Код документа: RU2697152C2
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
Настоящее изобретение зарегистрировано вместе с перечнем последовательностей в электронном формате. Перечень последовательностей представлен в виде файла под названием CORE0115WOSEQ_ST25.txt, созданного 1 мая 2014 года, размером 692 Кб. Информация о перечне последовательностей в электронном формате в полном объеме включена в настоящий документ посредством ссылки.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Принцип, лежащий в основе антисмысловой технологии, заключается в том, что антисмысловое соединение гибридизуется с целевой нуклеиновой кислотой и модулирует количество, активность и/или функцию целевой нуклеиновой кислоты. Например, в некоторых случаях антисмысловые соединения приводят к изменению транскрипции или трансляции мишени. Такое модулирование экспрессии может быть достигнуто, например, разрушением целевой мРНК или ингибированием на основании занятости. Пример модулирования целевой функции РНК за счет разрушения представляет собой разрушение за счет РНКазы Н целевой РНК при гибридизации с ДНК-подобным антисмысловым соединением. Другой пример модулирования генной экспрессии за счет направленного разрушения представляет собой РНК-интерференция (РНКи). РНКи относится к антисмысл-опосредованному сайленсингу гена по механизму, в котором применяется РНК-индуцируемый комплекс сайленсинга (RISC). Дополнительный пример модулирования целевой функции РНК представляет собой механизм на основании занятости, такой как использует в естественных условиях микроРНК. МикроРНК представляют собой небольшие некодирующие РНК, которые регулируют экспрессию РНК, кодирующих белки. Связывание антисмыслового соединения с микроРНК препятствует связыванию микроРНК с ее матричными РНК мишенями, и, следовательно, затрудняет функцию микроРНК. МикроРНК-миметики могут усиливать естественную функцию микроРНК. Некоторые антисмысловые соединения изменяют сплайсинг пре-мРНК. Независимо от конкретного механизма, специфичность в отношении последовательностей делает антисмысловые соединения перспективными в качестве средств для подтверждения наличия цели и функционализации генов, а также в качестве терапевтических средств для селективного модулирования экспрессии генов, участвующих в патогенезе заболеваний.
Антисмысловая технология представляет собой эффективный способ модулирования экспрессии одного или более специфических генных продуктов и, следовательно, может быть признана исключительно подходящей в ряде терапевтических, диагностических и исследовательских применений. Химически модифицированные нуклеозиды могут быть внедрены в антисмысловые соединения для усиления одного или более свойств, таких как устойчивость к нуклеазе, фармакокинетика или аффинность к целевой нуклеиновой кислоте. В 1998 году антисмысловое соединение Vitravene® (фомивирсен; разработанный компанией Isis Pharmaceuticals Inc., Карлсбад, штат Калифорния) стал первым антисмысловым лекарством, получившим разрешение на продажу от Администрации США по пищевым продуктам и лекарственным веществам (FDA), и в настоящее время представляет собой средство для лечения вызванного цитомегаловирусом (CMV) ретинита у пациентов со СПИДом. В качестве другого примера, антисмысловый олигонуклеотид, направленный на ApoB, KYNAMRO™, был одобрен Администрацией США по пищевым продуктам и лекарственным веществам (FDA) в качестве вспомогательного средства для гиполипидемических лекарств и диет для снижения содержания холестерина липрпротеинов низкой плотности (LDL-C), ApoB, общего холестерина (TC) и холестерина липопротеинов невысокой плотности (не-HDL-C) у пациентов с гомозиготной семейной гиперхолестеринемией (HoFH).
Новые химические модификации обладают улучшенной активностью и эффективностью антисмысловых соединений, раскрывая потенциал для пероральной доставки, а также для усовершенствования подкожного введения, снижения возможных побочных эффектов, и приводят к улучшению удобства для пациента. Химические модификации, усиливающие активность антисмысловых соединений, позволяют осуществлять введение более низких доз, что снижает возможность токсичности, а также уменьшает общую стоимость лечения. Модификации, увеличивающие устойчивость к разрушению, приводят к более медленному выведению из организма, обеспечивая возможность менее частого введения доз. Различные типы химических модификаций могут быть комбинированы в одном соединении для дальнейшей оптимизации эффективности соединения.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены сопряженные антисмысловые соединения. В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены сопряженные антисмысловые соединения, содержащие антисмысловый олигонуклеотид, комплементарный транскрипту нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены способы, включающие контакт клетки с сопряженным антисмысловым соединением, содержащим антисмысловый олигонуклеотид, комплементарный транскрипту нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены способы, включающие контакт клетки с сопряженным антисмысловым соединением, содержащим антисмысловый олигонуклеотид, и уменьшение количества или активности транскрипта нуклеиновой кислоты в клетке.
Ранее был описан асиалогликопротеиновый рецептор (ASGP-R). См., например, Park et al., PNAS, том 102, №47, cc. 17125-17129 (2005). Такие рецепторы экспрессируются на клетках печени, в частности, гепатоцитах. Кроме того, было показано, что соединения, содержащие кластеры трех N-ацетилгалактозаминовых (GalNAc) лигандов, способны связываться с ASGP-R, приводя к захвату указанного соединения в клетку. См., например, Khorev et al., Bioorganic and Medicinal Chemistry, 16, 9, cc. 5216-5231 (май, 2008). Соответственно, конъюгаты, содержащие такие кластеры GalNAc, применяли для облегчения захвата некоторых соединений в клетки печени, в частности, гепатоциты. Например, было показано, что некоторые GalNAc-содержащие конъюгаты увеличивают активность дуплексных миРНК соединений в клетках печени in vivo. В таких случаях GalNAc-содержащий конъюгат, как правило, прикрепляется к смысловой спирали дуплекса миРНК. Поскольку смысловая спираль отбрасывается перед окончательной гибридизацией антисмысловой спирали с целевой нуклеиновой кислотой, то маловероятно, что такой конъюгат будет влиять на активность. Как правило, конъюгат присоединяется к 3'-концу смысловой спирали миРНК. См., например, патент США 8106022. Некоторые группы конъюгата, описанные в настоящем документе, более активны и/или синтезируются легче, чем группы конъюгата, описанные ранее.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения конъюгаты присоединяются к односпиральным антисмысловым соединениям, включая, но не
ограничиваясь ими, антисмысловые соединения на основе РНКазы H и антисмысловые соединения, которые изменяют сплайсинг целевой нуклеиновой кислоты пре-мРНК. В таких вариантах реализации конъюгат должен оставаться присоединенным к антисмысловому соединению достаточно долго для обеспечения преимущества (улучшенного захвата в клетки), но затем он должен либо расщепляться, либо иным образом не препятствовать последующим стадиям, необходимым для активности, таким как гибридизация с целевой нуклеиновой кислотой и взаимодействие с РНКазой H или ферментами, связанными со сплайсингом или модулированием сплайсирования. Такой баланс свойств более важен при осаждении односпиральных антисмысловых соединений, чем соединений миРНК, где конъюгат может быть просто присоединен к смысловой спирали. В настоящем документе описаны односпиральные антисмысловые соединения, обладающие улучшенной активностью в клетках печени in vivo, по сравнению с таким же антисмысловым соединением, не имеющим конъюгата. Учитывая необходимый баланс свойств для этих соединений, такая улучшенная активность является неожиданной.
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата по настоящему документу содержат расщепляемый фрагмент. Как было отмечено, не ограничиваясь каким-либо механизмом, логично, что конъюгат должен сохраняться у соединения достаточно долго для обеспечения усиления захвата, но после этого желательно, чтобы некоторая его часть или, в идеале, весь конъюгат расщеплялся, выделяя исходное соединение (например, антисмысловое соединение) в его наиболее активной форме. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый нуклеозид. Такие варианты реализации обладают преимуществом эндогенных нуклеаз в клетке за счет присоединения остальной части конъюгата (кластера) к антисмысловому олигонуклеотиду через нуклеозид при помощи одной или более расщепляемых связей, таких как фосфодиэфирные связи. В некоторых вариантах реализации кластер связан с расщепляемым нуклеозидом через фосфодиэфирную связь. В некоторых вариантах реализации расщепляемый нуклеозид присоединен к антисмысловому олигонуклеотиду (антисмысловому соединению) фосфодиэфирной связью. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата может содержать два или три расщепляемых нуклеозида. В таких вариантах реализации указанные расщепляемые нуклеозиды связаны друг с другом, с антисмысловым соединением и/или с кластером посредством расщепляемых связей (таких
как фосфодиэфирная связь). Некоторые конъюгаты по настоящему документу не содержат расщепляемый нуклеозид, а вместо этого содержат расщепляемую связь. Показано, что достаточное расщепление конъюгата из олигонуклеотида обеспечивается по меньшей мере за счет одной связи, которая легко поддается расщеплению в клетке (расщепляемая связь).
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения представляют собой пролекарства. Такие пролекарства вводят животному, и они в конечном итоге метаболизируются до более активной формы. Например, сопряженные антисмысловые соединения расщепляются с удалением всего или части конъюгата, приводя к активной (или более активной) форме антисмыслового соединения, не содержащего всего или части конъюгата.
В некоторых вариантах реализации конъюгаты присоединены у 5'-конца олигонуклеотида. Некоторые такие 5'-конъюгаты расщепляются более эффективно, чем аналоги, имеющие такую же группу конъюгата, присоединенную у 3'-конца. В некоторых вариантах реализации улучшенная активность может коррелировать с улучшенным расщеплением. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие конъюгат у 5'-конца, обладают более высокой эффективностью, чем олигонуклеотиды, содержащие конъюгат у 3'-конца (см., например, Примеры 56, 81, 83 и 84). Кроме того, 5'-присоединение обеспечивает более простой синтез олигонуклеотида. Как правило, олигонуклеотиды синтезируют на твердой подложке в направлении от 3' к 5'. Для получения 3'-сопряженного олигонуклеотида, как правило присоединяют предварительно сопряженный 3'-нуклеозид к твердой подложке, а затем обычным путем создают олигонуклеотид. Однако присоединение такого сопряженного нуклеозида к твердой подложке усложняет синтез. Кроме того, применяя такой подход, конъюгат затем присутствует в ходе всего синтеза олигонуклеотида и может разрушаться во время последующих стадий или может ограничивать типы реакций и реагентов, которые можно применять. Применяя структуры и методики, описанные в настоящем документе для 5'-сопряженных олигонуклеотидов, можно синтезировать олигонуклеотид при помощи стандартных автоматизированных методик и внедрять в конъюгат окончательный (5'-ближайший) нуклеозид или после отделения олигонуклеотида от твердой подложки.
С учетом известного уровня техники и настоящего описания, специалисты в данной области техники могут легко получить любые из конъюгатов и сопряженных
олигонуклеотидов, описанных в настоящем документе. Кроме того, синтез некоторых таких конъюгатов и сопряженных олигонуклеотидов, описанных в настоящем документе, проще и/или требует меньше стадий и, следовательно, менее дорогой, чем синтез ранее описанных конъюгатов, что дает преимущество при производстве. Например, синтез некоторых групп конъюгата состоит из меньшего количество синтетических стадий, что приводит к увеличению выхода, по сравнению с ранее описанными группами конъюгата. Группы конъюгатов, такие как GalNAc3-10 в Примере 46 и GalNAc3-7 в Примере 48, гораздо проще, чем ранее описанные конъюгаты, такие как описаны в публикациях U.S. 8106022 или U.S. 7262177, для которых необходима сборка большего количества химических промежуточных соединений. Соответственно, эти и другие конъюгаты, описанные в настоящем документе, обладают преимуществом по сравнению с ранее описанными соединениями для применения с любым олигонуклеотидом, включая односпиральные олигонуклеотиды и любую спираль двухспиральных олигонуклеотидов (например, миРНК).
Точно так же в настоящем документе описаны группы конъюгатов, имеющие только один или два лиганда GalNAc. Как показано, такие сопряженные группы усиливают активность антисмысловых соединений. Такие соединения гораздо проще получить, чем конъюгаты, содержащие три лиганда GalNAc. Группы конъюгатов, содержащие один или два лиганда GalNAc, могут быть присоединены к любым антисмысловым соединениям, включая односпиральные олигонуклеотиды и любую спираль двухспиральных олигонуклеотидов (например, миРНК).
В некоторых вариантах реализации конъюгаты, описанные в настоящем документе, существенно не изменяют некоторые показатели переносимости. Например, в настоящем документе показано, что сопряженные антисмысловые соединения являются не более иммуногенными, чем не сопряженные исходные соединения. Поскольку активность улучшается, то варианты реализации, в которых переносимость остается такой же (или, в действительности, если даже переносимость ухудшается лишь незначительно, по сравнению с приростом активности), обладают улучшенными характеристиками для терапии.
В некоторых вариантах реализации сопряжение позволяет изменять антисмысловые соединения так, чтобы они обладали менее выраженными последствиями в отсутствие сопряжения. Например, в некоторых вариантах реализации замена одной или более тиофосфатных связей полностью тиофосфатного антисмыслового соединения на
фосфодиэфирные связи приводит к улучшению некоторых показателей переносимости. Например, в некоторых случаях такие антисмысловые соединения, имеющие один или более фосфодиэфиров, являются менее иммуногенными, чем такие же соединения, в которых каждая связь представляет собой тиофосфат. Однако в некоторых случаях, как показано в Примере 26, такое же замещение одной или более тиофсофатных связей на фосфодиэфирные связи приводит также к снижению клеточного захвата и/или к снижению активности. В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения, описанные в настоящем документе, допускают такое изменение связей с небольшим снижением или без снижения захвата и активности, по сравнению с сопряженным полностью тиофосфатным аналогом. В действительности, в некоторых вариантах реализации, например, в Примерах 44, 57, 59 и 86, олигонуклеотиды, содержащие конъюгат и по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, фактически демонстрируют повышенную активность in vivo даже по сравнению с полностью тиофосфатным аналогом, также содержащим такой же конъюгат. Более того, поскольку сопряжение приводит к значительному увеличению захвата/активности, то небольшое снижение такого существенного прироста может быть приемлемым для достижения улучшенной переносимости. Соответственно, в некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения содержат по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь.
В некоторых вариантах реализации сопряжение антисмысловых соединений по настоящему документу приводит к улучшенной доставке, захвату и активности в гепатоцитах. Следовательно, в ткань печени доставляется большее количество соединения. Однако в некоторых вариантах реализации изобретения такая улучшенная доставка сама по себе не объясняет общего увеличения активности. В некоторых таких вариантах реализации изобретения большее количество соединения поступает в гепатоциты. В некоторых вариантах реализации изобретения даже такой улучшенный захват гепатоцитов сам по себе не объясняет общего увеличения активности. В таких вариантах реализации изобретения увеличивается продуктивный захват сопряженного соединения. Например, как показано в Примере 102, некоторые варианты реализации GalNAc-содержащих конъюгатов увеличивают обогащение антисмысловых олигонуклеотидов в гепатоцитах, по сравнению с не паренхимальными клетками. Такое обогащение преимущественно для олигонуклеотидов, которые направлены на гены, экспрессируемые в гепатоцитах.
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения по настоящему документу приводят к уменьшению воздействия на почки. Например, как показано в Примере 20, концентрации антисмысловых олигонуклеотидов, содержащих некоторые варианты реализации GalNAc-содержащих конъюгатов, в почках ниже, чем концентрации антисмысловых олигонуклеотидов, не имеющих GalNAc-содержащего конъюгата. Это имеет несколько преимущественных терапевтических применений. Для терапевтических показаний, в которых не требуется проявление активности в почках, воздействие на почки подвергает их риску токсичности без соответствующей пользы. Более того, высокая концентрация в почках обычно приводит к выводу соединения с мочой, обеспечивая более быстрое выведение. Соответственно, для внепочечных мишеней накопление в почках является нежелательным.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены сопряженные антисмысловые соединения, представленные формулой:
где
A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
C представляет собой линкер конъюгата;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
На представленной выше схеме и в аналогичных схемах в настоящем документе группа ветвления «D» разветвляется такое количество раз, которое необходимо для соответствия количеству групп (E-F), указанному количеством «q». Так, если q=1, то формула представляет собой:
если q=2, то формула представляет собой:
если q=3, то формула представляет собой:
если q=4, то формула представляет собой:
если q=5, то формула представляет собой:
В некоторых вариантах реализации изобретения представлены сопряженные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
В некоторых вариантах реализации изобретения представлены сопряженные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
В некоторых вариантах реализации изобретения представлены сопряженные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
В некоторых вариантах реализации изобретения представлены сопряженные антисмысловые соединения, имеющие структуру:
В настоящем описании представлены следующие не ограниченные нумерованные варианты реализации изобретения:
Вариант реализации 1. Сопряженное антисмысловое соединение, содержащее:
антисмысловый олигонуклеотид, содержащий 12-30 связанных нуклеозидов и группу конъюгата, при этом группа конъюгата содержит: расщепляемый фрагмент; линкер конъюгата; и фрагмент, направляющий на клетку.
Вариант реализации 2. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 1, в котором:
расщепляемый фрагмент ковалентно связан с антисмысловым олигонуклеотидом;
линкер конъюгата ковалентно связан с расщепляемым фрагментом; и
фрагмент, направляющий на клетку, ковалентно связан с линкером конъюгата.
Вариант реализации 3. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 1 или 2, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит группу ветвления.
Вариант реализации 4. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 3, в котором группа ветвления ковалентно присоединена к линкеру конъюгата.
Вариант реализации 5. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-4, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере одну связку.
Вариант реализации 6. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 5, в котором по меньшей мере одна связка ковалентно присоединена к группе ветвления.
Вариант реализации 7. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-6, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 8. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 7, в котором каждый по меньшей мере из одного лиганда ковалентно присоединен к связке.
Вариант реализации 9. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 1-8, в котором соединение имеет структуру, представленную формулой I, изображенной ниже:
где
A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
C представляет собой линкер конъюгата;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 10. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-9, в котором расщепляемый фрагмент содержит 1-4 связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов, при этом связь между антисмысловым олигонуклеотидом и первым расщепляемым фрагментом нуклеозида представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 11. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 10, в котором каждая межнуклеозидная связь между каждым из связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 12. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 10 или 11, в котором расщепляемый фрагмент содержит 1-3 связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов.
Вариант реализации 13. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 10 или 11, в котором расщепляемый фрагмент содержит 1-2 связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов.
Вариант реализации 14. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 10, в котором расщепляемый фрагмент содержит один расщепляемый фрагмент нуклезида.
Вариант реализации 15. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-14, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый фрагмент нуклеозида, выбранного из группы, состоящей из пурина, замещенного пурина, пиримидина или замещенного пиримидина.
Вариант реализации 16. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-14, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый фрагмент нуклеозида, выбранного из цитидина, уридина, аденозина, тимидина и гуанозина.
Вариант реализации 17. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-14, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый фрагмент дезоксинуклеозида, выбранного из дезоксиаденозина, дезоксигуанозина, дезоксиинозина, тимидина, дезоксиуридина и дезоксицитидина.
Вариант реализации 18. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-17, в котором расщепляемый фрагмент содержит дезоксиаденозин.
Вариант реализации 19. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-18, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой дезоксиаденозин.
Вариант реализации 20. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-19, в котором расщепляемый фрагмент имеет структуру, выбранную из:
где каждый из Bx, Bx1, Bx2 и Bx3 независимо представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 21. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 20, в котором гетероциклический основной фрагмент выбран из: урацила., тимина, цитозина, 5-метилцитозина, аденина или гуанина.
Вариант реализации 22. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-19, в котором расщепляемый фрагмент имеет структуру:
Вариант реализации 23. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-22, в котором линкер конъюгата содержит пирролидин.
Вариант реализации 24. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-23, в котором линкер конъюгата содержит ПЭГ.
Вариант реализации 25. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-24, в котором линкер конъюгата содержит амид.
Вариант реализации 26. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-25, в котором линкер конъюгата содержит полиамид.
Вариант реализации 27. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-26, в котором линкер конъюгата содержит амин.
Вариант реализации 28. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-27, в котором линкер конъюгата содержит одну или более дисульфидных связей.
Вариант реализации 29. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-28, в котором линкер конъюгата содержит белковый связывающий фрагмент.
Вариант реализации 30. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 29, в котором белковый связывающий фрагмент содержит липид.
Вариант реализации 31. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 30, в котором белковый связывающий фрагмент выбран из: холестерина, холевой кислоты, адамантан-уксусной кислоты, 1-пирен-масляной кислоты, дигидротестостерона, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерина, геранилоксигексиловой группы, гексадецилглицерина, борнеола, ментола, 1,3-пропандиола, гептадециловой группы,
пальмитиновой кислоты, миристиновой кислоты, O3-(олеоил)литохолевой кислоты, O3-(олеоил)холеновой кислоты, диметокситритила или феноксазина, витамина (например, фолата, витамина A, витамина E, биотина, пиридоксаля), пептида, углевода (например, моносахарида, дисахарида, трисахарида, тетрасахарида, олигосахарида, полисахарида), эндосомолитического компонента, стероида (например, уваола, гецигенина, диосгенина), терпена (например, тритерпена, сарсасапогенина, фриделина, литохолевой кислоты, дериватизованной эпифриделанолом) или катионного липида.
Вариант реализации 32. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-31, в котором белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от C16 до C22, холестерин, холевую кислоту, витамин E, адамантан или 1-пентафторпропил.
Вариант реализации 33. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-32, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20; и p равен от 1 до 6. В таких вариантах реализации изобретения, которые содержат более одного n, каждый n выбран независимо.
Вариант реализации 34. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-33, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную
из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 35. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-33, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 36. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-33, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 37. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-33, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 38. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-33, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 39. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-33, в котором линкер конъюгата имеет структуру:
Вариант реализации 40. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-39, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит углевод.
Вариант реализации 41. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-40, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит углеводный кластер.
Вариант реализации 42. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-41, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит лиганд рецептора клеточной поверхности.
Вариант реализации 43. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-42, в котором направляющий фрагмент содержит по меньшей мере один N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 44. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-43, в котором направляющий фрагмент содержит группу ветвления.
Вариант реализации 45. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 44, в котором группа ветвления содержит простой эфир.
Вариант реализации 46. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 44 или 45, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
Вариант реализации 47. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 44 или 45, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 48. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 44 или 45, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 49. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 44 или 45, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 50. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-49, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит связку.
Вариант реализации 51. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-49, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит две связки.
Вариант реализации 52. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-49, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит три связки.
Вариант реализации 53. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-49, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит четыре или более связок.
Вариант реализации 54. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-53, в котором по меньшей мере одна связка содержит ПЭГ.
Вариант реализации 55. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-54, в котором по меньшей мере одна связка содержит амид.
Вариант реализации 56. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-55, в котором по меньшей мере одна связка содержит полиамид.
Вариант реализации 57. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-56, в котором по меньшей мере одна связка содержит амин.
Вариант реализации 58. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-57, в котором по меньшей мере две связки отличны друг от друга.
Вариант реализации 59. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-57, в котором все связки являются одинаковыми.
Вариант реализации 60. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-59, в котором каждая связка выбрана из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый p равен от 1 до около 6.
Вариант реализации 61. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-60, в котором каждая связка выбрана из:
Вариант реализации 62. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-61, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 63. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-61, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
Вариант реализации 64. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-63, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 65. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 64, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит один лиганд.
Вариант реализации 66. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 64, в котором направляющий фрагмент содержит два лиганда.
Вариант реализации 67. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 64, в котором направляющий фрагмент содержит три лиганда.
Вариант реализации 68. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 64-67, в котором лиганд ковалентно присоединен к каждой связке.
Вариант реализации 69. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-68, в котором по меньшей мере один лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 70. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-69, в котором каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 71. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-70, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-(O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида,
2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 72. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-71, в котором лиганд представляет собой галактозу.
Вариант реализации 73. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-71, в котором лиганд представляет манноза-6-фосфат.
Вариант реализации 74. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-71, в котором каждый лиганд выбран из:
где каждый R1 выбран из OH и NHCOOH.
Вариант реализации 75. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-71, в котором каждый лиганд выбран из:
Вариант реализации 76. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-71, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 77. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-71, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 78. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-77, в котором каждая группа, направляющая на клетку, имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 79. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-77, в котором каждая группа, направляющая на клетку, имеет следующую структуру:
Вариант реализации 80. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-79, в котором конъюгат имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Z представляет собой H или связанную твердую подложку;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение;
X представляет собой O или S; и
Bx представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 81. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-79, в котором конъюгат имеет следующую структуру:
где Z представляет собой H или связанную твердую подложку;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение.
Вариант реализации 82. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-81, в котором группа конъюгата присоединена в 2'-положении нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 83. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-81, в котором группа конъюгата присоединена в 3'-положении нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 84. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-81, в котором группа конъюгата присоединена в 5'-положении нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 85. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-82, в котором группа конъюгата присоединена к 5'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 86. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-84, в котором группа конъюгата присоединена к 3'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 87. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-84, в котором группа конъюгата присоединена к внутреннему нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 88. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-87, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного антисмыслового соединения в гепатоцит, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 89. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-88, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного антисмыслового соединения в клетку печени, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 90. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-89, в котором группа конъюгата увеличивает накопление сопряженного антисмыслового соединения в печени, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 91. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-90, в котором группа конъюгата снижает накопление сопряженного антисмыслового соединения в почках, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 92. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-91, в котором антисмысловый нуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы H.
Вариант реализации 93. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-92, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 94. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-93, в котором каждый нуклеозид антисмыслового олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 95. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-94, в котором антисмысловый олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 96. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 93-95, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит модифицированный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 97. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 96, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой
немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 98. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 97, в котором 5'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 99. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 97, в котором 5'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 100. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 97, в котором 5'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 101. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 97, в котором 5'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 102. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-101, в котором 3'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 103. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-101, в котором 3'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 104. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-91, в котором 3'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 105. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-101, в котором 3'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 106. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-105, в котором центральная область состоит из 5 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 107. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-105, в котором центральная область состоит из 6 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 108. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-105, в котором центральная область состоит из 7 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 109. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-105, в котором центральная область состоит из 8 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 110. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-105, в котором центральная область состоит из 9 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 111. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 97-105, в котором центральная область состоит из 10 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 112. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-111, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 14-26 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 113. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-111, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 15-25 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 114. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-111, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 115. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-114, в котором каждый модифицированный нуклеозид независимо содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент или бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 116. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 115, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 117. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 116, в котором каждый модифицированный нуклеозид, содержащий 2'-замещенный сахарный фрагмент, содержит 2'-заместитель, независимо выбранный из: галогена, необязательно замещенного аллила, необязательно замещенного амино, азидо, необязательно замещенного SH, CN, OCN, CF3, OCF3, O, S или N(Rm)-алкила; O, S или N(Rm)-алкенила; О, S или N(Rm)-алкинила; необязательно замещенного O-алкиленил-O-алкила, необязательно замещенного алкинила, необязательно замещенного алкарила, необязательно замещенного аралкила, необязательно замещенного O-алкарила, необязательно замещенного O-аралкила, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или О-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой H, амино-защитную группу или замещенный или незамещенный C1-C10 алкил;
где каждая необязательно замещенная группа необязательно замещена группой заместителя, независимо выбранной из: гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
Вариант реализации 118. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 116, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, OCH3, OCH2F, OCHF2, OCF3, ОСН2СН3, O(CH2)2F, OCH2CHF2, OCH2CF3, ОСН2-СН=CH2, O(CH2)2-ОСН3, O(CH2)2-SCH3, O(CH2)2-OCF3, O(CH2)3-N(R1)(R2), O(CH2)2-ON(R1)(R2), O(CH2)2-O(CH2)2-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R3)-(CH2)2-N(R1)(R2) и O(CH2)2-N(R3)-C(=NR4)[N(R1)(R2)]; где каждый R1, R2, R3 и R4 независимо представляет собой H или C1-C6 алкил.
Вариант реализации 119. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 116, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=CH2, O(СН2)2-OCH3 (MOE), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2. OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 120. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 116, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-MOE сахарный фрагмент.
Вариант реализации 121. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 116, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-OMe сахарный фрагмент.
Вариант реализации 122. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 116, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-F сахарный фрагмент.
Вариант реализации 123. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-122, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий заменитель сахара.
Вариант реализации 125. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 123, в котором модифицированный нуклеозид содержит HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 126. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-125, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 127. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 126, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой cEt сахарный фрагмент.
Вариант реализации 128. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 126, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой LNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 129. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-128, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 130. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 129, в котором каждая межнуклеозидная связь антисмыслового олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 131. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 129, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную связь и по меньшей мере одну немодифицированную фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 132. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-131, в котором по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 133. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-122, в котором каждая модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 134. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-133, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 135. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-133, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 136. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 137. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 138. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 139. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 140. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 141. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 142. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-132, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 143. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 16 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 144. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 145. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 146. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 147. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 148. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 149. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 150. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 151. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 152. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 153. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-142, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 154. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-153, в котором каждая концевая межнуклеозидная связь
антисмыслового олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 155. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-154, в котором каждая межнуклеозидная связь, связывающая два дезоксинуклеозида антисмыслового олигонуклеотида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 156. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-155, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь, связывающая два модифицированных нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 157. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-156, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь антисмыслового олигонуклеотида, которая находится в положении 3' модифицированного нуклеозида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 158. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 129-157, в котором каждая межнуклеозидная связь антисмыслового олигонуклеотида, которая находится в положении 3' дезоксинуклеозида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 159. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-158, в котором антисмысловые олигонуклеотиды имеют мотив, выбранный из:
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM; и
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь, и каждый y представляет собой либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, при условии, что по меньшей мере один у представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 160. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-158, в котором антисмысловые олигонуклеотиды имеют мотив, выбранный из:
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM; и
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый o представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, и каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 161. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 159 или 160, в котором каждый M независимо выбран из: 2'-MOE нуклеозида и бициклического нуклеозида.
Вариант реализации 162. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 161, в котором каждый М независимо выбран из 2'-МОЕ нуклеозида, cEt нуклеозида и LNA нуклеозида.
Вариант реализации 163. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 159 или 160, в котором каждый M представляет собой 2'-MOE нуклеозид.
Вариант реализации 165. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 159 или 160, в котором каждый M представляет собой LNA нуклеозид.
Вариант реализации 166. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-165, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 8 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 167. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-165, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 10 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 168. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-165, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 12 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 169. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-165, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 14 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 170. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-165, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 16 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 171. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-165, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 18 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 172. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-171, в котором антисмысловый олигонуклеотид по меньшей мере на 90% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 173. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-171, в котором антисмысловый олигонуклеотид по меньшей мере на 95% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 174. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-171, в котором антисмысловый олигонуклеотид на 100% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 175. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 166-174, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой пре-мРНК.
Вариант реализации 176. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 166-174, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой мРНК.
Вариант реализации 177. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 166-176, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 178. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 177, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 179. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 177 или 178, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: рецептора андрогена, аполипопротеина (a), аполипопротеина B, аполипопротеина C-III, C-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы IB, STAT3 и транстиретина.
Вариант реализации 180. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 166-179, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой вирусную нуклеиновую кислоту.
Вариант реализации 181. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 180, отличающееся тем, что вирусная нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 182. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 181, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту вируса гепатита B.
Вариант реализации 183. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24.
Вариант реализации 184. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 25, 26, 27, 28, 29 или 30.
Вариант реализации 185. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 31.
Вариант реализации 186. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 32.
Вариант реализации 187. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 33.
Вариант реализации 188. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 34.
Вариант реализации 189. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42 или 43.
Вариант реализации 190. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 44, 45, 46, 47 или 48.
Вариант реализации 191. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58 или 59.
Вариант реализации 192. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66 или 67.
Вариант реализации 193. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 69, 70, 71 или 72.
Вариант реализации 194. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 73.
Вариант реализации 195. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 или 81.
Вариант реализации 196. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 68.
Вариант реализации 197. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-179, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 82-103.
Вариант реализации 198. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке, включающий контакт клетки с сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 1-197.
Вариант реализации 199. Способ по варианту реализации 198, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку печени.
Вариант реализации 200. Способ по варианту реализации 199, отличающийся тем, что клетка представляет собой гепатоцит.
Вариант реализации 201. Способ по любому из вариантов реализации 198-200, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 202. Способ по любому из вариантов реализации 198-200, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 203. Способ по варианту реализации 202, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 204. Способ по варианту реализации 202, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 205. Фармацевтическая композиция, содержащая сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-197 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
Вариант реализации 206. Фармацевтическая композиция по варианту реализации 205, отличающаяся тем, что фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель выбран из стерильной воды и стерильного солевого раствора.
Вариант реализации 207. Способ лечения заболевания или состояния у животного, включающий введение фармацевтической композиции по варианту реализации 205 или 206 указанному животному и лечение посредством этого заболевания или состояния у животного.
Вариант реализации 208. Способ по варианту реализации 207, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 209. Способ по варианту реализации 207, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 210. Способ по любому из вариантов реализации 207-209, отличающийся тем, что заболевание или состояние представляет собой заболевание или состояние печени.
Вариант реализации 211. Способ по любому из вариантов реализации 207-210, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
Вариант реализации 212. Способ по варианту реализации 211, отличающийся тем, что введение осуществляют подкожной инъекцией.
Вариант реализации 213. Способ по варианту реализации 211, отличающийся тем, что введение осуществляют внутривенной инъекцией.
Вариант реализации 214. Способ по варианту реализации 211, отличающийся тем, что введение осуществляют внутримышечной инъекцией.
Вариант реализации 215. Способ по любому из вариантов реализации 207-214, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение представлено в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 216. Способ по любому из вариантов реализации 207-214, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение представлено в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 217. Способ по любому из вариантов реализации 207-216, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение представлено в дозе более 10 мг/кг.
Вариант реализации 218. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 2 месяца.
Вариант реализации 219. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 4 месяца.
Вариант реализации 220. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 6 месяцев.
Вариант реализации 221. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы в неделю.
Вариант реализации 222. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые две недели.
Вариант реализации 223. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые три недели.
Вариант реализации 224. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые четыре недели.
Вариант реализации 225. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые пять недель.
Вариант реализации 226. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые шесть недель.
Вариант реализации 227. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые семь недель.
Вариант реализации 228. Способ по любому из вариантов реализации 207-217, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые восемь недель.
Вариант реализации 229. Сопряженное антисмысловое соединение, содержащее: антисмысловый олигонуклеотид, содержащий 12-30 связанных нуклеозидов и группу конъюгата, при этом группа конъюгата содержит по меньшей мере один фрагмент, направляющий на клетку.
Вариант реализации 230. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 229, в котором группа конъюгата содержит 2 фрагмента, направляющих на клетку.
Вариант реализации 231. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 229, в котором группа конъюгата содержит 3 фрагмента, направляющих на клетку.
Вариант реализации 232. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 229, в котором группа конъюгата содержит 4 фрагмента, направляющих на клетку.
Вариант реализации 233. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-232, в котором каждый фрагмент, направляющий на клетку, содержит расщепляемую связь.
Вариант реализации 234. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-233, в котором каждый фрагмент, направляющий на клетку, содержит связку и лиганд.
Вариант реализации 235. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 234, в котором лиганд представляет собой лиганд рецептора клеточной поверхности.
Вариант реализации 236. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 235, в котором по меньшей мере одна связка содержит расщепляемую связь.
Вариант реализации 237. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 235, в котором каждая связка содержит расщепляемую связь.
Вариант реализации 238. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-237, в котором группа конъюгата содержит линкер конъюгата.
Вариант реализации 239. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 238, в котором линкер конъюгата содержит одну или более расщепляемых связей.
Вариант реализации 240. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-239, в котором группа конъюгата содержит группу ветвления.
Вариант реализации 241. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 240, в котором группа конъюгата содержит одну или более расщепляемых связей.
Вариант реализации 242. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-241, в котором группа конъюгата содержит расщепляемый фрагмент.
Вариант реализации 243. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 242, в котором расщепляемый фрагмент содержит одну или более расщепляемых связей.
Вариант реализации 244. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-243, в котором группа конъюгата содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
Вариант реализации 245. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-243, в котором группа конъюгата содержит по меньшей мере две расщепляемые связи.
Вариант реализации 246. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-243, в котором группа конъюгата содержит по меньшей мере 3 расщепляемые связи.
Вариант реализации 247. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-243, в котором группа конъюгата содержит по меньшей мере 4 расщепляемые связи.
Вариант реализации 248. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-243, в котором группа конъюгата содержит по меньшей мере 5 расщепляемых связей.
Вариант реализации 249. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-248, содержащее расщепляемую связь, выбранную из амида,
полиамида, сложного эфира, простого эфира, фосфодиэфира, фосфатного эфира, карбамата, дисульфида или пептида.
Вариант реализации 250. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 249, в котором пептид представляет собой дипептид.
Вариант реализации 251. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 249, в котором пептид представляет собой трипептид.
Вариант реализации 252. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 249, в котором пептид представляет собой лизин.
Вариант реализации 253. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 249, в котором пептид представляет собой производное лизина.
Вариант реализации 254. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 250-251, в котором один или более пептидов представляют собой лизин.
Вариант реализации 255. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 250-251, в котором два или более пептидов представляют собой лизин.
Вариант реализации 256. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-255, в котором группа конъюгата содержит:
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
Вариант реализации 257. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-255, в котором группа конъюгата содержит:
Вариант реализации 258. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-257, в котором группа ветвления содержит:
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
Вариант реализации 259. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-257, в котором группа ветвления содержит:
Вариант реализации 260. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-259, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит углевод.
Вариант реализации 261. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-259, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит углеводный кластер.
Вариант реализации 262. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-259, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит лиганд рецептора клеточной поверхности.
Вариант реализации 263. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-259, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 264. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-263, в котором:
расщепляемый фрагмент ковалентно связан с антисмысловым олигонуклеотидом;
линкер конъюгата ковалентно связан с расщепляемым фрагментом; и
фрагмент, направляющий на клетку, ковалентно связан с линкером конъюгата.
Вариант реализации 265. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-264, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит группу ветвления.
Вариант реализации 266. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 265, в котором группа ветвления ковалентно присоединена к линкеру конъюгата.
Вариант реализации 267. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-266, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере одну связку.
Вариант реализации 268. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-267, в котором по меньшей мере одна связка ковалентно присоединена к группе ветвления.
Вариант реализации 269. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-267, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 270. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 269, в котором каждый по меньшей мере из одного лиганда ковалентно присоединен к связке.
Вариант реализации 271. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-270, в котором соединение имеет структуру, представленную формулой I, изображенной ниже:
где
A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
C представляет собой линкер конъюгата;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 272. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-271, в котором расщепляемый фрагмент содержит 1-4 связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов, при этом связь между антисмысловым олигонуклеотидом и первым расщепляемым фрагментом нуклеозида представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 273. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 272, в котором каждая межнуклеозидная связь между каждым из связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 274. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 271 или 272, в котором расщепляемый фрагмент содержит 1-3 связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов.
Вариант реализации 275. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 271 или 272, в котором расщепляемый фрагмент содержит 1-2 связанных расщепляемых фрагментов нуклеозидов.
Вариант реализации 276. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализаций 271, в котором расщепляемый фрагмент содержит один расщепляемый фрагмент нуклезида.
Вариант реализации 277. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-276, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый фрагмент нуклеозида, выбранного из группы, состоящей из пурина, замещенного пурина, пиримидина или замещенного пиримидина.
Вариант реализации 278. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-276, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый фрагмент нуклеозида, выбранного из цитидина, уридина, аденозина, тимидина и гуанозина.
Вариант реализации 279. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-276, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый фрагмент дезоксинуклеозида, выбранного из дезоксиаденозина, дезоксигуанозина, дезоксиинозина, тимидина, дезоксиуридина и дезоксицитидина.
Вариант реализации 280. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-280, в котором расщепляемый фрагмент содержит дезоксиаденозин.
Вариант реализации 281. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-280, в котором расщепляемый фрагмент представляет собой дезоксиаденозин.
Вариант реализации 282. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-276, в котором расщепляемый фрагмент имеет структуру, выбранную из:
где каждый из Bx, Bx1, Bx2 и Bx3 независимо представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 283. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 282, в котором гетероциклический основной фрагмент выбран из: урацила, тимина, цитозина, 5-метилцитозина, аденина или гуанина.
Вариант реализации 284. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-276, в котором расщепляемый фрагмент имеет структуру:
Вариант реализации 285. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-285, в котором линкер конъюгата содержит пирролидин.
Вариант реализации 286. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-286, в котором линкер конъюгата содержит ПЭГ.
Вариант реализации 287. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-287, в котором линкер конъюгата содержит амид.
Вариант реализации 288. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-288, в котором линкер конъюгата содержит полиамид.
Вариант реализации 289. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-289, в котором линкер конъюгата содержит амин.
Вариант реализации 290. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-290, в котором линкер конъюгата содержит одну или более дисульфидных связей.
Вариант реализации 291. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-291, в котором линкер конъюгата содержит белковый связывающий фрагмент.
Вариант реализации 292. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 292, в котором белковый связывающий фрагмент содержит липид.
Вариант реализации 293. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 293, в котором белковый связывающий фрагмент выбран из: холестерина, холевой кислоты, адамантан-уксусной кислоты, 1-пирен-масляной кислоты, дигидротестостерона, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерина, геранилоксигексиловой группы, гексадецилглицерина, борнеола, ментола, 1,3-пропандиола, гептадециловой группы, пальмитиновой кислоты, миристиновой кислоты, O3-(олеоил)литохолевой кислоты, O3-(олеоил)холеновой кислоты, диметокситритила или феноксазина, витамина (например, фолата, витамина A, витамина E, биотина, пиридоксаля), пептида, углевода (например, моносахарида, дисахарида, трисахарида, тетрасахарида, олигосахарида, полисахарида), эндосомолитического компонента, стероида (например, уваола, гецигенина, диосгенина), терпена (например, тритерпена, например, сарсасапогенина, фриделина, литохолевой кислоты, дериватизованной эпифриделанолом) или катионного липида.
Вариант реализации 294. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-293, в котором белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от С16 до С22, холестерин, холевую кислоту, витамин E, адамантан или 1-пентафторпропил.
Вариант реализации 295. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-294, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и p равен от 1 до 6.
Вариант реализации 296. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-295, в котором линкер конъюгата имеет структуру,
выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 297. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-295, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 298. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-295, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 299. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-295, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 300. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-295, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 301. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-295, в котором линкер конъюгата имеет структуру:
Вариант реализации 302. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-301, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит углевод.
Вариант реализации 303. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-302, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит углеводный кластер.
Вариант реализации 304. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-303, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит лиганд рецептора клеточной поверхности.
Вариант реализации 305. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-304, в котором направляющий фрагмент содержит по меньшей мере один N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 306. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-305, в котором направляющий фрагмент содержит группу ветвления.
Вариант реализации 307. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 306, в котором группа ветвления содержит простой эфир.
Вариант реализации 308. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 306 или 307, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
Вариант реализации 309. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 306 или 307, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 310. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 306 или 307, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 311. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 306 или 307, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 312. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 306 или 307, в котором группа ветвления содержит:
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
Вариант реализации 313. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 306 или 307, в котором группа ветвления содержит:
Вариант реализации 314. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-313, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит связку.
Вариант реализации 315. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-313, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит две связки.
Вариант реализации 316. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-313, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит три связки.
Вариант реализации 317. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-313, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит четыре или более связок.
Вариант реализации 318. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-317, в котором по меньшей мере одна связка содержит ПЭГ.
Вариант реализации 319. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-318, в котором по меньшей мере одна связка содержит амид.
Вариант реализации 320. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-319, в котором по меньшей мере одна связка содержит полиамид.
Вариант реализации 321. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-320, в котором по меньшей мере одна связка содержит амин.
Вариант реализации 322. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-321, в котором по меньшей мере две связки отличны друг от друга.
Вариант реализации 323. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-321, в котором все связки являются одинаковыми.
Вариант реализации 324. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-323, в котором каждая связка выбрана из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый p равен от 1 до около 6.
Вариант реализации 325. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-324, в котором каждая связка выбрана из:
Вариант реализации 326. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-324, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 327. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-324, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
Вариант реализации 328. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-328, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 329. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 328, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит один лиганд.
Вариант реализации 330. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 328, в котором направляющий фрагмент содержит два лиганда.
Вариант реализации 331. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 328, в котором направляющий фрагмент содержит три лиганда.
Вариант реализации 332. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 328-331, в котором лиганд ковалентно присоединен к каждой связке.
Вариант реализации 333. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором по меньшей мере один лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 334. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 335. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 336. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором лиганд представляет собой галактозу.
Вариант реализации 337. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором лиганд представляет манноза-6-фосфат.
Вариант реализации 338. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором каждый лиганд выбран из:
где каждый R1 выбран из OH и NHCOOH.
Вариант реализации 339. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором каждый лиганд выбран из:
Вариант реализации 340. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 341. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру.
Вариант реализации 342. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-332, в котором каждая группа, направляющая на клетку, имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 343. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-336, в котором каждая группа, направляющая на клетку, имеет следующую структуру:
Вариант реализации 344. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-336, в котором конъюгат имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Z представляет собой H или связанную твердую подложку;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение;
X представляет собой O или S; и
Bx представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 345. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-336, в котором конъюгат имеет следующую структуру:
где Z представляет собой H или связанную твердую подложку; и
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение.
Вариант реализации 346. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-345, в котором группа конъюгата присоединена в 2'-положении нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 347. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-345, в котором группа конъюгата присоединена в 3'-положении нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 348. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-345, в котором группа конъюгата присоединена в 5'-положении нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 349. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-345, в котором группа конъюгата присоединена к 5'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 350. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-350, в котором группа конъюгата присоединена к 3'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 351. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-350, в котором группа конъюгата присоединена к внутреннему нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 352. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-351, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного антисмыслового соединения в гепатоцит, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 353. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-352, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного антисмыслового соединения в клетку печени, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 354. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-353, в котором группа конъюгата увеличивает накопление сопряженного антисмыслового соединения в печени, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 355. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-354, в котором группа конъюгата снижает накопление сопряженного антисмыслового соединения в почках, по сравнению с несопряженным антисмысловым соединением.
Вариант реализации 356. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-355, в котором антисмысловый нуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы H.
Вариант реализации 357. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-356, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 358. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-357, в котором каждый нуклеозид антисмыслового олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 359. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-358, в котором антисмысловый олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 360. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 357-359, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит модифицированный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 361. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 359, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой
немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 362. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 361, в котором 5'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 363. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 361, в котором 5'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 364. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 361, в котором 5'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 365. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 361, в котором 5'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 366. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-365, в котором 3'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 367. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-365, в котором 3'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 368. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-365, в котором 3'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 369. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-365, в котором 3'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 370. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-369, в котором центральная область состоит из 5 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 371. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-369, в котором центральная область состоит из 6 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 372. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-369, в котором центральная область состоит из 7 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 373. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-369, в котором центральная область состоит из 8 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 374. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-369, в котором центральная область состоит из 9 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 375. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 361-369, в котором центральная область состоит из 10 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 376. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-376, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 14-26 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 377. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-376, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 15-25 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 378. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-376, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 379. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-378, в котором каждый модифицированный нуклеозид независимо содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент или бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 380. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 379, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 381. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 380, в котором каждый модифицированный нуклеозид, содержащий 2'-замещенный сахарный фрагмент, содержит 2'-заместитель, независимо выбранный из: галогена, необязательно замещенного аллила, необязательно замещенного амино, азидо, необязательно замещенного SH, CN, OCN, CF3, OCF3, O, S или N(Rm)-алкила; O, S или N(Rm)-алкенила; O, S или N(Rm)-алкинила; необязательно замещенного O-алкиленил-O-алкила, необязательно замещенного алкинила, необязательно замещенного алкарила, необязательно замещенного аралкила, необязательно замещенного O-алкарила, необязательно замещенного O-аралкила, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или О-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой H, амино-защитную группу или замещенный или незамещенный C1-C10 алкил;
где каждая необязательно замещенная группа необязательно замещена группой заместителя, независимо выбранной из: гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
Вариант реализации 382. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 380, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, OCH3, OCH2F, OCHF2, OCF3, OCH2CH3, O(CH2)2F, OCH2CHF2, OCH2CF3, OCH2-CH=CH2, O(CH2)2-OCH3, O(CH2)2-SCH3, O(CH2)2-OCF3, O(CH2)3-N(R1)(R2), O(CH2)2-ON(R1)(R2), O(CH2)2-O(CH2)2-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R3)-(CH2)2-N(R1)(R2) и O(CH2)2-N(R3)-C(=NR4)[N(R1)(R2)]; где каждый R1, R2, R3 и R4 независимо представляет собой H или C1-C6 алкил.
Вариант реализации 383. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 380, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, OCH3, OCF3, OCH2CH3, OCH2CF3, ОСН2-CH=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (MOE), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 384. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 380, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-MOE сахарный фрагмент.
Вариант реализации 385. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 380, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-OMe сахарный фрагмент.
Вариант реализации 386. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 380, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-F сахарный фрагмент.
Вариант реализации 387. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-386, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий заменитель сахара.
Вариант реализации 388. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 387, в котором модифицированный нуклеозид содержит F-HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 389. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 387, в котором модифицированный нуклеозид содержит HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 390. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-389, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 391. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 390, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой cEt сахарный фрагмент.
Вариант реализации 392. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 390, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой LNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 393. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1-392, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 394. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 393, в котором каждая межнуклеозидная связь антисмыслового олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 395. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 394, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную связь и по меньшей мере одну немодифицированную фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 396. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-395, в котором по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 397. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором каждая модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 398. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 399. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 400. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 401. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 402. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 403. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 404. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 405. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 406. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 407. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 16 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 408. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 409. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 410. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 411. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 412. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 413. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 414. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 415. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 416. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 417. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-406, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 418. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-418, в котором каждая концевая межнуклеозидная связь
антисмыслового олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 419. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-418, в котором каждая межнуклеозидная связь, связывающая два дезоксинуклеозида антисмыслового олигонуклеотида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 420. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-419, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь, связывающая два модифицированных нуклеозида антисмыслового олигонуклеотида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 421. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-420, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь антисмыслового олигонуклеотида, которая находится в положении 3' модифицированного нуклеозида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 422. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 393-396 или 398-418, в котором каждая межнуклеозидная связь антисмыслового олигонуклеотида, которая находится в положении 3' дезоксинуклеозида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 423. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-422, в котором антисмысловые олигонуклеотиды имеют мотив, выбранный из:
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM; и
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь, и каждый у представляет собой либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, при условии, что по меньшей мере один y представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 424. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-422, в котором антисмысловые олигонуклеотиды имеют мотив, выбранный из:
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM; и
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый o представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, и каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 425. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 423 или 424, в котором каждый M независимо выбран из: 2'-MOE нуклеозида и бициклического нуклеозида.
Вариант реализации 426. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 425, в котором каждый M независимо выбран из 2'-MOE нуклеозида, cEt нуклеозида и LNA нуклеозида.
Вариант реализации 427. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 425 или 426, в котором каждый M представляет собой 2'-MOE нуклеозид.
Вариант реализации 428. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 425 или 426, в котором каждый M представляет собой cEt нуклеозид.
Вариант реализации 429. Сопряженное антисмысловое соединение по вариантам реализации 425 или 426, в котором каждый M представляет собой LNA нуклеозид.
Вариант реализации 430. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-429, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 8 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 431. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-429, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 10 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 432. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-429, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 12 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 433. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-429, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 14 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 434. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-429, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 16
нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 435. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-429, в котором антисмысловый олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 18 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 436. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-435, в котором антисмысловый олигонуклеотид по меньшей мере на 90% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 437. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-435, в котором антисмысловый олигонуклеотид по меньшей мере на 95% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 438. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-435, в котором антисмысловый олигонуклеотид на 100% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 439. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 430-438, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой пре-мРНК.
Вариант реализации 440. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 430-438, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой мРНК.
Вариант реализации 441. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 430-440, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 442. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 441, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 443. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 441 или 442, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: рецептора андрогена, аполипопротеина (a), аполипопротеина B, аполипопротеина C-III, C-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы IB, STAT3 и транстиретина.
