Phki-опосредованное ингибирование мишеней повышенного внутриглазного давления - RU2007132874A

Реферат

1. Способ ослабления экспрессии мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления у индивидуума, который включает введение индивидууму композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов и фармацевтически приемлемого носителя, причем интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца любой последовательности SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:82 и SEQ ID NO:220 - SEQ ID NO:717.

2. Способ по п.1, в котором интерферирующая РНК представляет собой shРНК.

3. Способ по п.1, в котором мишеневая мРНК повышенного внутриглазного давления кодирует β-адренергический рецептор, и интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца любой последовательности SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:52 и SEQ ID NO:220 - SEQ ID NO:282.

4. Применение для изготовления медикамента для лечения повышенного внутриглазного давления у индивидуума композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов и фармацевтически приемлемого носителя, причем интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца любой последовательности SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:82 и SEQ ID NO:220 - SEQ ID NO:717, где лечение направлено на повышенное внутриглазное давление.

5. Применение по п.4, в котором интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца любой последовательности SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:42 и SEQ ID NO:220 - SEQ ID NO:241.

6. Применение по п.4, в котором интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца любой последовательности SEQ ID NO:43 - SEQ ID NO:52 и SEQ ID NO:242 - SEQ ID NO:282.

7. Способ ослабления экспрессии первого варианта мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления без ослабления экспрессии второго варианта мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления у индивидуума, включающий введение индивидууму композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемого носителя, причем интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца первого варианта,

где экспрессия первого варианта мРНК ослабляется без ослабления экспрессии второго варианта мРНК, и где первый вариант мишеневой мРНК представляет собой SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:127 или SEQ ID NO:129, и второй вариант мишеневой мРНК представляет собой SEQ ID NO:123, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:128 или SEQ ID NO:130 соответственно.

8. Способ ослабления экспрессии первого варианта мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления без ослабления экспрессии второго варианта мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления у индивидуума, включающий введение индивидууму композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемого носителя, причем интерферирующая РНК содержит область, по меньшей мере, из 13 непрерывных нуклеотидов, которая, по меньшей мере, на 90% комплементарна последовательности или, по меньшей мере, на 90% идентична последовательности с предпоследними 13 нуклеотидами 3' конца первого варианта,

где экспрессия первого варианта мРНК ослабляется без ослабления экспрессии второго варианта мРНК, и где первый вариант мишеневой мРНК представляет собой SEQ ID NO:123, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:128 или SEQ ID NO:130, и второй вариант мишеневой мРНК представляет собой SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:127 или SEQ ID NO:129 соответственно.

9. Способ ослабления экспрессии мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления у индивидуума, включающий введение индивидууму композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемого носителя, причем интерферирующая РНК содержит смысловую нуклеотидную цепь, антисмысловую нуклеотидную цепь и область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов;

где антисмысловая цепь гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:123, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:126, SEQ ID NO:127, SEQ ID NO:128, SEQ ID NO:129, SEQ ID NO:130, SEQ ID NO:131, SEQ ID NO:132 или SEQ ID NO:133, и имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:123, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:126, SEQ ID NO:127, SEQ ID NO:128, SEQ ID NO:129, SEQ ID NO:130, SEQ ID NO:131, SEQ ID NO:132 или SEQ ID NO:133 соответственно, где экспрессия мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления ослабляется.

10. Способ по п.9, в котором композиция вводится местным, интравитреальным, транссклеральным, периокулярным, конъюктивальным, под теноновую фасцию, интракамеральным, субретинальным, субконъюктивальным, ретробульбарным или интраканаликулярным путем.

11. Способ по п.9, в котором композиция вводится посредством экспрессии in vivo извектора экспрессии, способного экспрессировать интерферирующую РНК.

12. Способ по п.9, в котором мишеневая мРНК повышенного внутриглазного давления кодирует β1- или β2-адренергический рецептор, и антисмысловая цепь гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3 или SEQ ID NO:4, и имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3 или SEQ ID NO:4 соответственно.

13. Способ по п.9, в котором мишеневая мРНК повышенного внутриглазного давления кодирует ацетилхолинэстеразу, и антисмысловая цепь гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:5 или SEQ ID NO:123, и имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:5 или SEQ ID NO:123 соответственно.

