Способы и композиции, включающие очищенные рекомбинантные полипептиды - RU2016108828A
Код документа: RU2016108828A
Формула
1. Композиция, включающая анти-IL13 моноклональное антитело, очищенное из клеток-хозяев яичника китайского хомячка, где композиция включает анти-IL13 антитело и остаточное количество PLBL2 хомячка, где количество PLBL2 хомячка составляет менее 20 нг/мг, или менее 15 нг/мг, или менее 10 нг/мг, или менее 8 нг/мг, или менее 5 нг/мг, или менее 3 нг/мг, или менее 2 нг/мг, или менее 1 нг/мг, или менее 0,5 нг/мг.
2. Композиция по п. 1, где анти-IL13 антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 1, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 2, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 3, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 4, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 5, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 6.
3. Композиция по п. 2, где анти-IL13 антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 7.
4. Композиция по п. 2, где анти-IL13 антитело включает вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 9.
5. Композиция по п. 3, где анти-IL13 антитело включает тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 10.
6. Композиция по п. 4, где анти-IL13 антитело включает легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 14.
7. Композиция по п. 2, где анти-IL13 антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 7, и вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 9.
8. Композиция по п. 7, где анти-IL13 антитело включает тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 10, и легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 14.
9. Композиция по п. 1, где количество PLBL2 хомячка было определено с использованием иммунологического анализа или масс-спектрометрического анализа.
10. Композиция по п. 9, где иммунологический анализ представляет собой ELISA на все белки клеток яичника китайского хомячка или ELISA на PLBL2 хомячка.
11. Композиция по п. 9, где масс-спектрометрический анализ представляет собой LC-MS/MS.
12. Очищенный препарат анти-IL13 моноклонального антитела, выделенного из клеток-хозяев яичника китайского хомячка, где препарат очищен с помощью процесса, включающего стадию хроматографии гидрофобных взаимодействий (HIC), в результате которой получают очищенный препарат, где очищенный препарат включает анти-IL13 антитело и остаточное количество PLBL2 хомячка, где количество PLBL2 хомячка составляет менее 20 нг/мг, или менее 15 нг/мг, или менее 10 нг/мг, или менее 8 нг/мг, или менее 5 нг/мг, или менее 3 нг/мг, или менее 2 нг/мг, или менее 1 нг/мг, или менее 0,5 нг/мг.
13. Препарат анти-IL13 антитела по п. 12, где стадия HIC включает применение смолы PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub).
14. Препарат анти-IL13 антитела по п. 13, где HIC включает применение, колонки со смолой PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub) в режиме сбора проскока.
15. Препарат анти-IL13 антитела по п. 14, где HIC включает применение уравновешивающего буфера и промывочного буфера, где уравновешивающий буфер и промывочный буфер включают 50 мМ ацетат натрия, рН 5,0.
16. Препарат анти-IL13 антитела по п. 15, где проскок контролируют по поглощению при 280 нанометрах, и проскок собирают между 0,5 OD и 1,5 OD.
17. Препарат анти-IL13 антитела по п. 15, где проскок собирают в объеме максимум 8 объемов колонки.
18. Препарат анти-IL13 антитела по п. 12, где процесс дополнительно включает стадию аффинной хроматографии.
19. Препарат анти-IL13 антитела по п. 18, где аффинная хроматография представляет собой хроматографию на белке А.
20. Препарат анти-IL13 антитела по п. 12, где процесс дополнительно включает стадию ионообменной хроматографии.
21. Препарат анти-IL13 антитела по п. 20, где ионообменная хроматография представляет собой анионообменную хроматографию.
22. Очищенный препарат анти-IL13 моноклонального антитела, выделенный из клеток яичника китайского хомячка, где препарат антитела очищают с помощью процесса,
включающего первую стадию аффинной хроматографии на белке А, вторую стадию анионообменной хроматографии и третью стадию хроматографии гидрофобных взаимодействий (HIC), в результате которого получают очищенный препарат, где очищенный препарат включает анти-IL13 антитело и остаточное количество PLBL2 хомячка, где количество PLBL2 хомячка составляет менее 20 нг/мг, или менее 15 нг/мг, или менее 10 нг/мг, или менее 8 нг/мг, или менее 5 нг/мг, или менее 3 нг/мг, или менее 2 нг/мг, или менее 1 нг/мг, или менее 0,5 нг/мг.
