Пептид, полученный из mphosph1, и включающая его вакцина - RU2018116623A
Код документа: RU2018116623A
Формула
1. Пептид, содержащий менее чем 15 аминокислот, со способностью индуцировать цитотоксическую T-клетку (ЦТЛ), который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из:
аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 12, 27, 52, 53, 118, 119 и 170; и
аминокислотной последовательности, в которой одна, две или несколько аминокислот замещены, удалены, вставлены и/или добавлены к аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 12, 27, 52, 53, 118, 119 и 170.
2. Пептид по п. 1, который выбран из группы, состоящей из нижеизложенных от (i) до (ii):
пептид, содержащий аминокислотную последовательность с одной или несколькими заменами, выбранными из группы, состоящей из нижеизложенных от (a) до (с), введенных в аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 12, 27, 52 и 53:
вторая аминокислота с N-конца замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из треонина, валина, изолейцина, лейцина, фенилаланина и тирозина;
третья аминокислота с N-конца замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из лейцина, фенилаланина, тирозина, изолейцина и аланина; и
седьмая аминокислота с N-конца замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из лейцина, изолейцина, тирозина, валина и фенилаланина; и
C-концевая аминокислота замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из лизина и аргинина;
(ii) пептид, содержащий аминокислотную последовательность, в которой одна или несколько замен, выбранных из группы, состоящей из нижеизложенных от (a) до (c), введены в аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 118,119 и 170:
первая аминокислота с N-конца замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из аспарагиновой кислоты и глутаминовой кислоты;
вторая аминокислота с N-конца замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из фенилаланина, тирозина, аланина, изолейцина, лейцина и валина; и
C-концевая аминокислота замещена аминокислотой, выбранной из группы, состоящей из аргинина и лизина.
3. Пептид по п. 1, который состоит из аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 5, 12, 27, 52, 53, 118, 119 и 170.
4. Полинуклеотид, который кодирует пептид по любому из пп. 1-3.
5. Композиция, содержащая фармацевтически приемлемый носитель и, по меньшей мере, один ингредиент, выбранный из группы, состоящей из нижеизложенных от (a) до (e):
один или несколько типов пептидов по любому из пп. 1-3;
один или несколько типов полинуклеотидов, кодирующих пептид(-ы) по любому из пп. 1-3 в экспрессируемой форме;
антигенпрезентирующая клетка (АПК), которая презентирует на своей клеточной поверхности комплекс из пептида по любому из пп. 1-3 и антигена HLA;
экзосома, которая презентирует на своей поверхности комплекс из пептида по любому из пп. с 1 до 3 и антигена HLA; и
ЦТЛ, который нацелен на пептид по любому из пп. 1-3.
6. Композиция по п. 5, которая является композицией для индуцирования ЦТЛ, где ингредиент представляет собой, по меньшей мере, один ингредиент, выбранный из группы, состоящей из нижеизложенных от (a) до (d):
один или несколько типов пептидов по любому из пп. 1-3;
один или несколько типов полинуклеотидов, кодирующих пептид(-ы) по любому из пп. пп. 1-3 в экспрессируемой форме;
антигенпрезентирующая клетка (АПК), которая презентирует на своей клеточной поверхности комплекс из пептида по любому из пп. пп. 1-3 и антигена HLA;
экзосома, которая презентирует на своей поверхности комплекс из пептида по любому из пп. пп. 1-3 и антигена HLA.
7. Композиция по п. 5, которая является фармацевтической композицией.
8. Композиция по п. 7, которая предназначена для одного или нескольких применений, выбранных из группы, состоящей из (i) лечения злокачественных опухолей, (ii) предупреждения (профилактики) злокачественной опухоли и (iii) предупреждения (профилактики) послеоперационного рецидива злокачественной опухоли.
9. Композиция по п. 7, которая предназначена для индуцирования иммунного ответа против злокачественной опухоли.
10. Композиция по п. 8 или 9, где злокачественная опухоль выбрана из группы, состоящей из рака мочевого пузыря, рака молочной железы, рака шейки матки, холангиоцеллюлярного рака, хронического миелолейкоза (ХМЛ), рака толстого кишечника, рака желудка, рака легких, лимфомы, остеосаркомы, рака предстательной железы, рака почки и опухоли мягких тканей.
