Код документа: RU2742250C2
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ
Данное изобретение относится, в общем, к вакцинам против реовируса птиц.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Реовирус птиц (ARV) является представителем рода Orthoreovirus в семействе Reoviridae. Он связан с рядом заболеваний, наиболее известным из которых является синдром вирусного артрита (теносиновит), который характеризуется набуханием суставов и поражениями в икроножных сухожилиях и вызывает значительные экономические потери в птицеводстве. Восприимчивость к ARV-инфекции чаще всего встречается у молодых (возрастом 1-2 недели) цыплят. Контроль над вирусным теносиновитом у кур-бройлеров обеспечивается антителами, которые передаются потомству после вакцинации родительских стай. Доступные живые аттенуированные и инактивированные вакцины против ARV основаны на штамме S1133 (van der Heide et al., 1983), а также выделенных штаммах, принадлежащих к одному серотипу (Goldenberg et al., 2010). Однако эти вакцины не являются эффективными против различных ARV, обнаруженных в мире (Jones 2000, Goldenberg et al., 2010; Lublin et al., 2011).
Секвенирование белка сигма C (SC) изолятов ARV для генетической характеристики позволило провести их разделение на генотипы (Kant et al., 2003; Lublin et al., 2011; Goldenberg et al., 2010; Troxler et al., 2013). Вакцинация на основе смеси четырех представителей генотипов ARV обеспечивала защиту от всех тестируемых вирусов четырех генотипов [Lublin et al. 2011; WO 2009/093251]. Внешний белок SC, связывающийся с капсидом ARV, кодируемый геном S1, является относительно небольшим белком, состоящим из 326 аминокислот (Benavente & Martinez-Costas 2007), гомотримером с третичной структурой, состоящей из двух доменов: «голова», который расположен на С-конце белка и «стержень» на N-конце. Кристаллическая структура C-концевого домена и остатков 117-326 была определена (Guardado Calvo et al., 2005; Guardado-Calvo et al., 2009). SC индуцирует реовирус-специфические нейтрализующие антитела (Shapouri et al., 1996; Grande et al., 1997), что делает его подходящим кандидатом для рекомбинантной субъединичной вакцины.
Действительно, эффективные рекомбинантные вакцины в прошлом были разработаны против ряда вирусов, включая вакцины против гепатита В (McAleer et al., 1984) и против папилломавируса (Valentino & Poronsky 2015) у людей, а также против инфекционного бурсита птиц (IBD) (Pitcovski et al., 2003) и синдрома снижения яйценоскости у кур (Fingerut et al. 2003) и геморрагического энтерита у индюков (Pitcovski et al., 2005). SC экспрессировался в различных системах экспрессии, включая бактерии, бакуловирус, дрожжи, растения и клетки млекопитающих. Рекомбинантные белки были использованы для диагностики чтобы различать штаммы. Было показано, что анти-SC-антитела нейтрализуют вирус в клеточных линиях [28,31]. В предыдущем исследовании SC, экспрессируемый в бактериях, проявлял лишь слабую иммуногенность (Goldenberg et al., 2011; Vasserman et al., 2004). Поэтому существует большая потребность в эффективной вакцине против ARV.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ СУЩНОСТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
В одном аспекте данное изобретение относится к выделенному полипептиду, содержащему или по существу состоящему из аминокислотной последовательности, соответствующей аминокислотным остаткам, образующим полный или частичный α-спиральный домен, шарнирный домен, домен тройной β-спирали и полный или частичный глобулярный головной домен белка сигма C реовируса птиц и не имеющему последовательность аминокислот, которая является N-терминальной по отношению к указанному α-спиральному домену.
В дополнительном аспекте данное изобретение относится к молекуле нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующей по меньшей мере один из выделенных полипептидов, определенных в данном документе.
В другом аспекте данное изобретение относится к вектору экспрессии, содержащему контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с указанной молекулой нуклеиновой кислоты, описанной в данном документе, причем указанный экспрессионный вектор разработан для репликации и экспрессии соответствующих генов, например, в клетке бактерий, дрожжей или насекомых.
В следующем аспекте данное изобретение относится к вакцине, содержащей, по меньшей мере, один из выделенных полипептидов, описанных в данном документе.
В еще одном аспекте данное изобретение предлагает вакцину, содержащую экспрессионный вектор млекопитающих, такой как pcDNA3, содержащий контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с молекулой нуклеиновой кислоты, описанной в данном документе.
В дополнительном аспекте данное изобретение относится к вирусному вектору, такому как рекомбинантный вирус болезни Марека (MD), содержащему контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с молекулой нуклеиновой кислоты, описанной в данном документе.
В еще одном аспекте данное изобретение относится к любой из вакцин или вирусных векторов, описанных в данном документе для применения при вакцинации видов птиц или для применения в индуцировании иммунного ответа птиц, обеспечивающего защиту от реовируса птиц.
В еще одном дополнительном аспекте данное изобретение относится к способу вакцинации видов птиц против реовируса птиц или для индуцирования иммунного ответа птиц, обеспечивающего защиту от реовируса птиц, который включает введение птице любой из вакцин или вирусных векторов, описанных в данном документе.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ
На Фиг. 1A-B изображена эффективная экспрессия сигма С изолятов ARV; His-меченые остатки 122-326 экспрессировались в E. coli BL21. Окрашивание Кумасси Бриллиантовым Синим (A) демонстрирует устойчивую экспрессию белков ожидаемого молекулярного размера. Их идентичность была подтверждена с использованием мышиного моноклонального анти-His-антитела с помощью вестерн-блоттинга (B). Дорожка 1: растворимый SC1 133, дорожка 2: растворимый SC528, дорожка 3: растворимый SC5223, дорожка 4: растворимый SC5215, дорожка 5: нерастворимый SC1 133, дорожка 6: нерастворимый SC528, дорожка 7: нерастворимый SC5223, дорожка 8: нерастворимый SC5215, дорожка 9: отрицательный контроль (остатки сигма C 1-326 без his-метки, полученные в E. coli). Дорожка 10: маркер молекулярного веса. Стрелка указывает на белок сигма С.
На Фиг. 2 изображена гистограмма с титрами антител после вакцинации рекомбинантными белками SC1-326, SC122-326 и SC192-326, все из которых являются последовательностями ARV S1133. Контроли: N.C - отрицательный контроль (птицы, вакцинированные с помощью PBS в адъюванте), P.C - положительный контроль (инъецированные ARV S1133). *** Значимые различия при P <0,001.
На Фиг. 3 изображена гистограмма, демонстрирующая обнаружение вируса антителами, полученными после инъекции белка. Относительный уровень антител против ARV после инъекции SC 1-326, SC122-326 и SC192-326 представлен как отношение между OD тестируемого образца (S) и антител против ARV 1133, представленных в KIT, которые служат положительным контролем (P) (S/P). Значение более 0,2 считается положительным (распознавание вируса). N.C - отрицательный контроль (птицы, вакцинированные с помощью PBS в адъюванте). *** Значимые различия при P <0,001.
На Фиг. 4 изображена гистограмма, демонстрирующая пролиферацию лимфоцитов, полученных из селезенок птиц, вакцинированных с помощью PBS в адъюванте в качестве отрицательного контроля (N.C.), штаммом вакцины против ARV S1133 в качестве положительного контроля (P.C.), SC1-326 или SC122-326, после стимуляции с помощью ARV. Клетки обрабатывали конканавалином A (ConA) или липополисахаридом (LPS) в качестве контролей клеточной пролиферации в ответ на неспецифические антигены (Ag), ARV для специфической Ag-пролиферации или самой средой в качестве отрицательного контроля (NC). Измеренное поглощение пропорционально количеству жизнеспособных клеток. Результаты представлены как индекс стимуляции (SI), представляющий соотношение между стимулированными и не стимулированными клетками. ***, ** Значимо отличается при P <0,001 и 0,01 соответственно.
На Фиг. 5 изображен линейный график, показывающий влияние первичной вакцинации с помощью SC 122-326 на вторичный ответ на ARV. Результаты выражены как конечные точки разведения, определенные с помощью ИФА (оптическая плотность (OD) была измерена при 450 нм). Отрицательный контроль - вакцинация с помощью PBS и адъюванта. Круги - первичный иммунный ответ на штамм вакцины против ARV S1133; Квадраты - Иммунный ответ на ARV после первичной вакцинации с помощью SC 122-326; Неперевернутые треугольники - Иммунный ответ на ARV после первичной вакцинации с помощью ARV; Перевернутые треугольники - Отрицательный контроль. *** Значимо отличается при P <0,001.
На Фиг. 6 изображена модель частичной структуры (аминокислоты 117-326) белка сигма C (SC) штамма S1133 реовируса птиц. Числа представляют собой положения аминокислот в структуре белка. Согласно Guardado-Calvo et al. [18].
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ СУЩНОСТИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Реовирус птиц (ARV) мутирует относительно быстро, и во всем мире существует много вариантов. Вакцины, которые защищают от одного генотипа, неэффективны против других (Lu et al. 2015; Vasserman et al. 2004; Goldenberg et al. 2010; Shapouri et al. 1995). Производство аттенуированной вакцины является длительным процессом, и неэффективным в случае сильно мутированных вирусов. Адаптация вакцин к изменениям в полевом вирусе заключается в использовании инактивированных вакцин, которые производятся путем размножения вирулентных изолятов в клеточных культурах или оплодотворенных яйцах и последующей их инактивации. В эпоху молекулярной биологии субъединичные вакцины могут быть получены с помощью генной инженерии. В этом способе в системе экспрессии продуцируется только соответствующий обновленный белок для индукции нейтрализующих антител. Как показано ранее [26, 27], белок сигма C (SC) в его полной 326-аминокислотной форме может быть экспрессирован в бактериальной системе экспрессии. Однако, хотя антитела против S1133, вирусного штамма ARV, идентифицируют рекомбинантный SC, был получен низкий титр антител в ответ на иммунизацию этим белком.
Три различных фрагмента остатков белка 1-326, 122-326 и 192-326 (Фиг. 5) были идентифицированы и испытаны в соответствии с данным изобретением в качестве кандидатов для субъединичной вакцины, которая будет индуцировать наивысший уровень нейтрализующих анти-ARV антител. Данное изобретение основано на том, что, хотя SC 1-326 индуцирует низкий титр антител, два других фрагмента индуцируют иммунный ответ с высоким титром антител, наиболее выделяющимся из которых является SC 122-326 (Фиг. 2). Было также установлено, что после стимуляции спленоцитов, выделенных от птиц, вакцинированных различными полипептидами SC, только клетки птиц, подвергшихся воздействию полипептида SC 122-326, пролиферировали в той же степени, что и положительный контроль, при котором была проведена вакцинация целым вирусом (Фиг. 4).
Поскольку SC 122-326 обеспечивал самые высокие уровни антител, он был дополнительно проанализирован. Способность получать вторичный иммунный ответ против ARV после прайминга с помощью SC 122-326 показала, что те же В- и Т-лимфоциты индуцируются с помощью SC 122-326 и целым вирусом (Фиг. 5). Это позволяет проводить вакцинацию в молодом возрасте с помощью SC 122-326 и преодолевать неспособность антител материнского происхождения стимулировать полный ответ.
Эффективность SC 122-326 в качестве вакцины против ARV была дополнительно протестирована с помощью теста на нейтрализацию вируса. Антитела, продуцируемые против белка SC, показали успешную нейтрализацию в клеточных системах [28, 45]. Однако тесты на нейтрализацию более точны при прогнозировании вирусной нейтрализации у взрослых птиц. Таким образом, в соответствии с данным изобретением было обнаружено, что антитела, продуцируемые после инъекции белка SC 122-326, являются протективными, исключая заражение эмбрионов птиц вирулентным штаммом в той же степени, что и антитела, продуцируемые в ответ на целый вирус (Таблица 5). Следует отметить, что антитела, полученные после инъекции полного белка SC (SC 1-326), не являются протективными. Таким образом, очевидно, что выделенный полипептид SC 122-326 имеет значительно отличающиеся характеристики, чем эквивалент в контексте полного белка.
С учетом вышеизложенного в одном аспекте данное изобретение относится к выделенному полипептиду, содержащему или по существу состоящему из аминокислотной последовательности, соответствующей аминокислотным остаткам, образующим полный или частичный α-спиральный домен, шарнирный домен, домен тройной β-спирали и полный или частичный глобулярный головной домен белка сигма C реовируса птиц, как изображено на Фиг. 6, и не имеющему последовательность аминокислот, которая является N-терминальной по отношению к указанному α-спиральному домену.
Термин «выделенный полипептид» относится к факту, что аминокислотная последовательность представляет собой фрагмент полноразмерного белка сигма С, который экспрессируется вне его естественного контекста в полноразмерном белке сигма С и используется в данном документе взаимозаменяемо с термины «рекомбинантный полипептид», «синтетический полипептид» или «фрагмент полноразмерного белка сигма С».
