Ферменты биосинтеза люциферина и их применение - RU2730038C2

Код документа: RU2730038C2

Чертежи

Показать все 26 чертежа(ей)

Описание

Область изобретения

[01] Группа изобретений относится к области биотехнологии и генетической инженерии. В частности, изобретение относится к ферментам биолюминесцентной системы грибов.

Уровень техники

[02] Люциферазами называют ферменты, которые катализируют окисление низкомолекулярных соединений люциферинов, сопровождающееся испусканием света – биолюминесценцией. В результате окисления из люциферина образуется оксилюциферин, который высвобождается из комплекса с ферментом – люциферазой.

[03] Люциферазы широко используются в качестве репортерных генов в ряде биомедицинских приложений и в биотехнологии. Например, люциферазы используются для определения жизнеспособности клеток, активности промоторов и других компонентов живых систем, в исследованиях канцерогенеза на животных моделях, в способах выявления в среде микроорганизмов, токсических агентов, в качестве индикаторов для определения концентрации различных веществ, для визуализации прохождения сигнальных каскадов и т.д. [Scott et al., Annu Rev Anal Chem, 2011, 4: 297-319; Badr and Tannous, Trends Biotechnol. 2011, 29: 624-33; Andreu et al., FEMS Microbiol Rev. 2011, 35: 360-94]. Многие способы применения люцифераз описаны в обзорах [Kaskova et al., Chem Soc Rev., 2016, 45: 6048-6077; Scott et al., Annu Rev Anal Chem, 2011, 4: 297-319; Widder and Falls, IEEE Journal of Selected Topics in Quantum Electronics, 2014, 20: 232-241]. Все основные способы применения люцифераз включают детекцию света, испускаемого в зависимости от исследуемого явления или сигнала. В большинстве случаев детекция осуществляется с помощью люминометра или модифицированного оптического микроскопа.

[04] Известны тысячи способных к биолюминесценции видов, для которых описано около десятка различных по строению люциферинов и несколько десятков соответствующих им ферментов-люцифераз. Показано, что у различных организмов системы биолюминесценции возникали в эволюции независимо более сорока раз [Herring, Journal of Bioluminescence and Chemiluminescence, 1987, 1: 147–63; Haddock et al., Annual Review of Marine Science, 2010; 2: 443–93].

[05] Описана группа люцифераз насекомых, катализирующих окисление D-люциферина [de Wet et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1985, 82: 7870-3; de Wet et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1987, 7: 725-37]. Описана группа люцифераз, катализирующих окисление целентеразина[O. Shimomura, Bioluminescence: Chemical Principles and Methods, World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd, Singapore, 2006, 470 p.]. Известны биолюминесцентные системы остракод рода Cypridina, которые характеризуются химически высокоактивным люциферином и высокостабильной люциферазой [Shimomura et al., Science, 1969, 164: 1299-300]. Также известны биолюминесцентные системы динофлагеллят и эвфаузиид. В настоящее время клонированы гены, кодирующие три люциферазы из этой группы [O. Shimomura, Bioluminescence: Chemical Principles and Methods, World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd, Singapore, 2006]. Существенным недостатком данной системы является ее неполная изученность: полные люциферазные последовательности еще не установлены.

[06] Недавно были описаны группа люцифераз и люциферин биолюминесцентной системы грибов. Биолюминесценция грибов была известна на протяжении сотен лет, однако люциферин грибов был идентифицирован только в 2015 году: им оказался 3-гидроксигиспидин – способный проникать через мембраны клеток метаболит [Purtov et al., Angewandte Chemie, 2015, 54: 8124–28]. В этой же работе было подтверждено наличие в лизатах грибов фермента, осуществляющего гидроксилирование гиспидина с получением люциферина, однако фермент идентифицирован не был. В патентной заявке №2017102986 от 30.01.2017 были описаны гены люцифераз из нескольких грибов, использующие в качестве люциферина 3-гидроксигиспидин, имеющий структуру:

[07] Было показано, что люциферазы грибов могут катализировать сопровождающееся выделением света окисление и других химических соединений, структуры которых показаны в Таблице 1 [Kaskova et al., Sci. Adv. 2017;3: e1602847]. Все эти соединения, являющиеся люциферинами грибов, включая 3-гидроксигиспидин, относятся к группе 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-онов и имеют общую формулу:

, где R - арил или гетероарил.

Таблица 1. Примеры люциферинов грибов

Название соединения по классификации ИЮПАК (прочие названия соединения)Формула соединенияЗамещающая группа («R») по классификации ИЮПАК(Е)-6-(3,4-дигидроксистирил)-3,4-дигидрокси-2Н-пиран-2-он
(3-гидроксигиспидин)
3,4-дигидроксифенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он
фенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он
4-гидроксифенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он
2-гидроксифенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2,4-дигидроксистирил)-2Н-пиран-2-он
2,4-дигидроксифенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксистирил)-2Н-пиран-2-он
4-гидрокси-3,5-
диметоксифенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксистирил)-2Н-пиран-2-он
4-гидрокси-3-
метоксифенил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он
6-гидроксинафталин-2-ил
(Е)-6-(4-аминостирил)-3,4-дигидрокси-2Н-пиран-2-он
4-аминофенил
(Е)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-3,4-гидрокси-2Н-пиран-2-он
4-диэтиламинофенил
(Е)-6-(2-( 1Н-индол-3-ил)винил)-3,4-дигидрокси-2Н-пиран-2-он
1Н-индол-3-ил
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2Н-пиран-2-он
2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил

[08] Для подавляющего большинства люциферинов неизвестны ферменты, обеспечивающие их синтез в живом организме, а также восстановление оксилюциферина обратно в люциферин. Таким образом, большинство применений биолюминесценции предполагает добавление экзогенного люциферина в систему (например, культуру клеток или организм), содержащую люциферазу. Использование биолюминесцентных систем, таким образом, оказывается ограниченным из-за ряда причин: многие люциферины плохо проникают через клеточную мембрану, сами люциферины химически неустойчивы, и их химический синтез является сложным многостадийным и дорогостоящим процессом.

[09] Единственная биолюминесцентная система, для которой определены ферменты синтеза люциферина, описана у морских бактерий. Эта система значительно отличается от других биолюминесцентных систем. Бактериальный люциферин (миристиновый альдегид), окисляется в процессе реакции, но не является эмиттером биолюминесценции [O. Shimomura, Bioluminescence: Chemical Principles and Methods, World Scientific Publishing Co. Pte. Ltd, Singapore, 2006, 470 p.]. Помимо люциферина в качестве ключевых компонентов люминесцентной реакции выступают НАДН (никотинамидадениндинуклеотид) и ФМН-H2 (флавинмононуклеотид), окисленное производное которого и выступает в качестве истинного источника света. Биолюминесцентная система морских бактерий – единственная на сегодня может быть полностью закодирована в гетерологичной системе экспрессии и может рассматриваться как наиболее близкий аналог настоящего изобретения. Однако данная система применима преимущественно для прокариотических организмов. Для получения автономной биолюминесценции используется оперон luxCDABE, кодирующий люциферазы (гетеродимеры luxA и luxB) и белки биосинтеза субстрата биолюминесценции – люциферина luxCDE (Meighen 1991). В 2010 году удалось добиться автономной люминесценции с помощью этой системы в клетках человека – однако низкая интенсивность биолюминесценции, лишь в 12 раз превосходящая сигнал, исходящий от небиолюминесцентных клеток, не позволила использовать разработанную систему для решения большинства прикладных задач [Close et al. PloS One, 2010, 5 (8):e12441]. Работы по увеличению интенсивности испускаемого света не увенчались успехом из-за токсичности компонентов бактериальной системы для эукариотических клеток [Hollis et al. FEBS Letters, 2001, 506 (2):140–42].

[010] Идентификация ферментов, обеспечивающих синтез люциферина из устойчивых и/или широко распространенных в клетках соединений-предшественников и восстановление оксилюциферина обратно в люциферин, представляется актуальной задачей. Выявление таких ферментов позволяет обеспечить более простой и дешевый способ синтеза люциферина и открывает путь к созданию автономных биолюминесцентных систем. Особый интерес представляют нетоксичные для эукариотических клеток биолюминесцентные системы.

Сущность изобретения

[011] Заявители расшифровали стадии биосинтеза люциферина в биолюминесцентной системе грибов и идентифицировали ферменты, вовлеченные в циклическое обращение люциферина грибов и кодирующие их последовательности нуклеиновых кислот.

[012] Стадии оборота люциферина грибов показаны на схеме:

[013] Таким образом, настоящее изобретение прежде всего обеспечивает изолированные белки биосинтеза люциферина грибов, а также кодирующие их нуклеиновые кислоты.

[014] В преимущественных воплощениях настоящее изобретение обеспечивает гиспидин-гидроксилазы, характеризующиеся аминокислотной последовательностью, выбранной из группы в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, а также белки по существу сходные, гомологи, мутанты и производные указанных гиспидин-гидроксилаз.

[015] В некоторых воплощениях гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения характеризуются аминокислотной последовательностью, которая на протяжении по крайней мере 350 аминокислот имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28.

[016] В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения характеризуется наличием нескольких разделенных неконсервативными аминокислотными вставками консенсусных последовательностей, показанных в SEQ ID NOs: 29-33.

[017] Гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения катализируют реакцию превращения 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

,

в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[018] Также обеспечиваются гиспидин-синтазы, характеризующиеся аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55, а также белки по существу сходные, мутанты, гомологи и производные указанных гиспидин-синтаз.

[019] В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность гиспидин-синтазы настоящего изобретения характеризуется наличием нескольких разделенных неконсервативными аминокислотными вставками консенсусных последовательностей, показанных в SEQ ID NOs: 56-63.

[020] В некоторых воплощениях гиспидин-синтазы настоящего изобретения характеризуются аминокислотной последовательностью, которая имеет не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55.

[021] Гиспидин-синтазы настоящего изобретения катализируют реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R выбран из группы арил или гетероарил в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[022] Также обеспечиваются кофеилпируват-гидролазы, характеризующиеся аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, а также белки по существу сходные, мутанты, гомологи и производные указанных кофеилпируват-гидролаз.

[023] В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения характеризуется наличием нескольких разделенных неконсервативными аминокислотными вставками консенсусных последовательностей, показанных в SEQ ID NOs: 76-78.

[024] В некоторых воплощениях аминокислотная последовательность кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью. выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75.

[025] Кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения катализируют реакцию превращения 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновые кислоты, имеющей структурную формулу

, где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой

.

[026] В преимущественных воплощениях гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения катализируют реакцию превращения предлюциферина в люциферин грибов, например, гиспидина в 3-гидроксигиспидин.

[027] В преимущественных воплощениях гиспидин-синтазы настоящего изобретения катализируют превращение предшественника предлюциферина в предлюциферин, например, превращение кофейной кислоты в гиспидин.

[028] В преимущественных воплощениях кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения катализируют превращение оксилюциферина грибов в предшественник предлюциферина, например, превращение кофеилпирувата в кофейную кислоту.

[029] Также обеспечивается применение белка, аминокислотная последовательность которого на протяжении по крайней мере 350 аминокислот имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, и/или аминокислотная последовательность которого содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 29-33, в системах in vitro или in vivo как гиспидин-гидроксилазы, катализирующей реакцию превращения 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

,в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу
, где R - арил или гетероарил.

[030] Также обеспечивается применение белка, аминокислотная последовательность которого имеет не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, и\или аминокислотная последовательность которого содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 56-63, в системах in vitro или in vivo как гиспидин-синтазы, катализирующей реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу
, где R - арил или гетероарил.

[031] Также обеспечивается применение белка, аминокислотная последовательность которого имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, и/или аминокислотная последовательность которого содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 76-78, в системах in vitro или in vivo как кофеилпируват-гидролазы, катализирующей реакцию превращения 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновые кислоты, имеющей структурную формулу

, где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
.

[032] Также обеспечиваются нуклеиновые кислоты, кодирующие вышеозначенные гиспидин-гидроксилазы, гиспидин-синтазы и кофеилпируват-гидролазы.

[033] В некоторых воплощениях обеспечиваются нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-гидроксилазы, аминокислотная последовательность которых выбрана из группы:

(а) аминокислотная последовательность показана в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28;

(б) аминокислотная последовательность имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, на протяжении по крайней мере 350 аминокислот;

(в) аминокислотная последовательность содержит консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 29-33.

[034] В некоторых воплощениях обеспечиваются нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазы, аминокислотная последовательность которых выбрана из группы:

(а) аминокислотная последовательность показана в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55;

(б) аминокислотная последовательность имеет не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55;

(в) аминокислотная последовательность содержит консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 56-63.

[035] В некоторых воплощениях обеспечиваются нуклеиновые кислоты, кодирующие кофеилпируват-гидролазы, аминокислотная последовательность которых выбрана из группы:

(а) аминокислотная последовательность показана в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75;

(б) аминокислотная последовательность имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75;

(в) аминокислотная последовательность содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 76-78.

[036] Также обеспечивается применение нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, аминокислотная последовательность которого на протяжении по крайней мере 350 аминокислот имеет не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности, (например, по крайней мере 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, или аминокислотная последовательность которого содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 29-33, для получения в системах in vitro или in vivo гиспидин-гидроксилазы, катализирующей реакцию превращения 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

,

в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[037] Также обеспечивается применение нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, аминокислотная последовательность которого имеет не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, ли не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности, (например, по крайней мере 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, или аминокислотная последовательность которого содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 56-63, для получения в системах in vitro или in vivo гиспидин-синтазы, катализирующей реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу
, где R - арил или гетероарил.

[038] Также обеспечивается применение нуклеиновой кислоты, кодирующей белок, аминокислотная последовательность которого имеет не менее 60% идентичности или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности, (например, по крайней мере 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, или аминокислотная последовательность которого содержит разделенные неконсервативными аминокислотными вставками консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 76-78, для получения в системах in vitro или in vivo кофеилпируват-гидролазы, катализирующей реакцию превращения 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновые кислоты, имеющей структурную формулу

, где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
.

[039] Также обеспечивается белок слияния, включающий оперативно сшитые непосредственно или через аминокислотные линкеры по крайней мере одну гиспидин-гидроксилазу по изобретению, и\или по крайней мере одну гиспидин-синтазу по изобретению, и\или по крайней мере одну кофеилпируват-гидролазу по изобретению, и сигнал внутриклеточной локализации и\или сигнальный пептид и\или люциферазу, способную окислять с выделением света люциферин грибов.

[040] Люцифераза, способная окислять с выделением света люциферин грибов, известна из уровня техники. В преимущественных воплощениях она имеет аминокислотную последовательность по существу сходную или идентичную с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98. Например, она может иметь аминокислотную последовательность, которая по крайней мере на 40% идентична, например, по крайней мере на 45% идентична, или по крайней мере на 50% идентична, или по крайней мере на 55% идентична, или по крайней мере на 60% идентична, или по крайней мере на 70% идентична, или по крайней мере на 75% идентична, или по крайней мере на 80% идентична, или по крайней мере на 85% идентична аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98. Во многих воплощениях аминокислотная последовательность указанной люциферазы имеет не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности, (например, по крайней мере 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98.

[041] В некоторых воплощениях белок слияния имеет аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO: 101.

[042] Также обеспечивается нуклеиновая кислота, кодирующая вышеуказанный белок слияния.

[043] Также обеспечивается кассета экспрессии, включающая (а) регион инициации транскрипции функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую фермент биосинтеза люциферина грибов, то есть гиспидин-синтазу, гиспидин-гидроксилазу или кофеилпируват-гидролазу или белок слияния по изобретению (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине.

[044] Также обеспечивается вектор для переноса нуклеиновой кислоты в клетку-хозяина, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую фермент биосинтеза люциферина грибов по изобретению, то есть гиспидин-синтазу, гиспидин-гидроксилазу или кофеилпируват-гидролазу или белок слияния по изобретению.

[045] Также обеспечивается клетка-хозяин, содержащая как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку кассету экспрессии, в состав которой входит нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу и/или гиспидин-гидроксилазу и/или кофеилпируват-гидролазу настоящего изобретения. Такая клетка продуцирует по крайней мере один из вышеперечисленных ферментов биосинтеза люциферина грибов за счет экспрессии введенной в нее нуклеиновой кислоты.

[046] Также обеспечивается антитело, полученное с помощью белка по изобретению.

[047] Также обеспечивается способ получения люциферина грибов, представляющего собой 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющего структурную формулу

, где R - арил или гетероарил, в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях с по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы по изобретениюс по крайней мере одной молекулой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она со структурной формулой
, с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)Н и с по крайней мере одной молекулы молекулярного кислорода.

[048] Также обеспечивается способ получения предлюциферина грибов, представляющего собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой

, где R - арил или гетероарил, в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

с по крайней мере одной молекулой гиспидин-синтазы по изобретению, с по крайней мере одной молекулой кофермента А, с по крайней мере одной молекулы АТФ и с по крайней мере с двумя молекулами малонил-КоА.

[049] Также обеспечивается способ получения люциферина грибов, в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях с по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы по изобретениюс по крайней мере одной молекулой 3-арилакриловой кислоты, с по крайней мере одной молекулой гиспидин-синтазы по изобретению, с по крайней мере одной молекулой кофермента А, с по крайней мере одной молекулы АТФ, с по крайней мере с двумя молекулами малонил-КоА, с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)Н и с по крайней мере одной молекулы молекулярного кислорода.

[050] Способы получения люциферина и предлюциферина грибов могут быть реализованы в клетке или организме, в этом случае способы включают введение в клетку нуклеиновых кислот, кодирующих соответствующие ферменты биосинтеза люциферина (гиспидин-синтазы и/или гиспидин-гидроксилазы), способные к экспрессии указанных ферментов в клетке или организме. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты вводят в клетку или организм в составе кассеты-экспрессии или вектора по изобретению.

[051] В некоторых воплощениях в клетку или организм дополнительно вводят нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу, способную осуществлять перенос 4-фосфопантетеинила от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтаз. В некоторых воплощениях 4'-фосфопантотеинил трансфераза имеет аминокислотную последовательность по существу сходную или идентичную с SEQ ID NO: 105.

[052] Также обеспечивается применение поликетидсинтазы (PKS) аминокислотная последовательность которой идентична последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139 по крайней мере на 40%, или по крайней мере на 45%, или по крайней мере на 50%, или по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99%, для получение гиспидина в системе in vitro или in vivo.

[053] В некоторых воплощениях способ получения гиспидина включает объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы PKS с по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА и по крайней мере одной молекулой кофеил-КоА. В некоторых воплощениях способ включает объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы PKS с по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА, по крайней мере одну молекулу кофейной кислоты, по крайней мере одну молекулу кофермента А, по крайней мере одну молекулу кумарат-КоА-лигазы и по крайней мере одну молекулу АТФ.

[054] Для нужд настоящего изобретения может быть использована любая кумарат-КоА-лигаза, катализирующая реакцию превращения кофейной кислоты в кофеил-КоА. Например, кумарат-КоА-лигаза имеет аминокислотную последовательность, которая идентична последовательности, показанной в SEQ ID NO:141 по крайней мере на 40%, или по крайней мере на 45%, или по крайней мере на 50%, или по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99%.

[055] Реакция может быть использована в любых способах вместо реакции получения предлюциферина грибов из предшественников предлюциферина с помощью гиспидин-синтазы настоящего изобретения. Например, реакция может осуществляться в клетке или организме и включать введение в клетку или организм кассеты экспрессии, содержащей нуклеиновую кислоту, кодирующую PKS. При необходимости в клетку или организм также вводится нуклеиновая кислота, кодирующая кумарат-КоА-лигазу.

[056] В некоторых воплощениях в клетку или организм дополнительно вводят нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты, например, нуклеиновые кислоты, кодирующие тирозин-аммоний-лиазу, аминокислотная последовательность которой по существу сходная или идентичная аминокислотной последовательности тирозин-аммоний-лиазы Rhodobacter capsulatus, показанной в SEQ ID NO: 107, и нуклеиновые кислоты, кодирующие компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы, аминокислотные последовательности которых по существу сходны с последовательностями компонентов HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli, показанными в SEQ ID NOs: 109 и 111. В некоторых воплощениях используется нуклеиновая кислота, кодирующая фенилаланин-аммоний-лиазу, аминокислотная последовательность которой по существу сходна с аминокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID NOs:117.

[057] Также обеспечиваются способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов, в том числе клеток или организмов растений, или животных, или бактерий, или грибов.

[058] В преимущественных воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают введение в клетку или организм по крайней мере одной нуклеиновой кислоты по изобретению, а также нуклеиновой кислоты, кодирующей люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света. Нуклеиновые кислоты вводятся в клетку или организм в форме, которая обеспечивает их экспрессию и продукцию функциональных белковых продуктов. Например, нуклеиновые кислоты находятся в составе кассеты экспрессии. Нуклеиновые кислоты присутствуют в клетках как части экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии.

[059] В преимущественных воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-гидроксилазу по изобретению и нуклеиновой кислоты, кодирующей люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света. Указанная клетка или организм приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющего собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой

, где R - арил или гетероарил.

[060] В некоторых воплощениях вместо нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу, в клетку вводят нуклеиновую кислоту, кодирующую белок слияния гиспидин-гидроксилазы и люциферазы.

[061] В некоторых воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают также введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-синтазу по изобретению. Указанная клетка или организм приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предшественника предлюциферина грибов, представляющего собой 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил.

[062] В некоторых воплощениях в клетку вместо нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-синтазу, вводят нуклеиновую кислоту, кодирующую PKS.

[063] В некоторых воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают также введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей кофеилпируват-гидролазу по изобретению, что приводит к увеличению интенсивности биолюминесценции.

[064] В некоторых воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают также введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей 4'-фосфопантотеинил трансферазу.

[065] В некоторых воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают также введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей кумарат-КоА-лигазу.

[066] В некоторых воплощениях способы получения трансгенных биолюминесцентных клеток или организмов включают также введение в клетку или организм нуклеиновых кислот, кодирующих ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты.

[067] Также обеспечиваются трансгенные биолюминесцентные клетки и организмы, полученные с помощью вышеописанных методов, и содержащие одну или несколько нуклеиновых кислот по изобретению как части экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки.

[068] В некоторых воплощениях трансгенные биолюминесцентные клетки и организмы по изобретению способны к автономной биолюминесценции без экзогенного добавления люциферина, предлюциферина и предшественника предлюциферина.

[069] Также обеспечиваются комбинации белков и нуклеиновых кислот по изобретению, изделия и наборы, содержащие белки и нуклеиновые кислоты по изобретению. Например, обеспечиваются комбинации нуклеиновых кислот для получения автономно светящихся клеток, клеточных линий или трансгенных организмов, комбинации для анализа активности промоторов, или комбинации для мечения клеток.

[070] В некоторых воплощениях обеспечиваются наборы для получения люциферина грибов и/или предлюциферина грибов, включающие вышеописанную гиспидин-гидроксилазу и/или гиспидин-синтазу и/или PKS или кодирующие их нуклеиновые кислоты.

[071] В некоторых воплощениях обеспечиваются наборы для получения биолюминесцентной клетки или биолюминесцентного трансгенного организма, включающие нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света. Набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу. Набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу или PKS. Набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу и/или нуклеиновую кислоту, кодирующую кумарат-КоА-лигазу и/или нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты. Набор может также содержать дополнительные компоненты: буферные растворы, антитела, люциферин грибов, предлюциферин грибов, предшественник предлюциферина грибов и тд. Набор может также содержать инструкцию по применению набора. В некоторых воплощениях нуклеиновые кислоты находятся в составе кассеты экспрессии или вектора для внедрения в клетки или организмы.

[072] В преимущественных воплощениях клетки и трансгенные организмы по изобретению способны производить люциферин грибов из предшественников. В некоторых воплощениях клетки и трансгенные организмы по изобретению способны к биолюминесценции в присутствии предшественника люциферина грибов. В некоторых воплощениях клетки и трансгенные организмы по изобртению способны к автономной биолюминесценции.

[073] В перечисленных выше способах и применениях в преимущественных воплощениях используется предлюциферин - 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, выбранный из группы:

(Е)-6-(3,4-дигидроксистирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он (гиспидин),

(Е)-4-гидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он,

(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он (бисноръянгонин),

(Е)-4-гидрокси-6-(2-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,

(Е)-4-гидрокси-6-(2,4-дигидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,

(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксистирил)-2Н-пиран-2-он,

(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксистирил)-2Н-пиран-2-он,

(Е)-4-гидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он,

(Е)-6-(4-аминостирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,

(Е)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,

(Е)-6-(2-(1Н-индол-3-ил)винил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,

(Е)-4-гидрокси-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2Н-пиран-2-он.

[074] В преимущественных воплощениях для нужд настоящего изобретения применима 3-арилакриловая кислота, выбранная из группы: кофейная кислота, коричная кислота, паракумаровая кислота, кумаровая кислота, умбеллиновая кислота, синаповая кислота, феруловая кислота.

[075] В преимущественных воплощениях в качестве люциферина используется 3-гидроксигиспидин, в качестве предлюциферина – гиспидин, в качестве предшественника предлюциферина – кофейная кислота.

[076] Технический результат состоит в создании эффективного способа получения автономных биолюминесцентных систем, обладающих видимым свечением, в том числе на основе эукариотических несветящихся клеток и организмов.

[077] Также технический результат состоит в разработке нового эффективного способа синтеза гиспидина и его функциональных аналогов.

[078] Также технический результат состоит в разработке нового эффективного способа синтеза люциферина грибов и его функциональных аналогов.

[079] Также технический результат состоит в получении автономно светящихся клеток и организмов.

[080] Технический результат достигается за счет идентификации стадий превращения люциферина в биолюминесцентных грибах и выявлении аминокислотных и нуклеотидных последовательностей белков, вовлеченных в биосинтез люциферина. Функция всех белков была продемонстрирована впервые.

Краткое описание чертежей

[081] Фиг. 1 показывает множественное выравнивание аминокислотных последовательностей гиспидин-гидроксилаз. FAD/NAD(P)-связывающий домен отмечен подчеркиванием. Консенсусные последовательности показаны под выравниванием.

[082] Фиг. 2 показывает множественное выравнивание аминокислотных последовательностей гиспидин-синтаз. Консенсусные последовательности показаны под выравниванием.

[083] Фиг. 3 показывает множественное выравнивание аминокислотных последовательностей кофеилпируват-гидролаз. Консенсусные последовательности показаны под выравниванием.

[084] Фиг. 4 показывает интенсивности свечения клеток Pichia pastoris, экспрессирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу (А) или только люциферазу (Б), или дрожжи дикого типа (И), при опрыскивании колоний 3-гидроксигиспидином (люциферин, левый график) и гиспидином (предлюциферин, правый график).

[085] Фиг. 5 показывает сравнение интенсивности свечения клеток HEK293NT, экспрессирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу, и клеток HEK293NT, экспрессирующих только люциферазу, при добавлении гиспидина.

[086] Фиг. 6 показывает кривую люминесценции клеток HEK293T, экспрессирующих (1) гены гиспидин-гидроксилазы и люциферазы по отдельности при добавлении гиспидина; (2) ген химерного белка гиспидин-гидроксилазы и люциферазы при добавлении гиспидина; (3) ген химерного белка гиспидин-гидроксилазы и люциферазы при добавлении 3-гидроксигиспидина.

[087] Фиг. 7 иллюстрирует способность трансфицированных клеток Pichia pastoris к автономной биолюминесценции в отличие от клеток дикого типа: на чашке Петри слева клетки под дневным освещением, справа – клетки в темноте.

[088] Фиг. 8 показывает свечение культуры трансфицированных клеток Pichia pastoris в темноте.

[089] Рис. 9 показывает автономно биолюминесцентные трансгенные растения Nicotiana benthamiana. Фотография слева снята при внешнем освещении, фотография справа снята в темноте.

Осуществление изобретения

Определения

[090] Различные термины, относящиеся к объектам настоящего изобретения, используются выше и также в описании и в формуле изобретения. В описании данного изобретения термины «включает» и «включающий» интерпретируются как означающие «включает, помимо всего прочего». Указанные термины не предназначены для того, чтобы их истолковывали как «состоит только из».

[091] Термины «люминесценция» и «биолюминесценция» для нужд настоящего изобретения являются взаимозаменяемыми и обозначают явление выделения света в ходе химической реакции, катализируемой ферментом - люциферазой.

[092] Термины «способен к реакции», «осуществляет реакцию» и им подобные по отношению к активности белка означают, что указанной белок является ферментом, катализирующим означенную реакцию.

[093] Как здесь используется, термин «люцифераза» означает белок, который обладает способностью катализировать окисление молекулярным кислородом химического соединения (люциферина), где реакция окисления сопровождается выделением света (люминесценцией или биолюминесценцией) и происходит освобождение окисленного люциферина.

[094] Как здесь используется, термин «люциферин грибов» означает химическое соединение, выбранное из группы 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-онов, имеющих структурную формулу

[095] , где R арил или гетероарил.

[096] Люциферин грибов окисляется группой люцифераз, далее обозначаемых термином «люциферазы, способные окислять люциферин грибов с выделением света» или ему подобным. Указанные люциферазы найдены у биолюминесцентных грибов, например, они описаны в заявке RU №2017102986/10(005203) от 30.01.2017. Аминокислотные последовательности люцифераз применимых в рамках способов и комбинаций настоящего изобретения по существу сходны или идентичны аминокислотным последовательностям, выбранным из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98. Во многих вариантах осуществления настоящего изобретения применимые для нужд настоящего изобретения люциферазы характеризуются аминокислотными последовательностями, которые по крайней мере на 40% идентичны, например, по крайней мере на 45% идентичны, или по крайней мере на 50% идентичны, или по крайней мере на 55% идентичны, или по крайней мере на 60% идентичны, или по крайней мере на 70% идентичны, или по крайней мере на 75% идентичны, или по крайней мере на 80% идентичны, или по крайней мере на 85% идентичны аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98. Часто люциферазы характеризуются аминокислотными последовательностями, которые имеют с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88,90 , 92, 94, 96, 98, не менее 90% идентичности (например, не менее 91%, не менее 92%, не менее 93%, не менее 94%, не менее 95%, не менее не менее 96%, не менее 97%, не менее 98%, не менее 99% идентичности или 100% идентичности).

[097] При окислении люциферина грибов образуется «оксилюциферин грибов», который представляет собой 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновую кислоту со структурной формулой

[098] .

[099] Термины «предлюциферин грибов» или просто «предлюциферин» используется здесь для обозначения соединений, относящихся к группе 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-онов, имеющих структурную формулу

, где R – арил или гетероарил. В ходе химической реакции, катализируемой ферментом настоящего изобретения, предлюциферин превращается в люциферин грибов.

[0100] Термин «предшественник предлюциферина» используется здесь для обозначения соединений, относящихся к группе 3-арилакриловых кислот со структурной формулой

[0101] , где R – арил или гетероарил. Из 3-арилакриловых кислот в ходе химической реакции, катализируемой ферментом настоящего изобретения, образуются предлюциферины.

[0102] Примеры люциферинов гриба показаны в Таблице 1. Связанные с люциферинами грибов примеры предлюциферинов, оксилюциферинов и предшественников предлюциферинов показаны в Таблице 2.

Таблица 2. Примеры предлюциферинов, предшественников предлюциферинов и оксилюциферинов грибов (приведены названия соединений согласно номенклатуре ИЮПАК, под структурной формулой жирным шрифтом указаны традиционные названия соединений).

ЛюциферинПредшественник предлюциферинаПредлюциферинОксилюциферин(Е)-6-(3,4-дигидроксистирил)-3,4-дигидрокси-2Н-пиран-2-он (3-гидроксигиспидин)(E)-3-(3,4-дигидроксифенил)пропеновая кислота

кофейная кислота
(Е)-6-(3,4-дигидроксистирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он

гиспидин
(2Е,5Е)-6-(3,4-дигидроксифенил)-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота

кофеилпируват
(Е)-3,4-дигидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он(E)-3-фенилпропеновая кислота

коричная кислота
(Е)-4-гидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-4-оксо-6-фенилгекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он(E)-3-(4-гидроксифенил)пропеновая кислота

паракумаровая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он

бисноръянгонин
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(4-гидроксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он(E)-3-(2-гидроксифенил)пропеновая кислота

кумаровая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(2-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(2-гидроксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2,4-дигидроксистирил)-2Н-пиран-2-он(E)-3-(2,4-дигидроксифенил)пропеновая кислота

умбеллиновая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(2,4-дигидроксистирил)-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(2,4-дигидроксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксистирил)-2Н-пиран-2-он(E)-3-(4-гидрокси-3,5-диметоксифенил)пропеновая кислота

синаповая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксистирил)-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксистирил)-2Н-пиран-2-он(E)-3-(4-гидрокси-3-метоксифенил)пропеновая кислота

феруловая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксистирил)-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он(E)-3-(6-гидроксинафталин-2-ил)пропеновая кислота

3-(6-гидроксинафталин-2-ил)акриловая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(6-гидроксинафталин-2-ил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-6-(4-аминостирил)-3,4-дигидрокси-2Н-пиран-2-он(E)-3-(4-аминофенил)пропеновая кислота

4-аминокоричная кислота
(Е)-6-(4-аминостирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-6-(4-аминофенил)-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-3,4-гидрокси-2Н-пиран-2-он(E)-3-(4-диэтиламинофенил)пропеновая кислота

4-диэтиламинокоричная кислота
(Е)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он
(2Е.5Е)-6-(4-(диэтиламино)фенил)-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-6-(2-(1Н-индол-3-ил)винил)-3,4-дигидрокси-2Н-пиран-2-он(Е)-3-(1Н-индол-3-ил)пропеновая кислота

3-индолилакриловая кислота
(Е)-6-(2-( 1Н-индол-3-ил)винил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(1Н-индол-3-ил)-4-оксогекса-2,5-диеновая кислота
(Е)-3,4-дигидрокси-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2Н-пиран-2-он(Е)-3-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)пропеновая кислота
(Е)-4-гидрокси-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2Н-пиран-2-он
(2Е,5Е)-2-гидрокси-4-оксо-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)гекса-2,5-диеновая кислота

[0103] Термин «арил» или «арильный заместитель» обозначает ароматический радикал в одинарной или конденсированной карбоциклической кольцевой системе, содержащий от пяти до четырнадцати кольцевых членов. В предпочтительном осуществлении кольцевая система содержит от шести до десяти членов кольца. Один или несколько атомов водорода могут также быть заменены на заместитель, выбранный из ацила, ациламино, ацилокси, алкенила, алкокси, алкила, алкинила, амино, арила, арилокси, азидо, карбамоила, карбоалкокси, карбокси, карбоксиамидо, карбоксиамино, циано, дизамещенного амино, формила, гуанидино, галогена, гетероарила, гетероциклила, гидрокси, иминоамино, монозамещенного амино, нитро, оксо, фосфонамино, сульфинила, сульфонамино, сульфонила, тио, тиоациламино, тиоуреидо или уреидо. Примеры арильных групп включают без ограничения фенил, нафтил, бифенил, терфенил. Кроме того, в значение термина «арил», так, как оно используется здесь, входят группы, в которых ароматический цикл соединен с одним или более неароматическими циклами.

[0104] Термин «гетероциклический ароматический заместитель», «гетероарильный заместитель» или «гетероарил» обозначает ароматический радикал, который содержит от одного до четырех гетероатомов или гетерогрупп, выбранных из O, N, S или SO, в одинарной или конденсированной гетероциклической кольцевой системе, содержащей от пяти до пятнадцати кольцевых членов. В предпочтительном осуществлении гетероарильная кольцевая система содержит от шести до десяти кольцевых членов. Один или несколько атомов водорода могут также быть заменены на заместитель, выбранный из ацила, ациламино, ацилокси, алкенила, алкокси, алкила, алкинила, амино, арила, арилокси, карбамоила, карбоалкокси, карбокси, карбоксиамидо, карбоксиамино, циано, дизамещенного амино, формила, гуанидино, галогена, гетероарила, гетероциклила, гидрокси, иминоамино, монозамещенного амино, нитро, оксо, фосфонамино, сульфинила, сульфонамино, сульфонила, тио, тиоациламино, тиоуреидо или уреидо. Примеры гетероарильных групп включают без ограничения пиридинильную, тиазолильную, тиадиазолильную, изохинолинильную, пиразолильную, оксазолильную, оксадиазоильную, триазолильную и пирролильную группы. Кроме того, в значение термина «гетероарил», так, как оно используется здесь, входят группы, в которых гетероароматический цикл соединен с одним или более неароматическими циклами.

[0105] В настоящем изобретении для обозначения химических соединений кроме традиционных названий (при наличии) используются названия в соответствии с международной номенклатурой ИЮПАК.

[0106] Термин «фермент биосинтеза люциферина» или «фермент, вовлеченный в циклический оборот превращений люциферина» или ему подобный используется для обозначения фермента, катализирующего реакции превращения предшественника предлюциферина в предлюциферин, и/или предлюциферина в люциферин грибов и/или оксилюциферина в предшественник предлюциферина в системах in vitro и/или in vivo. Если не указано иное, люциферазы не включены в понятие «ферменты биосинтеза люциферина грибов».

[0107] Термин «гиспидин-гидроксилаза» используется здесь для описания фермента, катализирующего реакцию превращения предлюциферина в люциферин грибов, например, синтез 3-гидроксигиспидина из гиспидина.

[0108] Термин «гиспидин-синтаза» используется здесь для описания фермента, способного катализировать синтез предлюциферина грибов из предшественника предлюциферина, например, синтез гиспидина из кофейной кислоты.

[0109] Термин «PKS» используется здесь для описания фермента, принадлежащего к группе поликетидсинтаз III типа, способного катализировать синтез гиспидина из кофеил-КоА.

[0110] Термин «кофеилпируват-гидролаза» используется здесь для описания фермента, способного катализировать расщепление оксилюциферина грибов на более простые соединения, например, с образованием предшественника предлюциферина. Примером такой реакции является превращение кофеилпирувата в кофейную кислоту.

[0111] Термин «функциональный аналог» используется в настоящем изобретении для описания химических соединений или белков, которые выполняют одну и ту же функцию и/или могут быть использованы для одного и того же назначения. Например, все люциферины грибов, перечисленные в Таблице 1, являются функциональными аналогами друг друга.

[0112] Термин «АТФ» относится к аденозинтрифосфату, который является основным переносчиком энергии в клетке и имеет структурную формулу:

.

[0113] Термин «НАД(Ф)Н» используется здесь для обозначения молекулы восстановленного никотинамидадениндинуклеотидфосфата (НАДФН) или никотинамидадениндинуклеотида (НАДН). Термин «НАД(Ф)» используется для обозначения окисленной формы никотинамидадениндинуклеотидфосфата (НАДН) или никотинамидадениндинуклеотида (НАДН). Никотинамидадениндинуклеотид:

и никотинамидадениндинуклеотидфосфат:

представляют собой динуклеотиды, построенные из амида никотиновой кислоты и аденина, соединенных между собой цепочкой, состоящей из двух остатков D-рибозы и двух остатков фосфорной кислоты. НАДФ отличается от НАД содержанием ещё одного остатка фосфорной кислоты, присоединенного к гидроксилу одного из остатков D-рибозы. Оба соединения широко распространены в природе и участвуют во множестве окислительно-восстановительные реакций, выполняя функцию переносчиков электронов и водорода, которые принимает от окисляемых веществ. Восстановленные формы переносят полученные электроны и водород на другие вещества.

[0114] Термины «кофермент А» или «КоА» относится к хорошо известному из уровня техники коферменту, вовлеченному в процессы окисления и синтеза жирных кислот, биосинтеза жиров, окислительных превращений продуктов распада углеводов, со структурной формулой:

.

[0115] Термин «малонил-КоА» относится к производному кофермента А, образующемуся при синтезе жирных кислот и содержащему остаток малоновой кислоты:

.

[0116] Термин «кумарил-КоА» относится к тиоэфиру кофермента А и кумаровой кислоты:

[0117] Термин «кофеил-КоА» относится к тиоэфиру кофермента А и кофейной кислоты:

[0118] Используемый здесь термин «мутант» или «производное» относятся к белку, раскрытому в настоящем изобретении, в котором одна или более аминокислот добавлены и/или замещены и/или удалены (делетированы) и/или вставлены (инсертированы) в N-конец и/или С-конец, и/или в пределах нативных аминокислотных последовательностей белков настоящего изобретения. Как здесь используется, термин «мутант» относится к молекуле нуклеиновой кислоты, которая кодирует мутантный белок. Кроме того, термин «мутант» здесь относится к любому варианту, который короче или длиннее белка или нуклеиновой кислоты, раскрытых в настоящем изобретении.

[0119] Термин «гомология» используется для описания взаимосвязи последовательностей нуклеотидов или аминокислот с другими последовательностями нуклеотидов или аминокислот, которая определена степенью идентичности и/или сходства между указанными сравниваемыми последовательностями.

[0120] Как здесь используется, аминокислотная или нуклеотидная последовательности «по существу идентичны» или «по существу такие же» как референсная последовательность, если аминокислотная или нуклеотидная последовательности имеют по крайней мере 40% идентичности с указанной последовательностью внутри выбранного для сравнения региона. Таким образом, по существу сходные последовательности включают те, которые имеют, например, по крайней мере, 40% идентичности, или по крайней мере, 50% идентичности, или по крайней мере, 55% идентичности, или по крайней мере, 60% идентичности, или по крайней мере, 62% идентичности, или по крайней мере 65% идентичности, или по крайней мере 70% идентичности, или по крайней мере, 75% идентичности, например, по крайней мере, 80% идентичности, по крайней мере, 85% идентичности, по крайней мере, 90% идентичности (например, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности). Две последовательности, которые идентичны одна другой, так же по существу сходны. Для целей настоящего изобретения длина сравниваемых последовательностей составляет по крайней мере 100 или более аминокислот, предпочтительно, по крайней мере, 200 аминокислот, например, 300 аминокислот или более аминокислот. В частности, возможно сравнение аминокислотных последовательностей полноразмерных белков. Для нуклеиновых кислот длина сравниваемых последовательностей в основном составляет, по крайней мере, 300 или более нуклеотидов; предпочтительно, по крайней мере, 600 нуклеотидов, в том числе 900 или более нуклеотидов.

[0121] Одним из примеров алгоритма, пригодного для определения процента идентичности последовательности и подобности последовательностей, является алгоритм BLAST, описанный в работе Altschul и др., J. Mol. Biol. 215: 403-410 (1990). Программное обеспечение для выполнения анализов по BLAST можно получить через национальный центр информации по биотехнологии (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/). Этот алгоритм включает в себя прежде всего нахождение пар с наиболее высокой степенью идентичности (ПВИ) путем идентификации коротких слов длиной W в тестируемой последовательности, которые либо полностью совпадают, либо удовлетворяют некоторому пороговому положительному значению Т при совмещении со словом такой же длины из последовательности, полученной в базе. Т - это пороговое значение близости слова (Altschul и др., 1990). Эти первоначальные нахождения близости слов (совпадений) служат затравкой для инициации поиска более длинных ПВИ, содержащих эти слова. Затем эти совпадения слов расширяются в обоих направлениях вдоль каждой последовательности настолько далеко, насколько может увеличиваться совокупное значение баллов за совпадения. Совокупные значения вычисляются при помощи (для нуклеотидных последовательностей) параметров М (премиальный балл, начисляемый за пару совпадающих остатков; он всегда> 0) и N (штрафной балл за несовпадение остатков; он всегда <0). Для вычисления совокупного значения по последовательностям аминокислот применяется матрица начисления баллов. Расширение совпадений слов в каждом направлении останавливается тогда, когда совокупное значение баллов за совпадения падает от максимального достигнутого значения на величину X, когда совокупное значение счета падает до нуля или ниже нуля вследствие накопления одного или нескольких отрицательных результатов совпадения, или же при достижении конца любой из последовательностей. Параметры W, Т и X алгоритма BLAST определяют чувствительность и скорость совмещения. В программе BLASTN (для нуклеотидных последовательностей) по умолчанию длина слова (W) принимается равной 11, ожидаемое значение (Е) равным 10, падение (отсечка) равным 100, М=5, N=-4, и сравнение выполняется по обеим цепочкам. Для последовательностей аминокислот программа BLASTP по умолчанию принимает длину слова (W) равной 3, ожидаемое значение (Е) равным 10, а также использует матрицу начисления баллов BLOSUM62 (см. Henikoff и Henikoff, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89: 10915 (1989)).

[0122] Кроме вычисления процента идентичности последовательности алгоритм BLAST также выполняет статистический анализ подобности между двумя последовательностями (см., например, Karlin и Altschul, Proc. Nat'l. Acad. Sci. USA 90: 5873-5787 (1993)). Одной из величин определения подобности, предоставляемой алгоритмом BLAST, является наименьшая суммарная вероятность (P(N)), показывающая вероятность, с которой совпадение между двумя нуклеотидными или аминокислотными последовательностями может произойти случайно. Например, тестируемая последовательность нуклеиновых кислот считается подобной ссылочной последовательности, если наименьшая суммарная вероятность при сравнении тестовой последовательности нуклеиновых кислот со ссылочной последовательностью нуклеиновых кислот меньше 0,1, более предпочтительно меньше чем 0,01, а наиболее предпочтительно меньше чем 0,001.

[0123] Термин «консенсусная последовательность» относится к архетипичной аминокислотной последовательности, с которой сравнивают все варианты конкретных представляющих интерес белков или последовательностей. Консенсусные последовательности и методы их определения хорошо известны специалистам в данной области. Например, консенсусная последовательность определяется с помощью множественного сравнения известных гомологичных белков путем выявления аминокислот, наиболее часто встречающихся в данном положении во всей совокупности родственных последовательностей.

[0124] Термин «консервативная последовательность» используется для обозначения нуклеотидной последовательности в нуклеиновых кислотах или последовательности аминокислот в полипептидной цепи, которые совсем не изменяются или незначительно изменяются у разных организмов в ходе эволюции. Соответственно «неконсервативная последовательность» – это последовательность, которая значительно варьирует у сравниваемых организмов.

[0125] Термин «аминокислотная вставка» означает одну или несколько аминокислот внутри полипептидной цепи, которые находятся между обсуждаемыми фрагментами белка (белковыми доменами, линкерами, консенсусными последовательностями). Специалистам в данной области очевидно, что обсуждаемые фрагменты и аминокислотные вставки оперативно связаны и образуют единую полипептидную цепь.

[0126] Для определения доменной структуры белка может быть использован любое программное обеспечение, известное из уровня техники. Например, может быть использовано программное обеспечение SMART (Simple Modular Architecture Research Tool), доступное в сети Интернет по адресу http://smart.embl-heidelberg.de [Schultz et al., PNAS 1998; 95: 5857-5864; Letunic I, Doerks T, Bork P Nucleic Acids Res 2014; doi:10.1093/nar/gku949].

[0127] Термин «оперативно связанный» или ему подобный при описании белков слияния относиться к полипептидным последовательностям, которые находятся в физической и функциональной связи одна с другой. В наиболее предпочтительных воплощениях, функции полипептидных компонентов химерной молекулы не изменены по сравнению с функциональными свойствами выделенных полипептидных компонентов. Например, гиспидин-гидроксилаза настоящего изобретения может быть оперативно сшита с представляющим интерес партнером слияния, например, люциферазой. В этом случае белок слияния сохраняет свойства гиспидин-гидроксилазы, а представляющий интерес полипептид сохраняет его оригинальную биологическую активность – например, способность окислять люциферин с выделением света. В некоторых воплощениях настоящего изобретения, активности партнеров слияния могут быть снижены по сравнению с активностями изолированных белков. Такие белки слияния также находят применение в рамках настоящего изобретения.

[0128] Термин «оперативно связанный» или ему подобный при описании нуклеиновых кислот означает, что нуклеиновые кислоты ковалентно связаны таким образом, что в местах их соединения отсутствуют «сбои» рамки считывания и стоп-кодоны. Как очевидно для любого специалиста в данной области техники, нуклеотидные последовательности, кодирующие белок слияния, включающий «оперативно связанные» компоненты (белки, полипептиды, линкерные последовательности, аминокислотные вставки, белковые домены и т.д.), состоят из фрагментов, кодирующих указанные компоненты, где эти фрагменты ковалентно связаны таким образом, что в ходе транскрипции и трансляции нуклеотидной последовательности продуцируется полноразмерный белок слияния.

[0129] При описании связи нуклеиновой кислоты с регуляторными кодирующими последовательностями (промоторами, энхансерами, терминаторами транскрипции) термин «оперативно связаны» означает, что последовательности расположены и сшиты таким образом, регуляторная последовательность будет воздействовать на уровень экспрессии кодирующей или последовательности нуклеиновой кислоты.

[0130] В контексте настоящего изобретения «связывание» нуклеиновых кислот означает, что две или несколько нуклеиновых кислот соединяют вместе при помощи любых способов, известных в данной отрасли. Для примера, не являющегося ограничивающим, скажем, что нуклеиновые кислоты можно лигировать вместе при помощи, например, ДНК-лигазы или соединять отжигом при помощи ПЦР. Нуклеиновые кислоты также можно соединять путем химического синтеза нуклеиновой кислоты, используя последовательность из двух или нескольких отдельных нуклеиновых кислот.

[0131] Термины «регуляторные элементы» или «регуляторные последовательности» относятся к последовательностям, включенным в управление экспрессией кодирующей нуклеиновой кислоты. Регуляторные элементы включают в себя промотор, терминирующие сигналы и другие последовательности, влияющие на экспрессию нуклеиновой кислоты. В типичном случае они также охватывают последовательности, требуемые для надлежащей трансляции нуклеотидной последовательности.

[0132] Термин «промотор» используется для описания нетранслируемой и нетранскрибируемой последовательности ДНК, находящейся до кодирующей области и содержащей участок связывания РНК-полимеразы, а также инициирующей транскрипцию ДНК. Область промотора может также включать в себя другие элементы, работающие регуляторами экспрессии генов.

[0133] Как здесь используется, термин «функциональный» означает, что нуклеотидная или аминокислотная последовательность может функционировать для указанного испытания или задачи. Термин «функциональный», используемый для описания люцифераз, означает, что белок обладает способностью производить сопровождающуюся люминесценцией реакцию окисления люциферина. При описании гиспидин-гидроксилаз термин «функциональный» означает, что белок обладает способностью катализировать реакцию превращения по крайней мере одного из предлюциферинов, показанных в Таблице 2 в соответствующий люциферин. При описании гиспидин-синтаз термин «функциональный» означает, что белок обладает способностью катализировать реакцию превращения по крайней мере одного из предшественников предлюциферинов в предлюциферин, например, превращение кофейной кислоты в гиспидин. При описании кофеилпируват-гидролаз термин «функциональный» означает, что белок обладает способностью катализировать реакцию превращения по крайней мере одного из оксилюциферинов в предшественник предлюциферина (например, превращение кофеилпирувата в кофейную кислоту).

[0134] Как здесь используется, термин «ферментативные свойства» относятся к способности белка катализировать ту или иную химическую реакцию.

[0135] Как здесь используется, термин «биохимические свойства» относятся к белковому фолдингу (сворачиванию) и скорости созревания, времени полужизни, скорости катализа, pH и температурной стабильности, и другим подобным свойствам.

[0136] Как здесь используется, «спектральные свойства» относятся к спектрам, квантовому выходу и интенсивности люминесценции и другим подобным свойствам.

[0137] Ссылка на нуклеотидную последовательность, «кодирующую» полипептид, означает, что с нуклеотидной последовательности в ходе транскрипции мРНК и трансляции продуцируется этот полипептид. При этом может быть указана как кодирующая цепь, идентичная мРНК и обычно используемая в списке последовательностей, так и комплементарная цепь, которая используется как матрица при транскрипции. Как очевидно для любого специалиста в данной области техники, термин также включает любые вырожденные нуклеотидные последовательности, кодирующие одинаковую аминокислотную последовательность. Нуклеотидные последовательности, кодирующие полипептид, включают последовательности, содержащие интроны.

[0138] Термины «экспрессионная кассета» или «кассета экспрессии» используются здесь в значении последовательности нуклеиновых кислот, способной направлять экспрессию конкретной нуклеотидной последовательности в соответствующей клетке-хозяине. Как правило «кассета экспрессии» содержит гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую белок или его функциональный фрагмент, оперативно связанную с промотором и сигналами терминации. В типичном случае она также содержит последовательности, требуемые для надлежащей трансляции значимой нуклеотидной последовательности. Экспрессионная кассета может быть такой, которая встречается в природе (в том числе и в клетках хозяина), но была получена в рекомбинантной форме, полезной для экспрессии гетерологичной нуклеиновой кислоты. Часто «кассета экспрессии» является гетерологичной по отношению к хозяину, т.е. конкретная последовательность нуклеиновых кислот этой экспрессионной кассеты не встречается в природе в клетке-хозяине, и должна вводиться в клетку-хозяин или в предшественник клетки-хозяина путем трансформации. Экспрессия нуклеотидной последовательности может находиться под управлением конститутивного промотора или индуцируемого промотора, который инициирует транскрипцию только тогда, когда клетка-хозяин открыта для определенного внешнего стимула. В случае многоклеточного организма промотор может также обладать специфичностью к конкретной ткани, или органу, или к стадии развития.

[0139] «Гетерологичная» или «экзогенная» нуклеиновая кислота означает нуклеиновую кислоту, не имеющуюся в клетке-хозяине дикого типа.

[0140] Термин «эндогенный» относится к нативному белку или нуклеиновой кислоте в их природном положении в геноме организма.

[0141] Как здесь используется, термин «специфически гибридизуется» относится к ассоциации между двумя одноцепочечными молекулами нуклеиновых кислот или в достаточной степени комплементарными последовательностями, что разрешает такую гибридизацию в предопределенных условиях, обычно использующихся в данной области (иногда используется термин «по существу комплементарный»).

[0142] «Изолированная» молекула нуклеиновой кислоты или изолированный белок представляют собой молекулу нуклеиновой кислоты или белок, которые вследствие действий человека существуют отдельно от своей естественной среды, а поэтому не являются продуктом природы. Изолированная молекула нуклеиновой кислоты или изолированный белок могут существовать в очищенной форме или могут существовать в неестественной среде, например, (что не означает ограничений) такой, как рекомбинантная прокариотическая клетка, растительная клетка, животная клетка, клетка небиолюминесцентного гриба, трансгенный организм (гриб, растение, животное) и т.д.

[0143] «Трансформация» - это процесс для введения гетерологичной нуклеиновой кислоты в клетку-хозяин или в организм. В частности, «трансформация» означает устойчивую интеграцию молекулы ДНК в геном интересующего организма.

[0144] «Трансформированный / трансгенный / рекомбинантный» относится к организму-хозяину, такому как бактерия, или растение, или гриб, или животное, в который ввели гетерологичную молекулу нуклеиновой кислоты. Эта молекула нуклеиновой кислоты может быть устойчиво интегрирована в геном хозяина, или же эта молекула нуклеиновой кислоты также может присутствовать как внехромосомная молекула. Такая внехромосомная молекула может быть способна к саморепликации. Следует понимать, что к трансгенным или устойчиво-трансформированным клеткам, тканям или организмам относятся не только конечные продукты процесса трансформации, но также и их трансгенное потомство. Термины «не трансформированный», «не трансгенный» или «не рекомбинантный», или «дикого типа» относятся к природному организму-хозяину или клетке-хозяину, например, к бактерии или растению, который не содержит гетерологичной молекулы нуклеиновой кислоты.

[0145] Термин «автономно светящийся» или «автономно биолюминесцентный» относятся к трансгенным организмам и клеткам-хозяевам, которые обладают способностью к биолюминесценции без экзогенного добавления люциферинов, предлюциферинов или предшественников предлюциферинов.

[0146] Термин «4'-фосфопантотеинил трансфераза» используется здесь для обозначения фермента, осуществляющего перенос 4-фосфопантетеинила от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтазы. 4'-фосфопантотеинил трансферазы экпсрессируются в природе многими растениями и грибами и известны из уровня техники [Gao Menghao et al., Microbial Cell Factories 2013,12:77]. Специалисту в данной области очевидно, что для нужд настоящего изобретения может быть использован любой функциональный вариант 4'-фосфопантотеинил трансферазы. Например, может быть использована 4'-фосфопантотеинил трансфераза NpgA из Aspergillus nidulans (SEQ ID NO 104, 105), описанная в [Gao Menghao et al., Microbial Cell Factories 2013,12:77], или ее гомолог или мутант, то есть белок, аминокислотная последовательность которого по существу сходная или идентичная с последовательностью, показанной в SEQ ID NO: 105. Например, может быть использована 4'-фосфопантотеинил трансфераза, имеющая по крайней мере 40% идентичности с последовательностью SEQ ID NO: 105, в том числе, по крайней мере, 50% идентичности, или по крайней мере, 55% идентичности, или по крайней мере, 60% идентичности, или по крайней мере, 62% идентичности, или по крайней мере 65% идентичности, или по крайней мере 70% идентичности, или по крайней мере, 75% идентичности, например, или по крайней мере, 80% идентичности, или по крайней мере, 85% идентичности, или по крайней мере, 90% идентичности (например, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности).

[0147] Нуклеотиды обозначаются по их основаниям следующими стандартными сокращенными обозначениями: аденин (А), цитозин (С), тимин (Т) и гуанин (G). Аналогичным образом аминокислоты обозначаются следующими стандартными сокращенными обозначениями: аланин (Ala; А), аргинин (Arg; R), аспарагин (Asn; N), аспарагиновая кислота (Asp; D), цистеин (Cys; С), глутамин (Gln; Q), глутаминовая кислота (Glu; Е), глицин (Gly; G), гистидин (His; Н), изолейцин (Не; 1), лейцин (Leu; L), лизин (Lys; К), метионин (Met; М), фенилаланин (Phe; F), пролин (Pro; Р), серин (Ser; S), треонин (Thr; Т), триптофан (Trp; W), тирозин (Туг; Y) и валин (Val; V).

[0148] Настоящее изобретение направлено на новые ферменты биосинтеза люциферина грибов, кодирующие их нуклеиновые кислоты, применение белков в качестве ферментов, катализирующих стадии биосинтеза люциферина грибов. Также изобретение обеспечивает применение нуклеиновых кислот для получения указанных ферментов в клетке или организме. Также обеспечиваются способы получения химических соединений, являющихся люциферинами и предлюциферинами грибов, в системах in vitro и in vivo. Также обеспечиваются векторы, включающие нуклеиновую кислоту, описанную в настоящем изобретении. Кроме того, настоящее изобретение обеспечивает кассеты экспрессии, включающие нуклеиновую кислоту настоящего изобретения и регуляторные элементы, необходимые для экспрессии нуклеиновой кислоты в выбранной клетке-хозяине. Кроме того, обеспечиваются клетки, стабильные клеточные линии, трансгенные организмы (например, растения, животные, грибы, микроорганизмы), включающие нуклеиновые кислоты, векторы или экспрессионные кассеты настоящего изобретения. Также обеспечиваются комбинации нуклеиновых кислот для получения автономно светящихся клеток, клеточных линий или трансгенных организмов. В преимущественных воплощениях клетки и трансгенные организмы способны производить люциферин грибов из предшественников. В некоторых воплощениях клетки и трансгенные организмы способны производить предлюциферин грибов из предшественников. В некоторых воплощениях клетки и трансгенные организмы способны к биолюминесценции в присутствии предшественника люциферина грибов. В некоторых воплощениях клетки и трансгенные организмы способны к автономной биолюминесценции. Также обеспечиваются комбинации белков для получения люциферина и его предшественников из более простых химических соединений. Также обеспечивается набор, содержащий нуклеиновые кислоты или векторы или экспрессионные кассеты настоящего изобретения, предназначенный для получения светящихся клеток, клеточных линий или трансгенных организмов.

Белки

[0149] Как было указано выше, настоящее изобретение обеспечивает белки, вовлеченные в качестве ферментов в биосинтез (циклическую систему превращений) люциферина грибов.

[0150] Белки по изобретению могут быть получены из природных источников или получены с помощью рекомбинантных технологий. Например, белки дикого типа могут быть выделены из биолюминесцентных грибов, например, из грибов, относящихся к типу Basidiomycota, преимущественно к классу Basidiomycetes, в частности, к отряду Agaricales. Например, белки дикого типа могут быть выделены из грибов Neonothopanus nambi, Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos и т.д. Белки настоящего изобретения могут также быть получены экспрессией рекомбинантной нуклеиновой кислоты, кодирующей последовательность, белка в соответствующем хозяине или в бесклеточной системе экспрессии, как описано в разделе «Нуклеиновые кислоты». В некоторых воплощениях белки применяются внутри клеток-хозяев, в которые введены способные к экспрессии нуклеиновые кислоты, кодирующие указанные белки.

[0151] В преимущественных воплощениях заявленные белки укладываются быстро после экспрессии в клетке-хозяине. Под быстрым укладыванием понимается то, что белки достигают своей третичной структуры, которая обеспечивает их ферментативное свойство, через короткий период времени. В этих воплощениях, белки укладываются в течение периода времени, который в общем случае не превышает приблизительно 3 дня, обычно не превышает приблизительно 2 дня и чаще не превышает приблизительно 12-24 часа.

[0152] В некоторых воплощениях белки используются в изолированной форме. Для очистки белка могут применяться любые обычные методики, где подходящие методы очистки белка описаны в Guide to Protein Purification, (Deuthser ed., Academic Press, 1990). Например, лизат может быть приготовлен из исходного источника и очищен с использованием ВЭЖХ, вытеснительной хроматографии, гель-электрофореза, аффинной хроматографии и т.п.

[0153] Если белки согласно настоящему изобретению находятся в изолированной форме, то это означает, что данный белок по существу свободен от присутствия других белков или других природных биологических молекул, таких как олигосахариды, нуклеиновые кислоты и их фрагменты и т.п., где термин «по существу свободен» в данном случае означает, что менее чем 70%, обычно менее чем 60% и чаще менее чем 50% указанной композиции, содержащей выделенный белок, представляет собой другую природную биологическую молекулу. В некоторых вариантах указанные белки присутствуют по существу в очищенной форме, где термин «по существу очищенная форма» обозначает чистоту, равную по меньшей мере 95%, обычно равную по меньшей мере 97% и чаще равную по меньшей мере 99%.

[0154] Белки настоящего изобретения сохраняют активность при температурах ниже 50°С, чаще при температурах до 45°С, то есть они сохраняют активность при температурах 20-42°С и могут быть использованы в системах гетерологической экспрессии in vitroи in vivo.

[0155] Заявленные белки обладают рН стабильностью в диапазоне от 4 до 10, чаще в диапазоне от 6.5 до 9.5. Оптимум рН стабильности заявленных белков лежит в диапазоне между 6.8 и 8.5, например, между 7.3-8.3.

[0156] Заявленные белки активны в физиологических условиях. Термин «физиологические условия» в данном изобретении подразумевает среду, имеющую температуру в диапазоне от 20 до 42°С, pH в диапазоне от 6.8 до 8.5, солевой и осмолярностью 300-400 мосмоль/л. В частности, термин «физиологические условия» включает внутриклеточную среду, клеточный экстракт и жидкости, экстрагированные из живых организмов, такие как плазма крови. «Физиологические условия» могут быть созданы искусственно. Например, комбинируя известные химические соединения могут быть созданы реакционные смеси, обеспечивающие «физиологические условия». Способы создания таких сред хорошо известны из уровня техники. Неограничивающие примеры включают:

[0157] 1) Раствор Рингера, изотоничный плазме крови млекопитающих.

[0158] Раствор Рингера состоит из 6,5 г NaCl, 0,42 г KCl и 0,25 г CaCl2, растворенных в 1 литре бидистиллированной воды. При приготовлении раствора соли добавляются последовательно, каждую последующую соль прибавляют только после растворения предыдущей. Для предотвращения выпадения осадка углекислого кальция рекомендуется через раствор бикарбоната натрия пропускать углекислый газ. Раствор готовят на свежей дистиллированной воде.

[0159] 2) Раствор Версена

[0160] Раствор Версена представляет собой смесь ЭДТА и неорганических солей, растворенную в воде дистиллированной или в воде для инъекций, стерилизованную методом мембранной фильтрации с использованием фильтров с конечным размером пор 0,22 мкм. 1л раствора Версена содержит NaCl 8.0 г, KCl 0.2 г, натрий фосфорнокислый двузамещенный 12-водный 1,45 г, калий фосфорнокислый однозамещенный 0,2 г, натриевая соль этилендиаминтетрауксусной кислоты 0,2 г, бидистиллированная вода – до 1 л. Раствор Версена должен иметь буферную емкость не менее 1,4 мл. Содержание иона хлора – от 4,4 до 5,4 г/л, ЭДТА – не менее 0,6 ммоль/л.

[0161] 3) фосфатно-солевой буфер (PBS, Na-фосфатный буфер)

[0162] Na-фосфатный буфер состоит из 137 мМ NaCl, 10 мМ Na2HPO4, 1,76 мМ KH2PO4. Буфер может также содержать KCl в концентрации до 2.7 мМ. Для приготовления 1 литра однократного натрий-фосфатного буфера используют: 8,00 г NaCl, 1,44 г Na2HPO4, 0,24 г KH2PO4, 0,20 г KCl (опционно). Растворяют в 800 мл дистиллированной воды. Требуемый pH доводят соляной кислотой или гидроксидом натрия. Далее доводят объем до 1 л дистиллированной водой.

[0163] Специфические белки, представляющие интерес, являются ферментами, вовлеченными в циклический биосинтез люциферина грибов, их мутантами, гомологами и производными. Каждый из этих специфических типов полипептидных структур, представляющих интерес, далее будет рассмотрен индивидуально более подробно.

[0164] Гиспидин-гидроксилазы

[0165] Гиспидин-гидрокислазами настоящего изобретения являются белки, которые обладают способностью катализировать синтез люциферина из предлюциферина. Иными словами, это ферменты, катализирующие реакцию превращения 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

,

в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[0166] Реакция осуществляется в физиологических условиях в системах in vitro и in vivo в присутствии по крайней мере одной молекулы НАД(Ф)Н и по крайней мере одной молекулы молекулярного кислорода (О2) на одну молекулу 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она:

[0167] Гиспидин-гидроксилазы, представляющие интерес, включают белки из биолюминесцентных грибов Neonothopanus nambi, Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, а также их функциональные мутанты, гомологи и производные.

[0168] В преимущественных воплощениях гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения характеризуются наличием ФАД/НАД-связывающего домена (FAD/NAD(P) binding domain, IPR002938 – код по публичной базе данных InterPro, доступной в сети Интернет по адресу http://www.ebi.ac.uk/interpro). Указанный домен участвует в связывании флавинадениндинуклеотида (FAD) и никотинамидадениндинуклеотиида (NAD) у множества ферментов, добавляющих гидроксильную группу к субстрату и найденных в метаболических путях множества организмов. Гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения содержат указанный домен длиной 350-385 аминокислот, чаще 360-380 аминокислот, например, 364-377 аминокислоты, фланкированный N- и C-концевые неконсервативными аминокислотными последовательностями, обладающими более низким процентом идентичности друг с другом. Положение ФАД/НАД-связывающего домена у заявленных гиспидин-гидроксилаз указано на множественном выравнивании аминокислотных последовательностей индивидуальных белков на фиг. 1.

[0169] Также обеспечиваются гомологи или мутанты гиспидин-гидроксилаз, последовательность которых отличаются от описанных выше указанных специфических аминокислотных последовательностей, заявленных в изобретении, то есть SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28. Представляющие интерес гомологи или мутанты имеют по меньшей мере не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с белком, аминокислотная последовательность которого выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, на протяжении по крайней мере 350 аминокислот. В особенности это относится к последовательностям аминокислот, которые обеспечивают функциональные участки белка, то есть к последовательности входящего в состав гиспидин-гидроксилаз ФАД/НАД-связывающего домена.

[0170] В преимущественных воплощениях аминокислотная последовательность гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения характеризуется наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), характерных только для данной группы ферментов. Эти консенсусные последовательности показаны в SEQ ID NOs: 29-33. Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей гиспидин-гидроксилаз оперативно связаны через аминокислотные вставки с меньшей консервативностью.

[0171] Гиспидин-синтазы

[0172] Гиспидин-синтазы настоящего изобретения представляют собой белки, которые обладают способностью катализировать синтез предлюциферина из его предшественников. Иными словами, это ферменты, катализирующие реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[0173] Примеры 3-арилакриловых кислот, служащих предшественниками предлюциферинов, показаны в Таблице 2.

[0174] Реакция осуществляется в физиологических условиях в системах in vitro и in vivo в присутствии по крайней мере одной молекулы кофермента А, по крайней мере одной молекулы АТФ и по крайней мере двух молекул малонил-КоА:

[0175] Гиспидин-синтазы, представляющие интерес, включают белки из биолюминесцентных грибов Neonothopanus nambi, Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, а также их функциональные мутанты, гомологи и производные.

[0176] В преимущественных воплощениях аминокислотная последовательность гиспидин-синтазы настоящего изобретения характеризуется наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), характерных только для данной группы ферментов. Эти консенсусные последовательности показаны в SEQ ID NOs: 56-63. Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей гиспидин-синтаз оперативно связаны через аминокислотные вставки с меньшей консервативностью.

[0177] Во многих вариантах осуществления настоящего изобретения представляющие интерес аминокислотные последовательности гомологов и мутантов специфических гиспидин-синтаз характеризуются значительной идентичностью с последовательностями, показанными в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, которая составляет, например, не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) на протяжении всей аминокислотной последовательности белка.

[0178] В преимущественных воплощениях гиспидин-синтазы настоящего изобретения являются полидоменными белками, относящимися к суперсемейству поликетидсинтаз. В преимущественных воплощениях гиспидин-синтазы настоящего изобретения подвергаются посттрансляционной модификации, а именно для их созревания требуется перенос 4-фосфопантетеинила от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтазы. Из уровня техники известны ферменты - 4'-фосфопантотеинил трансферазы, осуществляющие такую модификацию [Gao Menghao et al., Microbial Cell Factories 2013,12:77]. 4'-фосфопантотеинил трансферазы экпсрессируются в природе многими растениями и грибами, в клетках которых созревание функциональной гиспидин-синтазы настоящего изобретения происходит без введения дополнительных ферментов или кодирующих их нуклеиновых кислот. В тоже время для созревания гиспидин-синтазы в клетках ряда низших грибов (например, дрожжей) и животных требуется введение в клетки-хозяева кодирующей последовательности 4'-фосфопантотеинил трансферазы. Специалисту в данной области очевидно, что для нужд настоящего изобретения может быть использован любой функциональный вариант 4'-фосфопантотеинил трансферазы, известный из уровня техники. Например, может быть использована 4'-фосфопантотеинил трансфераза NpgA из Aspergillus nidulans (SEQ ID NO 104, 105), описанная в [Gao Menghao et al., Microbial Cell Factories 2013,12:77], любой ее гомолог или мутант с подтвержденной активностью.

[0179] Кофеилпируват-гидролазы

[0180] Кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения представляют собой белки, которые обладают способностью катализировать превращение оксилюциферина, представляющего собой 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновые кислоту, имеющую структурную формулу

[0181] , где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой

[0182] , где R – арил или гетероарил.

[0183] Примеры оксилюциферинов показаны в Таблице 2.

[0184] Реакция осуществляется в физиологических условиях в системах in vitro и in vivo:

[0185] В преимущественных воплощениях кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения осуществляют превращение кофеилпирувата в кофейную кислоту. В преимущественных воплощениях они осуществляют превращение оксилюциферина, показанного в Таблице 2 в предшественник предлюциферина.

[0186] Кофеилпируват-гидролазы, представляющие интерес, включают белки из биолюминесцентных грибов Neonothopanus nambi, Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, а также их функциональные мутанты, гомологи и производные.

[0187] В преимущественных воплощениях аминокислотная последовательность кофеилпируват-гидролаз настоящего изобретения (включая представляющие интерес гомологи и мутанты) характеризуется наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), характерных только для данной группы ферментов. Эти консенсусные последовательности показаны в SEQ ID NOs: 76-78. Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей кофеилпируват-гидролаз оперативно связаны через аминокислотные вставки с меньшей консервативностью.

[0188] Во многих вариантах осуществления настоящего изобретения представляющие интерес аминокислотные последовательности кофеилпируват-гидролаз характеризуются значительной идентичностью с последовательностями, показанными в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, которая составляет, например, не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) на протяжении всей аминокислотной последовательности белка.

[0189] Гомологи вышеописанных специфических белков (то есть белков с аминокислотными последовательностями SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55, 65, 67, 69, 71, 73, 75) могут быть выделены из природных источников. Гомологи могут быть обнаружены во многих организмах (грибах, растениях, микроорганизмах, животных). В частности, гомологи могут быть обнаружены у различных видов биолюминесцентных грибов в частности из грибов, относящихся к типу Basidiomycota, преимущественно к классу Basidiomycetes, в частности, к отряду Agaricales. Также особый интерес в качестве источника гомологов белков настоящего изобретения представляют небиолюминесцентные грибы и растения, производящие гиспидин, такие как Pteris ensiformis [Yung-Husan Chen et al., «Identification of phenolic antioxidants from Sword Brake fern (Pteris ensiformis Burm.)», Food Chemistry, Volume 105, Issue 1, 2007, pp. 48-56], Inonotus xeranticus [In-Kyoung Lee et al., «Hispidin Derivatives from the Mushroom Inonotus xeranticus and Their Antioxidant Activity», J. Nat. Prod., 2006, 69 (2), pp. 299–301], Phellinus sp. [In-Kyoung Lee et al., «Highly oxygenated and unsaturated metabolites providing a diversity of hispidin class antioxidants in the medicinal mushrooms Inonotus and Phellinus». Bioorganic & Medicinal Chemistry. 15 (10): 3309–14.], Equisetum arvense [Markus Herderich et al., «Establishing styrylpyrone synthase activity in cell free extracts obtained from gametophytes of Equisetum arvense L. by high performance liquid chromatography–tandem mass spectrometry». Phytochem. Anal., 8: 194-197.].

[0190] Также обеспечиваются белки, которые являются производными или мутантами вышеописанных белков, встречающихся в природе. Мутанты и производные могут сохранять биологические свойства белков дикого типа (например, встречающихся в природе), или могут иметь биологические свойства, которые отличаются от белков дикого типа. Мутации включают замены одной или более аминокислот, делецию или инсерцию одной или более аминокислот, замены или усечения, или удлинения N-конца, замены или усечения, или удлинения C-конца и т.п. Мутанты и производные могут быть получены с использованием стандартных методов молекулярной биологии, как подробно описано в разделе «Нуклеиновые кислоты». Мутанты по существу идентичны белкам дикого типа, то есть имеют с ними по крайней мере 40% идентичности внутри выбранного для сравнения региона. Таким образом, по существу сходные последовательности включают те, которые имеют, например, по крайней мере, 40% идентичности, или по крайней мере, 50% идентичности, или по крайней мере, 55% идентичности, или по крайней мере, 60% идентичности, или по крайней мере, 62% идентичности, или по крайней мере 65% идентичности, или по крайней мере 70% идентичности, или по крайней мере, 75% идентичности, например, по крайней мере, 80% идентичности, или по крайней мере, 85% идентичности, или по крайней мере, 90% идентичности (например, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) внутри выбранного для сравнения региона. Во многих воплощениях гомологи, представляющие интерес, имеют намного более высокую идентичность последовательности, например, 70%, 75%, 80%, 85%, 90% (например, 92%, 93%, 94%) или выше, например, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, 99,5%, особенно для последовательности аминокислот, которые обеспечивают функциональные области белка.

[0191] Производные могут быть также получены с использованием стандартных методов и включают изменение при помощи РНК, химические модификации, модификации после трансляции и после транскрипции и т.п. Например, производные могут быть получены методами, такими как измененное фосфорилирование или гликозилирование, или ацетилирование, или липидирование, или различными типами расщепления при созревании и т.п.

[0192] Для поиска функциональных мутантов, гомологов и производных используются способы хорошо известные специалистам в данной области. Например, может быть использован функциональный скрининг экспрессионной библиотеки, содержащей варианты (например, мутантные формы белков, или гомологичные белки или производные белков). Экспрессионная библиотека получается путем клонирования нуклеиновых кислот, кодирующих тестируемые варианты белков в экспрессионный вектор и их введение в подходящие клетки-хозяина. Способы работы с нуклеиновыми кислотами описаны более подробно в разделе «Нуклеиновые кислоты». Для выявления функциональных ферментов настоящего изобретения к клеткам, экспрессирующим тестируемые нуклеиновые кислоты, добавляют подходящий субстрат. Появление ожидаемого продукта реакции, катализируемой функциональным ферментом, можно обнаружить с помощью методов высокоэффективной жидкостной хроматографии, используя синтетические варианты ожидаемых продуктов реакции в качестве стандартов. Например, для выявления функциональных гиспидин-гидроксилаз в качестве субстрата может быть использован гиспидин или иной предлюциферин, показанный в таблице 2. Ожидаемым продуктом реакции является люциферин грибов. Для выявления гиспидин-синтаз в качестве субстрата может быть использован предшественник предлюциферина (например, кофейная кислота), а продуктом реакции является соответствующий предлюциферин грибов. Следует учитывать, что для скрининга функциональных гиспидин-синтаз клетки-хозяева должны экспрессировать 4'-фосфопантотеинил трансферазу, обеспечивающую посттрансляционную модификацию белка.

[0193] Для поиска функциональных кофеилпируват-гидролаз в качестве субстрата реакции используется оксилюциферин (Таблица 2), а тестируемым продуктом реакции является предшественник предлюциферина – 3-арилакриловая кислота.

[0194] Во многих воплощениях настоящего изобретения для поиска функциональных ферментов настоящего изобретения может использоваться биолюминесцентная реакция. В этом случае для приготовления экспрессионной библиотеки используются клетки, продуцирующие люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, и функциональные ферменты, обеспечивающие производство люциферина грибов из продукта ферментативной реакции, осуществляемой анализируемым белком.

[0195] Так для скрининга функциональных гиспидин-гидроксилаз используются клетки-хозяева, продуцирующие функциональную люциферазу, субтратом которой является люциферин грибов. При добавлении предлюциферина к клеткам, содержащим функциональный вариант гиспидин-гидроксилазы, происходит образование люциферина грибов и возникновение свечения за счет реакции окисления люциферина грибов люциферазой.

[0196] Для скрининга функциональных гиспидин-синтаз используются клетки-хозяева, дополнительно продуцирующие функциональную люциферазу, субстратом которой является люциферин грибов, и функциональную гиспидин-гидроксилазу. При добавлении предшественника люциферина к таким клеткам происходит образование люциферина грибов и возникновение свечения за счет реакции окисления люциферина грибов люциферазой.

[0197] Для скрининга функциональных кофеилпируват-гидролаз используются клетки-хозяева, продуцирующие функциональную люциферазу, субстратом которой является люциферин грибов, функциональную гиспидин-гидроксилазу и функциональную гиспидин-синтазу. При добавлении оксилюциферина к таким клеткам происходит образование люциферина грибов и возникновение свечения за счет реакции окисления люциферина грибов люциферазой.

[0198] Для скринига могут быть использованы любые люциферазы способные окислять с выделением света люциферин, выбранный из группы 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-онов с общей формулой

, где R – арил или гетероарил. Неограничивающие примеры люциферинов приведены в таблице 1. Неограничивающие примеры подходящих люцифераз описаны в разделе «Применение, комбинации и способы использования» ниже.

[0199] Реакция окисления люциферинов люциферазой сопровождается выделением детектируемого света. Выделяемый в процессе реакции свет может быть выявлен обычными методами (например, при визуальном осмотре, осмотре с помощью приборов ночного видения, спектрофотометрией, спектрофлуориметрией, с использованием фотографической регистрации изображения, с использованием специализированного оборудования для детекции люминесценции и флуоресценции, такого, как, например, IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer) и т.п.). Регистрируемый свет может испускаться в диапазоне интенсивностей от одного фотона до легко заметного глазу света, например, с интенсивностью 1 кд, и яркого света с интенсивностью, например, 100 кд, и более. Испускаемый при окислении 3-гидроксигиспидина свет находится в диапазоне от 400 до 700 нм, чаще в диапазоне от 450 до 650 нм, с максимумом эмиссии при 520-590 нм. Свет, испускаемый при окислении других 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-онов, может иметь сдвиг максимума эмиссии (Таблица 3).

Таблица 3. Максимумы эмиссии для ряда люциферинов грибов

ВеществоМаксимум эмиссии, нм3-гидроксигиспидин 538(E)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2H-пиран-2-он 520(E)-6-(2-(1H-индол-3-ил)винил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он,480(E)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он504(E)-3,4-дигидрокси-6-(2-(2,3,6,7-тетрагидро-1H,5H-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2H-пиран-2-он,534(E)-3,4-дигидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2H-пиран-2-он564

[0200] Примеры осуществления функционального скрининга с использованием биолюминесценции описаны в экспериментальной части ниже.

[0201] Также изобретение охватывает белки слияния, включающие белок настоящего изобретения. Его гомолог, мутант, в том числе укороченную или удлиненную форму. Белок по изобретению может быть оперативно слит с сигналом внутриклеточной локализации (например, сигналом локализации в ядре, сигналом локализации в митохондриях, или пероксисомах, или лизосомах, или аппарате Гольджи, или в других клеточных органеллах), сигнальным пептидом, обеспечивающим выделение белка в межклеточное пространство, трансмембранным доменом или с любым белком или полипептидом (партнером слияния), представляющим интерес. Белки слияния могут включать оперативно сшитые, например, гиспидин-гидроксилазу, и\или гиспидин-синтазу, и\или кофеилпируват-гидролазу, заявленную в изобретении, с присоединенным на C- или N-конец партнером слияния. Неограничивающие примеры партнеров слияния могут включать белки настоящего изобретения, имеющие иную ферментативную функцию, антитела или их связывающие фрагменты, лиганды или рецепторы, люциферазы, способные использовать люциферины грибов в качестве субстратов в биолюминесцентной реакции. В некоторых воплощениях партнер слияния и белок по изобретению оперативно сшиты через линкерную последовательность (пептидный линкер), обеспечивающую независимый фолдинг и функционирование белка слияния. Способы изготовления белков слияния хорошо известны специалистам в данной области.

[0202] В некоторых воплощениях белки слияния включают оперативно сшитые через короткий пептидный линкер гиспидин-гидроксилазу по изобретению и люциферазу, способную осуществлять реакцию окисления люциферина гриба с выделением света. Подобный белок слияния может быть использован для получения биолюминесценции в системах in vitro и in vivo в присутствии предлюциферина (например, в присутствии гиспидина). Специалисту в области техники очевидно, что любая функциональная гиспидин-гидроксилаза, описанная выше, может быть использована с любой функциональной люциферазой для создания белка слияния. Специфические примеры белков слияния описаны ниже в Экспериментальной части. Примеры люцифераз, которые могут быть использованы при создании белков слияния, описаны в разделе «Применение, комбинации и способы использования» ниже.

Нуклеиновые кислоты

[0203] Настоящее изобретение обеспечивает нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза люциферина грибов, гомологи и мутанты этих белков, в том числе укороченные и удлиненные формы.

[0204] Нуклеиновая кислота, как здесь используется, представляет собой изолированную молекулу ДНК, такую как геномная молекула ДНК или молекула кДНК, или молекулу РНК, такую как молекула мРНК. В частности, указанные нуклеиновые кислоты представляют собой молекулы кДНК, имеющие открытую рамку считывания, которая кодирует фермент биосинтеза люциферина изобретения, и способна, при подходящих условиях, обеспечивать экспрессию фермента по изобретению.

[0205] Термин «кДНК» предназначен для описания нуклеиновых кислот, которые отражают расположение элементов последовательности, находящихся в нативной зрелой мРНК, где элементы последовательности представляют собой экзоны и 5-' и 3'-некодирующие области. Незрелая мРНК может иметь экзоны, разделенные промежуточными интронами, которые, если присутствуют, удаляются в ходе посттрансляционного РНК сплайсинга, с образованием зрелой мРНК, имеющей открытую рамку считывания.

[0206] Геномная последовательность, представляющая интерес, может включать нуклеиновую кислоту, присутствующую между инициирующим кодоном и терминирующим кодоном, как определено в перечисленных последовательностях, включая все интроны, которые обычно присутствуют в нативной хромосоме. Геномная последовательность, представляющая интерес, дополнительно может включать 5'- и 3'-нетранслируемые области, находящиеся в зрелой мРНК, так же как специфические транскрипционные и трансляционные регулирующие последовательности, такие как промоторы, энхансеры, и т.д., включающие фланкирующую геномную ДНК размером приблизительно 1 т.п.н., но возможно и больше, у 5'- или 3'-конца транскрибированной области.

[0207] Изобретение также охватывает нуклеиновые кислоты, которые являются гомологичными, по существу сходными, идентичными, производными или миметиками нуклеиновых кислот, кодирующих белки настоящего изобретения.

[0208] Заявленные нуклеиновые кислоты присутствуют в среде, отличной от их естественной среды; например, они выделены, присутствуют в обогащенных количествах, или присутствуют или экспрессированы in vitro или в клетке, или в организме, другом чем их естественно встречающаяся среда окружения.

[0209] Специфические нуклеиновые кислоты, представляющие интерес, включают нуклеиновые кислоты, которые кодируют гиспидин-гидроксилазу, или гиспидин-синтазу, или кофеилпируват-гидролазу, описанную в разделе «Белки» выше. Каждый из этих специфических типов нуклеиновых кислот, представляющих интерес, индивидуально раскрывается более детально.

[0210] Нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-гидроксилазы.

[0211] В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты по изобретению кодируют белки, способные катализировать реакцию превращения 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она (предлюциферина), имеющего структурную формулу

,

в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он (люциферин грибов), имеющий структурную формулу

,

[0212] где R - арил или гетероарил.

[0213] В преимущественных воплощениях, нуклеиновые кислоты кодируют гиспидин-гидроксилазы, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NO: 29-33.

[0214] Специфические примеры нуклеиновых кислот включают нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-гидроксилазы, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28. Примеры нуклеиновых кислот, кодирующих указанные белки, приведены в SEQ ID NOs: 1, 3,5, 7, 9, 11, 13, 15, 17, 19, 21, 23, 25, 27. Также интерес представляют функциональные мутанты, гомологи и производные вышеуказанных специфических нуклеиновых кислот.

[0215] В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты по изобретению кодируют белки, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% идентичны последовательностям, показанным в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, на протяжении по крайней мере 350 аминокислот.

[0216] Нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазы

[0217] В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты по изобретению кодируют белки, способные катализировать реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

[0218] , где R – арил илигетероарил в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

[0219] , где R - арил или гетероарил.

[0220] В преимущественных воплощениях, нуклеиновые кислоты кодируют гиспидин-синтазы, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 56-63.

[0221] Специфические примеры нуклеиновых кислот включают нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазы по изобретению, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55. Примеры нуклеиновых кислот, кодирующих указанные белки, приведены в SEQ ID NOs: 34, 36,38,40,42, 44, 46, 48, 50, 52, 54.

[0222] Также интерес представляют функциональные мутанты, гомологи и производные вышеуказанных специфических нуклеиновых кислот.

[0223] В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты по изобретению кодируют белки, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% идентичны последовательностям, показанным в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55, на протяжении всей полипептидной цепи белка.

[0224] Нуклеиновые кислоты, кодирующие кофеилпируват-гидролазы

[0225] В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты по изобретению кодируют белки, способные катализировать реакцию превращения оксилюциферина, имеющего структурную формулу

[0226] , где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой

[0227] , где R выбран из группы арил, гетероарил.

[0228] В преимущественных воплощениях, нуклеиновые кислоты кодируют кофеилпируват-гидролазы, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 76-78. Специфические примеры нуклеиновых кислот включают нуклеиновые кислоты, кодирующие кофеилпируват-гидролазы, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75. Примеры нуклеиновых кислот, кодирующих указанные белки, приведены в SEQ ID NOs: 64, 66, 68, 70,72, 74.

[0229] Также интерес представляют нуклеиновые кислоты, кодирующие функциональные мутанты, гомологи и производные вышеуказанных белков.

[0230] В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты по изобретению кодируют белки, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% идентичны последовательностям, показанным в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, на протяжении всей полипептидной цепи.

[0231] Нуклеиновые кислоты, представляющие интерес (например, нуклеиновые кислоты, кодирующие гомологи белков, характеризующихся аминокислотными последовательностями показанными в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53,55, 65, 67, 69, 71, 73, 75), могут быть выделены из любых организмов (грибов, растений, микроорганизмов, животных), в частности из различных видов биолюминесцентных грибов, например, из грибов, относящихся к типу Basidiomycota, преимущественно к классу Basidiomycetes, в частности, к отряду Agaricales, например, из биолюминесцентных грибов Neonothopanus nambi, Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos и т.д. Также особый интерес в качестве источника нуклеиновых кислот, кодирующих гомологи белков настоящего изобретения, представляют небиолюминесцентные грибы и растения, производящие гиспидин, такие как Pteris ensiformis [Yung-Husan Chen et al., «Identification of phenolic antioxidants from Sword Brake fern (Pteris ensiformis Burm.)», Food Chemistry, Volume 105, Issue 1, 2007, pp. 48-56], Inonotus xeranticus [In-Kyoung Lee et al., «Hispidin Derivatives from the Mushroom Inonotus xeranticus and Their Antioxidant Activity», J. Nat. Prod., 2006, 69 (2), pp. 299–301], Phellinus sp. [In-Kyoung Lee et al., «Highly oxygenated and unsaturated metabolites providing a diversity of hispidin class antioxidants in the medicinal mushrooms Inonotus and Phellinus». Bioorganic & Medicinal Chemistry. 15 (10): 3309–14.], Equisetum arvense [Markus Herderich et al., «Establishing styrylpyrone synthase activity in cell free extracts obtained from gametophytes of Equisetum arvense L. by high performance liquid chromatography–tandem mass spectrometry». Phytochem. Anal., 8: 194-197.].

[0232] Гомологи идентифицируются любыми из множества способов. Фрагмент кДНК настоящего изобретения может использоваться как гибридизационный зонд против библиотеки кДНК от целевого организма, с использованием условий низкой жесткости. Зонд может быть большим фрагментом или одним или более коротким вырожденным праймером. Нуклеиновые кислоты, имеющие сходство последовательности, детектируются гибридизацией в условиях низкой жесткости, например, при 50°С и 6×SSC (0,9М хлористого натрия /0,09М цитрата натрия) с последующей промывкой при 55×С в 1×SSC (01,15М хлористого натрия/0,015 М цитрата натрия). Идентичность последовательности может быть определена гибридизацией в условиях высокой жесткости, например, при 50°С или выше и 0,1×SSC (15 мМ хлористого натрия/ 1,5 мМ цитрата натрия). Нуклеиновые кислоты, имеющие область, по существу идентичную представленным последовательностям, например, аллельным вариантам, генетически-измененным вариантам нуклеиновой кислоты, и т.д., связываются с представленными последовательностями в условиях высокой жесткости гибридизации. С использованием зондов, в частности меченых зондов последовательностей ДНК, можно выделить гомологичные или схожие гены.

[0233] Гомологи могут быть идентифицированы с помощью полимеразной цепной реакции из геномной или кДНК библиотеки. Олигонуклеотидные праймеры, представляющие фрагменты известных последовательностей специфических нуклеиновых кислот, можно использовать в качестве праймеров для ПЦР. В предпочтительном аспекте олигонуклеотидные праймеры имеют вырожденную структуру и соответствуют фрагментам нуклеиновой кислоты, кодирующим консервативные участки аминокислотной последовательности белка, например,. консенсусные последовательности, показанные в SEQ ID NOs: 29-33, 56-63, 76-78. Полноразмерные кодирующие последовательности могут быть затем выявлены с помощью методов 3’- и 5’-RACE, хорошо известных из уровня техники.

[0234] Гомологи могут быть также идентифицированы в результатах полногеномного секвенирования организмов с помощью сравнения аминокислотных последовательностей, предсказанных на основе полученной в ходе секвенирования с аминокислотными последовательностями SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53,55, 65, 67, 69, 71, 73, 75. Идентичность последовательностей определяется на основании референсной последовательности. Алгоритмы для анализа последовательности известны в данной области, такие как BLAST, описанный в Altschul et al., J. Mol. Biol., 215, pp. 403-10 (1990). Для целей настоящего изобретения для определения уровня идентичности и сходства между нуклеотидными последовательностями и аминокислотными последовательностями может быть использовано сравнение нуклеотидных и аминокислотных последовательностей, производимое с помощью пакета программ Blast, предоставляемого National Center for Biotechnology Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast) с использованием содержащего разрывы выравнивания со стандартными параметрами.

[0235] Также обеспечиваются нуклеиновые кислоты, которые гибридизуются с вышеописанными нуклеиновыми кислотами в жестких условиях, предпочтительно в условиях высокой жесткости (то есть, комплементарные предварительно описанным нуклеиновым кислотам). Примером гибридизации в жестких условиях является при 50°С или выше и 0,1×SSC (15 мМ хлористого натрия/ 1,5 мМ цитрата натрия). Другим примером гибридизации в условиях высокой жесткости является инкубация в течение ночи при 42°С в 50% растворе формамида, 5×SSC (150 мМ NaCl, 15 мМ тринатрий цитрат), 50 мМ фосфата натрия (рН 7,6), 5 × раствора Денхардта, 10% сульфата декстрана, и 20 мкг/мл денатурированной, разрезанной ДНК семенной жидкости лосося, с предварительной промывкой в 0,1×SSC при приблизительно 65°С. Другие условия высокой жесткости гибридизации известны в данной области и могут также использоваться для определения нуклеиновых кислот изобретения.

[0236] Также обеспечиваются нуклеиновые кислоты, кодирующие варианты, мутанты или производные белков изобретения. Мутанты или производные могут быть получены на матричной нуклеиновой кислоте, выбранной из вышеописанных нуклеиновых кислот, путем модификации, делеции или добавления одного или более нуклеотидов в матричной последовательности или их комбинации, для получения варианта матричной нуклеиновой кислоты. Модификации, добавления или делеции могут быть выполнены любым способом, известным в данной области (см., например, Gustin et al., Biotechniques (1993) 14: 22; Barany, Gene (1985) 37: 111-123; and Colicelli et al., Mol. Gen. Genet. (1985) 199:537-539, Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, (1989), CSH Press, pp.15.3-15.108), включая подверженный ошибкам ПЦР, перестановку, олигонуклеотид-направленный мутагенез, ПЦР со сборкой, парный ПЦР мутагенез, мутагенез in vivo, кассетный мутагенез, рекурсивный ensemble мутагенез, экспоненциальный множественный мутагенез, сайт-специфический мутагенез, неспецифический мутагенез, генное реассемблирование, генный сайт-насыщающий мутагенез (GSSM), искусственное реассемблирование с лигированием (SLR) или их комбинации. Модификации, добавления или делеции могут быть также выполнены способом, включающим рекомбинацию, рекурсивную рекомбинацию последовательности, фосфотиоат-модифицированный мутагенез ДНК, мутагенез на урацил-содержащей матрице, мутагенез с двойным пропуском, точечный восстановительный по рассогласованию мутагенез, мутагенез штамма, дефицитного по восстановлениям, химический мутагенез, радиоактивный мутагенез, делеционный мутагенез, рестрикционно-избирательный мутагенез, рестрикционный мутагенез с очисткой, синтез с искусственными генами, множественный мутагенез, создание химерных множественных нуклеиновых кислот и их комбинации. Нуклеиновые кислоты, кодирующие укороченные и удлиненные варианты указанных люцифераз, также входят в рамки настоящего изобретения. Как здесь используется, эти варианты белков содержат аминокислотные последовательности с измененными C-, N-, или обоими концами полипептидной цепи.

[0237] В преимущественных воплощениях обсуждаемые гомологи и мутанты являются функциональными ферментами, способными осуществлять реакции биосинтеза люциферина гриба, например, люциферина грибов. Гомологи и мутанты, представляющие интерес, могут иметь измененные свойства, такие как скорость созревания в клетке-хозяине, способность к агрегации или димеризации, период полураспада или иные биохимические свойства, в том числе константу связывания с субстратом, термостабильность, pH-стабильность, температурный оптимум активности, pH-оптимум активности, константу Михаэлиса-Ментен, субстратную специфичность, диапазон побочных продуктов. В некоторых воплощениях, гомологи и мутанты имеют такие же свойства как заявленные белки.

[0238] Нуклеиновые кислоты, кодирующие функциональные гомологи и мутанты настоящего изобретения, могут быть определены в ходе функциональных тестов, например, при функциональном скрининге экспрессионной библиотеки, описанном выше в разделе «Белки».

[0239] Кроме того, также обеспечиваются вырожденные варианты нуклеиновых кислот, которые кодируют белки настоящего изобретения. Вырожденные варианты нуклеиновых кислот включают замены кодонов нуклеиновой кислоты на другие кодоны, кодирующие те же самые аминокислоты. В частности, вырожденные варианты нуклеиновых кислот создаются, чтобы увеличить экспрессию в клетке-хозяине. В этом воплощении, кодоны нуклеиновой кислоты, которые не являются предпочтительными или являются менее предпочтительными в генах в клетке-хозяине, заменены кодонами, которые излишне представлены в кодирующих последовательностях в генах в клетке-хозяине, где указанные замененные кодоны кодируют ту же самую аминокислоту. В частности, интерес представляют гуманизированные версии нуклеиновых кислот настоящего изобретения. Как здесь используется, термин «гуманизированный» относится к заменам, сделанным в последовательности нуклеиновой кислоты для оптимизации кодонов для экспрессии белка в клетках млекопитающих (Yang et al., Nucleic Acids Research (1996) 24: 4592-4593). См. также Патент США № 5795737, который описывает гуманизацию белков, раскрытие которого здесь включено ссылкой. Особый интерес представляют варианты нуклеиновых кислот. Оптимизированные для экспрессии в растительных клетках. Примеры таких нуклеиновых кислот, кодирующих белки настоящего изобретения показаны в SEQ ID NOs: 103, 113 и 114.

[0240] Заявленные нуклеиновые кислоты могут быть выделены и получены по существу в очищенной форме. По существу, очищенная форма означает, что нуклеиновые кислоты являются по меньшей мере приблизительно на 50% чистыми, обычно по меньшей мере приблизительно на 90% чистыми и являются обычно «рекомбинантными», то есть фланкированы одним или более нуклеотидов, с которыми она обычно не связывается в хромосоме, встречающейся в природе в ее естественном организме-хозяине.

[0241] Заявленные нуклеиновые кислоты могут быть синтезированы искусственно. Способы получения нуклеиновых кислот хорошо известны из области техники. Например, доступность информации о последовательности аминокислот или информации о нуклеотидной последовательности дает возможность изготовить выделенные молекулы нуклеиновых кислот настоящего изобретении с помощью олигонуклеотидного синтеза. В случае информации о последовательности аминокислот, может быть синтезировано несколько нуклеиновых кислот отличающихся друг от друга вследствие вырожденности генетического кода. Методы выбора вариантов кодонов для требуемого хозяина хорошо известны в данной области.

[0242] Синтетические олигонуклеотиды могут быть приготовлены с помощью фосфорамидитного метода, и полученные конструкты могут быть очищены с помощью методов хорошо известных в данной области, таких как высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ) или других методов как описано, например, в Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., (1989) Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY, и по инструкции, описанной в, например, United States Dept. of HHS, National Institute of Health (NIH) Guidelines for Recombinant DNA Research. Длинные двухцепочечные молекулы ДНК настоящего изобретения могут быть синтезированы следующим образом: могут быть синтезированы несколько меньших фрагментов с необходимой комплементарностью, которые содержат подходящие концы, способные к когезии с соседним фрагментом. Соседние фрагменты могут быть сшиты с помощью ДНК-лигазы, методов, основанных на рекомбинации, или метода, основанного на ПЦР.

[0243] Также обеспечиваются нуклеиновые кислоты, кодирующие белки слияния, включающие белки настоящего изобретения. Примеры подобных белков приведены выше в разделе «Белки». Нуклеиновые кислоты, кодирующие белки слияния, могут быть синтезированы искусственно как описано выше.

[0244] Также обеспечиваются кассеты экспрессии или системы, использованные inter alia для получения заявленных белков (то есть гиспидин-гидроксилаз, гиспидин-синтаз и кофеилпируват-гидролаз) или белков слияния на их основе или для репликации заявленных молекул нуклеиновой кислоты. Кассета экспрессии может существовать как внехромосомный элемент или может быть включена в геном клетки в результате введения указанной кассеты экспрессии в клетку. При введении кассеты экспрессии в клетку происходит образование белкового продукта, кодируемого нуклеиновой кислотой изобретения; в этом случае говорят, что белок «продуцируется» или «экспрессируется» клеткой. Применима любая система экспрессии, включая, например, бактериальные системы, дрожжи, растения, насекомых, земноводных или клетки млекопитающих. В кассете экспрессии целевая нуклеиновая кислота оперативно соединяется с регуляторными последовательностями, которые могут включать промоторы, энхансеры, терминирующие последовательности, операторы, репрессоры и индукторы. Как правило кассета экспрессии содержит по крайней мере (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту по изобретению; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине. Способы получения кассет или систем экспрессии, способных экспрессировать желательный продукт, известны специалистам в данной области.

