Биосинтетический генный кластер карримицина - RU2018125487A
Код документа: RU2018125487A
Формула
1. Биосинтетический генный кластер карримицина, состоящий из 44 генов, включающих:
1) пять генов поликетидсинтазы, включающих ОРС 10-14;
2) девять генов, относящихся к единице интенсификации синтеза и модификации поликетона, включающих ОРС 1, ОРС 4-6, 15 и 36-39;
3) шестнадцать генов, относящихся к синтезу гликозила, включающих ОРС 9, 16-22, 24, 26, 28, 29, 33-35 и 41;
4) шесть генов, относящихся к переносу гликозила, включающих ОРС 7, 8, 30-32
и 40;
5) два гена, относящихся к резистентности, включающих ОРС 3 и 25;
6) четыре гена, относящихся к регуляции биосинтеза, включающих ОРС 2, 23, 27 и 42; и
7) два гена, включающих экзогенные маркерные гены, полученные посредством генной инженерии, ОРС 43 и ген микарозы-4''-O-гидроксил-изовалерил-трансферазы ОРС 44, связанный с ОРС 43.
2. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что пять генов поликетидсинтазы кодируют фермент биосинтеза поликетида, и этот фермент катализирует синтез 16-членного лактонового кольца карримицина, при этом
аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям 5 генов поликетидсинтазы ОРС 10-14, включают в себя IA-W10, IA-W11, IA-W12, IA-W13 и IA-W14.
3. Биосинтетический генный кластер по п. 1 или 2, отличающийся тем, что пять поликетидсинтаз включают в себя аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям структурных доменов кетосинтазы (КС), ацилтрансферазы (AT), кеторедуктазы (КР), дегидразы (ДГ), еноилредуктазы (ЕР), ацилпереносящего белка (АПБ) и тиоэстеразы.
4. Биосинтетический генный кластер по п. 3, отличающийся тем, что пять поликетидсинтаз включают в себя модули или структурные домены.
5. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям генов, относящихся к единице интенсификации синтеза и модификации поликетона, содержащие ОРС 1, 4-6, 15 и 36-39, включают в себя IA-W1, IA-W4, IA-W5, IA-W6, IA-W15, IA-W36, IA-W37, IA-W38 и IA-W39.
6. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям генов, относящихся к синтезу гликозила, содержащие ОРС 9, 16-22, 24, 26, 28, 29, 33-35 и 41, включают в себя IA-W9, IA-W16, IA-W17, IA-W18, IA-W19, IA-W20, IA-W21, IA-W22, IA-W24, IA-W26, IA-W28, IA-W29, IA-W33, IA-W34, IA-W35 и IA-W41.
7. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям генов, относящихся к переносу гликозила, содержащие ОРС 7, 8, 30-32 и 40, включают в себя IA-W7, IA-W8, IA-W30, IA-W31, IA-W32 и IA-W40.
8. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям генов, относящихся к резистентности, содержащие ОРС 3 и 25, включают в себя IA-W3 и IA-W25.
9. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям генов, относящихся к регуляции биосинтеза, содержащие ОРС 2, 23, 27 и 42, включают в себя IA-W2, IA-W23, IA-W27 и IA-W42.
10. Биосинтетический генный кластер по п. 1, отличающийся тем, что аминокислотные последовательности, соответствующие нуклеотидным или комплементарным последовательностям экзогенных маркерных генов, полученных методом генной инженерии, содержащие ОРС 43 и ОРС 44, связанный с ОРС 43, включают в себя IA-W43 и IA-W44.
