Гомогенный анализ связывания биополимеров путем множественных измерений приварьирующих условиях - RU2004105151A

Реферат

1. Способ анализа последовательность-специфичной гибридизации, включающий обеспечение мишени, включающей, по меньшей мере, одну биополимерную последовательность-мишень; обеспечение зонда, включающего, по меньшей мере, одну биополимерную последовательность зонда; добавление указанного зонда и указанной мишени в среду связывания для обеспечения тестируемого образца; подачу первого стимула (стимулирующего воздействия) на указанный тестируемый образец для получения первого стимулированного тестируемого образца; детекцию первого сигнала от указанного первого стимулированного тестируемого образца, при этом указанный первый сигнал коррелирует со сродством связывания между указанным зондом и указанной мишенью; подачу второго стимула на указанный первый стимулированный тестируемый образец для обеспечения второго стимулированного тестируемого образца; детекцию второго сигнала от указанного второго стимулированного тестируемого образца, при этом указанный второй сигнал коррелирует со сродством связывания между указанным зондом и указанной мишенью; и сравнение указанного первого сигнала и указанного второго сигнала для выполнения анализа; причем в указанном тестируемом образце обеспечивается, по меньшей мере, одна метка, и указанный первый стимул, указанный второй стимул, указанный первый сигнал и указанный второй сигнал представляют собой электромагнитное излучение, при условии, что в случае, когда указанный первый стимул и указанный второй стимул представляют собой фотонное излучение, то промежуточный электронный стимул подается на указанный тестируемый образец после указанного первого стимула и перед указанным вторым стимулом, а в случае, когда указанный первый стимул и указанный второй стимул представляют собой электронное излучение, то указанный первый сигнал и указанный второй сигнал представляют собой электрический ток.

2. Способ по п.1, в котором указанный первый стимул является фотонным, а указанный второй стимул - электронным.

3. Способ по п.1, в котором указанный первый стимул является фотонным и указанный второй стимул является фотонным.

4. Способ по п.1, в котором указанный первый стимул является электронным, а указанный второй стимул - фотонным.

5. Способ по п.1, в котором указанный первый стимул является электронным и указанный второй стимул является электронным.

6. Способ по п.1, в котором подача указанного второго стимула, по меньшей мере, частично совпадает с подачей указанного первого стимула.

7. Способ по п.1, в котором указанный первый сигнал является фотонным, а указанный второй сигнал - электронным.

8. Способ по п.1, в котором указанный первый сигнал является фотонным и указанный второй сигнал является фотонным.

9. Способ по п.1, в котором указанный первый сигнал является электронным, а указанный второй сигнал - фотонным.

10. Способ по п.1, в котором указанный первый сигнал является электронным и указанный второй сигнал является электронным.

11. Способ по п.1, в котором указанное электромагнитное излучение выбрано из группы, состоящей из фотонного излучения и электронного излучения.

12. Способ по п.11, в котором указанное фотонное излучение представляет собой лазерный луч.

13. Способ по п.11, в котором указанное электронное излучение представляет собой электрическое напряжение.

14. Способ по п.1, в котором указанная, по меньшей мере, одна метка передает энергию, по меньшей мере, на одну другую метку для формирования, по меньшей мере, одного из указанного первого сигнала и указанного второго сигнала.

15. Способ по п.1, в котором указанная, по меньшей мере, одна метка является хемилюминесцентной или электрохемилюминесцентной.

16. Способ по п.1, в котором указанная, по меньшей мере, одна метка является электронной спиновой меткой.

17. Способ по п.1, в котором указанная биополимерная последовательность-зонд и указанная биополимерная последовательность-мишень содержат нуклеиновые основания, и указанный зонд специфически гибридизуется с указанной мишенью с образованием дуплекса.

18. Способ по п.1, в котором указанная биополимерная последовательность-зонд и указанная биополимерная последовательность-мишень содержат нуклеиновые основания, и указанный зонд специфически гибридизуется с указанной мишенью с образованием триплекса.