[0245] Также обеспечиваются вектор и другие конструкции нуклеиновой кислоты, содержащие заявленные нуклеиновые кислоты. Подходящие векторы включают вирусные и невирусные векторы, плазмиды, космиды, фаги и т.д., предпочтительно плазмиды, и используются для клонирования, амплификации, экспрессии, переноса и т.д., последовательности нуклеиновой кислоты настоящего изобретения в подходящего хозяина. Выбор подходящего вектора является понятным для квалифицированного специалиста в данной области. Полноразмерная нуклеиновая кислота или ее часть обычно вставляются в вектор посредством прикрепления ДНК-лигазой к расщепленному ферментами рестрикции сайту в векторе. Альтернативно, желательная нуклеотидная последовательность может быть вставлена гомологичной рекомбинацией in vivo, обычно, присоединением гомологичных участков к вектору на флангах желательной нуклеотидной последовательности. Гомологичные участки добавляются лигированием олигонуклеотидов или полимеразной цепной реакцией, с использованием праймеров, включающих, например, как гомологичные участки, так и часть желательной нуклеотидной последовательности. Вектор, как правило, имеет ориджин репликации, обеспечивающий его размножение в клетках-хозяевах в результате его введения в клетку как внехромосомного элемента. Вектор также может содержать регуляторные элементы, обеспечивающие экспрессию нуклеиновой кислоты в клетке-хозяине и получение рекомбинантного функционального белка. В экспрессионном векторе, указанная нуклеиновая кислота является функционально связанной с регуляторной последовательностью, которая может включить промоторы, энхансеры, терминаторы, операторы, репрессоры, сайленсеры, инсуляторы и индукторы. Для экспрессии функциональных белков или их укороченных форм кодирующие их нуклеиновые кислоты оперативно сшивают с нуклеиновыми кислотами, содержащими, по крайней мере, регуляторные последовательности и сайт начала транскрипции. Также эти нуклеиновые кислоты могут содержать последовательности, кодирующие гистидиновую метку (6 His tag), сигнальный пептид или функциональные белковые домены. Во многих воплощениях векторы обеспечивают интеграцию нуклеиновой кислоты, оперативно связанной с регуляторными элементами, в геном клетки-хозяина. Вектор может содержать кассету экспрессии для селектируемого маркера, такого как флуоресцентный белок (например, gfp), ген устойчивости к антибиотику (например, ген устойчивости к амфициллину, или канамицину, или неомицину или гигромицину и т.д.), гены, обусловливающие устойчивость к гербицидам, такие как гены, обусловливающие устойчивость к фосфинотрицину и гербицидам на основе сульфонамида, или иной селектируемый маркер, известный из уровня техники.

[0246] Вектор может содержать дополнительные кассеты экспрессии, включающие нуклеиновые кислоты, кодирующие 4'-фосфопантотеинил трансферазу, белки синтеза 3-арилакриловых кислот (например, описанные в разделе «Применение, комбинации и способы использования»), люциферазы и т.д.

[0247] Вышеописанные системы экспрессии могут использоваться в прокариотических или эукариотических хозяевах. Для получения белка могут использоваться клетки-хозяева, такие как Е. coli, В. subtilis, S. cerevisiae, клетки насекомого, или клетки высшего организма, не являющиеся эмбриональными клетками человека, такие как дрожжи, растения (например, Arabidopsis thaliana, Nicotiana benthamiana, Physcomitrella patens), позвоночные, например, COS 7 клетки, НЕК 293, СНО, ооциты Xenopus и т.д.

[0248] Клеточные линии, которые устойчиво продуцируют белки настоящего изобретения, могут быть выбраны способами, известными в данной области (например, ко-трансфекция с селектируемым маркером, таким как dhfr, gpt, генами устойчивости к антибиотику (ампициллину, или канамицину, или неомицину или гигромицину и т.д.), что делает возможным выявление и выделение трансфицированных клеток, которые содержат ген, включенный в геном или существующий в составе экстрахромосомного элемента.

[0249] Если используется любая вышеупомянутая клетка-хозяин или другие подходящие для репликации и/или экспрессии нуклеиновых кислот изобретения клетки-хозяева или организмы, то полученная реплицированная нуклеиновая кислота, экспрессированный белок или полипептид находятся в рамках притязания изобретения как продукт клетки-хозяина или организма. Продукт может быть выделен подходящим способом, известным в данной области.

[0250] Во многих воплощениях настоящего изобретения в клетку ко-трансфецируют несколькими кассетами экспрессии, содержащими нуклеиновые кислоты по изобретению, кодирующие различные ферменты биосинтеза люциферина грибов. В некоторых воплощениях в клетку дополнительно вводят кассету экспрессии, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света. В ряде случаев кассеты экспрессии объединяют в составе одного вектора, который используют для трансформации клеток. В некоторых воплощениях в клетку дополнительно вводят нуклеиновые кислоты, кодирующие 4'-фосфопантотеинил трансферазу и/или белки синтеза 3-арилакриловых кислот.

[0251] Также обеспечиваются короткие фрагменты ДНК заявленных нуклеиновых кислот, которые применяются как праймеры для ПЦР, амплификации rolling circle, гибридизационные скрининговые пробы и т.д. Длинные фрагменты ДНК применяются для получения кодируемых полипептидов, как ранее описано. Однако, для использования в геометрических реакциях амплификации, таких как ПЦР, используется пара коротких фрагментов ДНК, то есть праймеров. Точная последовательность праймера не является критической для изобретения, но для большинства применений праймеры будут гибридизоваться с заявленной последовательностью в условиях строгости, как известно в данной области. Предпочтительно выбрать пару праймеров, которые дадут продукт амплификации по меньшей мере приблизительно из 50 нуклеотидов, предпочтительно по меньшей мере приблизительно из 100 нуклеотидов и могут простираться на полную последовательность нуклеиновой кислоты. Алгоритмы отбора последовательностей праймеров обычно известны и доступны в коммерческих пакетах программ. Праймеры для амплификации гибридизуются с комплементарными цепочками ДНК и будут затравлять встречные реакции амплификации.

[0252] Молекулы нуклеиновых кислот настоящего изобретения также могут применяться для определения экспрессии гена в биологическом образце. Способ, в котором исследуются клетки на наличие специфических нуклеотидных последовательностей, таких как геномная ДНК или РНК, хорошо отработан в данной области. Кратко, выделяют ДНК или мРНК из образца клетки. мРНК может быть амплифицирована с помощью ОТ-ПЦР, с использованием обратной транскриптазы для формирования комплементарной цепочки ДНК, с последующей амплификацией с помощью полимеразной цепной реакцией с использованием праймеров, специфических для заявленных последовательностей ДНК. Альтернативно, образец мРНК отделяют с помощью гель-электрофореза, переносят на подходящий носитель, например, нитроцеллюлозу, нейлон и т.д., и затем тестируют фрагментом заявленной ДНК в качестве пробы. Могут также использоваться другие способы, такие как анализы сшивания олигонуклеотидов, гибридизация in situ и гибридизация ДНК-пробами, иммобилизованными на твердый чип. Обнаружение мРНК, гибридизующейся с заявленной последовательностью указывает на экспрессию гена в образце.

Трансгенные организмы

[0253] Также обеспечиваются трансгенные организмы, трансгенные клетки и трансгенные клеточные линии, экспрессирующие нуклеиновые кислоты согласно настоящему изобретению. Трансгенные клетки согласно настоящему изобретению включают одну или несколько нуклеиновых кислот, рассматриваемых в настоящем изобретении, которые присутствуют в качестве трансгена. Для целей настоящего изобретения может использоваться любая подходящая клетка-хозяин, включающая прокариотические (например, Escherichia coli, Streptomyces sp., Bacillus subtilis, Lactobacillus acidophilus и т.п.) или эукариотические клетки-хозяева, не являющиеся эмбриональными клетками человека. Трансгенные организмы согласно настоящему изобретению могут представлять прокариотические или эукариотические организмы, включающие бактерии, цианобактерии, грибы, растения и животные, в которые вводится одна или большее число клеток организма, содержащих гетерологичную нуклеиновую кислоту согласно настоящему изобретению, путем встраивания ее за счет манипуляции человеком, например, в рамках трансгенных методик, известных в данной области.

[0254] В одном варианте осуществления настоящего изобретения трансгенный организм может представлять собой прокариотический организм. Способы трансформации прокариотических хозяйских клеток хорошо известны в данной области (см., например, Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., (1989) Cold Spring Harbor Laboratory Press и Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology (1995) John Wiley & Sons, Inc).

[0255] В другом варианте осуществления настоящего изобретения указанный трансгенный организм может представлять собой гриб, например, дрожжи. Дрожжи широко используются в качестве носителя для гетерологичной генной экспрессии (см., например, Goodey et al., Yeast biotechnology, D R Berry et al., eds, (1987) Allen and Unwin, London, pp. 401-429, и Kong et al., Molecular and Cell Biology of Yeasts, E. F. Walton and G. T. Yarronton, eds, Blackie, Glasgow (1989) pp. 107-133). Доступно несколько типов дрожжевых векторов, включающих интегрирующиеся векторы, которые требуют рекомбинации с геномом-хозяином для своего поддержания, а также автономно реплицирующиеся плазмидные векторы.

[0256] Другим организмом-хозяином является организм животного. Трансгенные животные могут быть получены с использованием трансгенных методик, известных в данной области и описанных в стандартных руководствах (таких как: Pinkert, Transgenic Animal Technology: A Laboratory Handbook, 2nd edition (2003) San Diego: Academic Press; Gersenstein and Vinterstein, Manipulating the Mouse Embryo: A Laboratory Manual, 3rd ed, (2002) Nagy A. (Ed), Cold Spring Harbor Laboratory; Blau et al., Laboratory Animal Medicine, 2nd Ed., (2002) Fox J.G., Anderson L.C., Loew F.M., Quimby F.W. (Eds), American Medical Association, American Psychological Association; Gene Targeting: A Ptactical Approach by Alexandra L. Joyner (Ed.) Oxford University Press; 2nd edition (2000)). Например, трансгенные животные могут быть получены посредством гомологичной рекомбинации, в рамках которой меняется эндогенный локус. Альтернативно, конструкцию нуклеиновой кислоты интегрируют в случайном режиме в геном. Векторы для стабильной интеграции включают плазмиды, ретровирусы и другие вирусы животных, YAC и т.п.

[0257] Нуклеиновая кислота может быть введена в клетку, непосредственно или опосредованно, за счет введения в предшественник клетки, с помощью осторожной генетической манипуляции, такой как микроинъекция, или с помощью инфекции рекомбинантным вирусом или с использованием рекомбинантного вирусного вектора, трансфекции, трансформации, доставки с помощью генной пушки или трансконъюгации. Методики переноса молекул нуклеиновой кислоты (например, ДНК) в такие организмы хорошо известны и описаны в стандартных руководствах таких, как Sambrook et al. (Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3nd Ed., (2001) Cold Spring Harbor Press, Cold Spring Harbor, NY).

[0258] Термин «генетическая манипуляция» не включает классический кроссбридинг или оплодотворение in vitro, но, скорее, обозначает введение рекомбинантной молекулы нуклеиновой кислоты. Указанная молекула нуклеиновой кислоты может быть интегрирована в хромосому или может представлять собой внехромосомно реплицирующуюся ДНК.

[0259] Конструкции ДНК для гомологичной рекомбинации включают по меньшей мере часть нуклеиновой кислоты согласно настоящему изобретению, где нуклеиновая кислота по изобретению оперативно присоединена к участкам гомологии к целевому локусу. В конструкции ДНК для проведения случайной интеграции нет необходимости включать участки гомологии для облегчения рекомбинации. Могут быть также включены маркеры позитивной и негативной селекции. Способы получения клеток, содержащих целевые генные модификации, посредством гомологической рекомбинации, известны в данной области. Различные методики трансфекции клеток млекопитающих описаны, например, в работе Keown et al., Meth. Enzymol. (1990) 185:527-537).

[0260] В случае эмбриональных стволовых клеток (ES), может быть использована клеточная линия ES или эмбриональные клетки могут быть получены в свежем виде от организма-хозяина, такого как мышь, крыса, морская свинка и т.п. Такие клетки выращивают на соответствующем питательном слое для фибробластов или выращивают в присутствии фактора ингибирования лейкозных клеток (LIF). Трансформированные ES или эмбриональные клетки могут быть использованы для создания трансгенных животных с использованием соответствующей методики, известной в данной области.

[0261] Трансгенные животные могут представлять собой любых животных, отличных от человека, включая млекопитающее, отличное от человека (например, мышь, крыса), птицу или земноводное и т.п., и используются в функциональных исследованиях, при скрининге лекарственных препаратов и т.п.

[0262] Могут быть также получены трансгенные растения. Способы получения трансгенных растительных клеток и растений описаны в патентах №№ US 5767367, US5750870, US5739409, US5689049, US5689045, US5674731, US5656466, US5633155, US5629470, US5595896, US5576198, US5538879 и US5484956, описание которых включено в настоящее изобретение в качестве ссылок. Способы получения трансгенных растений обобщены также в следующих обзорах: Plant Biochemistry and Molecular Biology (eds. Lea and Leegood, John Wiley & Sons (1993) pp. 275-295 и в Plant Biotechnology and Transgenic Plants (eds. Oksman-Caldentey and Barz) (2002) 719 p.

[0263] Для получения трансгенного организма-хозяина могут использоваться, например, эмбриогенные эксплантаты, содержащие соматические клетки. После сбора клеток или тканей интересующую экзогенную ДНК вводят в растительные клетки, и для такого введения доступно множество различных методик. При наличии выделенных протопластов возникает возможность введения с использованием ДНК-опосредованных протоколов генного переноса, включающих инкубирование протопластов с депротеинезированной ДНК, такой как плазмида, включающей экзогенную кодирующую последовательность, представляющую интерес, в присутствии поливалентных катионов (например, ПЭГ или поли-L-орнитин); или по методу электропорации протопластов в присутствии оголенной ДНК, включающей интересующую экзогенную последовательность. Далее отбирают протопласты, которые успешно захватили экзогенную ДНК, растят их до образования каллуса и в итоге получают трансгенные растения посредством контакта с соответствующими количествами и взятыми в соответствующих соотношениях стимулирующих факторов, таких как ауксины и цитокинины.

[0264] Могут использоваться другие подходящие методы получения растений, такие как подход, основанный на использовании «генной пушки» или трансформация, опосредованная использованием Agrobacterium, известные специалистам в данной области.

Антитела

[0265] Термин «антитело» используется здесь для обозначения полипептида или группы полипептидов, включающих по крайней мере один активный центр антитела (антиген-связывающий сайт). Термин «антиген-связывающий сайт» обозначает пространственную структуру, параметры поверхности и распределение заряда у которой комплементарны параметрам эпитопа антигена: это обеспечивает связывание антитела с соответствующим антигеном. Понятие «антитело» охватывает, например, антитела позвоночных животных, химерные антитела, гибридные антитела, гуманизованные антитела, измененные антитела, моновалентные антитела, фрагменты Fab и монодоменные антитела.

[0266] Антитела, специфичные в отношении белков по настоящему изобретению, применимы в аффинной хроматографии, иммунологических тестах и в выявлении и идентификации белков по изобретению (гиспидин-гидроксилаз, гиспидин-синтаз и кофеилпируват-гидролаз). Антитела, представляющие интерес, связываются с антигенными полипептидами или белками, или белковыми фрагментами, которые описаны выше в разделе «Белки». Антитела по настоящему изобретению могут быть иммобилизованы на носитель и использованы в иммунологическом тесте или на аффинной хроматографической колонке с целью выявления и/или разделения полипептидов, белков или белковых фрагментов, или клеток, включающих такие полипептиды, белки или белковые фрагменты. Как альтернатива, такие полипептиды, белки или белковые фрагменты могут быть иммобилизованы так, чтобы выявлять антитела, способные связываться специфически с ними.

[0267] Антитела, специфичные в отношении белков по настоящему изобретению, как поликлональные, так и моноклональные, могут быть получены с применением стандартных методов. В целом, вначале белок используют для иммунизации подходящего млекопитающего, предпочтительно мыши, крысы, кролика или козы. Кролики и козы являются предпочтительными объектами для получения поликлональных сывороток благодаря получению значительного объема сыворотки крови, а также доступности помеченных антикроличьих и антикозьих антител. Иммунизацию обычно проводят путем перемешивания или эмульгирования конкретного белка в физиологическом растворе, предпочтительно с адъювантом, таким как полный адъювант Фрейнда, с последующим введением полученной смеси или эмульсии парентеральным путем (обычно путем подкожной или внутримышечной инъекции). Обычно достаточными дозами являются по 50-200 мкг за одну инъекцию.

[0268] В различных воплощениях изобретения для иммунизации используют рекомбинантные или природные белки в нативной или денатурированной форме. Для иммунизации могут быть использованы также белковые фрагменты или синтетические полипептиды, содержащие часть аминокислотной последовательности белка по изобретению.

[0269] Иммунизацию обычно бустируют через 2-6 недель путем одной или нескольких дополнительных инъекций белка в физиологическом растворе, предпочтительно с включением неполного адъюванта Фрейнда. Также антитела могут быть получены альтернативным путем с помощью иммунизации in vitro с применением известных в данной области техники методов, которые с точки зрения целей настоящего изобретения эквивалентны иммунизации in vivo. Поликлональные антисыворотки получают путем отбора крови у иммунизованных животных в стеклянную или пластиковую емкость с последующей инкубацией крови при 25 С в течение 1 часа и затем инкубацией при 4 С в течение 2-18 часов. Сыворотку выделяют центрифугированием (например, при 1000 g в течение 10 минут). У кроликов за один раз можно получить 20-50 мл крови.

[0270] Моноклональные антитела получают с использованием стандартного метода Келера-Мильштейна (Kohler & Milstein, 1975, Nature, 256, 495-496) или его модификаций. Обычно в соответствии с описанным выше иммунизуют мышь или крысу. Однако, в отличие от взятия крови у животных с целью получения сыворотки, в данном методе удаляют селезенку (и, что необязательно, некоторые крупные лимфатические узлы) и мацерируют ткань с целью разделения отдельных клеток. Если желательно, клетки селезенки могут быть подвергнуты скринингу (после удаления не специфически адгезировавшихся клеток) путем нанесения клеточной суспензии на планшет или в отдельную планшетную лунку, покрытые белком-антигеном. В-лимфоциты, экспрессирующие связанный с мембраной иммуноглобулин, специфичный в отношении тестируемого антигена, связываются на планшете таким образом, что с остатком суспензии не смываются с него. Затем проводят слияние полученных в результате В-лимфоцитов или же всех мацерированных спленоцитов с миеломными клетками, в результате чего образуются гибридомы: их затем культивируют в селективной среде (например, в среде HAT, содержащей гипоксантин, аминоптерин и тимидин). Полученные в результате гибридомы высевают в ограничивающем разведении и тестируют на выработку антител, которые специфическим образом связываются с использовавшимся для иммунизации антигеном (и которые не связываются с посторонними антигенами). Отобранные гибридомы, секретирующие моноклональные антитела (mAb), затем культивируют либо in vitro (например, в ферментерах в виде пучка полых волокон или стеклянных емкостях для тканевых культур), либо in vivo (в асцитной жидкости у мышей).

[0271] Антитела (как поликлональные, так и моноклональные) могут быть помечены с применением стандартных методов. Подходящими метками являются флуорофоры, хромофоры, радионуклиды (в частности, 32P и 125I), электронно-плотные реагенты, ферменты и лиганды, для которых известны специфичные партнеры по связыванию. Ферменты обычно выявляют по их каталитической активности. Например, пероксидазу хрена обычно выявляют по ее способности конвертировать 3,3’,5,5’-тетраметилбензидин (ТМВ) в синий пигмент, количественно оцениваемый на спектрофотометре. Термин «специфичный партнер по связыванию» обозначает белок, способный связывать молекулу-лиганд, проявляя при этом высокий уровень специфичности, как, например, в случае с антигеном и специфичным в отношении него моноклональным антителом. Другими примерами специфичных партнеров по связыванию являются биотин и авидин (или стрептавидин), иммуноглобулин-G и белок-А, а также многочисленные пары рецепторов и их лигандов, известные в данной области техники. Другие варианты и возможности будут очевидны специалистам в данной области техники и в объеме настоящего изобретения рассматриваются как эквивалентные.

[0272] Антигены, иммуногены, полипептиды, белки или белковые фрагменты по настоящему изобретению вызывают образование специфических партнеров по связыванию - антител. Указанные антигены, иммуногены, полипептиды, белки или белковые фрагменты по настоящему изобретению включают иммуногенные композиции по настоящему изобретению. Такие иммуногенные композиции могут дополнительно содержать или включать адъюванты, носители или другие композиции, которые стимулируют или усиливают, или стабилизируют антигены, полипептиды, белки или белковые фрагменты по настоящему изобретению. Такие адъюванты и носители будут очевидны для специалистов в данной области техники.

Применение, комбинации и способы использования

[0273] Настоящее изобретение обеспечивает применение белков биосинтеза люциферина грибов в качестве ферментов, катализирующих реакции (1) синтеза люциферина (а именно 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-она), имеющего структурную формулу

, где R - арил или гетероарил, из предлюциферина (а именно 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она), имеющего структурную формулу

; или синтеза предлюциферина из 3-арилакриловой кислоты (предшественника предлюциферина) со структурной формулой

, где R выбран из группы арил или гетероарил; или синтеза 3-арилакриловой кислоты из 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновую кислоты (оксилюциферина) со структурной формулой
.

[0274] Белки биосинтеза люциферина грибов находят применение во многих способах реализации настоящего изобретения, неограничивающие примеры которых приведены в этой главе ниже.

[0275] Белки биосинтеза люциферина грибов, применение которых обеспечивается настоящим изобретением, могут быть получены из различных природных источников или получены с помощью рекомбинантных технологий. Например, белки дикого типа могут быть выделены из биолюминесцентных грибов, например, из грибов, относящихся к типу Basidiomycota, преимущественно к классу Basidiomycetes, в частности, к отряду Agaricales. Например, белки дикого типа могут быть выделены из биолюминесцентных грибов Neonothopanus nambi, Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos и т.д. Они могут также быть получены экспрессией рекомбинантной нуклеиновой кислоты, кодирующей последовательность, белка в соответствующем хозяине или в бесклеточной системе экспрессии.

[0276] В некоторых воплощениях белки применяются внутри клеток-хозяев, где они экспрессируются и осуществляют реакции циклического превращения люциферина грибов. В других воплощениях используются изолированные рекомбинантные или природные белки или экстракты, содержащие белки по применению.

[0277] Белки биосинтеза люциферина грибов активны в физиологических условиях.

[0278] В некоторых воплощениях обеспечивается применение белков - гиспидин-гидроксилаз в системах in vitro и in vivo для получения люциферина, который окисляется люциферазами биолюминесцентных грибов, их гомологами и мутантами с выделением света. Таким образом, настоящим изобретением обеспечивается применение гиспидин-гидроксилаз настоящего изобретения для катализа реакции превращения 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она (предлюциферина), имеющего структурную формулу

,

в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он (люциферин грибов), имеющий структурную формулу

,

где R - арил или гетероарил.

[0279] Способ получения люциферина грибов из предлюциферина включает объединение по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы с по крайней мере одной молекулой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)Н и по крайней мере с одной молекулы молекулярного кислорода (О2). Реакция осуществляется в физиологических условиях в системах in vitro и in vivo при температуре от 20 до 42 градусов Цельсия, в том числе реакция может осуществляться в клетках, тканях и организмах–хозяевах, экспрессирующих гиспидин-гидроксилазу. В преимущественных воплощениях указанные клетки, ткани и организмы содержат достаточное количество НАД(Ф)Н и молекулярного кислорода для осуществления реакции. В реакции может быть использован экзогенно добавляемый 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, или эндогенный 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, производимый в клетках, тканях или организмах.

[0280] В преимущественных воплощениях гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения осуществляют синтез 3-гидроксигиспидина из гиспидина. В преимущественных воплощениях они осуществляют синтез по крайней мере одного функционального аналога 3-гидроксигиспидина из соответствующего предлюциферина, показанного в Таблице 2. В некоторых воплощениях гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения осуществляют синтез 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-она из любого соответствующего 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[0281] Получаемый 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он находит применение для получения свечения в системах in vitro и in vivo, содержащих функциональную люциферазу, опознающую люциферин грибов в качестве субстрата.

[0282] Применимыми для нужд настоящего изобретения в качестве гиспидин-гидроксилаз являются белки, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, а также их мутанты, гомологи и производные. Например, могут быть использованы функциональные гиспидин-гидроксилазы 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% на протяжении по крайней мере 350 аминокислот. Например, они могут быть идентичны на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% на протяжении всей полипептидной цепи белка.

[0283] В преимущественных воплощениях, применимыми для нужд настоящего изобретения в качестве гиспидин-гидроксилазы являются белки, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 29-33. Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей гиспидин-гидроксилаз оперативно связаны через аминокислотные вставки с меньшей консервативностью (Фиг.1).

[0284] В некоторых воплощениях обеспечивается применение белков гиспидин-синтаз в системах in vitro и in vivo для получения предлюциферина грибов из его предшественника, то есть применение для катализа реакции превращения 3-арилакриловых кислот со структурной формулой

, где R выбран из группы арил, гетероарил, в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[0285] Способ получения предлюциферина включает объединение по крайней мере одной молекулы гиспидин-синтазы с по крайней мере одной молекулой 3-арилакриловой кислоты с по крайней мере одной молекулы кофермента А, с по крайней мере одной молекулы АТФ и по крайней мере с двумя молекулами малонил-КоА.

[0286] Реакция осуществляется в физиологических условиях при температуре от 20 до 42 градусов Цельсия, в том числе реакция может осуществляться в клетках, тканях и организмах – хозяевах, экспрессирующих функциональную гиспидин-синтазу. В преимущественных воплощениях указанные клетки, ткани и организмы содержат достаточное количество кофермента А, малонил-КоА и АТФ для осуществления реакции.

[0287] В реакции может быть использована экзогенно добавляемая 3-арилакриловая кислота или 3-арилакриловая кислота, производимая в клетках, тканях или организмах.

[0288] Например, гиспидин-синтазы настоящего изобретения могут быть использованы для получения гиспидина из кофейной кислоты. В преимущественных воплощениях они осуществляют синтез функционального аналога гиспидина (6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она) из соответствующей 3-арилакриловой кислоты, показанной в Таблице 2.

[0289] Получаемый 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он находит применение для получения люциферина грибов в присутствии гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения. Гиспидин и его функциональные аналоги также находят применение в медицине, так как проявляют антиоксидантные и противоопухолевые свойства; по некоторым данным гиспидин способен предотвращать ожирение [Be Tu et al., Drug Discov Ther. 2015 Jun; 9 (3): 197–204; Nguyen et al., Drug Discov Ther. 2014 Dec; 8 (6): 238–44; Yousfi et al., Phytother Res. 2009 Sep; 23 (9): 1237–42].

[0290] Применимыми для нужд настоящего изобретения в качестве гиспидин-синтаз являются белки, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55, а также их мутанты, гомологи и производные. Например, могут быть использованы функциональные гиспидин-синтазы, имеющие аминокислотную последовательность, которая идентична последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55, по крайней мере на 40%, чаще по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99%.

[0291] В преимущественных воплощениях, применимыми для нужд настоящего изобретения в качестве гиспидин-синтаз являются белки, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 56-63. Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей гиспидин-синтаз оперативно связаны через аминокислотные вставки с меньшей консервативностью (Фиг. 2).

[0292] В некоторых воплощениях обеспечивается применение белков кофеилпируват-гидролаз в системах in vitro и in vivo для получения 3-арилакриловых кислот со структурной формулой

[0293] , где R выбран из группы арил, гетероарил, из 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновой кислоты со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил. Реакция осуществляется в физиологических условиях в системах in vitro и in vivo. Кофеилпируват-гидролазы настоящего изобретения находят применение в системах автономной биолюминесценции, детально описанных ниже.

[0294] Применимыми для нужд настоящего изобретения в качестве кофеилпируват-гидролаз являются белки, аминокислотные последовательности которых показаны в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, а также их мутанты, гомологи и производные. Например, могут быть использованы функциональные кофеилпируват-гидролазы, имеющие аминокислотную последовательность, которая идентична последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, по крайней мере на 60%, по крайней мере на 65%, по крайней мере на 70%, по крайней мере на 80%, по крайней мере на 85%, по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99%.

[0295] В преимущественных воплощениях, применимыми для нужд настоящего изобретения в качестве кофеилпируват-гидролаз являются белки, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 76-78. Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей кофеилпируват-гидролаз оперативно связаны через аминокислотные вставки с меньшей консервативностью (Фиг. 3).

[0296] Также обеспечиваются комбинации белков, применимые в способах настоящего изобретения. В преимущественных воплощениях комбинации включают функциональную гиспидин-гидроксилазу и функциональную гиспидин-синтазу. Комбинация находит применение для получения 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-она из 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил. Например, комбинация может быть использована для получения гидроксигиспидина кофейной кислоты. Реакция осуществляется в физиологических условиях в присутствии по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы, по крайней мере одной молекулы гиспидин-синтазы, по крайней мере одной молекулы 3-арилакриловой кислоты, по крайней мере одной молекулы кофермента А, по крайней мере одной молекулы АТФ, по крайней мере двух молекул малонил-КоА, по крайней мере одной молекулы НАД(Ф)Н и по крайней мере одной молекулы молекулярного кислорода (О2).

[0297] В некоторых воплощениях комбинация включает также люциферазу, способную использовать 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой

, где R - арил или гетероарил, в качестве люциферина. Окисление указанного 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-она такой люциферазой сопровождается биолюминесценцией и образованием оксилюциферина (6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновой кислоты).

[0298] В качестве люциферазы может быть использован любой белок, характеризующихся вышеуказанной активностью. Например, могут быть использованы известные люциферазы из биолюминесцентных грибов, в том числе описанные в заявке RU №2017102986/10(005203) от 30.01.2017, а также их гомологи, мутанты и химерные белки, обладающие люциферазной активностью.

[0299] Во многих вариантах осуществления настоящего изобретения применимые для нужд настоящего изобретения люциферазы характеризуются аминокислотными последовательностями, которые по крайней мере на 40% идентичны, например, по крайней мере на 45% идентичны, или по крайней мере на 50% идентичны, или по крайней мере на 55% идентичны, или по крайней мере на 60% идентичны, или по крайней мере на 70% идентичны, или по крайней мере на 75% идентичны, или по крайней мере на 80% идентичны, или по крайней мере на 85% идентичны аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98. Часто люциферазы характеризуются аминокислотными последовательностями, которые имеют с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88,90 , 92, 94, 96, 98, не менее 90% идентичности (например, не менее 91%, не менее 92%, не менее 93%, не менее 94%, не менее 95%, не менее не менее 96%, не менее 97%, не менее 98%, не менее 99% идентичности или 100% идентичности).

[0300] Мутанты могут сохранять биологические свойства люциферазы дикого типа, из которого они были получены, или могут обладать биологическим свойствами, которые отличаются от свойств белков дикого типа. Термин «биологическое свойство» люцифераз согласно настоящему изобретению относится, без ограничения, к способности окислять различные люциферины; биохимическим свойствам, таким, как стабильность in vivo и/или in vitro (например, период полувыведения); скорость созревания; тенденция к агрегации или олигомеризации, а также другие подобные свойства. Мутации включают изменения одной или нескольких аминокислот, делеции или вставки одной или нескольких аминокислот; N-концевые усечения или расширения, С-концевые усечения или расширения и т.п.

[0301] В некоторых воплощениях настоящего изобретения люциферазы используются в изолированной форме, то есть это означает, что данный они по существу свободны от присутствия других белков или других природных биологических молекул, таких как олигосахариды, нуклеиновые кислоты и их фрагменты и т.п., где термин «по существу свободен» в данном случае означает, что менее чем 70%, обычно менее чем 60% и чаще менее чем 50% указанной композиции, содержащей выделенный белок, представляет собой другую природную биологическую молекулу. В некоторых вариантах указанные белки присутствуют по существу в очищенной форме, где термин «по существу очищенная форма» обозначает чистоту, равную по меньшей мере 95%, обычно равную по меньшей мере 97% и чаще равную по меньшей мере 99%.

[0302] В некоторых воплощениях люциферазы используются в составе экстрактов, полученных из биолюминесцентных грибов или из клеток-хозяев, содержащих кодирующие рекомбинантные люциферазы нуклеиновые кислоты.

[0303] В многих воплощениях люциферазы находятся гетерологических системах экспрессии (в клетках или организмах настоящего изобретения), которые содержат нуклеиновые кислоты, кодирующие рекомбинантные люциферазы.

[0304] Способы получения рекомбинантных белков, в частности люцифераз, как в выделенном виде, или в составе экстрактов, или в гетерологических системах экспрессии хорошо известны из уровня техники и описаны в разделе «Нуклеиновые кислоты». Способы очистки белков описаны в разделе «Белки».

[0305] В преимущественных воплощениях люциферазы сохраняют активность при температурах ниже 50°С, чаще при температурах до 45°С, то есть они сохраняют активность при температурах 20-42°С и могут быть использованы в системах гетерологической экспрессии in vitro и in vivo. Как правило описываемые люциферазы обладают рН стабильностью в диапазоне от 4 до 10, чаще в диапазоне от 6.5 до 9.5. Оптимум рН стабильности заявленных белков лежит в диапазоне между 7.0 и 8.5, например, между 7.3-8.0. В преимущественных воплощениях, указанные люциферазы активны в физиологических условиях.

[0306] Комбинация гиспидин-гидроксилазы и люциферазы, окисляющей люциферин грибов с выделением света, находит применение в способах выявления гиспидина и его функциональных аналогов в биологических объектах: клетках, тканях, или организмах. Способ включает контакт исследуемого биологического объекта или полученного из него экстракта с комбинацией выделенных гиспидин-гидроксилазы и указанной люциферазы в подходящем реакционном буфере, создающим физиологические условия и содержащим необходимые компоненты для осуществления реакций. Специалист в области может составить множество реакционных буферов, удовлетворяющих данному условию. Неограничивающим примером реакционного буфера может служить 0.2 M натрий-фосфатный буфер (pH 7.0-8.0) с добавлением 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозида (DDM), 1 мМ НАДФН.

[0307] Наличие гиспидина или его функционального аналога определяется по появлению детектируемого света - биолюминесценции. Способы детекции детектируемого света описаны выше в разделе «Белки» при описании способов функционального скрининга.

[0308] Комбинация гиспидин-гидроксилазы, гиспидин-синтазы и люциферазы, окисляющей люциферин грибов с выделением света, находит применение в способах выявления 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил, в биологических объектах. Способ включает контакт исследуемого биологического объекта или полученного из него экстракта с комбинацией выделенных гиспидин-гидроксилазы, гиспидин-синтазы и люциферазы, создающим физиологические условия и содержащим необходимые компоненты для осуществления реакций. Специалист в области может составить множество реакционных буферов, удовлетворяющих данному условию. Неограничивающим примером реакционного буфера может служить 0.2 M натрий-фосфатный буфер (pH 7.0-8.0) с добавлением 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM), 1 мМ НАДФН, 10 мМ АТФ, 1 мМ КоА, 1 мМ Малонил-КоА.

[0309] Наличие 3-арилакриловой кислоты определяется по появлению детектируемого света - биолюминесценции. Способы детекции детектируемого света описаны выше в разделе «Белки» при описании способов функционального скрининга.

[0310] В некоторых воплощениях вместо комбинации гиспидин-гидроксилазы и люциферазы, окисляющей люциферин грибов с выделением света, может быть использован белок слияния, описанный в разделе «Белки» выше. Белок слияния одновременно проявляет активность гиспидин-гидроксилазы и активность люциферазы и может быть использован в любых способах вместо комбинации двух указанных ферментов.

[0311] В некоторых воплощениях вместо вышеописанной гиспидин-синтазы используется поликетидсинтаза III типа, характеризующаяся аминокислотной последовательностью, по существу сходной с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139. Применимыми для нужд настоящего изобретения являются поликетидсинтазы III типа, имеющие аминокислотную последовательность, которая идентична последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139 по крайней мере на 40%, чаще по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, или по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99%.

[0312] Представители указанных поликетидсинтаз (PKS) выявлены во многих растительных организмах, из уровня техники известна их способность и/или способность их мутантов катализировать синтез бисноръянгонина из кумарила-КоА [Lim et al., Molecules, 2016 Jun 22;21(6)]. Заявители продемонстрировали, что указанные ферменты также способны катализировать синтез гиспидин из кофеил-КоА в системах in vitro и in vivo:

[0313] Таким образом применение указанных белков для синтеза гиспидина также находится в рамках настоящего изобретения.

[0314] В некоторых воплощениях настоящего изобретения PKS используются в изолированной форме, то есть это означает, что они по существу свободны от присутствия других белков или других природных биологических молекул, таких как олигосахариды, нуклеиновые кислоты и их фрагменты и т.п., где термин «по существу свободен» в данном случае означает, что менее чем 70%, обычно менее чем 60% и чаще менее чем 50% указанной композиции, содержащей выделенный белок, представляет собой другую природную биологическую молекулу. В некоторых вариантах указанные белки присутствуют по существу в очищенной форме, где термин «по существу очищенная форма» обозначает чистоту, равную по меньшей мере 95%, обычно равную по меньшей мере 97% и чаще равную по меньшей мере 99%.

[0315] В многих воплощениях PKS находятся в гетерологических системах экспрессии (в клетках или организмах настоящего изобретения), которые содержат нуклеиновые кислоты, кодирующие рекомбинантные ферменты.

[0316] Способы получения рекомбинантных белков как в выделенном виде, или в составе экстрактов, или в гетерологических системах экспрессии хорошо известны из уровня техники и описаны в разделе «Нуклеиновые кислоты». Способы очистки белков описаны в разделе «Белки».

[0317] В преимущественных воплощениях PKS сохраняют активность при температурах ниже 50°С, чаще при температурах до 45°С, то есть они сохраняют активность при температурах 20-42°С и могут быть использованы в системах гетерологической экспрессии in vitro и in vivo. Как правило описываемые PKS обладают рН стабильностью в диапазоне от 4 до 10, чаще в диапазоне от 6.0 до 9.0 Оптимум рН стабильности заявленных белков лежит в диапазоне между 6.5 и 8.5, например, между 7.0-7.5. В преимущественных воплощениях, указанные PKS активны в физиологических условиях.

[0318] Способ получения гиспидина включает объединение по крайней мере одной молекулы описанной выше поликетидсинтазы III типа с по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА и по крайней мере одной молекулой кофеил-КоА.

[0319] В некоторых воплощениях способ включает получение кофеил-КоА из кофейной кислоты в ходе ферментативной реакции, катализируемой кумарат-КоА-лигазой. В этом случае способ включает объединение по крайней мере одной молекулы описанной выше поликетидсинтазы III типа с по крайней мере одной молекулой кофейной кислоты, с по крайней мере одной молекулой кофермента А, с по крайней мере одной молекулой кумарат-КоА-лигазы, с по крайней мере одной молекулой АТФ и по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА.

[0320] Для нужд настоящего изобретения могут быть использованы любые известные из уровня техники ферменты кумарат-КоА-лигазы, осуществляющие реакцию присоединения кофермента А к кофейной кислоте с образованием кофеил-КоА:

[0321] В частности, может быть использована кумарат-КоА-лигаза 1 из Arabidopsis thaliana, имеющая аминокислотную и нуклеотидную последовательности, показанные в SEQ ID NO: 141, а также ее функциональные мутанты и гомологи. Например, пригодной для нужд настоящего изобретения является функциональная кумарат-КоА-лигаза, аминокислотная последовательность которой имеет не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с аминокислотной последовательностью, показанной в SEQ ID NO: 141.

[0322] Все указанные реакции осуществляются в физиологических условиях при температуре от 20 до 50 градусов Цельсия, в том числе реакция может осуществляться в клетках, тканях и организмах – хозяевах, экспрессирующих функциональные ферменты.

[0323] В комбинации с гиспидин-гидроксилазой настоящего изобретения PKS и кумарат-КоА-лигаза могут быть использованы для получения 3-гидроксигиспидина из кофейной кислоты. Реакция осуществляется в физиологических условиях в присутствии по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы, по крайней мере одной молекулы PKS, по крайней мере одной молекулы кумарат-КоА-лигазы, по крайней мере одной молекулы кофейной кислоты или кофеил-КоА, по крайней мере одной молекулы кофермента А, с по крайней мере одной молекулой АТФ, с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)H, с по крайней мере одной молекулой кислорода и по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА.

[0324] Также настоящее изобретение обеспечивает применение нуклеиновых кислот, кодирующих ферменты биосинтеза люциферина грибов, гомологи и мутанты этих белков, в том числе укороченные и удлиненные формы и белки слияния, для получения ферментов, вовлеченных в биосинтез люциферина грибов, в системах in vitro и\или in vivo.

[0325] В преимущественных воплощениях обеспечивается применение нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-гидроксилазы по изобретению, а именно белки, характеризующиеся аминокислотными последовательностями, показанными в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, а также их функциональные гомологи, мутанты и производные. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты кодируют белки, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 40%, чаще по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, по крайней мере на 55%, по крайней мере на 60%, по крайней мере на 65%, по крайней мере на 70%, по крайней мере на 80%, по крайней мере на 85%, по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% идентичны последовательностям, показанным в SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, на протяжении по крайней мере 350 аминокислот. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты кодируют белки, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NO: 29-33.

[0326] Также обеспечивается применение нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-синтазы, а именно белки, характеризующиеся аминокислотными последовательностями, показанными в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, а также их функциональные гомологи, мутанты и производные. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты кодируют белки, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на на 40%, чаще по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% идентичны последовательностям, показанным в SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45,47,49, 51, 53, 55, на протяжении всей полипептидной цепи белка. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты кодируют белки, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 56-63.

[0327] Также обеспечивается применение нуклеиновых кислот, кодирующих кофеилпируват-гидролазы, а именно белки, характеризующиеся аминокислотными последовательностями, показанными в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, а также их функциональные гомологи, мутанты и производные. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты кодируют белки, аминокислотные последовательности которых по крайней мере 40%, чаще по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99% идентичны последовательностям, показанным в SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75, на протяжении всей полипептидной цепи. В преимущественных воплощениях нуклеиновые кислоты кодируют белки, аминокислотные последовательности которых характеризуются наличием нескольких консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), показанных в SEQ ID NOs: 76-78.

[0328] Вышеперечисленные группы нуклеиновых кислот находят применение для получения рекомбинантных белков гиспидин-гидроксилаз, гиспидин-синтаз и кофеилпируват-гидролаз, а также для экспрессии этих белков в гетерологических системах экспрессии.

[0329] В частности, нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-гидроксилазы находят применение для получения клеток-продуцентов 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

[0330] из экзогенного или эндогенного 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

, где R - арил или гетероарил.

[0331] Нуклеиновые кислоты, кодирующие кофеилпируват-гидролазы, находят применение для получения клеток и организмов, способных осуществлять реакцию превращения оксилюциферина в предшественник предлюциферинов.

[0332] Нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазы, находят применение для получения клеток-продуцентов вышеуказанного 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она из соответствующей 3-арилакриловой кислоты. Например, клетки, экспрессирующие гиспидин-синтазу, находят применение для получения гиспидина из кофейной кислоты.

[0333] В некоторых воплощениях нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазы, находят применение для получения гиспидина из тирозина. В указанных воплощениях в клетки дополнительно вводят нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты, обеспечивающие синтез кофейной кислоты из тирозина. Такие ферменты известны из уровня техники. Например, может быть использована комбинация нуклеиновых кислот, кодирующих тирозин-аммоний-лиазу Rhodobacter capsulatus, и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli как описано в [Lin и Yan. Microb Cell Fact. 2012, 4;11:42]. Специалисту в данной области очевидно, что альтернативно могут быть использованы любые иные известные из уровня техники ферменты, осуществляющие реакции превращения тирозина в кофейную кислоту, например, ферменты, аминокислотные последовательности которых по существу сходны аминокислотным последовательностям тирозин-аммоний-лиазы Rhodobacter capsulatus и компонентам HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. сoli, показанным в SEQ ID NOs: 107, 109 и 111. Например, указанные ферменты могут иметь аминокислотные последовательности, которые имеют не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, или не менее 80% идентичности, или или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности) с последовательностями, показанными в SEQ ID NOs: 107, 109 и 111 соответственно.

[0334] В некоторых воплощениях нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазы, находят применение для получения клеток-продуцентов функциональных аналогов гиспидина из ароматических соединений, в том числе ароматических аминокислот и их производных. В указанных воплощениях в клетки дополнительно вводят нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты, обеспечивающие синтез 3-арилакриловых кислот, из которых, в свою очередь, происходит биосинтез функциональных аналогов гиспидина. Такие ферменты известны из уровня техники. Например, для биосинтеза коричной кислоты может быть использована нуклеиновая кислота, кодирующая фенилаланин-аммоний-лиазу Streptomyces maritimus, как описано в [Bang, H.B., Lee, Y.H., Kim, S.C. et al. Microb Cell Fact (2016) 15: 16. https://doi.org/10.1186/s12934-016-0415-9]. Специалисту в данной области очевидно, что альтернативно могут быть использованы любые иные известные из уровня техники ферменты, осуществляющие реакции превращения ароматических аминокислот и других ароматических соединений в 3-арилакриловые кислоты. Например, для синтеза коричной кислоты может быть использована любая функциональная фенилаланин-аммоний-лиаза, например, фенилаланин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой по существу сходна с последовательностью, показанной в SEQ ID NO: 117, например, последовательность которой идентична последовательности SEQ ID NO: 117 по крайней мере на 40%, в том числе, имеет с ней не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности).

[0335] В некоторых воплощениях для получения клеток-хозяев, экспрессирующих функциональную гиспидин-синтазу, требуется их ко-трансфекция нуклеиновой кислотой, кодирующей гиспидин-синтазу по изобретению, и нуклеиновой кислотой, кодирующей 4'-фосфопантотеинил трансферазу, способную осуществлять перенос 4-фосфопантетеинила от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтаз. В других воплощениях выбранные клетки-хозяева, например, клетки растений или клетки некоторых низших грибов (например, относящихся к роду Aspergillus) содержат эндогенную 4'-фосфопантотеинил трансферазу и ко-трансфекция не требуется.

[0336] Также обеспечивается применение комбинаций нуклеиновых кислот по изобретению. Так комбинация нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-гидроксилазу и гиспидин-синтазу, находит применение для получения клеток-продуцентов 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-она из 3-арилакриловой кислоты, например, для получения 3-гидроксигиспидина из кофейной кислоты и/или из тирозина. В некоторых воплощениях комбинация нуклеиновых кислот включает нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу. В некоторых воплощениях комбинация нуклеиновых кислот включает нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты, обеспечивающие синтез 3-арилакриловой кислоты из метаболитов клетки, например, ферменты, обеспечивающие синтез кофейной кислоты из тирозина или синтез коричной кислоты из фенилаланина.

[0337] В некоторых воплощениях для получения клеток-продуцентов гиспидина из кофейной кислоты используется комбинация нуклеиновых кислот, кодирующих PKS и кумарат-КоА-лигазы. Пригодной для нужд настоящего изобретения являются нуклеиновая кислота, кодирующая функциональную PKS, аминокислотная последовательность которой по существу сходна или идентична последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139; например, PKS, аминокислотная последовательность которой идентична последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139, по крайней мере на 40%, чаще по крайней мере на 45%, обычно по крайней мере на 50%, например, по крайней мере на 55%, или по крайней мере на 60%, или по крайней мере на 65%, или по крайней мере на 70%, или по крайней мере на 80%, или по крайней мере на 85%, или по крайней мере на 90%, или по крайней мере на 91%, или по крайней мере на 92%, или по крайней мере на 93%, или по крайней мере на 94%, или по крайней мере на 95%, или по крайней мере на 96%, или по крайней мере на 97%, или по крайней мере на 98%, или по крайней мере на 99%. Также пригодной для нужд настоящего изобретения является нуклеиновая кислота, кодирующая функциональную кумарат-КоА-лигазу, катализирующую реакцию присоединения кофермента А к кофейной кислоте с образованием кофеил-КоА. Например, может быть использована нуклеиновая кислота, кодирующая функциональную кумарат-КоА-лигазу, аминокислотная последовательность которой идентична последовательности, показанной в SEQ ID NO: 141, или имеет с ней не менее 40% идентичности, например, не менее 45% идентичности, или не менее 50% идентичности, или не менее 55% идентичности, или не менее 60% идентичности, или не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, например, не менее 80% идентичности, не менее 85% идентичности, не менее 90% идентичности (например, по крайней мере 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99% идентичности).

[0338] В некоторых воплощениях используется комбинация нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-гидроксилазу по изобретению, и нуклеиновой кислоты, кодирующей PKS. В преимущественных воплощениях комбинация также включает нуклеиновую кислоту, кодирующую кумарат-КоА-лигазу. Комбинация находит применение для получения клеток-продуцентов 3-гидроксигиспидина из кофейной кислоты и/или кофеил-КоА.

[0339] В некоторых воплощениях комбинация нуклеиновых кислот включает нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты, обеспечивающие синтез кофейной кислоты из тирозина.

[0340] Особый интерес представляют комбинации нуклеиновых кислот по изобретению, используемые вместе с нуклеиновой кислотой, кодирующей люциферазу, способную окислять люциферины гриба с выделением света. Молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие люциферазы для нужд настоящего изобретения, могут быть клонированы из биологических источников, например, из гриба, относящегося к типу Basidiomycota, преимущественно к классу Basidiomycetes, в частности, к отряду Agaricales или получены с помощью методов генной инженерии. Мутанты люцифераз, обладающие люциферазной активностью, могут быть получены с использованием стандартных методик молекулярной биологии, таких как подробно описанные выше в разделе «Нуклеиновые кислоты». Мутации включают изменения одной или нескольких аминокислот, делеции или вставки одной или нескольких аминокислот; N-концевые усечения или расширения, С-концевые усечения или расширения и т.п. В преимущественных воплощениях эти нуклеиновые кислоты кодируют люциферазы, аминокислотные последовательности которых по крайней мере на 40% идентичны, например, по крайней мере на 45% идентичны, или по крайней мере на 50% идентичны, или по крайней мере на 55% идентичны, или по крайней мере на 60% идентичны, или по крайней мере на 70% идентичны, или по крайней мере на 75% идентичны, или по крайней мере на 80% идентичны, или по крайней мере на 85% идентичны аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98. Например, они могут иметь аминокислотные последовательности, которые имеют не менее 90% идентичности (например, не менее 91%, не менее 92%, не менее 93%, не менее 94%, не менее 95%, не менее не менее 96%, не менее 97%, не менее 98%, не менее 99% идентичности или 100% идентичности) с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88,90 , 92, 94, 96, 98. Неограничивающие примеры нуклеиновых кислот, кодирующих люциферазы, показаны в SEQ ID NOs: 79, 81, 83, 85, 87, 89, 91, 93 и 95.

[0341] В некоторых воплощениях используется комбинация нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-гидроксилазу по изобретению, и нуклеиновой кислоты, кодирующей описанную выше люциферазу. Комбинация находит применение в широком спектре приложений при мечении организмов, тканей, клеток, клеточных органелл или белков с помощью биолюминесценции. Способы мечения организмов, тканей, клеток, клеточных органелл или белков с помощью люциферазы хорошо известны из уровня техники и подразумевают введение в клетку-хозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей люциферазу, например, в составе кассеты экспрессии, обеспечивающей экспрессию люциферазы в указанной клетке, ткани или организме. При добавлении подходящего люциферина к клеткам, ткани или организму, экспрессирующим люциферазу, возникает детектируемый свет. При мечении клеточных органелл или белков, нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, оперативно связывают с нуклеиновой кислотой, кодирующей соответственно сигнал локализации в исследуемой клеточной органелле или исследуемый белок. При ко-экспрессии в клетках люциферазы и гиспидин-синтазы настоящего изобретения биологические объекты (клетки, ткани, организмы, клеточные органеллы или белки) приобретают способность светиться в присутствии не только люциферина грибов, но и предлюциферина (последний в большинстве случаев отличается большей стабильностью в присутствии кислорода воздуха).

[0342] Также комбинация нуклеиновых кислот находит применение при исследовании зависимости активности двух промоторов в гетерологических системах экспрессии. В этом случае в клетку-хозяина вводится оперативно связанная с промотором «А» нуклеиновая кислота, кодирующая люциферазу, и оперативно связанная с промотором «Б» нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-гидроксилазу. Добавляя к аликвотам клеток (или клеточных экстрактов) люциферин, или предлюциферин, или смесь предлюциферина с люциферазой, по появлению свечения можно детектировать активность одного промотора «А» (свечение детектируется только в присутствии люциферина), одного промотора «Б» (свечение детектируется в присутствии смеси предлюциферина и люциферазы), или обоих промоторов (свечение детектируется во всех случаях).

[0343] В некоторых воплощениях комбинация также содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу. В некоторых воплощениях комбинация содержит дополнительно нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу.

[0344] В некоторых воплощениях комбинация содержит нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу, нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, нуклеиновую кислоту, кодирующую PKS, и нуклеиновую кислоту, кодирующую кумарат-КоА-лигазу.

[0345] Комбинации находят применение в широком спектре приложений при мечении организмов, тканей, клеток, клеточных органелл или белков с помощью биолюминесценции. В данном воплощении для получения свечения к биологическим объектам, экспрессирующим гиспидин-гидроксилазу, люциферазу и гиспидин-синтазу или гиспидин-гидроксилазу, люциферазу, PKS и кумарат-КоА-лигазу добавляют подходящий предшественник предлюциферина, например, кофейную кислоту или кумаровую кислоту.

[0346] Комбинации также находят применение в способах исследования зависимости активности трех промоторов в гетерологических системах экспрессии. Способы предполагают введение к клетку-хозяина нуклеиновой кислоты, кодирующей люциферазу, под контролем промотора «А», нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-гидроксилазу под контролем промотора «Б» и нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-синтазу (или PKS), под контролем промотора «В». Если для созревания функциональной гиспидин-синтазы необходима ко-экспрессия 4'-фосфопантотеинил трансферазы, то ее также вводят в клетку под контролем любого пригодного конститутивного или индуцируемого промотора. Об одновременной активации всех трех промоторов будет свидетельствовать появление детектируемого света при добавлении к клеткам (или их экстрактам) подходящего предшественника предлюциферина.

[0347] Комбинации также находят применение при получении трансгенных светящихся организмов. В преимущественных воплощениях, трансгенные организмы получают из организмов, дикий тип которых не обладает способностью к биолюминесценции. Нуклеиновые кислоты, кодирующие целевые белки вводят в трансгенный организм в составе кассеты экспрессии или вектора, которые существуют в организме в виде внехромосомного элемента или интегрируются в геном организма, как описано выше в разделе «Трансгенные организмы», и обеспечиваю экспрессию целевых белков. Трансгенные организмы по изобретению отличаются тем, что экспрессируют кроме люциферазы, субстратом которой является люциферин гриба, по крайней мере гиспидин-гидроксилазу. В преимущественных воплощениях они также экспрессируют гиспидин-синтазу. В других преимущественных воплощениях они экспрессируют также PKS. В других преимущественных воплощениях они экспрессируют также PKS. В некоторых воплощениях, они экспрессируют также кумарат-КоА-лигазу. Известно, что эндогенная кумарат-КоА-лигаза присутствует во многих растительных организмах, поэтому ее дополнительное введение осуществляется в случаях, когда эндогенная кумарат-КоА-лигаза отсутствует.

[0348] В некоторых воплощениях они также экспрессируют кофеилпируват-гидролазу. В отличие от организмов, экспрессирующих только люциферазу, трансгенные организмы, полученные с использованием нуклеиновых кислот настоящего изобретения, приобретают способность светиться в присутствии предлюциферинов и/или предшественников предлюциферинов - 3-арилакриловой кислот (чаще всего – кофейной кислоты) – представляющих собой наиболее дешевый и стабильный субстрат для получения биолюминесценции, который может быть добавлен в воду для полива растений, или в среду культивирования микроорганизмов, или в корм или среду обитания животных (например, рыб). Биолюминесцентные трансгенные организмы (растения, или животные, или грибы) находят применение в качестве источников света, а также используются для декоративных целей. Биолюминесцентные трансгенные организмы, клетки и клеточные культуры также можно использовать в различных скринингах, в которых интенсивность биолюминесценции меняется в зависимости от внешнего воздействия. Например, их можно использовать при анализе влияния различных факторов на активность промоторов, регулирующих экспрессию экзогенных нуклеиновых кислот.

[0349] Особый интерес представляют автономно биолюминесцентные трансгенные организмы, которые также обеспечиваются настоящим изобретением.

[0350] В некоторых воплощениях в указанных организмах в качестве метаболита присутствует хотя бы одна 3-арилакриловая кислота со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил.

[0351] В качестве неограничивающих примеров подобных организмов можно привести высшие и низшие растения, включая цветковые растения и мхи. Для получения автономно светящихся трансгенных растений в них вводят способные к экспрессии соответствующих ферментов нуклеиновые кислоты, кодирующие гиспидин-синтазу, гиспидин-гидроксилазу и люциферазу, способную окислять люциферин гриба с выделением света. Так как растения содержат, как правило, эндогенную 4'-фосфопантотеинил трансферазу, то дополнительного введения нуклеиновой кислоты, кодирующий этот фермент, для получения автономно светящихся растений, как правило, не требуется.

[0352] В некоторых воплощениях для получения автономно биолюминесцентных трансгенных организмов используются организмы, которые в природе не производят 3-арилакриловых кислот. Примерами таких организмов являются животные и многие микроорганизмы, например, дрожжи и бактерии. Для получения автономной биолюминесценции в организмы в этом случае дополнительно вводят способные к экспрессии нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты, обеспечивающие биосинтез 3-арилакриловых кислот из метаболитов клетки, например, кофейной кислоты из тирозина. При необходимости в организмы также вводят нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу.

[0353] В некоторых воплощениях для получения автономно светящихся организмов в них вводят способные к экспрессии соответствующих ферментов нуклеиновые кислоты, кодирующие PKS, гиспидин-гидроксилазу и люциферазу, способную окислять люциферин гриба с выделением света. В преимущественных воплощениях указанные клетки, ткани и организмы содержат достаточное количество кофеил-КоА и малонил-коА для осуществления реакции синтеза гиспидина.

[0354] В случаях, когда трансгенный организм не производит достаточных количеств кофеил-КоА в ходе нормальных метаболических процессов, в указанные клетки или организмы также вводится нуклеиновая кислота, кодирующая кумарат-КоА-лигазу, а также, при необходимости, ферменты биосинтеза кофейной кислоты из тирозина.

[0355] В преимущественных воплощениях комбинация нуклеиновых кислот для получения автономно биолюминесцентных клеток или трансгенных организмов также включает нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу. Как продемонстрировано в экспериментальной части ниже, экспрессия кофеилпируват-гидролазы приводит к увеличению интенсивности биолюминесценции автономно-светящихся биолюминесцентных клеток или трансгенных организмов. В преимущественных воплощениях интенсивность биолюминесценции увеличивается по крайней мере в 1.5 раза, чаще по крайней мере в 2 раза, обычно по крайней мере в пять раз, например, в 7-9 раз, например, в 8 или более раз.

[0356] Автономно биолюминесцентные трансгенные организмы (растения, или животные, или грибы), а также клетки и клеточные культуры отличаются от трансгенных организмов, клеток и клеточных культур, экспрессирующих только люциферазу и известных из уровня техники, тем, что для их свечения не требуется экзогенного добавления к ним люциферина или его предшественника.

[0357] В некоторых воплощениях вместо комбинации нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу, используется нуклеиновая кислота, кодирующая белок слияния этих двух ферментов. Специалисту в данной области очевидно, что указанный белок слияния и комбинация нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу, являются взаимозаменяемыми объектами во всех способах использования. Также очевидно, что на основе нуклеиновых кислот по изобретению могут быть изготовлены другие белки слияния, которые будут сохранять свойства партнеров слияния; такие белки слияния и кодирующие их нуклеиновые кислоты могут без ограничения использоваться вместо комбинаций отдельных белков и нуклеиновых кислот.

[0358] Во всех описанных выше применениях и способах нуклеиновые кислоты могут находиться в форме кассет экспрессии, которые можно применять для обеспечения экспрессии кодирующей последовательности в клетке-хозяине. Нуклеиновую кислоту можно интродуцировать в клетку-хозяина в составе вектора для осуществления экспрессии в пригодной клетке-хозяине или не включая ее в вектор, например, ее можно встраивать в липосому или вирусную частицу. В альтернативном варианте очищенную молекулу нуклеиновой кислоты можно встраивать непосредственно в клетку-хозяина с помощью пригодных средств, например, путем прямого эндоцитозного поглощения. Генетическую конструкцию можно интродуцировать непосредственно в клетки организма-хозяина (например, растения) путем трансфекции, инфекции, микроинъекции, клеточного слияния, слияния протопластов, путем бомбардировки микроснарядами или с помощью «генной пушки» (пушки для обстрела несущими генетические конструкции микрочастицами).

[0359] Так же обеспечивается применение поликлональных и моноклональных антител по изобретению. Они находят применение в способах окрашивания препаратов тканей, клеток или организмов для выявления локализации экспрессированных или природных гиспидин-гидроксилаз, гиспидин-синтаз и кофеилпируват-гидролаз по изобретению. Способы окрашивания с помощью специфческих антител хорошо известны из уровня техники и описаны, например, в [Быков В. Л. Цитология и общая гистология]. Прямой иммуногистохимический метод основан на реакции специфического связывания меченых антител непосредственно с выявляемым веществом, непрямой иммуногистохимический метод основан на том, что немеченые первичные антитела связываются с выявляемым веществом, а далее уже их выявляют при помощи вторичных меченых антител, при этом первичные антитела служат антигенами для вторичных антител. Также антитела находят применение для остановки ферментативной реакции. Контакт антитела со специфичным партнером по связыванию приводит к ингибированию ферментативной реакции. Также антитела находят применение в методах очистки рекомбинантных и природных белков по изобретению с помощью аффинной хроматографии. Способы аффинной хроматографии известны из уровня техники и описаны, например, в [Ninfa et al (2009). Fundamental Laboratory Approaches for Biochemistry and Biotechnology (2 ed.). Wiley. p. 133. ; Cuatrecasas (1970). JBC. Retrieved November 22, 2017].

Наборы и изделия

[0360] Следующим вариантом осуществления изобретения является изделие, которое включает описанные выше гиспидин-гидроксилазу, или гиспидин-синтазу, или кофеилпируват-гидролазу, или нуклеиновую кислоту, кодирующую вышеуказанный фермент, предпочтительно с элементами для обеспечения экспрессии целевого белка в клетке-хозяине, например, вектор или кассету экспрессии, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую целевой белок. Альтернативно, нуклеиновые кислоты могут содержать фланкирующие последовательности для ее встраивания в целевой вектор. Нуклеиновые кислоты могут быть включены в лишенные промотора векторы, предназначенные для удобного клонирования целевых регуляторных элементов. Рекомбинантные белки могут находиться в лиофилизированном состоянии или в растворенном виде в буферном растворе. Нуклеиновые кислоты могут находится в лиофилизированном состоянии или в виде осадка в спиртовом растворе или в растворенном виде в воде или буферном растворе.

[0361] В некоторых воплощениях изделие включает клетки, экспрессирующие одну или несколько из вышеперечисленных нуклеиновых кислот.

[0362] В некоторых воплощениях изделие включает трансгенный организм, экспрессирующий одну или несколько из вышеперечисленных нуклеиновых кислот.

[0363] В некоторых воплощениях изделие включает антитела для окрашивания, и/или ингибирования и\или аффинной хроматографии вышеуказанных ферментов.

[0364] Изделие представляет собой контейнер с этикеткой и приложенной к нему инструкцией. Приемлемыми контейнерами являются, например, флаконы, ампулы, пробирки, шприцы, планшеты для клеток, чашки Петри и т.д. Контейнер может быть изготовлен из различных материалов, таких как стекло или полимерные материалы. Выбор подходящего контейнера очевиден специалисту в данной области.

[0365] Кроме того, изделие может включать другие продукты, необходимые с коммерческой точки зрения и с точки зрения потребителя, например, реакционный буфер, или компоненты для его изготовления, буфер для разведения и/или растворения и/или хранения белков или нуклеиновых кислот, или компоненты для его изготовления, деионизованую воду, вторичные антитела к специфическим антителам по изобретению, среду для культивирования клеток или компоненты для ее изготовления, питание для трансгенного организма.

[0366] Изделия также включают инструкции для осуществления предлагаемых методов. Инструкции могут присутствовать в разных формах, при этом к изделию может прилагаться одна или несколько таких форм, например, инструкция может быть представлена в виде файла на электронном носителе и\или быть представлена на печатном носителе.

[0367] Изобретение относится также к наборам, которые можно применять для различных целей. Набор может включать комбинацию белков по изобретению или комбинацию нуклеиновых кислот по изобретению, предпочтительно с элементами для обеспечения экспрессии целевых белков в клетке-хозяине, например, вектор или кассету экспрессии, содержащую нуклеиновую кислоту, кодирующую целевой белок. В некоторых воплощениях набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин гриба с выделением света. В некоторых воплощениях набор может содержать нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты, вовлеченные в биосинтез кофейной кислоты из тирозина. В некоторых воплощениях набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу. В некоторых воплощениях набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую PKS. В некоторых воплощениях набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую кумарат-КоА-лигазу.

[0368] В некоторых воплощениях набор может также содержать антитела для очистки рекомбинантных белков или окрашивания экспрессированных белков в клетках-хозяевах. В некоторых воплощениях набор может также содержать праймеры, комплементарные участкам указанной нуклеиновой кислоты, для амплификации нуклеиновой кислоты или ее фрагмента. В некоторых воплощениях набор может также содержать один или несколько люциферинов грибов и/или предлюциферинов и/или предшественников предлюциферинов. Указанные соединения могут находиться в виде сухого порошка, в виде раствора в органическом растворителе, в виде раствора в воде. В некоторых воплощениях набор может включать клетки, содержащие одну или несколько из вышеперечисленных нуклеиновых кислот. В некоторых воплощениях набор может включать трансгенный организм по изобретение, например, штамм продуцент или трансгенное автономно биолюминесцентное растение. Все компоненты набора помещаются в подходящие контейнеры. Наборы как правило также включают инструкцию по использованию.

[0369] Для наилучшего понимания изобретения приводятся следующие примеры. Эти примеры приведены только в иллюстративных целях и не должны толковаться как ограничивающие сферу применения изобретения в любой форме.

[0370] Все публикации, патенты и патентные заявки, указанные в этой спецификации включены в данный документ путем отсылки. Хотя вышеупомянутое изобретение было довольно подробно описано путем иллюстрации и примера в целях исключения двусмысленного толкования, специалистам в данной области на основе идей, раскрытых в данном изобретении, будет вполне понятно, что могут быть внесены определенные изменения и модификации без отклонения от сущности и объема прилагаемых вариантов осуществления изобретения.

Экспериментальная часть (Примеры)

Пример 1. Выделение последовательностей гиспидин-гидроксилаз

[0371] Суммарная РНК из мицелия Neonothopanus nambi была выделена по методу, описанному в [Chomczynski and Sacchi, Anal. Biochem., 1987, 162, 156-159]. кДНК была амплифицирована с помощью SMART PCR cDNA Synthesis Kit (Clontech, США) согласно протоколу производителя. Полученная кДНК была использована для амплификации кодирующей последовательности люциферазы, нуклеотидная и аминокислотная последовательности которой показаны в SEQ ID NOs: 79, 80. Кодирующая последовательность была клонирована в вектор pGAPZ (Invitrogen, США) согласно протоколу производителя и трансформирована в компетентные клетки E.coli штамма XL1 Blue. Бактерии выращивали на чашках Петри в присутствии антибиотика зеоцина. Через 16 ч колонии были смыты с чашек, интенсивно перемешаны, и из них была выделена плазмидная ДНК с помощью набора для выделения плазмидной ДНК (Евроген, Россия). Выделенная плазмидная ДНК была линеаризована по сайту рестрикции AvrII и использована для трансформации клеток Pichia pastoris GS115. Электропорация была проведена по методу с использованием ацетата лития и дитиотреитола, описанному в [Wu and Letchworth, Biotechniques, 2004, 36:152-4]. Электропорированные клетки были рассеяны на чашки Петри со средой RDB medium, содержащей 1 M сорбитола, 2% (вес/объем) глюкозы, 1.34 % (вес/объем) дрожжевую основу азотного агара (YNB), 0.005 % (вес/объем) смеси аминокислот, 0.00004 % (вес/объем) биотина и 2 % (вес/объем) агара. Полученные колонии опрыскивали раствором 3-гидроксигиспидина, детектируя присутствие в клетках люциферазы по появлению света. Испускаемый колониями свет детектировали с помощью IVIS Spectrum CT (PerkinElmer, США). Колонии, в которых детектировалось свечение в ответ на добавление 3-гидроксигиспидина отбирали для дальнейшей работы.

[0372] Далее амплифицированную суммарную кДНК из Neonothopanus nambi клонировали в вектор pGAPZ и трансформировали в компетентные клетки E.coli штамма XL1 Blue. Бактерии выращивали на чашках Петри в присутствии антибиотика зеоцина. Через 16 ч колонии были смыты с чашек, интенсивно перемешаны, и из них была выделена плазмидная ДНК с помощью набора для выделения плазмидной ДНК (Евроген, Россия). Выделенная плазмидная ДНК была линеаризована по сайту рестрикции AvrII и использована для трансформации клеток дрожжей Pichia pastoris GS115, конститутивно экспрессирующих люциферазу Neonothopanus nambi. Трансформацию осуществляли методом электропорации как описано выше. Клетки были рассеяны на чашки Петри со средой RDB, содержащей 1 M сорбитола, 2% (вес/объем) глюкозы, 1.34% (вес/объем) дрожжевую основу азотного агара (YNB), 0.005% (вес/объем) смеси аминокислот, 0.00004% (вес/объем) биотина и 2% (вес/объем) агара. Разнообразие итоговой библиотеки кДНК Neonothopanus nambi в дрожжах составило порядка одного миллиона клонов. Полученные колонии опрыскивали раствором гиспидина, детектируя присутствие в клетках гиспидин-гидроксилазы по появлению света. Испускаемый колониями свет детектировали с помощью IVIS Spectrum CT (Perkin Elmer, США). В качестве отрицательного контроля использовали клетки, экспрессирующие только люциферазу, и клетки дрожжей дикого типа. При скрининге библиотеки колонии, в которых детектировалось свечение, отбирали и использовали для ПЦР в качестве матрицы со стандартными плазмидными праймерами. Продукты ПЦР секвенировали по методу Сенгера, чтобы определить последовательность экспрессируемого гена. Полученная последовательность нуклеиновой кислоты гиспидин-гидроксилазы показана в SEQ ID NO: 1. Кодируемая ею аминокислотная последовательность показана в SEQ ID NO: 2.

[0373] На Фиг. 4 показано свечение клеток Pichia pastoris, экспрессирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу или только люциферазу, или дрожжи дикого типа, при опрыскивании колоний 3-гидроксигиспидином (люциферин) и гиспидином (предлюциферин). Данные показывают, что в присутствии гиспидин-гидроксилазы в клетках образуется люциферин.

[0374] На следующем этапе из грибов Armillaria fuscipes, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Mycena chlorophos, Neonothopanus nambi, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius и Panellus stipticus была выделена геномная ДНК и проведено полногеномное секвенирование по технологии Illumina HiSeq (Illumina, США) согласно рекомендациям производителя. Результаты секвенирования были использованы для предсказания аминокислотных последовательностей гипотетических белков и использованы для поиска гомологов гиспидин-гидроксилазы из Neonothopanus nambi. Поиск гомологов осуществлялся с помощью программного обеспечения, предоставляемого National Center for Biotechnology Information. Был также проведен поиск аминокислотных последовательностей в данных геномного секвенирования грибов в базе данных NCBI Genbank. При поиске использовали стандартные параметры поиска blastp. В результате были идентифицированы последовательности гомологов гиспидин-гидроксилазы из Neonothopanus nambi – в Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos.

[0375] Нуклеотидные и аминокислотные последовательности гомологов гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi показаны в SEQ ID NOs: 3-28.

[0376] Все выявленные ферменты по существу сходны друг с другом. Степень идентичности аминокислотных последовательностей показана в Таблице 4.

Таблица 4. Процент идентичности аминокислотных последовательностей полноразмерных природных белков гиспидин-гидроксилаз.

SEQ ID NO:2SEQ ID NO:4SEQ ID NO:6SEQ ID NO:16SEQ ID NO:8SEQ ID NO:14SEQ ID NO:20SEQ ID NO:22SEQ ID NO:24SEQ ID NO:26SEQ ID NO:28SEQ ID NO:210061717270897273737369SEQ ID NO:461100504848634951505045SEQ ID NO:671501006969718586878867SEQ ID NO:672486910076727172727271SEQ ID NO:187248709976727173737371SEQ ID NO:870486976100717070717173SEQ ID NO:107048697699717070717173SEQ ID NO:1489637172711007275737471SEQ ID NO:2072498571707210091929368SEQ ID NO:2273518672707591100939369SEQ ID NO:2473508772717392931009569SEQ ID No:2673508872717493939510069SEQ ID NO:2869456771737168696969100

[0377] Из Panellus stipticus и Mycena citricolor было выделено несколько высокогомологичных аминокислотных последовательностей гиспидин-гидроксилазы, отличающихся единичными аминокислотными заменами. Их нуклеотидные и аминокислотные последовательности показаны в SEQ ID NOs 7-13 (Panellus stipticus) и SEQ ID NOs 15-18 (Mycena citricolor). Дальнейшее исследование свойств указанных белков не выявило влияния этих замен на ферментативные свойства.

[0378] Кодирующие последовательности выявленных гомологов (SEQ ID NOs: 3-28) были клонированы и трансформированы в клетки Pichia pastoris GS115, конститутивно экспрессирующие люциферазу Neonothopanus nambi по описанному выше протоколу. Полученные колонии опрыскивали раствором гиспидина, детектируя присутствие в клетках гиспидин-гидроксилазы по появлению света. Испускаемый колониями свет детектировали с помощью IVIS Spectrum CT (PerkinElmer, США). Все колонии, экспрессирующие тестируемые гены (SEQ ID NOs: 3,5,7,9,11,13,15,17,19, 21, 23, 25,27), производили в 1000-100000000 раз больше света при опрыскивании раствором гиспидина, чем контрольные клетки, что подтверждает способность ферментов, кодируемых протестированными генами, катализировать превращение гиспидина в 3-гидроксигиспидин (люциферин грибов).

[0379] Был проведен структурный анализ аминокислотных последовательностей выявленных ферментов. Анализ с помощью программного обеспечения SMART (Simple Modular Architecture Research Tool), доступное в сети Интернет по адресу http://smart.embl-heidelberg.de [Schultz et al., PNAS 1998; 95: 5857-5864; Letunic I, Doerks T, Bork P Nucleic Acids Res 2014; doi:10.1093/nar/gku949] выявил, что в состав всех выявленных белков входит FAD/NAD(P)-связывающий домен (FAD/NAD(P) binding domain, IPR002938 – код по публичной базе данных InterPro, доступной в сети Интернет по адресу http://www.ebi.ac.uk/interpro). Этот домен участвует в связывании ФАД и НАД у ряда ферментов, в частности, монооксигеназ – представителей крупного суперсемейства ферментов, добавляющих гидроксильную группу к субстрату и найденных в метаболических путях множества организмов. Выявленные гиспидин-гидроксилазы кроме FAD/NAD(P)-связывающего домена содержат оперативно связанные с ним N- и C-концевые аминокислотные последовательности (Фиг. 1). С помощью множественного выравнивания и сравнения аминокислотных последовательностей, выявленных гиспидин-гидроксилаз (Фиг. 1) было обнаружено, что они содержат в своем составе несколько консервативных аминокислотных мотивов (консенсусных последовательностей), характерных только для данной группы ферментов (SEQ ID NOs: 29-33). Консенсусные участки внутри аминокислотных последовательностей оперативно связаны через аминокислотные вставки.

Пример 2. Экспрессия гиспидин-гидроксилазы и люциферазы грибов в клетках млекопитающих и их совместное использование для мечения клеток

[0380] Кодирующие последовательности гиспидин-гидроксилазы и люциферазы из Neonothopanus nambi, полученные как описано в Примере 1, оптимизировали для экспрессии в клетках млекопитающих (гуманизировали). Оптимизированные нуклеиновые кислоты (SEQ ID NOs: 99 и 100) получали синтетическим путем. Кодирующую последовательность гиспидин-гидроксилазы клонировали в вектор pmKate2-keratin (Евроген, Россия), используя сайты рестрикции NheI и NotI вместо последовательности, кодирующий белок слияния mKate2-keratin. Последовательность люциферазы была амплифицирована с помощью ПЦР, обработана эндонуклеазами рестрикции NheI и EcoRV (New England Biolabs, Ipswich, MA) и лигирована в лентивирусный вектор pRRLSIN.cPPT.EF1. Плазмидную ДНК очищали с помощью наборов для очистки плазмидной ДНК (Евроген). Плазмидная ДНК, содержащая ген люциферазы, была использована для создания стабильно экспрессирующих линий HEK293NT. Векторные частицы были получены кальциево-фосфатной трансфекцией (Invitrogen, Carlsbad, CA) клеток HELK293T согласно протоколу, указанному на сайте производителя. За 24 часа до трансфекции 1 500 000 клеток были посажены в 60-мм культуральную чашку. Для трансфекции использовали около 4 и 1.2 мкг упаковочных плазмид pR8.91 и pMD.G, а также 5 мкг трансферной плазмиды, содержащей последовательность люциферазы. Вирусные частицы были собраны спустя 24 часа после трансфекции, сконцентрированы в 10 раз и использованы для трансдукции клеток HEK293NT. Около 100% клеток HEK293NT стабильно экспрессировали люциферазу Neonothopanus nambi.

[0381] Полученные клетки подвергали повторной трансфекции вектором, содержащим кодирующую последовательность гиспидин-гидроксилазы, с помощью трансфекционного реагента FuGENE HD (Promega, США) по протоколу производителя. Спустя 24 часа после трансфекции в среду добавляли гиспидин в концентрации 800 мкг/мл, и детектировали свечение клеток с помощью IVIS Spectrum CT (PerkinElmer). Полученные клетки испускали свет с интенсивностью более чем на два порядка превышающей сигнал, исходящий от нетрансфицированных контрольных клеток (Рис. 5).

[0382] Клетки визуализировали в проходящем свете, в канале для детекции зеленой люминесценции. Экспрессия гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi в клетках человека приводила к появлению отчетливого светового сигнала в зеленой области спектра в присутствии гиспидина, позволяющего отличить трансфицированные клетки от нетрансфицированных.

Пример 3. Использование гиспидин-гидроксилазы с аналогами гиспидина в клеточном лизате

[0383] Клетки HEK293NT, экспрессирующие люциферазу и гиспидин-гидроксилазу Neonothopanus nambi, полученныекак описано в Примере 2, смывали с чашек Петри спустя 24 часа после трансфекции с помощью раствора Версена с добавлением 0.025% трипсина, меняли среду на фосфатно-солевой буфер с pH 8.0 центрифугированием, ресуспендировали клетки, лизировали ультразвуком в приборе Bioruptor (Diagenode, Бельгия) в течение 7 минут при температуре 0°C в условиях, рекомендованных производителем, а в среду добавляли 1 мМ НАДФН (Sigma-Aldrich, США), а также гиспидин или один из его аналогов:

(E)-4-гидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2H-пиран-2-он, (E)-6-(2-(1H-индол-3-ил)винил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, (E)-6-(2-(1,2,3,5,6,7-гексагидропиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, E)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, или (E)-4-гидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2H-пиран-2-он в концентрации 660 мкг/мл. Спектры биолюминесценции детектировали с помощью спектрофлюориметра Varian Cary Eclipse. Испускание света в лизатах наблюдалось при добавлении всех указанных функциональных аналогов гиспидина. В зависимости от используемого люциферина наблюдалось ожидаемое смещение максимума люминесценции.

Пример 4. Получение рекомбинантных гиспидин-гидроксилаз

[0384] На 5’-конец нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-3-гидроксилазы и люциферазу из Neonothopanus nambi, полученные как описано в примерах 1 и 2, была оперативно присоединена полигистидиновая последовательность (гис-таг). Полученные конструкции были клонированы в вектор pET-23 с помощью эндонуклеаз рестрикции BamHI и HindIII. Вектор использовали для трансформации клеток Escherichia coli штамма BL21-DE3. Клетки высевали на чашки Петри со средой LB, содержащей 1.5% агар, ампициллин 100 мкг/мл, и инкубировали в течение ночи при 37°С. Колонии Escherichia coli затем переносили в 4 мл жидкой среды LB с добавлением ампициллина, инкубировали в течение ночи при покачивании при 37oC. 1 мл ночной культуры переносили в 100 мл среду Overnight Express Autoinduction medium (Novagen), в которую был предварительно добавлен ампициллин. Культуру растили при 37oC в течение 2.5 часов до достижения оптической плотности 0.6 ОЕ при 600 нм, а затем растили на комнатной температуре в течение 16 часов. Затем клетки осаждали центрифугированием при 4500 об/мин в течение 20 минут в центрифуге Eppendorf 5810R, ресуспендировали в 35 мл буфера (50 мМ Тris HCl рН 8.0, 150 мМ NaCl). Клетки разрушали ультразвуком и снова центрифугировали. Для очистки рекомбинантных белков использовали металл-аффинную хроматографию на смоле TALON (Clontech, США). Наличие ожидаемого рекомбинантного продукта подтверждали с помощью электрофореза.

[0385] Аликвоты выделенных рекомбинантных гиспидин-гидроксилаз использовали для проверки функциональности и стабильности. Для определения функциональности 15 мкл раствора выделенного рекомбинантного белка вносили в пробирку, содержащую 100 мкл буфера (0.2 M Na-фосфат буфера, 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM) pH 8.0), 0.5 мкл очищенной рекомбинантной люциферазы Neonothopanus nambi, 1 мМ НАДФН и 0.2 мкМ гиспидина. Пробирку помещали в люминометр. Активность выделенных рекомбинантных белков приводила к испусканию света при соединении с гиспидином и его аналогами, описанными в примере 3, в присутствии люциферазы Neonothopanus nambi. Во всех случаях интенсивность испускаемого света при использовании гиспидина была наибольшей при использовании гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, и наименьшей – у гиспидин-гидроксилазы Armillaria mellea.

Пример 5. Получение 3-гидроксигиспидина, (Е)-3,4-дигидрокси-6-стирил-2H-пиран-2-она и (Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2H-пиран-2-она с использованием рекомбинантной гиспидин-гидроксилазы

[0386] Выделенную рекомбинантную гиспидин-гидроксилазу из Neonothopanus nambi, полученную как описано в Примере 4, добавляли к реакционным смесям, содержащим 1 мМ НАДФН и 0.2 мкМ гиспидина, (Е)-4-гидрокси-6-стирил-2H-пиран-2-она или (Е)-4-гидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2H-пиран-2-она в 100 мкл буфера (0.2 M Na-фосфат буфера, 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM) pH 8.0). Через 30 минут реакционную смесь анализировали с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии, используя синтетические люциферины в качестве стандартов. Хроматография продемонстрировала возникновение пиков, соответствующих гидроксилированным по третьему положению производным: 3-гидроксигиспидину, (Е)-3,4-дигидрокси-6-стирил-2H-пиран-2-ону и (Е)-3,4-дигидрокси-6-(4-гидрокси-стирил)-2H-пиран-2-ону.

Пример 6. Детекция биолюминесценции с помощью белка слияния гиспидин-гидроксилазы и люциферазы

[0387] Гуманизированные последовательности ДНК, кодирующие гиспидин-гидроксилазу и люциферазу Neonothopanus nambi, полученные как описано в Примере 2,оперативно сшивали друг с другом посредством гибкого короткого пептидного линкера с аминокислотной последовательностью GGSGGSGGS (SEQ ID NOs:115). Последовательности нуклеотидов и аминокислот полученного химерного белка показаны в SEQ ID NO 101 и 102. Нуклеиновую кислоту, кодирующую химерный белок, клонировали в вектор pEGFP-N1 (Clontech, США) вместо гена EGFP под контроль цитомегаловирусного промотора. Полученную конструкцию трансфицировали в клетки HEK293T. Также в качестве контроля котрансфицировали аналогичные векторы, содержащие гены гиспидин-гидроксилазы и люциферазы по-отдельности. Трансфекцию проводили с помощью трансфекционного агента FuGENE HD (Promega, USA) по протоколу производителя. Через 24 часа после трансфекции 1 млн клеток ресуспендировали в 0,5 мл PBS и регистрировали люминесценцию без добавления гиспидина и с добавлением гиспидина (10 мкг на 1 млн клеток) с помощью люминометра. Добавление гиспидина приводило к появлению в клетках биолюминесценции в зеленой области спектра (Фиг. 6). К появлению биолюминесцентного сигнала также приводило и добавление 3-гидроксигиспидина. Экспрессия белков слияния гиспидин-гидроксилазы с люциферазой вместо одной люциферазы позволяет использовать более стабильные предшественники люциферина (гиспидин, бисноръянгонин и другие) для биолюминесцентного мечения клеток и не требует котрансфекции двух нуклеиновых кислот в клетки.

Пример 7. Приготовление поликлональных антител

[0388] Кодирующие последовательности гиспидин-гидроксилаз Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 1) и Armillaria mellea (SEQ ID NO: 19) были синтетически получены в виде линейной двуцепочечной ДНК и клонированы в экспрессионные векторы pQE-30 (Qiagen, Германия) таким образом, что рекомбинантные белки содержали на N-конце гистидиновую метку. После экспрессии в E. coli, рекомбинантные белки были очищены с помощью металл-аффинной смолы TALON (Clontech, США) в денатурирующих условиях. Препараты очищенного белка, эмульсифицированные в адъюванте Фрейнда, были использованы для четырех иммунизаций кроликов с месячными интервалами. Кровь кроликов отбирали на десятый или одиннадцатый дни после иммунизаций. Активность полученных поликлональных антисывороток проверяли с помощью методов ELISA и Вестерн-иммуноблоттинга на панели очищенных рекомбинантных гиспидин-гидроксилаз, полученных как описано в примере 4.

[0389] Антитела, полученные при иммунизации кролика белком из Neonothopanus nambi, демонстрировали активность против денатурированной и неденатурированной гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi и против денатурированной гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus gardneri.

Антитела, полученные при иммунизации кролика белком из Armillaria mellea были активны против денатурированных и неденатурированных гиспидин-гидроксилаз из Armillaria mellea, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae и Armillaria fuscipes.

Пример 8. Получение трансгенных растений, экспрессирующих гиспидин-гидроксилазу и люциферазу Neonothopanus nambi

[0390] Кодирующие последовательности гиспидин-гидроксилазы и люциферазы Neonothopanus nambi были оптимизированы для экспрессии в клетках мха Physcomitrella patens. Затем in silico была создана кассета экспрессии, содержащая промотор гена aktI риса, 5’-нетранслируемую область цитомегаловируса человека, кодирующую последовательность гиспидин-гидроксилазы, оптимизированную для экспрессии в клетках растений (SEQ ID NO 103), стоп-кодон, последовательность терминатора из гена osc агробактерии Agrobacterium tumefaciens, промотор убиквитина риса, оптимизированную для экспрессии в клетках мха кодирующую последовательность люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO 112), терминатор из гена nos агробактерии Agrobacterium tumefaciens.

[0391] Полученная последовательность была синтезирована, таким образом, что все указанные фрагменты оказались оперативно сшиты между собой, и клонирована с помощью методики Gibson assembly [Gibson et al., Nat Methods, 2009, 6:343-5] в экспрессионный вектор pLand#1 (Institut Jean-Pierre Bourgin, Франция), между фрагментами ДНК, совпадающими с локусом геномной ДНК мха Physcomitrella patens между последовательностями высокоэкспрессируемых генов мха Pp3c16_6440V3.1 и Pp3c16_6460V3.1. Вектор pLand#1 также содержал последовательность гидовой РНК (sgRNA) для нуклеазы Cas9, комплементарную участку того же локуса ДНК.

[0392] Препарат плазмидной ДНК был котрансформирован вместе с экспрессионным вектором, содержащим последовательность нуклеазы Cas9 под промотором убиквитина Arabidopsis thaliana, в протопласты мха Physcomitrella patens согласно протоколу полиэтиленгликольной трансформации, описанному в [Cove et al., Cold Spring Harb Protoc., 2009, 2]. Протопласты затем инкубировали в среде BCD в течение двух дней в темноте при покачивании с интенсивностью 50 об/мин для регенерации клеточной стенки. Протопласты затем переносили на чашки Петри, содержащие агар и среду BCD и выращивали при 16-часовом освещении в течение недели. Трансформированные колонии мха скринировали с внешних геномных праймеров с помощью ПЦР для определения успешности интеграции генетической конструкции в геном, переносили на свежие чашки Петри и выращивали в тех же условиях освещения в течение 30 дней.

[0393] Полученные гаметофиты мха вымачивали в среде BCD, содержащей гиспидин в концентрации 900 мкг/мл, и анализировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Все проанализированные трансгенные растения демонстрировали биолюминесценцию с интенсивностью, как минимум на два порядка превышающую интенсивность сигнала контрольных растений, экспрессирующих только люциферазу, инкубированных в том же растворе с гиспидином.

Пример 9. Идентификация гиспидин-синтаз и кофеилпируват-гидролаз

[0394] Предшественники люциферина грибов, такие как гиспидин, относятся к большой группе химических соединений – производных поликетидов. Такие соединения могут быть теоретически получены из 3-арилакриловых кислот, в которых заместителем по третьему положению являются ароматические заместители, в том числе арил или гетероарил. Из уровня техники известно, что ферменты, вовлеченные в синтез поликетидов и их производных у различных организмов, представляют собой многодоменные комплексы, относящиеся к белковому суперсемейству поликетидсинтаз. В то же время из уровня техники не было известно ни одной поликетидсинтазы, способной осуществлять катализ реакции превращения 3-арилакриловой кислоты в замещенный 4-гидрокси-2H-пиран-2-он. Для поиска целевой поликетидсинтазы был использован скрининг библиотеки кДНК из Neonothopanus nambi.

[0395] Известно, что для получения функциональных поликетидсинтаз в дрожжевой системе гетерологической экспрессии необходимо дополнительно ввести в культуру ген, экспрессирующий 4'-фосфопантотеинил трансферазу – фермент, осуществляющий перенос 4-фосфопантетеинила от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтазы [Gao Menghao et al., Microbial Cell Factories 2013,12:77]. Ген 4'-фосфопантотеинил трансферазы NpgA из Aspergillus nidulans (SEQ ID NOs 104, 105), известный из уровня техники, был получен синтетическим путем и клонирован в вектор pGAPZ. Плазмида была линеаризована по сайту рестрикции AvrII и использована для трансформации линии дрожжей Pichia pastoris GS115, конститутивно экспрессирующих люциферазу и гиспидин-гидроксилазу Neonothopanus nambi, полученнной как описано в Примере 1. Разнообразие итоговой библиотеки кДНК Neonothopanus nambi в дрожжах составило порядка одного миллиона клонов.

[0396] Библиотеку кДНК из Neonothopanus nambi, экспрессированную в указанной линии дрожжей Pichia pastoris, получали по протоколу, приведенному в Примере 1 и использовали для идентификации гиспидин-синтаз и кофеилпируват-гидролаз. Клетки были рассеяны на чашки Петри со средой RDB medium, содержащей 1 M сорбитола, 2% (вес/объем) глюкозы, 1.34 % (вес/объем) дрожжевую основу азотного агара (YNB), 0.005 % (вес/объем) смеси аминокислот, 0.00004 % (вес/объем) биотина и 2 % (вес/объем) агара.

[0397] Для идентификации гена гиспидин-синтазы полученные колонии опрыскивали раствором кофейной кислоты (потенциального предшественника гиспидина), детектируя присутствие в клетках гиспидин-синтазы по появлению света. Испускаемый колониями свет детектировали с помощью IVIS Spectrum CT (PerkinElmer, США). В качестве отрицательного контроля использовали клетки, экспрессирующие только люциферазу и гиспидин-гидроксилазу, и клетки дрожжей дикого типа. При скрининге библиотеки колонии, в которых детектировалось свечение, отбирали и использовали для ПЦР в качестве матрицы со стандартными плазмидными праймерами. Продукты ПЦР секвенировали по методу Сенгера, чтобы определить последовательность экспрессируемого гена. Полученная последовательность нуклеиновой кислоты гиспидин-синтазы показана в SEQ ID NO: 34. Кодируемая ею аминокислотная последовательность показана в SEQ ID NO: 35.

[0398] Полученную линию дрожжей Pichia pastoris, содержащую интегрированные в геном гены люциферазы, гиспидин-гидроксилазы и гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi, а также ген 4'-фосфопантотеинил трансферазы NpgA из Aspergillus nidulans, использовали далее для идентификации фермента, катализирующего превращение оксилюциферина ((2Е,5Е)-6-(3,4-дигидроксифенил)-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновой кислоты) в кофейную кислоту. Линию клеток снова трансформировали линеаризованной плазмидной библиотекой генов Neonothopanus nambi, полученной на первом этапе работы. Колонии опрыскивали раствором кофеилпирувата, детектируя присутствие в клетках целевого фермента по появлению света. Испускаемый колониями свет детектировали с помощью IVIS Spectrum CT (PerkinElmer, США). В качестве отрицательного контроля использовали клетки, экспрессирующие только люциферазу и гиспидин-гидроксилазу, и клетки дрожжей дикого типа. При скрининге библиотеки колонии, в которых детектировалось свечение, отбирали и использовали для ПЦР в качестве матрицы со стандартными плазмидными праймерами. Продукты ПЦР секвенировали по методу Сенгера, чтобы определить последовательность экспрессируемого гена. Полученная последовательность нуклеиновой кислоты выделенного фермента показана в SEQ ID NO: 64. Кодируемая ею аминокислотная последовательность показана в SEQ ID NO: 65. Выявленный фермент получил название кофеилпируват-гидролаза.

Пример 10. Идентификация гомологов гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi и кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi

[0399] Для поиска гомологов гиспидин синтазы и кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi использовали данные полногеномного секвенирования из биолюминесцентных грибов, полученные как описано в Примере 1. Поиск гомологов осуществлялся с помощью программного обеспечения, предоставляемого National Center for Biotechnology Information. Был также проведен поиск аминокислотных последовательностей в данных геномного секвенирования грибов в базе данных NCBI Genbank. При поиске использовали стандартные параметры поиска blastp.

[0400] Были идентифицированы последовательности гомологов гиспидин-синтазы из Neonothopanus nambi – в Armillaria fuscipes, Armillaria mellea, Guyanagaster necrorhiza, Mycena citricolor, Neonothopanus gardneri, Omphalotus olearius, Panellus stipticus, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae, Mycena chlorophos. Их нуклеотидные и аминокислотные последовательности показаны в SEQ ID NO 36-55. Все выявленные ферменты были по существу сходны друг с другом. Степень идентичности аминокислотных последовательностей показана в Таблице 5.

Таблица 5. Процент идентичности аминокислотных последовательностей полноразмерных природных белков гиспидин-синтаз

SEQ ID NO:35SEQ ID NO:53SEQ ID NO:43SEQ ID NO:45SEQ ID NO:37SEQ ID NO:41SEQ ID NO:55SEQ ID NO:47SEQ ID NO:49SEQ ID NO:51SEQ ID NO:35100565756518157505757SEQ ID NO:53561008052455588468888SEQ ID NO:43578010052475683458586SEQ ID NO:45565252100535452545353SEQ ID NO:37514547531005146514747SEQ ID NO:41815556545110055505656SEQ ID NO:55578883524655100469091SEQ ID NO:47504645545150461004646SEQ ID NO:49578885534756904610095SEQ ID NO:51578886534756914695100

[0401] Из Panellus stipticus было выделено две высокогомологичные аминокислотные последовательности гиспидин-синтаз, отличающиеся единичной аминокислотной заменой. Их нуклеотидные и аминокислотные последовательности показаны в SEQ ID NO 36-39.

[0402] Выявленные ферменты были проверены на способность осуществлять реакцию превращения кофейной кислоты в гиспидин с помощью способа, описанного в примере 9.

[0403] Множественное выравнивание аминокислотных последовательностей выявленных белков позволило идентифицировать несколько высокогомологичных фрагментов аминокислотной последовательности, характерных для данной группы ферментов. Консенсусные последовательности для этих фрагментов показаны в SEQ ID NOs: 70-77. Указанные последовательности разделены протяженными аминокислотными последовательностями как показано на Фиг. 2.

[0404] Последовательности гомологов кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi были идентифицированы в Neonothopanus gardneri, Armillaria mellea, Armillaria fuscipes, Armillaria gallica, Armillaria ostoyae Нуклеотидные и аминокислотные последовательности выявленных гомологов показаны в SEQ ID NOs: 66-75. Выявленные ферменты были проверены на способность осуществлять реакцию превращения кофеилпирувата в кофейную кислоту с помощью способа, описанного в Примере 9.

[0405] Все выявленные ферменты по существу сходны друг с другом и имеют длину 280-320 аминокислот. Степень идентичности аминокислотных последовательностей показана в Таблице 6.

Таблица 6. Процент идентичности аминокислотных последовательностей полноразмерных природных белков кофеиллпируват-гидролаз.

SEQ ID NO:65SEQ ID NO:73SEQ ID NO:75SEQ ID NO:67SEQ ID NO:69SEQ ID NO:71SEQ ID NO:651006464646464SEQ ID NO:736410092629695SEQ ID NO:756492100629090SEQ ID NO:676462621006061SEQ ID NO:696496906010097SEQ ID NO:716495906197100

[0406] Анализ с помощью программного обеспечения SMART (Simple Modular Architecture Research Tool), доступное в сети Интернет по адресу http://smart.embl-heidelberg.de [Schultz et al., PNAS 1998; 95: 5857-5864; Letunic I, Doerks T, Bork P Nucleic Acids Res 2014; doi:10.1093/nar/gku949] выявил, что в состав выявленных ферментов входит расположенный ближе к С-концу фумарилацетазный домен (EC 3.7.1.2) длиной около 200 аминокислот, однако консервативная область начинается примерно с 8 аминокислоты согласно нумерации аминокислот кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi. Множественное выравнивание позволило выявить консенсусные последовательности (SEQ ID NOs 76-78), характерные для данной группы белков, разделенные аминокислотными вставками с более низкой идентичностью. Положение консенсусных последовательностей показано на (Фиг. 3).

Пример 11. Получение рекомбинантных гиспидин-синтазы и кофеилпируват-гидролазы и их использование для получения биолюминесценции

[0407] На 5’-концы нуклеиновых кислот, кодирующих гиспидин-синтазу и кофеилпируват-гидролазу Neonothopanus nambi, полученных как описано в примере 9, была оперативно присоединена последовательность, кодирующая полигистидин (гис-таг), и полученные конструкции были клонированы в вектор pET-23 с помощью эндонуклеаз рестрикции NotI и SacI. Векторы использовали для трансформации клеток Escherichia coli штамма BL21-DE3-codon+, которую осуществляли электропорацией. Трансформированные клетки высевали на чашки Петри со средой LB, содержащей 1.5% агар, ампициллин 100мкг/мл, и инкубировали в течение ночи при 37°С. Колонии Escherichia coli затем переносили в 4 мл жидкой среды LB, содержащей 100 мкг/мл ампициллина, инкубировали в течение ночи при покачивании при 37°С. 1 мл ночной культуры переносили в 200 мл среды Overnight Express Autoinduction medium (Novagen), в которую был предварительно добавлен ампициллин. Культуру инкубировали при 37°С в течение 3 часов до достижения оптической плотности 0.6 ОЕ при 600 нм, а затем инкубировали при комнатной температуре в течение 16 часов. Затем клетки осаждали центрифугированием при 4500 об/мин в течение 20 минут в центрифуге Eppendorf 5810R, ресуспендировали в 20 мл буфера (50 мМ Тris HCl рН 8.0, 150 мМ NaCl), лизировали ультразвуком в приборе Bioruptor (Diagenode, Бельгия) в течение 7 минут при температуре 0°C в условиях, рекомендованных производителем, и снова центрифугировали. Белок из лизата получали с помощью аффинной хроматографии на смоле Talon (Clontech, США). Наличие ожидаемого рекомбинантного продукта подтверждали с помощью электрофореза по наличию полос ожидаемой длины.

[0408] Аликвоты выделенных рекомбинантных белков использовали для проверки функциональности.

[0409] Для определения функциональности гиспидин-синтазы 30 мкл раствора выделенного рекомбинантного белка вносили в пробирку, содержащую 100 мкл буфера (0.2 M Na-фосфат буфера, 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM) pH 8.0, все компоненты – Sigma-Aldrich, США), 0.5 мкл очищенной рекомбинантной люциферазы Neonothopanus nambi, полученной как описано в Примере 4, 1 мМ НАДФН (Sigma-Aldrich, США), 15 мкл очищенной рекомбинантной гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, полученной как описано в Примере 4, 10 мМ АТФ (ThermoFisher Scientific, США), 1 мМ КоА (Sigma-Aldrich, США), 1 мМ Малонил-КоА (Sigma-Aldrich, США). Пробирку помещали в люминометр GloMax 20/20 (Promega, США). Реакционные смеси демонстрировали биолюминесцентное свечение при добавлении в раствор 20 мкМ кофейной кислоты (Sigma-Aldrich, США). Испускаемый свет обладал максимумом эмиссии в области 520-535 нм.

