Композиции, способы и применения переноса генов для лечения нейродегенеративных заболеваний - RU2019117062A
Код документа: RU2019117062A
Формула
1. Способ лечения млекопитающего, имеющего лизосомную болезнь накопления (LSD), причем упомянутый способ содержит этапы:
введения в головной мозг или спинной мозг млекопитающего множества частиц AAV,
причем упомянутые частицы AAV содержат
(i) капсидный белок AAV;
(ii) нуклеиновую кислоту, вставленную между парой инвертированных концевых повторов (ITR) AAV, причем упомянутая нуклеиновая кислота кодирует полипептид, обладающий лизосомной гидролазной активностью;
(iii) элемент контроля экспрессии, управляющий экспрессией упомянутой нуклеиновой кислоты; и причем
упомянутые частицы AAV способны трансдуцировать клетки упомянутого млекопитающего и обеспечивать экспрессию упомянутого полипептида.
2. Способ по п. 1, в котором упомянутый полипептид обладает активностью трипептидилпептидазы-1 (TPP1).
3. Способ по п. 1, в котором упомянутый полипептид содержит TPP1, ее профермент или ее ферментативно активный вариант.
4. Способ по п. 1, в котором один или несколько ITR AAV содержат один или несколько ITR AAV2.
5. Способ по п. 1, в котором нуклеиновая кислота кодирует TPP1 млекопитающего.
6. Способ по п. 1, в котором нуклеиновая кислота кодирует человеческую TPP1.
7. Способ по п. 1, в котором нуклеиновая кислота кодирует белок с активностью TPP1 и имеющий идентичность 80% или больше человеческой TPP1 приведенной как SEQ ID NO:1.
8. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит энхансер CMV.
9. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит промотор бета-актина.
10. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит промотор бета-актина кур.
11. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит энхансер CMV и промотор бета-актина кур.
12. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит последовательность, имеющую идентичность 80% или больше с энхансером CMV, приведенным в SEQ ID NO:3, и/или последовательность, имеющую идентичность 80% или больше с промотором бета-актина кур, приведенным в SEQ ID NO:3.
13. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит последовательность, имеющую идентичность 80% или больше с SEQ ID NO:3.
14. Способ по любому из пп. 1-7, в котором элемент контроля экспрессии содержит SEQ ID NO:3.
15. Способ по любому из пп. 1-14, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1, VP2 и/или VP3, имеющую идентичность 70% или больше с последовательностями VP1, VP2 и/или VP3 AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, Rh10, Rh74 или AAV-2i8.
16. Способ по любому из пп. 1-14, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1, имеющую идентичность 80% или больше с AAV2, причем в данной капсидной последовательности тирозин в положениях 444, 500 и/или 730 замещен на аминокислоту, отличную от тирозина.
17. Способ по любому из пп. 1-14, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1, имеющую идентичность 90% или больше с AAV2, причем в данной капсидной последовательности тирозин в положениях 444, 500 и/или 730 замещен на фенилаланин.
18. Способ по любому из пп. 1-14, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1 AAV2, в которой тирозин в положениях 444, 500 и/или 730 замещен на фенилаланин.
19. Способ по любому из пп. 1-14, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1, VP2 или VP3, выбранную из любого из серотипов AAV AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, Rh10, Rh74 или AAV-2i8.
20. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в головной мозг упомянутого млекопитающего.
21. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в большую цистерну, внутрижелудочковое пространство, желудочек головного мозга, субарахноидальное пространство, интратекальное пространство и/или эпендиму упомянутого млекопитающего.
22. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в спинномозговую жидкость (СМЖ) упомянутого млекопитающего.
23. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в желудочковую систему.
24. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в ростральный боковой желудочек.
25. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в каудальный боковой желудочек.
26. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в правый и/или левый боковой желудочек.
27. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в правый и/или левый ростральный боковой желудочек.
28. Способ по любому из пп. 1-19, содержащий введение множества частиц AAV в правый и/или левый каудальный боковой желудочек.
29. Способ по любому из пп. 1-28, в котором упомянутые частицы AAV контактируют с эпендимальными клетками упомянутого млекопитающего.
