Опосредуемое rnai ингибирование мишеней глаза - RU2007132848A

Реферат

1. Способ снижения экспрессии мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, у субъекта, предусматривающий введение субъекту композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК длиной от 19 до 49 нуклеотидов и фармацевтически приемлемый носитель, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательностей с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательности SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:14-SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:83-SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:102-SEQ ID NO:122, SEQ ID NO:135-SEQ ID NO:219, SEQ ID NO:720 и SEQ ID NO:721.

2. Способ по п.1, согласно которому мРНК-мишень, связанная с внутриглазной гипертензией, кодирует карбоангидразу II и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:14-SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:83-SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:135-SEQ ID NO:155, SEQ ID NO:720 и SEQ ID NO:721.

3. Способ по п.1, согласно которому мРНК-мишень, связанная с внутриглазной гипертензией, кодирует карбоангидразу IV и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:23-SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:156-SEQ ID NO:177.

4. Способ по п.1, согласно которому мРНК-мишень, связанная с внутриглазной гипертензией, кодирует карбоангидразу XII и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:102-SEQ ID NO:122 и SEQ ID NO:178-SEQ ID NO:219.

5. Способ по п.1, в котором участок смежных нуклеотидов представляет собой участок по меньшей мере из 14 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 85% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 85% идентичностью последовательности с предконцевыми 14 нуклеотидами 3'-конца последовательности идентификатора последовательности.

6. Способ по п.1, в котором участок смежных нуклеотидов представляет собой участок по меньшей мере из 15, 16, 17 или 18 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 80% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 80% идентичностью последовательности с предконцевыми 15, 16, 17 или 18 нуклеотидами, соответственно, 3'-конца последовательности идентификатора последовательности.

7. Способ по п.1, в котором интерферирующая РНК представляет собой shRNA.

8. Способ по п.1, в котором интерферирующая РНК представляет собой miRNA.

9. Способ по п.1, в котором интерферирующая РНК представляет собой siRNA.

10. Применение для получения лекарственного средства для лечения у субъекта внутриглазной гипертензии композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемый носитель, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:14-SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:83-SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:102-SEQ ID NO:122, SEQ ID NO:135-SEQ ID NO:219, SEQ ID NO:720 и SEQ ID NO:721.

11. Применение по п.10, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:14-SEQ ID NO:22, SEQ ID NO:83-SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:135-SEQ ID NO:155, SEQ ID NO:720 и SEQ ID NO:721.

12. Применение по п.10, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:23-SEQ ID NO:32 и SEQ ID NO:156-SEQ ID NO:177.

13. Применение по п.10, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца любой из последовательностей SEQ ID NO:102-SEQ ID NO:122 и SEQ ID NO:178-SEQ ID NO:219.

14. Применение по п.10, где интерферирующая РНК представляет собой shRNA.

15. Применение по п.10, где композицию изготавливают для местного введения, введения в стекловидное тело, транссклерального, периокулярного, конъюнктивального введения, введения под тенонову капсулу, внутрикамерного, субретинального, субконъюнктивального, ретробульбарного или внутриканальцевого введения.

16. Применение по п.10, где композицию изготавливают для введения посредством экспрессии in vivo с помощью экспрессирующего вектора, способного экспрессировать интерферирующую РНК.

17. Применение по п.10, где интерферирующая РНК представляет собой miRNA.

18. Применение по п.10, где интерферирующая РНК представляет собой siRNA.

19. Способ снижения экспрессии первого варианта мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, без ослабления экспрессии второго варианта мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, у субъекта, предусматривающий введение субъекту композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемый носитель, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца первого варианта, где экспрессию мРНК первого варианта снижают без снижения экспрессии мРНК второго варианта и где мРНК-мишень первого варианта представляет собой SEQ ID NO:101 и мРНК-мишень второго варианта представляет собой SEQ ID NO:134.