Вариант реализации 444. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 430-440, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой вирусную нуклеиновую кислоту.
Вариант реализации 445. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 444, отличающееся тем, что вирусная нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 446. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 445, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту вируса гепатита B.
Вариант реализации 447. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24.
Вариант реализации 448. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 25, 26, 27, 28, 29 или 30.
Вариант реализации 449. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 31.
Вариант реализации 450. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 32.
Вариант реализации 451. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 33.
Вариант реализации 452. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ 1D №: 34.
Вариант реализации 453. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42 или 43.
Вариант реализации 454. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 44, 45, 46, 47 или 48.
Вариант реализации 455. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит
последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58 или 59.
Вариант реализации 456. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66 или 67.
Вариант реализации 457. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 69, 70, 71 или 72.
Вариант реализации 458. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 73.
Вариант реализации 459. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 или 81.
Вариант реализации 460. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 68.
Вариант реализации 461. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-443, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 82-103.
Вариант реализации 462. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке, включающий контакт клетки с сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 229-461.
Вариант реализации 463. Способ по варианту реализации 462, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку печени.
Вариант реализации 464. Способ по варианту реализации 462, отличающийся тем, что клетка представляет собой гепатоцит.
Вариант реализации 465. Способ по любому из вариантов реализации 462-464, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 466. Способ по любому из вариантов реализации 462-464, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 467. Способ по варианту реализации 466, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 468. Способ по варианту реализации 466, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 469. Фармацевтическая композиция, содержащая сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 229-469 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
Вариант реализации 470. Фармацевтическая композиция по варианту реализации 469, отличающаяся тем, что фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель выбран из стерильной воды и стерильного солевого раствора.
Вариант реализации 471. Способ лечения заболевания или состояния у животного, включающий введение фармацевтической композиции по варианту реализации 469 или 470 указанному животному и лечение посредством этого заболевания или состояния у животного.
Вариант реализации 472. Способ по варианту реализации 471, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 473. Способ по варианту реализации 471, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 474. Способ по любому из вариантов реализации 471-473, отличающийся тем, что заболевание или состояние представляет собой заболевание или состояние печени.
Вариант реализации 475. Способ по любому из вариантов реализации 471-474, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
Вариант реализации 476. Способ по варианту реализации 475, отличающийся тем, что введение осуществляют подкожной инъекцией.
Вариант реализации 477. Способ по варианту реализации 475, отличающийся тем, что введение осуществляют внутривенной инъекцией.
Вариант реализации 478. Способ по варианту реализации 475, отличающийся тем, что введение осуществляют внутримышечной инъекцией.
Вариант реализации 479. Способ по любому из вариантов реализации 471-478, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение представлено в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 480. Способ по любому из вариантов реализации 471-478, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение представлено в дозе менее 1 мг/кг.
Вариант реализации 481. Способ по любому из вариантов реализации 471-480, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение представлено в дозе более 10 мг/кг.
Вариант реализации 482. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 2 месяца.
Вариант реализации 483. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 4 месяца.
Вариант реализации 484. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 6 месяцев.
Вариант реализации 485. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы в неделю.
Вариант реализации 486. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые две недели.
Вариант реализации 487. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые три недели.
Вариант реализации 488. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые четыре недели.
Вариант реализации 489. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые пять недель.
Вариант реализации 490. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые шесть недель.
Вариант реализации 491. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые семь недель.
Вариант реализации 492. Способ по любому из вариантов реализации 471-481, отличающийся тем, что сопряженное антисмысловое соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые восемь недель.
Вариант реализации 493. Сопряженное соединение, содержащее по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу и один или более лигандов.
Вариант реализации 494. Сопряженное соединение по варианту реализации 493, содержащее два или более лигандов.
Вариант реализации 495. Сопряженное соединение по варианту реализации 493, содержащее три лиганда.
Вариант реализации 496. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 493-495, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 497. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 493-495, в котором лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин.
Вариант реализации 498. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 493-497, в котором группа конъюгата содержит структуру, выбранную из:
Вариант реализации 499. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 493-498, в котором сопряженное соединение содержит связку, имеющую структуру, выбранную из:
где L представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой H, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил;
R2 представляет собой H, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 500. Сопряженное соединение по варианту реализации 499, в котором связка имеет структуру, выбранную из:
где Z2 представляет собой H или CH3; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 501. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 493-500, в котором указанное сопряженное соединение ковалентно присоединено к олигонуклеотиду.
Вариант реализации 502. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа
конъюгата представляет собой сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 493-500.
Вариант реализации 503. Соединение, имеющее формулу (I):
где:
Bx представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
T1 представляет собой гидроксил, водород, гидроксил-защитную группу, фосфорный фрагмент или химически активную фосфорную группу.
Вариант реализации 504. Соединение, имеющее формулу (II):
где:
Bx представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
T1 представляет собой гидроксил, водород, гидроксил-защитную группу, фосфорный фрагмент или химически активную фосфорную группу.
Вариант реализации 505. Соединение по любому из вариантов реализации 503 или 504, в котором указанный фосфорный фрагмент имеет формулу:
где:
n равен 0 или 1;
Ra и Rc, каждый независимо, представляют собой OH, SH, C1-C6 алкил, замещенный C1-C6 алкил, C1-C6 алкокси, замещенный C1-C6 алкокси, амино или замещенный амино; и
Rb представляет собой O или S.
Вариант реализации 506. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа конъюгата представляет собой сопряженное соединение формулы (III):
где:
Bx представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
T2 представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, присоединенную к нуклеозиду, нуклеотиду, олигонуклеозиду, олигонуклеотиду, мономерной субъединице или олигомерному соединению.
Вариант реализации 507. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа конъюгата представляет собой сопряженное соединение формулы (IV):
где:
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
Т2 представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, присоединенную к нуклеозиду, нуклеотиду, олигонуклеозиду, олигонуклеотиду, мономерной субъединице или олигомерному соединению.
Вариант реализации 508. Соединение или олигомерное соединение по любому из вариантов реализации 503-507, в котором гетероциклический основной фрагмент представляет собой пиримидин, замещенный пиримидин, пурин или замещенный пурин.
Вариант реализации 509. Соединение или олигомерное соединение по любому из вариантов реализации 503-507, в котором Вх представляет собой урацил, тимин, цитозин, 5-метилцитозин, аденин или гуанин.
Вариант реализации 510. Соединение или олигомерное соединение по любому из вариантов реализации 503-507, в котором Вх представляет собой аденин.
Вариант реализации 511. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент
C представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 512. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где:
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент
C представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд;
n1 равен 0 или 1; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 513. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511 или 512, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый L независимо представляет собой фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 514. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511 или 512, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 515. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511 или 512, в котором линкер конъюгата имеет структуру:
Вариант реализации 516. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511 или 512, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 517. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511 или 512, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 518. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511 или 512, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 519. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 518, в котором линкер конъюгата содержит пирролидин.
Вариант реализации 520. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 519, в котором линкер конъюгата не содержит пирролидин.
Вариант реализации 521. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 520, в котором линкер конъюгата содержит ПЭГ.
Вариант реализации 522. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 521, в котором линкер конъюгата содержит амид.
Вариант реализации 523. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 522, в котором линкер конъюгата не содержит амид.
Вариант реализации 524. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 523, в котором линкер конъюгата содержит полиамид.
Вариант реализации 525. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 524, в котором линкер конъюгата содержит амин.
Вариант реализации 526. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 525, в котором линкер конъюгата содержит одну или более дисульфидных связей.
Вариант реализации 527. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511 или 526, в котором линкер конъюгата содержит белковый связывающий фрагмент.
Вариант реализации 528. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 527, в котором белковый связывающий фрагмент содержит липид.
Вариант реализации 529. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 528, в котором белковый связывающий фрагмент выбран из: холестерина, холевой кислоты, адамантан-уксусной кислоты, 1-пирен-масляной кислоты, дигидротестостерона, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерина, геранилоксигексиловой группы,
гексадецилглицерина, борнеола, ментола, 1,3-пропандиола, гептадециловой группы, пальмитиновой кислоты, миристиновой кислоты, О3-(олеоил)литохолевой кислоты, О3-(олеоил)холеновой кислоты, диметокситритила или феноксазина, витамина (например, фолата, витамина A, витамина E, биотина, пиридоксаля), пептида, углевода (например, моносахарида, дисахарида, трисахарида, тетрасахарида, олигосахарида, полисахарида), эндосомолитического компонента, стероида (например, уваола, гецигенина, диосгенина), терпена (например, тритерпена, например, сарсасапогенина, фриделина, литохолевой кислоты, дериватизованной эпифриделанолом) или катионного липида.
Вариант реализации 530. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 527-529, в котором белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от C16 до C22, холестерин, холевую кислоту, витамин E, адамантан или 1-пентафторпропил.
Вариант реализации 531. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-512, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и p равен от 1 до 6.
Вариант реализации 532. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-512, в котором линкер конъюгата имеет структуру,
выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 533. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-512, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 534. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-512, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 535. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 536. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 537. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет одну из следующих структур:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 538. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет одну из следующих структур:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 539. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 540. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 541. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-536, в котором группа ветвления содержит простой эфир.
Вариант реализации 542. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
Вариант реализации 543. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 544. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-536, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 545. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-536, в котором группа ветвления содержит:
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
Вариант реализации 546. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-536, в котором группа ветвления содержит:
Вариант реализации 547. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-546, в котором каждая связка выбрана из:
где L выбран из фосфорной связывающей группы и нейтральной связывающей группы;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил;
R2 представляет собой Н, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 548. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 511-546, в котором каждая связка выбрана из:
где Z2 представляет собой Н или CH3; и
каждый m2 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m2 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 549. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором по меньшей мере одна связка содержит ПЭГ.
Вариант реализации 550. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором по меньшей мере одна связка содержит амид.
Вариант реализации 551. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором по меньшей мере одна связка содержит полиамид.
Вариант реализации 552. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором по меньшей мере одна связка содержит амин.
Вариант реализации 553. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором по меньшей мере две связки отличны друг от друга.
Вариант реализации 554. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором все связки являются одинаковыми.
Вариант реализации 555. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором каждая связка выбрана из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый p равен от 1 до около 6.
Вариант реализации 556. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором каждая связка выбрана из:
Вариант реализации 557. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 558. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 511-546, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
Вариант реализации 559. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-558, в котором фрагмент, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
Вариант реализации 560. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-558, в котором фрагмент, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
Вариант реализации 561. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-558, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 562. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 493-502 или 511-558, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит один лиганд.
Вариант реализации 563. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 493-502 или 511-558, в котором направляющий фрагмент содержит три лиганда.
Вариант реализации 564. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 493-502 или 511-558, в котором направляющий фрагмент содержит три лиганда.
Вариант реализации 565. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором каждый лиганд ковалентно присоединен к каждой связке.
Вариант реализации 566. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором по меньшей мере один лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 567. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 568. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-
дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 569. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором лиганд представляет собой галактозу.
Вариант реализации 570. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором лиганд представляет манноза-6-фосфат.
Вариант реализации 571. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором каждый лиганд выбран из:
где каждый R1 выбран из ОН и NHCOOH.
Вариант реализации 572. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором каждый лиганд выбран из:
Вариант реализации 573. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 574. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 561-564, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 575. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором фрагмент, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 576. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором фрагмент, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
Вариант реализации 577. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 578. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 579. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 580. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q представляет собой указанное антисмысловое соединение;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 581. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q представляет собой указанное антисмысловое соединение.
Вариант реализации 582. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q представляет собой указанное антисмысловое соединение.
Вариант реализации 583. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q представляет собой указанное антисмысловое соединение; и
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку.
Вариант реализации 584. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 493-502 или 511-574, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q представляет собой указанное антисмысловое соединение; и
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку.
Вариант реализации 585. Сопряженный олигонуклеотид, содержащий олигонуклеотид и группу конъюгата, при этом группа конъюгата представляет собой любую группу конъюгата по любому из вариантов реализации 493-584.
Вариант реализации 586. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 585, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 587. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 586, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит модифицированное основание.
Вариант реализации 588. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 586 или 587, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 589. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 588, в котором заменитель сахара представляет собой тетрагидропиран.
Вариант реализации 590. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 589, в котором тетрагидропиран представляет собой F-HNA.
Вариант реализации 591. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-590, в котором остальная часть олигонуклеотида содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий модифицированный сахар.
Вариант реализации 592. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 591, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий модифицированный сахар, выбран из бициклического нуклеозида и 2'-модифицированного нуклеозида.
Вариант реализации 593. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 586, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой бициклический нуклеозид.
Вариант реализации 594. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 593, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-(CH2)2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 595. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 593, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-(CH2)2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 596. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 593, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-С(CH3)Н-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 597. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 586, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 598. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 597, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид выбран из 2'-F нуклеозида, 2'-ОСН3 нуклеозида и 2'-O(CH2)2OCH3 нуклеозида.
Вариант реализации 599. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 598, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 600. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 598, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 601. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 598, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-O(CH2)2-OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 602. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 585-601, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере один немодифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 603. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 602, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой рибонуклеозид.
Вариант реализации 604. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 602, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой дезоксирибонуклеозид.
Вариант реализации 605. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 585-604, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере два немодифицированных нуклеозида.
Вариант реализации 606. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 605, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат одинаковую модификацию.
Вариант реализации 607. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 605, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат различные модификации.
Вариант реализации 608. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 605-607, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 609. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 605-608, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит 2'-модификацию.
Вариант реализации 610. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 609, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов независимо выбран из 2'-F нуклеозидов, 2'-ОCH3 нуклеозидов и 2'-O(CH2)2OСН3 нуклеозидов.
Вариант реализации 611. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 610. в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 612. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 610, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 613. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализаций 610, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-O(CH2)2OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 614. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-613, в котором по существу каждый нуклеозид указанного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 615. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-601 или 606-613, в котором каждый нуклеозид указанного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 616. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-615, в котором олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 617. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-615, в котором олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 618. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-615, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение.
Вариант реализации 619. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-615, в котором олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид на основе RISC.
Вариант реализации 620. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-615, отличающийся тем, что олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 621. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 586-615, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 622. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-621, в котором группа конъюгата присоединена к 5'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 623. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-621, в котором группа конъюгата присоединена к 3'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 624. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-621, в котором группа конъюгата присоединена к внутреннему нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 625. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-624, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного олигонуклеотидного соединения в гепатоцит, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 626. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-624, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного олигонуклеотидного соединения в клетке печени, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 627. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-626, в котором группа конъюгата увеличивает накопление сопряженного олигонуклеотидного соединения в печени, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 628. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 586-627, в котором группа конъюгата снижает накопление сопряженного олигонуклеотидного соединения в почках, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 629. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 586-628, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет сахарный мотив, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 630. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 629, в котором 5'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 631. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 629, в котором 5'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 632. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 629, в котором 5'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 633. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 629, в котором 5'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 634. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором 3'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 635. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором 3'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 636. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором 3'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 637. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором 3'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 638. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором центральная область состоит из 5. связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 639. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором центральная область состоит из 6 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 640. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором центральная область состоит из 7 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 641. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором центральная область состоит из 8 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 642. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором центральная область состоит из 9 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 643. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-633, в котором центральная область состоит из 10 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 644. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-644, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 14-26 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 645. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-644, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 15-25 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 646. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-644, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 647. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-644, в котором каждый модифицированный нуклеозид независимо содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент или бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 648. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 647, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 649. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 648, в котором каждый модифицированный нуклеозид, содержащий 2'-замещенный сахарный фрагмент, содержит 2'-заместитель, независимо выбранный из: галогена, необязательно замещенного аллила, необязательно замещенного амино, азидо, необязательно замещенного SH, CN, OCN, CF3, OCF3, О, S или N(Rm)-алкила; О, S или N(Rm)-алкенила; О, S или N(Rm)-алкинила; необязательно замещенного О-алкиленил-О-алкила, необязательно замещенного алкинила, необязательно замещенного алкарила, необязательно замещенного аралкила, необязательно замещенного О-алкарила, необязательно замещенного О-аралкила, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или О-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н, аминозащитную группу или замещенный или незамещенный C1-C10 алкил; где каждая необязательно замещенная группа необязательно замещена группой заместителя, независимо выбранной из: гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
Вариант реализации 650. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 648, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОCH3, OCH2F, OCHF2, OCF3, ОCH2CH3, O(CH2)2F, OCH2CHF2, OCH2CF3, ОCH2-СН=CH2, O(CH2)2-ОCH3, O(CH2)2-SCH3, O(CH2)2-OCF3, O(CH2)3-N(R1)(R2) O(CH2)2-ON(R1)(R2), O(CH2)2-O(CH2)2-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R3)-(CH2)2-N(R1)(R2) и O(CH2)2-N(R3)-C(=NR4)[N(R1)(R2)]; где каждый R1, R2, R3 и R4 независимо представляет собой Н или C1-C6 алкил.
Вариант реализации 651. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 648, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОCH3, OCF3, ОCH2CH3, OCH2CF3, ОCH2-СН=CH2, O(CH2)2-ОCH3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 652. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 648, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-МOE сахарный фрагмент.
Вариант реализации 653. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 648, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-ОМе сахарный фрагмент.
Вариант реализации 654. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 648, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеоззд содержит 2'-F сахарный фрагмент.
Вариант реализации 655. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 629-644, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий заменитель сахара.
Вариант реализации 656. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 655, в котором модифицированный нуклеозид содержит F-HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 657. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 655, в котором модифицированный нуклеозид содержит HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 658. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любом) из вариантов реализации 629-657, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 659. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 658, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой cEt сахарный фрагмент.
Вариант реализации 660. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 658, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой LNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 661. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-660, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 662. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 661, в котором каждая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 663. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 661, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную связь и по меньшей мере одну немодифицированную фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 664. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-663, в котором по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 665. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-663, в котором каждая модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 666. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 667. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 668. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 669. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 670. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 671. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 672. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 673. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 674. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661-662, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 675. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 16 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 676. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 677. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 678. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 679. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 680. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 681. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 682. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 683. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 684. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 685. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 661 или 663-674, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 686. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-685, в котором каждая концевая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 687. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-662 или 665-686, в котором каждая межнуклеозидная связь, связывающая два дезоксинуклеозида сопряженного олигонуклеотида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 688. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-662 или 665-687, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь, связывающая два модифицированных нуклеозида сопряженного олигонуклеотида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 689. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-662 или 665-688, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида, которая находится в положении 3' модифицированного нуклеозида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 690. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-662 или 665-689, в котором каждая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида, который находится в положении 3' дезоксинуклеозида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 691. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-662 или 665-690, в котором сопряженный олигонуклеозид имеет химический мотив, выбранный из:
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM; и
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый s представляет собой тиофосфатиую межнуклеозидную связь, и каждый у представляет собой либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, при условии, что по меньшей мере один у представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 692. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-662 или 665-690, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет химический мотив, выбранный из:
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM; и
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый о представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, и каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 693. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 691 или 692, в котором каждый М независимо выбран из: 2'-МОЕ нуклеозида и бициклического нуклеозида.
Вариант реализации 694. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 693, в котором каждый М независимо выбран из 2'-МОЕ нуклеозида, cEt нуклеозида и LNA нуклеозида.
Вариант реализации 695. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 693 или 694, в котором каждый М представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.
Вариант реализации 696. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 693 или 694, в котором каждый М представляет собой cEt нуклеозид.
Вариант реализации 697. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по вариантам реализации 693 или 694, в котором каждый М представляет собой LNA нуклеозид.
Вариант реализации 698. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 8 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 699. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 10 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 700. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 12 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 701. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 14 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 702. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 16 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 703. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 18 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 704. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид по меньшей мере на 90% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 705. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид по меньшей мере на 95% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 706. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-697, в котором сопряженный олигонуклеотид на 100% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 707. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-706, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой пре-мРНК.
Вариант реализации 708. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-706, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой мРНК.
Вариант реализации 709. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-706, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой микроРНК.
Вариант реализации 710. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-709, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 711. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-709, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 712. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-709, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: рецептора андрогена, аполипопротеина (а), аполипопротеина В, аполипопротеина C-III, С-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы 1B, STAT3 и транстиретина.
Вариант реализации 713. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 698-709, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой вирусную нуклеиновую кислоту.
Вариант реализации 714. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 713, отличающееся тем, что вирусная нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 715. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 714, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту вируса гепатита В.
Вариант реализации 716. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24.
Вариант реализации 717. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 25, 26, 27, 28, 29 или 30.
Вариант реализации 718. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 31.
Вариант реализации 719. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 32.
Вариант реализации 720. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 33.
Вариант реализации 721. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 34.
Вариант реализации 722. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42 или 43.
Вариант реализации 723. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 44, 45, 46, 47 или 48.
Вариант реализации 724. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 49, 50, 51, 52, 53. 54, 55, 56, 57, 58 или 59.
Вариант реализации 725. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 60, 61, 62, 63, 61, 65, 66 или 67.
Вариант реализации 726. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 69, 70, 71 или 72.
Вариант реализации 727. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 73.
Вариант реализации 728. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 или 81.
Вариант реализации 729. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 68.
Вариант реализации 730. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-708, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 82-103.
Вариант реализации 731. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 585-731, в котором сопряженный олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 732. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке, включающий контакт клетки с соединением или сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 493-731.
Вариант реализации 733. Способ по варианту реализации 732, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку печени.
Вариант реализации 734. Способ по варианту реализации 732, отличающийся тем, что клетка представляет собой гепатоцит.
Вариант реализации 735. Способ по любому из вариантов реализации 732-734, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 736. Способ по любому из вариантов реализации 732-734, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 737. Способ по варианту реализации 736, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 738. Способ по варианту реализации 736, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 739. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение или сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 493-731 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
Вариант реализации 740. Фармацевтическая композиция по варианту реализации 739, отличающаяся тем, что фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель выбран из стерильной воды и стерильного солевого раствора.
Вариант реализации 741. Способ лечения заболевания или состояния у животного, включающий введение фармацевтической композиции по варианту реализации 739 или 740 указанному животному и лечение посредством этого заболевания или состояния у животного.
Вариант реализации 742. Способ по варианту реализации 741, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 743. Способ по варианту реализации 741, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 744. Способ по любому из вариантов реализации 741-743, отличающийся тем, что заболевание или состояние представляет собой заболевание или состояние печени.
Вариант реализации 745. Способ по любому из вариантов реализации 741-743, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
Вариант реализации 746. Способ по варианту реализации 745, отличающийся тем, что введение осуществляют подкожной инъекцией.
Вариант реализации 747. Способ по варианту реализации 745, отличающийся тем, что введение осуществляют внутривенной инъекцией.
Вариант реализации 748. Способ по варианту реализации 745, отличающийся тем, что введение осуществляют внутримышечной инъекцией.
Вариант реализации 749. Способ по любому из вариантов реализации 741-748, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 750. Способ по любому из вариантов реализации 741-748, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе более 1 мг/кг.
Вариант реализации 751. Способ по любому из вариантов реализации 741-748, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе более 10 мг/кг.
Вариант реализации 752. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 2 месяца.
Вариант реализации 753. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 4 месяца.
Вариант реализации 754. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 6 месяцев.
Вариант реализации 755. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы в неделю.
Вариант реализации 756. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые две недели.
Вариант реализации 757. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые три недели.
Вариант реализации 758. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые четыре недели.
Вариант реализации 759. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые пять недель.
Вариант реализации 760. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые шесть недель.
Вариант реализации 761. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые семь недель.
Вариант реализации 762. Способ по любому из вариантов реализации 741-751, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые восемь недель.
Вариант реализации 763. Сопряженное антисмысловое соединение, содержащее: антисмысловый олигонуклеотид, содержащий 12-30 связанных нуклеозидов и группу конъюгата, при этом группа конъюгата содержит по меньшей мере один фрагмент, направляющий на клетку.
Вариант реализации 764. Способ снижения активности или количества белка аполипопротеина С-III в клетке, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 493-731; и снижение посредством этого активности или количества белка аполипопротеина С-III в клетке.
Вариант реализации 765. Способ снижения общего холестерина, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 493-731; и снижение посредством этого холестерина.
Вариант реализации 766. Способ снижения триглицеридов, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 493-731; и снижение посредством этого триглицеридов.
Вариант реализации 767. Способ снижения LDL, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 493-731; и снижение посредством этого LDL.
Вариант реализации 768. Способ увеличения HDL, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 493-731: и увеличение посредством этого HDL.
Вариант реализации 769. Способ по любому из вариантов реализации 764-768, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 770. Способ по любому из вариантов реализации 764-768, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 771. Способ по любому из вариантов реализации 764-768, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 772. Соединение или сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1-771, или его пролекарство.
Вариант реализации 773. Пролекарство антисмыслового соединения, содержащего структуру:
где ASO представляет собой антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1-771.
Вариант реализации 774. Пролекарство антисмыслового соединения, содержащего указанную структуру, при этом один или более метаболитов пролекарства имеют структуру:
и где ASO представляет собой антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1-771.
Вариант реализации 775. Пролекарство антисмыслового соединения, при этом один или более метаболитов пролекарства содержат антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1-771.
Вариант реализации 776. Пролекарство, содержащее:
где ASO представляет собой антисмысловый олигонуклеотид по любому из пп. 1-731.
Вариант реализации 777. Способ производства антисмыслового олигонуклеотида по любому из вариантов реализации 1-771.
Вариант реализации 778. Способ получения антисмыслового олигонуклеотида по любому из вариантов реализации 1-771.
Вариант реализации 779. Сопряженное соединение, содержащее по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу и один или более лигандов.
Вариант реализации 780. Сопряженное соединение по варианту реализации 779, содержащее два или более лиганда.
Вариант реализации 781. Сопряженное соединение по варианту реализации 779, содержащее три лиганда.
Вариант реализации 782. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 779-781, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкоиирансзы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюкогептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллононитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 783. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 779-781 котором лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин.
Вариант реализации 784. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 779-783, в котором группа конъюгата содержит структуру, выбранную из:
Вариант реализации 785. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации; 779-784, в котором сопряженное соединение содержит связку, имеющую структуру, выбранную из:
где L представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, C1-С6 алкил или замещенный C1-C6 алкил;
R2представляет собой Н, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил; и
каждый m1независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 786. Сопряженное соединение по варианту реализации 785, в котором связка имеет структуру, выбранную из:
где Z2 представляет собой Н или CH3; и
каждый m1независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 787. Сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 779-786, в котором указанное сопряженное соединение ковалентно присоединено к олигонуклеотиду.
Вариант реализации 788. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа конъюгата представляет собой сопряженное соединение по любому из вариантов реализации 780-786.
Вариант реализации 789. Соединение, имеющее формулу (V):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a или GalNAc3-11a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомернего соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 790. Соединение, имеющее формулу (VIII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 791. Соединение, имеющее формулу (IX):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 792. Соединение, имеющее формулу (X):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 793. Соединение, имеющее формулу (XI):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 794. Соединение, имеющее формулу (XII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 795. Соединение, имеющее формулу (XIII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 796. Соединение, имеющее формулу (XIV):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 797. Соединение, имеющее формулу (XV):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 798. Соединение, имеющее формулу (I):
где:
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
T1 представляет собой гидроксил, водород, гидроксил-защитную группу, фосфорный фрагмент или химически активную фосфорную группу.
Вариант реализации 799. Соединение, имеющее формулу (II):
где:
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
T1 представляет собой гидроксил, водород, гидроксил-защитную группу, фосфорный фрагмент или химически активную фосфорную группу.
Вариант реализации 800. Соединение по любому из вариантов реализации 798 или 799, в котором фосфорный фрагмент имеет формулу:
где:
n равен 0 или 1;
Ra и Rc, каждый независимо, представляют собой ОН, SH, C1-C6 алкил, замещенный C1-C6 алкил, С1-С6 алкокси, замещенный C1-C6 алкокси, амино или замещенный амино; и
Rb представляет собой O или S.
Вариант реализации 801. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа конъюгата представляет собой сопряженное соединение формулы (III):
где:
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
Т2 представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, присоединенную к нуклеозиду, нуклеотиду, олигонуклеозиду, олигонуклеотиду, мономерной субъединице или олигомерному соединению.
Вариант реализации 802. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа конъюгата представляет собой сопряженное соединение формулы (IV):
где:
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и
Т2 представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, присоединенную к нуклеозиду, нуклеотиду, олигонуклеозиду, олигонуклеотиду, мономерной субъединице или олигомерному соединению.
Вариант реализации 803. Соединение или олигомерное соединение по любому из вариантов реализации 798-802, в котором гетероциклический основной фрагмент представляет собой пиримидин, замещенный пиримидин, пурин или замещенный пурин.
Вариант реализации 804. Соединение или олигомерное соединение по любому из вариантов реализации 798-802, в котором Вх представляет собой урацил, тимин, цитозин, 5-метилцитозин, аденин или гуанин.
Вариант реализации 805. Соединение или олигомерное соединение по любому из вариантов реализации 798-802, в котором Вх представляет собой аденин.
Вариант реализации 806. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где:
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент
C представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 807. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где:
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
C представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд;
n1 равен 0 или 1; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 808. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
C представляет собой линкер конъюгата;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 809. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
C представляет собой линкер конъюгата;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 810. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
C представляет собой линкер конъюгата;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 811. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 812. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
B представляет собой расщепляемый фрагмент;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 813. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
D представляет собой группу ветвления;
каждый E представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 814. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру,
выбранную из:
где каждый L независимо представляет собой фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу; и каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 815. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру,
выбранную из:
Вариант реализации 816. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру:
Вариант реализации 817. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 818. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 819. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 820. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит пирролидин.
Вариант реализации 821. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата не содержит пирролидин.
Вариант реализации 822. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит ПЭГ.
Вариант реализации 823. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит амид.
Вариант реализации 824. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата не содержит амид.
Вариант реализации 825. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит полиамид.
Вариант реализации 826. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит амин.
Вариант реализации 827. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит одну или более дисульфидных связей.
Вариант реализации 828. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата содержит белковый связывающий фрагмент.
Вариант реализации 829. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 828, в котором белковый связывающий фрагмент содержит липид.
Вариант реализации 830. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 829, в котором белковый связывающий фрагмент выбран из: холестерина, холевой кислоты, адамантан-уксусной кислоты, 1-пирен-масляной кислоты, дигидротестостерона, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерина, геранилоксигексиловой группы, гексадецилглицерина, борнеола, ментола, 1,3-пропандиола, гептадециловой группы, пальмитиновой кислоты, миристиновой кислоты, O3-(олеоил)литохолевой кислоты, O3-(олеоил)холеновой кислоты, диметокситритила или феноксазина, витамина (например; фолата, витамина A, витамина E, биотина, пиридоксаля), пептида, углевода (например, моносахарида, дисахарида, трисахарида, тетрасахарида, олигосахарида, полисахарида), эндосомолитического компонента, стероида (например, уваола, гецигенина, диосгенина), терпена (например, тритерпена, например, сарсасапогенина, фриделина, литохолевой кислоты, дериватизованной эпифриделанолом) или катионного липида.
Вариант реализации 831. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 828-830, в котором белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от С16 до С22, холестерин, холевую кислоту, витамин E, адамантан или 1-пентафтор пропил.
Вариант реализации 832. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и p равен от 1 до 6.
Вариант реализации 833. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру,
выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 834. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 835. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-810, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 836. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет одну из следующих структур:
где каждый А1 независимо представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 837. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет одну из следующих структур:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 838. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 839. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 840. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 841. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 842. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-835, в котором группа ветвления содержит простой эфир.
Вариант реализации 843. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
Вариант реализации 844. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 845. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-835, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 846. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-835, в котором группа ветвления содержит:
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
Вариант реализации 847. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-835, в котором группа ветвления содержит:
Вариант реализации 848. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-847, в котором каждая связка выбрана из:
где L выбран из фосфорной связывающей группы и нейтральной связывающей группы;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил;
R2 представляет собой Н, C1-C6 алкил или замещенный С1-С6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 849. Сопряженное антисмысловое соединение по варианту реализации 806-847, в котором каждая связка выбрана из:
где Z2 представляет собой Н или CH3; и
каждый m2 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m2 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 850. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из
вариантов реализации 806-847, в котором по меньшей мере одна связка содержит ПЭГ.
Вариант реализации 851. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из
вариантов реализации 806-847, в котором по меньшей мере одна связка содержит амид.
Вариант реализации 852. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором по меньшей мере одна связка содержит полиамид.
Вариант реализации 853. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором по меньшей мере одна связка содержит амии.
Вариант реализации 854. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором по меньшей мере две связки отличны друг от друга.
Вариант реализации 855. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором все связки являются одинаковыми.
Вариант реализации 856. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором каждая связка выбрана из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый p равен от 1 до около 6.
Вариант реализации 857. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором каждая связка выбрана из:
Вариант реализации 858. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 859. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-847, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
Вариант реализации 860. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 861. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 862. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-859, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 863. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-859, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 864. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-859, в котором направляющий фрагмент содержит два лиганда.
Вариант реализации 865. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-859, в котором направляющий фрагмент содержит три лиганда.
Вариант реализации 866. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-859, в котором каждый лиганд ковалентно присоединен к каждой связке.
Вариант реализации 867. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором по меньшей мере один лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 868. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 869. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы. производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-
глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-О-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 870. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором лиганд представляет собой галактозу.
Вариант реализации 871. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором лиганд представляет манноза-6-фосфат.
Вариант реализации 872. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором каждый лиганд выбран из:
где каждый R1 выбран из ОН и NHCOOH.
Вариант реализации 873. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором каждый лиганд выбран из:
Вариант реализации 874. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 875. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 862-866, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 876. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 877. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 878. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 879. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 880. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 881. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 882. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 883. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 884. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 885. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 886. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 806-860, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 887. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 888. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 889. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 890. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 891. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 892. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 893. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку.
Вариант реализации 894. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где A представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку.
Вариант реализации 895. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 896. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 897. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 898. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
и где А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 899. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
и где А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 900. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 901. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 902. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 903. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 904. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 905. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 906. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 779-789, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
Вариант реализации 907. Сопряженный олигонуклеотид, содержащий олигонуклеотид и группу конъюгата, при этом группа конъюгата представляет собой любую группу конъюгата по любому из вариантов реализации 779-907.
Вариант реализации 908. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 907, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 909. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 908, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит модифицированное основание.
Вариант реализации 910. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 908 или 909, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 911. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 910, в котором заменитель сахара представляет собой тетрагидропиран.
Вариант реализации 912. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 911, в котором тетрагидропиран представляет собой F-HNA.
Вариант реализации 913. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 908-912, в котором остальная часть олигонуклеотида содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий модифицированный сахар.
Вариант реализации 914. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 913, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий модифицированный сахар, выбран из бициклического нуклеозида и 2'-модифицированного нуклеозида.
Вариант реализации 915. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 914, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой бициклический нуклеозид.
Вариант реализации 916. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 915, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-СН2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 917. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 915, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-(СН2)2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 918. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 915, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-С(СН3)Н-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 919. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 914, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 920. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 919, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид выбран из 2'-F нуклеозида, 2'-ОСН3 нуклеозида и 2'-O(СН2)2OCH3 нуклеозида.
Вариант реализации 921. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 920, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 922. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 920, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 923. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 920, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-O(СН2)2ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 924. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-923, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере один немодифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 925. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 924, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой рибонуклеозид.
Вариант реализации 926. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 924, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой дезоксирибонуклеозид.
Вариант реализации 927. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-926, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере два немодифицированных нуклеозида.
Вариант реализации 928. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 927, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат одинаковую модификацию.
Вариант реализации 929. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 927, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат различные модификации.
Вариант реализации 930. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 927-929, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 931. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 927-930, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит 2'-модификацию.
Вариант реализации 932. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 931, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов независимо выбран из 2'-F нуклеозидов, 2'-ОСН3 нуклеозидов и 2'-O(СН2)2OCH3 нуклеозидов.
Вариант реализации 933. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 932, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 934. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 932, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 935. Сопряженный олигонуклеотид по варианту реализации 932, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-O(СН2)2OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 936. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-935, в котором по существу каждый нуклеозид указанного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 937. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-927 или 930-936, в котором каждый нуклеозид указанного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 938. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-937, в котором олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 939. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-937, в котором олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 940. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-937, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение.
Вариант реализации 941. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-937, в котором олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид основе RISC.
Вариант реализации 942. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-937, отличающийся тем, что олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 943. Сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 907-937, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 944. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата присоединена к 5'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 945. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата присоединена к 3'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 946. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата присоединена к внутреннему нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 947. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного олигонуклеотидного соединения в гепатоцит, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 948. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного олигонуклеотидного соединения в клетке печени, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 949. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата увеличивает накопление сопряженного олигонуклеотидного соединения в печени, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 950. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-943, в котором группа конъюгата снижает накопление сопряженного олигонуклеотидного соединения в почках, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 951. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 907-935 или 938-950, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет сахарный мотив, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов-3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 952. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 951, в котором 5'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 953. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 951, в котором 5'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 954. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 951, в котором 5'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 955. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 951, в котором 5'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 956. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-955, в котором 3'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 957. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-955, в котором 3'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 958. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-955, в котором 3'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 959. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-955, в котором 3'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 960. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-959, в котором центральная область состоит из 5 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 961. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-959, в котором центральная область состоит из 6 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 962. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-959, в котором центральная область состоит из 7 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 963. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-959, в котором центральная область состоит из 8 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 964. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-959, в котором центральная область состоит из 9 связанны к нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 965. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-959, в котором центральная область состоит из 10 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 966. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-965, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 14-26 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 967. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-965, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 15-25 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 968. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-965, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 969. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-968, в котором каждый модифицированный нуклеозид независимо содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент или бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 970. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 969, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 971. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 970, в котором каждый модифицированный нуклеозид, содержащий 2'-замещенный сахарный фрагмент, содержит 2'-заместитель, независимо выбранный из: галогена, необязательно замещенного аллила, необязательно замещенного амино, азидо, необязательно замещенного SH, CN, OCN, CF3, OCF3, О, S или N(Rm)-алкенила; О, S или N(Rm)-алкила; О, S или N(Rm)-алкинила; необязательно замещенного О-алкиленил-О-алкила, необязательно замещенного алкинила, необязательно замещенного алкарила, необязательно замещенного аралкила, необязательно замещенного О-алкарила, необязательно замещенного О-аралкила, O(СН2)2SCH3, O-(СН2)2-O-N(Rm)(Rn) или О-СН2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н, амино-защитную группу или замещенный или незамещенный C1-С10 алкил;
где каждая необязательно замещенная группа необязательно замещена группой заместителя, независимо выбранной из: гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
Вариант реализации 972. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 970, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCH2F, OCHF2, OCF3, OCH2CH3, O(СН2)2F, OCH2CHF2, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3, O(СН2)2-SCH3, O(СН2)2-OCF3, O(СН2)3-N(R1)(R2), O(CH2)2-ON(R1)(R2), O(СН2)2-O(СН2)2-N(R1)(R2), ОСН2С(=O)-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R3)-(СН2)2-N(R1)(R2) и O(СН2)2-N(R3)-C(=NR4)[N(R1)(R2)]; где каждый R1, R2, R3 и R4 независимо представляет собой H или C1-С6 алкил.
Вариант реализации 973. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 970, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3(МОЕ), O(СН2)2-O(СН2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(СН2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 974. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 970, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-МОЕ сахарный фрагмент.
Вариант реализации 975. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 970, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-ОМе сахарный фрагмент.
Вариант реализации 976. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 970, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-F сахарный фрагмент.
Вариант реализации 977. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-968, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий заменитель сахара.
Вариант реализации 978. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 977, в котором модифицированный нуклеозид содержит F-HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 979. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 977, в котором модифицированный нуклеозид содержит HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 980. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 951-968, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 981. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 980, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой cEt сахарный фрагмент.
Вариант реализации 982. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 980, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой LNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 983. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-982, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 984. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 908, в котором каждая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 985. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 983, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную связь и по меньшей мере одну немодифицированную фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 986. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-985, в котором по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 987. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-985, в котором каждая модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 988. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 989. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 990. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 991. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 992. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 993. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 994. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 995. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 996. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983-984, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 997. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 16 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 998. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 999. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1000. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1001. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1002. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1003. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1004. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1005. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1006. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1007. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 983 или 985-996, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1008. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1007, в котором каждая концевая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1009. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-984 или 997-1008, в котором каждая межнуклеозидная связь, связывающая два дезоксинуклеозида сопряженного олигонуклеотида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1010. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-984 или 997-1009, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь, связывающая два модифицированных нуклеозида сопряженного олигонуклеотида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1011. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-984 или 997-1010, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида, которая находится в положении 3' модифицированного нуклеозида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1012. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-984 или 997-1011, в котором каждая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида, который находится в положении 3' дезоксинуклеозида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1013. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-984 или 997-1012, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет химический мотив, выбранный из:
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM; и
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь, и каждый у представляет собой либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, при условии, что по меньшей мере один у представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1014. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-984 или 997-1012, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет химический мотив, выбранный из:
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM; и
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM;
где каждый М независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый о представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, и каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1015. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 1013 или 1014, в котором каждый М независимо выбран из: 2'-МОЕ нуклеозида и бициклического нуклеозида.
Вариант реализации 1016. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 1015, в котором каждый М независимо выбран из 2'-МОЕ нуклеозида, cEt нуклеозида и LNA нуклеозида.
Вариант реализации 1017. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 1015 или 1016, в котором каждый М представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.
Вариант реализации 1018. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 1015 или 1016, в котором каждый М представляет собой cEt нуклеозид.
Вариант реализации 1019. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по вариантам реализации 1015 или 1016, в котором каждый М представляет собой LNA нуклеозид.
Вариант реализации 1020. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 8 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1021. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 10 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1022. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 12 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1023. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 14 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1024. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 16 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1025. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 18 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1026. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид по меньшей мере на 90% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1027. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид по меньшей мере на 95% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1028. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1019, в котором сопряженный олигонуклеотид на 100% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1029. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1028, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой пре-мРНК.
Вариант реализации 1030. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1028, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой мРНК.
Вариант реализации 1031. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1030, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой микроРНК.
Вариант реализации 1032. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1030, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1033. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1030, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 1034. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1030, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: рецептора андрогена, аполипопротеина (а), аполипопротеина В, аполипопротеина C-III, С-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы 1B, STAT3, SRB-1 и транстиретина.
Вариант реализации 1035. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1020-1031, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой вирусную нуклеиновую кислоту.
Вариант реализации 1036. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 1035, отличающееся тем, что вирусная нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1037. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по варианту реализации 1036, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту вируса гепатита В.
Вариант реализации 1038. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24.
Вариант реализации 1039. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 25, 26, 27, 28, 29 или 30.
Вариант реализации 1040. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 31.
Вариант реализации 1041. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 32.
Вариант реализации 1042. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 33.
Вариант реализации 1043. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 34.
Вариант реализации 1044. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42 или 43.
Вариант реализации 1045. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 44, 45, 46, 47 или 48.
Вариант реализации 1046. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58 или 59.
Вариант реализации 1047. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66 или 67.
Вариант реализации 1048. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 69, 70, 71 или 72.
Вариант реализации 1049. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 73.
Вариант реализации 1050. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 или 81.
Вариант реализации 1051. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 68.
Вариант реализации 1052. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1030, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 82-103, 111 или 113.
Вариант реализации 1053. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 907-1052, в котором сопряженный олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1054. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение или сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 779-1053 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
Вариант реализации 1055. Фармацевтическая композиция по варианту реализации 1054, отличающаяся тем, что фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель выбран из стерильной воды и стерильного солевого раствора.
Вариант реализации 1056. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке, включающий контакт клетки с соединением или сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 779-1053 или с фармацевтической композицией по вариантам реализации 1054-1055.
Вариант реализации 1057. Способ по варианту реализации 1056, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку печени.
Вариант реализации 1058. Способ по варианту реализации 1056, отличающийся тем, что клетка представляет собой гепатоцит.
Вариант реализации 1059. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1058, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 1060. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1058, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 1061. Способ по варианту реализации 1060, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 1062. Способ по варианту реализации 1060, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1063. Способ лечения заболевания или состояния у животного, включающий введение фармацевтической композиции по варианту реализации 1054 или 1056 указанному животному и лечение посредством этого заболевания или состояния у животного.
Вариант реализации 1064. Способ по варианту реализации 1063, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 1065. Способ по варианту реализации 1063, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1066. Способ по любому из вариантов реализации 1063-1065, отличающийся тем, что заболевание или состояние представляет собой заболевание или состояние печени.
Вариант реализации 1067. Способ по любому из вариантов реализации 1063-1065, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
Вариант реализации 1068. Способ по варианту реализации 1067, отличающийся тем, что введение осуществляют подкожной инъекцией.
Вариант реализации 1069. Способ по варианту реализации 1067, отличающийся тем, что введение осуществляют внутривенной инъекцией.
Вариант реализации 1070. Способ по варианту реализации 1067, отличающийся тем, что введение осуществляют внутримышечной инъекцией.
Вариант реализации 1071. Способ по любому из вариантов реализации 741-748, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 1072. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1070, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе менее 1 мг/кг.
Вариант реализации 1073. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1070, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе более 10 мг/кг.
Вариант реализации 1074. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 2 месяца.
Вариант реализации 1075. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 4 месяца.
Вариант реализации 1076. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 6 месяцев.
Вариант реализации 1077. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы в неделю.
Вариант реализации 1078. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые две недели.
Вариант реализации 1079. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые три недели.
Вариант реализации 1080. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые четыре недели.
Вариант реализации 1081. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые пять недель.
Вариант реализации 1082. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые шесть недель.
Вариант реализации 1083. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые семь недель.
Вариант реализации 1084. Способ по любому из вариантов реализации 1056-1073, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые восемь недель.
Вариант реализации 1085. Сопряженное антисмысловое соединение, содержащее:
антисмысловый олигонуклеотид, содержащий 12-30 связанных нуклеозидов и группу конъюгата, при этом группа конъюгата содержит по меньшей мере один фрагмент, направляющий на клетку.
Вариант реализации 1086. Способ снижения активности или количества белка аполипопротеина С-III в клетке, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 779-1055; и снижение посредством этого активности или количества белка аполипопротеина С-III в клетке.
Вариант реализации 1087. Способ снижения общего холестерина, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 779-1055; и снижение посредством этого общего холестерина.
Вариант реализации 1088. Способ снижения триглицеридов, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 779-1055; и снижение посредством этого триглицеридов.
Вариант реализации 1089. Способ снижения LDL, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 779-1055; и снижение посредством этого LDL.
Вариант реализации 1090. Способ увеличения HDL, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из вариантов реализации 779-1055; и увеличение посредством этого HDL.
Вариант реализации 1091. Способ по любому из вариантов реализации 1086-1090, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 1092. Способ по любому из вариантов реализации 1086-1090, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 1093. Способ по любому из вариантов реализации 1086-1090, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1094. Соединение или сопряженный олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1-1055, или его пролекарство.
Вариант реализации 1095. Способ производства антисмыслового олигонуклеотида по любому из вариантов реализации 1-1055.
Вариант реализации 1096. Способ получения антисмыслового олигонуклеотида по любому из вариантов реализации 1-1055.
Вариант реализации 1097. Способ производства сопряженного антисмыслового соединения по любому из вариантов реализации 1-1055, при этом указанный способ включает составление композиции сопряженного антисмыслового соединения для применения у людей, выполнение хроматографического анализа составленного в композицию сопряженного антисмыслового соединения и упаковывание сопряженного антисмыслового соединения в форму, готовую для продажи.
Вариант реализации 1098. Сопряженное соединение, содержащее по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу и один или более лигандов.
Вариант реализации 1099. Сопряженное соединение по п. 1098, содержащее два или более лигандов.
Вариант реализации 1100. Сопряженное соединение по п. 1098, содержащее три лиганда.
Вариант реализации 1101. Сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1100, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофуранозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранозы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-
ацетилгалактозамина, 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-О-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-О-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-О-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 1102. Сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1101 котором лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин.
Вариант реализации 1103. Сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1102, в котором группа конъюгата содержит структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 12; и
где m равен от 1 до 12.
Вариант реализации 1104. Сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1102, в котором сопряженное соединение содержит связку, имеющую структуру, выбранную из:
где L представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный C1-С6 алкил;
R2 представляет собой Н, C1-C6 алкил или замещенный C1-С6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 1105. Сопряженное соединение по п. 1104, в котором связка имеет структуру, выбранную из:
где Z2 представляет собой Н или СН3; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 1106. Сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1102, в котором связка имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 12; и
где m равен от 1 до 12.
Вариант реализации 1107. Сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1106, в котором указанное сопряженное соединение ковалентно присоединено к олигонуклеотиду.
Вариант реализации 1108. Олигомерное соединение, содержащее олигонуклеотид и по меньшей мере одну группу конъюгата, при этом по меньшей мере одна группа конъюгата представляет собой сопряженное соединение по любому из пп. 1098-1108.
Вариант реализации 1109. Соединение, имеющее формулу (V):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a или GalNAc3-22a,
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1110. Соединение, имеющее формулу (Va):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a или GalNAc3-22a, а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и где Q13 выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3(МОЕ), O(СН2)2-O(СН2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(СН2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 1111. Соединение по п. 1109 или 1110, в котором Вх выбран из аденина, гуанина, тимина, урацила или цитозина.
Вариант реализации 1112. Соединение по любому из пп. 1109-1111, в котором Q13 представляет собой O(СН2)2-ОСН3.
Вариант реализации 1113. Соединение, имеющее формулу (XVI):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1114. Соединение, имеющее формулу (XVII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1115. Соединение, имеющее формулу (XVIII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1116. Соединение, имеющее формулу (XIX):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1117. Соединение, имеющее формулу (XX):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1118. Соединение, имеющее формулу (XXI):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1119. Соединение, имеющее формулу (XXII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1120. Соединение, имеющее формулу (XXIII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1121. Соединение, имеющее формулу (XXIIIa):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1122. Соединение, имеющее формулу (XXIV):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1123. Соединение, имеющее формулу (XXIVa):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1124. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1125. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где:
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд;
n1 равен 0 или 1; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1126. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
С представляет собой линкер конъюгата;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1127. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
С представляет собой линкер конъюгата;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1128. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
С представляет собой линкер конъюгата;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1129. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1130. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1131. Сопряженное антисмысловое соединение, при этом указанное соединение имеет структуру, представленную формулой:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
D представляет собой группу ветвления;
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
Вариант реализации 1132. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый L независимо представляет собой фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1133. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 1134. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата имеет структуру:
Вариант реализации 1135. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 1136. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 1137. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата имеет одну из структур, выбранных из:
Вариант реализации 1138. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит пирролидин.
Вариант реализации 1139. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1140. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит ПЭГ.
Вариант реализации 1141. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит амид.
Вариант реализации 1142. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата не содержит амид.
Вариант реализации 1143. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит полиамид.
Вариант реализации 1144. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит амин.
Вариант реализации 1145. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит одну или более дисульфидных связей.
Вариант реализации 1146. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором линкер конъюгата содержит белковый связывающий фрагмент.
Вариант реализации 1147. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1146, в котором белковый связывающий фрагмент содержит липид.
Вариант реализации 1148. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1146, в котором белковый связывающий фрагмент выбран из: холестерина, холевой кислоты, адамантан-уксусной кислоты, 1-пирен-масляной кислоты, дигидротестостерона, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерина, геранилоксигексиловой группы, гексадецилглицерина,
борнеола, ментола, 1,3-пропандиола, гептадециловой группы, пальмитиновой кислоты, миристиновой кислоты, O3-(олеоил)литохолевой кислоты, O3-(олеоил)холеновой кислоты, диметокситритила или феноксазина, витамина (например, фолата, витамина А, витамина Е, биотина, пиридоксаля), пептида, углевода (например, моносахарида, дисахарида, трисахарида, тетрасахарида, олигосахарида, полисахарида), эндосомолитического компонента, стероида (например, уваола, гецигенина, диосгенина), терпена (например, тритерпена, например, сарсасапогенина, фриделина, литохолевой кислоты, дериватизованной эпифриделанолом) или катионного липида.
