Способ получения l-аминокислот с помощью алкалифильной бактерии - RU2016144069A
Код документа: RU2016144069A
Формула
1. Аланиндегидрогеназа, отличающаяся тем, что указанный фермент имеет последовательность, которая по меньшей мере на 85% идентична последовательности под SEQ ID NO: 72.
2. Полинуклеотид, который кодирует аланиндегидрогеназу, выбранную из группы, включающей:
a) полинуклеотиды, которые кодируют аланиндегидрогеназу по п. 3;
b) полинуклеотиды с последовательностью, которая по меньшей мере на 75% идентична последовательности в положениях 301-1365 под SEQ ID NO: 71;
c) полинуклеотиды, которые являются комплементарными полинуклеотидам согласно (a) или (b).
3. Ферменты кластера hut, выбранные из
a) уроканатгидратазы (hutU), характеризующейся тем, что указанный фермент имеет последовательность, которая по меньшей мере на 85 или 90%, предпочтительно по меньшей мере на 92, 94, 96 или 98%, в особенности на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 192;
b) имидазолонпропионазы (hutI), характеризующейся тем, что указанный фермент имеет последовательность, которая по меньшей мере на 85 или 90%, предпочтительно по меньшей мере на 92, 94, 96 или 98%, в особенности на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 194;
c) гистидинаммиаклиазы (hutH), характеризующейся тем, что указанный фермент имеет последовательность, которая по меньшей мере на 85 или 90%, предпочтительно по меньшей мере на 92, 94, 96 или 98%, в особенности на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 196; и
d) формимидоилглутамазы, характеризующейся тем, что указанный фермент имеет последовательность, которая по меньшей мере на 85 или 90%, предпочтительно по меньшей мере на 92, 94, 96 или 98%, в особенности на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 198.
4. Полинуклеотиды, которые кодируют ферменты кластера hut, выбранные из
a) полинуклеотида, который кодирует уроканатгидратазу (hutU) по п. 5(а) и предпочтительно имеет последовательность, которая по меньшей мере на 70 или 75%, предпочтительно по меньшей мере на 80 или 85%, особенно предпочтительно по меньшей мере на 90 или 95%, в особенности на 100% идентична последовательности в положениях 301-1983 под SEQ ID NO: 191;
b) полинуклеотида, который кодирует имидазолонпропионазу (hutI) по п. 5(b) и предпочтительно имеет последовательность, которая по меньшей мере на 70 или 75%, предпочтительно по меньшей мере на 80 или 85%, особенно предпочтительно по меньшей мере на 90 или 95%, в особенности на 100% идентична последовательности в положениях 301-1509 под SEQ ID NO: 193;
с) полинуклеотида, который кодирует гистидинаммиаклиазу (hutН) по п. 5(c) и предпочтительно имеет последовательность, которая по меньшей мере на 70 или 75%, предпочтительно по меньшей мере на 80 или 85%, особенно предпочтительно по меньшей мере на 90 или 95%, в особенности на 100% идентична последовательности в положениях 301-1851 под SEQ ID NO: 195;
d) полинуклеотида, который кодирует формимидоилглутамазу (hutG) по п. 5(d) и предпочтительно имеет последовательность, которая по меньшей мере на 70 или 75%, предпочтительно по меньшей мере на 80 или 85%, особенно предпочтительно по меньшей мере на 90 или 95%, в особенности на 100% идентична последовательности в положениях 301-1209 под SEQ ID NO: 197; и
e) полинуклеотидов, которые комплементарны полинуклеотидам согласно (a) - (d).
5. Рекомбинантный микроорганизм, отличающийся тем, что указанный микроорганизм содержит по меньшей мере одну аланиндегидрогеназу по п. 1 и/или по меньшей мере один полинуклеотид по п. 2.
6. Рекомбинантный микроорганизм по п. 5, отличающийся тем, что аланиндегидрогеназа по п. 1 и/или полинуклеотид по п. 2 присутствует в указанном микроорганизме в сверхэкспрессируемой форме.
7. Рекомбинантный микроорганизм, отличающийся тем, что указанный микроорганизм содержит по меньшей мере один фермент, предпочтительно все ферменты кластера hut по п. 3 и/или по меньшей мере один полинуклеотид, предпочтительно полинуклеотиды, кодирующие все ферменты кластера hut, по п. 4.
8. Рекомбинантный микроорганизм по п. 7, отличающийся тем, что по меньшей мере один фермент, предпочтительно все ферменты кластера hut по п. 3 и/или по меньшей мере один полинуклеотид, предпочтительно полинуклеотиды, кодирующие все ферменты кластера hut, по п. 4 присутствуют в сверхэкспрессируемой форме.
9. Рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 5-9, отличающийся тем, что указанный микроорганизм является коринебактерией, предпочтительно вида C. humireducens или C. glutamicum.
10. Способ получения в избыточном количестве L-аминокислоты с помощью микроорганизма, отличающийся тем, что в указанном способе применяют полипептид по п. 1 или 3, и/или полинуклеотид по п. 2 или 4, и/или рекомбинантный микроорганизм по любому из пп. 5-9.
11. Способ получения в избыточном количестве L-аминокислоты, отличающийся тем, что в указанном способе применяют алкалифильную бактерию.
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что алкалифильная бактерия представляет собой алкалифильную коринеформную бактерию, в частности алкалифильную коринебактерию, предпочтительно C. humireducens.
13. Способ по любому из пп. 10-12, отличающийся тем, что получаемая в избыточном количестве L-аминокислота выбрана из L-аланина, L-валина, L-аминокислот семейства глутамата, в частности L-глутамата, L-глутамина, L-пролина и L-аргинина, и L-аминокислот семейства аспартата, в частности L-аспартата, L-аспарагина, L-метионина, L-лизина, L-изолейцина и L-треонина.
14. Способ по п. 13, отличающийся тем, что получаемая в избыточном количестве L-аминокислота выбрана из L-аланина, L-валина, L-глутаминовой кислоты и L-лизина.
15. Ферменты, выбранные из группы, предусматривающей
a) треониндегидратазу (IlvA, EC 4.3.1.19) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 106, и кодирующие ее полинуклеотиды,
b) субъединицу ацетолактатсинтазы (IlvB) c последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 98, и кодирующие ее полинуклеотиды,
с) изомероредуктазу (IlvC, EC 1.1.1.86) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 100, и кодирующие ее полинуклеотиды,
d) дегидратазу дигидроксикислот (IlvD, EC 4.2.1.9) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 102, и кодирующие ее полинуклеотиды,
e) трансаминазу (IlvE, EC 2.6.1.42) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 104, и кодирующие ее полинуклеотиды,
f) ацетолактатсинтазу (IlvH, EC 2.2.1.6) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 122, и кодирующие ее полинуклеотиды,
g) треонинсинтазу (ThrC, EC 4.2.3.1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 108, и кодирующие ее полинуклеотиды,
h) необязательно устойчивую к ингибированию конечным продуктом изопропилмалатсинтазу (LeuA, EC 2.3.3.13) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 110, и кодирующие ее полинуклеотиды,
i) изопропилмалатдегидрогеназу (LeuB, EC 1.1.1.85) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 112, и кодирующие ее полинуклеотиды,
j) субъединицы изопропилмалатизомеразы (LeuCD, EC 4.2.1.33) с последовательностями, которые по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентичны последовательностям под SEQ ID NO: 114 или SEQ ID NO: 116, и кодирующие их полинуклеотиды,
k) 3-метил-2-оксобутаноат-гидроксиметилтрансферазу (PanB, EC 2.1.2.11) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 118, и кодирующие ее полинуклеотиды,
l) пантотенатсинтазу (PanC, EC 6.3.2.1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 120, и кодирующие ее полинуклеотиды,
m) глутаматдегидрогеназу (Gdh) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 124, и кодирующие ее полинуклеотиды,
n) глутаминсинтетазу (глутаминсинтетазу 1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 126, и кодирующие ее полинуклеотиды,
о) глутаминсинтетазу (глутаминсинтетазу 2) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 128, и кодирующие ее полинуклеотиды,
р) глутаматсинтазу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 130, и кодирующие ее полинуклеотиды,
q) изоцитратдегидрогеназу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 132, и кодирующие ее полинуклеотиды,
r) аконитатгидразу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 134, и кодирующие ее полинуклеотиды,
s) цитратсинтазу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 136, и кодирующие ее полинуклеотиды,
t) аминопептидазу С (PepC) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 138, и кодирующие ее полинуклеотиды,
u) пируватдегидрогеназу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 140, и кодирующие ее полинуклеотиды,
v) пируваткиназу (пируваткиназу 1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 142, и кодирующие ее полинуклеотиды,
w) пируваткиназу (пируваткиназу 2) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 144, и кодирующие ее полинуклеотиды,
x) енолазу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 146, и кодирующие ее полинуклеотиды,
y) 2,3-бисфосфоглицерат-зависимую фосфоглицератмутазу (GpmA) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 148, и кодирующие ее полинуклеотиды,
z) фосфоглицераткиназу (Pgk) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 150, и кодирующие ее полинуклеотиды,
аa) глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназу (глицерин-3-фосфат-дегидрогеназу 1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 152, и кодирующие ее полинуклеотиды,
