Модуляторы связывающих свойств i-домена рецепторов коллагена - RU2008114829A

Реферат

1. Уточненная in silico модель MIDAS-сайта I-домена интегрина α2β1, характеризуемая координатами аминокислот Asp151, Ser153, Ser155, Thr221, Asp254, Tyr285, Leu286 и Leu296. ! 2. Модель по п.1, характеризуемая координатами аминокислот Asn154, Gly218, Asp219, Gly255, Glu256, Asn289, Leu291 и Asp292. ! 3. Модель по п.2, характеризуемая координатами аминокислот, приведенными в таблице 1. ! 4. Модель по пп.1-3, характеризуемая ключевыми молекулами воды W514, W699, W701, W700, W668, W597, W644 и W506. ! 5. Способ идентификации соединений, модулирующих α2β1-интегрин, подразумевающий: ! (а) применение алгоритма трехмерного молекулярного моделирования к атомным координатам, содержащего I-домен интегрина α2β1, для определения пространственных координат зависимого от действия ионов металлов адгезионного сайта (MIDAS) данного интегрина; и ! (б) in silico скрининг библиотеки пространственных координат набора соединений-кандидатов против пространственных координат, определенных согласно (а), для идентификации соединений, способных связываться с MIDAS-сайтом изучаемого интегрина. ! 6. Способ по п.5, дополнительно включающий в себя этапы: ! (в) введения в рассмотрение фрагмента I-домена α2-интегрина, содержащего используемые в данной модели аминокислотные остатки; ! (г) приведения данного фрагмента в контакт с изучаемым модулятором-кандидатом; и ! (д) определения способности пептидного фрагмента связываться с данным потенциальным ингибитором. ! 7. Способ по любому из пп.5 и 6, в котором обсуждаемые соединения являются ингибиторами интегринов. ! 8. Соединение, модулирующее, содержащее I-домен интегрин α2β1, идентифицированное или полученное при помощи способа по любому из пп.5-7. ! 9. Соединение по п.8 общей формулы (I) ! ! где RC выбирается из груп