20. Способ снижения экспрессии первого варианта мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, без ослабления экспрессии второго варианта мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, у субъекта, предусматривающий введение субъекту композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемый носитель, где интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере из 13 смежных нуклеотидов, обладающих по меньшей мере 90% комплементарностью последовательности или по меньшей мере 90% идентичностью последовательности с предконцевыми 13 нуклеотидами 3'-конца первого варианта, где экспрессию мРНК первого варианта снижают без снижения экспрессии мРНК второго варианта и где мРНК-мишень первого варианта представляет собой SEQ ID NO:134 и мРНК-мишень второго варианта представляет собой SEQ ID NO:101.

21. Способ снижения экспрессии мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, у субъекта, предусматривающий введение субъекту композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемый носитель, где интерферирующая РНК содержит смысловую нуклеотидную цепь, антисмысловую нуклеотидную цепь и участок по меньшей мере из практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов; где антисмысловая цепь гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO 2, SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134, и содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134, соответственно, где экспрессия мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, снижается.

22. Способ по п.21, в котором мРНК-мишень, связанная с внутриглазной гипертензией, кодирует карбоангидразу II и антисмысловая цепь гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, и содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1.

23. Способ по п.21, в котором мРНК-мишень, связанная с внутриглазной гипертензией, кодирует карбоангидразу IV, и антисмысловая цепь гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:2, и содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:2.

24. Способ по п.21, в котором мРНК-мишень, связанная с внутриглазной гипертензией, кодирует карбоангидразу XII и антисмысловая цепь гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134, и содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134, соответственно.

25. Способ по п.21, в котором антисмысловую цепь конструируют для нацеливания на мРНК, соответствующую SEQ ID NO:1, которая содержит нуклеотид 232, 527, 721, 728, 809, 810, 855, 856, 921, 1139, 506, 547, 548, 740, 911, 1009, 1140, 1149, 1150, 1151, 1188, 1194, 1195, 1223, 1239, 1456, 1457, 1458, 100, 158, 166, 247, 286, 318, 322, 328, 371, 412, 482, 504, 505, 541, 734, 772, 777, 814, 972, 998, 1232, 317 или 401.

26. Способ по п.21, в котором антисмысловую цепь конструируют для нацеливания на мРНК, соответствующую SEQ ID NO:2, которая содержит нуклеотид 213, 252, 258, 266, 399, 457, 463, 490, 595, 1064, 109, 112, 125, 126, 150, 261, 265, 280, 398, 453, 459, 462, 467, 492, 534, 785, 801, 825, 827, 876, 1003 или 1012.

27. Способ по п.21, в котором антисмысловую цепь конструируют для нацеливания на мРНК, соответствующую SEQ ID NO:101, которая содержит нуклеотид 191, 239, 274, 275, 341, 389, 412, 413, 423, 687, 689, 695, 710, 791, 792, 794, 983, 993, 994, 995, 691, 1039, 1568, 2326, 2332, 2425, 2433, 2844, 2845, 2880, 2884, 2891, 2954, 2955, 2956, 2957, 2964, 2965, 3006, 3007, 3012 или 3026.

28. Способ по п.21, в котором антисмысловую цепь конструируют для нацеливания на мРНК, соответствующую SEQ ID NO:134, которая содержит нуклеотид 687, 1535, 2293, 2299, 2392, 2400, 2811, 2812, 2847, 2851, 2858, 2921, 2922, 2923, 2924, 2931, 2932, 2973, 2974, 2979 или 2993.

29. Способ по п.21, дополнительно предусматривающий введение субъекту второй интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов и содержащей смысловую нуклеотидную цепь, антисмысловую нуклеотидную цепь и участок по меньшей мере практически полной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов; где антисмысловая цепь второй интерферирующей РНК гибридизуется при физиологических условиях со вторым участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:101 или SEQ EID NO:134, и антисмысловая цепь содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов со вторым подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134 соответственно.

30. Способ по п.21, в котором смысловая нуклеотидная цепь и антисмысловая нуклеотидная цепь соединены посредством нуклеотидной последовательности в виде петли.

