Композиции химерного поксвируса и их применение - RU2019106319A
Код документа: RU2019106319A
Формула
1. Химерный поксвирус, содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, имеющую идентичность последовательности, составляющую по меньшей мере 70% с SEQ ID NO:1 или SEQ ID NO:2, при этом указанная последовательность нуклеиновой кислоты включает:
(i) фрагменты нуклеиновой кислоты по меньшей мере из двух штаммов поксвируса, выбранных из группы, состоящей из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины, штамма AS вируса осповакцины, штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров;
(ii) одну или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты; или
(iii) последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую определяемый фрагмент.
2. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты включает:
(i) фрагменты нуклеиновой кислоты по меньшей мере из двух штаммов поксвируса, выбранных из группы, состоящей из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины, штамма AS вируса осповакцины, штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров; и
(ii) одну или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты.
3. Химерный поксвирус по п.1 или 2, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты образуют часть второстепенного гена указанного химерного поксвируса.
4. Химерный поксвирус по п.3, в котором указанный второстепенный ген представляет собой ген тимидинкиназы.
5. Химерный поксвирус по п.3, в котором указанный второстепенный ген представляет собой ген F14.5L.
6. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты независимо кодируют ингибитор PD-L1 или натрий-йодидный симпортер.
7. Химерный поксвирус по п.6, в котором указанный ингибитор PD-L1 представляет собой анти-PD-L1 scFv.
8. Химерный поксвирус по п.1, в котором части указанного второстепенного гена удалены.
9. Химерный поксвирус по п.1, в котором каждая из указанных одной или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты функционально связанна с промотором.
10. Химерный поксвирус по п.9, в котором указанный промотор представляет собой ранний промотор вируса осповакцины.
11. Химерный поксвирус по п. 9 или 10, в котором указанный промотор представляет собой синтетический ранний промотор.
12. Химерный поксвирус по п.9, в котором указанный промотор представляет собой поздний промотор вируса осповакцины.
13. Химерный поксвирус по п. 9 или 12, в котором указанный промотор представляет собой промотор Н5 или промотор 11К.
14. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты функционально связаны с основным геном указанного химерного поксвируса.
15. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты функционально связаны с геном ДНК-полимеразы указанного химерного поксвируса.
16. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты функционально связаны с 3'-концом гена ДНК-полимеразы указанного химерного поксвируса.
17. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты функционально связаны с геном урацил-ДНК-гликозилазы.
18. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты функционально связаны 3'-концом гена урацил-ДНК-гликозилазы.
19. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты независимо кодируют миРНК-связывающую последовательность.
20. Химерный поксвирус по п.19, в котором указанная миРНК-связывающая последовательность представляет собой miR100-связывающую последовательность или let7c-связывающую последовательность.
21. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная одна или более противораковых последовательностей нуклеиновой кислоты представляют собой первую противораковую последовательность нуклеиновой кислоты и вторую противораковую последовательность нуклеиновой кислоты.
22. Химерный поксвирус по п.21, в котором указанная первая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует натрий-йодидный симпортер, а указанная вторая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует миРНК-связывающую последовательность.
23. Химерный поксвирус по п.22, в котором указанная первая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты образует часть гена тимидинкиназы, а указанная вторая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты функционально связана с геном урацил-ДНК-гликозилазы.
24. Химерный поксвирус по п.22, в котором указанная первая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты образует часть гена тимидинкиназы, а указанная вторая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты функционально связана с геном ДНК-полимеразы.
25. Химерный поксвирус по п.21, в котором указанная первая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует натрий-йодидный симпортер, а указанная вторая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты кодирует ингибитор PD-L1.
26. Химерный поксвирус по п.25, в котором указанная первая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты образует часть гена тимидинкиназы, а указанная вторая противораковая последовательность нуклеиновой кислоты образует часть гена F14.5L.
27. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты включает:
(i) фрагменты нуклеиновой кислоты по меньшей мере из двух штаммов поксвируса, выбранных из группы, состоящей из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины, штамма AS вируса осповакцины, штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров; и
(ii) указанную последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую определяемый фрагмент.
