Формула
1. Фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере один неоантигенный пептид и фармацевтически приемлемый носитель, причем каждый по меньшей мере один неоантигенный пептид содержит опухолеспецифичный неоэпитоп, способный связываться с белком HLA у субъекта, а каждый опухолеспецифичный неоэпитоп содержит опухолеспецифичную мутацию, присутствующую в опухоли, при этом:
(a) композиция включает по меньшей мере один неоантигенный пептид, содержащий опухолеспецифичную мутацию, присутствующую в опухоли по меньшей мере у 1% субъектов в популяции субъектов, страдающих раком;
(b) композиция включает по меньшей мере один неоантигенный пептид, содержащий опухолеспецифичный неоэпитоп, который связывается с белком HLA, присутствующим по меньшей мере у 5% субъектов в популяции субъектов, страдающих раком; и
(c) композиция включает по меньшей мере один неоантигенный пептид, способный вызвать иммунный ответ против опухоли, присутствующей по меньшей мере у 5% субъектов в популяции субъектов, страдающих раком.
2. Фармацевтическая композиция по п. 1, при этом популяция субъектов страдает от адренокортикальной карциномы (ACC), карциномы уротелия мочевого пузыря (BLCA), инвазивной карциномы молочной железы (BRCA), плоскоклеточной карциномы шейки матки и эндоцервикальной аденокарциномы (CESC), аденокарциномы толстой кишки (COAD), хронической лимфоцитарной лейкемии (CLL), колоректального рака (CRC), диффузной крупно-B-клеточной лимфомы (DLBCL), мультиформной глиобластомы (GBM), плоскоклеточной карциномы головы и шеи (HNSC), хромофобного рака почек (KICH), светлоклеточной карциномы почек (KIRC), папиллярноклеточной карциномы почек (KIRP), острой миелоидной лейкемии (LAML), гепатоцеллюлярной карциномы печени (LIHC), аденокарциномы легких (LUAD), плоскоклеточной карциномы легких (LUSC), множественной миеломы (ММ), серозной цистаденокарциномы яичников (OV), аденокарциномы поджелудочной железы (PAAD), аденокарциномы простаты (PRAD), аденокарциномы прямой кишки (READ), кожной меланомы (SKCM), аденокарциномы желудка (STAD), опухолей половых клеток яичек (TGCT), аденокарциномы щитовидной железы (THCA), эндометриоидной карциномы стенки матки (UCEC) или карциносаркомы матки (UCS).
3. Фармацевтическая композиция по п. 1 или 2, при этом популяция, страдающая раком, проходила лечение, проходит лечение или выбрана для лечения ибрутинибом, эрлотинибом, иматинибом, гефитинибом, кризотинибом, трастузумабом, вемурафенибом, ингибитором RAF/MEK или антиэстрогеновой терапией.
4. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-3, при этом опухолеспецифичные мутации включают мутации типа сплайс-вариантов, точечные мутации и/или мутации со сдвигом рамки считывания.
5. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-4, при этом по меньшей мере один неоантигенный пептид включает по меньшей мере один неоантигенный пептид, полученный из длинного участка пептида, фланкирующего и включающего в себя опухолеспецифичную мутацию, в который входят все смежные сегменты в пределах длинного пептида.
6. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-5, при этом опухолеспецифичные мутации присутствуют в одном или нескольких генах, представленных в любой из таблиц.
7. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-6, при этом композиция включает по меньшей мере один неоантигенный пептид, приведенный в любой из таблиц.
8. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом опухолеспецифичные мутации присутствуют в одном или нескольких генах, кодирующих белок, выбранный из группы, состоящей из лиганда-1 запрограммированной смерти (PD-L1), андрогенового рецептора (AR), тирозинкиназы Брутона (BTK), рецептора эпидермального фактора роста (EGFR), BCR-Abl, c-kit, PIK3CA, HER2, EML4-ALK, KRAS, ALK, ROS1, AKT1, BRAF, MEK1, MEK2, NRAS, RAC1 и ESR1.
9. Фармацевтическая композиция по п. 8, при этом по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация возникла при альтернативном сплайсинге PD-L1 или AR.
10. Фармацевтическая композиция по п. 9, при этом по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация возникла из сплайс-варианта sPD-L1, AR-V1 или AR-V7.
11. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-8, при этом опухолеспецифичные мутации включают мутации типа лекарственной устойчивости.
12. Фармацевтическая композиция по п. 11, при этом по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация представляет собой мутацию типа лекарственной устойчивости, выбранную из группы, состоящей из BTK/C481S, EGFR/T790M, BCR-Abl/T315I, BCR-Abl/Y253H, BCR-Abl/E255K, BCR-Abl/E255V, c-kit/T670I, PIK3CA/E545K, PIK3CA/E542K, HER2/G776(YVMA), HER2/E545K, EML4-ALK/G1269A, KRAS/G12V/D, ALK/L1196M, ALK/G1202R, ALK/S1206Y, ALK/1151T(ins), ALK/F1174C, ROS1/G2032R, AKT1/E17K, BRAF/V600E, MEK1/Q56P, MEK1/E203K, MEK1/C121S, MEK1/V60E, MEK1/G128V, MEK1/V154I, MEK1/P124S, MEK1/P124L, NRAS/Q61K/L/R, NRAS/T58I, MEK2/C125S, RAC1/P29S, ESR1/S463P, AR/V534E, AR/P535H, AR/L536Q, AR/L536R, AR/Y537C, AR/Y537S, AR/Y537N, AR/D538G и AR/F876L.
13. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-12, при этом по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация встречается по меньшей мере у 500 пациентов в год в популяции субъектов, страдающих раком, причем данная по меньшей мере одна мутация включает мутации, приведенные для популяции в таблице 9.
14. Фармацевтическая композиция по п. 13, при этом по меньшей мере один неоантигенный пептид включает по меньшей мере один пептид, приведенный в таблице 9.
15. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от CLL; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из SF3B1:p.K700E, MYD88:p.L273P, NOTCH1:p.P2514fs, ABCA11P:p.E901D, AHNAK:p.D3823E, ZNF814:p.E348D, AHNAK:p.V1220I, AHNAK:p.H1203N, ANKRD30A:p.A232V, APOOL:p.I138L, EGR2:p.H397N, MKI67:p.H2213D, NRAS:p.Q61R, PLIN4:p.M691V, XPO1:p.E571K, ZCRB1:p.L76F, ZNF700:p.N652H, ZNF700:p.Q654R, ZNF844:p.D458H, AHNAK:p.A4046V, ANKRD36:p.P337R, C1orf170:p.T203I, CAST:p.D639E, EGR2:p.E369K, GPR123:p.L630P, IKZF3:p.L162R, MUC4:p.P4224R, OR9Q1:p.M34L, PKD2:p.Y486F, PRAMEF11:p.R104Q, SYNJ1:p.I681F, TP53:p.R248Q, TP53:p.R248W, TRPV2:p.L627del, ZNF254:p.S498A, ZNF732:p.A459T, ZNF749:p.E530Q, ZNF845:p.M423I, ABCA11P:p.G900E, ACRC:p.E243D, ACRC:p.A244V, ACSL3:p.T188S, ADAMTS2:p.D948N, AGAP6:p.S127I, AHNAK:p.A2114G, ANKRD36:p.D1014Y, ARID3A:p.G550fs, ARID4A:p.D1154E, ATP2B4:p.R183H, ATRNL1:p.L1244F, BNC1:p.Y937N, BRAF:p.K601N, BTLA:p.Q86K, C14orf177:p.G90V, C2orf44:p.N456K, C3orf15:p.R552Q, CACNA2D1:p.Y376N, CALD1:p.E340K, CCDC15:p.P488H, CCDC79:p.N440T, CCNB3:p.A932T, CD109:p.L470Q, CD209:p.Q189L, CKAP2:p.*684K, CMA1:p.I81K, CMIP:p.A230T, CNTNAP4:p.I12F, CRYM:p.*315K, DICER1:p.E1705K, DPCR1:p.L716P, EIF3A:p.M1093L, EIF4G3:p.R8H, ETFDH:p.I281F, EWSR1:p.Y656C, F5:p.L1332P, F5:p.L1253F, FAM50A:p.H317R, FBXL13:p.S102R, FBXW7:p.R465H, FHL1:p.D184E, FILIP1:p.I522K, FRG1B:p.Q39K, GNB1:p.I80T, GPR110:p.R443G, GPR98:p.Y6152F, HDGFL1:p.188_189insA, IGF2BP2:p.T186S, IL1R2:p.L364fs, KIAA1109:p.L4680P, KRAS:p.G13D, KRTAP19-1:p.G61S, MAF:p.G53fs, MAGEC1:p.L609H, MAP2K1:p.K57N, MED12:p.L36R, MED12:p.G44S, METAP2:p.Y137N, METTL9:p.Y57F, MGP:p.V15L, MKI67:p.R2222K, MUC16:p.T11005I, MUC4:p.S3941N, MUC4:p.S3941G, MUC4:p.V3091L, MUC4:p.S2951Y, MUC4:p.A2841S, MUC4:p.S2760A, MUC4:p.T2335M, MUC4:p.T1627K, MUC4:p.T1547S, MUC4:p.H1133Q, MYD88:p.M240T, NEDD4L:p.P194del, NEFH:p.S704T, NRG4:p.G21fs, OR2A25:p.S105C, OR4C16:p.Y63F, OR4N4:p.L150fs, PABPC1:p.K254fs, PIWIL1:p.P372fs, PLCD3:p.E499fs, PLEKHB1:p.S146P, PPIL4:p.S382R, PRDM4:p.*802K, PRG4:p.N675H, PRKAB1:p.P104H, R3HDM2:p.S592G, R3HDM2:p.S588N, R3HDM2:p.R206W, RPS2:p.R200G, RPTN:p.G364S, SF3B1:p.K666E, SF3B1:p.N626Y, SF3B1:p.Y623C, SIX3:p.I27L, SLC39A7:p.L456fs, SLC6A9:p.R94K, TFG:p.A382V, TGOLN2:p.K83R, TGOLN2:p.T80S, TLR2:p.D327V, TNKS2:p.T619fs, TP53:p.R273H, TP53:p.C242F, TP53:p.R175H, TWISTNB:p.H306Q, UBXN7:p.A276V, WDR78:p.N110K, XIRP2:p.V3008E, ZNF382:p.H186Q, ZNF578:p.R306H, ZNF578:p.G311S, ZNF578:p.H334R, ZNF700:p.S649C, ZNF705A:p.D298N, ZNF836:p.K608Q и ZNF836:p.I571N.
16. Фармацевтическая композиция по п. 15, при этом по меньшей мере у 17,49% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
17. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от BLCA; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из PIK3CA:p.E545K, FGFR3:p.S249C, TP53:p.R248Q, PIK3CA:p.E542K, RXRA:p.S427F, ZNF814:p.D404E, FBXW7:p.R505G, NOTCH2:p.P6fs, TP53:p.E285K, ANKRD30A:p.A353P, C3orf70:p.S6L, EFCAB6:p.R379K, ERCC2:p.N238S, FAM47C:p.Q225E, FOXQ1:p.S135L, HLA-A:p.Q78R, MUC4:p.H4205Q, OTUD4:p.T909I, SLAMF1:p.S277fs, SPRED3:p.S128del, TMCO2:p.S15fs, TP53:p.R280T, TP53:p.E271K, TP53:p.A159V, ZNF706:p.I8N, ZNF706:p.R3P, ACACB:p.E2318Q, ACPP:p.E321K, ACRC:p.A264V, ADAMTS2:p.23_24insL, AFF3:p.E919K, AHNAK:p.S4150F, AHNAK:p.D2889H, AHNAK:p.V1940A, ALX4:p.R126Q, ANKRD12:p.E627K, ANKRD32:p.T999N, ARID1A:p.S614L, ASXL2:p.117_118SS>S, ATP12A:p.R858C, ATP9A:p.R519Q, BCAS3:p.T214M, BPI:p.M255I, CACNG8:p.V146G, CAMSAP1:p.T466fs, CDC27:p.I91fs, CDKN1A:p.E44fs, CEP192:p.S2058L, CGB8:p.T18A, CHRNA3:p.L23del, CHST4:p.D352N, CLIP1:p.S1018fs, COX6A1:p.S8L, CREBBP:p.D1435H, CRIPAK:p.M48fs, CSPG5:p.D119N, CUL1:p.E485K, DLC1:p.S741T, DLL3:p.D318H, DOPEY2:p.E1196K, ECM1:p.E266K, EEF1A2:p.Y418S, EEF2K:p.E673K, EMILIN1:p.R27G, ERBB2:p.S310F, ERBB3:p.M91I, ERBB3:p.V104L, ERBB3:p.D297Y, ERCC2:p.Y14C, FAM155A:p.Q86del, FAM43B:p.E272del, FASTKD3:p.Q625E, FBXW7:p.S546L, FGFR3:p.R248C, FGFR3:p.G380R, FGFRL1:p.H479fs, GBE1:p.M587I, GIMAP1-GIMAP5:p.S311C, GNA13:p.R200G, H1FOO:p.A214fs, HEATR7B2:p.E1109K, HIST1H1D:p.I81M, HRAS:p.G12D, HRCT1:p.H92P, ILF3:p.E484K, KCNK2:p.S6W, KIAA0907:p.Q446P, KIF23:p.E350K, KLF5:p.S118L, KLHL15:p.D185G, LAMA4:p.E639K, LILRA1:p.H410Y, LILRB1:p.L479del, LLGL2:p.P955fs, LPIN1:p.S974L, LRRC16A:p.D227N, LRTM2:p.S139L, LURAP1L:p.55_56insGGG, MAGEC1:p.P553del, MCL1:p.E171del, MN1:p.S472L, MUC7:p.A191V, MVP:p.E412K, NBPF10:p.E3455K, NFE2L2:p.E79K, NFE2L2:p.R34G, NOS1AP:p.Q306del, OR2T35:p.V319fs, OR4N2:p.L150fs, PABPC3:p.K333fs, PAX3:p.S197L, PBX2:p.E70K, PBXIP1:p.H729del, PCDP1:p.E537K, PEX1:p.I370fs, PHLDA3:p.E82K, PLEKHM2:p.S459L, PLVAP:p.A321V, POLR3B:p.L372F, POTEC:p.R477Q, PPL:p.H326Y, PPP1R15A:p.E196K, PRDM16:p.E271Q, PRIC285:p.E1289Q, PRMT8:p.S31P, PUF60:p.S396L, RAB11FIP4:p.S596L, RAD51C:p.D167N, RAD51C:p.Y224H, RALGPS1:p.R381Q, RARS2:p.R6C, RBM26:p.P644A, RERE:p.K176N, RXRA:p.S427Y, SERPINA12:p.R211G, SF3B1:p.E902K, SLC6A9:p.R243W, SLC9A5:p.L447F, SPESP1:p.F121L, SRPRB:p.G14S, SYN2:p.A34del, SYTL2:p.I440M, TAB3:p.R211T, TAF1B:p.R292C, TAOK2:p.L981del, TAS1R3:p.E525K, TAS2R9:p.E163Q, TBC1D1:p.S71F, TBC1D2B:p.R920Q, TFPI2:p.R222C, TM6SF1:p.S15W, TMEM131:p.K640fs, TMEM19:p.G331fs, TP53:p.R273C, TP53:p.R248W, TP53:p.R175H, TP53:p.K132N, TRAM1:p.E41Q, TSKS:p.E513K, TTN:p.C20935G, UBOX5:p.S417L, UGP2:p.D262H, VGF:p.E433K, XAB2:p.E782K, XYLB:p.S87F, ZC3H4:p.E798K, ZNF208:p.K852E, ZNF208:p.I647S, ZNF626:p.G198E, ZNF749:p.Q457E, ZNF761:p.H373R, ZNF799:p.T43A, ZNF799:p.W41G, ZNF799:p.E589G, ZNF844:p.P503R, ZNF845:p.M423T, ZNF845:p.T479M, ZNF860:p.H464R, ZNF878:p.S181R, ZNF91:p.R333H и ZNF91:p.H305R.
18. Фармацевтическая композиция по п. 17, при этом по меньшей мере у 26,92% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
19. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-14, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от неоплазии; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает мутацию со сдвигом рамки, возникающую при вставке по меньшей мере одного нуклеотида в кодирующую последовательность GATA3.
20. Фармацевтическая композиция по п. 19, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от BRCA; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций со сдвигом рамки, выбранных из группы, состоящей из GATA3:p.L328fs, GATA3:p.N334fs, GATA3:p.L344fs, GATA3:p.H400fs, GATA3:p.S408fs, GATA3:p.S430fs, GATA3:p.H434fs, GATA3:p.H435fs и GATA3:p.S408fs.
21. Фармацевтическая композиция по любому из п.п. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от BRCA; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из PIK3CA:p.H1047R, PIK3CA:p.E545K, PIK3CA:p.E542K, AKT1:p.E17K, TP53:p.R175H, PIK3CA:p.N345K, PIK3CA:p.H1047L, SF3B1:p.K700E, GATA3:p.S408fs, PIK3CA:p.E726K, TP53:p.Y220C, TP53:p.H193R, PIK3CA:p.Q546R, TP53:p.R273C, TP53:p.R248W, TP53:p.R273H, TP53:p.I195T, TP53:p.H179R, FGFR2:p.N549K, NUP93:p.E14K, PIK3CA:p.C420R, PIK3CA:p.E453K, PIK3CA:p.Q546K, TP53:p.V216M, TP53:p.C176F, CDH1:p.E243K, ERBB2:p.L755S, KRAS:p.G12V, PIK3CA:p.E545A, TBL1XR1:p.I141fs, TP53:p.G266E, TP53:p.R248Q, TP53:p.Y163C, TP53:p.C141Y, TP53:p.G108fs, ACPP:p.R43W, AKT2:p.I289M, ARHGAP9:p.R137C, C9orf174:p.R136W, CDC42BPA:p.P675T, COL12A1:p.S395L, CRISPLD1:p.R222W, CT47B1:p.234_243EKLTEEATEE>E, CYP1A2:p.V483M, DAB2IP:p.E161K, DGKB:p.S13L, DMD:p.K1772N, DPEP1:p.V11L, ERBB2:p.S310F, ERBB2:p.D769Y, ERBB3:p.E928G, ESYT1:p.R816W, FAM179A:p.A831T, FAM58BP:p.A70T, FMN2:p.S751F, GALNTL6:p.K567del, GATA3:p.L328fs, GATA3:p.N334fs, GATA3:p.L344fs, GATA3:p.H400fs, GATA3:p.S408fs, GATA3:p.S430fs, GATA3:p.H434fs, GATA3:p.H435fs, GDAP1:p.T307A, GRB14:p.A300T, GUCY2C:p.G549C, IL17B:p.R34W, KCNB2:p.R231H, KIF1B:p.R1320W, KIF26B:p.V1113M, KLF4:p.K434Q, LY9:p.I69L, MAP2K4:p.S184L, MAP2K4:p.S251I, MAP2K4:p.T261fs, MAP3K1:p.L318fs, MAP3K1:p.I761fs, MAP3K1:p.V1346del, MAP3K1:p.L1384fs, MAPK13:p.E315K, MAPK4:p.V100M, MARCH5:p.R170C, MBP:p.E120K, MEFV:p.R377H, METTL15:p.Q53E, MS4A4A:p.V99M, MUC17:p.R4415H, MYH6:p.T847M, MYO5B:p.A405V, NARS2:p.P240R, NLGN4X:p.D382N, NLRC4:p.R288W, OR13G1:p.R258H, OR2AK2:p.V45I, OTOF:p.T388M, PACSIN2:p.Q331H, PALM2-AKAP2:p.A299T, PCDH19:p.R286C, PCDHGC5:p.D664N, PIK3CA:p.R88Q, PIK3CA:p.E110del, PIK3CA:p.K111del, PIK3CA:p.PVPHGLEDL447del, PIK3CA:p.L455fs, PIK3CA:p.M1004I, PIK3CA:p.M1043I, PIK3CA:p.N1044Y, PIK3R1:p.KPDL567del, PREX2:p.R363Q, PRRX1:p.A196V, PTEN:p.V317fs, RGSL1:p.V222I, RUNX1:p.R142fs, RUNX1:p.D96fs, SCN2A:p.R36K, SLC25A32:p.Q83E, SLC25A45:p.G106C, STRA6:p.Q68R, STX6:p.H153D, TBX3:p.H187Y, TFPT:p.S252C, TINAG:p.R332W, TMEM71:p.R63Q, TP53:p.E286K, TP53:p.R282W, TP53:p.V272M, TP53:p.S241fs, TP53:p.C238fs, TP53:p.C238F, TP53:p.C238Y, TP53:p.Y234C, TP53:p.Y220S, TP53:p.R209fs, TP53:p.G199V, TP53:p.L194R, TP53:p.H193L, TP53:p.H193Y, TP53:p.V173L, TP53:p.V173M, TP53:p.K132N, TP53:p.R110fs, TUBD1:p.A200V, VLDLR:p.R231H, VWA3A:p.V955I, VWF:p.K1720N, XPO1:p.E571K и ZNF268:p.F901del.