Различные области белка сигма C хорошо охарактеризованы, как описано в Guardado-Calvo, 2009; При рассмотрении общей структуры наблюдается четкое разделение между стержневым (аминокислотные остатки 117-191) и глобулярными головным доменами (аминокислотные остатки 196-326). Стержневой домен можно далее подразделить на a-спиральную тройную суперспираль (аминокислотные остатки 117-154), линкерную область (аминокислотные остатки 155-159) и два повтора тройной β-спирали (аминокислотные остатки 160-191).
В некоторых вариантах реализации изобретения выделенный полипептид содержит или, по существу, состоит из аминокислотной последовательности, соответствующей аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или, в особенности, 122-326, белка сигма C штамма S1 133 ARV, как указано далее в SEQ ID NO: 1, обозначенный в данном документе как «внутренняя последовательность белка S1 133» или «внутренняя аминокислотная последовательность». В частности, внутренняя аминокислотная последовательность имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с аминокислотной последовательностью, соответствующей аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.
В других конкретных вариантах реализации изобретения любой из изолированных полипептидов, определенных выше, блокирует или уменьшает связывание инфекционного реовируса птиц с нативным рецептором белка сигма C реовируса птиц. Способы измерения связывания лигандов с белками хорошо известны в данной области техники, например, с помощью поверхностного плазмонного резонанса (SPR), как описано в Barton Erik S, J.Craig Forres, Jodi L Connolly, James D Chappell, Yuan Liu, Frederick J Schnell, Asma Nusrat, Charles A Parkos, Terence S Dermody. Junction Adhesion Molecule Is a Receptor for Reovirus. Cell, Vol. 104, 441-451, February 9, 2001.
В еще более конкретных вариантах реализации изобретения любой из выделенных полипептидов, определенных выше, при введении птице, необязательно в сочетании с адъювантом, индуцирует защитный иммунный ответ против инфекционного реовируса птиц. В некоторых вариантах реализации изобретения, когда какой-либо один из выделенных полипептидов, определенных выше, вводится птице, он вызывает образование значительно более высоких системных уровней нейтрализующего антитела против белка сигма С по сравнению с системными уровнями указанного антитела, полученными после введения птице полноразмерного белка сигма C штамма S1133 ARV. Способы измерения индукции защитного иммунного ответа у птиц хорошо известны в данной области техники. Например, как описано в Примерах ниже, титр антител можно легко измерить в сыворотке вакцинированных птиц с помощью теста ИФА и способность сыворотки нейтрализовать вирулентный реовирус может быть легко исследована путем мониторинга ингибирования эмбриональной смертности после инокуляции живого вируса.
В некоторых вариантах реализации изобретения любой из выделенных полипептидов, определенных выше, содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, при не менее 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с внутренней аминокислотной последовательностью белка сигма C, выбранной из группы, указанной в Таблице 1, указанная внутренняя аминокислотная последовательность соответствует аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.
В некоторых вариантах реализации изобретения любой из выделенных полипептидов, определенных выше, включает аминокислотную последовательность, соответствующую внутренней аминокислотной последовательности в аминокислотной последовательности белка сигма С, выбранного из группы, указанной в Таблице 1, указанная внутренняя аминокислотная последовательность соответствует аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.
В конкретных вариантах реализации изобретения выделенный полипептид содержит или по существу состоит из аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 и SEQ ID NO: 5, такой как SEQ ID NO: 2 (т.е. внутренней последовательности белка SI 133, ISR5223, ISR5215 и ISR528, соответственно).
Таблица 1: Номера доступа баз данных для репрезентативных полноразмерных белков сигма C реовируса птиц.
В некоторых вариантах реализации изобретения любой из выделенных полипептидов, определенных выше, дополнительно содержит метку для идентификации и/или очистки, такую как полигистидиновая метка (например, His6), но также может быть метка (His-Asn)6, FLAG-метка или любая другая метка, которая может способствовать очистке полипептида. Можно использовать единственную метку или множество ее копий, или можно использовать различные метки в комбинациях. Метка(и) может быть слита с С-концом или N-концом полипептида. Например, выделенный полипептид, имеющий внутреннюю аминокислотную последовательность белка, указанную в любой из SEQ ID NO: 1 и 6-34, такой как SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5, может дополнительно содержать метку для идентификации и/или очистки, такую как описанная выше.
Для экспрессии описанных выше полипептидов бактериальные или эукариотические клетки, такие как дрожжи или растительные клетки, могут быть трансформированы молекулой нуклеиновой кислоты, а экспрессированный полипептид может быть очищен с использованием метки для очистки, вставленной в полипептид и/или с помощью других способов очистки белка, хорошо известных в данной области техники. Предпочтительно, полипептид экспрессируется в бактериальной клетке, более предпочтительно E. coli.
Для использования в иммуногенных композициях/вакцинах любой из указанных выше полипептидов может быть скомбинирован с белком-носителем, таким как, но не ограничиваясь этим, термолабильный энтеротоксин (LT) E. coli, бычий сывороточный альбумин и флагеллин. Белок-носитель может быть слит с N- или С-концом полипептида либо он может фланкировать полипептид на обоих концах. Белок-носитель может быть слит с полипептидом рекомбинантными способами, то есть полипептид и белок-носитель кодируются одной последовательностью нуклеиновой кислоты и экспрессируются в виде непрерывного полипептида. Альтернативно, полипептид и белок-носитель могут быть получены отдельно, а затем химически присоединены друг к другу.
Предпочтительным белком-носителем для всех аспектов данного изобретения является белок LT. Он обеспечивает функцию носителя, а также известен как мощный адъювант при инъекции и пероральном введении, который способен системно индуцировать сильный ответ IgG и локальный ответ IgA, а также цитотоксический ответ Т-клеток-хелперов. Поскольку реовирус представляет собой мукозальный антиген, предпочтительно стимулировать иммунный ответ мукозальной системы. Антитела IgA, полученные с помощью пероральных вакцинаций в тканях слизистой оболочки, являются основными сдерживающими факторами против мукозальных антигенов. LT-белок представляет собой гексамер, который состоит из двух субъединиц: 27-kDa каталитического домена A (LTA), закрепленного в кольце из пяти идентичных 11,6-кДа B-субъединиц (LTB). Фрагмент A1 является токсичным и катализирует перенос ADP-рибозы из NAD в стимулирующие α-субъединицы G-белков (Gsα). Для использования LT в качестве иммуностимулятора у животных его токсичность может быть нейтрализована мутациями (Vasserman, Y., Pitcovski, J., 2006). Либо одна из субъединиц A и B может использоваться в соединении с полипептидом согласно изобретению.
Полипептид также может быть присоединен к физиологически приемлемым микрогранулам, которые могут содержать молекулы энхансера, такие как LT, в дополнение к полипептиду. Альтернативно, полипептид может быть косвенно связан с носителем посредством антител или биотинилированных полипептидов, может быть связан с носителем через авидин или стрептавидин.
Микрочастицы, предназначенные для использования в данном изобретении, предпочтительно имеют размер в диапазоне от 10 нм до 200 мкм. Размер, выбранный для конкретной микрочастицы, будет зависеть от поставляемого активного агента и предполагаемого пути введения. Для пероральной доставки частицы обычно имеют диапазон размеров от 0,5 до 5,0 мкм. Для подкожной доставки подходящий размер составляет менее 100 мкм. Микрочастицы для парентеральной доставки обычно имеют размер менее 200 мкм, предпочтительно менее 150 мкм.
В дополнительном аспекте данное изобретение относится к молекуле нуклеиновой кислоты, содержащей последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую по меньшей мере один из выделенных полипептидов, определенных выше.
В другом аспекте данное изобретение относится к вектору экспрессии, содержащему контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с молекулой нуклеиновой кислоты, описанной выше, причем указанный экспрессионный вектор предназначен для репликации и экспрессии соответствующих генов, например, в клетке бактерий, дрожжей или насекомых.
Изобретение дополнительно рассматривает клетки, содержащие и/или экспрессирующие любой из векторов экспрессии, определенных выше. Примеры клеток, подходящих для экспрессии полипептидов согласно данному изобретению представляют собой бактериальные клетки, такие как клетки E.coli, клетки дрожжей, клетки насекомых, растительные клетки или клетки млекопитающих.
В следующем аспекте данное изобретение относится к вакцине, содержащей, по меньшей мере, один из выделенных полипептидов, описанных выше.
В еще одном аспекте данное изобретение предлагает вакцину, содержащую экспрессионный вектор млекопитающих, такой как pcDNA3, содержащий контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с любой из молекул нуклеиновой кислоты, описанных выше.
В дополнительном аспекте данное изобретение относится к вирусному вектору, такому как рекомбинантный вирус болезни Марека (MD), содержащий контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с любой из молекул нуклеиновой кислоты, описанных выше.
В WO 2009/093251, включенной посредством ссылки, как если бы она была полностью раскрыта в данном документе, раскрыто, что высоковариабельная и иммуногенная аминокислотная последовательность белка сигма C содержит консервативные и иммуногенные домены, которые являются общими для всех изолятов реовируса птиц, идентифицированных в Израиле и других странах. Выявленные консервативные последовательности расположены между аминокислотным остатком, соответствующим аминокислотным остаткам 170 и 323 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.
Термин «консервативный домен» относится к домену, сохраняющемуся среди вариантов вируса; а именно, аминокислотные последовательности доменов сходны, но не обязательно абсолютно идентичны друг другу.
WO 2009/093251 далее раскрывает, что генетически вариабельные штаммы реовируса птиц, или изоляты, инфицирующие птиц в Израиле и в других странах можно разделить на четыре группы в соответствии с изменчивостью аминокислотной последовательности белка сигма С, выраженной в изолятах. Один представитель одной из групп представляет собой только часть изолятов реовируса птиц в природе; однако один представитель каждой из четырех групп, взятые вместе, представляют собой много, если не большинство, вариантов, существующих в природе. Четыре группы изолятов реовируса (RI) упоминаются в данном документе как группы RI I-IV (Таблица 2).
Определяющей особенностью каждой группы RI является то, что аминокислотные последовательности различных белков сигма С указанной группы RI имеют по меньшей мере 75% идентичности. Состав групп может незначительно варьировать в зависимости от алгоритма и программного обеспечения, используемого для анализа последовательностей. Важная концепция заключается в том, что каждая группа представляет собой долю вирусной популяции и что отдельные представители, взятые из каждой из групп, вместе представляют собой всю вирусную популяцию.
Поскольку консервативные иммуногенные домены находятся в выделенном полипептиде согласно данному изобретению, концепция, раскрытая в WO 2009/093251, может быть использована для получения улучшенной вакцины, содержащей выделенные полипептиды согласно данному изобретению, которые представляют собой всю вирусную популяцию.
В соответствии с данным изобретением было обнаружено, что внутренний полипептид белков сигма С четырех различных вариантов реовируса птиц, каждый из которых соответствует аминокислотным остаткам 122-326 белка сигмы C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1 можно эффективно экспрессировать in vitro.
В некоторых вариантах реализации изобретения вакцина содержит по меньшей мере два разных рекомбинантных полипептида; или в случае вакцины, содержащей экспрессионный вектор млекопитающих или вирусный вектор, молекула нуклеиновой кислоты кодирует по меньшей мере два разных рекомбинантных полипептида; и каждый из указанных, по меньшей мере, двух различных рекомбинантных полипептидов получают из представителя одной из двух, трех или четырех групп различных белков сигма С, причем определяющим признаком каждой группы является то, что аминокислотные последовательности различных белков сигма С указанной группы имеют по меньшей мере 75% идентичности, необязательно, как показано в Таблице 2, и как описано в WO 2009/093251, включенной посредством ссылки, как если бы она была полностью раскрыта в данном документе. Используемый в данном документе термин «производный от» означает, что рекомбинантный полипептид представляет собой фрагмент репрезентативного белка сигма С, содержащего аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма С штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1. Вакцина может быть модифицирована путем замены одного полипептида, который является представителем для одной группы на другой полипептид из той же самой группы.
Таблица 2. Изоляты реовируса (RI) из Израиля, классифицированые в четырех группах RI и SEQ ID NO (SIN) белков сигма C (SCP), классифицированые в четырех соответствующих группах SCP.
1Жирным: изоляты, экспрессирующие вариант белка сигма C, наиболее соответствующий его группе.
2SIN, SEQ ID NO:
Например, один из по меньшей мере двух разных выделенных полипептидов может быть выделенным полипептидом, полученным из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I); полипептидом, полученным из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II); полипептидом, полученным из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); или полипептидом, полученным из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV). Вакцина дополнительно содержит один, два, три или более дополнительных различных полипептидов, как определено выше. В конкретных вариантах реализации изобретения в каждой из вышеуказанных соответствующих комбинаций различные полипептиды имеют аминокислотную последовательность, указанную в SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5.
В другом примере два из по меньшей мере двух различных полипептидов могут представлять собой первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (группа I) и второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II); первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I) и второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I) и второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV); первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II) и второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II) и второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV); или первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III) и вторым полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV). Вакцина дополнительно содержит один, два или более дополнительных полипептидов, как определено выше.
В конкретных вариантах реализации изобретения в каждой из вышеупомянутых соответствующих комбинаций два различных полипептида имеют аминокислотную последовательность, указанную в SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5.
