Системы и способы для обнаружения клеток с применением сконструированных трансдукционных частиц - RU2015143532A
Код документа: RU2015143532A
Формула
1. Способ, включающий:
смешивание с образцом множества трансдукционных частиц, ассоциированных с целевой клеткой, где множество трансдукционных частиц сконструировано как содержащее молекулу нуклеиновой кислоты, разработанную для вызывания продуцирования целевой клеткой множества репортерных молекул, где множество трансдукционных частиц разработано для связывания и доставки молекулы нуклеиновой кислоты в целевую клетку, где множество трансдукционных частиц является нереплицируемым;
поддержание образца и множества трансдукционных частиц с целью экспрессии множества репортерных молекул, когда целевая клетка присутствует в образце; и
прием сигнала, ассоциированного с количеством репортерных молекул в множестве.
2. Способ по п. 1, в котором величина сигнала не зависит от количества трансдукционных частиц в множестве, большего предварительно заданного количества.
3. Способ по п. 1, в котором множество трансдукционных частиц сконструировано как не способное к лизогенной репликации.
4. Способ по п. 1, в котором множество трансдукционных частиц сконструировано как не способное к литической репликации.
5. Способ по п. 1, в котором множество трансдукционных частиц представляет собой вирусный вектор, свободный от ДНК дикого типа, способной к демонстрации вирусных функций дикого типа, ассоциированных с вирусом, из которого получен вирусный вектор.
6. Способ по п. 1, в котором множество трансдукционных частиц свободно от репортерных молекул.
7. Способ по п. 1, в котором множество трансдукционных частиц получено из бактериофага.
8. Способ по п. 1, в котором множество трансдукционных частиц содержит структурный белок вируса и молекулу нуклеиновой кислоты, где молекула нуклеиновой кислоты содержит репортерный ген под управлением промотора и сайт, который распознается вирусной системой упаковки нуклеиновых кислот, и который является подходящим для упаковки молекулы нуклеиновой кислоты в пределах структурного белка вируса.
9. Способ по п. 8, в котором молекула нуклеиновой кислоты также содержит точку начала репликации, подходящую для распространения трансдуцированной молекулы нуклеиновой кислоты в пределах целевой клетки.
10. Способ по п. 9 в котором молекула нуклеиновой кислоты также содержит селектируемый маркер, подходящий для выбора в пределах целевой клетки.
11. Способ по п. 10 в котором промотор является конститутивным, индуцируемым или условным.
12. Способ по п. 1, в котором целевая клетка представляет собой бактерию, выбранную из группы, состоящей из Escherichia, Mycobacterium, Staphylococcus, Listeria, Clostridium, Enterococcus, Streptococcus, Helicobacter, Rickettsia, Haemophilus, Xenorhabdus, Acinetobacter, Bordetella, Pseudomonas, Aeromonas, Actinobacillus, Pasteurella, Vibrio, Legionella, Bacillus, Calothrix, Methanococcus, Stenotrophomonas, Chlamydia, Neisseria, Salmonella, Shigella, Campylobacter и Yersinia.
13. Способ по п. 1, в котором молекула нуклеиновой кислоты разработана для вызывания продуцирования в целевой клетке множества репортерных молекул только тогда, когда целевая клетка содержит по меньшей мере один элемент из гена устойчивости к лекарственному препарату, гена чувствительности к лекарственному препарату, токсина, или видоспецифичного гена.
14. Способ по п. 1, в котором репортерная молекула из множества репортерных молекул представляет собой любую молекулу из бактериальной люциферазы, эукариотической люциферазы, флуоресцентного белка, фермента, подходящего для колориметрического обнаружения, белка, подходящего для иммунологического анализа, пептида, подходящего для иммунологического анализа, или нуклеиновой кислоты, которая функционирует как аптамер или которая демонстрирует ферментную активность.
15. Способ по п. 1, в котором:
образец находится в контейнере, который жидкостно изолирован от области за пределами контейнера;
множество трансдукционных частиц поддерживается в жидкостной изоляции от образца до смешивания; и
смешивание включает размещение множества трансдукционных частиц в образце в условиях поддержания жидкостной изоляции между областью и контейнером.
16. Способ по п. 1, в котором поддержание включает поддержание образца при температуре, меньшей чем либо равной приблизительно 45 градусам Цельсия в течение временного периода, меньшего чем приблизительно четыре часа.