11. Композиция по любому из пп. 5-10, которую формулируют для введения индивидууму, положительному, по меньшей мере, по одному HLA, выбранному из группы, состоящей из HLA-A11, и HLA-A33.
12. Способ индуцирования АПК со способностью индуцировать ЦТЛ, который включает этап, выбранный из группы, состоящей из:
контакта АПК с пептидом по любому из пп. 1-3 in vitro, ex vivo или in vivo; и
введения полинуклеотида, кодирующего пептид по любому из пп. 1-3, в АПК.
13. Способ индуцирования ЦТЛ, который включает этап, выбранный из группы, состоящей из:
совместного культивирования CD8-положительной T-клетки/клеток с АПК, которые презентируют на своей поверхности комплекс из антигена HLA и пептида по любому из пп. 1-3;
совместного культивирования CD8-положительной T-клетки/клеток с экзосомой/экзосомами, которые презентируют на своей поверхности комплекс из антигена HLA и пептида по любому из пп. 1-3; и
введение в CD8-положительную T-клетку/клетки полинуклеотида, кодирующего каждую субъединицу T-клеточного рецептора (TCR), способного связываться с пептидом по любому из пп. 1-3, презентированным при помощи антигена HLA на клеточной поверхности.
14. АПК, которая презентирует на своей поверхности комплекс из антигена HLA и пептида по любому из пп. 1-3.
15. АПК по п. 14, которая индуцирована при помощи способа по п. 12.
16. ЦТЛ, которая нацелена на пептид по любому из пп. 1-3.
17. ЦТЛ по п. 16, которая индуцирована при помощи способа по п. 13.
18. Способ индуцирования иммунного ответа против злокачественной опухоли, который включает введение индивидууму, по меньшей мере, одного ингредиента, выбранного из группы, состоящей из нижеизложенных с (a) по (e):
один или несколько типов пептидов по любому из пп. с 1 до 3;
один или несколько типов полинуклеотидов, кодирующих пептид(-ы) по любому из пп. 1-3 в экспрессируемой форме;
антигенпрезентирующая клетка (АПК), которая презентирует на своей клеточной поверхности комплекс из пептида по любому из пп. с 1 до 3 и антигена HLA;
экзосома, которая презентирует на своей поверхности комплекс из пептида по любому из пп. 1-3 и антигена HLA; и
ЦТЛ, который нацелен на пептид по любому из пп. 1-3.
19. Способ лечения и/или профилактики злокачественной опухоли, и/или профилактики ее послеоперационного рецидива, который включает введение индивидууму, по меньшей мере, одного ингредиента, выбранного из группы, состоящей из нижеизложенных пп. с (a) по (e):
один или несколько типов пептидов по любому из пп. 1-3;
один или несколько типов полинуклеотидов, кодирующих пептид(-ы) по любому из пп. 1-3 в экспрессируемой форме;
антигенпрезентирующая клетка (АПК), которая презентирует на своей клеточной поверхности комплекс из пептида по любому пп. 1-3 и антигена HLA;
экзосома, которая презентирует на своей поверхности комплекс из пептида по любому из пп. 1-3 и антигена HLA; и
ЦТЛ, который нацелен на пептид по любому из пп. 1-3.
20. Антитело, которое связывается с пептидом по любому из пп. 1-3.
21. Способ скрининга на пептид со способностью индуцировать ЦТЛ, который включает этапы:
создания кандидатных последовательностей, состоящих из аминокислотной последовательности, в которой один, два, или несколько аминокислотных остатков замещены, удалены, вставлены и/или добавлены по сравнению с исходной аминокислотной последовательностью, состоящей из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO: 5, 12, 27, 52, 53, 118, 119 и 170;
отбор в кандидатных последовательностях, полученных в (a), кандидатной последовательности, которая не имеет значительной гомологии (идентичности последовательности) с любым известным продуктом гена человека, за исключением MPHOSPH1;
контакт АПК с пептидом, состоящим из кандидатной последовательности, выбранной в (b);
контакт АПК из (c) с CD8-положительной T-клеткой; и
отбор пептида, который имеет равную или более высокую способность индуцировать ЦТЛ, по сравнению с пептидом, состоящим из исходной аминокислотной последовательности.
22. Эмульсия, содержащая один или несколько типов пептидов по любому из пп. 1-3, водорастворимый носитель и масляный адъювант.
23. Набор, включающий контейнер, который содержит композицию по любому из пп. 5-11, и контейнер, который содержит адъювант.
