcagggcctg aacaaaccag tcaacgacct ttcccgtggc 1320

gcaacagtcc ctgacatcgt caacacagta gccatcaccg caattcaggc aggaggacgc 1380

agctaatgg cattggcact tgttttgaac tccggttcat cttccatcaa attccagctg 1440

gtcaaccccg aaaactctgc catcgacgag ccatatgttt ctggtcttgt ggagcagatt 1500

ggtgagccaa acggccgcat cgtactcaaa gtagagggtg aaaaatacac cctagagaca 1560

cccatcgcag atcactccga aggcctaaac ctggcgttcg atctcatgga ccagcacaac 1620

tgtggtcctt cccaactgga aatcaccgca gttggacacc gcgtggtcca cggtggaatc 1680

ttgttctctg cgccggaact catcactgat gaaatcgttg aaatgatccg cgatctcatt 1740

ccactcgcac cactgcacaa ccctgcaaac gttgacggca ttgatgttgc tcgaaaaatt 1800

ctccccgatg tcccacacgt agctgtcttt gacaccggtt tcttccactc acttccacca 1860

gcagctgcac tgtatgccat caacaaggat gtcgcagctg aacacggaat caggcgctat 1920

ggtttccacg gtacctccca cgaatttgtg tccaagcgcg tggtggaaat tttggaaaag 1980

cccaccgaag acatcaacac catcaccttc cacctgggca acggcgcatc catggctgct 2040

gttcaaggcg gccgtgcggt agatacttcc atgggtatga cacctctcgc gggacttgtc 2100

atgggtaccc gaagcggtga cattgatcca ggtgtcgttt tccatctctc acgcaccgct 2160

ggcatgagca tcgatgagat cgataatctg ctgaacaaaa agtcgggtgt aaagggactt 2220

tccggagtca atgatttccg tgaactgcgg gaaatgatcg acaacaatga tcaagatgcc 2280

tggtccgcgt acaacattta catacaccaa ctccgccgct acctcggttc ctacatggtg 2340

gcactgggac gggtagacac catcgtgttc accgccggtg ttggtgaaaa tgcccagttt 2400

gtccgtgagg atgccttggc aggtttggaa atgtacggca tcgaaatcga tccggagcgc 2460

aacgcactgc caaacgatgg tcctagattg atttccaccg atgcctccaa ggtgaaggtg 2520

tttgttattc caactaatga agagttggct atcgctaggt acgcggtgaa gttcgcttag 2580

2580

<210> 9

<211> 652

<212> PRT

<213> E.coli acetyl-CoA synthetase

<400> 9

Met Ser Gln Ile His Lys His Thr Ile Pro Ala Asn Ile Ala Asp Arg

1 5 10 15

Cys Leu Ile Asn Pro Gln Gln Tyr Glu Ala Met Tyr Gln Gln Ser Ile

20 25 30

Asn Val Pro Asp Thr Phe Trp Gly Glu Gln Gly Lys Ile Leu Asp Trp

35 40 45

Ile Lys Pro Tyr Gln Lys Val Lys Asn Thr Ser Phe Ala Pro Gly Asn

50 55 60

Val Ser Ile Lys Trp Tyr Glu Asp Gly Thr Leu Asn Leu Ala Ala Asn

65 70 75 80

Cys Leu Asp Arg His Leu Gln Glu Asn Gly Asp Arg Thr Ala Ile Ile

85 90 95

Trp Glu Gly Asp Asp Ala Ser Gln Ser Lys His Ile Ser Tyr Lys Glu

100 105 110

Leu His Arg Asp Val Cys Arg Phe Ala Asn Thr Leu Leu Glu Leu Gly

115 120 125

Ile Lys Lys Gly Asp Val Val Ala Ile Tyr Met Pro Met Val Pro Glu

130 135 140

Ala Ala Val Ala Met Leu Ala Cys Ala Arg Ile Gly Ala Val His Ser

145 150 155 160

Val Ile Phe Gly Gly Phe Ser Pro Glu Ala Val Ala Gly Arg Ile Ile

165 170 175

Asp Ser Asn Ser Arg Leu Val Ile Thr Ser Asp Glu Gly Val Arg Ala

180 185 190

Gly Arg Ser Ile Pro Leu Lys Lys Asn Val Asp Asp Ala Leu Lys Asn

195 200 205

Pro Asn Val Thr Ser Val Glu His Val Val Val Leu Lys Arg Thr Gly

210 215 220

Gly Lys Ile Asp Trp Gln Glu Gly Arg Asp Leu Trp Trp His Asp Leu

225 230 235 240

Val Glu Gln Ala Ser Asp Gln His Gln Ala Glu Glu Met Asn Ala Glu

245 250 255

Asp Pro Leu Phe Ile Leu Tyr Thr Ser Gly Ser Thr Gly Lys Pro Lys

260 265 270

Gly Val Leu His Thr Thr Gly Gly Tyr Leu Val Tyr Ala Ala Leu Thr

275 280 285

Phe Lys Tyr Val Phe Asp Tyr His Pro Gly Asp Ile Tyr Trp Cys Thr

290 295 300

Ala Asp Val Gly Trp Val Thr Gly His Ser Tyr Leu Leu Tyr Gly Pro

305 310 315 320

Leu Ala Cys Gly Ala Thr Thr Leu Met Phe Glu Gly Val Pro Asn Trp

325 330 335

Pro Thr Pro Ala Arg Met Ala Gln Val Val Asp Lys His Gln Val Asn

340 345 350

Ile Leu Tyr Thr Ala Pro Thr Ala Ile Arg Ala Leu Met Ala Glu Gly

355 360 365

Asp Lys Ala Ile Glu Gly Thr Asp Arg Ser Ser Leu Arg Ile Leu Gly

370 375 380

Ser Val Gly Glu Pro Ile Asn Pro Glu Ala Trp Glu Trp Tyr Trp Lys

385 390 395 400

Lys Ile Gly Asn Glu Lys Cys Pro Val Val Asp Thr Trp Trp Gln Thr

405 410 415

Glu Thr Gly Gly Phe Met Ile Thr Pro Leu Pro Gly Ala Thr Glu Leu

420 425 430

Lys Ala Gly Ser Ala Thr Arg Pro Phe Phe Gly Val Gln Pro Ala Leu

435 440 445

Val Asp Asn Glu Gly Asn Pro Leu Glu Gly Ala Thr Glu Gly Ser Leu

450 455 460

Val Ile Thr Asp Ser Trp Pro Gly Gln Ala Arg Thr Leu Phe Gly Asp

465 470 475 480

His Glu Arg Phe Glu Gln Thr Tyr Phe Ser Thr Phe Lys Asn Met Tyr

485 490 495

Phe Ser Gly Asp Gly Ala Arg Arg Asp Glu Asp Gly Tyr Tyr Trp Ile

500 505 510

Thr Gly Arg Val Asp Asp Val Leu Asn Val Ser Gly His Arg Leu Gly

515 520 525

Thr Ala Glu Ile Glu Ser Ala Leu Val Ala His Pro Lys Ile Ala Glu

530 535 540

Ala Ala Val Val Gly Ile Pro His Asn Ile Lys Gly Gln Ala Ile Tyr

545 550 555 560

Ala Tyr Val Thr Leu Asn His Gly Glu Glu Pro Ser Pro Glu Leu Tyr

565 570 575

