Вариантные последовательности оболочки флавивируса и пути их применения - RU2018142835A
Код документа: RU2018142835A
Формула
1. Выделенный рекомбинантный аналог петли слияния белка Е флавивируса, содержащий по меньшей мере один сайт гликозилирования для N-связанного гликана, который не присутствует в природной последовательности петли слияния белка Е флавивируса, где по меньшей мере один сайт гликозилирования представляет собой секвон N-связанного гликозилирования (Asn-X-Ser/Thr), и остаток Asn (N) секвона занимает любое из положений 98-110 (DRGWGNGCGLFGK) природной аминокислотной последовательности петли слияния белка Е флавивируса, где X представляет собой любой аминокислотный остаток за исключением пролина, и Ser/Thr обозначает сериновый или треониновый остаток.
2. Выделенный рекомбинантный аналог петли слияния белка Е флавивируса по п. 1, содержащий два сайта гликозилирования, которые не присутствуют в природной последовательности петли слияния белка Е флавивируса.
3. Выделенный рекомбинантный аналог белка Е флавивируса, содержащий аналог петли слияния белка Е флавивируса по п. 1 или 2.
4. Аналог по любому из предыдущих пунктов, содержащий по меньшей мере один дополнительный гликан, присоединенный к нему.
5. Аналог по п. 4, где по меньшей мере один дополнительный гликан представляет собой N-связанный гликан.
6. Аналог по любому из предыдущих пунктов, который представляет собой продукт экспрессии рекомбинантной последовательности ДНК или РНК.
7. Аналог по любому из предыдущих пунктов, содержащий такой секвон N-связанного гликозилирования (Asn-X-Ser/Thr), что остаток Asn (N) секвона занимает любое из положений 98-101 и/или 106-110.
8. Аналог по любому из предыдущих пунктов, где X представляет собой любой из следующих 13 аминокислотных остатков Gly, His, Asn, Gln, Tyr, Val, Ala, Met, Ile, Lys, Arg, Thr или Ser.
9. Аналог по любому из предыдущих пунктов, где белок Е флавивируса представляет собой белок Е вируса денге, и остаток Asn (N) секвона занимает положение 101, 108 или как 101, так и 108 аминокислотной последовательности петли слияния белка Е флавивируса, или белок Е флавивируса представляет собой белок Е вируса Зика, и остаток Asn (N) секвона занимает положение 100 аминокислотной последовательности петли слияния белка Е флавивируса.
10. Аналог по любому из предыдущих пунктов, где флавивирус представляет собой вирус денге, и аминокислотная последовательность 98-110 аналога петли слияния белка Е флавивируса выбрана из: DRGNGSGCGLNGS, DRGNGSGCGLFGK и DRGWGNGCGLNGS.
11. Аналог по любому из предыдущих пунктов, где флавивирус представляет собой вирус Зика, и аминокислотная последовательность 98-110 аналога петли слияния белка Е флавивируса представляет собой DRNHTNGCGLFGK.
12. Последовательность выделенной рекомбинантной ДНК или РНК, содержащая последовательность, кодирующую аналог петли слияния белка Е флавивируса по любому из пп. 1-11.
13. Последовательность выделенной рекомбинантной ДНК по п. 12, которая представляет собой вакцину на основе плазмидной или линейной ДНК.
14. Последовательность выделенной рекомбинантной ДНК по п. 12 или 13, кодирующая аналог белка Е флавивируса по любому из пп. 1-11 под контролем промотора млекопитающего.
15. Клетка-хозяин, содержащая последовательность ДНК или РНК по любому из пп. 12-14.
16. Эукариотическая клетка-хозяин, содержащая последовательность ДНК по п. 12 или вакцинный иммуноген на основе плазмидной или линейной ДНК по п. 13 или 14.
17. Клетка-хозяин по п. 15 или 16, способная экспрессировать аналог по любому из пп. 1-11.
18. Клетка-хозяин по любому из пп. 15-17, способная экспрессировать и осуществлять гликозилирование аналога по любому из пп. 1-11.
19. Способ получения аналога по любому из пп. 1-11, предусматривающий культивирование клетки-хозяина по любому из пп. 15-18 в условиях, подходящих для экспрессии аналога, и выделение аналога.
20. Композиция, содержащая аналог по любому из пп. 1-11 и разбавитель.
21. Иммуногенная (вакцинная) композиция, способная индуцировать иммунологический ответ у субъекта, инокулированного указанной композицией, при этом композиция содержит аналог по любому из пп. 1-11 вместе с фармацевтически приемлемым разбавителем, адъювантом и/или носителем.
22. Композиция по п. 20 или 21, содержащая один или несколько флавивирусных аналогов, выбранных из аналога DEN-1, аналога DEN-2, аналога DEN-3, аналога DEN-4 и аналога вируса Зика.
23. Композиция по любому из пп. 20-22, содержащая четыре аналога вируса денге, представляющих каждый из четырех серотипов вируса денге DEN-1, DEN-2, DEN-3 и DEN-4.
24. Композиция по любому из пп. 20-23, содержащая аналог вируса Зика.
25. Композиция по любому из пп. 20-24, содержащая четыре аналога вируса денге, представляющих каждый из четырех серотипов вируса денге DEN-1, DEN-2, DEN-3 и DEN-4, и аналог вируса Зика.
26. Связывающая молекула, способная специфически связываться с аналогом по любому из пп. 1-11.
27. Связывающая молекула по п. 26, где связывающая молекула представляет собой антитело или его фрагмент, доменное антитело, белковый каркас или аптамер, способные специфически связываться с аналогом по любому из пп. 1-11.
28. Аналог, композиция или связывающая молекула по любому из пп. 1-11, 20-25 или 26-27 для применения в качестве лекарственного препарата.
29. Аналог, композиция или связывающая молекула по любому из пп. 1-11, 20-25 или 26-27 для применения в качестве вакцины.
30. Аналог, композиция или связывающая молекула по любому из пп. 1-11, 20-25 или 26-27 для применения в профилактическом или терапевтическом лечении флавивирусной инфекции или для изготовления лекарственного препарата для профилактического или терапевтического лечения флавивирусной инфекции.
31. Способ защиты субъекта от инфекции, вызванной флавивирусом, предусматривающий введение указанному субъекту аналога, композиции или связывающей молекулы по любому из пп. 1-11, или 20-25, или 26-27.
32. Аналог, композиция или связывающая молекула по любому из пп. 1-11, 20-25 или 26-27 для применения в качестве диагностического средства.
33. Диагностический набор, содержащий аналог, композицию или связывающую молекулу по любому из пп. 1-11, 20-25 или 26-27, и реагент, способный выявлять иммунологический комплекс (антиген-антитело), который содержит указанные выделенный аналог или связывающую молекулу.
34. Набор для диагностического теста по п. 33, дополнительно содержащий один или несколько контрольных стандартов, и/или разбавитель образца, и/или буфер для промывания.
35. Набор для диагностического теста по п. 33 или 34, где указанные аналог и/или связывающая молекула иммобилизированы на твердой подложке.
36. Набор для диагностического теста по любому из пп. 33-35, где твердая подложка представляет собой лунку микропланшета.
37. Набор для диагностического теста по любому из пп. 33-36, где иммунологический комплекс, который содержит указанные выделенный аналог или связывающую молекулу, выявляется посредством ELISA.
38. Набор для диагностического теста по любому из пп. 33-37, где указанный иммунологический комплекс, который содержит указанные выделенный аналог или связывающую молекулу, выявляется с помощью иммунохроматографического анализа.
