Эндофитные композиции и способы улучшения признаков растений - RU2019129891A

1. Способ улучшения агрономически важного признака у растения сои, включающий гетерологичное нанесение эндофита на элемент растения сои в количестве, эффективном для улучшения агрономически важного признака у растения, полученного из указанного обработанного элемента растения, относительно растения, полученного из контрольного элемента растения, при этом

a. указанный эндофит является представителем рода Periconia и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32 и 33, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466; или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Periconia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, и при этом агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня и области корня; или

b. указанный эндофит является представителем рода Curvularia и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 34-38, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Curvularia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, при этом агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня, области корня и урожайности.

2. Способ улучшения агрономически важного признака у растения пшеницы, включающий гетерологичное нанесение эндофита на элемент растения пшеницы в количестве, эффективном для улучшения агрономически важного признака у растения, полученного из указанного обработанного элемента растения, относительно растения, полученного из контрольного элемента растения, при этом а. указанный эндофит является членом рода Curvularia и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32 и 33; (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Periconia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, и при этом агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из скорости прорастания, биомассы сухого побега и урожайности;

b. указанный эндофит является членом рода Coniochaeta и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 34-38, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Curvularia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, и при этом агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня и урожайности;

c. указанный эндофит является членом рода Aspergillus и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную SEQ ID NO: 39, и при этом агрономически важным признаком является урожайность;

d. указанный эндофит является членом рода Coniochaeta и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 40-43, и при этом агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из скорости прорастания, длины корня, биомассы сухого побега и урожайности; или

e. указанный эндофит является членом рода Pestalotiopsis и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 44-48, и при этом агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из скорости прорастания, и биомассы сухого побега.

3. Способ улучшения агрономически важного признака у растения кукурузы, включающий гетерологичное нанесение эндофита на элемент растения кукурузы в количестве, эффективном для улучшения агрономически важного признака у растения, полученного из указанного обработанного элемента растения, относительно растения, полученного из контрольного элемента растения, при этом

a. указанный эндофит является представителем рода Periconia и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32 и 33, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Periconia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, и при этом агрономически важным признаком является урожайность; или

b. указанный эндофит является членом рода Curvularia и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 34-38, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Curvularia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, и при этом агрономически важным признаком является урожайность.

4. Способ улучшения агрономически важного признака у растения риса, включающий гетерологичное нанесение эндофита на элемент растения риса в количестве, эффективном для улучшения агрономически важного признака у растения, полученного из указанного обработанного элемента растения, относительно растения, полученного из контрольного элемента растения, при этом а. указанный эндофит является представителем рода Coniochaeta и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 40 и 43, и при этом агрономически важным признаком является биомасса сухих корней; или

b. указанный эндофит является членом рода Enterobacter и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 49-51, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67465, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Enterobacter, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67465, и при этом агрономически важным признаком является биомасса сухих корней.

5. Способ по любому из предшествующих пунктов, в котором элемент растения представляет собой семя, при этом необязательно указанное семя является модифицированным, и/или

в котором указанный эндофит гетерологично наносится на элемент растения в препарате, дополнительно содержащем одно или несколько из следующего: стабилизатор, консервант, носитель, поверхностно-активное вещество, фунгицид, нематоцид, бактерицид, инсектицид или гербицид, или любую их комбинацию,

в котором указанный процент идентичности составляет, по меньшей мере, 98%, по меньшей мере, 99% или 100%, и/или

в котором указанный процент идентичности определяется по области выравнивания из, по меньшей мере, 100 нуклеотидов, по меньшей мере, 200 нуклеотидов, по меньшей мере, 300 нуклеотидов, по меньшей мере, 400 нуклеотидов или, по меньшей мере, 500 нуклеотидов.