Альтернативно, три из по меньшей мере двух различных полипептидов могут представлять собой первый полипептид, полученным из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I), второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II) и третий полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет не менее 75% идентичности по SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I), второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II) и третий полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV); первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I), второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III) и третий полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV); или первый полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II), второй полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности по SEQ ID NO: 17-22 (Группа III) и третий полипептид, полученный из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV). В конкретных вариантах реализации изобретения в каждой из вышеуказанных соответствующих комбинаций три различных полипептида имеют аминокислотную последовательность, указанную в SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 или SEQ ID NO: 5. Вакцина дополнительно содержит один или более дополнительных полипептидов, как определено выше.
В некоторых вариантах реализации изобретения вакцина содержит четыре различных полипептида; или вакцина, содержащая экспрессионный вектор млекопитающих или вирусный вектор, содержит молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую четыре различных полипептида, причем первый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I); второй из указанных четырех различных полипептидов получают из белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II); третий из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); и четвертый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 или 23 (Группа IV).
В конкретных вариантах реализации изобретения первый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85% по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 8 (Группа I); второй из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 16 (Группа II); третий из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% , или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 19 (Группа III); и четвертый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 23 (Группа IV).
В конкретных вариантах реализации изобретения первый из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 6-11 (Группа I); второй из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12-16 (Группа II); третий из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); и четвертый из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV). В более конкретных вариантах реализации изобретения четыре различных полипептида имеют аминокислотную последовательность, указанную в SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 и SEQ ID NO: 5.
В некоторых вариантах реализации изобретения любая из вакцин согласно данному изобретению содержит фармацевтически приемлемое количество фармацевтически приемлемого разбавителя или носителя. Фармакологически приемлемые разбавители и носители, подходящие для использования в вакцине согласно изобретению, могут представлять собой любой обычный жидкий носитель, подходящий для ветеринарных фармацевтических композиций, такой как сбалансированный солевой раствор, подходящий для использования в тканях или средах для культивирования клеток, например, фосфатно-солевой буферный раствор или дистиллированную воду. Другие подходящие среды могут включать эмульсии. Обезжиренное сухое молоко можно использовать в качестве носителя в вакцинах, приготовленных для применения с помощью питьевой воды.
В некоторых вариантах реализации изобретения любая из вакцин согласно данному изобретению, независимо от того, содержит ли она фармацевтически приемлемое количество фармацевтически приемлемого разбавителя или носителя или нет, дополнительно содержит адъювант, такой как термолабильный энтеротоксин (LT), полный адъювант Фрейнда, неполный адъювант Фрейнда, гидроксид алюминия; и/или консервант, такой как тимеросал или 20% эмульсии вода-в-масле с, например, минеральным маслом Marcol 52 (ESSO, Франция).
В еще одном аспекте данное изобретение относится к любой из вакцин или вирусных векторов, описанных выше, для использования при вакцинации видов птиц или для использования в индуцировании иммунного ответа птиц, обеспечивающего защиту от реовируса птиц. Вакцина или вирусный вектор могут использоваться вместе с фармацевтически приемлемым количеством фармацевтически приемлемого разбавителя или носителя и/или адъюванта, как описано выше.
В еще одном дополнительном аспекте данное изобретение относится к способу вакцинации видов птиц или для индуцирования иммунного ответа птиц, обеспечивающего защиту от реовируса птиц, который включает введение птице любой из вакцин или вирусных векторов, описанных выше. В конкретных вариантах реализации изобретения вакцина содержит комбинацию из четырех изолированных полипептидов, как описано выше. Вакцину или вирусный вектор можно вводить вместе с фармацевтически приемлемым количеством фармацевтически приемлемого разбавителя или носителя и/или адъюванта, как описано выше.
В некоторых вариантах реализации изобретения виды птиц, которые могут быть вакцинированы с использованием любой из вакцин и способов, описанных в данном документе, представляют собой любые виды птиц, которые производятся на коммерческой основе, такие как домашняя птица, например, куры, индейки, утки, гуси, фазаны, голуби или цесарки.
В некоторых вариантах реализации изобретения описанное выше применение или способ индуцирует продукцию значительно более высоких, например, статистически значимо более высоких, системных уровней нейтрализующего антитела против белка сигма C по сравнению с системными уровнями указанного антитела, полученными после введения указанной птице полноразмерного белка сигма С штамма S1133 ARV.
В некоторых вариантах реализации изобретения вакцина может быть введена любым подходящим способом введения, таким как инъекция, внутрикожно или подкожно; или перорально с питьевой водой.
Далее изобретение будет проиллюстрировано следующими неограничивающими примерами.
ПРИМЕРЫ
Материалы и Способы
Экспрессия белка SC
Три фрагмента кДНК SC из штамма вакцины S1133, кодирующего остатки SC 1-326, 122-326 и 192-326, были получены с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) со специально разработанными олигонуклеотидами (Таблица 3). Фрагменты 122-326 и 192-326 были разрезаны рестрикционными ферментами BamHI и EagI, сайты разрезания которых были введенными в праймеры во время синтеза, и были
Таблица 3. Разработанные олигонуклеотиды для амплификации фрагментов сигма C (SC).
aОлигонуклеотиды были разработаны для амплификации гена, кодирующего частичные белки SC122-326 и SC192-326; 5'-концы олигонуклеотидов были разработаны для создания сайтов рестрикции ферментов BamHI-EagI, BamHI-Eagl и EcoRI-EcoRI (подчеркнуто), соответственно, после амплификации ПЦР.
клонированы в экспрессионный вектор pET28a (Novagen, Darmstadt, Германия), который содержал метку для очистки, содержащую шесть последовательных гистидиновых остатков на N-конце. Последовательность вставки была подтверждена с помощью анализа ДНК-последовательности (Hy-Labs, Rehovot, Израиль). Для экспрессии штамм BL21 (DE3) Escherichia coli был свежетрансформирован плазмидой. Культуры выращивали аэробно при температуре 37 °C до оптической плотности (OD) 0,6-0,8 при 600 нм. Культуры охлаждали до температуры ниже 25 °С и экспрессию индуцировали добавлением 1 мМ изопропил β-D-1-тиогалактопиранозида (IPTG) и инкубированием в течение 3 ч при 25 °С. Собранные клетки ресуспендировали в 40 мл холодного ресуспензионного буфера (4,29 мМ Na2HPО4, 1,47 мМ KH2PO4, 2,7 мМ KCl, 137 мМ NaCl, 0,1 % об./об. Tween-20) и замораживали при температуре -20 °C (Guardado-Calvo et al. 2009). Бактерии подвергали лизису с помощью ультразвука три раза в течение 10 мин каждый раз (Sonics, Taunton, MA, США), центрифугировали (10000×g в течение 15 мин при 4 °C) и осадок отбрасывали. Остаток SC 1-326 экспрессировали, как описано ранее (Goldenberg et al., 2011). Экспрессируемый фрагмент белка SC122-326 очищали в колонке с агарозой Ni-NTA в соответствии с инструкциями производителя (Qiagen, Hilden, Германия). Очищенный белок подвергали диализу в течение ночи против фосфатно-солевого буфера (PBS) при 4 °С. Экспрессируемые SC-белки были обнаружены с помощью 12%-ного электрофореза в SDS-полиакриламидном геле (PAGE). Количество белка SC оценивали по сравнению со стандартной кривой известных количеств альбумина бычьей сыворотки, добавленных в анализ на том же геле.
Клонирование и экспрессия SC в Pichia pastoris
Фрагмент ДНК, кодирующий остатки SC 1-326, получали с помощью ПЦР со специфически сконструированными олигонуклеотидами (Таблица 3). Этот фрагмент был разрезан рестрикционным ферментом EcoRI (GAATTC), сайт разрезания которого введен праймерами во время синтеза. Выделенный фрагмент лигировали с плазмидой pHILD2, представленной в наборе P. pastoris (Invitrogen, San Diego, CA, США), как описано ранее (Pitcovski et al., 2003). Кратко, лигированная ДНК-конструкция трансформировалась в клетки E. coli XL1-Blue и белые колонии, которые росли на чашках LB (Луриа-Бертани), содержащих ампициллин (100 мкг/мл), X-Gal до конечной концентрации 80 мкг/мл и IPTG до конечной концентрации 20 мМ были выделены. После характеристики, плазмиды, содержащие SC с правильной последовательностью, клонировали в P. pastoris следующим образом.
Вектор линеаризировали и вводили в клетки P. pastoris, что приводило к введению трансгена в локус AOX1. Положительные колонии выращивали и производство рекомбинантного белка индуцировали с помощью добавления метанола. После индукции клетки лизировали путем интенсивного встряхивания со стеклянными гранулами, центрифугировали и супернатант, содержащий растворимый SC, анализировали с помощью SDS-PAGE.
Иммуноферментный анализ (ИФА)
Для определения титра анти-SC-антител, SC использовали в качестве антигена в ИФА. Антиген разбавляли в покрывающем буфере (0,397 г Na2CО3, 0,732 г NaHCО3, 250 мл бидистиллированной воды с pH 9,6) и инкубировали в пластине ИФА (Nunc, Rochester, NY, США) в течение 24 часов при температуре 4 °C.После каждого последующего этапа следовали три промывки с помощью 0,05% Tween-20 в PBS. Сыворотку птиц, вакцинированных тестируемыми белками или контролями, последовательно разводили в 2 раза (1:100-1:800 000) в блокирующем буфере (5% мас./об. обезжиренного молока, 0,05% Твин-20 в PBS) и инкубировали в течение 1 часа. Добавляли вторичное антитело, конъюгированный с пероксидазой кроличий анти-куриный IgG (Sigma, Rehovot, Израиль), разбавленный 1:7000 и смесь инкубировали в течение 1 часа. Затем добавляли субстрат o-фенилендиаминдигидрохлорид (Sigma). OD измеряли с помощью считывателя ИФА (Thermo Scientific Multiskan RC, Vantaa, Финляндия) при 450 нм. Титр конечной точки определяли как последнее разбавление, для которого OD оставалось положительным (относительно отрицательного контроля в ИФА).
Уровень анти-ARV антител сыворотке вакцинированных птиц определяли с помощью коммерческого ИФА (IDEXX® Laboratories, США) в соответствии с инструкциями производителя. Значения OD измерялись при 650 нм. Значения отношения поглощения образца к контролю (S/P), превышающие 0,2, считали положительным на ARV (отношение S/P = среднее значение OD образца) - среднее значение OD отрицательного контроля/среднее значение OD положительного контроля - среднее значение OD отрицательного контроля).
Анализ пролиферации клеток
Селезенки отбирали у птиц в течение 42 дней после вакцинации и подвергали мацерации с помощью плунжера шприца через сито для получения суспензии отдельных клеток в PBS. Спленоциты суспендировали в RPMI 1640 с добавлением 2% фетальной бычьей сыворотки, 2 мМ L-глутамина, пенициллина (100 ед/мл) и стрептомицина (10 нг/мл) (Biotech Industry, Bet Haemek, Израиль). Клетки (1 × 106 на лунку) высевали на 96-луночные культуральные планшеты. Конканавалин А (ConA, 5 мкг/мл), липополисахарид (LPS, 5 мкг/мл) или ARV (5 мкл/лунка при титре 106,6) (Sigma Aldrich) добавляли в качестве стимуляторов в трех повторностях и инкубировали в течение 48 часов. Анализ CellTiter-Blue (CTB) проводили путем добавления 20 мкл реагента CTB (Promega, Madison, WI, США) в каждую лунку. Затем клетки инкубировали в течение 6 ч при температуре 37 °С при 5% СО2. Интенсивность цвета реагента CTB определяли с помощью флуорометра при длинах волн возбуждения/излучения 560 и 590 нм соответственно. Измеренное поглощение было пропорционально количеству жизнеспособных клеток. Результаты были рассчитаны и представлены как индекс стимуляции (SI), представляющий соотношение между стимулированными и не стимулированными клетками.
Тест на нейтрализацию вирулентного штамма S1133 ARV
Способность сыворотки нейтрализовать вирулентный реовирус проверялась путем мониторинга ингибирования эмбриональной смертности через 3-7 дней после инокуляции. Тестируемые сыворотки фильтровали и нагревали в течение 30 мин при температуре 56 °С для инактивации активности комплемента. Вирус разбавляли с помощью PBS в серии 10-кратных разведений. Смеси равных объемов разбавленных вируса и сывороток (или PBS в качестве отрицательного контроля) инкубировали в течение 40 мин при комнатной температуре. Каждую из смесей инокулировали в пять 7-дневных оплодотворенных яиц SPF.
Чтобы подтвердить потенциал вирулентности индикаторного вируса, 10 яиц инокулировали неразбавленными вирусом, который смешивали 1:1 с PBS. Кроме того, в нескольких экспериментах безвирусные сыворотки инокулировали в оплодотворенные яйца, чтобы подтвердить отсутствие неспецифической смертности из-за компонентов сыворотки. Все яйца ежедневно освещались в темной комнате, чтобы определить жизнеспособность эмбриона, и было зарегистрировано количество живых и мертвых эмбрионов.