28. Химерный поксвирус по п.27, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая определяемый фрагмент, кодирует флуоресцентный фрагмент.
29. Химерный поксвирус по п.27 или 28, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая определяемый фрагмент, образует часть второстепенного гена указанного химерного поксвируса.
30. Химерный поксвирус по п.29, в котором указанный второстепенный ген представляет собой ген тимидинкиназы.
31. Химерный поксвирус по п.29 или 30, в котором части указанного второстепенного гена удалены.
32. Химерный поксвирус по п.27, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующая определяемый фрагмент, функционально связана с промотором.
33. Химерный поксвирус по п.32, в котором указанный промотор представляет собой ранний промотор вируса осповакцины.
34. Химерный поксвирус по п.33, в котором указанный промотор представляет собой синтетический ранний промотор.
35. Химерный поксвирус по п.32, в котором указанный промотор представляет собой поздний промотор вируса осповакцины.
36. Химерный поксвирус по п.35, в котором указанный промотор представляет собой промотор Н5 или промотор 11К.
37. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты имеет идентичность последовательностей, составляющую по меньшей мере 80%.
38. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты имеет идентичность последовательностей, составляющую по меньшей мере 85%.
39. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты имеет идентичность последовательностей, составляющую по меньшей мере 90%.
40. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты имеет идентичность последовательностей, составляющую по меньшей мере 95%.
41. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты имеет идентичность последовательностей, составляющую по меньшей мере 98%.
42. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанные фрагменты нуклеиновой кислоты происходят из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины и штамма AS вируса осповакцины.
43. Химерный поксвирус по п.1, в котором указанные фрагменты нуклеиновой кислоты происходят из штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров.
44. Химерный поксвирус по п.1, полученный согласно способу, включающему:
(i) инфицирование клетки по меньшей мере двумя штаммами поксвируса, выбранными из группы, состоящей из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины, штамма AS вируса осповакцины, штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров; и
(ii) обеспечение возможности репликации указанных по меньшей мере двух штаммов поксвируса, получая таким образом химерный поксвирус.
45. Химерный поксвирус по п.44, при этом указанную клетку инфицируют штаммом Brighton вируса коровьей оспы, штаммом Herman поксвируса енотов, штаммом Utrecht поксвируса кроликов, штаммом WR вируса осповакцины, штаммом IHD вируса осповакцины, штаммом Elstree вируса осповакцины, штаммом CL вируса осповакцины, штаммом Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины и штаммом AS вируса осповакцины.
46. Химерный поксвирус по п.44, при этом указанную клетку инфицируют штаммом NZ2 орф-вируса и штаммом TJS псевдопоксвируса коров.
47. Химерный поксвирус по п.1, при этом указанный химерный поксвирус представляет собой онколитический вирус.
48. Химерный поксвирус по п.1, при этом указанный поксвирус включает миРНК-связывающую последовательность.
49. Химерный поксвирус по п.48, в котором указанная миРНК-связывающая последовательность образует часть гена ДНК-полимеразы указанного химерного поксвируса.
50. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая химерный поксвирус по п.1.
51. Фармацевтическая композиция, содержащая терапевтически эффективное количество химерного поксвируса по п.1.
52. Способ лечения рака у пациента, включающий введение указанному пациенту терапевтически эффективного количество химерного поксвируса по п.1, с осуществлением, таким образом, лечения рака у указанного пациента.
53. Способ по п.52, в котором указанный рак представляет собой рак молочной железы, рак толстой кишки, рак почки, лейкоз, рак легкого, меланому, рак яичников, рак предстательной железы, рак поджелудочной железы, рак головного мозга, рак печени, рак желудка или саркому.
54. Способ по п.52 или 53, в котором указанный рак представляет собой трижды негативный рак молочной железы.
55. Способ по п.52, в котором указанное введение включает введение первого химерного поксвируса и второго химерного поксвируса.