[0410] Для определения функциональности кофеилпируват-гидролазы 10 мкл раствора выделенного рекомбинантного белка вносили в пробирку, содержащую 100 мкл буфера (0.2 M Na-фосфат буфера, 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM) pH 8.0), 0.5 мкл люциферазы Neonothopanus nambi, 1 мМ НАДФН (Sigma-Aldrich, США), 15 мкл гиспидин-гидроксилазы, 10 мМ АТФ (ThermoFisher Scientific, США), 1 мМ КоА (Sigma-Aldrich, США), 1 мМ Малонил-КоА (Sigma-Aldrich, США), 30 мкл очищенной рекомбинантной гиспидин-синтазы. Пробирку помещали в люминометр GloMax 20/20 (Promega, США). Биолюминесцентное свечение реакционной смеси детектировалось при добавлении в раствор 25 мкМ кофеилпирувата, свидетельствуя о способности тестируемого фермента разлагать кофеилпируват до кофейной кислоты. Испускаемый свет обладал максимумом эмиссии в области 520-535 нм.

[0411] Полученные ферменты использовали для получения свечения (биолюминесценции) в реакции с люциферазой и гиспидин-гидроксилазой Neonothopanus nambi, полученными как описано в Примере 4. По 5 мкл раствора каждого выделенного рекомбинантного белка вносили в пробирку, содержащую 100 мкл буфера (0.2 M Na-фосфат буфера, 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM) pH 8.0), 1 мМ НАДФН (Sigma-Aldrich, США), 10 мМ АТФ (ThermoFisher Scientific, США), 1 мМ КоА (Sigma-Aldrich, США), 1 мМ малонил-КоА (Sigma-Aldrich, США) и 0.2 мкМ одной из 3-арилакриловых кислот: паракумаровой кислоты (Sigma-Aldrich, США), коричной кислоты (Sigma-Aldrich, США) или феруловой кислоты (Abcam, США). В другом эксперименте в пробирку вместо замещенной 3-арилакриловой кислоты добавляли аналоги оксилюциферина грибов – (2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(4-гидроксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновую, (2Е,5Е)-2-гидрокси-4-оксо-6-фенилгекса-2,5-диеновую, или (2Е,5Е)-2-гидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксифенил)-4-оксогекса-2,5-диеновую кислоты – также в концентрации 0.2 мкМ. Пробирки помещали в люминометр. Активность выделенных рекомбинантных белков приводила к испусканию света в каждой из описанных реакций.

Пример 13. Получение гиспидина из кофейной кислоты

[0412] Кассета экспрессии, содержащая нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs 34, 35), под контролем конститутивного промотора J23100, и кассета экспрессии, содержащая ген 4'-фосфопантотеинил трансферазы NpgA из Aspergillus nidulans (SEQ ID NOs 104, 105) под контролем промотора araBAD, фланкированные участками гомологии к сайту SS9 были получены синтетическим путем и клонированы в бактериальный экспрессионный вектор, содержащий кассету устойчивости к зеоцину. Полученную конструкцию использовали для трансформации и интеграции в геном E. coli BW25113 при помощи рекомбинации, опосредованной белками бактериофага лямбда как описано в Bassalo et al. [ACS Synth Biol. 2016 Jul 15;5(7):561-8], с использованием отбора на устойчивость к зеоцину. Интеграцию полноразмерной конструкции подтверждали с помощью ПЦР с праймеров, специфичных к участкам гомологии SS9, а затем убеждались в корректности интегрированной конструкции секвенированием ПЦР-продукта геномной ДНК по методу Сэнгера.

[0413] Полученный штамм E. coli использовали для получения гиспидина. На первой этапе, бактерии культивировали в пяти 50-мл пластиковых пробирках в среде LB в течение 10 часов при покачивании 200 оборотов в минуту при 37°C. 250 мл полученной культуры добавляли к 3.3 литрам ферментационной среды в ферментер Biostat B5 (Braun, Германия) так, что начальная оптическая плотность культуры при 600 нм составляла около 0.35. Ферментационная среда содержала 10 г/л пептона, 5 г/л кофейной кислоты, 5 г/л дрожжевого экстракта, 10 г/л NaCl, 25 г/л глюкозы, 15 г/л (NH4)2SO4, 2 г/л KH2PO4, 2 г/л MgSO4·7 H2O, 14.7  мг/л CaCl2, 0.1 мг/л тиамина, 1.8 мг/л, и 0.1% раствора следующего состава: ЭДТА 8 мг/л, CoCl2·6 H2O 2.5 мг/л, MnCl2·4H2O 15 мг/л, CuCl2·2H2O 1.5 мг/л, H3BO3 3 мг/л, Na2MoO4·2H2O 2.5 мг/л, Zn(CH3COO)2·2H2O 13 мг/л, цитрат железа(III) 100 мг/л, гидрохлорида тиамина 4.5 мг/л. Ферментацию осуществляли при 37 °C, с аэрацией 3 л/мин и перемешивании со скоростью 200 оборотов в минуту. Спустя 25 часов культивирования к культуре добавляли арабинозу до финальной концентрации 0.1 мМ. pH контролировали автоматически добавлением NH4OH, доводя pH до значения 7.0. Раствор, содержащий глюкозу 500 г/л, кофейную кислоту 5 г/ л, арабинозу 2 г/л, триптон 25 г/л, дрожжевой экстракт 50 г/л, MgSO4·7H2O 17.2 г/л, (NH4)SO4 7.5 г/л, аскорбиновую кислоту 18 г/л, добавляли в ферментер для поддержания уровня глюкозы каждый раз при повышении pH до 7.1. Спустя 56 часов культивирования концентрация гиспидина в среде составляла 1.23 г/л. Среда из ферментера, а также очищенный из нее с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии гиспидин, обладали активностью в биолюминесцентной реакции с гиспидин-гидроксилазой и люциферазой Neonothopanus nambi.

Пример 13. Получение 3-гидроксигиспидина из кофейной кислоты

[0414] Кассета экспрессии, содержащая нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs 1, 2) под контролем промотора J23100, была получена синтетически и клонирована в бактериальный экспрессионный вектор, содержащий ген устойчивости к спектиномицину. Полученный вектор трансформировали в клетки E. coli, экспрессирующие гиспидин-синтазу Neonothopanus nambi, ген устойчивости к зеоцину и ген NpgA, полученные как описано в примере 12. Полученные бактерии использовали для получения 3-гидроксигиспидина путем ферментации, по протоколу, описанному в Примере 12, однако с добавлением спектиномицина в концентрации 50 мг/мл во все используемые для культивирования среды. Спустя 48 часов культивирования концентрация 3-гидроксигиспидина в среде составляла 2.3 г/л. Среда из ферментера, а также очищенный из нее с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии 3-гидроксигиспидин, обладали активностью в биолюминесцентной реакции с люциферазой Neonothopanus nambi.

Пример 14 Получение гиспидина из метаболитов клетки и тирозина

[0415] Для производства биосинтетического гиспидина из тирозина был получен штамм E. coli, эффективно производящий тирозин и кофейную кислоту. Штамм E. coli был получен как описано в [Lin и Yan. Microb Cell Fact. 2012 Apr 4;11:42]. За основу для создания штамма была взята линия E. coli BW25113 с интегрированным мутантным геном пермеазы lacY (lacY A177C) по сайту attB, обеспечивающим равномерное потребление арабинозы клетками бактерий. Кассеты экспрессии, содержащие кодирующие последовательности генов тирозин-аммоний-лиазы Rhodobacter capsulatus (SEQ ID NOs: 106, 107), и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli (SEQ ID NOs: 108-111), каждый под контролем конститутивного промотора J23100, были получены синтетически и интегрированы в геном штамма E. coli как описано в Примере 12. На следующем этапе в геном E. coli интегрировали плазмиду, полученную как описано в Примере 12 и содержащую кодирующую последовательность гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi под контролем конститутивного промотора J23100, кассету устойчивости к зеоцину из вектора pGAP-Z, а также ген NpgA. Интеграцию в геном E. coli осуществляли при помощи рекомбинации, опосредованной белками бактериофага лямбда, по методике из [Bassalo et al., ACS Synth Biol. 2016; 5(7):561-568]. Интеграцию полноразмерной конструкции подтверждали с помощью ПЦР с праймеров, специфичных к участкам гомологии SS9 (5’-CGGAGCATTTTGCATG-3’ и 5’-TGTAGGATCAAGCTCAG-3’), а затем убеждались в корректности интегрированной конструкции секвенированием ПЦР-продукта геномной ДНК по методу Сэнгера. Полученный штамм бактерий использовали для получения биосинтетического гиспидина в ферментере.

[0416] Культивирование бактерий производили в ферментере, как описано в Примере 12, с единственным отличием – в среды для культивирования бактерий не добавляли кофейную кислоту. Биосинтетический гиспидин выделяли из среды с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии. Созданный штамм был способен к производству 1.20 мг/л гиспидина за 50 часов ферментации. Чистота полученного препарат составила 97.3%. Добавление тирозина в среды для культивирования в концентрации 10 г/мл позволяло повысить выход гиспидина до 108.3 мг/мл.

Пример 15. Создание трансгенных автономно биолюминесцентных дрожжей Pichia pastoris

[0417] Для создания автономно биолюминесцентных дрожжей Pichia pastoris были синтезированы кассеты экспрессии, содержащие под контролем промотора GAP и терминатора tAOX1 кодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 79, 80), гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 1, 2), гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 34, 35), кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 64, 65), белка NpgA Aspergillus nidulans (SEQ ID NOs: 104, 105), тирозин-аммоний-лиазы Rhodobacter capsulatus (SEQ ID NOs: 106, 107), и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli (SEQ ID NOs: 108-111). Каждая кассета экспрессии была фланкирована последовательностями узнавания рестриктазы BsmBI. Также синтетически были получены участки гомологии к гену MET6 Pichia pastoris (Uniprot F2QTU9), фланкированные сайтами рестриктазы BsmBI. Синтетическую ДНК обрабатывали рестриктазами BsmBI и объединяли в одну плазмиду по протоколу клонирования Golden Gate, описанному в [Iverson et al., ACS Synth Biol. 2016 Jan 15;5(1):99-103]. 10 фмоль каждого из фрагментов ДНК смешивали в реакции, содержащей однократный буфер для ДНК-лигазы (Promega, США), 20 единиц активности ДНК-лигазы (Promega, США), 10 единиц активности эндонуклеазы рестрикции в общем объеме 10 мкл. Полученную реакционную смесь помещали в амплификатор и инкубировали при температурах 16°C и 37°C по следующему протоколу: 25 циклов инкубации при 37°C в течение 1.5 мин и при 16°C – 3 мин, затем единовременная инкубация при 50°C в течение 5 мин, а затем единовременная инкубация при 80°C в течение 10 мин. 5 мкл реакционной смеси трансформировали в химически компетентные клетки E.coli. Корректность сборки плазмидной ДНК подтверждали секвенированием по методу Сенгера, и препарат очищенной плазмидной ДНК использовали для трансформации клеток Pichia pastoris GS11 электропорацией. Электропорация была проведена по методу с использованием ацетата лития и дитиотреитола, описанному в [Wu and Letchworth, Biotechniques, 2004, 36:152-4]. Электропорированные клетки были рассеяны на чашки Петри со средой RDB, содержащей 1 M сорбитола, 2% (w/v) глюкозы, 1.34 % (w/v) дрожжевую основу азотного агара (YNB), 0.005 % (w/v) смеси аминокислот, 0.00004 % (w/v) биотина и 2 % (w/v) агара. Интеграцию кассеты генов в геном подтверждали с помощью ПЦР с праймеров, отжигающихся на участки гомологии. Полученный штамм дрожжей, содержащий корректную вставку в геноме, был способен автономно производить свет, в отличие от штамма дрожжей дикого типа (Фиг. 7, 8).

Пример 16. Создание трансгенных автономно биолюминесцентных цветковых растений

[0418] Для создания автономно биолюминесцентных цветковых растений на основе вектора pBI121 (Clontech, США) был создан бинарный вектор для агробактериальной трансформации, содержащий оптимизированные для экспрессии в растенияхкодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 112), гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 103), гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 113), кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 114) и ген устойчивости к канамицину, каждый ген – под контролем промотора 35S из вируса мозаики цветной капусты. Последовательности для сборки кассет экспрессии получали синтетическим путем, сборку вектора осуществляли по протоколу клонирования Golden Gate, описанному в [Iverson et al., ACS Synth Biol. 2016 Jan 15;5(1):99-103].

[0419] Arabidopsis thaliana трансформировали путем совместного культивирования ткани растения с бактериями Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0 [Lazo et al., Biotechnology, 1991 Oct; 9(10):963-7], содержащими созданный бинарный вектор. Трансформацию осуществляли, применяя совместное культивирование сегментов корней Arabidopsis thaliana (экотип С24), как описано [Valvekens et al., 1988, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 85, 5536-5540]. Корни растений арабидопсиса культивировали на агаризованной среде Гамборга B-5 c 20 г/л глюкозы, 0,5 г/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и 0,05 кинетина в течении 3 дней. Затем корни нарезали на кусочки длиной 0,5 см и переносили в 10 мл жидкой среды Гамборга B-5 c 20 г/л глюкозы, 0,5 г/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и 0,05 кинетина и добавляли 1,0 мл среды ночной культуры агробактерий. Кокультивацию эксплантов с агробактериями проводили в течении 2-3 минут. После этого экспланты помещали на стерильные фильтры в чашки Петри с агаризованной средой того же состава. Через 48 часов инкубации в термостате при температуре 25°C экспланты переносили на свежую среду с цефотаксимом 500 мг/л и канамицином 50 мг/л. Через три недели начинали регенерацию растений на селективной среде, содержащей канамицин 50 мг/л. Трансгенные растения укореняли и переносили в среду проращивания или на грунт. Биолюминесценцию визуализировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Более 90% трансгенных растений испускали свет, как минимум на два порядка превышающий сигнал от растений дикого типа.

[0420] Nicotiana benthamiana трансформировали путем совместного культивирования ткани растения с бактериями Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0 [Lazo et al., Biotechnology, 1991 Oct; 9(10):963-7], содержащими созданный бинарный вектор. Трансформацию осуществляли, применяя совместное культивирование сегментов листьев Nicotiana benthamiana. Затем листья нарезали на кусочки длиной 0,5 см и переносили в 10 мл жидкой среды Гамборга B-5 c 20 г/л глюкозы, 0,5 г/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и 0,05 кинетина и добавляли 1,0 мл среды ночной культуры агробактерий. Кокультивацию эксплантов с агробактериями проводили в течении 2-3 минут. После этого экспланты помещали на стерильные фильтры в чашки Петри с агаризованной средой того же состава. Через 48 часов инкубации в термостате при температуре 25°C экспланты переносили на свежую среду с цефотаксимом 500 мг/л и канамицином 50 мг/л. Через три недели начинали регенерацию растений на селективной среде, содержащей канамицин 50 мг/л. Трансгенные растения укореняли и переносили в среду проращивания или на грунт. Биолюминесценцию визуализировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Более 90% трансгенных растений испускали свет, как минимум на два порядка превышающий сигнал от растений дикого типа. Фотографии автономно светящихся растений Nicotiana benthamiana приведены на Фиг. 9.

[0421] Для создания автономно биолюминесцентной полевицы побегоносной Agrostis stolonifera L. в вектор pBI121 (Clontech, США) клонировали кодирующие последовательности генов метаболического каскада люциферина гриба, оптимизированные для экспрессии в растенияхи фланкированные сайтами эндонуклеазы рестрикции BsaI: люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 126), гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 117), гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 127), кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 128) и ген устойчивости к гербициду глифосату (ген bar). Каждая последовательность находилась под контролем промотора CmYLCV [Stavolone et al., Plant Mol Biol. 2003 Nov;53(5):663-73]. Последовательности синтезировали по стандартной методике. Сборка вектора осуществлялась по протоколу клонирования Golden Gate. Трансформацию проводили методом агробактериальной трансформации эмбриогенного калусса. В жидкую среду добавляли ночную культуру бактерий Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0 [Lazo et al., Biotechnology, 1991 Oct; 9(10):963-7], содержащую созданный бинарный вектор. После двух дней кокультивации на агаризованой среде Мурасиге-Скуга, растения переносили на свежую среду с добавлением цефотаксима 500 мг/л и фосфинотрицина 10 мг/л. Регенерация растений начиналась через три недели. Трансгенные растения пересаживали на среду с половинным содержанием солей Мурасиге-Скуга и фосфинотрицином 8 мг/л для укоренения. Укорененные растения высаживали в теплицу. Около 25% полученных растений с корректной и полной интеграцией в геном метаболического каскада, обладали биолюминесценцией, превышающей биолюминесценцию контрольных растений дикого типа.

[0422] Особый интерес представляют организмы, способные испускать свет в определенных тканях или в определенное время суток. Такие организмы более эффективно расходуют ресурсы, требуемые для излучения света. Для создания автономно биолюминесцентных роз, испускающих свет только в лепестках, были отобраны несколько разновидностей роз с белыми лепестками. На основе вектора pBI121 (Clontech, США) было создано два бинарных вектора для агробактериальной трансформации, содержащих метаболический каскад из оптимизированных для экспрессии в растениях кодирующих последовательностей люциферазы Neonothopanus nambi, гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi, кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi и гена устойчивости к неомицину. Все гены, кроме гена люциферазы, были помещены под контроль промотора вируса мозаики цветной капусты 35S. В одном из векторов ген люциферазы был помещен под контроль промотора халконсинтазы розы, а в другом – под контроль промотора UEP1 хризантемы. Использовались синтетические нуклеиновые кислоты, необходимые для сборки вектора, фланкированные сайтами узнавания рестриктазы BsaI, сборка вектора осуществлялась по протоколу клонирования Golden Gate. Трансгенные растения розы Rosa hybrida L. cv. Tinike получали путем совместного культивирования эмбриогенного каллуса с бактериями Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0 [Lazo et al., Biotechnology, 1991 Oct; 9(10):963-7], содержащим один из бинарных векторов, описанных выше. Культивирование проводили в жидкой среде, содержащей макро- и микро-соли Мурасиге-Скуга, с добавлением кинетина 1-2 мг/л, 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты - 3 мг/л и 6-бензиламинопурина 1 мг/л в течении 40 минут. Каллус переносили на агаризованную среду того же состава. Через два дня экспланты переносили на свежую среду Мурасиге-Скуга с добавлением цефотаксима 500мг/л и канамицина 50 мг/л. Формирование и регенерация побегов происходила через 5-8 недель. Побеги переносили на среду размножения или укоренения. Укорененные побеги высаживали в теплицу в торфяную смесь. Цветение наблюдали через 8 недель. Растения с развитыми цветками визуализировали в IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Для каждой из протестированных конструкций, все протестированные растения автономно испускали свет, как минимум на три порядка превышающий сигнал от растений дикого типа. Свет исходил только из тканей лепестков, подтверждая тканеспецифичное функционирование промоторов.

[0423] Для создания автономно биолюминесцентных растений, в которых биолюминесценция регулируется циркадными ритмами и активируется в темное время суток использовали ранее полученный бинарный вектор для агробактериальной трансформации, содержащий кодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi, гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi, кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi и ген устойчивости к канамицину, каждый ген – под контролем промотора 35S из вируса мозаики цветной капусты. В нем заменяли промотор для экспрессии люциферазы Neonothopanus nambi на промотор гена CAT3 из Arabidopsis thaliana. Транскрипция с промотора гена CAT3 регулируется циркадными ритмами и активируется в вечернее время. Последовательность промотора CAT3 известна из уровня техники [Michael и McClung, Plant Physiol. 2002 Oct;130(2):627-38]. Arabidopsis thaliana трансформировали путем совместного культивирования ткани растения с бактериями Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0 [Lazo et al., Biotechnology, 1991 Oct; 9(10):963-7], содержащими созданный бинарный вектор. Трансформацию осуществляли, применяя совместное культивирование сегментов корней Arabidopsis thaliana (экотип С24), как описано [Valvekens et al., 1988, Proc. Nat. Acad. Sci. USA 85, 5536-5540]. Корни растений арабидопсиса культивировали на агаризованной среде Гамборга B-5 c 20 г/л глюкозы, 0,5 г/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и 0,05 кинетина в течении 3 дней. Затем корни нарезали на кусочки длиной 0,5 см и переносили в 10 мл жидкой среды Гамборга B-5 c 20 г/л глюкозы, 0,5 г/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и 0,05 кинетина и добавляли 1,0 мл среды ночной культуры агробактерий. Кокультивацию эксплантов с агробактериями проводили в течении 2-3 минут. После этого экспланты помещали на стерильные фильтры в чашки Петри с агаризованной средой того же состава. Через 48 часов инкубации в термостате при температуре 25°C экспланты переносили на свежую среду с цефотаксимом 500 мг/л и канамицином 50 мг/л. Через три недели начинали регенерацию растений на селективной среде, содержащей канамицин 50 мг/л. Трансгенные растения укореняли и переносили в среду проращивания, растили в условиях естественной смены дня и ночи. Биолюминесценцию визуализировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer), помещая растения в прибор на сутки и регистрируя интенсивность биолюминесценции каждые полчаса. Растения испускали свет в течение суток, однако интенсивность биолюминесценции значительно модулировалась циркадными ритмами: интегральная интенсивность свечения в темное время суток превышала интегральную светимость в течение дня более, чем в 1000 раз для 85% процентов проанализированных растений.

Пример 17. Создание трансгенных автономно биолюминесцентных низших растений

[0424] Автономно биолюминесцентный мох Physcomitrella patens был создан с помощью котрансформации протопластов плазмидами способом, описанным в Примере 8. Были синтетически получены кассеты экспрессии, включающие оптимизированные для экспрессии в растениях кодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 112), гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 103), гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 113), кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 114) и ген устойчивости к канамицину, каждая под контролем промотора актина 2 риса. Кассеты экспрессии оперативно сшивали в векторе pBI121 (Clontech, США) таким образом, чтобы конструкция, включающая полный метаболический каскад и ген устойчивости к канамицину, оказались фланкированы последовательностями, совпадающими с последовательностью целевого локуса в геноме мха. Сборка вектора осуществлялась по протоколу клонирования Golden Gate [Iverson et al., ACS Synth Biol. 2016 Jan 15;5(1):99-103]. Также в вектор клонировали ген гидовой РНК, комплементарный целевому участку в геноме мха. Плазмида с перечисленными генами была котрансформирована с плазмидой для конститутивной экспрессии нуклеазы Cas9, согласно протоколу полиэтиленгликольной трансформации, описанному в [Cove et al., Cold Spring Harb Protoc., 2009, 2]. Полученные трансформированные протопласты инкубировали без света в течение суток в среде BG-11, а затем переносили на чашки Петри со средой BG-11 и 8.5% агаром. Спустя месяц после выращивания на чашках при непрерывном облучении светом, проводили визуализацию в IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). 70% протестированных растений испускали свет, как минимум на порядок превышающий сигнал от растений дикого типа.

Пример 18. Получение трансгенных люминесцентных животных

[0425] Трансгенные рыбы Danio rerio, содержащие ген гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, были созданы по методу, описанному в [Hisano et al., Sci Rep., 2015, 5:8841]. Методика включает экспрессию гидовой РНК и нуклеазы Cas9 для создания точечного разрыва в области, гомологичной последовательности гидовой РНК. Для создания трансгенных животных были заказаны синтетические фрагменты ДНК, содержащие последовательности гидовой РНК из плазмиды pX330, Addgene #42230 и мРНК нуклеазы Cas9 под контролем промотора полимеразы бактериофага T7. Полученные фрагменты использовали для транскрипции in vitro с помощью реагентов из набора MAXIscript T7 kit (Life Technologies, США), а синтезированную РНК очищали с помощью набора для выделения РНК (Евроген, Россия).

[0426] Кодирующую последовательность гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, фланкированную 50-нуклеотидными последовательностями из гена krtt1c19e Danio rerio, описанные в [Hisano et al., Sci Rep., 2015, 5:8841] получали синтетическим путем и клонировали в основу плазмиды pEGFP/C1, содержащую ориджин репликации pUC и кассету устойчивости в канамицину. Полученный вектор, мРНК нуклеазы Cas9 и гидовая РНК были растворены в инъекционном буфере (40 мМ HEPES (pH 7.4), 240 мМ KCl с добавлением 0.5% фенолового красного) и инъецированы в 1-2-клеточные зародыши ранее полученной линии Danio rerio, стабильно экспрессирующей люциферазу Neonothopanus nambi, в объеме около 1-2 нл. Из 48 зародышей, около 12 зародышей пережили инъекцию и демонстрировали нормальное развитие на четвертый день после оплодотворения.

[0427] Для регистрации биолюминесцентного сигнала раствор гиспидина инъецировали внутривенно в личинки Danio rerio согласно методике, описанной в [Cosentino et al., J Vis Exp. 2010; (42): 2079]. Биолюминесценцию регистрировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). После регистрации из личинок выделяли геномную ДНК для подтверждения интеграции гена гиспидин-гидроксилазы в геном. Все личинки с корректной интеграцией гена гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi в геном демонстрировали биолюминесценцию с интенсивностью, как минимум на два порядка превышающую интенсивность сигнала, исходящего от рыб дикого типа после инъекции раствора гиспидина.

Пример 19. Исследование влияния кофеилпируват-гидролазы на свечение автономно биолюминесцентных организмов

[0428] Для исследования влияния кофеилпируват-гидролазы на свечение автономно биолюминесцентных организмов использовали бинарный вектор для агробактериальной трансформации, содержащий кодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi, гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi, кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi и ген устойчивости к канамицину, каждый ген – под контролем промотора 35S из вируса мозаики цветной капусты, полученный как описано в Примере 16 и контрольный вектор, отличающийся тем, что из него была удалена последовательность кофеилпируват-гидролазы. Векторы использовали для трансформации Arabidopsis thaliana в одинаковых условиях по протоколу, описанному в Примере 16. Биолюминесценцию визуализировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Сравнение интенсивностей биолюминесценции растений, экспрессирующих все четыре гена биолюминесцентной системы Neonothopanus nambi, с растениями, экспрессирующими только люциферазу, гиспидин-гидроксилазу и гиспидин-синтазу, выявило, что растения, дополнительно экспрессирующие кофеилпируват-гидролазу обладают в среднем в 8.3 раза более яркой биолюминесценцией. Приведенные данные свидетельствуют о том, что экспрессия кофеилпируват-гидролазы позволяет увеличить эффективность биолюминесцентного каскада, что приводит к увеличению интенсивности испускаемого растениями света.

Пример 20. Влияние внешнего добавления кофейной кислоты на биолюминесценцию трансгенных организмов

[0429] Автономно биолюминесцентные трансгенные растения Nicotiana benthamiana, полученные как описано в Примере 16, переносили на грунт и культивированы в течение восьми недель. Затем стебель растений срезали и помещали на два часа в воду, после чего измеряли интенсивность биолюминесценции с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Затем растения переносили в один из пяти водных растворов с концентрацией кофейной кислоты 0.4 г/л, 0.8 г/л, 1.6 г/л, 3.2 г/л или 6.4 г/л, а контрольные растения помещали в воду. Спустя еще два часа инкубации в растворе кофейной кислоты или воде снова измеряли биолюминесценцию. Во всех случаях интенсивность биолюминесценции растений, инкубированных в растворе кофейной кислоты, повышалась по сравнению с интенсивностью до помещения в раствор кофейной кислоты, причем наибольшие изменения наблюдались для растений, прошедших инкубацию в растворе c концентрацией 6.4 г/л. Контрольные растения, инкубированные в воде, не демонстрировали значимого изменения интенсивности биолюминесценции в течение четырех часов после начала инкубации.

Пример 21. Использование генов биолюминесцентной системы грибов для анализа активности промоторов и внутриклеточной логической интеграции внешних сигналов.

[0430] Кодирующие последовательности гиспидин-синтазы, гиспидин-гидроксилазы и люциферазы Neonothopanus nambi были использованы для мониторинга одновременной активации нескольких промоторов. Синтетические кассеты экспрессии, содержащие кодирующую последовательность гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 34, 35) под контролем индуцируемого арабинозой промотора E. coli araBAD, кодирующую последовательность гиспидин-гидроксилазы (SEQ ID NOs 1, 2) под контролем индуцируемого IPTG промотора T7/lacO, и ген люциферазы (SEQ ID NOs: 79, 80) под контролем индуцируемого рамнозой промотора pRha, а также ген NpgA (SEQ ID NOs: 104, 105) под контролем конститутивного промотора J23100 (Registry of Standard Biological parts, Part:BBa_J23100). Полученные синтетические нуклеиновые кислоты клонировали в вектор MoClo_Level2 [Weber et al., PLoS One. 2011 Feb 18;6(2):e16765] вместо вставки, содержащий ген LacZ, с помощью эндонуклеазы рестрикции BpiI. Полученный вектор трансформировали в компетентные клетки штамма E.coli BL21 (NEB, США), содержащие геномную копию полимеразы бактериофага T7.

[0431] Для определения возможность регистрации одновременной активации нескольких промоторов, клетки, полученные на предыдущем этапе, подращивали в течение ночи в колбе в среде LB объемом 100 мл c добавлением ампициллина в концентрации 100 мг/л. На следующий день аликвоты культуры клеток помещали на 120 минут при температуре 24°С и покачивании 200 оборотов в минуту в одну из сред следующего состава:

1. Среда LB с добавлением 1% арабинозы,

2. Среда LB с добавлением 0.2% рамнозы,

3. Среда LB с добавлением 0.5% IPTG,

4. Среда LB с добавлением 1% арабинозы и 0.2% рамнозы,

5. Среда LB с добавлением 1% арабинозы и 0.5% IPTG,

6. Среда LB с добавлением 0.2% рамнозы и 0.5% IPTG,

7. Среда LB с добавлением 1% арабинозы, 0.2% рамнозы и 0.5% IPTG,

8. Среда LB (контроль).

[0432] После инкубации клетки осаждали центрифугированием, заменяли среду на фосфатно-солевой буфер с pH 7.4 (Sigma-Aldrich, США) с добавлением кофейной кислоты (Sigma-Aldrich, США) в концентрации 1 г/л, клетки ресуспендировали пипетированием. Биолюминесценцию клеток анализировали через полчаса с помощью люминометра GloMax 20/20 (Promega, США). Эксперимент повторяли в трех повторностях. Из восьми проанализированных проб интенсивность биолюминесценции значимо отличалась от биолюминесценции контрольных бактерий, инкубированных в среде LB (среда №8), только для бактерий, прошедших инкубацию в среде №7 (среда LB с добавлением 1% арабинозы, 0.2% рамнозы и 0.5% IPTG). Таким образом, свечение бактерий позволяло судить о помещении бактерий в среду, обеспечивающую одновременную активацию трех различных промоторов. В поставленном эксперименте бактериальные клетки интегрировали информацию о присутствии во внешней среде индуцирующих активность промоторов веществ и сигнализировали свечением только в случае, когда все три вещества присутствовали в среде одновременно, внутриклеточно выполняя логическую операцию «И».

[0433] Синтетические кассеты экспрессии, содержащие (1) кодирующую последовательность гиспидин-гидроксилазы (SEQ ID NOs: 1, 2) под контролем промотора Odf2 по [Pletz et al., Biochim Biophys Acta. 2013 Jun;1833(6):1338-46]; (2) кодирующую последовательность гиспидин-синтазы (SEQ ID NOs: 34, 35) под контролем промотора циклин-зависимой киназы CDK7; (3) люциферазы (SEQ ID NOs: 79, 80) под контролем промотора гена CCNH клонировали в вектор pmKate2-keratin (Евроген, Россия) вместо последовательностей цитомегаловирусного промотора и вставки mKate2-keratin. Так же кодирующую последовательность гена NpgA (SEQ ID NOs: 104, 105) клонировали в вектор pmKate2-keratin вместо последовательности вставки mKate2-keratin. Все полученные векторы ко-трансфицировали в клетки HEK293T с помощью трансфекционного реагента FuGENE HD (Promega, США) по протоколу производителя. Спустя 24 часа после трансфекции в среду добавляли кофейную кислоту в концентрации 5 мг/мл, и детектировали свечение клеток с помощью микроскопа Leica TCS SP8. Испускание света позволило определить одновременную активацию промоторов Odf2, CCNH и CDK7, причем интенсивность испускаемого света была связана со стадией клеточного цикла.

[0434] Полученные данные свидетельствуют о том, что гены биолюминесцентной системы грибов можно применять для мониторинга одновременной активности нескольких промоторов, для детекции наличия в среде различных веществ и их комбинаций, а также для логической интеграции внешних сигналов внутри клетки.

Пример 22. Выявление гиспидина в растительных экстрактах

[0435] Кодирующие последовательности гиспидин-гидроксилазы и люциферазы Neonothopanus nambi, полученные как описано в Примере 1, были клонированы в вектор pET23 под контроль промотора T7. Препараты очищенной плазмидной ДНК были использованы для транскрипции и трансляции белков in vitro с помощью набора PURExpress In Vitro Protein Synthesis Kit (NEB, США). Полученную реакционную смесь использовали для анализа наличия и концентрации гиспидина и его функциональных аналогов в лизатах около 19 различных растений (Chrysanthemum sp., Ananas comosus, Petunia atkinsiana, Picea abies, Urtica dioica, Solanum lycopersicum, Nicotiana benthamiana, Nicotiana tobacum, Arabidopsis thaliana, Rosa glauca, Rosa rubiginosa, Equisetum arvense, Equisetum telmateia, Polygala sabulosa, Rosa rugosa, Clematis tashiroi, Kalanchoe sp., Triticum aestivum, Dianthus caryophyllus), добавляя 2 мкл лизата растения к 100 мкл реакционной смеси и регистрируя интенсивность испускаемого света с помощью люминометра GloMax (Promega, США). Было определено, что максимальная концентрация гиспидина и его функциональных аналогов содержится в лизатах хвощей Equisetum arvense и Equisetum telmateia. Также гиспидин или его функциональные аналоги были обнаружены в лизатах Polygala sabulosa, Rosa rugosa и Clematis tashiroi.

Пример 23. Выявление PKS, способных катализировать синтез гиспидина, и их использование для получения гиспидина в системах in vitro и in vivo.

[0436] Предшественники люциферина грибов, такие как гиспидин, относятся к группе производных поликетидов. Из уровня техники известно, что ферменты, вовлеченные в синтез поликетидов в растениях относятся к белковому суперсемейству поликетидсинтаз, причем в отличие от поликетидсинтаз грибов, поликетидсинтазы растений являются сравнительно компактными белками, использующими в качестве субстрата КоА-эфиры кислот, в том числе 3-арилакриловых кислот. Из уровня техники не было известно ни одной поликетидсинтазы, способной осуществлять катализ реакции превращения КоА-эфира кофейной кислоты в гиспидин, однако гиспидин обнаруживается во многих растительных организмах.

[0437] С помощью биоинформатического анализа были отобраны потенциально способные катализировать синтез гиспидина 11 поликетидсинтаз из следующих источников:

Aquilaria sinensis (2 фермента),
Hydrangea macrophylla,
Arabidopsis thaliana,
Physcomitrella patens,
Polygonum cuspidatum,
Rheum palmatum,

Rheum tataricum,

Wachendorfia thyrsiflora,

Piper methysticum (два фермента).

[0438] Была проведена оптимизация выбранных нуклеотидных последовательностей для экспрессии в клетках дрожжей Pichia pastoris и растения Nicotiana benthamiana. Полученные нуклеиновые кислоты были получены синтетическим путем, клонированы в вектор pGAPZ и использованы для проверки способности экспрессированных белков синтезировать гиспидин.

[0439] Для этого в геном линии дрожжей Pichia pastoris GS115, конститутивно экспрессирующих люциферазу и гиспидин-гидроксилазу Neonothopanus nambi, полученной как описано в Примере 1, была дополнительно введена плазмида pGAPZ содержащая ген кумарат-КоА-лигазы 1 Arabidopsis thaliana (последовательности нуклеотидов и аминокислот для нее показаны в SEQ ID NOs: 140, 141), также полученный с помощью олигонуклеотидного синтеза. Плазмида была линеаризована по сайту рестрикции AvrII и использована для трансформации в клетки Pichia pastoris GS115.

[0440] Полученные клетки дрожжей, конститутивно экспрессирующие люциферазу и гиспидин-гидроксилазу Neonothopanus nambi и кумарат-КоА-лигазу 1 Arabidopsis thaliana, трансфецировалилинеаризованными плазмидами, содержащими кодирующие последовательности PKS, и рассевали на чашки Петри со средой RDB, содержащей 1 M сорбитола, 2% (вес/объем) глюкозы, 1.34 % (вес/объем) дрожжевую основу азотного агара (YNB), 0.005 % (вес/объем) смеси аминокислот, 0.00004 % (вес/объем) биотина и 2 % (вес/объем) агара. Для идентификации ферментов, обладающих активностью гиспидин-синтаз, полученные колонии опрыскивали раствором кофейной кислоты, детектируя присутствие в клетках гиспидин-синтазы по появлению биолюминесценции. Испускаемый колониями свет детектировали с помощью IVIS Spectrum CT (PerkinElmer, США). В качестве отрицательного контроля использовали линию дрожжей, конститутивно экспрессирующих люциферазу, гиспидин-гидроксилазу и кумарат-КоА-лигазу 1, а также клетки дрожжей дикого типа. Среди проанализированных генов, активностью гиспидин-синтаз обладали 11 ферментов, последовательность которых показана в SEQ ID NOs: 118, 120, 122, 124, 126, 128, 130, 132, 134, 136, 138. Кодируемые ими аминокислотные последовательности показаны в SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139 соответственно. Наибольшую активность проявляли ферменты из PKS1 и PKS2 из Aquilaria sinensis (SEQ ID NOs:119, 121), PKS из Arabidopsis thaliana (SEQ ID NO:123) и PKS из Hydrangea macrophylla (SEQ ID NO:125).

[0441] Нуклеиновая кислота, кодирующая PKS из Hydrangea macrophylla (SEQ ID NOs: 124, 125) была использована для получения рекомбинантного белка по методике, описанной в Примере 4. Наличие ожидаемого рекомбинантного продукта подтверждали с помощью электрофореза по наличию полос ожидаемой длины. Аликвоты выделенного рекомбинантного белка использовали для проверки функциональности: 30 мкл раствора выделенного рекомбинантного белка вносили в пробирку, содержащую 100 мкл буфера (0.2 M Na-фосфат буфера, 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM) pH 8.0, все компоненты – Sigma-Aldrich, США), 0.5 мкл очищенной рекомбинантной люциферазы Neonothopanus nambi, полученной как описано в Примере 4, 1 мМ НАДФН (Sigma-Aldrich, США), 15 мкл очищенной рекомбинантной гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi, полученной как описано в Примере 4, 10 мМ АТФ (ThermoFisher Scientific, США), 1 мМ КоА (Sigma-Aldrich, США), 1 мМ Малонил-КоА (Sigma-Aldrich, США). Пробирку помещали в люминометр GloMax 20/20 (Promega, США). Реакционные смеси демонстрировали биолюминесцентное свечение при добавлении в раствор 20 мкМ кофеил-КоА. Испускаемый свет обладал максимумом эмиссии в области 520-535 нм.

[0442] Нуклеиновая кислота, кодирующая PKS2 из Aquilaria sinensis (SEQ ID NO:120, 121) была использована для получения штамма продуцента гиспидина. Для этого синтезировали кассету экспрессии, содержащую нуклеиновую кислоту SEQ ID NO:120 под контролем конститутивного промотора J23100, и кассету экспрессии, содержащую нуклеиновую кислоту SEQ ID NO: 140, кодирующую 4-кумарат-КоА-лигазу 1 из Arabidopsis thaliana, под контролем промотора araBAD; обе кассеты экспрессии фланкировали участками гомологии к сайту SS9. Кассеты экспрессии клонировали в бактериальный экспрессионный вектор, содержащий кассету устойчивости к зеоцину и использовали для трансформации и интеграции в геном E. coli BW25113 при помощи рекомбинации, опосредованной белками бактериофага лямбда как описано в Bassalo et al. [ACS Synth Biol. 2016 Jul 15;5(7):561-8], с использованием отбора на устойчивость к зеоцину. Интеграцию полноразмерной конструкции подтверждали с помощью ПЦР с праймеров, специфичных к участкам гомологии SS9, а затем убеждались в корректности интегрированной конструкции секвенированием ПЦР-продукта геномной ДНК по методу Сэнгера.

[0443] Полученный штамм E. coli использовали для получения гиспидина. На первой этапе, бактерии культивировали в пяти 50-мл пластиковых пробирках в среде LB в течение 10 часов при покачивании 200 оборотов в минуту при 37°C. 250 мл полученной культуры добавляли к 3.3 литрам ферментационной среды в ферментер Biostat B5 (Braun, Германия) так, что начальная оптическая плотность культуры при 600 нм составляла около 0.35. Ферментационная среда содержала 10 г/л пептона, 5 г/л кофейной кислоты, 5 г/л дрожжевого экстракта, 10 г/л NaCl, 25 г/л глюкозы, 15 г/л (NH4)2SO4, 2 г/л KH2PO4, 2 г/л MgSO4·7 H2O, 14.7  мг/л CaCl2, 0.1 мг/л тиамина, 1.8 мг/л, и 0.1% раствора следующего состава: ЭДТА 8 мг/л, CoCl2·6 H2O 2.5 мг/л, MnCl2·4H2O 15 мг/л, CuCl2·2H2O 1.5 мг/л, H3BO3 3 мг/л, Na2MoO4·2H2O 2.5 мг/л, Zn(CH3COO)2·2H2O 13 мг/л, цитрат железа(III) 100 мг/л, гидрохлорида тиамина 4.5 мг/л. Ферментацию осуществляли при 37 °C, с аэрацией 3 л/мин и перемешивании со скоростью 200 оборотов в минуту. Спустя 25 часов культивирования к культуре добавляли арабинозу до финальной концентрации 0.1 мМ. pH контролировали автоматически добавлением NH4OH, доводя pH до значения 7.0. Раствор, содержащий глюкозу 500 г/л, кофейную кислоту 5 г/ л, арабинозу 2 г/л, триптон 25 г/л, дрожжевой экстракт 50 г/л, MgSO4·7H2O 17.2 г/л, (NH4)SO4 7.5 г/л, аскорбиновую кислоту 18 г/л, добавляли в ферментер для поддержания уровня глюкозы каждый раз при повышении pH до 7.1. Спустя 56 часов культивирования концентрация гиспидина в среде составляла 3.48 г/л. Среда из ферментера, а также очищенный из нее с помощью высокоэффективной жидкостной хроматографии гиспидин, обладали активностью в биолюминесцентной реакции с гиспидин-гидроксилазой и люциферазой Neonothopanus nambi, полученными как описано в Примере 4.

[0444] Для создания автономно биолюминесцентных дрожжей Pichia pastoris были использованы кассеты экспрессии, содержащие под контролем промотора GAP и терминатора tAOX1 кодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 79, 80), гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 1, 2), гиспидин-синтазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 34, 35), кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NOs: 64, 65), тирозин-аммоний-лиазы Rhodobacter capsulatus (SEQ ID NOs: 106, 107), и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli (SEQ ID NOs: 108-111), описанные как описано в Примере 15, а так же были синтезированы аналогичные кассеты экспрессии, содержащие кодирующие последовательности 4-кумарат-КоА-лигазы 1 из Arabidopsis thaliana (SEQ ID NOs: 140, 141) и трех PKS: из Aquilaria sinensis (SEQ ID NOs:120, 121), PKS из Arabidopsis thaliana (SEQ ID NOs:122, 123) и PKS из Hydrangea macrophylla (SEQ ID NO:124, 125). Каждая кассета экспрессии была фланкирована последовательностями узнавания рестриктазы BsmBI. Также синтетически были получены участки гомологии к гену MET6 Pichia pastoris (Uniprot F2QTU9), фланкированные сайтами рестриктазы BsmBI. Синтетическую ДНК обрабатывали рестриктазами BsmBI и объединяли в одну плазмиду по протоколу клонирования Golden Gate, описанному в [Iverson et al., ACS Synth Biol. 2016 Jan 15;5(1):99-103]. Было изготовлено три плазмиды, отличающиеся включенной в их состав PKS. Полученные плазмиды использовали для получения трансгенных дрожжей Pichia pastoris по методике, описанной в Примере 15. Интеграцию кассеты генов в геном подтверждали с помощью ПЦР с праймеров, ожигающихся на участки гомологии. Все три полученных штамма дрожжей, содержащих корректную вставку в геноме, были способены автономно производить свет, в отличие от штамма дрожжей дикого типа.

[0445] Для создания автономно биолюминесцентных цветковых растений на основе вектора pBI121 (Clontech, США) был создан набор бинарных векторов для агробактериальной трансформации, содержащий оптимизированные для экспрессии в растенияхкодирующие последовательности люциферазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 112), гиспидин-гидроксилазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 103), кофеилпируват-гидролазы Neonothopanus nambi (SEQ ID NO: 114), ген устойчивости к канамицину, и PKS (SEQ ID NOs: 122, 123), каждый ген – под контролем промотора 35S из вируса мозаики цветной капусты. Последовательности для сборки кассет экспрессии получали синтетическим путем, сборку вектора осуществляли по протоколу клонирования Golden Gate, описанному в [Iverson et al., ACS Synth Biol. 2016 Jan 15;5(1):99-103]. Nicotiana tabacum трансформировали путем совместного культивирования ткани растения с бактериями Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0 [Lazo et al., Biotechnology, 1991 Oct; 9(10):963-7], содержащими созданный бинарный вектор. Трансформацию осуществляли, применяя совместное культивирование сегментов листьев Nicotiana tabacum. Затем листья нарезали на кусочки длиной 0,5 см и переносили в 10 мл жидкой среды Гамборга B-5 c 20 г/л глюкозы, 0,5 г/л 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и 0,05 кинетина и добавляли 1,0 мл среды ночной культуры агробактерий. Кокультивацию эксплантов с агробактериями проводили в течении 2-3 минут. После этого экспланты помещали на стерильные фильтры в чашки Петри с агаризованной средой того же состава. Через 48 часов инкубации в термостате при температуре 25°C экспланты переносили на свежую среду с цефотаксимом 500 мг/л и канамицином 50 мг/л. Через три недели начинали регенерацию растений на селективной среде, содержащей канамицин 50 мг/л. Трансгенные растения укореняли и переносили в среду проращивания или на грунт. Биолюминесценцию визуализировали с помощью IVIS Spectrum In Vivo Imaging System (Perkin Elmer). Трансгенных растений испускали свет, как минимум на три порядка превышающий сигнал от растений дикого типа.

Пример 24. Комбинации нуклеиновых кислот

[0446] Комбинация 1:

[0447] Состав: (а) Нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28; и (б) Нуклеиновая кислота, кодирующая люциферазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98.

[0448] Комбинация может быть использована для получения биолюминесценции в системах экспрессии in vitro или in vivo в присутствии вещества, выбранного из группы 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-онов, имеющих структурную формулу

,

в котором заместителем по шестому положению является 2-арилвинильный или 2-гетероарилвинильный заместитель (R-CH=CH-), в том числе 2-(3,4-дигидроксистирил), 2-(4-гидроксистирил), 2-(4-(диэтиламино)стирил), 2-(2-(1H-индол-3-ил)винил), 2-(2-(1,2,3,5,6,7-гексагидропиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил), 2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил.

[0449] Также указанная комбинация может быть использована для исследования зависимости двух промоторов в гетерологических системах экспрессии.

[0450] Также указанная комбинация может быть использована для выявления гиспидина и его аналогов в биологических образцах.

[0451] Также указанная комбинация может быть использована для мечения клеток с помощью биолюминесценции. Появляющейся в присутствии гиспидина и его функциональных аналогов.

[0452] Комбинация 2:

[0453] Состав: (а) Нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, и (б) Нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55.

[0454] Комбинация может быть использована для получения люциферина грибов в системах экспрессии in vitro или in vivo из вещества, выбранного из замещенной акриловой кислоты со структурной формулой

[0455] , где R – арил или гетероарил (например, из кофейной кислоты).

[0456] Комбинация 3:

[0457] Включает все компоненты, указанные в Комбинации 2, а также нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98.

[0458] Комбинация может быть использована для получения биолюминесценции в системах экспрессии in vitro или in vivo в присутствии вещества, выбранного из замещенной акриловой кислоты со структурной формулой

[0459] , где R – арил или гетероарил.

[0460] Комбинация может быть использована для получения биолюминесцентных клеток и трансгенных организмов. Также указанная комбинация может быть использована для исследования зависимости трех промоторов в гетерологических системах экспрессии.

[0461] Комбинация 4.

[0462] Включает все компоненты, указанные в Комбинации 3, также нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75.

[0463] Комбинация может быть использована для получения биолюминесцентных клеток и трансгенных организмов.

[0464] Комбинация 5.

[0465] Состав: (а) Нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55; и (б) Нуклеиновая кислота, кодирующая гена 4'-фосфопантотеинил трансферазу, аминокислотная последовательность которой показана в SEQ ID NO: 105

[0466] Комбинация может быть использована для получения гиспидина из кофейной кислоты в системах экспрессии in vitro и in vivo.

[0467] Комбинация 6

[0468] Состав: (а) Нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55; (б) Нуклеиновая кислота, кодирующая гена 4'-фосфопантотеинил трансферазу, аминокислотная последовательность которой показана в SEQ ID NO: 105; и (в) нуклеиновые кислоты, кодирующме ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

[0469] , где R – арил или гетероарил из метаболитов клетки (например, нуклеиновые кислоты, кодирующие тирозин-аммоний-лиазу и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы).

[0470] Комбинация может быть использована для получения гиспидина из тирозина в системах экспрессии in vitro и in vivo.

[0471] Комбинации 2-4 могут также включать кодирующую последовательность гена 4'-фосфопантотеинил трансферазы NpgA (SEQ ID NOs: 104, 105) или иного фермента, проявляющего ту же активность.

[0472] Комбинация 7

[0473] Состав: (а) Нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28, и (б) Нуклеиновая кислота, кодирующая PKS, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139.

[0474] Комбинация может быть использована для получения 3-гидроксигиспидина в системах экспрессии in vitro или in vivo из кофеил-КоА.

[0475] Комбинация 8

[01] Включает все компоненты, указанные в Комбинации 7, а также нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98. Комбинация может быть использована для получения биолюминесценции в системах экспрессии in vitro или in vivo в присутствии кофеил-КоА.

[0476] Комбинация 9

[0477] Включает все компоненты, указанные в Комбинации 8, также нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 65, 67, 69, 71, 73, 75.

[0478] Комбинация может быть использована для получения биолюминесцентных клеток и трансгенных организмов.

[0479] Комбинация 10

[0480] Состав: (а) Нуклеиновая кислота, кодирующая PKS, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139; и (б) нуклеиновая кислота, кодирующая 4-кумарат-КоА-лигазу 1 из Arabidopsis thaliana, аминокислотная последовательность которой показана в SEQ ID NO: 141.

[0481] Комбинация может быть использована для получения гиспидина из кофейной кислоты в системах экспрессии in vitro и in vivo.

[0482] Комбинация 11

[0483] Включает все компоненты, указанные в Комбинации 10, также нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза кофейной кислоты (например, нуклеиновые кислоты, кодирующие тирозин-аммоний-лиазу и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы).

[0484] Комбинация может быть использована для получения гиспидина из тирозина в системах экспрессии in vitro и in vivo.

[0485] Пример 25. Комбинации рекомбинантных белков

[0486] Комбинация 1

[0487] Состав: (а) гиспидин-гидроксилаза, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28; и (б) гиспидин-синтаза, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55.

[0488] Комбинация может быть использована для получения люциферина грибов из вещества, выбранного из 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил (например из кофейной кислоты).

[0489] Комбинация 2

[0490] Включает компоненты, указанные в комбинации 1, так же люциферазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98.

[0491] Комбинация может быть использована для детекции наличия в образце 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

[0492] , где где R – арил или гетероарил (например, из кофейной кислоты).

[0493] Комбинация 3

[0494] Состав: (а) гиспидин-гидроксилаза, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28; и (б) PKS, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139; и (в) 4-кумарат-КоА-лигаза 1 из Arabidopsis thaliana, аминокислотная последовательность которой показана в SEQ ID NO: 141. Комбинация может быть использована для получения люциферина грибов из кофейной кислоты.

Пример 25. Наборы

[0495] В приведенных ниже примерах нуклеиновые кислоты могут быть включены в кассеты экспрессии или векторы и оперативно сшиты с регуляторными элементами для их экспрессии в клетке-хозяине. Альтернативно, нуклеиновые кислоты могут содержать фланкирующие последовательности для ее встраивания в целевой вектор. Нуклеиновые кислоты могут быть включены в лишенные промотора векторы, предназначенные для удобного клонирования целевых регуляторных элементов.

[0496] Набор реагентов #1 включает очищенный препарат гиспидин-синтазы настоящего изобретения и может быть использован для получения гиспидина из кофейной кислоты. Также набор может быть использован для получения другого 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

из соответствующей 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой
, где R – арил или гетероарил.

[0497] Набор реагентов может также включать реакционный буфер. Например, 0.2 M натрий-фосфатный буфер (pH 8.0) с добавлением 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM), 1 мМ НАДФН, 10 мМ АТФ, 1 мМ КоА, 1 мМ Малонил-КоА или компоненты для приготовления реакционного буфера.

[0498] Набор реагентов может также включать деионизованную воду.

[0499] Набор реагентов может также включать инструкцию по применению набора.

[0500] Набор реагентов #2 включает очищенный препарат гиспидин-синтазы настоящего изобретения и очищенный препарат гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения и может быть использован для получения люциферина грибов из вещества, выбранного из 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил (например, из кофейной кислоты).

[0501] Набор реагентов может также включать реакционный буфер: 0.2 M натрий-фосфатный буфер (pH 8.0) с добавлением 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM), 1 мМ НАДФН, 10 мМ АТФ, 1 мМ КоА, 1 мМ Малонил-КоА или компоненты для приготовления реакционного буфера.

[0502] Набор реагентов может также включать деионизованную воду.

[0503] Набор реагентов может также включать инструкцию по применению набора.

[0504] Набор реагентов #3 включает очищенный препарат гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения и может быть использован для получения люциферина грибов из 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

, где R – арил или гетероарил. Например, набор может быть использован для получения 3-гидроксигиспидина из гиспидина.

[0505] Набор реагентов может также включать реакционный буфер. Например, 0.2 M натрий-фосфатный буфер (pH 8.0) с добавлением 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозида (DDM), 1 мМ НАДФН.

[0506] Набор реагентов может так же включать деионизованную воду.

[0507] Набор реагентов может также включать инструкцию по применению набора.

[0508] Наборы реагентов #4 и #5 отличатся от наборов #2 и #3 тем, что содержат очищенную люциферазу, субстратом которой является 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R – арил или гетероарил.

[0509] Наборы могут быть использованы для выявления 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

, где R – арил или гетероарил (например, из кофейной кислоты) и/или 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

, где R – арил или гетероарил, (например, гиспидина) в биологических пробах, например, в растительных экстрактах, экстрактах грибов и в микроорганизмах.

[0510] Наборы реагентов могут также включать реакционный буфер (как описано в описании наборов 2 и 3) для осуществления реакции или компоненты для приготовления реакционного буфера.

[0511] Набор реагентов может так же включать деионизованную воду.

[0512] Набор реагентов может также включать инструкцию по применению набора.

[0513] Набор реагентов может также включать кофейную кислоту. Например, водный раствор кофейной кислоты или осадок для разведения в воде.

[0514] Набор реагентов может также включать гиспидин.

[0515] Способы применения наборов

[0516] Для определения присутствия кофейной кислоты в исследуемом образце в кювету следует добавить 5 мкл смеси ферментов к 95 мкл размороженного на льду реакционного буфера, аккуратно перемешать, добавить 5 мкл анализируемого образца, снова аккуратно перемешать и поместить в люминометр. Интегрировать биолюминесцентный сигнал в течение двух минут в температурных условиях, не превышающих 30°C. В таких же условиях провести контрольные измерения с добавлением вместо аликвоты анализируемого образца 5 мкл раствора кофейной кислоты или 5 мкл воды. О наличии кофейной кислоты в образце в детектируемых количествах можно говорить, если свет, излучаемый анализируемым образцом, превышает фоновый сигнал, зарегистрированный от образца с водой.

[0517] Чувствительность: набор позволяет определить наличие в среде кофейной кислоты в концентрации, превышающей 1 нМ.

[0518] Условия хранения: все компоненты набора следует хранить при температуре, не превышающей -20°С.

[0519] Для определения присутствия гиспидина в исследуемом образце в кювету следует добавить 5 мкл смеси ферментов к 95 мкл размороженного на льду реакционного буфера, аккуратно перемешать, добавить 5 мкл анализируемого образца, снова аккуратно перемешать и поместить в люминометр. Интегрировать биолюминесцентный сигнал в течение двух минут в температурных условиях, не превышающих 30°C. В таких же условиях провести контрольные измерения с добавлением вместо аликвоты анализируемого образца 5 мкл раствора гиспидина или 5 мкл воды. О наличии гиспидина в образце в детектируемых количествах можно говорить, если свет, излучаемый анализируемым образцом, превышает фоновый сигнал, зарегистрированный от образца с водой.

[0520] Чувствительность: набор позволяет определить наличие в среде гиспидина в концентрации, превышающей 100 пМ.

[0521] Условия хранения: все компоненты набора следует хранить при температуре, не превышающей -20°С.

[0522] Набор реагентов #6 включает нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу настоящего изобретения. Например, гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28.

[0523] Набор реагентов может также содержать инструкцию по применению нуклеиновой кислоты.

[0524] Набор реагентов может также содержать деионизованную воду или буфер для растворения лиофилизированной нуклеиновой кислоты и/или разведения раствора нуклеиновой кислоты.

[0525] Набор реагентов может также содержать праймеры, комплементарные участкам указанной нуклеиновой кислоты, для амплификации нуклеиновой кислоты или ее фрагмента.

[0526] Набор реагентов может быть использован для получения рекомбинантной гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения или для экспрессии гиспидин-гидроксилазы в клетках и/или клеточных линиях и/или организмах. После экспрессии нуклеиновой кислоты в клетках, клеточных линиях и/или организмах эти клетки, клеточные линии и /или организмы приобретают способность катализировать реакцию превращения экзогенного или эндогенного 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу

,

в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R – арил или гетероарил. Например, они приобретают способность катализировать реакцию превращения гиспидина в 3-гидроксигиспидин.

[0527] Набор реагентов #7 включает нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу настоящего изобретения. Например, гиспидин-синтазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55.

[0528] Набор реагентов может также содержать инструкцию по применению нуклеиновой кислоты.

[0529] Набор реагентов может также содержать деионизованную воду или буфер для растворения лиофилизированной нуклеиновой кислоты и/или разведения раствора нуклеиновой кислоты.

[0530] Набор реагентов может также содержать праймеры, комплементарные участкам указанной нуклеиновой кислоты, для амплификации нуклеиновой кислоты или ее фрагмента.

[0531] Набор реагентов может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу, например, 4'-фосфопантотеинил трансферазу, имеющую аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO 105.

[0532] Набор реагентов может быть использован для получения рекомбинантной гиспидин-синтазы настоящего изобретения или для экспрессии гиспидин-гидроксилазы в клетках и/или клеточных линиях и/или организмах.

[0533] После экспрессии нуклеиновой кислоты в клетках, клеточных линиях и/или организмах эти клетки, клеточные линии и /или организмы приобретают способность катализировать реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

[0534] , где R – арил или гетероарил, в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, имеющих структурную формулу

.

[0535] Например, они приобретают способность катализировать реакцию превращения кофейной кислоты в гиспидин и/или коричной кислоты в (Е)-4-гидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он и/или паракумаровой кислоты в бисноръянгонин и/или (E)-3-(6-гидроксинафталин-2-ил)пропеновой кислоты в (Е)-4-гидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он и/или (Е)-3-(1Н-индол-3-ил)пропеновой кислоты в (Е)-6-(2-( 1Н-индол-3-ил)винил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он.

[0536] Набор реагентов может также содержать нуклеиновые кислоты, кодирующие тирозин-аммоний-лиазу и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы. В этом составе набор может быть использован для получения гиспидина из тирозина в системах экспрессии in vitro и in vivo.

[0537] Набор реагентов #8 включает нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу настоящего изобретения и нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу настоящего изобретения. Например, гиспидин-синтазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55 и гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28.

[0538] Набор реагентов может также содержать инструкцию по применению нуклеиновых кислот.

[0539] Набор реагентов может также содержать деионизованную воду или буфер для растворения лиофилизированной нуклеиновой кислоты и/или разведения раствора нуклеиновой кислоты.

[0540] Набор реагентов может также содержать праймеры, комплементарные участкам входящих в набор нуклеиновых кислот, для амплификации этих нуклеиновых кислот или их фрагментов.

[0541] Набор реагентов может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу, например, 4'-фосфопантотеинил трансферазу, имеющую аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO 105.

[0542] Набор реагентов может также содержать нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты из метаболитов клетки, например, кодирующие тирозин-аммоний-лиазу и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы.

[0543] Набор может быть использован для любого применения, описанного для наборов 6 и 7. Набор также может быть использован для экспрессии гиспидин-гидроксилазы и гиспидин-синтазы в клетках и/или клеточных линиях и/или организмах. После экспрессии нуклеиновой кислоты в клетках, клеточных линиях и/или организмах эти клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают способность производить 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу

, где R – арил или гетероарил, из соответствующей 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

.

[0544] Набор также может быть использован для экспрессии в клетках и/или клеточных линиях и/или организмах гиспидин-гидроксилазы, гиспидин- синтазы вместе с тирозин-аммоний-лиазой и компонентами HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы. После экспрессии нуклеиновой кислоты в клетках, клеточных линиях и/или организмах эти клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают способность производить гиспидин из тирозина и метаболитов клетки.

[0545] Набор реагентов #9 включает нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу настоящего изобретения. Например, гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять с выделением света по крайней мере один из люциферинов грибов. Например, может быть использована люцифераза, аминокислотная последовательность которой выбрана из в SEQ ID NOs: 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98.

[0546] Набор реагентов может также содержать инструкцию по применению нуклеиновых кислот.

[0547] Набор реагентов может также содержать деионизованную воду или буфер для растворения лиофилизированной нуклеиновой кислоты и/или разведения раствора нуклеиновой кислоты.

[0548] Набор реагентов может также содержать праймеры, комплементарные участкам входящих в набор нуклеиновых кислот, для амплификации этих нуклеиновых кислот или их фрагментов.

[0549] Набор может быть использован для мечения клеток и/или клеточных линий и/или организмов, где указанные клетки, клеточные линии и/или организмы эти клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают в результате экспрессии указанных нуклеиновых кислот способность к биолюминесценции в присутствии экзогенного или эндогенного предлюциферина грибов. Например, они приобретают способность к биолюминесценции в присутствии гиспидина.

[0550] Набор может быть также использован для исследования ко-активации промоторов целевых генов.

[0551] Набор может также включать нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу настоящего изобретения, например, гиспидин-синтазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NO: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55. В этом случае набор может быть использован для получения клеток, клеточных линий и трансгенных организмов, способных к биолюминесценции в присутствии экзогенной или эндогенной 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой

[0552] где R – арил или гетероарил. Например, в присутствии 3-арилакриловой кислоты, выбранной из группы: кофейная кислота, или коричная кислота, или пара-кумаровая кислота, или кумаровая кислота, или умбеллиновая кислота, или синаповая кислота, или феруловая кислота. В частности, набор может быть использован для получения автономно биолюминесцирующих трансгенных организмов, например, растений или грибов.

[0553] Набор может также включать нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу, например, 4'-фосфопантотеинил трансферазу, имеющую аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO 105 или ей подобную.

[0554] Набор может так же содержать нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты из метаболитов клетки.

[0555] Набор может так же содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу настоящего изобретения, например, кофеилпируват-гидролазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NO: 65, 67, 69, 71, 73, 75.

[0556] Набор может быть также использован для любого применения, описанного для наборов #6-#8.

[0557] Набор может быть также использован для создания клеточных линий, позволяющих определить наличие кофейной кислоты в исследуемом образце.

[0558] Набор реагентов #10 включает клетки Agrobacterium tumefaciens штамма AGL0, несущие плазмиду, содержащую кодирующие последовательности гиспидин-синтазы, гиспидин-гидроксилазы, люциферазы, фосфопантотеинил-трансферазы NpgA и гена устойчивости к антибиотику (например, к канамицину) под контролем подходящего промотора, например, промотора 35S вируса мозаики цветной капусты.

[0559] Набор реагентов может так же включать праймеры для определения корректности интеграции кассеты экспрессии в клетки двудольных цветковых растений.

[0560] Набор реагентов может быть использован для получения автономно биолюминесцентных двудольных растений.

[0561] Набор реагентов может так же включать инструкцию по применению набора.

[0562] Способ применения: Произвести трансформацию двудольного растения клетками агробактерий из набора по протоколу, оптимально подходящему для данного вида растения. Селекцию растений проводить на среде с антибиотиком (например, канамицином). Корректность полноразмерной интеграции кассеты экспрессии произвести с помощью ПЦР с праймерами из набора.

[0563] Условия хранения: компетентные клетки агробактерий следует хранить при температуре, не превышающей -70°С, допускается хранение раствора кофейной кислоты при температурах, не превышающих -20°С.

[0564] Набор реагентов #11

[0565] Набор включает очищенный препарат PKS и очищенный препарат гиспидин-гидроксилазы настоящего изобретения и может быть использован для получения люциферина грибов из кофеил-КоА. Набор реагентов может так же включать реакционный буфер: 0.2 M натрий-фосфатный буфер (pH 8.0) с добавлением 0.5 M Na2SO4, 0.1% додецилмальтозид (DDM), 1 мМ НАДФН, 10 мМ АТФ, 1 мМ Малонил-КоА или компоненты для приготовления реакционного буфера. Набор реагентов может так же включать деионизованную воду. Набор реагентов может так же включать инструкцию по применению набора.

[0566] Набор реагентов #12

[0567] Набор включает нуклеиновую кислоту, кодирующую PKS и нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу настоящего изобретения. Например, PKS, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139 и гиспидин-гидроксилазу, аминокислотная последовательность которой выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28.

[0568] Набор реагентов может также содержать инструкцию по применению нуклеиновых кислот. Набор реагентов может также содержать деионизованную воду или буфер для растворения лиофилизированной нуклеиновой кислоты и/или разведения раствора нуклеиновой кислоты. Набор реагентов может также содержать праймеры, комплементарные участкам входящих в набор нуклеиновых кислот, для амплификации этих нуклеиновых кислот или их фрагментов.

[0569] Набор реагентов может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую кумарат-КоА-лигазу, например, кумарат-КоА-лигазы, имеющую аминокислотную последовательность, показанную в SEQ ID NO 141.

[0570] Набор реагентов может также содержать нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза кофейной кислоты из метаболитов клетки, например, кодирующие тирозин-аммоний-лиазу и компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы. Набор реагентов может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу настоящего изобретения.

[0571] Набор реагентов может быть использован для экспрессии гиспидин-гидроксилазы и PKS в клетках и/или клеточных линиях и/или организмах. После экспрессии нуклеиновой кислоты в клетках, клеточных линиях и/или организмах эти клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают способность производить 3-гидроксигиспидин из кофейной кислоты. Набор также может быть использован для экспрессии в клетках и/или клеточных линиях и/или организмах гиспидин-гидроксилазы, PKS вместе с кумарат-КоА-лигазой, кофеил-пируватгидролазой и/или комбинацией тирозин-аммоний-лиазы и компонентов HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы. После экспрессии нуклеиновых кислот в клетках, клеточных линиях и/или организмах эти клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают способность производить 3-гидроксигиспидин из тирозина и метаболитов клетки.

[0572] Набор может также содержать нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять 3-гидроксигиспидин с выделением света. В этом случае набор может быть использован для мечения клеток и/или клеточных линий и/или организмов, где указанные клетки, клеточные линии и/или организмы эти клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают в результате экспрессии указанных нуклеиновых кислот способность к биолюминесценции в присутствии экзогенного или эндогенного гиспидина и/или кофеил-КоА и/или кофейной кислоты. Например, клетки, клеточные линии и/или организмы приобретают способность к автономной биолюминесценции.

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> Общество с ограниченной ответственностью «Планта»

<120> Ферменты биосинтеза люциферина и их применение

<130> 46243

<160> 141

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 1266

<212> DNA

<213> Neonothopanus nambi

<400> 1

atggcatcgt ttgagaattc tctaagcgtt ttgattgtcg gggccggact tggtgggctt 60

gctgctgcca tcgcgctgcg tcgccaaggg catgtcgtga aaatatacga ctcctctagc 120

ttcaaagccg aacttggtgc gggactcgct gtgccgccta acaccttgcg cagtctacag 180

caacttggtt gcaataccga gaacctcaat ggtgtggata atctttgctt cactgcgatg 240

gggtatgacg ggagtgtagg gatgatgaac aacatgactg actatcgaga ggcatacggt 300

acttcttgga tcatggtcca ccgcgttgac ttgcataacg agctgatgcg cgtagcactt 360

gatccaggtg ggctcggacc tcctgcgaca ctccatctta atcatcgtgt cacattctgc 420

gatgtcgacg cttgcaccgt gacattcacc aacgggacca ctcaatcagc tgatctcatc 480

gttggtgcag acggtatacg ctctaccatt cggcggtttg tcttagaaga agacgtgact 540

gtgcctgcgt caggaatcgt cgggtttcga tggcttgtac aagctgacgc gctggaccca 600

tatcctgaac tcgactggat tgttaaaaag cctcctctag gcgcgcgact gatctccact 660

cctcagaatc cacagtctgg tgttggcttg gctgacaggc gcactatcat catctacgca 720

tgtcgtggcg gcaccatggt caatgtcctt gcagtgcatg atgacgaacg tgaccagaac 780

accgcagatt ggagtgtacc ggcttccaaa gacgatctat ttcgtgtttt ccacgattac 840

catccacgct ttcggcggct tttagagctt gcgcaggata ttaatctctg gcaaatgcgt 900

gttgtacctg ttttgaaaaa atgggttaac aagcgggttt gcttgttagg agatgctgcg 960

cacgcttctt taccgacgtt gggtcaaggt tttggtatgg gtctggaaga tgccgtagca 1020

cttggtacac tccttccaaa gggtaccact gcatctcaga tcgagactcg acttgcggtg 1080

tacgaacagc tacgtaagga tcgtgcggaa tttgttgcgg ctgaatcata tgaagagcaa 1140

tatgttcctg aaatgcgggg actttatctg aggtcaaagg aactgcgtga tagagtcatg 1200

ggttatgata tcaaagtgga gagcgagaag gttctcgaga cgctcctaag aagttctaat 1260

tctgcc 1266

<210> 2

<211> 422

<212> PRT

<213> Neonothopanus nambi

<400> 2

Met Ala Ser Phe Glu Asn Ser Leu Ser Val Leu Ile Val Gly Ala Gly

1 5 10 15

Leu Gly Gly Leu Ala Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly His Val

20 25 30

Val Lys Ile Tyr Asp Ser Ser Ser Phe Lys Ala Glu Leu Gly Ala Gly

35 40 45

Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Leu Arg Ser Leu Gln Gln Leu Gly Cys

50 55 60

Asn Thr Glu Asn Leu Asn Gly Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr Ala Met

65 70 75 80

Gly Tyr Asp Gly Ser Val Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp Tyr Arg

85 90 95

Glu Ala Tyr Gly Thr Ser Trp Ile Met Val His Arg Val Asp Leu His

100 105 110

Asn Glu Leu Met Arg Val Ala Leu Asp Pro Gly Gly Leu Gly Pro Pro

115 120 125

Ala Thr Leu His Leu Asn His Arg Val Thr Phe Cys Asp Val Asp Ala

130 135 140

Cys Thr Val Thr Phe Thr Asn Gly Thr Thr Gln Ser Ala Asp Leu Ile

145 150 155 160

Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Arg Phe Val Leu Glu

165 170 175

Glu Asp Val Thr Val Pro Ala Ser Gly Ile Val Gly Phe Arg Trp Leu

180 185 190

Val Gln Ala Asp Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp Ile Val

195 200 205

Lys Lys Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Ser Thr Pro Gln Asn Pro

210 215 220

Gln Ser Gly Val Gly Leu Ala Asp Arg Arg Thr Ile Ile Ile Tyr Ala

225 230 235 240

Cys Arg Gly Gly Thr Met Val Asn Val Leu Ala Val His Asp Asp Glu

245 250 255

Arg Asp Gln Asn Thr Ala Asp Trp Ser Val Pro Ala Ser Lys Asp Asp

260 265 270

Leu Phe Arg Val Phe His Asp Tyr His Pro Arg Phe Arg Arg Leu Leu

275 280 285

Glu Leu Ala Gln Asp Ile Asn Leu Trp Gln Met Arg Val Val Pro Val

290 295 300

Leu Lys Lys Trp Val Asn Lys Arg Val Cys Leu Leu Gly Asp Ala Ala

305 310 315 320

His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly Leu Glu

325 330 335

Asp Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Lys Gly Thr Thr Ala Ser

340 345 350

Gln Ile Glu Thr Arg Leu Ala Val Tyr Glu Gln Leu Arg Lys Asp Arg

355 360 365

Ala Glu Phe Val Ala Ala Glu Ser Tyr Glu Glu Gln Tyr Val Pro Glu

370 375 380

Met Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Lys Glu Leu Arg Asp Arg Val Met

385 390 395 400

Gly Tyr Asp Ile Lys Val Glu Ser Glu Lys Val Leu Glu Thr Leu Leu

405 410 415

Arg Ser Ser Asn Ser Ala

420

<210> 3

<211> 1620

<212> DNA

<213> Omphalotus olearius

<400> 3

atgacgccct ccgagagtcc tttgaatatc tcgattgttg gtgctgggct cggggggctt 60

gctgcagcta ttgcgctgcg tcgtcaaggt catatcatca gaatcttcga ctcgtcaagt 120

tttaaaacgg aactgggtgc tggacttgct gttccaccca atacattacg cagtcttcag 180

gaacttggct gtgatattca gaacttcaat gccgtggaca atctttgttt caccgcgatg 240

ggctacgacg ggagtgtagg gatgatgaac aatatgactg actatcgtga ggcgtatggt 300

gttccctggg tcatggtcca ccgcgttgac ctacataatg aactgcgacg tgtggcactc 360

gatccagatg gccttggacc tcctgcagca ttgcacctca atcatcgtgt gacatcctgc 420

gatgtcgatt cctgcaccgt cacattcgct aacggaaccg ctcatacagc ggatctcatc 480

gttggcgcgg atggtatacg ctcttccatc cgacccttcg tgttgggaga agacgtaatc 540

gtacctgcaa caggaatcgc aggatttcga tggctcatac aagccgaccg gctagatgcg 600

tatcctgaac tcgactggat tgtcaagaac cctcctctcg gcgcgcgatt gatttctgct 660

ccggctcgga aggaacgttc tgtaatcagc gaagcccggc ctgatcgacg tacgattata 720

ttatatgcgt gtcgtggtgg tactattgtc aatgtccttg cggtgcacga cgacgaacgt 780

gatcaggaca ccgtagaatg gagcgtgcca gctaccaaag acgacctatt tcgcgttttc 840

aacgattatc acccaagatt tcggcgactt ctggacctgg cggaggatgt taatctctgg 900

cagatgcgtg ttgtgcctgt tttgagacga tgggttaata aacgggtttg cttgctggga 960

gatgcagcac atgcttcttt accgacattg ggtcaaggtt ttggtatggg tctcgaggat 1020

gcggtggcac ttggtacgct tcttccgagc gggactactg tgtcacagat tgaaatccga 1080

ctttgggtgt atgaaaaact gcgcaaggag cgtgctgaat ttgtttcggc tgaatcgtat 1140

gaagaacact gctctgtgga ttgctataaa tctcataaag cccagtcgac atccaataca 1200

gtgacagaag cagacgacat cttggaagaa ccaaagcctc tgaagccttt atcgtctctg 1260

aaatggccgt acgttcccga agaaccttcg tatcctgatc ccctccaaag aaacgacccc 1320

aaacccctac aactcagaca ctacgaagca atagctacat ctcctgcagt acgggaggtc 1380

ctatcgagtc atccgaatct ccctgcttta ttgacgtcta tcgacaaact gagaggtttt 1440

gatcgcgaac gagctttaga aaaggcgttg gaggttactg cgcctgcgct tgttgatgat 1500

tcaagggctg tagcgctgga ggacgatgta ctcgcaatga gagcattggt agaagcgatt 1560

gaaggtgctg ttaggggcaa taaagaagac gcattaggtc tggattggac tggtagtact 1620

<210> 4

<211> 540

<212> PRT

<213> Omphalotus olearius

<400> 4

Met Thr Pro Ser Glu Ser Pro Leu Asn Ile Ser Ile Val Gly Ala Gly

1 5 10 15

Leu Gly Gly Leu Ala Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly His Ile

20 25 30

Ile Arg Ile Phe Asp Ser Ser Ser Phe Lys Thr Glu Leu Gly Ala Gly

35 40 45

Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Leu Arg Ser Leu Gln Glu Leu Gly Cys

50 55 60

Asp Ile Gln Asn Phe Asn Ala Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr Ala Met

65 70 75 80

Gly Tyr Asp Gly Ser Val Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp Tyr Arg

85 90 95

Glu Ala Tyr Gly Val Pro Trp Val Met Val His Arg Val Asp Leu His

100 105 110

Asn Glu Leu Arg Arg Val Ala Leu Asp Pro Asp Gly Leu Gly Pro Pro

115 120 125

Ala Ala Leu His Leu Asn His Arg Val Thr Ser Cys Asp Val Asp Ser

130 135 140

Cys Thr Val Thr Phe Ala Asn Gly Thr Ala His Thr Ala Asp Leu Ile

145 150 155 160

Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Ser Ile Arg Pro Phe Val Leu Gly

165 170 175

Glu Asp Val Ile Val Pro Ala Thr Gly Ile Ala Gly Phe Arg Trp Leu

180 185 190

Ile Gln Ala Asp Arg Leu Asp Ala Tyr Pro Glu Leu Asp Trp Ile Val

195 200 205

Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Ser Ala Pro Ala Arg Lys

210 215 220

Glu Arg Ser Val Ile Ser Glu Ala Arg Pro Asp Arg Arg Thr Ile Ile

225 230 235 240

Leu Tyr Ala Cys Arg Gly Gly Thr Ile Val Asn Val Leu Ala Val His

245 250 255

Asp Asp Glu Arg Asp Gln Asp Thr Val Glu Trp Ser Val Pro Ala Thr

260 265 270

Lys Asp Asp Leu Phe Arg Val Phe Asn Asp Tyr His Pro Arg Phe Arg

275 280 285

Arg Leu Leu Asp Leu Ala Glu Asp Val Asn Leu Trp Gln Met Arg Val

290 295 300

Val Pro Val Leu Arg Arg Trp Val Asn Lys Arg Val Cys Leu Leu Gly

305 310 315 320

Asp Ala Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met

325 330 335

Gly Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Ser Gly Thr

340 345 350

Thr Val Ser Gln Ile Glu Ile Arg Leu Trp Val Tyr Glu Lys Leu Arg

355 360 365

Lys Glu Arg Ala Glu Phe Val Ser Ala Glu Ser Tyr Glu Glu His Cys

370 375 380

Ser Val Asp Cys Tyr Lys Ser His Lys Ala Gln Ser Thr Ser Asn Thr

385 390 395 400

Val Thr Glu Ala Asp Asp Ile Leu Glu Glu Pro Lys Pro Leu Lys Pro

405 410 415

Leu Ser Ser Leu Lys Trp Pro Tyr Val Pro Glu Glu Pro Ser Tyr Pro

420 425 430

Asp Pro Leu Gln Arg Asn Asp Pro Lys Pro Leu Gln Leu Arg His Tyr

435 440 445

Glu Ala Ile Ala Thr Ser Pro Ala Val Arg Glu Val Leu Ser Ser His

450 455 460

Pro Asn Leu Pro Ala Leu Leu Thr Ser Ile Asp Lys Leu Arg Gly Phe

465 470 475 480

Asp Arg Glu Arg Ala Leu Glu Lys Ala Leu Glu Val Thr Ala Pro Ala

485 490 495

Leu Val Asp Asp Ser Arg Ala Val Ala Leu Glu Asp Asp Val Leu Ala

500 505 510

Met Arg Ala Leu Val Glu Ala Ile Glu Gly Ala Val Arg Gly Asn Lys

515 520 525

Glu Asp Ala Leu Gly Leu Asp Trp Thr Gly Ser Thr

530 535 540

<210> 5

<211> 1329

<212> DNA

<213> Guyanagaster necrorhiza

<400> 5

atgcaacaaa tcgacgaagt gtgcccattg aaagtgatcg ttgtaggtgc tggacttggg 60

ggcctttctg ctgccattgc ccttcgtagg caaggccatt gtgtccatat actggaatcg 120

tcaagtttca agagcgaact tggcgcaggt ctcgcagtac cgcccaatac tgtacgctca 180

cttcgaggcc taggctgtaa catcgacaat ctcaagcctg tggataatct ttgtttcact 240

gccatggcgc atgacggaag tcctggtatg atgaataaca tgacggacta tggccaggcg 300

tatggagatc cttgggtaat ggcgcatcgt gttgaccttc acaatgagct catgcgagtg 360

gcccttgaac ccgaaaaaac gggacctcct gcccagcttc gtctggacag ccaggtggca 420

tcttgcaatg tagatgcctg taccgtttct cttgtcgacg gaacaattta ttccgctgat 480

cttatcgttg gtgcagacgg aattaggtct accatacgct cctatgtttt ggacgcagaa 540

atagacatac ctcctaccgg tatcgctgga taccgttggc tcacacctgc agaagctttg 600

gagccatatc ccgaactcga ctggatcatc aagaacccac ccctaggagc acgtttaatc 660

acagctcctg tacgccgaaa cgacagcatt gagcagtcgg gtcctgctcc tatttctgag 720

aaggctgaca agcgtacgat catcatctac gcgtgccgga atggtactat gcttaacgtt 780

ctcggtgtac acgatgaccc tcgcaaccag aacgaagttg gatggaacgt gccagttacc 840

caagaaagtt tgctggattt ttttaaagac tatcatcccc gattcaagcg tctgcttgag 900

ctggctgaca atgttcatct gtggcaaatg cgcgtcgtcc cgcggcttga gacttggatc 960

aataaacgcg tgtgtttgtt gggcgattct gcgcatgcat cattaccaac actcggtcaa 1020

ggcttcggga tgggacttga ggatgccgta gcccttgcaa ccctccttcc gatgggaacc 1080

aaagtgtctg acatcgagaa ccgcctcgtc gcctacgaaa gcttgcgtaa ggggcgcgct 1140

gagtatgtgg ccatggaatc gttcgaacaa cagaatatcc cggaaaagcg aggcttgtat 1200

ctcaggtctt ctatgatgcg tgacgaaatc atgggttatg atgtcaaagc cgaggctgag 1260

aaggttttta aagaattaat gacctcgact gataaggtta cataccgtcc ccatgtggac 1320

tgtctatgg 1329

<210> 6

<211> 443

<212> PRT

<213> Guyanagaster necrorhiza

<400> 6

Met Gln Gln Ile Asp Glu Val Cys Pro Leu Lys Val Ile Val Val Gly

1 5 10 15

Ala Gly Leu Gly Gly Leu Ser Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly

20 25 30

His Cys Val His Ile Leu Glu Ser Ser Ser Phe Lys Ser Glu Leu Gly

35 40 45

Ala Gly Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Val Arg Ser Leu Arg Gly Leu

50 55 60

Gly Cys Asn Ile Asp Asn Leu Lys Pro Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr

65 70 75 80

Ala Met Ala His Asp Gly Ser Pro Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp

85 90 95

Tyr Gly Gln Ala Tyr Gly Asp Pro Trp Val Met Ala His Arg Val Asp

100 105 110

Leu His Asn Glu Leu Met Arg Val Ala Leu Glu Pro Glu Lys Thr Gly

115 120 125

Pro Pro Ala Gln Leu Arg Leu Asp Ser Gln Val Ala Ser Cys Asn Val

130 135 140

Asp Ala Cys Thr Val Ser Leu Val Asp Gly Thr Ile Tyr Ser Ala Asp

145 150 155 160

Leu Ile Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Ser Tyr Val

165 170 175

Leu Asp Ala Glu Ile Asp Ile Pro Pro Thr Gly Ile Ala Gly Tyr Arg

180 185 190

Trp Leu Thr Pro Ala Glu Ala Leu Glu Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp

195 200 205

Ile Ile Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Thr Ala Pro Val

210 215 220

Arg Arg Asn Asp Ser Ile Glu Gln Ser Gly Pro Ala Pro Ile Ser Glu

225 230 235 240

Lys Ala Asp Lys Arg Thr Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg Asn Gly Thr

245 250 255

Met Leu Asn Val Leu Gly Val His Asp Asp Pro Arg Asn Gln Asn Glu

260 265 270

Val Gly Trp Asn Val Pro Val Thr Gln Glu Ser Leu Leu Asp Phe Phe

275 280 285

Lys Asp Tyr His Pro Arg Phe Lys Arg Leu Leu Glu Leu Ala Asp Asn

290 295 300

Val His Leu Trp Gln Met Arg Val Val Pro Arg Leu Glu Thr Trp Ile

305 310 315 320

Asn Lys Arg Val Cys Leu Leu Gly Asp Ser Ala His Ala Ser Leu Pro

325 330 335

Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu

340 345 350

Ala Thr Leu Leu Pro Met Gly Thr Lys Val Ser Asp Ile Glu Asn Arg

355 360 365

Leu Val Ala Tyr Glu Ser Leu Arg Lys Gly Arg Ala Glu Tyr Val Ala

370 375 380

Met Glu Ser Phe Glu Gln Gln Asn Ile Pro Glu Lys Arg Gly Leu Tyr

385 390 395 400

Leu Arg Ser Ser Met Met Arg Asp Glu Ile Met Gly Tyr Asp Val Lys

405 410 415

Ala Glu Ala Glu Lys Val Phe Lys Glu Leu Met Thr Ser Thr Asp Lys

420 425 430

Val Thr Tyr Arg Pro His Val Asp Cys Leu Trp

435 440

<210> 7

<211> 1284

<212> DNA

<213> Panellus stipticus

<400> 7

atgtcacaag gcactgaaga ctcgccctca ctcttcgcaa tagttgtcgg tgctggtctg 60

gtcggctttg ccgctgccgt cgcgctgcgc cgtcaaggtc accgtgtcac gatctacgaa 120

tcttcaagct ttaagacaga acttggggcg ggcctcgcga tcccttcaaa cacattgcga 180

tgcttggttg gccttggatg tactgtcgcc aacatggatc ccgtcaataa tctttgtttt 240

acatcgatgg catacgatgg taccgcgggg atgaaaagcg acagctccga ctacgaggcg 300

cagtatggca ctccctggat catggcccac cgcgtcgatc tgcacaagga gcttcgtcgc 360

ctggcagtgg atcccgaggg caccggtccc cccgcagaac tgcaccttag ccaccgggtt 420

gtctcctgcg acgtcgaatc cggctccgtc acgctcctgg acggctccgt tcagtcagca 480

gacttgataa ttggggctga tggaattcgt tcaaccgttc gcaaatttgt cgtaggcgaa 540

gaaatagcaa tccccccatc tcgtacggcg ggcttccgct ggctcacaca agcaagcgct 600

cttgacccct accccgaact ggattggatc gtgaaaacgc cgccgttggg tgctcgggta 660

atctccgctc cgattcaacc tccagaagtc acccacatcg accaccgtac gatcgtcatc 720

tatgcctgtc gcggaggtcg tctcgtaaat gttctaggaa tacatgagga tctgcgcgac 780

caggattctg tcgactggaa cgtccccata acgcgagaag cgctgctcca ctttttcgga 840

gactaccacc cacggttcaa gcggctcttg gagctcgcgg aggacgtaca cgtctggcag 900

atgcgcgtgg tccccccact gccgacatgg gtgaacggcc gcgtatgcat catgggcgac 960

gcagcgcatg catcgcttcc cacactggga caagggtttg gcatgggcct cgaagacgcg 1020

gtcgcgctcg ggacgctgct ttctagttcg acgccgtcaa gcgacattcc aagccgtctc 1080

gtcgcgtacg agaagcttcg caaagcgcgc gctgagtatg tttccaaaga gtcgtacgaa 1140

cagcagcatg tccgagaaaa gagagggctg tatctccggt cccgagaaat gcgggatgtg 1200

atcatgggat acgacgtgaa gaaggaggca gaacggatct tgagcgagat cagcattgca 1260

caagaacagt gtgctgttca tgat 1284

<210> 8

<211> 428

<212> PRT

<213> Panellus stipticus

<400> 8

Met Ser Gln Gly Thr Glu Asp Ser Pro Ser Leu Phe Ala Ile Val Val

1 5 10 15

Gly Ala Gly Leu Val Gly Phe Ala Ala Ala Val Ala Leu Arg Arg Gln

20 25 30

Gly His Arg Val Thr Ile Tyr Glu Ser Ser Ser Phe Lys Thr Glu Leu

35 40 45

Gly Ala Gly Leu Ala Ile Pro Ser Asn Thr Leu Arg Cys Leu Val Gly

50 55 60

Leu Gly Cys Thr Val Ala Asn Met Asp Pro Val Asn Asn Leu Cys Phe

65 70 75 80

Thr Ser Met Ala Tyr Asp Gly Thr Ala Gly Met Lys Ser Asp Ser Ser

85 90 95

Asp Tyr Glu Ala Gln Tyr Gly Thr Pro Trp Ile Met Ala His Arg Val

100 105 110

Asp Leu His Lys Glu Leu Arg Arg Leu Ala Val Asp Pro Glu Gly Thr

115 120 125

Gly Pro Pro Ala Glu Leu His Leu Ser His Arg Val Val Ser Cys Asp

130 135 140

Val Glu Ser Gly Ser Val Thr Leu Leu Asp Gly Ser Val Gln Ser Ala

145 150 155 160

Asp Leu Ile Ile Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Val Arg Lys Phe

165 170 175

Val Val Gly Glu Glu Ile Ala Ile Pro Pro Ser Arg Thr Ala Gly Phe

180 185 190

Arg Trp Leu Thr Gln Ala Ser Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp

195 200 205

Trp Ile Val Lys Thr Pro Pro Leu Gly Ala Arg Val Ile Ser Ala Pro

210 215 220

Ile Gln Pro Pro Glu Val Thr His Ile Asp His Arg Thr Ile Val Ile

225 230 235 240

Tyr Ala Cys Arg Gly Gly Arg Leu Val Asn Val Leu Gly Ile His Glu

245 250 255

Asp Leu Arg Asp Gln Asp Ser Val Asp Trp Asn Val Pro Ile Thr Arg

260 265 270

Glu Ala Leu Leu His Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg Phe Lys Arg

275 280 285

Leu Leu Glu Leu Ala Glu Asp Val His Val Trp Gln Met Arg Val Val

290 295 300

Pro Pro Leu Pro Thr Trp Val Asn Gly Arg Val Cys Ile Met Gly Asp

305 310 315 320

Ala Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly

325 330 335

Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Ser Ser Ser Thr Pro

340 345 350

Ser Ser Asp Ile Pro Ser Arg Leu Val Ala Tyr Glu Lys Leu Arg Lys

355 360 365

Ala Arg Ala Glu Tyr Val Ser Lys Glu Ser Tyr Glu Gln Gln His Val

370 375 380

Arg Glu Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Arg Glu Met Arg Asp Val

385 390 395 400

Ile Met Gly Tyr Asp Val Lys Lys Glu Ala Glu Arg Ile Leu Ser Glu

405 410 415

Ile Ser Ile Ala Gln Glu Gln Cys Ala Val His Asp

420 425

<210> 9

<211> 1284

<212> DNA

<213> Panellus stipticus

<400> 9

atgtcacaag gcactgaaga ctcgccctca ctcttcgcaa tagttgtcgg tgctggtctg 60

gtcggctttg ccgctgccgt cgcgctgcgc cgtcaaggtc accgtgtcac gatctacgaa 120

tcttcaagct ttaagacaga acttggggcg ggcctcgcga tcccttcaaa cacattgcga 180

tgcttggttg gccttggatg tactgtcgcc aacatggatc ccgtcaataa tctttgtttt 240

acatcgatgg catacgatgg taccgcgggg atgaaaagcg acagctccga ctacgaggcg 300

cagtatggca ctccctggat catggcccac cgcgtcgatc tgcacaagga gcttcgtcgc 360

ctggcagtgg atcccgaggg caccggtccc cccgcagaac tgcaccttag ccaccgggtt 420

gtctcctgcg acgtcgaatc cggctccgtc acgctcctgg acggctccgt tcagtcagca 480

gacttgataa ttggggctga tggaattcgt tcaaccgttc gcaaatttgt cgtaggcgaa 540

gaaatagcaa tccccccatc tcgtacggcg ggcttccgct ggctcacaca agcaagcgct 600

cttgacccct accccgaact ggattggatc gtgaaaacgc cgccgttggg tgctcgggta 660

atctccgctc cgattcaacc tccagaagtc acccacatcg accaccgtac gatcgtcatc 720

tatgcctgtc gcggaggtcg tctcgtaaat gttctaggaa tacatgagga tctgcgcgac 780

caggattctg tcgactggaa cgtccccata acgcgagaag cgctgctcca ctttttcgga 840

gactaccacc cacggttcaa gcggctcttg gagctcgcgg aggacgtaca cgtctggcag 900

atgcgcgtgg tccccccact gccgacatgg gtgaacggcc gcgtatgcat catgggcgac 960

gcagcgcatg catcgcttcc cacactggga caagggtttg gcatgggcct cgaagacgcg 1020

gtcgcgctcg ggacgctgct tcctagttcg acgccgtcaa gcgacattcc aagccgtctc 1080

gtcgcgtacg agaagcttcg caaagcgcgc gctgagtatg tttccaaaga gtcgtacgaa 1140

cagcagcatg tccgagaaaa gagagggctg tatctccggt cccgagaaat gcgggatgtg 1200

atcatgggat acgacgtgaa gaaggaggca gaacggatct tgagcgagat cagcattgca 1260

caagaacagt gtgctgttca tgat 1284

<210> 10

<211> 428

<212> PRT

<213> Panellus stipticus

<400> 10

Met Ser Gln Gly Thr Glu Asp Ser Pro Ser Leu Phe Ala Ile Val Val

1 5 10 15

Gly Ala Gly Leu Val Gly Phe Ala Ala Ala Val Ala Leu Arg Arg Gln

20 25 30

Gly His Arg Val Thr Ile Tyr Glu Ser Ser Ser Phe Lys Thr Glu Leu

35 40 45

Gly Ala Gly Leu Ala Ile Pro Ser Asn Thr Leu Arg Cys Leu Val Gly

50 55 60

Leu Gly Cys Thr Val Ala Asn Met Asp Pro Val Asn Asn Leu Cys Phe

65 70 75 80

Thr Ser Met Ala Tyr Asp Gly Thr Ala Gly Met Lys Ser Asp Ser Ser

85 90 95

Asp Tyr Glu Ala Gln Tyr Gly Thr Pro Trp Ile Met Ala His Arg Val

100 105 110

Asp Leu His Lys Glu Leu Arg Arg Leu Ala Val Asp Pro Glu Gly Thr

115 120 125

Gly Pro Pro Ala Glu Leu His Leu Ser His Arg Val Val Ser Cys Asp

130 135 140

Val Glu Ser Gly Ser Val Thr Leu Leu Asp Gly Ser Val Gln Ser Ala

145 150 155 160

Asp Leu Ile Ile Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Val Arg Lys Phe

165 170 175

Val Val Gly Glu Glu Ile Ala Ile Pro Pro Ser Arg Thr Ala Gly Phe

180 185 190

Arg Trp Leu Thr Gln Ala Ser Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp

195 200 205

Trp Ile Val Lys Thr Pro Pro Leu Gly Ala Arg Val Ile Ser Ala Pro

210 215 220

Ile Gln Pro Pro Glu Val Thr His Ile Asp His Arg Thr Ile Val Ile

225 230 235 240

Tyr Ala Cys Arg Gly Gly Arg Leu Val Asn Val Leu Gly Ile His Glu

245 250 255

Asp Leu Arg Asp Gln Asp Ser Val Asp Trp Asn Val Pro Ile Thr Arg

260 265 270

Glu Ala Leu Leu His Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg Phe Lys Arg

275 280 285

Leu Leu Glu Leu Ala Glu Asp Val His Val Trp Gln Met Arg Val Val

290 295 300

Pro Pro Leu Pro Thr Trp Val Asn Gly Arg Val Cys Ile Met Gly Asp

305 310 315 320

Ala Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly

325 330 335

Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Ser Ser Thr Pro

340 345 350

Ser Ser Asp Ile Pro Ser Arg Leu Val Ala Tyr Glu Lys Leu Arg Lys

355 360 365

Ala Arg Ala Glu Tyr Val Ser Lys Glu Ser Tyr Glu Gln Gln His Val

370 375 380

Arg Glu Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Arg Glu Met Arg Asp Val

385 390 395 400

Ile Met Gly Tyr Asp Val Lys Lys Glu Ala Glu Arg Ile Leu Ser Glu

405 410 415

Ile Ser Ile Ala Gln Glu Gln Cys Ala Val His Asp

420 425

<210> 11

<211> 1284

<212> DNA

<213> Panellus stipticus

<400> 11

atgtcacaag gcactgaaga ctcgccctca ctcttcgcaa tagttgtcgg tgctggtctg 60

gtcggctttg ccgctgccgt cgcgctgcgc cgtcaaggtc accgtgtcac tatctacgaa 120

tcttcaagct ttaagacaga acttggggcg ggcctcgcga tcccttcaaa cacattgcga 180

tgcttggttg gccttggatg tactgtcgcc aatctggatc ccgtcaataa tctttgtttt 240

acatcgatgg cttacgatgg taccgcgggg atgaaaagcg acagctccga ctacgaggcg 300

cagtatggca ctccctggat catggcccac cgcgtcgatc tgcacaagga gcttcgtcgc 360

ctggcagtgg atcccgaggg caccggtccc cccgcagaac tgcaccttag ccaccgggtt 420

gtctcctgcg acgtcgaatc cggctccgtc acgctcctgg acggctccat tcagtcagca 480

gacttgataa ttggggctga tggaattcgt tcaaccgttc gcaaatttgt cgtaggcgaa 540

gaaatagcaa tccccccatc tcgtacggcg ggcttccgtt ggctcacaca agcaagcgct 600

cttgacccct accccgaact ggattggatc gtgaaaacgc cgccgttggg tgctcgggta 660

atctccgctc cgattcaacc tccagaagtc acccacatcg accaccgtac gatcgtcatc 720

tatgcctgtc gcggaggtcg tctcgtaaat gttctaggaa tacatgagga tctgcgcgac 780

caggattctg tcgactggaa cgtccccata acgcgagaag cgctgctcca ctttttcgga 840

gactaccacc cacggttcaa gcggctcttg gagctcgcgg aggacgtaca cgtctggcag 900

atgcgcgtgg tccccccact gccgacatgg gtgaacggcc gcgtatgcat catgggcgac 960

gcagcgcatg catcgcttcc cacactggga caagggtttg gcatgggcct cgaagacgcg 1020

gtcgcgctcg ggacgctgct tcctagttcg acgccgtcag gcgacattcc aagccgtctc 1080

gtcgcgtacg agaagcttcg caaagcgcgc gctgagtatg tttccaaaga gtcgtacgaa 1140

cagcagcatg tccgagaaaa gagagggctg tatctccggt cccgagaaat gcgggatgtg 1200

atcatgggat acgacgtgaa gaaggaggca gaacggatct ttagcgagat cagcattgca 1260

caagaacagc gtgctgttca tgat 1284

<210> 12

<211> 428

<212> PRT

<213> Panellus stipticus

<400> 12

Met Ser Gln Gly Thr Glu Asp Ser Pro Ser Leu Phe Ala Ile Val Val

1 5 10 15

Gly Ala Gly Leu Val Gly Phe Ala Ala Ala Val Ala Leu Arg Arg Gln

20 25 30

Gly His Arg Val Thr Ile Tyr Glu Ser Ser Ser Phe Lys Thr Glu Leu

35 40 45

Gly Ala Gly Leu Ala Ile Pro Ser Asn Thr Leu Arg Cys Leu Val Gly

50 55 60

Leu Gly Cys Thr Val Ala Asn Leu Asp Pro Val Asn Asn Leu Cys Phe

65 70 75 80

Thr Ser Met Ala Tyr Asp Gly Thr Ala Gly Met Lys Ser Asp Ser Ser

85 90 95

Asp Tyr Glu Ala Gln Tyr Gly Thr Pro Trp Ile Met Ala His Arg Val

100 105 110

Asp Leu His Lys Glu Leu Arg Arg Leu Ala Val Asp Pro Glu Gly Thr

115 120 125

Gly Pro Pro Ala Glu Leu His Leu Ser His Arg Val Val Ser Cys Asp

130 135 140

Val Glu Ser Gly Ser Val Thr Leu Leu Asp Gly Ser Ile Gln Ser Ala

145 150 155 160

Asp Leu Ile Ile Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Val Arg Lys Phe