22. Фармацевтическая композиция по п. 21, при этом по меньшей мере у 36,04% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
23. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом
(a) популяция субъектов страдает от COAD; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из KRAS:p.G12D, BRAF:p.V600E, KRAS:p.G12V, ACVR2A:p.K435fs, GRB14:p.KKK295del, SEC63:p.L532fs, TGFBR2:p.E125fs, ATR:p.K771fs, ICA1:p.N204fs, KRAS:p.G12C, TP53:p.R175H, ABCA8:p.R842Q, ACTL7B:p.R354H, ACVR2A:p.K435fs, AIM2:p.K340fs, ALG2:p.S302Y, ANKIB1:p.K144fs, ARSG:p.V131I, ATP10D:p.R311H, AXIN2:p.W663fs, C5orf30:p.D4N, CACNG3:p.V134I, CASP5:p.K78fs, CC2D2A:p.R1284C, CDH10:p.E349K, DNMT1:p.E432K, DOCK2:p.G170R, DOCK5:p.E177K, EGR2:p.R390H, ERBB3:p.V104M, FAM135B:p.R884H, FBXW7:p.R505C, FBXW7:p.R465H, FHDC1:p.R254W, FOXL1:p.N89K, HCN4:p.R525H, HLA-DMA:p.E84K, HTR3B:p.R236C, ITGA4:p.T673M, KIF18A:p.R17C, KIF20B:p.E991K, KLHL5:p.R326C, KRAS:p.A146T, KRAS:p.G13D, LPHN3:p.R1183Q, MAP2K4:p.R287H, MAPK8IP1:p.L217fs, MFSD5:p.R280Q, MUC16:p.R8606H, MYO6:p.D1180N, NAA25:p.S807Y, NBPF14:p.V44L, NRAS:p.Q61K, NRAS:p.G13R, PAX3:p.T424M, PGAM1:p.R240H, PHF3:p.R1410I, PIK3CA:p.R88Q, PIK3CA:p.E545K, PIK3CA:p.H1047R, PLXNA3:p.V14fs, POSTN:p.R508C, PTPRU:p.D1434N, PYGO2:p.Q150fs, RBBP7:p.E274K, SFPQ:p.R611Q, SGSM1:p.F1117L, SLC25A40:p.R96Q, SLC8A1:p.R431H, SLITRK3:p.S298L, SPATA22:p.S150L, SUN3:p.E128K, TGFBR1:p.S241L, TP53:p.R273H, TP53:p.R273C, TP53:p.R248W, TRPV5:p.R492H, USP40:p.S851L, VPS13C:p.D1359Y, ZBTB24:p.L607I, ZNF434:p.R306C, ZNF443:p.R301I, ZNF484:p.R138C и ZNF770:p.S441P.
24. Фармацевтическая композиция по п. 23, при этом по меньшей мере у 27,14% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
25. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от GBM; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из HSD17B7P2:p.N175S, IDH1:p.R132H, EGFR:p.A289V, EGFR:p.G598V, WASH3P:p.G175S, ZNF814:p.D404E, RPSA:p.Q111E, NBPF10:p.E3455K, TP53:p.R248Q, BRAF:p.V600E, EGFR:p.A289T, PRB2:p.N230del, RGPD5:p.P1760A, TP53:p.R175H, CHEK2:p.K373E, EGFR:p.R108K, EGFR:p.R222C, PIK3CA:p.E545K, PIK3R1:p.G376R, POTEC:p.K507E, SDHAP2:p.V195E, SLC6A10P:p.K88N, TP53:p.R282W, TP53:p.R273H, CD3EAP:p.K219del, DST:p.R146C, EGFR:p.A289D, EGFR:p.H304Y, FRG1B:p.S71N, GOLGA8DP:p.A116E, KRTAP4-11:p.R121K, KRTAP4-11:p.S48R, MAP3K1:p.P324L, OGDH:p.I78fs, PODXL:p.S162fs, PSPH:p.V145I, SPINT1:p.A316V, TP53:p.R248W, TP53:p.G245S, TP53:p.Y220C, TP53:p.R158H, TSHZ2:p.A222T, UBC:p.L149R, ZDHHC4:p.R300H, ZNF844:p.R447P, AASS:p.T878fs, ABCC10:p.R570W, ADAM29:p.V205I, ADAMTS8:p.V524M, AGAP3:p.R766W, AICDA:p.Y144F, AK7:p.A159V, AK8:p.D243A, ANO2:p.R334C, AOX1:p.A507V, ARHGAP5:p.M691L, CALN1:p.V231I, CARM1:p.A202V, CD163L1:p.V721M, CD1D:p.L25fs, CD209:p.A283T, CDH18:p.A195T, CILP2:p.V553M, CIZ1:p.L89P, CLOCK:p.L123fs, COL6A5:p.T2224M, CSF2RB:p.G298S, CSMD3:p.E171K, CYP2D6:p.H352R, DCAF12L1:p.R335H, DCAF12L2:p.R246H, DPP10:p.V183I, DPY19L2P1:p.R378Q, DQX1:p.R505H, DRD5:p.S275R, DVL2:p.V66G, EFCAB6:p.R379K, EGFR:p.L62R, EGFR:p.R252C, EGFR:p.P596S, EGFR:p.P596L, EGFR:p.G598A, EGFR:p.E709K, EPHA1:p.A184T, ERC2:p.R20H, ESPNP:p.R627Q, FAM126B:p.R382H, FBN3:p.V886I, FGF14:p.T229M, FLG2:p.H1901fs, FLG:p.R2886H, FLNA:p.V1240M, FOXG1:p.H57del, FPR2:p.R54Q, FRG1B:p.K13N, FRG1B:p.A53T, GABRA6:p.V314I, GJB3:p.R160H, GLT8D2:p.A178V, GRM3:p.R183C, HERC1:p.R2330H, HNF1B:p.T417M, HTRA3:p.Q403R, IDH1:p.R132G, IFNA10:p.L80F, IFNA10:p.V79A, JHDM1D:p.R313H, JPH1:p.A395T, KEL:p.V411M, KIAA0907:p.R516fs, KIAA1704:p.D88del, KLK6:p.R120H, KRAS:p.G12D, KRTAP4-7:p.L121V, KRTAP4-7:p.L148V, KRTAP5-4:p.S131C, LAT2:p.L18W, LIMK2:p.R203H, LUM:p.R330C, MCOLN3:p.V141I, MGAT4B:p.T444P, MUC17:p.V77M, MUC17:p.3204_3205insP, MYO1D:p.T109M, MYO6:p.Q914fs, NAP1L5:p.140_141EE>E, NF1:p.F1658fs, NHP2L1:p.R84C, NLRP5:p.R737W, NPTX1:p.A263T, NUFIP2:p.Q29del, ODF4:p.R61C, OR11H12:p.H154P, OR2A7:p.V18I, OR2H1:p.V287I, OR2T12:p.R184H, OR5D13:p.R236C, OR5P2:p.A100V, OR6N2:p.R293C, PASD1:p.A236del, PCDH11X:p.T486M, PCDHB13:p.P221L, PDGFRA:p.E229K, PDGFRB:p.S650L, PHC3:p.T35del, PIK3C2B:p.R287fs, PIK3CA:p.M1V, PIK3CA:p.R88Q, PIK3CA:p.M1043V, PIK3CA:p.H1047R, PIK3R1:p.K379N, PODNL1:p.A150V, POTEE:p.V166M, POTEG:p.R136H, PRKCD:p.G432fs, PROKR2:p.V297I, PTEN:p.C136Y, PTEN:p.S170N, PTEN:p.R173H, PTEN:p.T277I, PTEN:p.V317fs, PTPN14:p.E716del, R3HDM2:p.412_413QQ>Q, RAB11FIP5:p.R170H, RASAL3:p.R82H, RB1:p.N316fs, RDH8:p.A198V, REN:p.15_16LL>L, RIMBP2:p.R830H, SCAF11:p.E926fs, SCN7A:p.R1358H, SCNN1G:p.R564H, SDHAP2:p.R31C, SDHAP3:p.A66T, SEMG2:p.R292C, SH3RF2:p.R318C, SHB:p.A460T, SIGLEC10:p.T250M, SLC13A5:p.Q273P, SLC17A9:p.V324I, SLC22A9:p.R407Q, SLC26A3:p.V88I, SLC5A3:p.A302fs, SLC9A4:p.R631H, SPAM1:p.R346Q, SPEN:p.E803fs, SPTA1:p.A2011V, SUSD5:p.T513M, SYNE1:p.R8468H, TARSL2:p.G366D, TAS2R41:p.A255T, TAT:p.R367H, TFPI2:p.R206C, THSD7B:p.R90C, TMEM147:p.A92V, TMEM156:p.R81C, TMPRSS6:p.V302I, TNFSF9:p.A232T, TP53:p.C238F, TP53:p.C238Y, TP53:p.Y234C, TP53:p.V216M, TP53:p.H179R, TP53:p.T155N, TRAPPC10:p.K133fs, TTN:p.R21402W, TTN:p.V16403M, TUBBP5:p.V102M, TYRP1:p.T352fs, UBC:p.R73L, UGT2B28:p.P289H, USH2A:p.R3719H, WASH6P:p.L211V, ZFP42:p.V227I, ZFP42:p.T264M, ZNF181:p.V305G, ZNF280B:p.E400K, ZNF534:p.N583K, ZNF563:p.W208fs, ZNF844:p.F487L и ZPBP:p.R154C.
26. Фармацевтическая композиция по п. 25, при этом по меньшей мере у 34,36% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
27. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от HNSC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из PIK3CA:p.E545K, PIK3CA:p.E542K, TP53:p.R175H, PIK3CA:p.H1047R, TP53:p.R282W, TP53:p.R248Q, TP53:p.R273H, TP53:p.R248W, TP53:p.G245S, RHOA:p.E40Q, EP300:p.D1399N, HRAS:p.G13V, MB21D2:p.Q311E, NFE2L2:p.E79Q, TP53:p.H179Y, FBXW7:p.R505G, HIST1H2BF:p.E77K, HRAS:p.G12D, MAPK1:p.E322K, NFE2L2:p.D29H, TP53:p.P278S, TP53:p.C242F, TP53:p.Y220C, TP53:p.H193L, TP53:p.H179R, TP53:p.V157F, TP53:p.R110L, AKNAD1:p.K620R, ANXA6:p.R231Q, AP1G2:p.D243N, ATAD5:p.D441N, ATP6AP2:p.E119Q, B2M:p.M1I, BCL11A:p.E579K, C1orf172:p.Y30fs, C7orf57:p.E30K, CCDC135:p.E313K, CDH12:p.P706T, CDH7:p.Q225K, CDK11B:p.E79del, CDKN2A:p.H83Y, CHCHD4:p.T79M, CIRH1A:p.S250I, CLSTN2:p.P759L, CRB1:p.L628fs, DENND5B:p.G1023E, DNAH5:p.Q1797E, DSP:p.R160G, EDA:p.L58F, EFCAB6:p.E1002K, ELF4:p.S415L, EP300:p.C1164Y, EPHA3:p.T802R, EPHA6:p.D952H, ERBB2:p.M916I, ESRRA:p.D219N, FAM101A:p.I89del, FBXO24:p.M553V, FCAR:p.V233M, GPANK1:p.Y351fs, GPR20:p.V300I, GPRASP1:p.S706L, GPRIN3:p.R633fs, GRID2:p.T649fs, GRM3:p.F682L, GUCY2F:p.S404L, HCRTR2:p.D100Y, HIST1H3C:p.K37M, HIST1H4C:p.R68P, HLX:p.S12T, HOXD10:p.Y151C, HPS3:p.K812N, HRAS:p.G12A, HRAS:p.G12S, IFT140:p.E664K, INPPL1:p.T493M, ITGA10:p.R669Q, ITGB1:p.D158N, KIAA1429:p.D1526N, KIAA1429:p.S138F, KPRP:p.E553fs, KSR2:p.T555M, LINGO2:p.P410T, LPCAT1:p.V187del, MAGEB3:p.V75A, MAP3K7:p.E524Q, MAP4K3:p.P657fs, MAP9:p.K485N, MARS2:p.R481Q, MBOAT7:p.R424W, MUC16:p.R12774H, MUC5B:p.T4388M, MYH11:p.E993K, MYOCD:p.T493M, MYOM1:p.R63Q, NANOS3:p.S183L, NCOR1:p.R1561Q, NCOR1:p.Q169E, NCR1:p.D213N, NFE2L2:p.E79K, ODZ1:p.R366M, OPN1MW:p.A285T, OR2M2:p.A95fs, OR2M3:p.M273I, OR2T33:p.R120S, OR6V1:p.I248fs, PABPC5:p.P58L, PACSIN1:p.E359K, PIK3CA:p.M1043V, PIK3CA:p.H1047L, PIWIL1:p.V699M, PLIN5:p.430_431insNG, PLXNA3:p.P58S, PRB1:p.R274fs, PRSS1:p.D107N, RAC1:p.A159V, RGS7:p.L21fs, RPA1:p.R31H, RPL18:p.R178fs, SFI1:p.R821Q, SLC35D3:p.*417S, SLC5A7:p.G336C, SMARCA4:p.P913L, STAT3:p.D661V, SYCP2:p.K474N, SYT6:p.R249H, TBX21:p.E494K, THSD7A:p.R1046C, THSD7A:p.C728F, TMC3:p.R934S, TMTC2:p.T409R, TP53:p.E285K, TP53:p.C275F, TP53:p.R273C, TP53:p.G266E, TP53:p.G262V, TP53:p.R249S, TP53:p.G245V, TP53:p.C238F, TP53:p.M237I, TP53:p.Y236C, TP53:p.Y236D, TP53:p.R196P, TP53:p.PHHERC177del, TP53:p.V173L, TP53:p.V173M, TP53:p.Y163C, TP53:p.P151T, TP53:p.V143M, TP53:p.P58fs, URI1:p.S13fs, ZNF177:p.K384N, ZNF750:p.S96fs и ZZZ3:p.R5Q.
28. Фармацевтическая композиция по п. 27, при этом по меньшей мере у 21,61% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
29. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от KIRC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из WASH3P:p.G175S, VHL:p.L89H, VHL:p.S111N, WDR52:p.V1227G, KRT1:p.552_559YGSGGSSY>Y, KRTAP1-1:p.S34C, PALM2-AKAP2:p.1075_1076insEA, ZNF814:p.D404E, DOPEY2:p.Y2048S, KAT2B:p.W111fs, PABPC1:p.E156fs, PCDHGC5:p.G599V, PIK3CA:p.E545K, RRAD:p.A278E, SIRPA:p.D131del, UQCRFS1:p.I83V, VHL:p.P45L, VHL:p.V74D, VHL:p.R82P, VHL:p.L116fs, VHL:p.L158V, VHL:p.L169P, WDR73:p.DGTRSQ315del, ABCA3:p.E95D, ABCC5:p.L1090fs, ACADS:p.R330H, ACAN:p.G952E, ACSM2A:p.L402fs, ADAM23:p.K380M, ADH1A:p.D154V, AFF3:p.SA620del, AGAP6:p.D69fs, AGAP7:p.E71fs, AHNAK:p.5_6insE, AIDA:p.K247M, ALAS1:p.G302R, ANAPC16:p.R95fs, ANK2:p.N453S, ANKRD36:p.K378R, ARHGEF5:p.E487G, ARSD:p.AGV234del, ARSD:p.A234G, ATP2A1:p.G704C, ATP7A:p.Q990fs, AVIL:p.G299fs, AXDND1:p.EQ991del, BAP1:p.N78S, BAP1:p.M1I, BLM:p.H660Q, BMPER:p.RIAL444del, BRK1:p.K70Q, BTRC:p.I416M, C16orf55:p.D118A, C19orf33:p.K102E, C20orf132:p.E382D, C2orf71:p.1225_1226insS, C6orf132:p.173_182PPPLLLEPPP>P, CASP5:p.R23fs, CATSPER4:p.T425M, CCDC120:p.I8V, CCR5:p.S185I, CCZ1:p.E214D, CD7:p.P174fs, CDAN1:p.L646fs, CDH23:p.F1132Y, CDK5RAP2:p.H1592Q, CENPB:p.E410V, CERCAM:p.A85fs, CHEK2:p.K373E, CHIT1:p.P284fs, CLCN2:p.645_645R>RR, CLUL1:p.G463R, CNTNAP4:p.Y436S, CUL9:p.D1726E, CWC25:p.K364E, CXorf51B:p.V43I, DDX39B:p.F149fs, DIRAS1:p.G79C, DISP2:p.F1021S, DNMBP:p.T78P, DOCK8:p.A177fs, DPCR1:p.H383N, DPCR1:p.L768del, EGFR:p.L838M, ENPEP:p.F289C, ESPNP:p.W122fs, FAM105A:p.H126N, FAM186A:p.IPPQAQELEIPL1556del, FAM194B:p.EEEEYL135del, FAM22F:p.S691del, FAM22F:p.P690fs, FAM47A:p.LRPEPPETGVSH235del, FAM47C:p.P388S, FAM78A:p.W192L, FBXO34:p.Q294fs, FGFR3:p.R571fs, FGFR3:p.P716H, FMN2:p.AIPPPPPLPGA956del, FOXD4L4:p.C405fs, FUT6:p.S140fs, GJA1:p.A311fs, GOLGA5:p.L492I, GPM6A:p.A50V, GPRIN1:p.231_239RKEDPGSLR>R, GRAMD1B:p.P356H, GREB1:p.S344Y, GRM6:p.A718fs, GUSB:p.L501V, GUSB:p.C500R, HBB:p.F86C, HDAC6:p.G977D, HEXDC:p.T482P, HNF1B:p.N302K, HNRPLL:p.M327V, HRC:p.P439fs, HSFX2:p.D92E, IL1RAP:p.F50C, IVL:p.EQQEGQLKHP167del, KANK4:p.S253P, KCNJ18:p.E378K, KIAA1751:p.K97N, KRT1:p.SSYGSGG557del, KRT2:p.L299W, KRT4:p.F154fs, KRTAP10-6:p.49_49P>PSCCAP, KRTAP5-7:p.C120Y, KRTAP9-2:p.CCQP140del, LARS:p.P185fs, LCP1:p.P445fs, LOC338651:p.PHRSHSPPWS102del, LRCH2:p.D717G, LTA4H:p.F107L, LYST:p.Q710H, MAFA:p.207_208HH>H, MAGEC1:p.P239del, MAP2K5:p.Q445R, MAPKAPK2:p.T214fs, MARCKS:p.K152fs, MED12L:p.P2071S, MEGF6:p.A582fs, MGST3:p.G143fs, MLXIPL:p.S790R, MOCOS:p.S849P, MST1R:p.M464V, MTOR:p.C1483F, MTOR:p.L1460P, MUC16:p.P11260A, MUC17:p.R1227fs, MUC17:p.H1228fs, MUC2:p.1480_1481insI, MUC6:p.P1569fs, MYO3A:p.N525S, NBPF3:p.D491V, NCOR1P1:p.L52P, NDUFA4L2:p.G3fs, NEFH:p.651_651K>KAKSPEK, NES:p.V611L, NFAT5:p.Q906E, NOXO1:p.G3fs, NR2C1:p.S270I, NSMCE2:p.Q31fs, NUDT21:p.W13fs, ODZ2:p.W628fs, ONECUT1:p.L424M, OR10A3:p.F73V, OR4F4:p.E15G, OR4N2:p.L150fs, OR51B5:p.A66fs, OR7C1:p.F104fs, PABPC1:p.Y408F, PABPC1:p.K333fs, PABPC1:p.A181T, PABPC3:p.P191T, PALLD:p.A996T, PALM2-AKAP2:p.G1118fs, PARD6A:p.G84fs, PASK:p.T62I, PCDH15:p.C1713F, PCNT:p.G136S, PGM5:p.G426fs, PGPEP1L:p.R164fs, PIK3C2B:p.F1473L, PIK3CA:p.N1044K, PIK3R5:p.L371R, PITRM1:p.P816T, PLIN4:p.T347I, PODXL:p.28_30PSP>P, POLR1C:p.K332Q, POTED:p.I214V, PPM1E:p.R311W, PRKCE:p.Q157fs, PROX1:p.V225D, PRRC2C:p.P1883T, PRX:p.P549L, PSD3:p.T563P, PTCH1:p.P689H, RANBP3:p.L386W, RASGEF1C:p.A188T, RGPD6:p.F946L, RHEB:p.Y35N, RIMBP3:p.A396del, RIN3:p.L449V, RLIM:p.S501L, RNF17:p.S351C, RUNX2:p.P466H, SCAF1:p.P208fs, SDK1:p.K508fs, SECISBP2:p.D608E, SERPINB3:p.S209C, SESTD1:p.I306M, SFRP4:p.P325fs, SH3KBP1:p.P563fs, SIPA1L3:p.G777A, SLC13A2:p.L493fs, SLC16A9:p.CVLLGG470del, SLC25A5:p.A118T, SLC44A5:p.V70F, SLC4A8:p.N229K, SLC52A1:p.G370del, SLC52A2:p.G399fs, SLC6A10P:p.K88N, SLC6A14:p.A85fs, SLC9B1:p.V446fs, SON:p.VLESSAVT1359del, SP8:p.G165del, SPAG1:p.353_354insD, SPATA9:p.C189F, SPEG:p.A992fs, SPTB:p.T1864I, SRA1:p.V110L, STAT6:p.P354fs, STK11IP:p.A155E, STXBP3:p.E279G, SVIL:p.M93T, SYNE1:p.R8468S, SYNJ2:p.K832T, SYNPO:p.G619fs, TAOK2:p.Q899fs, TAS2R38:p.I311T, TBC1D12:p.F608Y, TBC1D1:p.H277R, TBC1D3:p.A556fs, TBC1D3C:p.A495fs, TBC1D3F:p.A556fs, TCF7:p.H140P, TDRD10:p.W276C, THRAP3:p.K551R, TMEM102:p.A110P, TMEM161B:p.L142P, TMEM230:p.D140G, TMEM47:p.G87S, TRDN:p.*730Y, TTBK1:p.T1065S, UBE2O:p.R1118fs, UBR5:p.T1306fs, UPK3A:p.G272fs, VHL:p.G39S, VHL:p.S65L, VHL:p.N78D, VHL:p.R79P, VHL:p.W88L, VHL:p.L89P, VHL:p.R107P, VHL:p.S111R, VHL:p.H115N, VHL:p.D121Y, VHL:p.G123fs, VHL:p.D126fs, VHL:p.L128H, VHL:p.L135F, VHL:p.I151T, VHL:p.L153P, VHL:p.L158P, VHL:p.Q164fs, VHL:p.L184P, VHL:p.L188P, WASH6P:p.315_316insAPP, WASH6P:p.T201M, WWP2:p.G458A, ZCCHC6:p.K937N, ZFAND2B:p.I149T, ZFR2:p.Y107N, ZNF273:p.N319K, ZNF462:p.S650T, ZNF516:p.A256D, ZNF519:p.H431Y, ZNF687:p.F858C, ZNF732:p.E227Q, ZNF880:p.Q406R, ZP3:p.V362fS и ZRANB1:p.*735fs.