bb) глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназу (глицерин-3-фосфат-дегидрогеназу 2) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 154, и кодирующие ее полинуклеотиды,
сс) триозофосфатизомеразу (TpiA) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 156, и кодирующие ее полинуклеотиды,
dd) фруктозобисфосфатальдолазу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 158, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ее) 1-фосфофруктокиназу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 160, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ff) 6-фосфофруктокиназу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 162, и кодирующие ее полинуклеотиды,
gg) аттенуированные полинуклеотиды (sucCD), которые кодируют субъединицы сукцинил-CoA-лигазы (SucCD, EC 6.2.1.5),
hh) ДНК-связывающий домен HTH tetR-типа (McbR) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, и кодирующие его полинуклеотиды,
ii) гомосеринкиназу (ThrB, EC 2.7.1.39) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 4, и кодирующие ее полинуклеотиды,
jj) глюкозо-6-фосфат-изомеразу (Pgi, EC 5.3.1.9) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 6, и кодирующие ее полинуклеотиды,
kk) фосфоенолпируваткарбоксикиназу (Pck, EC 4.1.1.32) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 8, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ll) D-метионин-связывающий липопротеин (MetQ) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 10, и кодирующие его полинуклеотиды,
mm) транспортер метионина (MetР) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 12, и кодирующие его полинуклеотиды,
nn) АТФ-зависимый транспортер метионина (MetN) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 14, и кодирующие его полинуклеотиды,
oo) S-аденозилметионинсинтазy (MetK) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 16, и кодирующие ее полинуклеотиды,
pp) пермеазу системы импорта метионина (MetI) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 18, и кодирующие ее полинуклеотиды,
qq) 4-гидрокси-тетрагидродипиколинатсинтазу (DapA, EC 4.3.3.7) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 20, и кодирующие ее полинуклеотиды,
rr) цистеинсинтазу (CBS, CysK) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 22, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ss) карбоксилатаминлигазу с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 24, и кодирующие ее полинуклеотиды,
tt) цистатионин-бета-лиазу (AecD) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 26, и кодирующие ее полинуклеотиды,
uu) аспартатполуальдегиддегидрогеназу (Asd, EC 1.2.1.11) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 28, и кодирующие ее полинуклеотиды,
vv) сверхэкспрессируемый полинуклеотид (metH), который кодирует 5-метилтетрагидрофолатгомоцистеинметилтрансферазу (MetH, EC 2.1.1.13),
ww) малую субъединицу транспортера аминокислот с разветвленной цепью (BrnE) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 30, и кодирующие ее полинуклеотиды,
хх) большую субъединицу транспортера аминокислот с разветвленной цепью (BrnF) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 32, и кодирующие ее полинуклеотиды,
yy) серинацетилтрансферазy (CysE) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 34, и кодирующие ее полинуклеотиды,
zz) цистеинсинтазу (CysK) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 36, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ааа) Н-белок системы расщепления глицина (GcvH) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 38, и кодирующие его полинуклеотиды,
bbb) P-белок системы расщепления глицина (GcvP) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 40, и кодирующие его полинуклеотиды,
ccc) T-белок системы расщепления глицина (GcvT) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 42, и кодирующие его полинуклеотиды,
ddd) серингидроксиметилтрансферазy (GlyA) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 44, и кодирующие ее полинуклеотиды,
eee) необязательно устойчивую к ингибированию конечным продуктом гомосериндегидрогеназу (Hom, EC 1.2.1.11) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 46, и кодирующие ее полинуклеотиды,
fff) липоилсинтазy (LipA) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 48, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ggg) липоилтрансферазy (LipВ) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 50, и кодирующие ее полинуклеотиды,
hhh) дигидролипоилдегидрогеназу (Lpd) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 52, и кодирующие ее полинуклеотиды,
iii) липоатпротеинлигазу (LplA) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 94, и кодирующие ее полинуклеотиды,
jjj) дигидролипоилдегидрогеназу (GcvL) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 96, и кодирующие ее полинуклеотиды,
kkk) устойчивую к ингибированию конечным продуктом аспартаткиназу (LysC, EC 2.7.2.4) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, и кодирующие ее полинуклеотиды,
