Композиции и способы модулирования экспрессии hbv и ttr - RU2015151202A
Код документа: RU2015151202A
Формула
1. Соединение, содержащее модифицированный олигонуклеотид и конъюгирущую группу, при этом модифицированный олигонуклеотид состоит из 12-30 связанных нуклеозидов и содержит последовательность азотистых оснований, включающую часть из по меньшей мере 8 смежных азотистых оснований, комплементраную равной по длине части SEQ ID NO: 1, при этом последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 80% комплементарна SEQ ID NO: 1, и где конъюгирущая группа содержит:
2. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный сахар.
3. Соединение по п. 2, отличающееся тем, что модифицированный сахар представляет собой бициклический сахар.
4. Соединение по любому из пп. 2 и 3, отличающееся тем, что по меньшей мере один модифицированный сахар содержит 2'-O-метоксиэтил, стерически затрудненный этил, а 3'-фтор-HNA или 4' (СН2)n-O-2' мостик, где n равно 1 или 2.
5. Соединение по п. 2, отличающееся тем, что по меньшей мере один модифицированный сахар представляет собой 2'-O-метоксиэтил.
6. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одно модифицированное азотистое основание.
7. Соединение п. 6, отличающееся тем, что модифицированное азотистое основание представляет собой 5-метилцитозин.
8. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что конъюгирующая группа связана с модифицированным олигонуклеотидом на 5'-конце модифицированного олигонуклеотида.
9. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что конъюгирующая группа связана с модифицированным олигонуклеотидом на 3'-конце модифицированного олигонуклеотида.
10. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что каждая межнуклеозидная связь модифицированного олигонуклеотида выбрана из фосфодиэфирной межнуклеозидной связи и тиофосфатной межнуклеозидной связи.
11. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере 5 фосфодиэфирных межнуклеозидных связей.
12. Соединение по п. 10, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит по меньшей мере две тиофосфатные межнуклеозидные связи.
13. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид является одноцепочечным.
14. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид является двухцепочечным.
15. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит модифицированный сахар.
16. Соединение по п. 15, отличающееся тем, что каждая межнуклеозидная связь в сегменте гэпа модифицированного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную связь.
17. Соединение по п. 16, отличающееся тем, модифицированный олигонуклеотид дополнительно содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь в каждом сегменте крыла.
18. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 90% комплементарна SEQ ID NO: 1.
19. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 95% комплементарна SEQ ID NO: 1.
20. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что последовательность азотистых оснований модифицированного олигонуклеотида по меньшей мере на 100% комплементарна SEQ ID NO: 1.
21. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид содержит последовательность азотистых оснований любой из SEQ ID NO: 3-11.
22. Соединение по любому из пп. 1-3, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид состоит из связанных нуклеозидов, состоящих из азотистых оснований любой из SEQ ID NO: 3-11.
23. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности SEQ ID NO: 3, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; при этом каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтил-сахар; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
24. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности SEQ ID NO: 4, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; при этом каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтил-сахар; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
25. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 20 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности любой из SEQ ID NO: 7, 6 или 8, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из шести связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из четырех связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; при этом каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтил-сахар; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
26. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 17 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности SEQ ID NO: 5, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из трех связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из четырех связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; и каждый нуклеозид каждого сегмента крыла содержит 2'-O-метоксиэтил-сахар; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
27. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности SEQ ID NO: 10, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из двух связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из четырех связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; при этом два связанных нуклеозида сегмента 5'-крыла содержат 2'-O-метоксиэтил-сахар и стерически затрудненный этил-сахар в 5'-3' направлении; при этом четыре связанных нуклеозида сегмента 3'-крыла содержат затрудненный этил-сахар, 2'-O-метоксиэтил-сахар, затрудненный этил-сахар и 2'-O-метоксиэтил-сахар в 5'-3' направлении; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
28. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 16 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности SEQ ID NO: 9, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из десяти связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из трех связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из трех связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; при этом три связанных нуклеозида сегмента 5'-крыла содержат 2'-O-метоксиэтил-сахар, стерически затрудненный этил-сахар и стерически затрудненный этил-сахар в 5'-3' направлении; при этом три связанных нуклеозида сегмента 3'-крыла содержат затрудненный этил-сахар, затрудненный этил-сахар и 2'-O-метоксиэтил-сахар в 5'-3' направлении; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
29. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид, состоит из 18 связанных нуклеозидов, имеющих последовательность азотистых оснований, состоящую из последовательности SEQ ID NO: 11, и при этом модифицированный олигонуклеотид содержит:
сегмент гэпа, состоящий из восьми связанных дезоксинуклеозидов;
сегмент 5'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов; и
сегмент 3'-крыла, состоящий из пяти связанных нуклеозидов,
при этом сегмент гэпа расположен между сегментом 5'-крыла и сегментом 3'-крыла; при этом пять связанных нуклеозидов сегмента 5'-крыла содержат стерически затрудненный этил-сахар, дезоксисахар, стерически затрудненный этил-сахар, дезоксисахар и стерически затрудненный этил-сахар в 5'-3' направлении; при этом каждый из пяти связанных нуклеозидов сегмента 3'-крыла содержит 2'-O-метоксиэтил-сахар; и при этом каждый цитозин представляет собой 5-метилцитозин.
30. Соединение по любому из пп. 23-29, отличающееся тем, что каждая межнуклеозидная связь в сегменте гэпа модифицированного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную связь.
31. Соединение по п. 30, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид дополнительно содержит по меньшей мере одну тиофосфатную межнуклеозидную связь в каждом сегменте крыла.
32. Соединение по любому из пп. 23-29, отличающееся тем, что каждая межнуклеозидная модифицированного олигонуклеотида представляет собой тиофосфатную связь.
33. Соединение по любому из пп. 23-29, отличающееся тем, что модифицированный олигонуклеотид является одноцепочечным.
34. Соединение по п. 1, отличающееся тем, что соединение состоит из следующей формулы:
или его фармацевтически приемлемой соли.
35. Композиция, содержащая соединение по любому из пп. 1-34 и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
36. Применение соединения по любому из пп. 1-34 или композиции по п. 35 в производстве лексарственного средства для лечения у субъекта заболевания, расстройства или патологического состояния, связанного с HBV, при этом заболевание, расстройство или патологическое состояние представляет собой разлитие желчи, воспаление печени, фиброз печени, воспаление, цирроз печени, печеночную недостаточность, рак печени, диффузное гепатоцеллюлярное воспалительное заболевание, гемофагоцитарный синдром, сывороточный гепатат, HBV виремию или трансплантацию, связанную с заболеванием печени.
37. Применение соединения по любому из пп. 1-34 или композиции по п. 35 в производстве лексарственного средства для снижения уровней антигена HBV в организме субъекта, инифицированного HBV.
38. Применение по п. 37, отличающееся тем, что антиген HBV представляет собой HBsAG или HBeAG.