165 170 175

Val Val Gly Glu Glu Ile Ala Ile Pro Pro Ser Arg Thr Ala Gly Phe

180 185 190

Arg Trp Leu Thr Gln Ala Ser Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp

195 200 205

Trp Ile Val Lys Thr Pro Pro Leu Gly Ala Arg Val Ile Ser Ala Pro

210 215 220

Ile Gln Pro Pro Glu Val Thr His Ile Asp His Arg Thr Ile Val Ile

225 230 235 240

Tyr Ala Cys Arg Gly Gly Arg Leu Val Asn Val Leu Gly Ile His Glu

245 250 255

Asp Leu Arg Asp Gln Asp Ser Val Asp Trp Asn Val Pro Ile Thr Arg

260 265 270

Glu Ala Leu Leu His Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg Phe Lys Arg

275 280 285

Leu Leu Glu Leu Ala Glu Asp Val His Val Trp Gln Met Arg Val Val

290 295 300

Pro Pro Leu Pro Thr Trp Val Asn Gly Arg Val Cys Ile Met Gly Asp

305 310 315 320

Ala Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly

325 330 335

Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Ser Ser Thr Pro

340 345 350

Ser Gly Asp Ile Pro Ser Arg Leu Val Ala Tyr Glu Lys Leu Arg Lys

355 360 365

Ala Arg Ala Glu Tyr Val Ser Lys Glu Ser Tyr Glu Gln Gln His Val

370 375 380

Arg Glu Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Arg Glu Met Arg Asp Val

385 390 395 400

Ile Met Gly Tyr Asp Val Lys Lys Glu Ala Glu Arg Ile Phe Ser Glu

405 410 415

Ile Ser Ile Ala Gln Glu Gln Arg Ala Val His Asp

420 425

<210> 13

<211> 1248

<212> DNA

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 13

atggcactat ctgagagtcc tttgaacgtc ttgatagtag gagcggggct cggggggctt 60

gctgctgcca tagcactacg tcgtcaaggg catatcgtga aaatattcga ttcctccagt 120

ttcaaaaccg aacttggtgc aggacttgct gtcccgccta ataccctgcg tagtctgcag 180

gaactcgggt gcagtgtcga gaacctcaat gctgtggata atctttgctt cactgcgatg 240

gggtatgacg ggagtgtagg aatgatgaac aatatgaccg actatcgaga ggcgtacggt 300

catccttggg tcatggttca ccgtgtcgac ttgcataatg agctgaagcg cgtggcgctt 360

gatccagacg gcctcggacc tcctgcaact ttgcatctca accatcgtgt cacattctgc 420

gacatcgact cttgcactgt cacgttcgct aatgggactt ctaaatcggc agatcttatc 480

gtaggcgcag acggtatacg ctctaccatt cgcaagttca ttcttggaga agacgtcgtt 540

atacccgcgt caggaatagc agggtttcga tggcttgtgc aagctgacgc gctggatccg 600

tatcctgaac tcgactggat cgtgaagaac cctcctctag gagcccgact gatttccgct 660

cctaggaatc aacagtctac tgataggcgc actatcatca tctatgcgtg tcgtagcggc 720

accatggtca acgtactcgc agtacatgat gatgatcgtg accagaacgc cgtagattgg 780

agtgcaccag cttccaaaga tgatttattc cacatcttcc acgactacca cccacgattc 840

cagcggcttc tggagctggc gcaagatatc aatctctggc aaatgcgtgt tgttcctgtt 900

ctgaaacaat gggttaacaa acgtgtttgc ttgttaggag atgcggcaca cgcttcttta 960

cctacattag ggcagggatt tggtatgggt ctagaagatg ccgtagcact gggtacgctt 1020

cttccaaagg gggccacagt atctcagatc gagagccgac tcgcggtgta tgaaattctg 1080

cgcaaggagc gtgctgaatt tgtttcggct gagtcatatg aagagcagta cgttccagaa 1140

aaacgcgggc tttacttaag atcgaaggaa ttgcgcgaca gtgtcatggg ttacgatatt 1200

aaaatggaga gcgagaaggt tctcgtggca ttacttagcg gttcttca 1248

<210> 14

<211> 416

<212> PRT

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 14

Met Ala Leu Ser Glu Ser Pro Leu Asn Val Leu Ile Val Gly Ala Gly

1 5 10 15

Leu Gly Gly Leu Ala Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly His Ile

20 25 30

Val Lys Ile Phe Asp Ser Ser Ser Phe Lys Thr Glu Leu Gly Ala Gly

35 40 45

Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Leu Arg Ser Leu Gln Glu Leu Gly Cys

50 55 60

Ser Val Glu Asn Leu Asn Ala Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr Ala Met

65 70 75 80

Gly Tyr Asp Gly Ser Val Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp Tyr Arg

85 90 95

Glu Ala Tyr Gly His Pro Trp Val Met Val His Arg Val Asp Leu His

100 105 110

Asn Glu Leu Lys Arg Val Ala Leu Asp Pro Asp Gly Leu Gly Pro Pro

115 120 125

Ala Thr Leu His Leu Asn His Arg Val Thr Phe Cys Asp Ile Asp Ser

130 135 140

Cys Thr Val Thr Phe Ala Asn Gly Thr Ser Lys Ser Ala Asp Leu Ile

145 150 155 160

Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Lys Phe Ile Leu Gly

165 170 175

Glu Asp Val Val Ile Pro Ala Ser Gly Ile Ala Gly Phe Arg Trp Leu

180 185 190

Val Gln Ala Asp Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp Ile Val

195 200 205

Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Ser Ala Pro Arg Asn Gln

210 215 220

Gln Ser Thr Asp Arg Arg Thr Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg Ser Gly

225 230 235 240

Thr Met Val Asn Val Leu Ala Val His Asp Asp Asp Arg Asp Gln Asn

245 250 255

Ala Val Asp Trp Ser Ala Pro Ala Ser Lys Asp Asp Leu Phe His Ile

260 265 270

Phe His Asp Tyr His Pro Arg Phe Gln Arg Leu Leu Glu Leu Ala Gln

275 280 285

Asp Ile Asn Leu Trp Gln Met Arg Val Val Pro Val Leu Lys Gln Trp

290 295 300

Val Asn Lys Arg Val Cys Leu Leu Gly Asp Ala Ala His Ala Ser Leu

305 310 315 320

Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala Val Ala

325 330 335

Leu Gly Thr Leu Leu Pro Lys Gly Ala Thr Val Ser Gln Ile Glu Ser

340 345 350

Arg Leu Ala Val Tyr Glu Ile Leu Arg Lys Glu Arg Ala Glu Phe Val

355 360 365

Ser Ala Glu Ser Tyr Glu Glu Gln Tyr Val Pro Glu Lys Arg Gly Leu

370 375 380

Tyr Leu Arg Ser Lys Glu Leu Arg Asp Ser Val Met Gly Tyr Asp Ile

385 390 395 400

Lys Met Glu Ser Glu Lys Val Leu Val Ala Leu Leu Ser Gly Ser Ser

405 410 415

<210> 15

<211> 1257

<212> DNA

<213> Mycena citricolor

<400> 15

atgaacaccc ccaataacgc tctcgatgtt attgttgtcg gtgctggcct ggttggtttc 60

gcggccgctg ctgctctacg ccgacaaggt catcgcgtga ctatctacga gacttccagc 120

ttcaagaacg agctaggagc tggccttgct attccaccca acactgtccg tggcctaatt 180

ggcttgggat gtgtgattga gaacttggac ccggtggaga atctatgcgt ttccgtcgct 240

tttgacggaa gtgctggtat gcgcagtgac cagaccaact acgaagcaag ctacggcctt 300

ccctggatca tggtgcatcg cgtcgatttg cacaatgagc ttcgtcgggt tgctctcagt 360

gccgagggga acattggtcc cccagccgag ctacgcctgg accaccgagt cagctcgtgt 420

gatgtcgaga aatgcactgt gacgctgagc aatggcgata cccaccacgc ggatctgatc 480

attggagcag acgggatcca ttctacaatc cgatccttcg tcgtgggcga ggaaatcgtc 540

attccgccct ccaagacagc cggtttccgc tggctcacag agagtactgc gttggagccc 600

tatccggaat tggactggat tgtgaagatc ccaccacttg gcgcccggct gatctctgcg 660

ccaatgaacc ctgcgccacc gcaggtcgac caccggacga tcatcatcta cgcctgtcgt 720

ggcagtacac tgataaatgt actcggagtc catgaggatc tccgcgatca agatacagtt 780

ccctggaatg cacccgtaac ccaatcggag ctgctccagt tctttggcga ttaccatccg 840

cgattcaaac gattgttgga gcttgcaaat gatgttcatg tgtggcagat gcgagtagtg 900

ccccgcttgg agacctgggt caatcgtcgg gtttgcatta tgggcgatgc tgcgcatgca 960

tcactcccca cgctgggtca aggtttcgga atggggctcg aggatgcagt cgctcttgga 1020

acactccttc cgcttgggac aactcccgaa gagatcccgg accgtctcac cctctggcag 1080

gatctcgtca aacctcgggc tgagtttgtc gcgactgaat cctacgaaca gcagcatatt 1140

cctgcgaaac ggggactcta tcttcgctcg caggagatgc gcgactgggt catgggatac 1200

gatgtccagg ctgaggcaca gaaggtcttg gcgggagctg tgaatagatc caaggga 1257

<210> 16

<211> 419

<212> PRT

<213> Mycena citricolor

<400> 16

Met Asn Thr Pro Asn Asn Ala Leu Asp Val Ile Val Val Gly Ala Gly

1 5 10 15

Leu Val Gly Phe Ala Ala Ala Ala Ala Leu Arg Arg Gln Gly His Arg

20 25 30

Val Thr Ile Tyr Glu Thr Ser Ser Phe Lys Asn Glu Leu Gly Ala Gly

35 40 45

Leu Ala Ile Pro Pro Asn Thr Val Arg Gly Leu Ile Gly Leu Gly Cys

50 55 60

Val Ile Glu Asn Leu Asp Pro Val Glu Asn Leu Cys Val Ser Val Ala

65 70 75 80

Phe Asp Gly Ser Ala Gly Met Arg Ser Asp Gln Thr Asn Tyr Glu Ala

85 90 95

Ser Tyr Gly Leu Pro Trp Ile Met Val His Arg Val Asp Leu His Asn

100 105 110

Glu Leu Arg Arg Val Ala Leu Ser Ala Glu Gly Asn Ile Gly Pro Pro

115 120 125

Ala Glu Leu Arg Leu Asp His Arg Val Ser Ser Cys Asp Val Glu Lys

130 135 140

Cys Thr Val Thr Leu Ser Asn Gly Asp Thr His His Ala Asp Leu Ile

145 150 155 160

Ile Gly Ala Asp Gly Ile His Ser Thr Ile Arg Ser Phe Val Val Gly

165 170 175

Glu Glu Ile Val Ile Pro Pro Ser Lys Thr Ala Gly Phe Arg Trp Leu

180 185 190

Thr Glu Ser Thr Ala Leu Glu Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp Ile Val

195 200 205

Lys Ile Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Ser Ala Pro Met Asn Pro

210 215 220

Ala Pro Pro Gln Val Asp His Arg Thr Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg

225 230 235 240

Gly Ser Thr Leu Ile Asn Val Leu Gly Val His Glu Asp Leu Arg Asp

245 250 255

Gln Asp Thr Val Pro Trp Asn Ala Pro Val Thr Gln Ser Glu Leu Leu

260 265 270

Gln Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg Phe Lys Arg Leu Leu Glu Leu

275 280 285

Ala Asn Asp Val His Val Trp Gln Met Arg Val Val Pro Arg Leu Glu

290 295 300

Thr Trp Val Asn Arg Arg Val Cys Ile Met Gly Asp Ala Ala His Ala

305 310 315 320

Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala

325 330 335

Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Leu Gly Thr Thr Pro Glu Glu Ile

340 345 350

Pro Asp Arg Leu Thr Leu Trp Gln Asp Leu Val Lys Pro Arg Ala Glu

355 360 365

Phe Val Ala Thr Glu Ser Tyr Glu Gln Gln His Ile Pro Ala Lys Arg

370 375 380

Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Gln Glu Met Arg Asp Trp Val Met Gly Tyr

385 390 395 400

Asp Val Gln Ala Glu Ala Gln Lys Val Leu Ala Gly Ala Val Asn Arg

405 410 415

Ser Lys Gly

<210> 17

<211> 1260

<212> DNA

<213> Mycena citricolor

<400> 17

atgaacaccc ccaataacgc tctcgatgtt attgttgtcg gtgctggcct ggttggtttc 60

gcggccgctg ctgctctacg ccgacaaggt catcgcgtga ctatctatga gacttccagc 120

ttcaagaacg agttaggagc tggcctggct attccaccca acactgtccg tggtctaatt 180

ggcttgggat gtgtgattga gaacttggac ccggtggaga atctatgctt cactgccgtc 240

gcgtttgacg gaagtgctgg tatgcgcagc gaccaaacca actacgaagc aagttacggc 300

cttccctgga tcatggtgca tcgtgtcgat ttgcacaacg agcttcgtcg ggttgctctc 360

agcgccgagg ggaacactgg tcccccagcg gagctacgcc tggaccaccg agtcagctcg 420

tgtgatgtcg agaaatgcac tgtgacgctg agcaatgggg atacccacca cgcagatctg 480

atcattggag cagacgggat ccattctaca atccgatcct tcgttgtggg cgaggaaatc 540

gtcattccgc cctccaagac agccggtttc cgctggctca cagagagtac tgcgttggag 600

ccctatccgg aattggactg gattgtgaag atcccaccac ttggcgcccg gctgatctct 660

gcgccaatga accctgcgcc accgcaggtc gaccaccgga cgatcatcat ctacgcctgt 720

cgtggcagta cactgataaa tgtactcgga gtccatgagg atctccgcga tcaagataca 780

gtcccctgga atgcacccgt aacccaatcg gagctgctcc agttctttgg cgattaccat 840

ccgcggttca aacgattgtt ggagcttgca aatgatgttc atgtgtggca gatgcgagta 900

gtgccccgct tggagacctg ggtcaatcgt cgggtttgca ttatgggcga tgctgcgcat 960

gcatcactcc ccacgctggg tcaaggtttc ggaatggggc tcgaggatgc agtcgctctt 1020

ggaacactcc ttccgcttgg gacaactccc gaagagatcc cggaccgtct caccctctgg 1080

caggatctcg tcaaacctcg ggctgagttt gtcgcgactg aatcctacga acagcagcat 1140

attcctgcga aacggggact ctatcttcgc tcgcaggaga tgcgcgactg ggtcatggga 1200

tacgatgtcc aggctgaggc acagaaggtc ttggcgggag ctgtgaatag atccaaggga 1260

<210> 18

<211> 420

<212> PRT

<213> Mycena citricolor

<400> 18

Met Asn Thr Pro Asn Asn Ala Leu Asp Val Ile Val Val Gly Ala Gly

1 5 10 15

Leu Val Gly Phe Ala Ala Ala Ala Ala Leu Arg Arg Gln Gly His Arg

20 25 30

Val Thr Ile Tyr Glu Thr Ser Ser Phe Lys Asn Glu Leu Gly Ala Gly

35 40 45

Leu Ala Ile Pro Pro Asn Thr Val Arg Gly Leu Ile Gly Leu Gly Cys

50 55 60

Val Ile Glu Asn Leu Asp Pro Val Glu Asn Leu Cys Phe Thr Ala Val

65 70 75 80

Ala Phe Asp Gly Ser Ala Gly Met Arg Ser Asp Gln Thr Asn Tyr Glu

85 90 95

Ala Ser Tyr Gly Leu Pro Trp Ile Met Val His Arg Val Asp Leu His

100 105 110

Asn Glu Leu Arg Arg Val Ala Leu Ser Ala Glu Gly Asn Thr Gly Pro

115 120 125

Pro Ala Glu Leu Arg Leu Asp His Arg Val Ser Ser Cys Asp Val Glu

130 135 140

Lys Cys Thr Val Thr Leu Ser Asn Gly Asp Thr His His Ala Asp Leu

145 150 155 160

Ile Ile Gly Ala Asp Gly Ile His Ser Thr Ile Arg Ser Phe Val Val

165 170 175

Gly Glu Glu Ile Val Ile Pro Pro Ser Lys Thr Ala Gly Phe Arg Trp

180 185 190

Leu Thr Glu Ser Thr Ala Leu Glu Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp Ile

195 200 205

Val Lys Ile Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Ser Ala Pro Met Asn

210 215 220

Pro Ala Pro Pro Gln Val Asp His Arg Thr Ile Ile Ile Tyr Ala Cys

225 230 235 240

Arg Gly Ser Thr Leu Ile Asn Val Leu Gly Val His Glu Asp Leu Arg

245 250 255

Asp Gln Asp Thr Val Pro Trp Asn Ala Pro Val Thr Gln Ser Glu Leu

260 265 270

Leu Gln Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg Phe Lys Arg Leu Leu Glu

275 280 285

Leu Ala Asn Asp Val His Val Trp Gln Met Arg Val Val Pro Arg Leu

290 295 300

Glu Thr Trp Val Asn Arg Arg Val Cys Ile Met Gly Asp Ala Ala His

305 310 315 320

Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly Leu Glu Asp

325 330 335

Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Leu Gly Thr Thr Pro Glu Glu

340 345 350

Ile Pro Asp Arg Leu Thr Leu Trp Gln Asp Leu Val Lys Pro Arg Ala

355 360 365

Glu Phe Val Ala Thr Glu Ser Tyr Glu Gln Gln His Ile Pro Ala Lys

370 375 380

Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Gln Glu Met Arg Asp Trp Val Met Gly

385 390 395 400

Tyr Asp Val Gln Ala Glu Ala Gln Lys Val Leu Ala Gly Ala Val Asn

405 410 415

Arg Ser Lys Gly

420

<210> 19

<211> 1287

<212> DNA

<213> Armillaria mellea

<400> 19

atgcaacaaa tcgacgaagc gcgcccattg aaagtgatag tagtgggtgc tggactttgt 60

gggctttccg ccgccattgc acttcgtagg caagggcatc atgttcatat acttgaatct 120

tcaagtttta agagcgagct tggcgcaggt ctcgccgtcc cacccaatac tgtacgctct 180

cttcgaggcc taggttgtaa catcgacaat ctcaagcccg tggataattt gtgtttctct 240

gccatggcgc atgacggaag cccaggcatg atgaataaca tgacagacta tcacaaggcg 300

tacggtgatc cttgggtaat ggcacatcgt gtcgacctcc ataacgagct cttgcgagtg 360

gctttcgacc ccgaaggaac agggcctcct gctcaacttc gtttgggcgt ccaggtagtg 420

acttgcgata tggaagcttg tacaatttcc cttgtcgatg gaacagtctg ttccgccgat 480

cttatcgtag gagctgacgg tattaagtcg accatacgct cctgtgttct aggcaaagaa 540

atagacatac ctcctaccgg tatcgccgga taccgctggc tcataccggc agaagctttg 600

gagccctatc ccgagctcga ctggattatc aagaacccac ccctaggagc acgtttaatc 660

acggatcccg tacgccgaac tgaacaaacg gatgacggta agaaggctga caagcgcacg 720

atcataatct atgcgtgccg cagtggcacg atgatcaacg ttcttggtgt gcacgatgac 780

ctgcgcaacc agaatgaagt cggatggaac gtaccagtca cacgggaaaa cttgctggag 840

tttttcgggg actaccaccc acggtttaag cgtttactcc agctagccga tagtattcat 900

ttgtggcaaa tgcgtgttgt cccacggctt gacacatgga ttaatagatg cgtgtgtttg 960

ctgggcgatt ctgcacatgc gtcattacca actctcgggc aaggcttcgg aatgggtctt 1020

gaggatgccg tagctctcgc agccctcctt ccgatgggaa ccaatgcgtc tgacgttgag 1080

aaccgcctta tcgcctacga aagcttgcgt aaggagcgtg cagagtatgt agccacggaa 1140

tcattagaac agcaggatat tgcaggaaag cgaggcttgt atctcaggtc tcctatgatg 1200

cgcgataaaa taatgggtta tgatattaaa gcggaagctg agaaggtttt aatcgaatta 1260

aaaaattcga cagctcagca ggtcact 1287

<210> 20

<211> 429

<212> PRT

<213> Armillaria mellea

<400> 20

Met Gln Gln Ile Asp Glu Ala Arg Pro Leu Lys Val Ile Val Val Gly

1 5 10 15

Ala Gly Leu Cys Gly Leu Ser Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly

20 25 30

His His Val His Ile Leu Glu Ser Ser Ser Phe Lys Ser Glu Leu Gly

35 40 45

Ala Gly Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Val Arg Ser Leu Arg Gly Leu

50 55 60

Gly Cys Asn Ile Asp Asn Leu Lys Pro Val Asp Asn Leu Cys Phe Ser

65 70 75 80

Ala Met Ala His Asp Gly Ser Pro Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp

85 90 95

Tyr His Lys Ala Tyr Gly Asp Pro Trp Val Met Ala His Arg Val Asp

100 105 110

Leu His Asn Glu Leu Leu Arg Val Ala Phe Asp Pro Glu Gly Thr Gly

115 120 125

Pro Pro Ala Gln Leu Arg Leu Gly Val Gln Val Val Thr Cys Asp Met

130 135 140

Glu Ala Cys Thr Ile Ser Leu Val Asp Gly Thr Val Cys Ser Ala Asp

145 150 155 160

Leu Ile Val Gly Ala Asp Gly Ile Lys Ser Thr Ile Arg Ser Cys Val

165 170 175

Leu Gly Lys Glu Ile Asp Ile Pro Pro Thr Gly Ile Ala Gly Tyr Arg

180 185 190

Trp Leu Ile Pro Ala Glu Ala Leu Glu Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp

195 200 205

Ile Ile Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Thr Asp Pro Val

210 215 220

Arg Arg Thr Glu Gln Thr Asp Asp Gly Lys Lys Ala Asp Lys Arg Thr

225 230 235 240

Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg Ser Gly Thr Met Ile Asn Val Leu Gly

245 250 255

Val His Asp Asp Leu Arg Asn Gln Asn Glu Val Gly Trp Asn Val Pro

260 265 270

Val Thr Arg Glu Asn Leu Leu Glu Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg

275 280 285

Phe Lys Arg Leu Leu Gln Leu Ala Asp Ser Ile His Leu Trp Gln Met

290 295 300

Arg Val Val Pro Arg Leu Asp Thr Trp Ile Asn Arg Cys Val Cys Leu

305 310 315 320

Leu Gly Asp Ser Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe

325 330 335

Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Ala Ala Leu Leu Pro Met

340 345 350

Gly Thr Asn Ala Ser Asp Val Glu Asn Arg Leu Ile Ala Tyr Glu Ser

355 360 365

Leu Arg Lys Glu Arg Ala Glu Tyr Val Ala Thr Glu Ser Leu Glu Gln

370 375 380

Gln Asp Ile Ala Gly Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Pro Met Met

385 390 395 400

Arg Asp Lys Ile Met Gly Tyr Asp Ile Lys Ala Glu Ala Glu Lys Val

405 410 415

Leu Ile Glu Leu Lys Asn Ser Thr Ala Gln Gln Val Thr

420 425

<210> 21

<211> 1278

<212> DNA

<213> Armillaria fuscipes

<400> 21

atgcaacaaa tcgacgaagc gcgtccattg aaggtgctag tcgtgggtgc tggactctgt 60

gggctttccg ccgccatcgc acttcgtaga caagggcatc acgtccatat acttgaatct 120

tcaagtttca agagcgaact tggggcaggt ctcgccgtgc cacctaatac tgtgcgctct 180

cttcgaggtc tcggctgtga catagacaat ctcaagcccg tggataatct ttgtttcact 240

gctatgtcgc atgacggaag cccaggcatg atgaataaca tgacggacta tcgcaaggcg 300

tatggtgatc cttgggtgat ggcacatcgt gtcgaccttc ataacgagct tatgcgagtg 360

gctctcgacc ctgatgggac aggtcctcct gcccaacttc gtttgggcgt ccaggttgtg 420

tcttgcgatg ttgaagcttg tactgtttcc cttgtcgatg gagaggtctg ttccgccgat 480

cttatcgttg gagctgatgg tatcaggtca accatacgct cctatgttct aggcaaagaa 540

atagatatac ctcctaccgg cattgccgga taccgctggc ttacaccatc agaggctttg 600

gagccttttc ccgaacttga ttggattatc aagaacccac ctctaggagc acgtctaatc 660

accgctccca tacgccggaa cgaacaaatg aatgacggtg agatggctga caagcgtacg 720

atcatcatct acgcgtgccg caacggcaca atgattaacg ttctcggtgt gcacgatgac 780

ccgcgcaacc agaatgaagt cggatggaac gtgccagtaa cccaagaaaa attgctcgaa 840

tttttcggag actaccaccc acggttcaaa agtttacttc agctatctga tagtattcat 900

ttgtggcaaa tgcgtgttgt tccacggctt gacacatgga tcaatcaacg tgtgtgtttg 960

ctgggcgatt ctgcacatgc gtcattacca acgctcgggc aaggcttcgg gatgggtctt 1020

gaggacgcca tagctcttgc aaccctcctt ccgatgggcg ccaaagtgtc ggacattgag 1080

aatcgcctta tcgcctacga aagcctgcgt aaggagcgtg cagagtttgt agccacggaa 1140

tcattagaac agcaagatat tcccgaaaag cgaggcttgt atctcagatc ccctatgatg 1200

cgcgataaaa taatgggtta cgatatcaaa gccgaagctg aaaaggtttt aatggagtta 1260

ttgagctcga aagctcaa 1278

<210> 22

<211> 426

<212> PRT

<213> Armillaria fuscipes

<400> 22

Met Gln Gln Ile Asp Glu Ala Arg Pro Leu Lys Val Leu Val Val Gly

1 5 10 15

Ala Gly Leu Cys Gly Leu Ser Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly

20 25 30

His His Val His Ile Leu Glu Ser Ser Ser Phe Lys Ser Glu Leu Gly

35 40 45

Ala Gly Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Val Arg Ser Leu Arg Gly Leu

50 55 60

Gly Cys Asp Ile Asp Asn Leu Lys Pro Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr

65 70 75 80

Ala Met Ser His Asp Gly Ser Pro Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp

85 90 95

Tyr Arg Lys Ala Tyr Gly Asp Pro Trp Val Met Ala His Arg Val Asp

100 105 110

Leu His Asn Glu Leu Met Arg Val Ala Leu Asp Pro Asp Gly Thr Gly

115 120 125

Pro Pro Ala Gln Leu Arg Leu Gly Val Gln Val Val Ser Cys Asp Val

130 135 140

Glu Ala Cys Thr Val Ser Leu Val Asp Gly Glu Val Cys Ser Ala Asp

145 150 155 160

Leu Ile Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Ser Tyr Val

165 170 175

Leu Gly Lys Glu Ile Asp Ile Pro Pro Thr Gly Ile Ala Gly Tyr Arg

180 185 190

Trp Leu Thr Pro Ser Glu Ala Leu Glu Pro Phe Pro Glu Leu Asp Trp

195 200 205

Ile Ile Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Thr Ala Pro Ile

210 215 220

Arg Arg Asn Glu Gln Met Asn Asp Gly Glu Met Ala Asp Lys Arg Thr

225 230 235 240

Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg Asn Gly Thr Met Ile Asn Val Leu Gly

245 250 255

Val His Asp Asp Pro Arg Asn Gln Asn Glu Val Gly Trp Asn Val Pro

260 265 270

Val Thr Gln Glu Lys Leu Leu Glu Phe Phe Gly Asp Tyr His Pro Arg

275 280 285

Phe Lys Ser Leu Leu Gln Leu Ser Asp Ser Ile His Leu Trp Gln Met

290 295 300

Arg Val Val Pro Arg Leu Asp Thr Trp Ile Asn Gln Arg Val Cys Leu

305 310 315 320

Leu Gly Asp Ser Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe

325 330 335

Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala Ile Ala Leu Ala Thr Leu Leu Pro Met

340 345 350

Gly Ala Lys Val Ser Asp Ile Glu Asn Arg Leu Ile Ala Tyr Glu Ser

355 360 365

Leu Arg Lys Glu Arg Ala Glu Phe Val Ala Thr Glu Ser Leu Glu Gln

370 375 380

Gln Asp Ile Pro Glu Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Pro Met Met

385 390 395 400

Arg Asp Lys Ile Met Gly Tyr Asp Ile Lys Ala Glu Ala Glu Lys Val

405 410 415

Leu Met Glu Leu Leu Ser Ser Lys Ala Gln

420 425

<210> 23

<211> 1266

<212> DNA

<213> Armillaria gallica

<400> 23

atgcaacaaa tcgacgaagc gcgcgcattg aaagtgatag tcgtgggtgc tggactttgc 60

gggctttccg ccgccattgt acttcgtagg caagggcatc acgtccatat acttgaatct 120

tcaagtttca agagcgaact tggtgcaggt cttgccgtgc cgcccaacac tgtacgctct 180

cttcgaggtc taggttgtaa catcgacaat ctcaagcccg tggataatct ttgtttcact 240

gccatggctc atgacggaag cccaggcatg atgaataaca tgacagacta tcagaaggcg 300

tacggcgatc cttgggtaat ggcgcatcgt gtcgacctcc ataacgagct catgcgagtg 360

gctctcgacc ctgaaggaac aggccctgct gcccagcttc gtttgggcgt ccaggtggtg 420

tcttgtgatg tggaagcttg taccatttct cttgtcgatg gatcaatctg taccgccgat 480

cttatcgtcg gagctgatgg tattaggtca accatacggt cctatgtttt gggcaaagaa 540

atagacatac ctcctaccgg tattgctgga taccgctggc tcacaccggc agaagctttg 600

gacccatatc ccgaactcga ctggattatc aagaacccac ccctgggagc acgtttaatc 660

acagctcccg ttcgccgaaa cgataaggcg gatgacggtg agaaagctga caagcgcacg 720

atcataatct acgcgtgccg cagtggcact atgatcaacg ttctcggtgt gcacgatgac 780

ccgcgcaacc agaatgaagt cggatggaac gtaccagtta cccaggaaaa tttgttggag 840

tttttcgaag actaccaccc acggtttaag cgtttacttc agctgaccga taacattcat 900

ttgtggcaaa tgcgtgttgt cccgcggctt gacacatgga ttaataaacg cgtgtgtttg 960

ctgggcgatt ctgcacatgc gtcattacca acactcgggc aaggcttcgg gatgggtctt 1020

gaggacgccg tagctctcgc aaccctcctt ccgatgggaa ccaaattgtc tgacattgaa 1080

aaccgtcttg tcgcctacga aagcttgcgt aaggagcgtg ctgagtatgt agccacggaa 1140

tcattagaac agcaggatat tccgggaaag cgaggcttgt atctcaggtc tcctgtgatg 1200

cgcgataaaa taatgggtta tgatatcaaa gccgaagctg agaaggtttt aatggaattg 1260

ataacc 1266

<210> 24

<211> 422

<212> PRT

<213> Armillaria gallica

<400> 24

Met Gln Gln Ile Asp Glu Ala Arg Ala Leu Lys Val Ile Val Val Gly

1 5 10 15

Ala Gly Leu Cys Gly Leu Ser Ala Ala Ile Val Leu Arg Arg Gln Gly

20 25 30

His His Val His Ile Leu Glu Ser Ser Ser Phe Lys Ser Glu Leu Gly

35 40 45

Ala Gly Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Val Arg Ser Leu Arg Gly Leu

50 55 60

Gly Cys Asn Ile Asp Asn Leu Lys Pro Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr

65 70 75 80

Ala Met Ala His Asp Gly Ser Pro Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp

85 90 95

Tyr Gln Lys Ala Tyr Gly Asp Pro Trp Val Met Ala His Arg Val Asp

100 105 110

Leu His Asn Glu Leu Met Arg Val Ala Leu Asp Pro Glu Gly Thr Gly

115 120 125

Pro Ala Ala Gln Leu Arg Leu Gly Val Gln Val Val Ser Cys Asp Val

130 135 140

Glu Ala Cys Thr Ile Ser Leu Val Asp Gly Ser Ile Cys Thr Ala Asp

145 150 155 160

Leu Ile Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Ser Tyr Val

165 170 175

Leu Gly Lys Glu Ile Asp Ile Pro Pro Thr Gly Ile Ala Gly Tyr Arg

180 185 190

Trp Leu Thr Pro Ala Glu Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp

195 200 205

Ile Ile Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Thr Ala Pro Val

210 215 220

Arg Arg Asn Asp Lys Ala Asp Asp Gly Glu Lys Ala Asp Lys Arg Thr

225 230 235 240

Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg Ser Gly Thr Met Ile Asn Val Leu Gly

245 250 255

Val His Asp Asp Pro Arg Asn Gln Asn Glu Val Gly Trp Asn Val Pro

260 265 270

Val Thr Gln Glu Asn Leu Leu Glu Phe Phe Glu Asp Tyr His Pro Arg

275 280 285

Phe Lys Arg Leu Leu Gln Leu Thr Asp Asn Ile His Leu Trp Gln Met

290 295 300

Arg Val Val Pro Arg Leu Asp Thr Trp Ile Asn Lys Arg Val Cys Leu

305 310 315 320

Leu Gly Asp Ser Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe

325 330 335

Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Ala Thr Leu Leu Pro Met

340 345 350

Gly Thr Lys Leu Ser Asp Ile Glu Asn Arg Leu Val Ala Tyr Glu Ser

355 360 365

Leu Arg Lys Glu Arg Ala Glu Tyr Val Ala Thr Glu Ser Leu Glu Gln

370 375 380

Gln Asp Ile Pro Gly Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Pro Val Met

385 390 395 400

Arg Asp Lys Ile Met Gly Tyr Asp Ile Lys Ala Glu Ala Glu Lys Val

405 410 415

Leu Met Glu Leu Ile Thr

420

<210> 25

<211> 1278

<212> DNA

<213> Armillaria ostoyae

<400> 25

atgcaacaaa tcgacgaagc gcacccattg acagtgatag tcgtgggtgc tggactttgc 60

gggctttccg ccgccattgc acttcgtagg caagggcatc acgtccatat acttgaatct 120

tcaagtttca aaagcgaact tggcgcaggt ctcgccgtgc cgcccaacac tgtacgctct 180

cttcgaggtc taggttgtaa catcgacaat ctcaagcccg tggataatct ttgtttcact 240

gccatggcgc atgacggaag cccaggcatg atgaataaca tgacagacta tcacaaggcg 300

tacggcgagc cttgggtaat ggcgcatcgt gtcgacctcc ataacgagct catgcgagtg 360

gctctcgacc ctgaaggaac aggtcctcct gctcagcttc gtttgggtgt ccaggtggtg 420

tcttgcgatg tggaagcttg taccatttct cttgtcgatg gatcaatctg ttccgccgat 480

cttatcgtcg gagctgatgg tattaggtca accatacgct cctatgtttt gggcaaagaa 540

atagacatac ctcctaccgg tattgctgga taccgttggc tcacaccggc agaagctttg 600

gagccatatc ccgaactcga ctggattatc aagaacccac ccctgggagc acgtttaatc 660

acggctcccg tacgccgaaa cgataagacg gatgacggtg agaagactga caagcgcacg 720

atcataatct acgcgtgccg caatggcact atgatcaacg ttctcggtgt gcacgatgac 780

ccgcgcaacc agaatgaagt cggatggaac gtaccagtta cccaggaaaa tttgttggag 840

tttttcgaag actaccaccc acggtttaag cgtttacttc agttggccga tagtattcat 900

ttgtggcaaa tgcgtgttgt cccacggctt gacacatgga ttaataaacg cgtgtgtttg 960

ctgggcgatt ctgcacatgc gtcattacca acactcgggc aaggcttcgg gatgggtctt 1020

gaggacgccg tagctctcgc agccctcctt ccgatgggaa ccaaagtgtc tgacgttgag 1080

agtcgtctta tcgcctacga aagcttgcgt aaggagcgtg ctgagtatgt agccacggaa 1140

tcattagaac agcagaatat tccgggaaag cgaggcttgt atctcaggtc tcctatgatg 1200

cgcgataaaa taatgggtta tgatatcaaa gccgaagctg agaaggtttt aatggaatta 1260

ataacctcga cagctcag 1278

<210> 26

<211> 426

<212> PRT

<213> Armillaria ostoyae

<400> 26

Met Gln Gln Ile Asp Glu Ala His Pro Leu Thr Val Ile Val Val Gly

1 5 10 15

Ala Gly Leu Cys Gly Leu Ser Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly

20 25 30

His His Val His Ile Leu Glu Ser Ser Ser Phe Lys Ser Glu Leu Gly

35 40 45

Ala Gly Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Val Arg Ser Leu Arg Gly Leu

50 55 60

Gly Cys Asn Ile Asp Asn Leu Lys Pro Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr

65 70 75 80

Ala Met Ala His Asp Gly Ser Pro Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp

85 90 95

Tyr His Lys Ala Tyr Gly Glu Pro Trp Val Met Ala His Arg Val Asp

100 105 110

Leu His Asn Glu Leu Met Arg Val Ala Leu Asp Pro Glu Gly Thr Gly

115 120 125

Pro Pro Ala Gln Leu Arg Leu Gly Val Gln Val Val Ser Cys Asp Val

130 135 140

Glu Ala Cys Thr Ile Ser Leu Val Asp Gly Ser Ile Cys Ser Ala Asp

145 150 155 160

Leu Ile Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Ser Tyr Val

165 170 175

Leu Gly Lys Glu Ile Asp Ile Pro Pro Thr Gly Ile Ala Gly Tyr Arg

180 185 190

Trp Leu Thr Pro Ala Glu Ala Leu Glu Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp

195 200 205

Ile Ile Lys Asn Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Thr Ala Pro Val

210 215 220

Arg Arg Asn Asp Lys Thr Asp Asp Gly Glu Lys Thr Asp Lys Arg Thr

225 230 235 240

Ile Ile Ile Tyr Ala Cys Arg Asn Gly Thr Met Ile Asn Val Leu Gly

245 250 255

Val His Asp Asp Pro Arg Asn Gln Asn Glu Val Gly Trp Asn Val Pro

260 265 270

Val Thr Gln Glu Asn Leu Leu Glu Phe Phe Glu Asp Tyr His Pro Arg

275 280 285

Phe Lys Arg Leu Leu Gln Leu Ala Asp Ser Ile His Leu Trp Gln Met

290 295 300

Arg Val Val Pro Arg Leu Asp Thr Trp Ile Asn Lys Arg Val Cys Leu

305 310 315 320

Leu Gly Asp Ser Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe

325 330 335

Gly Met Gly Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Ala Ala Leu Leu Pro Met

340 345 350

Gly Thr Lys Val Ser Asp Val Glu Ser Arg Leu Ile Ala Tyr Glu Ser

355 360 365

Leu Arg Lys Glu Arg Ala Glu Tyr Val Ala Thr Glu Ser Leu Glu Gln

370 375 380

Gln Asn Ile Pro Gly Lys Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Pro Met Met

385 390 395 400

Arg Asp Lys Ile Met Gly Tyr Asp Ile Lys Ala Glu Ala Glu Lys Val

405 410 415

Leu Met Glu Leu Ile Thr Ser Thr Ala Gln

420 425

<210> 27

<211> 1266

<212> DNA

<213> Mycena chlorophos

<400> 27

atgccctcca ccgccgaatc tccgcagccg ctcaagatcg tcatcgtcgg tgctgggctc 60

gttggtctcg ctgctgccat tgcgcttcgt cgcgagggtc atcatgtaga gatatacgaa 120

tcgtcgacgt tcaagaccga actcggcgcc ggtctcgcga taccgtgcaa taccctccgt 180

agcctcattg agctggggtg cattgtggct aacttgaacc cggtggagaa cctctgtttc 240

acgtctatgg cgcacgacgg aagcgagtca ggcatgcgaa gcgaccacac cgactacgag 300

gcgcgttatg ggaccccttg ggtcatggcg catcgcgtcg acatacacgc agagctgctc 360

cgaatggcca ccacctccga tattcccggc ccaccggcga cactgcatct cggccaacgc 420

gtccttgcct gcaatgtgtc cgactgctcc attgcactgg ccaccggcaa aacgatctca 480

gcggatctcg tcgttggtgc cgatgggatt cgctcgacca ttcgagctgc tgttcttggc 540

gaagatatcc acattccggc atcgggcact gccggcttcc gatggctcgt agattccgcc 600

gcgctggatc cctatcccga gctggactgg attgtgaaag cccgtccgct tggcgctcgc 660

gttatttctg ccccgatggg cctcgcactc gaagatcatc gtaccattgt gatctatgcg 720

tgtcgcggcg gtaacttgat caacgttctt gcggtccacg aagacaagcg cgaccaggag 780

gctgtccctt ggaatgtccc tttgacgcgc gaagccctct tggacttctt tagcgactac 840

cacccgcgtt tccgccgtct cttcgagctc gcgccggtcg acggaattca cgtctggcag 900

atgcgggtcg taccaccttt ggccaactgg atccgtgacc gcgtttgcat tctcggcgac 960

gcggcgcatg cgtctcttcc tactatgggc cagggctttg gccaaggtct cgaagacgcc 1020

gttgcgctag cgactttgct cccgctagga acgcgtagaa cggatatccc cgctcgtcta 1080

gtggcgtatg aggggatgcg caagcctcgg accgagtgga ttgcacgcga atcgtttgag 1140

cagcaggccg tcgcggaaaa gcgcggcatt tacttgcgct ctatcgaaat gcgcgatgcg 1200

gttatggggt ataatgttcg cgaggaggct aagcgcgtct tgtccgagct cactaaatct 1260

gattgt 1266

<210> 28

<211> 422

<212> PRT

<213> Mycena chlorophos

<400> 28

Met Pro Ser Thr Ala Glu Ser Pro Gln Pro Leu Lys Ile Val Ile Val

1 5 10 15

Gly Ala Gly Leu Val Gly Leu Ala Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Glu

20 25 30

Gly His His Val Glu Ile Tyr Glu Ser Ser Thr Phe Lys Thr Glu Leu

35 40 45

Gly Ala Gly Leu Ala Ile Pro Cys Asn Thr Leu Arg Ser Leu Ile Glu

50 55 60

Leu Gly Cys Ile Val Ala Asn Leu Asn Pro Val Glu Asn Leu Cys Phe

65 70 75 80

Thr Ser Met Ala His Asp Gly Ser Glu Ser Gly Met Arg Ser Asp His

85 90 95

Thr Asp Tyr Glu Ala Arg Tyr Gly Thr Pro Trp Val Met Ala His Arg

100 105 110

Val Asp Ile His Ala Glu Leu Leu Arg Met Ala Thr Thr Ser Asp Ile

115 120 125

Pro Gly Pro Pro Ala Thr Leu His Leu Gly Gln Arg Val Leu Ala Cys

130 135 140

Asn Val Ser Asp Cys Ser Ile Ala Leu Ala Thr Gly Lys Thr Ile Ser

145 150 155 160

Ala Asp Leu Val Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Ala

165 170 175

Ala Val Leu Gly Glu Asp Ile His Ile Pro Ala Ser Gly Thr Ala Gly

180 185 190

Phe Arg Trp Leu Val Asp Ser Ala Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu

195 200 205

Asp Trp Ile Val Lys Ala Arg Pro Leu Gly Ala Arg Val Ile Ser Ala

210 215 220

Pro Met Gly Leu Ala Leu Glu Asp His Arg Thr Ile Val Ile Tyr Ala

225 230 235 240

Cys Arg Gly Gly Asn Leu Ile Asn Val Leu Ala Val His Glu Asp Lys

245 250 255

Arg Asp Gln Glu Ala Val Pro Trp Asn Val Pro Leu Thr Arg Glu Ala

260 265 270

Leu Leu Asp Phe Phe Ser Asp Tyr His Pro Arg Phe Arg Arg Leu Phe

275 280 285

Glu Leu Ala Pro Val Asp Gly Ile His Val Trp Gln Met Arg Val Val

290 295 300

Pro Pro Leu Ala Asn Trp Ile Arg Asp Arg Val Cys Ile Leu Gly Asp

305 310 315 320

Ala Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Met Gly Gln Gly Phe Gly Gln Gly

325 330 335

Leu Glu Asp Ala Val Ala Leu Ala Thr Leu Leu Pro Leu Gly Thr Arg

340 345 350

Arg Thr Asp Ile Pro Ala Arg Leu Val Ala Tyr Glu Gly Met Arg Lys

355 360 365

Pro Arg Thr Glu Trp Ile Ala Arg Glu Ser Phe Glu Gln Gln Ala Val

370 375 380

Ala Glu Lys Arg Gly Ile Tyr Leu Arg Ser Ile Glu Met Arg Asp Ala

385 390 395 400

Val Met Gly Tyr Asn Val Arg Glu Glu Ala Lys Arg Val Leu Ser Glu

405 410 415

Leu Thr Lys Ser Asp Cys

420

<210> 29

<211> 72

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсусная последовательность аминокислот 1 для

гиспидин-гидроксилаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(72)

<223> X - любая аминокислота

<400> 29

Val Gly Ala Gly Leu Xaa Gly Xaa Xaa Ala Ala Xaa Xaa Leu Arg Arg

1 5 10 15

Xaa Gly His Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ser Xaa Phe Lys Xaa Glu

20 25 30

Xaa Gly Ala Gly Xaa Ala Xaa Pro Xaa Asn Thr Xaa Xaa Xaa Leu Xaa

35 40 45

Xaa Leu Gly Cys Xaa Xaa Xaa Asn Xaa Xaa Xaa Val Xaa Asn Leu Cys

50 55 60

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp Gly

65 70

<210> 30

<211> 33

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсусная последовательность аминокислот 2 для

гиспидин-гидроксилаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(33)

<223> X - любая аминокислота

<400> 30

Gly Met Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Tyr Xaa Xaa Xaa Tyr Gly Xaa Xaa

1 5 10 15

Trp Xaa Met Xaa His Arg Val Asp Xaa His Xaa Glu Leu Xaa Arg Xaa

20 25 30

Ala

<210> 31

<211> 96

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсусная последовательность аминокислот 3 для

гиспидин-гидроксилаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(96)

<223> X - любая аминокислота

<400> 31

Gly Pro Xaa Ala Xaa Leu Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Val Xaa Xaa Cys Xaa

1 5 10 15

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Ala

20 25 30

Asp Leu Xaa Xaa Gly Ala Asp Gly Ile Xaa Ser Xaa Xaa Arg Xaa Xaa

35 40 45

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa

50 55 60

Arg Trp Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Pro Glu Leu Asp

65 70 75 80

Trp Xaa Xaa Lys Xaa Xaa Pro Leu Gly Ala Arg Xaa Xaa Xaa Xaa Pro

85 90 95

<210> 32

<211> 57

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсусная последовательность аминокислот 4 для

гиспидин-гидроксилаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(57)

<223> X - любая аминокислота

<400> 32

Arg Thr Ile Xaa Xaa Tyr Ala Cys Arg Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asn Val

1 5 10 15

Leu Xaa Xaa His Xaa Asp Xaa Arg Xaa Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Trp Xaa

20 25 30

Xaa Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp Tyr His

35 40 45

Pro Arg Phe Xaa Xaa Leu Xaa Xaa Leu

50 55

<210> 33

<211> 83

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсусная последовательность аминокислот 5 для

гиспидин-гидроксилаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(82)

<223> X - любая аминоксилота

<400> 33

Trp Gln Xaa Arg Val Xaa Pro Xaa Leu Xaa Xaa Trp Xaa Xaa Xaa Xaa

1 5 10 15

Xaa Cys Xaa Xaa Gly Asp Xaa Ala His Ala Ser Leu Pro Thr Xaa Gly

20 25 30

Gln Gly Phe Gly Xaa Gly Leu Glu Asp Ala Xaa Ala Leu Xaa Xaa Leu

35 40 45

Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Arg Leu Xaa Xaa

50 55 60

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Lys Xaa Arg Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Glu Ser

65 70 75 80

Xaa Glu Gln

<210> 34

<211> 4832

<212> DNA

<213> Neonothopanus nambi

<400> 34

aaaaccatcc ttatattctc gctttgatgc tggctgtatg gaaacttgga ggcaccttcg 60

ctcctattga tgtccattct cctgccgaat tggtagctgg catgctgaac atagtctctc 120

cttcttgctt ggttattccg agctcagatg taactaatca aactcttgcg tgcgatctta 180

atatccccgt cgttgcattt cacccacatc aatccactat tcctgagctg aacaagaagt 240

acctcaccga ttctcaaatt tctccggatc ttcctttttc agatccaaac cggcctgctc 300

tgtacctctt cacttcgtcc gccacttctc gaagtaatct caaatgcgtg cctctcactc 360

acacctttat cttacgcaac agcctctcga agcgtgcatg gtgcaagcgt atgcgtccag 420

agacagactt tgacggcata cgcgttcttg gatgggcccc gtggtctcac gtcctagcac 480

acatgcaaga catcggacca ctcaccttac ttaatgccgg atgctacgtt tttgcgacta 540

ctccatccac gtaccctacg gaattgaagg acgacaggga cctgatatct tgcgcggcaa 600

atgctatcat gtacaagggc gtcaagtcat ttgcttgtct tccctttgta ctcggagggc 660

tgaaggcatt atgcgagtct gagccatccg tgaaggcgca tctacaggtc gaggagagag 720

ctcaactcct gaagtctctg caacacatgg aaattcttga gtgtggaggt gccatgctcg 780

aagcaagtgt tgcgtcttgg gctattgaga actgcattcc catttcgatc ggtattggta 840

tgacggagac tggtggagcg ctctttgcag gccccgttca ggccatcaaa accgggtttt 900

cttcagagga taaattcatt gaagatgcta cttacttgct cgttaaggat gatcatgaga 960

gtcatgctga ggaggatatt aacgagggtg aactagttgt gaaaagtaaa atgctcccac 1020

gaggctacct tggctatagt gatccttcct tctcagtcga cgatgctggc tgggttacat 1080

ttagaacagg agacagatac agcgttacac ctgacggaaa gttttcctgg ctgggccgga 1140

acactgattt cattcagatg accagtggtg agacgctgga tccccgacca attgagagct 1200

cgctctgcga aagttctctt atttctagag catgcgttat cggagataaa tttctcaacg 1260

ggcctgctgc tgctgtttgt gcgatcattg agcttgagcc cacagcggtg gaaaaaggac 1320

aagctcactc gcgtgagata gcaagagttt tcgcacctat taatcgagac ctaccgcctc 1380

ctcttaggat tgcatggtcg cacgttttgg ttctccagcc ctcggagaag ataccgatga 1440

cgaagaaggg taccatcttc cgcaagaaaa ttgagcaggt gtttggctct gcgttgggtg 1500

gcagctctgg agataactct caagccactg cggatgctgg cgttgttcga cgagacgagt 1560

tatcgaacac tgtcaagcac ataattagcc gtgttttagg agtttccgat gacgaattac 1620

tttggacgct atcatttgcg gagttaggaa tgacgtcagc actagccact cgcatcgcca 1680

acgagttgaa cgaagtttta gttggagtta atctccctat caacgcttgc tatatacatg 1740

tcgaccttcc ttctctaagc aatgccgtct atgcgaaact tgcacacctc aagttaccag 1800

atcgtactcc cgaacccagg caagcccctg tcgaaaactc tggtgggaag gagatcgttg 1860

tcgttggcca ggcctttcgt cttcctggct caataaacga tgtcgcctct cttcgagacg 1920

cattcctggc gagacaagca tcatccatta tcactgaaat accatccgat cgctgggacc 1980

acgccagctt ctatcccaag gatatacgtt tcaacaaggc tggccttgtg gatatagcca 2040

attatgatca tagctttttc ggactgacgg caaccgaagc gctctatctg tcgccaacta 2100

tgcgtctagc attagaagtt tcgtttgaag cgctagagaa tgctaatatc ccggtgtcac 2160

aactcaaggg ttcgcaaaca gcggtttatg ttgctactac agatgacgga tttgagaccc 2220

ttttgaatgc cgaggccggc tatgatgctt atacaagatt ctatggcact ggtcgagcag 2280

caagtacagc gagcgggcgc ataagctgtc ttcttgatgt ccatggaccc tctattactg 2340

ttgatacggc atgcagtgga ggggctgttt gtattgacca agcaatcgac tatctacaat 2400

catcgagtgc agcagacacc gctatcatat gtgctagtaa cacgcactgc tggccaggct 2460

cgttcaggtt tctttccgca caagggatgg tatccccagg aggacgatgc gcgacattta 2520

caactgatgc tgatggctac gtgccctctg agggcgcggt cgccttcata ttgaaaaccc 2580

gagaagcagc tatgcgtgac aaggacacta tcctcgcgac aatcaaagcg acacagatat 2640

cgcacaatgg ccgatctcaa ggtcttgtgg caccgaatgt caactcgcaa gctgaccttc 2700

atcgctcgtt gcttcaaaaa gctggcctta gcccggctga tatccgtttc attgaagctc 2760

atgggacagg aacgtcactg ggagacctct cagaaattca agctataaat gatgcttata 2820

cctcctctca gccgcgcacg accggcccac tcatagtcag cgcttccaaa acggtcattg 2880

gtcataccga accagctggc cccttggtcg gtatgctgtc ggtcttgaac tctttcaaag 2940

aaggcgccgt ccctggtctc gcccatctta ccgcagacaa tttgaatccc tcgctggact 3000

gttcttctgt gccacttctc attccctatc aacctgttca cctggctgca cccaagcctc 3060

accgagctgc tgtaaggtca tacggctttt caggtaccct gggcggcatc gttctagagg 3120

ctcctgacga agaaagatta gaagaagagc tgccaaatga caagcccatg ttgttcgtcg 3180

tcagcgcaaa gacacataca gcactaatcg aatacctggg gcggtatctc gagttcctct 3240

tgcaggcgaa cccccaagat ttttgtgaca tttgttatac aagctgcgtt gggcgggagc 3300

actatagata tcgctatgct tgtgtagcaa atgatatgga ggacctcata ggccaactcc 3360

agaaacgttt gggcagcaag gtgccgccaa agccgtcata caaacgcggt gctttggcct 3420

ttgccttttc tggtcagggt acacaattcc gagggatggc gacagagctt gcaaaagcgt 3480

actccggctt ccgaaagatc gtgtcggatc tcgcaaagag agctagcgag ttgtcaggtc 3540

atgccattga ccgttttctt cttgcatatg acataggcgc tgaaaatgta gctcctgata 3600

gtgaggcaga ccagatttgc atctttgtgt atcagtgttc tgtccttcgc tggctgcaga 3660

ctatggggat tagacccagt gcagtgatag gccatagcct cggggagatc tcagcttctg 3720

tggcggcagg agcactttct cttgactccg ctttggatct tgtcatctca cgagctcgcc 3780

ttttgcgctc ttcggcaagt gctcctgcag gaatggcagc tatgtctgcc tcgcaagacg 3840

aggttgtgga gttgattggg aaactagacc tcgacaaggc taattcgctc agcgtttcgg 3900

tcataaatgg tccccaaaat actgtcgtgt ccggctcttc agcggctatt gaaagcatag 3960

tggctttagc gaaagggaga aagatcaaag cgtctgccct gaatatcaat caagcttttc 4020

atagtccata cgtcgacagt gccgtccctg gtctccgtgc ttggtcagaa aagcatatct 4080

cctcagctcg gccattgcaa attccgctgt attcaacgtt gttgggagca caaatctctg 4140

agggagagat gttgaatcca gatcactggg tcgaccatgc acggaagcct gtacagttcg 4200

cacaagcagc cacaaccatg aaagaatcct tcaccggagt catcatagat atcggccctc 4260

aagtagtggc ttggtcactt ctgctctcga acgggctcac gtccgtgact gcgctcgctg 4320

cgaaaagagg gagaagtcaa caggtggctt tcttaagcgc cttggcggat ttgtatcaag 4380

attacggtgt tgttcctgat tttgtcgggc tttatgctca gcaggaagat gcttcgaggt 4440

tgaagaagac ggatatcttg acgtatccgt tccagcgggg cgaagagact ctttctagtg 4500

gttctagcac tccgacattg gaaaacacgg atttggattc cggtaaggaa ttacttatgg 4560

gaccgactcg ggggttgtta cgcgcggacg acttgcgtga cagtatcgtt tcttctgtga 4620

aggatgttct ggaactcaag tcaaatgaag acctcgattt gtctgaaagt ctgaatgcgc 4680

ttggtatgga ctcgatcatg ttcgctcagt tacggaagcg tattggggaa ggactcggat 4740

tgaatgttcc gatggttttt ctgtcggacg cgttttctat tggtgagatg gttagtaatc 4800

ttgtggaaca ggcggaggcg tctgaggaca at 4832

<210> 35

<211> 1678

<212> PRT

<213> Neonothopanus nambi

<400> 35

Met Asn Ser Ser Lys Asn Pro Pro Ser Thr Leu Leu Asp Val Phe Leu

1 5 10 15

Asp Thr Ala Arg Asn Leu Asp Thr Ala Leu Arg Asn Val Leu Glu Cys

20 25 30

Gly Glu His Arg Trp Ser Tyr Arg Glu Leu Asp Thr Val Ser Ser Ala

35 40 45

Leu Ala Gln His Leu Arg Tyr Thr Val Gly Leu Ser Pro Thr Val Ala

50 55 60

Val Ile Ser Glu Asn His Pro Tyr Ile Leu Ala Leu Met Leu Ala Val

65 70 75 80

Trp Lys Leu Gly Gly Thr Phe Ala Pro Ile Asp Val His Ser Pro Ala

85 90 95

Glu Leu Val Ala Gly Met Leu Asn Ile Val Ser Pro Ser Cys Leu Val

100 105 110

Ile Pro Ser Ser Asp Val Thr Asn Gln Thr Leu Ala Cys Asp Leu Asn

115 120 125

Ile Pro Val Val Ala Phe His Pro His Gln Ser Thr Ile Pro Glu Leu

130 135 140

Asn Lys Lys Tyr Leu Thr Asp Ser Gln Ile Ser Pro Asp Leu Pro Phe

145 150 155 160

Ser Asp Pro Asn Arg Pro Ala Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Thr

165 170 175

Ser Arg Ser Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Thr Phe Ile Leu

180 185 190

Arg Asn Ser Leu Ser Lys Arg Ala Trp Cys Lys Arg Met Arg Pro Glu

195 200 205

Thr Asp Phe Asp Gly Ile Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His

210 215 220

Val Leu Ala His Met Gln Asp Ile Gly Pro Leu Thr Leu Leu Asn Ala

225 230 235 240

Gly Cys Tyr Val Phe Ala Thr Thr Pro Ser Thr Tyr Pro Thr Glu Leu

245 250 255

Lys Asp Asp Arg Asp Leu Ile Ser Cys Ala Ala Asn Ala Ile Met Tyr

260 265 270

Lys Gly Val Lys Ser Phe Ala Cys Leu Pro Phe Val Leu Gly Gly Leu

275 280 285

Lys Ala Leu Cys Glu Ser Glu Pro Ser Val Lys Ala His Leu Gln Val

290 295 300

Glu Glu Arg Ala Gln Leu Leu Lys Ser Leu Gln His Met Glu Ile Leu

305 310 315 320

Glu Cys Gly Gly Ala Met Leu Glu Ala Ser Val Ala Ser Trp Ala Ile

325 330 335

Glu Asn Cys Ile Pro Ile Ser Ile Gly Ile Gly Met Thr Glu Thr Gly

340 345 350

Gly Ala Leu Phe Ala Gly Pro Val Gln Ala Ile Lys Thr Gly Phe Ser

355 360 365

Ser Glu Asp Lys Phe Ile Glu Asp Ala Thr Tyr Leu Leu Val Lys Asp

370 375 380

Asp His Glu Ser His Ala Glu Glu Asp Ile Asn Glu Gly Glu Leu Val

385 390 395 400

Val Lys Ser Lys Met Leu Pro Arg Gly Tyr Leu Gly Tyr Ser Asp Pro

405 410 415

Ser Phe Ser Val Asp Asp Ala Gly Trp Val Thr Phe Arg Thr Gly Asp

420 425 430

Arg Tyr Ser Val Thr Pro Asp Gly Lys Phe Ser Trp Leu Gly Arg Asn

435 440 445

Thr Asp Phe Ile Gln Met Thr Ser Gly Glu Thr Leu Asp Pro Arg Pro

450 455 460

Ile Glu Ser Ser Leu Cys Glu Ser Ser Leu Ile Ser Arg Ala Cys Val

465 470 475 480

Ile Gly Asp Lys Phe Leu Asn Gly Pro Ala Ala Ala Val Cys Ala Ile

485 490 495

Ile Glu Leu Glu Pro Thr Ala Val Glu Lys Gly Gln Ala His Ser Arg

500 505 510

Glu Ile Ala Arg Val Phe Ala Pro Ile Asn Arg Asp Leu Pro Pro Pro

515 520 525

Leu Arg Ile Ala Trp Ser His Val Leu Val Leu Gln Pro Ser Glu Lys

530 535 540

Ile Pro Met Thr Lys Lys Gly Thr Ile Phe Arg Lys Lys Ile Glu Gln

545 550 555 560

Val Phe Gly Ser Ala Leu Gly Gly Ser Ser Gly Asp Asn Ser Gln Ala

565 570 575

Thr Ala Asp Ala Gly Val Val Arg Arg Asp Glu Leu Ser Asn Thr Val

580 585 590

Lys His Ile Ile Ser Arg Val Leu Gly Val Ser Asp Asp Glu Leu Leu

595 600 605

Trp Thr Leu Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Ala Leu Ala Thr

610 615 620

Arg Ile Ala Asn Glu Leu Asn Glu Val Leu Val Gly Val Asn Leu Pro

625 630 635 640

Ile Asn Ala Cys Tyr Ile His Val Asp Leu Pro Ser Leu Ser Asn Ala

645 650 655

Val Tyr Ala Lys Leu Ala His Leu Lys Leu Pro Asp Arg Thr Pro Glu

660 665 670

Pro Arg Gln Ala Pro Val Glu Asn Ser Gly Gly Lys Glu Ile Val Val

675 680 685

Val Gly Gln Ala Phe Arg Leu Pro Gly Ser Ile Asn Asp Val Ala Ser

690 695 700

Leu Arg Asp Ala Phe Leu Ala Arg Gln Ala Ser Ser Ile Ile Thr Glu

705 710 715 720

Ile Pro Ser Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro Lys Asp Ile

725 730 735

Arg Phe Asn Lys Ala Gly Leu Val Asp Ile Ala Asn Tyr Asp His Ser

740 745 750

Phe Phe Gly Leu Thr Ala Thr Glu Ala Leu Tyr Leu Ser Pro Thr Met

755 760 765

Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn Ile

770 775 780

Pro Val Ser Gln Leu Lys Gly Ser Gln Thr Ala Val Tyr Val Ala Thr

785 790 795 800

Thr Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Glu Ala Gly Tyr Asp

805 810 815

Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Ala Ser Thr Ala Ser

820 825 830

Gly Arg Ile Ser Cys Leu Leu Asp Val His Gly Pro Ser Ile Thr Val

835 840 845

Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ala Val Cys Ile Asp Gln Ala Ile Asp

850 855 860

Tyr Leu Gln Ser Ser Ser Ala Ala Asp Thr Ala Ile Ile Cys Ala Ser

865 870 875 880

Asn Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Arg Phe Leu Ser Ala Gln Gly

885 890 895

Met Val Ser Pro Gly Gly Arg Cys Ala Thr Phe Thr Thr Asp Ala Asp

900 905 910

Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys Thr Arg

915 920 925

Glu Ala Ala Met Arg Asp Lys Asp Thr Ile Leu Ala Thr Ile Lys Ala

930 935 940

Thr Gln Ile Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn

945 950 955 960

Val Asn Ser Gln Ala Asp Leu His Arg Ser Leu Leu Gln Lys Ala Gly

965 970 975

Leu Ser Pro Ala Asp Ile Arg Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr

980 985 990

Ser Leu Gly Asp Leu Ser Glu Ile Gln Ala Ile Asn Asp Ala Tyr Thr

995 1000 1005

Ser Ser Gln Pro Arg Thr Thr Gly Pro Leu Ile Val Ser Ala Ser

1010 1015 1020

Lys Thr Val Ile Gly His Thr Glu Pro Ala Gly Pro Leu Val Gly

1025 1030 1035

Met Leu Ser Val Leu Asn Ser Phe Lys Glu Gly Ala Val Pro Gly

1040 1045 1050

Leu Ala His Leu Thr Ala Asp Asn Leu Asn Pro Ser Leu Asp Cys

1055 1060 1065

Ser Ser Val Pro Leu Leu Ile Pro Tyr Gln Pro Val His Leu Ala

1070 1075 1080

Ala Pro Lys Pro His Arg Ala Ala Val Arg Ser Tyr Gly Phe Ser

1085 1090 1095

Gly Thr Leu Gly Gly Ile Val Leu Glu Ala Pro Asp Glu Glu Arg

1100 1105 1110

Leu Glu Glu Glu Leu Pro Asn Asp Lys Pro Met Leu Phe Val Val

1115 1120 1125

Ser Ala Lys Thr His Thr Ala Leu Ile Glu Tyr Leu Gly Arg Tyr

1130 1135 1140

Leu Glu Phe Leu Leu Gln Ala Asn Pro Gln Asp Phe Cys Asp Ile

1145 1150 1155

Cys Tyr Thr Ser Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Arg Tyr Arg Tyr

1160 1165 1170

Ala Cys Val Ala Asn Asp Met Glu Asp Leu Ile Gly Gln Leu Gln

1175 1180 1185

Lys Arg Leu Gly Ser Lys Val Pro Pro Lys Pro Ser Tyr Lys Arg

1190 1195 1200

Gly Ala Leu Ala Phe Ala Phe Ser Gly Gln Gly Thr Gln Phe Arg

1205 1210 1215

Gly Met Ala Thr Glu Leu Ala Lys Ala Tyr Ser Gly Phe Arg Lys

1220 1225 1230

Ile Val Ser Asp Leu Ala Lys Arg Ala Ser Glu Leu Ser Gly His

1235 1240 1245

Ala Ile Asp Arg Phe Leu Leu Ala Tyr Asp Ile Gly Ala Glu Asn

1250 1255 1260

Val Ala Pro Asp Ser Glu Ala Asp Gln Ile Cys Ile Phe Val Tyr

1265 1270 1275

Gln Cys Ser Val Leu Arg Trp Leu Gln Thr Met Gly Ile Arg Pro

1280 1285 1290

Ser Ala Val Ile Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Ser Ala Ser Val

1295 1300 1305

Ala Ala Gly Ala Leu Ser Leu Asp Ser Ala Leu Asp Leu Val Ile

1310 1315 1320

Ser Arg Ala Arg Leu Leu Arg Ser Ser Ala Ser Ala Pro Ala Gly

1325 1330 1335

Met Ala Ala Met Ser Ala Ser Gln Asp Glu Val Val Glu Leu Ile

1340 1345 1350

Gly Lys Leu Asp Leu Asp Lys Ala Asn Ser Leu Ser Val Ser Val

1355 1360 1365

Ile Asn Gly Pro Gln Asn Thr Val Val Ser Gly Ser Ser Ala Ala

1370 1375 1380

Ile Glu Ser Ile Val Ala Leu Ala Lys Gly Arg Lys Ile Lys Ala

1385 1390 1395

Ser Ala Leu Asn Ile Asn Gln Ala Phe His Ser Pro Tyr Val Asp

1400 1405 1410

Ser Ala Val Pro Gly Leu Arg Ala Trp Ser Glu Lys His Ile Ser

1415 1420 1425

Ser Ala Arg Pro Leu Gln Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Leu Gly

1430 1435 1440

Ala Gln Ile Ser Glu Gly Glu Met Leu Asn Pro Asp His Trp Val

1445 1450 1455

Asp His Ala Arg Lys Pro Val Gln Phe Ala Gln Ala Ala Thr Thr

1460 1465 1470

Met Lys Glu Ser Phe Thr Gly Val Ile Ile Asp Ile Gly Pro Gln

1475 1480 1485

Val Val Ala Trp Ser Leu Leu Leu Ser Asn Gly Leu Thr Ser Val

1490 1495 1500

Thr Ala Leu Ala Ala Lys Arg Gly Arg Ser Gln Gln Val Ala Phe

1505 1510 1515

Leu Ser Ala Leu Ala Asp Leu Tyr Gln Asp Tyr Gly Val Val Pro

1520 1525 1530

Asp Phe Val Gly Leu Tyr Ala Gln Gln Glu Asp Ala Ser Arg Leu

1535 1540 1545

Lys Lys Thr Asp Ile Leu Thr Tyr Pro Phe Gln Arg Gly Glu Glu

1550 1555 1560

Thr Leu Ser Ser Gly Ser Ser Thr Pro Thr Leu Glu Asn Thr Asp

1565 1570 1575

Leu Asp Ser Gly Lys Glu Leu Leu Met Gly Pro Thr Arg Gly Leu

1580 1585 1590

Leu Arg Ala Asp Asp Leu Arg Asp Ser Ile Val Ser Ser Val Lys

1595 1600 1605

Asp Val Leu Glu Leu Lys Ser Asn Glu Asp Leu Asp Leu Ser Glu

1610 1615 1620

Ser Leu Asn Ala Leu Gly Met Asp Ser Ile Met Phe Ala Gln Leu

1625 1630 1635

Arg Lys Arg Ile Gly Glu Gly Leu Gly Leu Asn Val Pro Met Val

1640 1645 1650

Phe Leu Ser Asp Ala Phe Ser Ile Gly Glu Met Val Ser Asn Leu

1655 1660 1665

Val Glu Gln Ala Glu Ala Ser Glu Asp Asn

1670 1675

<210> 36

<211> 4512

<212> DNA

<213> Panellus stipticus

<400> 36

atgcctcctg ctccttcctc catccttgat gtgttcaccg agactgcata caatcctcgc 60

acctccaacc gtcctgtagt agaatgtggc gagcacctct ggacatactc acaacttgaa 120

gcagtttcca atgccatgtc gcaagacctg gagaactcga tcggtcttta cgcgaaggtc 180

gcttttgtcg gtgaaaacca tccatttgtt ttcgctctca tgcttgcggt ctggaaaatt 240

gctggcacat tcatccccat tgatgcgcac attcctcccg ccctcctaga tggcatggtc 300

gacattgtga agccgatgcg catctatgta tcatcggccg atacctctaa ttcctcctgg 360

gcctcagaac tcgcggtcga gtccaaactc gcgtggtggc gacgcatgca gccaagcatc 420

aacctagaca acacccgagt cctcggctgg gccccgtggt cgcatgtatt atcccacatg 480

caggacattg gcaccgctac cattctcacc gcaggctgtt acgtctttgc ctctatccct 540

tccacatatc agcttcagca ggcgccaaca gatcttacga cccaagtcat caacggtatc 600

ctcaataaaa acatctcggc gcttgctgcc cttccatttg ttttcggcgg tatcaaagca 660

gcgtgcgagt cgggcgatct ggatgtggag gcacttctgg gtgccctgcg ccgcatgacg 720

atgctcgaat gtggcggggc tgcgctcgac cctgcaattg caaattggac ggatataaat 780

ggtgtatcgc tcatggttgg gattggaatg acggaaacgg gtggtgcaat cttcgcgggg 840

agggcgaaag actcgctctc cgggtttctt gctgagggcc tgatctcaga tgccagaatt 900

gagcttgaca agggtaaatc tgatggctcg gatgagggag agcttgttgt cacaagcaag 960

ctacttccac atggctacat tggcttcgat gacgggtcat tttccgtgga tgcgcaaggg 1020

tgggtgacgt tcaagacaag ggattgctat cgtgtcaagg actcgaagtt tatttggcta 1080

ggccgggcca ctgattacat tcaggcgagc acatctctcc ttcctcagcg ctttaaacat 1140

gaactgcgct atcagatgac aagcggcgaa tcccttgacc cgcgtcccct cgaaaatttc 1200

ttacgctccg ccgagttcat ctccaatgtg tgcgtcatag gtgacaactt cctccggggt 1260

gcctccactt ctgtgtgggc cgttatcgag ctcacggaca gcgcgcaccg tctggatgcc 1320

gcttcagcga gaaagcaggt ggcgcgcgtg ctggcgccgc tcaatggtgg cctcccaccc 1380

gctctccgga tctcgatgtc ctcggtgttg atattgagcg gatcacagaa aattccgcgc 1440

acgaagaagg gcgaaatctt ccgtaagcag attgaggatc tgtttggtgc cgcgatgagc 1500

atgccgcctg aggctgagcc ggctctggag gatgaactaa caagtattgt tggaaatgtc 1560

ctcaacatat cggacagcga catgttgacc tcgatgactt ttgccgaact tggaatgacc 1620

tctgttctcg cagtaaaaat ctcagcaagg ctcaacgagc accttgctgg gcgggccgtc 1680

ctcccggcca acatctgtta catctacatc gatactccat cactgattgc cggcatccgg 1740

aacttccttt cgccggcatc ttctgatcaa gagccatcga actttgccac cacggcagac 1800

aagaaggacg aaatcgtcat cataggcaaa gccttccggc ttcccggcgg gatcaacgac 1860

gactctgctc tctgggctgc tcttatgggc aagaacgact ctgttattgc agacatcccg 1920

ccagaccgtt gggatcatgc tagcttctat cccgcccaca tctgcttgcg caaggccggg 1980

cttatagata tgtccagcta tgactatggg ttctttggcc tttcggcgac tgaggcgtac 2040

tatgtgtcgc ccaccatgcg cgcagcgctc gaggtggcgt tcgaagcgct ggaggatgcg 2100

aacatcccgg tgtcaagaat caaggggaca aatacgagtg tttttgttgc aacgaaagat 2160

gatggatttg agacattgct gaatgcggcg catggatttg atgatgctga cggatacgtc 2220

ccttcagaag gcgccgtcgc ttttatactg aagacacgga cggcggcgga gagggatggg 2280

gatcgaatta tggccatcat caaagccacg gaagtctcgc ataatggaag atctcaggga 2340

ctcgccgcgc cgaacgtcaa ggcgcaagcc gctcttcata gagcagtctt gcgcaaagct 2400

aagctcgacc ctctggacat ccatttcatt gaagcccacg gaactggaac accgctgggc 2460

gatctttgtg aaatacaagg cataaatgaa gcctttgtct ccgcacgtcc acgtgcggag 2520

gatccactca ttgtcagcgc ctcaaagtct tcccttgggc acaccgaacc ttcggctgga 2580

ttggttggga tgctatctgt gttgatggcc ttgaagcacg gcatcgtgcc tgggttgctc 2640

catctccgag cggacaatgc taaccaccaa ctggacctga cacaagttcc acttcgtata 2700

tcaccggaac ctgtagtcat cgccgcatcc aagccgcatc acgccatggt gctatcctat 2760

ggattttcag gtacattggc agacattgtt ttggagagtc cggaagaacc atcgtcccca 2820

aacccgggag ccgcgggccc aatgatattt gtcctcagcg cgaagacttc cgcggctctg 2880

tcggcatata tcaaggctta cattgcattt ctacagaatg cagacgcgca cgagttttac 2940

aacatctgct acaccgcctg cgttggaaga gaacattaca aacacagatt tgcttgcgtt 3000

gcaaatgacc ttgctgatct gattcgccaa ttacaagact gtgcgagtgc gctggctcca 3060

accaaaagta gtactggtgc cttggcgttc gcgttccctg gccaaggcgt gcaatttcca 3120

ggcatggccg ctgcacttgc taaaaggcat tccatatttc gcgactatgt catggaattc 3180

ggtgatagag cacaagatct ttgtggcttg cccatcgcaa agatgttgct ggacgtggat 3240

gcagcagagg aagaagatat ccacagtgac gtagaccaga tttgcgtctt tgtctatcag 3300

tattcgatgt gtcgatggct tagggagctc gggctcgagg caagtgcggt tatcgggcac 3360

agtttgggtg aaataacggc cgcacttatc ggggacgcat ttacatttga agtggctctc 3420

gatctcgttg tcactcgagg acggctactc cgcccttctc aagggaatcc aggcgggatg 3480

gctgcgctgg catgccccga ggagaatgtc ccggcgattt tggaccaatg tcgtgtggac 3540

agtaccatta gcgtctccgt tatcaatggt ccgaggagcc tttgtgtatc cggagcttcc 3600

aacgacatcg acgagtttgt caagatggca aaacggcaaa acatcaaagc gactcgactg 3660

agggtggacc aaggatttca tagccctcga gttgatagtg ccgcggttgg actgcgtgca 3720

tggtcaggtt ctttttccaa atcatttcag ccgttgcgca tcacattata ctctacttct 3780

ctgggtgctg caatctcgaa aggagagatt ttgaatcaga cgcattgggc cgatcacgtc 3840

cgccgtccgg tcatattctc aaaagcagca gcagccatcc tcgaggacaa gtccattggc 3900

gcgatcctgg atatcggacc acagacggtg gcatggtctc tccttctggc gaacggctgc 3960

aacgtcgcgt cagctgttgc cctgtccggc cgaagagtac aagatcagga aacagccttt 4020

ttatctgcac tggcgaatct gtatcaaaat cacggggtga cgccgaattt tcgcgtattt 4080

tatgctcacc aggcagtcca ggcgcgctat agaaccgtgg acatcccgaa gtatcccttc 4140

caacgccgac atcgatatcc atcctacatt ccatcgcgca atgccacggg tgccaacaga 4200

ctgaaagaac cattccgtag cgacctggat gaaccggctc aagacacgga gcacaccgcg 4260

gaactgagag tggacatgac tccggagaag ctccgggacg ccctgatgca ctgtgtgcgg 4320

gacacattgg aaggcgaaga ttttgatgaa tcggaatccc tcgtttcgcg tggaattgac 4380

tccattactt ttgcgggttt acggaagcgt gttcaagaac gacacggact taatctttcc 4440

atcattttct ggtctgatgg gttttctgtg aaagacatgg tcgacagcct catcgaacag 4500

cattttgtcc ac 4512

<210> 37

<211> 1504

<212> PRT

<213> Panellus stipticus

<400> 37

Met Pro Pro Ala Pro Ser Ser Ile Leu Asp Val Phe Thr Glu Thr Ala

1 5 10 15

Tyr Asn Pro Arg Thr Ser Asn Arg Pro Val Val Glu Cys Gly Glu His

20 25 30

Leu Trp Thr Tyr Ser Gln Leu Glu Ala Val Ser Asn Ala Met Ser Gln

35 40 45

Asp Leu Glu Asn Ser Ile Gly Leu Tyr Ala Lys Val Ala Phe Val Gly

50 55 60

Glu Asn His Pro Phe Val Phe Ala Leu Met Leu Ala Val Trp Lys Ile

65 70 75 80

Ala Gly Thr Phe Ile Pro Ile Asp Ala His Ile Pro Pro Ala Leu Leu

85 90 95

Asp Gly Met Val Asp Ile Val Lys Pro Met Arg Ile Tyr Val Ser Ser

100 105 110

Ala Asp Thr Ser Asn Ser Ser Trp Ala Ser Glu Leu Ala Val Glu Ser

115 120 125

Lys Leu Ala Trp Trp Arg Arg Met Gln Pro Ser Ile Asn Leu Asp Asn

130 135 140

Thr Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His Val Leu Ser His Met

145 150 155 160

Gln Asp Ile Gly Thr Ala Thr Ile Leu Thr Ala Gly Cys Tyr Val Phe

165 170 175

Ala Ser Ile Pro Ser Thr Tyr Gln Leu Gln Gln Ala Pro Thr Asp Leu

180 185 190

Thr Thr Gln Val Ile Asn Gly Ile Leu Asn Lys Asn Ile Ser Ala Leu

195 200 205

Ala Ala Leu Pro Phe Val Phe Gly Gly Ile Lys Ala Ala Cys Glu Ser

210 215 220

Gly Asp Leu Asp Val Glu Ala Leu Leu Gly Ala Leu Arg Arg Met Thr

225 230 235 240

Met Leu Glu Cys Gly Gly Ala Ala Leu Asp Pro Ala Ile Ala Asn Trp

245 250 255

Thr Asp Ile Asn Gly Val Ser Leu Met Val Gly Ile Gly Met Thr Glu

260 265 270

Thr Gly Gly Ala Ile Phe Ala Gly Arg Ala Lys Asp Ser Leu Ser Gly

275 280 285

Phe Leu Ala Glu Gly Leu Ile Ser Asp Ala Arg Ile Glu Leu Asp Lys

290 295 300

Gly Lys Ser Asp Gly Ser Asp Glu Gly Glu Leu Val Val Thr Ser Lys

305 310 315 320

Leu Leu Pro His Gly Tyr Ile Gly Phe Asp Asp Gly Ser Phe Ser Val

325 330 335

Asp Ala Gln Gly Trp Val Thr Phe Lys Thr Arg Asp Cys Tyr Arg Val

340 345 350

Lys Asp Ser Lys Phe Ile Trp Leu Gly Arg Ala Thr Asp Tyr Ile Gln

355 360 365

Ala Ser Thr Ser Leu Leu Pro Gln Arg Phe Lys His Glu Leu Arg Tyr

370 375 380

Gln Met Thr Ser Gly Glu Ser Leu Asp Pro Arg Pro Leu Glu Asn Phe

385 390 395 400

Leu Arg Ser Ala Glu Phe Ile Ser Asn Val Cys Val Ile Gly Asp Asn

405 410 415

Phe Leu Arg Gly Ala Ser Thr Ser Val Trp Ala Val Ile Glu Leu Thr

420 425 430

Asp Ser Ala His Arg Leu Asp Ala Ala Ser Ala Arg Lys Gln Val Ala

435 440 445

Arg Val Leu Ala Pro Leu Asn Gly Gly Leu Pro Pro Ala Leu Arg Ile

450 455 460

Ser Met Ser Ser Val Leu Ile Leu Ser Gly Ser Gln Lys Ile Pro Arg

465 470 475 480

Thr Lys Lys Gly Glu Ile Phe Arg Lys Gln Ile Glu Asp Leu Phe Gly

485 490 495

Ala Ala Met Ser Met Pro Pro Glu Ala Glu Pro Ala Leu Glu Asp Glu

500 505 510

Leu Thr Ser Ile Val Gly Asn Val Leu Asn Ile Ser Asp Ser Asp Met

515 520 525

Leu Thr Ser Met Thr Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Val Leu Ala

530 535 540

Val Lys Ile Ser Ala Arg Leu Asn Glu His Leu Ala Gly Arg Ala Val

545 550 555 560

Leu Pro Ala Asn Ile Cys Tyr Ile Tyr Ile Asp Thr Pro Ser Leu Ile

565 570 575

Ala Gly Ile Arg Asn Phe Leu Ser Pro Ala Ser Ser Asp Gln Glu Pro

580 585 590

Ser Asn Phe Ala Thr Thr Ala Asp Lys Lys Asp Glu Ile Val Ile Ile

595 600 605

Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Gly Ile Asn Asp Asp Ser Ala Leu

610 615 620

Trp Ala Ala Leu Met Gly Lys Asn Asp Ser Val Ile Ala Asp Ile Pro

625 630 635 640

Pro Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro Ala His Ile Cys Leu

645 650 655

Arg Lys Ala Gly Leu Ile Asp Met Ser Ser Tyr Asp Tyr Gly Phe Phe

660 665 670

Gly Leu Ser Ala Thr Glu Ala Tyr Tyr Val Ser Pro Thr Met Arg Ala

675 680 685

Ala Leu Glu Val Ala Phe Glu Ala Leu Glu Asp Ala Asn Ile Pro Val

690 695 700

Ser Arg Ile Lys Gly Thr Asn Thr Ser Val Phe Val Ala Thr Lys Asp

705 710 715 720

Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Ala His Gly Phe Asp Asp Ala

725 730 735

Asp Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys Thr

740 745 750

Arg Thr Ala Ala Glu Arg Asp Gly Asp Arg Ile Met Ala Ile Ile Lys

755 760 765

Ala Thr Glu Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Ala Ala Pro

770 775 780

Asn Val Lys Ala Gln Ala Ala Leu His Arg Ala Val Leu Arg Lys Ala

785 790 795 800

Lys Leu Asp Pro Leu Asp Ile His Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly

805 810 815

Thr Pro Leu Gly Asp Leu Cys Glu Ile Gln Gly Ile Asn Glu Ala Phe

820 825 830

Val Ser Ala Arg Pro Arg Ala Glu Asp Pro Leu Ile Val Ser Ala Ser

835 840 845

Lys Ser Ser Leu Gly His Thr Glu Pro Ser Ala Gly Leu Val Gly Met

850 855 860

Leu Ser Val Leu Met Ala Leu Lys His Gly Ile Val Pro Gly Leu Leu

865 870 875 880

His Leu Arg Ala Asp Asn Ala Asn His Gln Leu Asp Leu Thr Gln Val

885 890 895

Pro Leu Arg Ile Ser Pro Glu Pro Val Val Ile Ala Ala Ser Lys Pro

900 905 910

His His Ala Met Val Leu Ser Tyr Gly Phe Ser Gly Thr Leu Ala Asp

915 920 925

Ile Val Leu Glu Ser Pro Glu Glu Pro Ser Ser Pro Asn Pro Gly Ala

930 935 940

Ala Gly Pro Met Ile Phe Val Leu Ser Ala Lys Thr Ser Ala Ala Leu

945 950 955 960

Ser Ala Tyr Ile Lys Ala Tyr Ile Ala Phe Leu Gln Asn Ala Asp Ala

965 970 975

His Glu Phe Tyr Asn Ile Cys Tyr Thr Ala Cys Val Gly Arg Glu His

980 985 990

Tyr Lys His Arg Phe Ala Cys Val Ala Asn Asp Leu Ala Asp Leu Ile

995 1000 1005

Arg Gln Leu Gln Asp Cys Ala Ser Ala Leu Ala Pro Thr Lys Ser

1010 1015 1020

Ser Thr Gly Ala Leu Ala Phe Ala Phe Pro Gly Gln Gly Val Gln

1025 1030 1035

Phe Pro Gly Met Ala Ala Ala Leu Ala Lys Arg His Ser Ile Phe

1040 1045 1050

Arg Asp Tyr Val Met Glu Phe Gly Asp Arg Ala Gln Asp Leu Cys

1055 1060 1065

Gly Leu Pro Ile Ala Lys Met Leu Leu Asp Val Asp Ala Ala Glu

1070 1075 1080

Glu Glu Asp Ile His Ser Asp Val Asp Gln Ile Cys Val Phe Val

1085 1090 1095

Tyr Gln Tyr Ser Met Cys Arg Trp Leu Arg Glu Leu Gly Leu Glu

1100 1105 1110

Ala Ser Ala Val Ile Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ala

1115 1120 1125

Leu Ile Gly Asp Ala Phe Thr Phe Glu Val Ala Leu Asp Leu Val

1130 1135 1140

Val Thr Arg Gly Arg Leu Leu Arg Pro Ser Gln Gly Asn Pro Gly

1145 1150 1155

Gly Met Ala Ala Leu Ala Cys Pro Glu Glu Asn Val Pro Ala Ile

1160 1165 1170

Leu Asp Gln Cys Arg Val Asp Ser Thr Ile Ser Val Ser Val Ile

1175 1180 1185

Asn Gly Pro Arg Ser Leu Cys Val Ser Gly Ala Ser Asn Asp Ile

1190 1195 1200

Asp Glu Phe Val Lys Met Ala Lys Arg Gln Asn Ile Lys Ala Thr

1205 1210 1215

Arg Leu Arg Val Asp Gln Gly Phe His Ser Pro Arg Val Asp Ser

1220 1225 1230

Ala Ala Val Gly Leu Arg Ala Trp Ser Gly Ser Phe Ser Lys Ser

1235 1240 1245

Phe Gln Pro Leu Arg Ile Thr Leu Tyr Ser Thr Ser Leu Gly Ala

1250 1255 1260

Ala Ile Ser Lys Gly Glu Ile Leu Asn Gln Thr His Trp Ala Asp

1265 1270 1275

His Val Arg Arg Pro Val Ile Phe Ser Lys Ala Ala Ala Ala Ile

1280 1285 1290

Leu Glu Asp Lys Ser Ile Gly Ala Ile Leu Asp Ile Gly Pro Gln

1295 1300 1305

Thr Val Ala Trp Ser Leu Leu Leu Ala Asn Gly Cys Asn Val Ala

1310 1315 1320

Ser Ala Val Ala Leu Ser Gly Arg Arg Val Gln Asp Gln Glu Thr

1325 1330 1335

Ala Phe Leu Ser Ala Leu Ala Asn Leu Tyr Gln Asn His Gly Val

1340 1345 1350

Thr Pro Asn Phe Arg Val Phe Tyr Ala His Gln Ala Val Gln Ala

1355 1360 1365

Arg Tyr Arg Thr Val Asp Ile Pro Lys Tyr Pro Phe Gln Arg Arg

1370 1375 1380

His Arg Tyr Pro Ser Tyr Ile Pro Ser Arg Asn Ala Thr Gly Ala

1385 1390 1395

Asn Arg Leu Lys Glu Pro Phe Arg Ser Asp Leu Asp Glu Pro Ala

1400 1405 1410

Gln Asp Thr Glu His Thr Ala Glu Leu Arg Val Asp Met Thr Pro

1415 1420 1425

Glu Lys Leu Arg Asp Ala Leu Met His Cys Val Arg Asp Thr Leu

1430 1435 1440

Glu Gly Glu Asp Phe Asp Glu Ser Glu Ser Leu Val Ser Arg Gly

1445 1450 1455

Ile Asp Ser Ile Thr Phe Ala Gly Leu Arg Lys Arg Val Gln Glu

1460 1465 1470

Arg His Gly Leu Asn Leu Ser Ile Ile Phe Trp Ser Asp Gly Phe

1475 1480 1485

Ser Val Lys Asp Met Val Asp Ser Leu Ile Glu Gln His Phe Val

1490 1495 1500

His

<210> 38

<211> 4803

<212> DNA

<213> Panellus stipticus

<400> 38

atggcactgg tctctcccac ttgttcgtct cagatgcctc ctgctccttc ctccatcctt 60

gatgtgttca ccgagactgc atacaatcct cgcacctcca accgtcctgt agtagaatgt 120

ggcgagcacg tctggaccta ctcacaactt gaagcagttt ccaatgccat gtcgcaagac 180

ctggagaact cgatcggtct ttacgcgaag gtcgcttttg tcggtgaaaa ccatccattt 240

gttttcgctc tcatgcttgc agtctggaaa attgctggca cattcatccc cattgatgcg 300

cacattcctc ccgccctcct agatggcatg gtcgacattg tgaagccgat gtgcatctat 360

gtatcatcgg ccgatacctc taattcctcc tgggcctcag aactcgcggt cgaggttcgg 420

gtattccgtc cggaagaatc tacgattccg gctttgaacg aacactatgg aagatccagc 480

atcactcccg ctcagcatcg gccaatactc aacgtggtcc aggcagttcc cctgacacac 540

aaatttatcc tcagcaactg tcagtccaaa ctcgcgtggt ggcgacgcat gcagccaagc 600

atcaacctag acaacacccg agtcctcggc tgggccccgt ggtcgcatgt attatcccac 660

atgcaggaca ttggcaccgc taccattctc accgcaggct gttacgtctt tgcctctatc 720

ccttccacat atcagcttca gcaggcgcca acagatctta cgacccaagt catcaacggt 780

atcctcaata aaaacatctc ggcgcttgct gcccttccat ttgttttcgg cggtatcaaa 840

gcagcgtgcg agtcgggcga tctggatgtg gaggcacttc tgggtgccct gcgccgcatg 900

acgatgctcg aatgtggcgg ggctgcgctc gaccctgcaa ttgcaaattg gacggatata 960

aacggtgtat cgctcatggt tgggattgga atgacagaaa cgggcggtgc aatcttcgcg 1020

gggagggcga aagactcgct ctccgggttt cttgctgagg gtctgatctc agacgccaga 1080

attgagcttg acaagggtga atctgatggc tcggatggta cgacgttctc catcttctcg 1140

accactgccg gaattaaacc tgattgtcag agggagagct tgttgtcaca agcaagctac 1200

ttccacatgg ctacattggc ttcgatgacg ggtcattttc cgtggatgcg caagggtgac 1260

aacttcctcc ggggtgcctc cacttctgtg tgggccatta tcgagctcac ggacagcgcg 1320

caccgcctgg atgccgcttc agcgagaaag caggtggcgc gcgtactggc gccgctcaat 1380

ggtggcctcc cacccgctct ccggatctca atgtcctcgg tgttgatatt gagcggatca 1440

cagaaaattc cgcgcacgaa gaagggcgag atcttccgta agcagattga ggatctgttt 1500

ggtgccgcga tgagcatgcc gcctgaggct gagccggctc tggaggatga actaacaagt 1560

attgttggaa atgtcctcaa catatcggac agcgacatgt tgacctcgat gacttttgcc 1620

gaacttggaa tgacctctgt tctggcagta aaaatctcag caaggctcaa cgagcacctt 1680

gctgggcggg ccgtcctccc ggccaacatc tgttacatct acatcgatac tccatcactg 1740

attgccggca tccggaactt cctttcgccg acatcttctg atcaagagcc atcgaacttt 1800

gccaccacgg cagacaagaa ggacgagatc gtcatcatag gcaaagcctt tcggcttccc 1860

ggcgggatca acgacgactc tgctctctgg gctgctctta tgggcaagaa cgactctgtt 1920

attgcagaca tcccgccaga ccgttgggat catgctagct tctatcccgc ccacatctgc 1980

ttgcgcaagg ctgggcttat agatatgtcc agctatgact atgggttctt tggcctttcg 2040

gcgactgagg cgtactatgt gtcgcccacc atgcgcgcag cgctcgaggt ggcgttcgaa 2100

gcgctggagg atgcgaacat cccggtgtca agaattaagg ggacaaatac gagtgttttt 2160

gttgcaacga aagatgatgg atttgagaca ttgctgaatg cggcgcatgg atttgatgcg 2220

tatacccggt tctacgggac tgggcgggct ccaagtactg ccagtgggcg cataagctac 2280

cttcttgaca tccatgggcc ctcactcaca gtagatacgg cctgtagcgg aggaattgtc 2340

tgcattgatc aagatatacc agcgaattta tgtatcatag cgatcgcata cctccagtct 2400

ggcgccggtg aatcagccat cgaacgacaa tacaggtttc tcacggcgca gaacatggca 2460

tcgcccacta gccgctgttc caccttcact gcagatgctg acggatatgt cccttcagaa 2520

ggcgccgtcg cttttatact gaagacacgg actgcggcgg agagggatgg ggatcgaatt 2580

atggccatca tcaaagccac agaagtctcg cataatggaa gatctcaggg actcgccgcg 2640

ccgaacgtca aagcgcaagc cgctcttcat agagcagtct tgcgcaaagc taagctcgac 2700

cctctggaca tccatttcat tgaagcccac ggaactgttt taggaacacc gctgggtgat 2760

ctttgtgaaa tacaaggcat aaatgaagcc tttgtctccg cacgtccacg tgcggaggat 2820

ccactcattg tcagcgcctc caagtcttcc cttgggcaca ccgaaccttc ggctggattg 2880

gttgggatgc tatctgtgtt gatggccttg aagcacggca tcgtgcctgg gttgctccat 2940

ctccgagcgg acaatgctaa ccaccaactg gacctgacac gagtcccact gcgtatatca 3000

ccggaacctg tagtcatcgc cgcatccaag ccgcatcacg ccatggtgct gctcacagtc 3060

cgtacattgg cagacattgt tttggagagt ccggaagaac caccgtccca gaacccggga 3120

gccgcgggcc caatgatatt tgtcctcagc gcgaagactt ccgcggctct gtcggcatat 3180

atcaaggctt acattgcatt tctacagaat gcagacgcgc acgagtttta caacatctgc 3240

tacaccgcct gtgttggaag agaacattac aaacacagat ttgcttgcgt tgcaaatgac 3300

cttgctgatc tgattcgcca attacaagac tgtgcgagtg cgctggctcc aaccaaaagt 3360

agtactggtg ccttggcgtt cgcgttccct ggccaaggcg tgcaatttcc aggcatggcc 3420

gctgcacttg ctaaaaggca ttccatattt cgcgactatg tcatggaatt tggtcataga 3480

gcacaagatc tttgtggctt gcccatcgca aagatgttgc tggacgtgga tgcagcagag 3540

gaagaagata tccacagtga cgtagaccag atttgcgtct ttgtctatca gtattcgatg 3600

tgtcgatggc ttagggagct cgggctcgag gcaagtgcgg ttatcgggca cagtttgggc 3660

gaaataacag ccgcacttat cggggacgca tttacatttg aagtggctct cgatctcgtt 3720

gtcactcgag gacggctact ccgcccttct caagggaatc caggcgggat ggctgcgctg 3780

gcatgccccg aggagaatgt cccagcgatt ttggaccaat gtcgtgtgga cagtaccatt 3840

agcgtctccg ttatcaatgg tccgaggagc ctttgtgtat ccggagcttc caacgacatc 3900

gacgagtttg tcaagatggc aaaacggcaa aacatcaaag cgactcgact gagggtggac 3960

caaggatttc atagccctcg agttgatagt gccgcggttg gactgcgtga atggtcaggt 4020

tctttttcga aatcatttca gccgttgcgc atcacattat actctacgtc tctgggtgct 4080

gcaatctcga aaggagagat tttgactcag acacattggg ccgatcacgt ccgccgtccg 4140

gtcatattct caaaagcagc agcagccatc ctcgaggaca agtccattgg cgcgatcctg 4200

gatatcggac cacagacggt ggcatggtct ctccttctgg cgaacggctg caacgtcgcg 4260

tcagctgttg ccctgtccgg ccgaagagta caagatcagg aaacggcctt tttatctgca 4320

ctggcgaatc tgtatcaaaa tcacggggtg acgccgaatt ttcgcgtatt ttacgctcac 4380

caggcagtcc aggcgcgcta tagaaccgtg gacattccga agtatccctt ccaacgccga 4440

catcgatatc catcctacat tccatcgcgc aatgccacgg gtgccaacag actgaaagaa 4500

ccattccgta gcgacctgga tgaaccggct caagacacgg agcacaccgc ggaaatgaga 4560

gtggacatga ctccggagaa gctccgggac gccctgatgc actgtgtgcg ggacacactg 4620

gaaggcgaag attttgatga atcggaatcc ctcgtttcgc gtggaattga ctccattact 4680

tttgcgggtc tacggaagcg tgttcaagaa cgacacggac ttaatctttc catcattttc 4740

tggtctgatg ggttttctgt gaaagacatg gtcgacagcc tcatcgaaca gcattttgtc 4800

cac 4803

<210> 39

<211> 1601

<212> PRT

<213> Panellus stipticus

<400> 39

Met Ala Leu Val Ser Pro Thr Cys Ser Ser Gln Met Pro Pro Ala Pro

1 5 10 15

Ser Ser Ile Leu Asp Val Phe Thr Glu Thr Ala Tyr Asn Pro Arg Thr

20 25 30

Ser Asn Arg Pro Val Val Glu Cys Gly Glu His Val Trp Thr Tyr Ser

35 40 45

Gln Leu Glu Ala Val Ser Asn Ala Met Ser Gln Asp Leu Glu Asn Ser

50 55 60

Ile Gly Leu Tyr Ala Lys Val Ala Phe Val Gly Glu Asn His Pro Phe

65 70 75 80

Val Phe Ala Leu Met Leu Ala Val Trp Lys Ile Ala Gly Thr Phe Ile

85 90 95

Pro Ile Asp Ala His Ile Pro Pro Ala Leu Leu Asp Gly Met Val Asp

100 105 110

Ile Val Lys Pro Met Cys Ile Tyr Val Ser Ser Ala Asp Thr Ser Asn

115 120 125

Ser Ser Trp Ala Ser Glu Leu Ala Val Glu Val Arg Val Phe Arg Pro

130 135 140

Glu Glu Ser Thr Ile Pro Ala Leu Asn Glu His Tyr Gly Arg Ser Ser

145 150 155 160

Ile Thr Pro Ala Gln His Arg Pro Ile Leu Asn Val Val Gln Ala Val

165 170 175

Pro Leu Thr His Lys Phe Ile Leu Ser Asn Cys Gln Ser Lys Leu Ala

180 185 190

Trp Trp Arg Arg Met Gln Pro Ser Ile Asn Leu Asp Asn Thr Arg Val

195 200 205

Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His Val Leu Ser His Met Gln Asp Ile

