Пептиды, включающие в себя домен, связывающий субъединицу вирусного фосфопротеина (р) с вирусным нуклеопротеином (n0), не содержащим рнк - RU2017101210A
Код документа: RU2017101210A
Формула
1. Выделенный пептид, состоящий не более чем из 100 аминокислот, содержащий аминокислотную последовательность формулы (I):
валин-Хаа1-Хаа2-глицин-лейцин-Хаа3-Хаа4-Хаа5-Хаа6-Хаа7-Хаа8, где
Хаа1 представляет собой глутамин (Q), серии (S), аспарагин (N), лизин (K) или эквивалентную полярную аминокислоту,
Хаа2 представляет собой глутаминовую кислоту (Е), аспарагиновую кислоту (D), аспарагин (N), лизин (K) или эквивалентную отрицательно заряженную (или кислую) аминокислоту,
Хаа3 представляет собой глутаминовую кислоту (Е), аспарагиновую кислоту (D), лизин (K) или глутамин (Q), серии (S) или аспарагин (N),
Хаа4 представляет собой цистеин (С), изолейцин (I),
Хаа5 представляет собой изолейцин (I), лейцин (L) или валин (V), или эквивалентную неполярную алифатическую аминокислоту,
Хаа6 представляет собой глутамин (Q), лизин (K), аргинин (R) или аспарагиновую кислоту(D),
Хаа7 представляет собой аланин (А), или фенилаланин (F), или эквивалентную неполярную аминокислоту,
Хаа8 представляет собой изолейцин (I), лейцин (L), или валин (V), или эквивалентную неполярную алифатическую аминокислоту.
2. Выделенный пептид по п. 1, где
Хаа1 представляет собой аспарагин (N) или глутамин (Q);
Хаа2 представляет собой аспарагиновую кислоту (D) или глутаминовую кислоту (Е);
Хаа3 представляет собой аспарагин (N) или глутаминовую кислоту (Е);
Хаа4 представляет собой изолейцин (I) или цистеин (С);
Хаа5 представляет собой изолейцин (I);
Хаа6 представляет собой аспарагиновую кислоту (D) или глутамин (Q);
Хаа7 представляет собой фенилаланин (F) или аланин (А);
Хаа8 представляет собой изолейцин (I).
3. Выделенный пептид по п. 1, где пептид выбран из группы, состоящей из:
I) аминокислотной последовательности, начиная с остатка валина в позиции 7 до остатка изолейцина в позиции 17 в SEQ ID NO: 1,
II) аминокислотной последовательности, начиная с остатка валина в позиции 9 до остатка лейцина в позиции 19 в SEQ ID NO: 2,
III) аминокислотной последовательности, по существу гомологичной последовательности (I) или (II), предпочтительно, аминокислотной последовательности по меньшей мере на 80% идентичной последовательности (I) или (II).
4. Выделенный пептид по любому из пп. 1-3, содержащий аминокислотную последовательность формулы (II):
Yaa1-Yaa2-Yaa3-Yaa4-Yaa5-валин-Хаа1-Хаа2-глицин-лейцин-Хаа3-Хаа4-Xaa5-Xaa6-Xaa7-Xaa8-Yaa6-Yaa7-Yaa8, где
Хаа1-Хаа2-Хаа3-Хаа4-Хаа5-Хаа6-Хаа7-Хаа8 являются такими, как определено в п. 1,
Yaa1 представляет собой аспарагиновую кислоту (D), глутаминовую кислоту (Е) или эквивалентную кислую аминокислоту,
Yaa2 представляет собой глутамин (Q) или лизин (K),
Yaa3 представляет собой аланин (А), лейцин (L), или тирозин (Y),
Yaa4 представляет собой глутаминовую кислоту (Е), тирозин (Y), или аргинин (R),
Yaa5 представляет собой аспарагин (N), гистидин (Н) или лейцин (L),
Yaa6 представляет собой глутамин (Q), лизин (K) или аргинин (R),
Yaa7 представляет собой лизин (K), аланин (А) или глутаминовую кислоту (Е),
Yaa8 представляет собой аспарагин (N), глутаминовую кислоту (Е) или серии (S).