Ala Glu Val Arg Asn Trp Val Arg Lys Glu Ile Gly Pro Leu Ala Thr

580 585 590

Pro Asp Val Leu His Trp Thr Asp Ser Leu Pro Lys Thr Arg Ser Gly

595 600 605

Lys Ile Met Arg Arg Ile Leu Arg Lys Ile Ala Ala Gly Asp Thr Ser

610 615 620

Asn Leu Gly Asp Thr Ser Thr Leu Ala Asp Pro Gly Val Val Glu Lys

625 630 635 640

Leu Leu Glu Glu Lys Gln Ala Ile Ala Met Pro Ser

645 650

<210> 10

<211> 1959

<212> DNA

<213> E.coli acetyl-CoA synthetase

<400> 10

atgagccaaa ttcacaaaca caccattcct gccaacatcg cagaccgttg cctgataaac 60

cctcagcagt acgaggcgat gtatcaacaa tctattaacg tacctgatac cttctggggc 120

gaacagggaa aaattcttga ctggatcaaa ccttaccaga aggtgaaaaa cacctccttt 180

gcccccggta atgtgtccat taaatggtac gaggacggca cgctgaatct ggcggcaaac 240

tgccttgacc gccatctgca agaaaacggc gatcgtaccg ccatcatctg ggaaggcgac 300

gacgccagcc agagcaaaca tatcagctat aaagagctgc accgcgacgt ctgccgcttc 360

gccaataccc tgctcgagct gggcattaaa aaaggtgatg tggtggcgat ttatatgccg 420

atggtgccgg aagccgcggt tgcgatgctg gcctgcgccc gcattggcgc ggtgcattcg 480

gtgattttcg gcggcttctc gccggaagcc gttgccgggc gcattattga ttccaactca 540

cgactggtga tcacttccga cgaaggtgtg cgtgccgggc gcagtattcc gctgaagaaa 600

aacgttgatg acgcgctgaa aaacccgaac gtcaccagcg tagagcatgt ggtggtactg 660

aagcgtactg gcgggaaaat tgactggcag gaagggcgcg acctgtggtg gcacgacctg 720

gttgagcaag cgagcgatca gcaccaggcg gaagagatga acgccgaaga tccgctgttt 780

attctctaca cctccggttc taccggtaag ccaaaaggtg tgctgcatac taccggcggt 840

tatctggtgt acgcggcgct gacctttaaa tatgtctttg attatcatcc gggtgatatc 900

tactggtgca ccgccgatgt gggctgggtg accggacaca gttacttgct gtacggcccg 960

ctggcctgcg gtgcgaccac gctgatgttt gaaggcgtac ccaactggcc gacgcctgcc 1020

cgtatggcgc aggtggtgga caagcatcag gtcaatattc tctataccgc acccacggcg 1080

atccgcgcgc tgatggcgga aggcgataaa gcgatcgaag gcaccgaccg ttcgtcgctg 1140

cgcattctcg gttccgtggg cgagccaatt aacccggaag cgtgggagtg gtactggaaa 1200

aaaatcggca acgagaaatg tccggtggtc gatacctggt ggcagaccga aaccggcggt 1260

ttcatgatca ccccgctgcc tggcgctacc gagctgaaag ccggttcggc aacacgtccg 1320

ttcttcggcg tgcaaccggc gctggtcgat aacgaaggta acccgctgga gggggccacc 1380

gaaggtagcc tggtaatcac cgactcctgg ccgggtcagg cgcgtacgct gtttggcgat 1440

cacgaacgtt ttgaacagac ctacttctcc accttcaaaa atatgtattt cagcggcgac 1500

ggcgcgcgtc gcgatgaaga tggctattac tggataaccg ggcgtgtgga cgacgtgctg 1560

aacgtctccg gtcaccgtct ggggacggca gagattgagt cggcgctggt ggcgcatccg 1620

aagattgccg aagccgccgt agtaggtatt ccgcacaata ttaaaggtca ggcgatctac 1680

gcctacgtca cgcttaatca cggggaggaa ccgtcaccag aactgtacgc agaagtccgc 1740

aactgggtgc gtaaagagat tggcccgctg gcgacgccag acgtgctgca ctggaccgac 1800

tccctgccta aaacccgctc cggcaaaatt atgcgccgta ttctgcgcaa aattgcggcg 1860

ggcgatacca gcaacctggg cgatacctcg acgcttgccg atcctggcgt agtcgagaag 1920

ctgcttgaag agaagcaggc tatcgcgatg ccatcgtaa 1959

<210> 11

<211> 37

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> PlysC-argA-F

<400> 11

gaaaggtgca caaagatggt aaaggaacgt aaaaccg 37

<210> 12

<211> 34

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Tn-argA-RXh

<400> 12

gcccactagt ctcgagcatg cggcgttgat tttg 34

<210> 13

<211> 34

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Tn-PlysC-FXh

<400> 13

gaatgagttc ctcgagccga tgctagggcg aaaa 34

<210> 14

<211> 36

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> PlysC-R

<400> 14

ctttgtgcac ctttcgatct acgtgctgac agttac 36

<210> 15

<211> 35

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> PlysC-argE-F

<400> 15

gaaaggtgca caaagatgaa aaacaaatta ccgcc 35

<210> 16

<211> 36

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Tn-argE-RXh

<400> 16

gcccactagt ctcgaggttt gagtcactgt cggtcg 36

<210> 17

<211> 38

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Pro-pta-FX

<400> 17

ccggggatcc tctagagggg ttctaaaaaa tgtggagt 38

<210> 18

<211> 43

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> pta-PlysC-R

<400> 18

gccgtgcttt tcgccctagc atcggacatc gcctttctaa ttt 43

<210> 19

<211> 25

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> PlysC-F

<400> 19

ccgatgctag ggcgaaaagc acggc 25

<210> 20

<211> 40

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> PlysC-pta-ackA-F

<400> 20

gaaaggtgca caaagatgtc tgacacaccg acctcagctc 40

<210> 21

<211> 34

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Pro-pta-RX

<400> 21

gcaggtcgac tctagattat ccggcattgg ctct 34

<210> 22

<211> 18

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Pta-ackA-R

<400> 22

tgcagtttca ccccttaa 18