23. Препарат анти-IL13 антитела по п. 22, где стадия аффинной хроматографии включает применение смолы MABSELECT SURE™, стадия анионообменной хроматографии включает применение смолы Q SEPHAROSE™ Fast Flow, и стадия HIC включает применение смолы PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (high sub).
24. Препарат анти-IL13 антитела по п. 23, где:
стадия аффинной хроматографии включает применение колонки со смолой MABSELECT SURE™ в режиме связывания и элюирования;
стадия анионообменной хроматографии включает применение колонки со смолой Q SEPHAROSE™ Fast Flow в режиме связывания и элюирования; и
стадия HIC включает применение колонки со смолой PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub) в режиме сбора проскока.
25. Препарат анти-IL13 антитела по п. 12 или 22, где анти-IL13 антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 1, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 2, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 3, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 4. CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 5, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 6.
26. Препарат анти-IL13 антитела по п. 25, где анти-IL13 антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 7.
27. Препарат анти-IL13 антитела по п. 25, где анти-IL13 антитело включает вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 9.
28. Препарат анти-IL13 антитела по п. 26, где анти-IL13 антитело включает тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 10.
29. Препарат анти-IL13 антитела по п. 27, где анти-IL13 антитело включает легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 14.
30. Препарат анти-IL13 антитела по п. 25, где анти-IL13 антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 7, и вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 9.
31. Препарат анти-IL13 антитела по п. 30, где анти-IL13 антитело включает тяжелую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 10, и легкую цепь, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 14.
32. Препарат анти-IL13 антитела по п. 12 или 22, где количество PLBL2 хомячка было определено с использованием иммунологического анализа или масс-спектрометрического анализа.
33. Препарат анти-IL13 антитела по п. 32, где иммунологический анализ представляет собой ELISA на все белки клеток яичника китайского хомячка или ELISA на PLBL2 хомячка.
34. Препарат анти-IL13 антитела по п. 32, где масс-спектрометрический анализ представляет собой LC-MS/MS.
35. Способ очистки рекомбинантного полипептида, получаемого в клетках-хозяевах яичника китайского хомячка, где способ обеспечивает получение очищенного препарата, включающего рекомбинантный полипептид и остаточное количество PLBL2 хомячка.
36. Способ по п. 35, где количество PLBL2 хомячка составляет менее 20 нг/мг, или менее 15 нг/мг, или менее 10 нг/мг, или менее 8 нг/мг, или менее 5 нг/мг, или менее 3 нг/мг, или менее 2 нг/мг, или менее 1 нг/мг, или менее 0,5 нг/мг.
37. Способ по п. 36, включающий стадию хроматографии гидрофобных взаимодействий (HIC).
38. Способ по п. 37, где стадия HIC включает применение смолы PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub).
39. Способ по п. 38, где стадия HIC включает применение колонки со смолой PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub) в режиме сбора проскока.
40. Способ по п. 37, где рекомбинантный полипептид выбран из фактора роста, цитокина, антитела, фрагмента антитела и иммуноадгезина.
41. Способ по п. 40, где рекомбинантный полипептид представляет собой антитело.
42. Способ по п. 41, где антитело представляет собой гуманизированное моноклональное антитело.
43. Способ по п. 42, где антитело представляет собой IgG1, или IgG2, или IgG3, или IgG4.
44. Способ по п. 43, где антитело представляет собой IgG4.
45. Способ по п. 41, где антитело представляет собой анти-IL13.
46. Способ по п. 44, где антитело представляет собой лебрикизумаб.
47. Способ по п. 45, где анти-IL13 антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 1, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 2, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 3, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 4, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 5, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 6.
48. Способ по любому из пп. 45, 46 или 47, где стадия HIC включает применение колонки со смолой в режиме сбора проскока и включает применение уравновешивающего буфера и промывочного буфера, где уравновешивающий буфер и промывочный буфер включают 50 мМ ацетат натрия, рН 5,0.
49. Способ по п. 48, где проскок контролируют по поглощению при 280 нанометрах, и проскок собирают между 0,5 OD и 1,5 OD.
50. Способ по п. 48, где проскок собирают в объеме максимум 8 объемов колонки.
51. Способ по п. 48, дополнительно включающий стадию аффинной хроматографии.
52. Способ по п. 51, где аффинная хроматография представляет собой хроматографию на белке А.