17. Способ по п. 1, дополнительно включающий:
размещение вещества в образце, где вещество разработано для реагирования с множеством репортерных молекул с целью усиления сигнала.
18. Способ по п. 1, в котором:
образец находится в контейнере, который жидкостно изолирован от области за пределами контейнера;
вещество поддерживается в жидкостной изоляции от образца до размещения; и
размещение включает размещение вещества в образце в условиях поддержания жидкостной изоляции между областью и контейнером.
19. Способ по п. 1, в котором поддержание включает поддержание образца в течение такого периода времени, чтобы продуцировалось количество репортерных молекул в множестве, которое является достаточным для выдачи сигнала, вне зависимости от репликации клеток.
20. Способ по п. 1, в котором поддержание включает поддержание образца в течение такого периода времени, чтобы продуцировалось количество репортерных молекул в множестве, которое является достаточным для выдачи сигнала, и это количество дополнительно увеличивалось вследствие репликации клеток.
21. Способ, включающий:
смешивание с образцом множества трансдукционных частиц, ассоциированных с целевой клеткой, где множество трансдукционных частиц сконструировано как содержащее молекулу нуклеиновой кислоты, разработанную для вызывания продуцирования целевой клеткой множества репортерных молекул, где множество трансдукционных частиц свободно от ДНК дикого типа, способной к демонстрации вирусных функций дикого типа, ассоциированных с вирусом, из которого получено множество трансдукционных частиц;
поддержание образца и множества трансдукционных частиц с целью экспрессии множества репортерных молекул, продуцируемых, когда целевая клетка присутствует в образце; и
прием сигнала, ассоциированного с количеством репортерных молекул в множестве, где величина сигнала не зависит от количества трансдукционных частиц в множестве выше предварительно заданного количества.
22. Способ по п. 21, в котором множество трансдукционных частиц свободно от репортерной молекулы.
23. Способ по п. 21, в котором множество трансдукционных частиц получено из бактериофага.
24. Способ по п. 21, в котором:
образец находится в контейнере, который жидкостно изолирован от области за пределами контейнера, где и смешивание, и поддержание, и прием выполняются в условиях поддержания жидкостной изоляции между областью и контейнером.
25. Способ по п. 21, в котором образец находится в контейнере, который жидкостно изолирован от области за пределами контейнера, где способ также включает:
размещение вещества в образце в условиях поддержания жидкостной изоляции между областью и контейнером, где вещество разработано для реагирования с множеством репортерных молекул с целью усиления выдачи сигнала, и где вещество поддерживается в жидкостной изоляции от образца перед размещением.
26. Способ, включающий:
введение в образец множества трансдукционных частиц, ассоциированных с целевой клеткой, где множество трансдукционных частиц сконструировано как содержащее молекулу нуклеиновой кислоты, разработанную для вызывания продуцирования целевой клеткой множества репортерных молекул, где множество трансдукционных частиц является не способным к лизогенной репликации;
поддержание образца и множества трансдукционных частиц с целью экспрессии множества репортерных молекул, когда целевая клетка присутствует в образце; и
прием сигнала, ассоциированного с количеством репортерных молекул в множестве, где величина сигнала не зависит от количества трансдукционных частиц в множестве выше предварительно заданного количества.
27. Способ по п. 26, в котором множество трансдукционных частиц сконструировано как не способное к литической репликации.
28. Способ по п. 26, в котором поддержание включает поддержание образца в течение такого периода времени, чтобы продуцировалось количество репортерных молекул в множестве, которое является достаточным для выдачи сигнала, вне зависимости от репликации клеток.
29. Устройство, содержащее:
корпус, сконфигурированный для съемного соединения с реакционной камерой, где корпус задает первый объем реагента и второй объем реагента, корпус содержит блок доставки, задающий первый канал между первым объемом реагента и реакционной камерой, когда корпус соединен с реакционной камерой, блок доставки, задающий второй канал между вторым объемом реагента и реакционной камерой, когда корпус соединен с реакционной камерой;
первый привод, имеющий блок плунжера, размещенный в пределах первого объема реагента, где блок зацепления первого привода сконфигурирован для того, чтобы им манипулировали с целью перемещения блока плунжера в пределах первого объема реагента; и
второй привод, имеющий блок плунжера, размещенный с возможностью движения в пределах второго объема реагента, где блок зацепления второго привода сконфигурирован для того, чтобы им манипулировали с целью перемещения блока плунжера второго привода в пределах второго объема реагента, где блок зацепления
второго привода, по меньшей мере, частично окружает блок зацепления первого привода.