Индекс нейтрализации (NI) определяли как отношение между самым высоким разведением вируса, которое убило по меньшей мере 95% (кумулятивно) эмбрионов и разведением вируса, которое убило одинаковый процент эмбрионов в присутствии антител. Значение NI выражалось как отношение между log разведений. NI, равный 2 или более в антисыворотке, рассматривался как нейтрализующий вирус.
Таблица 4. Программа вакцинации.
aВозраст, дней;bПоложительный контроль;cОтрицательный контроль.
Статистические вычисления
Результаты ИФА, нейтрализации и клеточной пролиферации были проанализированы с помощью однофакторного анализа дисперсии (ANOVA) тестом Тьюки. Все анализы были выполнены с помощью программного обеспечения GraphPadPrism5.
Пример 1. Экспрессия белка SC
После анализа структуры белка SC фрагменты кДНК, кодирующие три полипептидных остатка: 1-326, 122-326, 192-326, продуцировали, клонировали и экспрессировали в E.coli. На 5'-конце добавляли полигистидиновую метку, чтобы можно было обнаружить и очистить экспрессированные белки. Полученные белки были частично очищены. Экспрессированные фрагменты SC были ожидаемого размера 36 кД, 23 кД и 15 кД (соответственно), при определении на 12%-ном SDS-полиакриламидном геле.
На Фиг.1 изображена эффективная экспрессия фрагмента 122-326 четырех различных изолятов реовируса: SC1 133, SC528, SC5223 и SC5215.
Пример 2. Образование антитела в ответ на вакцинацию
После вакцинации иммуногенность белков SC и способность продуцируемых антител к детектированию вируса тестировали с помощью ИФА. Используя SC 122-326 в качестве антигена, антитела, полученные после вакцинации белками SC122-326 и SC192-326, обнаружили антиген при высоких титрах 1: 800,000. Среднее значение титров птиц в этой группе было значимо выше (Р <0,001), чем среднее значение в отрицательном контроле, тогда как среднее значение титра антител, полученное после вакцинации белком SC 1-326, было аналогично такому отрицательного контроля (Фиг.2).
Уровень антител против целого вируса после вакцинации SC 192-326 или отрицательный контроль достигли значения 0,2 или ниже, тогда как уровни антител, полученных после вакцинации SC 1-326 или SC 122-326, были положительными (0,25 и 0,5 соответственно) (Фиг. 3). S/P в группе SC 122-326 было значительно выше, чем в других группах.
Аналогичным образом, после вакцинации иммуногенность фрагментов SC 122-326 четырех разных Групп RI (SEQ ID NO: 2, 3, 4 и 5) и способность продуцируемых антител к обнаружению вирусов тестируются с помощью ИФА.
Пример 3. Пролиферация клеток
Спленоциты от вакцинированных цыплят исследовали на антигенспецифическую клеточную пролиферацию. Клетки обрабатывали с помощью ConA в качестве контроля пролиферации Т-клеток, LPS в качестве контроля пролиферации В-клеток (положительный контроль), PBS (отрицательный контроль) и ARV (специфический антиген). В анализе CTB измеренное поглощение пропорционально количеству жизнеспособных клеток. Результаты представлены как SI (митоген- или антиген-стимулированные/нестимулированные клетки).
Обработки в случае положительного контроля проявляли пролиферацию после стимула. Клетки, стимулированные с помощью ARV, показали значимые различия среди групп лечения. Клетки из группы, иммунизированной вирусом или SC 122-326 показали значимую пролиферацию по сравнению с отрицательным контролем (P <0,01), тогда как пролиферация в группе, которой была введена SC1-326, была значимо ниже, чем SC 122-326, или у групп положительного контроля (P <0,05) (Фиг.4).
Аналогично, спленоциты от цыплят, вакцинированных комбинированной вакциной, содержащей полипептиды SEQ ID NO: 2, 3, 4 и 5 исследуются на предмет антигенспецифической клеточной пролиферации.
Пример 4. Эффект SC122-326 для индукции ответа против ARV
Был протестирован эффект вакцинации SC 122-326 по сравнению с вакцинацией цельновирусной вакциной в качестве индуктора первичного ответа против ARV. Одной группе цыплят вводили вакцину против штамма ARV S1133, а другой - SC 122-326. Через две недели ARV S1133 вводили в обе группы. Первичная вакцинация с помощью ARV или SC 122-326 вызывает аналогичное значимое повышение после вторичной вакцинации целым ARV (Фиг. 5).
Аналогичным образом, был исследован эффект вакцинации комбинированной вакциной, содержащей полипептиды SEQ ID NO: 2, 3, 4 и 5 по сравнению с вакцинацией цельновирусной вакциной в качестве индуктора первичного ответа против ARV.
Пример 5. Нейтрализация вируса
Сыворотки от вакцинированных птиц тестировали на предмет способности нейтрализации вирулентного вируса в оплодотворенных яйцах SPF. Защита не была обеспечена сыворотками, продуцируемыми птицами в случае отрицательного контроля, или группой, которой вводили SC 1-326 (NI = 0). Напротив, сыворотка, продуцируемая птицами, инъецированными белком SC 122-326, обеспечивала защиту (способность к нейтрализации), подобную той, которая достигалась с помощью антител, которые развивались после вакцинации целым вирусом (NI> 4) (Таблица 3).
Аналогичным образом, сыворотки от птиц, вакцинированных комбинированной вакциной, содержащей полипептиды SEQ ID NO: 2, 3, 4 и 5 исследуются на предмет на способности нейтрализации вирулентного вируса в оплодотворенных яйцах SPF.
Таблица 5. Нейтрализация вируса антителами против ARV или SC фрагментов.
aИндекс нейтрализации (NI) 2 или выше рассматривается как нейтрализующий против этого вируса.
ССЫЛКИ
Benavente, J. & Martmez-Costas, J., 2007. Avian reovirus: Structure and biology. Virus Research, 123(2), pp. 105-119. Available at: http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0168170206002772.
Fingerut, E. et al., 2003. A subunit vaccine against the adenovirus egg-drop syndrome using part of its fiber protein. Vaccine, 21, pp.2761-2766.
Goldenberg, D. et al., 2011. Differentiating infected from vaccinated animals, and among virulent prototypes of reovirus. Journal of Virological Methods, 177(1), pp.80-86. Available at: http://dx.doi.Org/10.1016/j.jviromet.2011.06.023.
Goldenberg, D. et al., 2010. Genetic and antigenic characterization of sigma C protein from avian reovirus. Avian pathology : journal of the W.V.P.A, 39(3), pp. 189-199.
Grande, A.N.A. et al., 1997. Protein Architecture of Avian Reovirus S1 133 and Identification of the Cell Attachment Protein. ,71(1), pp.59-64.
Guardado Calvo, P. et al., 2005. Structure of the Carboxy-terminal Receptor-binding Domain of Avian Reovirus Fibre SigmaC. Journal of Molecular Biology, 354(1), pp. 137-149.
Available at: http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0022283605010995.
Guardado-Calvo, P. et al., 2009. Crystallographic structure of the a -helical triple coiled-coil domain of avian reovirus S1 133 fibre. Journal of General Virology, 90(2009), pp.672-677.
van der Heide, L., Kalbac, M. & Brustolon, M., 1983. Development of an attenuated apathogenic reovirus vaccine against viral arthritis/tenosynovitis. Avian diseases, 27(3), pp.698-706. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6314976 [Accessed December 9, 2015].
Jones, R.C., 2000. Avian reovirus infections. Revue scientifique et technique (International Office of Epizootics), 19(2), pp.614-25. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10935283 [Accessed December 9, 2015].
Jung, K.M. et al., 2014. Use of IgY antibody to recombinant avian reovirus oC protein in the virus diagnostics. Acta virologica, 58(2), pp. 108-13. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24957714 [Accessed December 9, 2015].
Kant, A. et al., 2003. Classification of Dutch and German avian reoviruses by sequencing the sigma C protein. Veterinary research, 34(2), pp.203-12. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12657212 [Accessed December 9, 2015].
Lu, H. et al., 2015. Isolation and molecular characterization of newly emerging avian reovirus variants and novel strains in Pennsylvania, USA, 2011-2014. Scientific Reports, 5(April), p.14727. Available at: http://www.nature.com/articles/srepl4727.
Lublin, A. et al., 2011. Wide-range protection against avian reovirus conferred by vaccination with representatives of four defined genotypes. Vaccine, 29(47), pp.8683-8688. Available at: http://dx.doi.Org/10.1016/j.vaccine.2011.08.114.
McAleer, W.J. et al., 1984. Human hepatitis B vaccine from recombinant yeast. Nature, 307(5947), pp. 178-80. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6318124 [Accessed December 9, 2015].
Pitcovski, J. et al., 2005. A subunit vaccine against hemorrhagic enteritis adenovirus. Vaccine, 23,pp.4697-4702.
Pitcovski, J. et al., 2003. Development and large-scale use of recombinant VP2 vaccine for the prevention of infectious bursal disease of chickens. Vaccine, 21, pp.4736-4743.
Shapouri, M.R. et al., 1995. Cloning, sequencing and expression of the S1 gene of avian reovirus. The Journal of general virology, 76 ( Pt 6)(1995), pp.1515-20. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7782781.
Shapouri, M.R.S. et al., 1996. Characterization of monoclonal antibodies against avian reovirus strain S1133. Avian pathology: journal of the W.V.P.A, 25(1), pp.57-67. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18645837 [Accessed December 9, 2015].
Troxler, S. et al., 2013. Identification of a new reovirus causing substantial losses in broiler production in France, despite routine vaccination of breeders. The Veterinary record, 172(21), p.556. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23636701 [Accessed December 9, 2015].
Valentino, K. & Poronsky, C.B., 2015. Human Papillomavirus Infection and Vaccination. Journal of pediatric nursing. Available at: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0882596315003267 [Accessed November 22, 2015].
Vasserman, Y. et al., 2004. The influence of reovirus sigma C protein diversity on vaccination efficiency. Avian diseases, 48(2), pp.271-8. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15283414 [Accessed December 9, 2015].
Wu, H. et al., 2005. Yeast-derived sigma C protein-induced immunity against avian reovirus. Avian diseases, 49(2), pp.281-4. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16094835 [Accessed December 9, 2015].
Lublin, A. et al., 2011. Wide-range protection against avian reovirus conferred by vaccination with representatives of four defined genotypes. Vaccine, 29(47), pp.8683-8688. Available at: http://dx.doi.Org/10.1016/j.vaccine.2011.08.114.
McAleer, W.J. et al., 1984. Human hepatitis B vaccine from recombinant yeast. Nature, 307(5947), pp. 178-80. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/6318124 [Accessed December 9, 2015].
Pitcovski, J. et al., 2005. A subunit vaccine against hemorrhagic enteritis adenovirus. Vaccine, 23,pp.4697-4702.
Pitcovski, J. et al., 2003. Development and large-scale use of recombinant VP2 vaccine for the prevention of infectious bursal disease of chickens. Vaccine, 21, pp.4736-4743.
Shapouri, M.R. et al., 1995. Cloning, sequencing and expression of the S1 gene of avian reovirus. The Journal of general virology, 76 (Pt 6)(1995), pp.1515-20. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7782781.
Shapouri, M.R.S. et al., 1996. Characterization of monoclonal antibodies against avian reovirus strain S1133. Avian pathology: journal of the W.V.P.A, 25(1), pp.57-67. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18645837 [Accessed December 9, 2015].
Troxler, S. et al., 2013. Identification of a new reovirus causing substantial losses in broiler production in France, despite routine vaccination of breeders. The Veterinary record, 172(21), p.556. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23636701 [Accessed December 9, 2015].
Valentino, K. & Poronsky, C.B., 2015. Human Papillomavirus Infection and Vaccination. Journal of pediatric nursing. Available at: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0882596315003267 [Accessed November 22, 2015].
Vasserman, Y. et al., 2004. The influence of reovirus sigma C protein diversity on vaccination efficiency. Avian diseases, 48(2), pp.271-8. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15283414 [Accessed December 9, 2015].
Wu, H. et al., 2005. Yeast-derived sigma C protein-induced immunity against avian reovirus. Avian diseases, 49(2), pp.281-4. Available at: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16094835 [Accessed December 9, 2015].
