Формула
1. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело
(a) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133,
(b) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и
(c) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16.
2. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.1, где антитело не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, эта третья форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность третьей формы представляет собой SEQ ID № 139.
3. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где антитело
(a) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133,
(b) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, эта третья форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность третьей формы представляет собой SEQ ID № 139; и
(c) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.1, в котором (i) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; (ii) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; и (iii) клетки на стадии (c) представляют собой клетки SKOV3.
4. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.3, в котором (i) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; (ii) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; и (iii) клетки на стадии (c) представляют собой клетки SKOV3.
5. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.2, в котором (i) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; (ii) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; (iii) клетка, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, представляет собой клетку SKOV3; и (iv) клетки на стадии (c) представляют собой клетки SKOV3.
6. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-5, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифически связывается с аминокислотной последовательностью CTRNGTQLQNFTLDRSSV (SEQ ID № 130), где аминокислотный остаток номер 4 (N4) и аминокислотный остаток номер 10 (N10) из CTRNGTQLQNFTLDRSSV (SEQ ID № 130) гликозилированы.
7. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-6, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифически связывается с эпитопом, который содержит N-гликозилированный аспарагин 1806 из SEQ ID № 150.
8. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-7, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент иммуноспецифически связывается с аминокислотной последовательностью CGTQLQNFTLDRSSV (SEQ ID № 131), где аминокислотный остаток номер 7 (N7) из CGTQLQNFTLDRSSV (SEQ ID № 131) гликозилирован.
9. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 6-8, где гликозилирование состоит из N-связанной хитобиозы.
10. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-9, где происходит интернализация антитела или его антигенсвязывающего фрагмента в клетку, которая экспрессирует первую форму MUC16, при контакте клетки с антителом или антигенсвязывающим фрагментом.
11. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.10, где клетка представляет собой клетку SKOV3, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16.
12. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-11, где антитело ингибирует рост опухоли, которая экспрессирует гликозилированную форму MUC16.
13. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-12, где антитело представляет собой моноклональное антитело.
14. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область тяжелой цепи (VH), которая содержит
(a) определяющую комплементарность область (CDR)1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность TX1GMGVG (SEQ ID № 103), в которой X1 представляет собой L или V;
(b) CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность HIWWDDX2DKYYX3PALKS (SEQ ID № 104), в которой X2 представляет собой E или отсутствует и X3 представляет собой Y или N; и
(c) CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IGTAQATDALDY (SEQ ID № 105).
15. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит
(a) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX8TX9GM (SEQ ID № 109), в которой X8 представляет собой N или S и в которой X9 представляет собой L или V;
(b) CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность WDDX10 (SEQ ID № 110), в которой X10 представляет собой E или отсутствует; и
(c) CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GTAQATDALD (SEQ ID № 111).
16. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит
(a) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX15TX16GMG (SEQ ID № 115), в которой X15 представляет собой N или S и X16 представляет собой V или L;
(b) CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IWWDDX17DK (SEQ ID № 116), в которой X17 представляет собой E или отсутствует; и
(c) CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность X18RIGTAQATDALDY (SEQ ID № 117), в которой X18 представляет собой T, A или S.
17. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 3, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 4, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 5.
18. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 15, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 9, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 10, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 11.
19. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 15, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 16, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 17.
20. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 23, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 24, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 25.
21. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 15, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 29, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 30, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 31.
22. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 35, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 36, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 37.
23. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 43, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 44, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 45.
24. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 15, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 49, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 50, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 51.
25. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 55, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 56, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 57.
26. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 63, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 64, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 65.
27. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 15, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 69, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 70, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 71.
28. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 75, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 76, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 77.
29. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-14, где антитело содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 83, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 84, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 85.
30. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 15, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 89, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 90, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 91.
31. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-13 или 16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 95, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 96, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 97.
32. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-31, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит аминокислотную последовательность QVX21LKESGPGX22LQPSQTLSLTCSFSGFSLX23TX24GMGVGWX25RQX26SGKGLEWLAHIWWDDX27DKYYX28PALKSRLTISX29X30X31SKNQVFLKIX32NVX33TADX34ATYYCX35RIGTAQATDALDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID № 101), в которой X21 представляет собой T или N, X22 представляет собой I или K, X23 представляет собой N или S, X24 представляет собой V или L, X25 представляет собой S или I, X26 представляет собой P или S, X27 представляет собой E или отсутствует, X28 представляет собой N или Y, X29 представляет собой K или R, X30 представляет собой A или D, X31 представляет собой T или S, X32 представляет собой V или A, X33 представляет собой G или D, X34 представляет собой T, I или S и X35 представляет собой T, S или A.
33. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-19 или 32, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 1.
34. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-16, 20-22 или 32, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 21.
35. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-16, 23-25 или 32, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 41.
36. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-16, 26-28 или 32 где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 61.
37. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-16 или 29-32, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 81.
38. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит
(a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность RSSKSLX4X5SNGNTYLY (SEQ ID № 106), в которой X4 представляет собой R или L и X5 представляет собой K или H;
(b) CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMSNLAS (SEQ ID № 107); и
(c) CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQX6LEX7PLT (SEQ ID № 108), в которой X6 представляет собой G или S и X7 представляет собой H или Y.
39. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит
(a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность SKSLX11X12SNGNTY (SEQ ID № 112), в которой X11 представляет собой L или R и X12 представляет собой H или K;
(b) CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 113); и
(c) CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность X13LEX14PL (SEQ ID № 114), в которой X13 представляет собой G или S и X14 представляет собой H или Y.
40. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит
(a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность KSLX19X20SNGNTY (SEQ ID № 118), в которой X19 представляет собой V или L и X20 представляет собой H или K;
(b) CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 119); и
(c) CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQSLEYPLT (SEQ ID № 120).
41. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-38, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 26, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 27, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 28.
42. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37 или 39, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 32, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 33, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 34.
43. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37 или 40, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 38, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 39, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 40.
44. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-38, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 46, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 47, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 48.
45. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37 или 39, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 52, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 53, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 54.
46. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37 или 40, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 58, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 59, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 60.
47. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-38, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 86, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 87, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 88.
48. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37 или 39, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 92, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 93, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 94.
49. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37 или 40, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 98, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 99, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 100.
50. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 6, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 7, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 8.
51. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 12, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 13, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 14.
52. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 18, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 19, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 20.
53. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит вариабельную область легкой цепи (VL), которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 66, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 67, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 68.
54. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 72, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 73, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 74.
55. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по пп. 1-37, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 78, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 79, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 80.
56. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-49, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит аминокислотную последовательность DIVMTQAAPSX36X37VTPGESVSISCRSSKSLX38X39SNGNTYLYWFLQRPGQSPQRLIYYMSNLASGVPDRFSGRGSGTDFTLX40ISRVEAX41DVGVYYCMQX42LEX43PLTFGGGTKLEIK (SEQ ID № 102), в которой X36 представляет собой I или V, X37 представляет собой P или S, X38 представляет собой R или L, X39 представляет собой K или H, X40 представляет собой R или K, X41 представляет собой E или G, X42 представляет собой S или G и X43 представляет собой Y или H.
57. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-43, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 22.
58. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-40, или 44-46, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 42.
59. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-40, или 47-49, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 82.
60. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, или 50-52, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 2.
61. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-37, или 53-55, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 62.
62. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифически связываются с MUC16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VH, которая содержит:
(a) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность TX1GMGVG (SEQ ID № 103), в которой X1 представляет собой L или V; CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность HIWWDDX2DKYYX3PALKS (SEQ ID № 104), в которой X2 представляет собой E или отсутствует и X3 представляет собой Y или N; и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IGTAQATDALDY (SEQ ID № 105); или
(b) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX8TX9GM (SEQ ID № 109), в которой X8 представляет собой N или S и в которой X9 представляет собой L или V; CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность WDDX10 (SEQ ID № 110), в которой X10 представляет собой E или отсутствует; и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GTAQATDALD (SEQ ID № 111); или
(c) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX15TX16GMG (SEQ ID № 115), в которой X15 представляет собой N или S и X16 представляет собой V или L; CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IWWDDX17DK (SEQ ID № 116), в которой X17 представляет собой E или отсутствует; и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность X18RIGTAQATDALDY (SEQ ID № 117), в которой X18 представляет собой T, A или S; или
(d) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 3, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 4, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 5; или
(e) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 9, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 10, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 11; или
(f) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 15, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 16, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 17; или
(g) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 23, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 24, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 25; или
(h) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 29, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 30, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 31; или
(i) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 35, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 36, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 37; или
(j) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 43, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 44, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 45; или
(k) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 49, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 50, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 51; или
(l) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 55, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 56, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 57; или
(m) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 63, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 64, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 65; или
(n) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 69, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 70, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 71; или
(o) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 75, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 76, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 77; или
(p) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 83, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 84, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 85; или
(q) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 89, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 90, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 91; или
(r) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 95, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 96, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 97.
63. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифически связываются с MUC16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит VL, которая содержит:
(a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность RSSKSLX4X5SNGNTYLY (SEQ ID № 106), в которой X4 представляет собой R или L и X5 представляет собой K или H; CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMSNLAS (SEQ ID № 107); и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQX6LEX7PLT (SEQ ID № 108), в которой X6 представляет собой G или S и X7 представляет собой H или Y; или
(b) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность SKSLX11X12SNGNTY (SEQ ID № 112), в которой X11 представляет собой L или R и X12 представляет собой H или K; CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 113); и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность X13LEX14PL (SEQ ID № 114), в которой X13 представляет собой G или S и X14 представляет собой H или Y; или
(c) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность KSLX19X20SNGNTY (SEQ ID № 118), в которой X19 представляет собой V или L и X20 представляет собой H или K; CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 119); и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQSLEYPLT (SEQ ID № 120); или
(d) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 26, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 27, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 28; или
(e) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 32, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 33, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 34; или
(f) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 38, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 39, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 40; или
(g) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 46, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 47, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 48; или
(h) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 52, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 53, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 54; или
(i) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 58, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 59, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 60; или
(j) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 86, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 87, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 88; или
(k) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 92, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 93, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 94; или
(l) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 98, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 99, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 100; или
(m) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 6, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 7, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 8; или
(n) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 12, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 13, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 14; или
(o) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 18, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 19, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 20; или
(p) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 66, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 67, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 68; или
(q) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 72, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 73, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 74; или
(r) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 78, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 79, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 80.
64. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифически связываются с MUC16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит:
(a) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность TX1GMGVG (SEQ ID № 103), в которой X1 представляет собой L или V; CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность HIWWDDX2DKYYX3PALKS (SEQ ID № 104), в которой X2 представляет собой E или отсутствует и X3 представляет собой Y или N; и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IGTAQATDALDY (SEQ ID № 105); и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность RSSKSLX4X5SNGNTYLY (SEQ ID № 106), в которой X4 представляет собой R или L и X5 представляет собой K или H; CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMSNLAS (SEQ ID № 107); и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQX6LEX7PLT (SEQ ID № 108), в которой X6 представляет собой G или S и X7 представляет собой H или Y; или
(b) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX8TX9GM (SEQ ID № 109), в которой X8 представляет собой N или S и в которой X9 представляет собой L или V; CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность WDDX10 (SEQ ID № 110), в которой X10 представляет собой E или отсутствует; и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GTAQATDALD (SEQ ID № 111); и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность SKSLX11X12SNGNTY (SEQ ID № 112), в которой X11 представляет собой L или R и X12 представляет собой H или K; CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 113); и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность X13LEX14PL (SEQ ID № 114), в которой X13 представляет собой G или S и X14 представляет собой H или Y; или
(c) (i) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX15TX16GMG (SEQ ID № 115), в которой X15 представляет собой N или S и X16 представляет собой V или L; CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IWWDDX17DK (SEQ ID № 116), в которой X17 представляет собой E или отсутствует; и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность X18RIGTAQATDALDY (SEQ ID № 117), в которой X18 представляет собой T, A или S; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность KSLX19X20SNGNTY (SEQ ID № 118), в которой X19 представляет собой V или L и X20 представляет собой H или K; CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 119); и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQSLEYPLT (SEQ ID № 120); или
(d) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 23, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 24, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 25; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 26, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 27, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 28; или
(e) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 29, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 30, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 31; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 32, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 33, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 34; или
(f) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 35, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 36, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 37; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 38, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 39, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 40; или
(g) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 43, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 44, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 45; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 46, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 47, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 48; или
(h) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 49, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 50, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 51; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 52, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 53, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 54; или
(i) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 55, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 56, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 57; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 58, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 59, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 60; или
(j) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 83, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 84, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 85; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 86, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 87, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 88; или
(k) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 89, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 90, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 91; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 92, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 93, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 94; или
(l) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 95, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 96, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 97 и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 98, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 99, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 100; или
(m) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 3, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 4, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 5; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 6, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 7, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 8; или
(n) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 9, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 10, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 11; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 12, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 13, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 14; или
(o) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 15, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 16, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 17; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 18, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 19, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 20; или
(p) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 63, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 64, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 65; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 66, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 67, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 68; или
(q) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 69, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 70, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 71; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 72, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 73, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 74; или
(r) (i) VH, которая содержит CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 75, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 76, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 77; и (ii) VL, которая содержит CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 78, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 79, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 80.
65. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые иммуноспецифически связываются с MUC16, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержит:
(a) (i) VH, которая содержит аминокислотную последовательность QVX21LKESGPGX22LQPSQTLSLTCSFSGFSLX23TX24GMGVGWX25RQX26SGKGLEWLAHIWWDDX27DKYYX28PALKSRLTISX29X30X31SKNQVFLKIX32NVX33TADX34ATYYCX35RIGTAQATDALDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID № 101), в которой X21 представляет собой T или N, X22 представляет собой I или K, X23 представляет собой N или S, X24 представляет собой V или L, X25 представляет собой S или I, X26 представляет собой P или S, X27 представляет собой E или отсутствует, X28 представляет собой N или Y, X29 представляет собой K или R, X30 представляет собой A или D, X31 представляет собой T или S, X32 представляет собой V или A, X33 представляет собой G или D, X34 представляет собой T, I или S и X35 представляет собой T, S или A; и (ii) VL, которая содержит аминокислотную последовательность DIVMTQAAPSX36X37VTPGESVSISCRSSKSLX38X39SNGNTYLYWFLQRPGQSPQRLIYYMSNLASGVPDRFSGRGSGTDFTLX40ISRVEAX41DVGVYYCMQX42LEX43PLTFGGGTKLEIK (SEQ ID № 102), в которой X36 представляет собой I или V, X37 представляет собой P или S, X38 представляет собой R или L, X39 представляет собой K или H, X40 представляет собой R или K, X41 представляет собой E или G, X42 представляет собой S или G и X43 представляет собой Y или H; или
(b) (i) VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 1; и (ii) VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 2;
(c) (i) VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 21; и (ii) VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 22; или
(d) (i) VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 41; и (ii) VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 42; или
(e) (i) VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 61; и (ii) VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 62; или
(f) (i) VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 81; и (ii) VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 82.
66. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 14-65, где антитело содержит полученные у человека константные области тяжелой и легкой цепи.
67. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.66, в котором константная область тяжелой цепи имеет изотип, выбранный из группы, состоящей из гамма1, гамма2, гамма3 и гамма4.
68. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.66 или 67, в котором константная область легкой цепи имеет изотип, выбранный из группы, состоящей из каппа и лямбда.
69. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-31, 38-55 или 62-64, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент гуманизированы.
70. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.69, в где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой гуманизированную форму антитела грызуна.
71. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-70, где антитело представляет собой иммуноглобулин, который содержит две идентичные тяжелые цепи и две идентичные легкие цепи.
72. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по п.71, где иммуноглобулин представляет собой IgG.
73. Конъюгат антитела, который содержит антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-72, конъюгированные со средством.
74. Конъюгат антитела по п.73, в котором средство представляет собой визуализирующее средство или цитотоксическое средство.
75. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-70, в котором антитело или его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой биспецифическое антитело.
76. Биспецифическое антитело по п.75, где биспецифическое антитело иммуноспецифически связывает CD3.
77. Биспецифическое антитело по п.75 или 76, где биспецифическое антитело содержит иммуноглобулин, который иммуноспецифически связывает MUC16, где легкую цепь иммуноглобулина конъюгируют через пептидный линкер с одноцепочечным вариабельным фрагментом (scFv), который иммуноспецифически связывается с CD3.
78. Конъюгат биспецифического антитела, который содержит биспецифическое антитело по любому из пп. 75-77, конъюгированное со средством.
79. Конъюгат биспецифического антитела по п.78, в котором средство представляет собой визуализирующее средство или цитотоксическое средство.
80. Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-70, в котором его антигенсвязывающий фрагмент представляет собой scFv.
81. Конъюгат scFv, который содержит scFv по п.80, конъюгированный со средством.
82. Конъюгат scFv по п.81, в котором средство представляет собой визуализирующее средство или цитотоксическое средство.
83. Химерный антигенный рецептор (CAR), который содержит: антитело или антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-72; или scFv по п.80 или конъюгат scFv по п.81 или 82.
84. Тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть, где тяжелая цепь или ее антигенсвязывающая часть содержит VH, которая содержит:
(I) (a) определяющую комплементарность область (CDR)1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность TX1GMGVG (SEQ ID № 103), в которой X1 представляет собой L или V;
(b) CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность HIWWDDX2DKYYX3PALKS (SEQ ID № 104), в которой X2 представляет собой E или отсутствует и X3 представляет собой Y или N; и
(c) CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IGTAQATDALDY (SEQ ID № 105); где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(II) (a) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX8TX9GM (SEQ ID № 109), в которой X8 представляет собой N или S и X9 представляет собой L или V;
(b) CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность WDDX10 (SEQ ID № 110), в которой X10 представляет собой E или отсутствует; и
(c) CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GTAQATDALD (SEQ ID № 111);
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(III) (a) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность GFSLX15TX16GMG (SEQ ID № 115), в которой X15 представляет собой N или S и X16 представляет собой V или L;
(b) CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность IWWDDX17DK (SEQ ID № 116), в которой X17 представляет собой E или отсутствует; и
(c) CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность X18RIGTAQATDALDY (SEQ ID № 117), в которой X18 представляет собой T, A или S;
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(IV) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 3, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 4, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 5,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(V) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 9, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 10, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 11,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VI) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 15, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 16, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 17,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VII) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 23, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 24, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 25,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VIII) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 29, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 30, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 31,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(IX) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 35, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 36, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 37,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(X) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 43, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 44, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 45,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XI) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 49, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 50, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 51,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XII) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 55, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 56, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 57,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XIII) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 63, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 64, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 65,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XIV) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 69, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 70, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 71,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XV) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 75, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 76, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 77,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XVI) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 83, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 84, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 85,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XVII) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 89, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 90, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 91,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XVIII) CDR1 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 95, CDR2 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 96, и CDR3 VH, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 97,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16.
85. Тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть, где тяжелая цепь или ее антигенсвязывающая часть содержит VH, которая содержит:
(I) аминокислотную последовательность QVX21LKESGPGX22LQPSQTLSLTCSFSGFSLX23TX24GMGVGWX25RQX26SGKGLEWLAHIWWDDX27DKYYX28PALKSRLTISX29X30X31SKNQVFLKIX32NVX33TADX34ATYYCX35RIGTAQATDALDYWGQGTSVTVSS (SEQ ID № 101), в которой X21 представляет собой T или N, X22 представляет собой I или K, X23 представляет собой N или S, X24 представляет собой V или L, X25 представляет собой S или I, X26 представляет собой P или S, X27 представляет собой E или отсутствует, X28 представляет собой N или Y, X29 представляет собой K или R, X30 представляет собой A или D, X31 представляет собой T или S, X32 представляет собой V или A, X33 представляет собой G или D, X34 представляет собой T, I или S и X35 представляет собой T, S или A,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(II) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 1,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(III) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 21,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(IV) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 41,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(V) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 61,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VI) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 81,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16.
86. Тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п.84 или 85, где тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть содержит полученную у человека константную область тяжелой цепи.
87. Тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п.86, где константная область тяжелой цепи или ее антигенсвязывающей части имеет изотип, выбранный из группы, состоящей из гамма1, гамма2, гамма3 и гамма4.
88. Тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п.85, где указанная тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть гуманизирована.
89. Тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п.88, где указанная тяжелая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть представляет собой гуманизированную форму тяжелой цепи грызуна.
90. Конъюгат тяжелой цепи антитела, который содержит тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть по любому из пп. 84-89, в котором указанную тяжелую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть конъюгируют со средством.
91. Конъюгат тяжелой цепи антитела по п.90, в котором средство представляет собой визуализирующее средство или цитотоксическое средство.
92. Легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть, где легкая цепь или ее антигенсвязывающая часть содержит VL, которая содержит:
(I) (a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность RSSKSLX4X5SNGNTYLY (SEQ ID № 106), в которой X4 представляет собой R или L и X5 представляет собой K или H;
(b) CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMSNLAS (SEQ ID № 107); и
(c) CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQX6LEX7PLT (SEQ ID № 108), в которой X6 представляет собой G или S и X7 представляет собой H или Y,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(II) (a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность SKSLX11X12SNGNTY (SEQ ID № 112), в которой X11 представляет собой L или R и X12 представляет собой H или K;
(b) CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 113); и
(c) CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность X13LEX14PL (SEQ ID № 114), в которой X13 представляет собой G или S и X14 представляет собой H или Y,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(III) (a) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность KSLX19X20SNGNTY (SEQ ID № 118), в которой X19 представляет собой V или L и X20 представляет собой H или K;
(b) CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность YMS (SEQ ID № 119); и
(c) CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность MQSLEYPLT (SEQ ID № 120),
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(IV) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 6, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 7, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 8,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(V) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 12, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 13, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 14,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VI) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 18, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 19, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 20,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VII) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 26, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 27, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 28,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VIII) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 32, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 33, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 34,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VIX) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 38, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 39, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 40,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(X) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 46, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 47, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 48,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XI) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 52, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 53, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 54,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XII) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 58, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 59, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 60,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XIII) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 66, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 67, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 68,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XIV) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 72, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 73, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 74,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XV) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 78, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 79, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 80,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XVI) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 86, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 87, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 88,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XVII) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 92, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 93, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 94,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(XVIII) CDR1 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 98, CDR2 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 99, и CDR3 VL, которая содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 100,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16.
93. Легкая цепь антитела, где легкая цепь содержит VL, которая содержит:
(I) аминокислотную последовательность DIVMTQAAPSX36X37VTPGESVSISCRSSKSLX38X39SNGNTYLYWFLQRPGQSPQRLIYYMSNLASGVPDRFSGRGSGTDFTLX40ISRVEAX41DVGVYYCMQX42LEX43PLTFGGGTKLEIK (SEQ ID № 102), в которой X36 представляет собой I или V, X37 представляет собой P или S, X38 представляет собой R или L, X39 представляет собой K или H, X40 представляет собой R или K, X41 представляет собой E или G, X42 представляет собой S или G и X43 представляет собой Y или H,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(II) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 2,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(III) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 22,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(IV) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 42,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(V) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 62,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16;
(VI) аминокислотную последовательность из SEQ ID № 82,
где, необязательно, антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, содержащие легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть, (i) иммуноспецифически связывается с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) не имеет иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует вторую форму MUC16, эта вторая форма не гликозилирована, и где аминокислотная последовательность второй формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) ингибирует инвазию матригеля in vitro клетками, которые рекомбинантно экспрессируют указанную первую форму MUC16.
94. Легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п. 92 или 93, где легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть содержит полученную у человека константную область легкой цепи.
95. Легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п. 94, где константная область легкой цепи или ее антигенсвязывающей части имеет изотип, выбранный из группы, состоящей из каппа и лямбда.
96. Легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п.92, где указанная легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть гуманизирована.
97. Легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть по п.96, где указанная легкая цепь антитела или ее антигенсвязывающая часть представляет собой гуманизированную форму антитела грызуна.
98. Конъюгат легкой цепи антитела, который содержит легкую цепь антитела или ее антигенсвязывающую часть по любому из пп. 92-97, конъюгированную со средством.
99. Конъюгат легкой цепи антитела по п. 98, в котором средство представляет собой визуализирующее средство или цитотоксическое средство.
100. Слитый белок, который содержит легкую цепь антитела по любому одному из пп. 92-99, конъюгированную через пептидный линкер с scFv.
101. Слитый белок по п. 100, в котором scFv связывается с CD3.
102. T-клетка, которая рекомбинантно экспрессирует CAR по п.83.
103. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют scFv по п. 80.
104. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют конъюгат scFv по п. 81 или 82.
105. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют CAR по п. 83.
106. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют тяжелую цепь антитела по любому из пп. 84-89.
107. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют конъюгат тяжелой цепи антитела по п. 90 или 91.
108. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют легкую цепь антитела по любому из пп. 92-97.
109. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют конъюгат легкой цепи антитела по п. 98 или 99.
110. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют слитый белок по п. 100 или 101.
111. Полинуклеотид, который содержит последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют (a) тяжелую цепь антитела по любому из пп. 84-89 или конъюгат тяжелой цепи антитела по п. 90 или 91; и (b) легкую цепь антитела по любому из пп. 92-97, конъюгат легкой цепи антитела по п. 98 или 99 или слитый белок по п. 100 или 101.
112. Вектор, который содержит полинуклеотид по любому из пп. 103-110, функционально связанный с промотором.
113. Вектор, который содержит (a) полинуклеотид по п.106 или 107, функционально связанный с первым промотором; и (b) полинуклеотид по любому из пп. 108-110, функционально связанный со вторым промотором.
114. Клетка ex vivo, которая содержит полинуклеотид по любому из пп. 103-105, функционально связанный с промотором.
115. Клетка ex vivo, которая содержит полинуклеотид по п.106 или 107, функционально связанный с промотором.
116. Клетка ex vivo, которая содержит полинуклеотид по любому из пп. 108-110, функционально связанный с промотором.
117. Клетка ex vivo, которая содержит вектор по п. 112.
118. Клетка ex vivo, которая содержит вектор по п. 113.
119. Клетка ex vivo, которая содержит один или несколько полинуклеотидов, которые кодируют антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-72, функционально связанные с промотором.
120. Способ получения тяжелой цепи антитела, который включает культивирование клетки по п. 115 в таких условиях, что полинуклеотид экспрессируют с помощью клетки для того, чтобы получать тяжелую цепь антитела или конъюгат тяжелой цепи антитела, кодируемые полинуклеотидом.
121. Способ получения легкой цепи антитела, который включает культивирование клетки по п. 116 в таких условиях, что полинуклеотид экспрессируют с помощью клетки для того, чтобы получать легкую цепь антитела, конъюгат легкой цепи антитела или слитый белок, кодируемые полинуклеотидом.
122. Способ получения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, который включает культивирование клетки ex vivo по п. 118 в таких условиях, что полинуклеотид, функционально связанный с первым промотором, и полинуклеотид, функционально связанный со вторым промотор, экспрессируют с помощью клетки для того, чтобы получать (i) тяжелую цепь антитела или конъюгат тяжелой цепи антитела, кодируемые полинуклеотидом; и (ii) легкую цепь антитела, конъюгат легкой цепи антитела или слитый белок, кодируемые полинуклеотидом.
123. Фармацевтическая композиция, которая содержит: терапевтически эффективное количество антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по любому из пп. 1-72, конъюгат антитела по п. 73 или 74, биспецифическое антитело по любому из пп. с 75 до 77, конъюгат биспецифического антитела по п. 78 или 79, scFv по п. 80, конъюгат scFv по п. 81 или 82, CAR по п. 83, тяжелую цепь антитела по любому из пп. 84-89, конъюгат тяжелой цепи антитела по п. 90 или 91, легкую цепь антитела по любому одному из пп. 92-97, конъюгат легкой цепи антитела по п.98 или 99, слитый белок по п. 100 или 101 или T-клетку по п.102; и фармацевтически приемлемый носитель.
124. Способ лечения раке у пациента, нуждающегося в этом, который включает введение указанному пациенту фармацевтической композиции по п. 123.
125. Способ по п. 124, в котором указанная рак представляет собой рак легкого, поджелудочной железы, молочной железы, матки, фаллопиевой трубы или первичной брюшины.
126. Способ по п. 124 или 125, в котором указанная рак представляет собой рак яичника.
127. Способ по любому из пп. 124-126, в котором указанным пациентом является пациент-человек.
128. Способ по любому из пп. 124-127, где способ дополнительно включает введение терапевтически эффективного количества дополнительного терапевтического средства пациенту.
129. Способ по п.128, в котором фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество первого антитела, которое представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-72, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент распознает эпитоп в MUC16, который содержит N-гликозилированный Asn1806 из SEQ ID № 150, но не содержит N-гликозилированный Asn1800 из SEQ ID № 150; где дополнительное терапевтическое средство представляет собой второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, где второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент распознает эпитоп в MUC16, который содержит N-гликозилированный Asn1806 из SEQ ID № 150 и также содержит N-гликозилированный Asn1800 из SEQ ID № 150.
130. Способ по п.129, в котором первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент идентифицируют по (i) его способности иммуноспецифически связывать клетку, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма MUC16 гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) отсутствию у него иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, эта третья форма гликозилирована, где аминокислотная последовательность третьей формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) его способности иммуноспецифически связывать клетку, которая рекомбинантно экспрессирует четвертую форму MUC16, эта четвертая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность четвертой формы представляет собой SEQ ID № 152; и где клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, клетка, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, и клетка, которая рекомбинантно экспрессирует четвертую форму MUC16, относятся к одному типу клеток, и
где второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент идентифицируют по (i) его способности иммуноспецифически связываться с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; и (ii) отсутствию у него иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует пятую форму MUC16, эта пятая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность пятой формы представляет собой SEQ ID № 172, где клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, относится к тому же типу клеток, что и клетка, которая рекомбинантно экспрессирует пятую форму MUC16.