5. Выделенный пептид по п. 4, где пептид выбран из группы, состоящей из:
I) аминокислотной последовательности, состоящей из
(SEQ ID NO: 1);
II) аминокислотной последовательности, начиная с остатка лейцина в позиции 6 до остатка аспарагиновой кислоты в позиции 40 в SEQ ID NO: 1;
III) аминокислотной последовательности, начиная с остатка лейцина в позиции 11 до остатка аспарагиновой кислоты в позиции 40 в SEQ ID NO: 1;
IV) аминокислотной последовательности, начиная с остатка метионина в позиции 1 до остатка аспарагина в позиции 20 в SEQ ID NO: 1;
V) аминокислотной последовательности, начиная с остатка аспарагина в позиции 20 до остатка глутамина в позиции 35 в SEQ ID NO: 1;
VI) аминокислотной последовательности, состоящей из
(SEQ ID NO: 2);
VII) аминокислотной последовательности, начиная с остатка метионина в позиции 1 до остатка аспарагина в позиции 22 в SEQ ID NO: 2;
VIII) аминокислотной последовательности, состоящей из
(SEQ ID NO: 3);
IX) аминокислотной последовательности, состоящей из
(SEQ ID NO: 4);
X) аминокислотной последовательности, начиная с остатка валина в позиции 9 до остатка лейцина в позиции 19 в SEQ ID NO: 4;
XI) аминокислотной последовательности, по существу гомологичной последовательности от (I) до (X), предпочтительно аминокислотной последовательности по меньшей мере на 80% идентичной последовательности от (I) до (X).
6. Выделенный пептид по любому из пп. 1-3, где указанный выделенный пептид связан с по меньшей мере одним проникающим в клетку пептидом.
7. Выделенный пептид по любому из пп. 1-3, где указанный пептид представляет собой модифицированный пептид.
8. Полинуклеотид, содержащий или состоящий из нуклеиновой кислоты, кодирующей пептид, определенный по любому из пп. 1-7.
9. Способ получения пептида, определенного по любому из пп. 1-7, где указанный способ включает стадии:
а) культивирования рекомбинантной клетки, содержащей рекомбинантный вектор, содержащий полинуклеотид, определенный по п. 8, в условиях, позволяющих экспрессировать пептид по любому из пп. 1-7;
б) необязательно, очистки пептида, полученного на стадии а).
10. Применение выделенного пептида по любому из пп. 1-7 для профилактики и/или лечения инфекции Paramyxovirinae, в частности инфекции Paramyxovirinae, выбранной из группы, состоящей из инфекции Rubulavirus, инфекции Avulavirus, инфекции Henipavirus, инфекции, подобной Henipavirus, инфекции Morbillivirus, инфекции, подобной Morbillivirus (вирусы, подобные парамиксовирусу тупайи (TPMV)), инфекции Respirovirus или инфекции Ferlavirus.
11. Применение по п. 10, где
указанная инфекция Avulavirus представляет собой инфицирование вирусом болезни Ньюкасла;
указанная инфекция Henipavirus представляет собой инфицирование вирусом Нипах (NiV) или вирусом Хендра (HeV);
указанная инфекция Morbillivirus представляет собой инфицирование вирусом кори (MeV), вирусом чумы крупного рогатого скота, вирусом собачьей чумки, вирусом чумы тюленей или вирусом чумы овец;
указанное инфицирование TPMV-подобными вирусами представляет собой инфицирование парамиксовирусом тупайи, вирусом Mossman, вирусом Нарива или вирусом Salem;
указанная инфекция Ferlavirus представляет собой инфицирование вирусом Фер-де-Ланс;
указанная инфекция Rubulavirus представляет собой инфицирование вирусом эпидемического паротита, вирусом парагриппа типа 2 и 4, вирусом Achimota 1 и 2, обезьяним вирусом парагриппа 5, вирусом Менангле, вирусом Tioman или Tuhokovirus 1, 2 и 3;
указанная инфекция Respirovirus представляет собой инфицирование вирусом Сендай, вирусами парагриппа человека 1 и 3.
12. Фармацевтическая композиция, содержащая пептид по любому из пп. 1-7, и один или более фармацевтически приемлемый эксципиент.
13. Применение выделенного пептида, полученного из N-концевого фосфопротеина (Р) вируса Paramyxovirinae, который обладает способностью ингибировать взаимодействие между фосфопротеином (Р) и нуклеопротеином (N0) указанного вируса Paramyxovirinae для лечения или профилактики инфекции Paramyxovirinae.
14. Применение по п. 13, где указанный выделенный пептид содержит по меньшей мере 9 и не более 100 аминокислот.
15. Применение по п. 13 или 14, где указанный выделенный пептид связан по меньшей мере с одним проникающим в клетку пептидом.
16. Применение по п. 13 или 14, где указанный пептид представляет собой модифицированный пептид.
