Мультиаллельное генотипирование однонуклеотидных полиморфизмов и индел-мутаций - RU2706203C1

Реферат

Изобретение относится к области биотехнологии и молекулярной биологии. Предложен способ генотипирования одного или нескольких мультиаллельных маркеров, включающий получение сигналов одного или нескольких мультиаллельных маркеров в одном или нескольких образцах, с последующей кластеризацией сигналов для каждой пары аллелей, регистрацию сигналов одного или нескольких альтернативных аллелей для расчета фонового сигнала для одного или нескольких аллелей, с получением множества фоновых сигналов, каждый из которых представляет соответствующий аллель, присваивание исходного значения проявления генотипа каждого образца для каждой пары аллелей на основании сигналов и фоновых сигналов, расчет многомерного нормального распределения для каждого кластера, для каждого многомерного нормального распределения каждого кластера, расчет логарифмического правдоподобия принадлежности каждого образца, на основании логарифмического правдоподобия принадлежности, расчет, для каждого образца, вероятности принадлежности к каждому кластеру, присваивание конечного значения проявления генотипа каждому образцу на основании вероятности принадлежности. Способ может быть использован в генетике и медицине. 10 з.п. ф-лы, 16 ил., 1 табл.