131. Способ по п.128, в котором фармацевтическая композиция содержит терапевтически эффективное количество первого антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые представляют собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент по любому из пп. 1-72, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент распознает эпитоп в MUC16, который содержит N-гликозилированный Asn1806 из SEQ ID № 150, но не содержит N-гликозилированный Asn1800 из SEQ ID № 150; где дополнительное терапевтическое средство представляет собой терапевтически эффективное количество второго антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, где второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент распознает эпитоп в MUC16, который содержит N-гликозилированный Asn1800 из SEQ ID № 150, но не содержит N-гликозилированный Asn1806 из SEQ ID № 150.
132. Способ по п.131, в котором первое антитело или его антигенсвязывающий фрагмент идентифицируют по (i) его способности иммуноспецифически связывать клетку, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма MUC16 гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) отсутствию у него иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, эта третья форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность третьей формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) его способности иммуноспецифически связывать клетку, которая рекомбинантно экспрессирует четвертую форму MUC16, эта четвертая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность четвертой формы представляет собой SEQ ID № 152, где клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, клетка, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, и клетка, которая рекомбинантно экспрессирует четвертую форму MUC16, относятся к одному типу клеток, и
где второе антитело или его антигенсвязывающий фрагмент идентифицируют по (i) его способности иммуноспецифически связываться с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, эта первая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность первой формы представляет собой SEQ ID № 133; (ii) его способности иммуноспецифически связываться с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, эта третья форма MUC16 гликозилирована, и где аминокислотная последовательность третьей формы представляет собой SEQ ID № 139; и (iii) отсутствию у него иммуноспецифического связывания с клеткой, которая рекомбинантно экспрессирует четвертую форму MUC16, эта четвертая форма гликозилирована, и где аминокислотная последовательность четвертой формы представляет собой SEQ ID № 152; и где клетка, которая рекомбинантно экспрессирует первую форму MUC16, клетка, которая рекомбинантно экспрессирует третью форму MUC16, и клетка, которая рекомбинантно экспрессирует четвертую форму MUC16, относятся к одному типу клеток.
133. Иммуногенный гликопептид, который содержит один или несколько участков гликозилирования, где (i) иммуногенный гликопептид составляет от 10 до 60 аминокислотных остатков, от 10 до 30 аминокислотных остатков, от 15 до 25 аминокислотных остатков, от 15 до 20 аминокислотных остатков или от 15 до 18 аминокислотных остатков в длину и (ii) по меньшей мере один из одного или нескольких участков гликозилирования связан с углеводом.
134. Иммуногенный гликопептид по п.133, который содержит один, два или три участка гликозилирования.
135. Иммуногенный гликопептид по п.133, который содержит участок гликозилирования, который связан с углеводом.
136. Иммуногенный гликопептид по п.133, который содержит два участка гликозилирования, каждый из которых связан с углеводом.
137. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-136, в котором углевод представляет собой N- или O-связанный углевод.
138. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-137, в котором углевод представляет собой моносахарид, дисахарид, трисахарид, тетрасахарид или пентасахарид.
139. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-137, в котором углевод представляет собой дисахарид.
140. Иммуногенный гликопептид по п.139, в котором дисахарид представляет собой хитобиозу.
141. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-140, в котором N-конец иммуногенного гликопептида ацетилирован.
142. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-141, в котором C-конец гликопептида находится в форме производного N-метилкарбоксамида.
143. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-142, который конъюгируют с иммуногенным белком-переносчиком.
144. Иммуногенный гликопептид по п.143, где иммуногенным белком-переносчиком является гемоцианин морского блюдца.
145. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-144, который составляет от 15 до 18 аминокислотных остатков в длину.
146. Иммуногенный гликопептид по п.145, который содержит участок гликозилирования, который связан с хитобиозой.
147. Иммуногенный гликопептид по п.145, который содержит два участка гликозилирования, каждый из которых связан с хитобиозой.
148. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-144, который составляет 18 аминокислотных остатков в длину.
149. Иммуногенный гликопептид по п.148, который содержит два участка гликозилирования, каждый из которых связан с хитобиозой.
150. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-144, который составляет 15 аминокислотных остатков в длину.
151. Иммуногенный гликопептид по п.150, который содержит участок гликозилирования, который связан с хитобиозой.
152. Иммуногенный гликопептид по любому из пп. 133-151, который содержит по меньшей мере часть из 10 аминокислот аминокислотной последовательности из SEQ ID № 150, где по меньшей мере один из одного или нескольких участков гликозилирования находится в указанной части аминокислотной последовательности.
153. Иммуногенный гликопептид по п.152, который содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 129.
154. Иммуногенный гликопептид по п.153, который содержит участок гликозилирования в 30-м остатке (Asn) из SEQ ID № 129, который связан с хитобиозой.
155. Иммуногенный гликопептид по п.153, который содержит участок гликозилирования в 30-м остатке (Asn) из SEQ ID № 129, который связан с фрагментом Man3GlcNAc2.
