Новые мономеры и олигомеры пептидных нуклеиновых кислот - RU2016149427A
Код документа: RU2016149427A
Формула
1. Соединение общей формулы (I):
в которой
K представляет собой активную группу эфира карбоновой кислоты или -О-RM; где RM обозначает атом Н, метильную, этильную, аллильную, бензильную, фенильную, трет-бутильную или триметилсилильную группу;
Pr представляет собой атом Н или аминозащитную группу;
# обозначает асимметричный атом С;
Е представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацилильную или фенильную группу, при необходимости замещенную защитной группой для нуклеотидного основания;
R1 обозначает группу общей формулы (II):
в которой
R2 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты;
R3 обозначает атом Н или аминозащитную группу;
m обозначает 1, 2, 3 или 4; и
h обозначает 0, 1, 2 или 3;
при условии, что сумма m и h в общей формуле (II) находится в пределах: 2≤х≤5.
2. Соединение по п. 1, в котором Е представляет собой тиминильную, урацилильную, фенильную, N2-ацетилгуанинильную, N2-изобутирилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонилгуанинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-дибензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N2-ди-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N6-бензилоксикарбониладенинильную, N6-(4-метоксифенил)дифенилметиладенинильную, N6-анизоиладенинильную, N6-бензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-дибензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N6-ди-трет-бутилоксикарбониладенинильную, O6-бензилгуанинильную, N2-ацетил-О6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-изобутирил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонил-О6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N4-бензилоксикарбонилцитозинильную, N4-(4-метоксифенил)дифенилметилцитозинильную, N4-4-трет-бутилбензоилцитозинильную, N4-бензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-дибензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N4-ди-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N2-бензилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-(4-метоксифенил)дифенилметил-псевдо-изоцитозинильную, N2-4-трет-бутилбензоил-псевдо-изоцитозинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-ди-бензгидрилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную или N2-ди-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную группу.
3. Соединение по п. 2, в котором Е представляет собой тиминильную, урацилильную, фенильную, N2-бензилоксикарбонилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонилгуанинильную, N2-трет-бутилоксикарбонилгуанинильную, N2-бензилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N2-бензгидрилоксикарбонил-O6-дифенилкарбамоилгуанинильную, N6-бензилоксикарбониладенинильную, N6-бензгидрилоксикарбониладенинильную, N6-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N6-ди-трет-бутилоксикарбониладенинильную, N4-бензилоксикарбонилцитозинильную, N4-бензгидрилоксикарбонилцитозинильную, N4-ди-трет-бутилоксикарбонилцитозинильную, N2-бензилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную, N2-бензгидрилоакикарбонил-псевдо-изоцитозинильную или N2-трет-бутилоксикарбонил-псевдо-изоцитозинильную группу.
4. Соединение по одному из пп. 1-3, в котором R2 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или -P(=O)(OV)(OH); и V каждый независимо представляет собой метильную, этильную, циклогексильную или бензильную группу.
5. Соединение по одному из пп. 1-4, в котором R3 обозначает атом Н.
6. Соединение по одному из пп. 1-4, в котором R3 представляет собой оксокарбаматную, тиокарбаматную защитную группу или защитную группу Mmt.
7. Соединение общей формулы (VI):
в которой
каждый Y в каждом случае независимо представляет собой группу общей формулы (IV):
каждый Z в каждом случае независимо представляет собой группу общей формулы (V):
где
каждый Е в каждом случае независимо представляет собой аденинильную, цитозинильную, псевдо-изоцитозинильную, гуанинильную, тиминильную, урацилильную или фенильную группу;
# обозначает асимметричный атом С;
каждый R41 в каждом случае представляет собой атом Н;
R11 каждый представляет собой группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R12;
в которой R12 в каждом случае независимо представляет собой группу эфира фосфоновой кислоты формулы -P(=O)(OV)2 или -P(=O)(OV)(OH); и каждый V в каждом случае независимо представляет собой метильную, этильную, циклогексильную или бензильную группу;
m в каждом случае независимо обозначает 1, 2, 3 или 4 и h в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2 или 3; при условии, что сумма m и h находится в пределах: 2≤х≤5;
d в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
f в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
g в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
j в каждом случае независимо обозначает 0, 1, 2, 3 или 4;
n=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
при условии, что сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj в общей формуле (VI) находится в пределах: 7≤х≤30; и по меньшей мере одна переменная f или j представляет собой целое число от 1 до 5;
при условии, что отношение (сумма повторяющихся звеньев Zf и Zj):(сумма всех повторяющихся звеньев Yd, Zf, Yg и Zj) в общей формул (VI) находится в пределах: 0,1≤х≤0,5;
R31 представляет собой атом Н; боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, гистидина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; или группу -(CH2)m-NH-(CH2)h-CH2-R12; в которой R12 обозначает группу эфира фосфоновой кислоты или группу фосфоновой кислоты; m представляет собой целое число от 1 до 5; и h представляет собой целое число от 0 до 4; при условии, что сумма m и h находится в пределах: 2≤х≤5;
R47 в каждом случае независимо обозначает атом Н; или боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина или аргинина;
t=0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8;
L представляет собой ОН, OEt, NH2 или -NHNH2;
U представляет собой группу общей формулы (VII):
в которой В представляет собой атом Н, фенильную группу или замещенную фенильную группу, замещенную 1-3 заместителями, выбранными из группы, которая состоит из ОН, F, Cl, Br, I и NO2; R48 обозначает атом Н; и
(I) каждый R46 в каждом случае независимо друг от друга представляет собой атом Н или боковую цепь аминокислоты аланина, аргинина, аспарагина, аспарагиновой кислоты, цистеина, глутамина, глутаминовой кислоты, гистидина, изолейцина, лейцина, лизина, метионина, орнитина, фенилаланина, пролина, гистидина, серина, треонина, триптофана, тирозина или валина; и s обозначает 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 или 8; или
(II) каждый R46 каждый раз независимо друг от друга представляет собой атом Н или группу формулы (IXb):
группу формулы (IХс):
группу формулы (IXd):
или группу формулы (IХе):
р в формулах (IXb), (IXc), (IXd) и (IXe) представляет собой число 3 или 4; и s=1, 2, 3 или 4.
8. Соединение по п. 7, в котором каждый R11 в каждом случае представляет собой группу формулы -CH2-CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2, или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
9. Соединение по п. 7 или 8, в котором каждый R31 представляет собой атом Н, боковую цепь аминокислоты лизина, орнитина, аргинина, гистидина, триптофана, тирозина, треонина или серина, группу формулы -СН2-СН2-СН2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2 или группу формулы -CH2-CH2-CH2-NH-CH2-CH2-P=O(OEt)2.
10. Соединение по одному из пп. 7-9, предназначенное для применения в качестве лекарственного средства.
11. Фармацевтическая композиция, содержащая по меньшей мере одно соединение по одному из пп. 7-9 и необязательно по меньшей мере один носитель и/или по меньшей мере один адъювант.