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> Gavish-Galilee Bio Applications, Ltd
Pitcovski, Jacob
Goldenberg, Dana
<120> ОПТИМИЗИРОВАННЫЙ ПОЛИПЕПТИД ДЛЯ СУБЪЕДИНИЧНОЙ ВАКЦИНЫ ПРОТИВ РЕОВИРУСА ПТИЦ
<130> GAVISH-067 PCT
<150> 62275838
<151> 2016-01-07
<160> 34
<170> PatentIn версия 3.5
<210> 1
<211> 326
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 1
Met Ala Gly Leu Asn Pro Ser Gln Arg Arg Glu Val Val Ser Leu Ile
1 5 10 15
Leu Ser Leu Thr Ser Asn Val Asn Ile Ser His Gly Asp Leu Thr Pro
20 25 30
Ile Tyr Glu Arg Leu Thr Asn Leu Glu Ala Ser Thr Glu Leu Leu His
35 40 45
Arg Ser Ile Ser Asp Ile Ser Thr Thr Val Ser Asn Ile Ser Ala Asn
50 55 60
Leu Gln Asp Met Thr His Thr Leu Asp Asp Val Thr Ala Asn Leu Asp
65 70 75 80
Gly Leu Arg Thr Thr Val Thr Ala Leu Gln Asp Ser Val Ser Ile Leu
85 90 95
Ser Thr Asn Val Thr Asp Leu Thr Asn Arg Ser Ser Ala His Ala Ala
100 105 110
Ile Leu Ser Ser Leu Gln Thr Thr Val Asp Gly Asn Ser Thr Ala Ile
115 120 125
Ser Asn Leu Lys Ser Asp Ile Ser Ser Asn Gly Leu Ala Ile Thr Asp
130 135 140
Leu Gln Asp Arg Val Lys Ser Leu Glu Ser Thr Ala Ser His Gly Leu
145 150 155 160
Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala Asp Gly Val Val Ser Leu Asp
165 170 175
Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser
180 185 190
Ala Glu Ala Gln Leu Met Gln Phe Arg Trp Met Ala Arg Gly Thr Asn
195 200 205
Gly Ser Ser Asp Thr Ile Asp Met Thr Val Asn Ala His Cys His Gly
210 215 220
Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser Thr Gly Asn Leu Thr Val Thr
225 230 235 240
Ser Asn Val Val Leu Leu Thr Phe Asp Leu Ser Asp Ile Thr His Ile
245 250 255
Pro Ser Asp Leu Ala Arg Leu Val Pro Ser Ala Gly Phe Gln Ala Ala
260 265 270
Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp Ser Ala Thr His Ala
275 280 285
Tyr Gln Ala Tyr Gly Val Tyr Ser Ser Ser Arg Val Phe Thr Ile Thr
290 295 300
Phe Pro Thr Gly Gly Asp Gly Thr Ala Asn Ile Arg Ser Leu Thr Val
305 310 315 320
Arg Thr Gly Ile Asp Thr
325
<210> 2
<211> 205
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная Последовательность
<220>
<223> синтетическая
<400> 2
Asp Gly Asn Ser Thr Ala Ile Ser Asn Leu Lys Ser Asp Ile Ser Ser
1 5 10 15
Asn Gly Leu Ala Ile Thr Asp Leu Gln Asp Arg Val Lys Ser Leu Glu
20 25 30
Ser Thr Ala Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala
35 40 45
Asp Gly Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg
50 55 60
Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Gln Leu Met Gln Phe Arg
65 70 75 80
Trp Met Ala Arg Gly Thr Asn Gly Ser Ser Asp Thr Ile Asp Met Thr
85 90 95
Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser
100 105 110
Thr Gly Asn Leu Thr Val Thr Ser Asn Val Val Leu Leu Thr Phe Asp
115 120 125
Leu Ser Asp Ile Thr His Ile Pro Ser Asp Leu Ala Arg Leu Val Pro
130 135 140
Ser Ala Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr
145 150 155 160
Arg Asp Ser Ala Thr His Ala Tyr Gln Ala Tyr Gly Val Tyr Ser Ser
165 170 175
Ser Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly Asp Gly Thr Ala
180 185 190
Asn Ile Arg Ser Leu Thr Val Arg Thr Gly Ile Asp Thr
195 200 205
<210> 3
<211> 205
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная Последовательность
<220>
<223> синтетическая
<400> 3
Gln Ala Leu Leu Val Glu Val Ser Asn Leu Lys Ser Ser Val Ser Ser
1 5 10 15
Gln Gly Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala Leu Glu
20 25 30
Gly Gly Ser Ser Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys Leu Glu
35 40 45
Asp Gly Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Val Ser
50 55 60
Arg Asn Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln
65 70 75 80
Trp Ser Val Lys Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp
85 90 95
Val Asn Ala His Ser His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr
100 105 110
Lys Gln Ser Leu Thr Val Thr Thr Ser Pro Ala Thr Leu Val Phe Glu
115 120 125
Leu Asp Arg Ile Thr Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro
130 135 140
Cys His Gly Phe Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe Gln
145 150 155 160
Arg Asp Gly Val Ser His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Lys Tyr Ser Ser
165 170 175
Ser Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly Asp Gly Thr Ala
180 185 190
Asn Ile Arg Ser Leu Thr Val Arg Thr Gly Ile Asp Thr
195 200 205
<210> 4
<211> 205
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная Последовательность
<220>
<223> синтетическая
<400> 4
Asn Gly Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn Leu Arg Asn Asp Val Ser Ala
1 5 10 15
Ser Gly Leu Asn Ile Thr Asp Leu Gln Asn Arg Val Lys Ser Leu Glu
20 25 30
Ser Asp Thr Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala
35 40 45
Asp Gly Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg
50 55 60
Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Arg Leu Met Gln Phe Gln
65 70 75 80
Trp Val Ala Lys Gly Thr Ser Gly Ser Ser Asp Thr Ile Asp Met Thr
85 90 95
Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser
100 105 110
Thr Gly Gly Leu Thr Val Thr Ser Asn Ala Val Ser Leu Thr Phe Asp
115 120 125
Leu Ser Tyr Ile Thr Asn Met Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro
130 135 140
Ser Ala Gly Phe Gln Val Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr
145 150 155 160
Arg Glu Ser Ser Thr His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Ala Tyr Ser Ser
165 170 175
Ala Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly Asn Gly Thr Ser
180 185 190
Asn Ile Arg Phe Leu Thr Val Arg Thr Gly Ile Asp Thr
195 200 205
<210> 5
<211> 205
<212> БЕЛОК
<213> Искусственная Последовательность
<220>
<223> синтетическая
<400> 5
Asn Ala Asn Val Thr Asp Ile Ala Asn Leu Lys Gly Ser Val Thr Thr
1 5 10 15
Leu Ser Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu
20 25 30
Ser Gly Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr
35 40 45
Asp Gly Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn
50 55 60
His Ala Leu Thr Ser Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln
65 70 75 80
Trp Leu Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu
85 90 95
Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr
100 105 110
Thr Glu Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser
115 120 125
Leu Asp Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro
130 135 140
Arg Ala Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr
145 150 155 160
Arg Asp Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala Tyr Ser Ser
165 170 175
Ser Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly Asp Gly Thr Ala
180 185 190
Asn Ile Arg Ser Leu Thr Val Arg Thr Gly Ile Asp Thr
195 200 205
<210> 6
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 6
Gly Asp Leu Lys Ser Val Tyr Glu Arg Leu Thr Ser Leu Glu Ala Ser
1 5 10 15
Thr Glu Ser Leu Arg Gln Ser Val Ser Gly Met Ser Val Thr Leu Ser
20 25 30
Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asp Thr Thr Arg Ala Leu Asp Asp Val
35 40 45
Thr Val Thr Leu Asn Asn Leu Ser Ala Thr Ile Thr Ala Leu Gln Ser
50 55 60
Ser Val Thr Thr Leu Ser Ala Thr Val Asp Glu Leu Thr Asn Thr Ser
65 70 75 80
Ser Ala His Ser Gly Met Leu Ser Ser Leu Gln Thr Ile Ile Asn Gly
85 90 95
Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn Leu Arg Asn Asp Val Ser Ala Ser Gly
100 105 110
Leu Asn Ile Thr Asp Leu Gln Asn Arg Val Lys Ser Leu Glu Ser Asp
115 120 125
Thr Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg Val Ser
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Arg Leu Met Gln Phe Gln Trp Val
165 170 175
Ala Lys Gly Thr Ser Gly Ser Ser Asp Thr Ile Gly Met Thr Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser Thr Gly
195 200 205
Gly Leu Thr Val Thr Ser Asn Ala Val Ser Leu Thr Phe Asp Leu Ser
210 215 220
Tyr Ile Thr Asn Met Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Ser Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Val Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Glu
245 250 255
Ser Ser Thr His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 7
<211> 268
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 7
Gly Asp Leu Lys Ser Val Tyr Glu Arg Leu Asn Ser Leu Glu Ala Ser
1 5 10 15
Thr Glu Ser Leu Arg Gln Ser Val Ser Gly Met Ser Val Thr Leu Ser
20 25 30
Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asp Thr Thr Arg Ala Leu Asp Asp Val
35 40 45
Thr Val Thr Leu Asn Asn Leu Ser Ala Thr Ile Thr Ala Leu Gln Ser
50 55 60
Ser Val Thr Thr Leu Ser Ala Thr Val Asp Glu Leu Thr Asn Thr Ser
65 70 75 80
Ser Ala His Ser Gly Met Leu Ser Ser Leu Gln Thr Ile Ile Asn Gly
85 90 95
Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn Leu Arg Asn Asp Val Ser Ala Ser Gly
100 105 110
Phe Asp Ile Ser Asp Leu Gln Asn Arg Val Lys Ser Leu Glu Ser Asp
115 120 125
Thr Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg Val Ser
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Arg Leu Met Gln Phe Gln Trp Val
165 170 175
Ala Lys Gly Thr Ser Gly Ser Ser Asp Thr Ile Asp Met Thr Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser Thr Gly
195 200 205
Gly Leu Thr Val Thr Ser Asn Ala Val Ser Leu Thr Phe Asp Leu Ser
210 215 220
Tyr Ile Thr Asn Met Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Ser Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Val Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Glu
245 250 255
Ser Ser Thr His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Ala Tyr
260 265
<210> 8
<211> 315
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 8
Ser Ser Gln Arg Arg Glu Val Val Ser Leu Ile Leu Ser Leu Asn Ser
1 5 10 15
Asn Val Thr Ile Asn Pro Gly Asp Leu Lys Ser Val Tyr Glu Arg Leu
20 25 30
Asn Ser Leu Glu Ala Ser Thr Glu Ser Leu Arg Gln Ser Val Ser Gly
35 40 45
Met Ser Val Thr Leu Ser Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asp Thr Thr
50 55 60
Arg Ala Leu Asp Asp Val Thr Val Thr Leu Asn Asn Leu Ser Ala Thr
65 70 75 80
Ile Thr Ala Leu Gln Ser Ser Val Thr Thr Leu Ser Ala Thr Val Asp
85 90 95
Glu Leu Thr Asn Thr Ser Ser Ala His Ser Gly Met Leu Ser Ser Leu
100 105 110
Gln Thr Ile Ile Asn Gly Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn Leu Arg Asn
115 120 125
Asp Val Ser Ala Ser Gly Leu Asn Ile Thr Asp Leu Gln Asn Arg Val
130 135 140
Lys Ser Leu Glu Ser Asp Thr Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro
145 150 155 160
Leu Ser Val Ala Asp Gly Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe
165 170 175
Cys Ser Gln Arg Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Arg Leu
180 185 190
Met Gln Phe Gln Trp Val Ala Lys Gly Thr Ser Gly Ser Ser Asp Thr
195 200 205
Ile Asp Met Thr Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr
210 215 220
Met Met Ser Ser Thr Gly Gly Leu Thr Val Thr Ser Asn Ala Val Ser
225 230 235 240
Leu Thr Phe Asp Leu Ser Tyr Ile Thr Asn Met Pro Ser Asp Leu Ser
245 250 255
Arg Leu Ile Pro Ser Ala Gly Phe Gln Val Ala Ser Phe Pro Val Asp
260 265 270
Val Ser Phe Thr Arg Glu Ser Ser Thr His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly
275 280 285
Ala Tyr Ser Ser Ala Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly
290 295 300
Asn Gly Thr Ser Asn Ile Arg Phe Leu Thr Val
305 310 315
<210> 9
<211> 301
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 9
Gln Arg Arg Glu Val Val Ser Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser Asn Ala
1 5 10 15
Thr Ile Asn Pro Gly Asp Leu Thr Ser Ile Arg Glu Arg Leu Thr Ser
20 25 30
Leu Glu Ala Ser Thr Glu Ser Leu Ser Arg Ser Ile Ser Ser Met Ser