Вариант реализации 1149. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1146-1147, в котором белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от С16 до С22, холестерин, холевую кислоту, витамин Е, адамантан или 1-пентафторпропил.
Вариант реализации 1150. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1128, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и р равен от 1 до 6.
Вариант реализации 1151. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1128, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1152. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1128, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 1153. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1128, в котором линкер конъюгата имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1154. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет одну из следующих структур:
где каждый A1 независимо представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1155. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет одну из следующих структур:
где каждый А1 независимо представляет собой О, S, С=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1156. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1157. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1158. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1159. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1160. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1154, в котором группа ветвления содержит простой эфир.
Вариант реализации 1161. Сопряженное антисмысловое соединение поп.1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
Вариант реализации 1162. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1163. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1154, в котором группа ветвления имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1164. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1154, в котором группа ветвления содержит:
где каждый j представляет собой целое число от 1 до 3; и
где каждый n представляет собой целое число от 1 до 20.
Вариант реализации 1165. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1154, в котором группа ветвления содержит:
Вариант реализации 1166. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1165, в котором каждая связка выбрана из:
где L выбран из фосфорной связывающей группы и нейтральной связывающей группы;
Z1 представляет собой С(=O)O-R2;
Z2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный С1-С6 алкил;
R2 представляет собой Н, С1-С6 алкил или замещенный С1-С6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 1167. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1165, в котором каждая связка выбрана из:
где Z2 представляет собой Н или СН3; и
каждый m2 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m2 больше 0 для каждой связки.
Вариант реализации 1168. Сопряженное антисмысловое соединение по п. 1124-1165, в котором каждая связка выбрана из:
где n равен от 1 до 12; и
где m равен от 1 до 12.
Вариант реализации 1169. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором по меньшей мере одна связка содержит ПЭГ.
Вариант реализации 1170. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором по меньшей мере одна связка содержит амид.
Вариант реализации 1171. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором по меньшей мере одна связка содержит полиамид.
Вариант реализации 1172. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором по меньшей мере одна связка содержит амин.
Вариант реализации 1173. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором по меньшей мере две связки отличны друг от друга.
Вариант реализации 1174. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором все связки являются одинаковыми.
Вариант реализации 1175. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором каждая связка выбрана из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый р равен от 1 до около 6.
Вариант реализации 1176. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором каждая связка выбрана из:
Вариант реализации 1177. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124 1165, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1178. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1165, в котором каждая связка имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1179. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1178, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит по меньшей мере один лиганд.
Вариант реализации 1180. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1178, в котором фрагмент, направляющий на клетку, содержит один лиганд.
Вариант реализации 1181. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1178, в котором направляющий фрагмент содержит два лиганда.
Вариант реализации 1182. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1178, в котором направляющий фрагмент содержит три лиганда.
Вариант реализации 1183. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором каждый лиганд ковалентно присоединен к каждой связке.
Вариант реализации 1184. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором по меньшей мере один лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 1185. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc).
Вариант реализации 1186. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором лиганд выбран из: полисахарида, модифицированного полисахарида, маннозы, галактозы, производного маннозы, производного галактозы, D-маннопиранозы, L-маннопиранозы, D-арабинозы, L-галактозы, D-ксилофурэкозы, L-ксилофуранозы, D-глюкозы, L-глюкозы, D-галактозы, L-галактозы, α-D-маннофуранозы, β-D-маннофуранозы, α-D-маннопиранозы, β-D-маннопиранозы, α-D-глюкопиранозы, β-D-глюкопиранозы, α-D-глюкофуранозы, β-D-глюкофуранозы, α-D-фруктофуранозы, α-D-фруктопиранозы, α-D-галактопиранозы, β-D-галактопиранъзы, α-D-галактофуранозы, β-D-галактофуранозы, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-амино-3-D-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы, 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы, N-гликолоил-α-нейраминовой кислоты, 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-D-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-tho-β-D-галактопиранозы, этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида, 2,5-ангидро-D-аллонитрила, рибозы, D-рибозы, D-4-тиорибозы, L-рибозы, L-4-тиорибозы.
Вариант реализации 1187. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором лиганд представляет собой галактозу.
Вариант реализации 1188. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором лиганд представляет манноза-6-фосфат.
Вариант реализации 1189. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором каждый лиганд выбран из:
где каждый R1 выбран из ОН и NHCOOH.
Вариант реализации 1190. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором каждый лиганд выбран из:
Вариант реализации 1191. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1192. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1179-1182, в котором каждый лиганд имеет следующую структуру:
Вариант реализации 1193. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1194. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1195. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
Вариант реализации 1196. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1197. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1198. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1199. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1200. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1201. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1202. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1203. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1204. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1205. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1206. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1207. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1208. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1209. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1210. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124 1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1211. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1212. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1213. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1214. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1215. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1216. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1153, в котором группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, имеющий следующую структуру:
Вариант реализации 1217. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1218. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1219. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1220. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
Z представляет собой Н или связанную твердую подложку; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1221. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1222. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1223. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1224. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1225. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1226. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1227. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1228. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-OCH3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1229. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1230. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1231. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из пп. 1124-1131, в котором группа конъюгата имеет следующую структуру:
где Q13 представляет собой Н или O(СН2)2-ОСН3;
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1232. Соединение по любому из пп. 1217-1231, в котором Вх выбран из аденина, гуанина, тимина, урацила или цитозина.
Вариант реализации 1233. Соединение по любому из пп. 1217-1231, в котором Вх представляет собой аденин.
Вариант реализации 1234. Соединение по любому из пп. 1217-1231, в котором Вх представляет собой тимин.
Вариант реализации 1235. Соединение по любому из пп. 1217-1234, в котором Q13 представляет собой O(СН2)2-ОСН3.
Вариант реализации 1236. Соединение по любому из пп. 1217-1234, в котором Q13 представляет собой Н.
Вариант реализации 1237. Сопряженный олигонуклеотид, содержащий олигонуклеотид и группу конъюгата, при этом группа конъюгата представляет собой любую группу конъюгата по любому из пп. 1098-1236.
Вариант реализации 1238. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1237, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1239. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1237, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит модифицированное основание.
Вариант реализации 1240. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1238 или 1239, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 1241. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1240, в котором заменитель сахара представляет собой тетрагидропиран.
Вариант реализации 1242. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1241, в котором тетрагидропиран представляет собой F-HNA.
Вариант реализации 1243. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1238-1242, в котором остальная часть олигонуклеотида содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий модифицированный сахар.
Вариант реализации 1244. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1243, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий модифицированный сахар, выбран из бициклического нуклеозида и 2'-модифицированного нуклеозида.
Вариант реализации 1245. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1244, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой бициклический нуклеозид.
Вариант реализации 1246. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1245, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-СН2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1247. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1245, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-(СН2)2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1248. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1245, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-С(СН3)Н-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1249. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1244, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1250. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1249, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид выбран из 2'-F нуклеозида, 2'-OCH3 нуклеозида и 2'-O(СН2)2OCH3 нуклеозида.
Вариант реализации 1251. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1250, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 1252. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1250, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 1253. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1250, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-O(СН2)2OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 1254. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1253, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере один немодифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1255. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1254, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой рибонуклеозид.
Вариант реализации 1256. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1254, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой дезоксирибонуклеозид.
Вариант реализации 1257. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1256, в котором олигонуклеотид содержит по меньшей мере два немодифицированных нуклеозида.
Вариант реализации 1258. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1257, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат одинаковую модификацию.
Вариант реализации 1259. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1257, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат различные модификации.
Вариант реализации 1260. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1257-1259, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 1261. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1257-1260, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит 2'-модификацию.
Вариант реализации 1262. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1261, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов независимо выбран из 2'-F нуклеозидов, 2'-OCH3 нуклеозидов и 2'-O(СН2)2OCH3 нуклеозидов.
Вариант реализации 1263. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1262, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 1264. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1262, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-OCH3 нуклеозид.
Вариант реализации 1265. Сопряженный олигонуклеотид по п. 1262, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-O(СН2)2ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 1266. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1265, в котором по существу каждый нуклеозид указанного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1267. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1257 или 1260-1266, в котором каждый нуклеозид указанного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1268. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1267, в котором олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1269. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1267, в котором олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1270. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1267, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение.
Вариант реализации 1271. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1267, в котором олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид на основе RISC.
Вариант реализации 1272. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1267, отличающийся тем, что олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1273. Сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1237-1267, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1274. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата присоединена к 5'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1275. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата присоединена к 3'-концевому нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1276. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата присоединена к внутреннему нуклеозиду антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1277. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного олигонуклеотидного соединения в гепатоцит, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 1278. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата увеличивает захват сопряженного олигонуклеотидного соединения в клетке печени, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 1279. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата увеличивает накопление сопряженного олигонуклеотидного соединения в печени, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 1280. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1273, в котором группа конъюгата снижает накопление сопряженного олигонуклеотидного соединения в почках, по сравнению с несопряженным олигонуклеотидным соединением.
Вариант реализации 1281. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1237-1265 или 1268-1280, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет сахарный мотив, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1282. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1281, в котором 5'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1283. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1281, в котором 5'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1284. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1281, в котором 5'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1285. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1281, в котором 5'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1286. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1285, в котором 3'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1287. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1285, в котором 3'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1288. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1285, в котором 3'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1289. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1285, в котором 3'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1290. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1289, в котором центральная область состоит из 5 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1291. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1289, в котором центральная область состоит из 6 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1292. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1289, в котором центральная область состоит из 7 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1293. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1289, в котором центральная область состоит из 8 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1294. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1289, в котором центральная область состоит из 9 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1295. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1289, в котором центральная область состоит из 10 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1296. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1295, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 14-26 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1297. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1295, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 15-25 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1298. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1295, в котором сопряженный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1299. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1298, в котором каждый модифицированный нуклеозид независимо содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент или бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1300. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1299, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1301. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1300, в котором каждый модифицированный нуклеозид, содержащий 2'-замещенный сахарный фрагмент, содержит 2'-заместитель, независимо выбранный из: галогена, необязательно замещенного аллила, необязательно замещенного амино, азидо, необязательно замещенного SH, CN, OCN, CF3, OCF3, О, S или N(Rm)-алкила; О, S или N(Rm)-алкенила; О, S или N(Rm)-алкинила; необязательно замещенного О-алкиленил-О-алкила, необязательно замещенного алкинила, необязательно замещенного алкарила,
необязательно замещенного аралкила, необязательно замещенного О-алкарила, необязательно замещенного О-аралкила, O(СН2)2SCH3, O-(СН2)2-O-N(Rm)(Rn) или О-СН2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н, амино-защитную группу или замещенный или незамещенный C1-С10 алкил; где каждая необязательно замещенная группа необязательно замещена группой заместителя, независимо выбранной из: гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
Вариант реализации 1302. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1300, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCH2F, OCHF2, OCF3, ОСН2СН3, O(СН2)2F, OCH2CHF2, OCH2CF3, OCH2-CH=СН2, O(СН2)2-OCH3, O(СН2)2-SCH3, O(СН2)2-OCF3, O(СН2)3-N(R1)(R2), O(СН2)2-ON(R1)(R2), O(СН2)2-O(СН2)2-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R3)-(СН2)2-N(R1)(R2) и O(СН2)2-N(R3)-C(=NR4)[N(R1)(R2)]; где каждый R1, R2, R3 и R4 независимо представляет собой Н или С1-С6 алкил.
Вариант реализации 1303. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1300, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3ОСН3 (МОЕ), O(СН2)2-O(СН2)2-N(CH3)2 OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(СН2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 1304. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1300, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-MOE сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1305. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1300, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-ОМе сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1306. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1300, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-F сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1307. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1298, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий заменитель сахара.
Вариант реализации 1308. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1307 в котором модифицированный нуклеозид содержит F-HNA сахарный фрагмент
Вариант реализации 1309. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1307, в котором модифицированный нуклеозид содержит HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1310. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1281-1298, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1311. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п.1310, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой cEt сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1312. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1310, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой LNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1313. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1312, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1314. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1238, в котором каждая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1315. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1313, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную связь и по меньшей мере одну немодифицированную фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1316. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315, в котором по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1317. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315, в котором каждая модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1318. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1319. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1320. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1321. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1322. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1323. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1324. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1325. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1326. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1314, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1327. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 16 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1328. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1329. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1330. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1331. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1332. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1333. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1334. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1335. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1336. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1337. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1313 или 1315-1326, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1338. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1337, в котором каждая концевая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1339. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1314 или 1327-1338, в котором каждая межнуклеозидная связь, связывающая два дезоксинуклеозида сопряженного олигонуклеотида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1340. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1314 или 1327-1339, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь, связывающая два модифицированных нуклеозида сопряженного олигонуклеотида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1341. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1314 или 1327-1340, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида, которая находится в положении 3' модифицированного нуклеозида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1342. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1314 или 1327-1341, в котором каждая межнуклеозидная связь сопряженного олигонуклеотида, который находится в положении 3' дезоксинуклеозида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1343. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1314 или 1327-1342, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет химический мотив, выбранный из:
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM; и
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь, и каждый у представляет собой либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, при условии, что по меньшей мере один у представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1344. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1314 или 1327-1342, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет химический мотив, выбранный из:
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM; и
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый о представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, и каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1345. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1343 или 1344, в котором каждый М независимо выбран из: 2'-МОЕ нуклеозида и бициклического нуклеозида.
Вариант реализации 1346. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1345, в котором каждый М независимо выбран из 2'-МОЕ нуклеозида, cEt нуклеозида и LNA нуклеозида.
Вариант реализации 1347. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1345 или 1346, в котором каждый М представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.
Вариант реализации 1348. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1345 или 1346, в котором каждый М представляет собой cEt нуклеозид.
Вариант реализации 1349. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по пп 1345 или 1346, в котором каждый М представляет собой LNA нуклеозид.
Вариант реализации 1350. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пл. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 8 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1351. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 10 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1352. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательноегь нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 12 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1353. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность
нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 14 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1354. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 16 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1355. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 18 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1356. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид по меньшей мере на 90% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1357. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид по меньшей мере на 95% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1358. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1349, в котором сопряженный олигонуклеотид на 100% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1359. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1350-1358, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой пре-мРНК.
Вариант реализации 1360. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1350-1358, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой мРНК.
Вариант реализации 1361. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1350-1358, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой микроРНК.
Вариант реализации 1362. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1350-1358, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1363. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из in. 1350-1358, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 1364. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1350-1360, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: антитрипсина альфа 1, рецептора андрогена, аполипопротеина (а), аполипопротеина В, аполипопротеина C-III, С-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы IB, STAT3, SRB-1 и транстиретина.
Вариант реализации 1365. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1350-1361, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой вирусную нуклеиновую кислоту.
Вариант реализации 1366. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1365, отличающееся тем, что вирусная нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1367. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по п. 1366, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту вируса гепатита В.
Вариант реализации 1368. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24.
Вариант реализации 1369. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 25, 26, 27, 28, 29 или 30.
Вариант реализации 1370. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 31.
Вариант реализации 1371. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательности нуклеооснований с SEQ ID №: 32.
Вариант реализации 1372. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 33.
Вариант реализации 1373. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 34.
Вариант реализации 1374. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42 или 43.
Вариант реализации 1375. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 44, 45, 46, 47 или 48.
Вариант реализации 1376. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58 или 59.
Вариант реализации 1377. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66 или 67.
Вариант реализации 1378. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 69, 70, 71 или 72.
Вариант реализации 1379. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 73.
Вариант реализации 1380. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 или 81.
Вариант реализации 1381. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 68.
Вариант реализации 1382. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 82-103, 111 или 113.
Вариант реализации 1383. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из пп. 1237-1382, в котором сопряженный олигонуклеотид представляет собой ангисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1384. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение или сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1098-1383 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
Вариант реализации 1385. Фармацевтическая композиция по п. 1384, отличающаяся тем, что фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель выбран из стерильной воды и стерильного солевого раствора.
Вариант реализации 1386. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке, включающий контакт клетки с соединением или сопряженным антисмысловым соединением по любому из пп. 1098-1383 или с фармацевтической композицией по пп. 1384-1385.
Вариант реализации 1387. Способ по п. 1386, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку печени.
Вариант реализации 1388. Способ по п. 1386, отличающийся тем, что клетка представляет собой гепатоцит.
Вариант реализации 1389. Способ по любому из пп. 1386-1388, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 1390. Способ по любому из пп. 1386-1388, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 1391. Способ по п. 1060, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 1392. Способ по п. 1060, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1393. Способ лечения заболевания или состояния у животного,
включающий введение фармацевтической композиции по п. 1384 или 1386 указанному животному и лечение посредством этого заболевания или состояния у животного.
Вариант реализации 1394. Способ по п. 1393, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 1395. Способ по п. 1393, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1396. Способ по любому из пп. 1393-1395, отличающийся тем, что заболевание или состояние представляет собой заболевание или состояние печени.
Вариант реализации 1397. Способ по любому из пп. 1393-1395, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
Вариант реализации 1398. Способ по п. 1397, отличающийся тем, что введение осуществляют подкожной инъекцией.
Вариант реализации 1400. Способ по п. 1397, отличающийся тем, что введение осуществляют внутримышечной инъекцией.
Вариант реализации 1401. Способ по любому из пп. 1393-1400, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 1402. Способ по любому из пп. 1393-1400, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе менее 1 мг/кг.
Вариант реализации 1403. Способ по любому из пп. 1393-1400, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид представлен в дозе более 10 мг/кг.
Вариант реализации 1404. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 2 месяца.
Вариант реализации 1405. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 4 месяца.
Вариант реализации 1406. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем. что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 6 месяцев.
Вариант реализации 1407. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы в неделю.
Вариант реализации 1408. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые две недели.
Вариант реализации 1409. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем. что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые три недели.
Вариант реализации 1410. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые четыре недели.
Вариант реализации 1411. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые пять недель.
Вариант реализации 1412. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые шесть недель.
Вариант реализации 1413. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем, что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые семь недель.
Вариант реализации 1414. Способ по любому из пп. 1393-1403, отличающийся тем. что сопряженный олигонуклеотид обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые восемь недель.
Вариант реализации 1415. Сопряженное антисмысловое соединение, содержащее:
антисмысловый олигонуклеотид, содержащий 12-30 связанных нуклеозидов и группу конъюгата, при этом группа конъюгата содержит по меньшей мере один фрагмент, направляющий на клетку.
Вариант реализации 1416. Способ снижения активности или количества белка аполипопротеина С-III в клетке, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним сопряженным антисмысловым соединением по любому из пп. 1098-1385; и снижение посредством этого активности или количества белка аполипопротеина С-III в клетке.
Вариант реализации 1417. Способ снижения общего холестерина, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из пп. 1098-1385; и снижение посредством этого общего холестерина.
Вариант реализации 1418. Способ снижения триглицеридов, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из пп. 1098-1385; и снижение посредством этого триглицеридов.
Вариант реализации 1419. Способ снижения LDL, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из пп. 1098-1385; и снижение посредством этого LDL.
Вариант реализации 1420. Способ увеличения HDL, включающий контакт клетки по меньшей мере с одним соединением по любому из пп. 1098-1385; и увеличение посредством этого HDL.
Вариант реализации 1421. Способ по любому из пп. 1416-1420, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 1422. Способ по любому из пп. 1416-1420, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 1424. Соединение или сопряженный олигонуклеотид по любому из пп. 1-1385, или его пролекарство.
Вариант реализации 1425. Способ производства антисмыслового олигонуклеотида по любому из пп. 1-1385.
Вариант реализации 1426. Способ получения антисмыслового олигонуклеотида по любому из пп. 1-1385.
Вариант реализации 1427. Способ производства сопряженного антисмыслового соединения по любому из пп. 1-1385, при этом указанный способ включает составление композиции сопряженного антисмыслового соединения для применения у людей, выполнение хроматографического анализа составленного в композицию сопряженного антисмыслового соединения и упаковывание сопряженного антисмыслового соединения в форму, готовую для продажи.
Вариант реализации 1428. Сопряженное олигонуклеотидное соединение по любому из вариантов реализации 1237-1360, в котором сопряженный олигонуклеотид содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 117, 118, 119, 120, 121, 122, 123, 124, 125, 126 или 127.
Вариант реализации 1429. Соединение, имеющее формулу (V):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-
11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a или GalNAc-23a.
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
Вариант реализации 1430. Соединение, имеющее формулу (Va):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a. GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a или GalNAc3-23a, а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Bx представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и где Q13 выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 1431. Соединение, имеющее формулу (XXV):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1432. Соединение, имеющее формулу (XXVI):
где:
Т2 содержит нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1433. Соединение, имеющее формулу (XXVII):
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1434. Соединение, имеющее формулу (XXVIII):
где:
Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1435. Соединение, имеющее формулу (XXIX):
где:
Т3 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1436. Соединение, имеющее формулу (XXX):
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1437. Соединение, имеющее формулу (XXXI):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1438. Соединение, имеющее формулу (XXXII):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1439. Соединение, имеющее формулу (XXXIII):
где:
Т3 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1440. Соединение, имеющее формулу (XXXIV):
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1441. Соединение, имеющее формулу (XXXV):
где:
Т3 представляет собой группу, содержащую линкер, нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1442. Соединение, имеющее формулу (XXXVI):
где:
CM представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1443. Соединение, имеющее формулу (XXXVII):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1444. Соединение, имеющее формулу (XXXVIII):
где: Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1445. Соединение, имеющее формулу (XXXIX):
где: Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу. реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1446. Соединение, имеющее формулу (XL):
где: Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1447. Соединение, имеющее формулу (XLI):
где каждый Y выбран из О, S замещенного или незамещенного C1-С10 алкила, амино, замещенного амино, азидо, алкенила или алкинила;
и где Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1448. Соединение, имеющее формулу (XLII):
где каждый Y выбран из О, S замещенного или незамещенного C1-С10 алкила, амино, замещенного амино, азидо, алкенила или алкинила;
и где Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1449. Соединение, имеющее формулу (XLIII):
где Y выбран из О, S замещенного или незамещенного C1-С10 алкила, амино, замещенного амино, азидо, алкенила или алкинила;
и где Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1450. Соединение, имеющее формулу (XLIV):
где T2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономгрную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1451. Соединение, имеющее формулу (XLV):
где Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1452. Соединение, имеющее формулу (XLV):
где Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1453. Соединение, имеющее формулу (XLV):
где T2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1454. Соединение по любому из вариантов реализации 1432-1453, в котором Т2 или Т3 выбран из:
где:
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
Т4 представляет собой Н, гидроксил-защитную группу или реакционноспособную фосфорную группу;
X представляет собой О или S;
Z представляет собой С1-С6 алкил, С2-Сб алкенил, С2-Сб алкинил, замещенный C1-C6
алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замещенный амид, замещенный амид, тиол или замещенный тио;
и где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1455. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Q выбран из: Н, галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, OCH2-CH=CH2, O(CH2)2-ОСН3, O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1456. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1457. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1458. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1459. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1460. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замещенный ацил или замещенный амид; и
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1461. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Q выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2; и
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1462. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1463. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1464. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1465. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1466. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замеченный ацил или замещенный амид; и
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1467. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Q выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(CH2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1468. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1469. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1470. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой O или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный C1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замещенный ацил или замещенный амид; и
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1471. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1472. Соединение, имеющее формулу:
где X представляет собой О или S;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный C1-C6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замещенный ацил или замещенный амид; и
где Т4 представляет собой нуклеозид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1473. Соединение, имеющее формулу:
и где А представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1474. Соединение, имеющее формулу (V):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a.
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1475. Соединение, имеющее формулу (Va):
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a,
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и где Q13 выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, О(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1476. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группм, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из о или S.
Вариант реализации 1477. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из O или S.
Вариант реализации 1478. Соединение, имеющее формулу:
где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галоген, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио;
один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1479. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где Q выбран из: водорода, галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1480. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a,
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и где Q или Q13 выбран из: водорода, галогена, OCH3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1481. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где Q выбран из: водорода, галогена, ОСН3, OCF3, OCH2CH3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 И OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1482. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, CalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где Q выбран из: водорода, галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1483. Соединение, имеющее формулу:
где Z представляет собой С1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галоген, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио;
один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAd-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где Q выбран из: водорода, галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S.
Вариант реализации 1484. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из T3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из о или S
и где Z представляет собой С1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галоген, водород, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.
Вариант реализации 1485. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения; и где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент; и где Q13 выбран из водорода, галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, О(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2;
и где X выбран из О или S
и где Z представляет собой С1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галоген, водород, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.
Вариант реализации 1486. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из О или S
и где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный C1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галигеч, водород, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.
Вариант реализации 1487. Соединение, имеющее формулу:
где один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X выбран из O или S.
и где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный C1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галоген, водород, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.
Вариант реализации 1488. Соединение, имеющее формулу:
где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенные С1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио;
один из Т3 или Т4 выбран из: GalNAc3-1a, GalNAc3-2a, GalNAc3-3a, GalNAc3-4a, GalNAc3-5a, GalNAc3-6a, GalNAc3-7a, GalNAc3-8a, GalNAc3-9a, GalNAc3-10a, GalNAc3-11a, GalNAc3-12a, GalNAc3-13a, GalNAc3-14a, GalNAc3-15a, GalNAc3-16a, GalNAc3-17a, GalNAc3-18a, GalNAc3-19a, GalNAc3-20a, GalNAc3-21a, GalNAc3-22a, GalNAc3-23a, GalNAc-24a, GalNAc-25a, GalNAc-26a, GalNAc-27a, GalNAc-28a, GalNAc-29a, GalNAc-30a, GalNAc-31a и GalNAc-32a;
а другой из Т3 или Т4 выбран из: гидроксила, гидроксил-защитной группы, нуклеозида, олигонуклеотида, мономерной субъединицы или олигомерного соединения;
где Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент;
и где X представляет собой О или S;
и где Z представляет собой C1-С6 алкил, С2-С6 алкенил, С2-С6 алкинил, замещенный C1-С6 алкил, замещенный С2-С6 алкенил, замещенный С2-С6 алкинил, галоген, водород, ацил, замещенный ацил, замещенный амид, тиол или замещенный тио.
Вариант реализации 1489. Соединение по любому из вариантов реализации 1474-1488, в котором Вх выбран из аденина, гуанина, тимина, урацила, цитозина или 5-метилцитозина.
Вариант реализации 1490. Соединение по любому из вариантов реализации 1474-1483 или 1485, в котором Q или Q13 представляет собой O(CH2)2-ОСН3.
Вариант реализации 1491. Соединение, имеющее формулу (XVI):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1492. Соединение, имеющее формулу (XVII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или
олигомерное соединение.
Вариант реализации 1493. Соединение, имеющее формулу (XVIII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1494. Соединение, имеющее формулу (XIX):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1495. Соединение, имеющее формулу (XX):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1496. Соединение, имеющее формулу (XXI):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1497. Соединение, имеющее формулу (XXII):
где:
Т2 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1498. Соединение, имеющее формулу (XXIII):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1499. Соединение, имеющее формулу (XXIIIa):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1500. Соединение, имеющее формулу (XXIV):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1501. Соединение, имеющее формулу (XXIVa):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1502. Соединение по любому из вариантов реализации 1432-1502, в котором олигомерное соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1503. Соединение по варианту реализации 1502, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой гэпмер.
Вариант реализации 1504. Соединение по варианту реализации 1502, в котором модифицированный олигонуклеотид активирует РНКазу Н при связывании с комплементарной целевой нуклеиновой кислотой.
Вариант реализации 1505. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1504, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1506. Соединение по варианту реализации 1505, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит модифицированное основание.
Вариант реализации 1507. Соединение по варианту реализации 1505 или 1506, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 1508. Соединение по варианту реализации 1507, в котором заменитель сахара представляет собой тетрагидропиран.
Вариант реализации 1509. Соединение по варианту реализации 1508, в котором тетрагидропиран представляет собой F-HNA.
Вариант реализации 1510. Соединение по любому из вариантов реализации 1505-1509. в котором остальная часть модифицированного олигонуклеотида содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий модифицированный сахар.
Вариант реализации 1511. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1510, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий модифицированный сахар.
Вариант реализации 1512. Соединение по варианту реализации 1511, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий модифицированный сахар, выбран из бициклического нуклеозида и 2'-модифицированного нуклеозида.
Вариант реализации 1513. Соединение по варианту реализации 1512, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой бициклический нуклеозид.
Вариант реализации 1514. Соединение по варианту реализации 1513, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-СН2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1515. Соединение по варианту реализации 1513, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-(СН2)2-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1516. Соединение по варианту реализации 1513, в котором бициклический нуклеозид представляет собой (4'-С(СН3)Н-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1517. Соединение по варианту реализации 1513, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1518. Соединение по варианту реализации 1512, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид выбран из 2'-F нуклеозида, 2'-ОСН3 нуклеозида и 2'-О(СН2)2ОСН3 нуклеозида.
Вариант реализации 1519. Соединение по варианту реализации 1518, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 1520. Соединение по варианту реализации 1518, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 1521. Соединение по варианту реализации 1518, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-О(СН2)2ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 1522. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1521, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере един немодифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1523. Соединение по варианту реализации 1522, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой рибонуклеозид.
Вариант реализации 1524. Соединение по варианту реализации 1522, в котором немодифицированный нуклеозид представляет собой дезоксирибонуклеозид.
Вариант реализации 1525. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1524, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере два модифицированных нуклеозида.
Вариант реализации 1526. Соединение по варианту реализации 1525, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат одинаковую модификацию.
Вариант реализации 1527. Соединение по варианту реализации 1525, в котором по меньшей мере два модифицированных нуклеозида содержат различные модификации.
Вариант реализации 1528. Соединение по любому из вариантов реализации 1525-1527, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит заменитель сахара.
Вариант реализации 1529. Соединение по любому из вариантов реализации 1525-1528, в котором по меньшей мере один по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов содержит 2'-модификацию.
Вариант реализации 1530. Соединение по варианту реализации 1529, в котором каждый го меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов независимо выбран из 2'-F нуклеозидов, 2'-ОСН3 нуклеозидов и 2'-О(СН2)2ОСН3 нуклеозидов.
Вариант реализации 1531. Соединение по варианту реализации 1530, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-F нуклеозид.
Вариант реализации 1532. Соединение по варианту реализации 1530, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 1533. Соединение по варианту реализации 1530, в котором каждый по меньшей мере из двух модифицированных нуклеозидов представляет собой 2'-О(СН2)2ОСН3 нуклеозид.
Вариант реализации 1534. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по существу каждый нуклеозид модифицированного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1535. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1522 или 1525-1534, в котором каждый нуклеозид модифицированного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1536. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по меньшей мере 4 нуклеозида модифицированного нуклеотида представляв собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1537. Соединение по любому из вариантов реализации 1520-1533, в котором по меньшей мере 5 нуклеозидов модифицированного нуклеотида представляют собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1538. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по меньшей мере 6 нуклеозидов модифицированного нуклеотида представляют собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1539. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по меньшей мере 7 нуклеозидов модифицированного нуклеотида представляют собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1540. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по меньшей мере 8 нуклеозидов модифицированного нуклеотида представляют собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1541. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по меньшей мере 9 нуклеозидов модифицированного нуклеотида представляют собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1542. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1533, в котором по меньшей мере 10 нуклеозидов модифицированного нуклеотида представляют собой дезоксирибонуклеозиды.
Вариант реализации 1543. Соединение по любому из вариантов реализации 1536-1542, в котором каждый из дезоксирибонуклеозидов модифицированного олигонуклеотида последовательно связан межнуклеозидными связями.
Вариант реализации 1544. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1543, в котором модифицированный олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1545. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1543, в котором модифицированный олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1546. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1543, 6 котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение.
Вариант реализации 1547. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1543, и котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой олигонуклеотид на основе RISC.
Вариант реализации 1548. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1543, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1549. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1547, в котором олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1550. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1534 или 1536-1546, отличающееся тем, что указанное соединение имеет сахарный мотив, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные
нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1551. Соединение по варианту реализации 1550, в котором 5'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1552. Соединение по варианту реализации 1550, в котором 5'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1553. Соединение по варианту реализации 1550, в котором 5'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1554. Соединение по варианту реализации 1550, в котором 5'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 5'-области.
Вариант реализации 1555. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1554, в котором 3'-область состоит из 2 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1556. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1554, в котором 3'-область состоит из 3 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1557. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1554, в котором 3'-область состоит из 4 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1558. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1554, в котором 3'-область состоит из 5 связанных нуклеозидов 3'-области.
Вариант реализации 1559. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1558, в котором центральная область состоит из 5 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1560. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1558, в котором центральная область состоит из 6 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1561. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1558, в котором центральная область состоит из 7 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1562. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1558, в котором центральная область состоит из 8 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1563. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1558, в котором центральная область состоит из 9 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1564. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1558, в котором центральная область состоит из 10 связанных нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1565. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1564, отличающееся тем, что указанное соединение состоит из 14-26 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1566. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1564, отличающееся тем, что указанное соединение состоит из 15-25 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1567. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1564, отличающееся тем, что указанное соединение состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1568. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1567, в котором каждый модифицированный нуклеозид независимо содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент или бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1569. Соединение по варианту реализации 1568, в котором по меньшей мере один модифицированный нуклеозид содержит 2'-замещенный сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1570. Соединение по варианту реализации 1569, в котором каждый модифицированный нуклеозид, содержащий 2'-замещенный сахарный фрагмент, содержит 2'-заместитель, независимо выбранный из: галогена, необязательно замещенного аллила, необязательно замещенного амино, азидо, необязательно замещенного SH, CN, OCN, CF3, OCF3, О, S или N(Rm)-алкила; О, S или N(Rm)-алкенила; О, S или N(Rm)-алкинила; необязательно замещенного O-алкиленил-О-алкила, необязательно замещенного алкинила, необязательно замещенного алкарила, необязательно замещенного аралкила, необязательно замещенного О-алкарила, необязательно замещенного О-аралкила, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или О-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой Н, амино-защитную группу или замещенный или незамещенный C1-С10 алкил;
где каждая необязательно замещенная группа необязательно замещена группой заместителя, независимо выбранной из: гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкокси (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
Вариант реализации 1571. Соединение по варианту реализации 1569, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCH2F, OCHF2, OCF3, ОСН2СН3, O(CH2)2F, OCH2CHF2, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3, O(СН2)2-SCH3, O(CH2)2-OCF3, O(CH2)3-N(R1)(R2), O(CH2)2-ON(R1)(R2), O(CH2)2-O(CH2)2-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R1)(R2), OCH2C(=O)-N(R3)-(CH2)2-N(R1)(R2) и O(CH2)2-N(R3)-C(=NR4)[N(R1)(R2)]; где каждый R1, R2, R3 и R4 независимо представляет собой Н или C1-С6 алкил.
Вариант реализации 1572. Соединение по варианту реализации 1569, в котором каждый 2'-заместитель независимо выбран из: галогена, ОСН3, OCF3, ОСН2СН3, OCH2CF3, ОСН2-СН=СН2, O(СН2)2-ОСН3 (МОЕ), O(CH2)2-O(CH2)2-N(CH3)2, OCH2C(=O)-N(H)CH3, OCH2C(=O)-N(H)-(CH2)2-N(CH3)2 и OCH2-N(H)-C(=NH)NH2.
Вариант реализации 1573. Соединение по варианту реализации 1569, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-МОЕ сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1574. Соединение по варианту реализации 1569, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-ОМе сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1575. Соединение по варианту реализации 1569, в котором по меньшей мере один 2'-модифицированный нуклеозид содержит 2'-F сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1576. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1575, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий заменитель сахара.
Вариант реализации 1577. Соединение по варианту реализации 1576, в котором модифицированный нуклеозид содержит F-HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1578. Соединение по варианту реализации 1576, в котором модифицированный нуклеозид содержит HNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1579. Соединение по любому из вариантов реализации 1550-1578, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1580. Соединение по варианту реализации 1579, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой cEt сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1581. Соединение по варианту реализации 1579, в котором бициклический сахарный фрагмент представляет собой LNA сахарный фрагмент.
Вариант реализации 1582. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1581, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1583. Соединение по варианту реализации 1582, в котором каждая межнуклеозидная связь указанного соединения представляет собой модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1584. Соединение по варианту реализации 1582, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере одну модифицированную связь и по меньшей мере одну немодифицированную фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1585. Соединение по любому из вариантов реализации 1582-1584, в котором по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1586. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, в котором каждая модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1587. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1588. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1589. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585 отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1590. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1591. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1592. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1593. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 8 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1594. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 9 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1595. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1585, отличающееся тем, что указанное соединение содержит по меньшей мере 10 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1596. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 16 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1597. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595. отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1598. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1599. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1600. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595. отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1601. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 3 595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1602. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1603. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1604. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1605. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1606. Соединение по любому из вариантов реализации 1584 или 1595, отличающееся тем, что указанное соединение содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1607. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1605, в котором каждая концевая межнуклеозидная связь указанного соединения представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1608. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1605, в котором каждая межнуклеозидная связь, связывающая два дезоксинуклеозида указанного соединения, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1609. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1605. в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь, связывающая два модифицированных нуклеозида указанного соединения, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1610. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1605, в котором каждая неконцевая межнуклеозидная связь указанного соединения, которая находится в положении 3' модифицированного нуклеозида, представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1611. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1605, в котором каждая межнуклеозидная связь указанного соединения, который находится в положении 3' дезоксинуклеозида, представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1612. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1588, отличающееся тем, что указанное соединение имеет мотив, выбранный из:
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM
MsMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMsM
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMsM; и
MsMyMyMyMy(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MyMyMyMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь, и каждый у представляет собой либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, при условии, что по меньшей мере один у представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1613. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1588, отличающееся тем, что указанное соединение имеет мотив, выбранный из:
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM
MsMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMsM
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMsM; и
MsMoMoMoMo(Ds)0-1(DsDs)(3-5)MoMoMoMsM;
где каждый M независимо представляет собой модифицированный нуклеозид, каждый D представляет собой дезоксинуклеозид; каждый о представляет собой фосфодиэфирную межнуклеозидную связь, и каждый s представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1614. Соединение по варианту реализации 1612 или 1613, в котором каждый М независимо выбран из: 2'-МОЕ нуклеозида и бициклического нуклеозида.
Вариант реализации 1615. Соединение по варианту реализации 1614, в котором каждый М независимо выбран из 2'-МОЕ нуклеозида, cEt нуклеозида и LNA нуклеозида.
Вариант реализации 1616. Соединение по варианту реализации 1612 или 1613, в котором каждый М представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид.
Вариант реализации 1617. Соединение по варианту реализации 1612 или 1613, в котором каждый М представляет собой cEt нуклеозид.
Вариант реализации 1618. Соединение по вариантам реализации 1612 или 1613, в котором каждый М представляет собой LNA нуклеозид.
Вариант реализации 1619. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 8 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1620. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 10 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1621. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 12 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1622. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 14 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1623. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение имеет последовательность
нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 16 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1624. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение имеет последовательность нуклеооснований, содержащую часть по меньшей мере из 18 нуклеооснований, комплементарную или равную по длине части целевой нуклеиновой кислоты.
Вариант реализации 1625. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение по меньшей мере на 90% комплементарно целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1626. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение по меньшей мере на 95% комплементарно целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1627. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1618, отличающееся тем, что указанное соединение на 100% комплементарно целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1628. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой пре-мРНК.
Вариант реализации 1629. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой мРНК.
Вариант реализации 1630. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой микроРНК.
Вариант реализации 1631. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1632. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 1633. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: антитрипсина альфа 1, рецептора андрогена, аполипопротеина (а), аполипопротеина В, аполипопротеина С-III, С-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы 1B, STAT3, SRB-1 и транстирегина.
Вариант реализации 1634. Соединение по варианту реализации 1627, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой вирусную нуклеиновую кислоту.
Вариант реализации 1635. Соединение по варианту реализации 1634, отличающееся тем, что вирусная нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1636. Соединение по варианту реализации 1634, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота представляет собой нуклеиновую кислоту вируса гепатита В.
Вариант реализации 1637. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24.
Вариант реализации 1638. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 25, 26, 27, 28, 29 или 30.
Вариант реализации 1639. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 31.
Вариант реализации 1640. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 32.
Вариант реализации 1641. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627. отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 33.
Вариант реализации 1642. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 34.
Вариант реализации 1643. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42 или 43.
Вариант реализации 1644. Соединение по любому из вариантов реализации 1507-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 44, 45, 46, 47 или 48.
Вариант реализации 1645. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58 или 59.
Вариант реализации 1646. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66 или 67.
Вариант реализации 1647. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 69, 70, 71 или 72.
Вариант реализации 1648. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 73.
Вариант реализации 1649. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80 или 81.
Вариант реализации 1650. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований с SEQ ID №: 68.
Вариант реализации 1651. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающееся тем, что указанное соединение содержит последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID №: 82-103, 111 или 113.
Вариант реализации 1652. Соединение по любому из вариантов реализации 1502-1627, отличающийся тем, что указанное соединение представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1653. Фармацевтическая композиция, содержащая соединение или соединение по любому из вариантов реализации 1502-1652 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
Вариант реализации 1654. Фармацевтическая композиция по варианту реализации 1653, отличающаяся тем, что фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель выбран из стерильной воды и стерильного солевого раствора.
Вариант реализации 1655. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке, включающий контакт клетки с соединением или сопряженным антисмысловым соединением по любому из вариантов реализации 1498-1648 или с фармацевтической композицией по вариантам реализации 1653-1654.
Вариант реализации 1656. Способ по варианту реализации 1655, отличающийся тем, что клетка представляет собой клетку печени.
Вариант реализации 1657. Способ по варианту реализации 1655, отличающий тем, что клетка представляет собой гепатоцит.
Вариант реализации 1658. Способ по любому из вариантов реализации 1655-1657, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 1659. Способ по любому из вариантов реализации 1655-1657, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 1660. Способ по варианту реализации 1659, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 1661. Способ по варианту реализации 1659, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1662. Способ лечения заболевания или состояния у животного, включающий введение фармацевтической композиции по варианту реализации 1653 или 1654 указанному животному и лечение посредством этого заболевания или состояния у животного.
Вариант реализации 1663. Способ по варианту реализации 1662, отличающийся тем, что животное представляет собой мышь.
Вариант реализации 1664. Способ по варианту реализации 1662, отличающийся тем, что животное представляет собой человека.
Вариант реализации 1665. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1664, отличающийся тем, что заболевание или состояние представляет собой заболевание или состояние печени.
Вариант реализации 1666. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1665, отличающийся тем, что введение является парентеральным.
Вариант реализации 1667. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1665, отличающийся тем, что введение осуществляют подкожной инъекцией.
Вариант реализации 1668. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1665, отличающийся тем, что введение осуществляют внутривенной инъекцией.
Вариант реализации 1669. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1665, отличающийся тем, что введение осуществляют внутримышечной инъекцией.
Вариант реализации 1670. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение представлено в дозе 1-10 мг/кг.
Вариант реализации 1671. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение представлено в дозе менее 1 мг/кг.
Вариант реализации 1672. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение представлено в дозе более 10 мг/кг.
Вариант реализации 1673. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 2 месяца.
Вариант реализации 1674. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 4 месяца.
Вариант реализации 1675. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с периодом введения доз, составляющим по меньшей мере 6 месяцев.
Вариант реализации 1676. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы в неделю.
Вариант реализации 1677. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые две недели.
Вариант реализации 1678. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз около одной дозы каждые три недели.
Вариант реализации 1679. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз. составляющей одну дозу каждые четыре недели.
Вариант реализации 1680. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз. составляющей одну дозу каждые пять недель.
Вариант реализации 1681. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые шесть недель.
Вариант реализации 1682. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые семь недель.
Вариант реализации 1683. Способ по любому из вариантов реализации 1662-1669, отличающийся тем, что соединение обеспечивают с частотой введения доз, составляющей одну дозу каждые восемь недель.
Вариант реализации 1684. Соединение или соединение по любому из вариантов реализации 1-1652, или его пролекарство.
Вариант реализации 1685. Способ производства антисмыслового олигонуклеотида по любому из вариантов реализации 1-1652.
Вариант реализации 1686. Способ получения антисмыслового олигонуклеотида по любому из вариантов реализации 1-1652.
Вариант реализации 1687. Способ производства сопряженного антисмыслового соединения по любому из вариантов реализации 1-1652, при этом указанный способ включает составление композиции сопряженного антисмыслового соединения для применения у людей, выполнение хроматографического анализа составленного в композицию сопряженного антисмыслового соединения и упаковывание сопряженного антисмыслового соединения в форму, готовую для продажи.
Вариант реализации 1688. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1179-1182, в котором связка имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 1689. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1179-1182, в котором связка имеет структуру:
Вариант реализации 1690. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1179-1182 или 1688-1689, в котором линкер имеет структуру, выбранную из:
Вариант реализации 1691. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1179-1182 или 1688-1689, в котором линкер имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
Вариант реализации 1692. Сопряженное антисмысловое соединение по любому из вариантов реализации 1179-1182 или 1688-1689, в котором линкер имеет структуру:
Вариант реализации 1693. Соединение, имеющее формулу (XXVI):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1694. Соединение по варианту реализации 1693, в котором линкер содержит амин, амид, сложный эфир, простой эфир, пирролидин, ПЭГ, полиамид или дисульфидную связь.
Вариант реализации 1695. Соединение по варианту реализации 1693 или 1694, в котором линкер не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1696. Соединение по любому из вариантов реализации 1693-1695, в котором линкер имеет формулу:
Вариант реализации 1697. Соединение по любому из вариантов реализации 1693-1696, в котором Т2 имеет формулу:
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1698. Соединение по любому из вариантов реализации 1693-1696, в котором Т2 имеет формулу:
где:
Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1699. Соединение по любому из вариантов реализации 1693-1698, в котором Т2 или Т3 представляет собой группу, содержащую олигомерное соединение, и при этом олигомерное соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1700. Соединение по варианту реализации 1699, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов, при этом по меньшей мере один нуклеозид представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1701. Соединение по варианту реализации 1699 или 1700, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, выбранный из: 2'-МОЕ нуклеозида, 2'-ОМе нуклеозида, 2'-F нуклеозида, (4'-СН2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-(СН2)2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-С(СН3)Н-О-2') бициклического нуклеозида; и морфолино.
Вариант реализации 1702. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1701, в котором модифицированный олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1703. Соединение по варианту реализации 1702, в котором каждый нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; каждый нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и каждый нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид.
Вариант реализации 1704. Соединение по любому из вариантов реализации 1702-1704, в котором 5'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 5'-области; 3'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 3'-области; и центральная область состоит из 8-10 нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1705. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1704, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1706. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1705, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1707. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1706, в котором каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1708. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1707, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 5'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1709. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1707, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 3'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1710. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1709. в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1711. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1710, в котором модифицированный олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1712. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1710, в котором модифицированный олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1713. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1712, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1714. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1712, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1715. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1712 в котором модифицированный олигонуклеотид изменяет сплайсинг целевой пре-мРНК.
Вариант реализации 1716. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1715, в котором модифицированный олигонуклеотид комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1717. Соединение по варианту реализации 1716, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота выбрана из: пре-мРНК, микроРНК или длинной не кодирующей РНК.
Вариант реализации 1718. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1717, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1720. Соединение по любому из вариантов реализации 1699-1717, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1721. Способ введения соединения по любому из вариантов реализации 1693-1720 животному.
Вариант реализации 1722. Способ лечения метаболического расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1693-1720 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1723. Способ лечения сердечно-сосудистого расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1693-1720 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1724. Соединение, имеющее формулу (XXXI):
где:
T2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1725. Соединение по варианту реализации 1724, в котором линкер содержит амин, амид, сложный эфир, простой эфир, пирролидин, ПЭГ, полиамид или дисульфидную связь.
Вариант реализации 1726. Соединение по варианту реализации 1724 или 1725, в котором линкер не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1727. Соединение по любому из вариантов реализации 1724-1726, в котором линкер представляет собой:
Вариант реализации 1728. Соединение по любому из вариантов реализации 1724-1727, в котором Т2 имеет формулу:
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид. нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1729. Соединение по любому из вариантов реализации 1724-1727, в котором Т2 имеет формулу:
где:
Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или
олигомерное соединение.
Вариант реализации 1730. Соединение по любому из вариантов реализации 1724-1729, в котором Т2 или Т3 представляет собой группу, содержащую олигомерное соединение, и при этом олигомерное соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1731. Соединение по варианту реализации 1730, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов, при этом по меньшей мере один нуклеозид представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1732. Соединение по варианту реализации 1730 или 1731, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, выбранный из: 2'-МОЕ нуклеозида, 2'-ОМе нуклеозида, 2'-F нуклеозида, (4'-СН2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-(СН2)2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-C(CH3)H-О-2') бициклического нуклеозида; и морфолино.
Вариант реализации 1733. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1732, в котором модифицированный олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-облаети, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из:
модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1734. Соединение по варианту реализации 1733, в котором каждый нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; каждый нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и каждый нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид.
Вариант реализации 1735. Соединение по любому из вариантов реализации 1733-1734, в котором 5'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 5'-области: 3'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 3'-области; и центральная область состоит из 8-10 нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1736. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1715, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1737. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1736, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1738. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1737, в котором каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1739. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1738, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 5'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1740. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1738, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 3'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1741. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1740, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1742. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1741, в котором модифицированный олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1743. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1741, в котором модифицированный олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1744. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1743, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1745. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1743, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1746. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1743, в котором модифицированный олигонуклеотид изменяет сплайсинг целевой пре-мРНК.
Вариант реализации 1747. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1746, в котором модифицированный олигонуклеотид комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1748. Соединение по варианту реализации 1747, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота выбрана из: пре-мРНК, микроРНК или длинной не кодирующей РНК.
Вариант реализации 1749. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1748, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1750. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1748. в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 18-22 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1751. Соединение по любому из вариантов реализации 1730-1743, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1752. Способ введения соединения по любому из вариантов реализации 1724-1751 животному.
Вариант реализации 1753. Способ лечения метаболического расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1724-1751 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1754. Способ лечения сердечно-сосудистого расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1724-1751 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1755. Соединение, имеющее формулу (XXXII):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1756. Соединение по варианту реализации 1755, в котором линкер содержит амин, амид, сложный эфир, простой эфир, пирролидин, ПЭГ, полиамид или дисульфидную связь.
Вариант реализации 1757. Соединение по варианту реализации 1755 или 1756, в котором линкер не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1758. Соединение по любому из вариантов реализации 1755-1757, в котором линкер представляет собой:
Вариант реализации 1759. Соединение по любому из вариантов реализации 1755-1758, в котором Т2 имеет формулу:
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1760. Соединение по любому из вариантов реализации 1755-1758, в котором Т2 имеет формулу:
где:
Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1761. Соединение по любому из вариантов реализации 1755-1760, в котором Т2 или Т3 представляет собой группу, содержащую олигомерное соединение, и при этом олигомерное соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1762. Соединение по варианту реализации 1761, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов, при этом по меньшей мере один нуклеозид представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1763. Соединение по варианту реализации 1761 или 1762. в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, выбранный из: 2'-МОЕ нуклеозида, 2'-OMe нуклеозида, 2'-F нуклеозида, (4'-CH2-O-2') бициклического нуклеозида, (4'-(CH2)2-O-2') бициклического нуклеозида, (4'-С(СН3)Н-O-2') бициклического нуклеозида; и морфолино.
Вариант реализации 1764. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1763, в котором модифицированный олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью. состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1765. Соединение по варианту реализации 1764, в котором каждый нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; каждый нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и каждый
нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид.