30. Способ по любому из пп. 1-29, дополнительно содержащий введение упомянутому млекопитающему первого иммуносупрессивного средства.
31. Способ по п. 30, дополнительно содержащий введение упомянутому млекопитающему второго иммуносупрессивного средства.
32. Способ по п. 30 или 31, в котором по меньшей мере одно из упомянутого первого иммуносупрессивного средства и упомянутого второго иммуносупрессивного средства вводят упомянутому млекопитающему перед введением упомянутых частиц AAV.
33. Способ по п. 30 или 31, в котором упомянутое первое иммуносупрессивное средство вводят перед введением упомянутых частиц AAV, а упомянутое второе иммуносупрессивное средство вводят перед, одновременно или после введения упомянутых частиц AAV.
34. Способ по любому из пп. 30-33, в котором упомянутое первое иммуносупрессивное средство содержит циклоспорин.
35. Способ по п. 34, в котором упомянутый циклоспорин вводят в дозировке приблизительно 5-20 мг/кг два раза в день в течение по меньшей мере 3 месяцев.
36. Способ по п. 34, в котором вводимую дозу упомянутого циклоспорина снижают через 1-2 месяца после введения упомянутых частиц AAV.
37. Способ по любому из пп. 30-36, в котором упомянутое второе иммуносупрессивное средство содержит микофенолат или его производное.
38. Способ по п. 37, в котором упомянутое производное микофенолата представляет собой микофенолата мофетил (MMF).
39. Способ по любому из пп. 30-38, в котором (i) упомянутое первое иммуносупрессивное средство вводят по меньшей мере приблизительно за две недели до введения упомянутых частиц AAV, и (ii) упомянутое второе иммуносупрессивное средство вводят приблизительно за две недели до или в течение 60 дней после введения упомянутых частиц AAV.
40. Способ по любому из пп. 37-39, в котором упомянутые микофенолат или его производное вводят в дозировке приблизительно 5-20 мг/кг в день.
41. Способ по любому из пп. 1-40, в котором упомянутые частицы AAV вводят в дозе от приблизительно 1×108 до приблизительно 1×1015 в.г. на кг.
42. Способ по любому из пп. 1-41, в котором клетки, содержащие спинномозговую жидкость (СМЖ) упомянутого млекопитающего, трансдуцируют упомянутыми частицами AAV.
43. Способ по любому из пп. 1-42, в котором упомянутые частицы AAV трансдуцируют эпендимальные клетки упомянутого млекопитающего.
44. Способ по любому из пп. 1-43, в котором клетки, трансдуцированные упомянутыми частицами AAV, экспрессируют и секретируют упомянутый полипептид в СМЖ упомянутого млекопитающего.
45. Способ по любому из пп. 2-44, в котором активность трипептидилпептидазы-1 (TPP1) в спинномозговой жидкости упомянутого млекопитающего детектируют на уровне по меньшей мере 5 пмоль TPP1 на мг белка, необязательно в течение более 350 дней.
46. Способ по любому из пп. 1-45, в котором упомянутое млекопитающее представляет собой не являющееся грызуном млекопитающее.
47. Способ по п. 46, в котором упомянутое не являющееся грызуном млекопитающее является приматом.
48. Способ по п. 46, в котором упомянутое не являющееся грызуном млекопитающее является человеком.
49. Способ по п. 48, в котором упомянутый человек является ребенком.
50. Способ по п. 49, в котором возраст упомянутого ребенка составляет от приблизительно 1 до приблизительно 4 лет.
51. Способ по любому из пп. 1-50, в котором упомянутая LSD представляет собой детский или позднедетский восковидные липофусцинозы (LINCL), нейронопатическую болезнь Гоше, юношескую болезнь Баттена, болезнь Фабри, MLD, болезнь Санфилиппо A, болезнь Хантера, болезнь Краббе, болезнь Моркио, болезнь Помпе, болезнь Ниманна-Пика C, болезнь Тея-Сакса, болезнь Гурлер (MPS-I H), болезнь Санфилиппо B, болезнь Марото-Лами, болезнь Ниманна-Пика A, цистиноз, болезнь Гурлер-Шейе (MPS-I H/S), синдром Слая (MPS VII), болезнь Шейе (MPS-I S), детскую болезнь Баттена, GM1-ганглиозидоз, муколипидоз II/III типа или болезнь Сандхоффа.