<210> 23

<211> 43

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> 13869_pta-PlysC-R

<400> 23

gccgtgcttt tcgccctagc atcggacatc gcctttctag ttt 43

<210> 24

<211> 33

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> PlysC-acs-F

<400> 24

gaaaggtgca caaagatgag ccaaattcac aaa 33

<210> 25

<211> 36

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Tn-acs-RXh

<400> 25

gcccactagt ctcgagaagg cgtttacgcc gcatcc 36

<210> 26

<211> 494

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 putrescine exporter

<400> 26

Met Thr Ser Glu Thr Leu Gln Ala Gln Ala Pro Thr Lys Thr Gln Arg

1 5 10 15

Trp Ala Phe Leu Ala Val Ile Ser Gly Gly Leu Phe Leu Ile Gly Val

20 25 30

Asp Asn Ser Ile Leu Tyr Thr Ala Leu Pro Leu Leu Arg Glu Gln Leu

35 40 45

Ala Ala Thr Glu Thr Gln Ala Leu Trp Ile Ile Asn Ala Tyr Pro Leu

50 55 60

Leu Met Ala Gly Leu Leu Leu Gly Thr Gly Thr Leu Gly Asp Lys Ile

65 70 75 80

Gly His Arg Arg Met Phe Leu Met Gly Leu Ser Ile Phe Gly Ile Ala

85 90 95

Ser Leu Gly Ala Ala Phe Ala Pro Thr Ala Trp Ala Leu Val Ala Ala

100 105 110

Arg Ala Phe Leu Gly Ile Gly Ala Ala Thr Met Met Pro Ala Thr Leu

115 120 125

Ala Leu Ile Arg Ile Thr Phe Glu Asp Glu Arg Glu Arg Asn Thr Ala

130 135 140

Ile Gly Ile Trp Gly Ser Val Ala Ile Leu Gly Ala Ala Ala Gly Pro

145 150 155 160

Ile Ile Gly Gly Ala Leu Leu Glu Phe Phe Trp Trp Gly Ser Val Phe

165 170 175

Leu Ile Asn Val Pro Val Ala Val Ile Ala Leu Ile Ala Thr Leu Phe

180 185 190

Val Ala Pro Ala Asn Ile Ala Asn Pro Ser Lys His Trp Asp Phe Leu

195 200 205

Ser Ser Phe Tyr Ala Leu Leu Thr Leu Ala Gly Leu Ile Ile Thr Ile

210 215 220

Lys Glu Ser Val Asn Thr Ala Arg His Met Pro Leu Leu Leu Gly Ala

225 230 235 240

Val Ile Met Leu Ile Ile Gly Ala Val Leu Phe Ser Ser Arg Gln Lys

245 250 255

Lys Ile Glu Glu Pro Leu Leu Asp Leu Ser Leu Phe Arg Asn Arg Leu

260 265 270

Phe Leu Gly Gly Val Val Ala Ala Gly Met Ala Met Phe Thr Val Ser

275 280 285

Gly Leu Glu Met Thr Thr Ser Gln Arg Phe Gln Leu Ser Val Gly Phe

290 295 300

Thr Pro Leu Glu Ala Gly Leu Leu Met Ile Pro Ala Ala Leu Gly Ser

305 310 315 320

Phe Pro Met Ser Ile Ile Gly Gly Ala Asn Leu His Arg Trp Gly Phe

325 330 335

Lys Pro Leu Ile Ser Gly Gly Phe Ala Ala Thr Ala Val Gly Ile Ala

340 345 350

Leu Cys Ile Trp Gly Ala Thr His Thr Asp Gly Leu Pro Phe Phe Ile

355 360 365

Ala Gly Leu Phe Phe Met Gly Ala Gly Ala Gly Ser Val Met Ser Val

370 375 380

Ser Ser Thr Ala Ile Ile Gly Ser Ala Pro Val Arg Lys Ala Gly Met

385 390 395 400

Ala Ser Ser Ile Glu Glu Val Ser Tyr Glu Phe Gly Thr Leu Leu Ser

405 410 415

Val Ala Ile Leu Gly Ser Leu Phe Pro Phe Phe Tyr Ser Leu His Ala

420 425 430

Pro Ala Glu Val Ala Asp Asn Phe Ser Ala Gly Val His His Ala Ile

435 440 445

Asp Gly Asp Ala Ala Arg Ala Ser Leu Asp Thr Ala Tyr Ile Asn Val

450 455 460

Leu Ile Ile Ala Leu Val Cys Ala Val Ala Ala Ala Leu Ile Ser Ser

465 470 475 480

Tyr Leu Phe Arg Gly Asn Pro Lys Gly Ala Asn Asn Ala His

485 490

<210> 27

<211> 1485

<212> DNA

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 putrescine exporter

<400> 27

atgacttcag aaaccttaca ggcgcaagcg cctacgaaaa cccaacgttg ggctttcctc 60

gccgttatca gcggtggtct ctttctgatc ggtgtagaca actcgattct ctacaccgca 120

ctccctctgc tgcgtgaaca gctcgcagcc accgaaaccc aagcgttgtg gatcatcaac 180

gcatatcccc tgctcatggc gggccttctt ttgggtaccg gcactttggg tgacaaaatc 240

ggccaccgcc ggatgttcct catgggcttg agcattttcg gaatcgcttc acttggtgct 300

gcgtttgctc caactgcgtg ggctcttgtt gctgcgagag ctttccttgg catcggtgcg 360

gcaacgatga tgcctgcaac cttggctctg atccgcatta cgtttgagga tgagcgtgag 420

cgcaacactg caattggtat ttggggttcc gtggcaattc ttggcgctgc ggcaggcccg 480

atcattggtg gtgcgctgtt ggaattcttc tggtggggtt cggttttcct cattaacgtt 540

ccggtggctg ttatcgcgtt gatcgctacg ctttttgtgg cgccggccaa tatcgcgaat 600

ccgtctaagc attgggattt cttgtcgtcg ttctatgcgc tgctcacact tgctgggttg 660

atcatcacga tcaaggaatc tgtgaatact gcacgccata tgcctcttct tttgggtgca 720

gtcatcatgt tgatcattgg tgcggtgttg tttagcagtc gtcagaagaa gatcgaggag 780

ccacttctag atctgtcgtt gttccgtaat cgccttttct taggcggtgt ggttgctgcg 840

ggcatggcga tgtttactgt gtccggtttg gaaatgacta cctcgcagcg tttccagttg 900

tctgtgggtt tcactccact tgaggctggt ttgctcatga tcccagctgc attgggtagc 960

ttcccgatgt ctattatcgg tggtgcaaac ctgcatcgtt ggggcttcaa accgctgatc 1020

agtggtggtt ttgctgccac tgccgttggc atcgccctgt gtatttgggg cgcgactcat 1080

actgatggtt tgccgttttt catcgcgggt ctattcttca tgggcgcggg tgctggttcg 1140