210 215 220

Gly Thr Ala Thr Ile Leu Thr Ala Gly Cys Tyr Val Phe Ala Ser Ile

225 230 235 240

Pro Ser Thr Tyr Gln Leu Gln Gln Ala Pro Thr Asp Leu Thr Thr Gln

245 250 255

Val Ile Asn Gly Ile Leu Asn Lys Asn Ile Ser Ala Leu Ala Ala Leu

260 265 270

Pro Phe Val Phe Gly Gly Ile Lys Ala Ala Cys Glu Ser Gly Asp Leu

275 280 285

Asp Val Glu Ala Leu Leu Gly Ala Leu Arg Arg Met Thr Met Leu Glu

290 295 300

Cys Gly Gly Ala Ala Leu Asp Pro Ala Ile Ala Asn Trp Thr Asp Ile

305 310 315 320

Asn Gly Val Ser Leu Met Val Gly Ile Gly Met Thr Glu Thr Gly Gly

325 330 335

Ala Ile Phe Ala Gly Arg Ala Lys Asp Ser Leu Ser Gly Phe Leu Ala

340 345 350

Glu Gly Leu Ile Ser Asp Ala Arg Ile Glu Leu Asp Lys Gly Glu Ser

355 360 365

Asp Gly Ser Asp Gly Thr Thr Phe Ser Ile Phe Ser Thr Thr Ala Gly

370 375 380

Ile Lys Pro Asp Cys Gln Arg Glu Ser Leu Leu Ser Gln Ala Ser Tyr

385 390 395 400

Phe His Met Ala Thr Leu Ala Ser Met Thr Gly His Phe Pro Trp Met

405 410 415

Arg Lys Gly Asp Asn Phe Leu Arg Gly Ala Ser Thr Ser Val Trp Ala

420 425 430

Ile Ile Glu Leu Thr Asp Ser Ala His Arg Leu Asp Ala Ala Ser Ala

435 440 445

Arg Lys Gln Val Ala Arg Val Leu Ala Pro Leu Asn Gly Gly Leu Pro

450 455 460

Pro Ala Leu Arg Ile Ser Met Ser Ser Val Leu Ile Leu Ser Gly Ser

465 470 475 480

Gln Lys Ile Pro Arg Thr Lys Lys Gly Glu Ile Phe Arg Lys Gln Ile

485 490 495

Glu Asp Leu Phe Gly Ala Ala Met Ser Met Pro Pro Glu Ala Glu Pro

500 505 510

Ala Leu Glu Asp Glu Leu Thr Ser Ile Val Gly Asn Val Leu Asn Ile

515 520 525

Ser Asp Ser Asp Met Leu Thr Ser Met Thr Phe Ala Glu Leu Gly Met

530 535 540

Thr Ser Val Leu Ala Val Lys Ile Ser Ala Arg Leu Asn Glu His Leu

545 550 555 560

Ala Gly Arg Ala Val Leu Pro Ala Asn Ile Cys Tyr Ile Tyr Ile Asp

565 570 575

Thr Pro Ser Leu Ile Ala Gly Ile Arg Asn Phe Leu Ser Pro Thr Ser

580 585 590

Ser Asp Gln Glu Pro Ser Asn Phe Ala Thr Thr Ala Asp Lys Lys Asp

595 600 605

Glu Ile Val Ile Ile Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Gly Ile Asn

610 615 620

Asp Asp Ser Ala Leu Trp Ala Ala Leu Met Gly Lys Asn Asp Ser Val

625 630 635 640

Ile Ala Asp Ile Pro Pro Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro

645 650 655

Ala His Ile Cys Leu Arg Lys Ala Gly Leu Ile Asp Met Ser Ser Tyr

660 665 670

Asp Tyr Gly Phe Phe Gly Leu Ser Ala Thr Glu Ala Tyr Tyr Val Ser

675 680 685

Pro Thr Met Arg Ala Ala Leu Glu Val Ala Phe Glu Ala Leu Glu Asp

690 695 700

Ala Asn Ile Pro Val Ser Arg Ile Lys Gly Thr Asn Thr Ser Val Phe

705 710 715 720

Val Ala Thr Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Ala His

725 730 735

Gly Phe Asp Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser

740 745 750

Thr Ala Ser Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu Asp Ile His Gly Pro Ser

755 760 765

Leu Thr Val Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile Val Cys Ile Asp Gln

770 775 780

Asp Ile Pro Ala Asn Leu Cys Ile Ile Ala Ile Ala Tyr Leu Gln Ser

785 790 795 800

Gly Ala Gly Glu Ser Ala Ile Glu Arg Gln Tyr Arg Phe Leu Thr Ala

805 810 815

Gln Asn Met Ala Ser Pro Thr Ser Arg Cys Ser Thr Phe Thr Ala Asp

820 825 830

Ala Asp Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys

835 840 845

Thr Arg Thr Ala Ala Glu Arg Asp Gly Asp Arg Ile Met Ala Ile Ile

850 855 860

Lys Ala Thr Glu Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Ala Ala

865 870 875 880

Pro Asn Val Lys Ala Gln Ala Ala Leu His Arg Ala Val Leu Arg Lys

885 890 895

Ala Lys Leu Asp Pro Leu Asp Ile His Phe Ile Glu Ala His Gly Thr

900 905 910

Val Leu Gly Thr Pro Leu Gly Asp Leu Cys Glu Ile Gln Gly Ile Asn

915 920 925

Glu Ala Phe Val Ser Ala Arg Pro Arg Ala Glu Asp Pro Leu Ile Val

930 935 940

Ser Ala Ser Lys Ser Ser Leu Gly His Thr Glu Pro Ser Ala Gly Leu

945 950 955 960

Val Gly Met Leu Ser Val Leu Met Ala Leu Lys His Gly Ile Val Pro

965 970 975

Gly Leu Leu His Leu Arg Ala Asp Asn Ala Asn His Gln Leu Asp Leu

980 985 990

Thr Arg Val Pro Leu Arg Ile Ser Pro Glu Pro Val Val Ile Ala Ala

995 1000 1005

Ser Lys Pro His His Ala Met Val Leu Leu Thr Val Arg Thr Leu

1010 1015 1020

Ala Asp Ile Val Leu Glu Ser Pro Glu Glu Pro Pro Ser Gln Asn

1025 1030 1035

Pro Gly Ala Ala Gly Pro Met Ile Phe Val Leu Ser Ala Lys Thr

1040 1045 1050

Ser Ala Ala Leu Ser Ala Tyr Ile Lys Ala Tyr Ile Ala Phe Leu

1055 1060 1065

Gln Asn Ala Asp Ala His Glu Phe Tyr Asn Ile Cys Tyr Thr Ala

1070 1075 1080

Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Lys His Arg Phe Ala Cys Val Ala

1085 1090 1095

Asn Asp Leu Ala Asp Leu Ile Arg Gln Leu Gln Asp Cys Ala Ser

1100 1105 1110

Ala Leu Ala Pro Thr Lys Ser Ser Thr Gly Ala Leu Ala Phe Ala

1115 1120 1125

Phe Pro Gly Gln Gly Val Gln Phe Pro Gly Met Ala Ala Ala Leu

1130 1135 1140

Ala Lys Arg His Ser Ile Phe Arg Asp Tyr Val Met Glu Phe Gly

1145 1150 1155

His Arg Ala Gln Asp Leu Cys Gly Leu Pro Ile Ala Lys Met Leu

1160 1165 1170

Leu Asp Val Asp Ala Ala Glu Glu Glu Asp Ile His Ser Asp Val

1175 1180 1185

Asp Gln Ile Cys Val Phe Val Tyr Gln Tyr Ser Met Cys Arg Trp

1190 1195 1200

Leu Arg Glu Leu Gly Leu Glu Ala Ser Ala Val Ile Gly His Ser

1205 1210 1215

Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ala Leu Ile Gly Asp Ala Phe Thr Phe

1220 1225 1230

Glu Val Ala Leu Asp Leu Val Val Thr Arg Gly Arg Leu Leu Arg

1235 1240 1245

Pro Ser Gln Gly Asn Pro Gly Gly Met Ala Ala Leu Ala Cys Pro

1250 1255 1260

Glu Glu Asn Val Pro Ala Ile Leu Asp Gln Cys Arg Val Asp Ser

1265 1270 1275

Thr Ile Ser Val Ser Val Ile Asn Gly Pro Arg Ser Leu Cys Val

1280 1285 1290

Ser Gly Ala Ser Asn Asp Ile Asp Glu Phe Val Lys Met Ala Lys

1295 1300 1305

Arg Gln Asn Ile Lys Ala Thr Arg Leu Arg Val Asp Gln Gly Phe

1310 1315 1320

His Ser Pro Arg Val Asp Ser Ala Ala Val Gly Leu Arg Glu Trp

1325 1330 1335

Ser Gly Ser Phe Ser Lys Ser Phe Gln Pro Leu Arg Ile Thr Leu

1340 1345 1350

Tyr Ser Thr Ser Leu Gly Ala Ala Ile Ser Lys Gly Glu Ile Leu

1355 1360 1365

Thr Gln Thr His Trp Ala Asp His Val Arg Arg Pro Val Ile Phe

1370 1375 1380

Ser Lys Ala Ala Ala Ala Ile Leu Glu Asp Lys Ser Ile Gly Ala

1385 1390 1395

Ile Leu Asp Ile Gly Pro Gln Thr Val Ala Trp Ser Leu Leu Leu

1400 1405 1410

Ala Asn Gly Cys Asn Val Ala Ser Ala Val Ala Leu Ser Gly Arg

1415 1420 1425

Arg Val Gln Asp Gln Glu Thr Ala Phe Leu Ser Ala Leu Ala Asn

1430 1435 1440

Leu Tyr Gln Asn His Gly Val Thr Pro Asn Phe Arg Val Phe Tyr

1445 1450 1455

Ala His Gln Ala Val Gln Ala Arg Tyr Arg Thr Val Asp Ile Pro

1460 1465 1470

Lys Tyr Pro Phe Gln Arg Arg His Arg Tyr Pro Ser Tyr Ile Pro

1475 1480 1485

Ser Arg Asn Ala Thr Gly Ala Asn Arg Leu Lys Glu Pro Phe Arg

1490 1495 1500

Ser Asp Leu Asp Glu Pro Ala Gln Asp Thr Glu His Thr Ala Glu

1505 1510 1515

Met Arg Val Asp Met Thr Pro Glu Lys Leu Arg Asp Ala Leu Met

1520 1525 1530

His Cys Val Arg Asp Thr Leu Glu Gly Glu Asp Phe Asp Glu Ser

1535 1540 1545

Glu Ser Leu Val Ser Arg Gly Ile Asp Ser Ile Thr Phe Ala Gly

1550 1555 1560

Leu Arg Lys Arg Val Gln Glu Arg His Gly Leu Asn Leu Ser Ile

1565 1570 1575

Ile Phe Trp Ser Asp Gly Phe Ser Val Lys Asp Met Val Asp Ser

1580 1585 1590

Leu Ile Glu Gln His Phe Val His

1595 1600

<210> 40

<211> 5073

<212> DNA

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 40

atgaattcca aagtgaatct tccctccact ttgcttgatg ttttcctcga gatcgctggc 60

gagccatcta ccgcttcgcg tgatgttttg gaatgtggcg agcacagatg gacttaccag 120

cagcttgacg ttgtttcatc tgctttagcc cagcatctca agtacactgt cggtctatct 180

cctacagtcg cagtgatcag cgaaaatcat ccttatgttt ttgccttgat cctggctgtg 240

tggaaagttg ggggcatttt cgcgcccctc gacgcacatg ctcctgctga gttggtagct 300

ggcatgttaa gcataatctc tccttcgtgc ttagtacttc agagcacaga tgtagctaat 360

caaactcttg cgtgtgatct cgatattcct gttgaggtat tccactcgcg tcaatccact 420

attcctgaac taaacaagaa atatctcacc gattctgggt taccggcggg ttttccgctc 480

tcagattcaa acaaaccggc tctgtatctc ttcacctcgt ctgccacttc tcggagcaat 540

cttaaatgcg tgcctctcac tcacgctttc atcctgagca atagcctctc gaaacgcgca 600

tggtgccaac gtatgcggcc agagacagac ttcgatggca tacgcgttct tggatgggct 660

ccatggtctc atgtcttggc gcacatgcag gacatcgggc ccgtcacttt actcaatgct 720

ggatgctacg tctttgctac tatcccttcc tcgtacccca cggatgtgca gagtgacagc 780

aatttgatat ctcatgtcgc aaatgctatc atacacaagg gtgtaaaatc gtttgcttgt 840

ctcccttttg tactcggagg gctgaaagca ttatgcgagt ccaagccatc cgtcaaagca 900

gatctacagg tcgaagagca agctcagctt ttgatctctc taaggcgcat ggaaattctt 960

gaatgcggag gtgcgatgct cgaagcgaat gttgcgtctt gggctatcga gaatcatatt 1020

ccggtctcta ttggtatcgg tatgacagaa actggtggcg cgcttttcgc tggacctgtt 1080

caggatatcc ggaccggttt ttctgcggac aataaattca tcaaggacgc tacctacttc 1140

ctagttgcaa atggagatga atctgggaac gatgtaactg aaggggagct agttgtgaaa 1200

agtaaaatgc tcccgcgagg ctatcttggc tacaatgatt cttccttttc cgttgacgat 1260

gacggattgg ttacgttcaa gacaggcgac agatacagtg ttacacgcga cggaagattc 1320

tcttggctag gcaggaatac tgatttcatt cagatgacta gtggagagac attagatccc 1380

cgacctgtcg agagttcgct ctgccaaagt cctctcatct ctcaagcatg cgttattgga 1440

gacaagtttc tcaacgggcc tgccactgct gtttgcgcga tcgttgagct tgagccgaca 1500

atggtagaaa cgggagaggc taactcgcgg gacatagtcc aagtctttgc acccatcaac 1560

cgagacctgc ctcctccttt aaggatagca tggtcgcaca ttttaattct caagcattcc 1620

gagaagatac cgatgacgaa gaagggaacg attttccgta agaagattga gcagatgttt 1680

ggcgctgcat tgggcattgc ttccatccct acaaacagtg tcaatggatc cgttggctcc 1740

ggagaagagc ctcaagctac tgcagatgag actgttctac aagatgaact atcaaatacc 1800

gtgaagaaaa taatcagccg tgttctagga gtaactgatg aggaattgct ttggacactg 1860

tcattcgcag agctgggaat gacctcaaca ctggctattc gtatcgtaaa cgagctgaac 1920

gaaactctcg ttgggggcga tctccctatc aatgcttgct acatttatgt cgacctttcc 1980

tctctgagca aggctgtgta tgcgaaactg gctcatctcg agctgtcaga tcatgttcct 2040

gagctcaaac aagctccctt caagtcttct ggcgggaaag agattgtcat tgtcggccaa 2100

gcgtttcgtc tacccggctc aatcaatgac gttgcctctc ttcgggatgc attcctagca 2160

agacagacat cgtccatcat cgctggaata ccttccgatc gctgggacca tgccagcttc 2220

tatcccaagg acatatgttt cgacaaggct ggtcttgtgg atatagctca ttatgatcat 2280

agcttcttcg gaatcacagc aacggaagcg ctccatctgt ctccaaccat gcgtcttgca 2340

ctggaagttt cgtttgaggc gcttgagaat gctaatatcc caacgtcgcg attgaaaggc 2400

tcgcagacgg cagtttatgt tgcaacaaca gatgacggat ttgagaccct gttgaatgct 2460

gaggctggct atgaagctta tacacggttt tatggtactg gtcgggcagc aagtacggcg 2520

agtgggcgca taagctatct tcttgatata catggaccct ccgtcactat tgacacggca 2580

tgcagtggtg gagttgtttg tatcgatcaa gcaatcaact atttacaatc gtcgagttca 2640

gcggacaccg ctatcgtgtt cctttctgct caagggatgg tctccccgag gggacgatgt 2700

gcgacattta cggctgatgc tgacggctat gtcccttctg agggtgcagt tgctttcgta 2760

ttgaaaactc gcgaagccgc tatacgcgac aaagacaaca ttctcgctac aatcaaagcg 2820

acacagattt cgcacaacgg ccgctcacaa ggacttgtag caccgaacgt aaactcgcaa 2880

gttgaccttc atcgttcgtt gctcgagaaa gctcgtctta gtcctgctga tgtccaattc 2940

attgaagctc atgggacagg aacgtcattg ggagatctct cagagattca agctataaac 3000

gctgcttaca cttcctctca gccacgtacg accggcccac tcatagtcag cgcttccaag 3060

actgtcgttg gccataccga accagctggt cctttggttg gtatgttgtc ggtcttgctg 3120

tctttccagg aaggcgcagt ccctggtctc gctcatctta ccacacgtaa cctcaatcct 3180

acgttggact attcttcagt gccgcttctc attccctctg aacctgttcg tctacaaaca 3240

ccaaagcctt atagagctgc cgtaatgtcc tacggctttt cgggtaccct ggccggcctc 3300

gttctagaga gccctgacga acgtagctca gaagaagagc cgcctgatga caagccgatg 3360

ctgttcgtcg ttagcgcaaa gacacacacg gcactaattg aatacctgca acggtatctc 3420

gagttcctct tacatgcgaa tccccgcgat ttctgtgata tctgctacac aagctgtgtc 3480

gggagggaac actatagata tcggtttgct tgtgttgcaa atgacatgga agacctcatt 3540

ggccaacttc aaagacgttt gtctagcaag ttaccatcga agccgctata caaacgcggt 3600

gctctggcct ttgcgttttc tggacagggg acacagtttc aaggaatggc gacagatctt 3660

gcgaagaggt actctggctt ccgaaaaatc gtttccggac tcgcaaagag tgctggcgag 3720

ctctcgggtt acgctattga ccgttatctt ctcgcgtatg acgttggtag cagtattgct 3780

actcctaata gtgaggtgga ccagatctgc attttcgtat accaatgctc tgtccttcgc 3840

tggttgggga gtattggaat taaaccaaac gtggtaatcg gccatagcct tggagagatt 3900

tcggcttctg tggcggcagg ggcactttct cttgacattg ctctggatct tgtcatctca 3960

cgagctgggt tgttgcgccc ctcgacagat gttcctgcgg gaatggctgc tgtggccgct 4020

tcacaacagg aggtcattga gttgattgat gcgctggacc ccgacaaggc aaattcgctc 4080

agtgtttcgg ttataaatgg acctcaaaat atcgttgtgt caggcgcttc agcagctatt 4140

gagagaatgg tcgcttctgc gaaggagaag aagatcaaag cttctgttct gaatattagc 4200

caagcttttc acagttcgta tgttgacagt gccattacgg gtcttcgagc ttggtcagaa 4260

aaacatattt cctcagcgat accactgcag attccgctgt attcgacatt gctgggagct 4320

cggatatcaa agggccaaaa actgaaccca gaccactggg tcgaccacgc acggaagccc 4380

gtacagttcg cacaagcagc tacggcgatg aaagaaacct tcaccggagt catcatggat 4440

atcggacccc aagcagtagc atggtcactt ctgcttgcaa acggactcac atccgtaacc 4500

gcgcttgctg cgaagagagg gaggagtcag caggtggctt tcttgagcgc cttggcggag 4560

ttgtatcagg attatggcat tgttcctgat tttgtggcgc tttatgctca ggaggaggaa 4620

atagacaagt tgaggaagac ggatattttg acatatccgt ttcagcgtgt taggaggtat 4680

ccgagtttta taccttcaag gcgtgtgaga ggtggagaaa ttccttcgag ccatcccagc 4740

gagtctgcga cgttggagaa cacgaatgag ggtacggctt tgcgtgctga gtcgagggtg 4800

ttgtgcaggg aggatctgca tgatagcatc gttacctctg tgaaggatgt tctagagctc 4860

aaaccaaatg aagatctaga tttgtctgaa agcctgaacg cgcttggtgt ggactctata 4920

atgtttgctc agttaaggaa acgtattggg gagggactcg ggttgagtat cccgacagtg 4980

ttcctttcgg atgccttttc tattaatgag atggttaata atcttatgga acaggcggag 5040

acgcctggtg aagagggcgt aatgcaggag aat 5073

<210> 41

<211> 1691

<212> PRT

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 41

Met Asn Ser Lys Val Asn Leu Pro Ser Thr Leu Leu Asp Val Phe Leu

1 5 10 15

Glu Ile Ala Gly Glu Pro Ser Thr Ala Ser Arg Asp Val Leu Glu Cys

20 25 30

Gly Glu His Arg Trp Thr Tyr Gln Gln Leu Asp Val Val Ser Ser Ala

35 40 45

Leu Ala Gln His Leu Lys Tyr Thr Val Gly Leu Ser Pro Thr Val Ala

50 55 60

Val Ile Ser Glu Asn His Pro Tyr Val Phe Ala Leu Ile Leu Ala Val

65 70 75 80

Trp Lys Val Gly Gly Ile Phe Ala Pro Leu Asp Ala His Ala Pro Ala

85 90 95

Glu Leu Val Ala Gly Met Leu Ser Ile Ile Ser Pro Ser Cys Leu Val

100 105 110

Leu Gln Ser Thr Asp Val Ala Asn Gln Thr Leu Ala Cys Asp Leu Asp

115 120 125

Ile Pro Val Glu Val Phe His Ser Arg Gln Ser Thr Ile Pro Glu Leu

130 135 140

Asn Lys Lys Tyr Leu Thr Asp Ser Gly Leu Pro Ala Gly Phe Pro Leu

145 150 155 160

Ser Asp Ser Asn Lys Pro Ala Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Thr

165 170 175

Ser Arg Ser Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Ala Phe Ile Leu

180 185 190

Ser Asn Ser Leu Ser Lys Arg Ala Trp Cys Gln Arg Met Arg Pro Glu

195 200 205

Thr Asp Phe Asp Gly Ile Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His

210 215 220

Val Leu Ala His Met Gln Asp Ile Gly Pro Val Thr Leu Leu Asn Ala

225 230 235 240

Gly Cys Tyr Val Phe Ala Thr Ile Pro Ser Ser Tyr Pro Thr Asp Val

245 250 255

Gln Ser Asp Ser Asn Leu Ile Ser His Val Ala Asn Ala Ile Ile His

260 265 270

Lys Gly Val Lys Ser Phe Ala Cys Leu Pro Phe Val Leu Gly Gly Leu

275 280 285

Lys Ala Leu Cys Glu Ser Lys Pro Ser Val Lys Ala Asp Leu Gln Val

290 295 300

Glu Glu Gln Ala Gln Leu Leu Ile Ser Leu Arg Arg Met Glu Ile Leu

305 310 315 320

Glu Cys Gly Gly Ala Met Leu Glu Ala Asn Val Ala Ser Trp Ala Ile

325 330 335

Glu Asn His Ile Pro Val Ser Ile Gly Ile Gly Met Thr Glu Thr Gly

340 345 350

Gly Ala Leu Phe Ala Gly Pro Val Gln Asp Ile Arg Thr Gly Phe Ser

355 360 365

Ala Asp Asn Lys Phe Ile Lys Asp Ala Thr Tyr Phe Leu Val Ala Asn

370 375 380

Gly Asp Glu Ser Gly Asn Asp Val Thr Glu Gly Glu Leu Val Val Lys

385 390 395 400

Ser Lys Met Leu Pro Arg Gly Tyr Leu Gly Tyr Asn Asp Ser Ser Phe

405 410 415

Ser Val Asp Asp Asp Gly Leu Val Thr Phe Lys Thr Gly Asp Arg Tyr

420 425 430

Ser Val Thr Arg Asp Gly Arg Phe Ser Trp Leu Gly Arg Asn Thr Asp

435 440 445

Phe Ile Gln Met Thr Ser Gly Glu Thr Leu Asp Pro Arg Pro Val Glu

450 455 460

Ser Ser Leu Cys Gln Ser Pro Leu Ile Ser Gln Ala Cys Val Ile Gly

465 470 475 480

Asp Lys Phe Leu Asn Gly Pro Ala Thr Ala Val Cys Ala Ile Val Glu

485 490 495

Leu Glu Pro Thr Met Val Glu Thr Gly Glu Ala Asn Ser Arg Asp Ile

500 505 510

Val Gln Val Phe Ala Pro Ile Asn Arg Asp Leu Pro Pro Pro Leu Arg

515 520 525

Ile Ala Trp Ser His Ile Leu Ile Leu Lys His Ser Glu Lys Ile Pro

530 535 540

Met Thr Lys Lys Gly Thr Ile Phe Arg Lys Lys Ile Glu Gln Met Phe

545 550 555 560

Gly Ala Ala Leu Gly Ile Ala Ser Ile Pro Thr Asn Ser Val Asn Gly

565 570 575

Ser Val Gly Ser Gly Glu Glu Pro Gln Ala Thr Ala Asp Glu Thr Val

580 585 590

Leu Gln Asp Glu Leu Ser Asn Thr Val Lys Lys Ile Ile Ser Arg Val

595 600 605

Leu Gly Val Thr Asp Glu Glu Leu Leu Trp Thr Leu Ser Phe Ala Glu

610 615 620

Leu Gly Met Thr Ser Thr Leu Ala Ile Arg Ile Val Asn Glu Leu Asn

625 630 635 640

Glu Thr Leu Val Gly Gly Asp Leu Pro Ile Asn Ala Cys Tyr Ile Tyr

645 650 655

Val Asp Leu Ser Ser Leu Ser Lys Ala Val Tyr Ala Lys Leu Ala His

660 665 670

Leu Glu Leu Ser Asp His Val Pro Glu Leu Lys Gln Ala Pro Phe Lys

675 680 685

Ser Ser Gly Gly Lys Glu Ile Val Ile Val Gly Gln Ala Phe Arg Leu

690 695 700

Pro Gly Ser Ile Asn Asp Val Ala Ser Leu Arg Asp Ala Phe Leu Ala

705 710 715 720

Arg Gln Thr Ser Ser Ile Ile Ala Gly Ile Pro Ser Asp Arg Trp Asp

725 730 735

His Ala Ser Phe Tyr Pro Lys Asp Ile Cys Phe Asp Lys Ala Gly Leu

740 745 750

Val Asp Ile Ala His Tyr Asp His Ser Phe Phe Gly Ile Thr Ala Thr

755 760 765

Glu Ala Leu His Leu Ser Pro Thr Met Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser

770 775 780

Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn Ile Pro Thr Ser Arg Leu Lys Gly

785 790 795 800

Ser Gln Thr Ala Val Tyr Val Ala Thr Thr Asp Asp Gly Phe Glu Thr

805 810 815

Leu Leu Asn Ala Glu Ala Gly Tyr Glu Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly

820 825 830

Thr Gly Arg Ala Ala Ser Thr Ala Ser Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu

835 840 845

Asp Ile His Gly Pro Ser Val Thr Ile Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly

850 855 860

Val Val Cys Ile Asp Gln Ala Ile Asn Tyr Leu Gln Ser Ser Ser Ser

865 870 875 880

Ala Asp Thr Ala Ile Val Phe Leu Ser Ala Gln Gly Met Val Ser Pro

885 890 895

Arg Gly Arg Cys Ala Thr Phe Thr Ala Asp Ala Asp Gly Tyr Val Pro

900 905 910

Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Val Leu Lys Thr Arg Glu Ala Ala Ile

915 920 925

Arg Asp Lys Asp Asn Ile Leu Ala Thr Ile Lys Ala Thr Gln Ile Ser

930 935 940

His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn Val Asn Ser Gln

945 950 955 960

Val Asp Leu His Arg Ser Leu Leu Glu Lys Ala Arg Leu Ser Pro Ala

965 970 975

Asp Val Gln Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr Ser Leu Gly Asp

980 985 990

Leu Ser Glu Ile Gln Ala Ile Asn Ala Ala Tyr Thr Ser Ser Gln Pro

995 1000 1005

Arg Thr Thr Gly Pro Leu Ile Val Ser Ala Ser Lys Thr Val Val

1010 1015 1020

Gly His Thr Glu Pro Ala Gly Pro Leu Val Gly Met Leu Ser Val

1025 1030 1035

Leu Leu Ser Phe Gln Glu Gly Ala Val Pro Gly Leu Ala His Leu

1040 1045 1050

Thr Thr Arg Asn Leu Asn Pro Thr Leu Asp Tyr Ser Ser Val Pro

1055 1060 1065

Leu Leu Ile Pro Ser Glu Pro Val Arg Leu Gln Thr Pro Lys Pro

1070 1075 1080

Tyr Arg Ala Ala Val Met Ser Tyr Gly Phe Ser Gly Thr Leu Ala

1085 1090 1095

Gly Leu Val Leu Glu Ser Pro Asp Glu Arg Ser Ser Glu Glu Glu

1100 1105 1110

Pro Pro Asp Asp Lys Pro Met Leu Phe Val Val Ser Ala Lys Thr

1115 1120 1125

His Thr Ala Leu Ile Glu Tyr Leu Gln Arg Tyr Leu Glu Phe Leu

1130 1135 1140

Leu His Ala Asn Pro Arg Asp Phe Cys Asp Ile Cys Tyr Thr Ser

1145 1150 1155

Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Arg Tyr Arg Phe Ala Cys Val Ala

1160 1165 1170

Asn Asp Met Glu Asp Leu Ile Gly Gln Leu Gln Arg Arg Leu Ser

1175 1180 1185

Ser Lys Leu Pro Ser Lys Pro Leu Tyr Lys Arg Gly Ala Leu Ala

1190 1195 1200

Phe Ala Phe Ser Gly Gln Gly Thr Gln Phe Gln Gly Met Ala Thr

1205 1210 1215

Asp Leu Ala Lys Arg Tyr Ser Gly Phe Arg Lys Ile Val Ser Gly

1220 1225 1230

Leu Ala Lys Ser Ala Gly Glu Leu Ser Gly Tyr Ala Ile Asp Arg

1235 1240 1245

Tyr Leu Leu Ala Tyr Asp Val Gly Ser Ser Ile Ala Thr Pro Asn

1250 1255 1260

Ser Glu Val Asp Gln Ile Cys Ile Phe Val Tyr Gln Cys Ser Val

1265 1270 1275

Leu Arg Trp Leu Gly Ser Ile Gly Ile Lys Pro Asn Val Val Ile

1280 1285 1290

Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Ser Ala Ser Val Ala Ala Gly Ala

1295 1300 1305

Leu Ser Leu Asp Ile Ala Leu Asp Leu Val Ile Ser Arg Ala Gly

1310 1315 1320

Leu Leu Arg Pro Ser Thr Asp Val Pro Ala Gly Met Ala Ala Val

1325 1330 1335

Ala Ala Ser Gln Gln Glu Val Ile Glu Leu Ile Asp Ala Leu Asp

1340 1345 1350

Pro Asp Lys Ala Asn Ser Leu Ser Val Ser Val Ile Asn Gly Pro

1355 1360 1365

Gln Asn Ile Val Val Ser Gly Ala Ser Ala Ala Ile Glu Arg Met

1370 1375 1380

Val Ala Ser Ala Lys Glu Lys Lys Ile Lys Ala Ser Val Leu Asn

1385 1390 1395

Ile Ser Gln Ala Phe His Ser Ser Tyr Val Asp Ser Ala Ile Thr

1400 1405 1410

Gly Leu Arg Ala Trp Ser Glu Lys His Ile Ser Ser Ala Ile Pro

1415 1420 1425

Leu Gln Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Leu Gly Ala Arg Ile Ser

1430 1435 1440

Lys Gly Gln Lys Leu Asn Pro Asp His Trp Val Asp His Ala Arg

1445 1450 1455

Lys Pro Val Gln Phe Ala Gln Ala Ala Thr Ala Met Lys Glu Thr

1460 1465 1470

Phe Thr Gly Val Ile Met Asp Ile Gly Pro Gln Ala Val Ala Trp

1475 1480 1485

Ser Leu Leu Leu Ala Asn Gly Leu Thr Ser Val Thr Ala Leu Ala

1490 1495 1500

Ala Lys Arg Gly Arg Ser Gln Gln Val Ala Phe Leu Ser Ala Leu

1505 1510 1515

Ala Glu Leu Tyr Gln Asp Tyr Gly Ile Val Pro Asp Phe Val Ala

1520 1525 1530

Leu Tyr Ala Gln Glu Glu Glu Ile Asp Lys Leu Arg Lys Thr Asp

1535 1540 1545

Ile Leu Thr Tyr Pro Phe Gln Arg Val Arg Arg Tyr Pro Ser Phe

1550 1555 1560

Ile Pro Ser Arg Arg Val Arg Gly Gly Glu Ile Pro Ser Ser His

1565 1570 1575

Pro Ser Glu Ser Ala Thr Leu Glu Asn Thr Asn Glu Gly Thr Ala

1580 1585 1590

Leu Arg Ala Glu Ser Arg Val Leu Cys Arg Glu Asp Leu His Asp

1595 1600 1605

Ser Ile Val Thr Ser Val Lys Asp Val Leu Glu Leu Lys Pro Asn

1610 1615 1620

Glu Asp Leu Asp Leu Ser Glu Ser Leu Asn Ala Leu Gly Val Asp

1625 1630 1635

Ser Ile Met Phe Ala Gln Leu Arg Lys Arg Ile Gly Glu Gly Leu

1640 1645 1650

Gly Leu Ser Ile Pro Thr Val Phe Leu Ser Asp Ala Phe Ser Ile

1655 1660 1665

Asn Glu Met Val Asn Asn Leu Met Glu Gln Ala Glu Thr Pro Gly

1670 1675 1680

Glu Glu Gly Val Met Gln Glu Asn

1685 1690

<210> 42

<211> 5298

<212> DNA

<213> Guyanagaster necrorhiza

<400> 42

atggcggccg ataggcactt ttctcttctc gatgtctttc tcgacgttgc ccataatgct 60

gagacgtcac aacgcaatat tttggaatgc ggcctggaca cctggacata ctcagatttg 120

gacatcatct cgtcggccct ggcccaggat ctcagtacta ccttgggttg ctctcccagg 180

gttgcagtcg tcagcgagaa ccatccctat gtatttgctc tcatgctggc cgtatggaag 240

cttggaggaa tattcatccc catcgacgtc catgttcccg ccgagctttt aacgggcatg 300

ctacgcatcg ttgctccaga ctgcgtggtg attcctgaga ctgatctttc taatcagcgc 360

gtcatctctg cactttacct ccacgttatt cccttcaatg tcaatgcgtc gacaatgtct 420

acacttcgac agaaatatgt cctatctact cagaaaccct tgctgtctga gttccctctt 480

cctcatgttg atcgtgcatg cctctatctc tttacgtcct ccgcgtcttc caccgccaac 540

ttgaaatgcg tacctttgac tcatgcactt atcctcagca actgtcgttc caagcttgca 600

tggtggcggc gtgttcgtcc agaagaaaac atggatggga tgcgtgtttt ggggtgggcg 660

ccttggtcac atattctcgc gtacatgcag gatattggga cagcaacgct cctgaatgca 720

ggctgctatg tctttgcatc tgttccgtcc acatatccta cgcagcacgt agccaatggc 780

ctgcaagacc ccacttcaaa tataatcaag tcgcttctca accgccgtat cacggcgttc 840

gcatgtgtgc cgttcattct tagtgaactg aaagctatgt gcgacccagc ttccggtccg 900

gacgccaagg atcaaatgtg cttgggagct ggggagaaag tgcgtcttat aagcacactg 960

cagaatctca tcatgttcga gtgtggaggc gctgcgctcg aggcagatat cacggattgg 1020

accgtcgaaa atggtatatc agtcatggtc ggtattggaa tgacggagac cgccggcacg 1080

gttttggcag cgcgtgcaca agacgctcgt tcgaatggct attctgccga agaggctctc 1140

atcgctgatg gcatactatc attggtcgga cctgacgagg aggaaatggc ctttgacgga 1200

gaacttgtcg tgaaaagcaa gctcatccca catggataca tcaagtacca cgattcggca 1260

ttttcagtgg actcagatga ctgggtgacg ttcaaaactg gggacaaata tcagcgtaca 1320

ccagatggac atttcaagtg gcttggaaga aagaccgatt ttattcagat gacaagcagc 1380

gaaaccttag atcccagacc tatcgaaaaa gccctctgca tgaaccccat tatcgcaaat 1440

gcgtgtgtca ttggtgacag gtttctaagg gaacctgcga cgggtgtatg tgccattgtc 1500

gagatcaggt cagatgtgga tatggcttcc gccgaggttg acagggagat tgcgaatgtc 1560

ctcgctccaa tcaatcgtga tcttcctccg gctcttcgaa tagcatggtc tcgcgtactc 1620

ataatccgac ctcctcagaa aataccactc acaaagaaag gtgaggtgtt tcgcaagaag 1680

attgaagata tatttggcac cttcttgggt gtcggtgtta ctaccaaggt ggaagtggac 1740

catgaaagta aagaagatga tacggaacac atcgtgagac aggttgtgag caatcttctt 1800

ggagtccatg atcctgagct attgtctact ttatctttcg ctgagctcgg gatgacctca 1860

tttatggccg ttagcatcgt taacacttta aacaagcata ttggcggcct cgcacttcca 1920

cttaactcat gctacattca tattgatctt gattctcttg tagatgccat ttcacttgaa 1980

cgtggtcatc gaaagaaccc tacgcccttt tcttctaacc ctttcctcgc ctttgaatcc 2040

agccagcaaa aggatatgga gattgtgatt gttggtaaag cattccgttt gcccggctca 2100

ctcgacaata gcacctctct ctgggaagct ttgttgtcaa agagtgattc agtcatcggt 2160

gacatcccac ccgatcgctg ggatcatgca agtttttacc cccacgatat atgctttacg 2220

aaagcaggcc ttgtcgatgt ttcccattat gactatagat ttttcggtct cactgctaca 2280

gaggcgttgt acgtatctcc gacaatgcgc ctcgccttgg aagtgtcatt tgaggctctg 2340

gagaatgcaa atattccctt atccaagttg aaggggacac gaactgctgt ttatgttgcc 2400

actaaagacg atgggttcga gacactctta aatgctgaac aaggctacga tgcctacacg 2460

cgattctacg gcacgggacg tgctccgagt accgcaagtg gccgtataag ctatcttctt 2520

gatattcatg gaccttctgt taccgttgac acagcatgca gcggaggcat tgtatgtata 2580

gaccaagcca tcacttttct gcaatccgga ggggcagata ctgctattgt ttgttcgagc 2640

aatacgcact gttggccggg atcatttatg ttcctgacag cgcaaggcat ggtctctcca 2700

aatggaagat gtgccacatt cactacaaat gcagatggat atgtaccttc agaaggcgca 2760

gtggctttcg ttctcaagac acacagcgca gcaacacgcg acaaagacaa tatactggcc 2820

gtgataaagt caacagacgt gtctcataac ggccgttctc aagggctagt tgcaccaaac 2880

gtaaaggcac agacaaacct acaccagtcg ctgttacgaa aagctgggct gcatcctgat 2940

ctaattaact ttatcgaagc tcatggaaca ggtacatctt taggagacct ttcagaaatc 3000

cagggtatca ataatgccta cacctcatct cgacctcgtc cagccggtcc tctgatcatt 3060

agcgcgtcaa aaacggtttt gggacatagt gaaccaactg caggaatggc cggcatcctc 3120

acaaccttgc tcgcctttga gaaagagacg gttcctggtc tcaaccactt aacggaacat 3180

aatttaaacc cttcgcttga ttgctctgca gtgcctctcc tgattcctca cgagcctgtt 3240

catatcagtg gtgcaaagcc ccatcgagct gcggttctat catacggatt cgcggggaca 3300

ctggctggta ccatcttaga gagtccacct tgcgacctta caaggccctt gtcaaacgac 3360

atacaagaac atcctatgat tttcgtcgtc agtgggaaaa cggtgccctc tctggaagca 3420

tatctagagc ggtatttggt atttttacgg gtcgcaaaac caagcgaatt ccatgacatc 3480

tgctacacca cttgcatcgg gagggagctg tataaatacc ggttctcctg cgttgcccga 3540

aacatggccg acctcatttc tcaaattgaa catcgactga cgacttgttc cacttcgaaa 3600

gagaagcccc gtggctcgtt aggattcgtg ttctcgggtc aaggtaccca gttccccggc 3660

atggcagcag cacttgccga acgatattca gggttccgag cgctcgtctc caagtttggg 3720

cagatcgccc aagagcagtc gggctacccg atcgataggc tgctcctcga agttaccgat 3780

acattaccag aagcaaacag cgaggtcgac caaatttgca tttttgtcta ccaatattct 3840

gttctgcaat ggctgcaacg tctaggcatt caaccgaaaa cagtccttgg tcacagtcta 3900

ggagaaatta ccgcctcagt cgcagttggc gccttctctt ttaggtctgc attggacctt 3960

gtggtcaccc gcgctcgtct tcttcgtcct caaccaaaat tctctgcggg aatggctgca 4020

gtagcagcgt ccaaggaaga agttgaagga cttatagata tgctcaaact tgcggagtcg 4080

ctgagcgttg cggttcataa cagtccacgg agtatcgttg tatcaggcgc atcagctgcg 4140

gtcgatgcca tggttgtcgc tgctaaaaag cagggcttga aggcctcccg cttaaaggtt 4200

gaccaagcct ttcacagccc ttacgttgat tctgctgtat cggggttgct cgactggtcc 4260

aataagcatc gttcgacctt cctcccattg aacatccctt tatactcaac tttgactggc 4320

gcgcgtattc cgaaaggagg gaagttctgc tgggatcact gggttaatca tgctcgaaag 4380

cccgtccagt ttgcggcggc agctgcagca atggacgaag atcaatccat cggtgttctt 4440

gttgatgttg gaccccaacc tgttgcgtgg accctccttc aagcgaataa cctcctcaat 4500

acctcttcga ttgctctatc agcaaaaatt ggaaaggatc aggagatggc gttgctctct 4560

gctttgagct acctcgtcca agagcacaac ctttctctca gcttttatga gctttactct 4620

cagcgtcacg gtactctgaa gaagacagac gttcctacct acccgttccg tcgcgtccac 4680

cgctacccga ctttcatacc gtcacggaat agaagtcctg ctgacatgag ggtagctata 4740

ccacctaccg acctctctgt ccgaaagaat gtggatgcaa caccgcagtc tcgtcgtgct 4800

ggcctgatag cctgtcttaa agttatcctc gagttaacac caggagagga atttgacctt 4860

tctgagactc tcaatgctcg tggggtcgat tcagttatgt tcgcacagtt gcggaagcgt 4920

gttggggaag aattcgacct agatatacca atgatctatt tatcagacgt gttcacgatg 4980

gaacagatga ttgactacct cgtcgaacag tccagcccca catcaaagtt ggtagagatt 5040

tcggttaatc aatcattaga cggagaaggc ctccggacag ggcttgtatc atgccttagg 5100

gacgtactgg aaatctcctc cgacgaagaa cttgactttt ccgaaacttt gaacgctcgt 5160

ggtacggact caattatgtt cgctcagcta cgaaaacgtg tcggggaagg atttggtctt 5220

gaaattccga tgatatatct gtctgatgtg tttaccatgg aagacatgat caatttcctt 5280

gtctcggagc gctcgtgc 5298

<210> 43

<211> 1766

<212> PRT

<213> Guyanagaster necrorhiza

<400> 43

Met Ala Ala Asp Arg His Phe Ser Leu Leu Asp Val Phe Leu Asp Val

1 5 10 15

Ala His Asn Ala Glu Thr Ser Gln Arg Asn Ile Leu Glu Cys Gly Leu

20 25 30

Asp Thr Trp Thr Tyr Ser Asp Leu Asp Ile Ile Ser Ser Ala Leu Ala

35 40 45

Gln Asp Leu Ser Thr Thr Leu Gly Cys Ser Pro Arg Val Ala Val Val

50 55 60

Ser Glu Asn His Pro Tyr Val Phe Ala Leu Met Leu Ala Val Trp Lys

65 70 75 80

Leu Gly Gly Ile Phe Ile Pro Ile Asp Val His Val Pro Ala Glu Leu

85 90 95

Leu Thr Gly Met Leu Arg Ile Val Ala Pro Asp Cys Val Val Ile Pro

100 105 110

Glu Thr Asp Leu Ser Asn Gln Arg Val Ile Ser Ala Leu Tyr Leu His

115 120 125

Val Ile Pro Phe Asn Val Asn Ala Ser Thr Met Ser Thr Leu Arg Gln

130 135 140

Lys Tyr Val Leu Ser Thr Gln Lys Pro Leu Leu Ser Glu Phe Pro Leu

145 150 155 160

Pro His Val Asp Arg Ala Cys Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Ser

165 170 175

Ser Thr Ala Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Ala Leu Ile Leu

180 185 190

Ser Asn Cys Arg Ser Lys Leu Ala Trp Trp Arg Arg Val Arg Pro Glu

195 200 205

Glu Asn Met Asp Gly Met Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His

210 215 220

Ile Leu Ala Tyr Met Gln Asp Ile Gly Thr Ala Thr Leu Leu Asn Ala

225 230 235 240

Gly Cys Tyr Val Phe Ala Ser Val Pro Ser Thr Tyr Pro Thr Gln His

245 250 255

Val Ala Asn Gly Leu Gln Asp Pro Thr Ser Asn Ile Ile Lys Ser Leu

260 265 270

Leu Asn Arg Arg Ile Thr Ala Phe Ala Cys Val Pro Phe Ile Leu Ser

275 280 285

Glu Leu Lys Ala Met Cys Asp Pro Ala Ser Gly Pro Asp Ala Lys Asp

290 295 300

Gln Met Cys Leu Gly Ala Gly Glu Lys Val Arg Leu Ile Ser Thr Leu

305 310 315 320

Gln Asn Leu Ile Met Phe Glu Cys Gly Gly Ala Ala Leu Glu Ala Asp

325 330 335

Ile Thr Asp Trp Thr Val Glu Asn Gly Ile Ser Val Met Val Gly Ile

340 345 350

Gly Met Thr Glu Thr Ala Gly Thr Val Leu Ala Ala Arg Ala Gln Asp

355 360 365

Ala Arg Ser Asn Gly Tyr Ser Ala Glu Glu Ala Leu Ile Ala Asp Gly

370 375 380

Ile Leu Ser Leu Val Gly Pro Asp Glu Glu Glu Met Ala Phe Asp Gly

385 390 395 400

Glu Leu Val Val Lys Ser Lys Leu Ile Pro His Gly Tyr Ile Lys Tyr

405 410 415

His Asp Ser Ala Phe Ser Val Asp Ser Asp Asp Trp Val Thr Phe Lys

420 425 430

Thr Gly Asp Lys Tyr Gln Arg Thr Pro Asp Gly His Phe Lys Trp Leu

435 440 445

Gly Arg Lys Thr Asp Phe Ile Gln Met Thr Ser Ser Glu Thr Leu Asp

450 455 460

Pro Arg Pro Ile Glu Lys Ala Leu Cys Met Asn Pro Ile Ile Ala Asn

465 470 475 480

Ala Cys Val Ile Gly Asp Arg Phe Leu Arg Glu Pro Ala Thr Gly Val

485 490 495

Cys Ala Ile Val Glu Ile Arg Ser Asp Val Asp Met Ala Ser Ala Glu

500 505 510

Val Asp Arg Glu Ile Ala Asn Val Leu Ala Pro Ile Asn Arg Asp Leu

515 520 525

Pro Pro Ala Leu Arg Ile Ala Trp Ser Arg Val Leu Ile Ile Arg Pro

530 535 540

Pro Gln Lys Ile Pro Leu Thr Lys Lys Gly Glu Val Phe Arg Lys Lys

545 550 555 560

Ile Glu Asp Ile Phe Gly Thr Phe Leu Gly Val Gly Val Thr Thr Lys

565 570 575

Val Glu Val Asp His Glu Ser Lys Glu Asp Asp Thr Glu His Ile Val

580 585 590

Arg Gln Val Val Ser Asn Leu Leu Gly Val His Asp Pro Glu Leu Leu

595 600 605

Ser Thr Leu Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Phe Met Ala Val

610 615 620

Ser Ile Val Asn Thr Leu Asn Lys His Ile Gly Gly Leu Ala Leu Pro

625 630 635 640

Leu Asn Ser Cys Tyr Ile His Ile Asp Leu Asp Ser Leu Val Asp Ala

645 650 655

Ile Ser Leu Glu Arg Gly His Arg Lys Asn Pro Thr Pro Phe Ser Ser

660 665 670

Asn Pro Phe Leu Ala Phe Glu Ser Ser Gln Gln Lys Asp Met Glu Ile

675 680 685

Val Ile Val Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Ser Leu Asp Asn Ser

690 695 700

Thr Ser Leu Trp Glu Ala Leu Leu Ser Lys Ser Asp Ser Val Ile Gly

705 710 715 720

Asp Ile Pro Pro Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro His Asp

725 730 735

Ile Cys Phe Thr Lys Ala Gly Leu Val Asp Val Ser His Tyr Asp Tyr

740 745 750

Arg Phe Phe Gly Leu Thr Ala Thr Glu Ala Leu Tyr Val Ser Pro Thr

755 760 765

Met Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn

770 775 780

Ile Pro Leu Ser Lys Leu Lys Gly Thr Arg Thr Ala Val Tyr Val Ala

785 790 795 800

Thr Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Glu Gln Gly Tyr

805 810 815

Asp Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser Thr Ala

820 825 830

Ser Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu Asp Ile His Gly Pro Ser Val Thr

835 840 845

Val Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile Val Cys Ile Asp Gln Ala Ile

850 855 860

Thr Phe Leu Gln Ser Gly Gly Ala Asp Thr Ala Ile Val Cys Ser Ser

865 870 875 880

Asn Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Met Phe Leu Thr Ala Gln Gly

885 890 895

Met Val Ser Pro Asn Gly Arg Cys Ala Thr Phe Thr Thr Asn Ala Asp

900 905 910

Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Val Leu Lys Thr His

915 920 925

Ser Ala Ala Thr Arg Asp Lys Asp Asn Ile Leu Ala Val Ile Lys Ser

930 935 940

Thr Asp Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn

945 950 955 960

Val Lys Ala Gln Thr Asn Leu His Gln Ser Leu Leu Arg Lys Ala Gly

965 970 975

Leu His Pro Asp Leu Ile Asn Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr

980 985 990

Ser Leu Gly Asp Leu Ser Glu Ile Gln Gly Ile Asn Asn Ala Tyr Thr

995 1000 1005

Ser Ser Arg Pro Arg Pro Ala Gly Pro Leu Ile Ile Ser Ala Ser

1010 1015 1020

Lys Thr Val Leu Gly His Ser Glu Pro Thr Ala Gly Met Ala Gly

1025 1030 1035

Ile Leu Thr Thr Leu Leu Ala Phe Glu Lys Glu Thr Val Pro Gly

1040 1045 1050

Leu Asn His Leu Thr Glu His Asn Leu Asn Pro Ser Leu Asp Cys

1055 1060 1065

Ser Ala Val Pro Leu Leu Ile Pro His Glu Pro Val His Ile Ser

1070 1075 1080

Gly Ala Lys Pro His Arg Ala Ala Val Leu Ser Tyr Gly Phe Ala

1085 1090 1095

Gly Thr Leu Ala Gly Thr Ile Leu Glu Ser Pro Pro Cys Asp Leu

1100 1105 1110

Thr Arg Pro Leu Ser Asn Asp Ile Gln Glu His Pro Met Ile Phe

1115 1120 1125

Val Val Ser Gly Lys Thr Val Pro Ser Leu Glu Ala Tyr Leu Glu

1130 1135 1140

Arg Tyr Leu Val Phe Leu Arg Val Ala Lys Pro Ser Glu Phe His

1145 1150 1155

Asp Ile Cys Tyr Thr Thr Cys Ile Gly Arg Glu Leu Tyr Lys Tyr

1160 1165 1170

Arg Phe Ser Cys Val Ala Arg Asn Met Ala Asp Leu Ile Ser Gln

1175 1180 1185

Ile Glu His Arg Leu Thr Thr Cys Ser Thr Ser Lys Glu Lys Pro

1190 1195 1200

Arg Gly Ser Leu Gly Phe Val Phe Ser Gly Gln Gly Thr Gln Phe

1205 1210 1215

Pro Gly Met Ala Ala Ala Leu Ala Glu Arg Tyr Ser Gly Phe Arg

1220 1225 1230

Ala Leu Val Ser Lys Phe Gly Gln Ile Ala Gln Glu Gln Ser Gly

1235 1240 1245

Tyr Pro Ile Asp Arg Leu Leu Leu Glu Val Thr Asp Thr Leu Pro

1250 1255 1260

Glu Ala Asn Ser Glu Val Asp Gln Ile Cys Ile Phe Val Tyr Gln

1265 1270 1275

Tyr Ser Val Leu Gln Trp Leu Gln Arg Leu Gly Ile Gln Pro Lys

1280 1285 1290

Thr Val Leu Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ser Val Ala

1295 1300 1305

Val Gly Ala Phe Ser Phe Arg Ser Ala Leu Asp Leu Val Val Thr

1310 1315 1320

Arg Ala Arg Leu Leu Arg Pro Gln Pro Lys Phe Ser Ala Gly Met

1325 1330 1335

Ala Ala Val Ala Ala Ser Lys Glu Glu Val Glu Gly Leu Ile Asp

1340 1345 1350

Met Leu Lys Leu Ala Glu Ser Leu Ser Val Ala Val His Asn Ser

1355 1360 1365

Pro Arg Ser Ile Val Val Ser Gly Ala Ser Ala Ala Val Asp Ala

1370 1375 1380

Met Val Val Ala Ala Lys Lys Gln Gly Leu Lys Ala Ser Arg Leu

1385 1390 1395

Lys Val Asp Gln Ala Phe His Ser Pro Tyr Val Asp Ser Ala Val

1400 1405 1410

Ser Gly Leu Leu Asp Trp Ser Asn Lys His Arg Ser Thr Phe Leu

1415 1420 1425

Pro Leu Asn Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Thr Gly Ala Arg Ile

1430 1435 1440

Pro Lys Gly Gly Lys Phe Cys Trp Asp His Trp Val Asn His Ala

1445 1450 1455

Arg Lys Pro Val Gln Phe Ala Ala Ala Ala Ala Ala Met Asp Glu

1460 1465 1470

Asp Gln Ser Ile Gly Val Leu Val Asp Val Gly Pro Gln Pro Val

1475 1480 1485

Ala Trp Thr Leu Leu Gln Ala Asn Asn Leu Leu Asn Thr Ser Ser

1490 1495 1500

Ile Ala Leu Ser Ala Lys Ile Gly Lys Asp Gln Glu Met Ala Leu

1505 1510 1515

Leu Ser Ala Leu Ser Tyr Leu Val Gln Glu His Asn Leu Ser Leu

1520 1525 1530

Ser Phe Tyr Glu Leu Tyr Ser Gln Arg His Gly Thr Leu Lys Lys

1535 1540 1545

Thr Asp Val Pro Thr Tyr Pro Phe Arg Arg Val His Arg Tyr Pro

1550 1555 1560

Thr Phe Ile Pro Ser Arg Asn Arg Ser Pro Ala Asp Met Arg Val

1565 1570 1575

Ala Ile Pro Pro Thr Asp Leu Ser Val Arg Lys Asn Val Asp Ala

1580 1585 1590

Thr Pro Gln Ser Arg Arg Ala Gly Leu Ile Ala Cys Leu Lys Val

1595 1600 1605

Ile Leu Glu Leu Thr Pro Gly Glu Glu Phe Asp Leu Ser Glu Thr

1610 1615 1620

Leu Asn Ala Arg Gly Val Asp Ser Val Met Phe Ala Gln Leu Arg

1625 1630 1635

Lys Arg Val Gly Glu Glu Phe Asp Leu Asp Ile Pro Met Ile Tyr

1640 1645 1650

Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Gln Met Ile Asp Tyr Leu Val

1655 1660 1665

Glu Gln Ser Ser Pro Thr Ser Lys Leu Val Glu Ile Ser Val Asn

1670 1675 1680

Gln Ser Leu Asp Gly Glu Gly Leu Arg Thr Gly Leu Val Ser Cys

1685 1690 1695

Leu Arg Asp Val Leu Glu Ile Ser Ser Asp Glu Glu Leu Asp Phe

1700 1705 1710

Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Thr Asp Ser Ile Met Phe Ala

1715 1720 1725

Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Gly Phe Gly Leu Glu Ile Pro

1730 1735 1740

Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Asp Met Ile Asn

1745 1750 1755

Phe Leu Val Ser Glu Arg Ser Cys

1760 1765

<210> 44

<211> 5034

<212> DNA

<213> Mycena citricolor

<400> 44

atgtccgcct cttcctccta ttctgaactg gagtctccga cgtcgctgct tgacgtattc 60

gtgcacgccg cgcgagaccc ccacaccgcg tcgcgtcgcg tgctggagtg cggctcggac 120

acatggacat acgcggcctt ggatgcggta tccgatggca tagcgaggga gctcgcgccc 180

ttcggtctgg cgcccaaggt cgctgtggtc agcgagaacc atccatttgt gttcgcgctg 240

ctgttcgcag tctggaagct cgggggaacg ttcatcccca tcgacgcgca tgtccccttt 300

gccatgctca cggggatggt gaacatcgtg aagccgacgt gtctctacct ccccgcctcc 360

gccacatcca acatatctct cgtgaaggcc ttcgacatac ggaccgtcgt atttgggcac 420

aaggagaatt ccatgcaagc tttgttcgac aagtactcat tgcacgcggc gccgttgcac 480

gcggcaccat tgcattacgc gcctcccagt gccgaccatg cctgtctgta tctcttcacg 540

tcgtcagcgt cctcgaccaa aaacctcaag gcggtcccgc tgacgcatac actcgtcctg 600

cgggggtgtc aatccaaact cgcttggtgg cgccgagtcc aacccggaaa gaatctcgac 660

gctatccgga tcctcggctg ggcaccctgg tctcacgttc tcgcctatat gcaggatatc 720

gggacagcga cactgctcaa cgcgggctgc tacgtctttg cgaccatccc ttcgtcctac 780

ccgcagctgc ctaccactac ccccgtcgat ctgacgactt cgctcatcga cgcgctcgtc 840

acgcggcgcg tcgcggcatt cgcctgtgtc cccttcgtcc tggcgaacct caaagccgcg 900

tgccagagca accaccccgc gcgctcccag ctgctcgagg cgctgcagaa gacgatcatg 960

ctcgagtgcg gtggggcggt gctggacgac gcgacggtgg actgggccga gcgcaacggc 1020

atccgcatct tcacgggaat cgggatgacc gagactggcg gggccgtttt cgtcggcctc 1080

gcgagcgaat ctagacgcgg gtttctaccg gaaggcctac tcggtgatgc atccttctcg 1140

atctcgagtg acacggacgc tcttgacgaa ggggaacttg tcgtgaaaag taaactcatc 1200

gcgcccggat atgtcggcta cgacgacgga gcgcactccg tggactgcga cggctgggtc 1260

acattcagga caggagatcg atatcgccag acccagccag acgggcgctt tacgtggcta 1320

ggaaggatca cagacttcat tcagatggtc agcggcgagt acctcgatcc gcggcccctc 1380

gaggagagtc tgcgtgcgtc cccgctgatc gccaacgcct gcatcgtggg cgacgcgttc 1440

ctcagcagcg cctcgacgag catcctcgcc atcatcgagc tcgcgacccc ggatctggcg 1500

cacacggcct ccatccgggc gcagctcgcg cgcgtcctcg cgcccctcaa ccgcgatctg 1560

cctccaccgc ttcggatcgc agcgtcttcg atcctggttc tggacgggat gcggaagatc 1620

ccgaagacga agaagggcga catcttccgc aaaaagctgg aagacacgtt cggtgcggag 1680

tttgagcaga tgctgcggac cgagaaagtc gggctgggtg acttggcgga tgtggatgcc 1740

ggtatcactc gtatcatcgg caacttgctc ggcatctccg acgacgagct tctgtcgacc 1800

atgtcgtttg ctgagctcgg gatgacctcg cttctcgccg tcaagatcgc gagcgaacta 1860

aacaagtttc tggacggccg ggctgtgctg cccacgaaca tctgttacat acactttgac 1920

gtgccctcgc tcacgagtag cgtccgagaa aggctatcct ccgcgccctc ctcgatcaca 1980

tccgccgcca gcgagcccgc ggcctcgtcc cccggcaccc cccgcgccga cgaaatcgtg 2040

atcgtgggca aggccttccg gctgccggac ggcgtgaacg acgacgccgc gctgtgggac 2100

gtcctgacgg gcgagtccgc gtcgatcatc aaggacatcc ccgccgaccg ctgggaccac 2160

gcgagcttct acccgaagga catccacttt ggcagagctg gtctggtgga tgtcgcgcgg 2220

ttcgactacg gctttttcgg catgacggcg agcgaggcgt attcgctgtc gccgacgatg 2280

cgcttggcgc tcgaagtcgc gtatgaggcg ttagaggacg cgaacattcc gttccgggcc 2340

gtcaagggct cgcgcatggg tgtgttcgtc gctgtgaaag acgatggatt cgagaccctg 2400

ttgcatgcgg ggcagggtta tgacgcttac acgcggttct atggaactgg aagggcgccg 2460

agcaccgcca gcggccgcat caactatctg ctcgatctcc acgggccgtc gatcaccgtc 2520

gacacggcct gcagcggcgg catcgtgtgc atcgaccagg ctgtcaccta tcttcaatcg 2580

ggcgctgcag agacggcgat cgtgtgttcg agcaacacac actgctggcc cggatccttc 2640

atgttcttga ccgcgcaagg catggcctcc cccaacggcc ggtgcgcatc cttcacatca 2700

gacgccgacg gatacgcgcc gtcggagggc gcggtgggct tcgtgctgaa gacgcggtct 2760

gccgctgtgc gcgacggcga tcggatactg gctacgatca gggccacgga gatcggacac 2820

aatggacggt ctcagggact cgctgcgccg aatgtcaggt cccaggcggc tgctcatcgg 2880

gcggtgctgc ggagagcgag gctggacccg tccgagattg acttcatcga agcgcatggg 2940

actggcacca cattgggcga tctgtgcgaa gtgcagggca tcaacgacag ctttgtctcg 3000

cccaagaaac gcgccaaccc tcttgtggtc agcgcgtcca agagcaccat cggccacacc 3060

gagccgtcgg cgggtctcgt cgggatcctg tccgcgctga tgtcgttcga gaagcgcatc 3120

gtgccgagat tggcatatct gactgagagc aatgtgaacc cggcgctcga cgcgagtgtc 3180

gttccgctgc actttcccac aaagcacatc gagctgcgcg ctgatgtgcc gtacaaggcc 3240

gtagtgatgt cgtacggatt cgcaggtacc ctagccgaca tcgtcctcga gagcgaggta 3300

ccccaaccca cgcccgcggt cgctcaggac acggccggcc aacagccaat gctcttcgtg 3360

ctcagcgcca aaaccccacg cgcactcgca gcctacatcg agctgtacct aggcttcctg 3420

cggcacgcgg acccgggcct cttcgcgcgc atctgctaca cggcgtgtgt cgcgcgcgag 3480

cactacaagc accgcgtcgc gtgcgttgcg acggacctcg tcgacctcat cgcgcagctc 3540

gagacgcgtc tggtgcagac ggcgtatgcg ggcggcggcg gggcccgggc cgcgcgcacc 3600

gggccgctgg tgtttgcgtt ttcggggcag ggcacgcagt tcccggcgat ggcggcgccg 3660

ctggcgcggc ggtacgcgcg cttcggggag atcgtggggg gctgtgcgcg catggcgcgc 3720

gagctgagcg ggttccccgt ggatggcatt ctcctcggag acgatgtgac gcccgtgaag 3780

gacaacagcg ctgcggcgga ggtgcacagc gaggtggacc agatctgcat atttgtgtac 3840

cagtatgcga tgtgtcggtg gttgggcgag ctgggtgtgg agcccaaggc tgccataggc 3900

cacagcttgg gagagatcac agcagcggtc atcgcaggag cactcccttt cgaagccgcc 3960

ctcgatctgg tcgtcacgcg cgcccggctg ctcaagccgt gcgccgagca accgagcggc 4020

atggcggcgc tcgcctgcac cccagacgtc gcatcgaagc tcacactcgg cgcgtcggtg 4080

tcggtgtcgg tctacaacgg cccgcagagc atctgcctgt ccggcgcgtc ggccgagctc 4140

gacgatgcgg tgcgggccgc gaaggcgcgg aacatcaagg cgacgcggct gcaggtcgac 4200

cagggcttcc actcgccgtg cgtcgacgcc gcggtgccgg ggctgcaggc gtggtgcgcg 4260

gcgcaccgtg cgtcagctgc gccgctgaag atgccgctgt actcgaccgt gcgcggggac 4320

gtcgttccga agggagcggc gctggatccg gagcactggg tggcgcacgc gcggaacccg 4380

gtgctgttcg cgcagacggc gcaggctctg aaagagtccc ttccgcatgg gatcactttg 4440

gacgtcggcc cgcaggcggt ggcgtggtcg ctgctgctgc tgaacgggct cagcgcgacg 4500

cgcacggtcg ctgccggggc gaagaagggc gcagaccagg agcgcgcgct gctgggggcg 4560

ctgggggcgc tgttcgagca gcacaaggtc acgccggact ttgggcggct gtacgcgccg 4620

ctcgagaaga cgcggatccc gacgtacccc tttgagcgcg cgcggtgcta cccgacgttc 4680

ataccctcgc gcttcgcgca cggggctgcg gctgctgcga agacagatgg cgaggtcctg 4740

tcggccgaag aagaaaatgt ggcacccgtg ggattgctga caaaggagga tctgcgtgcg 4800

gctctcgtcg cgtgtctccg agcgacgctc gagctgcgcc ccgacgaaga gctggacgaa 4860

gcagagccgc tgaccgtgca cggcgtggac tcgatcgggt ttgcgaagct gcgcaagcac 4920

gtcgaggacc gctgggggct ggacatcccc gtcgtgtact ggtccgacgc gttcaccgtc 4980

ggcgagatgc tcggcaactt ggtcggccag tatgacgtag tgtctactgc tgcg 5034

<210> 45

<211> 1678

<212> PRT

<213> Mycena citricolor

<400> 45

Met Ser Ala Ser Ser Ser Tyr Ser Glu Leu Glu Ser Pro Thr Ser Leu

1 5 10 15

Leu Asp Val Phe Val His Ala Ala Arg Asp Pro His Thr Ala Ser Arg

20 25 30

Arg Val Leu Glu Cys Gly Ser Asp Thr Trp Thr Tyr Ala Ala Leu Asp

35 40 45

Ala Val Ser Asp Gly Ile Ala Arg Glu Leu Ala Pro Phe Gly Leu Ala

50 55 60

Pro Lys Val Ala Val Val Ser Glu Asn His Pro Phe Val Phe Ala Leu

65 70 75 80

Leu Phe Ala Val Trp Lys Leu Gly Gly Thr Phe Ile Pro Ile Asp Ala

85 90 95

His Val Pro Phe Ala Met Leu Thr Gly Met Val Asn Ile Val Lys Pro

100 105 110

Thr Cys Leu Tyr Leu Pro Ala Ser Ala Thr Ser Asn Ile Ser Leu Val

115 120 125

Lys Ala Phe Asp Ile Arg Thr Val Val Phe Gly His Lys Glu Asn Ser

130 135 140

Met Gln Ala Leu Phe Asp Lys Tyr Ser Leu His Ala Ala Pro Leu His

145 150 155 160

Ala Ala Pro Leu His Tyr Ala Pro Pro Ser Ala Asp His Ala Cys Leu

165 170 175

Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Ser Ser Thr Lys Asn Leu Lys Ala Val

180 185 190

Pro Leu Thr His Thr Leu Val Leu Arg Gly Cys Gln Ser Lys Leu Ala

195 200 205

Trp Trp Arg Arg Val Gln Pro Gly Lys Asn Leu Asp Ala Ile Arg Ile

210 215 220

Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His Val Leu Ala Tyr Met Gln Asp Ile

225 230 235 240

Gly Thr Ala Thr Leu Leu Asn Ala Gly Cys Tyr Val Phe Ala Thr Ile

245 250 255

Pro Ser Ser Tyr Pro Gln Leu Pro Thr Thr Thr Pro Val Asp Leu Thr

260 265 270

Thr Ser Leu Ile Asp Ala Leu Val Thr Arg Arg Val Ala Ala Phe Ala

275 280 285

Cys Val Pro Phe Val Leu Ala Asn Leu Lys Ala Ala Cys Gln Ser Asn

290 295 300

His Pro Ala Arg Ser Gln Leu Leu Glu Ala Leu Gln Lys Thr Ile Met

305 310 315 320

Leu Glu Cys Gly Gly Ala Val Leu Asp Asp Ala Thr Val Asp Trp Ala

325 330 335

Glu Arg Asn Gly Ile Arg Ile Phe Thr Gly Ile Gly Met Thr Glu Thr

340 345 350

Gly Gly Ala Val Phe Val Gly Leu Ala Ser Glu Ser Arg Arg Gly Phe

355 360 365

Leu Pro Glu Gly Leu Leu Gly Asp Ala Ser Phe Ser Ile Ser Ser Asp

370 375 380

Thr Asp Ala Leu Asp Glu Gly Glu Leu Val Val Lys Ser Lys Leu Ile

385 390 395 400

Ala Pro Gly Tyr Val Gly Tyr Asp Asp Gly Ala His Ser Val Asp Cys

405 410 415

Asp Gly Trp Val Thr Phe Arg Thr Gly Asp Arg Tyr Arg Gln Thr Gln

420 425 430

Pro Asp Gly Arg Phe Thr Trp Leu Gly Arg Ile Thr Asp Phe Ile Gln

435 440 445

Met Val Ser Gly Glu Tyr Leu Asp Pro Arg Pro Leu Glu Glu Ser Leu

450 455 460

Arg Ala Ser Pro Leu Ile Ala Asn Ala Cys Ile Val Gly Asp Ala Phe

465 470 475 480

Leu Ser Ser Ala Ser Thr Ser Ile Leu Ala Ile Ile Glu Leu Ala Thr

485 490 495

Pro Asp Leu Ala His Thr Ala Ser Ile Arg Ala Gln Leu Ala Arg Val

500 505 510

Leu Ala Pro Leu Asn Arg Asp Leu Pro Pro Pro Leu Arg Ile Ala Ala

515 520 525

Ser Ser Ile Leu Val Leu Asp Gly Met Arg Lys Ile Pro Lys Thr Lys

530 535 540

Lys Gly Asp Ile Phe Arg Lys Lys Leu Glu Asp Thr Phe Gly Ala Glu

545 550 555 560

Phe Glu Gln Met Leu Arg Thr Glu Lys Val Gly Leu Gly Asp Leu Ala

565 570 575

Asp Val Asp Ala Gly Ile Thr Arg Ile Ile Gly Asn Leu Leu Gly Ile

580 585 590

Ser Asp Asp Glu Leu Leu Ser Thr Met Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met

595 600 605

Thr Ser Leu Leu Ala Val Lys Ile Ala Ser Glu Leu Asn Lys Phe Leu

610 615 620

Asp Gly Arg Ala Val Leu Pro Thr Asn Ile Cys Tyr Ile His Phe Asp

625 630 635 640

Val Pro Ser Leu Thr Ser Ser Val Arg Glu Arg Leu Ser Ser Ala Pro

645 650 655

Ser Ser Ile Thr Ser Ala Ala Ser Glu Pro Ala Ala Ser Ser Pro Gly

660 665 670

Thr Pro Arg Ala Asp Glu Ile Val Ile Val Gly Lys Ala Phe Arg Leu

675 680 685

Pro Asp Gly Val Asn Asp Asp Ala Ala Leu Trp Asp Val Leu Thr Gly

690 695 700

Glu Ser Ala Ser Ile Ile Lys Asp Ile Pro Ala Asp Arg Trp Asp His

705 710 715 720

Ala Ser Phe Tyr Pro Lys Asp Ile His Phe Gly Arg Ala Gly Leu Val

725 730 735

Asp Val Ala Arg Phe Asp Tyr Gly Phe Phe Gly Met Thr Ala Ser Glu

740 745 750

Ala Tyr Ser Leu Ser Pro Thr Met Arg Leu Ala Leu Glu Val Ala Tyr

755 760 765

Glu Ala Leu Glu Asp Ala Asn Ile Pro Phe Arg Ala Val Lys Gly Ser

770 775 780

Arg Met Gly Val Phe Val Ala Val Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu

785 790 795 800

Leu His Ala Gly Gln Gly Tyr Asp Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr

805 810 815

Gly Arg Ala Pro Ser Thr Ala Ser Gly Arg Ile Asn Tyr Leu Leu Asp

820 825 830

Leu His Gly Pro Ser Ile Thr Val Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile

835 840 845

Val Cys Ile Asp Gln Ala Val Thr Tyr Leu Gln Ser Gly Ala Ala Glu

850 855 860

Thr Ala Ile Val Cys Ser Ser Asn Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe

865 870 875 880

Met Phe Leu Thr Ala Gln Gly Met Ala Ser Pro Asn Gly Arg Cys Ala

885 890 895

Ser Phe Thr Ser Asp Ala Asp Gly Tyr Ala Pro Ser Glu Gly Ala Val

900 905 910

Gly Phe Val Leu Lys Thr Arg Ser Ala Ala Val Arg Asp Gly Asp Arg

915 920 925

Ile Leu Ala Thr Ile Arg Ala Thr Glu Ile Gly His Asn Gly Arg Ser

930 935 940

Gln Gly Leu Ala Ala Pro Asn Val Arg Ser Gln Ala Ala Ala His Arg

945 950 955 960

Ala Val Leu Arg Arg Ala Arg Leu Asp Pro Ser Glu Ile Asp Phe Ile

965 970 975

Glu Ala His Gly Thr Gly Thr Thr Leu Gly Asp Leu Cys Glu Val Gln

980 985 990

Gly Ile Asn Asp Ser Phe Val Ser Pro Lys Lys Arg Ala Asn Pro Leu

995 1000 1005

Val Val Ser Ala Ser Lys Ser Thr Ile Gly His Thr Glu Pro Ser

1010 1015 1020

Ala Gly Leu Val Gly Ile Leu Ser Ala Leu Met Ser Phe Glu Lys

1025 1030 1035

Arg Ile Val Pro Arg Leu Ala Tyr Leu Thr Glu Ser Asn Val Asn

1040 1045 1050

Pro Ala Leu Asp Ala Ser Val Val Pro Leu His Phe Pro Thr Lys

1055 1060 1065

His Ile Glu Leu Arg Ala Asp Val Pro Tyr Lys Ala Val Val Met

1070 1075 1080

Ser Tyr Gly Phe Ala Gly Thr Leu Ala Asp Ile Val Leu Glu Ser

1085 1090 1095

Glu Val Pro Gln Pro Thr Pro Ala Val Ala Gln Asp Thr Ala Gly

1100 1105 1110

Gln Gln Pro Met Leu Phe Val Leu Ser Ala Lys Thr Pro Arg Ala

1115 1120 1125

Leu Ala Ala Tyr Ile Glu Leu Tyr Leu Gly Phe Leu Arg His Ala

1130 1135 1140

Asp Pro Gly Leu Phe Ala Arg Ile Cys Tyr Thr Ala Cys Val Ala

1145 1150 1155

Arg Glu His Tyr Lys His Arg Val Ala Cys Val Ala Thr Asp Leu

1160 1165 1170

Val Asp Leu Ile Ala Gln Leu Glu Thr Arg Leu Val Gln Thr Ala

1175 1180 1185

Tyr Ala Gly Gly Gly Gly Ala Arg Ala Ala Arg Thr Gly Pro Leu

1190 1195 1200

Val Phe Ala Phe Ser Gly Gln Gly Thr Gln Phe Pro Ala Met Ala

1205 1210 1215

Ala Pro Leu Ala Arg Arg Tyr Ala Arg Phe Gly Glu Ile Val Gly

1220 1225 1230

Gly Cys Ala Arg Met Ala Arg Glu Leu Ser Gly Phe Pro Val Asp

1235 1240 1245

Gly Ile Leu Leu Gly Asp Asp Val Thr Pro Val Lys Asp Asn Ser

1250 1255 1260

Ala Ala Ala Glu Val His Ser Glu Val Asp Gln Ile Cys Ile Phe

1265 1270 1275

Val Tyr Gln Tyr Ala Met Cys Arg Trp Leu Gly Glu Leu Gly Val

1280 1285 1290

Glu Pro Lys Ala Ala Ile Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala

1295 1300 1305

Ala Val Ile Ala Gly Ala Leu Pro Phe Glu Ala Ala Leu Asp Leu

1310 1315 1320

Val Val Thr Arg Ala Arg Leu Leu Lys Pro Cys Ala Glu Gln Pro

1325 1330 1335

Ser Gly Met Ala Ala Leu Ala Cys Thr Pro Asp Val Ala Ser Lys

1340 1345 1350

Leu Thr Leu Gly Ala Ser Val Ser Val Ser Val Tyr Asn Gly Pro

1355 1360 1365

Gln Ser Ile Cys Leu Ser Gly Ala Ser Ala Glu Leu Asp Asp Ala

1370 1375 1380

Val Arg Ala Ala Lys Ala Arg Asn Ile Lys Ala Thr Arg Leu Gln

1385 1390 1395

Val Asp Gln Gly Phe His Ser Pro Cys Val Asp Ala Ala Val Pro

1400 1405 1410

Gly Leu Gln Ala Trp Cys Ala Ala His Arg Ala Ser Ala Ala Pro

1415 1420 1425

Leu Lys Met Pro Leu Tyr Ser Thr Val Arg Gly Asp Val Val Pro

1430 1435 1440

Lys Gly Ala Ala Leu Asp Pro Glu His Trp Val Ala His Ala Arg

1445 1450 1455

Asn Pro Val Leu Phe Ala Gln Thr Ala Gln Ala Leu Lys Glu Ser

1460 1465 1470

Leu Pro His Gly Ile Thr Leu Asp Val Gly Pro Gln Ala Val Ala

1475 1480 1485

Trp Ser Leu Leu Leu Leu Asn Gly Leu Ser Ala Thr Arg Thr Val

1490 1495 1500

Ala Ala Gly Ala Lys Lys Gly Ala Asp Gln Glu Arg Ala Leu Leu

1505 1510 1515

Gly Ala Leu Gly Ala Leu Phe Glu Gln His Lys Val Thr Pro Asp

1520 1525 1530

Phe Gly Arg Leu Tyr Ala Pro Leu Glu Lys Thr Arg Ile Pro Thr

1535 1540 1545

Tyr Pro Phe Glu Arg Ala Arg Cys Tyr Pro Thr Phe Ile Pro Ser

1550 1555 1560

Arg Phe Ala His Gly Ala Ala Ala Ala Ala Lys Thr Asp Gly Glu

1565 1570 1575

Val Leu Ser Ala Glu Glu Glu Asn Val Ala Pro Val Gly Leu Leu

1580 1585 1590

Thr Lys Glu Asp Leu Arg Ala Ala Leu Val Ala Cys Leu Arg Ala

1595 1600 1605

Thr Leu Glu Leu Arg Pro Asp Glu Glu Leu Asp Glu Ala Glu Pro

1610 1615 1620

Leu Thr Val His Gly Val Asp Ser Ile Gly Phe Ala Lys Leu Arg

1625 1630 1635

Lys His Val Glu Asp Arg Trp Gly Leu Asp Ile Pro Val Val Tyr

1640 1645 1650

Trp Ser Asp Ala Phe Thr Val Gly Glu Met Leu Gly Asn Leu Val

1655 1660 1665

Gly Gln Tyr Asp Val Val Ser Thr Ala Ala

1670 1675

<210> 46

<211> 4956

<212> DNA

<213> Mycena chlorophos

<400> 46

atgaatccgc cctcgtctat cctcgaagtc ttccagcgta ccgccctcga cccctcgggc 60

gccgaccggc gcgttctgga atgcgggccc gacttttgga cctacgcggg tctcgacgcg 120

gtttccacag gccttgcggc ggacttggct gctctcggag attctcccat cgtggctgtc 180

gtcgctgaga accatccctt cgtcttcgca ctcatgtttg ccgtctggaa attgcacggg 240

acgtttgttc ccatcgacgc gcatattccg tggaacctgc tcgacggcat gttggacatc 300

gtcaagccga cttgcatgtt tctcgtcgag tcggatacca acaatatctc gaacaccaag 360

gcccagggag tcgacttcgc tgtgcgcctc ttcggaggag aaggattcac catcccggcg 420

ctctcggcca aatatgcggg gaacgtctcg aatggcgccc ccgagtcact cccttctcca 480

gacgcgactg ctctgtatct gttcacgtcg tctgcctcgt cgcggcacaa tttgaaggcc 540

gttccgctca cgcatcgatt cattgccgct ggctgcgaag cgaaactcgc cttctggcac 600

cgtcttcatc ctcacaaccc caccgatgcg attcgcgtgc tgggatgggc tccgttgtcg 660

cacgtcctcg cgcatatgca ggatatcggc accgcggccc tcctcaacgc cggctgctat 720

gtcttttcga cgatcccctt gtcttacacc tcagcagaaa ctcagcccgc gcaagatatc 780

acctcggctc tcattcactc cgtgctccat tacgaggtca aagcatttgc gggcctgcct 840

tttgttattg cggcattcaa ggctgcttgt gaaggcggga acgaccgtct cctagcgcaa 900

ctacgctcca tgaccatgct cgagtgtggc ggggcgcagt tggacaagga catcgtggat 960

tgggcagtca agcaagcgat cccgctcgtg gttggggtcg ggatgacgga aacgggtggc 1020

gcgatactgg cgggccccgt cggggatgcg tcggatgggt ttcaccccca agggctgctg 1080

ctagatgcac agttctccct tatcggcaat gacgatgaat cggaaggcga gctggtcatc 1140

aagagtccca atcttccgcg cggatatctg aagtacgagg acggctcgtt cgacatcgac 1200

gcgcagggtg tcgtcacgtt caagactgga gacatctacc gcaaaagtgt cgagggtaaa 1260

ctcctttggg ttgggcgtag tacggatttc atccagatgg ctaccggcga gacgctcgat 1320

ccccgtcgtg ttgaacgggc gctacgcttc gcatcgggga tcaacgatgc ctgcatcatc 1380

gggaatgcgt tcctgaatgg ctcctctacc gcaatttacg ccatcatcga gctcgctccg 1440

cgcaccgtca acatcaataa tgattcaaat gtctcccatc tgcaggtggt tgcccgcgcc 1500

ctgtctccta tcaaccgcga ccttcctccc gcattacgca ttgtgttgtc ttctgtattg 1560

attctggctg aaggcatgaa gattccgagg acaaagaaag gcgaaatctt ccggaagaag 1620

attgatgaag ttttcggagc tgctctccgg gctttaggtc actcggcaac tccaacagag 1680

gttgttcttg agcaggaacc agcggcagcc agcaaaccca tttttgacaa gaacaagctg 1740

cagactgcta ttgcgcatag cttgggtctg gatattctgg agattgacct gctggacaag 1800

ctgacctttg ctgagcttgg catgacatct attcttgcaa ttcgggttgc agaagatctc 1860

aacaaattgc tgcagggaca agttaccctg ccagtcaata tctgctacct ctatccagat 1920

gcccagctgt tgtttgcagc agttcaggaa cagctgctca agcagcagca cccttcaacc 1980

ccaactgctc cctccgtgcc ggctttgctg tcagcaactt cctctgttcc aattctcttg 2040

caggaactag atgatgttgt cattgttggc aaatcattcc ggttgcctgg cggaatctac 2100

gatgatcgag cactctgggc agctctcacc aatcaagcta cccgaaaccc catctcatat 2160

atttcgggcc agcgctggga ccatacaagc ttttacccag ctgatattgc attcttgcag 2220

gcagggttgc ttgactccga ccactttacg gattttgatg cagctttctt cgggatgacc 2280

gagaaagagg catactatct gtccccgacc atgcggcttg ctcttgaagt agcctttgag 2340

gctctagaag atgcaaatat tcctgttggt caggtgaaag gcactagcat gggagtatat 2400

gcagctgtca aggatgatgg attcgaaacc cttttgaatg ctgctcatgg gtatgatgcc 2460

tacacacgat tctacggaac tggacgggca ccaagtacca ctagcgggcg gatcagtcaa 2520

ggagaatcag cgattgtctg ctccagcaat acacactgtt ggcctggctc cttcatgttc 2580

ttgactgccc aaggaatggt gtctcctcat ggacgttgtg cctccttcag tgctcaagca 2640

gatggatatg ttccttcaga gggtgctgtt gcatttatcc tgaagacccg caaagcagca 2700

gttcgggatg gaaaccaaat ttttgccaca attcgggctg cggtggtatc acacaatggt 2760

cgatcacaag gtcttgcagc accaaacatt caagcccaat ccgagttgca tcaacaagca 2820

ttgcagaagg caaatatcca acccactgat attcattttg tggaaactca tggaacaggg 2880

acttcgcttg gggatgtctg tgagattcat gggataaatg ctgcttttgc agcaggtcac 2940

cgtccctctg gacctctcat cattagtgca agcaaaggca ctattggaca tacagagcct 3000

tctgcaggtc ttgtgggcat catggcggca ctgctctcct tcaagcatgg ccttgttcct 3060

gggctgatcc atacatctca tgggcaactc aacccggcac ttgatcaatc caaagttccg 3120

cttatcttca gcccacaaac aatttccctg ggcggagaaa agccttacag atctgtggtc 3180

atgtcatatg gctttgcagg cacactagcg gatattgtgc ttgaaggccc tgctgaggag 3240

gctttttccg ggccaggcaa aaacagcagt gctcctccgc ctatgatctt tgccctcagt 3300

gccaaatctg catcagccct ccaagaatac aagcagaagt acatcacctt cctgcagaat 3360

gttggctctg gaggccaact gttcagcaag atctgtttga cttcttgcat tgcccgagag 3420

cactacaagc atagattctc ctgtgctgct cagaacacac tggatcttct tctgcagcta 3480

gagcactctg ttgctgccag ccacaaacct ccaacaactc gtaccggaac agtcaccttt 3540

gctttctctg gacagggagc ccaattcccc agcatggatg cagctctggc tcaaggctac 3600

tctgccttca aatccatctt gctggaactt ggaaacaagg ctgccaaact ctctggattc 3660

cccatcactg attgcctgtt ggcaacaaca gcatcagctg atgaagaagc cgtccatagt 3720

gaggtggacc aaatttgcat ttttgttcat caatatgcaa tggctctttt cctcgagatg 3780

ctaggaattg tccccggtgc tgccataggc cacagcttgg gagagatcac agcagcggtc 3840

gttgctggtg gactttcgtt tgaacttggc ctagagttgg tcatcctccg tgcacatctg 3900

ctccgtccag agcagaacaa gcccgctggc atggctgcct tggcatgctc agaagcggac 3960

ttcctcaagt ttccgtccac cgatgcaact atttctgttt tcaactctcc tcggagcatt 4020

gcagtctctg gagcagcaag ctccattgag acagttctta ctgctgccaa agagcagaat 4080

atcaaggcca cgaagctcag ggttgatcaa ggattccata gcagctatgt ggagcatgcg 4140

cttcccgggc tcaagcactg gtcagcaatg aattcaggct ccttccaggc actcaggatt 4200

ccactctatt caactgcact tggccatgtt gttcctgctg gagagaccct tcagccagat 4260

cactggatga accatacccg caatgctgtt cattttacgc aaactgcgca ggctctgaaa 4320

gagtcccttc cgcatgggat cactttggat cttggtcctc aggctgtagc tcaaactctc 4380

ctgctggcca atgaccatcc tgttggccgc accattggat tgtgtggcaa acgcacagga 4440

gatcaaagac atgcattcct gctcgctctt gctgagcttt accagcagca tggtcttgtg 4500

cccaactttc atgcacttta tggcgtagct gcccaggatc tcaaggacca tctcaccagc 4560

ctgccaacat atccattcca acgtgtccgc tgctatccca gctacattcc atcccgtcac 4620

tccaacactc ccgggaccac cgtggtgatt gatgcaaagc cgcgggatga agtgaaacct 4680

gtggcagagg tctcaaagtc ggacacggat tcttccacat cattttcttc gaccattctc 4740

ttccacattc gctccatcct tgagcttcgc ccccatgagg ttctggatac gtctgaatcc 4800

ctcttgacgt acggggtcga ctcgattggg tttgcagcac tgcagaaggc cctggagcag 4860

cagcatgggc taaacttgtc gattgtgttc tggagcgacg tgttttccat tgccgacatt 4920

gtgaagaatc ttgaggagca gaagagcttg aagatg 4956

<210> 47

<211> 1652

<212> PRT

<213> Mycena chlorophos

<400> 47

Met Asn Pro Pro Ser Ser Ile Leu Glu Val Phe Gln Arg Thr Ala Leu

1 5 10 15

Asp Pro Ser Gly Ala Asp Arg Arg Val Leu Glu Cys Gly Pro Asp Phe

20 25 30

Trp Thr Tyr Ala Gly Leu Asp Ala Val Ser Thr Gly Leu Ala Ala Asp

35 40 45

Leu Ala Ala Leu Gly Asp Ser Pro Ile Val Ala Val Val Ala Glu Asn

50 55 60

His Pro Phe Val Phe Ala Leu Met Phe Ala Val Trp Lys Leu His Gly

65 70 75 80

Thr Phe Val Pro Ile Asp Ala His Ile Pro Trp Asn Leu Leu Asp Gly

85 90 95

Met Leu Asp Ile Val Lys Pro Thr Cys Met Phe Leu Val Glu Ser Asp

100 105 110

Thr Asn Asn Ile Ser Asn Thr Lys Ala Gln Gly Val Asp Phe Ala Val

115 120 125

Arg Leu Phe Gly Gly Glu Gly Phe Thr Ile Pro Ala Leu Ser Ala Lys

130 135 140

Tyr Ala Gly Asn Val Ser Asn Gly Ala Pro Glu Ser Leu Pro Ser Pro

145 150 155 160

Asp Ala Thr Ala Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Ser Ser Arg His

165 170 175

Asn Leu Lys Ala Val Pro Leu Thr His Arg Phe Ile Ala Ala Gly Cys

180 185 190

Glu Ala Lys Leu Ala Phe Trp His Arg Leu His Pro His Asn Pro Thr

195 200 205

Asp Ala Ile Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Leu Ser His Val Leu Ala

210 215 220

His Met Gln Asp Ile Gly Thr Ala Ala Leu Leu Asn Ala Gly Cys Tyr

225 230 235 240

Val Phe Ser Thr Ile Pro Leu Ser Tyr Thr Ser Ala Glu Thr Gln Pro

245 250 255

Ala Gln Asp Ile Thr Ser Ala Leu Ile His Ser Val Leu His Tyr Glu

260 265 270

Val Lys Ala Phe Ala Gly Leu Pro Phe Val Ile Ala Ala Phe Lys Ala

275 280 285

Ala Cys Glu Gly Gly Asn Asp Arg Leu Leu Ala Gln Leu Arg Ser Met

290 295 300

Thr Met Leu Glu Cys Gly Gly Ala Gln Leu Asp Lys Asp Ile Val Asp

305 310 315 320

Trp Ala Val Lys Gln Ala Ile Pro Leu Val Val Gly Val Gly Met Thr

325 330 335

Glu Thr Gly Gly Ala Ile Leu Ala Gly Pro Val Gly Asp Ala Ser Asp

340 345 350

Gly Phe His Pro Gln Gly Leu Leu Leu Asp Ala Gln Phe Ser Leu Ile

355 360 365

Gly Asn Asp Asp Glu Ser Glu Gly Glu Leu Val Ile Lys Ser Pro Asn

370 375 380

Leu Pro Arg Gly Tyr Leu Lys Tyr Glu Asp Gly Ser Phe Asp Ile Asp

385 390 395 400

Ala Gln Gly Val Val Thr Phe Lys Thr Gly Asp Ile Tyr Arg Lys Ser

405 410 415

Val Glu Gly Lys Leu Leu Trp Val Gly Arg Ser Thr Asp Phe Ile Gln

420 425 430

Met Ala Thr Gly Glu Thr Leu Asp Pro Arg Arg Val Glu Arg Ala Leu

435 440 445

Arg Phe Ala Ser Gly Ile Asn Asp Ala Cys Ile Ile Gly Asn Ala Phe

450 455 460

Leu Asn Gly Ser Ser Thr Ala Ile Tyr Ala Ile Ile Glu Leu Ala Pro

465 470 475 480

Arg Thr Val Asn Ile Asn Asn Asp Ser Asn Val Ser His Leu Gln Val

485 490 495

Val Ala Arg Ala Leu Ser Pro Ile Asn Arg Asp Leu Pro Pro Ala Leu

500 505 510

Arg Ile Val Leu Ser Ser Val Leu Ile Leu Ala Glu Gly Met Lys Ile

515 520 525

Pro Arg Thr Lys Lys Gly Glu Ile Phe Arg Lys Lys Ile Asp Glu Val

530 535 540

Phe Gly Ala Ala Leu Arg Ala Leu Gly His Ser Ala Thr Pro Thr Glu

545 550 555 560

Val Val Leu Glu Gln Glu Pro Ala Ala Ala Ser Lys Pro Ile Phe Asp

565 570 575

Lys Asn Lys Leu Gln Thr Ala Ile Ala His Ser Leu Gly Leu Asp Ile

580 585 590

Leu Glu Ile Asp Leu Leu Asp Lys Leu Thr Phe Ala Glu Leu Gly Met

595 600 605

Thr Ser Ile Leu Ala Ile Arg Val Ala Glu Asp Leu Asn Lys Leu Leu

610 615 620

Gln Gly Gln Val Thr Leu Pro Val Asn Ile Cys Tyr Leu Tyr Pro Asp

625 630 635 640

Ala Gln Leu Leu Phe Ala Ala Val Gln Glu Gln Leu Leu Lys Gln Gln

645 650 655

His Pro Ser Thr Pro Thr Ala Pro Ser Val Pro Ala Leu Leu Ser Ala

660 665 670

Thr Ser Ser Val Pro Ile Leu Leu Gln Glu Leu Asp Asp Val Val Ile

675 680 685

Val Gly Lys Ser Phe Arg Leu Pro Gly Gly Ile Tyr Asp Asp Arg Ala

690 695 700

Leu Trp Ala Ala Leu Thr Asn Gln Ala Thr Arg Asn Pro Ile Ser Tyr

705 710 715 720

Ile Ser Gly Gln Arg Trp Asp His Thr Ser Phe Tyr Pro Ala Asp Ile

725 730 735

Ala Phe Leu Gln Ala Gly Leu Leu Asp Ser Asp His Phe Thr Asp Phe

740 745 750

Asp Ala Ala Phe Phe Gly Met Thr Glu Lys Glu Ala Tyr Tyr Leu Ser

755 760 765

Pro Thr Met Arg Leu Ala Leu Glu Val Ala Phe Glu Ala Leu Glu Asp

770 775 780

Ala Asn Ile Pro Val Gly Gln Val Lys Gly Thr Ser Met Gly Val Tyr

785 790 795 800

Ala Ala Val Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Ala His

805 810 815

Gly Tyr Asp Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser

820 825 830

Thr Thr Ser Gly Arg Ile Ser Gln Gly Glu Ser Ala Ile Val Cys Ser

835 840 845

Ser Asn Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Met Phe Leu Thr Ala Gln

850 855 860

Gly Met Val Ser Pro His Gly Arg Cys Ala Ser Phe Ser Ala Gln Ala

865 870 875 880

Asp Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys Thr

885 890 895

Arg Lys Ala Ala Val Arg Asp Gly Asn Gln Ile Phe Ala Thr Ile Arg

900 905 910

Ala Ala Val Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Ala Ala Pro

915 920 925

Asn Ile Gln Ala Gln Ser Glu Leu His Gln Gln Ala Leu Gln Lys Ala

930 935 940

Asn Ile Gln Pro Thr Asp Ile His Phe Val Glu Thr His Gly Thr Gly

945 950 955 960

Thr Ser Leu Gly Asp Val Cys Glu Ile His Gly Ile Asn Ala Ala Phe

965 970 975

Ala Ala Gly His Arg Pro Ser Gly Pro Leu Ile Ile Ser Ala Ser Lys

980 985 990

Gly Thr Ile Gly His Thr Glu Pro Ser Ala Gly Leu Val Gly Ile Met

995 1000 1005

Ala Ala Leu Leu Ser Phe Lys His Gly Leu Val Pro Gly Leu Ile

1010 1015 1020

His Thr Ser His Gly Gln Leu Asn Pro Ala Leu Asp Gln Ser Lys

1025 1030 1035

Val Pro Leu Ile Phe Ser Pro Gln Thr Ile Ser Leu Gly Gly Glu

1040 1045 1050

Lys Pro Tyr Arg Ser Val Val Met Ser Tyr Gly Phe Ala Gly Thr

1055 1060 1065

Leu Ala Asp Ile Val Leu Glu Gly Pro Ala Glu Glu Ala Phe Ser

1070 1075 1080

Gly Pro Gly Lys Asn Ser Ser Ala Pro Pro Pro Met Ile Phe Ala

1085 1090 1095

Leu Ser Ala Lys Ser Ala Ser Ala Leu Gln Glu Tyr Lys Gln Lys

1100 1105 1110

Tyr Ile Thr Phe Leu Gln Asn Val Gly Ser Gly Gly Gln Leu Phe

1115 1120 1125

Ser Lys Ile Cys Leu Thr Ser Cys Ile Ala Arg Glu His Tyr Lys

1130 1135 1140

His Arg Phe Ser Cys Ala Ala Gln Asn Thr Leu Asp Leu Leu Leu

1145 1150 1155

Gln Leu Glu His Ser Val Ala Ala Ser His Lys Pro Pro Thr Thr

1160 1165 1170

Arg Thr Gly Thr Val Thr Phe Ala Phe Ser Gly Gln Gly Ala Gln

1175 1180 1185

Phe Pro Ser Met Asp Ala Ala Leu Ala Gln Gly Tyr Ser Ala Phe

1190 1195 1200

Lys Ser Ile Leu Leu Glu Leu Gly Asn Lys Ala Ala Lys Leu Ser

1205 1210 1215

Gly Phe Pro Ile Thr Asp Cys Leu Leu Ala Thr Thr Ala Ser Ala

1220 1225 1230

Asp Glu Glu Ala Val His Ser Glu Val Asp Gln Ile Cys Ile Phe

1235 1240 1245

Val His Gln Tyr Ala Met Ala Leu Phe Leu Glu Met Leu Gly Ile

1250 1255 1260

Val Pro Gly Ala Ala Ile Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala

1265 1270 1275

Ala Val Val Ala Gly Gly Leu Ser Phe Glu Leu Gly Leu Glu Leu

1280 1285 1290

Val Ile Leu Arg Ala His Leu Leu Arg Pro Glu Gln Asn Lys Pro

1295 1300 1305

Ala Gly Met Ala Ala Leu Ala Cys Ser Glu Ala Asp Phe Leu Lys

1310 1315 1320

Phe Pro Ser Thr Asp Ala Thr Ile Ser Val Phe Asn Ser Pro Arg

1325 1330 1335

Ser Ile Ala Val Ser Gly Ala Ala Ser Ser Ile Glu Thr Val Leu

1340 1345 1350

Thr Ala Ala Lys Glu Gln Asn Ile Lys Ala Thr Lys Leu Arg Val

1355 1360 1365

Asp Gln Gly Phe His Ser Ser Tyr Val Glu His Ala Leu Pro Gly

1370 1375 1380

Leu Lys His Trp Ser Ala Met Asn Ser Gly Ser Phe Gln Ala Leu

1385 1390 1395

Arg Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Ala Leu Gly His Val Val Pro Ala