35 40 45
Thr Thr Val Ser Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asn Val Thr Arg Ala
50 55 60
Leu Asp Asp Val Thr Ala Asn Leu Asn Gly Ile Arg Val Thr Ile Thr
65 70 75 80
Thr Leu Gln Asp Ser Val Ser Thr Leu Ser Thr Thr Val Thr Asp Leu
85 90 95
Ser Arg Thr Ser Ser Ala His Ser Glu Ala Leu Ser Ser Leu Arg Thr
100 105 110
Ile Val Asp Gly Asn Ser Thr Ile Ile Gly Asn Leu Lys Ser Asp Val
115 120 125
Ala Ser Asn Gly Leu Ala Ile Thr Asp Leu Gln Ser Arg Val Lys Ser
130 135 140
Leu Glu Ser Ala Ser Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser
145 150 155 160
Val Ala Asp Gly Val Val Ser Leu Asn Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser
165 170 175
Gln Arg Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Leu Leu Met Gln
180 185 190
Phe Gln Trp Met Ala Arg Gly Thr Asn Gly Ser Ala Asp Asn Ile Asp
195 200 205
Met Thr Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Ile Met
210 215 220
Ser Ser Thr Gly Gly Leu Thr Val Thr Gln Asn Ala Val Ser Leu Thr
225 230 235 240
Phe Asp Leu Ser Tyr Ile Thr Arg Phe Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu
245 250 255
Ile Pro Ser Ala Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser
260 265 270
Phe Thr Arg Gly Ser Thr Thr His Thr Tyr Gln Ala Tyr Gly Val Tyr
275 280 285
Ser Ser Ser Arg Ile Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly
290 295 300
<210> 10
<211> 316
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 10
Gln Arg Arg Glu Val Val Ser Leu Ile Leu Ser Leu Asn Ser Asn Val
1 5 10 15
Thr Ile Asn Pro Gly Asp Leu Lys Ser Val Tyr Glu Arg Leu Thr Ser
20 25 30
Leu Glu Ala Ser Thr Glu Ser Leu Arg Gln Ser Val Ser Gly Met Ser
35 40 45
Val Thr Leu Ser Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asp Thr Thr Arg Ala
50 55 60
Leu Asp Asp Val Thr Val Thr Leu Asn Asn Leu Ser Ala Thr Ile Thr
65 70 75 80
Ala Leu Gln Ser Ser Val Thr Thr Leu Ser Ala Thr Val Asp Glu Leu
85 90 95
Thr Asn Thr Ser Ser Ala His Ser Gly Met Leu Ser Ser Leu Gln Thr
100 105 110
Ile Ile Asn Gly Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn Leu Arg Asn Asp Val
115 120 125
Ser Ala Ser Gly Leu Asn Ile Thr Asp Leu Gln Asn Arg Val Lys Ser
130 135 140
Leu Glu Ser Asp Thr Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser
145 150 155 160
Val Ala Asp Gly Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser
165 170 175
Gln Arg Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Arg Leu Met Gln
180 185 190
Phe Gln Trp Val Ala Lys Gly Thr Ser Gly Ser Ser Asp Thr Ile Asp
195 200 205
Met Thr Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met
210 215 220
Ser Ser Thr Gly Gly Leu Thr Val Thr Ser Asn Ala Val Ser Leu Thr
225 230 235 240
Phe Asp Leu Ser Tyr Ile Thr Asn Met Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu
245 250 255
Ile Pro Ser Ala Gly Phe Gln Val Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser
260 265 270
Phe Thr Arg Glu Ser Ser Thr His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Ala Tyr
275 280 285
Ser Ser Ala Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly Asn Gly
290 295 300
Thr Ser Asn Ile Arg Phe Leu Thr Leu Arg Thr Gly
305 310 315
<210> 11
<211> 318
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 11
Ser Gln Arg Arg Glu Val Val Ser Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser Asn
1 5 10 15
Ala Thr Ile Asn Pro Gly Asp Leu Thr Ser Ile Arg Glu Arg Leu Thr
20 25 30
Ser Leu Glu Ala Ser Thr Glu Ser Leu Ser Arg Ser Ile Ser Ser Met
35 40 45
Ser Thr Thr Val Ser Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asn Val Thr Arg
50 55 60
Ala Leu Asp Asp Val Thr Ala Asn Leu Asn Gly Ile Arg Val Thr Ile
65 70 75 80
Thr Thr Leu Gln Asp Ser Val Ser Thr Leu Ser Thr Thr Val Thr Asp
85 90 95
Leu Ser Arg Thr Ser Ser Ala His Ser Glu Ser Leu Ser Ser Leu Arg
100 105 110
Thr Ile Val Asp Gly Asn Ser Thr Ile Ile Gly Asn Leu Lys Ser Asp
115 120 125
Val Ala Ser Asn Gly Leu Ala Ile Thr Asp Leu Gln Ser Arg Val Lys
130 135 140
Pro Leu Glu Ser Ala Ser Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu
145 150 155 160
Ser Val Ala Asp Gly Val Val Ser Leu Asn Leu Asp Pro Tyr Phe Cys
165 170 175
Ser Gln Arg Val Ser Leu Ala Ser Tyr Ser Ala Glu Ala Leu Leu Met
180 185 190
Gln Phe Gln Trp Met Ala Arg Gly Thr Asn Gly Ser Ala Asp Asn Ile
195 200 205
Asp Met Thr Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Ile
210 215 220
Met Ser Ser Thr Gly Gly Leu Thr Val Thr Gln Asn Ala Val Ser Leu
225 230 235 240
Thr Phe Asp Leu Ser Tyr Ile Thr Arg Phe Pro Ser Asp Leu Ser Arg
245 250 255
Leu Ile Pro Ser Ala Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val
260 265 270
Ser Phe Thr Arg Gly Ser Thr Thr His Thr Tyr Gln Ala Tyr Gly Val
275 280 285
Tyr Ser Ser Ser Arg Ile Phe Thr Ile Thr Phe Pro Thr Gly Gly Asp
290 295 300
Gly Pro Ala Asn Ile Arg Phe Leu Thr Val Arg Thr Gly Ile
305 310 315
<210> 12
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 12
Gly Asp Leu Met Gln Ile His Glu Arg Leu Ser Ala Leu Glu Leu Thr
1 5 10 15
Thr Thr Ser Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr Ala Leu Ser Lys Val Thr
20 25 30
Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala Val Ser Leu Ala Glu Thr
35 40 45
Glu Gly Glu Leu Ile Lys Leu Ser Ser Ala Val Gln Cys Leu Arg Thr
50 55 60
Ser Leu Asp His Leu Leu Gln Asn Trp Arg Leu Cys Pro His Trp Tyr
65 70 75 80
Val Thr His Gly Ser Ser Ile Ser Asp Leu Gln Lys Glu Gly Gln Ala
85 90 95
Leu Ser Ser Glu Val Asn Asn Leu Asn Leu His Val Ser Ser Gln Gly
100 105 110
Leu Thr Val Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala Leu Glu Gly Gly
115 120 125
Ser Ser Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys Phe Glu Asp Gly
130 135 140
Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Val Ser Arg Asn
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Ser
165 170 175
Val Lys Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp Val Asn
180 185 190
Ala His Ser His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr Lys Gln
195 200 205
Ser Leu Thr Val Thr Ser Leu Leu Ala Thr Leu Val Phe Glu Leu Gly
210 215 220
Arg Ile Thr Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Cys His
225 230 235 240
Gly Phe Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe Gln Arg Asp
245 250 255
Gly Val Ser His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Lys
260 265
<210> 13
<211> 305
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 13
Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser Ser Val Thr Ile Ser Pro Gly Asp Leu
1 5 10 15
Met Gln Ile His Glu Arg Leu Ser Ala Leu Glu Leu Thr Thr Thr Ser
20 25 30
Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr Ala Leu Ser Lys Val Thr Asp Leu Ser
35 40 45
Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala Val Ser Leu Ala Glu Thr Lys Val Glu
50 55 60
Leu Ser Ser Leu Ser Ser Ala Val Gln Gly Leu Arg Thr Ser Leu Glu
65 70 75 80
Ser Ser Ala Ser Glu Leu Ala Ser Leu Ser Ser Leu Val Arg Asn His
85 90 95
Gly Ser Ala Ile Ser Asp Leu Gln Lys Glu Gly Gln Val Leu Leu Val
100 105 110
Glu Val Ser Asn Leu Lys Ser Ser Val Ser Ser Gln Gly Leu Thr Ile
115 120 125
Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala Leu Glu Gly Gly Ser Ser Thr
130 135 140
Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys Leu Glu Asp Gly Thr Val Ser
145 150 155 160
Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Val Ser Arg Asn Leu Thr Ser
165 170 175
Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Ser Val Lys Gly
180 185 190
Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp Val Asn Ala His Ser
195 200 205
His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr Lys Gln Ser Leu Thr
210 215 220
Val Thr Thr Ser Pro Ala Thr Leu Val Phe Glu Leu Asp Arg Ile Thr
225 230 235 240
Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Cys His Gly Phe Gln
245 250 255
Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe Gln Arg Asp Gly Val Ser
260 265 270
His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Lys Tyr Val Ser Ser Arg Val Phe Lys
275 280 285
Ile Thr Phe Ser Pro Gly Ser Ser Gly Pro Ala Val Val Gln Phe Leu
290 295 300
Thr
305
<210> 14
<211> 312
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 14
Gln Arg Arg Glu Val Val Gly Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser Ser Val
1 5 10 15
Thr Ile Ser Pro Gly Asp Leu Thr Gln Ile His Glu Arg Leu Ser Ala
20 25 30
Leu Glu Leu Thr Thr Thr Ser Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr Ala Leu
35 40 45
Ser Lys Val Thr Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala Val Ser
50 55 60
Leu Ala Glu Thr Lys Val Glu Leu Ser Ser Leu Ser Ser Ala Val Gln
65 70 75 80
Gly Leu Arg Thr Ser Leu Glu Ser Ser Ala Ser Glu Leu Ala Ser Leu
85 90 95
Ser Ser Leu Val Arg Asn His Gly Ser Ala Ile Ser Asp Leu Gln Lys
100 105 110
Glu Gly Gln Val Leu Leu Val Glu Val Ser Asn Leu Lys Ser Ser Val
115 120 125
Ser Ser Gln Gly Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala
130 135 140
Leu Glu Gly Gly Ser Ser Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys
145 150 155 160
Leu Glu Asp Gly Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser
165 170 175
Val Ser Arg Asn Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln
180 185 190
Phe Gln Trp Ser Val Lys Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp
195 200 205
Met Asp Val Asn Ala His Ser His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met
210 215 220
Ser Thr Lys Gln Ser Leu Thr Val Thr Thr Ser Pro Ala Thr Leu Val
225 230 235 240
Phe Glu Leu Asp Arg Ile Thr Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu
245 250 255
Ile Pro Cys His Gly Phe Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser
260 265 270
Phe Gln Arg Asp Gly Val Ser His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Lys Tyr
275 280 285
Val Ser Ser Arg Val Phe Lys Ile Thr Phe Ser Pro Gly Ser Ser Gly
290 295 300
Pro Ala Val Val Gln Phe Leu Thr
305 310
<210> 15
<211> 260
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 15
Val Val Gly Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser Ser Val Thr Ile Ser Pro
1 5 10 15
Gly Asp Leu Met Gln Ile His Glu Arg Leu Ser Ala Leu Glu Ser Ala
20 25 30
Ile Thr Ser Leu Asn Glu Ser Val Asp Thr Ala Leu Ser Lys Leu Val
35 40 45
Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp Ser Met Ala Val Ser Leu Ala Glu Thr
50 55 60
Lys Val Glu Leu His Ser Leu Ser Ser Asp Val Lys Gly Leu Arg Thr
65 70 75 80
Ser Leu Asp Ser Ser Ala Ser Glu Leu Ala Ser Leu Ser Ser Leu Val
85 90 95
His Asp His Gly Ser Ser Ile Ser Asp Leu Gln Lys Gly Ser Arg Val
100 105 110
Leu Ser Val Glu Val Asp Asn Leu Lys Ser Ser Val Ser Ser Gln Gly
115 120 125
Leu Met Ile Ser Ser Leu Glu Ser Arg Val Gln Ala Leu Glu Gly Gly
130 135 140
Pro Gly Thr Asn Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys Leu Glu Asp Gly
145 150 155 160
Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Val Ser Arg Asn
165 170 175
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Ser
180 185 190
Ala Lys Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp Val Asn
195 200 205
Ala His Ser His Gly Ser Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr Lys Gln
210 215 220
Ser Leu Thr Val Thr Thr Ser Pro Ala Thr Leu Val Phe Glu Leu Gly
225 230 235 240
Arg Ile Thr Ala Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Cys His
245 250 255
Gly Phe Gln Gln
260
<210> 16
<211> 254
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 16
Gln Arg Arg Glu Val Val Gly Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser Ser Val