30. Фармацевтическая композиция по п. 29, при этом по меньшей мере у 6% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
31. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от LAML; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из NPM1:p.W288fs, DNMT3A:p.R882H, NPM1:p.L287fs, IDH2:p.R140Q, IDH1:p.R132C, FLT3:p.D835Y, DNMT3A:p.R882C, FLT3:p.600_601insFREYEYD, IDH1:p.R132H, NRAS:p.G13D, U2AF1:p.S34F, KIT:p.D816V, FLT3:p.D835E, IDH2:p.R172K, NRAS:p.G12D, WT1:p.S381fs, ABTB1:p.L249fs, DNMT3A:p.R736H, FLT3:p.D835H, KRAS:p.G12D, NPM1:p.L287fs, NRAS:p.Q61H, NRAS:p.Q61K, PHACTR1:p.V251fs, RBBP4:p.E330K, RUNX1:p.R135G и U2AF1:p.S34Y.
32. Фармацевтическая композиция по п. 31, при этом по меньшей мере у 47,45% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
33. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от LUAD; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из KRAS:p.G12C, KRAS:p.G12V, EGFR:p.L858R, U2AF1:p.S34F, KRAS:p.G12A, TP53:p.R158L, KRAS:p.G12D, PIK3CA:p.E545K, TP53:p.R273L, EGFR:p.ELREA746del, KRAS:p.G13D, A2ML1:p.S654fs, BRAF:p.G469V, CTNNB1:p.S37F, EGFR:p.G719A, KRAS:p.G13C, MYOF:p.G165fs, EGFR:p.S768I, FAM47C:p.G948W, KRAS:p.Q61L, MYH10:p.L1091fs, NRAS:p.Q61L, OR4C3:p.H130fs, PI15:p.V22F, RAD50:p.D69Y, RIT1:p.M90I, TP53:p.C275F, TP53:p.R249M, TP53:p.R249G, TP53:p.R248P, TP53:p.R175H, TP53:p.Y163C, TP53:p.A159P, TP53:p.V157F, TP53:p.G154V, ABCB1:p.R467L, ACBD3:p.R224L, ACTA1:p.G275C, ACTN2:p.D893Y, ADAM30:p.Q741H, ADAMTS14:p.G238C, ADAMTS20:p.R1251S, ADAMTS20:p.R541L, ADAMTS5:p.L549M, ADAMTS9:p.G659W, ADCY2:p.P1016T, ADCY5:p.G623C, AFP:p.A182G, AHDC1:p.P155Q, AKAP1:p.LDRNEEG317del, ALKBH1:p.K137E, ANK2:p.Q3076L, ANKRD44:p.G339C, ANO3:p.A41S, AP1G1:p.R723L, APBB2:p.T243fs, APOB:p.L973M, APOBR:p.R840L, AQP10:p.Q261L, ARAP3:p.R1226L, ARFIP2:p.R86L, ARHGAP36:p.P16H, ARL13B:p.R358L, ASCC2:p.R365L, ASPM:p.S240F, ASXL3:p.P1470Q, ATRN:p.P197Q, AVIL:p.G64W, AXDND1:p.W101R, B3GAT1:p.R125L, BARX2:p.R68P, BCL9L:p.G980C, BCOR:p.N1459S, BEND2:p.P536Q, BMS1:p.G455V, BRAF:p.V600E, BRAF:p.G466V, BRD9:p.G330W, BRF1:p.V469L, BRWD3:p.H160N, BTRC:p.G260W, C11orf68:p.V135L, C15orf2:p.V753F, C15orf2:p.G906W, C18orf8:p.M61I, C1GALT1:p.G299V, C1orf173:p.G1454S, C1orf173:p.S688Y, C1orf87:p.R541L, C2orf53:p.P272H, C3orf20:p.R740L, C7:p.R687S, C7orf58:p.G140W, C7orf58:p.R238L, CACNA1A:p.S772Y, CACNA1D:p.R1073L, CACNA1E:p.R2089Q, CACNA2D1:p.A352E, CACNG3:p.R232W, CADPS:p.R959S, CALB2:p.R258C, CAMK2B:p.G131V, CARD11:p.I1065M, CCDC111:p.R417L, CCDC141:p.E1204V, CCDC19:p.R279L, CCDC19:p.R207L, CCKAR:p.L271M, CD1B:p.W41L, CDH10:p.S577R, CDH10:p.R472C, CDH10:p.R128S, CDH18:p.A721S, CDH20:p.P433H, CDH6:p.Q237K, CDK13:p.R880S, CDK4:p.R24L, CELF4:p.A309P, CFDP1:p.P129fs, CHN1:p.K264N, CHRNA4:p.S396R, CHRNA9:p.P361Q, CLCNKA:p.P124Q, CLEC12B:p.W217L, CLK4:p.R68L, CNTFR:p.D252Y, CNTN6:p.R807M, CNTNAP2:p.F395L, COL19A1:p.P538Q, COL5A2:p.G612W, COL5A2:p.G516W, COL9A1:p.P211Q, CPE:p.P290Q, CPNE8:p.Q127H, CPSF4:p.P219Q, CRIPAK:p.S180fs, CROT:p.Q580H, CRTC3:p.S363L, CSMD2:p.P1855Q, CSMD3:p.T2810N, CSMD3:p.P2727T, CSMD3:p.Q174H, CUBN:p.G596C, CUL4B:p.R91S, CUL7:p.L371F, CXCL9:p.K122N, CXCR4:p.E345Q, CXorf59:p.R198M, CYP11B1:p.R498G, CYP27A1:p.P112Q, CYP2B6:p.A444E, DACH2:p.R539L, DCC:p.R446H, DDX56:p.R329L, DEFA1:p.W90C, DENND2A:p.R688Q, DENND2A:p.R499L, DMBT1:p.R1521L, DNAH5:p.R3822L, DNAH9:p.S2993R, DNAI2:p.V231L, DPP6:p.L757F, DSG4:p.R128L, DST:p.A4410S, DZIP3:p.M322L, EBF3:p.R231S, EFCAB4B:p.E265Q, EHHADH:p.Q704H, ELAVL2:p.L263F, EMR1:p.R493H, ENAH:p.R514L, ENPP1:p.G738E, EPB41L3:p.A896S, EPG5:p.R2289L, EPHA1:p.G111V, EPHB6:p.R337H, EPRS:p.V1151L, ERBB2:p.S310Y, ERBB2:p.774_775insAYVM, ERBB2:p.776_776G>VC, ERN2:p.T295K, FAM120B:p.P467H, FAM127C:p.F52L, FAM135B:p.W240C, FAM210B:p.L112F, FAM47A:p.R690L, FAM47B:p.W163C, FAM47B:p.L567F, FAM5C:p.R457G, FAM70B:p.P277T, FAM71B:p.L583M, FAM75A6:p.R304S, FAM75A6:p.P54L, FAM75D1:p.R1265S, FARP1:p.R299L, FAT1:p.R4359L, FAT3:p.R1266H, FAT3:p.G1899V, FAT3:p.H3574N, FBXO18:p.M144I, FBXO31:p.G443fs, FCGBP:p.A1022S, FCRL2:p.V505L, FERD3L:p.P92H, FGB:p.E339Q, FGFR2:p.E116K, FGFRL1:p.R243L, FGFRL1:p.V274L, FKBPL:p.R320L, FLG2:p.G1545V, FLG2:p.L572F, FLG:p.P3254H, FLG:p.P2466Q, FMN2:p.P992T, FOLH1:p.A643S, FOXRED1:p.R136L, FRAS1:p.C382F, FRG2B:p.D142Y, FRMPD1:p.E1093Q, FSHB:p.T43N, GABRA5:p.Q224K, GADL1:p.L352I, GAL3ST3:p.A271S, GALNT14:p.D234E, GAS8:p.R313S, GATA3:p.M443I, GCDH:p.R82C, GEM:p.R268L, GFRAL:p.Q308K, GIT2:p.R123L, GJB4:p.R22S, GLB1L2:p.I407M, GLOD4:p.Q223fs, GNAO1:p.P283Q, GPNMB:p.I174M, GPR137B:p.G240C, GPR158:p.P762T, GPR98:p.G4307W, GRB7:p.R239L, GRHL1:p.G608W, GRID1:p.R683L, GRIK1:p.R368Q, GRM5:p.P895fs, GTF2E1:p.R192L, H3F3C:p.R131L, HAO2:p.H12N, HCN1:p.P231Q, HECW1:p.A183S, HGF:p.M686T, HIP1:p.R940L, HIST1H1E:p.R25P, HLA-DMA:p.A236fs, HOXA5:p.G11C, HS3ST3A1:p.G399W, HSD17B6:p.F209L, HSPA13:p.V85L, HSPBAP1:p.R282L, HTR5A:p.W298C, IGHMBP2:p.R615S, IL2:p.R103M, IL2RA:p.G61W, IL32:p.P215T, ING1:p.A220S, INMT:p.G56V, ITGA8:p.G616C, ITGAD:p.L528fs, ITGAX:p.R283H, ITIH1:p.G254W, ITIH2:p.L842V, ITK:p.R29L, ITPR2:p.P358Q, JMJD1C:p.R1198S, KCNA1:p.G376C, KCNH8:p.M455I, KCNJ3:p.L430F, KCNK18:p.G23V, KCNK2:p.R166L, KEAP1:p.G603W, KEAP1:p.R260L, KEAP1:p.S144F, KHDRBS2:p.S203L, KIAA1211:p.P1203Q, KIAA1549:p.L1272F, KIAA1755:p.Q108H, KIF15:p.E252Q, KIF9:p.G480R, KIRREL:p.G604C, KLF5:p.E419Q, KRAS:p.Q61H, KRTAP10-12:p.R64P, KRTAP27-1:p.M124I, KRTAP4-5:p.C91F, KRTAP5-1:p.S193Y, L1CAM:p.R632S, L3MBTL4:p.W162L, LAMA1:p.D1030Y, LAMB1:p.T1610fs, LAMB4:p.G1239W, LAMB4:p.G588W, LEF1:p.I53V, LEKR1:p.Q450K, LIM2:p.S150T, LIPJ:p.P236Q, LPHN3:p.E740D, LPPR4:p.R527S, LRFN5:p.N132K, LRP1B:p.G3563C, LRP2:p.M4039I, LRRC4C:p.Q10L, LRRIQ1:p.W792L, LRRTM4:p.S243Y, MAGEA10:p.R7H, MAGEC2:p.W109C, MAGI1:p.G1156V, MAGI2:p.P1044T, MAK:p.P373Q, MAP2K1:p.K57N, MARCH11:p.R193L, MEPE:p.G142C, MKI67:p.R1081S, MKRN3:p.P448H, MLL3:p.N393K, MLL3:p.Q356K, MMRN1:p.A1013S, MOGAT2:p.Q66fs, MXRA5:p.D324Y, MYH4:p.T790M, MYH8:p.R1117C, MYH8:p.H1006N, MYO5B:p.R708L, MYO7B:p.P2040H, MYO9B:p.R94L, MYT1L:p.P351Q, NAA11:p.T184K, NAB1:p.L72F, NAV1:p.R938L, NBPF15:p.G665E, NCAM2:p.G698C, NCAPD2:p.R220L, NDST3:p.V427I, NEK2:p.R239S, NFIA:p.L294F, NLRP3:p.R157C, NOTCH2:p.R2105L, NR4A2:p.R314L, NRG1:p.V481L, NRXN1:p.R813S, NRXN1:p.A660S, NRXN3:p.P23H, NRXN3:p.R103C, NTM:p.G333C, NUAK1:p.G173C, NYAP2:p.P437L, ODZ3:p.P218Q, OIT3:p.R508S, OOEP:p.R101C, OPN1LW:p.P283H, OR10H4:p.M199I, OR10J1:p.L157Q, OR10X1:p.L298I, OR10Z1:p.L205F, OR14A16:p.G160C, OR2A25:p.M80I, OR2AG2:p.G249W, OR2AK2:p.W37C, OR2H2:p.L205F, OR2J2:p.G234W, OR2L13:p.M106I, OR2L13:p.T242A, OR2L3:p.M1I, OR2L3:p.L67I, OR2L8:p.R121C, OR2L8:p.R171S, OR2M2:p.F177L, OR2M2:p.F323L, OR2M5:p.V205L, OR2T12:p.M258L, OR2T27:p.D11Y, OR2T33:p.P165Q, OR2T34:p.C246F, OR2T6:p.V213L, OR4C12:p.D309Y, OR4C12:p.M279I, OR4C16:p.L162M, OR4M2:p.A119S, OR4M2:p.A161S, OR51V1:p.P298T, OR5AS1:p.M39I, OR5B12:p.S289C, OR5B17:p.M266I, OR5D14:p.H246N, OR5D16:p.P264T, OR5D18:p.R123H, OR5F1:p.G44V, OR5J2:p.A36S, OR5L1:p.T275N, OR6C65:p.I154fs, OR6C75:p.G94W, OR6K2:p.P79Q, OR8D2:p.R306M, OR9A2:p.R289W, OR9G9:p.R169L, P2RX7:p.P142Q, P2RY10:p.T10K, P2RY10:p.V196L, PABPC5:p.R99S, PAPPA2:p.P917T, PAPPA2:p.P1706H, PBLD:p.P55Q, PCDH10:p.R587S, PCDH10:p.V986L, PCDH11X:p.R1010I, PCDHAC2:p.A742V, PCDHB5:p.P649S, PCDHGC5:p.K12N, PCDHGC5:p.P684H, PCLO:p.P3946T, PCMTD1:p.R271M, PDPR:p.G793W, PDYN:p.G191W, PDZD2:p.R565S, PDZD8:p.S980G, PFKM:p.R118S, PIGM:p.R225L, PIK3CA:p.E542K, PIK3CG:p.V165I, PILRA:p.S291fs, PLCE1:p.G564C, PLCL1:p.M564I, PLEKHA6:p.R110L, PNKP:p.G174W, POGZ:p.G75W, POLE:p.R573L, POM121L12:p.P231T, POM121L12:p.P242H, POTEE:p.V288M, POTEM:p.S78R, POU3F3:p.D321Y, PPT2:p.R265L, PRDM16:p.P1036L, PRELP:p.D201Y, PRPF40B:p.R160S, PRPF6:p.R763L, PTEN:p.R234L, PTPN11:p.G503V, PTPN13:p.E2067K, PTPRJ:p.G334W, PTPRT:p.R928L, PTPRU:p.P559S, PXDNL:p.P1456T, QSOX1:p.R401L, QSOX2:p.R683L, RAB13:p.R167L, RAB8A:p.G20W, RAPGEFL1:p.R356L, RBM19:p.G390W, RCL1:p.P112Q, REG1B:p.W57L, REG3A:p.S150L, REG4:p.G110V, RIMS2:p.R55L, RIT2:p.R85L, RLN2:p.S138C, RNF20:p.P529Q, RORB:p.G94W, RPL10L:p.K187T, RPRD2:p.R97S, RTN1:p.S103W, RUNX2:p.R337M, RYR2:p.K2413N, RYR2:p.M4334I, RYR3:p.P1670T, S100PBP:p.R5L, S1PR1:p.L104F, SAGE1:p.H298Q, SALL1:p.E965K, SALL1:p.R898W, SALL4:p.R187L, SBSPON:p.G133W, SCAF8:p.G740C, SCG2:p.P252Q, SCML4:p.L261F, SCN2A:p.T155K, SEC24D:p.A50fs, SEC61A2:p.G126V, SERPINA12:p.D253Y, SERPINA9:p.M414I, SERPINC1:p.R45L, SGIP1:p.R502L, SH3GL3:p.R174L, SH3PXD2A:p.S759L, SI:p.V1217F, SKOR1:p.Y883C, SLC1A2:p.F348fs, SLC24A5:p.R35S, SLC25A48:p.R101S, SLC35E2:p.R201L, SLC39A12:p.C628S, SLC39A6:p.R53L, SLC4A5:p.I533V, SLC5A1:p.G53W, SLC5A7:p.G442V, SLC6A11:p.W299L, SLC6A2:p.S354C, SLC8A1:p.G433C, SLIT1:p.R1460L, SLITRK5:p.R68L, SLITRK5:p.R468M, SLITRK6:p.N741K, SORL1:p.R205L, SOS1:p.N233Y, SOX9:p.E75K, SPAG16:p.V439L, SPIN4:p.Y171C, SPRR2D:p.P30fs, SPTA1:p.G2367C, SPTA1:p.D2243Y, SSX3:p.P127T, ST18:p.H778Q, STAC3:p.G117W, STOML3:p.D86Y, STX2:p.R107L, SUMF2:p.G110E, SUN3:p.P339Q, SV2C:p.P60Q, SYNDIG1:p.D135Y, SYNE1:p.K8632E, TARS2:p.E199K, TAS2R16:p.Q177H, TCOF1:p.K264R, TCTE1:p.S127I, TDO2:p.Q197H, THSD7A:p.G810W, THSD7A:p.R801L, TIFAB:p.D43E, TIGD4:p.S312F, TLL1:p.P53Q, TMPRSS11E:p.G259C, TMTC1:p.A864D, TMTC1:p.G212V, TMX3:p.R151C, TNNI1:p.R67L, TNR:p.L692I, TOP2A:p.R736L, TP53:p.R337L, TP53:p.E285K, TP53:p.R283P, TP53:p.D281N, TP53:p.C277F, TP53:p.V274F, TP53:p.R273H, TP53:p.I255F, TP53:p.R249S, TP53:p.M237I, TP53:p.S215I, TP53:p.C176F, TP53:p.R110L, TP53:p.G105C, TP53:p.P72fs, TPO:p.E558K, TRAF6:p.R502S, TRIM42:p.Q127K, TRIM48:p.A93D, TRIM4:p.R398L, TRIM51:p.W131C, TRIM9:p.R337S, TRIML1:p.H399Q, TRPM3:p.G298W, TSC1:p.G378C, TSG101:p.R276S, TSHZ1:p.K501N, TSHZ3:p.G677V, TTF2:p.R761S, TUBA3C:p.Q176fs, UBAC1:p.K330N, UBE2J2:p.G193W, UBR1:p.G1647W, UGT2B7:p.M214I, VMP1:p.E369Q, VPS13B:p.G2575W, VSTM2A:p.G75V, VWA3B:p.R557L, WBP11:p.P227fs, WDR52:p.G612C, WDR59:p.R837S, WDR75:p.P287Q, WDR88:p.G100W, ZCCHC5:p.G335W, ZFHX4:p.L811F, ZFHX4:p.T1663N, ZFHX4:p.H2511Q, ZFP14:p.Q17L, ZIC1:p.A112E, ZNF154:p.T408N, ZNF223:p.G23W, ZNF295:p.S732C, ZNF322:p.K106N, ZNF385D:p.T226S, ZNF454:p.S190I, ZNF492:p.P392H, ZNF521:p.G640C, ZNF521:p.P270H, ZNF536:p.G186C, ZNF536:p.G663W, ZNF644:p.G21W, ZNF716:p.H263L, ZNF71:p.V411L, ZNF782:p.G484W, ZNF831:p.Q617K, ZNF98:p.C492F и ZSWIM2:p.S214Y.