Вариант реализации 1766. Соединение по любому из вариантов реализации 1764-1765, в котором 5'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 5'-области; 3'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 3'-области; и центральная область состоит из 8-10 нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1767. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1766, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1768. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1767, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1769. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1768, в котором каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1770. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1769, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 5'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1771. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1769, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 3'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1772. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1771, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1773. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1772. в котором модифицированный олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1774. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1772, в котором модифицированный олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1775. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1774, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1776. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1774, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1777. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1777, в котором модифицированный олигонуклеотид изменяет сплайсинг целевой пре-мРНК.
Вариант реализации 1778. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1777, в котором модифицированный олигонуклеотид комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1779. Соединение по варианту реализации 1779, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота выбрана из: пре-мРНК, микроРНК или длинной не кодирующей РНК.
Вариант реализации 1780. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1779, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1781. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1779, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 18-22 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1782. Соединение по любому из вариантов реализации 1761-1779, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1783. Способ введения соединения по любому из вариантов реализации 1755-1782 животному.
Вариант реализации 1784. Способ лечения метаболического расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1755-1782 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1785. Способ лечения сердечно-сосудистого расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1755-1782 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1786. Соединение, имеющее формулу (XXXVIII):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1787. Соединение по варианту реализации 1786, в котором линкер содержит амин, амид, сложный эфир, простой эфир, пирролидин, ПЭГ, полиамид или дисульфидную связь.
Вариант реализации 1788. Соединение по варианту реализации 1786 или 1787, в котором линкер не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1789. Соединение по любому из вариантов реализации 1786-1788, в котором линкер представляет собой:
Вариант реализации 1790. Соединение по любому из вариантов реализации 1786-1789, в котором Т2 имеет формулу:
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1791. Соединение по любому из вариантов реализации 1786-1789, в котором Т2 имеет формулу:
где:
Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1792. Соединение по любому из вариантов реализации 1786-1791, в котором Т2 или Т3 представляет собой группу, содержащую олигомерное соединение, и при этом олигомерное соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1793. Соединение по варианту реализации 1792, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов, при этом по меньшей мере один нуклеозид представляет собой модифицированные нуклеозид.
Вариант реализации 1794. Соединение по варианту реализации 1792 или 1793, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, выбранный из: 2'-МОЕ нуклеозида, 2'-ОМе нуклеозида, 2'-F нуклеозида, (4'-СН2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-(СН2)2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-С(СН3)Н-О-2') бициклического нуклеозида; и морфолино.
Вариант реализации 1795. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1794, в котором модифицированный олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбран из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1796. Соединение по варианту реализации 1795, в котором каждый нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; каждый нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и каждый нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид.
Вариант реализации 1797. Соединение по любому из вариантов реализации 1795-1796, в котором 5'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 5'-области; 3'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 3'-области; и центральная область состоит из 8-10 нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1798. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1797, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1799. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1798, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1800. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1799, в котором каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1801. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1800, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 5'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1802. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1800, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 3'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1803. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1802, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение.
Вариант реализации 1804. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1803, в котором модифицированный олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1805. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1803, в котором модифицированный олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1806. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1805, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1807. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1805, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1808. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1805, в котором модифицированный олигонуклеотид изменяет сплайсинг целевой пре-мРНК.
Вариант реализации 1809. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1808, в котором модифицированный олигонуклеотид комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1810. Соединение по варианту реализации 1809, отличающееся тем, что целевая нуклеиновая кислота выбрана из: пре-мРНК, микроРНК или длинной не кодирующей РНК.
Вариант реализации 1811. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1810, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1812. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1810, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 18-22 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1813. Соединение по любому из вариантов реализации 1792-1810, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1814. Способ введения соединения по любому из вариантов реализации 1786-1813 животному.
Вариант реализации 1815. Способ лечения метаболического расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1786-1813 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1816. Способ лечения сердечно-сосудистого расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1786-1813 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1817. Соединение, имеющее формулу (XL):
где:
Т2 представляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1818. Соединение по варианту реализации 1817, в котором линкер содержит амин, амид, сложный эфир, простой эфир, пирролидин, ПЭГ, полиамид или дисульфидную связь.
Вариант реализации 1819. Соединение по варианту реализации 1817 или 1818, в котором линкер не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1820. Соединение по любому из вариантов реализации 1817-1819, в котором линкер представляет собой:
Вариант реализации 1821. Соединение по любому из вариантов реализации 1817-1820, в котором Т2 имеет формулу:
где:
СМ представляет собой расщепляемый фрагмент, а Т3 представляет собой нуклеозид,
нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1822. Соединение по любому из вариантов реализации 1817-1821, в котором Т2 имеет формулу:
где:
Т3 представляет собой нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу или олигомерное соединение.
Вариант реализации 1823. Соединение по любому из вариантов реализации 1817-1822, в котором Т2 или Т3 представляет собой группу, содержащую олигомерное соединение, и при этом олигомерное соединение представляет собой модифицированный олигонуклеотид.
Вариант реализации 1824. Соединение по варианту реализации 1823, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов, при этом по меньшей мере один нуклеозид представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1825. Соединение по варианту реализации 1824, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, выбранный из: 2'-МОЕ нуклеозида, 2'-ОМе нуклеозида, 2'-F нуклеозида, (4'-СН2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-(СН2)2-О-2') бициклического нуклеозида, (4'-С(СН3)Н-О-2') бициклического нуклеозида; и морфолино.
Вариант реализации 1826. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1825, в котором модифицированный олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, содержащий:
5'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 5'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 5'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 3'-ближайший нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид;
3'-область, состоящую из 2-8 связанных нуклеозидов 3'-области, при этом по меньшей мере два нуклеозида 3'-области представляют собой модифицированные нуклеозиды, и при этом 5'-ближайший нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и
центральную область между 5'-областью и 3'-областью, состоящую из 5-10 связанных нуклеозидов центральной области, каждый независимо выбрав из: модифицированного нуклеозида и немодифицированного дезоксинуклеозида, при этом 5'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид, и 3'-ближайший нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1827. Соединение по варианту реализации 1826, в котором каждый нуклеозид 5'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; каждый нуклеозид 3'-области представляет собой модифицированный нуклеозид; и каждый нуклеозид центральной области представляет собой немодифицированный дезоксинуклеозид.
Вариант реализации 1828. Соединение по любому из вариантов реализации 1815-1826, в котором 5'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 5'-области; 3'-область состоит из 2-5 связанных нуклеозидов 3'-области; и центральная область состоит из 8-10 нуклеозидов центральной области.
Вариант реализации 1829. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1828, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1830. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1829, в котором модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1831. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1830, в котором каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой либо тиофосфатную межнуклеозидную связь, либо фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1832. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1831, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 5'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1833. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1831, в котором модифицированный олигонуклеотид присоединен к остальной части соединений у 3'-конца модифицированного олигонуклеотида.
Вариант реализации 1834. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1833, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид.
Вариант реализации 1835. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1834, в котором модифицированный олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1836. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1834, в котором модифицированный олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1837. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1836, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид активирует путь RISC.
Вариант реализации 1838. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1836, в котором модифицированный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение на основе РНКазы Н.
Вариант реализации 1839. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1836, в котором модифицированный олигонуклеотид изменяет сплайсинг целевой пре-мРНК.
Вариант реализации 1840. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1839, в котором модифицированный олигонуклеотид комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1841. Соединение по варианту реализации 1840, отличающееся тем. что целевая нуклеиновая кислота выбрана из: пре-мРНК, микроРНК или длинной не кодирующей РНК.
Вариант реализации 1842. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1841, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1843. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1841, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 18-22 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1844. Соединение по любому из вариантов реализации 1824-1841, в котором модифицированный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1845. Способ введения соединения по любому из вариантов реализации 1817-1844 животному.
Вариант реализации 1846. Способ лечения метаболического расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1817-1844 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1847. Способ лечения сердечно-сосудистого расстройства, включающий введение соединения по любому из вариантов реализации 1817-1844 субъекту, нуждающемуся в этом.
Вариант реализации 1848. Способ, включающий введение сопряженного антисмыслового соединения животному, при этом сопряженное антисмысловое соединение содержит модифицированный олигонуклеотид, имеющий сахарный мотив гэпмера и конъюгат, содержащий GalNAc.
Вариант реализации 1849. Способ снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке в организме животного, включающий введение указанному животному сопряженного антисмыслового соединения, содержащего модифицированный олигонуклеотид и конъюгат, при этом модифицированный олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, а конъюгат содержит GalNAc; и снижение посредством этого количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке в организме животного.
Вариант реализации 1850. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1851. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1852. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1853. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1854. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1855. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1856. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1857. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1858. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат имеет группу ветвления, выбранную из следующих структур:
Вариант реализации 1859. Способ по варианту реализации 1848 или 1849, отличающийся тем, что конъюгат имеет линкер, выбранный из следующих структур:
где каждый n независимо выбран из 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
Вариант реализации 1860. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1859, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1861. Способ по варианту реализации 1860, отличающийся тем, что модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1862. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1863. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1864. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1865. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1866. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1867. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1868. Способ по варианту реализации 1860 или 1861, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1869. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1868, отличающийся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида выбран из фосфодиэфирной межнуклеозидной связи и тиофосфатной межнуклеозидно связи.
Вариант реализации 1870. Способ по варианту реализации 1869, отличающийся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1871. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1870, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид по меньшей мере на 80% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1872. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1870, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид по меньшей мере на 85% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1873. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1870, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид по меньшей мере на 90% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1874. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1870, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид на 100% комплементарен целевой нуклеиновой кислоте.
Вариант реализации 1875. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1874, отличающийся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в печени.
Вариант реализации 1876. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1875, отличающийся тем, что целевая нуклеиновая кислота экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 1877. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1876, отличающийся тем, что целевая нуклеиновая кислота кодирует белок, выбранный из: рецептора андрогена, аполипопротеина (а), аполипопротеина В, аполипопротеина С-III, С-реактивного белка, eIF-4E, фактора VII, фактора XI, рецептора глюкокортикоида, рецептора глюкагона, протеин-тирозин-фосфатазы 1В, STAT3 и транстиретина.
Вариант реализации 1878. Способ модулирования сплайсинга целевой нуклеиновой кислоты пре-мРНК в клетке, включающий контакт клетки с сопряженным антисмысловым соединением, при этом сопряженное антисмысловое соединение содержит модифицированный олигонуклеотид и конъюгат; и при этом конъюгат содержит GalNac; и модулирование посредством этого сплайсинга целевой нуклеиновой кислоты пре-мРНК в клетке.
Вариант реализации 1879. Способ по варианту реализации 1878, отличающийся тем, что целевая нуклеиновая кислота пре-мРНК экспрессируется в гепатоцитах.
Вариант реализации 1880. Способ по варианту реализации 1878 или 1879, отличающийся тем, что клетка находится in vitro.
Вариант реализации 1881. Способ по варианту реализации 1878 или 1879, отличающийся тем, что клетка находится in vivo.
Вариант реализации 1882. Способ по варианту реализации 1878 или 1879, отличающийся тем, что клетка находится в организме животного.
Вариант реализации 1883. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1882, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1884. Способ по варианту реализации 1883, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий 2'-О(СН2)2ОСН3 модификацию.
Вариант реализации 1885. Способ по варианту реализации 1883 или 1884, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один нуклеозид, содержащий 2'-ОСН3 модификацию.
Вариант реализации 1886. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1885, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид.
Вариант реализации 1887. Способ по варианту реализации 1886, включающий (4'-СН2-О-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1888. Способ по варианту реализации 1886 или 1887, включающий (4'-(СН2)2-О-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1889. Способ по любому из вариантов реализации 1886-1888, включающий (4'-C(CH3)H-O-2') BNA нуклеозид.
Вариант реализации 1890. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1889, отличающийся тем, что каждый нуклеозид модифицированного олигонуклеотида представляет собой модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1891. Способ по варианту реализации 1890, отличающийся тем, что каждый модифицированный нуклеозид модифицированного олигонуклеотида содержит одинаковую модификацию.
Вариант реализации 1892. Способ по варианту реализации 1890, отличающийся тем, что по меньшей мере два модифицированных нуклеозида модифицированного олигонуклеотида содержат модификации, отличные друг от друга.
Вариант реализации 1893. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1889 или 1891-1892, отличающийся тем, что по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида представляет собой немодифицированный дезоксинуклеотид.
Вариант реализации 1894. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1895. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1896. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1897. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1898. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1899. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1900. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1901. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат содержит следующую структуру:
Вариант реализации 1902. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат имеет группу ветвления, выбранную из следующих структур:
Вариант реализации 1903. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1893, отличающийся тем, что конъюгат имеет линкер, выбранный из следующих структур:
где каждый n независимо выбран из 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
Вариант реализации 1904. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1903, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1905. Способ по варианту реализации 1904, отличающийся тем, что модифицированная межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1906. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1907. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 2 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1908. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 3 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1909. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 4 фосфодиэфирных межнуклеозидных связи.
Вариант реализации 1910. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1911. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1912. Способ по варианту реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
Вариант реализации 1913. Способ по любому из вариантов реализации 1904 или 1905, отличающийся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида выбран из фосфодиэфирной межнуклеозидной связи и тиофосфатной межнуклеозидно связи.
Вариант реализации 1914. Способ по варианту реализации 1913, отличающийся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1915. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1913, отличающийся тем, что по меньшей мере один нуклеозид модифицированного олигонуклеотида представляет собой морфолино-нуклеозид.
Вариант реализации 1916. Способ по любому из вариантов реализации 1878-1913, отличающийся тем, что каждый нуклеозид модифицированного олигонуклеотида представляет собой морфолино-нуклеозид.
Вариант реализации 1917. Пролекарство, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, а антисмысловый олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид на основе РНКазы H.
Вариант реализации 1918. Пролекарство по варианту реализации 1917, отличающееся тем, что антисмысловый олигонуклеотид на основе РНКазы H представляет собой гэпмер.
Вариант реализации 1919. Пролекарство по варианту реализации 1917 или 1918, отличающееся тем, что конъюгат присоединен к антисмысловому олигонуклеотиду у 5'-конца антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1920. Пролекарство, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, а антисмысловый олигонуклеотид представляет собой антисмысловый олигонуклеотид, который изменяет сплайсинг пре-мРНК.
Вариант реализации 1921. Пролекарство по любому из вариантов реализации 1917-1920, отличающееся тем, что in vivo метаболизм пролекарства приводит к образованию антисмыслового олигонуклеотида без конъюгата.
Вариант реализации 1922. Пролекарство по любому из вариантов реализаций 1917-1921, отличающееся тем, что пролекарство по меньшей мере в 5 раз более эффективно in vivo, чем антисмысловый олигонуклеотид без конъюгата.
Вариант реализации 1923. Пролекарство по любому из вариантов реализации 1917-1921, отличающееся тем, что пролекарство по меньшей мере в 8 раз более эффективно in vivo, чем антисмысловый олигонуклеотид без конъюгата.
Вариант реализации 1924. Пролекарство по любому из вариантов реализации 1917-1921, отличающееся тем, что пролекарство по меньшей мере в 10 раз более эффективно in vivo, чем антисмысловый олигонуклеотид без конъюгата.
Вариант реализации 1925. Способ, включающий введение пролекарства по любому из вариантов реализации 1917-1924 животному.
Вариант реализации 1926. Соединение, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, при этом антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, и при этом последовательность нуклеооснований антисмыслового олигонуклеотида не на 100% комплементарна целевой нуклеиновой кислоте, выбранной из: мышиной Raf киназы C, мышиного рецептора Fas или человеческой фосфатазы и гомолога тензина (PTEN).
Вариант реализации 1927. Соединение по варианту реализации 1926, в котором конъюгат присоединен к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1928. Соединение по любому из вариантов реализации 1926 или 1927, в котором межнуклеозидные связи антисмыслового олигонуклеотида содержат по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь и по меньшей мере одну тиофосфатную связь.
Вариант реализации 1929. Соединение по любому из вариантов реализации 1926-1928, в котором группа конъюгата не содержит холан.
Вариант реализации 1930. Соединение по любому из вариантов реализации 1926-1929, в котором группа ветвления содержит четвертичный атом углерода или аминокислоту.
Вариант реализации 1931. Соединение, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, при этом антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, и при этом последовательность нуклеооснований антисмыслового олигонуклеотида комплементарна целевой нуклеионовой кислоте, которая может быть модулирована для лечения метаболического или сердечно-сосудистого расстройства.
Вариант реализации 1932. Соединение по варианту реализации 1931, в котором конъюгат присоединен к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1933. Соединение по любому из вариантов реализации 1931 или 1932, в котором межнуклеозидные связи антисмыслового олигонуклеотида содержат по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь и по меньшей мере одну тиофосфатную связь.
Вариант реализации 1934. Соединение по любому из вариантов реализации 1931-1933, в котором группа конъюгата не содержит холан.
Вариант реализации 1935. Соединение по любому из вариантов реализации 1931-1934, в котором группа ветвления содержит четвертичный атом углерода или аминокислоту.
Вариант реализации 1936. Соединение, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, и при этом антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь и по меньшей мере одну тиофосфатную связь.
Вариант реализации 1937. Соединение по варианту реализации 1936, в котором конъюгат присоединен к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1938. Соединение по любому из вариантов реализации 1936 или 1937, в котором антисмысловой олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера.
Вариант реализации 1939. Соединение по любому из вариантов реализации 1936-1938, в котором группа конъюгата не содержит холан.
Вариант реализации 1940. Соединение по любому из вариантов реализации 1936-1939, в котором группа ветвления содержит четвертичный атом углерода или аминокислоту.
Вариант реализации 1941. Соединение, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, и при этом группа конъюгата не содержит холан; и при этом антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера.
Вариант реализации 1942. Соединение по варианту реализации 1941, в котором конъюгат присоединен к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1943. Соединение по любому из вариантов реализации 1941 или 1942, в котором межнуклеозидные связи антисмыслового олигонуклеотида содержат по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь и по меньшей мере одну тиофосфатную связь.
Вариант реализации 1944. Соединение по любому из вариантов реализации 1941-1943, в котором группа ветвления содержит четвертичный атом углерода или аминокислоту.
Вариант реализации 1945. Соединение, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, и при этом антисмысловый олигонуклеотид имеет сахарный мотив гэпмера, а группа ветвления содержит четвертичный атом углерода или аминокислоту.
Вариант реализации 1946. Соединение по варианту реализации 1945, в котором конъюгат присоединен к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1947. Соединение по любому из вариантов реализации 1945 или 1946, в котором межнуклеозидные связи антисмыслового олигонуклеотида содержат по меньшей мере одну фосфодиэфирную связь и по меньшей мере одну тиофосфатную связь.
Вариант реализации 1948. Соединение по любому из вариантов реализации 1945-1957, в котором группа конъюгата не содержит холан.
Вариант реализации 1949. Соединение, содержащее антисмысловый олигонуклеотид и конъюгат, при этом конъюгат содержит по меньшей мере один GalNAc, а антисмысловый олигонуклеотид изменяет сплайсинг пре-мРНК.
Вариант реализации 1950. Соединение по любому из вариантов реализации 1926-1949, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1951. Соединение по любому из вариантов реализации 1926-1949, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 18-22 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1952. Соединение по любому из вариантов реализации 1926-1949, в котором антисмысловый олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1953. Способ по любому из вариантов реализации 1926-1949, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 10-30 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1954. Способ по любому из вариантов реализации 1926-1949, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 18-22 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1955. Способ по любому из вариантов реализации 1848-1916, отличающийся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из 16-20 связанных нуклеозидов.
Вариант реализации 1956. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из шести-одиннадцати последовательно связанных атомов.
Вариант реализации 1957. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из десяти последовательно связанных атомов.
Вариант реализации 1958. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-одиннадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка содержит только одну амидную связь.
Вариант реализации 1959. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где Y и Z независимо выбраны из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной, алкенильной или алкинильной группы или группы, содержащей эфир, кетон, амид, сложный эфир, карбамат, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир, тиофосфат, триазол, пирролидин, дисульфид или тиоэфир.
Вариант реализации 1960. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где Y и Z независимо выбраны из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной группы или группы, содержащей только один эфир или только два эфира, амид, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир или тиофосфат.
Вариант реализации 1961. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где Y и Z независимо выбраны из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной группы.
Вариант реализации 1962. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где m и n независимо выбраны из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 и 12.
Вариант реализации 1963. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где m равен 4, 5, 6, 7 или 8, и n равен 1, 2, 3 или 4.
Вариант реализации 1964. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом X не содержит эфирную группу.
Вариант реализации 1965. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из восьми последовательно связанных атомов, и при этом X не содержит эфирную группу.
Вариант реализации 1966. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка содержит только одну амидную связь, а X не содержит эфирную группу.
Вариант реализации 1967. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка состоит из амидной связи и замещенной или незамещенной C2-C11 алкильной группы.
Вариант реализации 1968. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где Y выбран из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной, алкенильной или алкинильной группы или группы, содержащей эфир, кетон, амид, сложный эфир, карбамат, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир, тиофосфат, триазол, пирролидин, дисульфид или тиоэфир.
Вариант реализации 1969. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где Y выбран из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной группы или группы, содержащей эфир, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир или тиофосфат.
Вариант реализации 1970. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где Y выбран из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной группы.
Вариант реализации 1971. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где n равен 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12.
Вариант реализации 1972. Соединение, содержащее фрагмент, направляющий на клетку, который имеет следующую структуру:
где n равен 4, 5, 6, 7 или 8.
Вариант реализации 1973. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит только один GalNAc, и группа конъюгата присоединена к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1974. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит только два лиганда GalNAc, и группа конъюгата присоединена к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1975. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит только один GalNAc, и группа конъюгата присоединена к 3'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1976. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит только два лиганда GalNAc, и группа конъюгата присоединена к 3'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1977. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит 1-4 лиганда GalNAc, а антисмысловый олигонуклеотид представляет собой гэпмер.
Вариант реализации 1978. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по варианту реализации 1977, в котором группа конъюгата присоединена к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1979. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1978, в котором группа конъюгата содержит линкер, который не содержит дисульфид.
Вариант реализации 1980. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1979, в котором группа конъюгата содержит линкер, который не содержит тиоэфир.
Вариант реализации 1981. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1980, в котором группа конъюгата содержит линкер, который не содержит пирролидин.
Вариант реализации 1982. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1981, в котором группа конъюгата не содержит полициклический фрагмент.
Вариант реализации 1983. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1981, в котором группа конъюгата содержит группу ветвления, которая не содержит полициклический фрагмент.
Вариант реализации 1984. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1983, в котором группа конъюгата содержит линкер, который не содержит липидный фрагмент.
Вариант реализации 1985. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1984, в котором связь между группой конъюгата и антисмысловым олигонуклеотидом не представляет собой тиофосфатную группу.
Вариант реализации 1986. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1985, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит
по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, при этом модифицированный нуклеозид представляет собой 2'-O-метоксиэтил (MOE) модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1987. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1986, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеозид, при этом модифицированный нуклеозид представляет собой cEt-модифицированный нуклеозид.
Вариант реализации 1988. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1987, в котором антисмысловый олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь и по меньшей мере одну фосфодиэфирную межнуклеозидную связь.
Вариант реализации 1989. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1987, в котором крылья гэпмера содержат по меньшей мере две различные сахарные модификации.
Вариант реализации 1990. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1977-1987, в котором последовательность антисмыслового нуклеотида выбрана из SEQ ID NO 17-159.
Вариант реализации 1991. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, по любому из вариантов реализации 1956-1972.
Вариант реализации 1992. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, по любому из вариантов реализации 1956-1972, а антисмысловый олигонуклеотид содержит гэпмер.
Вариант реализации 1993. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, по любому из вариантов реализации 1956-1972, а сахара антисмыслового олигонуклеотида модифицированы одинаково.
Вариант реализации 1994. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, по любому из вариантов реализации 1956-1972, а антисмысловый олигонуклеотид является односпиральным.
Вариант реализации 1995. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку, по любому из вариантов реализации 1956-1972, а антисмысловый олигонуклеотид является двухспиральным.
Вариант реализации 1996. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1991-1995, в котором конъюгат присоединен к 5'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1997. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид по любому из вариантов реализации 1991-1995, в котором конъюгат присоединен к 3'-концу антисмыслового олигонуклеотида.
Вариант реализации 1998. Сопряженный антисмысловый олигонуклеотид, содержащий группу конъюгата и антисмысловый олигонуклеотид, при этом группа конъюгата содержит 1-4 лиганда GalNAc, а сахара антисмыслового олигонуклеотида модифицированы одинаково.
В вариантах реализации, имеющих более одной конкретной переменной (например, более одного «m» или «n»), если не указано иное, каждая такая конкретная переменная выбрана независимо. Следовательно, для структуры, имеющей более одного n, каждый n
выбран независимо, так что они могут быть или не быть одинаковыми между собой.
Подробное описание
Следует понимать, что и представленное выше общее описание, и следующее подробное описание являются лишь иллюстративными и пояснительными, и они не ограничивают настоящее описание. В настоящем документе использование единственного числа включает множественное число, если специально не указано иное. При использовании в настоящем документе, термин «или» означает «и/или», если не указано иное. Кроме того, использование термина «включая», а также других форм, таких как «включает» и «включенный», не является ограничивающим. Также, такие термины как «элемент» или «компонент» охватывают как элементы и компоненты, содержащие одну единицу, так и элементы и компоненты, которые содержат более одной субъединицы, если специально не указано иное.
Названия разделов, используемые в настоящем документе, предназначены лишь для организационных целей, и их не следует толковать как ограничение описанного объекта изобретения. Все документы или части документов, цитируемые в настоящей заявке, включая, но не ограничиваясь ими, патенты, патентные заявки, статьи, книги и монографии, в явной форме включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме для всех целей.
А. Определения
При отсутствии конкретных определений, номенклатура, используемая в связи с ними, а также в связи с приемами и методиками аналитической химии, синтетической органической химии, а также медицинской и фармацевтической химии, описанная в настоящем документе, является общеизвестной и общепринятой в данной области техники. Для химического синтеза и химического анализа могут быть использованы стандартные методики. Некоторые такие методики и приемы представлены, например, в публикациях "Carbohydrate Modifications in Antisense Research" под редакцией Sangvi и Cook, American Chemical Society, федеральный округ Вашингтон, 1994; "Remington's Pharmaceutical Sciences," Mack Publishing Co., Истон, штат Пенсильвания, 21е издание, 2005; и "Antisense Drug Technology, Principles, Strategies, and Applications" под редакцией Stanley Т. Crooke, CRC Press, Бока Ратон, штат Флорида; а также в книге Sambrook et al., "Molecular Cloning, A laboratory Manual," 2e
издание, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1989, которые включены в настоящий документ посредством ссылки для всех целей. Если это допустимо, все патенты, заявки, опубликованные заявки и другие публикации, а также другие данные, упоминаемые в тексте настоящего описания, включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
Если не указано иное, следующие термины имеют следующие значения:
При использовании в настоящем документе, «нуклеозид» означает соединение, содержащее фрагмент нуклеооснования и сахарный фрагмент. Нуклеозиды включают, но не ограничиваются ими, природные нуклеозиды (которые находятся в ДНК и РНК) и модифицированные нуклеозиды. Нуклеозиды могут быть связаны с фосфатным фрагментом.
При использовании в настоящем документе, «химическая модификация» означает химическое отличие в соединении, по сравнению с природным аналогом. Химические модификации олигонуклеотидов включают нуклеозидные модификации (включая модификации сахарного фрагмента и модификации нуклеооснования) и модификации межнуклеозидных связей. В отношении олигонуклеотида химическая модификация включает не только отличия в последовательности нуклеооснований.
При использовании в настоящем документе, «фуранозил» означает структуру, содержащую 5-членное кольцо, содержащее четыре атома углерода и один атом кислорода.
При использовании в настоящем документе, «природный сахарный фрагмент» означает рибофуранозил, встречающийся в природной РНК, или дезоксирибофуранозил, встречающийся в природной ДНК.
При использовании в настоящем документе, «сахарный фрагмент» означает природный сахарный фрагмент или модифицированный сахарный фрагмент нуклеозида.
При использовании в настоящем документе, «модифицированный сахарный фрагмент» означает замещенный сахарный фрагмент или заменитель сахара.
При использовании в настоящем документе, «замещенный сахарный фрагмент» означает фуранозил, который не является природным сахарным фрагментом. Замещенные сахарные фрагменты включают, но не ограничиваются ими, фуранозилы, содержащие заместители в 2'-положении, 3'-положении, 5'-положении и/или 4'-положении. Некоторые замещенные сахарные фрагменты представляют собой бициклические сахарные фрагменты.
При использовании в настоящем документе, «2'-замещенный сахарный фрагмент»
означает фуранозил, содержащий заместитель в 2'-положении, отличный от H или OH. Если не указано иное, то 2'-замещенный сахарный фрагмент не является бициклическим сахарным фрагментом (т.е. 2'-заместитель 2'-замещенного сахарного фрагмента не образует мостик с другим атомом фуранозильного кольца).
При использовании в настоящем документе, «МОЕ» означает -OCH2CH2OCH3.
При использовании в настоящем документе, «2'-F нуклеозид» относится к нуклеозиду, содержащему сахар, который содержит фтор в 2'-положении. Если не указано иное, то фтор в 2'-F нуклеозиде находится в рибо-положении (заменяя OH природной рибозы).
При использовании в настоящем документе, термин «заменитель сахара» означает структуру, которая не содержит фуранозила и способна заменять природный сахарный фрагмент нуклеозида, так что образующиеся нуклеозидные субъединицы могут связываться вместе и/или связываться с другими нуклеозидами с образованием олигомерного соединения, которое может гибридизоваться с комплементарным олигомерным соединением. Такие структуры включают кольца, содержащие другое количество атомов, чем фуранозил (например, 4, 6 или 7-членные кольца); замену кислорода фуранозила некислородным атомом (например, углеродом, серой или азотом); или одновременное изменение количество атомов и замену кислорода. Такие структуры также могут содержать замещения, соответствующие замещениям, описанным для замещенных сахарных фрагментов (например, 6-членные карбоциклические бициклические заменители сахара, необязательно содержащие дополнительные заместители). Заменители сахара включают также более сложные сахарные заместители (например, некольцевые системы пептидной нуклеиновой кислоты). Заменители сахара включают, без ограничения, морфолино, циклогексенилы и циклогекситолы.
При использовании в настоящем документе, «бициклический сахарный фрагмент» означает модифицированный сахарный фрагмент, содержащий 4-7-членное кольцо (включая, но не ограничиваясь фуранозилом), содержащее мостик, связывающий два атома 4-7-членного кольца с образованием второго кольца, что приводит к получению бициклической структуры. В некоторых вариантах реализации 4-7-членное кольцо представляет собой сахарное кольцо. В некоторых вариантах реализации 4-7-членное кольцо представляет собой фуранозил. В некоторых таких вариантах реализации мостик соединяет 2'-углерод и 4'-углерод фуранозила.
При использовании в настоящем документе, «нуклеотид» означает нуклеозид, дополнительно содержащий фосфатную связывающую группу. При использовании в настоящем документе, «связанные нуклеозиды» могут быть или не быть связаны фосфатными связями и, следовательно, включают, но не ограничиваются ими, «связанные нуклеотиды». При использовании в настоящем документе, «связанные нуклеозиды» представляют собой нуклеозиды, которые связаны в непрерывную последовательность (т.е. между связанными нуклеозидами нет дополнительных нуклеозидов).
При использовании в настоящем документе, «нуклеооснование» означает группу атомов, которая может быть связана с сахарным фрагментом с образованием нуклеозида, который может быть внедрен в олигонуклеотид, и при этом указанная группа атомов может связываться с комплементарным природным нуклеооснованием другого олигонуклеотида или нуклеиновой кислоты. Нуклеооснования могут быть природными или могут быть модифицированными.
При использовании в настоящем документ, термины «немодифицированное нуклеооснование» или «природное нуклеооснование» означают природные гетероциклические нуклеооснования РНК или ДНК: пуриновые основания аденин (А) и гуанин (G) и пиримидиновые основания тимин (Т), цитозин (С) (включая 5-метил С) и урацил (U).
При использовании в настоящем документе, «модифицированное нуклеооснование» означает любое нуклеооснование, которое не является природным нуклеооснованием.
При использовании в настоящем документе, «модифицированный нуклеозид» означает нуклеозид, содержащий по меньшей мере одну химическую модификацию, по сравнению с природными нуклеозидами РНК или ДНК. Модифицированные нуклеозиды содержат модифицированный сахарный фрагмент и/или модифицированное нуклеооснование.
При использовании в настоящем документе, «бициклический нуклеозид» или «BNA» означает нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент.
При использовании в настоящем документе, «затрудненный этил-нуклеозид» или «cEt» означает нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент, который содержит мостик 4'-СН(CH3)-O-2'.
При использовании в настоящем документе, «нуклеозид закрытой нуклеиновой
кислоты» или «LNA» означает нуклеозид, содержащий бициклический сахарный фрагмент, который содержит мостик 4'-CH2-O-2'.
При использовании в настоящем документе, «2'-замещенный нуклеозид» означает нуклеозид, содержащий заместитель в 2'-положении, отличный от H или OH. Если не указано иное, то 2'-замещенный нуклеозид не является бициклическим нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «дезоксинуклеозид» означает нуклеозид, содержащий 2'-H фуранозильный сахарный фрагмент, находящийся в природных дезоксирибонуклеозидах (ДНК). В некоторых вариантах реализации 2'-дезоксинуклеозид может содержать модифицированное нуклеооснование или может содержать нуклеооснование РНК (например, урацил).
При использовании в настоящем документе, «олигонуклеотид» означает соединение, содержащее множество связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит один или более немодифицированных рибонуклеозидов (РНК) и/или немодифицированных дезоксирибонуклеозидов (ДНА), и/или один или более модифицированных нуклеозидов.
При использовании в настоящем документе, «олигонуклеозид» означает олигонуклеотид, в котором ни один из межнуклеозидных связей не содержит атом фосфора. При использовании в настоящем документе, олигонуклеотиды включают олигонуклеозиды.
При использовании в настоящем документе, «модифицированный олигонуклеотид» означает олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере один модифицированный нуклеозид и/или по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь.
При использовании в настоящем документе, «связь» или «связывающая группа» означает группу атомов, которая связывает вместе две или более других групп атомов.
При использовании в настоящем документе, «межнуклеозидная связь» означает ковалентную связь между соседними нуклеозидами в олигонуклеотиде.
При использовании в настоящем документе, «природная межнуклеозидная связь» означает фосфодиэфирную связь 3' с 5'.
При использовании в настоящем документе, «модифицированная межнуклеозидная связь» означает любую межнуклеозидную связь, отличную от природной межнуклеозидной связи.
При использовании в настоящем документе, «концевая межнуклеозидная связь»
означает связь между последними двумя нуклеозидами олигонуклеотида или его определенной области.
При использовании в настоящем документе, «фосфорная связывающая группа» означает связывающую группу, содержащую атом фосфора. Фосфорные связывающие группы включают, без ограничения, группы, имеющие формулу:
где:
Ra и Rd, каждый независимо, представляют собой O, S, CH2, NH или NJ1, где J1 представляет собой C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил;
Rb представляет собой O или S;
Rc представляет собой OH, SH, C1-C6 алкил, замещенный C1-C6 алкил, C1-C6 алкокси, замещенный C1-C6 алкокси, амино или замещенный амино; и
J1 представляет собой Rb представляет собой O или S.
Фосфорные связывающие группы включают, без ограничения, фосфодиэфир, тиофосфат, дитиофосфат, фосфонат, фосфорамидат, фосфортиоамидат, тионоалкил-фосфонат, фосфотриэфиры, тионоалкил-фосфотриэфиры и боранофосфат.
При использовании в настоящем документе, «межнуклеозидная фосфорная связывающая группа» означает фосфорную связывающую группу, которая напрямую связывает два нуклеозида.
При использовании в настоящем документе, «не межнуклеозидная фосфорная связывающая группа» означает фосфорную связывающую группу, которая не связывает напрямую два нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная фосфорная связывающая группа связывает нуклеозид с группой, отличной от нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная фосфорная связывающая группа
связывает две группы, ни одна из которых не является нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «нейтральная связывающая группа» означает связывающую группу, которая не имеет заряда. Нейтральные связывающие группы включают, без ограничения, фосфотриэфиры, метилфосфонаты, MMI (-CH2-N(CH3)-O-), амид-3 (-CH2-C(=O)-N(H)-), амид-4 (-CH2-N(H)-C(=O)-), формацеталь (-O-CH2-O-) и тиоформацеталь (-S-CH2-O-). Дополнительные нейтральные связывающие группы включают неионные связи, содержащие силокасан (диалкилсилоксан), карбоксилатный сложный эфир, карбоксамид, сульфид, сульфонатный сложный эфир и амиды (см., например: Carbohydrate Modifications in Antisense Research; под ред. Y.S. Sanghvi и P.D. Cook, ACS Symposium, серия 580; главы 3 и 4, (cc. 40-65)). Дополнительные нейтральные связывающие группы включают неионные связи, содержащие смешанные составные части N, O, S и CH2.
При использовании в настоящем документе, «межнуклеозидная нейтральная связывающая группа» означает нейтральную связывающую группу, которая напрямую связывает два нуклеозида.
При использовании в настоящем документе, «не межнуклеозидная нейтральная связывающая группа» означает нейтральную связывающую группу, которая не связывает напрямую два нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная нейтральная связывающая группа связывает нуклеозид с группой, отличной от нуклеозида. В некоторых вариантах реализации не межнуклеозидная нейтральная связывающая группа связывает две группы, ни одна из которых не является нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «олигомерное соединение» означает полимерную структуру, содержащую две или более субструктур. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение содержит олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение содержит одну или более сопряженных групп и/или концевых групп. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение состоит из олигонуклеотида. Олигомерные соединения включают также природные нуклеиновые кислоты. В некоторых вариантах реализации олигомерное соединение содержит скелет одной или более связанных мономерных субъединиц, при этом каждая связанная мономерная субъединица прямо или косвенно присоединена к гетероциклическому основному фрагменту.
В некоторых вариантах реализации олигомерные соединения могут содержать также мономерные субъединицы, которые не связаны с гетероциклическим основным фрагментом, обеспечивая таким образом сайты с удаленными основаниями. В некоторых вариантах реализации связи, соединяющие мономерные субъединицы, сахарные фрагменты или заменители и гетероциклические основные фрагменты, могут быть независимо модифицированы. В некоторых вариантах реализации единица связь-сахар, которая может содержать или не содержать гетероциклическое основание, может быть замещена миметиком, таким как мономеры в пептидных нуклеиновых кислотах.
При использовании в настоящем документе, «концевая группа» означает один или более атомов, присоединенных к любому или к обоим 3'- или 5'-концам олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации концевая группа представляет собой группу конъюгата. В некоторых вариантах реализации концевая группа содержит один или более нуклеозидов концевой группы.
При использовании в настоящем документе, «конъюгат» или «группа конъюгата» означает атом или группу атомов, связанную с олигонуклеотидом или олигомерным соединением. Как правило, группы конъюгата модифицируют одно или более свойств соединения, к которому они присоединены, включая, но не ограничиваясь ими, свойства фармакодинамики, фармакокинетики, связывания, поглощения, клеточного распределения, клеточного захвата, заряда и/или выведения.
При использовании в настоящем документе, «линкер конъюгата» или «линкер» к контексте группы конъюгата означает часть группы конъюгата, содержащую любой атом или группу атомов и ковалентно связывающую (1) олигонуклеотид с другой частью группы конъюгата или (2) две или более частей группы конъюгата.
Группы конъюгата показаны в настоящем документе как радикалы, обеспечивающие связь для образования ковалентного присоединения к олигомерному соединению, такому как антисмысловый олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации точка присоединения у олигомерного соединения представляет собой 3'-атом кислорода 3'-гидроксильной группы 3'-концевого нуклеозида олигомерного соединения. В некоторых вариантах реализации точка присоединения у олигомерного соединения представляет собой 5'-атом кислорода 5'-гидроксильной группы 5'-концевого нуклеозида олигомерного соединения. В некоторых вариантах реализации связь для образования присоединения к олигомерному соединению
представляет собой расщепляемую связь. В некоторых таких вариантах реализации такая расщепляемая связь составляет весь или часть расщепляемого фрагмента.
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат расщепляемый фрагмент (например, расщепляемую связь или расщепляемый нуклеозид) и часть углеводного кластера, такую как часть кластера GalNAc. Такая часть углеводного кластера содержит: направляющий фрагмент и, необязательно, линкер конъюгата. В некоторых вариантах реализации часть углеводного кластера определяют по количеству и сущности лиганда. Например, в некоторых вариантах реализации часть углеводного кластера содержит три группы GalNAc и обозначена «GalNAc3». В некоторых вариантах реализации часть углеводного кластера содержит 4 группы GalNAc и обозначена «GalNAc4». Конкретные части углеводных кластеров (имеющие конкретную связку, группы ветвления и линкера конъюгата) описаны в настоящем документе и обозначены римской цифром с последующим нижним индексом «а». Соответственно, «GalNac3-1a» относится к конкретной части углеводного кластера группы конъюгата, имеющей 3 группы GalNac и конкретно определенную связку, группы ветвления и линкера. Такой фрагмент углеводного кластера присоединен к олигомерному соединению через расщепляемый фрагмент, такой как расщепляемая связь или расщепляемый нуклеозид.
При использовании в настоящем документе, «расщепляемый фрагмент» означает связь или группу, которая может быть расщеплена при физиологических условиях. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент расщепляется внутри клетки или во внутриклеточных отделах, таких как эндосома или лизосома. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент расщепляется эндогенными ферментами, такими как нуклеазы. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент содержит группу атомов, имеющую один, два, три, четыре или более четырех расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой фосфодиэфирную связь.
При использовании в настоящем документе, «расщепляемая связь» означает любую химическую связь, которая может быть разрушена. В некоторых вариантах реализации расщепляемая связь выбрана из: амида, полиамида, сложного эфира, эфира, одного или обоих сложных эфиров фосфодиэфира, фосфатного сложного эфира, карбамата, дисульфида или пептида.
При использовании в настоящем документе, «углеводный кластер» означает соединение, имеющее один или более углеводных остатков, присоединенных к скелету или связывающей группе. (см., например, публикацию Maier et al., "Synthesis of Antisense Oligonucleotides Conjugated to a Multivalent Carbohydrate Cluster for Cellular Targeting," Bioconjugate Chemistry, 2003, (14): 18-29, которая в полном объеме включена в настоящий документ посредством ссылки, или Rensen et al., "Design and Synthesis of Novel N Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting of Lipoproteins to the Hepatic Asiaglycoprotein Receptor," J. Med. Chem. 2004, (47): 5798-5808, где представлены примеры углеводных сопряженных кластеров).
При использовании в настоящем документе, «модифицированный углевод» означает любой углевод, имеющий одну или более модификаций, по сравнению с природными углеводами.
При использовании в настоящем документе, «производное углевода» означает любое соединение, которое может быть синтезировано с использованием углевода в качестве исходного материала или промежуточного соединения.
При использовании в настоящем документе, «углевод» означает природный углевод, модифицированный углевод или производное углевода.
При использовании в настоящем документе, «защитная группа» означает любое соединение или защитную группу, известную специалистам в данной области техники. Не ограничивающие примеры защитных групп представлены в публикации "Protective Groups in Organic Chemistry", Т.W. Greene, P.G.M. Wuts, ISBN 0-471-62301-6, John Wiley & Sons, Inc, Нью-Йорк, полное содержание которой включено в настоящий документ посредством ссылки.
При использовании в настоящем документе, «односпиральное» означает олигомерное соединение, которое не гибридизовано с его комплементом и которое не имеет достаточной самокомплементарностью для образования устойчивого собственного дуплекса.
При использовании в настоящем документе, «двухспиральное» означает пару олигомерных соединений, которые гибридизованы друг с другом, или одно самокомплементарное олигомерное соединение, которое образует шпилечную структуру. В
некоторых вариантах реализации двухспиральное олигомерное соединение содержит первое и второе олигомерное соединение.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловое соединение» означает соединение, содержащее или состоящее из олигонуклеотида, по меньшей мере часть которого комплементарна целевой нуклеиновой кислоте, с которой возможна его гибридизация, что приводит к получению по меньшей мере одной антисмысловой активности.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловая активность» означает любое обнаруживаемое и/или измеримое изменение, обусловленное гибридизацией антисмыслового соединения с его целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации антисмысловая активность включает модулирование количества или активности транскрипта целевой нуклеиновой кислоты (например, мРНК). В некоторых вариантах реализации антисмысловая активность включает модулирование сплайсинга пре-мРНК.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловое соединение на основе РНКазы H» означает антисмысловое соединение, в котором по меньшей мере часть антисмысловой активности антисмыслового соединения обусловлена гибридизацией антисмыслового соединения с целевой нуклеиновой кислотой и последующим расщеплением целевой нуклеиновой кислоты под действием РНКазы H.
При использовании в настоящем документе, «антисмысловое соединение на основе RISC» означает антисмысловое соединение, в котором по меньшей мере часть антисмысловой активности антисмыслового соединения обусловлена РНК-индуцируемым комплексом сайленсинга (RISC).
При использовании в настоящем документе, «обнаружение» или «измерение» означает, что выполнено испытание или анализ для обнаружения или измерения. Такое обнаружение и/или измерение может приводить к результату с нулевым значением. Следовательно, даже если испытание для обнаружения или измерения приводит к обнаружению отсутствия активности (нулевой активности), то стадия обнаружения или измерения активности была выполнена.
При использовании в настоящем документе, «обнаруживаемая и/или измеримая активность» означает статистически значимую активность, которая не является нулевой.
При использовании в настоящем документе, «по существу не измененный» означает
небольшое или отсутствие изменения конкретного параметра, в частности, по сравнению с другим параметром, который изменился гораздо больше. В некоторых вариантах реализации параметр является по существу не измененным, если его изменение составило менее 5%. В некоторых вариантах реализации параметр является по существу не измененным, если его изменение составило менее двух раз, тогда как изменение другого параметра составило по меньшей мере десять раз. Например, в некоторых вариантах реализации антисмысловая активность представляет собой изменение количества целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых таких вариантах реализации количество нецелевой нуклеиновой кислоты является по существу не измененным, если оно изменяется гораздо меньше, чем изменяется количество целевой нуклеиновой кислоты, но это изменение не обязательно должно быть нулевым.
При использовании в настоящем документе, «экспрессия» означает процесс, посредством которого ген в конечном итоге преобразуется в белок. Экспрессия включает, но не ограничивается этим, транскрипцию, пост-транскрипционную модификацию (например, сплайсинг, полиаденилирование, добавление 5'-кэпа) и трансляцию.
При использовании в настоящем документе, «целевая нуклеиновая кислота» означает молекулу нуклеиновой кислоты, с которой предполагается гибридизация антисмыслового соединения с получением заданной антисмысловой активности. Антисмысловые олигонуклеотиды обладают достаточной комплементарностью с их целевыми нуклеиновыми кислотами для обеспечения гибридизации при физиологических условиях.
При использовании в настоящем документе, «комплементарность нуклеооснования» или «комплементарность» в отношении нуклеооснований означает нуклеооснование, которое способно к спариванию оснований с другим нуклеооснованием. Например, в ДНК аденин (А) комплементарен тимину (Т). Например, в РНК аденин (А) комплементарен урацилу (U). В некоторых вариантах реализации комплементарное нуклеооснование означает нуклеооснование антисмыслового соединения, которое способно к спариванию оснований с нуклеооснованием его целевой нуклеиновой кислоты. Например, если нуклеооснование в определенном положении антисмыслового соединения способно к водородному связыванию с нуклеооснованием в определенном положении целевой нуклеиновой кислоты, то это положение водородного связывания между олигонуклеотидом и целевой нуклеиновой кислотой считается комплементарным по этой паре нуклеооснований. Нуклеооснования,
содержащие определенные модификации, могут сохранять способность к спариванию с противоположным нуклеооснованием и, следовательно, все еще могут обладать комплементарностью нуклеооснований.
При использовании в настоящем документе, «не комплементарные» в отношении нуклеооснований означает пару нуклеооснований, которые не образуют водородные связи друг с другом.
При использовании в настоящем документе, «комплементарные» в отношении олигомерных соединений (например, связанных нуклеозидов, олигонуклеотидов или нуклеиновых кислот) означает способность таких олигомерных соединений или их областей к гибридизации с другим олигомерным соединением или его областью за счет комплементарности нуклеооснований. Комплементарные олигомерные соединения не обязательно должны обладать комплементарностью нуклеооснований в каждом нуклеозиде. До не которой степени допустимы некоторые несоответствия. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны по 70% нуклеооснований (комплементарность 70%). В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 80%. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 90%. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 95%. В некоторых вариантах реализации комплементарные олигомерные соединения или области комплементарны на 100%.
При использовании в настоящем документе, «несоответствие» означает нуклеооснование первого олигомерного соединения, которое не способно спариваться с нуклеооснованием в соответствующем положении второго олигомерного соединения при выравнивании первого и второго олигомерного соединения. Любое или оба первое и второе олигомерные соединения могут быть олигонуклеотидами.
При использовании в настоящем документе, «гибридизация» означает спаривание комплементарных олигомерных соединений (например, антисмыслового соединения и его целевой нуклеиновой кислоты). Не ограничиваясь конкретным механизмом, наиболее распространенный механизм спаривания включает водородное связывание, которое может представлять собой уотсон-криковское, хугстиновское или обратное хугстиновское водородное связывание между комплементарными нуклеооснованиями.
При использовании в настоящем документе, «специфически гибридизуется» означает способность олигомерного соединения гибридизоваться с одним сайтом нуклеиновой кислоты с большей аффинностью, чем оно гибридизуется с другим сайтом нуклеиновой кислоты.
При использовании в настоящем документе, «полностью комплементарный» в отношении олигонуклеотида или его части означает, что каждое нуклеооснование олигонуклеотида или его части способно к спариванию с нуклеооснованием комплементарной нуклеиновой кислоты или ее непрерывной частью. Следовательно, полностью комплементарная область не содержит несоответствий или не гибридизованных нуклеооснований в обеих спиралях.
При использовании в настоящем документе, «процент комплементарности» означает процент нуклеооснований олигомерного соединения, которые комплементарны равной по длине части целевой нуклеиновой кислоты. Процент комплементарности рассчитывают делением количества нуклеооснований олигомерного соединения, которые комплементарны нуклеооснованиям в соответствующих положениях целевой нуклеиновой кислоты, на общую длину олигомерного соединения.
При использовании в настоящем документе, «процент идентичности» означает количество нуклеооснований в первой нуклеиновой кислоте, которые относятся к тому же типу (независимо от химической модификации), что и нуклеооснования в соответствующих положениях второй нуклеиновой кислоты, деленное на общее количество нуклеооснований в первой нуклеиновой кислоте.
При использовании в настоящем документе, «модулирование» означает изменение количества или качества молекулы, функции или активности, по сравнению с количеством или качеством молекулы, функции или активности до модулирования. Например, модулирование включает изменение, как увеличение (стимуляцию или индукцию), так и снижение (ингибирование или уменьшение) генной экспрессии. В качестве дополнительного примера, модулирование экспрессии может включать изменение выбора сайта сплайсинга при процессинге пре-мРНК, что приводит к изменению абсолютного или относительного количества определенного сплайс-варианта, по сравнению с его количеством в отсутствие модулирования.
При использовании в настоящем документе, «химический мотив» означает характерный участок химических модификаций в олигонуклеотиде или его области. Мотивы могут быть определены по модификациям в определенных нуклеозидах и/или в определенных связывающих группах олигонуклеотида.
При использовании в настоящем документе, «нуклеозидный мотив» означает характерный участок нуклеозидных модификаций в олигонуклеотиде или его области. Связи такого олигонуклеотида могут быть модифицированными или немодифицированными. Если не указано иное, мотивы, описывающие в настоящем документе только нуклеозиды, представляют собой нуклеозидные мотивы. Следовательно, в таких случаях связи не ограничены.
При использовании в настоящем документе, «сахарный мотив» означает характерный участок сахарных модификаций в олигонуклеотиде или его области.
При использовании в настоящем документе, «связывающий мотив» означает характерный участок связывающих модификаций в олигонуклеотиде или его области. Нуклеозиды такого олигонуклеотида могут быть модифицированными или немодифицированными. Если не указано иное, мотивы, описывающие в настоящем документе только связи, представляют собой связывающие мотивы. Следовательно, в таких случаях нуклеозиды не ограничены.