gtaatgtctg tgtcttccac tgcgattatc ggttccgcgc cggtgcgtaa ggctggcatg 1200

gcgtcgtcga tcgaagaggt ctcttatgag ttcggcacgc tgttgtctgt cgcgattttg 1260

ggtagcttgt tcccattctt ctactcgctg catgccccgg cagaggttgc ggataacttc 1320

tcggcgggtg ttcaccacgc gattgatggc gatgcggcgc gtgcatcttt ggacaccgca 1380

tacattaacg tgttgatcat tgccctagta tgcgcagtag cggctgctct gatcagcagt 1440

taccttttcc gcggaaatcc gaagggagcc aataatgcgc actag 1485

<210> 28

<211> 494

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13869 putrescine exporter

<400> 28

Met Ile Ser Glu Thr Leu Gln Ala Gln Ala Pro Thr Lys Thr Gln Arg

1 5 10 15

Trp Ala Phe Leu Ala Val Ile Ser Gly Gly Leu Phe Leu Ile Gly Val

20 25 30

Asp Asn Ser Ile Leu Tyr Thr Ala Leu Pro Leu Leu Arg Glu Gln Leu

35 40 45

Ala Ala Thr Glu Thr Gln Ala Leu Trp Ile Ile Asn Ala Tyr Pro Leu

50 55 60

Leu Met Ala Gly Leu Leu Leu Gly Thr Gly Thr Leu Gly Asp Lys Ile

65 70 75 80

Gly His Arg Arg Met Phe Leu Met Gly Leu Ser Ile Phe Gly Ile Ala

85 90 95

Ser Leu Gly Ala Ala Phe Ala Pro Thr Ala Trp Ala Leu Val Ala Ala

100 105 110

Arg Ala Phe Leu Gly Ile Gly Ala Ala Thr Met Met Pro Ala Thr Leu

115 120 125

Ala Leu Ile Arg Ile Thr Phe Glu Asp Glu Arg Glu Arg Asn Thr Ala

130 135 140

Ile Gly Ile Trp Gly Ser Val Ala Ile Leu Gly Ala Ala Ala Gly Pro

145 150 155 160

Ile Ile Gly Gly Ala Leu Leu Glu Phe Phe Trp Trp Gly Ser Val Phe

165 170 175

Leu Ile Asn Val Pro Val Ala Val Ile Ala Leu Ile Ala Thr Leu Phe

180 185 190

Val Ala Pro Ala Asn Ile Ala Asn Pro Ser Lys His Trp Asp Phe Leu

195 200 205

Ser Ser Phe Tyr Ala Leu Leu Thr Leu Ala Gly Leu Ile Val Thr Ile

210 215 220

Lys Glu Ser Val Asn Thr Ala Arg His Leu Pro Leu Leu Val Gly Ala

225 230 235 240

Ile Ile Leu Leu Ile Ile Gly Ala Val Leu Phe Ser Ser Arg Gln Lys

245 250 255

Lys Ile Glu Glu Pro Leu Leu Asp Leu Ser Leu Phe Arg Asn Arg Leu

260 265 270

Phe Leu Gly Gly Val Val Ala Ala Gly Met Ala Met Phe Thr Val Ser

275 280 285

Gly Leu Glu Met Thr Thr Ser Gln Arg Phe Gln Leu Ser Val Gly Phe

290 295 300

Thr Pro Leu Glu Ala Gly Leu Leu Met Ile Pro Ala Ala Leu Gly Ser

305 310 315 320

Phe Pro Met Ser Ile Ile Gly Gly Ala Asn Leu His Arg Trp Gly Phe

325 330 335

Lys Pro Leu Ile Ser Gly Gly Phe Leu Ala Thr Ala Val Gly Ile Ala

340 345 350

Leu Cys Ile Trp Gly Ala Thr His Thr Asp Gly Leu Pro Phe Phe Ile

355 360 365

Ala Gly Leu Phe Phe Met Gly Ala Gly Ala Gly Ser Val Met Ser Val

370 375 380

Ser Ser Thr Ala Ile Ile Gly Ser Ala Pro Val Arg Lys Ala Gly Met

385 390 395 400

Ala Ser Ser Ile Glu Glu Val Ser Tyr Glu Phe Gly Thr Leu Leu Ser

405 410 415

Val Ala Ile Leu Gly Ser Leu Phe Pro Phe Phe Tyr Ser Leu His Ala

420 425 430

Pro Ala Glu Val Ala Asp Asn Phe Ser Ala Gly Val His His Ala Ile

435 440 445

Tyr Gly Asp Ala Ala Arg Ala Ser Leu Asp Thr Ala Tyr Ile Asn Val

450 455 460

Leu Ile Ile Ala Leu Val Cys Ala Val Ala Ala Ala Leu Ile Ser Ser

465 470 475 480

Tyr Leu Phe Arg Gly Asn Pro Lys Gly Ala Asn Asn Ala His

485 490

<210> 29

<211> 1485

<212> DNA

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13869 putrescine exporter

<400> 29

atgatttcag aaactttgca ggcgcaagcg cctacgaaaa cccaacgttg ggctttcctc 60

gctgttatca gcggtggtct ctttctgatc ggtgtagaca actcaatcct ctacaccgca 120

ctccccctgc tgcgtgaaca actcgcagcc actgaaaccc aagcgttgtg gatcatcaac 180

gcatatcccc tgctcatggc gggtcttctt ttgggtaccg gcactttggg tgacaaaatc 240

ggccaccgcc ggatgttcct catgggcttg agcattttcg gaatcgcttc acttggcgct 300

gcgtttgctc caactgcgtg ggctcttgtt gctgcgagag ctttccttgg catcggtgcg 360

gcgacgatga tgcccgcaac cttggctctg atccgcatta cgtttgaaga tgaacgcgaa 420

cggaacaccg cgattggcat ttggggttct gtggcaattc ttggcgcggc ggcaggtccg 480

atcattggtg gtgcgctgtt ggaattcttc tggtggggtt cggttttcct cattaacgtt 540

ccggtggctg ttatcgcgtt gatcgctacg ctttttgtgg cgccggccaa tatcgcgaat 600

ccgtccaagc actgggattt cttatcctcg ttctatgcat tgcttaccct tgcaggtttg 660

attgtcacca tcaaagaatc ggtaaacact gcacgtcatc tgccactgct tgtaggtgcc 720

atcatcttgc ttatcattgg tgcggtgttg tttagcagtc gtcagaagaa gatcgaggag 780

ccacttctag atctgtcgtt gttccgtaat cgccttttct taggcggtgt ggttgctgcg 840

ggcatggcga tgtttactgt gtccggtttg gaaatgacta cctcgcagcg tttccagttg 900

tctgtgggtt tcactccact tgaggctggt ttgctcatga tcccagctgc attgggtagc 960

ttcccgatgt ctattatcgg tggtgcaaac ttgcatcgtt ggggcttcaa accgctgatc 1020

agtggtggtt tccttgccac ggcagtcggc atcgccctgt gtatttgggg cgcgactcat 1080

actgatggtt tgccgttttt catcgcgggt ctgttcttca tgggcgcggg tgctggttcg 1140

gtaatgtctg tgtcttccac tgcgattatc ggttccgcgc cggtgcgtaa ggctggcatg 1200