56. Способ по п.55, в котором указанный первый химерный поксвирус содержит последовательность нуклеиновой кислоты, имеющую идентичность последовательности, составляющую по меньшей мере 70% с SEQ ID NO:1, и в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты включает фрагменты нуклеиновой кислоты из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины и штамма AS вируса осповакцины.
57. Способ по п.55 или 56, в котором указанный второй химерный поксвирус содержит последовательность нуклеиновой кислоты, имеющую идентичность последовательности, составляющую по меньшей мере 70% с SEQ ID NO:2, и в котором указанная последовательность нуклеиновой кислоты включает фрагменты нуклеиновой кислоты из штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров.
58. Способ по п.55, в котором указанный первый химерный поксвирус и указанный второй химерный поксвирус вводят в комбинированном синергическом количестве.
59. Способ по п.55, в котором указанный первый химерный поксвирус и указанный второй химерный поксвирус вводят одновременно.
60. Способ по п.55, в котором указанный первый химерный поксвирус и указанный второй химерный поксвирус вводят последовательно.
61. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве по меньшей мере 103 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
62. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве по меньшей мере 103 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
63. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве по меньшей мере 104 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
64. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве приблизительно 4×104 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
65. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве приблизительно 5×104 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
66. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве в количестве по меньшей мере 106 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
67. Способ по п.52, в котором указанный поксвирус вводят в количестве приблизительно 108 бляшкообразующих единиц (БОЕ)/кг.
68. Способ получения химерного поксвируса, включающий:
(i) инфицирование клетки по меньшей мере двумя штаммами поксвируса, выбранными из группы, состоящей из штамма Brighton вируса коровьей оспы, штамма Herman поксвируса енотов, штамма Utrecht поксвируса кроликов, штамма WR вируса осповакцины, штамма IHD вируса осповакцины, штамма Elstree вируса осповакцины, штамма CL вируса осповакцины, штамма Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины, штамма AS вируса осповакцины, штамма NZ2 орф-вируса и штамма TJS псевдопоксвируса коров; и
(ii) обеспечение возможности репликации указанных по меньшей мере двух штаммов поксвируса, тем самым получая указанный химерный поксвирус.
69. Способ по п.68, в котором каждый из указанных по меньшей мере двух вирусных штаммов поксвируса присутствует при множественности заражения, составляющей менее чем приблизительно 1.
70. Способ по п.68 или 69, в котором каждый из указанных по меньшей мере двух вирусных штаммов поксвируса присутствует при множественности заражения, составляющей менее чем приблизительно 0,1.
71. Способ по п.68, в котором каждый из указанных по меньшей мере двух штаммов поксвируса присутствует при множественности заражения, составляющей приблизительно 0,01.
72. Способ по п.68, в котором указанную клетку инфицируют штаммом Brighton вируса коровьей оспы, штаммом Herman поксвируса енотов, штаммом Utrecht поксвируса кроликов, штаммом WR вируса осповакцины, штаммом IHD вируса осповакцины, штаммом Elstree вируса осповакцины, штаммом CL вируса осповакцины, штаммом Lederle-Chorioallantoic вируса осповакцины и штаммом AS вируса осповакцины.
73. Способ по п.68, в котором указанную клетку инфицируют штаммом NZ2 орф-вируса и штаммом TJS псевдопоксвируса коров.
74. Способ по п.68, в котором указанный химерный поксвирус представляет собой онколитический вирус.
75. Способ по п.68, в котором указанный поксвирус включает миРНК-связывающую последовательность.
76. Способ ингибирования клеточной пролиферации клетки, включающий приведение в контакт клетки с химерным поксвирусом по п.1.
77. Способ по п.76, в котором указанная клетка представляет собой раковую клетку.
78. Способ по п.77, в котором указанная раковая клетка представляет собой клетку рака молочной железы, клетку рака толстой кишки, клетку рака почки, лейкозную клетку, клетку рака легкого, клетку меланомы, клетку рака яичников, клетку рака предстательной железы, клетку рака поджелудочной железы, клетку рака головного мозга, клетку рака печени, клетку рака желудка или клетку саркомы.
79. Способ по п.77 или 78, в котором указанная раковая клетка представляет собой клетку трижды негативного рака молочной железы.
