Способы, композиции и наборы для определения вируса иммунодефицита человека (вич) - RU2013151821A

Реферат

1. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, которая содержит нуклеотидную последовательность, как изложено в:5′-agg pnn tgn atg pan tgg atg-3′ (SEQ ID NO:10); или5′-agg pnn tgn ntg ptn tgg atg-3′ (SEQ ID NO:11),где p = универсальный нуклеотид и n = аналог цитидина, имеющий модификацию C-5.2. Выделенная молекула по п.1, где p представляет собой 6Н,8Н-3,4-дигидропиримидо[4,5-с][1,2]оксазин-7-он, где n представляет собой 5-(1-пропинил)-2′-дезоксицитидин.3. Выделенная молекула по п.1, где молекулу метят, используя FAM/BHQ-1.4. Композиция, содержащая молекулу по п.1, где композиция дополнительно содержит первый прямой праймер, имеющий последовательность, представленную в SEQ ID NO:14, и первый обратный праймер, имеющий последовательность, представленную в SEQ ID NO:15, где первый прямой и обратный праймер, каждый, способен к гибридизации с последовательностью-мишенью в условии ПЦР, чтобы, таким образом, амплифицировать последовательность-мишень.5. Композиция по п.4, где композиция дополнительно содержит: олигонуклеотидный зонд, имеющий последовательность, представленную в SEQ ID NO:6, второй прямой праймер, имеющий последовательность, представленную в SEQ ID NO:16 и второй обратный праймер, имеющий последовательность, представленную в SEQ ID NO:17.6. Способ амплификации последовательности-мишени, где способ включает: контактирование композиции по п.4 с последовательностью-мишенью в условии ПЦР.7. Способ определения ВИЧ в образце, где способ включает:а. проведение ПЦР с матрицей нуклеиновой кислоты в образце, используя прямой праймер, содержащий последовательность, представленную в SEQ ID NO:14, и обратный праймер, содержащий последовательность, представленную в SEQ ID NO:15; иб. контактирование ампликона, сгенери