6. Агрохимически активный микробный препарат, содержащий по меньшей мере одно масло, поверхностно-активное вещество, полимер и микробный активный ингредиент, причем указанный микробный активный ингредиент выбран из:

а. эндофита рода Periconia, содержащего, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32 и 33;

b. эндофита рода Periconia, который депонированного в депозитарии культур NRRL под №67466;

c. модифицированного эндофита рода Periconia, полученного из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466;

d. эндофита рода Curvularia, содержащего, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 34-38;

e. эндофита рода Curvularia, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467;

f. модифицированного эндофита рода Curvularia, полученного из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467;

g. эндофита рода Aspergillus, содержащего, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности SEQ ID NO: 39;

h. эндофита рода Coniochaeta, содержащего, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 40-43;

i. эндофита рода Enterobacter, содержащего, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 49-51;

j. эндофита рода Enterobacter, депонированного в депозитарии культур NRRL под №В67465; и

k. модифицированного эндофита рода Enterobacter, полученного из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №В67465.

7. Препарат по п. 6, отличающийся тем, что указанное масло представляет собой масло рапса или NEEM, и/или отличающийся тем, что указанное масло содержит эруковую кислоту, и/или отличающийся тем, что указанное масло обладает гербицидными или инсектицидными свойствами, и/или отличающийся тем, что указанное поверхностно-активное вещество представляет собой неионный детергент, и/или отличающийся тем, что указанное поверхностно-активное вещество представляет собой Твин-20 или Тритон Х-100,

и/или отличающийся тем, что указанный полимер представляет собой Flo Rite®, DISCO™ или Kannar® Universal Wonder,

и/или отличающийся тем, что указанный микробный активный ингредиент содержит суспензию спор,

и/или отличающийся тем, что указанный микробный активный ингредиент содержит споры, высушенные распылением,

и/или отличающийся тем, что указанный микробный активный ингредиент содержит полную клеточную среду,

и/или отличающийся тем, что указанный препарат дополнительно содержит одно или несколько из следующего: фунгицид, нематоцид, бактерицид, инсектицид или гербицид,

и/или отличающийся тем, что указанный препарат дополнительно содержит одно или несколько из следующего: стабилизатор, консервант, носитель, противокомплексный агент или любую их комбинацию, и/или отличающийся тем, что указанный эндофит является стабильным при хранении,

и/или отличающийся тем, что указанный процент идентичности составляет, по меньшей мере, 98%, по меньшей мере, 99% или 100%,

и/или отличающийся тем, что указанный процент идентичности определяется по области выравнивания из, по меньшей мере, 100 нуклеотидов, по меньшей мере, 200 нуклеотидов, по меньшей мере, 300 нуклеотидов, по меньшей мере, 400 нуклеотидов или, по меньшей мере, 500 нуклеотидов.

8. Синтетическая композиция, содержащая элемент растения и гетерологично нанесенный эндофит, при этом указанная синтетическая композиция способна обеспечить улучшенный агрономически важный признак, по сравнению с контрольным элементом растения, дополнительно не содержащим указанный эндофит, и при этом указанный эндофит выбран из:

a. члена рода Periconia, при этом указанный эндофит (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 32 и 33, необязательно при этом указанный эндофит содержит полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную каждой из последовательностей в группе, состоящей из SEQ ID NO: 32 и 33, (ii) является членом рода Periconia, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Periconia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67466, при этом необязательно указанный эндофит таксономически относится к Periconia macrospinosa, и/или указанный элемент растения принадлежит к роду Triticum, а улучшенный агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из скорости прорастания, биомассы сухого побега и урожайности, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Glycine, а улучшенный агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня и области корня, и/или при этом элемент растения относится к роду Zea, а улучшенный агрономически важный признак представляет собой урожайность;

b. члена рода Curvularia, при этом указанный эндофит (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 34-38, при этом указанная синтетическая композиция способна обеспечить улучшенный агрономически важный признак, по сравнению с контрольным элементом растения, дополнительно не содержащим указанный эндофит, при этом необязательно указанный эндофит содержит полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную, по меньшей мере, двум, трем, четырем или пяти последовательностям, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 34-38, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Curvularia, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарии культур NRRL под №67467, при этом необязательно указанный эндофит таксономически относится к Curvularia spicifera, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Triticum, а улучшенный агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня и урожайности, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Glycine, а улучшенный агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня, скорости прорастания и урожайности, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Zea, а улучшенный агрономически важный признак представляет собой урожайность;

