Варианты рекомбинантных ааv и их применения - RU2017116353A
Код документа: RU2017116353A
Формула
1. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: от 1 до 47, или ее фрагмент, который не кодирует пептид, который идентичен любой из последовательностей SEQ ID NO: от 98 до 100.
2. Выделенный белок капсида ААV, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: от 51 до 97.
3. Выделенный белок капсида AAV, содержащий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: от 51 до 61, причем аминокислотная последовательность, которая не совпадает с соответствующей аминокислотой последовательностью, представленной как SEQ ID NO: 98, заменена консервативной заменой.
4. Выделенный белок капсида AAV, содержащий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 62 до 67, причем аминокислотная последовательность, которая не совпадает с соответствующей аминокислотой последовательности, представленной как SEQ ID NO: 99, заменена консервативной заменой.
5. Выделенный белок капсида AAV, содержащий последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: от 68 до 97, причем аминокислотная последовательность, которая не совпадает с соответствующей аминокислотой последовательности, представленной как SEQ ID NO: 100, заменена консервативной заменой.
6. Пептидный фрагмент выделенного белка капсида ААV по любому из пп. 2-5, который не идентичен любой из последовательностей SEQ ID NO: 98 до 100.
7. Выделенный белок капсида ААV, содержащий пептидный фрагмент по п.6.
8. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий последовательность нуклеиновых кислот, кодирующую выделенный белок капсида ААV по любому из пп. 2-5.
9. Композиция, содержащая выделенный белок капсида ААV по любому из пп. 2-5.
10. Композиция, содержащая выделенный белок капсида ААV по любому из пп. 2-5 и фармацевтически приемлемый носитель.
11. Рекомбинантный ААV (rAAV), содержащий выделенный белок капсида ААV по любому из пп. 2-5.
12. Композиция, содержащая рекомбинантный rAAV по п.11.
13. Композиция по п.12, дополнительно содержащая фармацевтически приемлемый носитель.
14. Клетка-хозяин, содержащая нуклеиновую кислоту, которая включает кодирующую последовательность, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: от 1 до 47, которая функционально связана с промотором.
15. Композиция, содержащая клетку-хозяин по п.14 и стерильную среду для культивирования клеток.
16. Композиция, содержащая клетку-хозяин по п.15 и криоконсервант.
17. Способ доставки трансгена пациенту, включающий введение rAAV по п.11 пациенту, в котором rAAV содержит по меньшей мере один трансген, и в котором rAAV инфицирует клетки ткани-мишени пациента.
18. Способ создания соматической трансгенной животной модели, включающий введение рекомбинантного rAAV по п.11 животному, отличному от человека, в котором rAAV содержит по меньшей мере один трансген и в котором rAAV инфицирует клетку ткани-мишени животного, отличного от человека.
19. Способ по п.17, в котором по меньшей мере один трансген представляет собой ген, кодирующий белок.
20. Способ по п.17, в котором по меньшей мере один трансген кодирует малую интерферирующую нуклеиновую кислоту.
21. Способ по п.20, в котором малая интерферирующая нуклеиновая кислота представляет собой микроРНК.
22. Способ по п.20, в котором малая интерферирующая нуклеиновая кислота представляет собой микроРНК-губку или TUD РНК, которая ингибирует активность по меньшей мере одной микроРНК у пациента или животного.
23. Способ по п.22, в котором микроРНК экспрессируется в клетке ткани-мишени.
24. Способ по п.17, в котором ткань-мишень представляет собой скелетную мышцу, сердце, печень, поджелудочную железу, головной мозг или легкое.
25. Способ по п.18, в котором трансген экспрессирует транскрипт, который содержит по меньшей мере один сайт связывания микроРНК, причем микроРНК ингибирует активность трансгена в ткани, отличной от ткани-мишени, путем гибридизации с сайтом связывания.
26. Способ создания соматической трансгенной животной модели, включающий введение rAAV по п.23 животному, не являющемуся человеком, в котором rAAV содержит по меньшей мере один трансген, причем трансген экспрессирует транскрипт, который содержит по меньшей мере один участок связывания микроРНК, причем микроРНК ингибирует активность трансгена в ткани, отличной от ткани-мишени, путем гибридизации с сайтом связывания транскрипта.
27. Способ по п.26, в котором трансген содержит тканеспецифический промотор или индуцируемый промотор.
28. Способ по п.27, в котором тканеспецифический промотор представляет собой специфический промотор печень-специфического тироксин-связывающего глобулина (TBG), промотор инсулина, промотор глюкагона, промотор соматостатина, промотор панкреатического полипептида (PPY), промотор синапсина-1 (Syn), промотор креатинкиназы (MCK), промотор десмина млекопитающих (DES), промотор тяжелой цепи α-миозина (a-MHC), или промотор тропонина Т (cTnT) сердца.
29. Способ по п.17, в котором rAAV вводят внутривенно, чрескожно, внутриглазно, интратекально, перорально, внутримышечно, подкожно, интраназально или путем ингаляции.
30. Способ по п.17, в котором пациент выбран из мыши, крысы, кролика, собаки, кошки, овцы, свиньи и примата, отличного от человека.
31. Способ по п.17, в котором пациент представляет собой человека.
32. Соматическая трансгенная животная модель, полученная способом по п.18.
33. Набор для продуцирования rAAV, содержащий:
контейнер, содержащий выделенную нуклеиновую кислоту, имеющей последовательность по любому из SEQ ID NO: от 1 до 47.
34. Набор по п.33, дополнительно содержащий инструкции для получения rAAV.
35. Набор по п.34, дополнительно содержащий по меньшей мере один контейнер, содержащий рекомбинантный AAV-вектор, причем рекомбинантный AAV-вектор содержит трансген.
36. Набор, включающий:
контейнер, содержащий рекомбинантный AAV, имеющий выделенный белок капсида ААV по любому из пп.2-5.
37. Набор по п.36, в котором контейнер представляет собой шприц.
38. Выделенный белок капсида ААV, кодируемый нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: от 1 до 47.
39. Выделенный белок капсида ААV по п.38, в котором белок капсида является капсидным белком VP1.
40. Выделенны белок капсида ААV по п.38, в котором белок капсида является капсидным белком VP2.
41. Выделенный белок капсида по п.38, в котором белок капсида является капсидным белком VP3.
42. Псевдотипический ААV, содержащий белок капсида по любому из пп. 38-41.
