Варианты капсидов аденоассоциированного вируса и способы их применения - RU2018142768A
Код документа: RU2018142768A
Формула
1. Вариант капсидного белка аденоассоциированного вируса (AAV), содержащий пептидную вставку в петле GH капсидного белка относительно соответствующего родительского капсидного белка AAV, где пептидная вставка содержит аминокислотную последовательность ISDQTKH (SEQ ID NO: 14).
2. Вариант капсидного белка AAV по п. 1, где пептидная вставка содержит аминокислотную последовательность Y1Y2ISDQTKHY3, где каждый из Y1-Y3 независимо выбран из Ala, Leu, Gly, Ser, Thr и Pro.
3. Вариант капсидного белка AAV по п. 2, где пептидная вставка содержит или состоит из аминокислотной последовательности LAISDQTKHA (SEQ ID NO: 28).
4. Вариант капсидного белка AAV по любому из пп. 1-3, где сайт вставки расположен между аминокислотами, соответствующими аминокислотам 587 и 588 структурного белка VP1 AAV2 (SEQ ID NO: 2), или в соответствующим положении капсидного белка AAV другого серотипа.
5. Вариант капсидного белка AAV по любому из пп. 1-4, где капсидный белок содержит одну или несколько аминокислотных замен относительно VP1 AAV2 (SEQ ID NO: 2) или одну или несколько соответствующих замен в капсидном белке AAV другого. серотипа.
6. Вариант капсидного белка AAV по любому из пп. 1-5, где капсидный белок содержит одну или несколько следующих аминокислотных замен относительно VP1 AAV2 (SEQ ID NO: 2) или соответствующих замен в капсидном белке AAV другого серотипа: M1L, L15P, P34A, N57D, N66K, R81Q, Q101R, S109T, R144K, R144M, Q164K, T176P, L188I, S196Y, G226E, G236V, I240T, P250S, N312K, P363L, D368H, N449D, T456K, S463Y, D472N, R484C, A524T, P535S, N551S, A593E, I698V, V708I, V719M, S721L и L735Q..
7. Вариант капсидного белка AAV по п. 6, где капсидный белок содержит аминокислотную замену P34A относительно VP1 AAV2 (SEQ ID NO: 2) или соответствующую замену в капсидном белке AAV другого серотипа.
8. Вариант капсидного белка AAV по п. 7, где капсидный белок содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере на 90% идентичную, по меньшей мере на 95% идентичную, по меньшей мере на 99% идентичную или на 100% идентичную всей длине аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42.
9. Вариант капсидного белка AAV по п. 8, где капсидный белок по существу состоит из аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42.
10. Вариант капсидного белка по любому из пп. 1-9, где капсидный белок придает инфекционному рекомбинантному вириону AAV (rAAV) повышенную инфекционность в отношении клетки сетчатки по сравнению с инфекционностью вириона AAV в отношении клетки сетчатки, который содержит соответствующий капсидный белок родительского AAV.
11. Изолированная нуклеиновая кислота, содержащая нуклеотидную последовательность, которая кодирует вариант капсидного белка AAV по любому из пп. 1-10.
12. Инфекционный вирион rAAV, содержащий вариант капсидного белка AAV по любому из пп. 1-10.
13. Вирион rAAV по п. 12, дополнительно включающий гетерологичную нуклеиновую кислоту, кодирующую генный продукт.
14. Вирион rAAV по п. 13, где генный продукт представляет собой белок или короткую интерферирующую РНК.
15. Вирион rAAV по п. 14, где вариант капсидного белка AAV содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере на 90% идентичную, по меньшей мере на 95% идентичную, или по меньшей мере на 99% идентичную аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42, и где гетерологичная нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, который сопровождает белок Rab 1.
16. Вирион rAAV по п. 15, где вариант капсидного белка AAV состоит из аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42, и где нуклеотидная последовательность, кодирующая белок, который сопровождает белок Rab 1, функционально связана с промотором CAG.