При использовании в настоящем документе, «мотив модификации нуклеооснования» означает характерный участок модификаций нуклеооснований вдоль олигонуклеотида. Если не указано иное, то мотив модификации нуклеооснования не зависит от последовательности нуклеооснования.
При использовании в настоящем документе, «мотив последовательности» означает характерный участок нуклеооснований, расположенных вдоль олигонуклеотида или его части. Если не указано иное, то мотив последовательности не зависит от химических модификаций и, следовательно, может иметь любую комбинацию химических модификация, включая отсутствие химических модификаций.
При использовании в настоящем документе, «тип модификации» в отношении
нуклеозида или нуклеозида определенного «типа» означает химическую модификацию нуклеозида и включает модифицированные и немодифицированные нуклеозиды. Соответственно, если не указано иное, «нуклеозид, имеющий модификацию первого типа» может быть немодифицированным нуклеозидом.
При использовании в настоящем документе, «по-разному модифицированные» означает химические модификации или химические заместители, которые отличны друг от друга, включая их отсутствие или модификации. Так, например, МОЕ нуклеозид и немодифицированный нуклеозид ДНК являются «по-разному модифицированными», даже несмотря на то, что нуклеозид ДНК является немодифицированным. Точно так же, ДНК и РНК являются «по-разному модифицированными», даже несмотря на то, что оба представляют собой природные немодифицированные нуклеозиды. Нуклеозиды, которые являются одинаковыми, но содержат различные нуклеооснования, не являются по-разному модифицированными. Например, нуклеозид, содержащий 2'-OMe модифицированный сахар и немодифицированное адениновое нуклооснование, и нуклеозид, содержащий 2'-OMe модифицированный сахар и немодифицированное тиминовое нуклеооснования, не являются по-разному модифицированными.
При использовании в настоящем документе, «модификации одного типа» относится к модификациям, которые являются одинаковыми друг относительно друга, включая отсутствие модификаций. Так, например, два немодифицированных нуклеозида ДНК имеют «модификацию одного типа», даже несмотря на то, что нуклеозид ДНК является немодифицированным. Такие нуклеозиды, имеющие модификацию одного типа, могут содержать различные нуклеооснования.
При использовании в настоящем документе, «отдельные области» означает части олигонуклеотида, в которых химические модификации или мотив химических модификаций любой из соседних частей содержит по меньшей мере одно отличие для обеспечения возможности различать области друг от друга.
При использовании в настоящем документе, «фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель» означает любое вещество, подходящее для использования при введении животному. В некоторых вариантах реализации фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель представляет собой стерильный солевой раствор. В некоторых вариантах реализации такой стерильный солевой раствор представляет собой солевой раствор
фармацевтической марки.
При использовании в настоящем документе, термин «метаболическое расстройство» означает заболевание или состояние, которое характеризуется, прежде всего, дисрегуляцией метаболизма - сложного набора химических реакций, связанных с расщеплением пищи с выработкой энергии.
При использовании в настоящем документе, термин «сердечно-сосудистое расстройство» означает заболевание или состояние, которое характеризуется, прежде всего, ухудшенной функцией сердца или кровеносных сосудов.
При использовании в настоящем документе, термин «моно- или полициклическая кольцевая система» включает все кольцевые системы, выбранные из одиночных или полициклических радикальных кольцевых систем, в которых указанные кольца конденсированы или связаны, и включает одиночные или смешанные кольцевые системы, индивидуально выбранные из алифатических, алициклических, арильных, гетероарильных, аралкильных, арилалкильных, гетероциклических, гетероарильных, гетероароматических и гетероарилалкильных. Такие моно- и полициклические структуры могут содержать кольца, каждое из которых имеет одинаковую степень насыщенности, или каждое независимо имеет переменные степени насыщенности, включая полностью насыщенные, частично насыщенные или полностью ненасыщенные. Каждое кольцо может содержать кольцевые атомы, выбранные из C, N, O и S с образованием гетероциклических колец, а также колец, содержащих только кольцевые атомы C, которые могут быть представлены в смешанном мотиве, как, например, в бензимидазоле, в котором одно кольцо имеет только кольцевые атомы углерода, а конденсированное кольцо имеет два атома азота. Моно- или полициклическая кольцевая система может быть дополнительно замещена группами заместителей, как, например, фталимид, который имеет две группы =O, присоединенные к одному из колец. Моно- или полициклические кольцевые системы могут быть присоединены к исходным молекулам при помощи различных способов, таких как непосредственно через кольцевой атом, путем конденсации через несколько кольцевых атомов, через группу заместителя или через бифункциональный связывающий фрагмент.
При использовании в настоящем документе, «пролекарство» означает неактивную или менее активную форму соединения, которая при введении субъекту метаболизируется с образованием активного или более активного соединения (например, лекарства).
При использовании в настоящем документе, «заместитель» и «группа заместителя» означает атом или группу, которая вытесняет атом или группу указанного исходного соединения. Например, заместитель модифицированного нуклеозида представляет собой любой атом или группу, которая отлична от атома или группы, находящейся в природном нуклеозиде (например, модифицированный 2'-заместитель представляет собой любой атом или группу в 2'-положении нуклеозида, отличную от H или OH). Группы заместителей могут быть защищенными или не защищенными. В некоторых вариантах реализации соединения настоящего описания имеют заместители в одном или более чем в одном положении исходного соединения. Заместители также могут быть дополнительно замещены другими группами заместителей и могут быть присоединены напрямую или через связывающую группу, такую как алкильная или углеводородная группа, к исходному соединению.
Точно так же, при использовании в настоящем документе, «заместитель» в отношении химической функциональной группы означает атом или группу атомов, которая отлична от атома или группы атомов, обычно содержащихся в указанной функциональной группе. В некоторых вариантах реализации заместитель вытесняет атом водорода функциональной группы (например, в некоторых вариантах реализации заместитель замещенной метильной группы представляет собой атом или группу, отличную от водорода, которая вытесняет один или более атомов водорода незамещенной метильной группы). Если не указано иное, группы, которые могут быть использованы в качестве заместителей, включают, без ограничения, галоген, гидроксил, алкил, алкенил, алкинил, ацил (-C(O)Raa), карбоксил (-C(O)O-Raa), алифатические группы, алициклические группы, алкокси, замещенный окси (-O-Raa), арил, аралкил, гетероциклический радикал, гетероарил, гетероарилалкил, амино (-N(Rbb)(Rcc)), имино (=NRbb), амидо (-C(O)N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)C(O)Raa), азидо (-N3), нитро (-NO2), циано (-CN), карбамидо (-OC(O)N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)C(O)ORaa), уреидо (-N(Rbb)C(O)N(Rbb)(Rcc)), тиоуреидо (-N(Rbb)C(S)N(Rbb)(Rcc)), гуанидинил (-N(Rbb)C(=NRbb)N(Rbb)(Rcc)), амидинил (-C(=NRbb)N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)C(=NRbb)(Raa)), тиол (-SRbb), сульфинил (-S(O)Rbb), сульфонил (-S(O)2Rbb) и сульфонамидил (-S(O)2N(Rbb)(Rcc) или -N(Rbb)S(O)2Rbb). Где каждый Raa, Rbb и Rcc независимо представляет собой H, необязательно связанную химическую функциональную группу или дополнительную группу заместителя, при этом предпочтительный перечень включает, без ограничения, алкил, алкенил, алкинил, алифатические, алококси, ацил, арил, аралкил, гетероарил, алициклические,
гетероциклические и гетероарилалкил. Выбранные заместители с соединениями, описанными в настоящем документе, находятся в рекурсивной степени.
При использовании в настоящем документе, «алкил», используемый в настоящем документе, означает насыщенный прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода. Примеры алкильных групп включают, без ограничения, метил, этил, пропил, бутил, изопропил, н-гексил, октил, децил, додецил и т.п. Алкильные группы обычно содержат от 1 до около 24 атомов углерода, более часто от 1 до около 12 атомов углерода (C1-C12 алкил), при этом более предпочтительно от 1 до около 6 атомов углерода.
При использовании в настоящем документе, «алкенил» означает прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода и имеющий по меньшей мере одну двойную углерод-углеродную связь. Примеры алкенильных групп включают, без ограничения, этенил, пропенил, бутенил, 1-метил-2-бутен-1-ил, диены, такие как 1,3-бутадиен и т.п. Алкенильные группы обычно содержат от 2 до около 24 атомов углерода, более часто от 2 до около 12 атомов углерода, при этом более предпочтительно от 2 до около 6 атомов углерода. Алкенильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать одну или более дополнительных групп заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алкинил» означает прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода и имеющий по меньшей мере одну тройную углерод-углеродную связь. Примеры алкинильных групп включают, без ограничения, этинил, 1-пропинил, 1-бутинил и т.п. Алкинильные группы обычно содержат от 2 до около 24 атомов углерода, более часто от 2 до около 12 атомов углерода, при этом более предпочтительно от 2 до около 6 атомов углерода. Алкинильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать одну или более дополнительных групп заместителей.
При использовании в настоящем документе, «ацил» означает радикал, образованный за счет удаления гидроксильной группы от органической кислоты, и имеет общую формулу -C(O)-X, где X обычно является алифатическим, алициклическим или ароматическим.
Примеры включают алифатические карбонилы, ароматические карбонилы, алифатические сульфонилы, ароматические сульфинилы, алифатические сульфинилы, ароматические фосфаты, алифатические фосфаты и т.п. Ацильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алициклическая» означает циклическую кольцевую систему, в которой кольцо является алифатическим. Кольцевая система может содержать одно или более колец, при этом по меньшей мере одно кольцо является алифатическим. Предпочтительные алициклические системы включают кольца, имеющие от около 5 до около 9 атомов углерода в кольце. Алициклические группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алифатический» означает прямой или разветвленный углеводородный радикал, содержащий до двадцати четырех атомов углерода, в котором насыщенность между любыми двумя атомами углерода представляет собой одинарную, двойную или тройную связь. Алифатическая группа предпочтительно содержит от 1 до около 24 атомов углерода, более часто от 1 до около 12 атомов углерода, при этом более предпочтительно от 1 до около 6 атомов углерода. Прямая или разветвленная цепь алифатической группы может быть прервана одним или более гетероатомами, которые включают азот, кислород, серу и фосфор. Такие алифатические группы, прерванные гетероатомами, включают, без ограничения, полиалкокси, такие как полиалкиленгликоли, полиамины и полиимины. Алифатические группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «алкокси» означает радикал, образованный между алкильной группой и атомом кислорода, при этом атом кислорода используется для присоединения алкокси-группы к исходной молекуле. Примеры алкокси-групп включают, без ограничения, метокси, этокси, пропокси, изопропокси, н-бутокси, втор-бутокси, трет-бутокси, н-пентокси, неопентокси, н-гексокси и т.п. Алкокси-группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «аминоалкил» означает аминозамещенный C1-C12 алкильный радикал. Алкильная часть указанного радикала образует ковалентную связь с исходной молекулой. Аминогруппа может быть расположена в любом положении, и аминоалкильная группа может быть замещена дополнительной группой заместителя в алкильной и/или амино-части.
При использовании в настоящем документе, «аралкил» и «арилалкил» означает ароматическую группу, которая ковалентно связана с C1-C12 алкильным радикалом. Часть алкильного радикала образовавшейся аралкильной (или арилалкильной) группы образует ковалентную связь с исходной молекулой. Примеры включают, без ограничения, бензил, фенетил и т.п. Аралкильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей, присоединенные к алкильной, арильной или к обеим группам, которые образуют указанную радикальную группу.
При использовании в настоящем документе, «арил» и «ароматический» означает радикалы моно- или полициклической карбоциклической кольцевой системы, имеющие одно или более ароматических колец. Примеры арильных групп включают, без ограничения, фенил, нафтил, тетрагидронафтил, инданил, инденил и т.п. Предпочтительные арильные кольцевые системы имеют от около 5 до около 20 атомов углерода в одном или более кольцах. Арильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «гало» и «галоген» означает атом, выбранный из фтора, хлора, брома и йода.
При использовании в настоящем документе, «гетероарил» и «гетероароматический» означает радикал, содержащий моно- или полициклическое ароматическое кольцо, кольцевую систему или конденсированную кольцевую систему, в котором по меньшей мере одно из колец является ароматическим и содержит один или более гетероатомов. Гетероарил включает также конденсированные кольцевые системы, включая системы, в которых одно или более из конденсированных колец не содержат гетероатомов. Гетероарильные группы, как правило, содержат один кольцевой атом, выбранный из серы, азота или кислорода,
Примеры гетероарильных групп включают, без ограничения, пиридинил, пиразинил, пиримидинил, пирролил, пиразолил, имидазолил, тиазолил, оксазолил, изооксазолил, тиадиазолил, оксадиазолил, тиофенил, фуранил, хинолинил, изохинолинил, бензимидазолил, бензоксазолил, хиноксалинил и т.п. Гетероарильные радикалы могут быть присоединены к исходной молекуле напрямую или через связывающий фрагмент, такой как алифатическая группа или гетероатом. Гетероарильные группы, используемые в настоящем документе, могут необязательно содержать дополнительные группы заместителей.
При использовании в настоящем документе, «сопряженное соединение» означает любые атомы, группы атомов или группу связанных атомов, подходящую для применения в качестве группы конъюгата. В некоторых вариантах реализации сопряженные соединения могут обладать или влиять на одно или более свойств, включая, но не ограничиваясь этим, свойства фармакодинамики, фармакокинетики, связывания, адсорбции, клеточного распределения, клеточного захвата, заряда и/или выведения.
При использовании в настоящем документе, если не указано или немодифицировано иным образом, «двухспиральные» относится к двум отдельным олигомерным соединениям, которые гибридизованы друг с другом. Такие двухспиральные соединения могут иметь один или более не гибридизованных нуклеозидов у одного или обоих концов одной или обеих спиралей (выступы) и/или один или более внутренних не гибридизованных нуклеозидов (несоответствий), при условии, что существует достаточная комплементарность для сохранения гибридизации при физиологически релевантных условиях.
В. Некоторые соединения
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены сопряженные антисмысловые соединения, содержащие антисмысловые олигонуклеотиды и конъюгат.
а. Некоторые антисмыловые олигонуклеотиды
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены антисмысловые олигонуклеотиды. Такие антисмысловые олигонуклеотиды содержат связанные нуклеозиды, и каждый нуклеозид содержит сахарный фрагмент и
нуклеооснование. Структура таких антисмысловых олигонуклеотидов может быть рассмотрена с точки зрения химических особенностей (например, модификаций и характерных участков модификаций) и последовательности нуклеооснований (например, последовательность антисмыслового олигонуклеотида, сущность и последовательность целевой нуклеиновой кислоты).
i. Некоторые химические особенности
В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид содержит одну или более модификаций. В некоторых таких вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных нуклеозидов и/или модифицированных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации модифицированные нуклеозиды содержат модифицированный сахарный фрагмент и/или модифицированное нуклеооснование.
1. Некоторые сахарные фрагменты
В некоторых вариантах реализации соединения настоящего описания содержат один или более модифицированных нуклеозидов, содержащих модифицированный сахарный фрагмент. Такие соединения, содержащие один или более модифицированных по сахару нуклеозидов, могут обладать заданными свойствами, такими как улучшенная стабильность к нуклеазе или увеличенная связывающая аффинность к целевой нуклеиновой кислоте, по сравнению с олигонуклеотидом, содержащим только нуклеозиды, которые содержат природные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой замещенные сахарные фрагменты. В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой заменители сахара. Такие заменители сахара могут содержать одно или более замещений, соответствующих замещениям замещенных сахарных фрагментов.
В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой замещенные сахарные фрагменты, содержащие один или более немостиковых сахарных заместителей, включая, но не ограничиваясь этим, заместители в 2' и/или 5'-положениях. Примеры заместителей сахара, подходящих для 2'-положения включают, но не ограничиваются ими: 2'-F, 2'-OCH3 («OMe» или «O-метил») и 2'-O(CH2)2OCH3 («МОЕ»). В некоторых вариантах реализации заместитель сахара в 2'-положении
выбран из аллила, амино, азидо, тио, O-аллила, O-C1-C10 алкила, O-C1-C10 замещенного алкила; OCF3, O(CH2)2SCH3, O(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) и O-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой H или замещенный или незамещенный C1-C10 алкил. Примеры заместителей сахара в 5'-положении включают, но не ограничиваются ими: 5'-метил (R или S), 5'-винил и 5'-метокси. В некоторых вариантах реализации замещенные сахара содержат более одного немостикового сахарного заместителя, например, 2'-F-5'-метил-сахарные фрагменты (см., например, Международную заявку PCT WO 2008/101157, где представлены дополнительные 5', 2'-бис-замещенные сахарные фрагменты и нуклеозиды).
Нуклеозиды, содержащие 2'-замещенные сахарные фрагменты, упоминаются как 2'-замещенные нуклеозиды. В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит 2'-группу заместителя, выбранную из галогена, аллила, амино, азидо, SH, CN, OCN, CF3, OCF3, O, S или N(Rm)-алкила; O, S или N(Rm)-алкенила; O, S или N(Rm)-алкинила; O-алкиленил-O-алкила, алкинила, алкарила, аралкила, O-алкарила, O-аралкила, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn) или O-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой H, аминозащитную группу или замещенный или незамещенный C1-C10 алкил. Эти 2'-группы заместителей могут быть дополнительно замещены одной или более группами заместителей, независимо выбранными из гидроксила, амино, алкокси, карбокси, бензила, фенила, нитро (NO2), тиола, тиоалкоксн (S-алкила), галогена, алкила, арила, алкенила и алкинила.
В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит 2'-группу заместителя, выбранную из F, NH2, N3, OCF3, O-CH3, O(CH2)3NH2, CH2-CH=CH2, O-CH2-СН=CH2, OCH2CH2OCH3, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(Rm)(Rn), O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2 и N-замещенного ацетамида (O-CH2-C(=O)-N(Rm)(Rn), где каждый Rm и Rn независимо представляет собой H, аминозащитную группу или замещенный или незамещенный C1-C10 алкил.
В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит сахарный фрагмент, содержащий 2'-группу заместителя, выбранную из F, OCF3, O-CH3, OCH2CH2OCH3, O(CH2)2SCH3, O-(CH2)2-O-N(CH3)2, -O(CH2)2O(CH2)2N(CH3)2 и O-CH2-C(=O)-N(H)CH3.
В некоторых вариантах реализации 2'-замещенный нуклеозид содержит сахарный фрагмент, содержащий 2'-группу заместителя, выбранную из F, O-CH3 и OCH2CH2OCH3.
Некоторые модифицированные сахарные фрагменты содержат мостиковый сахарный заместитель, который образует второе кольцо, что приводит к получению бициклического сахарного фрагмента. В некоторых таких вариантах реализации бициклический сахарный фрагмент содержит мостик между 4' и 2' атомами фуранозного кольца. Примеры таких 4'-2' сахарных заместителей включают, но не ограничиваются ими: -[C(Ra)(Rb)]n-, -[C(Ra)(Rb)]n-O-, -C(RaRb)-N(R)-O- или -C(RaRb)-O-N(R)-; 4'-CH2-2', 4'-(CH2)2-2', 4'-(CH2)3-2', 4'-(CH2)-O-2' (LNA); 4'-(CH2)-S-2'; 4'-(CH2)2-O-2' (ENA); 4'-СН(CH3)-O-2' (cEt) и 4'-CH(CH2OCH3)-O-2', и его аналоги (см., например, патент США 7399845, выданный 15 июля 2008 года); 4'-С(CH3)(CH3)-O-2' и его аналоги (см., например, WO 2009/006478, опубликованный 8 января 2009 года); 4'-CH2-N(OCH3)-2' и его аналоги (см., например, WO 2008/150729, опубликованный 11 декабря 2008 года); 4'-CH2-O-N(CH3)-2' (см., например, US 2004/0171570, опубликованный 2 сентября 2004 года); 4'-CH2-O-N(R)-2' и 4'-CH2-N(R)-O-2'-, где каждый R независимо представляет собой H, защитную группу или C1-C12 алкил; 4'-CH2-N(R)-O-2', где R представляет собой H, C1-C12 алкил или защитную группу (см., например, патент США 7427672, выданный 23 сентября 2008 года); 4'-CH2-C(H)(CH3)-2' (см., например, Chattopadhyaya, et al., J. Org. Chem., 2009, 74, 118-134); и 4'-CH2-C(=CH2)-2' и его аналоги (см. опубликованную Международную заявку PCT WO 2008/154401, опубликованную 8 декабря 2008 года).
В некоторых вариантах реализации такие мостики 4'-2' независимо содержат от 1 до 4 связанных групп, независимо выбранных из -[C(Ra)(Rb)]n-, -C(Ra)=C(Rb)-, -C(Ra)=N-, -C(=NRa)-, -C(=O)-, -C(=S)-, -O-, -Si(Ra)2-, -S(=O)x- и -N(Ra)-;
где:
x равен 0, 1 или 2;
n равен 1, 2, 3 или 4;
каждый Ra и Rb независимо представляет собой H, защитную группу, гидроксил, C1-C12 алкил, замещенный C1-C12 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C5-C20 арил, замещенный С5-С20 арил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, гетероарил,
замещенный гетероарил, C5-C7 алициклический радикал, замещенный C5-C7 алициклический радикал, галоген, OJ1, NJ1J2, SJ1, N3, COOJ1, ацил (C(=O)-H), замещенный ацил, CN, сульфонил (S(=O)2-J1) или сульфоксил (S(=O)-J1); и
каждый J1 и J2 независимо представляет собой H, C1-C12 алкил, замещенный C1-C12 алкил, C2-C12 алкенил, замещенный C2-C12 алкенил, C2-C12 алкинил, замещенный C2-C12 алкинил, C5-C20 арил, замещенный C5-C20 арил, ацил (C(=O)-H), замещенный ацил, гетероциклический радикал, замещенный гетероциклический радикал, C1-C12 аминоалкил, замещенный C1-C12 аминоалкил или защитную группу.
Нуклеозиды, содержащие бициклические сахарные фрагменты, упоминаются как бициклические нуклеозиды или BNA. Бициклические нуклеозиды включают, но не ограничиваются ими, (А) α-L-метиленокси (4'-CH2-O-2') BNA, (В) β-D-метиленокси (4'-CH2-O-2') BNA (также упоминаемый как закрытая нуклеиновая кислота или LNA), (С) этиленокси (4'-(CH2)2-O-2') BNA, (D) аминоокси (4'-CH2-O-N(R)-2') BNA, (Е) оксиамино (4'-CH2-N(R)-O-2') BNA, (F) метил(метиленокси) (4'-СН(CH3)-O-2') BNA (также упоминаемый как затрудненный этил или cEt), (G) метилен-тио (4'-CH2-S-2') BNA, (Н) метилен-амино (4'-CH2-N(R)-2') BNA, (I) метил-карбоциклический (4'-CH2-СН(CH3)-2') BNA и (J) пропилен-карбоциклический (4'-(CH2)3-2') BNA, как показано ниже.
где Вх представляет собой фрагмент нуклеооснования, a R независимо представляет собой H, защитную группу или C1-C12 алкил.
В данной области техники известны дополнительные бициклические сахарные фрагменты, например: Singh et al., Chem. Commun., 1998, 4, 455-456; Koshkin et al., Tetrahedron, 1998, 54, 3607-3630; Wahlestedt et al., Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2000, 97, 5633-5638; Kumar et al., Bioorg. Med. Chem. Lett., 1998, 8, 2219-2222; Singh et al., J. Org. Chem., 1998, 63, 10035-10039; Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc., 129(26) 8362-8379 (4 июля 2007 года); Elayadi et al., Curr. Opinion Invens. Drugs, 2001, 2, 558-561; Braasch et al., Chem. Biol., 2001, 8, 1-7; Orum et al., Curr. Opinion Mol. Ther., 2001, 3, 239-243; патенты США №7053207 6268490 6770748 6794499 7034133 6525191 6670461 и 7399845; WO 2004/106356, WO 1994/14226, WO 2005/021570 и WO 2007/134181; публикации патентов США № US 2004/0171570, US 2007/0287831 и US 2008/0039618; патенты США с серийными номерами 12/129154 60/989574 61/026995 61/026998 61/056564 61/086231 61/097787 и 61/099844; и Международные заявки PCT № PCT/US2008/064591, PCT/US2008/066154 и PCT/US2008/068922.
В некоторых вариантах реализации бициклические сахарные фрагменты и нуклеозиды, содержащие такие бициклические сахарные фрагменты, дополнительно определяют по изомерной конфигурации. Например, нуклеозид, содержащий мостик 4'-2'-метилен-окси, может быть в α-L конфигурации или в β-D конфигурации. Ранее α-L-метиленокси (4'-CH2-O-2') бициклические нуклеозиды были внедрены в антисмысловые олигонуклеотиды, которые обладают антисмысловой активностью (Frieden et al., Nucleic Acids Research, 2003, 21, 6365-6372).
В некоторых вариантах реализации замещенные сахарные фрагменты содержат один
или более немостиковых сахарных заместителей и один или более мостиковых сахарных заместителей (например, 5'-замещенные и 4'-2'-мостиковые сахара), (см., например, Международную заявку PCT WO 2007/134181, опубликованную 11/22/07, в которой LNA замещена, например, 5'-метильной или 5'-виниловой группой).
В некоторых вариантах реализации модифицированные сахарные фрагменты представляют собой заменители сахара. В некоторых таких вариантах реализации атом кислорода природного сахара является замещенным, например, атомом серы, углерода или азота. В некоторых таких вариантах реализации такой модифицированный сахарный фрагмент содержит также мостиковые и/или немостиковые заместители, как описано выше. Например, некоторые заменители сахара содержат 4'-атом серы и замещение в 2'-положении (см., например, опубликованную патентную заявку США US 2005/0130923, опубликованную 16 июня 2005 года) и/или 5'-положении. В качестве дополнительного примера, были описаны карбоциклические бициклические нуклеозиды, имеющие мостик 4'-2' (см., например, Freier et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4429-4443 и Albaek et al., J. Org. Chem., 2006, 71, 7731-7740).
В некоторых вариантах реализации заменители сахара содержат кольца, имеющие не 5 атомов. Например, в некоторых вариантах реализации заменитель сахара содержит морфолино. Морфолино-соединения и их применение в олигомерных соединениях было описано в многочисленных патентах и опубликованных статьях (см., например: Braasch et al., Biochemistry, 2002, 41, 4503-4510; и патенты США 5698685; 5166315; 5185444; и 5034506). При использовании в настоящем документе, термин «морфолино» означает заменитель сахара, имеющий следующую структуру:
В некоторых вариантах реализации морфолино могут быть модифицированными, например, добавлением или изменением различных групп заместителей в представленной выше структуре морфолино. Такие заменители сахара упомянуты в настоящем документе как «модифицированные морфолино».
В качестве другого примера, в некоторых вариантах реализации заменитель сахара содержит шестичленный тетрагидропиран. Такие тетрагидропираны могут быть дополнительно модифицированы или замещены. Нуклеозиды, содержащие такие модифицированные тетрагидропираны, включают, но не ограничиваются ими, гекситоловую нуклеиновую кислоту (HNA), анитоловую нуклеиновую кислоту (ANA), манитоловую нуклеиновую кислоту (MNA) (см. Leumann, CJ. Bioorg. & Med. Chem. (2002) 10:841-854), фтор-HNA (F-HNA) и соединения, имеющие Формулу VI:
где независимо для каждого из указанного по меньшей мере одного тетрагидропиранового нуклеозидного аналога Формулы VI:
Вх представляет собой фрагмент нуклеооснования;
T3 и T4, каждый независимо, представляют собой межнуклеозидную связывающую группу, связывающую тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением, или один из T3 и T4 представляет собой межнуклеозидную связывающую группу, связывающую тетрагидропирановый нуклеозидный аналог с антисмысловым соединением, а другой из T3 и T4 представляет собой H, гидроксил-защитную группу, связанную группу конъюгата или 5' или 3'-концевую группу;
q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7, каждый независимо, представляют собой H, C1-C6 алкил, замещенный C1-C6 алкил, C2-C6 алкенил, замещенный C2-C6 алкенил, C2-C6 алкинил или замещенный C2-C6 алкинил; и
каждый из R1 и R2 независимо выбран из: водорода, галогена, замещенного или незамещенного алкокси, NJ1J2, SJ1, N3, OC(=X)J1, OC(=X)NJ1J2, NJ3C(=X)NJ1J2 и CN, где X представляет собой O, S или NJ1, и каждый J1, J2 и J3 независимо представляет собой H или C1-C6 алкил.
В некоторых вариантах реализации представлены модифицированные THP нуклеозиды Формулы VI, в которых каждый q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7 представляет собой H. В
некоторых вариантах реализации по меньшей мере один из q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7 отличен от H. В некоторых вариантах реализации по меньшей мере один из q1, q2, q3, q4, q5, q6 и q7 представляет собой метил. В некоторых вариантах реализации представлены THF нуклеозиды Формулы VI, в которых один из R1 и R2 представляет собой F. В некоторых вариантах реализации R1 представляет собой фтор, a R2 представляет собой H, R1 представляет собой метокси, a R2 представляет собой H, и R1 представляет собой метоксиэтокси, a R2 представляет собой H.
В данной области техники известны также многие другие бициклические и трициклические кольцевые системы заменителей сахара, которые могут быть использованы для модификации нуклеозидов для внедрения в антисмысловые соединения (см., например, обзорную статью: Leumann, J.С, Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2002, 10, 841-854).
Без ограничения, представлены также комбинации модификаций, такие как 2'-F-5'-метил-замещенные нуклеозиды (см. Международную заявку PCT WO 2008/101157, опубликованную 8/21/08, где описаны другие 5', 2'-бис-замещенные нуклеозиды) и замена атома кислорода рибозильного кольца на S и дополнительное замещение в 2'-положении (см. опубликованную заявку на патент США US 2005-0130923, опубликованную 16 июня 2005 года) или, альтернативно, 5'-замещение бициклической нуклеиновой кислоты (см. Международную заявку PCT WO 2007/134181, опубликованную 11/22/07, в которой 4'-CH2-O-2' бициклический нуклеозид дополнительно замещен в 5'-положении 5'-метильной или 5'-виниловой группой). Был описан также синтез и получение карбоциклических бициклических нуклеозидов вместе с их олигомеризацией и биохимическими исследованиями (см., например, Srivastava et al., J. Am. Chem. Soc. 2007, 129(26), 8362-8379).
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены олигонуклеотиды, содержащие модифицированные нуклеозиды. Такие модифицированные нуклеотиды могут содержать модифицированные сахара, модифицированные нуклеооснования и/или модифицированные связи. Конкретные модификации выбирают так, чтобы полученные олигонуклеотиды обладали желаемыми характеристиками. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат один или более РНК-подобных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат один или более ДНК-подобных нуклеотидов.
2. Некоторые модификации нуклеооснований
В некоторых вариантах реализации нуклеозиды настоящего описания содержат одно или более немодифицированных нуклеооснований. В некоторых вариантах реализации нуклеозиды настоящего описания содержат одно или более модифицированных нуклеооснований.
В некоторых вариантах реализации модифицированные нуклеооснования выбраны из: универсальных оснований, гидрофобных оснований, смешанных оснований, увеличенных в размере оснований и фторированных оснований, описанных в настоящем документе. 5-замещенные пиримидины, 6-азапиримидины и N-2, N-6 и О-6-замещенные пурины, включая 2-аминопропиладенин, 5-пропинилурацил; 5-пропинилцитозин; 5-гидроксиметил-цитозин, ксантин, гипоксантин, 2-аминоаденин, 6-метил и другие алкильные производные аденина и гуанина, 2-пропил и другие алкильные производные аденина и гуанина, 2-тиоурацил, 2-тиотимин и 2-тиоцитозин, 5-галоурацил и цитозин, 5-пропинил (-С≡С-CH3) урацил и цитозин и другие алкинильные производные пиримидиновых оснований, 6-азоурацил, цитозин и тимин, 5-урацил (псевдоурацил), 4-тиоурацил, 8-гало, 8-амино, 8-тиол, 8-тиоалкил, 8-гидроксил и другие 8-замещенные аденины и гуанины, 5-гало, в частности, 5-бром, 5-трифторметил и другие 5-замещенные урацилы и цитозины, 7-метилгуанин и 7-метиладенин, 2-F-аденин, 2-аминоаденин, 8-азагуанин и 8-азааденин, 7-деазагуанин и 7-деазааденин, 2-деазагуанин и 3-деазааденин, универсальные основания, гидрофобные основания, смешанные основания, увеличенные в размере основания и фторированные основания, описанные в настоящем документе. Дополнительные модифицированные нуклеооснования включают трициклические пиримидины, такие как феноксазина цитидин ([5,4-b][1,4]бензоксазин-2(3H)-он), фенотиазина цитидин (1H-пиримидо[5,4-b][1,4]бензотиазин-2(3H)-он), так называемые G-clamp, такие как замещенный феноксазина цитидин (например, 9-(2-аминоэтокси)-H-пиримидо[5,4-b][1,4]бензоксазин-2(3H)-он), карбазола цитидин (2Н-пиримидо[4,5-b]индол-2-он), пиридоиндола цитидин (H-пиридо[3',2':4,5]пирроло[2,3-d]пиримидин-2-он). Модифицированные нуклеооснования также могут включать нуклеооснования, в которых пуриновое или пиримидиновое основание заменено другими гетероциклами, например, 7-деаза-аденин, 7-деазагуанозин, 2-аминопиридин и 2-пиридон. Дополнительные нуклеооснования включают нуклеооснования, описанные в патенте США №3687808, описанные в публикации The Concise Encyclopedia Of Polymer Science And Engineering
Kroschwitz, J.I., ред., John Wiley & Sons, 1990, 858-859; описанные авторами Englisch et al., Angewandte Chemie, Международное издание, 1991, 30, 613; и описанные в публикации Sanghvi, Y.S., глава 15, Antisense Research and Applications, Crooke, S.T. и Lebleu, В., ред., CRC Press, 1993, 273-288.
Иллюстративные патенты США, в которых описано получение некоторых из вышеупомянутых модифицированных нуклеооснований, а также других модифицированных нуклеооснований, включают, без ограничения, U.S. 3687808; 4845205; 5130302; 5134066; 5175273; 5367066; 5432272; 5457187; 5459255; 5484908; 5502177; 5525711; 5552540; 5587469; 5594121; 5596091; 5614617; 5645985; 5681941; 5750692; 5763588; 5830653 и 6005096, некоторые из которых находятся на рассмотрении одновременно с настоящей заявкой, и каждый из которых включен в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
3. Некоторые межнуклеозидные связи
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены олигонуклеотиды, содержащие связанные нуклеозиды. В таких вариантах реализации нуклеозиды могут быть связаны вместе при помощи любой межнуклеозидной связи. Два основных класса межнуклеозидных связывающих групп определяются по наличию или отсутствию атома фосфора. Иллюстративные фосфорсодержащие межнуклеозидные связи включают, но не ограничиваются мими, фосфодиэфиры (PO), фосфотриэфиры, метилфосфонаты, фосфорамидаты и тиофосфаты (PS). Иллюстративные не содержащие фосфора межнуклеозидные связывающие группы включают, но не ограничиваются ими, метиленметилимино (-CH2-N(CH3)-O-CH2-), тиодиэфир (-O-C(O)-S-), тионокарбамат (-O-C(O)(NH)-S-); силоксан (-O-Si(H)2-O-); и N,N'-диметилгидразин (-CH2-N(CH3)-N(CH3)-). Модифицированные связи, в сравнении с природными фосфодиэфирными связями, могут быть использованы для изменения, обычно увеличения устойчивости олигонуклеотида к нуклеазе. В некоторых вариантах реализации межнуклеозидные связи, имеющие хиральный атом, могут быть получены в виде рацемической смеси или в виде отдельных энантиомеров. Иллюстративные хиральные связи включают, но не ограничиваются ими, алкилфосфонаты и тиофосфаты. Способы получения фосфорсодержащих и не содержащих фосфора межнуклеозидных связей хорошо известны специалистам в данной области техники.
Олигонуклеотиды, описанные в настоящем документе, содержат один или более асимметричных центров и, следовательно, могут образовывать энантиомеры, диастереомеры и другие стереоизомерные конфигурации, которые в соответствии с абсолютной стереохимией могут быть определены как (R) или (S), или, как для аномеров сахара, или как (D) или (L), как для аминокислот и т.д. В антисмысловые соединения, представленные в настоящем документе, включены все такие возможные изомеры, а также их рацемические и оптически чистые формы.
Нейтральные связывающие линкеры включают, без ограничения, фосфотриэфиры, метилфосфонаты, MMI (3'-CH2-N(CH3)-O-5'), амид-3 (3'-CH2-C(=O)-N(H)-5'), амид-4 (3'-CH2-N(H)-C(=O)-5'), формацеталь (3'-O-CH2-O-5') и тиоформацеталь (3'-S-CH2-O-5'). Дополнительные нейтральные межнуклеозидные связи включают неионные связи, содержащие силокасан (диалкилсилоксан), карбоксилатный сложный эфир, карбоксамид, сульфид, сульфонатный сложный эфир и амиды (см., например: Carbohydrate Modifications in Antisense Research; Y.S. Sanghvi и P.D. Cook, ред., ACS Symposium Series 580; главы 3 и 4, 40-65). Дополнительные нейтральные межнуклеозидные связи включают неионные связи, содержащие смешанные составные части N, O, S и CH2.
4. Некоторые мотивы
В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды содержат один или более модифицированных нуклеозидов (например, нуклеозид, содержащий модифицированный сахар и/или модифицированное нуклеооснование) и/или один или более модифицированных межнуклеозидных связей. Характерный участок таких модификаций в олигонуклеотиде упоминается в настоящем документе как мотив. В некоторых вариантах реализации мотивы сахара, нуклеооснования и линкера не зависят друг от друга.
а. Некоторые сахарные мотивы
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат один или более типов модифицированных сахарных фрагментов и/или природных сахарных фрагментов, расположенных вдоль олигонуклеотида или его области определенным образом или в виде мотива сахарной модификации. Такие мотивы могут содержать любые сахарные модификации, рассмотренные в настоящем документе и/или другие известные модификации сахара.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат или состоят из области, имеющей сахарный мотив гэпмера, который содержит две внешних области или «крыла» и центральную или внутреннюю область, или «гэп». Эти три области сахарного мотива гэпмера (5'-крыло, гэп и 3'-крыло) образуют непрерывную последовательность нуклеооснований, в которой по меньшей мере некоторые из сахарных фрагментов нуклеозидов в каждом крыле отличаются по меньшей мере от некоторых сахарных фрагментов нуклеозидов в гэпе. В частности, по меньшей мере те сахарные фрагменты нуклеозидов каждого крыла, которые расположены ближе всего к гэпу (3'-ближайший нуклеозид 5'-крыла и 5'-ближайший нуклеозид 3'-крыла), отличаются от сахарного фрагмента соседних нуклеозидов в гэпе, определяя таким образом границу между крыльями и гэпом. В некоторых вариантах реализации сахарные фрагменты в гэпе являются одинаковыми между собой. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более нуклеозидов, имеющих сахарный фрагмент, который отличается от сахарного фрагмента одного или более других нуклеозидов в гэпе. В некоторых вариантах реализации сахарные мотивы двух крыльев являются одинаковыми между собой (симметричный сахарный гэпмер). В некоторых вариантах реализации сахарные мотивы 5'-крыла отличаются от сахарного мотива 3'-крыла (асимметричный сахарный гэпмер).
i. Некоторые 5'-крылья
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-6 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 3-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 4 или 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1-3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1 или 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2 или 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера
состоит из 3 или 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 1 нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера состоит из 6 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере два бициклических нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере три бициклических нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере четыре бициклических нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой LNA нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-OMe нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 5'-крыла гэпмера представляет собой рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации один, более одного или каждый из нуклеозидов 5'-крыла представляет собой РНК-подобный нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 5'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
ii. Некоторые 3'-крылья
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-7 связанных
нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-6 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 3-5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 4 или 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1-3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1 или 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2-4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2 или 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 3 или 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 1 нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 2 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 3 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 4 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 5 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера состоит из 6 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой бициклический нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой затрудненный этил-нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой LNA нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере два не бициклических модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере
три не бициклических модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере четыре не бициклических модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-OMe нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид 3'-крыла гэпмера представляет собой рибонуклеозид. В некоторых вариантах реализации один, более одного или каждый из нуклеозидов 5'-крыла представляет собой РНК-подобный нуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один не бициклический модифицированный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера
содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один 2'-замещенный нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один 2'-МОЕ нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один бициклический нуклеозид, по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один затрудненный этил-нуклеозид, по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации 3'-крыло гэпмера содержит по меньшей мере один LNA нуклеозид, по меньшей мере один 2'-OMe нуклеозид и по меньшей мере один 2'-дезоксинуклеозид.
iii. Некоторые центральные области (гэпы)
В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-20 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-15 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-12 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6-8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6 или 7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7-10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7-9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7 или 8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 8-10 связанных
нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 8 или 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 6 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 7 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 8 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 9 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 10 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 11 связанных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп гэпмера состоит из 12 связанных нуклеозидов.
В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид гэпа гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации каждый нуклеозид гэпа гэпмера представляет собой 2'-дезоксинуклеозид или представляет собой модифицированный «ДНК-подобный» нуклеозид. В таких вариантах реализации «ДНК-подобный» означает, что нуклеозид имеет такие же характеристики, что и ДНК, то есть что дуплекс, содержащий гэпмер и молекулу РНК может активировать РНКазу H. Например, было показано, что при некоторых условиях 2'-(ara)-F поддерживает активацию РНКазы H и, следовательно, является ДНК-подобным. В некоторых вариантах реализации один или более нуклеозидов гэпа гэпмера не представляет собой 2'-дезоксинуклеозид и не является ДНК-подобным. В некоторых таких вариантах реализации гэпмер тем не менее поддерживает активацию РНКазы Н (например, за счет количества или положения не-ДНК нуклеозидов).
В некоторых вариантах реализации гэпы содержат участок немодифицированного 2'-дезоксинуклеозида, прерванный одним или более модифицированными нуклеозидами, что приводит к образованию трех субрайонов (двух участков одного или более 2'-дезоксинуклеозидов и участка одного или более прерывающих модифицированных нуклеозидов). В некоторых вариантах реализации ни один участок немодифицированных 2'-дезоксинуклеозидов не длиннее 5, 6 или 7 нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации такие короткие участки образуются за счет использования коротких гэп-областей. В некоторых вариантах реализации короткие участки образуются за счет прерывания более длинной области гэп.
В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один или более модифицированных нуклеозидов, выбранных из cEt, FHNA, LNA и 2-тиотимидина. В некоторых вариантах реализации гэп содержит один модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации гэп содержит 5'-замещенный сахарный фрагмент, выбранный из 5'-Me и 5'-(R)-Ме. В некоторых вариантах реализации гэп содержит два модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации гэп содержит три модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации гэп содержит четыре модифицированных нуклеозида. В некоторых вариантах реализации гэп содержит два или более модифицированных нуклеозидов, и каждый модифицированный нуклеозид является таким же. В некоторых вариантах реализации гэп содержит два или более модифицированных нуклеозидов, и каждый модифицированный нуклеозид является другим.
В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну или более модифицированных связей. В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну или более метилфосфонатных связей. В некоторых вариантах реализации гэп содержит две или более модифицированных связей. В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну или более модифицированных связей и один или более модифицированных нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации гэп содержит одну модифицированную связь и один модифицированный нуклеозид. В некоторых вариантах реализации гэп содержит две модифицированных связи и два или более модифицированных нуклеозидов.
b. Некоторые мотивы межнуклеозидных связей
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат модифицированные межнуклеозидные связи, расположенные вдоль олигонуклеотида или его области определенным образом или в виде мотива модифицированной межнуклеозидной связи. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат область, имеющую мотив чередующихся межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды по настоящему описанию содержат область одинаково модифицированных межнуклеозидных связей. В некоторых таких вариантах реализации олигонуклеотид содержит область, которая равномерно связана тиофосфатными межнуклеозидными связями. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид равномерно связан тиофосфатными
межнулеозидными связями. В некоторых вариантах реализации каждая межнуклеозидная связь олигонуклеотида выбран из фосфодиэфира и тиофосфата. В некоторых вариантах реализации каждая межнуклеозидная связь олигонуклеотида выбран из фосфодиэфира и тиофосфата, и по меньшей мере одна межнуклеозидная связь представляет собой тиофосфат.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 6 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 7 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 8 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 9 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 10 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит по меньшей мере один блок по меньшей мере из 12 последовательных тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых таких вариантах реализации по меньшей мере один такой блок расположен у 3'-конца олигонуклеотида. В
некоторых таких вариантах реализации по меньшей мере один такой блок расположен в пределах 3 нуклеозидов 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 15 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 14 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 13 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 12 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 11 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 10 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 9 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 8 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 7 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 6 тиофосфатных межнуклеозидных связей. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотид содержит менее 5 тиофосфатных межнуклеозидных связей.
с. Некоторые мотивы модификаций нуклеооснований
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат химические модификации нуклеооснований, расположенные вдоль олигонуклеотида или его области определенным образом или в виде мотива модификации нуклеооснований. В некоторых таких вариантах реализации модификации нуклеооснований расположены в разорванном мотиве. В некоторых вариантах реализации модификации нуклеооснований расположены в чередующемся мотиве. В некоторых вариантах реализации каждое нуклеооснование является модифицированным. В некоторых вариантах реализации ни одно из нуклеооснований не является химически модифицированным.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат блок модифицированных нуклеооснований. В некоторых таких вариантах реализации блок находится у 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации блок находится в пределах 3 нуклеотидов 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых таких вариантах реализации
блок находится у 5'-конца олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации блок находится в пределах 3 нуклеотидов 5'-конца олигонуклеотида.
В некоторых вариантах реализации модификации нуклеооснований зависят от природного основания в конкретном положении олигонуклеотида. Например, в некоторых вариантах реализации каждый пурин или каждый пиримидин в олигонуклеотиде является модифицированным. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый аденин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый гуанин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый тимин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый цитозин. В некоторых вариантах реализации модифицированным является каждый урацил.
В некоторых вариантах реализации некоторые, все или никакие из цитозиновых фрагментов в олигонуклеотиде не представляют собой 5-метилцитозиновые фрагменты. В настоящем документе 5-метилцитозин не является «модифицированным нуклеооснованием». Соответственно, если не указано иное, то немодифицированные нуклеооснования включают как цитозиновые остатки, содержащие 5-метил, так и те, которые не содержат 5-метил. В некоторых вариантах реализации оговорено состояние метилирования всех или некоторых цитозиновых нуклеооснований.
В некоторых вариантах реализации химические модификации нуклеооснований включают присоединение некоторых групп конъюгата к нуклеооснованиям. В некоторых вариантах реализации каждый пурин или каждый пиримидин в олигонуклеотиде может быть необязательно модифицирован так, чтобы он содержал группу конъюгата.
d. Некоторые общие длины
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены олигонуклеотиды любого из различных диапазонов длин. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат от X до Y связанных нуклеозидов, где X представляет собой наименьшее количество нуклеозидов в диапазоне, a Y представляет собой наибольшее количество нуклеозидов в диапазоне. В некоторых таких вариантах реализации каждый X и Y независимо выбран из 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49 и 50; при
условии, что X≤Y. Например, в некоторых вариантах реализации олигонуклеотид может состоять из 8-9, 8-10, 8-11, 8-12, 8-13, 8-14, 8-15, 8-16, 8-17, 8-18, 8-19, 8-20, 8-21, 8-22, 8-23, 8-24, 8-25, 8-26, 8-27, 8-28, 8-29, 8-30, 9-10, 9-11, 9-12, 9-13, 9-14, 9-15, 9-16, 9-17, 9-18, 9-19, 9-20, 9-21, 9-22, 9-23, 9-24, 9-25, 9-26, 9-27, 9-28, 9-29, 9-30, 10-11, 10-12, 10-13, 10-14, 10-15, 10-16, 10-17, 10-18, 10-19, 10-20, 10-21, 10-22, 10-23, 10-24, 10-25, 10-26, 10-27, 10-28, 10-29, 10-30, 11-12, 11-13, 11-14, 11-15, 11-16, 11-17, 11-18, 11-19, 11-20, 11-21, 11-22, 11-23, 11-24, 11-25, 11-26, 11-27, 11-28, 11-29, 11-30, 12-13, 12-14, 12-15, 12-16, 12-17, 12-18, 12-19, 12-20, 12-21, 12-22, 12-23, 12-24, 12-25, 12-26, 12-27, 12-28, 12-29, 12-30, 13-14, 13-15, 13-15, 13-17, 13-18, 13-19, 13-20, 13-21, 13-22, 13-23, 13-24, 13-25, 13-26, 13-27, 13-28, 13-29, 13-30, 14-15, 14-16, 14-17, 14-18, 14-19, 14-20, 14-21, 14-22, 14-23, 14-24, 14-25, 14-26, 14-27, 14-28, 14-29, 14-30, 15-16, 15-17, 15-18, 15-19, 15-20, 15-21, 15-22, 15-23, 15-24, 15-25, 15-26, 15-27, 15-28, 15-29, 15-30, 16-17, 16-18, 16-19, 16-20, 16-21, 16-22, 16-23, 16-24, 16-25, 16-26, 16-27, 15-28, 16-29, 16-30, 17-18, 17-19, 17-20, 17-21, 17-22, 17-23, 17-24, 17-25, 17-26, 17-27, 17-28, 17-29, 17-30, 18-19, 18-20, 18-21, 18-22, 18-23, 18-24, 18-25, 18-26, 18-27, 18-28, 18-29, 18-30, 19-20, 19-21, 19-22, 19-23, 19-24, 19-25, 19-26, 19-29, 19-28, 19-29, 19-30, 20-21, 20-22, 20-23, 20-24, 20-25, 20-26, 20-27, 20-28, 20-29, 20-30, 21-22, 21-23, 21-24, 21-25, 21-26, 21-27, 21-28, 21-29, 21-30, 22-23, 22-24, 22-25, 22-26, 22-27, 22-28, 22-29, 22-30, 23-24, 23-25, 23-26, 23-27, 23-28, 23-29, 23-30, 24-25, 24-26, 24-27, 24-28, 24-29, 24-30, 25-26, 25-27, 25-28, 25-29, 25-30, 26-27, 26-28, 26-29, 26-30, 27-28, 27-29, 27-30, 28-29, 28-30 или 29-30 связанных нуклеозидов. В тех вариантах реализации, в которых количество нуклеозидов в олигонуклеотиде соединения является ограниченным, либо до диапазона, либо до определенного числа, то соединение может, тем не менее, дополнительно содержать другие дополнительные заместители. Например, олигонуклеотид, содержащий 8-30 нуклеозидов, исключает олигонуклеотиды, имеющие 31 нуклеозид, но, если не указано иное, такой олигонуклеотид может дополнительно содержать, например, одну или более групп конъюгата, концевых групп или других заместителей.
Более того, если олигонуклеотид описан общим диапазоном длины и областями, имеющими определенную длину, и если сумма указанных длин областей меньше, чем верхняя граница диапазона общей длины, то олигонуклеотид может иметь дополнительные нуклеозиды, помимо тех, которые находятся в указанных областях, при условии, что общее количество нуклеозидов не превышает верхнюю границу диапазона общей длины.
5. Некоторые химические мотивы антисмысловых олигонуклеотидов
В некоторых вариантах реализации химические структурные особенности антисмысловых олигонуклеотидов описываются их сахарным мотивом, мотивом межнуклеозидной связи, мотивом модификации нуклеооснования и общей длиной. В некоторых вариантах реализации такие параметры не зависят друг от друга. Так, каждая межнуклеозидная связь олигонуклеотида, имеющий сахарный мотив гэпмера, может быть модифицированным или немодифицированным и может повторять или не повторять характер модификации сахарных модификаций гэпмера. Следовательно, межнуклеозидные связи в областях крыльев сахара-гэпмера могут быть одинаковыми или отличными друг от друга и могут быть одинаковыми или отличными от межнуклеозидных связей области гэп. Точно так же, такие сахар-гэпмерные олигонуклеотиды могут содержать одно или более модифицированных нуклеооснований, независимо от характера сахарных модификаций гэпмера. Специалистам в данной области техники понятно, что такие мотивы могут быть комбинированы с получением множества олигонуклеотидов.
