Бета-лактамазы с улучшенными свойствами для лечения - RU2016140627A
Код документа: RU2016140627A
Формула
1. Бета-лактамаза, содержащая аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 90% идентичности последовательности с SEQ ID NO: 1 и одну или более из следующих мутаций согласно классификации Ambler:
гидрофобный остаток, кроме фенилаланина (F) в положении 33;
гидрофобный остаток, кроме глутамина (Q) в положении 135;
гидрофильный остаток, кроме глицина (G) в положении 156;
гидрофобный остаток, кроме аланина (А) в положении 232;
гидрофильный остаток, кроме аланина (А) в положении 237;
гидрофобный или гидрофильный остаток, кроме аланина (А) в положении 238;
гидрофильный остаток, кроме серина (S) в положении 240;
гидрофобный остаток, кроме треонина (Т) в положении 243;
гидрофобный остаток, кроме аргинина (R) в положении 244;
гидрофильный остаток, кроме серина (S) в положении 266, и
гидрофильный остаток, кроме аспартата (D) в положении 276,
с оговоркой, что остаток гидрофильной аминокислоты, кроме аспарагиновой кислоты (D) в положении, соответствующем положению 276, отсутствует в контексте одиночного мутанта.
2. Бета-лактамаза по п. 1, отличающаяся тем, что остаток гидрофильной аминокислоты представляет собой полярный и положительно заряженный гидрофильный остаток, выбранный из аргинина (R) и лизина (К), или ароматический полярный и положительно заряженный гидрофильный остаток, включающий гистидин (Н).
3. Бета-лактамаза по п. 1, отличающаяся тем, что остаток гидрофильной аминокислоты представляет собой полярный и нейтральный из заряженного гидрофильного остатка, выбранного из аспарагина (N), глутамина (Q), серина (S), треонина (Т), пролина (Р) и цистеина (С).
4. Бета-лактамаза по п. 1, отличающаяся тем, что остаток гидрофильной аминокислоты представляет собой полярный и отрицательно заряженный гидрофильный остаток, выбранный из аспартата (D) и глутамата (Е).
5. Бета-лактамаза по п. 1, отличающаяся тем, что гидрофобная аминокислота представляет собой гидрофобную алифатическую аминокислоту, выбранную из глицина (G), аланина (А), лейцина (L), изолейцина (I), метионина (М) и валина (V), или гидрофобную ароматическую аминокислоту, выбранную из фенилаланина (F), триптофана (W) и тирозина (Y).
6. Бета-лактамаза по п. 1, содержащая одну или более из следующих мутаций согласно классификации Ambler:
F33Y,
Q135M,
G156R,
A232G,
A237S,
A238G или А238Т,
S240P или S240D,
T243I,
R244T,
S266N и
D276N, D276R или D276K.
7. Бета-лактамаза по п. 1, содержащая следующие мутации согласно классификации Ambler:
гидрофобный остаток, кроме аланина (А) в положении 232;
гидрофильный остаток, кроме аланина (А) в положении 237;
гидрофобный остаток, кроме аланина (А) в положении 238, и
гидрофильный остаток, кроме серина (S) в положении 240.
8. Бета-лактамаза по п. 7, дополнительно содержащая гидрофобный остаток, кроме аспартата (D) в положении 276.
9. Бета-лактамаза по п. 7, отличающаяся тем, что остаток гидрофильной аминокислоты представляет собой полярный и положительно заряженный гидрофильный остаток, выбранный из аргинина (R) и лизина (К), или ароматический полярный и положительно заряженный гидрофильный остаток, включающий гистидин (Н).
10. Бета-лактамаза по п. 7, отличающаяся тем, что остаток гидрофильной аминокислоты представляет собой полярный и нейтральный заряженный гидрофильный остаток, выбранный из аспарагина (N), глутамина (Q), серина (S), треонина (Т), пролина (Р) и цистеина (С).
11. Бета-лактамаза по п. 7, отличающаяся тем, что остаток гидрофильной аминокислоты представляет собой полярный и отрицательно заряженный гидрофильный остаток, выбранный из аспартата (D) и глутамата (Е).
12. Бета-лактамаза по п. 7, отличающаяся тем, что гидрофобная аминокислота представляет собой гидрофобную алифатическую аминокислоту, выбранную из глицина (G), аланина (А), лейцина (L), изолейцина (I), метионина (М) и валина (V), или гидрофобную ароматическую аминокислоту, выбранную из фенилаланина (F), триптофана (W) и тирозина (Y).
13. Бета-лактамаза по п. 7, содержащая следующие мутации согласно классификации Ambler:
A232G,
A237S,
A238G и
S240D.
14. Бета-лактамаза по п. 13, дополнительно содержащая мутацию D276R или D276K согласно классификации Ambler.
15. Бета-лактамаза по п. 13, дополнительно содержащая мутацию Q135M согласно классификации Ambler.
16. Бета-лактамаза по п. 8, содержащая следующие мутации согласно классификации Ambler:
A232G,
A237S,
A238G,
S240D и
D276N.
17. Бета-лактамаза по п. 1, дополнительно содержащая мутацию А238Т согласно классификации Ambler.
18. Бета-лактамаза по п. 17, дополнительно содержащая мутацию G156R согласно классификации Ambler.
19. Бета-лактамаза по п. 17, дополнительно содержащая мутацию D276N согласно классификации Ambler.
20. Бета-лактамаза по п. 17, дополнительно содержащая мутацию F33Y согласно классификации Ambler.
21. Бета-лактамаза по п. 1, содержащая мутацию D276N и одну или более из следующих мутаций согласно классификации Ambler:
F33Y,
S240P,
T243I и
S266N.
22. Бета-лактамаза по п. 21, содержащая мутацию D276N и мутацию F33Y согласно классификации Ambler.
23. Бета-лактамаза по п. 22, дополнительно содержащая мутацию S240P согласно классификации Ambler.
24. Бета-лактамаза по п. 21, дополнительно содержащая мутацию D276N и мутацию T243I согласно классификации Ambler.
25. Бета-лактамаза по п. 24, дополнительно содержащая мутацию S266N согласно классификации Ambler.
