Оптимизированный полипептид для субъединичной вакцины против реовируса птиц - RU2018127877A

1. Выделенный полипептид, содержащий аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотным остаткам, образующим полный или частичный α-спиральный домен, шарнирный домен, домен тройной β-спирали и полный или частичный глобулярный головной домен белка сигма С реовируса птиц и не имеющий последовательности аминокислот, которая является N-терминальной по отношению к указанному α-спиральному домену,

2. Выделенный полипептид по п. 1, содержащий внутреннюю аминокислотную последовательность, соответствующую аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма С штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.

3. Выделенный полипептид по п. 2, отличающийся тем, что указанная внутренняя аминокислотная последовательность имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма С штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.

4. Выделенный полипептид по любому из пп. 1-3, который блокирует или уменьшает связывание инфекционного реовируса птиц с нативным рецептором белка сигма С реовируса птиц.

5. Выделенный полипептид по любому из пп. 1-4, который при введении птице, необязательно в комбинации с адъювантом, индуцирует защитный иммунный ответ против инфекционного реовируса птиц.

6. Выделенный полипептид по п. 5, который при введении птице индуцирует образование значимо более высоких системных уровней нейтрализующего антитела против белка сигма С по сравнению с системными уровнями указанного антитела, полученными после введения птице полноразмерного белка сигма С штамма S1133 ARV.

7. Выделенный полипептид по п. 3, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с внутренней аминокислотной последовательностью белка сигма С, выбранного из группы, указанной в Таблице 1, указанная внутренняя аминокислотная последовательность соответствует аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма С штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1,

8. Выделенный полипептид по п. 7, содержащий аминокислотную последовательность в пределах аминокислотной последовательности белка сигма С, выбранного из группы, указанной в Таблице 3, указанная внутренняя аминокислотная последовательность соответствует аминокислотным остаткам 70-326, 117-326 или 122-326 белка сигма С штамма S1133 ARV, как указано в SEQ ID NO: 1.

9. Выделенный полипептид по п. 8, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 и SEQ ID NO: 5.

10. Выделенный полипептид по любому из пп. 1-9, дополнительно содержащий метку для идентификации и/или очистки, такую как полигистидиновая метка.

11. Молекула нуклеиновой кислоты, содержащая последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую по меньшей мере один выделенный полипептид по любому из пп. 1-10.

12. Экспрессионный вектор, содержащий контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с указанной молекулой нуклеиновой кислоты по п. 11, причем указанный экспрессионный вектор разработан для репликации и экспрессии соответствующих генов, например, в бактериальной, дрожжевой клетке или клетке насекомых.

13. Вакцина, содержащая по меньшей мере один выделенный полипептид по любому из пп. 1.-10.

14. Вакцина по п. 13, дополнительно содержащая адъювант, такой как термолабильный энтеротоксин (LT), полный адъювант Фрейнда, неполный адъювант Фрейнда, гидроксид алюминия; и/или консервант, такой как тимеросал или 20%-е эмульсии вода-в-масле, например, с минеральным маслом Marcol 52 (ESSO, Франция).

15. Вакцина, содержащая экспрессионный вектор млекопитающих, такой как pcDNA3, содержащий контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с указанной молекулой нуклеиновой кислоты по п. 11.

16. Вирусный вектор, такой как рекомбинантный вирус болезни Марека (MD), содержащий контролирующий элемент, такой как промотор, функционально связанный с указанной молекулой нуклеиновой кислоты по п. 11.

17. Вакцина по п. 13 или 14, содержащая по меньшей мере два разных полипептида; или вакцина по п. 15 или вирусный вектор по 16, отличающиеся тем, что указанная молекула нуклеиновой кислоты кодирует по меньшей мере два разных полипептида; каждый из указанных, по меньшей мере, двух различных полипептидов происходит от представителя одной из двух, трех или четырех групп различных белков сигма С, причем определяющим признаком каждой группы является то, что аминокислотные последовательности различных белков сигма С указанной группы имеют не менее 75% идентичности.

18. Вакцина по любому из пп. 13-15 и 17, содержащая четыре разных полипептида; или вирусный вектор по п. 16 или 17, содержащий молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую четыре разных полипептида, причем первый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 6-11 (Группа I); второй из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 12-16 (Группа II); третий из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); и четвертый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 75% идентичности с SEQ ID NO: 1 или 23 (Группа IV).

19. Вакцина или вирусный вектор по п. 18, отличающиеся тем, что первый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 8; второй из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85% по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 16; третий из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85% по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 19; и четвертый из указанных четырех различных полипептидов происходит от белка сигма С, который имеет по меньшей мере 40%, по меньшей мере 50%, по меньшей мере 60%, по меньшей мере 70%, по меньшей мере 80%, по меньшей мере 85% по меньшей мере 90% или по меньшей мере 95, 96, 97, 98 или 99% идентичности с SEQ ID NO: 23.

20. Вакцина или вирусный вектор по п. 18, отличающиеся тем, что первый из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 6-11 (Группа I); второй из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 12-16 (Группа II); третий из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 17-22 (Группа III); и четвертый из указанных четырех различных полипептидов происходит от полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1 и 23 (Группа IV).

21. Вакцина или вирусный вектор по п. 20, отличающиеся тем, что указанные четыре разных полипептида имеют аминокислотную последовательность, как указано в SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 4 и SEQ ID NO: 5,

22. Вакцина по любому из пп. 13-15 и пп. 17-21 или вирусный вектор по любому из пп. 16-21 для использования при вакцинации вида птиц против реовируса птиц или для индуцирования иммунного ответа птиц, обеспечивающего защиту от реовируса птиц.

23. Способ вакцинации вида птиц против реовируса птиц или индуцирования иммунного ответа птиц, обеспечивающего защиту от реовируса птиц, который включает введение птице вакцины по любому из пп. 13-15 и пп. 17-21 или вирусного вектора по любому из пп. 16-21.

24. Способ по п. 23, который индуцирует продуцирование значимо более высоких системных уровней нейтрализующего антитела против белка сигма С по сравнению с системными уровнями указанного антитела, полученными после введения указанной птице полноразмерного белка сигма С штамма S1133 ARV.

25. Способ по п. 23 или 24, включающий введение указанной вакцины птицам путем инъекции, внутрикожно или подкожно; или перорально посредством питьевой воды.