В некоторых вариантах реализации выбор межнуклеозидной связи и модификации нуклеозида не зависят друг от друга.
i. Некоторые последовательности и мишени
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены антисмысловые олигонуклеотиды, имеющие последовательность, комплементарную целевой нуклеиновой кислоте. Такие антисмысловые соединения могут гибридизоваться с целевой нуклеиновой кислотой с получением по меньшей мере одной антисмысловой активности. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения специфически гибридизуются с одной или более целевыми нуклеиновыми кислотами. В некоторых вариантах реализации специфически гибридизующееся антисмысловое соединение имеет последовательность нуклеооснований, содержащую область с достаточной комплементарностью с целевой нуклеиновой кислотой для обеспечения возможности гибридизации и получению антисмысловой активности, и недостаточной комплементарностью к любой нецелевой нуклеиновой кислоте для предотвращения или снижения неспецифической гибридизации с последовательностями нецелевых нуклеиновых кислот в условиях, в которых необходима
специфическая гибридизация (например, в физиологических условиях для in vivo или терапевтических применений и в условиях выполнения анализов - в случае in vitro анализов). В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды являются селективными между мишенью и не мишенью, даже если мишень и не мишень содержат целевую последовательность. В таких вариантах реализации селективность может быть результатом относительной доступности целевой области одной молекулы нуклеиновой кислоты, по сравнению с другой.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены антисмысловые соединения, содержащие олигонуклеотиды, которые полностью комплементарны целевой нуклеиновой кислоте по всей длине олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды на 99% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды на 95% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации такие олигонуклеотиды на 90% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте.
В некоторых вариантах реализации такие олигонуклеотиды на 85% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации такие олигонуклеотиды на 80% комплементарны целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации антисмысловое соединение содержит область, которая полностью комплементарна целевой нуклеиновой кислоте, и по меньшей мере на 80% комплементарно целевой нуклеиновой кислоте по всей длине олигонуклеотида. В некоторых таких вариантах реализации область полной комплементарности имеет от 6 до 14 нуклеозидов в длину.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды содержат область гибридизации и концевую область. В некоторых таких вариантах реализации область гибридизации состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и полностью комплементарна целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации область гибридизации содержит одно несоответствие в сравнении с целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации область гибридизации содержит два несоответствия в сравнении с целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации область гибридизации содержит три несоответствия в сравнении с целевой нуклеиновой кислотой. В некоторых вариантах реализации концевая область состоит из 1-4 концевых нуклеозидов. В некоторых вариантах реализации концевые
нуклеозиды находятся у 3'-конца. В некоторых вариантах реализации один или более концевых нуклеозидов не комплементарны целевой нуклеиновой кислоте.
Антисмысловые механизмы включают любой механизм, затрагивающий гибридизацию олигонуклеотида с целевой нуклеиновой кислотой, при этом гибридизация приводит к биологическому эффекту. В некоторых вариантах реализации такая гибридизация приводит либо к разрушению, либо к применению целевой нуклеиновой кислоты с сопутствующим подавлением или стимулированием клеточного механизма, затрагивающего, например, трансляцию, транскрипцию или сплайсинг целевой нуклеиновой кислоты.
Один из типов антисмыслового механизма, затрагивающий разрушение целевой РНК представляет собой антисмысл, опосредованный РНКазой H. РНКаза H представляет собой клеточную эндонуклеазу, которая расщепляет спираль РНК дуплекса РНК:ДНК. В данной области техники известно, что односпиральные антисмысловые соединения, которые являются «ДНК-подобными», вызывают активность РНКазы H в клетках млекопитающих. Следовательно, активация РНКазы H приводит к расщеплению РНК-мишени, посредством этого в значительной степени усиливая эффективность подавления генной экспрессии, опосредованного ДНК-подобным олигонуклеотидом.
В некоторых вариантах реализации группа конъюгата содержит расщепляемый фрагмент. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата содержит линкер. В некоторых вариантах реализации линкер содержит белковый связывающий фрагмент. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата содержит фрагмент, направляющий на клетку (упоминаемый также как группа, направляющая на клетку). В некоторых вариантах реализации фрагмент, направляющий на клетку, содержит группу ветвления. В некоторых вариантах реализации фрагмент, направляющий на клетку, содержит одну или более связок. В некоторых вариантах реализации фрагмент, направляющий на клетку, содержит углевод или углеводный кластер.
ii. Некоторые расщепляемые фрагменты
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемую связь. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент содержит
расщепляемую связь. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата содержит расщепляемый фрагмент. В некоторых таких вариантах реализации расщепляемым фрагмент присоединяется к антисмысловому олигонуклеотиду. В некоторых таких вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединяется непосредственно к фрагменту, направляющему на клетку. В некоторых таких вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединяется к линкеру конъюгата. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент содержит фосфат или фосфодиэфир. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой расщепляемый нуклеозид или нуклеозидный аналог. В некоторых вариантах реализации нуклеозид или нуклеозидный аналог содержит необязательно защищенное гетероциклическое основание, выбранное из пурина, замещенного пурина, пиримидина или замещенного пиримидина. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой нуклеозид, содержащий необязательно защищенное гетероциклическое основание, выбранное из урацила, тимина, цитозина, 4-N-бензоилцитозина, 5-метилцитозина, 4-N-бензоил-5-метилцитозина, аденина, 6-N-бензоиладенина, гуанина и 2-N-изобутирилгуанина. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой 2'-дезоксинуклеозид, который присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида фосфодиэфирной связью и присоединен к линкеру фосфодиэфирной или тиофосфатной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой 2'-дезоксиаденозин, который присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида фосфодиэфирной связью и присоединен к линкеру фосфодиэфирной или тиофосфатной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент представляет собой 2'-дезоксиаденозин, который присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида фосфодиэфирной связью и присоединен к линкеру фосфодиэфирной связью.
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к 3'-положению антисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к 5'-положению антисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к 2'-положению антисмыслового олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к антисмысловому олигонуклеотиду фосфодиэфирной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к указанному
линкеру либо фосфодиэфирной, либо тиофосфатной связью. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент присоединен к указанному линкеру фосфодиэфирной связью. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата не содержит расщепляемый фрагмент.
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент расщепляется после введения указанного комплекса в организм животного только после его поглощения целевой клеткой. Внутри клетки расщепляемый фрагмент расщепляется, высвобождая таким образом активный антисмысловый олигонуклеотид. Не ограничиваясь теорией, предполагается, что расщепляемый фрагмент расщепляется под действием одной или более нуклеаз внутри клетки. В некоторых вариантах реализации одна или более нуклеаз расщепляют фосфодиэфирную связь между расщепляемым фрагментом и линкером. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент имеет структуру, выбранную из следующих:
где каждый из Вх, Bx1, Вх2 и Вх3 независимо представляет собой гетероциклический основной фрагмент. В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент имеет структуру, выбранную из следующих:
iii. Некоторые линкеры
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат линкер. В некоторых таких вариантах реализации линкер ковалентно связан с расщепляемым фрагментом. В некоторых таких вариантах реализации линкер ковалентно связан с антисмысловым олигонуклеотидом. В некоторых вариантах реализации линкер ковалентно связан с фрагментом, направляющим на клетку. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит ковалентное присоединение к твердой подложке. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит ковалентное присоединение к белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит ковалентное присоединение к твердой подложке и дополнительно содержит ковалентное присоединение к белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линкер содержит несколько положений для присоединения связанных лигандов. В некоторых вариантах реализации линкер содержит несколько положений для присоединения связанных лигандов и не присоединен к группе ветвления. В некоторых вариантах реализации линкер дополнительно содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата не содержит линкер.
В некоторых вариантах реализации линкер содержит по меньшей мере одну линейную группу, содержащую группы, выбранные из алкильных, амидных, дисульфидных, полиэтиленгликолевых, тиоэфирных (-S-) и гидроксиламино (-O-N(H)-) групп. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит группы, выбранные из алкильных, амидных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит группы, выбранные из алкильных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах
реализации линейная группа содержит по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит по меньшей мере одну фосфодиэфирную группу. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит по меньшей мере одну нейтральную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, направляющему на клетку, и к расщепляемому фрагменту. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, направляющему на клетку, и к антисмысловому олигонуклеотиду. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, направляющему на клетку, к расщепляемому фрагменту и к твердой подложке. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к фрагменту, направляющему на клетку, к расщепляемому фрагменту, к твердой подложке и к белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линейная группа содержит одну или более расщепляемых связей.
В некоторых вариантах реализации линкер содержит линейную группу, ковалентно присоединенную к группе скелета. В некоторых вариантах реализации скелет содержит разветвленную алифатическую группу, которая содержит группы, выбранные из алкильных, амидных, дисульфидных, полиэтиленгликолевых, простых эфирных, тиоэфирных и гидроксиламино-групп. В некоторых вариантах реализации скелет содержит разветвленную алифатическую группу, которая содержит группы, выбранные из алкильных, амидных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации скелет содержит по меньшей мере одну моно- или полициклическую кольцевую систему. В некоторых вариантах реализации скелет содержит по меньшей мере две моно- или полициклические кольцевые системы. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту и линкеру. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту, линкеру и твердой подложке. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту, линкеру и белковому связывающему фрагменту. В некоторых вариантах реализации линейная группа ковалентно присоединена к группе скелета, а группа скелета ковалентно присоединена к расщепляемому фрагменту, линкеру, белковому
связывающему фрагменту и твердой подложке. В некоторых вариантах реализации группа скелета содержит одну или более расщепляемых связей.
В некоторых вариантах реализации линкер содержит белковый связывающий фрагмент. В некоторых вариантах реализации белковый связывающий фрагмент представляет собой липид, такой как, например, включая, но не ограничиваясь ими, холестерин, холевая кислота, адамантан-уксусная кислота, 1-пирен-масляная кислота, дигидротестостерон, 1,3-бис-O(гексадецил)глицерин, геранилоксигексиловая группа, гексадецилглицерин, борнеол, ментол, 1,3-пропандиол, гептадециловая группа, пальмитиновая кислота, миристиновая кислота, O3-(олеоил)литохолевая кислота, O3-(олеоил)холеновая кислота, диметокситритил или феноксазин, витамин (например, фолат, витамин А, витамин Е, биотин, пиридоксаль), пептид, углевод (например, моносахарид, дисахарид, трисахарид, тетрасахарид, олигосахарид, полисахарид), эндосомолитический компонент, стероид (например, уваол, гецигенин, диосгенин), терпен (например, тритерпен, например, сарсасапогенин, фриделин, литохолевая кислота, дериватизованная эпифриделанолом) или катионный липид. В некоторых вариантах реализации белковый связывающий фрагмент представляет собой насыщенную или ненасыщенную жирную кислоту с длиной цепи от C16 до C22, холестерин, холевую кислоту, витамин Е, адамантан или 1-пентафторпропил.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и p равен от 1 до 6.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
где каждый L независимо представляет собой фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
где n равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер конъюгата имеет структуру:
В некоторых вариантах реализации линкер конъюгата имеет структуру:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации линкер имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6 или 7.
iv. Некоторые фрагменты, направляющие на клетку
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат фрагменты, направляющие на клетку. Некоторые такие фрагменты, направляющие на клетку, увеличивают клеточный захват антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации фрагменты, направляющие на клетку, содержат группу ветвления, одну или более связок и один или более лигандов. В некоторых вариантах реализации фрагменты, направляющие на клетку, содержат группу ветвления, одну или более связок, один или более лигандов и одну или более расщепляемых связей.
1. Некоторые группы ветвления
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат направляющий фрагмент, содержащий группу ветвления и по меньшей мере два связанных лиганда. В
некоторых вариантах реализации группа ветвления присоединяет линкер конъюгата. В некоторых вариантах реализации группа ветвления присоединяет расщепляемый фрагмент. В некоторых вариантах реализации группа ветвления присоединяет антисмысловый олигонуклеотид. В некоторых вариантах реализации группа ветвления ковалентно присоединена к линкеру и каждому из связанных лигандов. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит разветвленную алифатическую группу, которая содержит группы, выбранные из алкильных, амидных, дисульфидных, полиэтиленгликолевых, простых эфирных, тиоэфирных и гидроксиламино-групп. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит группы, выбранные из алкильных, амидных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит группы, выбранные из алкильных и простых эфирных групп. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит моно- или полициклическую кольцевую систему. В некоторых вариантах реализации группа ветвления содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации группа конъюгата не содержит группу ветвления.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
j равен от 1 до 3; и
m равен от 2 до 6.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
m равен от 2 до 6.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
где каждый A1 независимо представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
где A1 представляет собой O, S, C=O или NH; и
каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации группа ветвления имеет структуру, выбранную из:
2. Некоторые связки
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат одну или более связок, ковалентно присоединенных к группе ветвления. В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат одну или более связок, ковалентно присоединенных к связывающей группе. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, простых эфирных, тиоэфирных, дисульфидных, амидных и полиэтиленгликолевых групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, замещенных алкильных, простых эфирных, тиоэфирных, дисульфидных, амидных, фосфодиэфирных и полиэтиленгликолевых групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, простых эфирных и амидных групп в любой комбинации. В некоторых вариантах
реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкильных, замещенных алкильных, фосфодиэфирных, простых эфирных и амидных групп в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка представляет собой линейную алифатическую группу, содержащую одну или более групп, выбранных из алкила и фосфодиэфира в любой комбинации. В некоторых вариантах реализации каждая связка содержит по меньшей мере одну фосфорную связывающую группу или нейтральную связывающую группу.
В некоторых вариантах реализации связка содержит одну или более расщепляемых связей. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через амидную или простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через фосфордиэфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через фосфорную связывающую группу или через нейтральную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к группе ветвления через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду либо через амидную, либо через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду либо через амидную, либо через простую эфирную группу. В некоторых вариантах реализации связка присоединена к лиганду через простую эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации каждая связка имеет длину от около 8 до около 20 атомов в цепи между лигандом и группой ветвления. В некоторых вариантах реализации каждая связка имеет длину от около 10 до около 18 атомов в цепи между лигандом и группой ветвления. В некоторых вариантах реализации каждая связка имеет длину около 13 атомов в цепи.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20; и
каждый p равен от 1 до около 6.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
где L представляет собой либо фосфорную связывающую группу, либо нейтральную связывающую группу;
Z1 представляет собой C(=O)O-R2;
Z2 представляет собой H, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил;
R2 представляет собой H, C1-C6 алкил или замещенный C1-C6 алкил; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
где Z2 представляет собой H или CH3; и
каждый m1 независимо равен от 0 до 20, при этом по меньшей мере один m1 больше 0 для каждой связки.
В некоторых вариантах реализации связка имеет структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах реализации связка содержит фосфорную связывающую группу. В некоторых вариантах реализации связка не содержит ни одной амидной связи. В некоторых вариантах реализации связка содержит фосфорную связывающую группу и не содержит ни одной амидной связи.
3. Некоторые лиганды
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены лиганды, при этом каждый лиганд ковалентно присоединен к связке. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд выбран так, чтобы он обладал аффинностью по меньшей мере к одному типу рецептора на клетке-мишени. В некоторых вариантах реализации лиганды выбраны так, чтобы они обладали аффинностью по меньшей мере к одному типу рецептора на поверхности клетки печени млекопитающего. В некоторых вариантах реализации лиганды выбраны так, чтобы они обладали аффинностью к печеночному асиалогликопрогеиновому рецептору (ASGP-R). В некоторых вариантах реализации каждый лиганд представляет собой углевод. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд независимо выбран из галактозы, N-ацетилгалактозамина, маннозы, глюкозы, глюкозамина и фукозы. В некоторых вариантах реализации каждый лиганд представляет собой N-ацетилгалактозамин (GalNAc). В некоторых вариантах реализации направляющий фрагмент содержит 2-6 лигандов. В некоторых вариантах реализации направляющий фрагмент содержит 3 лиганда. В некоторых вариантах реализации направляющий фрагмент содержит 3 N-ацетилгалактозаминовых лиганда.
В некоторых вариантах реализации лиганд представляет собой углевод, углеводное производное, модифицированный углевод, поливалентный углеводный кластер, полисахарид, модифицированный полисахарид или полисахаридное производное. В некоторых вариантах реализации лиганд представляет собой аминосахар или тиосахар. Например, аминосахара могут быть выбраны из любого количества соединений, известных в данной области техники, например, глюкозамина, сиаловой кислоты, α-D-галактозамина, N-ацетилгалактозамина, 2-ацетамидо-2-дезокси-D-галактопиранозы (GalNAc), 2-амино-3-O-[(R)-1-карбоксиэтил]-2-дезокси-β-D-глюкопиранозы (β-мурамовой кислоты), 2-дезокси-2-метиламино-L-глюкопиранозы, 4,6-дидезокси-4-формамидо-2,3-ди-O-метил-D-маннопиранозы, 2-дезокси-2-сульфоамино-D-глюкопиранозы и N-сульфо-D-глюкозамина, и N-гликолоил-α-нейраминовой
кислоты. Например, тиосахара могут быть выбраны из группы, состоящей из 5-тио-β-D-глюкопиранозы, метил 2,3,4-три-O-ацетил-1-тио-6-O-тритил-α-D-глюкопиранозида, 4-тио-β-D-галактопиранозы и этил 3,4,6,7-тетра-O-ацетил-2-дезокси-1,5-дитио-α-D-глюко-гептопиранозида.
В некоторых вариантах реализации «GalNac» или «Gal-NAc» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе, обычно упоминаемой в литературе как N-ацетилгалактозамин. В некоторых вариантах реализации «N-ацетилгалактозамин» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе. В некоторых вариантах реализации «GalNac» или «Gal-NAc» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе. В некоторых вариантах реализации «GalNac» или «Gal-NAc» относится к 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозе, которая включает и β-форму: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-β-D-галактопиранозу, и α-форму: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозу. В некоторых вариантах реализации обе формы, β-форма: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-β-D-галактопираноза, и α-форма: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопираноза, могут быть использованы взаимозаменяемо. Соответственно, в структурах, в которых изображена одна форма, подразумевается, что эти структуры включают также и другую форму. Например, если показана структура для α-формы: 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозы, то подразумевается, что эта структура включает также и другую форму. В некоторых предпочтительных вариантах реализации β-форма 2-(ацетиламино)-2-дезокси-D-галактопиранозы является предпочтительным вариантом реализации.
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
где каждый R1 выбран из OH и NHCOOH.
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
В некоторых вариантах один или более лигандов имеют структуру, выбранную из:
i. Некоторые конъюгаты
В некоторых вариантах реализации группы конъюгата содержат структурные особенности, представленные выше. В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20.
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
где каждый n независимо равен от 1 до 20;
Z представляет собой H или связанную твердую подложку;
Q представляет собой антисмысловое соединение;
X представляет собой O или S; и
Вх представляет собой гетероциклический основной фрагмент.
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых вариантах реализации конъюгаты не содержат пирролидин.
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых таких вариантах реализации группы конъюгата имеют следующую структуру:
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из шести-одиннадцати последовательно связанных атомов.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из десяти последовательно связанных атомов.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-одиннадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка содержит только одну амидную связь.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где Y и Z независимо выбраны из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной, алкенильной или алкинильной группы или группы, содержащей эфир, кетон, амид, сложным эфир, карбамат, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир, тиофосфат, триазол, пирролидин, дисульфид или тиоэфир.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где Y и Z независимо выбраны из С1-С12 замещенной или незамещенной алкильной группы или группы, содержащей только один эфир или только два эфира, амид, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир или тиофосфат.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где Y и Z независимо выбраны из С1-С12 замещенной или незамещенной алкильной группы.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где m и n независимо выбраны из 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 и 12.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где m равен 4, 5, 6, 7 или 8, и n равен 1, 2, 3 или 4.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом X не содержит эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из восьми последовательно связанных атомов, и при этом X не содержит эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка содержит только одну амидную связь, а X не содержит эфирную группу.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где X представляет собой замещенную или незамещенную связку из четырех-тринадцати последовательно связанных атомов, и при этом указанная связка состоит из амидной связи и замещенной или незамещенной С2-С11 алкильной группы.
В некоторых вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где Y выбран из C1-C12 замещенной или незамещенной алкильной, алкенильной или алкинильной группы или группы, содержащей эфир, кетон, амид, сложный эфир, карбамат, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир, тиофосфат, триазол, пирролидин, дисульфид или тиоэфир.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где Y выбран из С1-С12 замещенной или незамещенной алкильной группы или группы, содержащей эфир, амин, пиперидин, фосфат, фосфодиэфир или тиофосфат.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где Y выбран из С1-С12 замещенной или незамещенной алкильной группы.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где n равен 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 или 12.
В некоторых таких вариантах реализации фрагмент группы конъюгата, направляющий на клетку, имеет следующую структуру:
где n равен 4, 5, 6, 7 или 8.
b. Некоторые сопряженные антисмысловые соединения
В некоторых вариантах реализации конъюгаты связаны с нуклеозидом антисмыслового олигонуклеотида в 2', 3' или 5' положении нуклеозида. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
С представляет собой линкер конъюгата
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых таких вариантах реализации линкер конъюгата содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых таких вариантах реализации группа ветвления содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации каждая связка содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации конъюгаты связаны с нуклеозидом антисмыслового олигонуклеотида в 2', 3' или 5' положении нуклеозида.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
С представляет собой линкер конъюгата
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации конъюгаты связаны с нуклеозидом антисмыслового олигонуклеотида в 2', 3' или 5' положении нуклеозида. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
С представляет собой линкер конъюгата
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
В представляет собой расщепляемый фрагмент
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
где
А представляет собой антисмысловый олигонуклеотид;
D представляет собой группу ветвления
каждый Е представляет собой связку;
каждый F представляет собой лиганд; и
q представляет собой целое число от 1 до 5.
В некоторых таких вариантах реализации линкер конъюгата содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации каждая связка содержит по меньшей мере одну расщепляемую связь.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет структуру, выбранную из следующих:
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет структуру, выбранную из следующих:
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет структуру, выбранную из следующих:
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение имеет следующую структуру:
Иллюстративные патенты Соединенных штатов Америки, публикации патентных заявок Соединенных штатов Америки и публикации международных патентных заявок, в которых описано получение некоторых из указанных выше конъюгатов, сопряженных антисмысловых соединений, связок, линкеров, групп ветвления, лигандов, расщепляемых фрагментов, а также других модификаций, включают, без ограничения, US 5994517, US 6300319, US 6660720, US 6906182, US 7262177, US 7491805, US 8106022, US 7723509, US
2006/0148740, US 2011/0123520, WO 2013/033230 и WO 2012/037254, каждая из которых включена в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
Иллюстративные публикации, в которых описано получение некоторых из указанных выше конъюгатов, сопряженных антисмысловых соединений, связок, линкеров, групп ветвления, лигандов, расщепляемых фрагментов, а также других модификаций, включают, без ограничения, BIESSEN et al., "The Cholesterol Derivative of a Triantennary Galactoside with High Affinity for the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor: a Potent Cholesterol Lowering Agent" J. Med. Chem. (1995) 38:1846-1852, BIESSEN et al., "Synthesis of Cluster Galactosides with High Affinity for the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor" J. Med. Chem. (1995) 38:1538-1546, LEE et al., "New and more efficient multivalent glyco-ligands for asialoglycoprotein receptor of mammalian hepatocytes" Bioorganic & Medicinal Chemistry (2011) 19: 2494-2500, RENSEN et al., "Determination of the Upper Size Limit for Uptake and Processing of Ligands by the Asialoglycoprotein Receptor on Hepatocytes in Vitro and in Vivo" J. Biol. Chem. (2001) 276(40): 37577-37584, RENSEN et al., "Design and Synthesis of Novel N-Acetylgalactosamine-Terminated Glycolipids for Targeting of Lipoproteins to the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor" J. Med. Chem. (2004) 47: 5798-5808, SLIEDREGT et al., "Design and Synthesis of Novel Amphiphilic Dendritic Galactosides for Selective Targeting of Liposomes to the Hepatic Asialoglycoprotein Receptor" J. Med. Chem. (1999) 42: 609-618 и Valentijn et al., "Solid-phase synthesis of lysine-based cluster galactosides with high affinity for the Asialoglycoprotein Receptor" Tetrahedron, 1997, 53(2), 759-770, каждая из которых включена в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения содержат олигонуклеотид на основе РНКазы Н (такой как гэпмер) или сплайс-модулирующий олигонуклеотид (такой как полностью модифицированный олигонуклеотид) и любую группу конъюгата, содержащую по меньшей мере одну, две или три группы GalNAc. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение содержит любую группу конъюгата, представленную в следующих ссылках: Lee, Carbohydr Res, 1978, 67, 509-514; Connolly et al., J Biol Chem, 1982, 257, 939-945; Pavia et al., Int J Pep Protein Res, 1983, 22, 539-548; Lee et al., Biochem, 1984, 23, 4255-4261; Lee et al., Glycoconjugate J, 1987, 4, 317-328; Toyokuni et al., Tetrahedron Lett, 1990, 31, 2673-2676;
Biessen et al., J Med Chem, 1995, 38, 1538-1546; Valentijn et al., Tetrahedron, 1997, 53, 759-770; Kim et al., Tetrahedron Lett, 1997, 38, 3487-3490; Lee et al., Bioconjug Chem, 1997, 8, 762-765; Kato et al., Glycobiol, 2001, 11, 821-829; Rensen et al., J Biol Chem, 2001, 276, 37577-37584; Lee et al., Methods Enzymol, 2003, 362, 38-43; Westerlind et al., Glycoconj J, 2004, 21, 227-241; Lee et al., Bioorg Med Chem Lett, 2006, 16(19), 5132-5135; Maierhofer et al., Bioorg Med Chem, 2007, 15, 7661-7676; Khorev et al., Bioorg Med Chem, 2008, 16, 5216-5231; Lee et al., Bioorg Med Chem, 2011, 19, 2494-2500; Kornilova et al., Analyt Biochem, 2012, 425, 43-46; Pujol et al., Angew Chemie Int Ed Engl, 2012, 51, 7445-7448; Biessen et al., J Med Chem, 1995, 38, 1846-1852; Sliedregt et al., J Med Chem, 1999, 42, 609-618; Rensen et al., J Med Chem, 2004, 47, 5798-5808; Rensen et al., Arterioscler Thromb Vasc Biol, 2006, 26, 169-175; van Rossenberg et al., Gene Ther, 2004, 11, 457-464; Sato et al., J Am Chem Soc, 2004, 126, 14013-14022; Lee et al., J Org Chem, 2012, 77, 7564-7571; Biessen et al., FASEB J, 2000, 14, 1784-1792; Rajur et al., Bioconjug Chem, 1997, 8, 935-940; Duff et al., Methods Enzymol, 2000, 313, 297-321; Maier et al., Bioconjug Chem, 2003, 14, 18-29; Jayaprakash et al., Org Lett, 2010, 12, 5410-5413; Manoharan, Antisense Nucleic Acid Drug Dev, 2002, 12, 103-128; Merwin et al., Bioconjug Chem, 1994, 5, 612-620; Tomiya et al., Bioorg Med Chem, 2013, 21, 5275-5281; Международные заявки WO 1998/013381; WO 2011/038356; WO 1997/046098; WO 2008/098788; WO 2004/101619; WO 2012/037254; WO 2011/120053; WO 2011/100131; WO 2011/163121; WO 2012/177947; WO 2013/033230; WO 2013/075035; WO 2012/083185; WO 2012/083046; WO 2009/082607; WO 2009/134487; WO 2010/144740; WO 2010/148013; WO 1997/020563; WO 2010/088537; WO 2002/043771; WO 2010/129709; WO 2012/068187; WO 2009/126933; WO 2004/024757; WO 2010/054406; WO 2012/089352; WO 2012/089602; WO 2013/166121; WO 2013/165816; патенты США 4751219; 8552163; 6908903; 7262177; 5994517; 6300319; 8106022; 7491805; 7491805; 7582744; 8137695; 6383812; 6525031; 6660720; 7723509; 8541548; 8344125; 8313772; 8349308; 8450467; 8501930; 8158601; 7262177; 6906182; 6620916; 8435491; 8404862; 7851615; опубликованные заявки на патент США US 2011/0097264; US 2011/0097265; US 2013/0004427; US 2005/0164235; US 2006/0148740; US 2008/0281044; US 2010/0240730; US 2003/0119724; US 2006/0183886; US 2008/0206869; US 2011/0269814; US 2009/0286973; US 2011/0207799; US 2012/0136042; US 2012/0165393; US 2008/0281041; US 2009/0203135; US 2012/0035115; US 2012/0095075; US 2012/0101148; US 2012/0128760; US 2012/0157509; US 2012/0230938; US 2013/0109817; US 2013/0121954; US 2013/0178512; US 2013/0236968; US 2011/0123520; US 2003/0077829;
US 2008/0108801; и US 2009/0203132; каждая из которых включена посредством ссылки в полном объеме.
С. Некоторые применения и особенности
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения демонстрируют эффективное снижение целевой РНК in vivo. В некоторых вариантах реализации несопряженные антисмысловые соединения накапливаются в почках. В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения накапливаются в печени. В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения являются хорошо переносимыми. Такие свойства делают сопряженные антисмысловые соединения особенно пригодными для ингибирования многих целевых РНК, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые участвуют в метаболических, сердечно-сосудистых и других заболеваниях, расстройства или состояниях. Таким образом, в настоящем документе представлены способы лечения таких заболеваний, расстройств или состояний приведением тканей печени в контакт с сопряженными антисмысловыми соединениями, направленными на РНК, связанные с такими заболеваниями, расстройствами или состояниями. Следовательно, представлены также способы улучшения любых из множества метаболических, сердечно-сосудистых и других заболеваний, расстройств или состояний при помощи сопряженных антисмысловых соединений настоящего изобретения.
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения являются более эффективными, чем несопряженные аналоги при определенной концентрации в ткани. Не ограничиваясь какой-либо теорией или механизмом, в некоторых вариантах реализации конъюгат может обеспечивать возможность более эффективного вхождения сопряженного антисмыслового соединения в клетку или возможность более продуктивного вхождения в клетку. Например, в некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения могут демонстрировать более значительное снижение мишени, по сравнению с несопряженным аналогом, при этом и сопряженное антисмысловое соединение, и его несопряженный аналог находятся в ткани в одинаковых концентрациях. Например, в некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения могут демонстрировать более значительное снижение мишени, по сравнению с их
несопряженными аналогами, при этом и сопряженное антисмысловое соединение, и его несопряженный аналог находятся в печени в одинаковых концентрациях.
Ранее был рассмотрен продуктивный и непродуктивный захват олигонуклеотидов (см., например, Geary, R.S., Е. Wancewicz, et al. (2009). "Effect of Dose and Plasma Concentration on Liver Uptake and Pharmacologic Activity of a 2'-Methoxyethyl Modified Chimeric Antisense Oligonucleotide Targeting PTEN." Biochem. Pharmacol. 78(3): 284-91; и Koller, E., Т.M. Vincent, et al. (2011). "Mechanisms of single-stranded phosphorothioate modified antisense oligonucleotide accumulation in hepatocytes." Nucleic Acids Res. 39(11): 4795-807) Группы конъюгатов, описанные в настоящем документе, могут улучшать продуктивный захват.
В некоторых вариантах реализации группы конъюгатов, описанные в настоящем документе, могут дополнительно усиливать эффективность за счет увеличения аффинности сопряженного антисмыслового соединения к конкретному типу клетки или ткани. В некоторых вариантах реализации группы конъюгатов, описанные в настоящем документе, могут дополнительно усиливать эффективность за счет увеличения распознавания сопряженного антисмыслового соединения одним или более рецепторами клеточной поверхности. В некоторых вариантах реализации группы конъюгатов, описанные в настоящем документе, могут дополнительно усиливать эффективность за счет облегчения эндоцитоза сопряженного антисмыслового соединения.
В некоторых вариантах реализации расщепляемый фрагмент может дополнительно усиливать эффективность за счет обеспечения возможности расщепления конъюгата из антисмыслового олигонуклеотида после попадания сопряженного антисмыслового соединения в клетку. Соответственно, в некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения могут быть введены в более низких дозах, чем необходимы для несопряженных антисмысловых олигонуклеотидов.
Ранее в антисмысловые олигонуклеотиды уже были внедрены тиофосфатные связи. Такие тиофосфатные связи являются устойчивыми к нуклеазам и за счет этого улучшают стабильность олигонуклеотида. Кроме того, тиофосфатные связи связывают также некоторые белки, что приводит к накоплению антисмыслового олигонуклеотида в печени.
Олигонуклеотиды с меньшим количеством тиофосфатных связей меньше накапливаются в печени и больше - в почках (см., например, Geary, R., "Pharmacokinetic Properties of 2'-O-(2-Methoxyethyl)-Modified Oligonucleotide Analogs in Rats," Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics, том 296, №3, 890-897; и Pharmacological Properties of 2'-O-Methoxyethyl Modified Oligonucleotides in Antisense a Drug Technology, глава 10, Crooke, S.T., ред., 2008). В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды с меньшим количеством тиофсофатных межнуклеозидных связей и с большим количеством фосфодиэфирных межнуклеозидных связей меньше накапливаются в печени и больше - в почках. При лечении заболеваний печени это нежелательно по нескольким причинам: (1) меньше лекарства попадает в центр заданного действия (печень); (2) лекарство выводится с мочой; (3) почки подвергаются воздействию относительно высокой концентрации лекарства, что может приводить к токсичности в почках. Следовательно, для заболеваний печени тиофсофатные связи обеспечивают важное преимущество.
Однако в некоторых вариантах реализации введение олигонуклеотидов, равномерно связанных тиофсофатными межнуклеозидными связями, вызывает одну или более провоспалительных реакций. (См., например: J Lab Clin Med. 1996 Sep; 128(3): 329-38 "Amplification of antibody production by phosphorothioate oligodeoxynucleotides". Branda et al., и см. также, например: Toxicologic Properties in Antisense a Drug Technology, глаза 12, страницы 342-351, Crooke, S.T., ред., 2008). В некоторых вариантах реализации введение олигонуклеотидов, в которых большая часть межнуклеозидных связей содержит тиофосфатные межнуклеозидные связи, вызывает одну или более провоспалительных реакций.
В некоторых вариантах реализации степень провоспалительного эффекта может зависеть от нескольких переменных (например, модификация скелета, нецелевое действие, модификации нуклеооснований и/или модификации нуклеозида), см., например: Toxicologic Properties in Antisense a Drug Technology, глава 12, страницы 342-351, Crooke, S.T., ред., 2008). В некоторых вариантах реализации степень провоспалительного эффекта может быть ослаблена за счет подбора одной или более переменных. Например, степень провоспалительного эффекта данного олигонуклеотида может быть ослаблена за счет замены любого количества тиофосфатных межнуклеозидных связей на фосфодиэфирные
межнуклеозидные связи с уменьшением посредством этого общего количества тиофосфатных межнуклеозидных связей.
В некоторых вариантах реализации может быть желательно снизить количество тиофосфатных связей, если это может быть выполнено без потери стабильности и без сдвига распределения из печени в почки. Например, в некоторых вариантах реализации количество тиофосфатных связей может быть уменьшено за счет замены тиофосфатных связей на фосфодиэфирные связи. В таком варианте реализации антисмысловое соединение, имеющее меньшее количество тиофосфатных связей и большее количество фосфодиэфирных связей, может вызывать меньшее количество провоспалительных реакций или не вызывать провоспалительных реакций. Хотя антисмысловое соединение, имеющее меньшее количество тиофосфатных связей и большее количество фосфодиэфирных связей, может вызывать меньшее количество провоспалительных реакций, антисмысловое соединение, имеющее меньшее количество тиофосфатных связей и большее количество фосфодиэфирных связей, может не накапливаться в печени и может быть менее эффективным в такой же или аналогичной дозе, по сравнению с антисмысловым соединением, имеющим большее количество тиофосфатных связей. Поэтому в некоторых вариантах реализации желательно разработать антисмысловое соединение, которое имеет множество фосфодиэфирных связей и множество тиофосфатных связей, но которое при этом обладает также стабильностью и хорошим распределением в печени.
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения больше накапливаются в печени и меньше - в почках, чем несопряженные аналоги, даже если некоторые тиофосфатные связи заменены менее провоспалительными фосфодиэфирными межнуклеозидными связями. В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения больше накапливаются в печени и не так сильно выводятся с мочой, как их несопряженные аналоги, даже если некоторые тиофосфатные связи заменены менее провоспалительными фосфодиэфирными межнуклеозидными связями. В некоторых вариантах реализации применение конъюгата обеспечивает возможность разрабатывать более эффективные и лучше переносимые антисмысловые лекарства. Действительно, в некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения имеют более широкий терапевтический индекс, чем несопряженные аналоги. Это позволяет вводить
сопряженное антисмысловое соединение в более высокой абсолютной дозе благодаря меньшему риску провоспалительной реакции и меньшему риску токсичности для почек. Такая более высокая доза дает возможность вводить дозу реже, поскольку ожидается такой же коэффициент очищения (метаболизм). Кроме того, поскольку соединение является более эффективным, как описано выше, то можно допускать снижение концентрации перед введением следующей дозы, без потери терапевтической активности, что обеспечивает еще более продолжительные периоды между введениями доз.
В некоторых вариантах реализации сохраняется необходимость во внедрении некоторого количества тиофосфатных связей. Например, концевые связи легко подвергаются действию экзонуклеаз, и поэтому в некоторых вариантах реализации эти связи представляют собой тиофосфатные или другие модифицированные связи. Межнуклеозидные связи, соединяющие два дезоксинуклеозида, легко подвергаются действию эндонуклеаз, и поэтому в некоторых вариантах реализации эти связи представляют собой тиофосфатные или другие модифицированные связи. Межнуклеозидные связи между модифицированным нуклеозидом и дезоксинуклеозидом, где дезоксинуклеозид расположен на 5'-стороне связывающего дезоксинуклеозида, легко подвергаются действию эндонуклеаз, и поэтому в некоторых вариантах реализации эти связи представляют собой тиофосфатные или другие модифицированные связи. Межнуклеозидные связи между двумя модифицированными нуклеозидами определенных типов и между дезоксинуклеозидом и модифицированным нуклеозидом определенного типа, где модифицированный нуклеозид расположен на
В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 16 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 15 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 14 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 13 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид
сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 12 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 11 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 10 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 9 тиофосфатных связей. В некоторых вариантах реализации антисмысловый олигонуклеотид сопряженного антисмыслового соединения содержит менее 8 тиофосфатных связей.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения, содержащие одну или более групп конъюгата, описанных в настоящем документе, обладают повышенной активностью и/или эффективностью, и/или переносимостью, по сравнению с исходным антисмысловым соединением, не имеющим такой одной или нескольких групп конъюгата. Соответственно, в некоторых вариантах реализации присоединение таких групп конъюгата к олигонуклеотиду является желательным. Такие группы конъюгата могут быть присоединены у 5'- и/или 3'-конца олигонуклеотида. В некоторых случаях синтетически желательно присоединение у 5'-конца. Как правило, олигонуклеотиды синтезируют присоединением 3'-концевого нуклеозида к твердой подложке с последующим связыванием нуклеозидов от 3' к 5' при помощи методик, общеизвестных в данной области техники. Соответственно, если группа конъюгата необходима у 3'-конца, то можно (1) присоединить группу конъюгата к 3'-концевому нуклеозиду и присоединить этот сопряженный нуклеозид к твердой подложке для последующего получения олигонуклеотида или (2) присоединить группу конъюгата к 3'-концевому нуклеозиду готового олигонуклеотида после синтеза. Ни один из этих подходов не является особенно эффективным, и поэтому оба они затратны. В частности, присоединение сопряженного нуклеозида к твердой подложке, хотя и представлено в настоящем документе в разделе «Примеры», не является эффективным способом. В некоторых вариантах реализации присоединение группы конъюгата к 5'-концевому нуклеозиду синтетически проще, чем присоединение к 3'-концу. Можно присоединить несопряженный 3'-концевой нуклеозид к твердой подложке и получить олигонуклеотид по стандартным и хорошо описанным реакциям. Затем нужно лишь присоединить 5'-нуклеозид, имеющий группу конъюгата, на последней стадии связывания. В некоторых вариантах реализации это более эффективно, чем присоединение сопряженного нуклеозида
непосредственно к твердой подложке, как это обычно делают для получения 3'-сопряженного олигонуклеотида. В представленных в настоящем документе Примерах показано присоединение к 5'-концу. Кроме того, некоторые группы конъюгатов имеют синтетические преимущества. Например, некоторые группы конъюгата, содержащие фосфорные связывающие группы, получают синтетически проще и более эффективно, чем другие группы конъюгата, включая группы конъюгата, описанные ранее (например, WO/2012/037254).
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения вводят субъекту. В таких вариантах реализации антисмысловые соединения, содержащие одну или более групп конъюгата, описанных в настоящем документе, обладают повышенной активностью и/или эффективностью, и/или переносимостью, по сравнению с исходным антисмысловым соединением, не имеющим такой одной или нескольких групп конъюгата. Не ограничиваясь механизмом, предполагается, что группа конъюгата способствует распределению, доставке и/или поглощению в целевой клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации, после попадания в целевую клетку или ткань желательно, чтобы вся или часть группы конъюгата расщеплялась с высвобождением активного олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации не обязательно, чтобы из олигонуклеотида расщеплялась вся группа конъюгата. Например, в Примере 20а сопряженный олигонуклеотид вводили мышам и обнаруживали множество различных химических частиц, каждая из которых содержала различные части группы конъюгата, оставшиеся на олигонуклеотиде (Таблица 23а). Это сопряженное антисмысловое соединение показало хорошую эффективность (Таблица 23). Так, в некоторых вариантах реализации такой метаболитный профиль многократного частичного расщепления группы конъюгата не влияет на активность/эффективность. Тем не менее, в некоторых вариантах реализации желательно, чтобы пролекарство (сопряженный олигонуклеотид) давало одно активное соединение. В некоторых случаях, при обнаружении многочисленных форм активного соединения, может быть необходимо определить относительные количества и действие для каждой из них. В некоторых вариантах реализации, при необходимости регуляционного тестирования (например, FDA США или другого органа), желательно иметь одну (или преимущественно одну) активную частицу. В некоторых таких вариантах реализации желательно, чтобы такая одна активная частица представляла собой антисмысловый олигонуклеотид, не содержащий
никаких частей группы конъюгата. В некоторых вариантах реализации группы конъюгата у 5'-конца более вероятно приводят к полному метаболизму группы конъюгата. Не ограничиваясь механизмом, может быть, что эндогенные ферменты, отвечающие за метаболизм у 5'-конца (например, 5'-нуклеазы), более активны/эффективны, чем 3'-аналоги. В некоторых вариантах реализации определенные группы конъюгата более подвержены метаболизму до одной активной частицы. В некоторых вариантах реализации некоторые группы конъюгата более подвержены метаболизму до олигонуклеотида.
D. Антисенс
В некоторых вариантах реализации олигомерные соединения настоящего изобретения представляют собой антисмысловые соединения. В таких вариантах реализации олигомерное соединение комплементарно целевой нуклеиновой кислоте. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота представляет собой РНК. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота представляет собой некодирующую РНК. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота кодирует белок. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота выбрана из мРНК, пре-мРНК, микроРНК, некодирующей РНК, включая малую некодирующую РНК, и промотор-направляемой РНК. В некоторых вариантах реализации олигомерные соединения по меньшей мере частично комплементарны более чем одной целевой нуклеиновой кислоте. Например, олигомерные соединения настоящего изобретения могут представлять собой миметики микроРНК, которые обычно связываются с несколькими мишенями.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность нуклеооснований, которая по меньшей мере на 70% комплементарна последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность нуклеооснований, которая по меньшей мере на 80% комплементарна последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность нуклеооснований, которая по меньшей мере на 90% комплементарна последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность нуклеооснований,
которая по меньшей мере на 95% комплементарна последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность нуклеооснований, которая по меньшей мере на 98% комплементарна последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения содержат часть, имеющую последовательность нуклеооснований, которая на 100% комплементарна последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения по меньшей мере на 70%, 80%, 90%, 95%, 98% или 100% комплементарны последовательности нуклеооснований целевой нуклеиновой кислоты по всей длине антисмыслового соединения.
Антисмысловые механизмы включают любой механизм, затрагивающий гибридизацию олигомерного соединения с целевой нуклеиновой кислотой, при этом гибридизация приводит к биологическому эффекту. В некоторых вариантах реализации такая гибридизация приводит либо к разрушению, либо к применению целевой нуклеиновой кислоты с сопутствующим подавлением или стимулированием клеточного механизма, затрагивающего, например, трансляцию, транскрипцию или полиаденилированией целевой нуклеиновой кислоты или нуклеиновой кислоты, с которой целевая кислота может взаимодействовать иным образом.
Один из типов антисмыслового механизма, затрагивающий разрушение целевой РНК представляет собой антисмысл, опосредованный РНКазой Н. РНКаза Н представляет собой клеточную эндонуклеазу, которая расщепляет спираль РНК дуплекса РНК:ДНК. В данной области техники известно, что односпиральные антисмысловые соединения, которые являются «ДНК-подобными», вызывают активность РНКазы Н в клетках млекопитающих. Следовательно, активация РНКазы Н приводит к расщеплению РНК-мишени, посредством этого в значительной степени усиливая эффективность подавления генной экспрессии, опосредованного ДНК-подобным олигонуклеотидом.
Антисмысловые механизмы включают также, без ограничения, РНКи механизмы, в которых используется путь RISC. Такие РНКи механизмы включают, без ограничения, миРНК, оцРНК и микроРНК механизмы. Такие механизмы включают создание миметика микроРНК и/или анти-микро РНК.
Антисмысловые механизмы включают также, без ограничения, механизмы, которые гибридизуют или имитируют некодирующую РНК, отличную от микроРНК или мРНК. Такие некодирующие РНК включают, но не ограничиваются ими, промотор-направленную РНК и малую и длинную РНК, которая влияет на транскрипцию или трансляцию одной или более нуклеиновых кислот.
В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой РНКи соединения. В некоторых вариантах реализации олигомерные олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой оцРНК соединения. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, спарены со вторым олигомерным соединением с образованием миРНК. В некоторых таких вариантах реализации второе олигомерное соединение также содержит конъюгат. В некоторых вариантах реализации второе олигомерное соединение представляет собой любую модифицированную или немодифицированную нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой антисмысловую цепь в миРНК соединении. В некоторых вариантах реализации олигонуклеотиды, содержащие описанные в настоящем документе конъюгаты, представляют собой смысловую цепь в миРНК соединении. В тех вариантах реализации, в которых сопряженное олигомерное соединение представляет собой двухцепочечную миРНК, конъюгат может находиться на смысловой цепи, антисмысловой цепи или и на смысловой цепи, и на антисмысловой цепи.
D. Целевые нуклеиновые кислоты, области и сегменты
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на любую нуклеиновую кислоту. В некоторых вариантах реализации целевая нуклеиновая кислота кодирует белок-мишень, который является клинически значимым. В таких вариантах реализации модулирование целевой нуклеиновой кислоты приводит к клиническому преимуществу. Некоторые целевые нуклеиновые кислоты включают, но не ограничиваются ими, целевые нуклеиновые кислоты, представленные в Таблице 1.
Процесс таргетинга обычно включает определение по меньшей мере одной целевой области, сегмента или сайта в целевой нуклеиновой кислоте для антисмыслового взаимодействия с возникновением в результате такого заданного эффекта.
В некоторых вариантах реализации целевая область представляет собой структурно определенную область нуклеиновой кислоты. Например, в некоторых таких вариантах реализации целевая область может охватывать 3' UTR, 5' UTR, экзон, интрон, кодирующую область, область инициации трансляции, область терминации трансляции или другую определенную область или целевой сегмент нуклеиновой кислоты.
В некоторых вариантах реализации целевой сегмент представляет собой часть целевой области по меньшей мере примерно из 8 нуклеооснований, на которую направлено сопряженное антисмысловое соединение. Целевые сегменты могут содержать последовательности ДНК или РНК, которые содержат по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований от 5'-конца одного из целевых сегментов (остальные нуклеооснования тянутся друг за другом из той же ДНК или РНК, начинаясь сразу перед 5'-концом целевого сегмента и продолжаясь до момента, когда ДНК или РНК будет содержать от около 8 до около 30 нуклеооснований). Целевые сегменты представлены также последовательностми ДНК или РНК, которые содержат по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований от 3'-конца одного из целевых сегментов (остальные нуклеооснования тянутся друг за другом из той же ДНК или РНК, начинаясь сразу после 3'-конца целевого сегмента и продолжаясь до момента, когда ДНК или РНК будет содержать от около 8 до около 30 нуклеооснований). Целевые сегменты также могут быть представлены последовательностями ДНК или РНК, которые содержат по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований из внутренней части последовательности целевого сегмента, и могут тянуться в любом или в обоих направлениях до момента, когда сопряженное антисмысловое соединение будет содержать от около 8 до около 30 нуклеооснований.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновые кислоты, перечисленные в Таблице 1, могут быть модифицированы так, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь модифицированный сахарный фрагмент, немодифицированный сахарный фрагмент или смесь модифицированных и немодифицированных сахарных
фрагментов, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь модифицированная межнуклеозидная связь, немодифицированная межнуклеозидная связь или смесь модифицированных и немодифицированных межнуклеозидных связей, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь модифицированное нуклеооснование, немодифицированное нуклеооснование или смесь модифицированных и немодифицированных нуклеооснований, как описано в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут иметь мотив, описанный в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновые кислоты, перечисленные в Таблице 1, могут быть сопряжены так, как описано в настоящем документе.
1. Андрогенный рецептор (AR)
AR представляет собой фактор транскрипции, участвующий в качестве стимулятора в раке предстательной железы. AR активируется связыванием с его гормональными лигандами: андрогеном, тестостероном и/или DHT. Андроген-депривационная терапия, известная также как «химическая кастрация», представляет собой стратегию терапии «первой линии» против гормон-чувствительного, андроген-зависимого рака предстательной железы, которая снижает уровень циркулирующего в крови андрогена и посредством этого подавляет активность AR. Однако андроген-депривационная терапия зачастую приводит к возникновению и росту «кастрационно-резистентного» распространенного рака предстательной железы, при котором передача сигналов AR снова не зависит от связывания лиганда. Механизмы, лежащие в основе кастрационной резистентности при распространенном раке предстательной железы, остаются неясными.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту AR
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту AR, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NT_011669.17, нуклеооснования с 5079000 по 5270000, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 1. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 1, содержит последовательность по меньшей мере из 8 последовательных нуклеооснований, выбранную из последовательностей нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 17-24. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 1, содержит последовательность нуклеооснований, выбранную из последовательностей нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 17-24. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для AR
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту AR, для модулирования экспрессии AR у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия AR снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту AR, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает раком предстательной железы, таким как кастрационно-резистентный рак предстательной железы. В некоторых вариантах реализации субъект страдает раком предстательной железы, устойчивм к диарилгидантоиновому ингибитору андрогенного рецептора (AR), такому как MDV3100, который известен также как энзалутамид. MDV3100 или энзалутамид представляет собой экспериментальное лекарство-антагонист андрогенного рецептора, разработанное компанией Medivation для лечения кастрационно-резистентного рака предстательной железы. В некоторых вариантах реализации субъект страдает раком молочной железы. В некоторых аспектах рак молочной железы субъекта обладает одной или несколькими из следующих характеристик: положительный к андрогенному рецептору, зависимый от андрогена для роста, отрицательный к эстрогеновому рецептору (ER), независимый от эстрогена для роста, отрицательный к рецептору прогестерона (PR), независимый от прогестерона для роста или отрицательный к Her2/neu. В некоторых аспектах рак молочной железы или клетка рака молочной железы является апокринной.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту AR, для производства лекарственного средства.