1400 1405 1410

Gly Glu Thr Leu Gln Pro Asp His Trp Met Asn His Thr Arg Asn

1415 1420 1425

Ala Val His Phe Thr Gln Thr Ala Gln Ala Leu Lys Glu Ser Leu

1430 1435 1440

Pro His Gly Ile Thr Leu Asp Leu Gly Pro Gln Ala Val Ala Gln

1445 1450 1455

Thr Leu Leu Leu Ala Asn Asp His Pro Val Gly Arg Thr Ile Gly

1460 1465 1470

Leu Cys Gly Lys Arg Thr Gly Asp Gln Arg His Ala Phe Leu Leu

1475 1480 1485

Ala Leu Ala Glu Leu Tyr Gln Gln His Gly Leu Val Pro Asn Phe

1490 1495 1500

His Ala Leu Tyr Gly Val Ala Ala Gln Asp Leu Lys Asp His Leu

1505 1510 1515

Thr Ser Leu Pro Thr Tyr Pro Phe Gln Arg Val Arg Cys Tyr Pro

1520 1525 1530

Ser Tyr Ile Pro Ser Arg His Ser Asn Thr Pro Gly Thr Thr Val

1535 1540 1545

Val Ile Asp Ala Lys Pro Arg Asp Glu Val Lys Pro Val Ala Glu

1550 1555 1560

Val Ser Lys Ser Asp Thr Asp Ser Ser Thr Ser Phe Ser Ser Thr

1565 1570 1575

Ile Leu Phe His Ile Arg Ser Ile Leu Glu Leu Arg Pro His Glu

1580 1585 1590

Val Leu Asp Thr Ser Glu Ser Leu Leu Thr Tyr Gly Val Asp Ser

1595 1600 1605

Ile Gly Phe Ala Ala Leu Gln Lys Ala Leu Glu Gln Gln His Gly

1610 1615 1620

Leu Asn Leu Ser Ile Val Phe Trp Ser Asp Val Phe Ser Ile Ala

1625 1630 1635

Asp Ile Val Lys Asn Leu Glu Glu Gln Lys Ser Leu Lys Met

1640 1645 1650

<210> 48

<211> 5313

<212> DNA

<213> Armillaria gallica

<400> 48

atggaggccg acggtcacca ctctcttctc gatgtctttc tcagcgttgc acatgattct 60

gagaagtcca aacgtaatgt cttggaatgc ggccaggata cctggacata ctcagatttg 120

gacatcatct cgtcggcctt ggcacaggat ctcaaagcta ccttgggttg ttttcccaaa 180

gttgcagtcg tcagcgagaa ccatccctac gtgtttgctc tcatgctggc cgtttggaag 240

cttgaaggga tattcatccc catcgacgtc catattacag ctgaccttct aaagggcatg 300

ctacgcattg ttgcccccac ttgtctggcg atcccagaga ccgatatttc caaccagcgt 360

gttgcctctg cgattggtat acatgttctc cccttcaacg tgaatgcgtc gaccatgaat 420

gcacttcgac agaaatacga cccatttact cagaatgcct cgctatctgg atgcgcactt 480

ccttacgttg atcgcgcatg cctctatctc tttacatcct ccgcgtcctc tactgccaac 540

ttgaaatgtg tacctttgac ccatactctt atcctcagta actgccgttc caagctcgca 600

tggtggcggc gcgttcgtcc ggaaggcgaa atggatggga tacgtgttct agggtgggca 660

ccttggtcgc atatccttgc ctacatgcaa gatattggca cggcaacgtt cctgaatgcc 720

ggctgctatg tctttgcgtc cgttccatcc acatatcctt cacagctggc agcgaatggc 780

ctacaaggcc ccaccatgaa tatcatcgat tcacttcttg aacggcgagt cgccgcattt 840

gcttgcgtac cgttcatttt gagcgaacta aaagctatgt gcgagacggc tgccagtcca 900

gatgacaagc atctcatgtg cttgagagct gaggagaaag ttcgccttgt cagtgcgctg 960

cagcggctta tgatgctcga gtgcggaggc gctgcgctcg agtcggatgt cacacgttgg 1020

gccgtcgaaa atggcatatc ggtcatggtc ggcatcggga tgacggagac agtcggtacg 1080

ctgtttgcag agcgcgcgca agacgcctgt tccaatggct attctgcgca ggacgccctc 1140

attgctgatg gcatcatgtc actggtcggg tctgacaacg aggaagccac cttcgaaggg 1200

gaactagtcg tgaagagcaa gctcatccca cacggataca tcaactaccg tgattcgtcg 1260

ttttcggtgg actcggacgg ctgggtaacg ttcaaaacgg gagacaaata tcagcgcacg 1320

ccagatggac gattcaaatg gcttggaaga aagaccgatt ttattcagat gacaagcagc 1380

gaaacattgg atcccagacc cattgagcaa gccctctgtg cgaatccaag tatcgcaaat 1440

gcatgcgtca ttggtgacag gttcctgaga gagcctgcga ctagcgtatg cgccattgtc 1500

gagatcgggc ctgaagtgga catgccttcg tccaagatcg acagagaaat tgcgaatgcc 1560

ctcgctccaa tcaatcgcga ccttcctcct gctcttcgca tatcatggtc tcgcgtactc 1620

ataattcgac ctcctcagaa aataccagtt acgaggaaag gcgatgtgtt ccgtaagaag 1680

attgaagata tgtttgggcc tttccttggt gtcggcgttt ctaccgaggt cgaagccggc 1740

catgaaacta aagaagatga cacggaacac atcgtgagac aggttgtgag caatcttctt 1800

ggcgtccatg atcctgagct attgtctgct ttatctttcg ctgagctggg catgacctca 1860

tttatggctg ttagcatcgt caacgctctc aacaaacgca tcggcggcct cacccttccg 1920

tctaatgcat gctacatcca tattgatctt gattctcttg tggacgcgat ttcacttgaa 1980

tatggtcatg gaagtatccc tgcagagttg ccttctaacc ctttccccga catcgagtcc 2040

catcagcata atgataagga cattgtgata gtcggcaagg cattccgttt acccggctca 2100

ctcaacagta ctgcaactct ctgggaagct ttgttatcga ataacaattc ggtcatcagt 2160

gatatcccat ctgatcgctg ggatcatgca agcttttacc cccacaatat atgtttcacg 2220

aaagcaggcc tcgtcgatgt tgcacattac gactacagat tttttggcct catggcgaca 2280

gaggcgttgt acgtatctcc gacgatgcgc ctcgccttgg aagtgtcatt tgaagccctg 2340

gagaacgcaa atattccgct atccaagctg aaggggacac aaaccgctgt ctatgtcgcc 2400

actaaagacg atggcttcga gacactctta aatgccgagc aaggttacga tgcgtacacg 2460

cgattctacg gcacgggtcg cgctccgagt accgcaagcg gtcgcataag ctatcttctt 2520

gatattcatg ggccatctat taccgttgat acagcatgca gcggaggcat tgtatgtatg 2580

gatcaagcca tcactttctt gcaatccgga ggggccgata ccgcaattgt ctgttcgacc 2640

aatacgcact gttggccggg atcattcatg ttcctgacgg cacaaggcat ggtttctcca 2700

aatggaagat gcgctacatt cactaccgat gcagacggat atgtgccttc ggagggtgca 2760

gtggctttca ttctcaagac gcgcagcgct gcaatacgcg acaatgacaa tatactcgcc 2820

gtgatcaaat caacagatgt gtcccataac ggccgttctc aagggctagt tgcaccaaac 2880

gtaaaggcgc aggcaaacct acaccggtcg ttgctacgaa aagctgggct gtttcctgat 2940

caaattaact ttatcgaagc tcatggaaca ggtacatctc taggagacct ttcggaaatc 3000

cagggcatta ataacgccta catctcatca cgacctcgtc tggccggtcc ccttatcatt 3060

agtgcatcga aaacagtttt aggacacagt gaaccaacag cagggatggc cggcatcctc 3120

acagccttgc ttgcccttga gaaagagaca gttcctggtt taaatcactt aacggatcac 3180

aacctcaacc cttcgcttga ttgcagcgta gttcctctcc tgattcctca cgagtctatt 3240

cacattggtg gtgcaaagcc acatcgagct gcggttctgt catacggctt cgcgggtacg 3300

ctggccggtg ctatcttaga aggaccacct tctggtgtac catggccgtc gtcaaatgat 3360

atacaagaac accctatgat tttcgtcgtc agtgggaaaa ccgtgcctac actggaagcg 3420

tacctgggac ggtatttgac atttttgcgg gtcgcaaaaa cacacgactt ccaggacatc 3480

tgctacacca cttgcgtcgg gagggagcac tacaaatacc ggttctcctg cgttgcccga 3540

aacatggcag accttatttc tcaaattgaa catcgactga caactctttc cacttcgaaa 3600

cagaagcctc gcggctcgtt agggttcatg ttctcaggac aaggcacttg tttccctggt 3660

atggcttcag cacttgctga acaatattcg gggttccgaa tgctcgtctc taagtttggg 3720

caggctgccc aagagcggtc cggttatccg atcgataggc tgttgcttga agtttctgat 3780

acattaccag aaacaaacag cgaggtcgac caaatttgca tttttgtcta ccaatattct 3840

gttctgcaat ggttgcaatg tctaggcatt caaccgaaag cagtcctcgg tcacagcctg 3900

ggagaaatta ctgccgcagt cgcagctggc gccctttcgt tcgaatctgc gttggatctt 3960

gtggtcaccc gtgctcgtct tctccgtccc agaacaaaag actctgcagg aatggccgca 4020

gtagcagcgt ccaaggaaga agttgaagga gttatagaaa ccctccaact tgcaaactcg 4080

ctaagcgttg cggttcacaa cggtccgcgg agtgttgttg tgtcaggcgc atcagcagaa 4140

atcgatgccc tagttgtcgc agctaaagaa cggggcttga aagcctcccg cttaaaggtt 4200

gaccaaggct tccacagccc ttacgttgac tctgcggttc cgggtttact cgactggtca 4260

aacaagcatc gttcgacctt ctttccttta aacattcctc tatactcgac tttgaccggc 4320

gagcttattc cgaagggacg gaggttcgtc tcggatcact gggtaaacca tgctcgaaaa 4380

cctgttcagt ttgcggcggc agcggcagcg gtggatgaag atcgatccat tggtgtgctc 4440

gttgacgtcg gaccccaacc cgttgcgtgg accctccttc aagcaaacaa ccttctcaat 4500

acctctgcag ttgcgctatc cgcaaaggcc ggaaaggacc aggagatggc gctgctcact 4560

gctttgagct acctcttcca agagcacaac ctttctccca acttccacga gctttactct 4620

cagcgtcatg ggactctgca gaagacggac attcccacct acccattcca acgtgtccac 4680

cgctatccga ccttcatacc gtcacgaaat caaagtcctg ctattgcaac ggtagttata 4740

ccgccacctc gcttctctgt ccaaaaggct gcggatgtag catcacagtc gaaggaatca 4800

gactgtcgag ctggtttgat cagttgcctt agagccatcc tcgaattaac accggaagag 4860

gagtttgacc tttctgagac tctcaacgct cgtggtatgg attcgatcat gtttgcgcag 4920

ctacggaagc gggttgggga agaattcaac ctcgatatac ccatgatcta tctatcagac 4980

gtgttcacga tggaacagat ggtcgactac ctcgtcgaac agtccggatc cacacccgcg 5040

tcaaagcacg tagaaacttc agctaatcaa ccattagacg aagaagatct ccggacgggg 5100

ctcttgtcat gcctgaggaa cgtgctagaa attacccccg atgaagaact tgacctatct 5160

gaaactttga atgctcgtgg tgttgactcg atcatgttcg ctcagctgcg gaaacgcgtt 5220

ggggaaggtt ttggtgtgga aattccgatg atatatctgt ctgacgtgtt taccatggaa 5280

gacatgatca atttcctcgt ctccgagcgg tcg 5313

<210> 49

<211> 1771

<212> PRT

<213> Armillaria gallica

<400> 49

Met Glu Ala Asp Gly His His Ser Leu Leu Asp Val Phe Leu Ser Val

1 5 10 15

Ala His Asp Ser Glu Lys Ser Lys Arg Asn Val Leu Glu Cys Gly Gln

20 25 30

Asp Thr Trp Thr Tyr Ser Asp Leu Asp Ile Ile Ser Ser Ala Leu Ala

35 40 45

Gln Asp Leu Lys Ala Thr Leu Gly Cys Phe Pro Lys Val Ala Val Val

50 55 60

Ser Glu Asn His Pro Tyr Val Phe Ala Leu Met Leu Ala Val Trp Lys

65 70 75 80

Leu Glu Gly Ile Phe Ile Pro Ile Asp Val His Ile Thr Ala Asp Leu

85 90 95

Leu Lys Gly Met Leu Arg Ile Val Ala Pro Thr Cys Leu Ala Ile Pro

100 105 110

Glu Thr Asp Ile Ser Asn Gln Arg Val Ala Ser Ala Ile Gly Ile His

115 120 125

Val Leu Pro Phe Asn Val Asn Ala Ser Thr Met Asn Ala Leu Arg Gln

130 135 140

Lys Tyr Asp Pro Phe Thr Gln Asn Ala Ser Leu Ser Gly Cys Ala Leu

145 150 155 160

Pro Tyr Val Asp Arg Ala Cys Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Ser

165 170 175

Ser Thr Ala Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Thr Leu Ile Leu

180 185 190

Ser Asn Cys Arg Ser Lys Leu Ala Trp Trp Arg Arg Val Arg Pro Glu

195 200 205

Gly Glu Met Asp Gly Ile Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His

210 215 220

Ile Leu Ala Tyr Met Gln Asp Ile Gly Thr Ala Thr Phe Leu Asn Ala

225 230 235 240

Gly Cys Tyr Val Phe Ala Ser Val Pro Ser Thr Tyr Pro Ser Gln Leu

245 250 255

Ala Ala Asn Gly Leu Gln Gly Pro Thr Met Asn Ile Ile Asp Ser Leu

260 265 270

Leu Glu Arg Arg Val Ala Ala Phe Ala Cys Val Pro Phe Ile Leu Ser

275 280 285

Glu Leu Lys Ala Met Cys Glu Thr Ala Ala Ser Pro Asp Asp Lys His

290 295 300

Leu Met Cys Leu Arg Ala Glu Glu Lys Val Arg Leu Val Ser Ala Leu

305 310 315 320

Gln Arg Leu Met Met Leu Glu Cys Gly Gly Ala Ala Leu Glu Ser Asp

325 330 335

Val Thr Arg Trp Ala Val Glu Asn Gly Ile Ser Val Met Val Gly Ile

340 345 350

Gly Met Thr Glu Thr Val Gly Thr Leu Phe Ala Glu Arg Ala Gln Asp

355 360 365

Ala Cys Ser Asn Gly Tyr Ser Ala Gln Asp Ala Leu Ile Ala Asp Gly

370 375 380

Ile Met Ser Leu Val Gly Ser Asp Asn Glu Glu Ala Thr Phe Glu Gly

385 390 395 400

Glu Leu Val Val Lys Ser Lys Leu Ile Pro His Gly Tyr Ile Asn Tyr

405 410 415

Arg Asp Ser Ser Phe Ser Val Asp Ser Asp Gly Trp Val Thr Phe Lys

420 425 430

Thr Gly Asp Lys Tyr Gln Arg Thr Pro Asp Gly Arg Phe Lys Trp Leu

435 440 445

Gly Arg Lys Thr Asp Phe Ile Gln Met Thr Ser Ser Glu Thr Leu Asp

450 455 460

Pro Arg Pro Ile Glu Gln Ala Leu Cys Ala Asn Pro Ser Ile Ala Asn

465 470 475 480

Ala Cys Val Ile Gly Asp Arg Phe Leu Arg Glu Pro Ala Thr Ser Val

485 490 495

Cys Ala Ile Val Glu Ile Gly Pro Glu Val Asp Met Pro Ser Ser Lys

500 505 510

Ile Asp Arg Glu Ile Ala Asn Ala Leu Ala Pro Ile Asn Arg Asp Leu

515 520 525

Pro Pro Ala Leu Arg Ile Ser Trp Ser Arg Val Leu Ile Ile Arg Pro

530 535 540

Pro Gln Lys Ile Pro Val Thr Arg Lys Gly Asp Val Phe Arg Lys Lys

545 550 555 560

Ile Glu Asp Met Phe Gly Pro Phe Leu Gly Val Gly Val Ser Thr Glu

565 570 575

Val Glu Ala Gly His Glu Thr Lys Glu Asp Asp Thr Glu His Ile Val

580 585 590

Arg Gln Val Val Ser Asn Leu Leu Gly Val His Asp Pro Glu Leu Leu

595 600 605

Ser Ala Leu Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Phe Met Ala Val

610 615 620

Ser Ile Val Asn Ala Leu Asn Lys Arg Ile Gly Gly Leu Thr Leu Pro

625 630 635 640

Ser Asn Ala Cys Tyr Ile His Ile Asp Leu Asp Ser Leu Val Asp Ala

645 650 655

Ile Ser Leu Glu Tyr Gly His Gly Ser Ile Pro Ala Glu Leu Pro Ser

660 665 670

Asn Pro Phe Pro Asp Ile Glu Ser His Gln His Asn Asp Lys Asp Ile

675 680 685

Val Ile Val Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Ser Leu Asn Ser Thr

690 695 700

Ala Thr Leu Trp Glu Ala Leu Leu Ser Asn Asn Asn Ser Val Ile Ser

705 710 715 720

Asp Ile Pro Ser Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro His Asn

725 730 735

Ile Cys Phe Thr Lys Ala Gly Leu Val Asp Val Ala His Tyr Asp Tyr

740 745 750

Arg Phe Phe Gly Leu Met Ala Thr Glu Ala Leu Tyr Val Ser Pro Thr

755 760 765

Met Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn

770 775 780

Ile Pro Leu Ser Lys Leu Lys Gly Thr Gln Thr Ala Val Tyr Val Ala

785 790 795 800

Thr Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Glu Gln Gly Tyr

805 810 815

Asp Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser Thr Ala

820 825 830

Ser Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu Asp Ile His Gly Pro Ser Ile Thr

835 840 845

Val Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile Val Cys Met Asp Gln Ala Ile

850 855 860

Thr Phe Leu Gln Ser Gly Gly Ala Asp Thr Ala Ile Val Cys Ser Thr

865 870 875 880

Asn Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Met Phe Leu Thr Ala Gln Gly

885 890 895

Met Val Ser Pro Asn Gly Arg Cys Ala Thr Phe Thr Thr Asp Ala Asp

900 905 910

Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys Thr Arg

915 920 925

Ser Ala Ala Ile Arg Asp Asn Asp Asn Ile Leu Ala Val Ile Lys Ser

930 935 940

Thr Asp Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn

945 950 955 960

Val Lys Ala Gln Ala Asn Leu His Arg Ser Leu Leu Arg Lys Ala Gly

965 970 975

Leu Phe Pro Asp Gln Ile Asn Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr

980 985 990

Ser Leu Gly Asp Leu Ser Glu Ile Gln Gly Ile Asn Asn Ala Tyr Ile

995 1000 1005

Ser Ser Arg Pro Arg Leu Ala Gly Pro Leu Ile Ile Ser Ala Ser

1010 1015 1020

Lys Thr Val Leu Gly His Ser Glu Pro Thr Ala Gly Met Ala Gly

1025 1030 1035

Ile Leu Thr Ala Leu Leu Ala Leu Glu Lys Glu Thr Val Pro Gly

1040 1045 1050

Leu Asn His Leu Thr Asp His Asn Leu Asn Pro Ser Leu Asp Cys

1055 1060 1065

Ser Val Val Pro Leu Leu Ile Pro His Glu Ser Ile His Ile Gly

1070 1075 1080

Gly Ala Lys Pro His Arg Ala Ala Val Leu Ser Tyr Gly Phe Ala

1085 1090 1095

Gly Thr Leu Ala Gly Ala Ile Leu Glu Gly Pro Pro Ser Gly Val

1100 1105 1110

Pro Trp Pro Ser Ser Asn Asp Ile Gln Glu His Pro Met Ile Phe

1115 1120 1125

Val Val Ser Gly Lys Thr Val Pro Thr Leu Glu Ala Tyr Leu Gly

1130 1135 1140

Arg Tyr Leu Thr Phe Leu Arg Val Ala Lys Thr His Asp Phe Gln

1145 1150 1155

Asp Ile Cys Tyr Thr Thr Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Lys Tyr

1160 1165 1170

Arg Phe Ser Cys Val Ala Arg Asn Met Ala Asp Leu Ile Ser Gln

1175 1180 1185

Ile Glu His Arg Leu Thr Thr Leu Ser Thr Ser Lys Gln Lys Pro

1190 1195 1200

Arg Gly Ser Leu Gly Phe Met Phe Ser Gly Gln Gly Thr Cys Phe

1205 1210 1215

Pro Gly Met Ala Ser Ala Leu Ala Glu Gln Tyr Ser Gly Phe Arg

1220 1225 1230

Met Leu Val Ser Lys Phe Gly Gln Ala Ala Gln Glu Arg Ser Gly

1235 1240 1245

Tyr Pro Ile Asp Arg Leu Leu Leu Glu Val Ser Asp Thr Leu Pro

1250 1255 1260

Glu Thr Asn Ser Glu Val Asp Gln Ile Cys Ile Phe Val Tyr Gln

1265 1270 1275

Tyr Ser Val Leu Gln Trp Leu Gln Cys Leu Gly Ile Gln Pro Lys

1280 1285 1290

Ala Val Leu Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ala Val Ala

1295 1300 1305

Ala Gly Ala Leu Ser Phe Glu Ser Ala Leu Asp Leu Val Val Thr

1310 1315 1320

Arg Ala Arg Leu Leu Arg Pro Arg Thr Lys Asp Ser Ala Gly Met

1325 1330 1335

Ala Ala Val Ala Ala Ser Lys Glu Glu Val Glu Gly Val Ile Glu

1340 1345 1350

Thr Leu Gln Leu Ala Asn Ser Leu Ser Val Ala Val His Asn Gly

1355 1360 1365

Pro Arg Ser Val Val Val Ser Gly Ala Ser Ala Glu Ile Asp Ala

1370 1375 1380

Leu Val Val Ala Ala Lys Glu Arg Gly Leu Lys Ala Ser Arg Leu

1385 1390 1395

Lys Val Asp Gln Gly Phe His Ser Pro Tyr Val Asp Ser Ala Val

1400 1405 1410

Pro Gly Leu Leu Asp Trp Ser Asn Lys His Arg Ser Thr Phe Phe

1415 1420 1425

Pro Leu Asn Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Thr Gly Glu Leu Ile

1430 1435 1440

Pro Lys Gly Arg Arg Phe Val Ser Asp His Trp Val Asn His Ala

1445 1450 1455

Arg Lys Pro Val Gln Phe Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val Asp Glu

1460 1465 1470

Asp Arg Ser Ile Gly Val Leu Val Asp Val Gly Pro Gln Pro Val

1475 1480 1485

Ala Trp Thr Leu Leu Gln Ala Asn Asn Leu Leu Asn Thr Ser Ala

1490 1495 1500

Val Ala Leu Ser Ala Lys Ala Gly Lys Asp Gln Glu Met Ala Leu

1505 1510 1515

Leu Thr Ala Leu Ser Tyr Leu Phe Gln Glu His Asn Leu Ser Pro

1520 1525 1530

Asn Phe His Glu Leu Tyr Ser Gln Arg His Gly Thr Leu Gln Lys

1535 1540 1545

Thr Asp Ile Pro Thr Tyr Pro Phe Gln Arg Val His Arg Tyr Pro

1550 1555 1560

Thr Phe Ile Pro Ser Arg Asn Gln Ser Pro Ala Ile Ala Thr Val

1565 1570 1575

Val Ile Pro Pro Pro Arg Phe Ser Val Gln Lys Ala Ala Asp Val

1580 1585 1590

Ala Ser Gln Ser Lys Glu Ser Asp Cys Arg Ala Gly Leu Ile Ser

1595 1600 1605

Cys Leu Arg Ala Ile Leu Glu Leu Thr Pro Glu Glu Glu Phe Asp

1610 1615 1620

Leu Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Met Asp Ser Ile Met Phe

1625 1630 1635

Ala Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Glu Phe Asn Leu Asp Ile

1640 1645 1650

Pro Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Gln Met Val

1655 1660 1665

Asp Tyr Leu Val Glu Gln Ser Gly Ser Thr Pro Ala Ser Lys His

1670 1675 1680

Val Glu Thr Ser Ala Asn Gln Pro Leu Asp Glu Glu Asp Leu Arg

1685 1690 1695

Thr Gly Leu Leu Ser Cys Leu Arg Asn Val Leu Glu Ile Thr Pro

1700 1705 1710

Asp Glu Glu Leu Asp Leu Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Val

1715 1720 1725

Asp Ser Ile Met Phe Ala Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Gly

1730 1735 1740

Phe Gly Val Glu Ile Pro Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr

1745 1750 1755

Met Glu Asp Met Ile Asn Phe Leu Val Ser Glu Arg Ser

1760 1765 1770

<210> 50

<211> 5310

<212> DNA

<213> Armillaria ostoyae

<400> 50

atggaggccg acggtcacta ctctcttctc gatgtctttc tcagcgttgc acatgattct 60

gagaagtcca aacgtaatgt cttggaatgc ggccaggata cttggacata ctcggatttg 120

gacattatct cgtcggccct ggcacaggat ctcaaagcta tcttgggttg ttttcccaaa 180

gttgcagtcg tcagcgagaa ccatccctac gtatttgctc tcatgctggc cgtatggaag 240

cttgaaggga tattcatccc tatcgacgtc cacgttacag ctgaccttct aaagggcatg 300

ctacgcattg ttgctcccac ttgtctggtg atcccagaga ccgatatttt taaccagcgt 360

gttgcctctg caattggtat acatgttctc cccttcaacg tgaatgcgtc gaccatgact 420

gcacttcgac agaaatacca cccatttact cagaaagcct cgctatctgg gtgcgcactg 480

ccttacgttg atcgcgcatg cctctatctc tttacatcct ccgcgtcctc tactgccaat 540

ttgaaatgcg tacctttgac ccatactctt atcctcagta actgccgttc caagctcgca 600

tggtggcggc gcgttcgtcc ggaaggcgaa atggatgaga tacgtgttct agggtgggca 660

ccttggtcgc atatccttgc ctacatgcaa gatattggca cggcaacgct cctgaacgcc 720

ggttgctatg tctttgcgtc cgttccatcc acatatccta cacaactggc agcgaatggc 780

ttacaaggcc ctatcatgaa tatcatcgat tcacttcttg aacgacgagt cgccgcattt 840

gcttgcgtac cgttcatttt gagcgaacta aaagctatgt gcgagacggc ttccagtcca 900

gacgacaagc atcaaatgtg cttgagagct gaggagaaag ttcgccttgt cagtgcgctg 960

cagcggctta taatgctcga gtgcggaggc gctgcgcttg agtcaggtgt cacacgttgg 1020

gccgtcgaga atggcatatc agtcatggtc ggcatcggga tgacggagac agtcggtacg 1080

ctgtttgcag agcgcgcgca agacgcccgt tccaacggct attctgcgca ggacgccctc 1140

atttctgatg ggatcatgtc actggtcggg tctgacaacg aggaagccac cctcgaaggg 1200

gaactagtcg tcaagagcaa gctcatccct catggataca tcaagtaccg tgattcgtcg 1260

ttttcggtgg actcggacgg ctgggtaact ttcaaaacgg gagacaaata tcagcgcacg 1320

ccagatggac gattcaaatg gcttggaaga aagaccgatt ttattcagat gacaagcagc 1380

gaaacactgg atcccagacc cattgaggaa gccctctgtg cgaatccaag tatcgcaaat 1440

gcatgcgtca ttggtgacag gttcctgagg gagcctgcga ctagcgtatg cgccattgtc 1500

gagatcgggc cggaagtgga catgccttcg tccaagatcg acagagaaat tgcgaatacc 1560

ctcactccaa tcaatcgcgg ccttcctcct gctcttcgca tatcatggtc tcgcgtactc 1620

ataattcgac ctcctcagaa aataccagtt acgaggaaag gtgatgtgtt ccgtaagaag 1680

attgaagata tgtttgggtc tttccttggt gtcggcgttt ctaccgaggt cgaagtcgac 1740

catgaaacta aagaagatga tacgaaacac gtcgtgagac aggttgtaag caatcttctt 1800

ggagtccatg atcttgagtt attgtctgct ttatccttcg ccgagctggg catgacatca 1860

tttatggctg ttagcatcgt caacactcta aacaaacgca tcgacggcct cacccttcca 1920

cctaatgcat gctacatcca tattgatctt gattctcttg tggacgcgat ttcacttgaa 1980

catggtcatg aaagtatccc tgcagagttg ccttctaacc ctttccccgt tatcgagtcc 2040

catcaacata acgataagga cattgtgata gtcggcaagg cattccgttt acccggctca 2100

ctcaacaata ctgcatctct ctgggaagct ttgttatcga agaacagttc agtcatcagt 2160

gacatcccat ccgatcgctg ggatcacgca agcttttacc cccacgatat atgcttcacg 2220

aaagcaggcc tcgtcgatgt tgcacattac gactacagat tttttggcct cacggcgaca 2280

gaggcgttgt acgtatctcc gacgatgcgc ctcgccttgg aagtgtcatt tgaggccctg 2340

gagaacgcaa atattccact atccaagctg aaggggacgc aaaccgccgt ctatgtcgcc 2400

actaaagacg atggcttcga gacactctta aatgccgagc aaggctacga tgcatacacg 2460

cgattctacg gtacgggtcg tgctccgagt accgcaagcg gccgtataag ctatcttctt 2520

gatattcatg ggccatctgt caccgttgat acagcatgca gcggaggcat tgtatgtatg 2580

gatcaagcca tcactttctt gcaatccgga ggggccgata ccgctattgt ctgttcgagc 2640

aatacgcact gttggccggg atcattcatg ttcctgacgg cgcaaggcat ggtttctcaa 2700

aatggaagat gcgctacatt tactaccgat gcagacggat atgtaccttc ggagggtgca 2760

gtggctttca ttctcaagac gcgcagcgct gcgatacgcg acaacgacaa tatactcgcc 2820

gtgatcagat caacagacgt gtcccataac ggccgttctc aagggctagt tgcaccaaac 2880

gtaaaggcgc agacaaacct acaccggtcg ttgctacgaa aagctgggct gtttcctgat 2940

caaattaact ttatcgaagc tcatgggaca ggtacgtctc taggagacct ttcggaaatc 3000

cagggcatta ataacgccta cacctcaaca cgacctcgtc tggccggtcc ccttatcatt 3060

agcgcatcga aaacagtttt aggacacagt gaaccaacag cagggatggc cggcatcctc 3120

acagccttgc ttgcccttga gaaagagaca gttcctggtc taaatcactt aacggagcac 3180

aaccttaacc cttcgcttga ttgcagcgta gttcctctcc tgattcctca cgagtctatt 3240

cacattggtg gtgcaaagcc acatcgagct gcggttctgt catacggctt cgcgggtacg 3300

ctggccggtg ccatcttaga gggaccacct tctgatgtac caaggccgtc gtcaaataat 3360

atacaagaac accctatgat tttcgtcgtc agtgggaaaa ccgtgcctgc actggaagcg 3420

tacctaggac ggtatttggc atttttgcgg gtcgcaaaaa cacacgactt ccatgacatc 3480

tgctacacta cttgcgtcgg gagggagcac tacaaatacc ggttctcctg cgttgcccga 3540

aacatggcag accttatttc tcaaattgaa catcgactga cagctctttc cacttcgaaa 3600

cagaagcctc gcggctcgct agggttcata ttctcaggac aaggcactta tttccctggt 3660

atggctgcag cacttgccga acaatattcg gggttccgag tgctcgtctc taagtttggg 3720

caggctgccc aagagcggtc gggttatccg atcgataggc tgttgcttga agtttctgat 3780

acattgccag aaacaaacag cgaggtcgat caaatttgca tttttgtcta ccaatattct 3840

gttctgcaat ggctgcagag tctaggcatt caaccgaaag cagtcctcgg tcacagtctg 3900

ggagaaatta ctgcagcagt cgcagctggt gccctttcgt tcgaatctgc gttggacctt 3960

gtggtcaccc gtgctcgtct tctccgtcct agagcaaaag attctgcagg aatggccgca 4020

gtagcagcat ccaaggaaga agtcaaaggg cttatagaaa ccctccaact tgcggactcg 4080

ctgagcgttg cggttcataa cggtccgcgg agtgttgttg tgtcaggcgc atcagccgaa 4140

atcgacgccc tggttgtcgc agctaaagaa cggggcttga aggcctcccg cttaaaggtt 4200

gaccaaggct tccacagccc ttacgttgat tctgcggttc caggtttact cgactggtca 4260

aataagcatc gttcgacctt ccttcctttg aacattcctt tatactcgac tttgactggc 4320

gagcttattc cgaagggacg gaggttcgtc tcggatcact gggtaaacca tgctcgaaaa 4380

cctgtccagt ttgcggcggc agcggcagcc gtggatgaag accgatccat tggtgtgctc 4440

gttgacgttg gaccccaacc cgtcgcgtgg accctccttc aagcaaacaa ccttctcaat 4500

acctctgcag ttgcactatt cgcaaaggct ggaaaggatc aggagatggc gctgcttact 4560

gctttgagct acctcgtcca agagcacaac ctttctccca acttccatga gctttactct 4620

cagcgtcatg gtgctctgaa gaagacagac gttcccacct acccattccg ccgtgtccac 4680

cgctatccga ccttcatacc gtcacgaaat caaagtcctg ctgctgcgac ggtagctatg 4740

ccgccacccc gcttctctgt ccaaaagaat gcggatgtag catcacagtc gaaggaatca 4800

gactgtcgag ctggtttgat cagttgcctt agagccatcc tcgaattaac accggaagag 4860

gagtttgacc tttctgagac tctcaacgct cgtggtatgg attcgatcat gtttgcgcag 4920

ctacggaagc gggttgggga agaattcgac cttgacatac ccatgatcta tttatcagat 4980

gtgttcacga tggaacagat ggttgattac ctcgtcaaac agtccggatc cagacccgca 5040

ttaaaacacg cagaaattcc agttaatcaa ccattagacg aagatctccg gacgaggctc 5100

gtttcatgcc tgaggaacgt gctagaaatc acccccgatg aagaacttga cctatctgaa 5160

actttgaacg ctcgtggtgt tgactcgatc atgttcgctc agctacgaaa acgcgttggg 5220

gaaggatttg gtgtggaaat tccgatgata tatctgtccg acgtgtttac catggaagac 5280

atgatcaatt tcctcgtctc tgagcgctcg 5310

<210> 51

<211> 1770

<212> PRT

<213> Armillaria ostoyae

<400> 51

Met Glu Ala Asp Gly His Tyr Ser Leu Leu Asp Val Phe Leu Ser Val

1 5 10 15

Ala His Asp Ser Glu Lys Ser Lys Arg Asn Val Leu Glu Cys Gly Gln

20 25 30

Asp Thr Trp Thr Tyr Ser Asp Leu Asp Ile Ile Ser Ser Ala Leu Ala

35 40 45

Gln Asp Leu Lys Ala Ile Leu Gly Cys Phe Pro Lys Val Ala Val Val

50 55 60

Ser Glu Asn His Pro Tyr Val Phe Ala Leu Met Leu Ala Val Trp Lys

65 70 75 80

Leu Glu Gly Ile Phe Ile Pro Ile Asp Val His Val Thr Ala Asp Leu

85 90 95

Leu Lys Gly Met Leu Arg Ile Val Ala Pro Thr Cys Leu Val Ile Pro

100 105 110

Glu Thr Asp Ile Phe Asn Gln Arg Val Ala Ser Ala Ile Gly Ile His

115 120 125

Val Leu Pro Phe Asn Val Asn Ala Ser Thr Met Thr Ala Leu Arg Gln

130 135 140

Lys Tyr His Pro Phe Thr Gln Lys Ala Ser Leu Ser Gly Cys Ala Leu

145 150 155 160

Pro Tyr Val Asp Arg Ala Cys Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Ser

165 170 175

Ser Thr Ala Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Thr Leu Ile Leu

180 185 190

Ser Asn Cys Arg Ser Lys Leu Ala Trp Trp Arg Arg Val Arg Pro Glu

195 200 205

Gly Glu Met Asp Glu Ile Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His

210 215 220

Ile Leu Ala Tyr Met Gln Asp Ile Gly Thr Ala Thr Leu Leu Asn Ala

225 230 235 240

Gly Cys Tyr Val Phe Ala Ser Val Pro Ser Thr Tyr Pro Thr Gln Leu

245 250 255

Ala Ala Asn Gly Leu Gln Gly Pro Ile Met Asn Ile Ile Asp Ser Leu

260 265 270

Leu Glu Arg Arg Val Ala Ala Phe Ala Cys Val Pro Phe Ile Leu Ser

275 280 285

Glu Leu Lys Ala Met Cys Glu Thr Ala Ser Ser Pro Asp Asp Lys His

290 295 300

Gln Met Cys Leu Arg Ala Glu Glu Lys Val Arg Leu Val Ser Ala Leu

305 310 315 320

Gln Arg Leu Ile Met Leu Glu Cys Gly Gly Ala Ala Leu Glu Ser Gly

325 330 335

Val Thr Arg Trp Ala Val Glu Asn Gly Ile Ser Val Met Val Gly Ile

340 345 350

Gly Met Thr Glu Thr Val Gly Thr Leu Phe Ala Glu Arg Ala Gln Asp

355 360 365

Ala Arg Ser Asn Gly Tyr Ser Ala Gln Asp Ala Leu Ile Ser Asp Gly

370 375 380

Ile Met Ser Leu Val Gly Ser Asp Asn Glu Glu Ala Thr Leu Glu Gly

385 390 395 400

Glu Leu Val Val Lys Ser Lys Leu Ile Pro His Gly Tyr Ile Lys Tyr

405 410 415

Arg Asp Ser Ser Phe Ser Val Asp Ser Asp Gly Trp Val Thr Phe Lys

420 425 430

Thr Gly Asp Lys Tyr Gln Arg Thr Pro Asp Gly Arg Phe Lys Trp Leu

435 440 445

Gly Arg Lys Thr Asp Phe Ile Gln Met Thr Ser Ser Glu Thr Leu Asp

450 455 460

Pro Arg Pro Ile Glu Glu Ala Leu Cys Ala Asn Pro Ser Ile Ala Asn

465 470 475 480

Ala Cys Val Ile Gly Asp Arg Phe Leu Arg Glu Pro Ala Thr Ser Val

485 490 495

Cys Ala Ile Val Glu Ile Gly Pro Glu Val Asp Met Pro Ser Ser Lys

500 505 510

Ile Asp Arg Glu Ile Ala Asn Thr Leu Thr Pro Ile Asn Arg Gly Leu

515 520 525

Pro Pro Ala Leu Arg Ile Ser Trp Ser Arg Val Leu Ile Ile Arg Pro

530 535 540

Pro Gln Lys Ile Pro Val Thr Arg Lys Gly Asp Val Phe Arg Lys Lys

545 550 555 560

Ile Glu Asp Met Phe Gly Ser Phe Leu Gly Val Gly Val Ser Thr Glu

565 570 575

Val Glu Val Asp His Glu Thr Lys Glu Asp Asp Thr Lys His Val Val

580 585 590

Arg Gln Val Val Ser Asn Leu Leu Gly Val His Asp Leu Glu Leu Leu

595 600 605

Ser Ala Leu Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Phe Met Ala Val

610 615 620

Ser Ile Val Asn Thr Leu Asn Lys Arg Ile Asp Gly Leu Thr Leu Pro

625 630 635 640

Pro Asn Ala Cys Tyr Ile His Ile Asp Leu Asp Ser Leu Val Asp Ala

645 650 655

Ile Ser Leu Glu His Gly His Glu Ser Ile Pro Ala Glu Leu Pro Ser

660 665 670

Asn Pro Phe Pro Val Ile Glu Ser His Gln His Asn Asp Lys Asp Ile

675 680 685

Val Ile Val Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Ser Leu Asn Asn Thr

690 695 700

Ala Ser Leu Trp Glu Ala Leu Leu Ser Lys Asn Ser Ser Val Ile Ser

705 710 715 720

Asp Ile Pro Ser Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro His Asp

725 730 735

Ile Cys Phe Thr Lys Ala Gly Leu Val Asp Val Ala His Tyr Asp Tyr

740 745 750

Arg Phe Phe Gly Leu Thr Ala Thr Glu Ala Leu Tyr Val Ser Pro Thr

755 760 765

Met Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn

770 775 780

Ile Pro Leu Ser Lys Leu Lys Gly Thr Gln Thr Ala Val Tyr Val Ala

785 790 795 800

Thr Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Glu Gln Gly Tyr

805 810 815

Asp Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser Thr Ala

820 825 830

Ser Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu Asp Ile His Gly Pro Ser Val Thr

835 840 845

Val Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile Val Cys Met Asp Gln Ala Ile

850 855 860

Thr Phe Leu Gln Ser Gly Gly Ala Asp Thr Ala Ile Val Cys Ser Ser

865 870 875 880

Asn Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Met Phe Leu Thr Ala Gln Gly

885 890 895

Met Val Ser Gln Asn Gly Arg Cys Ala Thr Phe Thr Thr Asp Ala Asp

900 905 910

Gly Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys Thr Arg

915 920 925

Ser Ala Ala Ile Arg Asp Asn Asp Asn Ile Leu Ala Val Ile Arg Ser

930 935 940

Thr Asp Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn

945 950 955 960

Val Lys Ala Gln Thr Asn Leu His Arg Ser Leu Leu Arg Lys Ala Gly

965 970 975

Leu Phe Pro Asp Gln Ile Asn Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr

980 985 990

Ser Leu Gly Asp Leu Ser Glu Ile Gln Gly Ile Asn Asn Ala Tyr Thr

995 1000 1005

Ser Thr Arg Pro Arg Leu Ala Gly Pro Leu Ile Ile Ser Ala Ser

1010 1015 1020

Lys Thr Val Leu Gly His Ser Glu Pro Thr Ala Gly Met Ala Gly

1025 1030 1035

Ile Leu Thr Ala Leu Leu Ala Leu Glu Lys Glu Thr Val Pro Gly

1040 1045 1050

Leu Asn His Leu Thr Glu His Asn Leu Asn Pro Ser Leu Asp Cys

1055 1060 1065

Ser Val Val Pro Leu Leu Ile Pro His Glu Ser Ile His Ile Gly

1070 1075 1080

Gly Ala Lys Pro His Arg Ala Ala Val Leu Ser Tyr Gly Phe Ala

1085 1090 1095

Gly Thr Leu Ala Gly Ala Ile Leu Glu Gly Pro Pro Ser Asp Val

1100 1105 1110

Pro Arg Pro Ser Ser Asn Asn Ile Gln Glu His Pro Met Ile Phe

1115 1120 1125

Val Val Ser Gly Lys Thr Val Pro Ala Leu Glu Ala Tyr Leu Gly

1130 1135 1140

Arg Tyr Leu Ala Phe Leu Arg Val Ala Lys Thr His Asp Phe His

1145 1150 1155

Asp Ile Cys Tyr Thr Thr Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Lys Tyr

1160 1165 1170

Arg Phe Ser Cys Val Ala Arg Asn Met Ala Asp Leu Ile Ser Gln

1175 1180 1185

Ile Glu His Arg Leu Thr Ala Leu Ser Thr Ser Lys Gln Lys Pro

1190 1195 1200

Arg Gly Ser Leu Gly Phe Ile Phe Ser Gly Gln Gly Thr Tyr Phe

1205 1210 1215

Pro Gly Met Ala Ala Ala Leu Ala Glu Gln Tyr Ser Gly Phe Arg

1220 1225 1230

Val Leu Val Ser Lys Phe Gly Gln Ala Ala Gln Glu Arg Ser Gly

1235 1240 1245

Tyr Pro Ile Asp Arg Leu Leu Leu Glu Val Ser Asp Thr Leu Pro

1250 1255 1260

Glu Thr Asn Ser Glu Val Asp Gln Ile Cys Ile Phe Val Tyr Gln

1265 1270 1275

Tyr Ser Val Leu Gln Trp Leu Gln Ser Leu Gly Ile Gln Pro Lys

1280 1285 1290

Ala Val Leu Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ala Val Ala

1295 1300 1305

Ala Gly Ala Leu Ser Phe Glu Ser Ala Leu Asp Leu Val Val Thr

1310 1315 1320

Arg Ala Arg Leu Leu Arg Pro Arg Ala Lys Asp Ser Ala Gly Met

1325 1330 1335

Ala Ala Val Ala Ala Ser Lys Glu Glu Val Lys Gly Leu Ile Glu

1340 1345 1350

Thr Leu Gln Leu Ala Asp Ser Leu Ser Val Ala Val His Asn Gly

1355 1360 1365

Pro Arg Ser Val Val Val Ser Gly Ala Ser Ala Glu Ile Asp Ala

1370 1375 1380

Leu Val Val Ala Ala Lys Glu Arg Gly Leu Lys Ala Ser Arg Leu

1385 1390 1395

Lys Val Asp Gln Gly Phe His Ser Pro Tyr Val Asp Ser Ala Val

1400 1405 1410

Pro Gly Leu Leu Asp Trp Ser Asn Lys His Arg Ser Thr Phe Leu

1415 1420 1425

Pro Leu Asn Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Thr Gly Glu Leu Ile

1430 1435 1440

Pro Lys Gly Arg Arg Phe Val Ser Asp His Trp Val Asn His Ala

1445 1450 1455

Arg Lys Pro Val Gln Phe Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val Asp Glu

1460 1465 1470

Asp Arg Ser Ile Gly Val Leu Val Asp Val Gly Pro Gln Pro Val

1475 1480 1485

Ala Trp Thr Leu Leu Gln Ala Asn Asn Leu Leu Asn Thr Ser Ala

1490 1495 1500

Val Ala Leu Phe Ala Lys Ala Gly Lys Asp Gln Glu Met Ala Leu

1505 1510 1515

Leu Thr Ala Leu Ser Tyr Leu Val Gln Glu His Asn Leu Ser Pro

1520 1525 1530

Asn Phe His Glu Leu Tyr Ser Gln Arg His Gly Ala Leu Lys Lys

1535 1540 1545

Thr Asp Val Pro Thr Tyr Pro Phe Arg Arg Val His Arg Tyr Pro

1550 1555 1560

Thr Phe Ile Pro Ser Arg Asn Gln Ser Pro Ala Ala Ala Thr Val

1565 1570 1575

Ala Met Pro Pro Pro Arg Phe Ser Val Gln Lys Asn Ala Asp Val

1580 1585 1590

Ala Ser Gln Ser Lys Glu Ser Asp Cys Arg Ala Gly Leu Ile Ser

1595 1600 1605

Cys Leu Arg Ala Ile Leu Glu Leu Thr Pro Glu Glu Glu Phe Asp

1610 1615 1620

Leu Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Met Asp Ser Ile Met Phe

1625 1630 1635

Ala Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Glu Phe Asp Leu Asp Ile

1640 1645 1650

Pro Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Gln Met Val

1655 1660 1665

Asp Tyr Leu Val Lys Gln Ser Gly Ser Arg Pro Ala Leu Lys His

1670 1675 1680

Ala Glu Ile Pro Val Asn Gln Pro Leu Asp Glu Asp Leu Arg Thr

1685 1690 1695

Arg Leu Val Ser Cys Leu Arg Asn Val Leu Glu Ile Thr Pro Asp

1700 1705 1710

Glu Glu Leu Asp Leu Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Val Asp

1715 1720 1725

Ser Ile Met Phe Ala Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Gly Phe

1730 1735 1740

Gly Val Glu Ile Pro Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met

1745 1750 1755

Glu Asp Met Ile Asn Phe Leu Val Ser Glu Arg Ser

1760 1765 1770

<210> 52

<211> 5322

<212> DNA

<213> Armillaria fuscipes

<400> 52

atgaccatgg aggtcgacag ccactattct ctgctcgatg tctttctcag cattgcacat 60

gattctgaca agtccaaacg caatgtcttg gaatgcggcc tggaggcctg gacatactcg 120

gatttagaca tcatctcgtc ggctctggca caggatctca aagctacctt gggatgtttt 180

cccaaagttg cagtcgtcag cgagaaccat ccctacgtgt ttgctctcat gctggccgtc 240

tggaagctcg aagggatctt catccccata gacgtccacg ttacagctga ccttttaaag 300

ggcatgctac gcattgttgc tcctacttgt ctagtgatcc ctgagagcga tgtttccaac 360

cggcgtgttg cctctgcgat tggtatacgt gttctcccat ttgatgcgaa ttcgtcaacc 420

atgacggcac ttcgacaaaa gtacgaatca ttcactcaga aagcctcgcc atctgagtgc 480

acacttgccc acgccgatcg tacatgcctc tatcttttta catcctctgc atcctctacc 540

gccaacttga aatgtgtgcc tttgacccat actcttatcc tcaataactg ccgtaccaag 600

ctcgcatggt ggcagcgctt tcgtccagaa agcgaaatgg atgggatgcg tgttctaggg 660

tgggcacctt ggtcgcatat ccttgcctac atgcaagata tcggcacagc gacgctcctg 720

aacgccggtt gctatgtctt tgcgtccatt ccatccacat accctacaca actagcagca 780

aatggcttac aaggccccac tatgaatatc atcaacgcac ttcttgaacg acaaattgcc 840

gcatttgctt gcgtgccgtt cattttgagc gaactcaaag ctatgtgcga gatgacttcc 900

tgtacaggaa accaaatgtc cctaagagcc gaggagaaag ttcgcctggt cagggtgctg 960

caggggcttg taatgctcga gtgtggaggc gcggcacttg agtcagatgt tacgcgttgg 1020

gtcgttgaga atgacatacc agtcatggtt ggcattggga tgacggaaac agtcggtacg 1080

ctgttcgcag agcgcgccca agacgtccgt tccagcggat attccgccca agacgctctc 1140

attgctgatg gcattatgtc actggtcggt tctgacaacg aggaagccac tttcgaaggg 1200

gaactagtcg tgaagagcaa gctcatccca cagggataca tagggtaccg tgattcatcg 1260

ttctcggtgg actcagatgg ctgggtaacg ttcaaaactg gagataaata tcagcgcact 1320

ccagatggac gattaaaatg gcttgggaga aagaccgact ttatccagat gacaagcagc 1380

gaaacactgg atcccaggcc cattgagcaa actctttgtg cgaatccata cgtcgcaaaa 1440

gcatgcgtca ttggtgacag attcctgaga gatcccgcga ccagcgtatg tgccataatt 1500

gagatcaggc cggaagtgga catgccttcg tccaagatcg acagagaaat tgcgaatgcc 1560

cttgctccaa tcaatcgcga cctccctcct gctcttcgca tatcatggtc tcgcgtactc 1620

atgatcagac cccctcagaa aatcccagta acgaggaaag gcgatgtgtt ccgtaagaag 1680

attgaagata tgtttgggtc tttcctcggt gtcggtgttt ctactgaggt cggagtcgac 1740

catgaaactg aaaaagatga tacggaacac attgtgagac aggttgttac taatcttctt 1800

ggagtccatg atcccgagct attgtctgct ttatctttcg ctgagcttgg aatgacttca 1860

tttatggctg tcagcatcgt caactctcta aacaagtaca tcgatggcct cacccttcca 1920

cctaatgcat gttacatcca tattgatctt gattctcttg tggaggccat ttcacgtgaa 1980

cggggtcatg gaagtaacgc cacagagttg ccttctcaac ccgtccctgt tgagttacat 2040

caacctaacg ataaggacgt tgtgatagtt ggcaaggcat tccgtttacc tggctcactc 2100

gacagcactg catctctatg ggaagctttg ttatcaaaga acaattcagt cgtcagtgaa 2160

atcccatccg atcgctggga tcacgcaagc ttttaccccc acgacatttg cttcacgaaa 2220

gcaggcctcg tcgatgttgc ccattacgat tacagattct ttggcctcac ggctacagag 2280

gcattgtatg tatctccgac gatgcgtctc gccttggaag tgtcatttga agccctggag 2340

aatgcgaata ttccgttatc caatctgaag ggaacacaaa ccgctgtcta tgtcgccacc 2400

aaagacgatg gtttcgagac acttttaaat gccgagcagg gctatgatgc ctacacacga 2460

ttctatggca cgggccgcgc tccaagcacc gcaagtggcc gtataagcta tctacttgat 2520

attcatgggc catctgtcac cgttgataca gcatgcagcg gaggcattgt gtgtatggat 2580

caagccatca ctttcttgca gtccggaggg gcagatacag ctattgtctg ttcgagcaat 2640

acgcattgtt ggcctggatc atttatgttc ctgacggcgc aaggcatggt ttctccaaat 2700

ggaagatgcg ctacatttag taccgatgca gacggatatg tgccttcaga gggcgcagta 2760

gctttcgttc tcaagacgcg tagcgcagca atacgcgata atgacaatat cctcgccgta 2820

atcaaatcaa cagatgtgtc tcataacggc cgttctcaag ggctggttgc acctaacgtg 2880

aaggcgcaga caaacctgca tcaatcgttg ttacgaaaag ctgggctgtt tcctgatcaa 2940

atcaacttta tcgaagccca tggaacaggt acatctctag gagacctctc agaaatccag 3000

ggcatcaata acgcctacac ctcaacacga cctcgtctag acggtcccct tatcatcagc 3060

gcatcgaaaa cagtgatagg acacagcgaa ccaactgcag ggatggcggg catcctcaca 3120

gccttgcttg ctcttgagaa agaaacagtt cctggtctca atcacttaac ggagcacagc 3180

cttaaccctt cgcttgattg cagcatagtc ccgctcctga ttcctcacga gtctattcac 3240

attggtgggg taaagccaca tcgagctgcg gttctgtcat acggcttcgc gggtacactg 3300

gcgggtgcta tcttagaggg accgccttca gatgcaccaa ggccgtcgtc aaataatgtg 3360

caagatcacc ctatgatttt tgccctcagt gggaaaagcg cgtccgcact ggaagcatac 3420

ctaaggcggt atttggcatt cctgcggatt gcagatccac acgacttcca taacatctgc 3480

tacacttcct gtgtcgggag ggagcactac aaatatcggt tctcctgtgt tgcccgaaac 3540

atggcagacc ttatatctca aattgaacat cgactgacaa ctgtttccat tccgaaaccg 3600

aaacctcgtg gctcaatagg attcacgttc tcaggacaag gcacttattt ccctggcatg 3660

gccgcagcac tcactgaaca atattctgga ttccggacgc tcgtctctaa gcttgggcag 3720

gctgcgcaag agcggtcggg tcatccgatt gacaggctgt tacttgaagt ttccggtaca 3780

tcaccagaaa caaacagtga ggtcgagcaa atttgcacat ttatctacca atatgccgtt 3840

ctgcaatggt tgcagagcct aggcgttcaa ccgaaagcag tcctcggtca cagcctggga 3900

gaaattactg ccgcagtcgc agctggtgcc ctgtcgttcg aatccgcgtt ggaccttgtg 3960

gtgacccgtg ctcgtcttct ccgtcccgaa acaaaagatt ctgctgggat ggtcgcggta 4020

gcaacgtcca aggatgaagt tgaaggactt atagaaacac tccaagttgc ggacgcgcta 4080

agcgttgccg ttcacaacgg ttcacggagt gttgtggttt caggcacatc agcggaagtt 4140

gatgccctgg tcgtcgcagc taaagaacgg ggcttaaagg cttcccgctt aagagtcgac 4200

caaggtttcc acagcccttg cgttgattct gccgttcctg gtttactcga ctggtcaaat 4260

gagcatcgtt ccaccttcct tcctttgaat atgcctttat actcgacttt gaccggcgag 4320

gtcattccca agggacggaa attcgtctgg gatcactggg taaaccatgc tcgaaaacct 4380

gttcagtttg caccggcagc aaaagcggtg gacgaagacc gatccatcgg tgtgctcgtt 4440

gatgtaggac ctcaacctgt cgcttggacc cttttgcaag caaacaacct ttccaacacc 4500

tctacggttg cgctattcgc gaaagccgga aaggatcagg agatggcact gctcactgct 4560

ttgagctacc tcttccaaga gcacaacctt tctcccaagt ttcacgacct ttatactggg 4620

tataatggtg ctctgaagaa gacggacatt cccacgtacc cattccaacg tgtccatcgc 4680

tatcccacct tcataccatc acgaaatcag agtcctgctg tcgcgaaagc agtcgtgcag 4740

ccgccccgct tctctatcca aaggaatcga gaagccacat tacagtcgaa ggaaccagat 4800

caccgagctt gtttagtcac ttgccttaga gccatcctcg aattaacatc agaggaagaa 4860

cttgacctct ctgagaccct caacgctcgt ggcgtggact cgatcatgtt ttcacagcta 4920

cggaagcggg ttggagaaga attcaatctc gagataccca tgatctattt atcagacgta 4980

ttcacgatgg agcagatgat tgactacctc gtcgaacagt ccggatccaa tcccgcatca 5040

aagcaagtag gaactccggt taaccgacta tcaggcgaag aagatcttcg gacggggctc 5100

atctcatgcc tgagggacgt gctagaaatc actcctgatg atgaacttga tcacccaaaa 5160

gacctatctg aaactttaaa tgctcgtggt gttgattcga taatgttcgc tcagctacga 5220

aaacgcgtcg gggaaggatt tggtgtggaa attccgatga tatatctgtc tgatgtgttt 5280

accatggaag acatgattaa tttcctcgtt tctgagcgct ca 5322

<210> 53

<211> 1774

<212> PRT

<213> Armillaria fuscipes

<400> 53

Met Thr Met Glu Val Asp Ser His Tyr Ser Leu Leu Asp Val Phe Leu

1 5 10 15

Ser Ile Ala His Asp Ser Asp Lys Ser Lys Arg Asn Val Leu Glu Cys

20 25 30

Gly Leu Glu Ala Trp Thr Tyr Ser Asp Leu Asp Ile Ile Ser Ser Ala

35 40 45

Leu Ala Gln Asp Leu Lys Ala Thr Leu Gly Cys Phe Pro Lys Val Ala

50 55 60

Val Val Ser Glu Asn His Pro Tyr Val Phe Ala Leu Met Leu Ala Val

65 70 75 80

Trp Lys Leu Glu Gly Ile Phe Ile Pro Ile Asp Val His Val Thr Ala

85 90 95

Asp Leu Leu Lys Gly Met Leu Arg Ile Val Ala Pro Thr Cys Leu Val

100 105 110

Ile Pro Glu Ser Asp Val Ser Asn Arg Arg Val Ala Ser Ala Ile Gly

115 120 125

Ile Arg Val Leu Pro Phe Asp Ala Asn Ser Ser Thr Met Thr Ala Leu

130 135 140

Arg Gln Lys Tyr Glu Ser Phe Thr Gln Lys Ala Ser Pro Ser Glu Cys

145 150 155 160

Thr Leu Ala His Ala Asp Arg Thr Cys Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser

165 170 175

Ala Ser Ser Thr Ala Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Thr Leu

180 185 190

Ile Leu Asn Asn Cys Arg Thr Lys Leu Ala Trp Trp Gln Arg Phe Arg

195 200 205

Pro Glu Ser Glu Met Asp Gly Met Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp

210 215 220

Ser His Ile Leu Ala Tyr Met Gln Asp Ile Gly Thr Ala Thr Leu Leu

225 230 235 240

Asn Ala Gly Cys Tyr Val Phe Ala Ser Ile Pro Ser Thr Tyr Pro Thr

245 250 255

Gln Leu Ala Ala Asn Gly Leu Gln Gly Pro Thr Met Asn Ile Ile Asn

260 265 270

Ala Leu Leu Glu Arg Gln Ile Ala Ala Phe Ala Cys Val Pro Phe Ile

275 280 285

Leu Ser Glu Leu Lys Ala Met Cys Glu Met Thr Ser Cys Thr Gly Asn

290 295 300

Gln Met Ser Leu Arg Ala Glu Glu Lys Val Arg Leu Val Arg Val Leu

305 310 315 320

Gln Gly Leu Val Met Leu Glu Cys Gly Gly Ala Ala Leu Glu Ser Asp

325 330 335

Val Thr Arg Trp Val Val Glu Asn Asp Ile Pro Val Met Val Gly Ile

340 345 350

Gly Met Thr Glu Thr Val Gly Thr Leu Phe Ala Glu Arg Ala Gln Asp

355 360 365

Val Arg Ser Ser Gly Tyr Ser Ala Gln Asp Ala Leu Ile Ala Asp Gly

370 375 380

Ile Met Ser Leu Val Gly Ser Asp Asn Glu Glu Ala Thr Phe Glu Gly

385 390 395 400

Glu Leu Val Val Lys Ser Lys Leu Ile Pro Gln Gly Tyr Ile Gly Tyr

405 410 415

Arg Asp Ser Ser Phe Ser Val Asp Ser Asp Gly Trp Val Thr Phe Lys

420 425 430

Thr Gly Asp Lys Tyr Gln Arg Thr Pro Asp Gly Arg Leu Lys Trp Leu

435 440 445

Gly Arg Lys Thr Asp Phe Ile Gln Met Thr Ser Ser Glu Thr Leu Asp

450 455 460

Pro Arg Pro Ile Glu Gln Thr Leu Cys Ala Asn Pro Tyr Val Ala Lys

465 470 475 480

Ala Cys Val Ile Gly Asp Arg Phe Leu Arg Asp Pro Ala Thr Ser Val

485 490 495

Cys Ala Ile Ile Glu Ile Arg Pro Glu Val Asp Met Pro Ser Ser Lys

500 505 510

Ile Asp Arg Glu Ile Ala Asn Ala Leu Ala Pro Ile Asn Arg Asp Leu

515 520 525

Pro Pro Ala Leu Arg Ile Ser Trp Ser Arg Val Leu Met Ile Arg Pro

530 535 540

Pro Gln Lys Ile Pro Val Thr Arg Lys Gly Asp Val Phe Arg Lys Lys

545 550 555 560

Ile Glu Asp Met Phe Gly Ser Phe Leu Gly Val Gly Val Ser Thr Glu

565 570 575

Val Gly Val Asp His Glu Thr Glu Lys Asp Asp Thr Glu His Ile Val

580 585 590

Arg Gln Val Val Thr Asn Leu Leu Gly Val His Asp Pro Glu Leu Leu

595 600 605

Ser Ala Leu Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Phe Met Ala Val

610 615 620

Ser Ile Val Asn Ser Leu Asn Lys Tyr Ile Asp Gly Leu Thr Leu Pro

625 630 635 640

Pro Asn Ala Cys Tyr Ile His Ile Asp Leu Asp Ser Leu Val Glu Ala

645 650 655

Ile Ser Arg Glu Arg Gly His Gly Ser Asn Ala Thr Glu Leu Pro Ser

660 665 670

Gln Pro Val Pro Val Glu Leu His Gln Pro Asn Asp Lys Asp Val Val

675 680 685

Ile Val Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Ser Leu Asp Ser Thr Ala

690 695 700

Ser Leu Trp Glu Ala Leu Leu Ser Lys Asn Asn Ser Val Val Ser Glu

705 710 715 720

Ile Pro Ser Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro His Asp Ile

725 730 735

Cys Phe Thr Lys Ala Gly Leu Val Asp Val Ala His Tyr Asp Tyr Arg

740 745 750

Phe Phe Gly Leu Thr Ala Thr Glu Ala Leu Tyr Val Ser Pro Thr Met

755 760 765

Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn Ile

770 775 780

Pro Leu Ser Asn Leu Lys Gly Thr Gln Thr Ala Val Tyr Val Ala Thr

785 790 795 800

Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Glu Gln Gly Tyr Asp

805 810 815

Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser Thr Ala Ser

820 825 830

Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu Asp Ile His Gly Pro Ser Val Thr Val

835 840 845

Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile Val Cys Met Asp Gln Ala Ile Thr

850 855 860

Phe Leu Gln Ser Gly Gly Ala Asp Thr Ala Ile Val Cys Ser Ser Asn

865 870 875 880

Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Met Phe Leu Thr Ala Gln Gly Met

885 890 895

Val Ser Pro Asn Gly Arg Cys Ala Thr Phe Ser Thr Asp Ala Asp Gly

900 905 910

Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Val Leu Lys Thr Arg Ser

915 920 925

Ala Ala Ile Arg Asp Asn Asp Asn Ile Leu Ala Val Ile Lys Ser Thr

930 935 940

Asp Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn Val

945 950 955 960

Lys Ala Gln Thr Asn Leu His Gln Ser Leu Leu Arg Lys Ala Gly Leu

965 970 975

Phe Pro Asp Gln Ile Asn Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr Ser

980 985 990

Leu Gly Asp Leu Ser Glu Ile Gln Gly Ile Asn Asn Ala Tyr Thr Ser

995 1000 1005

Thr Arg Pro Arg Leu Asp Gly Pro Leu Ile Ile Ser Ala Ser Lys

1010 1015 1020

Thr Val Ile Gly His Ser Glu Pro Thr Ala Gly Met Ala Gly Ile

1025 1030 1035

Leu Thr Ala Leu Leu Ala Leu Glu Lys Glu Thr Val Pro Gly Leu

1040 1045 1050

Asn His Leu Thr Glu His Ser Leu Asn Pro Ser Leu Asp Cys Ser

1055 1060 1065

Ile Val Pro Leu Leu Ile Pro His Glu Ser Ile His Ile Gly Gly

1070 1075 1080

Val Lys Pro His Arg Ala Ala Val Leu Ser Tyr Gly Phe Ala Gly

1085 1090 1095

Thr Leu Ala Gly Ala Ile Leu Glu Gly Pro Pro Ser Asp Ala Pro

1100 1105 1110

Arg Pro Ser Ser Asn Asn Val Gln Asp His Pro Met Ile Phe Ala

1115 1120 1125

Leu Ser Gly Lys Ser Ala Ser Ala Leu Glu Ala Tyr Leu Arg Arg

1130 1135 1140

Tyr Leu Ala Phe Leu Arg Ile Ala Asp Pro His Asp Phe His Asn

1145 1150 1155

Ile Cys Tyr Thr Ser Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Lys Tyr Arg

1160 1165 1170

Phe Ser Cys Val Ala Arg Asn Met Ala Asp Leu Ile Ser Gln Ile

1175 1180 1185

Glu His Arg Leu Thr Thr Val Ser Ile Pro Lys Pro Lys Pro Arg

1190 1195 1200

Gly Ser Ile Gly Phe Thr Phe Ser Gly Gln Gly Thr Tyr Phe Pro

1205 1210 1215

Gly Met Ala Ala Ala Leu Thr Glu Gln Tyr Ser Gly Phe Arg Thr

1220 1225 1230

Leu Val Ser Lys Leu Gly Gln Ala Ala Gln Glu Arg Ser Gly His

1235 1240 1245

Pro Ile Asp Arg Leu Leu Leu Glu Val Ser Gly Thr Ser Pro Glu

1250 1255 1260

Thr Asn Ser Glu Val Glu Gln Ile Cys Thr Phe Ile Tyr Gln Tyr

1265 1270 1275

Ala Val Leu Gln Trp Leu Gln Ser Leu Gly Val Gln Pro Lys Ala

1280 1285 1290

Val Leu Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ala Val Ala Ala

1295 1300 1305

Gly Ala Leu Ser Phe Glu Ser Ala Leu Asp Leu Val Val Thr Arg

1310 1315 1320

Ala Arg Leu Leu Arg Pro Glu Thr Lys Asp Ser Ala Gly Met Val

1325 1330 1335

Ala Val Ala Thr Ser Lys Asp Glu Val Glu Gly Leu Ile Glu Thr

1340 1345 1350

Leu Gln Val Ala Asp Ala Leu Ser Val Ala Val His Asn Gly Ser

1355 1360 1365

Arg Ser Val Val Val Ser Gly Thr Ser Ala Glu Val Asp Ala Leu

1370 1375 1380

Val Val Ala Ala Lys Glu Arg Gly Leu Lys Ala Ser Arg Leu Arg

1385 1390 1395

Val Asp Gln Gly Phe His Ser Pro Cys Val Asp Ser Ala Val Pro

1400 1405 1410

Gly Leu Leu Asp Trp Ser Asn Glu His Arg Ser Thr Phe Leu Pro

1415 1420 1425

Leu Asn Met Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Thr Gly Glu Val Ile Pro

1430 1435 1440

Lys Gly Arg Lys Phe Val Trp Asp His Trp Val Asn His Ala Arg

1445 1450 1455

Lys Pro Val Gln Phe Ala Pro Ala Ala Lys Ala Val Asp Glu Asp

1460 1465 1470

Arg Ser Ile Gly Val Leu Val Asp Val Gly Pro Gln Pro Val Ala

1475 1480 1485

Trp Thr Leu Leu Gln Ala Asn Asn Leu Ser Asn Thr Ser Thr Val

1490 1495 1500

Ala Leu Phe Ala Lys Ala Gly Lys Asp Gln Glu Met Ala Leu Leu

1505 1510 1515

Thr Ala Leu Ser Tyr Leu Phe Gln Glu His Asn Leu Ser Pro Lys

1520 1525 1530

Phe His Asp Leu Tyr Thr Gly Tyr Asn Gly Ala Leu Lys Lys Thr

1535 1540 1545

Asp Ile Pro Thr Tyr Pro Phe Gln Arg Val His Arg Tyr Pro Thr

1550 1555 1560

Phe Ile Pro Ser Arg Asn Gln Ser Pro Ala Val Ala Lys Ala Val

1565 1570 1575

Val Gln Pro Pro Arg Phe Ser Ile Gln Arg Asn Arg Glu Ala Thr

1580 1585 1590

Leu Gln Ser Lys Glu Pro Asp His Arg Ala Cys Leu Val Thr Cys

1595 1600 1605

Leu Arg Ala Ile Leu Glu Leu Thr Ser Glu Glu Glu Leu Asp Leu

1610 1615 1620

Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Val Asp Ser Ile Met Phe Ser

1625 1630 1635

Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Glu Phe Asn Leu Glu Ile Pro

1640 1645 1650

Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Gln Met Ile Asp

1655 1660 1665

Tyr Leu Val Glu Gln Ser Gly Ser Asn Pro Ala Ser Lys Gln Val

1670 1675 1680

Gly Thr Pro Val Asn Arg Leu Ser Gly Glu Glu Asp Leu Arg Thr

1685 1690 1695

Gly Leu Ile Ser Cys Leu Arg Asp Val Leu Glu Ile Thr Pro Asp

1700 1705 1710

Asp Glu Leu Asp His Pro Lys Asp Leu Ser Glu Thr Leu Asn Ala

1715 1720 1725

Arg Gly Val Asp Ser Ile Met Phe Ala Gln Leu Arg Lys Arg Val

1730 1735 1740

Gly Glu Gly Phe Gly Val Glu Ile Pro Met Ile Tyr Leu Ser Asp

1745 1750 1755

Val Phe Thr Met Glu Asp Met Ile Asn Phe Leu Val Ser Glu Arg

1760 1765 1770

Ser

<210> 54

<211> 5304

<212> DNA

<213> Armillaria mellea

<400> 54

atggaggcca acggtcacta ctctcttctc gatgtctttc tcagcattgc acacgattct 60

gacaagtcca aacgtaatgt cttggaatgc ggtcaggata cctggacata ctcagatttg 120

gacattatct cgtcggccct ggcacaggat ctccaagcta cgctgggttg ttttcccaaa 180

gttgcagtcg tcagcgagaa ccatccctac atttttgctc tcatgctggc cgtttggaag 240

ctcgaaggga tattcatccc tgtcgacgtc catgttacag ctgaccttct aaagggcatg 300

ttacatatcg tcgctcccac ttgtctggtg atccctgaga ccgatatttc caaccagcgt 360

attgcttccg cgattggtat acatgttctc cccttcagtg cgaatgcgtc gaccatgact 420

gcacttcgac agaaatacga cctatgcatt cagaaagcct cgctatctga gcgcgcactt 480

cctcacgttg atcgcgcttg cctctatctc tttacatcct ctgcgtcctc tactgccaac 540

ttgaaatgcg tacctttgac ccatagtctt atcctcagta actgccgttc caaactcgca 600

tggtggcggc gcgttcgtcc agaggaagaa atggatggga tacgtgttct agggtgggca 660

ccttggtccc atatccttgc ctacatgcaa gatattggca cagcgacgct cctgaacgcc 720

ggttgctacg tctttgcgtc aattccgtcc acatatccta cacaactggt ggtgaatggc 780

ttacaaggcc ccaccatgaa tatcatcgac tcacttctta aacggcgaat cgtcgcattt 840

gcttgtgtcc cgttcatttt gggcgaacta aaagctatgt gcgagacggc ttcgggtcca 900

gatgtcaagc atcatatggg cttgagagct gaggagaagg ttcgccttgt tagggcactg 960

cagcagctta tgatgctcga gtgcggaggc gctgcgctcg agtcagatgt cacgcgttgg 1020

gttgtcgaaa atggcatatc ggtcatggtt ggcatcggga tgacggagac agttggtacg 1080

ctgtttgcag agcgcgcgca agacgcccgt tccaacggct actctgcgca gaacgccctc 1140

attactgatg gcattatgtc actggtcggg cctgacaacg aggaagtcac ctttgaaggg 1200

gaactagtcg tgaagagcaa gctcatccca cacgaataca tcaattaccg tgattcgtcg 1260

ttctcggtgg actcggatgg ctgggtaacg tttaaaacgg gagataaata tcagcgcaca 1320

ccagatggac gattcaaatg gcttggaaga aagaccgact ttattcagat gacaagcagt 1380

gaaacactgg atcccagacc cattgagaaa accctctgtg cgaatccaag tattgtaaat 1440

gcatgcgtca ttggtgacag attcctgagg gagcctgcaa ctagcgtatg cgccattgtc 1500

gagatcaggc cggaagtgga catcccttcg tccaagatcg acagggaaat tgcgaatgcc 1560

cttgctccaa tcaatcgcga cctccctcct gctcttcgca tatcatggtc tcgcgtactc 1620

ataattcgac ctcctcagaa aataccagtt acaaggaaag gcgatgtgtt ccgtaagaag 1680

attgaagatg tatttgggtc tttccttggt gtcggttcta ccgagatcaa agtcgaccat 1740

gaatctaaag aagatgatac ggaacacatt gtgagacagg ttgtcagcaa tcttcttgga 1800

gtccatgatc ctgagctatt gtctgcttta tctttcgctg agctgggaat gacctcgttt 1860

atagctgtta gtattgtcaa cgctctaaac aagcgcatca gcggcctcac ccttccacct 1920

aatgcgtgct acctccatat tgatcttgat tctcttgtga acgccatttc acgtgaacat 1980

ggtcatggaa ctaaccccgc agagttgcct tctaaacttt tccccgtcac cgagtcctat 2040

caacgtaatg ataaggacgt tgtgataatc ggcaaagcat tccgtttacc aggctcactc 2100

gacaatactg catctctctg ggaagctttg ttatcgaaga acaattcagt cgtcagtgac 2160

atcccatccg atcgctggga tcacgcaagc ttttaccccc acgatatatg cttcacgaaa 2220

gcaggcctcg tcgatgttgc acattacgat tacagattct ttgggctcac agcgacagag 2280

gcattgtacg tatctccgac gatgcgcctc gccttggaag tgtcatttga agcccttgag 2340

aacgcgaata ttccgctatc caagctgaag gggacacaaa cccctgtcta tgtcgccact 2400

aaagacgatg gctttgagac actcttaaat gctgagcaag gctacgatgc ttacacgcga 2460

ttctatggta caggtcgcgc tccgagcacc gcaagtggtc gtataagcta tctactcgat 2520

attcatgggc catctgttac cgttgataca gcatgcagcg gaggcattgt atgtatggat 2580

caagccatca ctttcttgca atccggaagg gccgataccg ctattgtctg ttcgagcaat 2640

acgcactgtt ggccgggatc atttatgttc ctgacggcgc agggcatggt ttctccacat 2700

ggaagatgcg ctacatttac taccgatgca gacggttatg taccttcgga gggtgctgtg 2760

gctttcattc tcaagacgcg cagtgctgca atacgcgata atgacaatat actcgccgtg 2820

atcaaatcaa cagatgtgtc ccataacggc cgttctcaag ggctagttgc accaaacgta 2880

aaggcgcaga caagcctaca ccgatcgttg ctacgaaaag ctggactatt tcctgatcaa 2940

atcaatttta tcgaagccca tggaacaggt acatctctag gagacctctc ggaaatccag 3000

ggcatcaaca acgcctacac ctcaacacga cctcgtttgg acggtcccct tatcattagc 3060

gcgtcgaaaa cagtgttggg acacagcgaa ccaattgcgg ggatggccgg catcctcaca 3120

gccttgcttt ccctcgagaa agaaacagtt tttggtttaa atcacttaac agagcacaac 3180

cttaaccctt cgcttgattg cagcctagtt cctctcctga ttcctcacga gtctattcac 3240

attggtggtg aaaaaccaca tcgagctgcg gttctgtcat acggtttcgc gggtacgctg 3300

gccggtgcca tcttagaggg accaccttca gatgtaccaa ggccgtcgtc aagcgatatg 3360

caagaacacc ctatggtttt cgtcctcagt gggaaaagcg tgcctgcact ggaaacgtac 3420

ctaagacggt atttggcatt tttgcgcgcc gcaaaaacaa acgacttcca tagcatctgc 3480

tacaccactt gcgtcgggag ggagcattac aaataccggt tctcctgcgt tgcccaaaat 3540

atggcagacc ttgtgtctca aattgaacat cgactgacaa ctctttccaa ttcgaaacag 3600

aaacctcgtg gctcgccagg gtttatgttc tcaggacaag gcacttattt ccctggtatg 3660

gctgcagcgc ttgctgaaca atatttgggg tttcgagtgc tagtctctag gtttgggaag 3720

gctgctcaag agcggtcggg ttatccgatc gataggctgt tgcttgaagt ttctgataca 3780

tcatcagaaa caaacagcga ggctgaccaa atttgcattt ttgtctacca atattccgtt 3840

ctgcaatggc tgcagagtct aggcattcaa ccgaaagcag tcctcggtca cagcctggga 3900

gaaattaccg ccgcagtcgc agctggtgcc ctttcattcg aatctgcgtt ggaccttgta 3960

gtcacccgtg ctcgtcttct ccgtcctgaa acaaaagatt cagcaggaat ggccgcagta 4020

gcagcatcca aggaagaagt tgaagaactt atagaaaacc tccaacttgc gcatgcgtta 4080

agtgttgcgg ttcacaacgg tccacggagt gttgttgtgt caggcgcatc gaccgaaatt 4140

gatgccctgg tcgtcgcagc taaagaacgg ggcttgaagg cttcccgctt aagagttgac 4200

caaggcttcc atagccctta cgttgattct gccgttccgg gtttactcga ctggtcaagt 4260

gaacattgtt cgaccttcct tcctttaaat attcctttat actcgacttt gaccggcgaa 4320

gttattccaa agggacggag gttcgcctgg gatcactggg taaaccatgc tcgaaaacct 4380

gttcagtttg cggcggcggc agcagcggtg gacgaagacc gatccatcgg cgtgctcctt 4440

gatgttggac cccaacccgt tgcgtggacc atccttcaag caagcagcct tttcaacacc 4500

tctgcagttg cgctatttgc gaaggctgga aaggatcagg agatggcgct gcttactact 4560

ttgagctacc tcttccaaga gcacaatctt tgtcccaact ttcacgagct ttactctcag 4620

cgtcatggtg ctcttaagaa gacggacatt cccacctacc cattccaacg tgtccaccgc 4680

tatccaacct tcataccatc acgaaatcaa agtcctgctg tcgcgaaggt agtagtccca 4740

tcgcgctttc ctgtccaaag gaaaggggaa gcaatatcac aatcgaacga atcagattac 4800

cgagctggtt tgatcacttg cctcagaacc atcctcgaat taacatcaga agaagagttt 4860

gacctttctg agaccctcaa cgctcgtggt gtggattcga tcatgttttc acagctacgg 4920

aagcgggttg gggaagaatt cgatctcgat atacccatga tctatttatc agacgtgttc 4980

acgatggaac agatgatcga ctacctcgtc gaacagtccg gatccagacc cgcgccaaag 5040

cacgtagaaa ctccggttaa cgaaccttta ggcaaagatc tccggacggg gctcgtttca 5100

tgcctgagga atgtactaga aatcaccccc gatgaagaac tcgacctatc tgaaactttg 5160

aacgctcgtg gtgtcgactc gatcatgttc gctcagctac gaaaacgcgt cggggaagga 5220

tttggcgtgg aaattccgat gatatatctg tctgacgtgt ttactatgga agacatgatc 5280

aatttcctcg tctctgagca cgcg 5304

<210> 55

<211> 1768

<212> PRT

<213> Armillaria mellea

<400> 55

Met Glu Ala Asn Gly His Tyr Ser Leu Leu Asp Val Phe Leu Ser Ile

1 5 10 15

Ala His Asp Ser Asp Lys Ser Lys Arg Asn Val Leu Glu Cys Gly Gln

20 25 30

Asp Thr Trp Thr Tyr Ser Asp Leu Asp Ile Ile Ser Ser Ala Leu Ala

35 40 45

Gln Asp Leu Gln Ala Thr Leu Gly Cys Phe Pro Lys Val Ala Val Val

50 55 60

Ser Glu Asn His Pro Tyr Ile Phe Ala Leu Met Leu Ala Val Trp Lys

65 70 75 80

Leu Glu Gly Ile Phe Ile Pro Val Asp Val His Val Thr Ala Asp Leu

85 90 95

Leu Lys Gly Met Leu His Ile Val Ala Pro Thr Cys Leu Val Ile Pro

100 105 110

Glu Thr Asp Ile Ser Asn Gln Arg Ile Ala Ser Ala Ile Gly Ile His

115 120 125

Val Leu Pro Phe Ser Ala Asn Ala Ser Thr Met Thr Ala Leu Arg Gln

130 135 140

Lys Tyr Asp Leu Cys Ile Gln Lys Ala Ser Leu Ser Glu Arg Ala Leu

145 150 155 160

Pro His Val Asp Arg Ala Cys Leu Tyr Leu Phe Thr Ser Ser Ala Ser

165 170 175

Ser Thr Ala Asn Leu Lys Cys Val Pro Leu Thr His Ser Leu Ile Leu

180 185 190

Ser Asn Cys Arg Ser Lys Leu Ala Trp Trp Arg Arg Val Arg Pro Glu

195 200 205

Glu Glu Met Asp Gly Ile Arg Val Leu Gly Trp Ala Pro Trp Ser His

210 215 220

Ile Leu Ala Tyr Met Gln Asp Ile Gly Thr Ala Thr Leu Leu Asn Ala

225 230 235 240

Gly Cys Tyr Val Phe Ala Ser Ile Pro Ser Thr Tyr Pro Thr Gln Leu

245 250 255

Val Val Asn Gly Leu Gln Gly Pro Thr Met Asn Ile Ile Asp Ser Leu

260 265 270

Leu Lys Arg Arg Ile Val Ala Phe Ala Cys Val Pro Phe Ile Leu Gly

275 280 285

Glu Leu Lys Ala Met Cys Glu Thr Ala Ser Gly Pro Asp Val Lys His

290 295 300

His Met Gly Leu Arg Ala Glu Glu Lys Val Arg Leu Val Arg Ala Leu

305 310 315 320

Gln Gln Leu Met Met Leu Glu Cys Gly Gly Ala Ala Leu Glu Ser Asp

325 330 335

Val Thr Arg Trp Val Val Glu Asn Gly Ile Ser Val Met Val Gly Ile

340 345 350

Gly Met Thr Glu Thr Val Gly Thr Leu Phe Ala Glu Arg Ala Gln Asp

355 360 365

Ala Arg Ser Asn Gly Tyr Ser Ala Gln Asn Ala Leu Ile Thr Asp Gly

370 375 380

Ile Met Ser Leu Val Gly Pro Asp Asn Glu Glu Val Thr Phe Glu Gly

385 390 395 400

Glu Leu Val Val Lys Ser Lys Leu Ile Pro His Glu Tyr Ile Asn Tyr

405 410 415

Arg Asp Ser Ser Phe Ser Val Asp Ser Asp Gly Trp Val Thr Phe Lys

420 425 430

Thr Gly Asp Lys Tyr Gln Arg Thr Pro Asp Gly Arg Phe Lys Trp Leu

435 440 445

Gly Arg Lys Thr Asp Phe Ile Gln Met Thr Ser Ser Glu Thr Leu Asp

450 455 460

Pro Arg Pro Ile Glu Lys Thr Leu Cys Ala Asn Pro Ser Ile Val Asn

465 470 475 480

Ala Cys Val Ile Gly Asp Arg Phe Leu Arg Glu Pro Ala Thr Ser Val

485 490 495

Cys Ala Ile Val Glu Ile Arg Pro Glu Val Asp Ile Pro Ser Ser Lys

500 505 510

Ile Asp Arg Glu Ile Ala Asn Ala Leu Ala Pro Ile Asn Arg Asp Leu

515 520 525

Pro Pro Ala Leu Arg Ile Ser Trp Ser Arg Val Leu Ile Ile Arg Pro

530 535 540

Pro Gln Lys Ile Pro Val Thr Arg Lys Gly Asp Val Phe Arg Lys Lys

545 550 555 560

Ile Glu Asp Val Phe Gly Ser Phe Leu Gly Val Gly Ser Thr Glu Ile

565 570 575

Lys Val Asp His Glu Ser Lys Glu Asp Asp Thr Glu His Ile Val Arg

580 585 590

Gln Val Val Ser Asn Leu Leu Gly Val His Asp Pro Glu Leu Leu Ser

595 600 605

Ala Leu Ser Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser Phe Ile Ala Val Ser

610 615 620

Ile Val Asn Ala Leu Asn Lys Arg Ile Ser Gly Leu Thr Leu Pro Pro

625 630 635 640

Asn Ala Cys Tyr Leu His Ile Asp Leu Asp Ser Leu Val Asn Ala Ile

645 650 655

Ser Arg Glu His Gly His Gly Thr Asn Pro Ala Glu Leu Pro Ser Lys

660 665 670

Leu Phe Pro Val Thr Glu Ser Tyr Gln Arg Asn Asp Lys Asp Val Val

675 680 685

Ile Ile Gly Lys Ala Phe Arg Leu Pro Gly Ser Leu Asp Asn Thr Ala

690 695 700

Ser Leu Trp Glu Ala Leu Leu Ser Lys Asn Asn Ser Val Val Ser Asp

705 710 715 720

Ile Pro Ser Asp Arg Trp Asp His Ala Ser Phe Tyr Pro His Asp Ile

725 730 735

Cys Phe Thr Lys Ala Gly Leu Val Asp Val Ala His Tyr Asp Tyr Arg

740 745 750

Phe Phe Gly Leu Thr Ala Thr Glu Ala Leu Tyr Val Ser Pro Thr Met

755 760 765

Arg Leu Ala Leu Glu Val Ser Phe Glu Ala Leu Glu Asn Ala Asn Ile

770 775 780

Pro Leu Ser Lys Leu Lys Gly Thr Gln Thr Pro Val Tyr Val Ala Thr

785 790 795 800

Lys Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Asn Ala Glu Gln Gly Tyr Asp

805 810 815

Ala Tyr Thr Arg Phe Tyr Gly Thr Gly Arg Ala Pro Ser Thr Ala Ser

820 825 830

Gly Arg Ile Ser Tyr Leu Leu Asp Ile His Gly Pro Ser Val Thr Val

835 840 845

Asp Thr Ala Cys Ser Gly Gly Ile Val Cys Met Asp Gln Ala Ile Thr

850 855 860

Phe Leu Gln Ser Gly Arg Ala Asp Thr Ala Ile Val Cys Ser Ser Asn

865 870 875 880

Thr His Cys Trp Pro Gly Ser Phe Met Phe Leu Thr Ala Gln Gly Met

885 890 895

Val Ser Pro His Gly Arg Cys Ala Thr Phe Thr Thr Asp Ala Asp Gly

900 905 910

Tyr Val Pro Ser Glu Gly Ala Val Ala Phe Ile Leu Lys Thr Arg Ser

915 920 925

Ala Ala Ile Arg Asp Asn Asp Asn Ile Leu Ala Val Ile Lys Ser Thr

930 935 940

Asp Val Ser His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Val Ala Pro Asn Val

945 950 955 960

Lys Ala Gln Thr Ser Leu His Arg Ser Leu Leu Arg Lys Ala Gly Leu

965 970 975

Phe Pro Asp Gln Ile Asn Phe Ile Glu Ala His Gly Thr Gly Thr Ser

980 985 990

Leu Gly Asp Leu Ser Glu Ile Gln Gly Ile Asn Asn Ala Tyr Thr Ser

995 1000 1005

Thr Arg Pro Arg Leu Asp Gly Pro Leu Ile Ile Ser Ala Ser Lys

1010 1015 1020

Thr Val Leu Gly His Ser Glu Pro Ile Ala Gly Met Ala Gly Ile

1025 1030 1035

Leu Thr Ala Leu Leu Ser Leu Glu Lys Glu Thr Val Phe Gly Leu

1040 1045 1050

Asn His Leu Thr Glu His Asn Leu Asn Pro Ser Leu Asp Cys Ser

1055 1060 1065

Leu Val Pro Leu Leu Ile Pro His Glu Ser Ile His Ile Gly Gly

1070 1075 1080

Glu Lys Pro His Arg Ala Ala Val Leu Ser Tyr Gly Phe Ala Gly

1085 1090 1095

Thr Leu Ala Gly Ala Ile Leu Glu Gly Pro Pro Ser Asp Val Pro

1100 1105 1110

Arg Pro Ser Ser Ser Asp Met Gln Glu His Pro Met Val Phe Val

1115 1120 1125

Leu Ser Gly Lys Ser Val Pro Ala Leu Glu Thr Tyr Leu Arg Arg

1130 1135 1140

Tyr Leu Ala Phe Leu Arg Ala Ala Lys Thr Asn Asp Phe His Ser

1145 1150 1155

Ile Cys Tyr Thr Thr Cys Val Gly Arg Glu His Tyr Lys Tyr Arg

1160 1165 1170

Phe Ser Cys Val Ala Gln Asn Met Ala Asp Leu Val Ser Gln Ile

1175 1180 1185

Glu His Arg Leu Thr Thr Leu Ser Asn Ser Lys Gln Lys Pro Arg

1190 1195 1200

Gly Ser Pro Gly Phe Met Phe Ser Gly Gln Gly Thr Tyr Phe Pro

1205 1210 1215

Gly Met Ala Ala Ala Leu Ala Glu Gln Tyr Leu Gly Phe Arg Val

1220 1225 1230

Leu Val Ser Arg Phe Gly Lys Ala Ala Gln Glu Arg Ser Gly Tyr

1235 1240 1245

Pro Ile Asp Arg Leu Leu Leu Glu Val Ser Asp Thr Ser Ser Glu

1250 1255 1260

Thr Asn Ser Glu Ala Asp Gln Ile Cys Ile Phe Val Tyr Gln Tyr

1265 1270 1275

Ser Val Leu Gln Trp Leu Gln Ser Leu Gly Ile Gln Pro Lys Ala

1280 1285 1290

Val Leu Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Thr Ala Ala Val Ala Ala

1295 1300 1305

Gly Ala Leu Ser Phe Glu Ser Ala Leu Asp Leu Val Val Thr Arg

1310 1315 1320

Ala Arg Leu Leu Arg Pro Glu Thr Lys Asp Ser Ala Gly Met Ala

1325 1330 1335

Ala Val Ala Ala Ser Lys Glu Glu Val Glu Glu Leu Ile Glu Asn

1340 1345 1350

Leu Gln Leu Ala His Ala Leu Ser Val Ala Val His Asn Gly Pro

1355 1360 1365

Arg Ser Val Val Val Ser Gly Ala Ser Thr Glu Ile Asp Ala Leu

1370 1375 1380

Val Val Ala Ala Lys Glu Arg Gly Leu Lys Ala Ser Arg Leu Arg

1385 1390 1395

Val Asp Gln Gly Phe His Ser Pro Tyr Val Asp Ser Ala Val Pro

1400 1405 1410

Gly Leu Leu Asp Trp Ser Ser Glu His Cys Ser Thr Phe Leu Pro

1415 1420 1425

Leu Asn Ile Pro Leu Tyr Ser Thr Leu Thr Gly Glu Val Ile Pro

1430 1435 1440

Lys Gly Arg Arg Phe Ala Trp Asp His Trp Val Asn His Ala Arg

1445 1450 1455

Lys Pro Val Gln Phe Ala Ala Ala Ala Ala Ala Val Asp Glu Asp

1460 1465 1470

Arg Ser Ile Gly Val Leu Leu Asp Val Gly Pro Gln Pro Val Ala

1475 1480 1485

Trp Thr Ile Leu Gln Ala Ser Ser Leu Phe Asn Thr Ser Ala Val

1490 1495 1500

Ala Leu Phe Ala Lys Ala Gly Lys Asp Gln Glu Met Ala Leu Leu

1505 1510 1515

Thr Thr Leu Ser Tyr Leu Phe Gln Glu His Asn Leu Cys Pro Asn

1520 1525 1530

Phe His Glu Leu Tyr Ser Gln Arg His Gly Ala Leu Lys Lys Thr

1535 1540 1545

Asp Ile Pro Thr Tyr Pro Phe Gln Arg Val His Arg Tyr Pro Thr

1550 1555 1560

Phe Ile Pro Ser Arg Asn Gln Ser Pro Ala Val Ala Lys Val Val

1565 1570 1575

Val Pro Ser Arg Phe Pro Val Gln Arg Lys Gly Glu Ala Ile Ser

1580 1585 1590

Gln Ser Asn Glu Ser Asp Tyr Arg Ala Gly Leu Ile Thr Cys Leu

1595 1600 1605

Arg Thr Ile Leu Glu Leu Thr Ser Glu Glu Glu Phe Asp Leu Ser

1610 1615 1620

Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Val Asp Ser Ile Met Phe Ser Gln

1625 1630 1635

Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Glu Phe Asp Leu Asp Ile Pro Met

1640 1645 1650

Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Gln Met Ile Asp Tyr

1655 1660 1665

Leu Val Glu Gln Ser Gly Ser Arg Pro Ala Pro Lys His Val Glu

1670 1675 1680

Thr Pro Val Asn Glu Pro Leu Gly Lys Asp Leu Arg Thr Gly Leu

1685 1690 1695

Val Ser Cys Leu Arg Asn Val Leu Glu Ile Thr Pro Asp Glu Glu

1700 1705 1710

Leu Asp Leu Ser Glu Thr Leu Asn Ala Arg Gly Val Asp Ser Ile

1715 1720 1725

Met Phe Ala Gln Leu Arg Lys Arg Val Gly Glu Gly Phe Gly Val

1730 1735 1740

Glu Ile Pro Met Ile Tyr Leu Ser Asp Val Phe Thr Met Glu Asp

1745 1750 1755

Met Ile Asn Phe Leu Val Ser Glu His Ala

1760 1765

<210> 56

<211> 40

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 1 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<223> X - любая аминокислота

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(40)

<223> X - любая аминокислота

<400> 56

Val Ala Xaa Xaa Xaa Glu Asn His Pro Xaa Xaa Xaa Ala Leu Xaa Xaa

1 5 10 15

Ala Val Trp Lys Xaa Xaa Gly Xaa Phe Xaa Pro Xaa Asp Xaa His Xaa

20 25 30

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Met

35 40

<210> 57

<211> 36

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 2 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (1)..(36)

<223> X - любая аминокислота

<400> 57

Leu Gly Trp Ala Pro Xaa Ser His Xaa Leu Xaa Xaa Met Gln Asp Ile

1 5 10 15

Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Leu Xaa Ala Gly Cys Tyr Val Phe Xaa Xaa Xaa

20 25 30

Pro Xaa Xaa Tyr

35

<210> 58

<211> 33

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 3 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (6)..(33)

<223> X - любая аминокислота

<400> 58

Glu Cys Gly Gly Ala Xaa Leu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Trp Xaa Xaa

1 5 10 15

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa Gly Met Thr Glu Thr Xaa

20 25 30

Gly

<210> 59

<211> 8

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 4 гиспидин-синтаз

<400> 59

Phe Ala Glu Leu Gly Met Thr Ser

1 5

<210> 60

<211> 25

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 5 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (2)..(24)

<223> X - любая аминокислота

<400> 60

Ile Xaa Xaa Xaa Arg Trp Asp His Xaa Ser Phe Tyr Pro Xaa Xaa Ile

1 5 10 15

Xaa Xaa Xaa Xaa Ala Gly Leu Xaa Asp

20 25

<210> 61

<211> 65

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 6 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (2)..(64)

<223> X - любая аминокислота

<400> 61

Asp Xaa Xaa Phe Phe Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Glu Ala Xaa Xaa Xaa Ser

1 5 10 15

Pro Thr Met Arg Xaa Ala Leu Glu Val Xaa Xaa Glu Ala Leu Glu Xaa

20 25 30

Ala Asn Ile Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Lys Gly Xaa Xaa Xaa Xaa Val Xaa

35 40 45

Xaa Ala Xaa Xaa Asp Asp Gly Phe Glu Thr Leu Leu Xaa Ala Xaa Xaa

50 55 60

Gly

65

<210> 62

<211> 50

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 7 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (5)..(47)

<223> X - любая аминокислота

<400> 62

Ala Asp Gly Tyr Xaa Pro Ser Glu Gly Ala Val Xaa Phe Xaa Leu Lys

1 5 10 15

Thr Xaa Xaa Ala Ala Xaa Arg Asp Xaa Xaa Xaa Ile Xaa Ala Xaa Ile

20 25 30

Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa His Asn Gly Arg Ser Gln Gly Leu Xaa Ala

35 40 45

Pro Asn

50

<210> 63

<211> 9

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 8 гиспидин-синтаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (8)..(8)