19. Способ по п.1, в котором указанная биополимерная последовательность-зонд и указанная биополимерная последовательность-мишень содержат нуклеиновые основания, и указанный зонд специфически гибридизуется с указанной мишенью с образованием квадруплекса.

20. Способ по п.1, в котором указанный зонд является аналогом нуклеиновой кислоты, содержащим, по меньшей мере, либо незаряженный остов, либо частично заряженный остов, либо катионный компонент, либо поперечно-сшивающий агент, либо поперечно-сшивающую боковую цепь или аналог нуклеиновых оснований.

21. Способ по п.1, в котором, по меньшей мере, одна из указанной биополимерной последовательности-зонда и указанной биополимерной последовательности-мишени содержит последовательность аминокислот.

22. Способ по п.1, дополнительно включающий подачу, по меньшей мере, одного дополнительного стимула на указанный второй стимулированный тестируемый образец для обеспечения дополнительно стимулированного тестируемого образца; детекцию, по меньшей мере, одного дополнительного сигнала от указанного дополнительно стимулированного тестируемого образца, при этом указанный, по меньшей мере, один дополнительный сигнал коррелирует со сродством связывания между указанным зондом и указанной мишенью; и сравнение указанного первого сигнала, указанного второго сигнала и указанного, по меньшей мере, одного дополнительного сигнала для выполнения анализа.

23. Способ по п.22, в котором указанный первый стимул, указанный второй стимул и указанный, по меньшей мере, один дополнительный стимул отличаются друг от друга.

24. Способ по п.22, в котором, по меньшей мере, один из указанного первого стимула, указанного второго стимула и указанного, по меньшей мере, одного дополнительного стимула подается прерывистым образом.

25. Способ по п.1, в котором, по меньшей мере, один из указанного первого стимула и указанного второго стимула подается прерывистым образом.

26. Способ по п.1, в котором, по меньшей мере, один из указанного зонда и указанной мишени прикреплен к субстрату, поверхности, перегородке, мембране или электроду.

27. Способ анализа последовательность-специфичной гибридизации, включающий обеспечение мишени; обеспечение зонда, при этом, по меньшей мере, один из указанного зонда и указанной мишени содержит, по меньшей мере, одну биополимерную последовательность; добавление указанного зонда и указанной мишени в среду связывания для обеспечения тестируемого образца; подачу первого стимула на указанный тестируемый образец для обеспечения первого стимулированного тестируемого образца; детекцию первого сигнала от указанного первого стимулированного тестируемого образца, при этом указанный первый сигнал коррелирует со сродством связывания между указанным зондом и указанной мишенью; подачу второго стимула на указанный первый стимулированный тестируемый образец для обеспечения второго стимулированного тестируемого образца; детекцию второго сигнала от указанного второго стимулированного тестируемого образца, при этом указанный второй сигнал коррелирует с указанным сродством связывания между указанным зондом и указанной мишенью; и сравнение указанного первого сигнала и указанного второго сигнала для выполнения указанного анализа; причем в указанном тестируемом образце обеспечивается, по меньшей мере, одна метка, и указанный первый стимул, указанный второй стимул, указанный первый сигнал и указанный второй сигнал представляют собой электромагнитное излучение, при условии, что в случае, когда указанный первый стимул и указанный второй стимул представляют собой фотонное излучение, то промежуточный электронный стимул подается на указанный тестируемый образец после указанного первого стимула и перед указанным вторым стимулом, а в случае, когда указанный первый стимул и указанный второй стимул представляют собой электронное излучение, то указанный первый сигнал и указанный второй сигнал представляют собой электрический ток.

28. Способ по п.27, в котором, по меньшей мере, один из указанного зонда и указанной мишени представляет собой белок, пептид или липидную мембрану.

29. Способ по п.27, в котором либо зонд, либо мишень не является биополимером.