Режим введения и составы для аденовирусов типа в - RU2015152860A
Код документа: RU2015152860A
Формула
1. Способ определения устойчивости микобактерий туберкулеза к противотуберкулезным препаратам второго ряда, где указанный способ включает одновременную детекцию мутаций в ДНК микобактерий туберкулеза биологического образца, приводящих к устойчивости микроорганизмов к противотуберкулезным препаратам второго ряда в участках генов gyrA, gyrB, rrs и промоторной области eis посредством мультиплексной полимеразной цепной реакции в режиме реального времени с использованием праймеров для амплификации и зондов детекции, которые комплементарны указанным участкам генов gyrA, gyrB, rrs и промоторной области eis, где противотуберкулезные препараты второго ряда представляют собой фторхинолоны, аминогликозиды и капреомицин, где указанные участки гена gyrA выбраны из группы, включающей кодоны 89, 90, 91, 94 или их комбинации, указанные участки гена gyB выбраны из группы, включающей кодоны 538, 539, 540 или их комбинацию, указанные участки гена rrs выбраны из группы, включающей позиции 1401, 514, 517 или их комбинации, и указанные участки промоторной области eis выбраны из группы, включающей позиции -10, -12, -37 или их комбинации.
2. Способ по п. 1, где аминогликозиды представляют собой канамицин и амикацин, фторхинолоны представляют собой офлоксацин, моксифлоксацин, левофлоксацин.
3. Способ по п. 1, где все реакции детекции мутаций устойчивости к противотуберкулезным препаратам второго ряда осуществляются в одном температурном режиме амплификации.
4. Способ по п.1, отличающийся тем, что указанный биологический образец представляет собой непосредственно материал клинического образца или предварительно выращенную культуру микроорганизмов.
5. Способ по п.1, отличающийся тем, что способ проводят для более чем одного биологического образца.
6. Способ по любому из пп. 1-5, где указанные зонды детекции представляют собой олигонуклеотидные последовательности длиной 19-24 нуклеотида, применяемые для детекции мутаций в кодонах 89, 90, 91 и 94 гена gyrA и в кодонах 538, 539 и 540 гена gyrB для выявления мутаций устойчивости к фторхинолонам, олигонуклеотидные последовательности длиной 19-22 нуклеотида, применяемые для детекции мутаций в позициях -10, -12 и -37 промоторной области гена eis для выявления мутаций устойчивости к канамицину, амикацину и/или капреомицину, и олигонуклеотидные последовательности длиной 20-22 нуклеотида, применяемые для детекции мутаций в позиции 1401, 514 и 517 гена rrs для выявления мутаций устойчивости к канамицину, амикацину и /или капреомицину.
8. Способ по п. 6, где указанные зонды включают нуклеотидные последовательности, выбранные из представленных в SEQ ID NO:7-14, 17-19, 26- 31 или их комбинации.
9. Способ по любому из пп. 1-5, где указанные праймеры для амплификации включают нуклеотидные последовательности, выбранные из представленных в SEQ ID NO: 1-6, 15, 16, 20-25 или их комбинации.
10. Набор зондов детекции для осуществления способа по любому из пп. 1-9, в котором указанные зонды включают нуклеотидные последовательности, выбранные из группы, состоящей из представленных в SEQ ID NO: 7-14, 17-19, 26- 31 или их комбинации.
11. Набор праймеров амплификации для осуществления способа по любому из пп. 1-9, в котором указанные праймеры включают нуклеотидные последовательности, выбранные из группы, состоящей из представленных в SEQ ID NO: 1-6, 15, 16, 20-25 или их комбинации.
12. Применение способа по любому из пп. 1-9 для подтверждения клинического диагноза туберкулеза с широкой лекарственной устойчивостью.