gcgtcgtcga tcgaagaggt ctcttatgag ttcggcacgc tgttgtctgt cgcgattttg 1260

ggtagcttgt tcccattctt ctactcgctg catgccccgg cagaggttgc ggataacttc 1320

tcggcgggtg ttcaccacgc gatttatggc gatgcggcgc gtgcatcttt ggacaccgca 1380

tacattaacg tgttgatcat tgccctagta tgcgcagtag cggctgctct gatcagcagt 1440

taccttttcc gcggaaatcc gaagggagcc aataatgcgc actag 1485

<210> 30

<211> 203

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13032 acetyltransferase

<400> 30

Met Ser Pro Thr Val Leu Pro Ala Thr Gln Ala Asp Phe Pro Lys Ile

1 5 10 15

Val Asp Val Leu Val Glu Ala Phe Ala Asn Asp Pro Ala Phe Leu Arg

20 25 30

Trp Ile Pro Gln Pro Asp Pro Gly Ser Ala Lys Leu Arg Ala Leu Phe

35 40 45

Glu Leu Gln Ile Glu Lys Gln Tyr Ala Val Ala Gly Asn Ile Asp Val

50 55 60

Ala Arg Asp Ser Glu Gly Glu Ile Val Gly Val Ala Leu Trp Asp Arg

65 70 75 80

Pro Asp Gly Asn His Ser Ala Lys Asp Gln Ala Ala Met Leu Pro Arg

85 90 95

Leu Val Ser Ile Phe Gly Ile Lys Ala Ala Gln Val Ala Trp Thr Asp

100 105 110

Leu Ser Ser Ala Arg Phe His Pro Lys Phe Pro His Trp Tyr Leu Tyr

115 120 125

Thr Val Ala Thr Ser Ser Ser Ala Arg Gly Thr Gly Val Gly Ser Ala

130 135 140

Leu Leu Asn His Gly Ile Ala Arg Ala Gly Asp Glu Ala Ile Tyr Leu

145 150 155 160

Glu Ala Thr Ser Thr Arg Ala Ala Gln Leu Tyr Asn Arg Leu Gly Phe

165 170 175

Val Pro Leu Gly Tyr Ile Pro Ser Asp Asp Asp Gly Thr Pro Glu Leu

180 185 190

Ala Met Trp Lys Pro Pro Ala Met Pro Thr Val

195 200

<210> 31

<211> 203

<212> PRT

<213> Corynebacterium glutamicum ATCC 13869 acetyltransferase

<400> 31

Met Ser Pro Thr Val Leu Pro Ala Thr Gln Ala Asp Phe Pro Lys Ile

1 5 10 15

Val Asp Val Leu Val Glu Ala Phe Ala Asn Asp Pro Ala Phe Leu Arg

20 25 30

Trp Ile Pro Gln Pro Asp Pro Gly Ser Ala Lys Leu Arg Ala Leu Phe

35 40 45

Glu Leu Gln Ile Glu Lys Gln Tyr Ala Val Ala Gly Asn Ile Asp Val

50 55 60

Ala Arg Asp Ser Glu Gly Glu Ile Val Gly Val Ala Leu Trp Asp Arg

65 70 75 80

Pro Asp Gly Asn His Ser Ala Lys Asp Gln Ala Ala Ile Leu Pro Arg

85 90 95

Leu Val Ser Ile Phe Gly Ile Lys Ala Ala Gln Val Ala Trp Thr Asp

100 105 110

Leu Ser Ser Ala Arg Phe His Pro Lys Phe Pro His Trp Tyr Leu Tyr

115 120 125

Thr Val Ala Thr Ser Ser Ser Ala Arg Gly Thr Gly Val Gly Ser Ala

130 135 140

Leu Leu Asn His Gly Ile Ala Arg Ala Gly Asp Glu Ala Ile Tyr Leu

145 150 155 160

Glu Ala Thr Ser Thr Arg Ala Ala Gln Leu Tyr Asn Arg Leu Gly Phe

165 170 175

Val Pro Leu Gly Tyr Ile Pro Ser Asp Asp Asp Gly Thr Pro Glu Leu

180 185 190

Ala Met Trp Lys Pro Pro Ala Met Pro Thr Val

195 200

<210> 32

<211> 357

<212> PRT

<213> Acetyl gamma glutamyl phosphate reductase (ArgC)

<400> 32

Met Ile Met His Asn Val Tyr Gly Val Thr Met Thr Ile Lys Val Ala

1 5 10 15

Ile Ala Gly Ala Ser Gly Tyr Ala Gly Gly Glu Ile Leu Arg Leu Leu

20 25 30

Leu Gly His Pro Ala Tyr Ala Ser Gly Glu Leu Glu Ile Gly Ala Leu

35 40 45

Thr Ala Ala Ser Thr Ala Gly Ser Thr Leu Gly Glu Leu Met Pro His

50 55 60

Ile Pro Gln Leu Ala Asp Arg Val Ile Gln Asp Thr Thr Ala Glu Thr

65 70 75 80

Leu Ala Gly His Asp Val Val Phe Leu Gly Leu Pro His Gly Phe Ser

85 90 95

Ala Glu Ile Ala Leu Gln Leu Gly Pro Asp Val Thr Val Ile Asp Cys

100 105 110

Ala Ala Asp Phe Arg Leu Gln Asn Ala Ala Asp Trp Glu Lys Phe Tyr

115 120 125

Gly Ser Glu His Gln Gly Thr Trp Pro Tyr Gly Ile Pro Glu Met Pro

130 135 140

Gly His Arg Glu Ala Leu Arg Gly Ala Lys Arg Val Ala Val Pro Gly

145 150 155 160

Cys Phe Pro Thr Gly Ala Thr Leu Ala Leu Leu Pro Ala Val Gln Ala

165 170 175

Gly Leu Ile Glu Pro Asp Val Ser Val Val Ser Ile Thr Gly Val Ser

180 185 190

Gly Ala Gly Lys Lys Ala Ser Val Ala Leu Leu Gly Ser Glu Thr Met

195 200 205

Gly Ser Leu Lys Ala Tyr Asn Thr Ser Gly Lys His Arg His Thr Pro

210 215 220

Glu Ile Ala Gln Asn Leu Gly Glu Val Ser Asp Lys Pro Val Lys Val

225 230 235 240

Ser Phe Thr Pro Val Leu Ala Pro Leu Pro Arg Gly Ile Leu Thr Thr

245 250 255

Ala Thr Ala Pro Leu Lys Glu Gly Val Thr Ala Glu Gln Ala Arg Ala

260 265 270

Val Tyr Glu Glu Phe Tyr Ala Gln Glu Thr Phe Val His Val Leu Pro

275 280 285

Glu Gly Ala Gln Pro Gln Thr Gln Ala Val Leu Gly Ser Asn Met Cys

290 295 300

His Val Gln Val Glu Ile Asp Glu Glu Ala Gly Lys Val Leu Val Thr

305 310 315 320

Ser Ala Ile Asp Asn Leu Thr Lys Gly Thr Ala Gly Ala Ala Val Gln

325 330 335

Cys Met Asn Leu Ser Val Gly Phe Asp Glu Ala Ala Gly Leu Pro Gln

340 345 350

Val Gly Val Ala Pro

355

<210> 33

<211> 388

<212> PRT

<213> Acetyl glutamate synthase or Ornithine acetyl transferase (ArgJ)