34. Фармацевтическая композиция по п. 33, при этом по меньшей мере у 33,42% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
35. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от LUSC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из PIK3CA:p.E545K, TP53:p.R158L, KRTAP5-5:p.GCG47del, NFE2L2:p.E79Q, CDKN2A:p.D108Y, DHX9:p.V40G, MAFA:p.207_208HH>H, NFE2L2:p.R34Q, PBX2:p.Y262F, PIK3CA:p.E542K, TP53:p.R273L, TP53:p.C242F, TP53:p.R175G, TP53:p.Y163C, TP53:p.V157F, AICDA:p.R131G, ALPK2:p.D53N, ANKFN1:p.M280I, ARPC1A:p.F212L, ASXL2:p.S1081L, C1orf74:p.D254N, C3orf30:p.D227E, CCDC121:p.W397L, CHN2:p.I43M, CLEC4C:p.R179L, CLN3:p.G206S, CNTN5:p.T178N, COL12A1:p.G2753C, CPS1:p.T855K, CSMD3:p.T1094K, CSMD3:p.Q691K, DDX11:p.R167T, EGFR:p.L861Q, EME1:p.D570H, EP300:p.D1399N, ESYT3:p.S574F, FAM135B:p.L648M, FAM135B:p.Q285H, FAM47A:p.G372W, FBXW7:p.R505G, FGFR3:p.S249C, GALNT13:p.G358C, GNL3L:p.K20N, GPC5:p.R347L, HCN1:p.A714S, HCN1:p.R659L, HCN1:p.G499V, HCN1:p.P326T, HERC2P3:p.A803V, HEXDC:p.T482P, HIST1H3B:p.E74K, HIST2H2BE:p.G54D, IFNA10:p.V79A, IL7R:p.S54L, INADL:p.P1340A, ISX:p.C2F, ITGAX:p.R685H, ITPR1:p.E1883Q, KCNN3:p.80_81insQQ, KEAP1:p.G480W, KEAP1:p.R470C, KEAP1:p.V155F, KIAA1751:p.L63F, KIAA2022:p.C345F, KIR3DL2:p.K229E, KLF5:p.E419Q, LAMA4:p.M1293I, LMLN:p.G199C, LRP2:p.A516V, LRRC66:p.F458L, LSG1:p.R517L, LUM:p.R310L, MB21D2:p.Q311E, MCHR1:p.S306F, MKRN3:p.G270V, MUC16:p.N11594K, NFE2L2:p.G81S, NFE2L2:p.G31A, NFE2L2:p.L30F, NFE2L2:p.D29H, OR2B11:p.G10V, OR2T2:p.F13V, OR4K2:p.C254F, OR51F2:p.R67P, OR51S1:p.R159Q, OR5D18:p.T271K, OR8H2:p.L166F, OR8J3:p.S160L, OR8K3:p.K235N, PCDHB1:p.N568K, PHIP:p.I1681M, PIK3CA:p.E726K, PIK3CA:p.H1047R, PLCE1:p.G439C, PRSS57:p.E39Q, PYHIN1:p.G148A, RANBP6:p.I984L, RBMXL1:p.G305C, REG1B:p.M67I, RGS6:p.W366L, RNF5:p.T136I, RP1:p.S1771L, RRP15:p.L214F, RYR2:p.E711K, SAMD3:p.Q206H, SLITRK3:p.R214L, SON:p.S908L, SP4:p.E11del, STK11:p.G279fs, TARBP1:p.L782V, TBCD:p.R476C, TMPRSS11F:p.R274Q, TP53:p.R337L, TP53:p.E271K, TP53:p.R267P, TP53:p.G245V, TP53:p.Y234C, TP53:p.Y220C, TP53:p.H214R, TP53:p.H193L, TP53:p.H179L, TPTE:p.M541I, TRIM7:p.L332I, TTN:p.T32425M, ZFP36L2:p.D240N, ZNF208:p.H883Q, ZNF48:p.R235H, ZNF626:p.K473R, ZNF676:p.P43T, ZZZ3:p.R162Q.
36. Фармацевтическая композиция по п. 35, при этом по меньшей мере у 7,87% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
37. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от OV; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из TP53:p.R273H, TP53:p.Y220C, TP53:p.R248Q, TP53:p.R175H, TP53:p.R273C, TP53:p.I195T, TP53:p.R248W, TP53:p.R282W, TP53:p.C176Y, TP53:p.V157F, TP53:p.S241F, TP53:p.H179R, TP53:p.G245S, TP53:p.H193R, ADCY2:p.V888I, B2M:p.M1V, BAP1:p.R227C, CYP4A11:p.V185F, DNAH5:p.R3197Q, GART:p.K807fs, GRIN2B:p.R519Q, HRNR:p.M1fs, KLHL29:p.L716fs, KRAS:p.G12V, MGA:p.R2435Q, MYO3A:p.N525S, NPAS2:p.Q201R, NRAS:p.Q61R, PDAP1:p.K55fs, PGAP1:p.F565C, TP53:p.S315fs, TP53:p.C275Y, TP53:p.R273L, TP53:p.V272M, TP53:p.G266V, TP53:p.G266R, TP53:p.D259Y, TP53:p.P250L, TP53:p.G245D, TP53:p.G245V, TP53:p.G244C, TP53:p.C238fs, TP53:p.Y236C, TP53:p.Y234C, TP53:p.V216M, TP53:p.S215R, TP53:p.Y205C, TP53:p.L194R, TP53:p.P191del, TP53:p.Y163C, TP53:p.A159V, TP53:p.K132N, TRPC7:p.D210V, UXS1:p.V100L, WNT11:p.C344Y и ZNF295:p.E885A.
38. Фармацевтическая композиция по п. 37, при этом по меньшей мере у 22,78% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
39. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от READ; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из KRAS:p.G12V, TP53:p.R273H, KRAS:p.A146T, KRAS:p.G12D, TP53:p.R175H, AKAP9:p.L3482I, APBA1:p.E624K, BAG5:p.D439N, C17orf97:p.E230D, CDH23:p.F177L, CERS3:p.E95D, DNAH5:p.R982H, ERBB2:p.V842I, GABRB3:p.D500N, KRAS:p.G13D, KRAS:p.G12C, KRAS:p.G12S, LRP6:p.R675Q, MACF1:p.F722L, MBOAT2:p.R43Q, MYO1D:p.E246K, NLRC4:p.E409K, NRAP:p.E327K, NRAS:p.Q61K, PCDH15:p.R1552I, PIK3CA:p.N345K, PIK3CA:p.E545K, POLE:p.S459F, PPP2R2B:p.P326L, SMAD4:p.R361H, TP53:p.R248W, ZFP2:p.R150I и ZNF563:p.K26N.
40. Фармацевтическая композиция по п. 39, при этом по меньшей мере у 20,51% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
41. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от SKCM; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из BRAF:p.V600E, NRAS:p.Q61R, NRAS:p.Q61K, HSD17B7P2:p.N175S, BRAF:p.V600K, DISP1:p.G732L, IDH1:p.R132C, NRAS:p.Q61L, MUC16:p.P5119S, RAC1:p.P29S, WASH3P:p.G175S, AGAP9:p.M248V, C15orf23:p.S24F, DNAH5:p.D3236N, SPTLC3:p.R97K, TMC5:p.R276C, CFB:p.R314M, FRG1B:p.A50P, INMT:p.S212F, LOC649330:p.G93E, MAP2K1:p.P124S, RGS7:p.R44C, STK19:p.D89N, ADAM30:p.G97L, ARL16:p.G6R, ARMC4:p.E22K, BRAF:p.K601E, CAPN13:p.P405S, CD1C:p.R89C, CLCC1:p.P406Q, CNTN5:p.S379F, DNAH5:p.R742Q, EEF1B2:p.S43G, FRG1B:p.I59V, GABRG1:p.E205K, IARS2:p.R832C, IL32:p.D218fs, ISX:p.R86C, KLHDC7A:p.E635K, NAP1L4:p.P285Q, NBPF10:p.Q908E, OR2A5:p.S71L, OR4E2:p.R226Q, OR4M1:p.G41E, OR4M2:p.S268F, OR4N2:p.G41E, OR51B2:p.S163L, PCDHGC5:p.R293C, PCLO:p.R4133C, PHGDH:p.G173L, POTEG:p.D51N, PPP6C:p.R301C, PRAMEF11:p.C84S, PSG9:p.E404K, PTPRB:p.D1560N, RNF152:p.P95S, SPAG16:p.P488S, SPATA8:p.E18K, TAF1A:p.R172M, TCEB3C:p.E308K, THSD7B:p.E126K, TTN:p.E12129K, XIRP2:p.D2439N и ZNF831:p.R1393Q.
42. Фармацевтическая композиция по п. 41, при этом по меньшей мере у 90,91% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
43. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от UCEC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из RPL22:p.K15fs, PTEN:p.R130G, PTEN:p.R130Q, KRAS:p.G12D, KRAS:p.G12V, PIK3CA:p.H1047R, PIK3CA:p.R88Q, PIK3CA:p.E545K, PTEN:p.V317fs, FGFR2:p.S252W, PIK3CA:p.E542K, CTNNB1:p.S37F, POLE:p.P286R, PPP2R1A:p.P179R, CTNNB1:p.S37C, KRAS:p.G13D, CTNNB1:p.D32N, CTNNB1:p.S33F, CTNNB1:p.G34R, KIAA2026:p.R574C, LIMCH1:p.R806fs, PIK3CA:p.H1047L, ALPK2:p.K523fs, CTNNB1:p.S33C, FBXW7:p.R505C, HPD:p.R284fs, KRAS:p.G12A, PIK3CA:p.R93Q, POLE:p.V411L, TP53:p.R248W, ABCA11P:p.R385I, ABI1:p.K445N, ACSM2B:p.K195N, APOB:p.F3102L, ASCC3:p.R136Q, C12orf4:p.R335Q, CCDC132:p.R838C, CHD4:p.R975H, CSDE1:p.R220C, CTNNB1:p.D32Y, CTNNB1:p.S33Y, CTNNB1:p.T41I, EXOC1:p.R588C, FBXW7:p.R465H, FGFR2:p.N549K, FUBP1:p.R430C, GEN1:p.S509L, IK:p.E90fs, KIF20B:p.E54K, MAX:p.H28R, MBOAT2:p.R43Q, METTL14:p.R298P, MFGE8:p.D170N, MS4A8B:p.S3L, NSMCE1:p.D244N, OXR1:p.E122K, PCDH19:p.E530K, PIK3CA:p.R108H, PIK3CA:p.N345K, PIK3CA:p.C420R, PIK3CA:p.Q546P, PIK3CA:p.Q546R, PTEN:p.R130L, RBL2:p.E127K, RXFP1:p.S223Y, SF3B1:p.R957Q, SLC20A1:p.P328fs, SOX17:p.S403I, TNS1:p.Q659del, TP53:p.R273H, TP53:p.R273C, TP53:p.R248Q, TTN:p.D16823N, TXNL1:p.R234C, ZFHX3:p.R1893fs, ZNF180:p.R625I, ZNF257:p.R392I, ZNF354B:p.D609N, ZNF43:p.R280C, ZNF709:p.R468I, ZNF765:p.S254L, ABCA5:p.R1476Q, ACVR1:p.R206H, ADAD1:p.S11L, ADAM9:p.R256Q, ADD3:p.E570K, ADGB:p.S1124L, AGXT2:p.R502C, AMBN:p.S225Y, ANKDD1A:p.R24H, ARHGEF33:p.R46I, ATP10B:p.L1304I, ATP2C1:p.E724K, ATP9A:p.R290Q, ATR:p.R1814fs, AVL9:p.F34L, BMPER:p.R241Q, BTN3A2:p.E153K, C14orf118:p.R279I, C14orf166B:p.F230L, C3orf23:p.R217C, C3orf62:p.R185Q, CACNA1C:p.S710L, CAGE1:p.E539K, CARD10:p.KE272del, CCDC144A:p.S1264L, CCDC168:p.D5020Y, CCDC36:p.R209I, CD55:p.E156K, CEP44:p.S253L, CIITA:p.E728K, CREBBP:p.P2094L, CTNNB1:p.S37A, CTTNBP2:p.S420L, DCT:p.R532Q, DIAPH2:p.E121K, DLG2:p.S624L, DNAH10:p.R1888Q, DNAH14:p.R1367C, DNAH7:p.R2961Q, DNAH8:p.R1347H, DNAJC13:p.E1248K, DNMT1:p.E51K, DST:p.S1767Y, DYNC2H1:p.E883D, EMR1:p.R631Q, EPHX4:p.R282Q, ERCC6L2:p.L445I, F10:p.E117K, FAM155B:p.E158K, FAM83B:p.R206Q, FARP1:p.S383L, FAT3:p.A4159T, FBXW7:p.R689W, FBXW7:p.R465C, FBXW7:p.G423V, FN1:p.R290C, FZD6:p.R416Q, GABRA3:p.R73H, GABRA4:p.R460Q, GALNTL2:p.E395K, GFAP:p.A233T, GGA2:p.A63V, GIGYF2:p.R227H, GNPTAB:p.R1189Q, GPR112:p.S1283Y, GPR98:p.R4142W, GRIA3:p.S646Y, GRM6:p.E363D, HMCN1:p.S133Y, HSPA4L:p.R483C, HTR2A:p.S219L, INTS7:p.R940C, INTS7:p.R106I, ITM2C:p.E167K, JAKMIP2:p.R283I, KCND3:p.S438L, KCNS2:p.D211N, KDM1B:p.F361L, KIAA0556:p.L330I, KIAA1147:p.A149V, KIF23:p.R150Q, KIF27:p.K925N, KIF9:p.R594Q, KLHL13:p.E213K, KLHL28:p.E33K, LIN9:p.R183W, LRBA:p.E2103K, LRP2:p.R2432I, MAGI2:p.L450M, MC5R:p.A109T, MEGF10:p.S1053L, MKI67:p.T1664fs, MKLN1:p.F485L, MMRN1:p.F917L, MSH4:p.E730K, MTOR:p.S2215Y, MUC7:p.S336L, MYBPC2:p.R646H, N4BP2L2:p.R506C, NAPSA:p.R121Q, NCOA7:p.E369D, NCR1:p.R258W, NEK11:p.R374Q, NHEJ1:p.R109Q, NNMT:p.E233K, NOTCH4:p.15_16LL>L, NPY1R:p.A371T, NRAS:p.Q61R, OGDHL:p.R57C, OMA1:p.R445Q, OPRM1:p.R462C, OR4C12:p.F248L, OR5AK2:p.K89N, OSBPL6:p.R577Q, PCDHAC2:p.K138N, PCDHB12:p.R289C, PCDHGC5:p.A70T, PIK3CA:p.R38H, PIK3CA:p.E39K, PIK3CA:p.E110del, PIK3CA:p.K111E, PIK3CA:p.Q546K, PIK3CA:p.M1043V, PIK3CA:p.M1043I, PLA2G3:p.R201Q, PLXNA1:p.E1295K, PON1:p.R306Q, POTEE:p.R303I, POTEF:p.K674N, PPP2R1A:p.S256F, PPP2R3B:p.F310L, PRAM1:p.A268T, PREX1:p.E1246K, PRKCQ:p.A324V, PTEN:p.R130P, PVRL4:p.A358T, RAI2:p.S385Y, RBM39:p.T353I, RELN:p.F2722L, RFPL1:p.R148Q, ROBO2:p.D1018N, ROS1:p.R245I, RPS6KA6:p.S394Y, RSBN1:p.E572K, RYR1:p.A2576T, SACS:p.R2906Q, SCAPER:p.R366Q, SELP:p.R429W, SENP7:p.S673Y, SEPHS1:p.E13K, SFRP4:p.R232Q, SGK1:p.K367del, SIX1:p.E191K, SLC10A7:p.S261L, SLC12A2:p.R828Q, SLC16A14:p.R495Q, SLC7A2:p.R322W, SMCR8:p.E175K, SOS1:p.N233Y, SPOP:p.E50K, STRN3:p.K218N, STXBP6:p.D92N, SULT1E1:p.R77Q, SUN3:p.L124I, SUSD1:p.R343C, SYNM:p.R516Q, TAF1:p.R843W, TDRD3:p.R322Q, THADA:p.S1941L, TLN2:p.S208L, TMEM161B:p.R315Q, TMPRSS3:p.R16Q, TP53:p.Y220C, TPTE:p.S423L, TRANK1:p.E846K, TRPC5:p.S490L, TRPM3:p.R429W, TSSK1B:p.E301K, TTLL7:p.R751H, TTN:p.S20317L, TTN:p.E6404K, TTN:p.R4434Q, TTN:p.R2506Q, UGT8:p.E102K, USF1:p.R52Q, USP16:p.R455Q, USP25:p.R873H, USP33:p.R36Q, VPRBP:p.R802Q, VPS13B:p.R692Q, WDR65:p.F110C, YTHDC2:p.E185K, ZFYVE1:p.R266Q, ZKSCAN1:p.R541fs, ZNF117:p.R157I, ZNF180:p.R569I, ZNF195:p.R59Q, ZNF254:p.K179N, ZNF263:p.R510I, ZNF333:p.R554Q, ZNF354B:p.R402I, ZNF442:p.R309Q, ZNF454:p.R376I, ZNF485:p.R374I, ZNF488:p.R206Q, ZNF559:p.E284K, ZNF594:p.R287I, ZNF611:p.R390I, ZNF645:p.R154C, ZNF649:p.R338Q, ZNF649:p.R198I, ZNF674:p.R405I, ZNF675:p.R220I, ZNF678:p.R564I, ZNF732:p.R354I, ZNF780A:p.R466Q, ZNF823:p.R547I, ZNF836:p.R854I, ZNF836:p.R630I, ZNF841:p.R757I и ZNF98:p.R370I.
