Последовательности нуклеиновых кислот и аминокислотные последовательности аденовирусов человекообразных обезьян, исключая человека, содержащие их векторы и их применения - RU2019144161A
Код документа: RU2019144161A
Формула
1. Выделенный полинуклеотид, кодирующий гексоновый белок аденовируса, содержащий следующее
A) (i) HVR1, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 11 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием А в положении 27,
(ii) HVR2, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 12 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием L в положении 1,
(iii) HVR3, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 13 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием V в положении 7,
(iv) HVR4, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 14 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(v) HVR5, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 15 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(vi) HVR6, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 16 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности, и
(vii) HVR7, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 17 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 1; или
B) (i) HVR1, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 18 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием V в положении 8, без D в положении 12, без Е в положении 13 и/или отсутствием L в положении 14,
(ii) HVR2, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 19 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием D в положении 10,
(iii) HVR3, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 20 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием Т в положении 6,
(iv) HVR4, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 21 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием L в положении 9,
(v) HVR5, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 22 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием Т в положении 3,
(vi) HVR6, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 23 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 9, и
(vii) HVR7, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 24 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 8; или
С) (i) HVR1, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 25 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(ii) HVR2, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 26 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(iii) HVR3, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 27 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием V в положении 7,
(iv) HVR4, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 28 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием Е в положении 10,
(v) HVR5, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 29 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием Т в положении 3,
(vi) HVR6, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 30 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 9, и
(vii) HVR7, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 31 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 8 и/или отсутствием Т в положении 11; или
D) (i) HVR1, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 32 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(ii) HVR2, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 33 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(iii) HVR3, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 34 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием Т в положении 6,
(iv) HVR4, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 35 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности без Q в положении 6 и/или без Е в положении 10,
(v) HVR5, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 36 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием Т в положении 3,
(vi) HVR6, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 37 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием K в положении 1, и
(vii) HVR7, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 38 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 8; или
E) (i) HVR1, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 39 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием А в положении 27,
(ii) HVR2, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 40 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(iii) HVR3, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 41 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(iv) HVR4, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 42 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(v) HVR5, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 43 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
(vi) HVR6, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 44 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности, и
(vii) HVR7, содержащая аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 45 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности и отсутствием I в положении 1.
2. Выделенный полинуклеотид по п. 1, в котором гексоновый белок согласно
A) содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 46 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
B) содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 47 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
C) содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 48 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности,
D) содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 49 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности, и/или
E) содержит аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 50 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности.
3. Выделенный полинуклеотид по любому из пп. 1-2, дополнительно кодирующий аденовирусный белок пентон, содержащий аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 51 или 52 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности.
4. Выделенный полинуклеотид по любому из пп. 1-3, дополнительно кодирующий белок фибера аденовируса, содержащий аминокислотную последовательность согласно SEQ ID NO: 53 или 54 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности.
5. Выделенный полинуклеотид по любому из пп. 1-4, дополнительно кодирующий некодирующую РНК, VA РНК II, содержащую нуклеотидную последовательность согласно SEQ ID NO: 57 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности, и/или некодирующую РНК, VA РНК I, содержащую нуклеотидную последовательность согласно SEQ ID NO: 55 или 56 или ее вариант, характеризующийся по меньшей мере 85% идентичности последовательности.
6. Выделенный полинуклеотид, кодирующий аденовирус, предпочтительно неспособный к репликации аденовирус, содержащий полинуклеотид по любому из пп. 1-5.
7. Выделенный полинуклеотид по п. 6, причем аденовирус представляет собой химерный аденовирус и/или несет неаденовирусный ген, белок или их фрагмент.
8. По меньшей мере один выделенный аденовирусный капсидный полипептид, кодируемый выделенным полинуклеотидом по любому из пп. 1-4.
9. Выделенный аденовирус, предпочтительно неспособный к репликации аденовирус, содержащий выделенный полинуклеотид по любому из пп. 1-7 и/или по меньшей мере один выделенный аденовирусный капсидный полипептид по п. 8.
10. Вирусоподобная частица, кодируемая выделенным полинуклеотидом по любому из пп. 1-7.
11. Вектор, содержащий выделенный полинуклеотид по любому из пп. 1-7.
12. Композиция, содержащая (i) адъювант, (ii) выделенный полинуклеотид по любому из пп. 1-7, по меньшей мере один выделенный аденовирусный капсидный полипептид по п. 8, аденовирус по п. 9, вирусоподобную частицу по п. 10 или вектор по п. 11 и необязательно (iii) фармацевтически приемлемое вспомогательное вещество.
13. Клетка, содержащая полинуклеотид по любому из пп. 1-7, по меньшей мере один выделенный аденовирусный капсидный полипептид по п. 8, аденовирус по п. 9, вирусоподобную частицу по п. 10 или вектор по п. 11.
14. Полинуклеотид по любому из пп. 1-7, по меньшей мере один выделенный аденовирусный капсидный полипептид по п. 8, аденовирус по п. 9, вирусоподобная частица по п. 10 или вектор по п. 11 и/или композиция по п. 12 для применения при лечении или профилактике заболевания.
15. Способ in vitro получения аденовируса или аденовирусоподобной частицы, предусматривающий следующие стадии:
(i) экспрессия выделенного полинуклеотида по любому из пп. 1-7 в клетке, так что аденовирус или аденовирусоподобная частица собираются в клетке,
(ii) выделение аденовируса или аденовирусоподобной частицы из клетки или среду, окружающей клетку.