30. Устройство по п. 29, в котором второй привод задает канал, в пределах которого перемещается блок зацепления первого привода, когда первым приводом манипулируют с целью перемещения блока плунжера первого привода.
31. Устройство по п. 29, в котором блок зацепления второго привода задает отверстие, в пределах которого размещен блок зацепления первого привода.
32. Устройство по п. 29, в котором блок плунжера первого привода сконфигурирован для перемещения независимо от перемещения блока плунжера второго привода.
33. Устройство по п. 29, в котором блок плунжера первого привода и часть корпуса совместно задают затвор для жидкостного изолирования первого объема реагента от объема за пределами корпуса.
34. Устройство по п. 29, в котором корпус содержит боковую стенку, отделяющую второй объем реагента от первого объема реагента.
35. Устройство по п. 29, в котором продольная ось блока плунжера первого привода смещена относительно продольной оси блока плунжера второго привода.
36. Устройство по п. 29, в котором первый канал является отдельным от второго канала.
37. Устройство по п. 29, в котором корпус содержит прокалыватель, размещенный в пределах первого объема реагента, где устройство также содержит:
контейнер для реагента, размещенный в пределах первого объема реагента, где прокалыватель сконфигурирован для прокалывания части контейнера для реагента, когда блок плунжера перемещается в пределах первого объема реагента.
38. Устройство по п. 29, в котором:
первый объем реагента содержит вирусный вектор, ассоциированный с целевой клеткой, где вирусный вектор сконструирован как содержащий последовательность нуклеиновой кислоты, разработанную для вызывания продуцирования целевой клеткой множества репортерных молекул; и
второй объем реагента содержит реагент, разработанный для реагирования с множеством репортерных молекул с целью усиления выдачи сигнала.
39. Устройство по п. 29, в котором блок доставки содержит выпускное отверстие, которое расположено в пределах реакционной камеры, когда корпус соединен с реакционной камерой, где
часть первого модуля размещена в пределах изоляционной камеры модуля изоляции, когда первый модуль соединен с модулем изоляции.
40. Устройство, содержащее:
корпус, сконфигурированный для съемного соединения с реакционной камерой, где корпус задает объем реагента;
элемент доставки, соединенный с корпусом, где элемент доставки задает канал между объемом реагента и реакционной камерой, когда корпус соединен с реакционной камерой, где первая концевая часть элемента доставки размещена в пределах объема реагента, вторая концевая часть элемента доставки размещена за пределами объема реагента; и
привод, имеющий блок плунжера, размещенный в пределах объема реагента, где блок плунжера сконфигурирован для перемещения в пределах объема реагента вдоль продольной оси корпуса с целью создания потока реагента из объема реагента через канал,
элемент доставки, сконфигурированный для направления потока реагента, выходящего из второй концевой части элемента доставки, в выходном направлении, не параллельном продольной оси корпуса.
41. Устройство по п. 40, дополнительно содержащее:
прокалываемый элемент, задающий часть границы объема реагента, первую концевая часть элемента доставки, содержащую прокалыватель, сконфигурированный для прокалывания прокалываемого элемента, когда блок плунжера перемещается в пределах объема реагента.
42. Устройство по п. 40, дополнительно содержащее:
контейнер для реагента, размещенный в пределах объема реагента; и
прокалыватель, сконфигурированный для прокалывания части контейнеры для реагента, когда блок плунжера перемещается в пределах объема реагента.
43. Устройство по п. 40, дополнительно содержащее:
реагент, размещенный в пределах объема реагента, где реагент содержит по меньшей мере один субстрат из субстратов эукариотической или бактериальной люциферазы.
44. Устройство по п. 40, в котором:
первая концевая часть элемента доставки задает первую часть канала; и
вторая концевая часть элемента доставки задает вторую часть канала, где центральная линия второй части канала имеет угловое смещение относительно центральной линии первой части канала.
45. Устройство по п. 40, в котором выходное направление и продольная ось задают угол, меньший, чем приблизительно тридцать градусов.