2. Аполипопротеин (а) (Аро(а))
Один белок Аро(а) связан дисульфидной связью с одним белком АроВ с образованием частицы липопротеина (a) (Lp(a)). Белок Аро(а) имеет высокую степень гомологии с плазминогеном, в частности, в повторяющемся домене «двойной петли» IV типа 2. Предполагается, что повторяющийся домен «двойной петли» в Аро(а) может отвечать за его протромботические и антифибринолитические свойства, потенциально усиливая атеросклеротическое прогрессирование. Аро(а) транскрипционно регулируется посредством IL-6, и в исследованиях пациентов с ревматоидным артритом, проходивших лечение ингибитором IL-6 (тоцилизумаб), уровни в плазме были снижены на 30% через 3 месяца лечения. Было показано, что Аро(а) предпочтительно связывает окисленные фосфолипиды и усиливает васкулярное воспаление. Кроме того, исследования позволяют предположить, что частица Lp(a) может также стимулировать эндотелиальную проницаемость, вызывать экспрессию ингибитора плазминогенного активатора типа 1 и активировать секрецию макрофагального интерлейкина-8. Важно, что в недавних исследованиях генетических ассоциаций было выявлено, что Lp(a) представляет собой независимый фактор риска для инфаркта миокарда, инсульта, болезни периферических сосудов и аневризма брюшной аорты. Кроме того, в исследовании ранней ишемической болезни сердца (PROCARDIS) ученые Clarke et al. описали достоверные и независимые связи между ишемической болезнью сердца и концентрациями Lp(a) в плазме. Кроме того, Solfrizzi et al. предположили, что повышенная концентрация Lp(a) в сыворотке может быть связана с повышенным риском болезни Альцгеймера (AD). Антисмысловые соединения, направленные на Аро(а), были ранее описаны в WO 2005/000201 и US 61/651539, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на Аро(а), ISIS-APOARx, в настоящее время проходит I фазу клинических испытаний для изучения профиля его безопасности.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту Аро(а)
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту Аро(а), имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_005577.2, которая включена в настоящий документ как SEQ ID
NO: 2. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 2.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 2, содержит последовательность по меньшей мере из 8 последовательных нуклеооснований, выбранную из последовательностей нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 25-30. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 2, содержит последовательность нуклеооснований, выбранную из последовательностей нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 25-30. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для Аро(а)
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту Аро(а), для модулирования экспрессии Аро(а) у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия Аро(а) снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту Аро(а), в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых
вариантах реализации субъект страдает сердечно-сосудистым и/или метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации субъект страдает гиперхолестеринемией, несемейной гиперхолестеринемией, семейной гиперхолестеринемией, гетерозиготной семейной гиперхолестеринемией, гомозиготной семейной гиперхолестеринемией, смешанной дислипидемией, атеросклерозом, риском развития атеросклероза, ишемической болезнью сердца, анамнезом ишемической болезни сердца, ишемической болезнью сердца с ранним началом, одним или более факторами риска ишемической болезни сердца, диабетом II типа, диабетом II типа с дислипидемией, дислипидемией, гипертриглицеридемией, гиперлипидемией, повышенной концентрацией жирных кислот, стеатозом печени, неалкагольным стеатогепатитом и/или неалкагольной жировой инфильтрацией печени.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту Аро(а), для производства лекарственного средства.
3. Аполипопротеин В (АроВ)
АроВ (известный также как аполипопротеин В-100; АроВ-100, аполипопротеин В-48; АроВ-48 и антиген Ag(x)) представляет собой крупный гликопротеин, который выполняет незаменимую роль при сборке и секреции липидов, а также в транспорте и рецептор-опосредованном захвате и доставке различных классов липопротеинов. АроВ выполняет различные функции, от абсорбции и переработки пищевых липидов до регуляции уровней циркулирующих липопротеинов (Davidson and Shelness, Annu. Rev. Nutr., 2000, 20, 169-193). Последнее свойство подчеркивает его значимость в отношении восприимчивости к атеросклерозу, которая сильно коррелирует с окружающей концентрацией АроВ-содержащих липопротеинов (Davidson and Shelness, Annu. Rev. Nutr., 2000, 20, 169-193). ApoB-100 представляет собой основной белковый компонент LDL-C и содержит домен, необходимый для взаимодействия этих липопротеиновых частиц с рецептором LDL. Повышенные уровни LDL-C представляют собой фактор риска для сердечно-сосудистых заболеваний, включая атеросклероз. Антисмысловые соединения, направленные на АроВ, были описаны ранее в WO 2004/044181, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством
ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на АроВ, KYNAMRO™, был одобрен Администрацией США по пищевым продуктам и лекарственным веществам (FDA) в качестве вспомогательного средства для гиполипидемических лекарств и диет для снижения содержания холестерина липопротеинов низкой плотности (LDL-C), АроВ, общего холестерина (ТС) и холестерина липопротеинов невысокой плотности (не-HDL-C) у пациентов с гомозиготной семейной гиперхолестеринемией (HoFH). Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту АроВ
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту АроВ, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_000384.1, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 3. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 3.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 3, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 31. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 3. содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 31. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для АроВ
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту АроВ, для модулирования экспрессии АроВ у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия АроВ снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту АроВ, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает сердечно-сосудистым и/или метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации субъект страдает гиперхолестеринемией, несемейной гиперхолестеринемией, семейной гиперхолестеринемией, гетерозиготной семейной гиперхолестеринемией, гомозиготной семейной гиперхолестеринемией, смешанной дислипидемией, атеросклерозом, риском развития атеросклероза, ишемической болезнью сердца, анамнезом ишемической болезни сердца, ишемической болезнью сердца с ранним началом, одним или более факторами риска ишемической болезни сердца, диабетом II типа, диабетом II типа с дислипидемией, дислипидемией, гипертриглицеридемией, гиперлипидемией, повышенной концентрацией жирных кислот, стеатозом печени, неалкагольным стеатогепатитом и/или неалкагольной жировой инфильтрацией печени.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту АроВ, для производства лекарственного средства.
4. Аполипопротеин C-III (ApoCIII)
ApoCIII представляет собой составную часть HDL и богатых триглицеридами (TG) липопротеинов. Повышенные уровни ApoCIII связаны с повышенными уровнями TG и такими заболеваниями как сердечно-сосудистое заболевание, метаболический синдром,
ожирение и диабет. Повышенные уровни TG связаны с панкреатитом. ApoCIII замедляет выведение богатых триглицеридами липопротеинов за счет ингибирования липолиза посредством подавления липопротеин-липазы (LPL) и препятствия связыванию липопротеина с гликозаминогликановой матрицей клеточной поверхности. Антисмысловые соединения, направленные на ApoCIII, были описаны ранее в WO 2004/093783 и WO 2012/149495, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В настоящее время антисмысловый олигонуклеотид, направленный на ApoCIII, ISIS-APOCIIIRx, проходит II фазу клинических испытаний для оценки его эффективности при лечении диабета или гипертриглицеридемии. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту ApoCIII
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту ApoCIII, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NT_033899.8, усеченную с нуклеооснования с 20262640 по 20266603, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 4. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 4. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту ApoCIII, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_000040.1, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 5. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 5. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат
конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 5, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 32. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 5, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 32. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для ApoCIII
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту ApoCIII, для модулирования экспрессии ApoCIII у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия ApoCIII снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую
кислоту ApoCIII, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает сердечно-сосудистым и/или метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации субъект страдает гипертриглицеридемией, несемейной гипертриглицеридемией, семейной гипертриглицеридемией, гетерозиготной семейной гипертриглицеридемией, гомозиготной семейной гипертриглицеридемией, смешанной дислипидемией, атеросклерозом, риском развития атеросклероза, ишемической болезнью сердца, анамнезом ишемической болезни сердца, ишемической болезнью сердца с ранним началом, одним или более факторами риска ишемической болезни сердца, диабетом II типа, диабетом II типа с дислипидемией, дислипидемией, гиперлипидемией, гиперхолестеринемией, повышенной концентрацией жирных кислот, стеатозом печени, неалкагольным стеатогепатитом, панкреатитом и/или неалкагольной жировой инфильтрацией печени.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту ApoCIII, для производства лекарственного средства.
5. C-Реактивный белок (CRP)
CRP (также известный как РТХ1) представляет собой незаменимый человеческий острофазовый агент, вырабатываемый в печени в ответ на множество воспалительных цитокинов. Этот белок, впервые идентифицированный в 1930 году, является высококонсервативным и считается ранним индикатором инфекционных или воспалительных состояний. В ответ на инфекционные, ишемические, травматические, ожоговые и воспалительные состояния уровни CRP в плазме увеличиваются в 1000 раз. В клинических испытаниях, в которых пациенты принимали липидопонижающую терапию, такую как статиновая терапия, было показано, что пациенты, у которых отмечено снижение и LDL-C, и CRP, имели сниженный риск дальнейших коронарных приступов, по сравнению с пациентами, у которых отмечено снишение только LDL-C. Антисмысловые соединения, направленные на CRP, были ранее описаны в WO 2003/010284 и WO 2005/005599, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на CRP, ISIS-CRPRx, в настоящее время
проходит 2 фазу клинических испытаний для изучения его эффективности при лечении субъектов с ревматоидным артритом и пароксизмальной фибрилляцией предсердий. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту CRP
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту CRP, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® M11725.1, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 6. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 6.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 6, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 33. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 6, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 33. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для CRP
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту CRP, для модулирования экспрессии CRP у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия CRP снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту CRP, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает сердечно-сосудистым и/или метаболическим заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации субъект страдает гиперхолестеринемией, несемейной гиперхолестеринемией, семейной гиперхолестеринемией, гетерозиготной семейной гиперхолестеринемией, гомозиготной семейной гиперхолестеринемией, смешанной дислипидемией, атеросклерозом, риском развития атеросклероза, ишемической болезнью сердца, анамнезом ишемической болезни сердца, ишемической болезнью сердца с ранним началом, одним или более факторами риска ишемической болезни сердца. В некоторых вариантах реализации индивидуум страдает пароксизмальной фибрилляцией предсердий, острым коронарным синдромом, сосудистым повреждением, закупоркой артерии, нестабильной стенокардией, пост-болезнью периферических сосудов, пост-инфарктом миокарда (MI), тромбозом, тромбами в глубокой вене, терминальной стадией почечной недостаточности (ESRD), хронической почечной недостаточностью, активацией комплемента, застойной сердечной недостаточностью или системным васкулитом. В некоторых вариантах реализации индивидуум перенес инсульт. В некоторых вариантах реализации индивидуум подвергался процедуре, выбранной из элективного стентирования, ангиопластики, пост-чрескожной транслюминальной ангиопластики (РТСА), пересадки сердца, гемодиализа или сердечно-легочного шунтирования. В некоторых вариантах реализации индивидуум страдает воспалительным заболеванием. В некоторых таких вариантах реализации воспалительное заболевание выбрано из воспалительной болезни кишечника, неспецифического язвенного колита, ревматоидного артрита или остеоартрита.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую
кислоту CRP, для производства лекарственного средства.
6. eIF4E
Сверхэкспрессия eIF4E была описана во многих раковых опухолях человека и в полученных из рака клеточных линиях, а также приводит к онкогенной трансформации клеток и инвазивному/метастатическому фенотипу в животных моделях. В отличие от не трансформированных выращенных клеток, трансформированные клеточные линии экспрессируют eIF4E не зависимо от наличия сывороточных факторов роста (Rosenwald, Cancer Lett., 1995, 98, 77-82). Избыток eIF4E приводит к аберрантному росту и неопластической морфологии в клетках HeLa, а также вызывает туморогенную трансформацию в фибробластах NIH 3Т3 и Rat2, судя по «безъякорному» росту, образованию трансформированных очагов в культуре и образованию опухолей у «голых» мышей (De Benedetti et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1990, 87, 8212-8216; и Lazaris-Karatzas et al., Nature, 1990, 345, 544-547).
Повышенные уровни eIF4E обнаружены в нескольких типах рака человека, включая, но не ограничиваясь ими, неходжкинскую лимфому, аденому и карциному толстой кишки, а также рак гортани, головы и шеи, предстательной железы, молочной железы и мочевого пузыря (Crew et al., Br. J. Cancer, 2000, 82, 161-166; Graff et al., Clin. Exp. Metastasis, 2003, 20, 265-273; Haydon et al., Cancer, 2000, 88, 2803-2810; Kerekatte et al., Int. J. Cancer, 1995, 64, 27-31; Rosenwald et al., Oncogene, 1999, 18, 2507-2517; Wang et al., Am. J. Pathol., 1999, 155, 247-255). Повышенная регуляция eIF4E представляет собой раннее событие при канцерогенезе толстой кишки и зачастую сопровождается повышением уровней циклина D1 (Rosenwald et al., Oncogene, 1999, 18, 2507-2517). Антисмысловые соединения, направленные на eIF4E, были описаны ранее в WO 2005/028628, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на eIF4E, ISIS-eIF4ERx, в настоящее время проходит 1/2 фазу клинических испытаний для исследования его эффективности при лечении субъектов, страдающих раком.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту eIF4E
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту eIF4E, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® M15353.1, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 7. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 7.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 7, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 34. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 7, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 34. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для eIF4E
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту eIF4E, для модулирования экспрессии eIF4E у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия eIF4E снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту eIF4E, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает раком. В некоторых аспектах рак представляет собой рак предстательной железы.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту eIF4E, для производства лекарственного средства.
7. Фактор VII
Фактор коагуляции VII (также известный как сывороточный ускоритель превращения протромбина) представляет собой основной компонент каскада коагуляции тканевого фактора. Клиницисты связывают повышенные уровни активности фактора VII с неблагоприятным прогнозом при некоторых тромботических заболеваниях, таких как сердечные приступы, а также с тромбозом на фоне рака, который является второй основной причиной смерти у онкологических пациентов. В доклинических исследованиях антисмысловое ингибирование фактора VII быстро снижало активность фактора VII более чем на 90 процентов за три дня, без наблюдаемого увеличения кровотечения, которое представляет собой распространенный побочный эффект существующих в настоящее время антитромботических лекарств. Антисмысловые соединения, направленные на фактор VII, были описаны ранее в WO 2009/061851, WO 2012/174154 и РСТ заявке № PCT/US 2013/025381, полное содержание каждой из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Запланированы клинические испытания для оценки ISIS-FVIIRx при острых клинических ситуациях, таких как после хирургической операции, для предотвращения развития у пациентов опасных кровяных сгустков. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту фактора VII
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту фактора VII, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NT_027140.6, усеченную с нуклеооснования 1255000 по 1273000, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 8. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 8, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 8.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 8, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 35-43. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 8, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 35-43. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для фактора VII
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту фактора VII, для модулирования экспрессии фактора VII у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия фактора VII снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту фактора VII, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает или имеет риск развития тромбоэмболического состояния, такого как сердечный приступ, инсульт, тромбоз глубокой вены или легочная эмболия. В некоторых вариантах реализации субъект имеет риск развития тромбоэмболического состояния и/или иным образом нуждается в антикоагулянтной терапии. Примеры таких субъектов включают тех, которые подвергаются обширной ортопедической операции, и пациентов, нуждающихся в постоянном антикоагулянтном лечении. В некоторых вариантах реализации пациент страдает или имеет риск развития воспалительного заболевания, расстройства или состояния. В некоторых вариантах реализации субъект страдает или имеет риск развития аллергических заболеваний (например, аллергического ринита, хронического риносинусита), аутоиммунных заболеваний (например, рассеянного склероза, артрита, склеродермии, псориаза, целиакии), сердечно-сосудистых заболеваний, колита, диабета (например, инсулинозависимого сахарного диабета 1 типа), гиперчувствительности (например, гиперчувствительности типа 1, 2, 3 или 4), инфекционных заболеваний (например, вирусной инфекции, микобактериальной инфекции, паразитической инфекции), заднего увеита, гиперчувствительности дыхательных путей, астмы, атопического
дерматита, колита, эндометриоза, болезни щитовидной железы (например, болезни Грейвса) и панкреатита.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту фактора VII, для производства лекарственного средства.
8. Фактор XI
Фактор коагуляции XI (также известный как плазменный предшественник тромбопластина) является важным членом каскада коагуляции. Высокие уровни фактора XI повышают риск тромбоза, процесса, подразумевающего аберрантное образование сгустков крови, который отвечает за большинство сердечных приступов и инсультов. Повышенные уровни фактора XI также увеличивают риск венозного тромбоза, распространенной проблемы после хирургической операции, особенно обширных ортопедических процедур, таких как эндопротезирование коленного или тазобедренного сустава. Люди с недостатком фактора XI имеют более низкую заболеваемость тромбоэмболическими состояниями с минимальным увеличением риска кровотечения. Антисмысловые соединения, направленные на фактор XI, были описаны ранее в WO 2010/045509 и WO 2010/121074, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В настоящее время антисмысловый олигонуклеотид, направленный на фактор XI, ISIS-FXIRx, проходит 2 фазу клинических испытаний для оценки эффективности ISIS-FXIRx для снижения ряда тромботических событий у пациентов после тотальной артропластики коленного сустава без усиления кровотечения. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту фактора XI
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту фактора XI, имеющую последовательность с номером
доступа GENBANK® NM_000128.3, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 9. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 9.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 9, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 44-48. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 9, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 44-48. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для фактора XI
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту фактора XI, для модулирования экспрессии фактора XI у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия фактора XI снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту фактора XI, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает или имеет риск развития тромбоэмболического состояния, такого как сердечный приступ, инсульт, тромбоз глубокой вены или легочная эмболия. В некоторых вариантах реализации субъект имеет риск развития тромбоэмболического состояния и/или иным образом нуждается в антикоагулянтной терапии. Примеры таких субъектов включают тех, которые подвергаются обширной ортопедической операции, и пациентов, нуждающихся в постоянном антикоагулянтном лечении. В некоторых вариантах реализации пациент страдает или имеет риск развития воспалительного заболевания, расстройства или состояния. В некоторых вариантах реализации субъект страдает или имеет риск развития аллергических заболеваний (например, аллергического ринита, хронического риносинусита), аутоиммунных заболеваний (например), рассеянного склероза, артрита, склеродермии, псориаза, целиакии), сердечно-сосудистых заболеваний, колита, диабета (например, инсулинозависимого сахарного диабета 1 типа), гиперчувствительности (например, гиперчувствительности типа 1, 2, 3 или 4), инфекционных заболеваний (например, вирусной инфекции, микобактериальной инфекции, паразитической инфекции), заднего увеита, гиперчувствительности дыхательных путей, астмы, атопического дерматита, колита, эндометриоза, болезни щитовидной железы (например, болезни Грейвса) и панкреатита.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту фактора XI, для производства лекарственного средства.
9. Глюкокортикоидный рецептор (GCCR)
Комплементарные ДНК клоны, кодирующие человеческий глюкокортикоидный рецептор (также известный как ядерный рецептор подсемейства 3, группы С, член 1; NR3C1; GCCR; GCR; GRL; глюкокортикоидный рецептор, лимфоцит), были впервые выделены в 1985 году (Hollenberg et al., Nature, 1985, 318, 635-641; Weinberger et al., Science, 1985, 228,
740-742). Этот ген расположен на человеческой хромосоме 5q11-q13 и состоит из 9 экзонов (Encio and Detera-Wadleigh, J Biol Chem, 1991, 266, 7182-7188; Gehring et al., Proc Natl Acad Sci USA, 1985, 82, 3751-3755).
Человеческий глюкокортикоидный рецептор состоит из трех основных доменов, N-концевого активирующего домена, центрального ДНК-связывающего домена и C-концевого лиганд-связывающего домена (Giguere et al., Cell, 1986, 46, 645-652). В отсутствие лиганда глюкокортикоидный рецептор образует крупный гетеромерный комплекс с несколькими другими белками, из которых он диссоциирует при связывании лиганда.
В печени глюкокортикоидные агонисты увеличивают в выработку глюкозы печенью за счет активации глюкокортикоидного рецептора, что впоследствии приводит к повышению экспрессии глюконеогенных ферментов фосфоенолпируват-карбоксикиназы (PEPCK) и глюкоза-6-фосфатазы. При глюконеогенезе глюкоза образуется через негексозные предшественники, такие как лактат, пируват и аланин (Link, Curr Opin Investig Drugs, 2003, 4, 421-429).
Антисмысловые соединения, направленные на GCCR, были описаны ранее в WO 2007/035759, WO 2005/071080 и РСТ заявке № PCT/US 2012/061984, полное содержание каждой из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на GCCR, ISIS-GCCRRx, в настоящее время прошел I фазу клинических испытаний с положительными результатами. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту GCCR
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту GCCR, имеющую последовательность комплемента с номером доступа GENBANK NT_029289.10, усеченную с нуклеооснования 3818000 по 3980000, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 10. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO:
10, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 10.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 10, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 49-59. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 10, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 49-59. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для GCCR
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту GCCR, для модулирования экспрессии GCCR у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия GCCR снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту GCCR, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает связанными с метаболизмом заболеваниями, включая метаболический синдром, сахарный диабет, инсулинорезистентность, диабетическую дислипидемию, гипертриглицеридемию, ожирение и увеличение веса.
Сахарный диабет характеризуется рядом физических и физиологических симптомов. Любой симптом, который, как известно специалистам в данной области техники, связан с диабетом 2 типа, можно улучшить или иным образом модулировать, как показано выше в разделе способов, описанных выше. В некоторых вариантах реализации симптом представляет собой физический симптом, выбранный из группы, состоящей из повышенных уровней глюкозы, повышенного увеличения веса, частого мочеиспускания, необычной жажды, чрезмерного чувства голода, крайней утомляемости, нечеткости зрения, частых инфекционных заболеваний, покалывания или онемения конечностей, сухости и зуда кожи, потери веса, медленно заживающих ран и припухлых десен. В некоторых вариантах реализации симптом представляет собой физиологический симптом, выбранный из группы, состоящей из инсулинорезистентности, повышенных уровней глюкозы, повышенной жировой массы, сниженной скорости метаболизма, сниженного выведения глюкозы, сниженной переносимости глюкозы, сниженной чувствительности к инсулину, сниженной чувствительности к печеночному инсулину, увеличенного размера и массы адипозной ткани, повышенного содержания жира в организме и повышенного веса тела.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту GCCR, для производства лекарственного средства.
10. Рецептор глюкагона (GCGR)
Диабет представляет собой хроническое метаболическое расстройство, характеризующееся ухудшением секреции и/или действия инсулина. При диабете 2 типа (T2DM) инсулинорезистентность приводит к неспособности инсулина контролировать активность глюконеогенных ферментов, и многие субъекты демонстрируют также недопустимые уровни циркулирующего глюкагона в состоянии натощак и после приема пищи. Глюкагон секретируется из α-клеток панкреатических островков и регулирует гомеостаз глюкозы за счет модулирования выработки глюкозы печенью (Quesada et al., J. Endocrinol. 2008. 199: 5-19). Глюкагон проявляет свое действие на целевые ткани за счет активации своего рецептора, GCGR. Рецептор глюкагона представляет собой белок размером 62 кДа, который является членом класса В семейства рецепторов, сопряженных с G-белком (Brubaker et al., Recept. Channels. 2002. 8: 179-88). Активация GCGR приводит к передаче сигнала G-белками (Gsα и Gq), при этом Gsα активирует аденилатциклазу, что вызывает выработку цАМФ, приводящую к повышению уровней протеинкиназы А. Передача сигналов GCGR в печени приводит к повышению выработки глюкозы печенью за счет инициации гликогенолиза и глюконеогенеза одновременно с подавлением гликогенеза (Jiang and Zhang, Am. J. Physiol. Endocrinol. Metab. 2003. 284: E671-E678). GCGR экспрессируется также во внепеченочных тканях, которые включают сердце, гладкую мускулатуру кишечника, почки, головной мозг и адипозную ткань (Hansen et al., Peptides. 1995. 16: 1163-1166).
Антисмысловые соединения, направленные на GCGR, были описаны ранее в WO 2004/096996, WO 2004/096016, WO 2007/035771 и WO 2013/043817, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на GCGR, ISIS-GCGRRx, в настоящее время прошел I фазу клинических испытаний с положительными результатами. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту GCGR
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту GCGR, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NW_926918.1, усеченную с нуклеооснования 16865000 по 16885000, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 11. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 11, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 11.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 11, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 60-67. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 11, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 60-67. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для GCGR
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту GCGR, для модулирования экспрессии GCGR у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия GCGR снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту GCGR, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает связанными с метаболизмом заболеваниями, включая
метаболический синдром, сахарный диабет, инсулинорезистентность, диабетическую дислипидемию, гипертриглицеридемию, ожирение и увеличение веса.
Сахарный диабет характеризуется рядом физических и физиологических признаков и/или симптомов. Любой симптом, который, как известно специалистам в данной области техники, связан с диабетом 2 типа, можно улучшить или иным образом модулировать, как показано выше в разделе способов, описанных выше. В некоторых вариантах реализации симптом представляет собой физический симптом или признак, такой как повышенные уровни глюкозы, повышенное увеличение веса, частое мочеиспускание, необычная жажда, чрезмерное чувство голода, крайня утомляемость, нечеткость зрения, частые инфекционные заболевания, покалывание или онемение конечностей, сухость и зуд кожи, потеря веса, медленно заживающие раны и припухлые десна. В некоторых вариантах реализации симптом или признак представляет собой физиологический симптом или признак, выбранный из группы, состоящей из повышенной инсулинорезистентности, повышенных уровней глюкозы, повышенной жировой массы, сниженной скорости метаболизма, сниженного выведения глюкозы, сниженной переносимости глюкозы, сниженной чувствительности к инсулину, сниженной чувствительности к печеночному инсулину, увеличенного размера и массы адипозной ткани, повышенного содержания жира в организме и повышенного веса тела.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту GCGR, для производства лекарственного средства.
11. Гепатит В (HBV)
Гепатит В представляет собой вирусное заболевание, передающееся парентерально через зараженный материал, такой как кровь и продукты крови, загрязненные иглы, половым путем и вертикально от инфицированной или несущей вирус матери к ее потомству. По оценкам Всемирной организации здравоохранения, во всем мире инфицировано более 2 миллиардов людей, при этом ежегодно происходит около 4 миллионов острых случаев, 1 миллионов смертей в год и 350-400 миллионов хронических носителей (Всемирная организация здравоохранения: Geographic Prevalence of Hepatitis В Prevalence, 2004.
http://www.who.int/vaccines-surveillance/graphics/htmls/hepbprev.htm).
Вирус HBV представляет собой двухспиральный гепатотропный вирус, который инфицирует только людей и человекоподобных приматов. Вирусная репликация происходит преимущественно в печени и, в меньшей степени, в почках, поджелудочной железе, костном мозге и селезенке (Hepatitis В virus biology. Microbiol Mol Biol Rev. 64: 2000: 51-68.). Вирусные и иммунные маркеры могут быть обнаружены в крови и являются характеристическими профилями антигенов-антител, развивающимися с течением времени. Первый обнаруживаемый вирусный маркер представляет собой HBsAg, за ним следует антиген е гепатита В (HBeAg) и ДНК HBV. В инкубационном периоде титры могут быть высокими, но уровни ДНК и HBeAg HBV начинают резко снижаться в начале заболевания и могут не быть обнаруживаемыми на пике клинической болезни (Hepatitis В virus infection-natural history and clinical consequences. N Engl J Med. 350: 2004; 1118-1129). HBeAg представляет собой вирусный маркер, обнаруживаемый в крови, который коррелирует с активной вирусной репликацией и, следовательно, высокой вирусной нагрузкой и инфективностью (Hepatitis В е antigen - the dangerous end game of hepatitis B. N Engl J Med. 347: 2002; 208-210). Наличие анти-HBsAb и анти-HBcAb (IgG) указывает на выздоровление и иммунитет у ранее инфицированного индивидуума.
В настоящее время терапии для хронической инфекции HBV, рекомендованные Американской ассоциацией по изучению заболеваний печени (AASLD) и Европейской ассоциацией по изучению печени (EASL), включают интерферон-альфа (INFα), пегилированный интерферон-альфа-2а (Peg-IFN2a), энтекавир и тенофовир. Терапии нуклеозидами и нуклеооснованиями, энтекавир и тенофовир, являются успешными для снижения вирусной нагрузки, но скорости сероконверсии HBeAg и снижения HBsAg даже ниже, чем скорости, достижимые при помощи IFNα терапии. Применяют также другие аналогичные терапии, включая ламивудин (3ТС), телбивудин (LdT) и адефовир, но терапевтическая эффективность терапий с нуклеозидами/нуклеооснованиями в целом ограничена появлением резистентности.
Следовательно, в данной области техники существует необходимость в открытии и разработке новых противовирусных терапий. Кроме того, существует необходимость в новых анти-HBV терапиях, способных увеличивать скорости сероконверсии HBeAg и HBsAg. В
недавних клинических исследованиях была обнаружена корреляция между сероконверсией и снижением HBeAg (Fried et al (2008) Hepatology 47:428), и снижением HBsAg (Moucari et al (2009) Hepatology 49:1151). Снижение уровней антигенов может обеспечивать возможность иммунологического контроля инфекции HBV, поскольку предполагается, что высокие уровни антигенов вызывают иммунологическую толерантность. Существующие нуклеозидные терапии для HBV могут значительно снижать уровни HBV в сыворотке, но мало влияют на уровни HBeAg и HBsAg.
Антисмысловые соединения, направленные на HBV, были описаны ранее в WO 2011/047312, WO 2012/145674 и WO 2012/145697, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Запланированы клинические исследования для оценки влияния антисмысловых соединения, направленных на HBV, на пациентов. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту HBV
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту HBV, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® U95551.1, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 12. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 12, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 12.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 12, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 68. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 12, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 68. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда
GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для HBV
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, для модулирования экспрессии HBV у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия HBV снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает состоянием, связанным с HBV. В некоторых вариантах реализации состояние, связанное с HBV, включает, но не ограничивается ими, хроническую HBV инфекцию, воспаление, фиброз, цирроз, рак печени, сывороточный гепатит, разлитие желчи, рак печени, воспаление печени, фиброз печени, цирроз печени, печеночную недостаточность, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, сывороточный гепатит и HBV виремию. В некоторых вариантах реализации состояние, связанное с hBV, может включать любой или все из следующих признаков: гриппоподобное заболевание, слабость, боль, головная боль, лихорадка, потеря аппетита, диарея, разлитие желчи, тошнота и рвота, боль в области печени, стул глинистого или серого цвета, общий зуд и моча темного цвета, в сочетании с положительным тестом на наличие вируса гепатита В, вирусного антигена гепатита В или положительным тестом на наличие антитела, специфичного к вирусному антигену гепатита В. В некоторых вариантах
реализации субъект имеет риск состояния, связанного с HBV. Сюда входят субъекты, имеющие один или более факторов риска для развития состояния, связанного с HBV, включая половой контакт с индивидуумом, инифицированным вирусом гепатита В, проживание в одном доме с индивидуумом с пожизненной инфекцией вируса гепатита В, воздействие крови человека, инфицированного вирусом гепатита В, инъекция запрещенных веществ субъектом с гемофилией и посещение мест распространения гепатита В. В некоторых вариантах реализации у субъекта идентифицирована необходимость лечения состояния, связанного с HBV.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту HBV, для производства лекарственного средства.
12. Протеин-тирозин-фосфатаза 1В (РТР1В)
РТР1В является членом семейства РТР (Barford, et al., Science 1994. 263: 1397-1404) и представляет собой цитозольный фермент (Neel and Tonks, Curr. Opin. Cell Biol. 1997. 9: 193-204). PTP1B экспрессируется повсеместно, включая ткани, которые являются основными регуляторами метаболизма инсулина, такие как печень, мышцы и жир (Goldstein, Receptor 1993. 3: 1-15), где он является основным ферментом РТР.
Считается, что РТР1В является отрицательным регулятором инсулиновой передачи сигналов. РТР1В взаимодействует с рецептором инсулина и дефосфорилирует его, посредством этого ослабляя и потенциально останавливая инсулиновую передачу сигналов (Goldstein et al., J. Biol. Chem. 2000. 275: 4383-4389). Физиологическая роль PTP1B при инсулиновой передаче сигналов продемонстрирована в моделях на нокаутных мышах. Мыши без гена РТР1В были защищены от инсулинорезистентности и ожирения (Elchebly et al., Science 1999. 283: 1544-1548). PTP1B-дефицитные мыши имели низкую тучность, повышенную скорость базального метаболизма, а также общего расхода энергии и были защищены от ожирения, обусловленного питанием. Стимулированное инсулином поглощение глюкозы было повышено в скелетной мускулатуре, тогда как жировая ткань осталась неизменной, что дает данные о том, что повышенная чувствительность к инсулину у
PTP1B-дефицитных мышей была тканеспецифичной (Klaman et al., Mol. Cell. Biol. 2000. 20 5479-5489). Эти мыши были фенотипически нормальными и были также устойчивыми к ожирению, обусловленному питанием, инсулинорезистентными и имели значительно более низкие уровни триглицеридов при питании с высоким содержанием жиров. Следовательно, будет преимущественным ингибирование РТР1В у пациентов, страдающих от диабета II типа, метаболического синдрома, диабетической дислипидемии или родственных метаболических заболеваний.
Антисмысловые соединения, направленные на РТР1В, были описаны ранее в WO 2001/053528, WO 2002/092772, WO 2004/071407, WO 2006/044531, WO 2012/142458, WO 2006/044531 и WO 2012/142458, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на PTP1B, ISIS-PTP1BRx, в настоящее время прошел I фазу клинических испытаний с положительными результатами. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту РТР1В
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту РТР1В, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_002827.2, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 13, или с номером доступа GENBANK NT_011362.9, усеченную с нуклеооснования 14178000 по 14256000, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 14. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 13, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 13.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 13, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 69-72. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 13, содержит
последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 69-72. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для РТР1В
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту РТР1В, для модулирования экспрессии РТР1В у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия РТР1В снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту РТР1В, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает связанными с метаболизмом заболеваниями, включая метаболический синдром, сахарный диабет, инсулинорезистентность, диабетическую дислипидемию, гипертриглицеридемию, ожирение и увеличение веса.
Сахарный диабет характеризуется рядом физических и физиологических симптомов. Любой симптом, который, как известно специалистам в данной области техники, связан с
диабетом 2 типа, можно улучшить или иным образом модулировать, как показано выше в разделе способов, описанных выше. В некоторых вариантах реализации симптом представляет собой физический симптом, выбранный из группы, состоящей из повышенных уровней глюкозы, повышенного увеличения веса, частого мочеиспускания, необычной жажды, чрезмерного чувства голода, крайней утомляемости, нечеткости зрения, частых инфекционных заболеваний, покалывания или онемения конечностей, сухости и зуда кожи, потери веса, медленно заживающих ран и припухлых десен. В некоторых вариантах реализации симптом представляет собой физиологический симптом, выбранный из группы, состоящей из повышенной инсулинорезистентности, повышенной жировой массы, сниженной скорости метаболизма, сниженного выведения глюкозы, сниженной переносимости глюкозы, сниженной чувствительности к инсулину, сниженной чувствительности к печеночному инсулину, увеличенного размера и массы адипозной ткани, повышенного содержания жира в организме и повышенного веса тела.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту РТР1В, для производства лекарственного средства.
13. STAT3
Семейство белков STAT (сигнальных трансдукторов и активаторов транскрипции) включает ДНК-связывающие белки, которые играют двойную роль в передаче сигналов и активации транскрипции. В настоящее время существует шесть отдельных членов семейства STAT (STAT1, STAT2, STAT3, STAT4, STAT5 и STAT6) и несколько изоформ (STAT1α, STAT1β, STAT3α и STAT3β). Активность STAT модулируется различными цитокинами и митогенными стимулами. Связывание цитокина с его рецептором приводит к активации протеин-тирозин-киназ Янус (JAK), связанных с этими рецепторами. Это фосфорилирует STAT, что приводит к транслокации в ядро и транскрипционной активации STAT-восприимчивых генов. Фосфорилирование в определенном остатке тирозина STAT приводит и их активации, приводя к образованию гомодимеров и/или гетеродимеров STAT, которые связываются с определенными последовательностями генных промоторов. События,
опосредованные цитокинами за счет активации STAT, включают клеточную пролиферацию и дифференцировку, а также предотвращение апоптоза.
Специфичность активации STAT обусловлена специфическими цитокинами, то есть каждый STAT отвечает за небольшое количество специфических цитокинов. Было обнаружено, что другие нецитокиновые сигнальные молекулы, такие как факторы роста, также активируют STAT. Связывание этих факторов с рецептором клеточной поверхности, связанным с протеин-тирозин-киназой, также приводит к фосфорилированию STAT.
В частности, было обнаружено, что STAT3 (также фактор острофазового ответа (APRF)) реагирует на интерлейкин-6 (IL-6), а также на эпидермальный фактор роста (EGF) (Darnell, Jr., J.E., et al., Science, 1994, 264, 1415-1421). Кроме того, было обнаружено, что STAT3 играет важную роль в передаче сигналов интерферонами (Yang, С.-Н., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1998, 95, 5568-5572). Существуют данные, позволяющие предположить, что STAT3 может регулироваться каскадом MAPK. ERK2 вызывает фосфорилирование серина и также связывается с STAT3 (Jain, N., et al., Oncogene, 1998, 17, 3157-3167).
STAT3 экспрессируется в большинстве типов клеток (Zhong, Z., et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 1994, 91, 4806-4810). Он вызывает экспрессию генов, участвующих в реакции на повреждение и воспаление ткани. Было также показано, что STAT3 предотвращает апоптоз за счет экспрессии bcl-2 (Fukada, Т., et al., Immunity, 1996, 5, 449-460).
Недавно STAT3 был обнаружен в митохондриях трансформированных клеток, и было показано, что он способствует активности гликолитического и окислительного фосфорилирования, аналогичной активности в раковых клетках (Gough, D.J., et al., Science, 2009, 324, 1713-1716). Ингибирование STAT3 в митохондриях ослабляет злокачественную трансформацию за счет активированного Ras. Эти данные подтверждают функцию Ras-опосредованной трансформации для STAT3 в митохондриях, помимо его роли в ядре.
Аберрантная экспрессия или конститутивная экспрессия STAT3 связана с рядом болезненных процессов.
Антисмысловые соединения, направленные на STAT3, были описаны ранее в WO 2012/135736 и WO 2005/08312, полное содержание каждого из которых включено в
настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на STAT3, ISIS-STAT3Rx, в настоящее время проходит 1/2 фазу клинических испытаний для исследования его эффективности при лечении субъектов, страдающих раком. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту STAT3
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту STAT3, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_139276.2, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 15. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 15, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 15.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 15, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 73. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 15, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 73. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для STAT3
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту STAT3, для модулирования экспрессии STAT3 у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия STAT3 снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту STAT3, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает гиперпролиферативным заболеванием, расстройством или состоянием. В некоторых вариантах реализации такое гиперпролиферативное заболевание, расстройство или состояние включает рак, а также сопутствующие злокачественные образования и метастазы. В некоторых вариантах реализации такие раковые заболевания включают рак легких, в том числе немелкоклеточный рак легких (NSCLC), рак поджелудочной железы, рак толстой и прямой кишок, множественную миелому, гепатоцеллюлярную карциному (НСС), глиобластому, рак яичников, остеосаркому, рак головы и шеи, рак молочной железы, эпидермоидную карциному, аденому кишечника, рак предстательной железы и рак желудка.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту STAT3, для производства лекарственного средства.
14. Транстиретин (TTR)
TTR (также известный как преальбумин, гипертироксинемия, диспреальбуминемическая, тироксин; старческий системный амилоидоз, амилоидная полиневропатия, амилоидоз I, PALB; дистранстиретинемическая, HST2651; ТВРА; диспреальбуминемическая эутиреоидная гипертироксинемия) представляет собой белок сыворотки/плазмы и спинномозговой жидкости, отвечающий за транспорт тироксина и ретинола (Sakaki et al, Mol Biol Med. 1989, 6: 161-8). Структурно TTR представляет собой гомотетрамер; точечные мутации и неправильное скручивание белка приводит к отложению
амилоидных фибрилл и сопровождается такими расстройствами как старческий системный амилоидоз (SSA), семейная амилоидная полиневропатия (FAP) и семейная амилоидная кардиопатия (FAC).
TTR синтезируется, в основном, печенью и хориоидным сплетением головного мозга, а также, в меньшей степени, сетчаткой глаза у людей (Palha, Clin Chem Lab Med, 2002, 40, 1292-1300). Транстиретин, которые синтезирован в печени, секретируется в кровь, тогда как транстиретин из хориоидного сплетения предназначен для спинномозговой жидкости (CSF). Синтез транстиретина в хориоидном сплетении составляет около 20% от общего локального синтеза белка и целых 25% от общего белка CSF (Dickson et al., J Biol Chem, 1986, 261, 3475-3478).
Благодаря возможности выполнения генетических и иммуногистохимических диагностических тестов, были обнаружены пациенты с TTR амилоидозом во многих народах мира. Недавние исследования показали, что TTR амилоидоз представляет собой не редкое эндемическое заболевание, как считалось ранее, и может поражать не менее 25% взрослого населения (Tanskanen et al, Ann Med. 2008;40(3): 232-9).
На биохимическом уровне TTR был определено как основной белковый компонент в амилоидных отложениях пациентов с FAP (Costa et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1978, 75: 4499-4503), а позже было обнаружено, что замена метионина на валин в положении 30 этого белка представляет собой наиболее распространенный молекулярный дефект, вызывающий это заболевание (Saraiva et al, J. Clin. Invest. 1984, 74: 104-119). При FAP происходит повсеместное системное внеклеточное отложение скоплений TTR, и амилоидные фибриллы возникают по всей соединительной ткани, особенно в периферической нервной системе (Sousa and Saraiva, Prog. Neurobiol. 2003, 71: 385-400). После отложения TTR происходит аксонная дегенерация, берущая начало в немиелинизированных и миелинизированных волокнах малого диаметра, что в конечном итоге приводит к потере нейронов в ганглионарных центрах.
Антисмысловые соединения, направленные на TTR, были описаны ранее в US 2005/0244869, WO 2010/017509 и WO 2011/139917, полное содержание каждого из которых включено в настоящий документ посредством ссылки. Антисмысловый олигонуклеотид, направленный на TTR, ISIS-TTRRx, в настоящее время проходит 2/3 фазу клинических
испытаний для исследования его эффективности при лечении субъектов, страдающих семейной амилоидной полиневропатией. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту TTR
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту TTR, имеющую последовательность с номером доступа GENBANK® NM_000371.3, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 16. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 16, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 16.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 16, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 74-81. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 16, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 74-81. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для TTR
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту TTR, для модулирования экспрессии TTR у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия TTR снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту TTR, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает заболеванием, расстройством или состоянием, связанным с транстиретином, или его симптомом. В некоторых вариантах реализации заболевание, расстройство или состояние, связанное с транстиретином, представляет собой транстиретиновый амилоидоз. «Амилоидоз, связанный с транстиретином» или «транстиретиновый амилоидоз», или «транстиретиновое амилоидное заболевание», при использовании в настоящем документе, представляет собой любую патологию или заболевание, связанное с дисфункцией или дисрегуляцией транстиретина, которая приводит к образованию содержащих транстиретин амилоидных фибрилл. Транстиретиновый амилоидоз включает, но не ограничивается ими, наследственный TTR амилоидоз, лептоменингеальный амилоидоз, семейную амилоидную полиневропатию (FAP), семейную амилоидную кардиомиопатию, семейный окулолептоменингеальный амилоидоз, старческий амилоидоз сердца или старческий системный амилоидоз.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту TTR, для производства лекарственного средства.
15. PCSK9
PCSK9 (также известный как про протеиновая конвертаза субтилизин/кексин 9) является членом семейства субтилизин-серин-протеаз. Другие восемь субтилизин-протеаз млекопитающих, PCSK1-PCSK8 (также называемых PC1/3, РС2, фурин, РС4, РС5/6, РАСЕ4. РС7 и S1P/SKI-1), представляют собой пропротеиновые конвертазы, которые перерабатывают большое количество белков в секреторном каскаде и играют роли в разнообразных биологических процессах (Bergeron, F. (2000) J. Mol. Endocrinol. 24, 1-22, Gensberg, K., (1998) Semin. Cell Dev. Biol. 9, 11-17, Seidah, N.G. (1999) Brain Res. 848, 45-62, Taylor, N.A., (2003) FASEB J. 17, 1215-1227 и Zhou, A., (1999) J. Biol. Chem. 274, 20745-20748). Было предположено, что PCSK9 играет роль в метаболизме холестерина. Экспрессия мРНК PCSK9 понижающе регулируется диетическим холестериновым питанием у мышей (Maxwell, K.N., (2003) J. Lipid Res. 44, 2109-2119), повышающе регулируется статинами в клетках HepG2 (Dubuc, G., (2004) Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol. 24, 1454-1459) и повышающе регулируется у трансгенных мышей с белком, связывающим стеролрегулирующие элементы (SREBP) (Horton, J.D., (2003) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 12027-12032), аналогично холестериновым биосинтетическим ферментам и рецептору липопротеина низкой плотности (LDLR). Кроме того, было обнаружено, что миссенс-мутации PCSK9 связаны с формой аутосомной доминантной гиперхолестеринемии (Hchola3) (Abifadel, М., et al. (2003) Nat. Genet. 34, 154-156, Timms, K.M., (2004) Hum. Genet. 114, 349-353, Leren, T.P. (2004) Clin. Genet. 65, 419-422). PCSK9 также может играть роль при определении уровней холестерина LDL у населения в целом, поскольку было показано, что однонуклеотидные полиморфизмы (SNP) связаны с уровнями холестерина японского населения (Shioji, K., (2004) J. Hum. Genet. 49, 109-114).
Антисмысловые соединения, направленные на PCSK9, были описаны ранее в патентах США 8084437; 8093222; 8664190; и в Международных заявках WO 2008/066776 и WO
2009/148605. Однако все еще существует необходимость в обеспечении пациентов дополнительными и более эффективными возможностями лечения.
Некоторые сопряженные антисмысловые соединения, направленные на нуклеиновую кислоту PCSK9
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения направлены на нуклеиновую кислоту PCSK9, имеющую последовательность с доступом GENBANK®, которая включена в настоящий документ как SEQ ID NO: 160. В некоторых таких вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 160, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 95% или на 100% комплементарно SEQ ID NO: 160.
В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 160, содержит по меньшей мере 8 последовательных нуклеооснований последовательности SEQ ID NO: 156-159. В некоторых вариантах реализации сопряженное антисмысловое соединение, направленное на SEQ ID NO: 160, содержит последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 156-159. В некоторых вариантах реализации такие сопряженные антисмысловые соединения содержат конъюгат, содержащий 1-3 лиганда GalNAc. В некоторых вариантах реализации такие антисмысловые соединения содержат конъюгат, описанный в настоящем документе.
Терапевтические показания для PCSK9
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту PCSK9, для модулирования экспрессии PCSK9 у субъекта. В некоторых вариантах реализации экспрессия PCSK9 снижена.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту PCSK9, в фармацевтической композиции для лечения субъекта. В некоторых вариантах реализации субъект страдает заболеванием, расстройством или состоянием, связанным с PCSK9, или его симптомом. В некоторых вариантах реализации заболевание, расстройство или состояние, связанное с PCSK9, представляет собой метаболическое или сердечно-сосудистое заболевание.
В некоторых вариантах реализации настоящего изобретения представлены способы применения сопряженного антисмыслового соединения, направленного на нуклеиновую кислоту PCSK9, для производства лекарственного средства.
Е. Некоторые конъюгаты GalNAc с нуклеиновыми кислотами
В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения содержат антисмысловые соединения, имеющие последовательности нуклеооснований антисмысловых соединений, представленные ниже в Таблице 16, присоединенные к конъюгату GalNAc. В некоторых вариантах реализации сопряженные антисмысловые соединения содержат антисмысловые соединения, имеющие последовательности нуклеооснований и химические модификации антисмысловых соединений, представленные ниже в Таблице 16, присоединенные к конъюгату GalNAc. Все межнуклеозидные связи представляют собой тиофосфатные межнуклеозидные связи, если не указано иное. Нижний индекс «l» означает LNA-бициклический нуклеозид. Нижний индекс «d» означает 2'-дезоксинуклеозид.
Нижний индекс «е» означает 2'-МОЕ модифицированный нуклеозид. Нижний индекс «v» означает 2-амино-2'-дезоксиаденозин.
Дополнительные последовательности олигонуклеотидов, подходящие для сопряжения с любыми описанными конъюгатами
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на фактор инициации эукариот 4Е (eIF4E), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на dIF4E, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на dIF4E, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на eIF4E, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в US 7425544, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 18-122, описанных в US 7425544, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловую спираль, имеющую последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 212-459, описанных в US 7425544, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на сигнальный трансдуктор и активатор транскрипции 3 (STAT3), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на STAT3, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на STAT3. представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры
антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на STAT3, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2012/135736, WO 2005/083124 и US 6727064, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 9-426, 430-442, 445-464, 471-498, 500-1034, 1036-1512 и 1541-2757, описанных в WO 2012/135736, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 2-81, 108-150 и 159-381, описанных в WO 2005/083124, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 2-81 и 108-150, описанных в US 6727064, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на глюкокортикоидный рецептор (GCCR), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на GCCR, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на GCCR, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на GCCR, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2005/071080, WO 2007/035759 и WO 2007/136988; полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 30-216 и 306-310, описанных в WO 2005/071080, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 26-113, описанных в WO 2007/035759, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 413-485, описанных в WO 2007/136988, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на рецептор глюкагона (GCGR), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на GCGR, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на GCGR, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на GCGR, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в US 7750142; US 7399853; WO 2007/035771; и WO 2007/134014; полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 20-399, описанных в US 7750142, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 20-399, описанных в US 7399853, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 2, описанную в WO 2007/035771, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO: 486-680, описанных в WO 2007/134014, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на протеин-тирозин-фосфатазу 1B (РТР1В), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на РТР1В, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на РТР1В, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на РТР1В, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в US 7563884 и WO 2007/131237, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 17-96 и 244-389, описанных в US 7563884, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 886-1552, описанных в WO 2007/131237, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на рецептор фактора роста фибробластов 4 (FGFR4), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на FGFR4, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на FGFR4, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на FGFR4, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2009/046141, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 21-24, 28, 29, 36, 38, 39, 43, 48, 51, 54-56, 58-60, 64-66 и 92-166, описанных в WO 2009/046141, и группу
конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на альфа-1-антитрипсин (А1АТ), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на A1AT, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на A1AT, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на А1АТ, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2013/142514, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 20-41, описанных в WO 2013/142514, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на фактор VII, известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на фактор VII, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на фактор VII, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на фактор VII, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2013/119979 и WO 2009/061851, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 21-659, описанных в WO 2013/119979, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации
соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 4-159 и 168-611, описанных в WO 2009/061851, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на фактор XI, известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на фактор XI, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на фактор XI, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на фактор XI, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2010/045509 и WO 2010/121074, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 15-270, описанных в WO 2010/045509, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 15-270, описанных в WO 2010/121074, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на вирус гепатита В (HBV), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на HBV, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на HBV, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на HBV,
которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2012/145697 и WO 2012/145697, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 5-310, 321-802, 804-1272, 1288-1350, 1364-1372, 1375, 1376 и 1379, описанных в WO 2012/145697, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 14-22, описанных в WO 2011/047312, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на транстиретин (TTR), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на TTR, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на TTR, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на TTR. которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2011/139917 и US 8101743, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 8-160, 170-177, описанных в WO 2011/139917, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 12-89, описанных в US 8101743, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований, комплементарную предпочтительному целевому сегменту любой из SEQ ID NO 90-133, описанных в US 8101743, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности
нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на аполипопротеин(а) (аро(а)), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на аро(а), представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на аро(а), представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на аро(а), которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2013/177468; US 8,673,632; US 7,259,150; и публикации заявки на патент США № US 2004/0242516; полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 12-130, 133, 134, описанных в WO 2013/177468, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 11-45 и 85-96, описанных в US 8673632, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 11-45, описанных в US 7259150, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 7-41, описанных в публикации заявки на патент США № US 2004/0242516, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на аполипопротеин В (АроВ), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах
реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на АроВ, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на АроВ, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на АроВ. которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в публикациях заявок на патент США № US 2010/0331390, US 2009/0306180 и US 2005/0009088; полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований SEQ ID NO: 20, описанную в US 2010/0331390, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 16-213, описанных в US 2009/0306180, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 17-70, 124-317, 319-333, 335-502, 504-804 и 864-887, описанных в US 2005/0009088, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на аполипопротеин C-III (ApoC-III), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на ApoC-III, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на ApoC-III, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на ApoC-III, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в публикации заявки на патент США №US 2013/0317085, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 19-96 и 209-221, описанных в US 2013/0317085, и группу конъюгата, описанную в настоящем
документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на пропротеиновую конвертазу субтилизин/кексин 9 (PCSK9), известную в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на PCSK9, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на PCSK9, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на PCSK9, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в US 8143230 и US 8664190, полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 329-403, описанных в US 8143230, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 4-455 и 458-461, описанных в US 8664190, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, направленный на C-реактивный белок (CRP), известный в данной области техники, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на CRP, представляют собой РНКи (миРНк или оцРНК) соединения. В некоторых вариантах реализации антисмысловые олигонуклеотиды, направленные на CRP, представляют собой антисмысловые соединения на основе РНКазы Н. Примеры антисмысловых олигонуклеотидов, направленных на CRP, которые подходят для сопряжения, включают, но не ограничиваются ими, те, которые описаны в WO 2003/010284, WO 2005/005599 и WO 2007/143317; полное содержание которых включено в настоящий документ посредством ссылки. В некоторых вариантах
реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 10-63, описанных в WO 2003/010284, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 19-72, 76-259 и 598-613, описанных в WO 2005/005599, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. В некоторых вариантах реализации соединение содержит антисмысловый олигонуклеотид, имеющий последовательность нуклеооснований любой из SEQ ID NO 409-412, описанных в WO 2007/143317, и группу конъюгата, описанную в настоящем документе. Последовательности нуклеооснований всех вышеупомянутых справочных SEQ ID NO включены в настоящий документ посредством ссылки.