<223> X - любая аминокислота

<400> 63

Gly His Ser Leu Gly Glu Ile Xaa Ala

1 5

<210> 64

<211> 867

<212> DNA

<213> Neonothopanus nambi

<400> 64

atggcgccaa tttcttcaac ttggtctcgt ctcattcgat ttgtggctat tgaaacgtcc 60

ctcgtgcata tcggtgaacc gatagacgcc accatggacg tcggtctggc gagacgagaa 120

ggcaagacga tccaagcata cgagattatt ggatcaggct cggctctaga cctctcagcc 180

caagtatcga agaatgtgct gactgtaagg gaactcctga tgccgctttc aagagaggaa 240

attaaaactg tacgatgctt ggggttgaac taccctgttc atgccaccga agcgaacgtt 300

gctgttccaa aattcccgaa tttgttctac aaaccagtga cctcgctcat tggccccgat 360

ggactcatta ccatcccttc cgttgtccaa cccccgaagg agcatcagtc cgattatgaa 420

gcggaacttg tcattgtcat cgggaaagca gcaaagaatg tatcggagga tgaggctttg 480

gattatgtat tgggatacac tgccgcgaac gatatttcgt ttaggaaaca ccagctagca 540

gtctcacaat ggtctttctc gaaaggattt ggtagccttc tactcactat ccgtatggca 600

caaacccact cgggtaacat taatcgcttc tccagagacc agattttcaa tgtcaagaag 660

acaatttcct tcctgtcaca aggcactaca ctggaaccag gttctatcat tttgactggt 720

acacctgacg gagtgggctt tgtgcgcaat ccaccacttt accttaaaga tggagatgaa 780

gtaatgacct ggattggaag tggaatcgga acattagcca atacagtgca agaagagaag 840

acttgcttcg ctagtggcgg acacgag 867

<210> 65

<211> 289

<212> PRT

<213> Neonothopanus nambi

<400> 65

Met Ala Pro Ile Ser Ser Thr Trp Ser Arg Leu Ile Arg Phe Val Ala

1 5 10 15

Ile Glu Thr Ser Leu Val His Ile Gly Glu Pro Ile Asp Ala Thr Met

20 25 30

Asp Val Gly Leu Ala Arg Arg Glu Gly Lys Thr Ile Gln Ala Tyr Glu

35 40 45

Ile Ile Gly Ser Gly Ser Ala Leu Asp Leu Ser Ala Gln Val Ser Lys

50 55 60

Asn Val Leu Thr Val Arg Glu Leu Leu Met Pro Leu Ser Arg Glu Glu

65 70 75 80

Ile Lys Thr Val Arg Cys Leu Gly Leu Asn Tyr Pro Val His Ala Thr

85 90 95

Glu Ala Asn Val Ala Val Pro Lys Phe Pro Asn Leu Phe Tyr Lys Pro

100 105 110

Val Thr Ser Leu Ile Gly Pro Asp Gly Leu Ile Thr Ile Pro Ser Val

115 120 125

Val Gln Pro Pro Lys Glu His Gln Ser Asp Tyr Glu Ala Glu Leu Val

130 135 140

Ile Val Ile Gly Lys Ala Ala Lys Asn Val Ser Glu Asp Glu Ala Leu

145 150 155 160

Asp Tyr Val Leu Gly Tyr Thr Ala Ala Asn Asp Ile Ser Phe Arg Lys

165 170 175

His Gln Leu Ala Val Ser Gln Trp Ser Phe Ser Lys Gly Phe Gly Ser

180 185 190

Leu Leu Leu Thr Ile Arg Met Ala Gln Thr His Ser Gly Asn Ile Asn

195 200 205

Arg Phe Ser Arg Asp Gln Ile Phe Asn Val Lys Lys Thr Ile Ser Phe

210 215 220

Leu Ser Gln Gly Thr Thr Leu Glu Pro Gly Ser Ile Ile Leu Thr Gly

225 230 235 240

Thr Pro Asp Gly Val Gly Phe Val Arg Asn Pro Pro Leu Tyr Leu Lys

245 250 255

Asp Gly Asp Glu Val Met Thr Trp Ile Gly Ser Gly Ile Gly Thr Leu

260 265 270

Ala Asn Thr Val Gln Glu Glu Lys Thr Cys Phe Ala Ser Gly Gly His

275 280 285

Glu

<210> 66

<211> 963

<212> DNA

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 66

atggcgccga ttttgacagt gagttccagt tcaatggtgc tgaatagctc aaaacaggct 60

atattgaata tttctgaata tcaccagccc tggactcgtc tcattcgatt tgtagccgtt 120

gagacgtcac tcgtgcatat tggtgaaccc atcgaggtga ctttggacgt cgggcaggca 180

aaatgtgaag gcaagacgat caaagcgtac gagattattg gatcagggtc ggccttggac 240

ctctcagctc aggtatcgaa gaatgtgcta accgtaaagg aactcttgat gccgctttcg 300

agagaagagg tcaagactgt gcggtgcttg ggactgaact attttactca tgcttccacc 360

gggcgcccgc tgtcgactag attaccgact ttgttctata agccagtgac ttcactcatc 420

ggacctgagg cgttcattaa tattccttcc gctgttcaac caccgaagga gcatcagtcc 480

gattatgaag cggagttggt aattattatt gggagagcgg cgaaggatgt accggaagag 540

gaggctttga attatgtttt gggatacacc gccgccaacg acatttcatt taggaaatat 600

caatttgcag tttcccagtg gtgtttttcg aaaggtttcg ataatacaaa cccaatcggt 660

ccgtgcatcg tttccgcatc ttccattccg aacccgcaag acatccagat ccaatgcaaa 720

ctgaacggga atgtcgttca gaatggaaac accagtgatc aaatttttaa tatcaagaaa 780

acagtcgctt ttttgtcgca aggaacaaca cttgagtcag gatcaatcat cctgaccggt 840

acgcctggcg gagtgggatt tgtgcgcgat ccaccgcttt accttaaaga tggagatgaa 900

gtagtgactt ggattggaag tggggttgga agtttagtca acgtagtaaa agaagagaag 960

act 963

<210> 67

<211> 321

<212> PRT

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 67

Met Ala Pro Ile Leu Thr Val Ser Ser Ser Ser Met Val Leu Asn Ser

1 5 10 15

Ser Lys Gln Ala Ile Leu Asn Ile Ser Glu Tyr His Gln Pro Trp Thr

20 25 30

Arg Leu Ile Arg Phe Val Ala Val Glu Thr Ser Leu Val His Ile Gly

35 40 45

Glu Pro Ile Glu Val Thr Leu Asp Val Gly Gln Ala Lys Cys Glu Gly

50 55 60

Lys Thr Ile Lys Ala Tyr Glu Ile Ile Gly Ser Gly Ser Ala Leu Asp

65 70 75 80

Leu Ser Ala Gln Val Ser Lys Asn Val Leu Thr Val Lys Glu Leu Leu

85 90 95

Met Pro Leu Ser Arg Glu Glu Val Lys Thr Val Arg Cys Leu Gly Leu

100 105 110

Asn Tyr Phe Thr His Ala Ser Thr Gly Arg Pro Leu Ser Thr Arg Leu

115 120 125

Pro Thr Leu Phe Tyr Lys Pro Val Thr Ser Leu Ile Gly Pro Glu Ala

130 135 140

Phe Ile Asn Ile Pro Ser Ala Val Gln Pro Pro Lys Glu His Gln Ser

145 150 155 160

Asp Tyr Glu Ala Glu Leu Val Ile Ile Ile Gly Arg Ala Ala Lys Asp

165 170 175

Val Pro Glu Glu Glu Ala Leu Asn Tyr Val Leu Gly Tyr Thr Ala Ala

180 185 190

Asn Asp Ile Ser Phe Arg Lys Tyr Gln Phe Ala Val Ser Gln Trp Cys

195 200 205

Phe Ser Lys Gly Phe Asp Asn Thr Asn Pro Ile Gly Pro Cys Ile Val

210 215 220

Ser Ala Ser Ser Ile Pro Asn Pro Gln Asp Ile Gln Ile Gln Cys Lys

225 230 235 240

Leu Asn Gly Asn Val Val Gln Asn Gly Asn Thr Ser Asp Gln Ile Phe

245 250 255

Asn Ile Lys Lys Thr Val Ala Phe Leu Ser Gln Gly Thr Thr Leu Glu

260 265 270

Ser Gly Ser Ile Ile Leu Thr Gly Thr Pro Gly Gly Val Gly Phe Val

275 280 285

Arg Asp Pro Pro Leu Tyr Leu Lys Asp Gly Asp Glu Val Val Thr Trp

290 295 300

Ile Gly Ser Gly Val Gly Ser Leu Val Asn Val Val Lys Glu Glu Lys

305 310 315 320

Thr

<210> 68

<211> 906

<212> DNA

<213> Armillaria gallica

<400> 68

atggcgccta ttatcactca atggtccaga cttatccgct ttgtcgccgt cgaaacctct 60

cgtgtacata ttggacagcc cgtagattct aacctggatg ttggtctagc ggcgtaccag 120

ggaatgctaa tcaaggctta cgaaatactt ggttctgctc tcgatccatc cgcccaaatg 180

actagcaaga tcctcactgt caaacaacta ttaaccccgc tgtctggcga agatgtcaag 240

gtcgttagat gcttgggtct caactaccca gcacatgcga atgaagggaa agtagaagca 300

cctaagtttc ctaacctttt ctataagcca gtgacgtcgc ttatcgggcc cctcgcacct 360

gtgatcattc ctgcagtcgc acaaccttct gcaatacatc aatccgatta tgaggctgaa 420

tttactgtcg tcataggcag ggcagctaag aatatcactg aagcggaagc tttagactat 480

gttctcggct acaccggcgg caatgacgtg tcttttcgtc agcatcaatt tgcggtctct 540

caatggtgtt tctccaaaag ttttgacaac acaaatccct ttgggccatg cttagttgcc 600

gcatcgtcta ttcccgaccc tcaaactgtg gccattaagt ttacactgaa tggtcaaact 660

gtccaagacg gaactactgc cgatcaactt ttcagcgtca aaaagaccat agcttatctt 720

tctcaaggca cgacgttaca gccgggctcc ataattatga ctggtactcc cagtggcgtt 780

ggattcgtcc gaaacccacc tctctacctc aaagatggag accatatgtt gacttggata 840

agcggtggaa tcggtacgct tgcaaacagc gtcgtggagg agaagactcc gactcctggt 900

ttagat 906

<210> 69

<211> 302

<212> PRT

<213> Armillaria gallica

<400> 69

Met Ala Pro Ile Ile Thr Gln Trp Ser Arg Leu Ile Arg Phe Val Ala

1 5 10 15

Val Glu Thr Ser Arg Val His Ile Gly Gln Pro Val Asp Ser Asn Leu

20 25 30

Asp Val Gly Leu Ala Ala Tyr Gln Gly Met Leu Ile Lys Ala Tyr Glu

35 40 45

Ile Leu Gly Ser Ala Leu Asp Pro Ser Ala Gln Met Thr Ser Lys Ile

50 55 60

Leu Thr Val Lys Gln Leu Leu Thr Pro Leu Ser Gly Glu Asp Val Lys

65 70 75 80

Val Val Arg Cys Leu Gly Leu Asn Tyr Pro Ala His Ala Asn Glu Gly

85 90 95

Lys Val Glu Ala Pro Lys Phe Pro Asn Leu Phe Tyr Lys Pro Val Thr

100 105 110

Ser Leu Ile Gly Pro Leu Ala Pro Val Ile Ile Pro Ala Val Ala Gln

115 120 125

Pro Ser Ala Ile His Gln Ser Asp Tyr Glu Ala Glu Phe Thr Val Val

130 135 140

Ile Gly Arg Ala Ala Lys Asn Ile Thr Glu Ala Glu Ala Leu Asp Tyr

145 150 155 160

Val Leu Gly Tyr Thr Gly Gly Asn Asp Val Ser Phe Arg Gln His Gln

165 170 175

Phe Ala Val Ser Gln Trp Cys Phe Ser Lys Ser Phe Asp Asn Thr Asn

180 185 190

Pro Phe Gly Pro Cys Leu Val Ala Ala Ser Ser Ile Pro Asp Pro Gln

195 200 205

Thr Val Ala Ile Lys Phe Thr Leu Asn Gly Gln Thr Val Gln Asp Gly

210 215 220

Thr Thr Ala Asp Gln Leu Phe Ser Val Lys Lys Thr Ile Ala Tyr Leu

225 230 235 240

Ser Gln Gly Thr Thr Leu Gln Pro Gly Ser Ile Ile Met Thr Gly Thr

245 250 255

Pro Ser Gly Val Gly Phe Val Arg Asn Pro Pro Leu Tyr Leu Lys Asp

260 265 270

Gly Asp His Met Leu Thr Trp Ile Ser Gly Gly Ile Gly Thr Leu Ala

275 280 285

Asn Ser Val Val Glu Glu Lys Thr Pro Thr Pro Gly Leu Asp

290 295 300

<210> 70

<211> 906

<212> DNA

<213> Armillaria ostoyae

<400> 70

atggcaccta ttattactca atggtccaga cttattcgct ttgttgccgt cgagacctct 60

cgtgtacata ttggacagcc catagattct accctggata ttggtctagc ggcgtaccag 120

ggaatgctaa tcaaggctta tgaaatactt ggttctgctc tcgatccatc cgcccaaatg 180

accagcaaga tcctcaccgt taaacagcta ttaactccgc tgtctggcga agatgtcaag 240

gtcgtccgat gcttgggtct taactatcca gctcatgcga atgaagggaa agtagaagcg 300

cctaagtttc ctaacctttt ctataagcca gtgacatcgc ttatcgggcc cctcgcacct 360

gtgatcattc ctgcagtcgc acagccttct gcaatacatc aatccgatta tgaggctgaa 420

tttactgtcg tcataggcag ggcagctaag aatgtcactg aagcggaagc tttagactat 480

gttctcgggt acaccggcgg caatgatgtg tcttttcgtc agcatcaatt tgcggtctct 540

caatggtgtt tctctaaaag ttttgacaat acaaatccct tcggtccatg cttagttgcc 600

gcatcgtcta ttcctgatcc tcaaactgtg gccattaagt ttacattgaa tggtgacacc 660

gtccaagacg gaactactgc tgatcaactt ttcagcgtca aaaagaccat cgcttatctt 720

tctcagggca cgacgttaca gccgggctcc ataattatga ctggcactcc cagtggtgtt 780

gggttcgtcc aaaacccacc tctctacctc aaagatgggg atcaaatgtt gacttggata 840

agcggtggaa tcggtacgct tgcaaacaac gtcgtagagg agaagactcc gactcctcgt 900

ttagac 906

<210> 71

<211> 302

<212> PRT

<213> Armillaria ostoyae

<400> 71

Met Ala Pro Ile Ile Thr Gln Trp Ser Arg Leu Ile Arg Phe Val Ala

1 5 10 15

Val Glu Thr Ser Arg Val His Ile Gly Gln Pro Ile Asp Ser Thr Leu

20 25 30

Asp Ile Gly Leu Ala Ala Tyr Gln Gly Met Leu Ile Lys Ala Tyr Glu

35 40 45

Ile Leu Gly Ser Ala Leu Asp Pro Ser Ala Gln Met Thr Ser Lys Ile

50 55 60

Leu Thr Val Lys Gln Leu Leu Thr Pro Leu Ser Gly Glu Asp Val Lys

65 70 75 80

Val Val Arg Cys Leu Gly Leu Asn Tyr Pro Ala His Ala Asn Glu Gly

85 90 95

Lys Val Glu Ala Pro Lys Phe Pro Asn Leu Phe Tyr Lys Pro Val Thr

100 105 110

Ser Leu Ile Gly Pro Leu Ala Pro Val Ile Ile Pro Ala Val Ala Gln

115 120 125

Pro Ser Ala Ile His Gln Ser Asp Tyr Glu Ala Glu Phe Thr Val Val

130 135 140

Ile Gly Arg Ala Ala Lys Asn Val Thr Glu Ala Glu Ala Leu Asp Tyr

145 150 155 160

Val Leu Gly Tyr Thr Gly Gly Asn Asp Val Ser Phe Arg Gln His Gln

165 170 175

Phe Ala Val Ser Gln Trp Cys Phe Ser Lys Ser Phe Asp Asn Thr Asn

180 185 190

Pro Phe Gly Pro Cys Leu Val Ala Ala Ser Ser Ile Pro Asp Pro Gln

195 200 205

Thr Val Ala Ile Lys Phe Thr Leu Asn Gly Asp Thr Val Gln Asp Gly

210 215 220

Thr Thr Ala Asp Gln Leu Phe Ser Val Lys Lys Thr Ile Ala Tyr Leu

225 230 235 240

Ser Gln Gly Thr Thr Leu Gln Pro Gly Ser Ile Ile Met Thr Gly Thr

245 250 255

Pro Ser Gly Val Gly Phe Val Gln Asn Pro Pro Leu Tyr Leu Lys Asp

260 265 270

Gly Asp Gln Met Leu Thr Trp Ile Ser Gly Gly Ile Gly Thr Leu Ala

275 280 285

Asn Asn Val Val Glu Glu Lys Thr Pro Thr Pro Arg Leu Asp

290 295 300

<210> 72

<211> 891

<212> DNA

<213> Armillaria mellea

<400> 72

atggcgccta ttatcactca gtggtccaga cttattcgct ttgttgccgt cgagacttct 60

cgtgtacatt ttggacagcc cgtagattct accctggatg ttggtctagc ggcgtaccag 120

ggtgtgttga tcaaggctta tgaaatactt ggttctgctc ttgatccatc cgcccaaatg 180

accagcaaga tcctcaccgt gaaacagcta ttaactccgc tgtctggcga ggatgtcaaa 240

gtcgtccgat gcttgggtct taactatcca gcacatgcga atgaagggaa agtagaagca 300

cccaagtttc ctaacctgtt ctataagcca gtgacatcgc ttatcgggcc cctcgcgcct 360

gtgatcattc ctgcagtcgc acagccttct gcaatacatc aatctgatta tgaggctgaa 420

tttactgttg tcctaggcag ggcagctaag aatgtcactg aagctgaagc cttggactat 480

gttctcggtt acaccggcgg caatgatgtg tcttttcggc agcatcaatt tgctgtctct 540

caatggtgtt tctccaaaag ttttgacaat acaaatccct tcggtccatg cttagttgcc 600

gcgtcgtcta ttcctgatcc tcaaactgtg gccattaagt ttacattgaa tggcaacacc 660

gtccaagatg gaactactgc tgatcaactt ttcagcgtca gaaagaccat cgcttatctt 720

tctcaaggca cgacgttaca gcctggctcc ataattatga ccggtactcc cagtggcgtt 780

gggttcgtcc gaaacccacc tctctacctc aaagatgggg atcaaatgtt gacttggatt 840

agcggtggaa tcggtacgct tgcaaacagc gtcatagagg agaagacccc a 891

<210> 73

<211> 297

<212> PRT

<213> Armillaria mellea

<400> 73

Met Ala Pro Ile Ile Thr Gln Trp Ser Arg Leu Ile Arg Phe Val Ala

1 5 10 15

Val Glu Thr Ser Arg Val His Phe Gly Gln Pro Val Asp Ser Thr Leu

20 25 30

Asp Val Gly Leu Ala Ala Tyr Gln Gly Val Leu Ile Lys Ala Tyr Glu

35 40 45

Ile Leu Gly Ser Ala Leu Asp Pro Ser Ala Gln Met Thr Ser Lys Ile

50 55 60

Leu Thr Val Lys Gln Leu Leu Thr Pro Leu Ser Gly Glu Asp Val Lys

65 70 75 80

Val Val Arg Cys Leu Gly Leu Asn Tyr Pro Ala His Ala Asn Glu Gly

85 90 95

Lys Val Glu Ala Pro Lys Phe Pro Asn Leu Phe Tyr Lys Pro Val Thr

100 105 110

Ser Leu Ile Gly Pro Leu Ala Pro Val Ile Ile Pro Ala Val Ala Gln

115 120 125

Pro Ser Ala Ile His Gln Ser Asp Tyr Glu Ala Glu Phe Thr Val Val

130 135 140

Leu Gly Arg Ala Ala Lys Asn Val Thr Glu Ala Glu Ala Leu Asp Tyr

145 150 155 160

Val Leu Gly Tyr Thr Gly Gly Asn Asp Val Ser Phe Arg Gln His Gln

165 170 175

Phe Ala Val Ser Gln Trp Cys Phe Ser Lys Ser Phe Asp Asn Thr Asn

180 185 190

Pro Phe Gly Pro Cys Leu Val Ala Ala Ser Ser Ile Pro Asp Pro Gln

195 200 205

Thr Val Ala Ile Lys Phe Thr Leu Asn Gly Asn Thr Val Gln Asp Gly

210 215 220

Thr Thr Ala Asp Gln Leu Phe Ser Val Arg Lys Thr Ile Ala Tyr Leu

225 230 235 240

Ser Gln Gly Thr Thr Leu Gln Pro Gly Ser Ile Ile Met Thr Gly Thr

245 250 255

Pro Ser Gly Val Gly Phe Val Arg Asn Pro Pro Leu Tyr Leu Lys Asp

260 265 270

Gly Asp Gln Met Leu Thr Trp Ile Ser Gly Gly Ile Gly Thr Leu Ala

275 280 285

Asn Ser Val Ile Glu Glu Lys Thr Pro

290 295

<210> 74

<211> 891

<212> DNA

<213> Armillaria fuscipes

<400> 74

atggcaccta ttatcactca atggtccaga cttattcgct ttgtctccat tgagacttct 60

ggtgttcata ttggacaacc cgtagatcct acccttgacg tcggtctagc ggcgtcccag 120

ggagtggcaa tcaaggttta tgaaataatt ggttctgcgc ttgatccatc cgcccaagtg 180

accagcaaaa tccttaccgt caaacagcta ttaactccgc tgtctggtga ggatgtcaag 240

gtcgtccggt gcttgggtct gaactatcca gcacatgcca atgaagggaa agtagaagca 300

cccaagtttc ctaacctttt ctataagcca gtgacatcgc ttattgggcc cctcgcgcct 360

gtgatcattc ctgcagtcgc acagccggcc gcaatacatc aatctgatta tgaggctgaa 420

tttactgttg tcattggcag ggcagccaag aatgtcacgg aagctgaagc cctggactat 480

gttcttggct acaccggcgg taatgatgtg tcttttcgga agcatcaatt tgcagtctct 540

caatggtgtt tctccaaaag ttttgacaat acaaatccct ttggaccatg cttagttgcc 600

gcttcgtcta tccctgatcc tcagaatgtg gccattaagt tcacgttgaa tggtaacacc 660

gttcaagatg gaactactgc tgaccaaatt ttcagcgtta gaaagactat cgcttatctt 720

tctcaaggca cgacgttaca gccaggctcc atcattatga ctggcactcc caatggcgtt 780

gggtttgtcc gagacccacc tctctacctc aaagacgggg atcaaatgct gacttggatt 840

agcggtggaa ttggtacgct tgcgaatggc gtcgtagaag agaagacccg g 891

<210> 75

<211> 297

<212> PRT

<213> Armillaria fuscipes

<400> 75

Met Ala Pro Ile Ile Thr Gln Trp Ser Arg Leu Ile Arg Phe Val Ser

1 5 10 15

Ile Glu Thr Ser Gly Val His Ile Gly Gln Pro Val Asp Pro Thr Leu

20 25 30

Asp Val Gly Leu Ala Ala Ser Gln Gly Val Ala Ile Lys Val Tyr Glu

35 40 45

Ile Ile Gly Ser Ala Leu Asp Pro Ser Ala Gln Val Thr Ser Lys Ile

50 55 60

Leu Thr Val Lys Gln Leu Leu Thr Pro Leu Ser Gly Glu Asp Val Lys

65 70 75 80

Val Val Arg Cys Leu Gly Leu Asn Tyr Pro Ala His Ala Asn Glu Gly

85 90 95

Lys Val Glu Ala Pro Lys Phe Pro Asn Leu Phe Tyr Lys Pro Val Thr

100 105 110

Ser Leu Ile Gly Pro Leu Ala Pro Val Ile Ile Pro Ala Val Ala Gln

115 120 125

Pro Ala Ala Ile His Gln Ser Asp Tyr Glu Ala Glu Phe Thr Val Val

130 135 140

Ile Gly Arg Ala Ala Lys Asn Val Thr Glu Ala Glu Ala Leu Asp Tyr

145 150 155 160

Val Leu Gly Tyr Thr Gly Gly Asn Asp Val Ser Phe Arg Lys His Gln

165 170 175

Phe Ala Val Ser Gln Trp Cys Phe Ser Lys Ser Phe Asp Asn Thr Asn

180 185 190

Pro Phe Gly Pro Cys Leu Val Ala Ala Ser Ser Ile Pro Asp Pro Gln

195 200 205

Asn Val Ala Ile Lys Phe Thr Leu Asn Gly Asn Thr Val Gln Asp Gly

210 215 220

Thr Thr Ala Asp Gln Ile Phe Ser Val Arg Lys Thr Ile Ala Tyr Leu

225 230 235 240

Ser Gln Gly Thr Thr Leu Gln Pro Gly Ser Ile Ile Met Thr Gly Thr

245 250 255

Pro Asn Gly Val Gly Phe Val Arg Asp Pro Pro Leu Tyr Leu Lys Asp

260 265 270

Gly Asp Gln Met Leu Thr Trp Ile Ser Gly Gly Ile Gly Thr Leu Ala

275 280 285

Asn Gly Val Val Glu Glu Lys Thr Arg

290 295

<210> 76

<211> 42

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 1

кофеилпируват-гидролаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (2)..(39)

<223> X - любая аминокислота

<400> 76

Trp Xaa Arg Leu Ile Arg Phe Val Xaa Xaa Glu Thr Ser Xaa Val His

1 5 10 15

Xaa Gly Xaa Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Asp Xaa Gly Xaa Ala Xaa Xaa

20 25 30

Xaa Gly Xaa Xaa Ile Xaa Xaa Tyr Glu Ile

35 40

<210> 77

<211> 137

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 2

кофеилпируват-гидролаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (5)..(136)

<223> X - любая аминокислота

<400> 77

Ser Ala Leu Asp Xaa Ser Ala Gln Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Leu Thr Val

1 5 10 15

Xaa Xaa Leu Leu Xaa Pro Leu Ser Xaa Glu Xaa Xaa Lys Xaa Val Arg

20 25 30

Cys Leu Gly Leu Asn Tyr Xaa Xaa His Ala Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa

35 40 45

Xaa Xaa Xaa Xaa Pro Xaa Leu Phe Tyr Lys Pro Val Thr Ser Leu Ile

50 55 60

Gly Pro Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Ile Pro Xaa Xaa Xaa Gln Pro Xaa Xaa

65 70 75 80

Xaa His Gln Ser Asp Tyr Glu Ala Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa Gly Xaa

85 90 95

Ala Ala Lys Xaa Xaa Xaa Glu Xaa Glu Ala Leu Xaa Tyr Val Leu Gly

100 105 110

Tyr Thr Xaa Xaa Asn Asp Xaa Ser Phe Arg Xaa Xaa Gln Xaa Ala Val

115 120 125

Ser Gln Trp Xaa Phe Ser Lys Xaa Phe

130 135

<210> 78

<211> 69

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Консенсуcная аминоксилотная последовательность 3

кофеилпируват-гидролаз

<220>

<221> MISC_FEATURE

<222> (3)..(65)

<223> X - любая аминокислота

<400> 78

Asp Gln Xaa Phe Xaa Xaa Xaa Lys Thr Xaa Xaa Xaa Leu Ser Gln Gly

1 5 10 15

Thr Thr Leu Xaa Xaa Gly Ser Ile Ile Xaa Thr Gly Thr Pro Xaa Gly

20 25 30

Val Gly Phe Val Xaa Xaa Pro Pro Leu Tyr Leu Lys Asp Gly Asp Xaa

35 40 45

Xaa Xaa Thr Trp Ile Xaa Xaa Gly Xaa Gly Xaa Leu Xaa Asn Xaa Val

50 55 60

Xaa Glu Glu Lys Thr

65

<210> 79

<211> 801

<212> DNA

<213> Neonothopanus nambi

<400> 79

atgcgcatta acattagcct ctcgtctctc ttcgaacgtc tctccaaact tagcagtcgc 60

agcatagcga ttacatgtgg agttgttctc gcctccgcaa tcgcctttcc catcatccgc 120

agagactacc agactttcct agaagtggga ccctcgtacg ctccgcagaa ctttagagga 180

tacatcatcg tctgtgtcct ctcgctattc cgccaagagc agaaagggct cgccatctat 240

gatcgtcttc ccgagaaacg caggtggttg gccgaccttc cctttcgtga aggaaccaga 300

cccagcatta ccagccatat cattcagcga cagcgcactc aactggtcga tcaggagttt 360

gccaccaggg agctcataga caaggtcatc cctcgcgtgc aagcacgaca caccgacaaa 420

acgttcctca gcacatcaaa gttcgagttt catgcgaagg ccatatttct cttgccttct 480

atcccaatca acgaccctct gaatatccct agccacgaca ctgtccgccg aacgaagcgc 540

gagattgcac atatgcatga ttatcatgat tgcacacttc atcttgctct cgctgcgcag 600

gatggaaagg aggtgctgaa gaaaggttgg ggacaacgac atcctttggc tggtcctgga 660

gttcctggtc caccaacgga atggactttt ctttatgcgc ctcgcaacga agaagaggct 720

cgagtagtgg agatgatcgt tgaggcttcc atagggtata tgacgaacga tcctgcagga 780

aagattgtag aaaacgccaa g 801

<210> 80

<211> 267

<212> PRT

<213> Neonothopanus nambi

<400> 80

Met Arg Ile Asn Ile Ser Leu Ser Ser Leu Phe Glu Arg Leu Ser Lys

1 5 10 15

Leu Ser Ser Arg Ser Ile Ala Ile Thr Cys Gly Val Val Leu Ala Ser

20 25 30

Ala Ile Ala Phe Pro Ile Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe Leu Glu

35 40 45

Val Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Phe Arg Gly Tyr Ile Ile Val

50 55 60

Cys Val Leu Ser Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys Gly Leu Ala Ile Tyr

65 70 75 80

Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Ala Asp Leu Pro Phe Arg

85 90 95

Glu Gly Thr Arg Pro Ser Ile Thr Ser His Ile Ile Gln Arg Gln Arg

100 105 110

Thr Gln Leu Val Asp Gln Glu Phe Ala Thr Arg Glu Leu Ile Asp Lys

115 120 125

Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp Lys Thr Phe Leu Ser

130 135 140

Thr Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Lys Ala Ile Phe Leu Leu Pro Ser

145 150 155 160

Ile Pro Ile Asn Asp Pro Leu Asn Ile Pro Ser His Asp Thr Val Arg

165 170 175

Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp Cys Thr

180 185 190

Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Glu Val Leu Lys Lys

195 200 205

Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro Gly Pro

210 215 220

Pro Thr Glu Trp Thr Phe Leu Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu Glu Ala

225 230 235 240

Arg Val Val Glu Met Ile Val Glu Ala Ser Ile Gly Tyr Met Thr Asn

245 250 255

Asp Pro Ala Gly Lys Ile Val Glu Asn Ala Lys

260 265

<210> 81

<211> 783

<212> DNA

<213> Omphalotus olearius

<400> 81

atgctcccag ctttcatcta caaaccaagg ctagtgatca cttgtgtatt cgttctggcc 60

tccgcactcg catttccctt catacgcaaa gattaccaga ctttcctgga ggtgggaccc 120

tcgtacgccc cgcagaacct ccaaggatac atcatcgtct gtgtactctc tctgttccgg 180

caagaacaga aagacgtagc gatttatgat cgccttcctg agaaaaggag gtggttagga 240

gacctcccgt ttcgcgaggg gccaagaccg agtatcacta gccatatcat ccagcgacag 300

cgcacccaat tggctgacgc cgagttcgct accaaagagc tgataggcaa aatcatccct 360

cgcgtccaag cccgacacac caacacaaca ttcctcagca catctaaatt cgaattccac 420

gcccaggcca tcttcctttt gccctctatc ccaatcaacg accctcaaaa cattccaagc 480

cacgataccg ttcgtcgcac gaaacgcgag atcgcgcata tgcatgatta tcacgactgt 540

acgttgcatc tcgcacttgc tgctcaagat gggaaggagg ttttagagaa aggatggggt 600

cagcgacatc ctcttgctgg acctggtgtt cctggcccgc cgacggagtg gacgtttctt 660

tatgcaccgc gcagcgaaga ggaggttcgg gttgtggaga tgattgttga ggcatcagtt 720

gtgtatatga cgaatgatcc tgcggataaa atcgtagaag ctactgtgca gggtactgaa 780

gaa 783

<210> 82

<211> 261

<212> PRT

<213> Omphalotus olearius

<400> 82

Met Leu Pro Ala Phe Ile Tyr Lys Pro Arg Leu Val Ile Thr Cys Val

1 5 10 15

Phe Val Leu Ala Ser Ala Leu Ala Phe Pro Phe Ile Arg Lys Asp Tyr

20 25 30

Gln Thr Phe Leu Glu Val Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Leu Gln

35 40 45

Gly Tyr Ile Ile Val Cys Val Leu Ser Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys

50 55 60

Asp Val Ala Ile Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Gly

65 70 75 80

Asp Leu Pro Phe Arg Glu Gly Pro Arg Pro Ser Ile Thr Ser His Ile

85 90 95

Ile Gln Arg Gln Arg Thr Gln Leu Ala Asp Ala Glu Phe Ala Thr Lys

100 105 110

Glu Leu Ile Gly Lys Ile Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asn

115 120 125

Thr Thr Phe Leu Ser Thr Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Gln Ala Ile

130 135 140

Phe Leu Leu Pro Ser Ile Pro Ile Asn Asp Pro Gln Asn Ile Pro Ser

145 150 155 160

His Asp Thr Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp

165 170 175

Tyr His Asp Cys Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys

180 185 190

Glu Val Leu Glu Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro

195 200 205

Gly Val Pro Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Leu Tyr Ala Pro Arg

210 215 220

Ser Glu Glu Glu Val Arg Val Val Glu Met Ile Val Glu Ala Ser Val

225 230 235 240

Val Tyr Met Thr Asn Asp Pro Ala Asp Lys Ile Val Glu Ala Thr Val

245 250 255

Gln Gly Thr Glu Glu

260

<210> 83

<211> 798

<212> DNA

<213> Armillaria gallica

<400> 83

atgtccttca tcgacagcat gaaacttgac ctcgtcggac acctctttgg catcaggaat 60

cgcggcttag ccgccgcttg ttgtgctcta gcagtcgcct ctactatcgc cttcccttac 120

attcgtaggg actaccagac atttttatct ggcggtccct cttacgctcc ccagaatatc 180

agaggatatt tcatcgtctg cgttctggcc ttgttccgtc aggagcaaaa gggccttgcg 240

atatatgatc gccttcccga gaagcgcagg tggctgcctg acttgcctcc tcgcaatggc 300

ccgcggccga tcacgaccag ccatataatc caaagacagc gcaaccaggc gccggacccc 360

aagttcgccc tcgaggaact caaggccacg gttattccac gggtgcaggc tcgccatact 420

gacctcaccc atctcagcct atccaaattc gagttccatg ctgaagcaat tttcctgctc 480

ccctctgtac ccatcgatga tccaaaaaat gttccaagtc acgacacggt gcgcaggacg 540

aaaagggaga tcgcgcatat gcacgactac catgacttca cgctgcatct tgcactggcc 600

gcccaagacg ggaaggaagt cgtgtcgaag ggatgggggc agcgacaccc cctagcaggc 660

cctggcgttc ctggtccacc tacggagtgg acatttattt atgcgccacg taacgaagag 720

gaactggcag tggtggaaat gattatcgag gcatcaatag gctatatgac caatgaccct 780

gctggagtag ttatcgca 798

<210> 84

<211> 266

<212> PRT

<213> Armillaria gallica

<400> 84

Met Ser Phe Ile Asp Ser Met Lys Leu Asp Leu Val Gly His Leu Phe

1 5 10 15

Gly Ile Arg Asn Arg Gly Leu Ala Ala Ala Cys Cys Ala Leu Ala Val

20 25 30

Ala Ser Thr Ile Ala Phe Pro Tyr Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe

35 40 45

Leu Ser Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Ile Arg Gly Tyr Phe

50 55 60

Ile Val Cys Val Leu Ala Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys Gly Leu Ala

65 70 75 80

Ile Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Pro Asp Leu Pro

85 90 95

Pro Arg Asn Gly Pro Arg Pro Ile Thr Thr Ser His Ile Ile Gln Arg

100 105 110

Gln Arg Asn Gln Ala Pro Asp Pro Lys Phe Ala Leu Glu Glu Leu Lys

115 120 125

Ala Thr Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp Leu Thr His

130 135 140

Leu Ser Leu Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Glu Ala Ile Phe Leu Leu

145 150 155 160

Pro Ser Val Pro Ile Asp Asp Pro Lys Asn Val Pro Ser His Asp Thr

165 170 175

Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp

180 185 190

Phe Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Glu Val Val

195 200 205

Ser Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro

210 215 220

Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Ile Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu

225 230 235 240

Glu Leu Ala Val Val Glu Met Ile Ile Glu Ala Ser Ile Gly Tyr Met

245 250 255

Thr Asn Asp Pro Ala Gly Val Val Ile Ala

260 265

<210> 85

<211> 798

<212> DNA

<213> Armillaria ostoyae

<400> 85

atgtccttca tcgacagcat gaaacttgac ttcgtcggac acctctttgg catcaggaat 60

cgcggcttag ccaccgcttg ttgtgctgtg gcagtcgctt ctgccatcgc cttcccttac 120

attcgtaggg actaccagac attcttatct ggcggtccct cttacgctcc ccagaacatc 180

aaaggatatc tcatcgtctg cgtcctggcc ttgttccgtc aggagcaaaa gggccttgcg 240

atatatgacc gccttcccga gaagcgcagg tggctacctg acttgcctcc tcgcaatggc 300

ccgcggccca tcacgaccag ccatataatc caaagacagc gcaaccaggc gccagactcc 360

aagttcgccc tcgaggaact caaggctacg gtcattccac gggtgcaggc tcgccacact 420

gacctcaccc atctcagcct atccaagttc gagttccatg ctgaagcaat cttcctgctc 480

ccctctgtac ccatcgatga tccaaaaaat gttccaagtc atgacacggt gcgcaggacg 540

aagagggaga tcgcgcatat gcacgactac catgacttta cgttgcatct tgcactggcc 600

gcccaagacg ggaaggaagt cgtggcgaag ggatgggggc agcgacaccc gctggcaggc 660

cctggcgttc ctggtccacc tacggagtgg acgtttattt atgcgccacg taacgaagag 720

gaactggcag tggtggaaat gattatcgag gcatcaatag gctatatgac caatgaccct 780

gctggaacag ttatcgta 798

<210> 86

<211> 266

<212> PRT

<213> Armillaria ostoyae

<400> 86

Met Ser Phe Ile Asp Ser Met Lys Leu Asp Phe Val Gly His Leu Phe

1 5 10 15

Gly Ile Arg Asn Arg Gly Leu Ala Thr Ala Cys Cys Ala Val Ala Val

20 25 30

Ala Ser Ala Ile Ala Phe Pro Tyr Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe

35 40 45

Leu Ser Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Ile Lys Gly Tyr Leu

50 55 60

Ile Val Cys Val Leu Ala Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys Gly Leu Ala

65 70 75 80

Ile Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Pro Asp Leu Pro

85 90 95

Pro Arg Asn Gly Pro Arg Pro Ile Thr Thr Ser His Ile Ile Gln Arg

100 105 110

Gln Arg Asn Gln Ala Pro Asp Ser Lys Phe Ala Leu Glu Glu Leu Lys

115 120 125

Ala Thr Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp Leu Thr His

130 135 140

Leu Ser Leu Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Glu Ala Ile Phe Leu Leu

145 150 155 160

Pro Ser Val Pro Ile Asp Asp Pro Lys Asn Val Pro Ser His Asp Thr

165 170 175

Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp

180 185 190

Phe Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Glu Val Val

195 200 205

Ala Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro

210 215 220

Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Ile Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu

225 230 235 240

Glu Leu Ala Val Val Glu Met Ile Ile Glu Ala Ser Ile Gly Tyr Met

245 250 255

Thr Asn Asp Pro Ala Gly Thr Val Ile Val

260 265

<210> 87

<211> 798

<212> DNA

<213> Armillaria mellea

<400> 87

atgtccttct tcgacagcgt gaaacttgac ctcgtcggac gcctctttgg catcaggaat 60

cgcggcttag ctgttacttg ttgtgctgtg gcagtcgcct ctatcatcgc gttcccttac 120

attcgtaggg actaccagac atttttatct gggggtccct cctacgctcc ccagaacatc 180

agaggatacc tcattgtctg cgtcctggcc ttgttccgtc aggagcaaaa aggccttgcg 240

atatacgacc gccttcccga gaagcgcagg tggctacctg acttgcctcc tcgcgatggc 300

ccacggccca tcacgaccag ccatataatc caaagacagc gcaaccaggc gccggacctc 360

aagttcgccc tcgaggaact caaggccacg gtcattccac gggtgcaggc tcgccacact 420

gacctcaccc atctcagcct atccaagttc gagttccatg ctgaagcaat cttcctgctc 480

ccctctgtac ccatcgatga tccaaagaat gtgccaagtc acgacacggt gcgcaggacg 540

aagagggaaa ttgcgcatat gcacgactac catgactaca cgctgcatct tgcgttggcc 600

gcccaagacg ggaaggaagt cgtatcaaag ggatgggggc agcgacaccc gctggcaggc 660

cctggcgttc ctggtccacc gacggagtgg acgtttattt atgcgccacg taacgaagag 720

gagctggcag tggtggaaat gattatcgag gcatcgatag gctatatgac caatgaccct 780

gcaggaaaaa ctatcgca 798

<210> 88

<211> 266

<212> PRT

<213> Armillaria mellea

<400> 88

Met Ser Phe Phe Asp Ser Val Lys Leu Asp Leu Val Gly Arg Leu Phe

1 5 10 15

Gly Ile Arg Asn Arg Gly Leu Ala Val Thr Cys Cys Ala Val Ala Val

20 25 30

Ala Ser Ile Ile Ala Phe Pro Tyr Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe

35 40 45

Leu Ser Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Ile Arg Gly Tyr Leu

50 55 60

Ile Val Cys Val Leu Ala Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys Gly Leu Ala

65 70 75 80

Ile Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Pro Asp Leu Pro

85 90 95

Pro Arg Asp Gly Pro Arg Pro Ile Thr Thr Ser His Ile Ile Gln Arg

100 105 110

Gln Arg Asn Gln Ala Pro Asp Leu Lys Phe Ala Leu Glu Glu Leu Lys

115 120 125

Ala Thr Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp Leu Thr His

130 135 140

Leu Ser Leu Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Glu Ala Ile Phe Leu Leu

145 150 155 160

Pro Ser Val Pro Ile Asp Asp Pro Lys Asn Val Pro Ser His Asp Thr

165 170 175

Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp

180 185 190

Tyr Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Glu Val Val

195 200 205

Ser Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro

210 215 220

Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Ile Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu

225 230 235 240

Glu Leu Ala Val Val Glu Met Ile Ile Glu Ala Ser Ile Gly Tyr Met

245 250 255

Thr Asn Asp Pro Ala Gly Lys Thr Ile Ala

260 265

<210> 89

<211> 798

<212> DNA

<213> Armillaria fuscipes

<400> 89

atgaccttct tggacagtat caaacttgac ctcgttgggc gcctctttgg catcaggaat 60

cacggcgtag ccgctgcctg ttgtgctgca gcagttgcct ctgccatcgt gttcccttat 120

attcgtaggg actaccagac atttctatct ggcggccctt cctacgctcc ccagaacatc 180

agaggataca tcattgtctg cgtcctagcc ttattccgcc aggagcaaaa aggccttgcg 240

atatatgacc gccttcccga gaagcgcagg tggttagctg acttgcctcc tcgcaatggc 300

ccacggccca tcacaaccag tcatataatt caaagacagc gcaaccaggc gccagacccc 360

aagttcgccc tcgaagaact caaggccaca gtcattccac gggtacaggc tcgccacact 420

gacctcaccc atctcagcct gtccaaattc gagtttcacg ctgaagcaat cttcctgctc 480

ccctctgtac ccatcgacga cccaaagaat atcccaagcc atgacacagt gcgcaggacg 540

aaaagggaga tcgcgcatat gcacgactat catgatttca cgctgcatct tgcactggct 600

gcccaagacg ggaaggaagt cgtatcaaag ggatgggggc agcggcaccc gctggcaggc 660

cctggtgtcc ctggtccacc aacggagtgg acgtttattt acgcgccacg gaacgaagag 720

gagctggcag tagtggaaat gataattgag gcatcaatag gctacatgac caatgaccct 780

gcaggatcag ttattcca 798

<210> 90

<211> 266

<212> PRT

<213> Armillaria fuscipes

<400> 90

Met Thr Phe Leu Asp Ser Ile Lys Leu Asp Leu Val Gly Arg Leu Phe

1 5 10 15

Gly Ile Arg Asn His Gly Val Ala Ala Ala Cys Cys Ala Ala Ala Val

20 25 30

Ala Ser Ala Ile Val Phe Pro Tyr Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe

35 40 45

Leu Ser Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Ile Arg Gly Tyr Ile

50 55 60

Ile Val Cys Val Leu Ala Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys Gly Leu Ala

65 70 75 80

Ile Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Ala Asp Leu Pro

85 90 95

Pro Arg Asn Gly Pro Arg Pro Ile Thr Thr Ser His Ile Ile Gln Arg

100 105 110

Gln Arg Asn Gln Ala Pro Asp Pro Lys Phe Ala Leu Glu Glu Leu Lys

115 120 125

Ala Thr Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp Leu Thr His

130 135 140

Leu Ser Leu Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Glu Ala Ile Phe Leu Leu

145 150 155 160

Pro Ser Val Pro Ile Asp Asp Pro Lys Asn Ile Pro Ser His Asp Thr

165 170 175

Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp

180 185 190

Phe Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Glu Val Val

195 200 205

Ser Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro

210 215 220

Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Ile Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu

225 230 235 240

Glu Leu Ala Val Val Glu Met Ile Ile Glu Ala Ser Ile Gly Tyr Met

245 250 255

Thr Asn Asp Pro Ala Gly Ser Val Ile Pro

260 265

<210> 91

<211> 738

<212> DNA

<213> Mycena citricolor

<400> 91

atggcttatc agctcacttg gattcagact ctcgtgctgg gtgcccttgt ggcaatggca 60

gtagcgttcc ccttcatcaa gaaagactac gagacgttcc tgaagggcgg cccctcctat 120

gcgccccaaa acgttcgcgg atacatcatc gtgctcgtgc tcgcgctctt ccgccaagag 180

cagctcgggc tggagatcta cgaccgcatg cccgagaaac gtcgctggct cgcgaatctc 240

cctcagcgcg agggcccccg ccccaagacc acaagtcaca tcatccagcg gcagctcagc 300

cagcacacgg accccgcatt cggcgccgcg tacctcaaag acaccgtcat tccgcgcgtc 360

caggcgcggc acgcagccaa cacgcacatc gcgcgctcga cgttcgagtt ccacgccgcc 420

gcgatcttcc tgaacgcgga cgtgccgctg cccgagggcc tgcccgcaag cgagacggtg 480

cggcggacca agggcgagat cgcgcacatg cacgactacc acgacttcac gctgcacctc 540

gcgctcgcgg cggcggatgg gaaggaggtg gtcggcaagg gctgggggca gcgccatccg 600

ctggcgggac ccggtgtgcc gggtccgccg aacgagtgga cctttgtgta tgcgccgagg 660

aatgaagagg agatgggcgt ggtcgagcag atcgtagagg cggcgattgg gtacatgtcg 720

aacgtgcctg cgctggaa 738

<210> 92

<211> 246

<212> PRT

<213> Mycena citricolor

<400> 92

Met Ala Tyr Gln Leu Thr Trp Ile Gln Thr Leu Val Leu Gly Ala Leu

1 5 10 15

Val Ala Met Ala Val Ala Phe Pro Phe Ile Lys Lys Asp Tyr Glu Thr

20 25 30

Phe Leu Lys Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Val Arg Gly Tyr

35 40 45

Ile Ile Val Leu Val Leu Ala Leu Phe Arg Gln Glu Gln Leu Gly Leu

50 55 60

Glu Ile Tyr Asp Arg Met Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Ala Asn Leu

65 70 75 80

Pro Gln Arg Glu Gly Pro Arg Pro Lys Thr Thr Ser His Ile Ile Gln

85 90 95

Arg Gln Leu Ser Gln His Thr Asp Pro Ala Phe Gly Ala Ala Tyr Leu

100 105 110

Lys Asp Thr Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Ala Ala Asn Thr

115 120 125

His Ile Ala Arg Ser Thr Phe Glu Phe His Ala Ala Ala Ile Phe Leu

130 135 140

Asn Ala Asp Val Pro Leu Pro Glu Gly Leu Pro Ala Ser Glu Thr Val

145 150 155 160

Arg Arg Thr Lys Gly Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp Phe

165 170 175

Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Ala Asp Gly Lys Glu Val Val Gly

180 185 190

Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro Gly

195 200 205

Pro Pro Asn Glu Trp Thr Phe Val Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu Glu

210 215 220

Met Gly Val Val Glu Gln Ile Val Glu Ala Ala Ile Gly Tyr Met Ser

225 230 235 240

Asn Val Pro Ala Leu Glu

245

<210> 93

<211> 747

<212> DNA

<213> Panellus stipticus

<400> 93

atgaacatca acctgaaagc tctgatcgga gtctgtgccg tgctcatcac cgctgcagtg 60

ttccccttcg ttcgtaaaga ctatcacacc tttcttgaag gtggaccatc ctacgcgccg 120

cagaatttgc aaggctatat catcgtgttg gtgctctcac tctttcgagg ggaggagacg 180

ggattggaaa tatacgaccg cttgcccgaa aaacgccgct ggctcgagga gctgcctgtt 240

cgcgaaggcc cgcgcccaaa gacaaccagc cacatcattc agagacaatt gaatcagcac 300

gttgacccgg acttcggaat gaactctttg aaaggctccg tcatccggcg ccttcaatcc 360

cgccaccagg acataactca actcgcactc tcgaaattcg aattccacgc cgaggccata 420

tttctgcgcc ccgatatcgc gatcaacgat cccaaacacg tcccgagcca cgacacggtg 480

cgccgcacaa agcgcgagat agctcacatg cacgactacc atgattacac gtgtcatttg 540

gcgctcgcag cgcaggatgg gaagcaagtg attgcaaaag ggtggggcca gagacatccg 600

ctcgcgggac cgggcatgcc ggggccgccg acggagtgga catttttgta tgcgccgagg 660

aatgaggcgg aggttcaagt gttggagacg attatcgaag cgtcaatcgg gtacatgtcg 720

aacgcaccag ccttgggtgg gagcgag 747

<210> 94

<211> 249

<212> PRT

<213> Panellus stipticus

<400> 94

Met Asn Ile Asn Leu Lys Ala Leu Ile Gly Val Cys Ala Val Leu Ile

1 5 10 15

Thr Ala Ala Val Phe Pro Phe Val Arg Lys Asp Tyr His Thr Phe Leu

20 25 30

Glu Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Leu Gln Gly Tyr Ile Ile

35 40 45

Val Leu Val Leu Ser Leu Phe Arg Gly Glu Glu Thr Gly Leu Glu Ile

50 55 60

Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Glu Glu Leu Pro Val

65 70 75 80

Arg Glu Gly Pro Arg Pro Lys Thr Thr Ser His Ile Ile Gln Arg Gln

85 90 95

Leu Asn Gln His Val Asp Pro Asp Phe Gly Met Asn Ser Leu Lys Gly

100 105 110

Ser Val Ile Arg Arg Leu Gln Ser Arg His Gln Asp Ile Thr Gln Leu

115 120 125

Ala Leu Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Glu Ala Ile Phe Leu Arg Pro

130 135 140

Asp Ile Ala Ile Asn Asp Pro Lys His Val Pro Ser His Asp Thr Val

145 150 155 160

Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp Tyr

165 170 175

Thr Cys His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Gln Val Ile Ala

180 185 190

Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Met Pro Gly

195 200 205

Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Leu Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Ala Glu

210 215 220

Val Gln Val Leu Glu Thr Ile Ile Glu Ala Ser Ile Gly Tyr Met Ser

225 230 235 240

Asn Ala Pro Ala Leu Gly Gly Ser Glu

245

<210> 95

<211> 792

<212> DNA

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 95

atgaatcttc cgtctttcgt ccaacgtctc tccacagcaa gcagtcgcag tatagcgatt 60

acttgcgtag ttgtccttgc ctctgcaatc gcctttccct tcatccgcag agactaccag 120

accttcctgg aagtgggacc ctcgtacgcc ccgcagaact ttagaggata catcatcgtc 180

tgtgtcctct cgttgttccg ccaagaacaa aaaggactcg aaatctacga tcggctccca 240

gagaaacgaa ggtggttgtc cgaccttccc tttcgtgacg ggcccagacc cagcatcaca 300

agccatatca ttcaacgaca gcgtacccaa ctagttgatc cggacttcgc tacccaggag 360

ctcataggca aagtcatccc tcgtgtgcaa gcacgacaca ccgacaaaac attcctcagc 420

acctccaaat tcgaatttca cgcaaaagcc atattcctcc tgccttccat cccaatcaac 480

gaccctctga acgttccaag ccacgacact gtccgacgaa cgaagcgcga gatcgcgcat 540

atgcatgatt atcatgattg cactcttcac atcgctctcg ctgctcagga cggaaaggag 600

gttttgaaga agggatgggg gcaacgacac ccactcgctg gacctggagt gcccggccca 660

ccgacggagt ggacgtttct ctatgcgcct cgaaacgaag aagaggttcg agttgtggag 720

atgattattg aggctgccat aggttacatg acgaatgatc cggcaggaaa agttgtagaa 780

gccactggaa ag 792

<210> 96

<211> 264

<212> PRT

<213> Neonothopanus gardneri

<400> 96

Met Asn Leu Pro Ser Phe Val Gln Arg Leu Ser Thr Ala Ser Ser Arg

1 5 10 15

Ser Ile Ala Ile Thr Cys Val Val Val Leu Ala Ser Ala Ile Ala Phe

20 25 30

Pro Phe Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe Leu Glu Val Gly Pro Ser

35 40 45

Tyr Ala Pro Gln Asn Phe Arg Gly Tyr Ile Ile Val Cys Val Leu Ser

50 55 60

Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys Gly Leu Glu Ile Tyr Asp Arg Leu Pro

65 70 75 80

Glu Lys Arg Arg Trp Leu Ser Asp Leu Pro Phe Arg Asp Gly Pro Arg

85 90 95

Pro Ser Ile Thr Ser His Ile Ile Gln Arg Gln Arg Thr Gln Leu Val

100 105 110

Asp Pro Asp Phe Ala Thr Gln Glu Leu Ile Gly Lys Val Ile Pro Arg

115 120 125

Val Gln Ala Arg His Thr Asp Lys Thr Phe Leu Ser Thr Ser Lys Phe

130 135 140

Glu Phe His Ala Lys Ala Ile Phe Leu Leu Pro Ser Ile Pro Ile Asn

145 150 155 160

Asp Pro Leu Asn Val Pro Ser His Asp Thr Val Arg Arg Thr Lys Arg

165 170 175

Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp Cys Thr Leu His Ile Ala

180 185 190

Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys Glu Val Leu Lys Lys Gly Trp Gly Gln

195 200 205

Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Val Pro Gly Pro Pro Thr Glu Trp

210 215 220

Thr Phe Leu Tyr Ala Pro Arg Asn Glu Glu Glu Val Arg Val Val Glu

225 230 235 240

Met Ile Ile Glu Ala Ala Ile Gly Tyr Met Thr Asn Asp Pro Ala Gly

245 250 255

Lys Val Val Glu Ala Thr Gly Lys

260

<210> 97

<211> 753

<212> DNA

<213> Mycena chlorophos

<400> 97

atggtccaac tcacccgaac ctccggattc atcgccgctg cggccattgt tgctgccatc 60

gccttcccgt tcattcgtcg agactaccag acgttccttc gtggtgggcc gtcctatgcc 120

ccacagaaca tccgcggcta tatcatcgtc ctggttctgt ccctcttccg cggcgaggag 180

aagggtcttg caatctacga gccccttcct gagaagcgca catggctgcc ggagcttccg 240

cggcgcgcgg gagaccggcc caagacgacg agccacatca tccaacggca gctcgaccag 300

taccccgacc cggactttgt cctcaaagcc ctgaaagcga cggtcatccc gcgtgtccaa 360

gcccggcaca cagacaagac tcacctcgcg ctgtccaagt tcgagttcca tgctgaggcc 420

atcttcgtgc gcccggaaat cgccatcgac gacccgaagc atatccccag ccacgacacg 480

gtgcgacgga cgaagcgcga gattgcgcac atgcacgact atcacgactg cacgctgcat 540

ttggcgctag cggcgcagga cgcgaagcag gtgctgcaga agggctgggg ccagcgccat 600

ccgctggcag ggcctgggat gcccgggccg cccacggagt ggacgttctt gtatgccccg 660

aggaccgagg aggaagtgaa ggttgtggag accattgtcg aggcctctat cgcgtacatg 720

acgaacgcgg agaagccggt cgagctggtg cag 753

<210> 98

<211> 251

<212> PRT

<213> Mycena chlorophos

<400> 98

Met Val Gln Leu Thr Arg Thr Ser Gly Phe Ile Ala Ala Ala Ala Ile

1 5 10 15

Val Ala Ala Ile Ala Phe Pro Phe Ile Arg Arg Asp Tyr Gln Thr Phe

20 25 30

Leu Arg Gly Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Ile Arg Gly Tyr Ile

35 40 45

Ile Val Leu Val Leu Ser Leu Phe Arg Gly Glu Glu Lys Gly Leu Ala

50 55 60

Ile Tyr Glu Pro Leu Pro Glu Lys Arg Thr Trp Leu Pro Glu Leu Pro

65 70 75 80

Arg Arg Ala Gly Asp Arg Pro Lys Thr Thr Ser His Ile Ile Gln Arg

85 90 95

Gln Leu Asp Gln Tyr Pro Asp Pro Asp Phe Val Leu Lys Ala Leu Lys

100 105 110

Ala Thr Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp Lys Thr His

115 120 125

Leu Ala Leu Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Glu Ala Ile Phe Val Arg

130 135 140

Pro Glu Ile Ala Ile Asp Asp Pro Lys His Ile Pro Ser His Asp Thr

145 150 155 160

Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp Tyr His Asp

165 170 175

Cys Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Ala Lys Gln Val Leu

180 185 190

Gln Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro Gly Met Pro

195 200 205

Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Leu Tyr Ala Pro Arg Thr Glu Glu

210 215 220

Glu Val Lys Val Val Glu Thr Ile Val Glu Ala Ser Ile Ala Tyr Met

225 230 235 240

Thr Asn Ala Glu Lys Pro Val Glu Leu Val Gln

245 250

<210> 99

<211> 801

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в млекопитающих

(гуманизаированная) нуклеиновая кислота, кодирующая белок SEQ ID

No:80

<400> 99

atgcgcatta acatctccct ttcatctctt ttcgagcgat tgagcaaact gagttccagg 60

agtattgcaa tcacttgtgg ggttgtcctc gcgagcgcca tcgcattccc catcatccgg 120

agagattatc agacgtttct tgaggtgggc cctagctatg caccacagaa cttccgagga 180

tatatcatcg tgtgtgtact gtcactgttt aggcaagaac aaaagggatt ggctatctat 240

gataggttgc ctgagaaacg gcggtggctc gctgatctcc catttagaga ggggacacga 300

ccgagcatca cttcacacat catacaaaga cagcgaacgc agctcgttga ccaagagttc 360

gcaactaggg aactgattga taaggtgata cccagagtac aggcgcgaca caccgataaa 420

acttttcttt ccacctctaa attcgagttc catgccaaag ctattttctt gttgccttcc 480

ataccgatta atgatcctct gaatattcca tcccacgaca cagttcgacg gacgaaacgc 540

gaaattgcgc acatgcacga ctatcacgat tgcactttgc acctggcact ggctgctcaa 600

gacggaaaag aagttctgaa aaagggttgg gggcaaagac atccgctggc gggacccggt 660

gtacctgggc cgcctacgga atggacattt ttgtacgcac cgaggaacga agaggaggcc 720

agggtcgttg agatgattgt tgaggctagt attgggtaca tgacgaatga tccggctggt 780

aaaattgttg aaaatgcaaa g 801

<210> 100

<211> 1266

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в млекопитающих

(гуманизаированная) нуклеиновая кислота, кодирующая белок SEQ ID

No:2

<400> 100

atggcgtcat tcgagaacag tcttagcgtg ctgatcgtcg gcgctgggct cggcggtctt 60

gctgcggcaa tcgccctcag gcgacaagga cacgttgtta aaatctatga cagctcatca 120

tttaaggcag agttgggcgc aggcctcgcg gtccccccaa acactttgag atcactgcaa 180

caactgggtt gtaatactga gaaccttaac ggcgtggata acctctgctt cactgcaatg 240

ggttacgatg gcagtgtggg tatgatgaac aatatgaccg attataggga ggcgtacggc 300

actagctgga taatggtcca tcgggttgat ctccacaatg agcttatgcg cgtagcgttg 360

gatccgggcg gattgggacc cccagctacc ttgcacttga atcaccgcgt gactttttgt 420

gatgtcgacg catgcacagt aaccttcacc aatgggacga ctcagtcagc ggatctcatc 480

gtcggcgccg acggtatacg atccactatc cgcagattcg tcctggagga agatgtcaca 540

gttccggcat ccggaatcgt tggtttccgc tggctcgtcc aggctgatgc tttggatcct 600

taccctgaac ttgactggat tgttaaaaag ccccctctcg gcgctaggtt gataagtacg 660

cctcaaaacc cgcagtctgg ggtaggtctc gcggatcgca gaacgatcat tatatacgcg 720

tgtcgaggag gtactatggt aaacgtactt gccgtccatg acgatgagag ggatcagaat 780

acggcagatt ggtccgtgcc agctagcaag gatgatcttt tcagagtttt tcacgactat 840

catcctcgat ttcggcggct gttggagttg gcgcaagaca tcaatctgtg gcagatgcgg 900

gtggtccccg ttctgaagaa atgggtgaac aaaagagtct gtctcttggg ggatgcagcg 960

catgcgtccc tccctacctt ggggcagggt ttcggcatgg ggttggagga cgccgtagcc 1020

cttgggactt tgcttccaaa ggggacgaca gcatcccaaa tagaaacaag acttgccgta 1080

tatgagcagc tccgaaaaga tcgcgccgag ttcgtcgcgg ctgagtccta cgaagaacaa 1140

tatgtaccag aaatgagggg actttacctg cgatccaaag aattgcgcga ccgggtaatg 1200

ggctatgaca taaaggtgga gtccgaaaag gtcttggaga cactgttgcg gtcaagcaat 1260

tccgcc 1266

<210> 101

<211> 2112

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеиновая кислота. кодирующая белок слияния

гиспидин-гидроксилазы и люциферазы

<400> 101

atggcatcgt ttgagaattc tctaagcgtt ttgattgtcg gggccggact tggtgggctt 60

gctgctgcca tcgcgctgcg tcgccaaggg catgtcgtga aaatatacga ctcctctagc 120

ttcaaagccg aacttggtgc gggactcgct gtgccgccta acaccttgcg cagtctacag 180

caacttggtt gcaataccga gaacctcaat ggtgtggata atctttgctt cactgcgatg 240

gggtatgacg ggagtgtagg gatgatgaac aacatgactg actatcgaga ggcatacggt 300

acttcttgga tcatggtcca ccgcgttgac ttgcataacg agctgatgcg cgtagcactt 360

gatccaggtg ggctcggacc tcctgcgaca ctccatctta atcatcgtgt cacattctgc 420

gatgtcgacg cttgcaccgt gacattcacc aacgggacca ctcaatcagc tgatctcatc 480

gttggtgcag acggtatacg ctctaccatt cggcggtttg tcttagaaga agacgtgact 540

gtgcctgcgt caggaatcgt cgggtttcga tggcttgtac aagctgacgc gctggaccca 600

tatcctgaac tcgactggat tgttaaaaag cctcctctag gcgcgcgact gatctccact 660

cctcagaatc cacagtctgg tgttggcttg gctgacaggc gcactatcat catctacgca 720

tgtcgtggcg gcaccatggt caatgtcctt gcagtgcatg atgacgaacg tgaccagaac 780

accgcagatt ggagtgtacc ggcttccaaa gacgatctat ttcgtgtttt ccacgattac 840

catccacgct ttcggcggct tttagagctt gcgcaggata ttaatctctg gcaaatgcgt 900

gttgtacctg ttttgaaaaa atgggttaac aagcgggttt gcttgttagg agatgctgcg 960

cacgcttctt taccgacgtt gggtcaaggt tttggtatgg gcctggaaga tgccgtagca 1020

cttggtacac tccttccaaa gggtaccact gcatctcaga tcgagactcg acttgcggtg 1080

tacgaacagc tacgtaagga tcgtgcggaa tttgttgcgg ctgaatcata tgaagagcaa 1140

tatgttcctg aaatgcgggg actttatctg aggtcaaagg aactgcgtga tagagtcatg 1200

ggttatgata tcaaagtgga gagcgagaag gttctcgaga cgctcctaag aagttctaat 1260

tctgcctccg gaactggggg caacgcctct gacggtggtg ggtctggtgg tatgcgcatt 1320

aacattagcc tctcgtctct cttcgaacgt ctctccaaac ttagcagtcg cagcatagcg 1380

attacatgtg gagttgttct cgcctccgca atcgcctttc ccatcatccg cagagactac 1440

cagactttcc tagaagtggg accctcgtac gctccgcaga actttagagg atacatcatc 1500

gtctgtgtcc tctcgctatt ccgccaagag cagaaagggc tcgccatcta tgatcgtctt 1560

cccgagaaac gcaggtggtt ggccgacctt ccctttcgtg aaggaaccag acccagcatt 1620

accagccata tcattcagcg acagcgcact caactggtcg atcaggagtt tgccaccagg 1680

gagctcatag acaaggtcat ccctcgcgtg caagcacgac acaccgacaa aacgttcctc 1740

agcacatcaa agttcgagtt tcatgcgaag gccatatttc tcttgccttc tatcccaatc 1800

aacgaccctc tgaatatccc tagccacgac actgtccgcc gaacgaagcg cgagattgca 1860

catatgcatg attatcatga ttgcacactt catcttgctc tcgctgcgca ggatggaaag 1920

gaggtgctga agaaaggttg gggacaacga catcctttgg ctggtcctgg agttcctggt 1980

ccaccaacgg aatggacttt tctttatgcg cctcgcaacg aagaagaggc tcgagtagtg 2040

gagatgatcg ttgaggcttc catagggtat atgacgaacg atcctgcagg aaagattgta 2100

gaaaacgcca ag 2112

<210> 102

<211> 704

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Аминокислотная последовательность белка слияния

гиспидин-гидроксилазы и люциферазы

<400> 102

Met Ala Ser Phe Glu Asn Ser Leu Ser Val Leu Ile Val Gly Ala Gly

1 5 10 15

Leu Gly Gly Leu Ala Ala Ala Ile Ala Leu Arg Arg Gln Gly His Val

20 25 30

Val Lys Ile Tyr Asp Ser Ser Ser Phe Lys Ala Glu Leu Gly Ala Gly

35 40 45

Leu Ala Val Pro Pro Asn Thr Leu Arg Ser Leu Gln Gln Leu Gly Cys

50 55 60

Asn Thr Glu Asn Leu Asn Gly Val Asp Asn Leu Cys Phe Thr Ala Met

65 70 75 80

Gly Tyr Asp Gly Ser Val Gly Met Met Asn Asn Met Thr Asp Tyr Arg

85 90 95

Glu Ala Tyr Gly Thr Ser Trp Ile Met Val His Arg Val Asp Leu His

100 105 110

Asn Glu Leu Met Arg Val Ala Leu Asp Pro Gly Gly Leu Gly Pro Pro

115 120 125

Ala Thr Leu His Leu Asn His Arg Val Thr Phe Cys Asp Val Asp Ala

130 135 140

Cys Thr Val Thr Phe Thr Asn Gly Thr Thr Gln Ser Ala Asp Leu Ile

145 150 155 160

Val Gly Ala Asp Gly Ile Arg Ser Thr Ile Arg Arg Phe Val Leu Glu

165 170 175

Glu Asp Val Thr Val Pro Ala Ser Gly Ile Val Gly Phe Arg Trp Leu

180 185 190

Val Gln Ala Asp Ala Leu Asp Pro Tyr Pro Glu Leu Asp Trp Ile Val

195 200 205

Lys Lys Pro Pro Leu Gly Ala Arg Leu Ile Ser Thr Pro Gln Asn Pro

210 215 220

Gln Ser Gly Val Gly Leu Ala Asp Arg Arg Thr Ile Ile Ile Tyr Ala

225 230 235 240

Cys Arg Gly Gly Thr Met Val Asn Val Leu Ala Val His Asp Asp Glu

245 250 255

Arg Asp Gln Asn Thr Ala Asp Trp Ser Val Pro Ala Ser Lys Asp Asp

260 265 270

Leu Phe Arg Val Phe His Asp Tyr His Pro Arg Phe Arg Arg Leu Leu

275 280 285

Glu Leu Ala Gln Asp Ile Asn Leu Trp Gln Met Arg Val Val Pro Val

290 295 300

Leu Lys Lys Trp Val Asn Lys Arg Val Cys Leu Leu Gly Asp Ala Ala

305 310 315 320

His Ala Ser Leu Pro Thr Leu Gly Gln Gly Phe Gly Met Gly Leu Glu

325 330 335

Asp Ala Val Ala Leu Gly Thr Leu Leu Pro Lys Gly Thr Thr Ala Ser

340 345 350

Gln Ile Glu Thr Arg Leu Ala Val Tyr Glu Gln Leu Arg Lys Asp Arg

355 360 365

Ala Glu Phe Val Ala Ala Glu Ser Tyr Glu Glu Gln Tyr Val Pro Glu

370 375 380

Met Arg Gly Leu Tyr Leu Arg Ser Lys Glu Leu Arg Asp Arg Val Met

385 390 395 400

Gly Tyr Asp Ile Lys Val Glu Ser Glu Lys Val Leu Glu Thr Leu Leu

405 410 415

Arg Ser Ser Asn Ser Ala Ser Gly Thr Gly Gly Asn Ala Ser Asp Gly

420 425 430

Gly Gly Ser Gly Gly Met Arg Ile Asn Ile Ser Leu Ser Ser Leu Phe

435 440 445

Glu Arg Leu Ser Lys Leu Ser Ser Arg Ser Ile Ala Ile Thr Cys Gly

450 455 460

Val Val Leu Ala Ser Ala Ile Ala Phe Pro Ile Ile Arg Arg Asp Tyr

465 470 475 480

Gln Thr Phe Leu Glu Val Gly Pro Ser Tyr Ala Pro Gln Asn Phe Arg

485 490 495

Gly Tyr Ile Ile Val Cys Val Leu Ser Leu Phe Arg Gln Glu Gln Lys

500 505 510

Gly Leu Ala Ile Tyr Asp Arg Leu Pro Glu Lys Arg Arg Trp Leu Ala

515 520 525

Asp Leu Pro Phe Arg Glu Gly Thr Arg Pro Ser Ile Thr Ser His Ile

530 535 540

Ile Gln Arg Gln Arg Thr Gln Leu Val Asp Gln Glu Phe Ala Thr Arg

545 550 555 560

Glu Leu Ile Asp Lys Val Ile Pro Arg Val Gln Ala Arg His Thr Asp

565 570 575

Lys Thr Phe Leu Ser Thr Ser Lys Phe Glu Phe His Ala Lys Ala Ile

580 585 590

Phe Leu Leu Pro Ser Ile Pro Ile Asn Asp Pro Leu Asn Ile Pro Ser

595 600 605

His Asp Thr Val Arg Arg Thr Lys Arg Glu Ile Ala His Met His Asp

610 615 620

Tyr His Asp Cys Thr Leu His Leu Ala Leu Ala Ala Gln Asp Gly Lys

625 630 635 640

Glu Val Leu Lys Lys Gly Trp Gly Gln Arg His Pro Leu Ala Gly Pro

645 650 655

Gly Val Pro Gly Pro Pro Thr Glu Trp Thr Phe Leu Tyr Ala Pro Arg

660 665 670

Asn Glu Glu Glu Ala Arg Val Val Glu Met Ile Val Glu Ala Ser Ile

675 680 685

Gly Tyr Met Thr Asn Asp Pro Ala Gly Lys Ile Val Glu Asn Ala Lys

690 695 700

<210> 103

<211> 1266

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в растениях нуклеиновая кислота,

кодирующая белок SEQ ID No:2

<400> 103

atggcatctt ttgagaattc tctgagcgtt ttgattgtcg gggccggact tggtgggctt 60

gctgctgcca tcgccctgcg tcgacaaggg catgtcgtga aaatatacga ctcctctagc 120

ttcaaagccg aacttggtgc tggactcgct gtgccgccta acaccttgcg tagtctccag 180

caacttggtt gcaataccga gaacctcaat ggtgtggata atctttgctt cactgctatg 240

gggtatgacg ggagtgtagg gatgatgaac aacatgactg actatcgaga ggcatacggt 300

acttcttgga tcatggtcca cagagttgac ttgcataacg agctgatgag ggtagcactt 360

gatccaggtg ggctcggacc tcctgcaaca ctccatctta atcatcgtgt cacattctgc 420

gatgtcgacg cttgcaccgt gacattcacc aacgggacca ctcaatcagc tgatctcatc 480

gttggtgcag acggtataag atctaccatt cgaaggtttg tcctggaaga agacgtgact 540

gtgcctgcat caggaatcgt cgggtttcga tggcttgtac aagctgacgc tctggaccca 600

tatcctgaac tcgactggat tgttaaaaag cctcctcttg gcgcacgact gatctccact 660

cctcagaatc cacagtctgg tgttggcttg gctgacagga ggactatcat catctacgca 720

tgtcgtggcg gcaccatggt caatgtcctt gcagtgcatg atgacgaacg tgaccagaac 780

accgcagatt ggagtgtacc ggcttccaaa gacgatctct ttcgtgtttt ccacgattac 840

catccacgat ttaggaggct tctcgagctt gctcaggata ttaatctctg gcaaatgcgt 900

gttgtacctg ttttgaaaaa atgggttaac aagagggttt gcttgctcgg agatgctgca 960

cacgcttctc tgccgacgtt gggtcaaggt tttggtatgg gtctggaaga tgccgtagca 1020

cttggtacac tccttccaaa gggtaccact gcatctcaga tcgagactcg acttgctgtg 1080

tacgaacagt tgcgtaagga tcgtgccgaa tttgttgccg ctgaatcata tgaagagcaa 1140

tatgttcctg aaatgcgagg actttatctg aggtcaaagg aactgcgtga tagagtcatg 1200

ggttatgata tcaaagtgga gagcgagaag gttctcgaga cgctccttag aagttctaat 1260

tctgcc 1266

<210> 104

<211> 1032

<212> DNA

<213> Aspergillus nidulans

<400> 104

atggtgcagg acacgtcatc tgcttctact tcccccattt tgacacgttg gtacatcgac 60

acaagaccct taacagcatc cacggcagca cttcctcttc tggaaacgtt gcagcctgca 120

gatcagatta gtgtacagaa gtattatcat ttaaaggata aacatatgag tcttgcttct 180

aacttattga agtatctgtt tgttcatcgt aattgtcgta ttccctggag ttctatcgtg 240

atctcccgta cacctgatcc tcaccgtcgt ccatgctaca ttcctccctc aggctctcag 300

gaagattcct tcaaagacgg atacactggt atcaatgttg agttcaatgt atcacaccaa 360

gccagtatgg tcgccattgc tggaaccgca tttactccca attctggtgg cgattctaaa 420

ctgaagcctg aggtgggaat cgacatcaca tgtgtaaacg agcgtcaggg ccgtaacggt 480

gaggagcgtt cattggaatc tcttcgtcaa tatatcgaca tcttctctga agtattctcc 540

acggctgaga tggcaaacat ccgtcgtctt gatggcgtta gtagttcttc tttaagtgct 600

gatcgtcttg ttgactatgg ttaccgtctt ttttatacat actgggccct gaaggaagcc 660

tatatcaaga tgactggtga agcattgctt gcaccatggt tacgtgagct ggagttctcc 720

aatgttgttg cccctgccgc tgttgctgaa tccggtgact ctgccggcga cttcggtgag 780

ccatacacag gagtccgtac gactttatat aaaaatttag ttgaggatgt gcgtatcgag 840

gtagccgccc ttggtggcga ttatcttttt gcaaccgcag ctcgtggagg aggaattgga 900

gccagttcaa ggcccggagg cggccctgat ggtagtggta tccgttcaca ggacccttgg 960

cgtccattta agaaacttga tatcgagcgt gacattcagc catgtgcaac aggtgtatgc 1020

aactgcctta gt 1032

<210> 105

<211> 344

<212> PRT

<213> Aspergillus nidulans

<400> 105

Met Val Gln Asp Thr Ser Ser Ala Ser Thr Ser Pro Ile Leu Thr Arg

1 5 10 15

Trp Tyr Ile Asp Thr Arg Pro Leu Thr Ala Ser Thr Ala Ala Leu Pro

20 25 30

Leu Leu Glu Thr Leu Gln Pro Ala Asp Gln Ile Ser Val Gln Lys Tyr

35 40 45

Tyr His Leu Lys Asp Lys His Met Ser Leu Ala Ser Asn Leu Leu Lys

50 55 60

Tyr Leu Phe Val His Arg Asn Cys Arg Ile Pro Trp Ser Ser Ile Val

65 70 75 80

Ile Ser Arg Thr Pro Asp Pro His Arg Arg Pro Cys Tyr Ile Pro Pro

85 90 95

Ser Gly Ser Gln Glu Asp Ser Phe Lys Asp Gly Tyr Thr Gly Ile Asn

100 105 110

Val Glu Phe Asn Val Ser His Gln Ala Ser Met Val Ala Ile Ala Gly

115 120 125

Thr Ala Phe Thr Pro Asn Ser Gly Gly Asp Ser Lys Leu Lys Pro Glu

130 135 140

Val Gly Ile Asp Ile Thr Cys Val Asn Glu Arg Gln Gly Arg Asn Gly

145 150 155 160

Glu Glu Arg Ser Leu Glu Ser Leu Arg Gln Tyr Ile Asp Ile Phe Ser

165 170 175

Glu Val Phe Ser Thr Ala Glu Met Ala Asn Ile Arg Arg Leu Asp Gly

180 185 190

Val Ser Ser Ser Ser Leu Ser Ala Asp Arg Leu Val Asp Tyr Gly Tyr

195 200 205

Arg Leu Phe Tyr Thr Tyr Trp Ala Leu Lys Glu Ala Tyr Ile Lys Met

210 215 220

Thr Gly Glu Ala Leu Leu Ala Pro Trp Leu Arg Glu Leu Glu Phe Ser

225 230 235 240

Asn Val Val Ala Pro Ala Ala Val Ala Glu Ser Gly Asp Ser Ala Gly

245 250 255

Asp Phe Gly Glu Pro Tyr Thr Gly Val Arg Thr Thr Leu Tyr Lys Asn

260 265 270

Leu Val Glu Asp Val Arg Ile Glu Val Ala Ala Leu Gly Gly Asp Tyr

275 280 285

Leu Phe Ala Thr Ala Ala Arg Gly Gly Gly Ile Gly Ala Ser Ser Arg

290 295 300

Pro Gly Gly Gly Pro Asp Gly Ser Gly Ile Arg Ser Gln Asp Pro Trp

305 310 315 320

Arg Pro Phe Lys Lys Leu Asp Ile Glu Arg Asp Ile Gln Pro Cys Ala

325 330 335

Thr Gly Val Cys Asn Cys Leu Ser

340

<210> 106

<211> 1593

<212> DNA

<213> Rhodobacter capsulatus

<400> 106

atgactcttc aatcccaaac tgctaaggat tgcttggcac tggatggtgc actgactttg 60

gtgcagtgcg aggcaatcgc cacgcatcgt agtcgtattt ccgttacgcc agccttgcgt 120

gaacgttgtg ctcgtgccca cgcacgtttg gagcacgcaa tcgcagagca gcgtcatatt 180

tacggtatca ccactggatt tggacccctg gctaaccgtc ttattggagc cgatcagggc 240

gctgagctgc aacagaatct gatttaccat cttgcaacgg gcgttggacc caagctgtcc 300

tgggcagagg cccgtgcact tatgttggca cgtcttaatt ccattttgca gggcgctagt 360

ggtgcttctc ctgaaacgat cgaccgtatc gtcgcagtac ttaacgctgg ctttgctcct 420

gaagttcccg cacaaggtac tgttggcgca agtggcgact tgactcccct tgcccacatg 480

gtactggccc tgcaaggccg tggacgtatg atcgatccta gtggacgtgt gcaagaggct 540

ggagccgtca tggatcgtct ttgcggaggc cctcttacgt tggccgcacg tgacggcctt 600

gctctggtca acggtacaag tgctatgact gctatcgctg ctcttactgg agtcgaggcc 660

gctcgtgcta tcgatgctgc acttcgtcac tccgccgttt tgatggaagt cctgtctgga 720

catgcagaag cctggcaccc cgcctttgca gagttgagac cccacccagg ccagttgcgt 780

gctactgaac gtttggccca ggccctggat ggcgcaggcc gtgtatgccg tactctgacg 840

gctgcccgtc gtcttactgc agccgacctg cgtccagagg accaccccgc acaagacgct 900

tattctctgc gtgtcgttcc tcaactggtt ggtgccgtat gggatactct tgactggcac 960

gaccgtgtcg tgacctgtga gcttaattca gtaaccgata accccatttt tccagagggt 1020

tgcgccgttc ctgcacttca cggaggaaac ttcatgggag tccacgtcgc actggcttca 1080

gacgctttga atgcagccct ggttaccctt gccggtcttg tagagcgtca aattgcccgt 1140

cttaccgacg agaaacttaa taaaggtctg cctgctttcc ttcacggtgg acaggcaggc 1200

cttcagagtg gcttcatggg cgctcaggtt acagcaactg ccctgttggc tgagatgcgt 1260

gcaaatgcaa ctccagtctc agtacaatcc ttgtccacaa acggtgcaaa ccaagacgtc 1320

gtatctatgg gaactatcgc cgcacgtcgt gctcgtgcac aattgttgcc actgtcacag 1380

attcaggcta tcttggcttt ggcattggcc caggctatgg atcttcttga cgatcccgag 1440

ggtcaagccg gatggtcttt gacagcccgt gatttgcgtg accgtatccg tgccgtttct 1500

cccggactgc gtgccgaccg tccactggca ggccatatcg aagctgttgc tcagggactt 1560

cgtcacccat ctgctgcagc cgatccacca gcc 1593

<210> 107

<211> 531

<212> PRT

<213> Rhodobacter capsulatus

<400> 107

Met Thr Leu Gln Ser Gln Thr Ala Lys Asp Cys Leu Ala Leu Asp Gly

1 5 10 15

Ala Leu Thr Leu Val Gln Cys Glu Ala Ile Ala Thr His Arg Ser Arg

20 25 30

Ile Ser Val Thr Pro Ala Leu Arg Glu Arg Cys Ala Arg Ala His Ala

35 40 45

Arg Leu Glu His Ala Ile Ala Glu Gln Arg His Ile Tyr Gly Ile Thr

50 55 60

Thr Gly Phe Gly Pro Leu Ala Asn Arg Leu Ile Gly Ala Asp Gln Gly

65 70 75 80

Ala Glu Leu Gln Gln Asn Leu Ile Tyr His Leu Ala Thr Gly Val Gly

85 90 95

Pro Lys Leu Ser Trp Ala Glu Ala Arg Ala Leu Met Leu Ala Arg Leu

100 105 110

Asn Ser Ile Leu Gln Gly Ala Ser Gly Ala Ser Pro Glu Thr Ile Asp

115 120 125

Arg Ile Val Ala Val Leu Asn Ala Gly Phe Ala Pro Glu Val Pro Ala

130 135 140

Gln Gly Thr Val Gly Ala Ser Gly Asp Leu Thr Pro Leu Ala His Met

145 150 155 160

Val Leu Ala Leu Gln Gly Arg Gly Arg Met Ile Asp Pro Ser Gly Arg

165 170 175

Val Gln Glu Ala Gly Ala Val Met Asp Arg Leu Cys Gly Gly Pro Leu

180 185 190

Thr Leu Ala Ala Arg Asp Gly Leu Ala Leu Val Asn Gly Thr Ser Ala

195 200 205

Met Thr Ala Ile Ala Ala Leu Thr Gly Val Glu Ala Ala Arg Ala Ile

210 215 220

Asp Ala Ala Leu Arg His Ser Ala Val Leu Met Glu Val Leu Ser Gly

225 230 235 240

His Ala Glu Ala Trp His Pro Ala Phe Ala Glu Leu Arg Pro His Pro

245 250 255

Gly Gln Leu Arg Ala Thr Glu Arg Leu Ala Gln Ala Leu Asp Gly Ala

260 265 270

Gly Arg Val Cys Arg Thr Leu Thr Ala Ala Arg Arg Leu Thr Ala Ala

275 280 285

Asp Leu Arg Pro Glu Asp His Pro Ala Gln Asp Ala Tyr Ser Leu Arg

290 295 300

Val Val Pro Gln Leu Val Gly Ala Val Trp Asp Thr Leu Asp Trp His

305 310 315 320

Asp Arg Val Val Thr Cys Glu Leu Asn Ser Val Thr Asp Asn Pro Ile

325 330 335

Phe Pro Glu Gly Cys Ala Val Pro Ala Leu His Gly Gly Asn Phe Met

340 345 350

Gly Val His Val Ala Leu Ala Ser Asp Ala Leu Asn Ala Ala Leu Val

355 360 365

Thr Leu Ala Gly Leu Val Glu Arg Gln Ile Ala Arg Leu Thr Asp Glu

370 375 380

Lys Leu Asn Lys Gly Leu Pro Ala Phe Leu His Gly Gly Gln Ala Gly

385 390 395 400

Leu Gln Ser Gly Phe Met Gly Ala Gln Val Thr Ala Thr Ala Leu Leu

405 410 415

Ala Glu Met Arg Ala Asn Ala Thr Pro Val Ser Val Gln Ser Leu Ser

420 425 430

Thr Asn Gly Ala Asn Gln Asp Val Val Ser Met Gly Thr Ile Ala Ala

435 440 445

Arg Arg Ala Arg Ala Gln Leu Leu Pro Leu Ser Gln Ile Gln Ala Ile

450 455 460

Leu Ala Leu Ala Leu Ala Gln Ala Met Asp Leu Leu Asp Asp Pro Glu

465 470 475 480

Gly Gln Ala Gly Trp Ser Leu Thr Ala Arg Asp Leu Arg Asp Arg Ile

485 490 495

Arg Ala Val Ser Pro Gly Leu Arg Ala Asp Arg Pro Leu Ala Gly His

500 505 510

Ile Glu Ala Val Ala Gln Gly Leu Arg His Pro Ser Ala Ala Ala Asp

515 520 525

Pro Pro Ala

530

<210> 108

<211> 1560

<212> DNA

<213> Escherichia coli

<400> 108

atgaaacctg aagattttcg tgcttccacc cagcggccct ttactggaga agaatatctg 60

aagtctcttc aagacggccg tgagatctat atttacggcg agcgtgtaaa ggatgttaca 120

acgcaccctg cttttcgtaa tgctgctgcc tcagttgccc aactttatga cgccctgcat 180

aaacccgaaa tgcaggactc actttgttgg aatacggaca cggggtccgg tggttacaca 240

cacaagttct ttcgtgtcgc caaatctgcc gatgacttgc gtcaacaacg tgatgctatc 300

gctgaatggt cacgtctgag ttacggctgg atgggccgta cgcccgacta taaggccgcc 360

tttggttgcg cattgggtgc aaatcccggc ttttatggac agtttgaaca aaatgcacgt 420

aactggtata ctcgtatcca ggaaaccggc ttgtacttta atcatgctat tgttaaccca 480

cctatcgatc gtcatttgcc aaccgataag gtcaaggatg tatatattaa acttgaaaag 540

gagacggacg ctggtatcat tgtgtctggc gctaaagtgg tggctacgaa cagtgcattg 600

acgcattaca atatgattgg ttttggttcc gcccaagtga tgggcgagaa ccccgacttt 660

gccttgatgt ttgttgcccc tatggacgct gacggagtaa aacttatttc acgtgcctca 720

tatgaaatgg tagctggtgc cactggttct ccttatgatt atcctctttc atcccgtttt 780

gacgaaaacg acgccatcct ggtcatggac aatgttctta ttccctggga gaacgtgctg 840

atctaccgtg acttcgatcg ttgccgtcgt tggactatgg aaggaggttt cgctcgtatg 900

tatccactgc aggcctgtgt tcgtttggct gtgaagttgg actttatcac agcccttctt 960

aaaaagtcac ttgagtgtac tggaacgttg gagttccgtg gtgtacaggc agatctgggc 1020

gaagtagtag cctggcgtaa tactttctgg gcactgtctg actctatgtg ctccgaggca 1080

acaccatggg tgaacggcgc atacctgccc gatcacgccg ctcttcaaac atatcgtgtg 1140

cttgctccca tggcttatgc taaaatcaaa aatattatcg agcgtaatgt aacttctggt 1200

ctgatttacc tgccatccag tgctcgtgac cttaacaatc ctcaaatcga tcagtatctt 1260

gcaaaatatg tgcgtggctc aaacggaatg gaccatgtgc agcgtatcaa aatcctgaag 1320

ttgatgtggg atgccatcgg ttctgaattt ggcggacgtc atgaactgta tgagattaac 1380

tactctggat ctcaagacga aatcagactt cagtgtttgc gtcaggccca aaattctgga 1440

aatatggata aaatgatggc tatggtagac cgttgtctga gtgagtacga tcaagatggt 1500

tggacagttc ctcatcttca taataatgac gatattaata tgcttgataa gttgcttaaa 1560

<210> 109

<211> 520

<212> PRT

<213> Escherichia coli

<400> 109

Met Lys Pro Glu Asp Phe Arg Ala Ser Thr Gln Arg Pro Phe Thr Gly

1 5 10 15

Glu Glu Tyr Leu Lys Ser Leu Gln Asp Gly Arg Glu Ile Tyr Ile Tyr

20 25 30

Gly Glu Arg Val Lys Asp Val Thr Thr His Pro Ala Phe Arg Asn Ala

35 40 45

Ala Ala Ser Val Ala Gln Leu Tyr Asp Ala Leu His Lys Pro Glu Met

50 55 60

Gln Asp Ser Leu Cys Trp Asn Thr Asp Thr Gly Ser Gly Gly Tyr Thr

65 70 75 80

His Lys Phe Phe Arg Val Ala Lys Ser Ala Asp Asp Leu Arg Gln Gln

85 90 95

Arg Asp Ala Ile Ala Glu Trp Ser Arg Leu Ser Tyr Gly Trp Met Gly

100 105 110

Arg Thr Pro Asp Tyr Lys Ala Ala Phe Gly Cys Ala Leu Gly Ala Asn

115 120 125

Pro Gly Phe Tyr Gly Gln Phe Glu Gln Asn Ala Arg Asn Trp Tyr Thr

130 135 140

Arg Ile Gln Glu Thr Gly Leu Tyr Phe Asn His Ala Ile Val Asn Pro

145 150 155 160

Pro Ile Asp Arg His Leu Pro Thr Asp Lys Val Lys Asp Val Tyr Ile

165 170 175

Lys Leu Glu Lys Glu Thr Asp Ala Gly Ile Ile Val Ser Gly Ala Lys

180 185 190

Val Val Ala Thr Asn Ser Ala Leu Thr His Tyr Asn Met Ile Gly Phe

195 200 205

Gly Ser Ala Gln Val Met Gly Glu Asn Pro Asp Phe Ala Leu Met Phe

210 215 220

Val Ala Pro Met Asp Ala Asp Gly Val Lys Leu Ile Ser Arg Ala Ser

225 230 235 240

Tyr Glu Met Val Ala Gly Ala Thr Gly Ser Pro Tyr Asp Tyr Pro Leu

245 250 255

Ser Ser Arg Phe Asp Glu Asn Asp Ala Ile Leu Val Met Asp Asn Val

260 265 270

Leu Ile Pro Trp Glu Asn Val Leu Ile Tyr Arg Asp Phe Asp Arg Cys

275 280 285

Arg Arg Trp Thr Met Glu Gly Gly Phe Ala Arg Met Tyr Pro Leu Gln

290 295 300

Ala Cys Val Arg Leu Ala Val Lys Leu Asp Phe Ile Thr Ala Leu Leu

305 310 315 320

Lys Lys Ser Leu Glu Cys Thr Gly Thr Leu Glu Phe Arg Gly Val Gln

325 330 335

Ala Asp Leu Gly Glu Val Val Ala Trp Arg Asn Thr Phe Trp Ala Leu

340 345 350

Ser Asp Ser Met Cys Ser Glu Ala Thr Pro Trp Val Asn Gly Ala Tyr

355 360 365

Leu Pro Asp His Ala Ala Leu Gln Thr Tyr Arg Val Leu Ala Pro Met

370 375 380

Ala Tyr Ala Lys Ile Lys Asn Ile Ile Glu Arg Asn Val Thr Ser Gly

385 390 395 400

Leu Ile Tyr Leu Pro Ser Ser Ala Arg Asp Leu Asn Asn Pro Gln Ile

405 410 415

Asp Gln Tyr Leu Ala Lys Tyr Val Arg Gly Ser Asn Gly Met Asp His

420 425 430

Val Gln Arg Ile Lys Ile Leu Lys Leu Met Trp Asp Ala Ile Gly Ser

435 440 445

Glu Phe Gly Gly Arg His Glu Leu Tyr Glu Ile Asn Tyr Ser Gly Ser

450 455 460

Gln Asp Glu Ile Arg Leu Gln Cys Leu Arg Gln Ala Gln Asn Ser Gly

465 470 475 480

Asn Met Asp Lys Met Met Ala Met Val Asp Arg Cys Leu Ser Glu Tyr

485 490 495

Asp Gln Asp Gly Trp Thr Val Pro His Leu His Asn Asn Asp Asp Ile

500 505 510

Asn Met Leu Asp Lys Leu Leu Lys

515 520

<210> 110

<211> 510

<212> DNA

<213> Escherichia coli

<400> 110

atgcagcttg atgagcagcg tttgcgtttt cgtgacgcta tggcatcact tagtgccgct 60

gtgaacatca tcacgactga gggagacgcc ggtcagtgcg gaatcacagc aaccgcagta 120

tgtagtgtta cggacactcc cccatctctg atggtctgta tcaatgccaa tagtgctatg 180

aatccagtct ttcagggtaa tggtaaactt tgtgtcaacg tcctgaatca cgagcaagag 240

ttgatggctc gtcattttgc aggaatgact ggtatggcta tggaagagcg tttttccttg 300

tcttgttggc aaaaaggacc actggcccag cctgtattga aaggttcttt ggcttccctg 360

gagggtgaga tccgtgacgt tcaagccatt ggaactcatc tggtatattt ggtagaaatc 420

aagaatatta tcctgtcagc cgagggccat ggtctgatct actttaaacg tcgttttcac 480

cccgtgatgc tggagatgga ggcagccatt 510

<210> 111

<211> 170

<212> PRT

<213> Escherichia coli

<400> 111

Met Gln Leu Asp Glu Gln Arg Leu Arg Phe Arg Asp Ala Met Ala Ser

1 5 10 15

Leu Ser Ala Ala Val Asn Ile Ile Thr Thr Glu Gly Asp Ala Gly Gln

20 25 30

Cys Gly Ile Thr Ala Thr Ala Val Cys Ser Val Thr Asp Thr Pro Pro

35 40 45

Ser Leu Met Val Cys Ile Asn Ala Asn Ser Ala Met Asn Pro Val Phe

50 55 60

Gln Gly Asn Gly Lys Leu Cys Val Asn Val Leu Asn His Glu Gln Glu

65 70 75 80

Leu Met Ala Arg His Phe Ala Gly Met Thr Gly Met Ala Met Glu Glu

85 90 95

Arg Phe Ser Leu Ser Cys Trp Gln Lys Gly Pro Leu Ala Gln Pro Val

100 105 110

Leu Lys Gly Ser Leu Ala Ser Leu Glu Gly Glu Ile Arg Asp Val Gln

115 120 125

Ala Ile Gly Thr His Leu Val Tyr Leu Val Glu Ile Lys Asn Ile Ile

130 135 140

Leu Ser Ala Glu Gly His Gly Leu Ile Tyr Phe Lys Arg Arg Phe His

145 150 155 160

Pro Val Met Leu Glu Met Glu Ala Ala Ile

165 170

<210> 112

<211> 801

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в растениях нуклеиновая кислота,

кодирующая белок SEQ ID No:80

<400> 112

atgaggataa atatctcttt gtctagtctc tttgagagac tgagcaaatt gtcatcccga 60

tccatcgcaa ttacctgcgg cgtagtcttg gcaagtgcaa tagcattccc aattatccga 120

agagactatc aaacgttcct tgaagtcggt ccgagctatg ccccacagaa cttccgaggc 180

tatatcatcg tttgtgtctt gtcacttttt aggcaagagc agaaagggtt ggcaatctat 240

gacaggcttc cagaaaagag gcgttggctt gccgacttgc cgtttcgtga agggacgagg 300

ccatccataa cctcccacat tatacagcgt cagcgtactc agctggtaga tcaagagttt 360

gcaaccagag aacttatcga taaggtgatc ccacgtgtgc aagcaagaca cacagacaaa 420

acttttctca gtacgtcaaa atttgagttt catgcaaagg ccatcttcct tctcccctct 480

atccctatta atgatcctct taacattccc tcacacgata cggtaagaag aaccaagcgt 540

gagatcgctc acatgcatga ttaccatgat tgcactctgc acttggctct tgctgctcag 600

gatggtaagg aagttttgaa gaaggggtgg ggccagcgtc acccactggc cggaccagga 660

gtcccaggcc ctcctactga gtggaccttc ctttacgcac caaggaacga agaggaggcc 720

agagttgtcg agatgatagt cgaagctagt attggctaca tgactaacga tcctgctggt 780

aagattgtcg aaaatgccaa g 801

<210> 113

<211> 5034

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в растениях нуклеиновая кислота,

кодирующая белок SEQ ID No:35

<400> 113

atgaattcca gcaagaatcc tccttccact cttcttgatg tttttctgga tactgccagg 60

aaccttgata ccgctttgag gaatgtcttg gaatgcggcg aacacagatg gtcctacaga 120

gagcttgata ctgtttcatc tgctctcgcc cagcatctta ggtacactgt cggtcttagt 180

cctactgtcg ccgtcatcag tgaaaaccat ccttatattc tcgctttgat gctggctgta 240

tggaaacttg gaggcacctt cgctcctatt gatgtccatt ctcctgccga attggtagct 300

ggcatgctga acatagtctc tccttcttgc ttggttattc cgagctcaga tgtaactaat 360

caaactcttg cctgcgatct taatatcccc gtcgttgcat ttcacccaca tcaatccact 420

attcctgagc tgaacaagaa gtacctcacc gattctcaaa tttctccgga tcttcctttt 480

tcagatccaa acagacctgc tctgtacctc ttcacttcat ccgccacttc tcgaagtaat 540

ctcaaatgcg tgcctctcac tcacaccttt atcctccgaa acagcctctc taagcgtgca 600

tggtgcaagc gtatgcgtcc agagacagac tttgacggca tacgtgttct tggatgggcc 660

ccgtggtctc acgtcctcgc acacatgcaa gacatcggac cactcaccct gcttaatgcc 720

ggatgctacg tttttgcaac tactccatcc acgtacccta cggaattgaa ggacgacagg 780

gacctgatat cttgcgccgc aaatgctatc atgtacaagg gcgtcaagtc atttgcttgt 840

cttccctttg tactcggagg gctgaaggca ctctgcgagt ctgagccatc cgtgaaggcc 900

catcttcagg tcgaggagag agctcaactc ctgaagtctc tgcaacacat ggaaattctt 960

gagtgtggag gtgccatgct cgaagcaagt gttgcctctt gggctattga gaactgcatt 1020

cccatttcta tcggtattgg tatgacggag actggtggag ccctctttgc aggccccgtt 1080

caggccatca aaaccgggtt ttcttcagag gataaattca ttgaagatgc tacttacttg 1140

ctcgttaagg atgatcatga gagtcatgct gaggaggata ttaacgaggg tgaactcgtt 1200

gtgaaaagta aaatgctccc acgaggctac cttggctata gtgatccttc cttctcagtc 1260

gacgatgctg gctgggttac atttagaaca ggagacagat acagcgttac acctgacgga 1320

aagttttcct ggctgggccg aaacactgat ttcattcaga tgaccagtgg tgagacgctg 1380

gatccccgac caattgagag cagtctctgc gaaagttctc ttatttctag agcatgcgtt 1440

atcggagata aatttctcaa cgggcctgct gctgctgttt gtgctatcat tgagcttgag 1500

cccacagctg tggaaaaagg acaagctcac agccgtgaga tagcaagagt tttcgcacct 1560

attaatcgag acttgccgcc tcctcttagg attgcatgga gtcacgtttt ggttctccag 1620

cccagtgaga agataccgat gacgaagaag ggtaccatct tcaggaagaa aattgagcag 1680

gtgtttggct ctgccttggg tggcagctct ggagataact ctcaagccac tgctgatgct 1740

ggcgttgttc gacgagacga gctttcaaac actgtcaagc acataattag ccgtgttctc 1800

ggagtttccg atgacgaact cctttggacg ttgtcatttg ccgagctcgg aatgacgtca 1860

gcattggcca ctcgaatcgc caacgagttg aacgaagttt tggttggagt taatctccct 1920

atcaacgctt gctatataca tgtcgacctt ccttctctga gcaatgccgt ctatgccaaa 1980

cttgcacacc tcaagctgcc agatcgtact cccgaaccca ggcaagcccc tgtcgaaaac 2040

tctggtggga aggagatcgt tgtcgttggc caggcctttc gtcttcctgg ctcaataaac 2100

gatgtcgcct ctcttcgaga cgcattcctg gccagacaag catcatccat tatcactgaa 2160

ataccatccg ataggtggga ccacgccagc ttctatccca aggatatacg tttcaacaag 2220

gctggccttg tggatatagc caattatgat catagctttt tcggactgac ggcaaccgaa 2280

gcactctatc tgtccccaac tatgcgtttg gcactcgaag tttcctttga agccttggag 2340

aatgctaata tcccggtgtc acaactcaag ggttctcaaa cagctgttta tgttgctact 2400

acagatgacg gatttgagac ccttttgaat gccgaggccg gctatgatgc ttatacaaga 2460

ttctatggca ctggtcgagc agcaagtaca gccagcgggc gtataagctg tcttcttgat 2520

gtccatggac cctctattac tgttgatacg gcatgcagtg gaggggctgt ttgtattgac 2580

caagcaatcg actatctgca atcaagcagt gcagcagaca ccgctatcat atgtgctagt 2640

aacacgcact gctggccagg cagcttcagg tttctttccg cacaagggat ggtatcccca 2700

ggaggacgat gcgcaacatt tacaactgat gctgatggct acgtgccctc tgagggcgct 2760

gtcgccttca tattgaaaac ccgagaagca gctatgcgtg acaaggacac tatcctcgcc 2820

acaatcaaag ctacacagat atcacacaat ggccgatctc aaggtcttgt ggcaccgaat 2880

gtcaacagcc aagctgacct tcatagaagc ttgcttcaaa aagctggcct tagcccggct 2940

gatatccgtt tcattgaagc tcatgggaca ggaacgtcac tgggagacct ctcagaaatt 3000

caagctataa atgatgctta tacctcctct cagccgcgta cgaccggccc actcatagtc 3060

agcgcttcca aaacggtcat tggtcatacc gaaccagctg gccccttggt cggtatgctg 3120

agtgtcttga actctttcaa agaaggcgcc gtccctggtc tcgcccatct taccgcagac 3180

aatttgaatc ccagtctgga ctgttcttct gtgccacttc tcattcccta tcaacctgtt 3240

cacctggctg cacccaagcc tcaccgagct gctgtaaggt catacggctt ttcaggtacc 3300

ctgggcggca tcgttctcga ggctcctgac gaagaaagac tggaagaaga gctgccaaat 3360

gacaagccca tgttgttcgt cgtcagcgca aagacacata cagcacttat cgaatacctg 3420

gggcgttatc tcgagttcct cttgcaggca aacccccaag atttttgtga catttgttat 3480

acaagctgcg ttgggcgtga gcactataga tatcgatatg cttgtgtagc aaatgatatg 3540

gaggacctca taggccaact ccagaaacgt ttgggcagca aggtgccgcc aaagccgtca 3600

tacaaacgtg gtgctttggc ctttgccttt tctggtcagg gtacacaatt ccgagggatg 3660

gccacagagc ttgcaaaagc atactccggc ttccgaaaga tcgtgtccga tctcgcaaag 3720

agagctagcg agttgtcagg tcatgccatt gaccgttttc ttcttgcata tgacataggc 3780

gctgaaaatg tagctcctga tagtgaggca gaccagattt gcatctttgt gtatcagtgt 3840

tctgtccttc gttggctgca gactatgggg attagaccca gtgcagtgat aggccatagc 3900

ctcggggaga tctcagcttc tgtggcagca ggagcacttt ctcttgactc cgctttggat 3960

cttgtcatct cacgagctcg tcttttgagg tcttcagcaa gtgctcctgc aggaatggca 4020

gctatgtctg cctctcaaga cgaggttgtg gagttgattg ggaaactcga cctcgacaag 4080

gctaattctc tcagcgtttc agtcataaat ggtccccaaa atactgtcgt gtccggctct 4140

tcagctgcta ttgaaagcat agtggctctt gccaaaggga gaaagatcaa agcctctgcc 4200

ctgaatatca atcaagcttt tcatagtcca tacgtcgaca gtgccgtccc tggtctccgt 4260

gcttggtcag aaaagcatat ctcctcagct agaccattgc aaattccgct gtattcaacg 4320

ttgttgggag cacaaatctc tgagggagag atgttgaatc cagatcactg ggtcgaccat 4380

gcacgaaagc ctgtacagtt cgcacaagca gccacaacca tgaaagaatc cttcaccgga 4440

gtcatcatag atatcggccc tcaagtagtg gcttggtcac ttctgctcag taacgggctc 4500

acgtccgtga ctgctctcgc tgcaaaaaga gggagaagtc aacaggtggc tttcctcagc 4560

gccttggccg atttgtatca agattacggt gttgttcctg attttgtcgg gctttatgct 4620

cagcaggaag atgcttcaag gttgaagaag acggatatct tgacgtatcc gttccagcgt 4680

ggcgaagaga ctctttctag tggttctagc actccgacat tggaaaacac ggatttggat 4740

tccggtaagg aactccttat gggaccgact agagggttgc tccgtgctga cgacttgcgt 4800

gacagtatcg tttcttctgt gaaggatgtt ctggaactca agtcaaatga agacctcgat 4860

ttgtctgaaa gtctgaatgc acttggtatg gacagcatca tgttcgctca gctccgaaag 4920

cgtattgggg aaggactcgg attgaatgtt ccgatggttt ttctgagcga cgccttttct 4980

attggtgaga tggttagtaa tcttgtggaa caggcagagg cttctgagga caat 5034

<210> 114

<211> 867

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в растениях нуклеиновая кислота,