53. Способ по п. 48, дополнительно включающий стадию ионообменной хроматографии.
54. Способ по п. 53, где ионообменная хроматография представляет собой анионообменную хроматографию.
55. Способ по п. 48, включающий первую стадию аффинной хроматографии на белке А и вторую стадию анионообменной хроматографии перед стадией хроматографии гидрофобных взаимодействий (HIC).
56. Способ по п. 55, где стадия аффинной хроматографии включает применение смолы MABSELECT SURE™, стадия анионообменной хроматографии включает применение смолы Q SEPHAROSE™ Fast Flow, и стадия HIC включает применение смолы PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (high sub).
57. Способ по п. 56, где:
стадия аффинной хроматографии включает применение колонки со смолой MABSELECT SURE™ в режиме связывания и элюирования;
стадия анионообменной хроматографии включает применение колонки со смолой Q SEPHAROSE™ Fast Flow в режиме связывания и элюирования, и
стадия HIC включает применение колонки со смолой PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub) в режиме сбора проскока.
58. Способ по п. 41, где антитело представляет собой анти-Abeta.
59. Способ по п. 44, где антитело представляет собой кренезумаб.
60. Способ по п. 58, где анти-Abeta антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 23, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 24, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 25, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 26, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 27, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 28.
61. Способ по любому из пп. 58, 59 или 60, где стадия HIC включает применение колонки со смолой в режиме сбора проскока и применение уравновешивающего буфера и промывочного буфера, где уравновешивающий буфер и промывочный буфер включают 150 мМ ацетат натрия, рН 5,0.
62. Способ по п. 61, где проскок контролируют по поглощению при 280 нанометрах, и проскок собирают, начиная с 0,5 OD, и в объеме 10 объемов колонки.
63. Способ по п. 61, дополнительно включающий стадию аффинной хроматографии.
64. Способ по п. 63, где аффинная хроматография представляет собой хроматографию на белке А.
65. Способ по п. 61, дополнительно включающий стадию комбинированной хроматографии.
66. Способ по п. 61, включающий первую стадию аффинной хроматографии на белке А и вторую стадию комбинированной хроматографии перед стадией хроматографии гидрофобных взаимодействий (HIC).
67. Способ по п. 66, где стадия аффинной хроматографии включает применение смолы MABSELECT SURE™, стадия комбинированной хроматографии включает применение САРТО™ Adhere, и стадия HIC включает применение смолы PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (high sub).
68. Способ по п. 67, где:
стадия аффинной хроматографии включает применение колонки со смолой MABSELECT SURE™ в режиме связывания и элюирования;
стадия комбинированной хроматографии включает применение колонки со смолой САРТО™ Adhere в режиме сбора проскока и
стадия HIC включает применение колонки со смолой PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub) в режиме сбора проскока.
69. Способ по п. 36, где количество PLBL2 хомячка количественно определяют с использованием иммунологического анализа или масс-спектрометрического анализа.
70. Способ по п. 69, где иммунологический анализ представляет собой ELISA на все белки клеток яичника китайского хомячка или ELISA на PLBL2 хомячка.
71. Способ по п. 69, где масс-спектрометрический анализ представляет собой LC-MS/MS.
72. Композиция, включающая анти-Abeta моноклональное антитело, очищенное из клеток-хозяев яичника китайского хомячка, где композиция включает анти-Abeta антитело и остаточное количество PLBL2 хомячка, где количество PLBL2 хомячка составляет менее 20 нг/мг, или менее 15 нг/мг, или менее 10 нг/мг, или менее 8 нг/мг, или менее 5 нг/мг, или менее 3 нг/мг, или менее 2 нг/мг, или менее 1 нг/мг, или менее 0,5 нг/мг.
73. Композиция по п. 72, где анти-Abeta антитело представляет собой кренезумаб.
74. Композиция по п. 72, где анти-Abeta антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 23, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 24, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 25, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 26, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 27, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 28.
75. Композиция по п. 74, где анти-Abeta антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 29.
76. Композиция по п. 74, где анти-Abeta антитело включает вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 30.
77. Композиция по п. 74, где анти-Abeta антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 29, и вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 30.
78. Способ по п. 43, где антитело представляет собой IgG1.
79. Способ по п. 41, где антитело представляет собой анти-IL17 A/F.
80. Способ по п. 79, где антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 15, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 16, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 17, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 18, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 19, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 20.