46. Устройство по п. 40, в котором объем реагента является первым объемом реагента, реагент является первым реагентом, элемент доставки является первым элементом доставки, плунжер является первым плунжером, и корпус задает второй объем реагента, где устройство также содержит:
второй элемент доставки, соединенный с корпусом, где второй элемент доставки задает канал между вторым объемом реагента и реакционной камерой, когда корпус соединен с реакционной камерой; и
второй привод, имеющий блок плунжера в пределах второго объема реагента, где блок плунжера второго привода сконфигурирован для перемещения в пределах второго объема реагента вдоль продольной оси корпуса с целью создания потока второго реагента от второго объема реагента через канал второго элемента доставки,
часть второго привода, по меньшей мере, частично окружающую часть первого привода.
47. Устройство по п. 46, в котором второй привод задает канал, в пределах которого перемещается часть первого привода, когда первым приводом манипулируют с целью перемещения блока плунжера первого привода.
48. Устройство, содержащее:
корпус, сконфигурированный для съемного соединения с реакционной камерой, где корпус задает объем реагента;
элемент доставки, соединенный с корпусом, где элемент доставки задает канал между объемом реагента и реакционной камерой, когда корпус соединен с реакционной камерой, где первая концевая часть элемента доставки размещена в пределах объема реагента и задает первую часть канала, вторая концевая часть элемента доставки расположена за пределами корпуса и задает вторую часть канала, где центральная линия второй части канала имеет угловое смещение относительно центральной линии первой части канала; и
привод, имеющий блок плунжера, размещенный в пределах объема реагента, где блок плунжера сконфигурирован для перемещения в пределах объема реагента вдоль продольной оси корпуса с целью создания потока реагента из объема реагента через канал.
49. Устройство по п. 48, дополнительно содержащее:
прокалываемый элемент, задающий часть границы объема реагента, первую концевая часть элемента доставки, содержащую прокалыватель, сконфигурированный для прокалывания прокалываемого элемента, когда блок плунжера перемещается в пределах объема реагента.
50. Устройство по п. 48, в котором центральная линия второй части канала и центральная линия первой части канала задает угол приблизительно между пятнадцатью градусами и приблизительно сорока пятью градусами.
51. Устройство по п. 48, дополнительно содержащее:
реагент, размещенный в пределах объема реагента, где реагента содержит тридеканал.
52. Способ, включающий:
размещение реакционной камеры, содержащей образец, в функциональном взаимодействии с детектором, где образец содержит множество репортерных молекул;
передачу, через элемент доставки, реагента в реакционную камеру таким образом, чтобы реагент протекал вдоль поверхности реакционной камеры и в образец, где реагент разработан для реагирования со множеством репортерных молекул с целью усиления выдачи сигнала, ассоциированного с количеством репортерных молекул в множестве; и
прием сигнала через детектор.
53. Способ по п. 52, в котором передача включает передачу реагента в направлении, не перпендикулярном поверхности образца.
54. Способ по п. 52, в котором передача включает передачу реагента со скоростью потока, составляющей по меньшей мере один миллилитр в секунду.
55. Способ по п. 52, в котором передача включает перемещение плунжера в направлении в пределах объема реагента, где первая концевая часть элемента доставки размещена в пределах объема реагента, вторая концевая часть элемента доставки размещена в пределах реакционной камеры, и поток реагента выходит из второй концевой части элемента доставки в выходном направлении, не параллельном направлению.
56. Способ по п. 52, дополнительно включающий:
поддержание положения реакционной камеры между передачей и приемом.
57. Способ по п. 52, в котором:
репортерная молекула является любой молекулой из бактериальной люциферазы, эукариотической люциферазы, флуоресцентного белка, фермента, подходящего для колориметрического обнаружения, белка, подходящего для иммунологического анализа, пептида, подходящего для иммунологического анализа, или нуклеиновой кислоты, которая функционируют как аптамер или которая демонстрирует ферментную активность; и
реагент содержит тридеканал.
58. Способ по п. 52, в котором прием выполняется в течение менее чем шестидесяти секунд после передачи.