c. представителя рода Aspergillus и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную SEQ ID NO. 39, при этом необязательно указанный эндофит таксономически относится к Aspergillus ruber, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Triticum, а улучшенный агрономически важный признак представляет собой урожайность;

d. члена рода Coniochaeta и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 40-43, при этом необязательно указанный эндофит содержит полинуклеотидные последовательности, по меньшей мере, на 97% идентичные по меньшей мере двум, по меньшей мере, трем последовательностям, по меньшей мере, четырем последовательностям, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 40-43, и/или при этом указанный эндофит таксономически относится к Coniochaeta prunicola, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Triticum, а улучшенный агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из длины корня, скорости прорастания, биомассы сухого побега и урожайности, и/или при этом указанный элемент растения принадлежит к роду Oryza, а улучшенный агрономически важный признак представляет собой биомассу сухого корня;

e. члена рода Pestalotiopsis и содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 44-48, при этом указанный эндофит содержит полинуклеотидные последовательности, по меньшей мере, на 97% идентичные по меньшей мере двум, по меньшей мере трем, по меньшей мере четырем, по меньшей мере пяти последовательностям, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 44-48, и/или при этом указанный эндофит таксономически относится к Pestalotiopsis neglecta, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Triticum, а улучшенный агрономически важный признак выбран из группы, состоящей из скорости прорастания и биомассы сухого побега;

f. члена рода Enterobacter и (i) содержит, по меньшей мере, одну полинуклеотидную последовательность, по меньшей мере, на 97% идентичную последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 49-51, при этом необязательно указанный эндофит содержит полинуклеотидные последовательности, по меньшей мере, на 97% идентичные по меньшей мере двум, по меньшей мере трем последовательностям, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 49-51, и/или при этом указанный эндофит содержит полинуклеотидные последовательности, по меньшей мере на 97% идентичные по меньшей мере трем последовательностям, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NOs: 49-51, (ii) депонирован в депозитарии культур NRRL под №В67465, или (iii) представляет собой модифицированный эндофит рода Enterobacter, полученный из эндофита, который депонирован в депозитарий культур NRRL под №В67465, при этом необязательно указанный эндофит таксономически относится к Enterobacter cowanii, и/или при этом указанный элемент растения относится к роду Oryza, а улучшенный агрономически важный признак представляет собой биомассу сухого корня.

9. Синтетическая композиция по п. 8, отличающаяся тем, что указанный улучшенный агрономически важный признак придается в нормальных условиях полива, и/или при этом указанный элемент растения представляет собой семя, при этом семя является модифицированным,

и/или синтетическая композиция помещена в субстрат, способствующий росту растений,

необязательно при этом, что указанный субстрат, способствующий росту растений, представляет собой почву,

и/или дополнительно содержащая препарат, который содержит одно или несколько из следующего: стабилизатор, консервант, носитель, поверхностно-активное вещество, противокомплексный агент или любую их комбинацию;

и/или дополнительно содержащая препарат, который содержит одно или несколько из следующего: фунгицид, нематоцид, бактерицид, инсектицид или гербицид,

и/или при этом указанная композиция ограничена объектом, выбранным из группы, состоящей из: бутылки, банки, ампулы, упаковки, сосуда, пакета, коробки, корзины, конверта, картонной коробки, контейнера, бункера, транспортировочного контейнера, кузова грузовика или ящика,

и/или при этом указанные синтетические комбинации являются устойчивыми при хранении;

и/или при этом указанный процент идентичности составляет, по меньшей мере, 98%, по меньшей мере, 99% или 100%;

и/или при этом указанный процент идентичности определяется по области выравнивания из, по меньшей мере, 100 нуклеотидов, по меньшей мере, 200 нуклеотидов, по меньшей мере, 300 нуклеотидов, по меньшей мере, 400 нуклеотидов или, по меньшей мере, 500 нуклеотидов.

10. Синтетическая композиция по п. 8 или 9, отличающаяся тем, что указанная композиция является подходящей для помещения на почву рядами с по существу постоянным расстоянием между каждой композицией в каждом ряду.