1 5 10 15
Thr Ile Ser Pro Gly Asp Leu Met Arg Ile His Glu Arg Leu Ser Ala
20 25 30
Leu Glu Leu Thr Thr Thr Ser Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr Ala Leu
35 40 45
Ser Lys Val Thr Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala Val Ser
50 55 60
Leu Ala Glu Thr Lys Val Glu Leu Ser Ser Leu Ser Ser Ala Val Gln
65 70 75 80
Gly Leu Arg Thr Ser Leu Glu Ser Ser Ala Ser Glu Leu Ala Ser Leu
85 90 95
Ser Ser Leu Val Arg Asn His Gly Ser Ala Ile Ser Asp Leu Gln Lys
100 105 110
Glu Gly Gln Ala Leu Leu Val Glu Val Ser Asn Leu Lys Ser Ser Val
115 120 125
Ser Ser Gln Gly Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala
130 135 140
Leu Glu Gly Gly Ser Ser Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys
145 150 155 160
Leu Glu Asp Gly Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser
165 170 175
Val Ser Arg Asn Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln
180 185 190
Phe Gln Trp Ser Val Lys Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp
195 200 205
Met Asp Val Asn Ala His Ser His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met
210 215 220
Ser Thr Lys Gln Ser Leu Thr Val Thr Thr Ser Pro Ala Thr Leu Val
225 230 235 240
Phe Glu Leu Asp Arg Ile Thr Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser
245 250
<210> 17
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 17
Gly Asp Leu Thr Thr Ile Tyr Glu Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Ser
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ile Ser Val Gly Asp Leu Ser Arg Lys Leu Ser
20 25 30
Glu Leu Glu Val Asp Leu Gln Asn Ile Asp Ser Ser Met His Gln Leu
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Thr Leu Ser Glu Glu Val Arg Gln Leu Arg Ser
50 55 60
Ala Val Gly Asp Asn Thr Asp Ser Ile Ser Ser Leu Ser Thr Met Val
65 70 75 80
Ser Asp His Gln Gln Leu Leu Ala Asp Leu Arg Thr Ser Leu Asn Ala
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Thr Asn Leu Lys Gly Gly Val Thr Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 18
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 18
Gly Asp Leu Thr Thr Ile Tyr Glu Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Ser
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ile Ser Val Gly Asp Leu Ser Arg Lys Leu Ser
20 25 30
Glu Leu Glu Val Asp Leu Gln Asn Ile Asp Ser Ser Met His Gln Leu
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Thr Leu Ser Glu Glu Val Arg Gln Leu Arg Ser
50 55 60
Ala Val Gly Asp Asn Thr Asp Ser Ile Ser Ser Leu Ser Thr Met Val
65 70 75 80
Ser Asp His Gln Gln Leu Leu Ala Asp Leu Gln Thr Ser Leu Asn Ala
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Thr Asn Leu Lys Gly Ser Val Thr Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 19
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 19
Gly Asp Leu Thr Thr Ile Tyr Glu Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Ser
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ile Ser Ala Gly Asp Leu Ser Arg Arg Phe Ser
20 25 30
Glu Leu Glu Val Asp Leu Gln Asn Val Asn Ser Ser Met His Gln Leu
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Thr Leu Ser Glu Glu Ala Arg Gln Leu Arg Ser
50 55 60
Ala Val Ser Asp Asn Thr Ala Ser Ile Ser Ser Leu Ser Thr Met Val
65 70 75 80
Ser Gly His Gln Gln Leu Leu Ala Asp Leu Gln Thr Ser Leu Asn Ala
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Ala Asn Leu Lys Gly Ser Val Thr Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 20
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 20
Gly Asp Leu Thr Thr Ile Tyr Glu Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Ser
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ile Ser Ala Gly Asp Leu Ser Arg Arg Phe Ser
20 25 30
Glu Leu Glu Val Asp Leu Gln Asn Val Asn Ser Ser Met His Gln Leu
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Thr Leu Ser Glu Glu Ala Arg Gln Leu Arg Ser
50 55 60
Ala Val Ser Asp Asn Thr Ala Ser Ile Ser Ser Leu Ser Thr Met Val
65 70 75 80
Ser Gly His Gln Gln Leu Leu Ala Asp Leu Gln Thr Ser Leu Asn Ala
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Ala Asn Leu Lys Gly Ser Val Thr Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Arg Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 21
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 21
Gly Asp Leu Ala Ser Ile His Asp Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Thr
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ala Ser Val Gly Asp Leu Ser Gln Lys Cys Ile
20 25 30
Asp Leu Glu Ser Asn Phe Gln Ser Val Glu Ser Ser Leu Gly Gln Val
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Asp Leu Ser Thr Glu Ile Arg Gln Leu Arg Leu
50 55 60
Ser Leu Asn Asp Ile Thr Ser Ser Met Ala Ser Leu Ser Thr Thr Val
65 70 75 80
Ser Asp His Asp Asn Ser Leu Ser Thr Leu Arg Val Ser Val Gln Thr
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Ala Asn Leu Lys Ser Ser Val Asn Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Ala Asp Leu Glu Lys Arg Leu Gly Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Arg Phe Ser Ser Pro Leu Ser Leu Asn Asn Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ser Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Arg Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Ile Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 22
<211> 296
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<220>
<221> misc_feature
<222> (7)..(7)
<223> Xaa может быть любой встречающейся в природе аминокислотой
<400> 22
Tyr Cys Ser Leu Thr Ser Xaa Arg Glu Tyr Lys Leu Trp Glu His Leu
1 5 10 15
Ala Ser Ile His Asp Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Thr Val Glu Ser
20 25 30
Leu Thr Ala Ser Val Gly Asp Leu Ser Gln Lys Cys Ile Asp Leu Glu
35 40 45
Ser Asn Phe Gln Ser Val Glu Ser Ser Leu Gly Gln Val Thr Ser Ser
50 55 60
Leu Thr Asp Leu Ser Thr Glu Ile Arg Gln Leu Arg Leu Ser Leu Asn
65 70 75 80
Asp Ile Ala Ser Ser Met Ala Ser Leu Ser Thr Thr Val Ser Asp His
85 90 95
Asp Asn Ser Leu Ser Thr Leu Arg Val Ser Val Gln Thr Asn Val Thr
100 105 110
Asp Ile Ala Asn Leu Lys Ser Ser Val Ser Thr Leu Ser Leu Thr Val
115 120 125
Ala Asp Leu Glu Lys Arg Leu Gly Val Val Glu Ser Gly Ser Ser Ser
130 135 140
Ser Leu Arg Phe Ser Ser Pro Leu Ser Leu Asn Asn Gly Val Val Ser
145 150 155 160
Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ser Leu Thr Ser
165 170 175
Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu Ala Arg Gly
180 185 190
Asp Asp Gly Ser Ser Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn Ala His Cys
195 200 205
His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu Asn Leu Thr
210 215 220
Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp Tyr Ile Thr
225 230 235 240
Arg Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Ile Pro Arg Ala Gly Phe Gln
245 250 255
Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp Thr Thr Thr
260 265 270
His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala Tyr Thr Thr Pro Arg Leu Ser Arg
275 280 285
Leu Arg Phe Leu Thr Gly Gly Thr
290 295
<210> 23
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 23
Gly Asp Leu Thr Pro Ile Tyr Glu Arg Leu Thr Asn Leu Glu Ala Ser
1 5 10 15
Thr Glu Leu Leu His Arg Ser Ile Ser Asp Ile Ser Thr Thr Val Ser
20 25 30
Asn Ile Ser Ala Ser Leu Gln Asp Met Thr His Thr Leu Asp Asp Val
35 40 45
Thr Ala Asn Leu Asp Gly Leu Arg Thr Thr Val Thr Ala Leu Gln Asp
50 55 60
Ser Val Ser Ile Leu Ser Thr Asn Val Thr Asp Leu Thr Asn Thr Ser
65 70 75 80
Ser Ala His Ala Ala Thr Leu Ser Ser Leu Gln Thr Thr Val Asp Gly
85 90 95
Asn Ser Thr Ala Ile Ser Asn Leu Lys Ser Asp Val Ser Ser Asn Gly
100 105 110
Leu Ala Ile Thr Asp Leu Gln Asp Arg Val Lys Ser Leu Glu Ser Thr
115 120 125
Ala Ser His Gly Leu Ser Phe Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg Val Ser
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Pro Ala Glu Ala Gln Leu Met Gln Phe Arg Trp Met
165 170 175
Ala Arg Gly Thr Asn Gly Ser Ser Asp Thr Ile Asp Met Thr Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser Thr Gly
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Ser Asn Val Val Leu Leu Thr Phe Asp Leu Ser
210 215 220
Asp Ile Thr His Ile Pro Ser Asp Leu Ala Arg Leu Val Pro Ser Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Ser Ala Thr His Ala Tyr Gln Ala Tyr Gly Val
260 265
<210> 24
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 24
Gly Asp Leu Thr Thr Ile Tyr Glu Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Ser
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ile Ser Val Gly Asp Leu Ser Arg Lys Leu Ser
20 25 30
Glu Leu Glu Val Asp Leu Gln Asn Ile Asp Ser Ser Met His Gln Leu
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Thr Leu Ser Glu Glu Val Arg Gln Leu Arg Ser
50 55 60
Ala Val Gly Asp Asn Thr Asp Ser Ile Ser Ser Leu Ser Thr Met Val
65 70 75 80
Ser Asp His Gln Gln Leu Leu Ala Asp Leu Gln Thr Ser Leu Asn Ala
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Thr Asn Leu Lys Gly Ser Val Thr Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 25
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 25
Gly Asp Leu Thr Thr Ile Tyr Glu Arg Leu Leu Lys Leu Asp Ser Ser
1 5 10 15
Val Glu Ser Leu Thr Ile Ser Ala Gly Asp Leu Ser Arg Arg Phe Ser
20 25 30
Glu Leu Glu Val Asp Leu Gln Asn Val Asn Ser Ser Met His Gln Leu
35 40 45
Thr Ser Ser Leu Thr Thr Leu Ser Glu Glu Ala Arg Gln Leu Arg Ser
50 55 60
Ala Val Ser Asp Asn Thr Ala Ser Ile Ser Ser Leu Ser Thr Met Val
65 70 75 80
Ser Gly His Gln Gln Leu Leu Ala Asp Leu Gln Thr Ser Leu Asn Ala
85 90 95
Asn Val Thr Asp Ile Ala Asn Leu Lys Gly Ser Val Thr Thr Leu Ser
100 105 110
Leu Thr Val Thr Asp Leu Glu Lys Arg Leu Lys Val Val Glu Ser Gly
115 120 125
Ser Ser Ser Ser Leu Glu Phe Thr Ser Pro Leu Ser Leu Thr Asp Gly
130 135 140
Val Val Ser Leu Asn Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Asp Asn His Ala
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ser Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Ala Arg Gly Asp Asp Gly Ser Ala Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu
195 200 205
Asn Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp
210 215 220
Tyr Ile Thr Lys Pro Pro Ser Asp Met Ser Arg Leu Val Pro Arg Ala
225 230 235 240
Gly Phe Gln Ala Ala Ser Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp
245 250 255
Thr Thr Thr His Ala Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 26
<211> 321
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 26
Leu Val Ile Ser Ser Gln Arg Arg Glu Val Val Ser Leu Ile Leu Ser
1 5 10 15
Leu Asn Ser Asn Val Thr Ile Asn Pro Gly Asp Leu Lys Ser Val Tyr
20 25 30
Glu Arg Leu Asn Ser Leu Glu Ala Ser Thr Glu Ser Leu Arg Gln Ser
35 40 45
Val Ser Gly Met Ser Val Thr Leu Ser Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln
50 55 60
Asp Thr Thr Arg Ala Leu Asp Asp Val Thr Val Thr Leu Asn Asn Leu
65 70 75 80
Ser Ala Thr Ile Thr Ala Leu Gln Ser Ser Val Thr Thr Leu Ser Ala
85 90 95
Thr Val Asp Glu Leu Thr Asn Thr Ser Ser Ala His Ser Gly Met Leu
100 105 110
Ser Ser Leu Gln Thr Ile Ile Asn Gly Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn
115 120 125
Leu Arg Asn Asp Val Ser Ala Ser Gly Leu Asn Ile Thr Asp Leu Gln
130 135 140
Asn Arg Val Lys Ser Leu Glu Ser Asp Thr Ser His Gly Leu Ser Phe
145 150 155 160
Ser Pro Pro Leu Ser Val Ala Asp Gly Val Val Ser Leu Asp Met Asp
165 170 175
Pro Tyr Phe Cys Ser Gln Arg Val Ser Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Glu
180 185 190