<400> 33

Met Ala Glu Lys Gly Ile Thr Ala Pro Lys Gly Phe Val Ala Ser Ala

1 5 10 15

Thr Thr Ala Gly Ile Lys Ala Ser Gly Asn Pro Asp Met Ala Leu Val

20 25 30

Val Asn Gln Gly Pro Glu Phe Ser Ala Ala Ala Val Phe Thr Arg Asn

35 40 45

Arg Val Phe Ala Ala Pro Val Lys Val Ser Arg Glu Asn Val Ala Asp

50 55 60

Gly Gln Ile Arg Ala Val Leu Tyr Asn Ala Gly Asn Ala Asn Ala Cys

65 70 75 80

Asn Gly Leu Gln Gly Glu Lys Asp Ala Arg Glu Ser Val Ser His Leu

85 90 95

Ala Gln Asn Leu Gly Leu Glu Asp Ser Asp Ile Gly Val Cys Ser Thr

100 105 110

Gly Leu Ile Gly Glu Leu Leu Pro Met Asp Lys Leu Asn Ala Gly Ile

115 120 125

Asp Gln Leu Thr Ala Glu Gly Ala Leu Gly Asp Asn Gly Ala Ala Ala

130 135 140

Ala Lys Ala Ile Met Thr Thr Asp Thr Val Asp Lys Glu Thr Val Val

145 150 155 160

Phe Ala Asp Gly Trp Thr Val Gly Gly Met Gly Lys Gly Val Gly Met

165 170 175

Met Ala Pro Ser Leu Ala Thr Met Leu Val Cys Leu Thr Thr Asp Ala

180 185 190

Ser Val Thr Gln Glu Met Ala Gln Ile Ala Leu Ala Asn Ala Thr Ala

195 200 205

Val Thr Phe Asp Thr Leu Asp Ile Asp Gly Ser Thr Ser Thr Asn Asp

210 215 220

Thr Val Phe Leu Leu Ala Ser Gly Ala Ser Gly Ile Thr Pro Thr Gln

225 230 235 240

Asp Glu Leu Asn Asp Ala Val Tyr Ala Ala Cys Ser Asp Ile Ala Ala

245 250 255

Lys Leu Gln Ala Asp Ala Glu Gly Val Thr Lys Arg Val Ala Val Thr

260 265 270

Val Val Gly Thr Thr Asn Asn Glu Gln Ala Ile Asn Ala Ala Arg Thr

275 280 285

Val Ala Arg Asp Asn Leu Phe Lys Cys Ala Met Phe Gly Ser Asp Pro

290 295 300

Asn Trp Gly Arg Val Leu Ala Ala Val Gly Met Ala Asp Ala Asp Met

305 310 315 320

Glu Pro Glu Lys Ile Ser Val Phe Phe Asn Gly Gln Ala Val Cys Leu

325 330 335

Asp Ser Thr Gly Ala Pro Gly Ala Arg Glu Val Asp Leu Ser Gly Ala

340 345 350

Asp Ile Asp Val Arg Ile Asp Leu Gly Thr Ser Gly Glu Gly Gln Ala

355 360 365

Thr Val Arg Thr Thr Asp Leu Ser Phe Ser Tyr Val Glu Ile Asn Ser

370 375 380

Ala Tyr Ser Ser

385

<210> 34

<211> 317

<212> PRT

<213> Acetyl glutamate kinase (ArgB)

<400> 34

Met Asn Asp Leu Ile Lys Asp Leu Gly Ser Glu Val Arg Ala Asn Val

1 5 10 15

Leu Ala Glu Ala Leu Pro Trp Leu Gln His Phe Arg Asp Lys Ile Val

20 25 30

Val Val Lys Tyr Gly Gly Asn Ala Met Val Asp Asp Asp Leu Lys Ala

35 40 45

Ala Phe Ala Ala Asp Met Val Phe Leu Arg Thr Val Gly Ala Lys Pro

50 55 60

Val Val Val His Gly Gly Gly Pro Gln Ile Ser Glu Met Leu Asn Arg

65 70 75 80

Val Gly Leu Gln Gly Glu Phe Lys Gly Gly Phe Arg Val Thr Thr Pro

85 90 95

Glu Val Met Asp Ile Val Arg Met Val Leu Phe Gly Gln Val Gly Arg

100 105 110

Asp Leu Val Gly Leu Ile Asn Ser His Gly Pro Tyr Ala Val Gly Thr

115 120 125

Ser Gly Glu Asp Ala Gly Leu Phe Thr Ala Gln Lys Arg Met Val Asn

130 135 140

Ile Asp Gly Val Pro Thr Asp Ile Gly Leu Val Gly Asp Ile Ile Asn

145 150 155 160

Val Asp Ala Ser Ser Leu Met Asp Ile Ile Glu Ala Gly Arg Ile Pro

165 170 175

Val Val Ser Thr Ile Ala Pro Gly Glu Asp Gly Gln Ile Tyr Asn Ile

180 185 190

Asn Ala Asp Thr Ala Ala Gly Ala Leu Ala Ala Ala Ile Gly Ala Glu

195 200 205

Arg Leu Leu Val Leu Thr Asn Val Glu Gly Leu Tyr Thr Asp Trp Pro

210 215 220

Asp Lys Ser Ser Leu Val Ser Lys Ile Lys Ala Thr Glu Leu Glu Ala

225 230 235 240

Ile Leu Pro Gly Leu Asp Ser Gly Met Ile Pro Lys Met Glu Ser Cys

245 250 255

Leu Asn Ala Val Arg Gly Gly Val Ser Ala Ala His Val Ile Asp Gly

260 265 270

Arg Ile Ala His Ser Val Leu Leu Glu Leu Leu Thr Met Gly Gly Ile

275 280 285

Gly Thr Met Val Leu Pro Asp Val Phe Asp Arg Glu Asn Tyr Pro Glu

290 295 300

Gly Thr Val Phe Arg Lys Asp Asp Lys Asp Gly Glu Leu

305 310 315

<210> 35

<211> 391

<212> PRT

<213> Acetyl ornithine aminotransferase (ArgD)

<400> 35

Met Ser Thr Leu Glu Thr Trp Pro Gln Val Ile Ile Asn Thr Tyr Gly

1 5 10 15

Thr Pro Pro Val Glu Leu Val Ser Gly Lys Gly Ala Thr Val Thr Asp

20 25 30

Asp Gln Gly Asn Val Tyr Ile Asp Leu Leu Ala Gly Ile Ala Val Asn

35 40 45

Ala Leu Gly His Ala His Pro Ala Ile Ile Glu Ala Val Thr Asn Gln

50 55 60

Ile Gly Gln Leu Gly His Val Ser Asn Leu Phe Ala Ser Arg Pro Val

65 70 75 80

Val Glu Val Ala Glu Glu Leu Ile Lys Arg Phe Ser Leu Asp Asp Ala

85 90 95

Thr Leu Ala Ala Gln Thr Arg Val Phe Phe Cys Asn Ser Gly Ala Glu

100 105 110

Ala Asn Glu Ala Ala Phe Lys Ile Ala Arg Leu Thr Gly Arg Ser Arg

115 120 125

Ile Leu Ala Ala Val His Gly Phe His Gly Arg Thr Met Gly Ser Leu

130 135 140

Ala Leu Thr Gly Gln Pro Asp Lys Arg Glu Ala Phe Leu Pro Met Pro

145 150 155 160

Ser Gly Val Glu Phe Tyr Pro Tyr Gly Asp Thr Asp Tyr Leu Arg Lys

165 170 175

Met Val Glu Thr Asn Pro Thr Asp Val Ala Ala Ile Phe Leu Glu Pro

180 185 190

Ile Gln Gly Glu Thr Gly Val Val Pro Ala Pro Glu Gly Phe Leu Lys

195 200 205

Ala Val Arg Glu Leu Cys Asp Glu Tyr Gly Ile Leu Met Ile Thr Asp

210 215 220

Glu Val Gln Thr Gly Val Gly Arg Thr Gly Asp Phe Phe Ala His Gln

225 230 235 240

His Asp Gly Val Val Pro Asp Val Val Thr Met Ala Lys Gly Leu Gly

245 250 255

Gly Gly Leu Pro Ile Gly Ala Cys Leu Ala Thr Gly Arg Ala Ala Glu

260 265 270

Leu Met Thr Pro Gly Lys His Gly Thr Thr Phe Gly Gly Asn Pro Val

275 280 285

Ala Cys Ala Ala Ala Lys Ala Val Leu Ser Val Val Asp Asp Ala Phe

290 295 300

Cys Ala Glu Val Ala Arg Lys Gly Glu Leu Phe Lys Glu Leu Leu Ala

305 310 315 320

Lys Val Asp Gly Val Val Asp Val Arg Gly Arg Gly Leu Met Leu Gly

325 330 335

Val Val Leu Glu Arg Asp Val Ala Lys Gln Ala Val Leu Asp Gly Phe

340 345 350

Lys His Gly Val Ile Leu Asn Ala Pro Ala Asp Asn Ile Ile Arg Leu

355 360 365

Thr Pro Pro Leu Val Ile Thr Asp Glu Glu Ile Ala Asp Ala Val Lys

370 375 380

Ala Ile Ala Glu Thr Ile Ala

385 390

<210> 36

<211> 319

<212> PRT

<213> Ornithine carbamoyl transferase (argF)