59. Устройство, содержащее:
элемент удержания, сконфигурированный для контактирования с первой частью контейнера для образцов с целью ограничения перемещения контейнера для образцов, где контейнер для образцов задает реакционный объем и объем реагента;
элемент активации, сконфигурированный для зацепления второй части контейнера для образцов с целью передачи реагента из объема реагента в реакционный объем, где элемент активации подвижно соединен с элементом удержания; и
привод, сконфигурированный для перемещения элемента активации относительно элемента удержания между первым положением, вторым положением и третьим положением, где элемент удержания сконфигурирован с размещением на расстоянии от первой части контейнера для образцов, когда элемент активации находится в первом положении, элемент активации сконфигурирован с размещением на расстоянии от второй части контейнера для образцов, и элемента удержания сконфигурирован для контактирования с первой частью контейнера для образцов, когда элемент активации находится во втором положении, элемент активации сконфигурирован для зацепления со второй частью контейнера для образцов с целью передачи реагента, и элемент удержания сконфигурирован для контактирования с первой частью контейнера для образцов, когда элемент активации находится в третьем положении.
60. Устройство по п. 59, в котором:
элемент активации сконфигурирован для перемещения в первом направлении; и
поверхность элемента активизации сконфигурирована для зацепления поверхности элемента удержания таким образом, чтобы элемента удержания перемещался во втором направлении, отличающемся от первого направления, когда элемент активации перемещается.
61. Устройство по п. 59, в котором:
элемент активации сконфигурирован для перемещения в первом направление из первого положения во второе положение; и
элемент удержания сконфигурирован для вращения, когда элемент активации перемещается из первого положения во второе положение.
62. Устройство по п. 59, дополнительно содержащее:
смещающий элемент,
поверхность элемента активации в контакте с поверхностью элемента удержания для поддержания элемента удержания на расстоянии от первой части контейнера для образцов, когда элемент активации находится в первом положении,
поверхность элемента активации, находящуюся на расстоянии от поверхности элемента удержания таким образом, что смещающий элемент приводит элемент удержания в контакт с первой частью контейнера для образцов, когда элемент активации находится во втором положении.
63. Устройство по п. 59, в котором:
первая часть контейнера для образцов представляет собой ближнюю концевую часть; и
элемент удержания содержит первое захватное устройство и второе захватное устройство, где первое захватное устройство сконфигурировано для вхождения в контакт с первой стороной ближней концевой части, и второе захватное устройство сконфигурировано для вхождения в контакт со второй стороной дальней концевой части, когда элемент активации находится во втором положении и третьем положении.
64. Устройство по п. 59, в котором:
элемент удержания содержит первое захватное устройство и второе захватное устройство, где первая часть контейнера для образцов размещена между и находится в контакте с первым захватным устройством и вторым захватным устройством, когда элемент активации находится во втором положении и третьем положении.
65. Устройство по п. 59, в котором элемент активации содержит блок плунжера, сконфигурированный для перемещения в пределах объема реагента, когда элемент активации перемещается из второго положения в третье положение.
66. Устройство по п. 59, в котором элемент активации является первым элементом активации, реагент является первым реагентом, объем реагента является первым объемом реагента, где устройство также содержит:
второй элемент активации, сконфигурированный для зацепления третьей части контейнера для образцов с целью передачи второго реагента из второго объема реагента контейнера для образцов в реакционный объем, где второй элемент активации подвижно соединен с первым элементом активации, второй элемент активации сконфигурирован для контактирования с третьей частью контейнера для образцов, когда первый элемент активации находится в первом положении, и второй элемент активации сконфигурирован для размещения на расстоянии от третьей части контейнера для образцов, когда элемент активации находится в третьем положении.
67. Устройство по п. 66, в котором по меньшей мере, часть второго элемента активации размещена с возможностью перемещения в пределах первого элемента активации.
68. Устройство, содержащее:
узел удержания, содержащий первое захватное устройство, второе захватное устройство и смещающий элемент, где первое захватное устройство и второе захватное устройство, сконфигурированы для вхождения в контакт с первой частью контейнера для образцов с целью ограничения перемещения контейнера для образцов, где контейнер для образцов задает реакционный объем и объем реагента;
элемент активации, сконфигурированный для зацепления второй часть контейнера для образцов с целью передачи реагента из объема реагента в реакционный объем, где элемент активации, соединен с возможностью движения с узлом удержания; и
привод, сконфигурированный для перемещения элемента активации относительно узла удержания между первым положением и вторым положением, где поверхность элемента активации находится в контакте с поверхностью узла удержания, чтобы поддерживать первое захватное устройство и второе захватное устройство в открытой конфигурации, когда элемент активации находится в первом положении, и поверхность элемента активации находится на расстоянии от поверхности узла удержания таким образом, чтобы смещающий элемент приводил первое захватное устройство и второе захватное устройство в закрытую конфигурацию, когда элемент активации находится во втором положении, где блок плунжера элемента активации сконфигурирован для перемещения в пределах объема реагента, когда элемент активации перемещается в направлении второго положения.