14. Способ по п.9, в котором мишеневая мРНК повышенного внутриглазного давления кодирует субъединицу Na⁺/K⁺-АТФазы, и антисмысловая цепь гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:126, SEQ ID NO:127, SEQ ID NO:128, SEQ ID NO:129, SEQ ID NO:130, SEQ ID NO:131 или SEQ ID NO:132, и имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:126, SEQ ID NO:127, SEQ ID NO:128, SEQ ID NO:129, SEQ ID NO:130, SEQ ID NO:131 или SEQ ID NO:132 соответственно.

15. Способ по п.9, в котором мишеневая мРНК повышенного внутриглазного давления кодирует Na-K-2Cl сотранспортер, и антисмысловая цепь гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:7 или SEQ ID NO:133, и имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:7 или SEQ ID NO:133 соответственно.

16. Применение для изготовления медикамента для лечения повышенного внутриглазного давления у индивидуума композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемого носителя, причем интерферирующая РНК содержит смысловую нуклеотидную цепь, антисмысловую нуклеотидную цепь и область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов;

где антисмысловая цепь гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:123, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:126, SEQ ID NO:127, SEQ ID NO:128, SEQ ID NO:129, SEQ ID NO:130, SEQ ID NO:131, SEQ ID NO:132 или SEQ ID NO:133, и имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3, SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5, SEQ ID NO:6, SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:123, SEQ ID NO:124, SEQ ID NO:125, SEQ ID NO:126, SEQ ID NO:127, SEQ ID NO:128, SEQ ID NO:129, SEQ ID NO:130, SEQ ID NO:131, SEQ ID NO:132 или SEQ ID NO:133 соответственно.

17. Применение по п.16, при котором смысловая нуклеотидная цепь и антисмысловая нуклеотидная цепь соединяются посредством петлевой последовательности нуклеотидов.

18. Применение по п.16, в котором композицию изготавливают для местного, интравитреального, транссклерального, периокулярного, конъюктивального, под теноновую фасцию, интракамерального, субретинального, субконъюктивального, ретробульбарного или интраканаликулярного введения.

19. Применение по п.16, в котором композиция содержит вектор экспрессии, способный экспрессировать интерферирующую РНК.

20. Способ ослабления экспрессии мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления у индивидуума, включающий введение индивидууму композиции, содержащей эффективное количество одноцепочечной интерферирующей РНК длиной 19-49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемого носителя,