81. Способ по п. 79 или 80, где стадия HIC включает применение колонки со смолой в режиме сбора проскока и включает применение уравновешивающего буфера и промывочного буфера, где уравновешивающий буфер и промывочный буфер включают 50 мМ ацетат натрия, рН 5,5.
82. Способ по п. 81, где проскок контролируют по поглощению при 280 нанометрах, и проскок собирают, начиная с 0,5 OD, и в объеме 10 объемов колонки.
83. Способ по п. 81, дополнительно включающий стадию аффинной хроматографии.
84. Способ по п. 83, где аффинная хроматография представляет собой хроматографию на белке А.
85. Способ по п. 81, дополнительно включающий стадию катионообменной хроматографии.
86. Способ по п. 81, включающий первую стадию аффинной хроматографии на белке А и вторую стадию катионообменной хроматографии перед стадией хроматографии гидрофобных взаимодействий (HIC).
87. Способ по п. 86, где стадия аффинной хроматографии включает применение смолы MABSELECT SURE™, стадия катионообменной хроматографии включает применение смолы POROS® 50HS, и стадия HIC включает применение смолы PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (high sub).
88. Способ по п. 87, где:
стадия аффинной хроматографии включает применение колонки со смолой MABSELECT SURE™ в режиме связывания и элюирования;
стадия катионообменной хроматографии включает применение колонки со смолой PORO® 50HS в режиме связывания и элюирования и
стадия HIC включает применение колонки со смолой PHENYL SEPHAROSE™ 6 Fast Flow (High Sub) в режиме сбора проскока.
89. Композиция, включающая анти-IL17 A/F моноклональное антитело, очищенное из клеток-хозяев яичника китайского хомячка, где композиция включает анти-IL17 A/F антитело и остаточное количество PLBL2 хомячка, где количество PLBL2 хомячка составляет менее 20 нг/мг, или менее 15 нг/мг, или менее 10 нг/мг, или менее 8 нг/мг, или менее 5 нг/мг, или менее 3 нг/мг, или менее 2 нг/мг, или менее 1 нг/мг, или менее 0,5 нг/мг.
90. Композиция по п. 89, где анти-IL17 A/F антитело включает три CDR тяжелой цепи, CDR-H1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 15, CDR-H2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 16, и CDR-H3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 17, и три CDR легкой цепи, CDR-L1, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 18, CDR-L2, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 19, и CDR-L3, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 20.
91. Композиция по п. 90, где анти-IL17 A/F антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 21.
92. Композиция по п. 90, где анти-IL17 A/F антитело включает вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 22.
93. Композиция по п. 90, где анти-IL17 A/F антитело включает вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 21, и вариабельную область легкой цепи, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO.: 22.
94. Способ лечения опосредованного IL-13 расстройства у пациента, включающий введение пациенту композиции для лечения, где композиция для лечения включает композицию по любому из пп. 1-8.
95. Способ по п. 94, где введение композиции для лечения является менее иммуногенным в отношении PLBL2 хомячка по сравнению с введением композиции сравнения, где композиция сравнения включает анти-IL13 моноклональное антитело, очищенное из клеток-хозяев яичника китайского хомячка, и остаточное количество PLBL2 хомячка, составляющее более 30 нг/мг, или более 50 нг/мг, или более 100 нг/мг, или более 200 нг/мг, или более 300 нг/мг.
96. Способ по п. 94, где композицию для лечения вводят подкожно один раз каждые четыре недели, или один раз каждые восемь недель, или один раз каждые 12 недель.
97. Способ по п. 96, где пациента лечат один раз каждые четыре недели на протяжении, по меньшей мере, одного месяца, или, по меньшей мере, трех месяцев, или, по меньшей мере, шести месяцев, или, по меньшей мере, девяти месяцев, или, по меньшей мере, двенадцати месяцев, или, по меньшей мере, 18 месяцев, или, по меньшей мере, двух лет, или больше двух лет.
98. Способ по п. 94, где опосредованное IL-13 расстройство выбрано из астмы, идиопатического легочного фиброза и атопического дерматита.
99. Способ по п. 94, где опосредованное IL-13 расстройство выбрано из аллергической астмы, неаллергической астмы, аллергического ринита, аллергического конъюктивита, экземы, крапивницы, пищевых аллергий, хронической обструктивной болезни легких, язвенного колита, инфекции RSV, увеита, склеродермии и остеопороза.