<400> 36

Met Thr Ser Gln Pro Gln Val Arg His Phe Leu Ala Asp Asp Asp Leu

1 5 10 15

Thr Pro Ala Glu Gln Ala Glu Val Leu Thr Leu Ala Ala Lys Leu Lys

20 25 30

Ala Ala Pro Phe Ser Glu Arg Pro Leu Glu Gly Pro Lys Ser Val Ala

35 40 45

Val Leu Phe Asp Lys Thr Ser Thr Arg Thr Arg Phe Ser Phe Asp Ala

50 55 60

Gly Ile Ala His Leu Gly Gly His Ala Ile Val Val Asp Ser Gly Ser

65 70 75 80

Ser Gln Met Gly Lys Gly Glu Ser Leu Gln Asp Thr Ala Ala Val Leu

85 90 95

Ser Arg Tyr Val Glu Ala Ile Val Trp Arg Thr Tyr Ala His Ser Asn

100 105 110

Phe His Ala Met Ala Glu Thr Ser Thr Val Pro Leu Val Asn Ser Leu

115 120 125

Ser Asp Asp Leu His Pro Cys Gln Ile Leu Ala Asp Leu Gln Thr Ile

130 135 140

Val Glu Asn Leu Ser Pro Glu Glu Gly Pro Ala Gly Leu Lys Gly Lys

145 150 155 160

Lys Ala Val Tyr Leu Gly Asp Gly Asp Asn Asn Met Ala Asn Ser Tyr

165 170 175

Met Ile Gly Phe Ala Thr Ala Gly Met Asp Ile Ser Ile Ile Ala Pro

180 185 190

Glu Gly Phe Gln Pro Arg Ala Glu Phe Val Glu Arg Ala Glu Lys Arg

195 200 205

Gly Gln Glu Thr Gly Ala Lys Val Val Val Thr Asp Ser Leu Asp Glu

210 215 220

Val Ala Gly Ala Asp Val Val Ile Thr Asp Thr Trp Val Ser Met Gly

225 230 235 240

Met Glu Asn Asp Gly Ile Asp Arg Thr Thr Pro Phe Val Pro Tyr Gln

245 250 255

Val Asn Asp Glu Val Met Ala Lys Ala Asn Asp Gly Ala Ile Phe Leu

260 265 270

His Cys Leu Pro Ala Tyr Arg Gly Lys Glu Val Ala Ala Ser Val Ile

275 280 285

Asp Gly Pro Ala Ser Lys Val Phe Asp Glu Ala Glu Asn Arg Leu His

290 295 300

Ala Gln Lys Ala Leu Leu Val Trp Leu Leu Ala Asn Gln Pro Arg

305 310 315

<210> 37

<211> 533

<212> PRT

<213> Glutamate expoter (NCgl1221)

<400> 37

Met Ile Leu Gly Val Pro Ile Gln Tyr Leu Leu Tyr Ser Leu Trp Asn

1 5 10 15

Trp Ile Val Asp Thr Gly Phe Asp Val Ala Ile Ile Leu Val Leu Ala

20 25 30

Phe Leu Ile Pro Arg Ile Gly Arg Leu Ala Met Arg Ile Ile Lys Arg

35 40 45

Arg Val Glu Ser Ala Ala Asp Ala Asp Thr Thr Lys Asn Gln Leu Ala

50 55 60

Phe Ala Gly Val Gly Val Tyr Ile Ala Gln Ile Val Ala Phe Phe Met

65 70 75 80

Leu Ala Val Ser Ala Met Gln Ala Phe Gly Phe Ser Leu Ala Gly Ala

85 90 95

Ala Ile Pro Ala Thr Ile Ala Ser Ala Ala Ile Gly Leu Gly Ala Gln

100 105 110

Ser Ile Val Ala Asp Phe Leu Ala Gly Phe Phe Ile Leu Thr Glu Lys

115 120 125

Gln Phe Gly Val Gly Asp Trp Val Arg Phe Glu Gly Asn Gly Ile Val

130 135 140

Val Glu Gly Thr Val Ile Glu Ile Thr Met Arg Ala Thr Lys Ile Arg

145 150 155 160

Thr Ile Ala Gln Glu Thr Val Ile Ile Pro Asn Ser Thr Ala Lys Val

165 170 175

Cys Ile Asn Asn Ser Asn Asn Trp Ser Arg Ala Val Val Val Ile Pro

180 185 190

Ile Pro Met Leu Gly Ser Glu Asn Ile Thr Asp Val Ile Ala Arg Ser

195 200 205

Glu Ala Ala Thr Arg Arg Ala Leu Gly Gln Glu Lys Ile Ala Pro Glu

210 215 220

Ile Leu Gly Glu Leu Asp Val His Pro Ala Thr Glu Val Thr Pro Pro

225 230 235 240

Thr Val Val Gly Met Pro Trp Met Val Thr Met Arg Phe Leu Val Gln

245 250 255

Val Thr Ala Gly Asn Gln Trp Leu Val Glu Arg Ala Ile Arg Thr Glu

260 265 270

Ile Ile Ser Glu Phe Trp Glu Glu Tyr Gly Ser Ala Thr Thr Thr Ser

275 280 285

Gly Thr Leu Ile Asp Ser Leu His Val Glu His Glu Glu Pro Lys Thr

290 295 300

Ser Leu Ile Asp Ala Ser Pro Gln Ala Leu Lys Glu Pro Lys Pro Glu

305 310 315 320

Ala Ala Ala Thr Val Ala Ser Leu Ala Ala Ser Ser Asn Asp Asp Ala

325 330 335

Asp Asn Ala Asp Ala Ser Val Ile Asn Ala Gly Asn Pro Glu Lys Glu

340 345 350

Leu Asp Ser Asp Val Leu Glu Gln Glu Leu Ser Ser Glu Glu Pro Glu

355 360 365

Glu Thr Ala Lys Pro Asp His Ser Leu Arg Gly Phe Phe Arg Thr Asp

370 375 380

Tyr Tyr Pro Asn Arg Trp Gln Lys Ile Leu Ser Phe Gly Gly Arg Val

385 390 395 400

Arg Met Ser Thr Ser Leu Leu Leu Gly Ala Leu Leu Leu Leu Ser Leu

405 410 415

Phe Lys Val Met Thr Val Glu Pro Ser Glu Asn Trp Gln Asn Ser Ser

420 425 430

Gly Trp Leu Ser Pro Ser Thr Ala Thr Ser Thr Ala Val Thr Thr Ser

435 440 445

Glu Thr Ser Ala Pro Val Ser Thr Pro Ser Met Thr Val Pro Thr Thr

450 455 460

Val Glu Glu Thr Pro Thr Met Glu Ser Asn Val Glu Thr Gln Gln Glu

465 470 475 480

Thr Ser Thr Pro Ala Thr Ala Thr Pro Gln Arg Ala Asp Thr Ile Glu

485 490 495

Pro Thr Glu Glu Ala Thr Ser Gln Glu Glu Thr Thr Ala Ser Gln Thr

500 505 510

Gln Ser Pro Ala Val Glu Ala Pro Thr Ala Val Gln Glu Thr Val Ala

515 520 525

Pro Thr Ser Thr Pro

530

<210> 38

<211> 711

<212> PRT

<213> Ornithine decarboxylase (ODC)

