Пептиды neil3 и включающие их вакцины - RU2016138428A
Код документа: RU2016138428A
Формула
1. Выделенный пептид по пункту (a) или (b) ниже, где указанный пептид обладает способностью индуцировать цитотоксические T лимфоциты (CTL):
(a) выделенный пептид, содержащий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 24, 33, 35, 41 и 43; или
(b) выделенный пептид, состоящий из аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: SEQ ID NOs: 24, 33, 35, 41 и 43, в котором 1, 2 или несколько аминокислот заменены, делетированы или добавлены.
2. Выделенный пептид по п.1(b), где указанный пептид обладает одной или обеими из следующих характеристик:
(a) вторая аминокислота с N-конца аминокислотной последовательности SEQ ID NOs: 24, 33, 35, 41 или 43 заменена на аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из фенилаланина, тирозина, метионина и триптофана; и
(b) C-концевая аминокислота аминокислотной последовательности SEQ ID NOs: 24, 33, 35, 41 или 43 заменена на аминокислоту, выбранную из группы, состоящей из фенилаланина, лейцина, изолейцина, триптофана и метионина.
3. Выделенный пептид по п.1 или 2, представляющий собой нонапептид или декапептид.
4. Выделенный полинуклеотид, кодирующий пептид по любому из пп.1-3.
5. Композиция для индукции CTL, где композиция содержит один или более пептидов по любому из пп.1-3, или один или более полинуклеотидов по п.4.
6. Фармацевтическая композиция для лечения и/или профилактики злокачественных опухолей, и/или предотвращения их послеоперационного рецидива, где композиция содержит один или более пептидов по любому из пп.1-3, или один или более полинуклеотидов по п.4.
7. Фармацевтическая композиция по п.6, предназначенная для введения субъекту, антиген HLA которого представляет собой HLA-A24.
8. Фармацевтическая композиция по п.6 или 7, предназначенная для лечения злокачественной опухоли.
9. Способ индукции антигенпредставляющей клетки (APC) со способностью индуцировать CTL, включающий стадию, выбранную из группы, состоящей из:
(a) приведения APC в контакт с пептидом по любому из пп.1-3 in vitro, ex vivo или in vivo, и
(b) введения полинуклеотида, кодирующего пептид по любому из пп.1-3, в APC.
10. Способ индукции CTL способом, включающим стадию, выбранную из группы, состоящей из:
(a) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с APC, представляющей на своей поверхности комплекс антигена HLA и пептида по любому из пп.1-3;
(b) совместного культивирования CD8-положительной T-клетки с экзосомой, представляющей на своей поверхности комплекс антигена HLA и пептида по любому из пп.1-3; и
(c) введения гена, содержащего полинуклеотид, кодирующий полипептид субъединицы T-клеточного рецептора (TCR), связывающийся с пептидом по любому из пп.1-3, в T-клетку.
11. Выделенная APC, представляющая на поверхности комплекс антигена HLA и пептида по любому из пп.1-3.
12. APC по п.11, индуцированная способом по п.9.
13. Выделенный CTL, нацеленный на любой из пептидов по пп.1-3.
14. CTL по п.13, индуцированный способом по п.10.
15. Способ индукции иммунного ответа против злокачественной опухоли у субъекта, включающий введение субъекту композиции, содержащей пептид по пп.1-3, его иммунологически активный фрагмент или полинуклеотид, кодирующий пептид или фрагмент.
16. Экзосома, представляющая комплекс, содержащий любой из пептидов по пп.1-3 и антиген HLA.
17. Антитело или его фрагмент против любого из пептидов по пп.1-3.
18. Вектор, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую любой из пептидов по пп.1-3.
19. Клетка-хозяин, трансформированная или трансфицированная экспрессирующим вектором по п.18.
20. Диагностический набор, содержащий любой из пептидов по пп.1-3, нуклеотид по п.4 или антитело по п.17.
21. Способ диагностики злокачественной опухоли, где указанный способ включает стадии:
(a) определения уровня экспрессии гена NEIL3 в полученном от субъекта биологическом образце любым из способов, выбранным из группы, состоящей из:
(i) детекции мРНК, включающей последовательность NEIL3,
(ii) детекции белка, включающего аминокислотную последовательность NEIL3, и
(iii) детекции биологической активности белка, включающего аминокислотную последовательность NEIL3; и
(b) корреляции увеличения уровня экспрессии, определенного на стадии (a), по сравнению с нормальным контрольным уровнем гена, с присутствием злокачественной опухоли.
22. Способ по п.21, где уровень экспрессии, определенный на стадии (a), по меньшей мере, на 10% превышает нормальный контрольный уровень.
23. Способ по п.21, где злокачественная опухоль выбрана из группы из злокачественной опухоли мочевого пузыря, злокачественной опухоли молочной железы, злокачественной опухоли шейки матки, холангиоцеллюлярной карциномы, злокачественной опухоли ободочной и прямой кишки, эндометриоза, злокачественной опухоли пищевода, злокачественной опухоли печени, NSCLC, остеосаркомы, злокачественной опухоли поджелудочной железы, злокачественной опухоли предстательной железы, карциномы почки, SCLC, опухоли мягких тканей, AML и CML.
24. Способ по п.21, где уровень экспрессии, определенный на стадии (a), определяют посредством детекции гибридизации зонда с генным транскриптом гена.
25. Способ по п.21, где уровень экспрессии, определяемый на стадии (a), определяют посредством детекции связывания антитела против белка NEIL3.
26. Способ по п.21, где полученный от субъекта биологический образец включает биоптат, слюну, кровь, плевральный выпот или мочу.
27. Способ по п.21, где ген NEIL3 кодирует полипептид, обладающий аминокислотной последовательностью, показанной на SEQ ID NO:45.
28. Способ по п.21, где аминокислотная последовательность NEIL3 представляет собой SEQ ID NO:45.
29. Набор, содержащий реагент для детекции, связывающий продукт транскрипции или трансляции NEIL3.
30. Применение по меньшей мере одного компонента, выбранного из группы, состоящей из (a)-(d), в производстве фармацевтической композиции для лечения или предотвращения рака или опухоли:
(a) пептид по любому из пп.1-3;
(b) нуклеиновая кислота, кодирующая пептид по любому из пп.1-3 в позволяющей экспрессию форме;
(c) APC или экзосома, представляющие пептид по любому из пп.1-3; или
(d) цитотоксическая Т-клетка по п.13 или 14.