156. Иммуногенный гликопептид по п.152, который содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 130.
157. Иммуногенный гликопептид по п.156, который содержит два участка гликозилирования в 4-м остатке (Asn) и 10-м остатке (Asn) из SEQ ID № 130, каждый из которых связан с хитобиозой.
158. Иммуногенный гликопептид по п.152, который содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 131.
159. Иммуногенный гликопептид по п.158, который содержит участок гликозилирования в 7-м остатке (Asn) из SEQ ID № 131, который связан с хитобиозой.
160. Способ получения антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, которые специфически связываются с гликопротеином, который включает иммунизацию субъекта иммуногенным гликопептидом, который содержит один или несколько участков гликозилирования, где (i) иммуногенный гликопептид составляет от 10 до 60 аминокислотных остатков, от 10 до 30 аминокислотных остатков, от 15 до 25 аминокислотных остатков, от 15 до 20 аминокислотных остатков или от 15 до 18 аминокислотных остатков в длину; (ii) иммуногенный гликопептид содержит по меньшей мере часть из 10 аминокислот аминокислотной последовательности гликопротеина; (iii) по меньшей мере один из одного или нескольких участков гликозилирования связан с углеводом; и (iv) по меньшей мере один из одного или нескольких участков гликозилирования находится в указанной части аминокислотной последовательности.
161. Способ по п.160, в котором антитело или его антигенсвязывающий фрагмент не имеют специфического связывания с не гликозилированной формой гликопротеина.
162. Способ по любому из пп. 160 или 161, в котором субъектом является коза, овца, осел, курица, морская свинка, крыса, кролик или мышь.
163. Способ по любому из пп. 160 или 161, в котором субъектом является крыса, кролик или мышь.
164. Способ по любому из пп. 160 или 161, в котором субъектом является мышь.
165. Способ по любому из пп. 160-164, в котором иммуногенный гликопептид содержит один, два или три участка гликозилирования.
166. Способ по любому из пп. 160-164, в котором иммуногенный гликопептид содержит участок гликозилирования, который связан с углеводом.
167. Способ по любому из пп. 160-164, в котором иммуногенный гликопептид содержит два участка гликозилирования, каждый из которых связан с углеводом.
168. Способ по любому из пп. 160-167, в котором углевод представляет собой N- или O-связанный углевод.
169. Способ по любому из пп. 160-168, в котором углевод представляет собой моносахарид, дисахарид, трисахарид, тетрасахарид или пентасахарид.
170. Способ по любому из пп. 160-168, в котором углевод представляет собой дисахарид.
171. Способ по п.170, в котором дисахарид представляет собой хитобиозу.
172. Способ по любому из пп. 160-171, в котором N-конец иммуногенного гликопептида ацетилирован.
173. Способ по любому из пп. 160-172, в котором C-конец гликопептида находится в форме производного N-метилкарбоксамида.
174. Способ по любому из пп. 160-173, который конъюгируют с иммуногенным белком-переносчиком.
175. Способ по п.174, в котором иммуногенным белком-переносчиком является гемоцианин морского блюдца.
176. Способ по любому из пп. 160-175, в котором иммуногенный гликопептид составляет от 15 до 18 аминокислотных остатков в длину.
177. Способ по п.176, в котором иммуногенный гликопептид содержит участок гликозилирования, который связан с хитобиозой.
178. Способ по п.176, в котором иммуногенный гликопептид содержит два участка гликозилирования, каждый из которых связан с хитобиозой.
179. Способ по любому из пп. 160-175, в котором иммуногенный гликопептид составляет 18 аминокислотных остатков в длину.
180. Способ по п.179, в котором иммуногенный гликопептид содержит два участка гликозилирования, каждый из которых связан с хитобиозой.
181. Способ по любому из пп. 160-175, в котором иммуногенный гликопептид составляет 15 аминокислотных остатков в длину.
182. Способ по п.181, в котором иммуногенный гликопептид содержит участок гликозилирования, который связан с хитобиозой.
183. Способ по любому из пп. 160-182, в котором гликопротеин содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 150.
184. Способ по п.183, в котором иммуногенный гликопептид содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 129.
185. Способ по п.184, в котором иммуногенный гликопептид содержит участок гликозилирования в 30-м остатке (Asn) из SEQ ID № 129, который связан с хитобиозой.
186. Способ по п.184, в котором иммуногенный гликопептид содержит участок гликозилирования в 30-м остатке (Asn) из SEQ ID № 129, который связан с фрагментом Man3GlcNAc2.
187. Способ по п.183, в котором иммуногенный гликопептид содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 130.
188. Способ по п.187, в котором иммуногенный гликопептид содержит два участка гликозилирования в 4-м остатке (Asn) и 10-м остатке (Asn) из SEQ ID № 130, каждый из которых связан с хитобиозой.
189. Способ по п.183, в котором иммуногенный гликопептид содержит аминокислотную последовательность из SEQ ID № 131.
190. Способ по п.189, в котором иммуногенный гликопептид содержит участок гликозилирования в 7-м остатке (Asn) из SEQ ID № 131, который связан с хитобиозой.