69. Устройство по п. 68, в котором:
элемент активации сконфигурирован для перемещения в первом направлении из первого положения во второе положение; и
первое захватное устройство перемещается во втором направлении, отличающемся от первого направления, когда элемент активации перемещается.
70. Устройство по п. 68, в котором:
элемент активации сконфигурирован для перемещения в первом направлении из первого положения во второе положение; и
первое захватное устройство сконфигурировано для вращения, когда элемент активации перемещается из первого положения во второе положение.
71. Устройство по п. 68, в котором элемент активации является первым элементом активации, реагент является первым реагентом, объем реагента является первым объемом реагента, где устройство также содержит:
второй элемент активации, сконфигурированный для зацепления третьей части контейнера для образцов с целью передачи второго реагента из второго объема реагента контейнера для образцов в реакционный объем, где второй элемент активации соединен с возможностью движения с первым элементом активации, второй элемент активации сконфигурирован для контактирования с третьей частью контейнера для образцов, когда первый элемент активации находится в первом положении, и второй элемент активации находится на расстоянии от третьей части контейнера для образцов, когда элемент активации находится во втором положении.
72. Устройство по п. 68, в котором по меньшей мере, часть второго элемента активации размещена с возможностью перемещения в пределах первого элемента активации.
73. Устройство, содержащее:
корпус, задающий канал, сконфигурированный для приема контейнера для образцов, где корпус задает объем обнаружения, сконфигурированный для помещения канала во взаимодействие с детектором, и корпус содержит первую уплотняющую поверхность и вторую уплотняющую поверхность, где первая часть контейнера для образцов и первая уплотняющая поверхность сконфигурированы для изолирования объема обнаружения от объема за пределами корпуса, когда вторая часть контейнера для образцов размещена в пределах объема обнаружения; и
заслонку, имеющую часть, размещенную с возможностью перемещения в пределах корпуса между первым положением заслонки и вторым положением заслонки, где уплотняющая поверхность заслонки и вторая уплотняющая поверхность сконфигурированы для изолирования объема обнаружения от канала корпуса, когда заслонка находится в первом положении заслонки, где канал корпуса находится во взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки.
74. Устройство по п. 73, в котором первая уплотняющая поверхность содержит уплотнительную прокладку.
75. Устройство по п. 73, в котором заслонка находится в первом положении заслонки, когда вторая концевая часть контейнера для образцов находится в пределах канала за пределами объема обнаружения, и заслонка находится во втором положении заслонки, когда вторая концевая часть контейнера для образцов находится в пределах объема обнаружения.
76. Устройство по п. 73, в котором заслонка содержит поверхность активизации, сконфигурированную для зацепления второй части контейнера для образцов с целью перемещения заслонки из первого положения заслонки во второе положение заслонки.
77. Устройство по п. 73, в котором заслонка содержит уклон, сконфигурированный для зацепления второй части контейнера для образцов, когда вторая часть контейнера для образцов перемещается в пределах канала к объему обнаружения с целью перемещения заслонки во второе положение заслонки.
78. Устройство по п. 73, в котором заслонка сконфигурирована для поступательного перемещения в пределах корпуса в направлении, смещенном относительно продольной оси канала.
79. Устройство по п. 73, дополнительно содержащее:
смещающий элемент, сконфигурированный для перевода заслонки в первое положение заслонки.
80. Устройство по п. 73, в котором заслонка задает калибровочный разъем, сконфигурированный для приема калибровочного источника света, где калибровочный разъем находится во взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится в первом положении заслонки, и калибровочный разъем изолирован от объема обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки.
81. Устройство, содержащее:
корпус, задающий канал, сконфигурированный для приема контейнера для образцов, где корпус задает объем обнаружения, сконфигурированный для помещения канала во взаимодействие с детектором, и корпус содержит уплотняющую поверхность; и
заслонку, имеющую часть, расположенную с возможностью перемещения в пределах корпуса между первым положением заслонки и вторым положением заслонки, где заслонка содержит уплотняющую поверхность и блок активизации, где блок активизации сконфигурирован для зацепления дальней концевой части контейнера для образцов с целью перемещения заслонки из первого положения заслонки во второе положение заслонки, когда дальняя концевая часть контейнера перемещается в направлении объема обнаружения, и уплотняющая поверхность заслонки и уплотняющая поверхность корпуса сконфигурированы для изолирования объема обнаружения от канала корпуса, когда заслонка находится в первом положении заслонки, где канал корпуса находится во взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки.