lll) цистатионин-гамма-синтазу (MetB) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 56, и кодирующие ее полинуклеотиды,
mmm) 5,10-метилентетрагидрофолатредуктазу (MetF) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 58, и кодирующие ее полинуклеотиды,
nnn) гомосерин-О-ацетилтрансферазу (MetX) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 60, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ooo) О-ацетилгомосеринлиазу (MetY) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 62, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ррр) устойчивую к ингибированию конечным продуктом пируваткарбоксилазу (Pyc, EC 6.4.1.1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 64, и кодирующие ее полинуклеотиды,
qqq) необязательно устойчивую к ингибированию конечным продуктом D-3-фосфоглицератдегидрогеназу (SerA) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 66, и кодирующие ее полинуклеотиды,
rrr) фосфосеринфосфатазу (SerB) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 68, и кодирующие ее полинуклеотиды,
sss) фосфосеринаминотрансферазу (SerС) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 70, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ttt) субъединицу сульфатаденилилтрансферазы (CysD), которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 74, и кодирующие ее полинуклеотиды,
uuu) аденозинфосфосульфатредуктазу (CysH) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 76, и кодирующие ее полинуклеотиды,
vvv) сульфитредуктазу (CysI) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 78, и кодирующие ее полинуклеотиды,
www) бета-цепь НАДФ-зависимой глутаматсинтазы (CysJ) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 80, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ххх) субъединицу сульфатаденилилтрансферазы (CysN), которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 82, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ууу) цистатионин-бета-синтазу (CysY) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 84, и кодирующие ее полинуклеотиды,
zzz) транспортер сульфата (CysZ) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 86, и кодирующие его полинуклеотиды,
aaaa) 5- метилтетрагидроптероилтриглутаматгомоцистеинметилтрансферазy (MetЕ) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, и кодирующие ее полинуклеотиды,
bbbb) пептидил-tRNA-гидролазy 1 (PtH1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 90, и кодирующие ее полинуклеотиды,
cccc) пептидил-tRNA-гидролазy 2 (PtH2) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 92, и кодирующие ее полинуклеотиды,
dddd) сверхэкспрессируемый полинуклеотид (ddh), который кодирует диаминопимелатдегидрогеназу (Ddh, EC 1.4.1.16),
ееее) диаминопимелатдекарбоксилазу (LysA, EC 4.1.1.20) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 164, и кодирующие ее полинуклеотиды,
ffff) аспартатаминотрансферазy (AaT, EC 2.6.1.1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 166, и кодирующие ее полинуклеотиды,
gggg) экспортер L-лизина (LysE, пермеазу эффлюкса лизина) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 168, и кодирующие его полинуклеотиды,
hhhh) сверхэкспрессируемый полинуклеотид (dapF), который кодирует диаминопимелатэпимеразу (DapF, EC 5.1.1.7),
iiii) дигидропиколинатредуктазy (DapB, EC 1.3.1.26) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 170, и кодирующие ее полинуклеотиды,
jjjj) глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназy (EC 1.1.1.49) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 172, и кодирующие ее полинуклеотиды,
kkkk) субъединицу Zwf глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназы (Zwf, EC 1.1.1.49) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 186, и кодирующие ее полинуклеотиды,
llll) субъединицу OpcA глюкозо-6-фосфат-дегидрогеназы (OpcA, EC 1.1.1.49) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 188, и кодирующие ее полинуклеотиды,
mmmm) дегидрогеназy фосфоглюконовой кислоты (Gnd, EC 1.1.1.44) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 174, и кодирующие ее полинуклеотиды,
nnnn) малат:хинон-оксидоредуктазy (Mqo, EC 1.1.99.16) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 176, и кодирующие ее полинуклеотиды,
oooo) субъединицу Е1р пируватдегидрогеназного комплекса (AceE, EC 1.2.4.1) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 178, и кодирующие ее полинуклеотиды,
pppp) цитратсинтазy (GltA, EC 4.1.3.7) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 180, и кодирующие ее полинуклеотиды,
qqqq) малатдегидрогеназy (Mdh, EC 1.1.1.37) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 182, и кодирующие ее полинуклеотиды,
rrrr) UDP-N-ацетилмурамоилаланил-D-глутамат-2,6-диаминопимелатлигазy (MurE, EC 6.3.2.13) с последовательностью, которая по меньшей мере на 90, 95 или 98%, предпочтительно на 100% идентична последовательности под SEQ ID NO: 184, и кодирующие ее полинуклеотиды.