<400> 38

Met Lys Ser Met Asn Ile Ala Ala Ser Ser Glu Leu Val Ser Arg Leu

1 5 10 15

Ser Ser His Arg Arg Val Val Ala Leu Gly Asp Thr Asp Phe Thr Asp

20 25 30

Val Ala Ala Val Val Ile Thr Ala Ala Asp Ser Arg Ser Gly Ile Leu

35 40 45

Ala Leu Leu Lys Arg Thr Gly Phe His Leu Pro Val Phe Leu Tyr Ser

50 55 60

Glu His Ala Val Glu Leu Pro Ala Gly Val Thr Ala Val Ile Asn Gly

65 70 75 80

Asn Glu Gln Gln Trp Leu Glu Leu Glu Ser Ala Ala Cys Gln Tyr Glu

85 90 95

Glu Asn Leu Leu Pro Pro Phe Tyr Asp Thr Leu Thr Gln Tyr Val Glu

100 105 110

Met Gly Asn Ser Thr Phe Ala Cys Pro Gly His Gln His Gly Ala Phe

115 120 125

Phe Lys Lys His Pro Ala Gly Arg His Phe Tyr Asp Phe Phe Gly Glu

130 135 140

Asn Val Phe Arg Ala Asp Met Cys Asn Ala Asp Val Lys Leu Gly Asp

145 150 155 160

Leu Leu Ile His Glu Gly Ser Ala Lys Asp Ala Gln Lys Phe Ala Ala

165 170 175

Lys Val Phe His Ala Asp Lys Thr Tyr Phe Val Leu Asn Gly Thr Ser

180 185 190

Ala Ala Asn Lys Val Val Thr Asn Ala Leu Leu Thr Arg Gly Asp Leu

195 200 205

Val Leu Phe Asp Arg Asn Asn His Lys Ser Asn His His Gly Ala Leu

210 215 220

Ile Gln Ala Gly Ala Thr Pro Val Tyr Leu Glu Ala Ser Arg Asn Pro

225 230 235 240

Phe Gly Phe Ile Gly Gly Ile Asp Ala His Cys Phe Asn Glu Glu Tyr

245 250 255

Leu Arg Gln Gln Ile Arg Asp Val Ala Pro Glu Lys Ala Asp Leu Pro

260 265 270

Arg Pro Tyr Arg Leu Ala Ile Ile Gln Leu Gly Thr Tyr Asp Gly Thr

275 280 285

Val Tyr Asn Ala Arg Gln Val Ile Asp Thr Val Gly His Leu Cys Asp

290 295 300

Tyr Ile Leu Phe Asp Ser Ala Trp Val Gly Tyr Glu Gln Phe Ile Pro

305 310 315 320

Met Met Ala Asp Ser Ser Pro Leu Leu Leu Glu Leu Asn Glu Asn Asp

325 330 335

Pro Gly Ile Phe Val Thr Gln Ser Val His Lys Gln Gln Ala Gly Phe

340 345 350

Ser Gln Thr Ser Gln Ile His Lys Lys Asp Asn His Ile Arg Gly Gln

355 360 365

Ala Arg Phe Cys Pro His Lys Arg Leu Asn Asn Ala Phe Met Leu His

370 375 380

Ala Ser Thr Ser Pro Phe Tyr Pro Leu Phe Ala Ala Leu Asp Val Asn

385 390 395 400

Ala Lys Ile His Glu Gly Glu Ser Gly Arg Arg Leu Trp Ala Glu Cys

405 410 415

Val Glu Ile Gly Ile Glu Ala Arg Lys Ala Ile Leu Ala Arg Cys Lys

420 425 430

Leu Phe Arg Pro Phe Ile Pro Pro Val Val Asp Gly Lys Leu Trp Gln

435 440 445

Asp Tyr Pro Thr Ser Val Leu Ala Ser Asp Arg Arg Phe Phe Ser Phe

450 455 460

Glu Pro Gly Ala Lys Trp His Gly Phe Glu Gly Tyr Ala Ala Asp Gln

465 470 475 480

Tyr Phe Val Asp Pro Cys Lys Leu Leu Leu Thr Thr Pro Gly Ile Asp

485 490 495

Ala Glu Thr Gly Glu Tyr Ser Asp Phe Gly Val Pro Ala Thr Ile Leu

500 505 510

Ala His Tyr Leu Arg Glu Asn Gly Ile Val Pro Glu Lys Cys Asp Leu

515 520 525

Asn Ser Ile Leu Phe Leu Leu Thr Pro Ala Glu Ser His Glu Lys Leu

530 535 540

Ala Gln Leu Val Ala Met Leu Ala Gln Phe Glu Gln His Ile Glu Asp

545 550 555 560

Asp Ser Pro Leu Val Glu Val Leu Pro Ser Val Tyr Asn Lys Tyr Pro

565 570 575

Val Arg Tyr Arg Asp Tyr Thr Leu Arg Gln Leu Cys Gln Glu Met His

580 585 590

Asp Leu Tyr Val Ser Phe Asp Val Lys Asp Leu Gln Lys Ala Met Phe

595 600 605

Arg Gln Gln Ser Phe Pro Ser Val Val Met Asn Pro Gln Asp Ala His

610 615 620

Ser Ala Tyr Ile Arg Gly Asp Val Glu Leu Val Arg Ile Arg Asp Ala

625 630 635 640

Glu Gly Arg Ile Ala Ala Glu Gly Ala Leu Pro Tyr Pro Pro Gly Val

645 650 655

Leu Cys Val Val Pro Gly Glu Val Trp Gly Gly Ala Val Gln Arg Tyr

660 665 670

Phe Leu Ala Leu Glu Glu Gly Val Asn Leu Leu Pro Gly Phe Ser Pro

675 680 685

Glu Leu Gln Gly Val Tyr Ser Glu Thr Asp Ala Asp Gly Val Lys Arg

690 695 700

Leu Tyr Gly Tyr Val Leu Lys

705 710

<210> 39

<211> 289

<212> DNA

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> lysCP1 promoter

<400> 39

ccgatgctag ggcgaaaagc acggcgagca gattgctttg cacttgattc agggtagttg 60

actaaagagt tgctcgcgaa gtagcacctg tcacttttgt ctcaaatatt aaatcgaata 120

tcaatatatg gtctgtttat tggaacgcgt cccagtggct gagacgcatc cgctaaagcc 180

ccaggaaccc tgtgcagaaa gaaaacactc ctctggctag gtagacacag tttattgtgg 240

tagagttgag cgggtaactg tcagcacgta gatcgaaagg tgcacaaag 289

<---

Реферат

Настоящее изобретение относится к биотехнологии и представляет собой модифицированный микроорганизм рода, продуцирующий орнитин, где активности N-ацетилглутаматсинтазы изи ацетилорнитиндезацетилазы извведены в указанный микроорганизм рода, обладающий активностью ацетилглутаматсинтазы или орнитинацетилтрансферазы (ArgJ). Изобретение позволяет повысить продукции орнитина. 2 н. и 10 з.п. ф-лы, 2 ил., 11 табл, 7 пр.

Формула