82. Устройство по п. 81, в котором:
уплотняющая поверхность корпуса является дальней уплотняющей поверхностью, и корпус задает ближнюю уплотняющую поверхность; и
ближняя концевая часть контейнера для образцов и ближняя уплотняющая поверхность сконфигурированы для изолирования объема обнаружения от объема за пределами корпуса, когда дальняя концевая часть контейнера для образцов размещена в пределах объема обнаружения.
83. Устройство по п. 81, в котором заслонка сконфигурирована для поступательного перемещения в пределах корпуса в направлении, смещенном относительно продольной оси канала.
84. Устройство по п. 81, дополнительно содержащий:
смещающий элемент, сконфигурированный для перевода заслонки в первое положение заслонки.
85. Устройство по п. 81, в котором заслонка задает калибровочный разъем, сконфигурированный для приема калибровочного источника света, где калибровочный разъем находится во взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится в первом положении заслонки, и калибровочный разъем изолирован от объема обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки.
86. Устройство, содержащее:
корпус, задающий канал, сконфигурированный для приема контейнера для образцов, где корпус задает объем обнаружения, сконфигурированный для помещения канала во взаимодействие с детектором, и корпус содержит уплотняющую поверхность; и
заслонку, задающую калибровочный разъем, сконфигурированный для приема калибровочного источника света, где заслонка размещена с возможностью перемещения в пределах корпуса между первым положением заслонки и вторым положением заслонки, где уплотняющая поверхность заслонки и уплотняющая поверхность корпуса сконфигурированы для изолирования объема обнаружения от канала корпуса, когда заслонка находится в первом положении заслонки, где калибровочный разъем находится во взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится в первом положении заслонки, и канал корпуса находится во взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки, и калибровочный разъем изолирован от объема обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки.
87. Устройство по п. 86, в котором:
уплотняющая поверхность корпуса является дальней уплотняющей поверхностью, и корпус задает ближнюю уплотняющую поверхность; и
ближняя концевая часть контейнера для образцов и ближняя уплотняющая поверхность сконфигурированы для изолирования объема обнаружения от объема за пределами корпуса, когда дальняя концевая часть контейнера для образцов размещена в пределах объема обнаружения.
88. Устройство по п. 86, в котором заслонка содержит поверхность активизации, сконфигурированную для зацепления дальней концевой части контейнера для образцов с целью перемещения заслонки из первого положения заслонки во второе положение заслонки, когда дальняя концевая часть контейнера перемещается в направлении объема обнаружения.
89. Устройство по п. 86, в котором заслонка сконфигурирована для поступательного перемещения в пределах корпуса в направлении, смещенном относительно продольной оси канала.
90. Способ, включающий:
прием первого сигнала, ассоциированного связывалось с амплитудой светового излучения в объеме обнаружения, в первый раз, где объем обнаружения оптически изолирован от канала подвижной заслонкой, и заслонка расположена в первом положении;
приложение силы к контейнеру для образцов, по меньшей мере, частично размещенному в пределах канала, таким образом, что дальняя концевая часть контейнера для образцов перемещает заслонку из первого положения во второе положение, и дальняя концевая часть контейнера для образцов размещена в пределах объема обнаружения, где канал находится в оптическом взаимодействии с объемом обнаружения, когда заслонка находится во втором положении заслонки; и
прием, когда дальняя концевая часть контейнера для образцов находится в объеме обнаружения, второго сигнала, ассоциированного с амплитудой светового излучения в объеме обнаружения, во второй раз.
91. Способ по п. 90, дополнительно включающий:
передачу излучения света в объем обнаружения через световой канал, заданный заслонкой, когда заслонка находится в первом положении.
92. Способ по п. 90, дополнительно включающий:
передачу, перед приемом второго сигнала, реагента в дальнюю концевую часть контейнера для образцов, где реагент разработан для реагирования с образцом в дальней концевой части контейнера для образцов с целью выдачи излучения света.