где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3, содержащей нуклеотид 468, 523, 799, 1563, 1565, 1569, 1593, 1613, 1614, 1626, 310, 322, 726, 769, 772, 801, 802, 1501, 1576, 1577, 1579, 1580, 1581, 1586, 1590, 1592, 1594, 1615, 1616, 1632, 1633 или 1654, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:3; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:4, содержащей нуклеотид 329, 375, 1031, 1046, 1149, 1163, 1371, 1401, 1426, 1880, 283, 607, 608, 609, 619, 623, 722, 857, 1037, 1091, 1115, 1124, 1136, 1137, 1151, 1164, 1393, 1394, 1395, 1406, 1407, 1427, 1428, 1429, 1442, 1725, 1726, 1756, 1757, 1758, 1767, 1790, 1791, 1792, 1793, 1803, 1861, 1869, 1971, 1972 или 1979, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:4; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:123, содержащей нуклеотид 1875, 1890, 1891, 2011, 2012, 2133 или 2134, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:123; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:5, содержащей нуклеотид 366, 370, 384, 385, 525, 588, 768, 1045, 1046, 1061, 1090, 1232, 1314, 1316, 1460, 1461, 1462, 1528, 1607, 1705, 1713, 382, 393, 397, 622, 1131, 1459, 1530, 2251, 2885, 2886, 386, 1231, 1315, 2047, 2049, 2053, 2055, 2057, 2125, 2126, 2127, 2250, 2253, 2258, 2260, 2318, 2395, 2397, 2404, 2405, 2643, 2645 или 2887, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:5; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:124, содержащей нуклеотид 2208, 2275, 2307, 2526, 2538, 2592, 2628, 2979, 2985, 3093, 3474, 3504, 3505, 3506, 3518, 343, 442, 700, 707, 811, 907, 1059, 1363, 1594, 1662, 1758, 1760, 1896, 2037 или 2147, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:124; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:125, содержащей нуклеотид 436, 441, 443, 552, 617, 701, 702, 832, 2204, 2291 или 2495, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:125; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:6, содержащей нуклеотид 471, 1990, 3080, 3797, 4037, 4093, 4225, 4323, 5213, 5285, 214, 467, 470, 472, 473, 632, 825, 946, 1693, 1767, 1768, 2157, 2263, 2589, 2590, 2765, 2988, 3094, 3144, 3145, 3344, 3345, 3418, 3666, 3828, 3850, 4040, 4041, 4061, 4882, 4894, 4900, 5040, 5114, 5115, 5128, 5129, 5253, 5296, 5375, 5384 или 5385, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:6; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:126, содержащей нуклеотид 240, 272, 362, 1836, 1851, 2103, 2137, 2138, 2139, 2157, 2158, 2160, 2425, 2580, 2601, 2646, 2650, 2794, 2803, 3116, 3124, 3126, 3129 или 3377, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:126; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:127, содержащей нуклеотид 113, 612, 702, 833, 1101, 1732, 1733, 1836, 2070, 2071, 2143, 2328, 2475, 2861, 2862, 2952, 3203, 3281, 3377, 3379, 3470, 3471, 3554, 3614, 3615, 3616, 3617, 3625, 3626, 3642, 3646, 3647, 3653, 3655, 3797, 3801, 3803, 3809 или 3810, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:127; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:128, содержащей нуклеотид 126, 251, 252, 253, 331, 427, 429, 520, 521, 530, 601, 602, 603, 604, 664, 665, 666, 667, 675, 676, 692, 696, 697, 702, 703, 705, 707, 847, 851, 853, 859 или 860, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:128; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:129, содержащей нуклеотид 1096, 1099, 1130, 1131, 1167, 1299, 1441, 1450, 1451, 1452, 1564, 1746, 1750, 1751, 1752, 1795, 203, 204, 214, 222, 224, 225, 226, 380, 525, 591, 612, 613, 615, 635, 636, 663, 664, 669, 699, 765, 790, 839, 840, 841, 900, 909, 933 или 947, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:129; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:130, содержащей нуклеотид 1063, 1102, 1106, 1107, 1108, 1109, 1111 или 1151, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:130; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:131, содержащей нуклеотид 653, 654, 771, 773, 841, 849, 853, 917, 918, 926, 927, 931, 981, 983, 984, 996, 998, 1022, 1023, 1160, 1214, 1355, 1356, 1381, 1394, 1425, 1474, 1550, 1620, 1707, 1740, 1753, 1825, 1956, 1965, 2598, 2599, 2608, 2828, 2829, 2888, 3012 или 3251, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:131; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:132, содержащей нуклеотид 292, 434, 438, 457, 459, 488, 490, 498, 499, 592, 639, 723, 774, 775, 788, 857, 858, 910, 911, 930, 931, 932, 1009, 1010, 1023, 1024, 1111, 1146, 1147, 1220, 1246, 1321, 1325, 1326, 1327, 1331, 1437, 1548, 1571, 1785, 1786 или 1787, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:132; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:7, содержащей нуклеотид 675, 974, 1373, 1780, 2102, 2151, 2315, 2542, 2609, 3197, 67, 71, 73, 353, 405, 864, 911, 912, 913, 1409, 1748, 1811, 1935, 1937, 1993, 2012, 2346, 2388, 2437, 2586, 3007, 3008, 3022, 3130, 3210, 3237 или 3271, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:7; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизируется при физиологических условиях с частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:133, содержащей нуклеотид 748, 749, 753, 1119, 1169, 1499, 1509, 1820, 2081, 2118, 2147, 2615, 2644, 2659, 2663, 2671, 2672, 2793, 2812, 2914, 2948, 3044, 3334, 3391, 3480, 3520, 3549, 3639, 3840, 3941, 3944, 4001, 4995, 4997, 5141, 5143, 5249, 5375, 5834, 5852, 5981 или 6678, и интерферирующая РНК имеет область, по меньшей мере, почти совершенной непрерывной комплементарности, по меньшей мере, из 19 нуклеотидов с гибридизирующейся частью мРНК, соответствующей SEQ ID NO:133;

где экспрессия мишеневой мРНК повышенного внутриглазного давления при этом ослабляется.

21. Способ по п.20, в котором интерферирующая РНК представляет собой miРНК.

22. Способ по п.20, в котором интерферирующая РНК представляет собой siРНК.

23. Композиция, содержащая интерферирующую РНК, имеющую длину 19-49 нуклеотидов и имеющую последовательность нуклеотидов, любую последовательность SEQ ID NO:33 - SEQ ID NO:82 и SEQ ID NO:220 - SEQ ID NO:717, или комплементарных им, и фармацевтически приемлемый носитель.

24. Композиция по п.23, в которой интерферирующая РНК представляет собой shРНК.

25. Композиция по п.23, в которой интерферирующая РНК представляет собой siРНК.