44. Фармацевтическая композиция по п. 43, при этом по меньшей мере у 67,74% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
45. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от ACC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из ZFPM1:p.EPL444del, GARS:p.P42A, ZNF517:p.V349A, LRIG1:p.L24V, CCDC102A:p.R96W, OPRD1:p.C27F, SOWAHA:p.R124P, LACTB:p.M5L, TOR3A:p.F13L, ZFPM1:p.E444fs, ZNF787:p.D367del, LRIG1:p.L26V, IRX3:p.L422P, TRIOBP:p.H1300R, TUBA1C:p.L146F, ZFPM1:p.P445fs, ZFPM1:p.446_447LA>P, TPO:p.S398T, USP42:p.R779P, ERCC2:p.D312N, GLTPD2:p.D209E, OTOP1:p.LLW104del, RINL:p.P402L, AMDHD1:p.S3G, ASPDH:p.Q266R, KCNK17:p.S21G, TMEM247:p.Q128E, MUC5B:p.D682G, OBSCN:p.R4516W, FAM184B:p.R784W, SEMA5B:p.V840D, ZNF598:p.E25G, ADAD2:p.G44E, C1orf106:p.R538C, ZAR1:p.Q42H, PANK2:p.G126A, PODXL:p.28_30PSP>P, SALL3:p.L593V, THEM4:p.L17R, C2orf81:p.T315P, CLDN23:p.V210M, FAM109A:p.GGG156del, FPGS:p.I22V, HHIPL1:p.V692A, MUC5B:p.M2869T, PLEC:p.R1386Q, SYT8:p.R373W, TAF5:p.S130A, TMEM189-UBE2V1:p.N6D, UQCRFS1:p.S6A, B3GNT6:p.L316fs, CCDC105:p.P499T, CLIC6:p.Q298E, IDUA:p.T374P, NOTCH2:p.C19W, RGS9BP:p.A96S, RREB1:p.G783V, SP8:p.G165del, WDR34:p.W60G, C19orf10:p.G12R, CELSR2:p.16_17insP, FAM75C1:p.71_71H>HLVSQRH, GPRIN2:p.R446H, KBTBD13:p.A81V, OGFR:p.S557T, PODXL:p.30_30P>PSP, BHLHE22:p.L62Q, C4orf32:p.G32E, C5orf65:p.Q245R, KNDC1:p.V806D, KRTAP10-6:p.49_49P>PSCCAP, LRP11:p.P92R, MAP1S:p.S411C, NOL9:p.S58A, RASIP1:p.R601C, RGMB:p.S63R, SARM1:p.R23P, TSC22D2:p.A419T, ZNF628:p.T230A, ZNF814:p.A337V, AATK:p.A541T, BTBD11:p.G265A, CRIPAK:p.C143R, KCTD3:p.F9V, KRT8:p.S59A, MUC5B:p.S681G, NCOR2:p.1846_1847insSSG, OGFR:p.E556K, APOE:p.C130R, C10orf95:p.A85S, C13orf33:p.R59G, CRIPAK:p.C174R, FAM18B2:p.C51Y, GLI3:p.P998L, GLTSCR2:p.Q389R, HECTD2:p.P19A, IRF2BPL:p.123_125QQQ>Q, MEX3C:p.179_182AAAA>A, NEFH:p.EE658del, RNF149:p.S9G, RNF222:p.A133T, SEZ6L2:p.R74P, TNIP2:p.R73G, ARRDC4:p.T79A, B3GNT6:p.P330fs, BAG1:p.G45R, C22orf26:p.P28L, CHDH:p.E40A, COQ2:p.V66L, CTGF:p.H83D, DLEU7:p.A83V, EPPK1:p.D2378H, FAM86C1:p.R30P, FZD1:p.93_94insP, GPRIN2:p.V241M, GPX1:p.11_13AAA>A, HES3:p.P96T, JMJD4:p.A11V, KANK3:p.R359H, LPPR2:p.A186S, NEFH:p.665_666insEE, NOM1:p.R24G, RNF39:p.G263C, SCRT1:p.S133A, SNED1:p.L1228P, TTLL11:p.122_123insKA, ZCCHC3:p.A159del, ZNF219:p.QP233del, ASB16:p.T249A, ASB2:p.H515P, ATP9B:p.S39G, AVL9:p.G7fs, C17orf96:p.L63V, C19orf29:p.A499V, CRB2:p.T1110M, CRIPAK:p.P173R, CRIPAK:p.I190L, CSGALNACT2:p.L362F, CTBS:p.LAL31del, CTNNB1:p.S45P, DMRT1:p.S45T, DOK7:p.G461D, FBRSL1:p.A836V, FEZ2:p.P50L, FRG1:p.S169N, HSD17B1:p.G313S, IBA57:p.S130R, KIF1A:p.E917D, KRTAP9-1:p.160_160Q>QPSCGSSCCQ, LURAP1L:p.55_56insGGG, NMU:p.A19E, NMU:p.A18E, NOXA1:p.D6E, NPTX1:p.G100D, PLIN5:p.R306W, TBP:p.95_96insQ, TMEM200C:p.S498G, TNXB:p.V706fs, VARS:p.P51S, ZC3H12D:p.P405S и ZZEF1:p.V30A.
46. Фармацевтическая композиция по п. 45, при этом по меньшей мере у 20% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
47. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от CESC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из PIK3CA:p.E545K, PIK3CA:p.E542K, MAPK1:p.E322K, EP300:p.D1399N, ERBB2:p.S310F, ERBB3:p.V104M, KRAS:p.G12D, ANKRD12:p.E721Q, ANKRD36:p.M1144T, MICA:p.G318fs, PIK3CA:p.E726K, PTEN:p.R130Q, ABCD1:p.S606P, ACTL7B:p.E211K, ADAM21:p.F129C, ADAMTS12:p.P1053A, AKT1:p.E17K, ANKLE1:p.V643L, ANO3:p.M956I, AOAH:p.R326T, APOD:p.S115L, ASCC1:p.H207Y, ATM:p.S800F, AURKA:p.S387L, BAG5:p.M286I, C12orf43:p.E28Q, C16orf3:p.G65S, C3orf70:p.S6L, C4orf21:p.E800Q, CALB2:p.K60N, CALCB:p.R81T, CCDC152:p.E153Q, CCDC53:p.R58C, CDC27:p.P242S, CFHR5:p.R441H, CLOCK:p.L123fs, CMYA5:p.E2733K, CNTRL:p.P185S, CSHL1:p.R117Q, CSMD3:p.H952Y, CTNNB1:p.D32G, CTSH:p.E254Q, DHPS:p.F49L, DMPK:p.R44H, DNAH14:p.F622fs, DNAH3:p.E3367Q, DNAH8:p.E587D, DNASE1L1:p.D212N, ECE2:p.D254N, FAM71B:p.H445D, FAM73A:p.G23V, FAS:p.E261K, FBXW7:p.R505G, FBXW7:p.R465C, FEZF2:p.E82K, FKBPL:p.E161Q, FMNL1:p.E927Q, GPATCH3:p.E275Q, GPR142:p.R304T, GPRIN2:p.T100P, GRAMD2:p.I123M, HERC2:p.S329F, HGF:p.G229A, HIF3A:p.A72T, HIST1H1B:p.K188N, HIST1H2AL:p.R30P, HIST2H2AC:p.R30P, HLA-C:p.N104K, HLA-DPB1:p.G114fs, HRNR:p.G2539S, INVS:p.R799K, JPH3:p.Q433H, JUP:p.S627L, KIAA1211:p.R308fs, KIAA1211:p.E309fs, KLK2:p.E161K, KRAS:p.G13D, KRAS:p.G12V, LIN9:p.E231K, LOC151174:p.P90S, LRRC37A3:p.A406D, LRTM2:p.L176V, MEPE:p.S30T, MUC12:p.R2634C, MUC4:p.S2936L, MYOM2:p.D988N, NFE2L2:p.D29H, NOTCH2:p.R2298W, NPIPL1:p.P250L, NR5A2:p.E80K, NYAP2:p.R197Q, OBSL1:p.E1642K, OR13C2:p.L9V, OSBP:p.Q721H, PAOX:p.H107Y, PDILT:p.E500K, PIAS3:p.D460N, PLEKHO2:p.E351Q, PNRC1:p.R73C, PPP4R1:p.L597F, PREP:p.F469L, PRKDC:p.Q3568E, PSME3:p.R231W, RANBP6:p.R915W, RCAN2:p.D440N, RNPC3:p.E116fs, SDHAP1:p.H66Y, SDHAP2:p.S37fs, SERPINA3:p.K158N, SERPINA4:p.R98C, SF1:p.R255W, SGSM1:p.E818K, SIM1:p.V213M, SLC10A4:p.F281L, SLC25A5:p.I79F, SLC35G2:p.K62fs, SLC4A9:p.R617C, SLCO2A1:p.M479I, SND1:p.Q38E, SPATA17:p.R72K, SRSF12:p.S150C, TADA2B:p.E67K, TCTEX1D2:p.S74L, TEDDM1:p.M166I, TEX15:p.E1652Q, TMC2:p.E92D, TMEM131:p.E1319Q, TNKS2:p.T619fs, TNS1:p.Q659del, TP53:p.E285K, TRAF3:p.S9F, TRIM61:p.K98N, TRPM1:p.M996I, TUFT1:p.L101F, U2AF1:p.S34F, UNC93B1:p.V498M, USP4:p.L259V, VCAN:p.S1308C, WDR17:p.P278S, ZBED4:p.S385L, ZEB2:p.E1094K, ZFYVE9:p.M1147I, ZNF16:p.R452W, ZNF677:p.R131T и ZSWIM4:p.E407K.
48. Фармацевтическая композиция по п. 47, при этом по меньшей мере у 23,71% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
49. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от CRC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из KRAS:p.G12D, KRAS:p.G12V, BRAF:p.V600E, KRAS:p.G13D, TP53:p.R175H, PIK3CA:p.E545K, FBXW7:p.R465H, KRAS:p.A146T, PIK3CA:p.H1047R, TP53:p.R248W, CDC27:p.D555E, SMAD4:p.R361H, TP53:p.R273H, KRAS:p.G12C, NRAS:p.Q61K, ERBB2:p.V842I, ERBB3:p.V104M, FBXW7:p.R465C, PIK3CA:p.R88Q, PIK3CA:p.E542K, TP53:p.R273C, TP53:p.G245S, AXIN2:p.G665fs, C16orf45:p.T106N, C20orf26:p.R1088Q, DNMT1:p.E432K, FBXW7:p.R505C, HLCS:p.E362K, HPSE2:p.K58N, KIF14:p.R598Q, KIF18A:p.R17C, KIF20B:p.E991K, KLHL5:p.R326C, KLK2:p.P57T, KRAS:p.G12A, KRAS:p.G12S, LPHN3:p.R1183Q, LRP6:p.R675Q, MYH8:p.R1048Q, NRAP:p.E327K, NRAS:p.G12C, PIK3CA:p.N345K, POSTN:p.R508C, PPP2R1A:p.R183W, PTEN:p.R130Q, RAF1:p.S257L, SDK1:p.T1181M, SGSM1:p.F1117L, TCF7L2:p.R482fs, TP53:p.R282W, TRIM23:p.R289Q, UGT8:p.E102K, ZNF491:p.R343Q, A2M:p.R732Q, AADACL4:p.A266T, ABCA8:p.E1158K, ABCA8:p.R842Q, ABCA8:p.A696T, ABCB8:p.R345H, ACACA:p.R1731C, ACADM:p.F48C, ACOT9:p.R50Q, ACPP:p.R105Q, ACTL7B:p.R354H, ACTL9:p.R331H, ACVR1:p.S290L, ADAM30:p.S314Y, ADAM32:p.R559Q, ADAMTS16:p.D817N, ADAMTS4:p.R156W, ADCY5:p.R661H, AGMAT:p.V313M, AGPAT4:p.A212T, AKAP12:p.E1282K, AKAP9:p.L3482I, ALB:p.S294L, ALDH1L1:p.A870T, ALG2:p.S302Y, AMOTL1:p.R676Q, AMPD1:p.K502N, AMPH:p.R292W, ANKRD6:p.R479C, APBA1:p.K730N, APBA1:p.E624K, APC:p.E847fs, APC:p.F1354fs, APC:p.M1413fs, APOB:p.R3136C, APOB:p.A43V, APPL1:p.R668W, AQPEP:p.A309T, ARF4:p.R149H, ARFGEF1:p.D1632N, ARHGAP32:p.E1253K, ARHGAP36:p.R128C, ARHGAP36:p.A147V, ARHGAP5:p.D890fs, ARNTL:p.T395M, ARPP21:p.R338H, ARSG:p.V131I, ASCC3:p.R1197Q, ATP10D:p.R311H, ATP6V0A4:p.R191Q, ATP9B:p.R265Q, AXDND1:p.E930D, AXIN2:p.W663fs, B2M:p.L13fs, B3GALNT1:p.R145Q, BACH1:p.R538Q, BAG5:p.D439N, BBOX1:p.F176V, BCL2L11:p.R91Q, BCL7A:p.T52M, BCLAF1:p.R37fs, BEND5:p.R198C, BICD2:p.R162H, BLVRA:p.S44L, BMP3:p.R344W, BNC2:p.R512W, BRPF1:p.R66C, BRWD3:p.R787C, BTBD7:p.S436L, BUB1B:p.F996L, BZRAP1:p.V1627I, C11orf30:p.R1111C, C14orf101:p.E295K, C14orf102:p.D115N, C14orf105:p.R100I, C15orf2:p.V488I, C15orf33:p.D340N, C16orf87:p.R151I, C1RL:p.L351fs, C22orf40:p.P32fs, C3orf39:p.R333W, C5orf30:p.D4N, C5orf4:p.R114Q, C6orf170:p.K724T, C7orf63:p.A10T, CACHD1:p.S720Y, CACNA1A:p.T665M, CACNA2D3:p.A332T, CACNB2:p.R608H, CACNG3:p.V134I, CACNG3:p.A138V, CACNG5:p.G121R, CADM1:p.S190L, CADPS:p.A1073T, CAPRIN2:p.E13K, CARD11:p.R423Q, CASC1:p.R54Q, CASP14:p.R5W, CBFB:p.E152K, CC2D2A:p.R1284C, CCDC18:p.K615N, CCDC60:p.R230H, CCDC81:p.R259I, CCDC88C:p.P1851fs, CCKBR:p.V236M, CD101:p.D283Y, CD101:p.R594Q, CD180:p.N228T, CDC14B:p.R375C, CDCA7L:p.P405fs, CDH10:p.E349K, CDH12:p.D674N, CDH20:p.A134V, CDH23:p.F177L, CDH2:p.D547Y, CDH9:p.F523L, CDK16:p.R108C, CEACAM5:p.L640I, CEP152:p.E21K, CERS3:p.E95D, CHD4:p.R975H, CHD5:p.A801T, CIZ1:p.V668A, CLEC18A:p.R423H, CLTCL1:p.R481W, CMAS:p.R110Q, CNRIP1:p.R102W, COBLL1:p.K732N, COL14A1:p.R1082I, COL17A1:p.P1004L, COL4A6:p.L550I, COL6A3:p.D2792N, COPB1:p.R425C, CORO2A:p.*526R, COX15:p.L86I, CSMD1:p.S781Y, CTCFL:p.E423K, CTDNEP1:p.E126K, CTTNBP2:p.R164C, CYP4B1:p.E434D, DACH2:p.R539C, DBC1:p.V216I, DBF4B:p.S254Y, DCHS2:p.F2149L, DCLK2:p.S549Y, DDI1:p.R275Q, DENND4A:p.P357H, DENND4C:p.R1081Q, DHTKD1:p.R410Q, DISP1:p.R763C, DKK2:p.R230H, DKK4:p.R203Q, DLC1:p.A350V, DLC1:p.E222D, DMD:p.R3195H, DNAH5:p.R982H, DNAH5:p.R224Q, DNAH9:p.D1547N, DNAJC24:p.E61K, DNM1:p.A251T, DNMT1:p.E1531Q, DNMT3B:p.R92W, DOCK10:p.A1830V, DOCK1:p.E864K, DOCK2:p.G170R, DOCK3:p.R1183C, DOCK5:p.E177K, DOK5:p.R274W, DPP8:p.G165R, DPY19L1:p.F378L, DUOX2:p.F880L, DVL2:p.A601fs, EBAG9:p.E187K, EBF3:p.G255fs, EDNRB:p.L450R, EGR2:p.R390H, EHD3:p.E44K, EIF2C1:p.R139Q, ELF3:p.F305fs, ELMOD2:p.T141M, EMR2:p.S75L, ENAM:p.R373H, ENOX2:p.R356W, ENTPD7:p.E327K, EPG5:p.D369N, EPHB2:p.R392H, ERCC6:p.V780I, ERCC6L:p.R505Q, ERRFI1:p.A421T, ESCO1:p.R300Q, ETV6:p.R369W, F8:p.S2269Y, FAM123B:p.F173fs, FAM135B:p.R884H, FAM169B:p.K165N, FAM170A:p.E56K, FAM171B:p.D459N, FAM181A:p.R109H, FAM5B:p.R402C, FBXO11:p.A432V, FBXW7:p.R689W, FBXW7:p.S582L, FBXW7:p.R14Q, FGF14:p.A236V, FHDC1:p.R254W, FHOD3:p.A225T, FHOD3:p.E813K, FMO3:p.F510L, FNDC1:p.R652H, FOXK1:p.R354W, FOXN3:p.P96fs, FPGT-TNNI3K:p.R455H, FZD3:p.D367N, GABRA4:p.R460Q, GABRA5:p.S126N, GABRB3:p.D500N, GALNTL5:p.R262I, GJA1:p.R362Q, GLRA3:p.L454I, GLRA3:p.F132L, GOLGA4:p.Q1536H, GP2:p.S41L, GPC6:p.A214T, GPLD1:p.R717Q, GPR125:p.R113Q, GPR156:p.F754L, GPR158:p.D566N, GPR21:p.R216H, GPR61:p.A62T, GPR98:p.R4142W, GPRC5A:p.V30I, GRAP2:p.E69D, GRIA1:p.R218C, GRIA2:p.R845Q, GRM7:p.R679Q, GTF3A:p.K306N, HAO1:p.R172C, HARS2:p.R168H, HBB:p.F42L, HCN4:p.R525H, HDAC5:p.A1044T, HGF:p.S467Y, HIPK4:p.R280H, HLA-DMA:p.E84K, HMG20A:p.E248D, HPS3:p.S468L, HRSP12:p.R120Q, HS3ST1:p.E287K, HTR3B:p.R236C, HTR5A:p.R152C, HTT:p.D1548N, HYDIN:p.R1187C, HYDIN:p.R939Q, HYDIN:p.R451Q, HYOU1:p.R158C, IFT172:p.A944V, IGJ:p.R77Q, IL17RA:p.Q803fs, IL1RAPL2:p.T647M, IL3:p.A90T, IL5RA:p.L47I, INPP5D:p.R523Q, INPP5K:p.R263C, IRAK3:p.R267Q, IREB2:p.R419Q, ITGA4:p.T673M, ITGA4:p.F900L, ITIH5:p.A912T, ITK:p.E196K, JAG1:p.A462T, JAK1:p.V310I, KAL1:p.V303I, KBTBD8:p.V549I, KCNA3:p.A415V, KCND3:p.S438L, KCNMB4:p.F209L, KCTD20:p.L314fs, KDELC1:p.L447I, KIAA0528:p.R181Q, KIAA0556:p.R1082W, KIAA1109:p.S4937Y, KIAA1804:p.V474M, KIAA1804:p.R477W, KIF16B:p.R145Q, KIF26B:p.A1114V, KPNA4:p.R29Q, KRAS:p.K117N, KRAS:p.Q61L, KRAS:p.Q61K, KRT6B:p.L197P, L1CAM:p.T186M, LALBA:p.A41T, LAMA4:p.A558V, LBX1:p.R176W, LPAR4:p.R145Q, LRP1B:p.K2623N, LRP2:p.R3043C, LRP2:p.S737L, LRRC18:p.R218W, LRRC31:p.K23T, LRRC7:p.R1389H, LZTS2:p.P100fs, MACF1:p.S292L, MACF1:p.F722L, MAEL:p.R345C, MAGEE1:p.V380M, MAGI1:p.R1198C, MAP1B:p.E2046D, MAP2:p.K530N, MAP2K4:p.R287H, MAP3K4:p.R275Q, MAP7D2:p.R487C, MAPK8IP1:p.L217fs, MBOAT2:p.R43Q, MCF2L2:p.R926Q, MECOM:p.R969C, METTL16:p.R200Q, METTL21A:p.R174Q, METTL6:p.F56L, MFF:p.R162C, MFSD5:p.R280Q, MIA3:p.Q356H, MMAA:p.R326C, MORC1:p.D113Y, MORC2:p.R740H, MPDZ:p.L804I, MR1:p.S46L, MRPL47:p.L234I, MS4A8B:p.S3L, MSH4:p.K464N, MSH6:p.T1085fs, MSH6:p.R1095H, MUC16:p.R8606H, MYH13:p.D311N, MYH7:p.R1689C, MYO1D:p.E246K, MYO3A:p.N525H, MYO6:p.D1180N, MYO9A:p.R2179Q, MYO9A:p.R167Q, MYOZ2:p.E251K, MYT1:p.E226K, NAA25:p.S807Y, NCAM1:p.R474W, NCOA4:p.R562Q, NEB:p.D5434N, NEB:p.L1591I, NEB:p.E1214K, NEDD9:p.A798T, NEDD9:p.A316T, NEK1:p.R608C, NFASC:p.V256I, NINL:p.R1366C, NLRC4:p.D593N, NLRC4:p.E409K, NLRP4:p.V229I, NLRP5:p.R392H, NME9:p.E75K, NOLC1:p.T428M, NPC1:p.E451K, NPSR1:p.R235Q, NRAS:p.Q61L, NRAS:p.G13R, NRAS:p.G12D, NRG2:p.T246M, NTN4:p.E59K, NUB1:p.R373Q, NUDT15:p.S83Y, NUF2:p.S340L, NUP88:p.A302V, ODZ1:p.R2556W, OGDHL:p.A427T, OGFRL1:p.E427K, OLFM4:p.K132N, OPRM1:p.R353H, OR10A3:p.S93Y, OR2M3:p.R235H, OR52W1:p.R133C, OR5AU1:p.R312H, OR5B17:p.R163H, OR8S1:p.A99V, OSTN:p.R115Q, OTOL1:p.V431I, OTUD3:p.R277I, PAN3:p.S580N, PANK3:p.R260I, PAX3:p.T424M, PCBP1:p.L102Q, PCDH10:p.V477M, PCDH15:p.R1552I, PCDHAC2:p.A519T, PCDHAC2:p.E190K, PCDHAC2:p.A266T, PCDHAC2:p.A156V, PCDHAC2:p.E271K, PCDHAC2:p.A736V, PCDHB5:p.D51Y, PCDHB8:p.D235N, PCDHGC5:p.S289L, PCDHGC5:p.V662M, PCNXL2:p.R135Q, PCOLCE2:p.A348V, PCOLCE2:p.R87H, PDE4B:p.S417L, PGAM1:p.R240H, PHF3:p.R1410I, PIAS2:p.S519L, PIGR:p.A580T, PIK3CA:p.D350G, PIK3CA:p.E545A, PIK3CA:p.E545G, PIK3CA:p.Q546K, PIP4K2C:p.R204H, PKHD1L1:p.F1856L, PLA2G4A:p.E443K, PLCG2:p.E544K, PLCG2:p.D973N, PLEKHA6:p.V328fs, PLEKHG4B:p.E384K, PLK1:p.D233G, PLOD3:p.R297fs, PLSCR3:p.E77K, PLXNC1:p.S462L, PLXNC1:p.R819C, POLA1:p.E603D, POLE:p.S459F, POLE:p.V411L, POLQ:p.R860Q, PPP2R2B:p.P326L, PPP2R5C:p.S259Y, PRAMEF4:p.R248H, PREX1:p.V731I, PRKAA2:p.R407Q, PRKAR2B:p.S309L, PRKCI:p.R480C, PRKRA:p.K122N, PSG8:p.R397C, PSG8:p.R320C, PSMD12:p.R201Q, PTPDC1:p.R430W, PTPN12:p.R765Q, PTPN13:p.S887L, PTPRD:p.L1053I, PTPRU:p.D1434N, PXDN:p.P856fs, PXDNL:p.T1312M, QRSL1:p.S226L, RAB7L1:p.R79W, RALGAPA1:p.R398C, RANBP2:p.R1231C, RBBP7:p.E313K, RBBP7:p.E274K, RBFOX2:p.A340T, RBMXL1:p.R331Q, RHOBTB1:p.T464M, RIMS2:p.R599Q, RIN3:p.S708L, RLBP1:p.D281N, RLBP1:p.A72V, RNASET2:p.A127V, RNF113B:p.A172V, RNF150:p.R236Q, RNF150:p.S208L, RNF43:p.S216L, ROR2:p.D672N, RPL6:p.F193C, RPS6KA5:p.E166K, RSPO2:p.R28C, RUVBL1:p.E431K, RUVBL1:p.R117C, RWDD2B:p.R254H, RXFP3:p.R113C, RYR3:p.R2705Q, SAGE1:p.R229C, SCFD2:p.R545W, SCML4:p.R194Q, SCN10A:p.T1570M, SCN11A:p.A1688T, SCN11A:p.V1289I, SCN11A:p.V566I, SCUBE2:p.V342M, SEMA3A:p.D81N, SEMA4D:p.R252Q, SEPHS1:p.R371Q, SEZ6L:p.S207L, SFPQ:p.R611Q, SFSWAP:p.S617Y, SGCG:p.A220V, SGCZ:p.I41M, SH3TC2:p.R89C, SIGLEC11:p.S363F, SIPA1L1:p.R1063Q, SIPA1L1:p.S1227Y, SLC12A1:p.S292L, SLC22A15:p.S201L, SLC24A2:p.A134V, SLC25A40:p.R96Q, SLC2A7:p.A65T, SLC30A9:p.R194H, SLC33A1:p.S542L, SLC35F3:p.A280T, SLC39A7:p.R382C, SLC43A1:p.P133L, SLC43A3:p.R216H, SLC44A5:p.R185H, SLC6A2:p.A562T, SLC8A1:p.R431H, SLFN12L:p.F232fs, SLITRK1:p.R52H, SLITRK3:p.S298L, SMAD2:p.R321Q, SMARCA4:p.R381Q, SOCS5:p.S464L, SORBS1:p.V1156M, SORBS1:p.F570L, SORCS2:p.R320W, SOX6:p.R719W, SPATA22:p.S150L, SPEG:p.A944V, SPTB:p.R86C, SPTBN4:p.A1993V, STIM2:p.R572Q, STT3B:p.D583Y, SULT1C4:p.R85Q, SUN3:p.E128K, SUPT6H:p.A957T, SYNE1:p.I1249L, SYNE1:p.R170W, SYNE2:p.K3103N, SYNGR4:p.R169Q, SYT7:p.T349M, TANK:p.S380L, TAS1R2:p.R270C, TAS2R1:p.F183L, TCF7L2:p.R488C, TDRD10:p.S322L, TECTB:p.L29I, TEKT5:p.R401H, TGFBR1:p.S241L, THAP5:p.S287Y, THSD7B:p.R90H, TLL1:p.T153M, TLL2:p.S872L, TM9SF2:p.R91H, TMCC3:p.R110H, TMEM132A:p.R481C, TMEM132D:p.R578W, TMEM55A:p.R189Q, TMEM74:p.R125Q, TMPRSS11A:p.S288L, TNIP2:p.A139T, TOP2B:p.R656H, TOX:p.S354L, TP53:p.G244D, TP53:p.R175C, TPO:p.A826T, TPR:p.S2155L, TPTE2:p.R258Q, TPTE:p.S423L, TRAK1:p.D627N, TRAPPC11:p.R568Q, TRIM23:p.R396Q, TRIM44:p.D331N, TRIO:p.R661W, TRPA1:p.K54N, TRPC5:p.S490L, TRPM6:p.R995H, TRPM7:p.R1862C, TRPM7:p.R843Q, TRPS1:p.R1125W, TRPV5:p.R492H, TRRAP:p.R3515W, TSHZ1:p.R881M, TTC21A:p.S270Y, TTN:p.R22795C, TTN:p.R3193Q, TTN:p.R328H, TUBA3D:p.R243Q, TUFT1:p.A340T, TXNDC15:p.R343Q, UBE2NL:p.R86I, UBIAD1:p.A97T, UGT2A1:p.N97fs, USH2A:p.F2369L, USP11:p.A286T, USP25:p.R1119Q, USP26:p.R861Q, USP29:p.F81L, USP31:p.D391N, USP40:p.S851L, UTP14A:p.V148I, VAV3:p.E685K, VCAN:p.R1125H, VPS13C:p.D1359Y, WBSCR17:p.R228C, WDR3:p.E841K, WDR52:p.A157T, XKR6:p.R268Q, XPOT:p.R541W, YTHDC1:p.R267Q, YTHDC2:p.E634K, ZBBX:p.R596I, ZBTB24:p.L607I, ZC3H13:p.R103Q, ZCWPW2:p.D144N, ZEB2:p.R156H, ZFHX4:p.E237D, ZFP14:p.R386C, ZFP28:p.R525I, ZFP2:p.R150I, ZFP3:p.R273I, ZFP90:p.R330Q, ZHX2:p.V790I, ZIC4:p.S305L, ZIM3:p.D352N, ZKSCAN4:p.R319Q, ZMYM4:p.R1446Q, ZNF117:p.R185I, ZNF167:p.R683I, ZNF180:p.R401I, ZNF19:p.R349I, ZNF205:p.R384C, ZNF236:p.S1480L, ZNF248:p.R568I, ZNF259:p.R174I, ZNF266:p.R512Q, ZNF266:p.R344Q, ZNF280B:p.E363K, ZNF283:p.R392Q, ZNF32:p.S62L, ZNF345:p.R82Q, ZNF345:p.R334I, ZNF350:p.R310Q, ZNF434:p.R306C, ZNF439:p.E239D, ZNF439:p.R262I, ZNF443:p.R301I, ZNF445:p.L682M, ZNF470:p.R641I, ZNF471:p.R282I, ZNF484:p.R138C, ZNF528:p.R279Q, ZNF563:p.K26N, ZNF573:p.R350I, ZNF583:p.R344I, ZNF585A:p.E638K, ZNF585A:p.E491D, ZNF625:p.R235Q, ZNF652:p.K327N, ZNF677:p.R451I, ZNF678:p.R368I, ZNF699:p.R41I, ZNF70:p.R244I, ZNF770:p.S441P, ZNF774:p.R423Q, ZNF782:p.K247T, ZNF7:p.R337I и ZNF831:p.E949D.
50. Фармацевтическая композиция по п. 49, при этом по меньшей мере у 56,65% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
51. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от DLBCL; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из EZH2:p.Y641F, MYD88:p.L273P, BCL2:p.G33R, CARD11:p.E626K, ADCY2:p.A87V, BCL2:p.N172S, BCL2:p.H20Q, BRAF:p.K601E, BTG1:p.L31F, CACNA1E:p.R1458C, CARD11:p.E93D, CD79B:p.Y197D, CD79B:p.Y197H, CREBBP:p.R1446H, GRID1:p.E622K, HIST1H1C:p.A65V, HIST1H1E:p.G133A, HIST1H3B:p.A48S, KRAS:p.G13D, MYD88:p.S251N, PABPC1:p.R94C, PIM1:p.L164F, PIM1:p.L184F, POU2F2:p.T239A, POU2F2:p.T239S, RELN:p.R2971Q, SLC25A48:p.A67T, STAT6:p.D468H, TNF:p.L47F и TRAF7:p.R11H.
52. Фармацевтическая композиция по п. 51, при этом по меньшей мере у 13,79% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
53. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от KICH; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из ACR:p.W279C, AGRN:p.1284_VT>A, C7orf25:p.R384fs, CAMSAP1:p.T466fs, CBWD6:p.E102fs, DOCK8:p.L1111fs, EBPL:p.Q196P, EBPL:p.L189V, GFM1:p.A17fs, GOLGA6L6:p.D570E, ITGA5:p.A48D, LUZP2:p.S154fs, MTMR9:p.K193fs, MUC16:p.P10452fs, MUC4:p.S2832P, ODF2L:p.K407fs, RHBDD3:p.G34fs, RILPL1:p.S358R, TAS2R30:p.L236fs, TRRAP:p.A973S, UBR5:p.K2120fs, URGCP:p.G639fs, ZNF98:p.A222T и ZSWIM6:p.Q610fs.
54. Фармацевтическая композиция по п. 53, при этом по меньшей мере у 50% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
55. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от KIRP; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из FAM18B2:p.C51Y, ZNF598:p.E25G, NEFH:p.E645K, EEF1B2:p.S43G, NEFH:p.AKSPEKEE652del, OBP2B:p.K61N, SKI:p.A62G, C14orf126:p.R6W, KRT8:p.S59A, ACSBG2:p.I250M, ASIC2:p.R46L, CSGALNACT2:p.L362F, FRG1B:p.A50P, IDUA:p.H33Q, KRTAP4-5:p.S74C, SCAF11:p.E926fs, SYN2:p.A34del, ZNF814:p.R322K, BMS1:p.E878D, JMY:p.P822T, KIF1A:p.E917D, KRTAP4-7:p.S57P, LAMA5:p.L2223R, LRP1:p.P1058T, MED16:p.H449Q, MUC2:p.T1488P, MUC5B:p.D682G, NACA2:p.R75K, NEFH:p.665_666insEE, OR2L8:p.S201fs, RGPD5:p.P1760A, RRN3:p.P11S, RRN3:p.R9C, STAG3L2:p.L81fs, ZNF814:p.G320E, ACP6:p.V29G, AHNAK2:p.S2166F, AHNAK2:p.P1215S, AP1G1:p.I782fs, AQP2:p.N68T, BAIAP2L2:p.V396M, BMP6:p.Q118L, BST1:p.G36A, CDR1:p.V31A, CLDN7:p.S172A, CLIP1:p.S1018fs, COL18A1:p.G884fs, CROCC:p.A355P, CTAGE15P:p.A364V, CUBN:p.I2816M, DMRT2:p.T106S, DPY19L1:p.V249L, DSPP:p.D1047N, EBPL:p.L189V, EIF4G1:p.E465del, EXOSC2:p.R11P, FAM216A:p.P36S, FCGR2A:p.V222G, FMOD:p.S331R, FOLR2:p.Q112R, FRG1B:p.L20P, GAGE2B:p.9_10insY, GDPD5:p.G593fs, GIMAP8:p.A544S, GLUD2:p.R300G, GLUD2:p.S496R, GPR135:p.Q5P, HOXD8:p.Q67H, IER5:p.R194G, IL25:p.C168fs, JSRP1:p.V92A, KRAS:p.G12D, KRTAP1-1:p.Y86C, KRTAP4-11:p.L161V, LTBP1:p.L163P, MAML2:p.Q591K, MAPK7:p.A501D, MEF2A:p.P99S, MET:p.H1094Y, MET:p.M1250T, MST1:p.N435fs, MUC2:p.T1582R, MUC2:p.T1722I, MUC4:p.A4222T, MUC4:p.T2335M, MUC4:p.P1138L, MUC5B:p.S1098A, MUC5B:p.S3431N, MYH7:p.A1487T, NBPF10:p.R39fs, NBPF10:p.Y638S, NEFH:p.654_654S>SPEKAKS, PARG:p.A584T, PBX2:p.Y262F, PIP4K2A:p.R219K, RLIM:p.S471P, RUNX2:p.Q71E, SGK223:p.R63S, SMARCB1:p.L365fs, SRCAP:p.Q1875fs, TBC1D2B:p.R920Q, TCF7L2:p.R482fs, TMEM131:p.K640fs, TMEM60:p.K77fs, TPPP:p.R30K, TRPV3:p.A218E, TTBK2:p.C83W, UBXN11:p.S510G, UGT1A1:p.T4A, UTS2R:p.A289E, YBX1:p.P250L, ZNF514:p.V81G, ZNF516:p.A256D, ZNF681:p.K405Q, ZNF814:p.D404E, ZNF814:p.P323H, ZXDB:p.G206R.
56. Фармацевтическая композиция по п. 55, при этом по меньшей мере у 42,24% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
57. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от LIHC; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из TP53:p.R249S, CTNNB1:p.D32V, CTNNB1:p.D32G, CTNNB1:p.S33P, CTNNB1:p.K335I, CTNNB1:p.H36P, EEF1A1:p.T432L, GNAS:p.R844C, OR2T4:p.V137L, TP53:p.H193R, ATXN1:p.Q217H, CSMD3:p.F2383fs, CTNNB1:p.D32N, CTNNB1:p.S33C, CTNNB1:p.G34V, CTNNB1:p.S45P, CTNNB1:p.N387K, DHRS4:p.I218T, DNM2:p.E378D, F5:p.Q426L, GALNTL5:p.A45T, GPX1:p.P77R, GRM8:p.R852C, IDH1:p.R132C, KIF26B:p.A2033T, KRT8:p.S59A, LOC100132247:p.T532P, NEB:p.D3854H, PIK3CA:p.H1047R, SOLH:p.R714H, TP53:p.R158H, TP53:p.V157F и ZNF638:p.D400N.
58. Фармацевтическая композиция по п. 57, при этом по меньшей мере у 6,57% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
59. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от MM; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из NRAS:p.Q61R, KRAS:p.Q61H, KRAS:p.G13D, NRAS:p.Q61K, BRAF:p.V600E, NRAS:p.Q61H, NRAS:p.G13R, ZNF717:p.W315C, ATP13A4:p.V431G, DNAJC12:p.R135K, IRF4:p.K123R, KRAS:p.A146T, KRAS:p.Q61R, KRAS:p.G12A, KRAS:p.G12D, ZNF717:p.N594I, ACTG1:p.A22P, ARL6IP1:p.M75L, BEND2:p.E630K, BRAF:p.G469A, CDHR1:p.R218G, DIS3:p.R780K, DMXL2:p.D2412E, DNAJC10:p.I80K, EGR1:p.Q9H, FGFR3:p.*807S, IDH1:p.R132C, IL6ST:p.P216H, INTS12:p.M1V, KRAS:p.K117N, KRAS:p.A59G, KRAS:p.G12R, MAX:p.R36W, MLL5:p.G492E, NBPF1:p.E810K, NRAS:p.Q61L, NRAS:p.G12D, ODF2L:p.E294K, PADI2:p.T114P, PNLIP:p.T37M, PRDM1:p.S588C, PTPN11:p.E76K, PTPN14:p.E286K, RBM6:p.V675G, SCN10A:p.R1142H, SRGAP1:p.T61M, SUSD1:p.T168P, TAS2R16:p.V231I, TINAG:p.E403K, TRIP12:p.L1775P и ZNF717:p.C844S.
60. Фармацевтическая композиция по п. 59, при этом по меньшей мере у 23,9% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
61. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от PRAD; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из HSD17B7P2:p.N175S, RGPD5:p.P1760A, FRG1B:p.L52S, EEF1B2:p.S43G, FRG1B:p.I10T, FRG1B:p.A53T, LRRC37A2:p.T102S, NBPF10:p.E3455K, PTH2:p.L22V, CYP2D7P1:p.S32A, FAM47C:p.N648D, MAP3K9:p.E38del, MUC4:p.H4205Q, CHEK2:p.K373E, FRG1B:p.A11T, FRG1B:p.A50P, HLA-J:p.R124W, KRTAP1-5:p.I88T, KRTAP4-9:p.D18V, NPIP:p.A271V, PDGFRA:p.R483fs, ZNF780A:p.Q600H, ZNF845:p.R925H, ZNF91:p.R333H, ARFGAP3:p.N299fs, BTN2A3P:p.P3S, FNBP4:p.TT58del, HLA-A:p.Q78R, LOC554223:p.RAPWMEQ147del, PODXL:p.28_30PSP>P, POLI:p.D17del, SPOP:p.F133L, SYN2:p.A34del, TMEM52:p.23_26LLPL>L, UBC:p.L149R, ZNF208:p.I647S, ZNF799:p.E589G, ZNF814:p.D404E, ASTN2:p.L221del, B4GALNT1:p.G88fs, C16orf74:p.S21del, CCDC15:p.H458P, CD209:p.R129W, CNTNAP1:p.S1029I, DBR1:p.541_542DD>D, FAM22F:p.S691del, FRG1B:p.D32V, FRG1B:p.I34T, FRG1B:p.N55D, FRG1B:p.I59V, FRG1B:p.S71N, KIF25:p.W3R, KRTAP4-11:p.L161V, KRTAP4-11:p.M93V, KRTAP4-11:p.R51K, KRTAP4-6:p.S153Y, LILRB5:p.S598P, LMOD2:p.E124del, LOC645752:p.L40P, LRP1:p.P1058T, LRRIQ3:p.K244fs, LURAP1L:p.55_56insGGG, MLLT10:p.V463E, MYOCD:p.Q310del, NBPF10:p.N1369D, OTUD4:p.T909I, PARG:p.A584T, PEX1:p.I370fs, POTEC:p.K507E, POTEC:p.R477Q, POU4F2:p.68_69insG, PRG4:p.T417P, SDHAP2:p.R31C, SPOP:p.F133C, SPOP:p.W131G, TIMD4:p.T152del, TMEM121:p.P299del, TP53:p.G245S, UBC:p.R73L, UBC:p.I191T, WASH3P:p.G175S, ZMIZ1:p.D1048fs, ZNF709:p.T413I, ACADS:p.R330H, ADAMTS7:p.K1357fs, AFF2:p.R597H, AGAP6:p.S127I, AK302238:p.A44T, AK302879:p.Q191R, ALDH1A2:p.R85C, ANAPC1:p.T537A, ANKRD36C:p.H438R, AP4B1:p.R276W, ARFGAP2:p.S38N, BBS9:p.F268fs, BC139719:p.L133R, BRAF:p.G469A, C22orf43:p.D171del, CANT1:p.K131R, CHD3:p.E35del, CLEC4A:p.R209H, CNOT3:p.E20K, CNPY3:p.17_18LL>L, CNTNAP3B:p.S317T, CNTNAP3B:p.M1247I, CTNNB1:p.T41A, DDX10:p.D788del, DLC1:p.S741T, DPY19L2:p.M210V, EDC4:p.S617del, EFCAB6:p.R379K, ERC2:p.927_928HH>H, FAM111B:p.S269fs, FEM1A:p.L620M, FHOD3:p.A632fs, FLJ43860:p.L850fs, FMN2:p.G59del, FNBP4:p.914_915PP>P, FRG1:p.E86del, FRG1B:p.K13N, FRG1B:p.P42Q, GABRB1:p.R416C, GABRR2:p.A368V, GAGE2B:p.9_10insY, GOLGA8DP:p.N84H, GOT2:p.R355W, GPATCH4:p.K210fs, HDGFL1:p.188_189insA, HLA-DQB2:p.G250S, HLA-DQB2:p.R247H, IDH1:p.R132H, IL27:p.E176del, IRF2BPL:p.123_125QQQ>Q, KANK3:p.DGDS489del, KIAA1462:p.858_859SS>S, KRTAP4-11:p.S48R, KRTAP4-7:p.S57P, KRTAP4-8:p.C95S, LPHN3:p.R826H, LRP10:p.L11del, LRP5:p.S1609P, LRRC16B:p.R787W, MAS1L:p.R324G, MECOM:p.R915Q, MED12:p.L1224F, MED12L:p.Q2115del, MESP2:p.GQGQGQGQ195del, MGAT4C:p.T345M, MLEC:p.E238del, MSLNL:p.T68P, MUC7:p.S173P, MYC:p.Q37del, NBPF10:p.N440D, NLRP6:p.E611del, NOX3:p.C404fs, OR1M1:p.V69I, OR7E24:p.L7fs, OTUD4:p.A153del, PANK2:p.T417fs, PCLO:p.S496P, PCNT:p.S162G, PCSK9:p.23_24insL, PHOSPHO1:p.S32del, POU4F1:p.H108del, PRAMEF8:p.R319H, PRDM7:p.M387L, PRG4:p.T597P, PTPRD:p.R1323C, PTPRF:p.R1174Q, ROBO3:p.RS1367del, ROCK1:p.T518S, RPTN:p.G296S, RTL1:p.152_152E>EE, SIRPA:p.V233I, SLC2A6:p.A230D, SLC8A2:p.E710del, SMG7:p.E846fs, SNAPC4:p.S542del, SP8:p.G165del, SPOP:p.F133I, SPOP:p.F133V, SPOP:p.F102C, SPOP:p.F102V, SRSF11:p.G17fs, SRSF4:p.K396del, SSPO:p.S4198fs, STAG3L2:p.L81fs, STK19:p.R18fs, TBC1D2B:p.R920Q, TBC1D9:p.P1233T, TCHH:p.P1158R, TCOF1:p.K1366del, TNRC18:p.2664_2665SS>S, TP53:p.R248Q, TP53:p.R175H, TP53:p.C141G, TSPAN4:p.L92V, UBXN11:p.GPGPGPSP504del, UTP3:p.E81del, WASH3P:p.L187V, ZAN:p.P717L, ZAN:p.L878P, ZFP90:p.R591fs, ZNF761:p.H373R и ZNF91:p.H305R.