кодирующая белок SEQ ID No:65

<400> 114

atggctccaa tttcttcaac ttggtctcgt ctcattcgat ttgtggctat tgaaacgtcc 60

ctcgtgcata tcggtgaacc gatagacgcc accatggacg tcggtctggc cagacgagaa 120

ggcaagacga tccaagcata cgagattatt ggatcaggca gtgctcttga cctctcagcc 180

caagtaagta agaatgtgct gactgtaagg gaactcctga tgccgctttc aagagaggaa 240

attaaaactg tacgatgctt ggggttgaac taccctgttc atgccaccga agcaaacgtt 300

gctgttccaa aattcccgaa tttgttctac aaaccagtga cctccctcat tggccccgat 360

ggactcatta ccatcccttc cgttgtccaa cccccgaagg agcatcagtc cgattatgaa 420

gcagaacttg tcattgtcat cgggaaagca gcaaagaatg taagtgagga tgaggctttg 480

gattatgtat tgggatacac tgccgctaac gatatttcct ttaggaaaca ccagcttgca 540

gtctcacaat ggtctttctc taaaggattt ggtagccttt tgctcactat ccgtatggca 600

caaacccact ctggtaacat taatagattc tccagagacc agattttcaa tgtcaagaag 660

acaatttcct tcctgtcaca aggcactaca ctggaaccag gttctatcat tttgactggt 720

acacctgacg gagtgggctt tgtgcgaaat ccaccacttt accttaaaga tggagatgaa 780

gtaatgacct ggattggaag tggaatcgga acattggcca atacagtgca agaagagaag 840

acttgcttcg ctagtggcgg acacgag 867

<210> 115

<211> 9

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Последовательность аминокислотного линкера

<400> 115

Gly Gly Ser Gly Gly Ser Gly Gly Ser

1 5

<210> 116

<211> 1569

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Оптимизированная для экспрессии в растениях нуклеиновая кислота,

кодирующая фенилаланин-аммоний-лиазу Streptomyces maritimus (SEQ

ID No: 117)

<400> 116

atgacattcg tgatagagct ggacatgaat gtcactcttg atcagttaga ggatgctgca 60

agacaaagaa cacccgtgga attgtctgca cctgtacgtt caagggtccg tgcttcacgt 120

gatgttttag ttaaattcgt acaagatgag cgtgtgattt acggtgtaaa tacttcaatg 180

ggcggattcg tggatcacct agtacctgtg agtcaggccc gtcaattgca agagaattta 240

atcaatgcag ttgccacaaa tgttggagca tatttagatg atacaacggc caggacgatt 300

atgttgagta ggattgtatc cctggcaagg ggcaattctg ccataactcc cgccaacctt 360

gacaaattag tggcagtgtt gaacgcagga atcgtcccat gcatccctga aaaaggttca 420

ttaggtactt caggtgactt aggccctctg gcagctatcg ccttagtatg cgctggccag 480

tggaaggcac gttacaatgg acaaataatg ccaggccgtc aggctctatc agaggccggt 540

gtcgaaccta tggaactttc atataaggac ggcctagcac ttataaacgg tacgtctgga 600

atggtaggcc ttggaactat ggttttacaa gccgctagga ggttagtgga caggtatttg 660

caagtaagtg ccttatctgt agaaggcttg gcaggcatga ctaaaccttt tgaccctcgt 720

gtacacggag ttaagcccca tagaggtcaa agacaagtag cttcccgtct atgggaagga 780

ttggccgatt ctcaccttgc cgtgaacgag cttgatactg aacaaaccct tgcaggtgaa 840

atgggcacgg tggcaaaggc tggaagttta gccatagagg atgcctactc cattcgttgc 900

acccctcaga tcctgggtcc agtcgtagac gtattggata ggatcggtgc aacattacaa 960

gacgagctga attcttcaaa cgataacccc attgtccttc ctgaggaagc agaagtattc 1020

cataatggac actttcatgg acagtatgtc gccatggcaa tggatcacct aaatatggct 1080

cttgctactg ttacgaatct tgccaataga agagtcgaca gatttctaga taaatcaaat 1140

tccaatggac taccagcctt tctttgccgt gaagacccag gccttaggct tggtttgatg 1200

ggcggccagt tcatgactgc atcaatcacc gctgaaaccc gtacactgac aatcccaatg 1260

tctgtacaat cacttacttc cacggcagat tttcaagaca tagtatcctt tggcttcgta 1320

gccgcaagga gagctagaga ggtgttgaca aacgctgctt atgtggtagc ctttgaacta 1380

ctgtgtgcct gtcaggctgt ggacatcaga ggagcagaca agctatcttc tttcacccgt 1440

cctctatatg aaagaaccag gaaaattgtt ccctttttcg acagagatga aacaattact 1500

gactacgttg agaagttagc tgctgattta atagcaggcg agcctgtaga tgccgctgtg 1560

gctgcacat 1569

<210> 117

<211> 523

<212> PRT

<213> Streptomyces maritimus

<400> 117

Met Thr Phe Val Ile Glu Leu Asp Met Asn Val Thr Leu Asp Gln Leu

1 5 10 15

Glu Asp Ala Ala Arg Gln Arg Thr Pro Val Glu Leu Ser Ala Pro Val

20 25 30

Arg Ser Arg Val Arg Ala Ser Arg Asp Val Leu Val Lys Phe Val Gln

35 40 45

Asp Glu Arg Val Ile Tyr Gly Val Asn Thr Ser Met Gly Gly Phe Val

50 55 60

Asp His Leu Val Pro Val Ser Gln Ala Arg Gln Leu Gln Glu Asn Leu

65 70 75 80

Ile Asn Ala Val Ala Thr Asn Val Gly Ala Tyr Leu Asp Asp Thr Thr

85 90 95

Ala Arg Thr Ile Met Leu Ser Arg Ile Val Ser Leu Ala Arg Gly Asn

100 105 110

Ser Ala Ile Thr Pro Ala Asn Leu Asp Lys Leu Val Ala Val Leu Asn

115 120 125

Ala Gly Ile Val Pro Cys Ile Pro Glu Lys Gly Ser Leu Gly Thr Ser

130 135 140

Gly Asp Leu Gly Pro Leu Ala Ala Ile Ala Leu Val Cys Ala Gly Gln

145 150 155 160

Trp Lys Ala Arg Tyr Asn Gly Gln Ile Met Pro Gly Arg Gln Ala Leu

165 170 175

Ser Glu Ala Gly Val Glu Pro Met Glu Leu Ser Tyr Lys Asp Gly Leu

180 185 190

Ala Leu Ile Asn Gly Thr Ser Gly Met Val Gly Leu Gly Thr Met Val

195 200 205

Leu Gln Ala Ala Arg Arg Leu Val Asp Arg Tyr Leu Gln Val Ser Ala

210 215 220

Leu Ser Val Glu Gly Leu Ala Gly Met Thr Lys Pro Phe Asp Pro Arg

225 230 235 240

Val His Gly Val Lys Pro His Arg Gly Gln Arg Gln Val Ala Ser Arg

245 250 255

Leu Trp Glu Gly Leu Ala Asp Ser His Leu Ala Val Asn Glu Leu Asp

260 265 270

Thr Glu Gln Thr Leu Ala Gly Glu Met Gly Thr Val Ala Lys Ala Gly

275 280 285

Ser Leu Ala Ile Glu Asp Ala Tyr Ser Ile Arg Cys Thr Pro Gln Ile

290 295 300

Leu Gly Pro Val Val Asp Val Leu Asp Arg Ile Gly Ala Thr Leu Gln

305 310 315 320

Asp Glu Leu Asn Ser Ser Asn Asp Asn Pro Ile Val Leu Pro Glu Glu

325 330 335

Ala Glu Val Phe His Asn Gly His Phe His Gly Gln Tyr Val Ala Met

340 345 350

Ala Met Asp His Leu Asn Met Ala Leu Ala Thr Val Thr Asn Leu Ala

355 360 365

Asn Arg Arg Val Asp Arg Phe Leu Asp Lys Ser Asn Ser Asn Gly Leu

370 375 380

Pro Ala Phe Leu Cys Arg Glu Asp Pro Gly Leu Arg Leu Gly Leu Met

385 390 395 400

Gly Gly Gln Phe Met Thr Ala Ser Ile Thr Ala Glu Thr Arg Thr Leu

405 410 415

Thr Ile Pro Met Ser Val Gln Ser Leu Thr Ser Thr Ala Asp Phe Gln

420 425 430

Asp Ile Val Ser Phe Gly Phe Val Ala Ala Arg Arg Ala Arg Glu Val

435 440 445

Leu Thr Asn Ala Ala Tyr Val Val Ala Phe Glu Leu Leu Cys Ala Cys

450 455 460

Gln Ala Val Asp Ile Arg Gly Ala Asp Lys Leu Ser Ser Phe Thr Arg

465 470 475 480

Pro Leu Tyr Glu Arg Thr Arg Lys Ile Val Pro Phe Phe Asp Arg Asp

485 490 495

Glu Thr Ile Thr Asp Tyr Val Glu Lys Leu Ala Ala Asp Leu Ile Ala

500 505 510

Gly Glu Pro Val Asp Ala Ala Val Ala Ala His

515 520

<210> 118

<211> 1173

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Aquilaria sinensis,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 118

atgggatctc aagatgttgc tggaggagct cttaagggag ttaatccagg aaaggctact 60

attcttgctc ttggaaaggc ttttccatat caacttgtta tgcaagaatt tcttgttgat 120

ggatatttta agaatacttc ttgtaaggat caagaactta agcaaaagct tgctagactt 180

tgtaagacta ctactgttaa gactagatat gttgttatgt ctgaagaaat tcttaataag 240

tatccagaac ttgctgttga aggaattcca actcttaagc aaagacttga tattggaaat 300

gaagctctta ctgaaatggc tattgaagct tctcaagctt gtattaagaa gtggggaaga 360

ccagcttctg aaattactca tcttgtttat gtttcttctt ctgaagctag acttccagga 420

ggagatcttt atcttgctca aggacttgga ctttctccaa gaactaagag agttgttctt 480

tattttatgg gatgttctgg aggagttgct ggacttagag ttgctaagga tattgctgaa 540

aataatccag gatctagagt tcttcttgct acttctgaaa ctactattgt tggatttaag 600

ccaccatctg ctcatagacc atatgatctt gttggagttg ctctttttgg agatggagct 660

ggagctatgg ttattggatc tgatccactt ccaggaactg aatctccact ttttgaactt 720

catactgcta ttcaaaattt tcttccaaat actgaaaaga ctattgatgg aagacttact 780

gaagaaggaa tttcttttaa gcttgctaga gaacttccac aaattgttga agatcatatt 840

gaaggatttt gtggacaact tactggagtt attggacttt ctcataagca atataataag 900

atgttttggg ctgttcatcc aggaggacca gctattctta atagagttga aaagagactt 960

gatcttcatc caaataagct tgatgcttct agaagagctc ttgaagatta tggaaatgct 1020

tcttctaatt ctattgttta tgttcttgat tatatgattg aagaaactct taagatgaag 1080

actgaatctc ttgaaccatc tgaatgggga cttattcttg cttttggacc aggagttact 1140

tttgaaggaa ttcttgctag aaatcttgct gtt 1173

<210> 119

<211> 391

<212> PRT

<213> Aquilaria sinensis

<400> 119

Met Gly Ser Gln Asp Val Ala Gly Gly Ala Leu Lys Gly Val Asn Pro

1 5 10 15

Gly Lys Ala Thr Ile Leu Ala Leu Gly Lys Ala Phe Pro Tyr Gln Leu

20 25 30

Val Met Gln Glu Phe Leu Val Asp Gly Tyr Phe Lys Asn Thr Ser Cys

35 40 45

Lys Asp Gln Glu Leu Lys Gln Lys Leu Ala Arg Leu Cys Lys Thr Thr

50 55 60

Thr Val Lys Thr Arg Tyr Val Val Met Ser Glu Glu Ile Leu Asn Lys

65 70 75 80

Tyr Pro Glu Leu Ala Val Glu Gly Ile Pro Thr Leu Lys Gln Arg Leu

85 90 95

Asp Ile Gly Asn Glu Ala Leu Thr Glu Met Ala Ile Glu Ala Ser Gln

100 105 110

Ala Cys Ile Lys Lys Trp Gly Arg Pro Ala Ser Glu Ile Thr His Leu

115 120 125

Val Tyr Val Ser Ser Ser Glu Ala Arg Leu Pro Gly Gly Asp Leu Tyr

130 135 140

Leu Ala Gln Gly Leu Gly Leu Ser Pro Arg Thr Lys Arg Val Val Leu

145 150 155 160

Tyr Phe Met Gly Cys Ser Gly Gly Val Ala Gly Leu Arg Val Ala Lys

165 170 175

Asp Ile Ala Glu Asn Asn Pro Gly Ser Arg Val Leu Leu Ala Thr Ser

180 185 190

Glu Thr Thr Ile Val Gly Phe Lys Pro Pro Ser Ala His Arg Pro Tyr

195 200 205

Asp Leu Val Gly Val Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ala Gly Ala Met Val

210 215 220

Ile Gly Ser Asp Pro Leu Pro Gly Thr Glu Ser Pro Leu Phe Glu Leu

225 230 235 240

His Thr Ala Ile Gln Asn Phe Leu Pro Asn Thr Glu Lys Thr Ile Asp

245 250 255

Gly Arg Leu Thr Glu Glu Gly Ile Ser Phe Lys Leu Ala Arg Glu Leu

260 265 270

Pro Gln Ile Val Glu Asp His Ile Glu Gly Phe Cys Gly Gln Leu Thr

275 280 285

Gly Val Ile Gly Leu Ser His Lys Gln Tyr Asn Lys Met Phe Trp Ala

290 295 300

Val His Pro Gly Gly Pro Ala Ile Leu Asn Arg Val Glu Lys Arg Leu

305 310 315 320

Asp Leu His Pro Asn Lys Leu Asp Ala Ser Arg Arg Ala Leu Glu Asp

325 330 335

Tyr Gly Asn Ala Ser Ser Asn Ser Ile Val Tyr Val Leu Asp Tyr Met

340 345 350

Ile Glu Glu Thr Leu Lys Met Lys Thr Glu Ser Leu Glu Pro Ser Glu

355 360 365

Trp Gly Leu Ile Leu Ala Phe Gly Pro Gly Val Thr Phe Glu Gly Ile

370 375 380

Leu Ala Arg Asn Leu Ala Val

385 390

<210> 120

<211> 1164

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS2 из Aquilaria sinensis,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 120

atgtctcaag ctattgctga taatgcttat agacatcatc ttaagagagc tccaactcca 60

ggaaaggcta ctgttcttgc tcttggaaag gcttttccaa agcaagttat tccacaagaa 120

aatcttgttg aaggatatat tagagatact aagtgtgaag atgtttctat taaggaaaag 180

cttgaaagac tttgtaagac tactactgtt aagactagat atactgttat gtctaaggaa 240

attcttgata attatccaga acttgttact gaaggatctc caactattag acaaagactt 300

gaaattgcta atccagctgt tgttgaaatg gctaaggaag cttctcttgc ttgtattaag 360

caatggggaa gaccagctgg agatattact catattgttt atgtttcttc ttctgaaatt 420

agacttccag gaggagatct ttatcttgct aatgaacttg gacttaagaa tgatattaat 480

agaattatgc tttattttct tggatgttat ggaggagtta ctggacttag agttgctaag 540

gatattgctg aaaataatcc aggatctaga attcttctta ctacttctga aactactatt 600

cttggattta gaccaccaaa taagtctaga ccatatgatc ttgttggagc tgctcttttt 660

ggagatggag ctgctgctgt tattattgga gctaatccag aaattggaag agaatctcca 720

tttatggaac ttaattttgc tcttcaacaa tttcttccag gaactcatgg agttattgat 780

ggaagacttt ctgaagaagg aattaatttt aagcttggaa gagatcttcc acaaaagatt 840

gaagataata ttgaagattt ttgtagaaag cttatgatta aggctgatgg agatcttaag 900

gaatttaatg aacttttttg ggctgttcat ccaggaggac cagctattct taatagactt 960

gaatctattc ttgatcttaa gaatggaaag cttgaatgtt ctagaagagc tcttatggat 1020

tatggaaatg tttcttctaa tactattttt tatgttatgg aatatatgag agaagaactt 1080

aagagagaag gatctgaaga atggggactt gctcttgctt ttggaccagg aattactttt 1140

gaaggaattc ttcttagatc tctt 1164

<210> 121

<211> 388

<212> PRT

<213> Aquilaria sinensis

<400> 121

Met Ser Gln Ala Ile Ala Asp Asn Ala Tyr Arg His His Leu Lys Arg

1 5 10 15

Ala Pro Thr Pro Gly Lys Ala Thr Val Leu Ala Leu Gly Lys Ala Phe

20 25 30

Pro Lys Gln Val Ile Pro Gln Glu Asn Leu Val Glu Gly Tyr Ile Arg

35 40 45

Asp Thr Lys Cys Glu Asp Val Ser Ile Lys Glu Lys Leu Glu Arg Leu

50 55 60

Cys Lys Thr Thr Thr Val Lys Thr Arg Tyr Thr Val Met Ser Lys Glu

65 70 75 80

Ile Leu Asp Asn Tyr Pro Glu Leu Val Thr Glu Gly Ser Pro Thr Ile

85 90 95

Arg Gln Arg Leu Glu Ile Ala Asn Pro Ala Val Val Glu Met Ala Lys

100 105 110

Glu Ala Ser Leu Ala Cys Ile Lys Gln Trp Gly Arg Pro Ala Gly Asp

115 120 125

Ile Thr His Ile Val Tyr Val Ser Ser Ser Glu Ile Arg Leu Pro Gly

130 135 140

Gly Asp Leu Tyr Leu Ala Asn Glu Leu Gly Leu Lys Asn Asp Ile Asn

145 150 155 160

Arg Ile Met Leu Tyr Phe Leu Gly Cys Tyr Gly Gly Val Thr Gly Leu

165 170 175

Arg Val Ala Lys Asp Ile Ala Glu Asn Asn Pro Gly Ser Arg Ile Leu

180 185 190

Leu Thr Thr Ser Glu Thr Thr Ile Leu Gly Phe Arg Pro Pro Asn Lys

195 200 205

Ser Arg Pro Tyr Asp Leu Val Gly Ala Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ala

210 215 220

Ala Ala Val Ile Ile Gly Ala Asn Pro Glu Ile Gly Arg Glu Ser Pro

225 230 235 240

Phe Met Glu Leu Asn Phe Ala Leu Gln Gln Phe Leu Pro Gly Thr His

245 250 255

Gly Val Ile Asp Gly Arg Leu Ser Glu Glu Gly Ile Asn Phe Lys Leu

260 265 270

Gly Arg Asp Leu Pro Gln Lys Ile Glu Asp Asn Ile Glu Asp Phe Cys

275 280 285

Arg Lys Leu Met Ile Lys Ala Asp Gly Asp Leu Lys Glu Phe Asn Glu

290 295 300

Leu Phe Trp Ala Val His Pro Gly Gly Pro Ala Ile Leu Asn Arg Leu

305 310 315 320

Glu Ser Ile Leu Asp Leu Lys Asn Gly Lys Leu Glu Cys Ser Arg Arg

325 330 335

Ala Leu Met Asp Tyr Gly Asn Val Ser Ser Asn Thr Ile Phe Tyr Val

340 345 350

Met Glu Tyr Met Arg Glu Glu Leu Lys Arg Glu Gly Ser Glu Glu Trp

355 360 365

Gly Leu Ala Leu Ala Phe Gly Pro Gly Ile Thr Phe Glu Gly Ile Leu

370 375 380

Leu Arg Ser Leu

385

<210> 122

<211> 1185

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Arabidopsis thaliana,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 122

atgtctaatt ctagaatgaa tggagttgaa aagctttctt ctaagtctac tagaagagtt 60

gctaatgctg gaaaggctac tcttcttgct cttggaaagg cttttccatc tcaagttgtt 120

ccacaagaaa atcttgttga aggatttctt agagatacta agtgtgatga tgcttttatt 180

aaggaaaagc ttgaacatct ttgtaagact actactgtta agactagata tactgttctt 240

actagagaaa ttcttgctaa gtatccagaa cttactactg aaggatctcc aactattaag 300

caaagacttg aaattgctaa tgaagctgtt gttgaaatgg ctcttgaagc ttctcttgga 360

tgtattaagg aatggggaag accagttgaa gatattactc atattgttta tgtttcttct 420

tctgaaatta gacttccagg aggagatctt tatctttctg ctaagcttgg acttagaaat 480

gatgttaata gagttatgct ttattttctt ggatgttatg gaggagttac tggacttaga 540

gttgctaagg atattgctga aaataatcca ggatctagag ttcttcttac tacttctgaa 600

actactattc ttggatttag accaccaaat aaggctagac catatgatct tgttggagct 660

gctctttttg gagatggagc tgctgctgtt attattggag ctgatccaag agaatgtgaa 720

gctccattta tggaacttca ttatgctgtt caacaatttc ttccaggaac tcaaaatgtt 780

attgaaggaa gacttactga agaaggaatt aattttaagc ttggaagaga tcttccacaa 840

aagattgaag aaaatattga agaattttgt aagaagctta tgggaaaggc tggagatgaa 900

tctatggaat ttaatgatat gttttgggct gttcatccag gaggaccagc tattcttaat 960

agacttgaaa ctaagcttaa gcttgaaaag gaaaagcttg aatcttctag aagagctctt 1020

gttgattatg gaaatgtttc ttctaatact attctttatg ttatggaata tatgagagat 1080

gaacttaaga agaagggaga tgctgctcaa gaatggggac ttggacttgc ttttggacca 1140

ggaattactt ttgaaggact tcttattaga tctcttactt cttct 1185

<210> 123

<211> 395

<212> PRT

<213> Arabidopsis thaliana

<400> 123

Met Ser Asn Ser Arg Met Asn Gly Val Glu Lys Leu Ser Ser Lys Ser

1 5 10 15

Thr Arg Arg Val Ala Asn Ala Gly Lys Ala Thr Leu Leu Ala Leu Gly

20 25 30

Lys Ala Phe Pro Ser Gln Val Val Pro Gln Glu Asn Leu Val Glu Gly

35 40 45

Phe Leu Arg Asp Thr Lys Cys Asp Asp Ala Phe Ile Lys Glu Lys Leu

50 55 60

Glu His Leu Cys Lys Thr Thr Thr Val Lys Thr Arg Tyr Thr Val Leu

65 70 75 80

Thr Arg Glu Ile Leu Ala Lys Tyr Pro Glu Leu Thr Thr Glu Gly Ser

85 90 95

Pro Thr Ile Lys Gln Arg Leu Glu Ile Ala Asn Glu Ala Val Val Glu

100 105 110

Met Ala Leu Glu Ala Ser Leu Gly Cys Ile Lys Glu Trp Gly Arg Pro

115 120 125

Val Glu Asp Ile Thr His Ile Val Tyr Val Ser Ser Ser Glu Ile Arg

130 135 140

Leu Pro Gly Gly Asp Leu Tyr Leu Ser Ala Lys Leu Gly Leu Arg Asn

145 150 155 160

Asp Val Asn Arg Val Met Leu Tyr Phe Leu Gly Cys Tyr Gly Gly Val

165 170 175

Thr Gly Leu Arg Val Ala Lys Asp Ile Ala Glu Asn Asn Pro Gly Ser

180 185 190

Arg Val Leu Leu Thr Thr Ser Glu Thr Thr Ile Leu Gly Phe Arg Pro

195 200 205

Pro Asn Lys Ala Arg Pro Tyr Asp Leu Val Gly Ala Ala Leu Phe Gly

210 215 220

Asp Gly Ala Ala Ala Val Ile Ile Gly Ala Asp Pro Arg Glu Cys Glu

225 230 235 240

Ala Pro Phe Met Glu Leu His Tyr Ala Val Gln Gln Phe Leu Pro Gly

245 250 255

Thr Gln Asn Val Ile Glu Gly Arg Leu Thr Glu Glu Gly Ile Asn Phe

260 265 270

Lys Leu Gly Arg Asp Leu Pro Gln Lys Ile Glu Glu Asn Ile Glu Glu

275 280 285

Phe Cys Lys Lys Leu Met Gly Lys Ala Gly Asp Glu Ser Met Glu Phe

290 295 300

Asn Asp Met Phe Trp Ala Val His Pro Gly Gly Pro Ala Ile Leu Asn

305 310 315 320

Arg Leu Glu Thr Lys Leu Lys Leu Glu Lys Glu Lys Leu Glu Ser Ser

325 330 335

Arg Arg Ala Leu Val Asp Tyr Gly Asn Val Ser Ser Asn Thr Ile Leu

340 345 350

Tyr Val Met Glu Tyr Met Arg Asp Glu Leu Lys Lys Lys Gly Asp Ala

355 360 365

Ala Gln Glu Trp Gly Leu Gly Leu Ala Phe Gly Pro Gly Ile Thr Phe

370 375 380

Glu Gly Leu Leu Ile Arg Ser Leu Thr Ser Ser

385 390 395

<210> 124

<211> 1197

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Hydrangea macrophylla,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 124

atggctacta agtctgttgc tgttgaagaa atgtgtaagg ctcaaaaggc tggaggacca 60

gctactattc ttgctattgg aactgctgtt ccatctaatt gttattatca atctgaatat 120

ccagattttt attttagagt tactaagtct gatcatctta ctgatcttaa gtctaagttt 180

aagagaatgt gtgaaagatc ttctattaag aagagatata tgcatcttac tgaagaaatt 240

cttgaagaaa atccaaatat gtgtactttt gctgctccat ctattgatgg aagacaagat 300

attgttgtta aggaaattcc aaagcttgct aaggaagctg cttctaaggc tattaaggaa 360

tggggacaac caaagtctaa tattactcat cttgtttttt gtactacttc tggagttgat 420

atgccaggat gtgattatca acttactaga cttcttggac ttagaccatc tattaagaga 480

cttatgatgt atcaacaagg atgtcatgct ggaggaactg gacttagact tgctaaggat 540

cttgctgaaa ataataaggg agctagagtt cttgttgttt gttctgaaat gactgttatt 600

aattttagag gaccatctga agctcatatg gattctcttg ttggacaatc tctttttgga 660

gatggagctt ctgctgttat tgttggatct gatccagatc tttctactga acatccactt 720

tatcaaatta tgtctgcttc tcaaattatt gttgctgatt ctgaaggagc tattgatgga 780

catcttagac aagaaggact tacttttcat cttagaaagg atgttccatc tcttgtttct 840

gataatattg aaaatactct tgttgaagct tttactccaa ttcttatgga ttctattgat 900

tctattattg attggaattc tattttttgg attgctcatc caggaggacc agctattctt 960

aatcaagttc aagctaaggt tggacttaag gaagaaaagc ttagagtttc tagacatatt 1020

ctttctgaat atggaaatat gtcttctgct tgtgtttttt ttattatgga tgaaatgaga 1080

aagagatcta tggaagaagg aaagggaact actggagaag gacttgaatg gggagttctt 1140

tttggatttg gaccaggatt tactgttgaa actattgttc ttcattctgt tccaatt 1197

<210> 125

<211> 399

<212> PRT

<213> Hydrangea macrophylla

<400> 125

Met Ala Thr Lys Ser Val Ala Val Glu Glu Met Cys Lys Ala Gln Lys

1 5 10 15

Ala Gly Gly Pro Ala Thr Ile Leu Ala Ile Gly Thr Ala Val Pro Ser

20 25 30

Asn Cys Tyr Tyr Gln Ser Glu Tyr Pro Asp Phe Tyr Phe Arg Val Thr

35 40 45

Lys Ser Asp His Leu Thr Asp Leu Lys Ser Lys Phe Lys Arg Met Cys

50 55 60

Glu Arg Ser Ser Ile Lys Lys Arg Tyr Met His Leu Thr Glu Glu Ile

65 70 75 80

Leu Glu Glu Asn Pro Asn Met Cys Thr Phe Ala Ala Pro Ser Ile Asp

85 90 95

Gly Arg Gln Asp Ile Val Val Lys Glu Ile Pro Lys Leu Ala Lys Glu

100 105 110

Ala Ala Ser Lys Ala Ile Lys Glu Trp Gly Gln Pro Lys Ser Asn Ile

115 120 125

Thr His Leu Val Phe Cys Thr Thr Ser Gly Val Asp Met Pro Gly Cys

130 135 140

Asp Tyr Gln Leu Thr Arg Leu Leu Gly Leu Arg Pro Ser Ile Lys Arg

145 150 155 160

Leu Met Met Tyr Gln Gln Gly Cys His Ala Gly Gly Thr Gly Leu Arg

165 170 175

Leu Ala Lys Asp Leu Ala Glu Asn Asn Lys Gly Ala Arg Val Leu Val

180 185 190

Val Cys Ser Glu Met Thr Val Ile Asn Phe Arg Gly Pro Ser Glu Ala

195 200 205

His Met Asp Ser Leu Val Gly Gln Ser Leu Phe Gly Asp Gly Ala Ser

210 215 220

Ala Val Ile Val Gly Ser Asp Pro Asp Leu Ser Thr Glu His Pro Leu

225 230 235 240

Tyr Gln Ile Met Ser Ala Ser Gln Ile Ile Val Ala Asp Ser Glu Gly

245 250 255

Ala Ile Asp Gly His Leu Arg Gln Glu Gly Leu Thr Phe His Leu Arg

260 265 270

Lys Asp Val Pro Ser Leu Val Ser Asp Asn Ile Glu Asn Thr Leu Val

275 280 285

Glu Ala Phe Thr Pro Ile Leu Met Asp Ser Ile Asp Ser Ile Ile Asp

290 295 300

Trp Asn Ser Ile Phe Trp Ile Ala His Pro Gly Gly Pro Ala Ile Leu

305 310 315 320

Asn Gln Val Gln Ala Lys Val Gly Leu Lys Glu Glu Lys Leu Arg Val

325 330 335

Ser Arg His Ile Leu Ser Glu Tyr Gly Asn Met Ser Ser Ala Cys Val

340 345 350

Phe Phe Ile Met Asp Glu Met Arg Lys Arg Ser Met Glu Glu Gly Lys

355 360 365

Gly Thr Thr Gly Glu Gly Leu Glu Trp Gly Val Leu Phe Gly Phe Gly

370 375 380

Pro Gly Phe Thr Val Glu Thr Ile Val Leu His Ser Val Pro Ile

385 390 395

<210> 126

<211> 1254

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Physcomitrella patens,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 126

atggcttcta gaagagttga agctgctttt gatggacaag ctgttgaact tggagctact 60

attccagctg ctaatggaaa tggaactcat caatctatta aggttccagg acatagacaa 120

gttactccag gaaagactac tattatggct attggaagag ctgttccagc taatactact 180

tttaatgatg gacttgctga tcattatatt caagaattta atcttcaaga tccagttctt 240

caagctaagc ttagaagact ttgtgaaact actactgtta agactagata tcttgttgtt 300

aataaggaaa ttcttgatga acatccagaa tttcttgttg atggagctgc tactgtttct 360

caaagacttg ctattactgg agaagctgtt actcaacttg gacatgaagc tgctactgct 420

gctattaagg aatggggaag accagcttct gaaattactc atcttgttta tgtttcttct 480

tctgaaatta gacttccagg aggagatctt tatcttgctc aacttcttgg acttagatct 540

gatgttaata gagttatgct ttatatgctt ggatgttatg gaggagcttc tggaattaga 600

gttgctaagg atcttgctga aaataatcca ggatctagag ttcttcttat tacttctgaa 660

tgtactctta ttggatataa gtctctttct ccagatagac catatgatct tgttggagct 720

gctctttttg gagatggagc tgctgctatg attatgggaa aggatccaat tccagttctt 780

gaaagagctt tttttgaact tgattgggct ggacaatctt ttattccagg aactaataag 840

actattgatg gaagactttc tgaagaagga atttctttta agcttggaag agaacttcca 900

aagcttattg aatctaatat tcaaggattt tgtgatccaa ttcttaagag agctggagga 960

cttaagtata atgatatttt ttgggctgtt catccaggag gaccagctat tcttaatgct 1020

gttcaaaagc aacttgatct tgctccagaa aagcttcaaa ctgctagaca agttcttaga 1080

gattatggaa atatttcttc ttctacttgt atttatgttc ttgattatat gagacatcaa 1140

tctcttaagc ttaaggaagc taatgataat gttaatactg aaccagaatg gggacttctt 1200

cttgcttttg gaccaggagt tactattgaa ggagctcttc ttagaaatct ttgt 1254

<210> 127

<211> 397

<212> PRT

<213> Physcomitrella patens

<400> 127

Met Ser Lys Thr Val Glu Asp Arg Ala Ala Gln Arg Ala Lys Gly Pro

1 5 10 15

Ala Thr Val Leu Ala Ile Gly Thr Ala Thr Pro Ala Asn Val Val Tyr

20 25 30

Gln Thr Asp Tyr Pro Asp Tyr Tyr Phe Arg Val Thr Lys Ser Glu His

35 40 45

Met Thr Lys Leu Lys Asn Lys Phe Gln Arg Met Cys Asp Arg Ser Thr

50 55 60

Ile Lys Lys Arg Tyr Met Val Leu Thr Glu Glu Leu Leu Glu Lys Asn

65 70 75 80

Leu Ser Leu Cys Thr Tyr Met Glu Pro Ser Leu Asp Ala Arg Gln Asp

85 90 95

Ile Leu Val Pro Glu Val Pro Lys Leu Gly Lys Glu Ala Ala Asp Glu

100 105 110

Ala Ile Ala Glu Trp Gly Arg Pro Lys Ser Glu Ile Thr His Leu Ile

115 120 125

Phe Cys Thr Thr Cys Gly Val Asp Met Pro Gly Ala Asp Tyr Gln Leu

130 135 140

Thr Lys Leu Leu Gly Leu Arg Ser Ser Val Arg Arg Thr Met Leu Tyr

145 150 155 160

Gln Gln Gly Cys Phe Gly Gly Gly Thr Val Leu Arg Leu Ala Lys Asp

165 170 175

Leu Ala Glu Asn Asn Ala Gly Ala Arg Val Leu Val Val Cys Ser Glu

180 185 190

Ile Thr Thr Ala Val Asn Phe Arg Gly Pro Ser Asp Thr His Leu Asp

195 200 205

Leu Leu Val Gly Leu Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ala Ala Ala Val Ile

210 215 220

Val Gly Ala Asp Pro Asp Pro Thr Leu Glu Arg Pro Leu Phe Gln Ile

225 230 235 240

Val Ser Gly Ala Gln Thr Ile Leu Pro Asp Ser Glu Gly Ala Ile Asn

245 250 255

Gly His Leu Arg Glu Val Gly Leu Thr Ile Arg Leu Leu Lys Asp Val

260 265 270

Pro Gly Leu Val Ser Met Asn Ile Glu Lys Cys Leu Met Glu Ala Phe

275 280 285

Ala Pro Met Gly Ile His Asp Trp Asn Ser Ile Phe Trp Ile Ala His

290 295 300

Pro Gly Gly Pro Thr Ile Leu Asp Gln Val Glu Ala Lys Leu Gly Leu

305 310 315 320

Lys Glu Glu Lys Leu Lys Ser Thr Arg Ala Val Leu Arg Glu Tyr Gly

325 330 335

Asn Met Ser Ser Ala Cys Val Leu Phe Ile Leu Asp Glu Val Arg Lys

340 345 350

Arg Ser Met Glu Glu Gly Lys Thr Thr Thr Gly Glu Gly Phe Asp Trp

355 360 365

Gly Val Leu Phe Gly Phe Gly Pro Gly Phe Thr Val Glu Thr Val Val

370 375 380

Leu His Ser Met Pro Ile Pro Lys Ala Asp Glu Gly Arg

385 390 395

<210> 128

<211> 1179

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Polygonum cuspidatum,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 128

atggctccag ctgttgctga tattagaaag gctcaaagag ctgaaggacc agctactgtt 60

cttgctattg gaactgctac tccaccaaat tgtgtttatc aaaaggatta tccagattat 120

tattttagag ttactaattc tgatcatatg actgatctta aggaaaagtt tagaagaatg 180

tgtgaaaagt ctaatattga aaagagatat atgtatctta ctgaagaaat tcttaaggaa 240

aatccaaata tgtgttctta tatgcaaact tcttctcttg atactagaca agatatggtt 300

gtttctgaag ttccaagact tggaaaggaa gctgctcaaa aggctattaa ggaatgggga 360

caaccaaagt ctaagattac tcatgttatt atgtgtacta cttctggagt tgatatgcca 420

ggagctgatt atcaacttac taagcttctt ggacttcatc catctgttaa gagatttatg 480

atgtatcaac aaggatgttt tgctggagga actgttctta gacttgctaa ggatcttgct 540

gaaaataata gaggagctag agttcttgtt gtttgttctg aaattactgc tatttgtttt 600

agaggaccaa ctgatactca tccagattct atggttggac aagctctttt tggagatgga 660

tctggagctg ttattattgg agctgatcca gatctttcta ttgaaaagcc aatttttgaa 720

cttgtttgga ctgctcaaac tattcttcca gattctgaag gagctattga tggacatctt 780

agagaagttg gacttacttt tcatcttctt aaggatgttc caggacttat ttctaagaat 840

attgaaaaga atcttactga agctttttct ccacttaatg tttctgattg gaattctctt 900

ttttggattg ctcatccagg aggaccagct attcttgatc aagttgaaac taagcttgga 960

cttaaggaag aaaagcttaa ggctactaga caagttctta atgattatgg aaatatgtct 1020

tctgcttgtg ttctttttat tatggatgaa atgagaaaga agtctgttga aaatggacat 1080

gctactactg gagaaggact tgaatgggga gttctttttg gatttggacc aggacttact 1140

gttgaaactg ttgttcttca ttctgttcca gttgctaat 1179

<210> 129

<211> 393

<212> PRT

<213> Polygonum cuspidatum

<400> 129

Met Ala Pro Ala Val Ala Asp Ile Arg Lys Ala Gln Arg Ala Glu Gly

1 5 10 15

Pro Ala Thr Val Leu Ala Ile Gly Thr Ala Thr Pro Pro Asn Cys Val

20 25 30

Tyr Gln Lys Asp Tyr Pro Asp Tyr Tyr Phe Arg Val Thr Asn Ser Asp

35 40 45

His Met Thr Asp Leu Lys Glu Lys Phe Arg Arg Met Cys Glu Lys Ser

50 55 60

Asn Ile Glu Lys Arg Tyr Met Tyr Leu Thr Glu Glu Ile Leu Lys Glu

65 70 75 80

Asn Pro Asn Met Cys Ser Tyr Met Gln Thr Ser Ser Leu Asp Thr Arg

85 90 95

Gln Asp Met Val Val Ser Glu Val Pro Arg Leu Gly Lys Glu Ala Ala

100 105 110

Gln Lys Ala Ile Lys Glu Trp Gly Gln Pro Lys Ser Lys Ile Thr His

115 120 125

Val Ile Met Cys Thr Thr Ser Gly Val Asp Met Pro Gly Ala Asp Tyr

130 135 140

Gln Leu Thr Lys Leu Leu Gly Leu His Pro Ser Val Lys Arg Phe Met

145 150 155 160

Met Tyr Gln Gln Gly Cys Phe Ala Gly Gly Thr Val Leu Arg Leu Ala

165 170 175

Lys Asp Leu Ala Glu Asn Asn Arg Gly Ala Arg Val Leu Val Val Cys

180 185 190

Ser Glu Ile Thr Ala Ile Cys Phe Arg Gly Pro Thr Asp Thr His Pro

195 200 205

Asp Ser Met Val Gly Gln Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ser Gly Ala Val

210 215 220

Ile Ile Gly Ala Asp Pro Asp Leu Ser Ile Glu Lys Pro Ile Phe Glu

225 230 235 240

Leu Val Trp Thr Ala Gln Thr Ile Leu Pro Asp Ser Glu Gly Ala Ile

245 250 255

Asp Gly His Leu Arg Glu Val Gly Leu Thr Phe His Leu Leu Lys Asp

260 265 270

Val Pro Gly Leu Ile Ser Lys Asn Ile Glu Lys Asn Leu Thr Glu Ala

275 280 285

Phe Ser Pro Leu Asn Val Ser Asp Trp Asn Ser Leu Phe Trp Ile Ala

290 295 300

His Pro Gly Gly Pro Ala Ile Leu Asp Gln Val Glu Thr Lys Leu Gly

305 310 315 320

Leu Lys Glu Glu Lys Leu Lys Ala Thr Arg Gln Val Leu Asn Asp Tyr

325 330 335

Gly Asn Met Ser Ser Ala Cys Val Leu Phe Ile Met Asp Glu Met Arg

340 345 350

Lys Lys Ser Val Glu Asn Gly His Ala Thr Thr Gly Glu Gly Leu Glu

355 360 365

Trp Gly Val Leu Phe Gly Phe Gly Pro Gly Leu Thr Val Glu Thr Val

370 375 380

Val Leu His Ser Val Pro Val Ala Asn

385 390

<210> 130

<211> 1152

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность мутанта L132S PKS из Rheum

palmatum, оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 130

atggctactg aagaaatgaa gaagcttgct actgttatgg ctattggaac tgctaatcca 60

ccaaattgtt attatcaagc tgattttcca gatttttatt ttagagttac taattctgat 120

catcttatta atcttaagca aaagtttaag agactttgtg aaaattctag aattgaaaag 180

agatatcttc atgttactga agaaattctt aaggaaaatc caaatattgc tgcttatgaa 240

gctacttctc ttaatgttag acataagatg caagttaagg gagttgctga acttggaaag 300

gaagctgctc ttaaggctat taaggaatgg ggacaaccaa agtctaagat tactcatctt 360

attgtttgtt gttctgctgg agttgatatg ccaggagctg attatcaact tactaagctt 420

cttgatcttg atccatctgt taagagattt atgttttatc atcttggatg ttatgctgga 480

ggaactgttc ttagacttgc taaggatatt gctgaaaata ataagggagc tagagttctt 540

attgtttgtt ctgaaatgac tactacttgt tttagaggac catctgaaac tcatcttgat 600

tctatgattg gacaagctat tcttggagat ggagctgctg ctgttattgt tggagctgat 660

ccagatctta ctgttgaaag accaattttt gaacttgttt ctactgctca aactattgtt 720

ccagaatctc atggagctat tgaaggacat cttcttgaat ctggactttc ttttcatctt 780

tataagactg ttccaactct tatttctaat aatattaaga cttgtctttc tgatgctttt 840

actccactta atatttctga ttggaattct cttttttgga ttgctcatcc aggaggacca 900

gctattcttg atcaagttac tgctaaggtt ggacttgaaa aggaaaagct taaggttact 960

agacaagttc ttaaggatta tggaaatatg tcttctgcta ctgttttttt tattatggat 1020

gaaatgagaa agaagtctct tgaaaatgga caagctacta ctggagaagg acttgaatgg 1080

ggagttcttt ttggatttgg accaggaatt actgttgaaa ctgttgttct tagatctgtt 1140

ccagttattt ct 1152

<210> 131

<211> 384

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Аминокислотная последовательность мутанта L132S PKS из Rheum

palmatum, оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 131

Met Ala Thr Glu Glu Met Lys Lys Leu Ala Thr Val Met Ala Ile Gly

1 5 10 15

Thr Ala Asn Pro Pro Asn Cys Tyr Tyr Gln Ala Asp Phe Pro Asp Phe

20 25 30

Tyr Phe Arg Val Thr Asn Ser Asp His Leu Ile Asn Leu Lys Gln Lys

35 40 45

Phe Lys Arg Leu Cys Glu Asn Ser Arg Ile Glu Lys Arg Tyr Leu His

50 55 60

Val Thr Glu Glu Ile Leu Lys Glu Asn Pro Asn Ile Ala Ala Tyr Glu

65 70 75 80

Ala Thr Ser Leu Asn Val Arg His Lys Met Gln Val Lys Gly Val Ala

85 90 95

Glu Leu Gly Lys Glu Ala Ala Leu Lys Ala Ile Lys Glu Trp Gly Gln

100 105 110

Pro Lys Ser Lys Ile Thr His Leu Ile Val Cys Cys Ser Ala Gly Val

115 120 125

Asp Met Pro Gly Ala Asp Tyr Gln Leu Thr Lys Leu Leu Asp Leu Asp

130 135 140

Pro Ser Val Lys Arg Phe Met Phe Tyr His Leu Gly Cys Tyr Ala Gly

145 150 155 160

Gly Thr Val Leu Arg Leu Ala Lys Asp Ile Ala Glu Asn Asn Lys Gly

165 170 175

Ala Arg Val Leu Ile Val Cys Ser Glu Met Thr Thr Thr Cys Phe Arg

180 185 190

Gly Pro Ser Glu Thr His Leu Asp Ser Met Ile Gly Gln Ala Ile Leu

195 200 205

Gly Asp Gly Ala Ala Ala Val Ile Val Gly Ala Asp Pro Asp Leu Thr

210 215 220

Val Glu Arg Pro Ile Phe Glu Leu Val Ser Thr Ala Gln Thr Ile Val

225 230 235 240

Pro Glu Ser His Gly Ala Ile Glu Gly His Leu Leu Glu Ser Gly Leu

245 250 255

Ser Phe His Leu Tyr Lys Thr Val Pro Thr Leu Ile Ser Asn Asn Ile

260 265 270

Lys Thr Cys Leu Ser Asp Ala Phe Thr Pro Leu Asn Ile Ser Asp Trp

275 280 285

Asn Ser Leu Phe Trp Ile Ala His Pro Gly Gly Pro Ala Ile Leu Asp

290 295 300

Gln Val Thr Ala Lys Val Gly Leu Glu Lys Glu Lys Leu Lys Val Thr

305 310 315 320

Arg Gln Val Leu Lys Asp Tyr Gly Asn Met Ser Ser Ala Thr Val Phe

325 330 335

Phe Ile Met Asp Glu Met Arg Lys Lys Ser Leu Glu Asn Gly Gln Ala

340 345 350

Thr Thr Gly Glu Gly Leu Glu Trp Gly Val Leu Phe Gly Phe Gly Pro

355 360 365

Gly Ile Thr Val Glu Thr Val Val Leu Arg Ser Val Pro Val Ile Ser

370 375 380

<210> 132

<211> 1173

<212> PRT

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Rheum tataricum,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 132

Ala Thr Gly Gly Cys Thr Cys Cys Ala Gly Ala Ala Gly Ala Ala Thr

1 5 10 15

Cys Thr Ala Gly Ala Cys Ala Thr Gly Cys Thr Gly Ala Ala Ala Cys

20 25 30

Thr Gly Cys Thr Gly Thr Thr Ala Ala Thr Ala Gly Ala Gly Cys Thr

35 40 45

Gly Cys Thr Ala Cys Thr Gly Thr Thr Cys Thr Thr Gly Cys Thr Ala

50 55 60

Thr Thr Gly Gly Ala Ala Cys Thr Gly Cys Thr Ala Ala Thr Cys Cys

65 70 75 80

Ala Cys Cys Ala Ala Ala Thr Thr Gly Thr Thr Ala Thr Thr Ala Thr

85 90 95

Cys Ala Ala Gly Cys Thr Gly Ala Thr Thr Thr Thr Cys Cys Ala Gly

100 105 110

Ala Thr Thr Thr Thr Thr Ala Thr Thr Thr Thr Ala Gly Ala Gly Cys

115 120 125

Thr Ala Cys Thr Ala Ala Thr Thr Cys Thr Gly Ala Thr Cys Ala Thr

130 135 140

Cys Thr Thr Ala Cys Thr Cys Ala Thr Cys Thr Thr Ala Ala Gly Cys

145 150 155 160

Ala Ala Ala Ala Gly Thr Thr Thr Ala Ala Gly Ala Gly Ala Ala Thr

165 170 175

Thr Thr Gly Thr Gly Ala Ala Ala Ala Gly Thr Cys Thr Ala Thr Gly

180 185 190

Ala Thr Thr Gly Ala Ala Ala Ala Gly Ala Gly Ala Thr Ala Thr Cys

195 200 205

Thr Thr Cys Ala Thr Cys Thr Thr Ala Cys Thr Gly Ala Ala Gly Ala

210 215 220

Ala Ala Thr Thr Cys Thr Thr Ala Ala Gly Gly Ala Ala Ala Ala Thr

225 230 235 240

Cys Cys Ala Ala Ala Thr Ala Thr Thr Gly Cys Thr Thr Cys Thr Thr

245 250 255

Thr Thr Gly Ala Ala Gly Cys Thr Cys Cys Ala Thr Cys Thr Cys Thr

260 265 270

Thr Gly Ala Thr Gly Thr Thr Ala Gly Ala Cys Ala Thr Ala Ala Thr

275 280 285

Ala Thr Thr Cys Ala Ala Gly Thr Thr Ala Ala Gly Gly Ala Ala Gly

290 295 300

Thr Thr Gly Thr Thr Cys Thr Thr Cys Thr Thr Gly Gly Ala Ala Ala

305 310 315 320

Gly Gly Ala Ala Gly Cys Thr Gly Cys Thr Cys Thr Thr Ala Ala Gly

325 330 335

Gly Cys Thr Ala Thr Thr Ala Ala Thr Gly Ala Ala Thr Gly Gly Gly

340 345 350

Gly Ala Cys Ala Ala Cys Cys Ala Ala Ala Gly Thr Cys Thr Ala Ala

355 360 365

Gly Ala Thr Thr Ala Cys Thr Ala Gly Ala Cys Thr Thr Ala Thr Thr

370 375 380

Gly Thr Thr Thr Gly Thr Thr Gly Thr Ala Thr Thr Gly Cys Thr Gly

385 390 395 400

Gly Ala Gly Thr Thr Gly Ala Thr Ala Thr Gly Cys Cys Ala Gly Gly

405 410 415

Ala Gly Cys Thr Gly Ala Thr Thr Ala Thr Cys Ala Ala Cys Thr Thr

420 425 430

Ala Cys Thr Ala Ala Gly Cys Thr Thr Cys Thr Thr Gly Gly Ala Cys

435 440 445

Thr Thr Cys Ala Ala Cys Thr Thr Thr Cys Thr Gly Thr Thr Ala Ala

450 455 460

Gly Ala Gly Ala Thr Thr Thr Ala Thr Gly Thr Thr Thr Thr Ala Thr

465 470 475 480

Cys Ala Thr Cys Thr Thr Gly Gly Ala Thr Gly Thr Thr Ala Thr Gly

485 490 495

Cys Thr Gly Gly Ala Gly Gly Ala Ala Cys Thr Gly Thr Thr Cys Thr

500 505 510

Thr Ala Gly Ala Cys Thr Thr Gly Cys Thr Ala Ala Gly Gly Ala Thr

515 520 525

Ala Thr Thr Gly Cys Thr Gly Ala Ala Ala Ala Thr Ala Ala Thr Ala

530 535 540

Ala Gly Gly Ala Ala Gly Cys Thr Ala Gly Ala Gly Thr Thr Cys Thr

545 550 555 560

Thr Ala Thr Thr Gly Thr Thr Ala Gly Ala Thr Cys Thr Gly Ala Ala

565 570 575

Ala Thr Gly Ala Cys Thr Cys Cys Ala Ala Thr Thr Thr Gly Thr Thr

580 585 590

Thr Thr Ala Gly Ala Gly Gly Ala Cys Cys Ala Thr Cys Thr Gly Ala

595 600 605

Ala Ala Cys Thr Cys Ala Thr Ala Thr Thr Gly Ala Thr Thr Cys Thr

610 615 620

Ala Thr Gly Gly Thr Thr Gly Gly Ala Cys Ala Ala Gly Cys Thr Ala

625 630 635 640

Thr Thr Thr Thr Thr Gly Gly Ala Gly Ala Thr Gly Gly Ala Gly Cys

645 650 655

Thr Gly Cys Thr Gly Cys Thr Gly Thr Thr Ala Thr Thr Gly Thr Thr

660 665 670

Gly Gly Ala Gly Cys Thr Ala Ala Thr Cys Cys Ala Gly Ala Thr Cys

675 680 685

Thr Thr Thr Cys Thr Ala Thr Thr Gly Ala Ala Ala Gly Ala Cys Cys

690 695 700

Ala Ala Thr Thr Thr Thr Thr Gly Ala Ala Cys Thr Thr Ala Thr Thr

705 710 715 720

Thr Cys Thr Ala Cys Thr Thr Cys Thr Cys Ala Ala Ala Cys Thr Ala

725 730 735

Thr Thr Ala Thr Thr Cys Cys Ala Gly Ala Ala Thr Cys Thr Gly Ala

740 745 750

Thr Gly Gly Ala Gly Cys Thr Ala Thr Thr Gly Ala Ala Gly Gly Ala

755 760 765

Cys Ala Thr Cys Thr Thr Cys Thr Thr Gly Ala Ala Gly Thr Thr Gly

770 775 780

Gly Ala Cys Thr Thr Thr Cys Thr Thr Thr Thr Cys Ala Ala Cys Thr

785 790 795 800

Thr Thr Ala Thr Cys Ala Ala Ala Cys Thr Gly Thr Thr Cys Cys Ala

805 810 815

Thr Cys Thr Cys Thr Thr Ala Thr Thr Thr Cys Thr Ala Ala Thr Thr

820 825 830

Gly Thr Ala Thr Thr Gly Ala Ala Ala Cys Thr Thr Gly Thr Cys Thr

835 840 845

Thr Thr Cys Thr Ala Ala Gly Gly Cys Thr Thr Thr Thr Ala Cys Thr

850 855 860

Cys Cys Ala Cys Thr Thr Ala Ala Thr Ala Thr Thr Thr Cys Thr Gly

865 870 875 880

Ala Thr Thr Gly Gly Ala Ala Thr Thr Cys Thr Cys Thr Thr Thr Thr

885 890 895

Thr Thr Gly Gly Ala Thr Thr Gly Cys Thr Cys Ala Thr Cys Cys Ala

900 905 910

Gly Gly Ala Gly Gly Ala Ala Gly Ala Gly Cys Thr Ala Thr Thr Cys

915 920 925

Thr Thr Gly Ala Thr Gly Ala Thr Ala Thr Thr Gly Ala Ala Gly Cys

930 935 940

Thr Ala Cys Thr Gly Thr Thr Gly Gly Ala Cys Thr Thr Ala Ala Gly

945 950 955 960

Ala Ala Gly Gly Ala Ala Ala Ala Gly Cys Thr Thr Ala Ala Gly Gly

965 970 975

Cys Thr Ala Cys Thr Ala Gly Ala Cys Ala Ala Gly Thr Thr Cys Thr

980 985 990

Thr Ala Ala Thr Gly Ala Thr Thr Ala Thr Gly Gly Ala Ala Ala Thr

995 1000 1005

Ala Thr Gly Thr Cys Thr Thr Cys Thr Gly Cys Thr Thr Gly Thr

1010 1015 1020

Gly Thr Thr Thr Thr Thr Thr Thr Thr Ala Thr Thr Ala Thr Gly

1025 1030 1035

Gly Ala Thr Gly Ala Ala Ala Thr Gly Ala Gly Ala Ala Ala Gly

1040 1045 1050

Ala Ala Gly Thr Cys Thr Cys Thr Thr Gly Cys Thr Ala Ala Thr

1055 1060 1065

Gly Gly Ala Cys Ala Ala Gly Thr Thr Ala Cys Thr Ala Cys Thr

1070 1075 1080

Gly Gly Ala Gly Ala Ala Gly Gly Ala Cys Thr Thr Ala Ala Gly

1085 1090 1095

Thr Gly Gly Gly Gly Ala Gly Thr Thr Cys Thr Thr Thr Thr Thr

1100 1105 1110

Gly Gly Ala Thr Thr Thr Gly Gly Ala Cys Cys Ala Gly Gly Ala

1115 1120 1125

Gly Thr Thr Ala Cys Thr Gly Thr Thr Gly Ala Ala Ala Cys Thr

1130 1135 1140

Gly Thr Thr Gly Thr Thr Cys Thr Thr Thr Cys Thr Thr Cys Thr

1145 1150 1155

Gly Thr Thr Cys Cys Ala Cys Thr Thr Ala Thr Thr Ala Cys Thr

1160 1165 1170

<210> 133

<211> 391

<212> PRT

<213> Rheum tataricum

<400> 133

Met Ala Pro Glu Glu Ser Arg His Ala Glu Thr Ala Val Asn Arg Ala

1 5 10 15

Ala Thr Val Leu Ala Ile Gly Thr Ala Asn Pro Pro Asn Cys Tyr Tyr

20 25 30

Gln Ala Asp Phe Pro Asp Phe Tyr Phe Arg Ala Thr Asn Ser Asp His

35 40 45

Leu Thr His Leu Lys Gln Lys Phe Lys Arg Ile Cys Glu Lys Ser Met

50 55 60

Ile Glu Lys Arg Tyr Leu His Leu Thr Glu Glu Ile Leu Lys Glu Asn

65 70 75 80

Pro Asn Ile Ala Ser Phe Glu Ala Pro Ser Leu Asp Val Arg His Asn

85 90 95

Ile Gln Val Lys Glu Val Val Leu Leu Gly Lys Glu Ala Ala Leu Lys

100 105 110

Ala Ile Asn Glu Trp Gly Gln Pro Lys Ser Lys Ile Thr Arg Leu Ile

115 120 125

Val Cys Cys Ile Ala Gly Val Asp Met Pro Gly Ala Asp Tyr Gln Leu

130 135 140

Thr Lys Leu Leu Gly Leu Gln Leu Ser Val Lys Arg Phe Met Phe Tyr

145 150 155 160

His Leu Gly Cys Tyr Ala Gly Gly Thr Val Leu Arg Leu Ala Lys Asp

165 170 175

Ile Ala Glu Asn Asn Lys Glu Ala Arg Val Leu Ile Val Arg Ser Glu

180 185 190

Met Thr Pro Ile Cys Phe Arg Gly Pro Ser Glu Thr His Ile Asp Ser

195 200 205

Met Val Gly Gln Ala Ile Phe Gly Asp Gly Ala Ala Ala Val Ile Val

210 215 220

Gly Ala Asn Pro Asp Leu Ser Ile Glu Arg Pro Ile Phe Glu Leu Ile

225 230 235 240

Ser Thr Ser Gln Thr Ile Ile Pro Glu Ser Asp Gly Ala Ile Glu Gly

245 250 255

His Leu Leu Glu Val Gly Leu Ser Phe Gln Leu Tyr Gln Thr Val Pro

260 265 270

Ser Leu Ile Ser Asn Cys Ile Glu Thr Cys Leu Ser Lys Ala Phe Thr

275 280 285

Pro Leu Asn Ile Ser Asp Trp Asn Ser Leu Phe Trp Ile Ala His Pro

290 295 300

Gly Gly Arg Ala Ile Leu Asp Asp Ile Glu Ala Thr Val Gly Leu Lys

305 310 315 320

Lys Glu Lys Leu Lys Ala Thr Arg Gln Val Leu Asn Asp Tyr Gly Asn

325 330 335

Met Ser Ser Ala Cys Val Phe Phe Ile Met Asp Glu Met Arg Lys Lys

340 345 350

Ser Leu Ala Asn Gly Gln Val Thr Thr Gly Glu Gly Leu Lys Trp Gly

355 360 365

Val Leu Phe Gly Phe Gly Pro Gly Val Thr Val Glu Thr Val Val Leu

370 375 380

Ser Ser Val Pro Leu Ile Thr

385 390

<210> 134

<211> 1182

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS из Wachendorfia thyrsiflora,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 134

atggcttcta ctgaaggaat tcaagcttat agaaataata tggctgaagg accagctact 60

attatggcta ttggaactgc taatccacca aatgttgttg atgcttctac ttttccagat 120

tattattgga gagttactaa ttctgaacat ctttctccag aatatagagt taagcttaag 180

agaatttgtg aaagatcttc tattagaaag agacatcttg ttcttactga acaacttctt 240

aaggaaaatc caactcttac tacttatgtt gatgcttctt atgatgaaag acaatctatt 300

gttcttgatg ctgttccaaa gcttgcttgt gaagctgctg ctaaggctat taaggaatgg 360

ggaagaccaa agactgatat tactcatatg gttgtttgta ctggagctgg agttgatgtt 420

ccaggagttg attataagat gatgaatctt cttggacttc caccaactgt taatagagtt 480

atgctttata atgttggatg tcatgcttct ggaactgttc ttagaattgc taaggatctt 540

gctgaaaata ataagggagc tagagttctt gttgtttctt ctgaagtttc tgttatgttt 600

tttagaggac cagctgaagg agatgttgaa attcttcttg gacaagctct ttttggagat 660

ggatctgctg ctattattgt tggagctgat ccaattgaag gagttgaaaa gccaattttt 720

caaatttttt ctgcttctca aatgactctt ccagaaggag aacatcttgt tgctggacat 780

cttagagaac ttggacttac ttttcatctt aagccacaac ttccaaatac tgtttcttct 840

aatattcata agccacttaa gaaggctttt gaaccactta atattactga ttggaattct 900

attttttgga ttgttcatcc aggaggaaga gctattcttg atcaagttca agaaaagatt 960

ggacttgaag aaaataagct tgatgtttct agatatgttc ttgctgaaaa tggaaatatg 1020

atgtctgctt ctgttttttt tattatggat gaaatgagaa agagatctgc tgctcaagga 1080

tgttctacta ctggagaagg acatgaatgg ggagttcttt ttggatttgg accaggactt 1140

tctattgaaa ctgttgttct tcattctgtt ccactttcta tt 1182

<210> 135

<211> 394

<212> PRT

<213> Wachendorfia thyrsiflora

<400> 135

Met Ala Ser Thr Glu Gly Ile Gln Ala Tyr Arg Asn Asn Met Ala Glu

1 5 10 15

Gly Pro Ala Thr Ile Met Ala Ile Gly Thr Ala Asn Pro Pro Asn Val

20 25 30

Val Asp Ala Ser Thr Phe Pro Asp Tyr Tyr Trp Arg Val Thr Asn Ser

35 40 45

Glu His Leu Ser Pro Glu Tyr Arg Val Lys Leu Lys Arg Ile Cys Glu

50 55 60

Arg Ser Ser Ile Arg Lys Arg His Leu Val Leu Thr Glu Gln Leu Leu

65 70 75 80

Lys Glu Asn Pro Thr Leu Thr Thr Tyr Val Asp Ala Ser Tyr Asp Glu

85 90 95

Arg Gln Ser Ile Val Leu Asp Ala Val Pro Lys Leu Ala Cys Glu Ala

100 105 110

Ala Ala Lys Ala Ile Lys Glu Trp Gly Arg Pro Lys Thr Asp Ile Thr

115 120 125

His Met Val Val Cys Thr Gly Ala Gly Val Asp Val Pro Gly Val Asp

130 135 140

Tyr Lys Met Met Asn Leu Leu Gly Leu Pro Pro Thr Val Asn Arg Val

145 150 155 160

Met Leu Tyr Asn Val Gly Cys His Ala Ser Gly Thr Val Leu Arg Ile

165 170 175

Ala Lys Asp Leu Ala Glu Asn Asn Lys Gly Ala Arg Val Leu Val Val

180 185 190

Ser Ser Glu Val Ser Val Met Phe Phe Arg Gly Pro Ala Glu Gly Asp

195 200 205

Val Glu Ile Leu Leu Gly Gln Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ser Ala Ala

210 215 220

Ile Ile Val Gly Ala Asp Pro Ile Glu Gly Val Glu Lys Pro Ile Phe

225 230 235 240

Gln Ile Phe Ser Ala Ser Gln Met Thr Leu Pro Glu Gly Glu His Leu

245 250 255

Val Ala Gly His Leu Arg Glu Leu Gly Leu Thr Phe His Leu Lys Pro

260 265 270

Gln Leu Pro Asn Thr Val Ser Ser Asn Ile His Lys Pro Leu Lys Lys

275 280 285

Ala Phe Glu Pro Leu Asn Ile Thr Asp Trp Asn Ser Ile Phe Trp Ile

290 295 300

Val His Pro Gly Gly Arg Ala Ile Leu Asp Gln Val Gln Glu Lys Ile

305 310 315 320

Gly Leu Glu Glu Asn Lys Leu Asp Val Ser Arg Tyr Val Leu Ala Glu

325 330 335

Asn Gly Asn Met Met Ser Ala Ser Val Phe Phe Ile Met Asp Glu Met

340 345 350

Arg Lys Arg Ser Ala Ala Gln Gly Cys Ser Thr Thr Gly Glu Gly His

355 360 365

Glu Trp Gly Val Leu Phe Gly Phe Gly Pro Gly Leu Ser Ile Glu Thr

370 375 380

Val Val Leu His Ser Val Pro Leu Ser Ile

385 390

<210> 136

<211> 1191

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS1 из Piper methysticum,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 136

atgtctaaga ctgttgaaga tagagctgct caaagagcta agggaccagc tactgttctt 60

gctattggaa ctgctactcc agctaatgtt gtttatcaaa ctgattatcc agattattat 120

tttagagtta ctaagtctga acatatgact aagcttaaga ataagtttca aagaatgtgt 180

gatagatcta ctattaagaa gagatatatg gttcttactg aagaacttct tgaaaagaat 240

ctttctcttt gtacttatat ggaaccatct cttgatgcta gacaagatat tcttgttcca 300

gaagttccaa agcttggaaa ggaagctgct gatgaagcta ttgctgaatg gggaagacca 360

aagtctgaaa ttactcatct tattttttgt actacttgtg gagttgatat gccaggagct 420

gattatcaac ttactaagct tcttggactt agatcttctg ttagaagaac tatgctttat 480

caacaaggat gttttggagg aggaactgtt cttagacttg ctaaggatct tgctgaaaat 540

aatgctggag ctagagttct tgttgtttgt tctgaaatta ctactgctgt taattttaga 600

ggaccatctg atactcatct tgatcttctt gttggacttg ctctttttgg agatggagct 660

gctgctgtta ttgttggagc tgatccagat ccaactcttg aaagaccact ttttcaaatt 720

gtttctggag ctcaaactat tcttccagat tctgaaggag ctattaatgg acatcttaga 780

gaagttggac ttactattag acttcttaag gatgttccag gacttgtttc tatgaatatt 840

gaaaagtgtc ttatggaagc ttttgctcca atgggaattc atgattggaa ttctattttt 900

tggattgctc atccaggagg accaactatt cttgatcaag ttgaagctaa gcttggactt 960

aaggaagaaa agcttaagtc tactagagct gttcttagag aatatggaaa tatgtcttct 1020

gcttgtgttc tttttattct tgatgaagtt agaaagagat ctatggaaga aggaaagact 1080

actactggag aaggatttga ttggggagtt ctttttggat ttggaccagg atttactgtt 1140

gaaactgttg ttcttcattc tatgccaatt ccaaaggctg atgaaggaag a 1191

<210> 137

<211> 397

<212> PRT

<213> Piper methysticum

<400> 137

Met Ser Lys Thr Val Glu Asp Arg Ala Ala Gln Arg Ala Lys Gly Pro

1 5 10 15

Ala Thr Val Leu Ala Ile Gly Thr Ala Thr Pro Ala Asn Val Val Tyr

20 25 30

Gln Thr Asp Tyr Pro Asp Tyr Tyr Phe Arg Val Thr Lys Ser Glu His

35 40 45

Met Thr Lys Leu Lys Asn Lys Phe Gln Arg Met Cys Asp Arg Ser Thr

50 55 60

Ile Lys Lys Arg Tyr Met Val Leu Thr Glu Glu Leu Leu Glu Lys Asn

65 70 75 80

Leu Ser Leu Cys Thr Tyr Met Glu Pro Ser Leu Asp Ala Arg Gln Asp

85 90 95

Ile Leu Val Pro Glu Val Pro Lys Leu Gly Lys Glu Ala Ala Asp Glu

100 105 110

Ala Ile Ala Glu Trp Gly Arg Pro Lys Ser Glu Ile Thr His Leu Ile

115 120 125

Phe Cys Thr Thr Cys Gly Val Asp Met Pro Gly Ala Asp Tyr Gln Leu

130 135 140

Thr Lys Leu Leu Gly Leu Arg Ser Ser Val Arg Arg Thr Met Leu Tyr

145 150 155 160

Gln Gln Gly Cys Phe Gly Gly Gly Thr Val Leu Arg Leu Ala Lys Asp

165 170 175

Leu Ala Glu Asn Asn Ala Gly Ala Arg Val Leu Val Val Cys Ser Glu

180 185 190

Ile Thr Thr Ala Val Asn Phe Arg Gly Pro Ser Asp Thr His Leu Asp

195 200 205

Leu Leu Val Gly Leu Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ala Ala Ala Val Ile

210 215 220

Val Gly Ala Asp Pro Asp Pro Thr Leu Glu Arg Pro Leu Phe Gln Ile

225 230 235 240

Val Ser Gly Ala Gln Thr Ile Leu Pro Asp Ser Glu Gly Ala Ile Asn

245 250 255

Gly His Leu Arg Glu Val Gly Leu Thr Ile Arg Leu Leu Lys Asp Val

260 265 270

Pro Gly Leu Val Ser Met Asn Ile Glu Lys Cys Leu Met Glu Ala Phe

275 280 285

Ala Pro Met Gly Ile His Asp Trp Asn Ser Ile Phe Trp Ile Ala His

290 295 300

Pro Gly Gly Pro Thr Ile Leu Asp Gln Val Glu Ala Lys Leu Gly Leu

305 310 315 320

Lys Glu Glu Lys Leu Lys Ser Thr Arg Ala Val Leu Arg Glu Tyr Gly

325 330 335

Asn Met Ser Ser Ala Cys Val Leu Phe Ile Leu Asp Glu Val Arg Lys

340 345 350

Arg Ser Met Glu Glu Gly Lys Thr Thr Thr Gly Glu Gly Phe Asp Trp

355 360 365

Gly Val Leu Phe Gly Phe Gly Pro Gly Phe Thr Val Glu Thr Val Val

370 375 380

Leu His Ser Met Pro Ile Pro Lys Ala Asp Glu Gly Arg

385 390 395

<210> 138

<211> 1182

<212> DNA

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Нуклеотидная последовательность PKS2 из Piper methysticum,

оптимизированная для экпрессии в Nicotiana benthamiana

<400> 138

atgtctaaga tggttgaaga acattgggct gctcaaagag ctagaggacc agctactgtt 60

cttgctattg gaactgctaa tccaccaaat gttctttatc aagctgatta tccagatttt 120

tattttagag ttactaagtc tgaacatatg actcaactta aggaaaagtt taagagaatt 180

tgtgataagt ctgctattag aaagagacat cttcatctta ctgaagaact tcttgaaaag 240

aatccaaata tttgtgctca tatggctcca tctcttgatg ctagacaaga tattgctgtt 300

gttgaagttc caaagcttgc taaggaagct gctactaagg ctattaagga atggggaaga 360

ccaaagtctg atattactca tcttattttt tgtactactt gtggagttga tatgccagga 420

gctgattatc aacttactac tcttcttgga cttagaccaa ctgttagaag aactatgctt 480

tatcaacaag gatgttttgc tggaggaact gttcttagac atgctaagga ttttgctgaa 540

aataatagag gagctagagt tcttgctgtt tgttctgaat ttactgttat gaatttttct 600

ggaccatctg aagctcatct tgattctatg gttggaatgg ctctttttgg agatggagct 660

tctgctgtta ttgttggagc tgatccagat tttgctattg aaagaccact ttttcaactt 720

gtttctacta ctcaaactat tgttccagat tctgatggag ctattaagtg tcatcttaag 780

gaagttggac ttactcttca tcttgttaag aatgttccag atcttatttc taataatatg 840

gataagattc ttgaagaagc ttttgctcca cttggaatta gagattggaa ttctattttt 900

tggactgctc atccaggagg agctgctatt cttgatcaac ttgaagctaa gcttggactt 960

aataaggaaa agcttaagac tactagaact gttcttagag aatatggaaa tatgtcttct 1020

gcttgtgttt gttttgttct tgatgaaatg agaagatctt ctcttgaaga aggaaagact 1080

acttctggag aaggacttga atggggaatt cttcttggat ttggaccagg acttactgtt 1140

gaaactgttg ttcttagatc tgttccaatt tctactgcta at 1182

<210> 139

<211> 394

<212> PRT

<213> Piper methysticum

<400> 139

Met Ser Lys Met Val Glu Glu His Trp Ala Ala Gln Arg Ala Arg Gly

1 5 10 15

Pro Ala Thr Val Leu Ala Ile Gly Thr Ala Asn Pro Pro Asn Val Leu

20 25 30

Tyr Gln Ala Asp Tyr Pro Asp Phe Tyr Phe Arg Val Thr Lys Ser Glu

35 40 45

His Met Thr Gln Leu Lys Glu Lys Phe Lys Arg Ile Cys Asp Lys Ser

50 55 60

Ala Ile Arg Lys Arg His Leu His Leu Thr Glu Glu Leu Leu Glu Lys

65 70 75 80

Asn Pro Asn Ile Cys Ala His Met Ala Pro Ser Leu Asp Ala Arg Gln

85 90 95

Asp Ile Ala Val Val Glu Val Pro Lys Leu Ala Lys Glu Ala Ala Thr

100 105 110

Lys Ala Ile Lys Glu Trp Gly Arg Pro Lys Ser Asp Ile Thr His Leu

115 120 125

Ile Phe Cys Thr Thr Cys Gly Val Asp Met Pro Gly Ala Asp Tyr Gln

130 135 140

Leu Thr Thr Leu Leu Gly Leu Arg Pro Thr Val Arg Arg Thr Met Leu

145 150 155 160

Tyr Gln Gln Gly Cys Phe Ala Gly Gly Thr Val Leu Arg His Ala Lys

165 170 175

Asp Phe Ala Glu Asn Asn Arg Gly Ala Arg Val Leu Ala Val Cys Ser

180 185 190

Glu Phe Thr Val Met Asn Phe Ser Gly Pro Ser Glu Ala His Leu Asp

195 200 205

Ser Met Val Gly Met Ala Leu Phe Gly Asp Gly Ala Ser Ala Val Ile

210 215 220

Val Gly Ala Asp Pro Asp Phe Ala Ile Glu Arg Pro Leu Phe Gln Leu

225 230 235 240

Val Ser Thr Thr Gln Thr Ile Val Pro Asp Ser Asp Gly Ala Ile Lys

245 250 255

Cys His Leu Lys Glu Val Gly Leu Thr Leu His Leu Val Lys Asn Val

260 265 270

Pro Asp Leu Ile Ser Asn Asn Met Asp Lys Ile Leu Glu Glu Ala Phe

275 280 285

Ala Pro Leu Gly Ile Arg Asp Trp Asn Ser Ile Phe Trp Thr Ala His

290 295 300

Pro Gly Gly Ala Ala Ile Leu Asp Gln Leu Glu Ala Lys Leu Gly Leu

305 310 315 320

Asn Lys Glu Lys Leu Lys Thr Thr Arg Thr Val Leu Arg Glu Tyr Gly

325 330 335

Asn Met Ser Ser Ala Cys Val Cys Phe Val Leu Asp Glu Met Arg Arg

340 345 350

Ser Ser Leu Glu Glu Gly Lys Thr Thr Ser Gly Glu Gly Leu Glu Trp

355 360 365

Gly Ile Leu Leu Gly Phe Gly Pro Gly Leu Thr Val Glu Thr Val Val

370 375 380

Leu Arg Ser Val Pro Ile Ser Thr Ala Asn

385 390

<210> 140

<211> 1734

<212> DNA

<213> Arabidopsis thaliana

<400> 140

atggaagaag attataagat ggctccacaa gaacaagctg tttctcaagt tatggaaaag 60

caatctaata ataataattc tgatgttatt tttagatcta agcttccaga tatttatatt 120

ccaaatcatc tttctcttca tgattatatt tttcaaaata tttctgaatt tgctactaag 180

ccatgtctta ttaatggacc aactggacat gtttatactt attctgatgt tcatgttatt 240

tctagacaaa ttgctgctaa ttttcataag cttggagtta atcaaaatga tgttgttatg 300

cttcttcttc caaattgtcc agaatttgtt ctttcttttc ttgctgcttc ttttagagga 360

gctactgcta ctgctgctaa tccatttttt actccagctg aaattgctaa gcaagctaag 420

gcttctaata ctaagcttat tattactgaa gctagatatg ttgataagat taagccactt 480

caaaatgatg atggagttgt tattgtttgt attgatgata atgaatctgt tccaattcca 540

gaaggatgtc ttagatttac tgaacttact caatctacta ctgaagcttc tgaagttatt 600

gattctgttg aaatttctcc agatgatgtt gttgctcttc catattcttc tggaactact 660

ggacttccaa agggagttat gcttactcat aagggacttg ttacttctgt tgctcaacaa 720

gttgatggag aaaatccaaa tctttatttt cattctgatg atgttattct ttgtgttctt 780

ccaatgtttc atatttatgc tcttaattct attatgcttt gtggacttag agttggagct 840

gctattctta ttatgccaaa gtttgaaatt aatcttcttc ttgaacttat tcaaagatgt 900

aaggttactg ttgctccaat ggttccacca attgttcttg ctattgctaa gtcttctgaa 960

actgaaaagt atgatctttc ttctattaga gttgttaagt ctggagctgc tccacttgga 1020

aaggaacttg aagatgctgt taatgctaag tttccaaatg ctaagcttgg acaaggatat 1080

ggaatgactg aagctggacc agttcttgct atgtctcttg gatttgctaa ggaaccattt 1140

ccagttaagt ctggagcttg tggaactgtt gttagaaatg ctgaaatgaa gattgttgat 1200

ccagatactg gagattctct ttctagaaat caaccaggag aaatttgtat tagaggacat 1260

caaattatga agggatatct taataatcca gctgctactg ctgaaactat tgataaggat 1320

ggatggcttc atactggaga tattggactt attgatgatg atgatgaact ttttattgtt 1380

gatagactta aggaacttat taagtataag ggatttcaag ttgctccagc tgaacttgaa 1440

gctcttctta ttggacatcc agatattact gatgttgctg ttgttgctat gaaggaagaa 1500

gctgctggag aagttccagt tgcttttgtt gttaagtcta aggattctga actttctgaa 1560

gatgatgtta agcaatttgt ttctaagcaa gttgtttttt ataagagaat taataaggtt 1620

ttttttactg aatctattcc aaaggctcca tctggaaaga ttcttagaaa ggatcttaga 1680

gctaagcttg ctaatggact ttctggatat ccatatgatg ttccagatta tgct 1734

<210> 141

<211> 578

<212> PRT

<213> Arabidopsis thaliana

<400> 141

Met Glu Glu Asp Tyr Lys Met Ala Pro Gln Glu Gln Ala Val Ser Gln

1 5 10 15

Val Met Glu Lys Gln Ser Asn Asn Asn Asn Ser Asp Val Ile Phe Arg

20 25 30

Ser Lys Leu Pro Asp Ile Tyr Ile Pro Asn His Leu Ser Leu His Asp

35 40 45

Tyr Ile Phe Gln Asn Ile Ser Glu Phe Ala Thr Lys Pro Cys Leu Ile

50 55 60

Asn Gly Pro Thr Gly His Val Tyr Thr Tyr Ser Asp Val His Val Ile

65 70 75 80

Ser Arg Gln Ile Ala Ala Asn Phe His Lys Leu Gly Val Asn Gln Asn

85 90 95

Asp Val Val Met Leu Leu Leu Pro Asn Cys Pro Glu Phe Val Leu Ser

100 105 110

Phe Leu Ala Ala Ser Phe Arg Gly Ala Thr Ala Thr Ala Ala Asn Pro

115 120 125

Phe Phe Thr Pro Ala Glu Ile Ala Lys Gln Ala Lys Ala Ser Asn Thr

130 135 140

Lys Leu Ile Ile Thr Glu Ala Arg Tyr Val Asp Lys Ile Lys Pro Leu

145 150 155 160

Gln Asn Asp Asp Gly Val Val Ile Val Cys Ile Asp Asp Asn Glu Ser

165 170 175

Val Pro Ile Pro Glu Gly Cys Leu Arg Phe Thr Glu Leu Thr Gln Ser

180 185 190

Thr Thr Glu Ala Ser Glu Val Ile Asp Ser Val Glu Ile Ser Pro Asp

195 200 205

Asp Val Val Ala Leu Pro Tyr Ser Ser Gly Thr Thr Gly Leu Pro Lys

210 215 220

Gly Val Met Leu Thr His Lys Gly Leu Val Thr Ser Val Ala Gln Gln

225 230 235 240

Val Asp Gly Glu Asn Pro Asn Leu Tyr Phe His Ser Asp Asp Val Ile

245 250 255

Leu Cys Val Leu Pro Met Phe His Ile Tyr Ala Leu Asn Ser Ile Met

260 265 270

Leu Cys Gly Leu Arg Val Gly Ala Ala Ile Leu Ile Met Pro Lys Phe

275 280 285

Glu Ile Asn Leu Leu Leu Glu Leu Ile Gln Arg Cys Lys Val Thr Val

290 295 300

Ala Pro Met Val Pro Pro Ile Val Leu Ala Ile Ala Lys Ser Ser Glu

305 310 315 320

Thr Glu Lys Tyr Asp Leu Ser Ser Ile Arg Val Val Lys Ser Gly Ala

325 330 335

Ala Pro Leu Gly Lys Glu Leu Glu Asp Ala Val Asn Ala Lys Phe Pro

340 345 350

Asn Ala Lys Leu Gly Gln Gly Tyr Gly Met Thr Glu Ala Gly Pro Val

355 360 365

Leu Ala Met Ser Leu Gly Phe Ala Lys Glu Pro Phe Pro Val Lys Ser

370 375 380

Gly Ala Cys Gly Thr Val Val Arg Asn Ala Glu Met Lys Ile Val Asp

385 390 395 400

Pro Asp Thr Gly Asp Ser Leu Ser Arg Asn Gln Pro Gly Glu Ile Cys

405 410 415

Ile Arg Gly His Gln Ile Met Lys Gly Tyr Leu Asn Asn Pro Ala Ala

420 425 430

Thr Ala Glu Thr Ile Asp Lys Asp Gly Trp Leu His Thr Gly Asp Ile

435 440 445

Gly Leu Ile Asp Asp Asp Asp Glu Leu Phe Ile Val Asp Arg Leu Lys

450 455 460

Glu Leu Ile Lys Tyr Lys Gly Phe Gln Val Ala Pro Ala Glu Leu Glu

465 470 475 480

Ala Leu Leu Ile Gly His Pro Asp Ile Thr Asp Val Ala Val Val Ala

485 490 495

Met Lys Glu Glu Ala Ala Gly Glu Val Pro Val Ala Phe Val Val Lys

500 505 510

Ser Lys Asp Ser Glu Leu Ser Glu Asp Asp Val Lys Gln Phe Val Ser

515 520 525

Lys Gln Val Val Phe Tyr Lys Arg Ile Asn Lys Val Phe Phe Thr Glu

530 535 540

Ser Ile Pro Lys Ala Pro Ser Gly Lys Ile Leu Arg Lys Asp Leu Arg

545 550 555 560

Ala Lys Leu Ala Asn Gly Leu Ser Gly Tyr Pro Tyr Asp Val Pro Asp

565 570 575

Tyr Ala

<---

Реферат

Настоящее изобретение относится к области биотехнологии, конкретно к белкам биосинтеза люциферина грибов. Изобретение раскрывает новые ферменты биосинтеза люциферина грибов и кодирующие их нуклеиновые кислоты, применение белков и нуклеиновых кислот в биосинтезе люциферина грибов. Раскрываются способы получения люциферина и предлюциферина грибов в системахи, а также применение таких веществ в качестве люминофоров в различных областях науки. 38 н. и 19 з.п. ф-лы, 25 пр., 6 табл., 9 ил.

Формула

1. Белок биосинтеза люциферина грибов, представляющий собой гиспидин-гидроксилазу, состоящий из:
а) аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28; или
б) аминокислотной последовательности, которая на протяжении по крайней мере 350 аминокислот имеет не менее 60% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28;
где указанная гиспидин-гидроксилаза катализирует превращение 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу
,
в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу
, где R - арил или гетероарил.
2. Белок по п. 1, где аминокислотная последовательность гиспидин-гидроксилазы имеет не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28.
3. Белок по п. 2, где аминокислотная последовательность гиспидин-гидроксилазы выбрана из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28 или идентична ей по крайней мере на 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 98% или 99%.
4. Белок по п. 1, где 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он выбран из группы:
(Е)-6-(3,4-дигидроксистирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2,4-дигидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-6-(4-аминостирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-6-(2-(1Н-индол-3-ил)винил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2Н-пиран-2-он.
5. Применение белка биосинтеза люциферина грибов, состоящего из:
а) аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28; или
б) аминокислотной последовательности, которая на протяжении по крайней мере 350 аминокислот имеет не менее 60% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16,18, 20, 22, 24, 26, 28;
в системах in vitro или in vivo как гиспидин-гидроксилазы, катализирующей реакцию превращения 6-(2- арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она, имеющего структурную формулу
,
в 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющий структурную формулу
, где R - арил или гетероарил.
6. Применение по п. 5, где аминокислотная последовательность имеет не менее 65% идентичности, или не менее 70% идентичности, или не менее 75% идентичности, или не менее 80% идентичности, или не менее 85% идентичности, или не менее 90% идентичности, или не менее 95% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8 10, 12, 14, 16, 18, 20, 22, 24, 26, 28.
7. Применение по п. 5, где 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он выбран из группы
(Е)-6-(3,4-дигидроксистирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-стирил-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2-гидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2,4-дигидроксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3,5-диметоксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(4-гидрокси-3-метоксистирил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2-(6-гидроксинафталин-2-ил)винил)-2Н-пиран-2-он,
(Е)-6-(4-аминостирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-6-(4-(диэтиламино)стирил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-6-(2-(1Н-индол-3-ил)винил)-4-гидрокси-2Н-пиран-2-он,
(Е)-4-гидрокси-6-(2,3,6,7-тетрагидро-1Н,5Н-пиридо[3,2,1-ij]хинолин-9-ил)винил)-2Н-пиран-2-он.
8. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок биосинтеза люциферина грибов гиспидин-гидроксилазу по п. 1.
9. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок биосинтеза люциферина грибов гиспидин-гидроксилазу по п. 2.
10. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок биосинтеза люциферина грибов гиспидин-гидроксилазу по п. 3.
11. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок биосинтеза люциферина грибов гиспидин-гидроксилазу по п. 4.
12. Кассета экспрессии, содержащая (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту по п. 8; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
13. Клетка-хозяин, содержащая кассету экспрессии по п. 12 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку, где указанная клетка экспрессирует функциональный белок биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой гиспидин-гидроксилазу, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
14. Клетка-хозяин, содержащая кассету экспрессии по п. 12 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку, и кассету экспрессии, включающую (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, которая кодирует гиспидин-синтазу, катализирующую реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой
в 6-(2-арилвинил)- 3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющего структурную формулу
, где R - арил или гетероарил; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине,
где указанная клетка экспрессирует функциональный белок биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой гиспидин-гидроксилазу, и дополнительно продуцирует функциональную гиспидин-синтазу, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
15. Клетка-хозяин, содержащая кассету экспрессии по п. 12 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку; кассету экспрессии, включающую (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, которая кодирует гиспидин-синтазу, катализирующую реакцию превращения 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой
в 6-(2-арилвинил)- 3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющего структурную формулу
, где R - арил или гетероарил; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине;
и кассету экспрессии, включающую (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, которая кодирует 4'-фосфопантотеинил трансферазу, способную осуществлять перенос 4-фосфопантетеинила от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтаз; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине,
где указанная клетка экспрессирует функциональный белок биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой гиспидин-гидроксилазу, и дополнительно продуцирует функциональную гиспидин-синтазу, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
16. Клетка-хозяин, содержащая кассету экспрессии по п. 12 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку, и кассету экспрессии, включающую (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, которая кодирует поликетидсинтазу III типа, катализирующую реакцию превращения кофеил-КоА в гиспидин; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, где указанная клетка экспрессирует функциональный белок биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой гиспидин-гидроксилазу, и дополнительно продуцирует функциональную поликетидсинтазу III типа, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
17. Клетка-хозяин, содержащая кассету экспрессии по п. 12 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку; кассету экспрессии, включающую (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, которая кодирует поликетидсинтазу III типа, катализирующую реакцию превращения кофеил-КоА в гиспидин; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; и кассету экспрессии, включающую (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, которая кодирует кумарат-КоА-лигазу, катализирующую реакцию присоединения кофермента А к кофейной кислоте с образованием кофеил-КоА; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, где указанная клетка экспрессирует функциональный белок биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой гиспидин-гидроксилазу, и дополнительно продуцирует функциональную поликетидсинтазу III типа, и продуцирует функциональную КоА-лигазу, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
18. Применение нуклеиновой кислоты, кодирующей белок биосинтеза люциферина грибов гиспидин-гидроксилазу, по п.8 для получения в системах in vitro или in vivo гиспидин-гидроксилазы по п.1.
19. Применение по п.18, где нуклеиновая кислота применяется для экспрессии белка биосинтеза люциферина грибов в составе кассеты экспрессии, которая также включает регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, и регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
20. Применение по п.19, где кассета экспрессии применяется в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
21. Способ биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой 6-(2-арилвинил)- 3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющего структурную формулу
, где R - арил или гетероарил, в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы по п. 1 с по крайней мере одной молекулой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-она со структурной формулой
, с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)Н и с по крайней мере одной молекулы молекулярного кислорода.
22. Способ по п. 21, где реакция осуществляется в клетке-хозяине или организме, включающий введение в клетку кассеты экспрессии по п. 12, в состав которой входит нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-гидроксилазу, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
23. Способ биосинтеза люциферина грибов, представляющего собой 6-(2-арилвинил)- 3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-он, имеющего структурную формулу
, где R - арил или гетероарил, в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы 3-арилакриловой кислоты со структурной формулой
с по крайней мере одной молекулой гиспидин-синтазы, катализирующей превращение 3-арилакриловой кислоты в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, с по крайней мере одной молекулой кофермента А, с по крайней мере одной молекулы АТФ, с по крайней мере с двумя молекулами малонил-КоА, с по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы по п. 1, с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)Н и с по крайней мере одной молекулы молекулярного кислорода.
24. Способ по п. 23, где реакция осуществляется в клетке-хозяине по п. 13.
25. Способ биосинтеза люциферина грибов в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы по п. 1 с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)H, с по крайней мере одной молекулой кислорода, с по крайней мере одной молекулы поликетидсинтазы III типа, с по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА и с по крайней мере одной молекулой кофеил-КоА.
26. Способ биосинтеза люциферина грибов в системе in vitro или in vivo, включающий объединение в физиологических условиях по крайней мере одной молекулы гиспидин-гидроксилазы по п. 1 с по крайней мере одной молекулой НАД(Ф)H, с по крайней мере одной молекулой кислорода, с по крайней мере одной молекулы поликетидсинтазы III типа, с по крайней мере одной молекулы кумарат-КоА-лигазы, по крайней мере одной молекулы кофейной кислоты или кофеил-КоА, по крайней мере одной молекулы кофермента А, с по крайней мере одной молекулой АТФ, и по крайней мере двумя молекулами малонил-КоА.
27. Способ по п. 25, где реакция осуществляется в клетке-хозяине по п. 16 или 17.
28. Способ по п. 26, где реакция осуществляется в клетке-хозяине по п. 17.
29. Способ по любому из пп. 22, 24, 27, 28, включающий дополнительное введение в клетку или организм нуклеиновых кислот, кодирующих ферменты биосинтеза 3- арилакриловой кислоты из метаболитов клетки со структурной формулой
, где R – арил или гетероарил.
30. Способ по п. 29, где ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты выбраны из группы:
(а) тирозин-аммоний-лиаза, компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы;
(б) фенилаланин-аммоний-лиаза.
31. Способ по п. 30, где ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты выбраны из группы:
(а) тирозин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID No: 107 или по крайней мере на 40% идентичную последовательности, показанной в SEQ ID No: 107; компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы, аминокислотные последовательности которых представляют собой SEQ ID Nos: 109 и 111 или по крайней мере на 40% идентичные последовательностям компонентов HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli, показанным в SEQ ID Nos: 109 и 111;
(б) фенилаланин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID Nos:117 или по крайней мере на 40% идентичную аминокислотной последовательности, показанной в SEQ ID Nos:117.
32. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
33. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-синтазу в составе кассеты экспрессии, где указанная гиспидин-синтаза катализирует превращение 3-арилакриловой кислоты в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии экзогенного или эндогенного предшественника предлюциферина грибов, представляющего собой 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
, где R – арил или гетероарил, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
34. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей гиспидин-синтазу в составе кассеты экспрессии, где указанная гиспидин-синтаза катализирует превращение 3-арилакриловой кислоты в 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он, где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии экзогенного или эндогенного предшественника предлюциферина грибов, представляющего собой 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
, где R – арил или гетероарил, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей 4'-фосфопантотеинил трансферазу, способную осуществлять перенос 4-фосфопантотеинил от кофермента А на серин в ацилпереносящем домене поликетидсинтаз, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
35. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей поликетидсинтазу III типа, где клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии экзогенного или эндогенного кофеил-КоА, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
36. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей поликетидсинтазу III типа, где клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии экзогенного или эндогенного кофеил-КоА, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей кумарат-КоА-лигазу, где клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии экзогенной или эндогенной кофейной кислоты, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
37. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, дополнительно включающий введение в клетку или организм нуклеиновых кислот, кодирующих ферменты биосинтеза 3- арилакриловой кислоты из метаболитов клетки, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
38.Способ по п. 37, где ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты выбраны из группы:
(а) тирозин-аммоний-лиаза; компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы- редуктазы;
(б) фенилаланин-аммоний-лиаза.
39. Способ по п. 38, где ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты выбраны из группы:
(а) тирозин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID No: 107 или по крайней мере на 40% идентичную последовательности, показанной в SEQ ID No: 107; компоненты HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы- редуктазы, аминокислотные последовательности которых представляют собой SEQ ID Nos: 109 и 111 или по крайней мере на 40% идентичные последовательностям компонентов HpaB и HpaC 4-гидроксифенилацетат 3-монооксигеназы-редуктазы E. coli, показанным в SEQ ID Nos: 109 и 111;
(б) фенилаланин-аммоний-лиаза, аминокислотная последовательность которой представляет собой SEQ ID Nos:117 или по крайней мере на 40% идентичную аминокислотной последовательности, показанной в SEQ ID Nos:117.
40. Способ получения трансгенной биолюминесцентной клетки или организма, включающий введение в клетку или организм кассеты экспрессии по п. 12, включающей нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, и кассеты экспрессии, содержащей (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, (в) регион терминации транскрипции; где указанная клетка приобретает способность к биолюминесценции в присутствии предлюциферина грибов, представляющем собой 6-(2-арилвинил)-4-гидрокси-2H-пиран-2-он со структурной формулой
, где R - арил или гетероарил, также включающий введение в клетку или организм нуклеиновой кислоты, кодирующей кофеилпируват-гидролазу, где указанная кофеилпируват-гидролаза катализирует превращение 6-арил-2-гидрокси-4-оксогекса-2,5-диеновой кислоты, имеющей структурную формулу
, где R - арил или гетероарил, в 3-арилакриловую кислоту со структурной формулой
, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
41. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, по п. 8, как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 12 и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, причем трансгенный организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
42. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, по п. 8, как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 12 и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, дополнительно содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
43. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, по п. 8, как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 12, и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, дополнительно содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, также содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая 4'-фосфопантотеинил трансферазу, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
44. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, по п. 8, как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 12, и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, причем трансгенный организм не является человеком или человеческим эмбрионом, дополнительно содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, также содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая поликетидсинтазу III типа, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
45. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, по п. 8, как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 12, и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, дополнительно содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая гиспидин-синтазу, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, также содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая поликетидсинтазу III типа, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, также содержащий как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая кумарат-КоА-лигазу, и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
46. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-гидроксилазу, по п. 8, как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 12, и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин грибов с выделением света, также содержащий кассету экспрессии, в состав которой входит (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновая кислота, кодирующая кофеилпируват-гидролазу и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
47. Набор для получения люциферина грибов, включающий гиспидин-гидроксилазу по п.1 и гиспидин-синтазу с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55 или аминокислотной последовательностью, которая имеет не менее 45% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, или поликетидсинтазу III типа с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID Nos: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139 или аминокислотной последовательностью, которая имеет не менее 40% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139.
48. Набор для получения люциферина грибов в системах in vitro или in vivo, включающий кодирующую гиспидин-гидроксилазу нуклеиновую кислоту по п. 8, и нуклеиновую кислоту, кодирующую гиспидин-синтазу с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55 или аминокислотной последовательностью, которая имеет не менее 45% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 35, 37, 39, 41, 43, 45, 47, 49, 51, 53, 55, или нуклеиновую кислоту, кодирующую поликетидсинтазу III типа с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID Nos: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139, или аминокислотной последовательностью, которая имеет не менее 40% идентичности с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы SEQ ID NOs: 119, 121, 123, 125, 127, 129, 131, 133, 135, 137, 139.
49. Набор для получения биолюминесцентной клетки или организма, включающий кодирующую гиспидин-гидроксилазу нуклеиновую кислоту по п. 8, и нуклеиновую кислоту, кодирующую люциферазу, способную окислять люциферин 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-онов грибов с выделением света, где аминокислотная последовательность люциферазы представляет собой:
а) аминокислотную последовательность, выбранную из группы SEQ ID Nos: 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98; или
б) аминокислотную последовательность, по крайней мере на 40% идентичную, например, по крайней мере на 45% идентичную, или по крайней мере на 50% идентичную, или по крайней мере на 55% идентичную, или по крайней мере на 60% идентичную, или по крайней мере на 70% идентичную, или по крайней мере на 75% идентичную, или по крайней мере на 80% идентичную, или по крайней мере на 85% идентичную аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID Nos: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98, причем клетка не является эмбриональной клеткой человека, а организм не является человеком или человеческим эмбрионом.
50. Набор по п.49, дополнительно содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую поликетидсинтазу III типа или гиспидин-синтазу.
51. Набор по п.50, дополнительно содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую 4'-фосфопантотеинил трансферазу и/или нуклеиновые кислоты, кодирующие ферменты биосинтеза 3-арилакриловой кислоты и/или нуклеиновую кислоту, кодирующую кофеилпируват-гидролазу.
52. Белок слияния для получения биолюминесценции в системах in vitro или in vivo, в состав которого входят гиспидин-гидроксилаза по п. 1, оперативно сшитая непосредственно или через короткий линкер на C- или N-конце с люциферазой, способной окислять с выделением света люциферин грибов 6-(2-арилвинил)-3,4-дигидрокси-2H-пиран-2-онов, где аминокислотная последовательность люциферазы представляет собой:
а) аминокислотную последовательность, выбранную из группы SEQ ID Nos: 80, 82, 84, 86, 88, 90, 92, 94, 96, 98; или
б) аминокислотную последовательность, по крайней мере на 40% идентичную, например, по крайней мере на 45% идентичную, или по крайней мере на 50% идентичную, или по крайней мере на 55% идентичную, или по крайней мере на 60% идентичную, или по крайней мере на 70% идентичную, или по крайней мере на 75% идентичную, или по крайней мере на 80% идентичную, или по крайней мере на 85% идентичную аминокислотной последовательности, выбранной из группы SEQ ID Nos: 80, 82, 84, 86, 88, 90 , 92, 94, 96, 98.
53. Белок слияния по п. 52, аминокислотная последовательность которого показана в SEQ ID No: 101.
54. Нуклеиновая кислота, кодирующая белок слияния по п. 52.
55. Кассета экспрессии, включающая (а) регион инициации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине; (б) нуклеиновую кислоту по п. 54; и (в) регион терминации транскрипции, функциональный в клетке-хозяине, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
56. Клетка-хозяин, содержащая кассету экспрессии по п. 55 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения указанной кассеты в указанную клетку, где указанная клетка экспрессирует белок слияния для получения биолюминесценции, причем клетка-хозяин не является эмбриональной клеткой человека.
57. Трансгенный организм, способный к биолюминесценции в присутствии люциферина грибов и предлюциферина грибов, содержащий нуклеиновую кислоту, кодирующую белок слияния, по п.54 как часть экстрахромосомного элемента или интегрированную в геном клетки как результат внедрения в указанную клетку кассеты экспрессии по п. 55, причем трансгенный организм не является человеком или человеческим эмбрионом.

Авторы

Патентообладатели

Заявители

0
0
0
0
Невозможно загрузить содержимое всплывающей подсказки.
Поиск по товарам