17. Вирион rAAV по п. 14, где вариант капсидного белка AAV содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере на 90% идентичную, по меньшей мере на 95% идентичную, или по меньшей мере на 99% идентичную аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42, и где гетерологичная нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую белок-регулятор ГТФазы пигментной дистрофии сетчатки.
18. Вирион rAAV по п. 17, где вариант капсидного белка AAV содержит или состоит из аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42.
19. Вирион rAAV по п. 18, где нуклеотидная последовательность, кодирующая белок-регулятор ГТФазы пигментной дистрофии сетчатки, функционально связана с промотором родопсинкиназы.
20. Вирион rAAV по п. 14, где вариант капсидного белка AAV содержит аминокислотную последовательность по меньшей мере на 90% идентичную, по меньшей мере на 95% идентичную, или по меньшей мере на 99% идентичную аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42, и где гетерологичная нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность, кодирующая полипептид, который ингибирует активность фактора роста эндотелия сосудов (VEGF).
21. Вирион rAAV по п. 20, где вариант капсидного белка AAV содержит или состоит из аминокислотной последовательности, представленной в SEQ ID NO: 42.
22. Вирион rAAV по п. 21, где полипептид представляет собой слитый белок или антитело.
23. Фармацевтическая композиция, содержащая вирион rAAV по любому из пп. 14-22 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
24. Способ доставки гетерологичной нуклеиновой кислоты в клетку сетчатки, включающий контактирование клетки сетчатки с вирионом rAAV по любому из пп. 14-22 или с фармацевтической композицией по п. 23.
25. Способ по п. 24, где клетку сетчатки выбирают из группы, состоящей из ганглиозных клеток сетчатки, амакринных клеток, горизонтальных клеток, биполярных клеток, фоторецепторных клеток, глиальных клеток Мюллера, клеток микроглии и пигментного эпителия сетчатки.
26. Применение вириона rAAV по любому из пп. 14-22 или фармацевтической композиции по п. 23 для изготовления лекарственного средства.
27. Применение вириона rAAV по п. 15 или 16, или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV по п. 15 или 16, для изготовления лекарственного средства для лечения хороидеремии.
28. Способ лечения хороидеремии у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту эффективного количества вириона rAAV по п. 15 или 16, или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV по п. 15 или 16.
29. Применение вириона rAAV по любому из пп. 17-19 или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV по любому из пп. 17-19, для изготовления лекарственного средства для лечения пигментной дистрофии сетчатки, связанной с Х-хромосомой.
30 Способ лечения пигментной дистрофии сетчатки, вызванной Х-хромосомой, у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту эффективного количества вириона rAAV по любому из пп. 17-19 или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV по любому из пп. 17-19
31. Применение вириона rAAV по любому из пп. 20-22 или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV по любому из пп. 20-22, для изготовления лекарственного средства для лечения влажной формы возрастной макулярной дегенерации сетчатки, диабетической ретинопатии, диабетического макулярного отека или хориоидальной неоваскуляризации.
32. Способ лечения влажной формы возрастной макулярной дегенерации, диабетической ретинопатии, диабетического макулярного отека или хориоидальной неоваскуляризации у субъекта, нуждающегося в этом, включающий введение субъекту эффективного количества вириона rAAV по любому из пп. 20-22 или фармацевтической композиции, содержащей вирион rAAV по любому из пп. 20-22.
33. Применение вириона rAAV или фармацевтической композиции по любому из пп. 26, 27, 29 и 31, где вирион rAAV или фармацевтическая композиция предназначена для введения путем интравитреальной инъекции.
34. Способ по любому из пп. 28, 30 и 32, где вирион rAAV или фармацевтическую композицию вводят субъекту путем интравитреальной инъекции.
35. Применение вириона rAAV или фармацевтической композиции по любому из пп. 26, 27, 29 и 31, где лекарственное средство предназначено для лечения человека.
36. Способ по любому из пп. 28, 30 и 32, где субъектом является человек.