62. Фармацевтическая композиция по п. 61, при этом по меньшей мере у 39,85% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
63. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от STAD; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из RNF43:p.G659fs, BZRAP1:p.P1416fs, XYLT2:p.Y526fs, LARP4B:p.T163fs, PGM5:p.I98V, ZBTB20:p.P692fs, ARID1A:p.G1848fs, FHOD3:p.P334fs, KIAA0182:p.T120fs, ATP6V1B1:p.Y383fs, PIK3CA:p.H1047R, FRMD4A:p.P1005fs, PIK3CA:p.E545K, CDC14A:p.N123fs, KRAS:p.G13D, MLL2:p.T172fs, BCORL1:p.S1679fs, PLEKHA6:p.V328fs, C9orf131:p.P342fs, CD4:p.Q164fs, FBXW7:p.R465C, GNG12:p.T68fs, IRS4:p.G591fs, JARID2:p.V422fs, KIAA0195:p.I902fs, MBD6:p.P732fs, MVK:p.P138fs, PAMR1:p.G101fs, WNT16:p.W165fs, ZNF43:p.N251fs, ABCA6:p.L306fs, ADAM28:p.K73fs, AOC3:p.L79fs, ATP2A1:p.R819fs, B2M:p.L13fs, C6orf89:p.P58fs, CNTLN:p.K1305fs, CR2:p.V206fs, DYRK4:p.K468fs, ERBB3:p.V104M, GLI1:p.W272fs, KRAS:p.G12D, MLL2:p.T172fs, MSH6:p.T1085fs, NLK:p.C190fs, OR5M3:p.T89fs, PAX6:p.P375fs, PTEN:p.L265fs, RABGAP1:p.K928fs, RAD51AP2:p.T316fs, SVIL:p.G1862fs, TP53:p.R273H, WNK4:p.G606fs, ARID1A:p.P2139fs, AXIN2:p.G665fs, C13orf33:p.R67fs, C1QTNF5:p.P308fs, CELSR1:p.G614fs, CRYGD:p.G159fs, DCHS1:p.R235fs, DDC:p.I433fs, EDNRB:p.Y383fs, EPHA2:p.P460fs, FOXN3:p.P96fs, HDAC4:p.P901fs, INF2:p.S527fs, KIRREL2:p.V649fs, KLF3:p.I104fs, KLHL14:p.P231fs, MAP7D3:p.Q308fs, OTX2:p.R44fs, PAFAH1B1:p.K302fs, PLAGL2:p.P10fs, POLM:p.P97fs, PRPF40B:p.I31fs, RALGAPB:p.T379fs, SBNO1:p.N1139fs, SERPINI1:p.L81fs, SH3KBP1:p.L574fs, SLC12A7:p.H686fs, SLC27A3:p.P643fs, TBX4:p.S370fs, TP53:p.R273C, TP53:p.R175H, TRAM1L1:p.R345fs, WBP1:p.P138fs, ABCC4:p.L883fs, AKAP13:p.K2785fs, ALDH3A1:p.P562fs, ALPK2:p.L356fs, ARFGEF1:p.P1552fs, ARID1A:p.G1848fs, AVPR1A:p.F351fs, BAX:p.M38fs, C14orf43:p.P313fs, C1QTNF5:p.G194fs, C7orf50:p.L179fs, CDC25C:p.K322fs, CETN3:p.K63fs, CHD3:p.P597fs, CTCF:p.K202fs, CTSC:p.F105fs, DDX17:p.G163fs, DLGAP3:p.G377fs, EBF3:p.G255fs, FHDC1:p.F100fs, FILIP1L:p.K749fs, FLNB:p.W529fs, GBP7:p.G431fs, GCC2:p.E700fs, GPR161:p.G517fs, IWS1:p.S802fs, KIAA0240:p.K895fs, KIAA1967:p.P415fs, LRRC43:p.D558fs, MACF1:p.R707fs, MBD6:p.G780fs, MLL3:p.F4496fs, MPRIP:p.A351fs, MUC6:p.2129_2130SS>S, NOX5:p.P467fs, OPTN:p.P24fs, OR4K5:p.F177fs, PIK3CA:p.N345K, PIK3CA:p.E542K, PLXNA1:p.P1016fs, PNPLA7:p.P1199fs, PODN:p.I301fs, PPP2R3B:p.T389fs, PRSS36:p.L680fs, RGL2:p.G203fs, RHOQ:p.V190fs, RNF111:p.R771fs, RTN2:p.P313fs, SALL4:p.V995fs, SBF1:p.P1076fs, SETDB2:p.R715fs, SNAPC2:p.T292fs, SPG20:p.F232fs, SRCAP:p.P1876fs, STAT2:p.P489fs, TCHP:p.E172fs, TP53:p.R282W, TP53:p.R248Q, USP21:p.K474fs, WDR7:p.G262fs, ZBTB7C:p.E157fs, ZFC3H1:p.K385fs, ZNF124:p.T339fs, ZNF626:p.K115fs, ADNP2:p.S322fs, AGAP1:p.G127fs, ALDH2:p.L286fs, ARHGAP5:p.D890fs, ARHGEF17:p.A615fs, ARID1A:p.Y1324fs, ART1:p.I243fs, ASCL4:p.D35fs, ATXN2L:p.G998fs, B3GNT5:p.F30fs, BCKDHA:p.H37fs, BCL9L:p.P1127fs, BEND3:p.D265fs, BNC2:p.S575R, BRD3:p.P24fs, C12orf51:p.P4235fs, C1R:p.P216fs, C7orf49:p.G130fs, CA2:p.I145fs, CABP5:p.R145fs, CASD1:p.F781fs, CASP8:p.R471fs, CCDC153:p.P200fs, CD93:p.D280fs, CROT:p.L32fs, CSF3R:p.P468fs, CTCF:p.K202fs, ERBB2:p.S310F, FAM46D:p.S69R, FBN3:p.G601fs, FBXO21:p.F144fs, GAS6:p.G150fs, GLYR1:p.G380fs, GXYLT1:p.L223fs, HAUS6:p.S530fs, IGF2R:p.T1314fs, ITGB1:p.L378I, KDM3B:p.P1316fs, KIF13A:p.K1115fs, KLF3:p.S224fs, LARP1:p.A223fs, LRP1:p.G1488fs, LRP1:p.G1488fs, MAGEE2:p.Q45fs, MAMSTR:p.P162fs, MAPK15:p.Q511fs, MLL2:p.P647fs, MOCS2:p.P22fs, MTG1:p.L105fs, MTG1:p.H327fs, MTIF2:p.N109fs, NID2:p.R1035fs, PAX2:p.P395fs, PCCA:p.R230H, PDZD2:p.R101fs, PFKP:p.M593fs, PIK3CA:p.R88Q, PLA2G1B:p.L53fs, PLAU:p.R201fs, PMEPA1:p.P208fs, POP1:p.K750fs, PTCH1:p.P1307fs, PTPRT:p.P1075fs, RDBP:p.P6fs, RNMT:p.K392fs, ROBO2:p.P1080fs, RUNDC3B:p.L6fs, SDAD1:p.K275fs, SLC10A6:p.G109fs, SNAPC1:p.D211fs, SPATA5L1:p.C685fs, SPTA1:p.K1732T, STAT5B:p.P367fs, SYT4:p.M1fs, TAF1L:p.K851fs, TAP2:p.L75fs, TBL1XR1:p.N126fs, THEMIS:p.K406fs, TMEM79:p.P161fs, TP53:p.C176F, TP53BP2:p.K69fs, TP53RK:p.L174fs, UBQLN2:p.A523fs, UHRF1BP1:p.I1330fs, VPRBP:p.K939fs, VPS13B:p.T56fs, WASF3:p.P305fs, YLPM1:p.E1178fs, ZC3H13:p.K1006fs, ZC3H18:p.P825fs, ZC3H4:p.E779Q, ZNF48:p.P247fs, ZNF608:p.A465fs, ZNF878:p.S238fs, ZSCAN18:p.P225fs, ABCB1:p.R527fs, ABCB6:p.G318fs, ACACB:p.G255fs, ACP1:p.Q123fs, ACTL6A:p.L88fs, ADAMTSL4:p.G778fs, AGBL5:p.I420fs, AHI1:p.K303fs, AKAP9:p.M3743fs, AKD1:p.R1209fs, ANKRD40:p.D99E, ARHGEF5:p.S1512fs, ARID1A:p.K1071fs, ARID3A:p.S557G, ARPP21:p.I130fs, ASPN:p.F67fs, ASXL3:p.E873fs, ATP6V1C2:p.R312fs, BEST3:p.P444fs, BRAF:p.P403fs, BRMS1:p.G107fs, BTBD11:p.T451fs, BTBD11:p.A561V, C11orf9:p.S261fs, C14orf102:p.R90fs, C14orf43:p.Q36fs, C15orf52:p.G98fs, C19orf21:p.R262C, C19orf70:p.P50fs, C20orf160:p.P46fs, C3:p.P890fs, CADPS2:p.N468fs, CASC3:p.S232F, CASC3:p.P603L, CASC3:p.P645L, CASC3:p.S658L, CASKIN2:p.P727fs, CBLL1:p.E138fs, CBLN3:p.P69fs, CCDC108:p.P1164fs, CCDC148:p.K420fs, CCDC153:p.P200fs, CCDC169-SOHLH2:p.K162R, CCDC88A:p.K677fs, CD1E:p.F85V, CD3EAP:p.K218fs, CDH11:p.K357T, CDH1:p.D254Y, CDH23:p.V403I, CFI:p.K37fs, CHPF2:p.D645fs, CIC:p.R507fs, CIC:p.A1114fs, CIC:p.A1114fs, CLSTN1:p.T615M, CNBD1:p.L396P, CNGA4:p.K510T, CNOT6:p.S248fs, CNTROB:p.R920fs, COL9A1:p.P283fs, CPAMD8:p.P784fs, CR1L:p.L79fs, CRB1:p.F630V, CSMD1:p.L3410V, CTNNA3:p.K856fs, CTNND1:p.I447fs, CTSD:p.P89fs, CUX1:p.A439fs, CYP7B1:p.K332T, DAB2IP:p.D994fs, DNAH11:p.T871fs, DNAH8:p.K1688fs, DNAJC1:p.K193fs, DNM2:p.P791fs, DSTN:p.F101fs, DYRK1B:p.Q545fs, EAF2:p.V109fs, EDNRB:p.A104V, EEA1:p.N570fs, EFHA1:p.F290fs, EGR1:p.P332fs, EIF4G3:p.K563fs, ELK3:p.S173fs, ENTPD2:p.G204fs, EOMES:p.G332fs, EPHA10:p.P868fs, EPHB6:p.G54fs, EPHX1:p.P132fs, EPPK1:p.G2015fs, ERBB4:p.M1fs, ESF1:p.T99fs, EXOSC8:p.L160fs, FAM113B:p.R51fs, FAM116A:p.L441fs, FAM135B:p.S645R, FAM151A:p.P117fs, FAM193A:p.D428fs, FAM193A:p.D428fs, FAM214B:p.A42fs, FAM40B:p.R740C, FAM70B:p.S19L, FASTKD1:p.K3fs, FBXW7:p.R479Q, FBXW9:p.G298fs, FER:p.L474fs, FERMT2:p.K152fs, FGGY:p.G138fs, FIGNL1:p.K309fs, FLG:p.K159fs, FLNB:p.W529fs, FOLH1:p.S501fs, FYB:p.G324fs, GABRD:p.Q412fs, GALNTL1:p.W317fs, GANAB:p.L23fs, GCDH:p.L389fs, GIMAP7:p.V276fs, GIPC3:p.G227fs, GLI3:p.P1033fs, GLIPR1L2:p.G92fs, GNPNAT1:p.F54fs, GON4L:p.M134fs, GPATCH4:p.K210fs, GRK4:p.K22fs, GTF3C1:p.S767fs, GTF3C4:p.E562fs, H2AFY2:p.K144fs, HCFC1R1:p.P83fs, HCRTR2:p.S9fs, HCRTR2:p.S9fs, HDLBP:p.G747fs, HECA:p.R333fs, HIVEP3:p.H554fs, HIVEP3:p.P534fs, HLA-C:p.P209fs, HOOK1:p.L361fs, HOXD8:p.P122fs, HTT:p.G697fs, IBTK:p.K1213fs, IDE:p.K37fs, IFT172:p.A837T, INPPL1:p.A974fs, INPPL1:p.P1154fs, INSM2:p.T533fs, INTS12:p.L14fs, INVS:p.R815fs, IPO11:p.S844fs, IRX6:p.A425V, ISG20L2:p.P288fs, ITGB8:p.A7fs, JARID2:p.G394fs, JHDM1D:p.R97fs, KBTBD6:p.G442fs, KCNC1:p.K455fs, KCNH2:p.G149A, KCNJ10:p.P102fs, KCNMB2:p.N151K, KCTD21:p.T6M, KIAA0586:p.A1592fs, KIAA1009:p.F406fs, KIAA1109:p.E1588fs, KIAA2026:p.K690fs, KIF26B:p.S1065fs, KIF6:p.L204fs, KIRREL:p.P335fs, KLC2:p.T568fs, KRAS:p.Q61H, KRAS:p.G12S, MAN1C1:p.G431fs, MAP1A:p.P2063fs, MAP2:p.K1472fs, MAP3K12:p.R449del, MAP7D1:p.A80fs, MGST2:p.K102fs, MKI67:p.T1664fs, MKL1:p.P307fs, MLL2:p.P2354fs, MLL2:p.L656fs, MLL2:p.P647fs, MLL2:p.L1877fs, MMP3:p.I64fs, MPDZ:p.K1582fs, MTUS2:p.R1005W, MUC16:p.A6156T, MYB:p.R481fs, MYEOV:p.L269fs, MYH11:p.K1263del, MYO18A:p.P209fs, MYO7A:p.I539fs, MYOCD:p.G226fs, NAA16:p.H514fs, NBEA:p.V2247fs, NCAPD3:p.Q909fs, NCAPH:p.T466fs, NCOR2:p.P1308fs, NEFM:p.A213V, NEK8:p.V690fs, NF1:p.T676fs, NHLRC1:p.F204fs, NKD1:p.P286fs, NPR3:p.Y138H, NT5M:p.P206fs, NUFIP2:p.R224fs, NUP210:p.L135fs, NYNRIN:p.G113fs, OBSCN:p.G997fs, OGDH:p.Y948fs, OR4C16:p.S135R, OR51A7:p.L124R, OR7C1:p.C179fs, OSBP2:p.H627fs, OTOF:p.E1304K, P2RX1:p.R20fs, PALB2:p.M296fs, PALB2:p.N280fs, PANK1:p.K400fs, PAPD4:p.C225fs, PAPPA2:p.I1683fs, PARP15:p.K461fs, PARP4:p.K847fs, PCDH10:p.N118fs, PCDH10:p.P225fs, PCGF3:p.H63fs, PELI2:p.G197fs, PHACTR1:p.V251fs, PHACTR2:p.S237fs, PHACTR4:p.S354fs, PHKB:p.K642fs, PIAS3:p.H116fs, PIGO:p.P787fs, PIGT:p.A346fs, PIK3R3:p.M341fs, PITPNM1:p.P295fs, PKN2:p.K76fs, PLA2G15:p.W230fs, PLAG1:p.K184fs, PLEKHO1:p.T254fs, PLOD3:p.R297fs, PLOD3:p.P296fs, PLXNA2:p.P464fs, POLQ:p.L1430fs, PPARGC1B:p.P135fs, PPL:p.P454fs, PPM1H:p.P226fs, PPP1R12C:p.P372fs, PREX2:p.R562fs, PRICKLE4:p.Q109fs, PRKAR1B:p.P87fs, PRKCG:p.R345C, PRMT8:p.S28fs, PROX1:p.F592fs, PRRG3:p.R163fs, PSD2:p.G256fs, PTCHD3:p.F588fs, PTPN4:p.N319fs, PTPRC:p.Q895H, PWWP2B:p.S84fs, PYGO2:p.Q150fs, RABGAP1:p.K928fs, RB1CC1:p.N1171fs, RBM6:p.R96fs, RHOA:p.Y42C, RIMS1:p.R71G, RIMS2:p.V401fs, RING1:p.G171fs, RINT1:p.L107fs, RNF43:p.P116fs, ROBO2:p.K1293fs, RPS6KA6:p.K109fs, RRS1:p.N45fs, RSF1:p.K386fs, RUSC2:p.P486fs, RXFP3:p.A60V, SAFB:p.W798fs, SCARF1:p.R614Q, SCLT1:p.K109fs, SERPINB12:p.Q168fs, SGK3:p.L61fs, SGOL2:p.E407fs, SIGLEC1:p.P318fs, SIK1:p.Q678fs, SLC16A6:p.G98fs, SLC25A17:p.F28fs, SLC26A7:p.I629fs, SLC32A1:p.V494I, SLC4A3:p.L1061fs, SLC7A10:p.P157fs, SLC9A2:p.T746fs, SLITRK1:p.K45fs, SND1:p.H721fs, SOAT1:p.F64fs, SORBS2:p.E1158fs, SOX7:p.L309fs, SPAG17:p.Q1264fs, SPTY2D1:p.P485fs, SRCIN1:p.P865fs, SREBF2:p.H763fs, SRRT:p.G102fs, STAB1:p.P1120fs, STRADA:p.R333fs, STX2:p.K252fs, SV2A:p.E138fs, SYCP2:p.M176fs, SYNJ2:p.P1111fs, TAS2R10:p.L196fs, TBC1D22B:p.A175fs, TEAD2:p.P298fs, TFE3:p.G482fs, TGM6:p.T358fs, TIMM44:p.K83fs, TIMP3:p.A199fs, TLR4:p.L498V, TMEM132D:p.P206fs, TMEM41A:p.F156fs, TMEM41B:p.F230fs, TMTC4:p.R611C, TNK2:p.P632fs, TOPBP1:p.I1381fs, TP53:p.E286K, TP53:p.P152fs, TRIP11:p.K541fs, TRPA1:p.T673fs, TRPM8:p.H765fs, TTF1:p.K336fs, TTI1:p.R707H, TTN:p.E15192D, U2AF2:p.L175fs, UBC:p.G684fs, UBR4:p.P2802fs, UPF2:p.E1033D, UPK2:p.P49fs, USP13:p.I116fs, USP15:p.K782fs, VASH1:p.G3fs, VEZF1:p.355_356insN, VPS13A:p.F2883fs, WAPAL:p.R522fs, WDFY3:p.L1842fs, WDR59:p.N160fs, WDR5:p.N214fs, WDR60:p.Q412fs, WDTC1:p.M287fs, WHSC1L1:p.K418fs, WNT1:p.W167fs, XIRP2:p.E1007D, YBX2:p.P226fs, YIF1A:p.R131fs, ZBBX:p.E151del, ZBTB40:p.L262fs, ZBTB7C:p.G342fs, ZBTB7C:p.D154fs, ZC3H18:p.T701fs, ZDHHC5:p.E651del, ZDHHC7:p.P316fs, ZFHX3:p.R1893fs, ZFHX3:p.E763fs, ZFHX4:p.L408fs, ZHX3:p.N249K, ZIM3:p.I384fs, ZKSCAN5:p.D13fs, ZMYM4:p.K345fs, ZNF236:p.T1410M, ZNF23:p.F122fs, ZNF334:p.K426fs, ZNF358:p.T130fs, ZNF701:p.L296fs, ZNF711:p.L737fs и ZNF831:p.A49fs.