F. Некоторые фармацевтические композиции
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены фармацевтические композиции, содержащие одно или более антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации такая фармацевтическая композиция содержит подходящий фармацевтически приемлемый разбавитель или носитель. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит стерильный солевой раствор и одно или более антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации такая фармацевтическая композиция состоит из стерильного солевого раствора и одного или более антисмысловых соединений. В некоторых вариантах реализации стерильный солевой раствор представляет собой солевой раствор фармацевтической марки. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит одно или более антисмысловых соединений и стерильную воду. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция состоит из одного или более антисмысловых соединений и стерильной воды. В некоторых вариантах реализации стерильный солевой раствор представляет собой воду фармацевтической марки. В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит одно или более антисмысловых соединений и фосфатно-солевой буферный раствор (PBS). В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция состоит из одного или более антисмысловых соединений и фосфатно-солевого буферного раствора (PBS). В некоторых вариантах реализации стерильный солевой раствор представляет собой PBS фармацевтической марки.
В некоторых вариантах реализации антисмысловые соединения могут быть смешаны с фармацевтически приемлемыми активными и/или инертными веществами для получения фармацевтических композиций или составов. Композиции и способы составления фармацевтических композиций зависят от множества критериев, включая, но не ограничиваясь этим, способ введения, тяжесть заболевания или дозу, подлежащую введению.
Фармацевтические композиции, содержащие антисмысловые соединения, охватывают любые фармацевтически приемлемые соли, сложные эфиры или соли таких сложных эфиров. В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции, содержащие
антисмысловые соединения, содержат один или более олигонуклеотидов, которые при введении млекопитающему, включая человека, могут обеспечивать (прямо или косвенно) его биологически активный метаболит или остаток. Соответственно, например, настоящее описание относится также к фармацевтически приемлемым солям антисмысловых соединений, пролекарствам, фармацевтически приемлемым солям таких пролекарств и к другим биоэквивалентам. Подходящие фармацевтически приемлемые соли включают, но не ограничиваются ими, соли натрия и калия.
Пролекарство может включать внедрение дополнительных нуклеозидов у одного или обоих концов олигонуклеотида, которые расщепляются в организме под действием эндогенных нуклеаз с образованием активного антисмыслового олигонуклеотида.
В многочисленных способах в терапиях с нуклеиновыми кислотами были применены липидные фрагменты. В некоторых таких способах нуклеиновую кислоту вводят в предварительно сформированные липосомы или липоплексы, полученные из смесей катионных липидов и нейтральных липидов. В некоторых способах получают ДНК комплексы с моно- или поликатионными липидами без участия нейтрального липида. В некоторых вариантах реализации липидный фрагмент выбиран для улучшения распределения фармацевтического агента в определенной клетке или ткани. В некоторых вариантах реализации липидный фрагмент выбиран для улучшения распределения фармацевтического агента в жировой ткани. В некоторых вариантах реализации липидный фрагмент выбиран для улучшения распределения фармацевтического агента в мышечной ткани.
В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции, представленные в настоящем документе, содержат один или более модифицированных олигонуклеотидов и одно или более вспомогательных веществ. В некоторых таких вариантах реализации вспомогательные вещества выбраны из воды, солевых растворов, спирта, полиэтиленгликолей, желатина, лактозы, амилазы, стеарата магния, талька, кремниевой кислоты, вязкого парафина, гидроксиметилцеллюлозы и поливинилпирролидона.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит систему доставки. Примеры систем доставки включают, но не ограничиваются ими, липосомы и эмульсии. Некоторые системы доставки подходят для
получения некоторых фармацевтических композиций, включая композиции, содержащие гидрофобные соединения. В некоторых вариантах реализации применяют некоторые органические растворители, такие как диметилсульфоксид.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит одну или более тканеспецифичных молекул доставки, предназначенных для доставки одного или более фармацевтических агентов настоящего описания в определенную ткань или типы клеток. Например, в некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции включают липосомы, покрытые тканеспецифичным антителом.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит систему совместного растворителя. Некоторые такие системы совместных растворителей содержат, например, бензиловый спирт, неполярное поверхностно-активное вещество, смешиваемый с водой органический полимер и водную фазу. В некоторых вариантах реализации такие системы совместных растворителей применяют для гидрофобных соединений. Не ограничивающий пример такой системы совместных растворителей представляет собой система совместных растворителей VPD, которая представляет собой раствор абсолютного этанола, содержащего 3% масс./об. бензилового спирта, 8% масс./об. неполярного поверхностно-активного вещества Polysorbate 80™ и 65% масс./об. полиэтиленгликоля 300. Пропорции таких систем совместных растворителей могут существенно варьироваться без значителного изменения их характеристик растворимости и токсичности. Кроме того, может варьироваться сущность компонентов совместных растворителей: например, вместо Polysorbate 80™ могут быть применены другие поверхностно-активные вещества; может варьироваться размер фракции полиэтиленгликоля; вместо полиэтиленгликоля могут быть применены другие биосовместимые полимеры, например, поливинилпирролидон; и вместо декстрозы могут быть применены другие сахара или полисахариды.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическую композицию, представленную в настоящем документе, получают для перорального введения. В некоторых вариантах реализации фармацевтические композиции получают для буккального введения.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическую композицию получают для введения инъекцией (например, внутривенной, подкожной, внутримышечной и т.д.). В некоторых таких вариантах реализации фармацевтическая композиция содержит носитель и составлена в водном растворе, таком как вода или физиологически совместимые буферы, такие как раствор Хэнкса, раствор Рингера или физиологический солевой буфер. В некоторых вариантах реализации включены другие ингредиенты (например, ингредиенты, улучшающие растворимость или служащие консервантами). В некоторых вариантах реализации суспензии для инъекций получают при помощи подходящих жидких носителей, суспендирующих агентов и т.п. Некоторые фармацевтические композиции для инъекций представлены в форме разовой дозы, например, в ампулах, или в многодозовых контейнерах. Некоторые фармацевтические композиции для инъекций представляют собой суспензии, растворы или эмульсии в масляных или водных жидких носителях, и они могут содержать вспомогательные агенты, такие как суспендирующие, стабилизирующие и/или диспергирующие агенты. Некоторые растворители, подходящие для применения в фармацевтических композициях для инъекций, включают, но не ограничиваются ими, липофильные растворители и жирные масла, такие как кунжутное масло, синтетические сложные эфиры жирных кислот, такие как этилолеат или триглицериды, и липосомы. Водные суспензии для инъекций могут содержать вещества, которые увеличивают вязкость суспензии, такие как карбоксиметилцеллюлоза натрия, сорбит или декстран. Такие суспензий могут также необязательно содержать подходящие стабилизаторы или агенты, которые увеличивают растворимость фармацевтических агентов с обеспечением возможности получения высококонцентрированных растворов.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическую композицию получают для трансмукозального введения. В некоторых таких вариантах реализации в составе применяют пенетранты, соответствующие барьеру, через который необходимо проникнуть. Такие пенетранты общеизвестны в данной области техники.
В некоторых вариантах реализации фармацевтическая композиция, представленная в настоящем документе, содержит олигонуклеотид в терапевтически эффективном количестве В некоторых вариантах реализации терапевтически эффективное количество является достаточным для предотвращения, облегчения или улучшения симптомов заболевания или
для увеличения продолжительности жизни субъекта, подлежащего лечению. Определение терапевтически эффективного количества находится в пределах возможностей специалистов в данной области техники.
В некоторых вариантах реализации один или более модифицированных олигонуклеотидов, представленных в настоящем документе, составляют в виде пролекарства. В некоторых вариантах реализации при введении in vivo пролекарство химически превращается в биологически, фармацевтически или терапевтически более активную форму олигонуклеотида. В некоторых вариантах реализации пролекарства пригодны благодаря тому, что их проще вводить, чем соответствующую активную форму. Например, в некоторых случаях пролекарство может быть более биодоступным (например, при пероральном введении), чем соответствующая активная форма. В некоторых случаях пролекарство может обладать улучшенной растворимостью, по сравнению с соответствующей активной формой. В некоторых вариантах реализации пролекарства менее растворимы в воде, чем соответствующая активная форма. В некоторых случаях такие пролекарства обладают превосходной передачей через клеточные мембраны, при этом растворимость в воде ухудшает их подвижность. В некоторых вариантах реализации пролекарство представляет собой сложный эфир. В некоторых таких вариантах реализации сложный эфир при введении метаболически гидролизуется до карбоновой кислоты. В некоторых случаях соединение, содержащее карбоновую кислоту, представляет собой соответствующую активную форму. В некоторых вариантах реализации пролекарство содержит короткий пептид (полиаминокислоту), связанный с кислотной группой. В некоторых таких вариантах реализации пептид расщепляется при введении с образованием соответствующей активной формы.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены композиции и способы снижения количества или активности целевой нуклеиновой кислоты в клетке. В некоторых вариантах реализации клетка находится в организме животного. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой млекопитающее. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой грызуна. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой примата. В некоторых вариантах реализации животное представляет собой примата, не являющегося человеком. В некоторых вариантах реализации
животное представляет собой человека.
В некоторых вариантах реализации настоящего описания представлены способы введения животному фармацевтической композиции, содержащей олигонуклеотид настоящего описания. Подходящие способы введения включают, но не ограничиваются ими, пероральный, ректальный, трансмукозальный, интестинальный, энтеральный, местный, суппозитории, через ингаляции, интратекальный, интрацеребровентрикулярный, внутрибрюшинный, интраназальный, интраокулярный, внутриопухолевый и парентеральный (например, внутривенный, внутримышечный, интрамедуллярный и подкожный). В некоторых вариантах реализации вводят фармацевтические интратекальные средства для достижения местного, а не системного воздействия. Например, фармацевтические композиции могут быть введены инъекцией непосредственно в область заданного эффекта (например, в печень).
Неограничивающее описание и включение посредством ссылки
Несмотря на то, что некоторые соединения, композиции и способы, описанные в настоящем документе, были подробно описаны в соответствии с некоторыми вариантами реализации изобретения, следующие примеры служат лишь для иллюстрации соединений, описанных в настоящем документе, и их не следует считать их ограничением. Каждая и ссылок, номера доступа GenBank и подобные ссылки, упоминаемые в настоящей заявке, включены в настоящий документ посредством ссылки в полном объеме.
Некоторые соединения, композиции и способы в настоящем документе описаны как «содержащие точно» или «содержащие только» определенное количество конкретных элементов или характеристик. Такие описания использованы для обозначения того, что, хотя соединение, композиция или способ может включать другие дополнительные элементы, количество конкретного элемента или характеристики представляет собой определенное число. Например, «конъюгат, содержащий только один GalNAc» представляет собой конъюгат, который содержит один и только один GalNAc, хотя он может содержать другие элементы, помимо указанного одного GalNAc.
Несмотря на то, что перечень последовательностей, сопровождающий этот файл, указывает каждую последовательность либо как «РНК», либо как «ДНА», по необходимости, в действительности эти последовательности могут быть модифицированы любой
комбинацией химических модификаций. Специалистам в данной области техники понятно, что такое обозначение как «РНК» или «ДНК» для описания модифицированных олигонуклеотидов, является в некоторых случаях произвольным. Например, олигонуклеотид, содержащий нуклеозид, содержащий 2'-ОН сахарный фрагмент и тиминовое основание, может быть описан как ДНК, имеющая модифицированный сахар (2'-ОН вместо природного 2'-Н в ДНК) или как РНК, имеющая модифицированное основание (тимин (метилированный урацил) вместо природного урацила в РНК).
Соответственно, последовательности нуклеиновых кислот, представленные в настоящем документе, включая, но не ограничиваясь ими, последовательности в перечне последовательностей, предназначены для охвата нуклеиновых кислот, содержащих любую комбинацию природных или модифицированных РНК и/или ДНК, включая, но не ограничиваясь ими, такие нуклеиновые кислоты, которые содержат модифицированные нуклеооснования. В качестве дополнительного примера и без ограничения, олигонуклеотид, содержащий последовательность нуклеооснований «ATCGATCG», хватывает любые олигонуклеотиды, имеющие такую последовательность нуклеооснований, модифицированных или немодифицированных, включая, но не ограничиваясь ими, такие соединения, которые содержат РНК основания, такие как те, которые имеют последовательность «AUCGAUCG», и те, которые имеют некоторые ДНК основания и некоторые РНК основания, такие как «AUCGATCG», а также олигонуклеотиды, имеющие другие модифицированные основания, такие как «ATmeCGAUCG», гдеmeC означает цитозиновое основание, содержащее метиловую группу в 5-положении.
Примеры
Следующие примеры иллюстрируют некоторые варианты реализации настоящего описания и не являются ограничивающими. Более того, если представлены конкретные варианты реализации, авторы изобретения подразумевают общее применение указанных конкретных вариантов реализации. Например, описание олигонуклеотида, содержащего конкретный мотив, дает обоснованное основание для дополнительных олигонуклеотидов, содержащих такой же или похожий мотив. И, например, если конкретная высокоаффинная модификация возникает в определенном положении, то в этом же положении считаются подходящими другие высокоаффинные модификации, если не указано иное.
Примеры
Следующие примеры иллюстрируют некоторые варианты реализации настоящего описания и не являются ограничивающими. Более того, если представлены конкретные варианты реализации, авторы изобретения подразумевают общее применение указанных конкретных вариантов реализации. Например, описание олигонуклеотида, содержащего конкретный мотив, дает обоснованное основание для дополнительных олигонуклеотидов, содержащих такой же или похожий мотив. И, например, если конкретная высокоаффинная модификация возникает в определенном положении, то в этом же положении считаются подходящими другие высокоаффинные модификации, если не указано иное.
Пример 1. Общий способ получения фосфорамидитов, Соединений 1, 1а и 2
Соединения 1, 1а и 2 получили по методикам, общеизвестным в данной области техники, описанным в данном описании (см. Seth et al., Bioorg. Med. Chem., 2011, 21(4), 1122-1125, J. Org. Chem., 2010, 75(5), 1569-1581, Nucleic Acids Symposium Series, 2008, 52(1), 553-554); и см. также опубликованные Международные заявки РСТ (WO 2011/115818, WO 2010/077578, WO 2010/036698, WO 2009/143369, WO 2009/006478 и WO 2007/090071) и патент США 7569686).
Соединение 3 (2-ацетамидо-1,3,4,6-тетра-O-ацетил-2-дезокси-β-D-галактопираноза или галактозамина пентаацетат) имеется в продаже. Соединение 5 получили по опубликованным методикам (Weber et al., J. Med. Chem., 1991, 34, 2692).
Пример 3. Получение Соединения 11
Соединения 8 и 9 имеются в продаже.
Пример 4. Получение Соединения 18
Соединение 11 получили по способам, описанным в Примере 3. Соединение 14 имеется в продаже. Соединение 17 получили по такому же способу, как описан в публикации Rensen et al., J. Med. Chem., 2004, 47, 5798-5808.
Пример 1. Получение Соединения 23
Соединения 19 и 21 имеются в продаже.
Пример 6. Получение Соединения 24
Соединения 18 и 23 получили так, как описано в способах в Примерах 4 и 5.
Пример 7. Получение Соединения 25
Соединение 24 получили по способам, представленным в Примере 6.
Пример 8. Получение Соединения 26
Соединение 24 получили по способам, представленным в Примере 6.
Пример 9. Общее получение сопряженных ASO, содержащих GalNAc3-1 у 3'-конца, Соединения 29
Где защищенный GalNAc3-l имеет структуру:
Кластерная часть GalNAc3 группы конъюгата GalNAc3-l (GalNAc3-1a) может быть комбинирована с любым расщепляемым фрагментом с получением различных групп конъюгата. При этом GalNAc3-1a имеет формулу:
Твердую подложку, связывающую защищенный GalNAc3-1, Соединение 25, получили по способам, представленным в Примере 7. Олигомерное Соединение 29, содержащее GalNAc3-1 у 3'-конца, получили по стандартным методика в автоматическом синтезаторе ДНК/РНК (см. Dupouy et al., Angew. Chem. Int. ред., 2006, 45, 3623-3627). Фосфорамидитные строительные блоки, Соединения 1 и 1a, получили по способам, представленным в Примере 1. Изображенные фосфорамидиты являются иллюстративными и не предназначены для ограничения, поскольку могут быть применены другие фосфорамидитные строительные блоки для получения олигомерных соединений, имеющих заданную последовательность и состав. Порядок и количество фосфорамидитов, добавляемых к твердой подложке, может быть подобрано для получения разорванных олигомерных соединений, описанных в настоящем документе. Такие разорванные олигомерные соединения могут иметь заданный состав и последовательность оснований, продиктованную любой данной мишенью.
Пример 10. Общее получение сопряженных ASO, содержащих GalNAc3-1 у 5'-конца, Соединения 34
Unylinker™ 30 имеется в продаже. Олигомерное соединение 34, содержащее кластер GalNAc3-1 у 5'-конца, получили по стандартным способам в автоматическом синтезаторе ДНК/РНК (см. Dupouy et al., Angew. Chem. Int. Ed., 2006, 45, 3623-3627). Фосфорамидитные строительные блоки, Соединения 1 и 1a, получили по способам, представленным в Примере 1. Изображенные фосфорамидиты являются иллюстративными и не предназначены для ограничения, поскольку могут быть применены другие фосфорамидитные строительные блоки для получения олигомерного соединения, имеющего заданную последовательность и состав. Порядок и количество фосфорамидитов, добавляемых к твердой подложке, может быть подобрано для получения разорванных олигомерных соединений, описанных в настоящем документе. Такие разорванные олигомерные соединения могут иметь заданный состав и последовательность оснований, продиктованную любой данной мишенью.
Пример 11. Получение Соединения 39
Соединения 4, 13 и 23 получили по способам, описанным в Примерах 2, 4 и 5. Соединение 35 получили по таким же способам, как описаны в публикации Rouchaud et al., Eur. J. Org. Chem., 2011, 12, 2346-2353.
Пример 12. Получение Соединения 40
Соединение 38 получили по способам, представленным в Примере 11.
Пример 13. Получение Соединения 44
Соединения 23 и 36 получили по способам, представленным в Примерах 5 и 11. Соединение 41 получили по таким же способам, как описаны в публикации WO 2009082607.
Пример 14. Получение Соединения 45
Соединение 43 получили по способам, представленным в Примере 13.
Пример 15. Получение Соединения 47
Соединение 46 имеется в продаже.
Пример 16. Получение Соединения 53
Соединения 48 и 49 имеются в продаже. Соединения 17 и 47 получили так, как описано в способах в Примерах 4 и 15.
Пример 17. Получение Соединения 54
Соединение 53 получили по способам, представленным в Примере 16.
Пример 18. Получение Соединения 55
Соединение 53 получили по способам, представленным в Примере 16.
Пример 19. Общий способ получения сопряженных ASO, содержащих GalNAc3-1 в 3'-положении, при помощи твердофазных методик (получение ISIS 647535, 647536 и 651900)
Если не указано иное, все реагенты и растворы, применяемые для синтеза олигомерных соединений, приобретены у коммерческих поставщиков. Стандартные фосфорамидитные строительные блоки и твердую подложку применили для внедрения нуклеозидных остатков, которые включают, например, остатки Т, A, G иmC.0,1 М раствор
фосфорамидита в безводном ацетонитриле применили для β-D-2'-дезоксирибонуклеозида и 2'-МОЕ.
Синтез антисмысловых олигонуклеотидов (ASO) выполнили на синтезаторе ABI 394 (в масштабе 1-2 мкмоль) или на синтезаторе
После сборки требуемой последовательности цианоэтил-фосфатные защитные группы снимали при помощи 1:1 (об./об.) смеси триэтиламина и ацетонитрила в течение 45 минут времени контакта. Связанные с твердой подложкой ASO суспендировали в водном растворе аммиака (28-30 масс. %) и нагревали при 55°C в течение 6 часов.
Затем отфильтровывали не связанные ASO и выпаривали аммиак кипячением. Остаток очищали жидкостной хроматографией высокого давления на сильной анионообменной колонке (GE Healthcare Bioscience, Source 30Q, 30 мкм, 2,54×8 см, А=100 мМ ацетата аммония в 30% водном CH3CN, В=1,5 М NaBr в А, 0-40% В за 60 мин., скорость потока 14 мл. мин-1, λ=260 нм). Остаток обессоливали при помощи ВЭЖХ на обращенно-фазовой колонке с получением заданных ASO с выделенным выходом 15-30% относительно первоначальной загрузки на твердую подложку. ASO характеризовали при помощи ион-парной ВЭЖХ, совмещенной с MC-анализом на системе Agilent 1100 MSD.
Антисмысловые олигонуклеотиды, не содержащие конъюгат, синтезировали по стандартным способам синтеза олигонуклеотидов, общеизвестным в данной области техники.
Применяя эти способы, получили три отдельных антисмысловых соединения, направленных на АроС III. Как показано ниже в Таблице 17, каждое из трех антисмысловых соединений, направленных на АроС III, имеет одну и ту же последовательность нуклеооснований. ISIS 304801 представляет собой 5-10-5 МОЕ гэпмер, содержащий только тиофосфатные связи; ISIS 647535 является таким же, как ISIS 304801, за исключением того, что он содержит GalNAc3-1, сопряженный у его 3'-конца; и ISIS 647536 является таким же, как ISIS 647535, за исключением того, что некоторые межнуклеозидные связи этого соединения представляют собой фосфодиэфирные связи. Как дополнительно показано в Таблице 17, были синтезированы два отдельных антисмысловых соединения, направленных на SRB-1. ISIS 440762 представляет собой 2-10-2 cEt гэпмер, содержащий только тиофосфатные межнуклеозидные связи; ISIS 651900 является таким же, как ISIS 440762, за исключением того, что он содержит GalNAc3-1 у его 3'-конца.
Нижние индексы: «е» означает 2'-МОЕ модифицированный нуклеозид; «d» означает β-D-2'-дезоксирибонуклеозид; «k» означает 6'-(S)-СН3 бициклический нуклеозид (например, cEt); «s» означает тиофосфатные межнуклеозидные связи (PS); «о» означает фосфодиэфирные межнуклеозидные связи (РО); и «o'» означает -O-Р(=O)(ОН)-. Верхний индекс «m» означает 5-метилцитозины. «GalNAc3-1» означает группу конъюгата, имеющую структуру,
изображенную ранее в Примере 9. Следует отметить, что GalNAc3-1 содержит расщепляемый аденозин, который связывает ASO с остальной частью конъюгата, который обозначен как «GalNAc3-1a». Номенклатура, используемая в представленной выше таблице, показывает полную последовательность нуклеооснований, включая аденозин, который является частью конъюгата. Следовательно, в представленной выше таблице последовательности также могут быть перечислены с окончанием «GalNAc3-1», без «Ado». Такое условное применение нижнего индекса «а» для обозначения части группы конъюгата, не содержащей расщепляемого нуклеозида или расщепляемого фрагмента, используется во всех представленных Примерах. Эта часть группы конъюгата, не содержащая расщепляемого фрагмента, упоминается в настоящем документе как «кластер» или «кластер конъюгата» или «кластер GalNAc3». В некоторых случаях группа конъюгата для удобства описана путем отдельного представления ее кластера и ее расщепляемого фрагмента.
Пример 20. Дозозависимое антисмысловое ингибирование человеческого ApoC III у huApoC III трансгенных мышей
ISIS 304801 и ISIS 647535, каждый из которых направлен на человеческий ApoC III и описан выше, отдельно испытывали и оценивали в дозозависимом исследовании на их способность ингибировать человеческий АроС III у трансгенных мышей с человеческим АроС III.
Лечение
Трансгенных мышей с человеческим ApoCIII выдерживали при 12-часовом цикле освещения/темноты и обеспечивали свободный доступ к пище Teklad lab. До начала эксперимента животных акклиматизировали по меньшей мере в течение 7 дней в исследовательской лаборатории. Приготовили ASO в PBS и стерилизовали фильтрованием через фильтр 0,2 микрона. ASO растворили в 0,9% PBS для инъекций.
Трансгенным мышам с человеческим АроС III один раз в неделю в течение двух неделю внутрибрюшинно вводили инъекции ISIS 304801 или 647535 при 0,08, 0,25, 0,75, 2,25 или 6,75 мкмоль/кг или PBS в качестве контрольного образца. Каждая экспериментальная группа состояла из 4 животных. Через сорок восемь часов после введения последней дозы каждую мышь обескровили и умертвили, и собрали ткани.
Анализ мРНК ApoC III
Уровни мРНК ApoC III в печени мышей определили при помощи ПЦР в реальном времени и реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN® (Molecular Probes, Inc. Юджин, штат Орегон) по стандартным протоколам. Уровни мРНК АроС III определяли относительно общей РНК (при помощи Ribogreen), затем нормализовали к контрольному образцу, обработанному PBS. Результаты, показанные ниже, представлены как средний процент уровней мРНК АроС III для каждой экспериментальной группы, нормализованных к контрольному образцу, обработанному PBS, и обозначены как «%PBS». Ниже в Таблице 18 представлена также полумаксимальная эффективная доза (ED50) для каждого ASO.
Показано, что оба антисмысловых соединения снижают РНК АроС III, по сравнению с контрольным образцом, обработанным PBS. Кроме того, антисмысловое соединение сопряженное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801).
Анализ белка АроС III (турбидиметрический анализ)
Анализ белка АроС III в плазме выполнили по способам, описанным в работе Graham et al, Circulation Research, до печати опубликованной онлайн 29 марта 2013 года.
Приблизительно 100 мкл плазмы, выделенной из мышей, анализировали без разбавления, применяя клинический анализатор Olympus и имеющийся в продаже турбидиметрический аналитический набор АроС III (Kamiya, кат. №KAI-006, Kamaya Biomedical, Сиэтл, штат Вашингтон). Протокол анализа выполняли по описанию поставщика.
Как показано ниже в Таблице 19, оба антисмысловых соединения снижают белок АроС III, по сравнению с PBS контрольным образцом. Кроме того, антисмысловое соединение, сопряженное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801).
Триглицериды и холестерин плазмы выделили по способу Bligh и Dyer (Bligh, E.G. and Dyer, W.J. Can. J. Biochem. Physiol. 37: 911-917, 1959) (Bligh, E and Dyer, W, Can J Biochem Physiol, 37, 911-917, 1959) (Bligh, E and Dyer, W, Can J Biochem Physiol, 37, 911-917, 1959; и измерили при помощи клинического анализатора Beckmann Coulter и имеющихся в продаже реагентов.
Уровни триглицеридов измерили относительно мышей, инъецированных PBS, и выразили как «% PBS». Результаты представлены в Таблице 20. Показано, что оба антисмысловых соединения снижают уровни триглицеридов. Кроме того, антисмысловое соединение, сопряженное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801).
Образцы плазмы анализировали при помощи ВЭЖХ для определения количества общего холестерина и различных фракций холестерина (HDL и LDL). Результаты
представлены в Таблицах 21 и 22. Показано, что оба антисмысловых соединения снижают общие уровни холестерина; оба снижают LDL; и оба повышают HDL. Кроме того, антисмысловое соединение, сопряженное с GalNAc3-1 (ISIS 647535), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 304801). Увеличение уровней HDL и снижение уровней LDL представляет собой преимущественный сердечно-сосудистый эффект антисмыслового ингибирования АроС III.
Фармакокинетический анализ (ФК)
Оценили также ФК ASO. Образцы печени и почек измельчили и экстрагировали по стандартным протоколам. Образцы анализировали на MSD1 при помощи ИП-ВЭЖХ-МС. Определили содержание (мкг/г) в ткани ISIS 304801 и 647535 полной длины, и результаты представлены в Таблице 23. Показано, что концентрации в печени антисмысловых соединений полной длины были схожими для двух антисмысловых соединений. Следовательно, даже несмотря на то, что GalNAc3-1-сопряженное антисмысловое соединение является более активным в печени (как показано по данным РНК и белка, представленным выше), его содержание в печени не намного выше. Действительно, рассчитанное значение ЕС50 (представленное в Таблице 23) подтверждает, что наблюдаемое увеличение эффективности сопряженного соединения не может быть приписано исключительно повышенному накоплению. Такой результат позволяет предположить, что конъюгат улучшает эффективность по другому механизму, чем простое накопление в печени, возможно за счет увеличения продуктивного захвата антисмыслового соединения в клетки.
Эти результаты показывают также, что концентрация CalNaAc3-1-сопряженного антисмыслового соединения почках ниже, чем концентрация антисмыслового соединения, не содержащего конъюгата GalNAc. Это имеет несколько преимущественных терапевтических применений. Для терапевтических показаний, в которых не требуется проявление активности в почках, воздействие на почки подвергает их риску токсичности без соответствующей пользы. Более того, высокая концентрация в почках обычно приводит к выводу соединения с мочой, обеспечивая более быстрое выведение. Соответственно, для внепочечных мишеней
накопление в почках является нежелательным. Эти данные позволяют предположить, что сопряжение с GalNAc3-1 снижает накопление в почках.
Идентифицировали также метаболиты ISIS 647535 и подтвердили их массы при помощи масс-спектрометрического анализа высокого разрешения. Сайты расщепления и структуры наблюдаемых метаболитов представлены ниже. Относительный % от общей длины ASO рассчитали по стандартным приемам, а результаты представлены в Таблице 23а. Основной метаболит ISIS 647535 представляет собой ASO полной длины без всего конъюгата (то есть ISIS 304801), который образуется в результате расщепления по сайту расщепления А, представленному ниже. Кроме того, наблюдали также дополнительные метаболиты, образующиеся из других сайтов расщепления. Эти результаты позволяют предположить, что может быть пригодным также внедрение других расщепляемых связей, таких как сложные эфиры, пептиды, дисульфиды, фосфорамидаты или ацил-гидразоны, между сахаром GalNAc3-1 и ASO, которые могут расщепляться под действием ферментов внутри клетки или которые могут расщепляться в восстановительной среде цитозоля, или которые лабильны в кислотном pH внутри эндосом и лизосом.
Пример 21. Антисмысловое ингибирование человеческого АроС III у трансгенных мышей с АроС III в исследовании одного введения
ISIS 304801, 647535 и 647536, каждый из которых направлен на человеческий АроС III и описан в Таблице 17, дополнительно оценивали в исследовании однокраного введения на их способность ингибировать человеческий АроС III у трансгенных мышей с человеческим АроС III.
Лечение
Трансгенных мышей с человеческим ApoCIII выдерживали при 12-часовом цикле освещения/темноты и обеспечивали свободный доступ к пище Teklad lab. До начала эксперимента животных акклиматизировали по меньшей мере в течение 7 дней в исследовательской лаборатории. Приготовили ASO в PBS и стерилизовали фильтрованием через фильтр 0,2 микрона. ASO растворили в 0,9% PBS для инъекций.
Трансгенным мышам с человеческим АроС III внутрибрюшинно ввели однократную инъекцию дозы, представленной ниже, соединения ISIS 304801, 647535 или 647536 (описанных выше), или PBS в качестве контрольного образца. Экспериментальная группа состояла из 3 животных, а контрольная группа состояла из 4 животных. Перед лечением, а также после последней дозы у каждой мыши брали кровь и анализировали образцы плазмы. Мышей умертвили через 72 часа после последнего введения.
Образцы собрали и анализировали для определения уровней мРНК АроС III и белка в печени; триглицеридов в плазме; и холестерина, включая фракции HDL и LDL, которые анализировали так, как описано выше (Пример 20). Данные этих анализов представлены ниже в Таблицах 24-28. Уровни трансаминазы в печени, аланин-аминотрансферазы (ALT) и аспартат-аминотрансферазы (AST) в сыворотке измеряли относительно мышей, инъецированных солевым раствором, применяя стандартные протоколы. Уровни ALT и AST показали, что антисмысловые соединения хорошо переносятся при всех введенных дозах.
Эти результаты демонстрируют усиление эффективности антисмысловых соединений, содержащих конъюгат GalNAc3-1 у 3'-конца (ISIS 647535 и 647536), по сравнению с антисмысловым соединением, не содаржащим конъюгат GalNAc3-1 (ISIS
304801). Кроме того, ISIS 647536, который содержит конъюгат GalNAc3-1 и несколько фосфодиэфирных связей, был таким же эффективным, как ISIS 647535, который содержит тот же конъюгат, и все межнуклеозидные связи в этом ASO являются тиофосфатными.
Эти результаты подтверждают, что конъюгат GalNAc3-1 улучшает эффективность антисмыслового соединения. Эти результаты показывают также равную эффективность GalNAc3-1-сопряженных антисмысловых соединений, в которых антисмысловые олигонуклеотиды имеют смешанные связи (ISIS 647536, который имеет шесть фосфодиэфирных связей), и полностью тиофосфатной версии того же антисмыслового соединения (ISIS 647535).
Тиофосфатные связи обеспечивают несколько свойств антисмысловых соединений. Например, они устойчивы к нуклеазному расщеплению и связываются с белками, что приводит к накоплению соединения в печени, а не в почках/моче. Эти свойства являются
желательными, особенно при лечении показаний в печени. Однако тиофосфатные связи связаны также с воспалительной реакцией. Соответственно, уменьшение количества тиофосфатных связей в соединении предположительно снижает риск воспаления, но снижает также концентрацию соединения в печени, повышает концентрацию в почках и моче, снижает стабильность в присутствии нуклеаз и уменьшает общую эффективность. Представленные результаты демонстрируют, что GalNAc3-1-сопряженное антисмысловое соединение, в котором некоторые тиофосфатные связи заменены фосфодиэфирными связями, настолько же эффективно против мишени в печени, как и аналог, содержащий только тиофосфатные связи. Такие соединения предположительно являются менее провоспалительными (см. Пример 24, в котором описан эксперимент, демонстрирующий, что уменьшение тиофосфатов (PS) приводит к снижению воспалительного действия).
Пример 22. Влияние модифицированного GalNAc3-1-сопряженного ASO, направленного на SRB-1, in vivo
ISIS 440762 и 651900, каждый из которых направлен на SRB-1 и описан в Таблице 17, оценили в дозозависимом исследовании на их способность ингибировать SRB-1 у Balb/c мышей.
Лечение
Шестинедельным самцам мышей Balb/c (Jackson Laboratory, Бар-Харбор, штат Мэн) ввели однократную подкожную инъекцию дозы, представленной ниже, соединения IS IS 440762, 651900 или PBS в качестве контрольного образца. Каждая экспериментальная группа состояла из 4 животных. Мышей умертвили через 48 часов после последнего введения для определения уровней мРНК SRB-1 в печени при помощи ПЦР в реальном времени и реагента для количественного определения РНК RIBOGREEN® (Molecular Probes, Inc., Юджин, штат Орегон) по стандартным протоколам. Уровни мРНК SRB-1 определяли относительно общей РНК (при помощи Ribogreen), затем нормализовали к контрольному образцу, обработанному PBS. Результаты, показанные ниже, представлены как средний процент уровней мРНК SRB-1 для каждой экспериментальной группы, нормализованных к контрольному образцу, обработанному PBS, и обозначены как «% PBS».
Как показано в Таблице 29, оба антисмысловых соединения снижают уровни мРНК SRB-1. Кроме того, антисмысловое соединение, содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 651900), было значительно более эффективным, чем антисмысловое соединение, не содержащее конъюгат GalNAc3-1 (ISIS 440762). Эти результаты демонстрируют, что преимущество эффективности конъюгатов GalNAc3-1 наблюдается при применении антисмысловых олигонуклеотидов, комплементарных различным мишеням и имеющих различные химически модифицированные нуклеозиды, в этом случае модифицированные нуклеозиды содержат затрудненные этил-сахарные фрагменты (бициклический сахарный фрагмент).
Пример 23. Протокол анализа человеческих мононуклеарных клеток периферической крови (hPBMC)
Анализ hPBMC выполнили при помощи пробирочного способа BD Vautainer CPT. Получили образец цельной крови, полученной от доноров-добровольцев, давших информированное согласие в Медицинской клинике США (Faraday & El Camino Real, Карлсбад), и собрали его в 4-15 пробирки BD Vacutainer СРТ по 8 мл (VWR. кат. №BD362753). Приблизительный исходный общий объем цельной крови в пробирка СРТ для каждого донора записали в формуляре анализа РВМС.
Перед центрифугированием образец крови незамедлительно повторно перемешали, осторожно переворачивая пробирки 8-10 раз. Пробирки СРТ центрифугировали при комнатной температуре (18-25°C) в горизонтальном (с избыточной поворачиваемостью) роторе в течение 30 минут с фактором разделения (RCF) 1500-1800 с затормаживанием (2700 об./мин. Beckman Allegra 6R). Клетки сняли с лейкоцитарной поверхности раздела (между слоями фиколла и полимерного геля); перенесли в стерильную 50 мл коническую пробирку и сгруппировали по 5 СРТ пробирок/50 мл коническая пробирка/донор. Затем клетки дважды промыли PBS (без Са++, Mg++; GIBCO). Пробирки пополнили до 50 мл и перемешали, переворачивая несколько раз. Затем образец центрифугировали при 330×g в течение 15 при комнатной температуре (1215 об./мин в Beckman Allegra 6R) и аспирировали максимальное количество надосадочной жидкости, не нарушая осадок. Клеточный осадок сняли, осторожно поворачивая пробирку, и повторно суспендировали клетки в RPMI + 10% FBS + пенициллин/стрептомицин (~ 1 мл / 10 мл исходного объема цельной крови). Пипеткой взяли 600 мкл образца и поместили во флакон с пробой (Beckman Coulter), содержащий 600 мкл реагента VersaLyse (Beckman Coulter, кат. №А09777), и осторожно перемешивали на вортексе в течение 10-15 секунд. Образец оставили инкубироваться в течение 10 минут при комнатной температуре, и снова перемешали перед подсчетом. Суспензию клеток считывали на анализаторе жизнеспособности клеток Vicell XR (Beckman Coulter), используя клетки типа РВМС (сохранили фактор разбавления 1:11 с другими параметрами). Записали количество живых клеток/мл и жизнеспособность. Клеточную суспензию разбавили до 1×107 живых РВМС/мл в RPMI + 10% FBS + пенициллин/стрептомицин.
Клетки поместили на планшет при 5×105 в 50 мкл/лунку 96-луночного тканевого культурального планшета (Falcon Microtest). 50 мкл/лунку 2х концентрации олигомеров/контроля, разбавленных в RPMI + 10% FBS + пенициллин/стрептомицин, добавили в соответствии с экспериментальной матрицей (в целом 100 мкл/лунку). Планшеты поместили на шейкер и оставили перемешиваться приблизительно на 1 минуту. После инкубации в течеие 24 часов при 37°C; 5% CO2, планшеты центрифугировали при 400×g в течение 10 минут, затем удалили надосадочную жидкость для анализа цитокинов MSD (то есть человеческих IL-6, IL-10, IL-8 и МСР-1).
Пример 24. Оценка провоспалительных эффектов в анализе hPBMC для GalNAc3-1-сопряженных ASO
Антисмысловые олигонуклеотиды (ASO), перечисленные в Таблице 30, оценили на провоспалительное действие в анализе hPBMC, используя протокол, описанный в Примере 23. ISIS 353512 представляет собой внутренний стандарт, который, как известно, обладает высоким ответом на высвобождение IL-6 в этом анализе. hPBMC выделили из свежых образцов, полученных от доноров-добровольцев, и обработали ASO в концентрациях 0, 0,0128, 0,064, 0,32, 1,6, 8, 40 и 200 мкМ. Через 24 часа обработки измерили уровни цитокинов.
Уровни IL-6 применили в качестве первичного показания. EC50 и Emax рассчитали по стандартным способам. Результаты выразили как среднее отношение Emax/EC50 для двух доноров и обозначили как «Emax/EC50». Более низкое соотношение означает относительное снижение провоспалительного ответа, а более высокое соотношение означает относительное увеличение провоспалительного ответа.
В отношении исследуемых соединений, наименее провоспалительным соединением было ASO, соединенное при помощи PS/PO (ISIS 616468). GalNAc3-1-сопряженное ASO, ISIS 647535, было немного менее провоспалительным, чем его несопряженный аналог, ISIS 304801. Эти результаты показывают, что внедрение нескольких РО связей снижает провоспалительную реакцию, а добавление конъюгата GalNAc3-1 не делает соединение более провоспалительным, и может снижать провоспалительную реакцию. Соответственно, можно ожидать, что антисмысловое соединение, содержащее смешанные PS/PO связи и конъюгат GalNAc3-1, может вызывать более слабые провоспалительные реакции, по сравнению с антисмысловым соединением, связанным только посредством PS, с конъюгатом GalNAc3-1 или без него. Эти результаты показывают, что GalNAc3-1-сопряженные антисмысловые соединения, в частности, соединения, имеющие меньшее содержание PS, являются менее провоспалительными.
В целом, эти результаты позволяют предположить, что GalNAc3-1-сопряженное соединение, в частности, соединение со сниженным содержанием PS, может быть введено в более высокой дозе, чем аналогичное полностью PS антисмысловое соединение без
конъюгата GalNAc3-1. Поскольку не ожидается, что период полувыведения для этих соединений будет существенно различаться, то такое введение в более высокой дозе обусловит менее частое введение доз. В действительности, такое введение может быть еще более редким, поскольку GalNAc3-1-сопряженные соединения являются более эффективными (см. Примеры 20-22), а повторное введение дозы необходимо только при снижении концентрации соединения ниже заданного уровня, при этом такой заданный уровень обусловлен эффективностью.
Нижние индексы: «е» означает 2'-МОЕ модифицированный нуклеозид; «d» означает β-D-2'-дезоксирибонуклеозид; «k» означает 6'-(S)-СН3 бициклический нуклеозид (например, cEt); «s» означает тиофосфатные межнуклеозидные связи (PS); «o» означает фосфодиэфирные межнуклеозидные связи (РО); и «o'» означает -O-P(=O)(ОН)-. Верхний индекс «m» означает 5-метилцитозины. «Ado'-GalNAc3-1a» означает конъюгат, имеющий структуру GalNAc3-1, представленную в Примере 9, присоединенный к 3'-концу указанного антисмыслового олигонуклеотида.
Пример 25. Влияние модифицированного GalNAc3-1-сопряженного ASO, направленного на человеческий АроС III, in vitro
ISIS 304801 и 647535, описанные выше, испытали in vitro. Первичные гепатоцитарные клетки трансгенных мышей при плотности 25000 клеток на лунку обработали концентрациями 0,03, 0,08, 0,24, 0,74, 2,22, 6,67 и 20 мкМ модифицированных олигонуклеотидов. После обработки в течение приблизительно 16 часов, из клеток выделили РНК и измерили уровни мРНК при помощи количественной ПЦР в реальном времени, а уровни мРНК hApoC III скорректировали в соответствии с общим содержанием РНК, измеренным при помощи RIBOGREEN.
IC50 рассчитали по стандартным способам, а результаты представлены в Таблице 32. Показано, что наблюдали сравнимую эффективность в клетках, обработанных ISIS 647535, по сравнению с контрольным образцом, ISIS 304801.
В этом эксперименте in vitro не наблюдали такого большого преимущества эффективности сопряжения с GalNAc3-1, как наблюдали in vivo. Последующие эксперименты свободного захвата в первичных гепатоцитах in vitro не показали повышенной эффективности олигонуклеотидов, содержащих различные конъюгаты GalNAc, по сравнению с олигонуклеотидами, не содержащими конъюгаты GalNAc (см. Примеры 60, 82 и 92).
Пример 26. Влияние связей PO/PS на кативность ASO в отношении АроС III
Трансгенным мышам с человеческим АроС III внутрибрюшинной инъекцией вводили 25 мг/кг ISIS 304801 или ISIS 616468 (оба описаны выше) или PBS в качестве контрольного образца, один раз в неделю в течение двух недель. Экспериментальная группа состояла из 3 животных, а контрольная группа состояла из 4 животных. Перед лечением, а также после последней дозы у каждой мыши брали кровь и анализировали образцы плазмы Мышей умертвили через 72 часа после последнего введения.
Образцы собрали и анализировали для определения уровней белка АроС III в печени, как описано выше (Пример 20). Данные этих анализов представлены ниже в Таблице 33.
Эти результаты демонстрируют снижение эффективности антисмысловых соединений с PO/PS (ISIS 616468) в крыльях, по сравнению с соединениями, содержащими только PS (ISIS 304801).
Пример 27. Соединение 56
Соединение 56 имеется в продаже у компании Glen Research или может быть получено по опубликованным методикам, описанным авторами Shchepinov et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4447-4454.
Пример 28. Получение Соединения 60
Соединение 4 получили по способам, описанным в Примере 2. Соединение 57 имеется в продаже. Соединение 60 подтвердили структурным анализом.
Соединение 57 является иллюстративным, и его не следует считать ограничивающим, поскольку могут быть применены другие монозащищенные замещенные или незамещенные алкилдиолы, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые представлены в данном описании, для получения фосфорамидитов, имеющих заданный состав.
Пример 29. Получение Соединения 63
Соединения 61 и 62 получили по таким же способам, как описаны авторами Tober et al., Eur. J. Org. Chem., 2013, 3, 566-577; и Jiang et al., Tetrahedron, 2007, 63(19), 3982-3988.
Альтернативно, Соединение 63 получили по таким же способам, как описаны в научной и патентной литературе авторами Kim et al., Synlett, 2003, 12, 1838-1840; и Kim et al., в опубликованной Международной заявке PCT WO 2004063208.
Пример 30. Получение Соединения 63b
Соединение 63а получили по таким же способам, как описаны авторами Hanessian et al., Canadian Journal of Chemistry, 1996, 74(9), 1731-1737.
Пример 31. Получение Соединения 63d
Соединение 63c получили по таким же способам, как описаны авторами Chen et al., Chinese Chemical Letters, 1998, 9(5), 451-453.
Пример 32. Получение Соединения 67
Соединение 64 получили по способам, представленным в Примере 2. Соединение 65 получили по таким же способам, как описаны авторами Or et al., в опубликованной
Международной заявке PCT WO 2009003009. Защитные группы, применяемые для Соединения 65, являются иллюстративными, и их не следует считать ограничением, поскольку могут быть применены другие защитные группы, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые представлены в данном описании.
Пример 33. Получение Соединения 70
Соединение 64 получили по способам, описанным в Примере 2. Соединение 68 имеется в продаже. Защитная группа, примененная для Соединения 68, является иллюстративной, и ее не следует считать ограничением, поскольку могут быть применены другие защитные группы, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые представлены в данном описании.
Пример 34. Получение Соединения 75а
Соединение 75 получили по опубликованным методикам, описанным авторами Shchepinov et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4447-4454.
Пример 35. Получение Соединения 79
Соединение 76 получили по опубликованным методикам, описанным авторами Shchepinov et al., Nucleic Acids Research, 1997, 25(22), 4447-4454.
Пример 36. Получение Соединения 79а
Соединение 77 получили по способам, представленным в Примере 35.
Пример 37. Общий способ получения сопряженного олигомерного соединения 82, содержащего фосфодиэфир-связанный конъюгат GalNAc3-2 у 5'-конца, на твердой подложке (Способ I)
где GalNAc3-2 имеет структуру:
Кластерная часть GalNAc3 группы конъюгата GalNAc3-2 (GalNAc3-2a) может быть комбинирована с любым расщепляемым фрагментом с получением различных групп конъюгата. При этом GalNAc3-2a имеет формулу:
VIMAD-связанное олигомерное соединение 79b получили по стандартным способам в автоматическом синтезаторе ДНК/РНК (см. Dupouy et al., Angew. Chem. Int. Ed., 2006, 45, 3623-3627). Фосфорамидитные Соединения 56 и 60 получили так, как описано в способах в Примерах 27 и 28, соответственно. Изображенные фософорамидиты являются иллюстративными, и их не следует считать ограничением, поскольку могут быть применены другие фосфорамидитные строительные блоки, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые представлены в данном описании, для получения олигомерного соединения, содержащего фосфодиэфир-связанную группу конъюгата у 5'-конца. Порядок и количество фосфорамидитов, добавляемых к твердой подложке, может быть подобрано для получения олигомерных соединений, описанных в настоящем документе, которые имеют любую заданную последовательность и состав.
Пример 38. Альтернативный способ получения олигомерного соединения 82, содержащего фосфодиэфир-связанный конъюгат GalNAc3-2 у 5'-конца (Способ II)
VIMAD-связанное олигомерное соединение 79b получили по стандартным способам в автоматическом синтезаторе ДНК/РНК (см. Dupouy et al., Angew. Chem. Int. Ed., 2006, 45,
3623-3627). GalNAc3-2-кластерный фосфорамидит, Соединение 79, получили по способам, представленным в Примере 35. Альтернативный способ обеспечивает возможность одностадийной установки фосфодиэфир-связанного GalNAc3-2 конъюгата на олигомерное соединение на последней стадии синтеза. Изображенные фософорамидиты являются иллюстративными, и их не следует считать ограничением, поскольку могут быть применены другие фосфорамидитные строительные блоки, включая, но не ограничиваясь ими, те, которые представлены в данном описании, для получения олигомерных соединений, содержащих фосфодиэфирный конъюгат у 5'-конца. Порядок и количество фосфорамидитов, добавляемых к твердой подложке, может быть подобрано для получения олигомерных соединений, описанных в настоящем документе, которые имеют любую заданную последовательность и состав.
Пример 39. Общий способ получения олигомерного соединения 83h, содержащего конъюгат GalNAc3-3 у 5'-конца (GalNAc3-1, модифицированный для 5'-концевого присоединения), на твердой подложке
Изобретение относится к области биотехнологии и медицине. Предложено соединение, сопряженное с тремя N-ацетилгалактозаминовыми лигандами. Соединение имеет структуру XXVI:где Тпредставляет собой группу, содержащую нуклеозид, нуклеотид, мономерную субъединицу, реакционноспособный сложный эфир, линкер, расщепляемый фрагмент или олигомерное соединение. Соединение обладает улучшенной активностью в клетках печени in vivo и пригодно для применения в способе лечения метаболического расстройства или в способе лечения сердечно-сосудистого расстройства. 15 з.п. ф-лы, 120 табл., 112 пр.