Ala Arg Leu Met Gln Phe Gln Trp Val Ala Lys Gly Thr Ser Gly Ser
195 200 205
Ser Asp Thr Ile Asp Met Thr Val Asn Ala His Cys His Gly Arg Arg
210 215 220
Thr Asp Tyr Met Met Ser Ser Thr Gly Gly Leu Thr Val Thr Ser Asn
225 230 235 240
Ala Val Ser Leu Thr Phe Asp Leu Ser Tyr Ile Thr Asn Met Pro Ser
245 250 255
Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Ser Ala Gly Phe Gln Val Ala Ser Phe
260 265 270
Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Glu Ser Ser Thr His Thr Tyr Gln
275 280 285
Val Tyr Gly Ala Tyr Ser Ser Ala Arg Val Phe Thr Ile Thr Phe Pro
290 295 300
Thr Gly Gly Asn Gly Thr Ser Asn Ile Arg Phe Leu Thr Val Arg Thr
305 310 315 320
Gly
<210> 27
<211> 294
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 27
Trp Ile Asp Thr Val Val Asp Phe Glu Arg Asp Tyr Lys Ser Trp Arg
1 5 10 15
Phe Asp Ala Asn Pro Glu Arg Leu Ser Ala Leu Glu Leu Thr Thr Thr
20 25 30
Ser Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr Ala Leu Ser Lys Val Thr Asp Leu
35 40 45
Ser Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala Val Ser Leu Ala Glu Thr Lys Val
50 55 60
Glu Leu Ser Ser Leu Ser Ser Val Val Gln Gly Leu Arg Thr Ser Leu
65 70 75 80
Glu Ser Ser Ala Ser Glu Leu Ala Ser Leu Ser Ser Leu Val Arg Asn
85 90 95
His Gly Ser Ser Ile Ser Asp Leu Gln Lys Glu Gly Gln Ala Leu Leu
100 105 110
Val Glu Val Asn Asn Leu Lys Ser Ser Val Ser Ser Gln Gly Leu Thr
115 120 125
Ile Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala Leu Glu Gly Gly Ser Ser
130 135 140
Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys Leu Glu Asp Gly Thr Val
145 150 155 160
Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Val Ser Arg Asn Leu Thr
165 170 175
Ser Tyr Ser Ala Ser Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Ser Val Lys
180 185 190
Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp Val Asn Ala His
195 200 205
Ser His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr Lys Gln Ser Leu
210 215 220
Thr Val Thr Thr Ser Pro Ala Thr Leu Val Phe Glu Leu Asp Arg Ile
225 230 235 240
Thr Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Cys His Gly Phe
245 250 255
Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe Gln Arg Asp Gly Val
260 265 270
Ser His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Lys Tyr Ala Ser Ser Arg Val Phe
275 280 285
Lys Ile Thr Phe Ser Pro
290
<210> 28
<211> 126
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 28
Asn Ile Lys Pro Gly Asp Leu Lys Ser Val Tyr Glu Arg Leu Thr Ser
1 5 10 15
Leu Glu Ala Ser Thr Glu Ser Leu Arg Gln Ser Val Ser Gly Met Ser
20 25 30
Val Thr Leu Ser Asp Leu Ser Ala Asp Leu Gln Asp Thr Thr Arg Ala
35 40 45
Leu Asp Asp Val Thr Val Thr Leu Asn Asn Leu Ser Ala Thr Ile Thr
50 55 60
Ala Leu Gln Ser Ser Val Thr Thr Leu Ser Ala Thr Val Asp Glu Leu
65 70 75 80
Thr Asn Thr Ser Ser Ala His Ser Gly Met Leu Ser Ser Leu Gln Thr
85 90 95
Ile Ile Asn Gly Asn Ser Ser Ala Ile Ser Asn Leu Arg Asn Asp Val
100 105 110
Ser Ala Ser Gly Leu Asn Ile Thr Asp Leu Gln Asp Arg Val
115 120 125
<210> 29
<211> 116
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 29
Asp Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Leu Ala Arg Gly Asp Asp Gly
1 5 10 15
Ser Ser Gly Ser Val Glu Met Leu Val Asn Ala His Cys His Gly Arg
20 25 30
Arg Thr Asp Tyr Met Met Ser Thr Thr Glu Asn Leu Thr Val Thr Gly
35 40 45
Asn Ser Thr Ser Leu Val Phe Ser Leu Asp Tyr Ile Thr Arg Pro Pro
50 55 60
Ser Asp Met Ser Arg Leu Ile Pro Arg Ala Gly Phe Gln Ala Ala Ser
65 70 75 80
Phe Pro Val Asp Val Ser Phe Thr Arg Asp Thr Thr Thr His Ala Tyr
85 90 95
Gln Val Tyr Gly Ala Tyr Thr Thr Pro Arg Leu Phe Lys Ile Thr Phe
100 105 110
Pro Thr Gly Arg
115
<210> 30
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 30
Gly Asp Leu Ile Pro Leu Tyr Glu Arg Leu Ser Ala Val Glu Lys Met
1 5 10 15
Cys Ala Thr Val Asn Asp Ser Leu Gly Arg Leu Thr Ser Leu Val Ser
20 25 30
Glu Met Ser Ala Arg Ile Asp Ser Leu Ala Asp Thr Leu Gln Glu Asn
35 40 45
Ala Ala Gly Leu Asp Gln Arg Ser Thr Val Thr Thr Leu Ser Val Ser
50 55 60
Leu Phe Asp Asp Leu Ser Gly Arg Val Ala Thr Leu Pro Leu Met Val
65 70 75 80
Ser Asn Gln Glu Ser Gln Leu Pro Ser Ser Leu Pro Ser Val Asn Ala
85 90 95
Leu Ser Thr Thr Cys Ser Asn Leu Gln Arg Asp Val Ser Ser Thr Ala
100 105 110
Leu Thr Val Thr Ser Leu Gly Gln Arg Val Glu Ala Leu Glu Ser Gly
115 120 125
Ala Gly Ser Asp Leu Thr Phe Met Ala Pro Leu Lys Val Asp Gly Lys
130 135 140
Ser Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Glu Arg Thr Asn
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Asn Ala Gln Leu Leu Gln Phe Gln Trp Leu
165 170 175
Val Arg Ser Glu Gly Glu Ser Ser Asp Ser Ile Asp Met Asn Val Val
180 185 190
Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr His Asp
195 200 205
Ser Leu Thr Val Val Gly Asn Ser Val Thr Leu Ile Phe Asn Leu Asp
210 215 220
Phe Ile Thr Leu Lys Ala Ser Asp Tyr Ala Arg Leu Val Pro Cys His
225 230 235 240
Gly Phe Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe Thr Lys Gly
245 250 255
Thr Ala Thr Gln Ser Tyr Gln Val Tyr Gly Ala
260 265
<210> 31
<211> 267
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 31
Gly Asp Leu Met Gln Ile His Glu Arg Leu Ser Ala Leu Glu Leu Thr
1 5 10 15
Thr Thr Ser Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr Ala Leu Ser Lys Val Thr
20 25 30
Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala Val Ser Leu Ala Glu Thr
35 40 45
Glu Gly Glu Leu Ile Lys Leu Ser Ser Ala Val Gln Cys Leu Arg Thr
50 55 60
Ser Leu Asp His Leu Leu Gln Asn Trp Arg Leu Cys Pro His Trp Tyr
65 70 75 80
Val Thr His Gly Ser Ser Ile Ser Asp Leu Gln Lys Glu Gly Gln Ala
85 90 95
Leu Ser Ser Glu Val Asn Asn Leu Asn Leu His Val Ser Ser Gln Gly
100 105 110
Leu Thr Val Ser Asn Leu Glu Arg Arg Val Gln Ala Leu Glu Gly Gly
115 120 125
Ser Ser Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro Leu Lys Phe Glu Asp Gly
130 135 140
Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Val Ser Arg Asn
145 150 155 160
Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Gly Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Ser
165 170 175
Val Lys Gly Glu Asp Gly Ala Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp Val Asn
180 185 190
Ala His Ser His Gly Pro Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr Lys Gln
195 200 205
Ser Leu Thr Val Thr Ser Leu Leu Ala Thr Leu Val Phe Glu Leu Gly
210 215 220
Arg Ile Thr Ser Leu Pro Ser Asp Leu Ser Arg Leu Ile Pro Cys His
225 230 235 240
Gly Phe Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe Gln Arg Asp
245 250 255
Gly Val Ser His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Lys
260 265
<210> 32
<211> 162
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 32
Gln Ser Gln Arg Arg Glu Val Gly Gly Leu Ile Leu Ser Leu Thr Ser
1 5 10 15
Ser Val Thr Ile Ser Pro Gly Asp Leu Met Arg Ile His Glu Arg Leu
20 25 30
Ser Ala Leu Glu Leu Thr Thr Thr Ser Leu Asn Asp Ser Val Asn Thr
35 40 45
Ala Leu Ser Lys Val Thr Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp Asn Met Ala
50 55 60
Val Ser Leu Ala Glu Thr Lys Val Glu Leu Ser Ser Leu Ser Ser Ala
65 70 75 80
Val Gln Gly Leu Arg Thr Ser Leu Glu Ser Ser Ala Ser Glu Leu Ala
85 90 95
Ser Leu Ser Ser Leu Val Arg Asn His Gly Ser Ala Ile Ser Asp Leu
100 105 110
Gln Lys Glu Gly Gln Ala Leu Leu Val Glu Val Ser Asn Leu Lys Ser
115 120 125
Ser Val Ser Ser Gln Gly Leu Thr Ile Ser Asn Leu Glu Arg Gln Val
130 135 140
Gln Ala Leu Glu Gly Gly Ser Ser Thr Thr Leu Ser Phe Ala Asp Pro
145 150 155 160
Leu Lys
<210> 33
<211> 229
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 33
Glu Arg Leu Ser Ala Leu Glu Ser Ala Ile Thr Ser Leu Asn Glu Ser
1 5 10 15
Val Asp Thr Ala Leu Ser Lys Leu Val Asp Leu Ser Gly Ser Leu Asp
20 25 30
Ser Met Ala Val Ser Leu Ala Glu Thr Lys Val Glu Leu His Ser Leu
35 40 45
Ser Ser Asp Val Lys Gly Leu Arg Thr Ser Leu Asp Ser Ser Ala Ser
50 55 60
Glu Leu Ala Ser Leu Ser Ser Leu Val His Asp His Gly Ser Ser Ile
65 70 75 80
Ser Asp Leu Gln Lys Gly Ser Arg Val Leu Ser Val Glu Val Asp Asn
85 90 95
Leu Lys Ser Ser Val Ser Ser Gln Gly Leu Met Ile Ser Ser Leu Glu
100 105 110
Ser Arg Val Gln Ala Leu Glu Gly Gly Pro Gly Thr Asn Leu Ser Phe
115 120 125
Ala Asp Pro Leu Lys Leu Glu Asp Gly Thr Val Ser Leu Glu Leu Asp
130 135 140
Pro Tyr Phe Cys Ser Val Arg Arg Asn Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Asp
145 150 155 160
Ala Gln Leu Met Gln Phe Gln Trp Ser Ala Lys Gly Glu Asp Gly Ala
165 170 175
Ala Asn Ser Ile Asp Met Asp Val Asn Ala His Ser His Gly Ser Arg
180 185 190
Thr Asp Tyr Leu Met Ser Thr Lys Gln Ser Leu Thr Val Thr Thr Ser
195 200 205
Pro Ala Thr Leu Val Phe Glu Leu Asp Arg Ile Thr Ala Leu Pro Ser
210 215 220
Asp Phe Ser Ser Leu
225
<210> 34
<211> 302
<212> БЕЛОК
<213> Реовирус птиц
<400> 34
Ile Ser Pro Gly Asp Leu Val Pro Val Tyr Asp Arg Leu Ser Ala Val
1 5 10 15
Glu Ala Ala Tyr Ala Thr Leu Asn Ala Ser Val Gly Gln Leu Thr Ser
20 25 30
Thr Met Ser Asp Leu Ser Ile Arg Leu Asp Asp Leu Ala Asn Ala Ile
35 40 45
Gln Ser Thr Ser Thr Asp Leu Arg Asp Val Gln Ser Arg Val Ser Ala
50 55 60
Leu Gln Thr Ser Val Asp Gly Ile Ser Ser Asp Val Ala Thr Leu Ser
65 70 75 80
Gln Ser Leu Ser Thr His Gly Ser Gln Leu Ser Ala Leu Ser Ser Ser
85 90 95
Val Ser Thr Leu Ser Thr Asp Met Ser Asn Ile Gln Arg Asp Val Ala
100 105 110
Ser Ser Ala Leu Asn Val Ala Asp Leu Gln Arg Arg Val Thr Ala Leu
115 120 125
Glu Ser Gly Ala Gly Ser Ser Leu Thr Phe Leu Ala Pro Leu Arg Ala
130 135 140
Asp Gly Gly Ser Val Ser Leu Asp Met Asp Pro Tyr Phe Cys Ser Glu
145 150 155 160
Arg Ser Asn Leu Thr Ser Tyr Ser Ala Ser Ala Gln Leu Leu Gln Phe
165 170 175
Gln Trp Phe Val Arg Ser Glu Gly Gly Ser Ser Asp Ser Ile Asp Met
180 185 190
Ser Val Val Ala His Cys His Gly Arg Arg Thr Asp Tyr Leu Met Ser
195 200 205
Ser His Asp Ser Leu Thr Val Thr Gly Asn Ser Val Ser Leu Val Phe
210 215 220
Asn Leu Asp Tyr Ile Thr Thr Ser Gly Val Asp Tyr Ala Arg Leu Ile
225 230 235 240
Pro Cys His Gly Phe Gln Gln Ala Thr Phe Pro Val Asp Ile Ser Phe
245 250 255
Thr Lys Asn Asp Ala Thr His Thr Tyr Gln Val Tyr Gly Ala Phe Asp
260 265 270
Gly Pro Arg Ile Phe Lys Val Thr Phe Ser Pro Gly Glu Thr Ser Thr
275 280 285
Thr Asn Ile Arg Phe Ile Thr Val Arg Thr Gly Ile Glu Ile
290 295 300
<---
Изобретение относится к биотехнологии. Описан выделенный полипептид для вакцинации птицы против реовируса птиц, где указанный выделенный полипептид содержит внутреннюю аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотным остаткам 122-326 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1. Также описан выделенный полипептид для вакцинации птицы против реовируса птиц, где указанный выделенный полипептид содержит внутреннюю аминокислотную последовательность, которая имеет по меньшей мере 70% идентичности аминокислотным остаткам 122-326 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1. Представлен выделенный полипептид для вакцинации птицы против реовируса птиц, где указанный выделенный полипептид содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 70% идентичности с внутренней аминокислотной последовательностью белка сигма C, выбранного из группы, указанной в Таблице 1, указанная внутренняя аминокислотная последовательность соответствует аминокислотным остаткам 122-326 белка сигма C штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1. Также представлен соответствующий вектор и вакцины. Изобретение расширяет арсенал средств для вакцинации птицы против реовируса птиц. 10 н. и 16 з.п. ф-лы, 5 табл., 5 пр., 6 ил.