52. Способ по любому из пп. 1-51, в котором введение упомянутых частиц AAV содержит инъекцию упомянутых частиц AAV.
53. Способ по любому из пп. 1-52, в котором начало симптома, связанного с упомянутой LSD, задерживают на 5-10, 10-25, 25-50 или 50-100 дней.
54. Способ по п. 53, в котором упомянутый симптом выбирают из группы, состоящей из проприоцептивного ответа, нистагма, угрозы, зрачкового светового рефлекса, мозжечковой атаксии и интенционного тремора.
55. Способ по любому из пп. 1-54, в котором измеримую утрату когнитивной функции, связанной с упомянутой LSD, задерживают на 5-10, 10-25, 25-50 или 50-100 дней.
56. Способ по любому из пп. 1-55, в котором продолжительность жизни млекопитающего, имеющего упомянутую LSD, увеличивается на 5-10, 10-25, 25-50 или 50-100 дней.
57. Способ по любому из пп. 1-56, в котором нейтрализующие антитела не детектируют в СМЖ упомянутого млекопитающего в течение по меньшей мере 30, 60, 90, 120 или более дней после введения упомянутых частиц AAV.
58. Способ по любому из пп. 1-57, в котором нейтрализующий антитела не детектируют в СМЖ упомянутого млекопитающего в течение по меньшей мере 250 дней после упомянутого введения упомянутых частиц AAV.
59. Способ по любому из пп. 1-58, в котором упомянутый полипептид экспрессируется в селезенке или сердце упомянутого млекопитающего.
60. Способ по любому из пп. 1-59, в котором упомянутый полипептид экспрессируется в стриатуме, таламусе, медулле, мозжечке, большом мозге, затылочной коре или префронтальной коре упомянутого млекопитающего.
61. Способ по любому из пп. 1-60, в котором упомянутый элемент контроля экспрессии обеспечивает большую экспрессию упомянутой нуклеиновой кислоты или полипептида, чем промотор CMV в одном или нескольких из стриатума, таламуса, медуллы, мозжечка, большого мозга, затылочной коры или префронтальной коры упомянутого млекопитающего.
62. Способ по любому из пп. 1-61, в котором упомянутый элемент контроля экспрессии обеспечивает приблизительно в 1-4 раза большую экспрессию упомянутой нуклеиновой кислоты или полипептида, чем промотор CMV в одном или нескольких из стриатума, таламуса, медуллы, мозжечка, большого мозга, затылочной коры или префронтальной коры упомянутого млекопитающего.
63. Способ по любому из пп. 1-62, в котором упомянутый элемент контроля экспрессии обеспечивает приблизительно в 1-2 раза большую экспрессию упомянутой нуклеиновой кислоты или полипептида, чем промотор CMV в одном или нескольких из стриатума, таламуса, медуллы, мозжечка, большого мозга, затылочной коры или префронтальной коры упомянутого млекопитающего.
64. Способ по любому из пп. 1-63, в котором упомянутые частицы AAV выбирают из группы, состоящей из частиц AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, AAV-rh74, AAV-rh10 и AAV-2i8.
65. Способ по любому из пп. 1-64, в котором один или несколько из упомянутых ITR выбирают из группы, состоящей из ITR AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, AAV12, AAV-rh74, AAV-rh10 и AAV-2i8.
66. Способ по любому из пп. 1-65, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1, VP2 и/или VP3, имеющую идентичность 90% или больше с последовательностями VP1, VP2 и/или VP3 AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, Rh10, Rh74 или AAV-2i8.
67. Способ по любому из пп. 1-66, в котором капсидная последовательность содержит капсидную последовательность VP1, VP2 или VP3, выбранную из любого из серотипов AAV AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10, AAV11, Rh10, Rh74 или AAV-2i8.