31. Применение для изготовления лекарственного средства для лечения у субъекта внутриглазной гипертензии композиции, содержащей эффективное количество интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемый носитель, где интерферирующая РНК содержит смысловую нуклеотидную цепь, антисмысловую нуклеотидную цепь и участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов; где антисмысловая цепь гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134, и содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, SEQ ID NO:2, SEQ ID NO:101 или SEQ ID NO:134, соответственно.

32. Применение по п.31, где смысловая нуклеотидная цепь и антисмысловая нуклеотидная цепь соединены посредством нуклеотидной последовательности в виде петли.

33. Применение по п.31, где композицию изготавливают для местного введения, введения в стекловидное тело, транссклерального, периокулярного, конъюнктивального введения, введения под тенонову капсулу, внутрикамерного, субретинального, субконъюнктивального, ретробульбарного или внутриканальцевого введения.

34. Применение по п.31, где композицию изготавливают для введения посредством экспрессии in vivo с помощью экспрессирующего вектора, способного экспрессировать интерферирующую РНК.

35. Способ снижения экспрессии мРНК-мишени, связанной с внутриглазной гипертензией, у субъекта, предусматривающий введение субъекту композиции, содержащей эффективное количество одноцепочечной интерферирующей РНК, имеющей длину от 19 до 49 нуклеотидов, и фармацевтически приемлемый носитель, где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1, содержащей нуклеотид 232, 527, 721, 728, 809, 810, 855, 856, 921, 1139, 506, 547, 548, 740, 911, 1009, 1140, 1149, 1150, 1151, 1188, 1194, 1195, 1223, 1239, 1456, 1457, 1458, 100, 158, 166, 247, 286, 318, 322, 328, 371, 412, 482, 504, 505, 541, 734, 772, 777, 814, 972, 998, 1232, 317 или 401, и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:1; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:2, содержащей нуклеотид 213, 252, 258, 266, 399, 457, 463, 490, 595, 1064, 109, 112, 125, 126, 150, 261, 265, 280, 398, 453, 459, 462, 467, 492, 534, 785, 801, 825, 827, 876, 1003 или 1012, и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:2; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:101, которая содержит нуклеотид 191, 239, 274, 275, 341, 389, 412, 413, 423, 687, 689, 695, 710, 791, 792, 794, 983, 993, 994, 995, 691, 1039, 1568, 2326, 2332, 2425, 2433, 2844, 2845, 2880, 2884, 2891, 2954, 2955, 2956, 2957, 2964, 2965, 3006, 3007, 3012 или 3026, и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:101; или где одноцепочечная интерферирующая РНК гибридизуется при физиологических условиях с участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:134, которая содержит нуклеотид 687, 1535, 2293, 2299, 2392, 2400, 2811, 2812, 2847, 2851, 2858, 2921, 2922, 2923, 2924, 2931, 2932, 2973, 2974, 2979 или 2993, и интерферирующая РНК содержит участок по меньшей мере практически полной непрерывной комплементарности по меньшей мере из 19 нуклеотидов с подлежащим гибридизации участком мРНК, соответствующей SEQ ID NO:134; где экспрессия мРНК-мишени, связанная с внутриглазной гипертензией, таким образом, снижается.

36. Способ по п.35, в котором интерферирующая РНК представляет собой miRNA.

37. Способ по п.35, в котором интерферирующая РНК представляет собой siRNA.

38. Композиция, содержащая интерферирующую РНК, имеющую длину от 19 до 49 нуклеотидов и имеющую нуклеотидную последовательность любой из последовательностей SEQ ID NO:8, SEQ ID NO:14-SEQ ID NO:32, SEQ ID NO:83-SEQ ID NO:100, SEQ ID NO:102-SEQ ID NO:122, SEQ ID NO:135-SEQ ID NO:219, SEQ ID NO:720 и SEQ ID NO:721 или любой из комплементарных им последовательностей, и фармацевтически приемлемый носитель.

39. Композиция по п.38, в которой интерферирующая РНК представляет собой shRNA.

40. Композиция по п.38, в которой интерферирующая РНК представляет собой siRNA.

41. Композиция по п.38, в которой интерферирующая РНК представляет собой miRNA.