64. Фармацевтическая композиция по п. 63, при этом по меньшей мере у 48,79% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
65. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от TGCT; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из FAM18B2:p.C51Y, BTN2A3P:p.P3S, MUC2:p.G1715S, NBPF10:p.L44V, SP8:p.G156S, DCP1B:p.Q252H, DEK:p.E41D, ERC1:p.K692R, FAM104B:p.D75H, FRG1B:p.M49V, KRTAP10-10:p.V234M, LRRCC1:p.A6V, NRAS:p.Q61R, PNPLA4:p.L223P, ANKLE1:p.C644fs, ANKLE1:p.C644fs, KIT:p.D816H, KIT:p.D816Y, MUC2:p.T1597I, PSMD11:p.A5V, RHPN2:p.V73M, RUNX2:p.Q71E, SP4:p.E7K, TUBA1C:p.L146F, ZNF814:p.Y324H, ADAMTS17:p.N572T, ATRX:p.K1936R, BCL11B:p.E535D, BMP2K:p.Q460H, BMP2K:p.H487Q, C12orf32:p.D60V, C22orf43:p.K19E, CDC27:p.N571I, CDC27:p.P242S, DDX11:p.K208fs, EBPL:p.L189V, EZH2:p.K510R, FAM86A:p.A141T, GAS2L2:p.D189A, GRID2IP:p.LS754del, HGC6,3:p.E171G, KIT:p.D816V, KIT:p.N822Y, KIT:p.N822K, KRAS:p.Q61R, KRAS:p.G12V, KRTAP1-1:p.I116V, LRRC37BP1:p.Y166D, MEF2A:p.R127Q, MFF:p.S7F, MST1:p.R347W, MUC4:p.S3048L, MUC6:p.H2000Q, MUC6:p.P1977H, NAT10:p.I393T, OPLAH:p.A900D, PIEZO1:p.Q749E, PRAMEF4:p.F300V, RBM10:p.E184D, SERINC2:p.T121P, SPIN2A:p.M150V, SRRM2:p.A2257S, SSBP3:p.K6R, ZNF680:p.R501W, ABCC8:p.Y512C, ABCC9:p.L466P, ABCD1:p.H169Q, ABL2:p.P19T, ACVR2B:p.R48C, AHDC1:p.P33fs, AHNAK2:p.L1640M, ALPPL2:p.W31S, AMMECR1:p.G77C, ANK3:p.D1322E, ANKHD1-EIF4EBP3:p.G60S, ANKRD11:p.Y2015S, ANKRD11:p.K369R, ANKRD50:p.V637M, APBB3:p.L450P, ARHGAP24:p.T35A, ARID4B:p.G1076A, ARMC3:p.A514T, ARRB2:p.T99P, ATAD5:p.I305V, ATXN3:p.305_306insQQQQQQQ, AVPR1B:p.G39R, AXDND1:p.E994Q, BAI2:p.A231G, BEST3:p.P383L, BIRC6:p.V414L, BIRC8:p.A225M, BRWD1:p.K1319R, BTN2A2:p.L15F, C12orf51:p.A2644T, C12orf65:p.K143T, C16orf62:p.L244I, C1QBP:p.T225I, C1orf167:p.S123G, C5orf25:p.Y4F, CACNA1E:p.G2080S, CAPNS1:p.LV303del, CCDC159:p.A332S, CDKAL1:p.P409L, CDYL:p.V48A, CDYL:p.A60G, CELSR2:p.L17P, CHD4:p.E138D, CKAP5:p.G576A, CLCC1:p.K52R, CMTM8:p.S26T, CNKSR2:p.P249L, CNTN5:p.I501T, COG5:p.H617R, COL15A1:p.K708R, COL6A3:p.A2378D, CRYGB:p.R143G, CSGALNACT2:p.L362F, CUL4A:p.I438F, CXXC1:p.Q156H, CYP19A1:p.F406L, DCLRE1B:p.F28I, DDX11:p.A376T, DDX11:p.E680D, DEPDC5:p.R1525Q, DLC1:p.S741T, DNMT1:p.R995Q, DOCK11:p.Q169E, DSPP:p.D1047N, E2F7:p.I91S, EBF1:p.D353G, ECI2:p.K55R, EEF1A2:p.Y418S, EIF3J:p.A8G, EML6:p.K805R, EPAS1:p.S474T, EPRS:p.L1335I, ERICH1:p.E327K, FAM101B:p.L5P, FAM104A:p.M1R, FAM110D:p.R71H, FAM155A:p.Q95R, FAM186A:p.G1492E, FAM194B:p.Y139H, FAM21B:p.P1231S, FAM32A:p.K9R, FAM46B:p.H416R, FAM48B1:p.I499V, FAM48B1:p.A516P, FAM5C:p.S425W, FAM86C2P:p.C120Y, FBXL14:p.V48G, FRMPD3:p.Q832del, FRS2:p.L47S, GDF5:p.E105fs, GPNMB:p.C3fs, GPT2:p.R10P, H2AFV:p.Q125R, HDLBP:p.R503C, HERC2:p.R2129C, HIST1H2BJ:p.K13R, HLX:p.N231K, HMGB3:p.E198D, HSF4:p.R169W, HSF4:p.S491P, HYAL4:p.D222N, INO80E:p.P206fs, INTS4:p.S460A, IQCF6:p.R3H, ITPR1:p.M1569I, ITPR3:p.R1698G, KANSL3:p.G376E, KCNA4:p.E627del, KDM5A:p.P423S, KDM6A:p.Y362fs, KIAA0020:p.K63R, KIDINS220:p.N851S, KIT:p.W557G, KLHDC2:p.W321S, KRAS:p.A146T, KRAS:p.Q61H, KRAS:p.Q61L, KRAS:p.G12A, KRAS:p.G12R, KRBA1:p.R839G, KRTAP4-8:p.T63S, L2HGDH:p.P441del, LAMC3:p.P174Q, LHCGR:p.L16Q, LOC401296:p.L144M, LPHN2:p.F906I, LRP12:p.G310C, LTB4R:p.F73L, LTBP3:p.L35del, LUC7L3:p.S148T, LYPD4:p.T64K, MAMLD1:p.Q572L, MAP4K2:p.R341G, MAPK7:p.A501D, MAT2A:p.E166G, MED12L:p.C1292Y, MESP2:p.Q182E, MEX3C:p.R534S, MIER2:p.L131F, MLL5:p.Y66C, MLLT3:p.177_178SS>S, MMS19:p.D1005N, MRPS25:p.E119del, MSH6:p.D576A, MTIF3:p.G65E, MUC17:p.M1807T, MUC17:p.T2279N, MUC17:p.G2474S, MUC2:p.TTPSPP1475del, MUC2:p.T1568M, MUC2:p.T1580N, MUC2:p.T1704I, MUC2:p.T1706M, MUC4:p.H1117D, MUC5B:p.R1097H, MYEF2:p.K323E, MYEOV:p.L302H, MYH8:p.A785V, MYO1A:p.N584K, NAP1L3:p.P353R, NAV1:p.I1433M, NCAM1:p.E131G, NEB:p.D3107N, NEFH:p.V670E, NELL2:p.G170D, NHS:p.D1561N, NKD2:p.H447del, NSD1:p.T461R, NT5C3:p.A3P, NYAP1:p.P480S, OBSCN:p.A908T, OR10J1:p.R244Q, OR1S2:p.M298I, OR2L3:p.K294R, OR6K6:p.F311L, PABPC3:p.V325fs, PBX2:p.Y262F, PCDHB4:p.P255F, PCMTD1:p.V281A, PCP4L1:p.K64R, PDE3A:p.A98E, PDIA6:p.N56K, PDS5A:p.L1309F, PHLDA2:p.R28S, PIGR:p.V183G, PIK3CA:p.E545K, PIK3CD:p.C381R, PKD1:p.T938M, PLEKHM1:p.A895V, PLEKHN1:p.A600D, PLXND1:p.R367L, PMS2:p.K651R, PNMA3:p.E200G, POTEF:p.S112G, PRAMEF8:p.I448V, PRDM2:p.E278D, PRODH:p.L527V, PRPF31:p.R289W, PSME4:p.N495D, PTGR1:p.E40A, PTPRB:p.Q726H, RABGEF1:p.N207D, RAC1:p.P34R, RANBP17:p.M900I, REV3L:p.A30S, RFC3:p.I82N, RFC3:p.K296N, RIMBP3:p.Q1154R, RPL19:p.R151C, RPL5:p.R58fs, RPTN:p.M538I, RRAD:p.A278E, RYR1:p.D668Y, RYR2:p.L2023F, SAFB:p.G799V, SCRIB:p.G332V, SDK1:p.Y2146C, SEC16A:p.T443K, SEC31B:p.P905S, SELO:p.R565Q, SELP:p.A297T, SI:p.I1681K, SLC2A7:p.H268Q, SLC37A1:p.V528I, SLC38A1:p.G100R, SMARCA2:p.D1158A, SMARCA5:p.T156fs, SMC3:p.E970Q, SMG1:p.P2696H, SNRNP200:p.A2129G, SPIN2B:p.M150V, ST6GALNAC1:p.S354N, STAMBPL1:p.Y143H, STARD8:p.G662A, STON1-GTF2A1L:p.N451S, SYMPK:p.A336G, TAS2R8:p.W98C, TCHH:p.W1016R, TET1:p.T1472S, TIAM1:p.G247M, TNS1:p.P183S, TOR1AIP2:p.G146R, TPRX1:p.S216P, TPRX1:p.S200P, TRMT61A:p.S244I, TSPAN4:p.L92V, TTF1:p.Q530R, UBE2M:p.G131D, UBR5:p.R2517S, UGT2B11:p.R447I, UMODL1:p.M559I, UNC93A:p.V445A, USP46:p.Q137R, VWA2:p.G317D, VWA7:p.V792G, WASH3P:p.L187V, WNT5B:p.K327E, WRN:p.E510D, XDH:p.P410S, ZAN:p.S755P, ZC3H11A:p.I777T, ZC3H7A:p.C575S, ZDHHC11:p.H250Q, ZFHX4:p.D3239N, ZKSCAN3:p.K200A, ZMYM4:p.T367I, ZNF174:p.P353T, ZNF322:p.Y353C, ZNF592:p.K324Q, ZNF592:p.P500T, ZNF782:p.C145F, ZNF799:p.C453R, ZNF804B:p.P644S и ZNRF3:p.R889W.
66. Фармацевтическая композиция по п. 65, при этом по меньшей мере у 51,61% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
67. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от THCA; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из BRAF:p.V600E, NRAS:p.Q61R, HRAS:p.Q61R, NRAS:p.Q61K, OTUD4:p.T909I, HRAS:p.Q61K, NLRP6:p.E611G, AKT1:p.E17K, ANKMY1:p.N302I, ATP6V1A:p.L237P, CYP19A1:p.S113I, DCUN1D4:p.L275P, DGCR8:p.E518K, DLC1:p.S741T, DNAH10:p.C1853F, EIF1AX:p.G9D, FAM75D5:p.L222P, FCGRT:p.P40A, KRAS:p.Q61K, LMX1B:p.Q285del, MAS1L:p.R324G, MED15:p.S35I, MEGF6:p.Y393C, ODZ2:p.A1529V, OR5L1:p.R122H, OR6K6:p.F311L, OTX1:p.D315N, POTEE:p.S75G, SCN5A:p.D1978H, TOP2A:p.K1199E и TSG101:p.K265R.
68. Фармацевтическая композиция по п. 67, при этом по меньшей мере у 69,88% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
69. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от UCS; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из TP53:p.R248Q, ZNF814:p.D404E, BTN2A3P:p.P3S, FBXW7:p.R465C, FRG1B:p.G65E, MUC4:p.H4205Q, NBPF10:p.V99F, PIK3CA:p.E545K, PIK3CA:p.H1047R, PPP2R1A:p.P179R, DDX11L2:p.*128Q, FBXW7:p.R479Q, FRG1B:p.K13N, FRG1B:p.L52S, HSD17B7P2:p.N175S, KRAS:p.G12V, LOC283788:p.S37G, TP53:p.R273H, TP53:p.S241Y, ADAMTS12:p.E359K, BCL2L11:p.L187fs, CDC27:p.L460fs, CHEK2:p.K373E, ESPNP:p.W122fs, FBXW7:p.R689W, FBXW7:p.R505G, FBXW7:p.R465H, FCGBP:p.V4019M, FRG1B:p.I10T, FRG1B:p.D32V, FRG1B:p.R37K, KRAS:p.G12D, LOC100233156:p.R21C, LOC283788:p.I46M, LRP1B:p.L1392F, MAMLD1:p.Q572L, MST1P9:p.L319P, MUC4:p.A2390T, MUC4:p.G2172S, NBPF10:p.E3455K, PIK3CA:p.G106V, PODXL:p.28_30PSP>P, POTEC:p.R477Q, PPP2R1A:p.R183W, PPP2R1A:p.S219L, PTPN18:p.TG378del, RGPD3:p.N756D, RPL13AP20:p.G107R, SAMD4B:p.R477W, SMAP1:p.E169fs, TP53:p.H193R, TP53:p.H179R, TP53:p.R175H, TUBBP5:p.R119H и U2AF1:p.S34F.
70. Фармацевтическая композиция по п. 69, при этом по меньшей мере у 16,07% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
71. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-7, при этом:
(a) популяция субъектов страдает от PAAD; и
(b) по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация включает любую комбинацию мутаций, выбранных из группы, состоящей из RBM14:p.AAAAAAA286del, KRAS:p.G12D, JMY:p.PPPPPPPPPPPP811del, RIOK1:p.D69del, LCE2A:p.SSGGCCGSSSGGCC47del, KRAS:p.G12V, C1QB:p.GPKGPMGPKGGPGAPGAP90del, ZFHX3:p.V777del, DBR1:p.541_542DD>D, AEBP1:p.K1133del, KRAS:p.G12R, RBM47:p.495_502AAAAAAAA>A, AP3S1:p.K41fs, MLL2:p.AEGPHLSPQPEELHLSPQ792del, RFX1:p.386_401GGGGGGGGGGGGGGSG>G, AXDND1:p.EQ991del, HERC2P3:p.A803V, RGPD3:p.N756D, FNDC1:p.D1180del, ANAPC1:p.T537A, IRS4:p.21_22AA>A, GIGYF2:p.Q1005del, NCOA3:p.Q1253fs, SIK3:p.950_951QQ>Q, GPR6:p.AAAAATAAGGPDTGEWGPPA36del, NBPF12:p.D1323fs, SHROOM4:p.1156_1157EE>E, ZMIZ2:p.VAAAAATATATATAT153del, DGKK:p.PAPP41del, LZTS1:p.RTQDLEGALRTKGLEL432del, CASQ2:p.395_396DD>D, DCP1B:p.251_252insH, ESPNP:p.296_317PPPPSFPPPPPPPGTQLPPPPP>P, KBTBD6:p.T403K, NBPF16:p.D449fs, ANKRD36C:p.H438R, ESPN:p.PPPPPPSFPPPPPPPGTQLPP430del, FCGBP:p.A2493V, KRAS:p.Q61H, NCOA3:p.Q1276del, OR2T2:p.C203fs, TMCC1:p.Q565L, BCKDHA:p.G129fs, ESPNP:p.H64fs, GNAS:p.R844H, NBPF14:p.R25C, OGFOD1:p.G477fs, RBM12:p.P693S, SLC38A10:p.1071_1072II>I, SORBS2:p.P866S, TP53:p.R248W, TP53:p.R175H и UBAC1:p.E269del.
72. Фармацевтическая композиция по п. 71, при этом по меньшей мере у 50% субъектов в популяции имеется данная по меньшей мере одна опухолеспецифичная мутация.
73. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-72, при этом композиция содержит по меньшей мере 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 или 20 неоантигенных пептидов.
74. Фармацевтическая композиция по п. 73, при этом композиция содержит от 15 до 20 неоантигенных пептидов.
75. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-74, при этом каждый неоантигенный пептид имеет длину от 5 до 50 аминокислот.
76. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-75, при этом каждый опухолеспецифичный неоэпитоп связывается с HLA-A, -B или -C со значением KD менее 500 нМ.
77. Фармацевтическая композиция по любому из пп. 1-76, которая является иммуногенной или вакцинной композицией.
78. Фармацевтическая композиция по п. 77, дополнительно содержащая иммуномодулятор или адъювант.
79. Фармацевтическая композиция по п. 78, при этом иммуномодулятор или адъювант выбран из группы, состоящей из поли-ICLC, ISS 1018, солей алюминия, Amplivax, AS15, BCG, CP-870,893, CpG7909, CyaA, dSLIM, GM-CSF, IC30, IC31, имиквимод, ImuFact IMP321, IS Patch, ISS, ISCO Matrix, JuvImmune, LipoVac, MF59, монофосфориллипида A, Montanide IMS 1312, Montanide ISA 206, Montanide ISA 50V, Montanide ISA-51, OK-432, OM-174, OM-197-MP-EC, ONTAK, PepTel®, векторных систем, микрочастиц PLGA, резиквимод, SRL172, виросом и других вирусоподобных частиц, YF-17D, VEGF Trap, R848, бета-глюкана, Pam3Cys и стимулона QS21 фирмы Aquila.
80. Способ лечения или профилактики опухолей у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение ему фармацевтической композиции по любому из пп. 1-79.
81. Способ по п. 80, при этом фармацевтическая композиция вводится в виде комбинированной терапии с другой противораковой терапией.
82. Способ по п. 81, при этом дополнительная терапия представлена ингибитором контрольной точки.
83. Способ по п. 81, при этом дополнительная терапия представлена хирургическим вмешательством, химиотерапией или таргетной терапией.
84. Способ профилактического лечения рака, включающий:
(a) выбор противоракового препарата для нуждающегося в этом пациента, причем препарат выбирается из группы, состоящей из ибрутиниба, эрлотиниба, иматиниба, гефитиниба, кризотиниба, трастузумаба, вемурафениба, ингибиторов RAF/MEK и антиэстрогеновой терапии; и
(b) профилактическое введение субъекту фармацевтической композиции по любому из пп. 1-79, причем по меньшей мере один неоантигенный пептид получен при мутациях типа лекарственной устойчивости, связанных с выбранным противораковым препаратом.
85. Способ лечения или профилактики опухолей в популяции нуждающихся в этом субъектов, включающий введение им средства, содержащего внеклеточный лиганд-связывающий домен, распознающий опухолеспецифичный неоэпитоп, содержащий опухолеспецифичную мутацию, которая встречается по меньшей мере у 1% субъектов в популяции.
86. Способ по п. 85, при этом средство включает антитела, фрагменты антител, конъюгаты антитело-лекарственное средство, аптамеры, CAR-рецепторы или T-клеточные рецепторы.
87. Способ по п. 86, при этом антитело или фрагмент антитела является гуманизированным, полностью человеческим или химерным.
88. Способ по п. 86 или 87, при этом фрагменты антител включают нанотела, Fab, Fab′, (Fab′)2, Fv, scFv, диатела, триатела, тетратела, bis-scFv, минитела, Fab2- или Fab3-фрагменты.
89. Способ по любому из пп. 85-88, при этом опухолеспецифичная мутация включает мутации, приведенные для любых популяций в таблице 9.
90. Способ по любому из пп. 85-88, при этом опухолеспецифичная мутация находится внутри гена, содержащего внеклеточный домен.
91. Способ по п. 90, при этом опухолеспецифичная мутация включает FGFR3 S249C, ERBB3 V104M, EGFR L858R, MUC4 H4205Q, PDGFRA R483fs, TMEM52 23_26LLPL>L или PODXL 28_30PSP>P.
92. Способ по п. 90, при этом опухолеспецифичная мутация находится во внеклеточном домене.
93. Способ по п. 92, при этом опухолеспецифичная мутация включает FGFR3 S249C или ERBB3 V104M.