Белки, связывающие десмоглеин 2 (dsg2), и их применение - RU2016110826A
Код документа: RU2016110826A
Формула
1. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3, содержащий:
a) один или более мотивов центрального домена полипептида фибриллы АВВ-2/3;
b) головной домен полипептида фибриллы АВВ-2/3, функционально связанный и расположенный в направлении С-конца по отношению к указанным одному или более мотивам центрального домена полипептида фибриллы АВВ-2/3, причем указанный головной домен полипептида фибриллы АВВ-2/3 содержит пептид в соответствии с любой из последовательностей, приведенных в SEQ ID NO: 1-11; и
c) один или более доменов димеризации, полученных не из вируса АВВ-2/3, функционально связанных и расположенных в направлении N-конца по отношению к указанным одному или более мотивам центрального домена полипептида фибриллы АВВ-2/3.
2. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 1, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 не содержит хвостового домена полипептида фибриллы АВВ-2/3.
3. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 1, отличающийся тем, что каждый мотив центрального домена выбран из группы, состоящей из мотива центрального домена полипептида фибриллы AB3, мотива центрального домена полипептида фибриллы AB7, мотива центрального домена полипептида фибриллы АВ11, мотива центрального домена полипептида фибриллы AB14, мотива центрального домена полипептида фибриллы АВ14а и их комбинаций.
4. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что указанные один или более мотивов центрального домена содержат 1-22 мотива центрального домена.
5. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что каждый мотив центрального домена содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 43-48.
6. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что указанный домен димеризации содержит аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из EVSALEK (SEQ ID NO: 24) и/или KVSALKE (SEQ ID NO: 25).
7. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что указанные один или более мотивов центрального домена представляют собой мотив центрального домена, содержащий последовательность SEQ ID NO: 43.
8. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, содержащий аминокислотную последовательность
(а)
(M/)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSIALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELKYKQTADFSARGFMPSTTAYPFVLPNAGTHNENFIFGQCYYKASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 28);
(b)
(M/)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSIALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELEYKQTADSSARGFMPSTTAYPFVLPNAGTHNENYIFGQCYYKASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 29);
(c)
(M/-)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSIALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELKYKQTADFSARGFMPSTTAYPFVLPNAGTHNENYIFGQCYYKASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLSAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 30);
(d)
(M/-)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSLALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELKYKQTADFSARGFMPSTTAYPFDLPNAGTHNENYIFGQCYYKASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 31);
(e)
(M/-)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSIALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGLVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLEPKYKQTADFSARGFMPSTTAYPFVLPNAGTHNENYIFGQCYYEASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 32);
(f)
(M/-)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSIALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELKYKQTADLSARGFMPSTTAYPFVLPNAGTHNENYIFGQCYYKASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 33); и
(g)
(M/-)
GSKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEKVSALKEGSGGGSGGGSGGGSNSIALKNNTLWTGPKPEANCIIEYGKQNPDSKLTLILVKNGGIVNGYVTLMGASDYVNTLFKNKNVSINVELYFDATGHILPDSSSLKTDLELKYKQTADFSARGFMPSTTAYPFVLPNAGTHNGNYIFGQCYYEASDGALFPLEVTVMLNKRLPDSRTSYVMTFLWSLNAGLAPETTQATLITSPFTFSYIREDD (SEQ ID NO: 34).
9. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 содержит один мотив центрального домена полипептида фибриллы АВВ-2/3.
10. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 включает гомотример.
11. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 включает димер указанного гомотримера.
12. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-3, дополнительно содержащий одно или более соединений, конъюгированных с указанным рекомбинантным полипептидом фибриллы АВВ-2/3.
13. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 12, отличающийся тем, что указанные одно или более соединений выбраны из группы, состоящей из терапевтических, диагностических и агентов для визуализации.
14. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 13, отличающийся тем, что указанные одно или более соединений содержат по меньшей мере один терапевтический агент, причем указанный терапевтический агент выбран из группы, состоящей из антител, иммуноконъюгатов, наночастиц, химиотерапевтических агентов, радиоактивных частиц, вирусов, вакцин, клеточных иммунотерапевтических агентов, конструкций для генной терапии, терапевтических агентов на основе нуклеиновых кислот, и их комбинаций.
15. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 5, отличающийся тем, что указанный домен димеризации содержит последовательность аминокислот, выбранную из групп, состоящей из EVSALEK (SEQ ID NO: 24) и/или KVSALKE (SEQ ID NO: 25).
16. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 5, отличающийся тем, что указанные один или более мотивов центрального домена представляют собой мотивы центрального домена с последовательностью SEQ ID NO: 43.
17. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 5, включающий аминокислотную последовательность полипептида, выбранного из группы, состоящей из SEQ ID NOS: 28-34.
18. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 15 и 16, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 содержит один мотив центрального домена полипептида фибриллы АВВ-2/3.
19. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 15-17, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 включает гомотример.
20. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 19, отличающийся тем, что указанный полипептид фибриллы АВВ-2/3 включает димер указанного гомотримера.
21. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 5, дополнительно содержащий одно или более соединений, конъюгированных с указанным рекомбинантным полипептидом фибриллы АВВ-2/3.
22. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 20, дополнительно содержащий одно или более соединений, конъюгированных с указанным рекомбинантным полипептидом фибриллы АВВ-2/3
23. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 21 или 22, отличающийся тем, что указанные одно или более соединений выбраны из группы, состоящей из терапевтических, диагностических и агентов для визуализации.
24. Рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по п. 23, отличающийся тем, что указанные одно или более соединений содержат по меньшей мере один терапевтический агент, причем указанный терапевтический агент выбран из группы, состоящей из антител, иммуноконъюгатов, наночастиц, химиотерапевтических агентов, радиоактивных частиц, вирусов, вакцин, клеточных иммунотерапевтических агентов, конструкций для генной терапии, терапевтических агентов на основе нуклеиновых кислот, и их комбинаций.
25. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая указанный рекомбинантный полипептид фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 1-20.
26. Рекомбинантный вектор экспрессии, содержащий выделенную нуклеиновую кислоту по п. 25.
27. Клетка-хозяин, содержащая рекомбинантный вектор экспрессии по п. 26.
28. Фармацевтическая композиция, содержащая
а) мультимер фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10-14 или 19-24; и
фармацевтически приемлемый носитель.
29. Способ увеличения эффективности терапевтического лечения или диагностики заболевания, связанного с эпителиальной тканью, и/или визуализации эпителиальных тканей, включающий введение субъекту, нуждающемуся в этом:
а) одного или более терапевтических агентов в количестве, которое достаточно для лечения указанного заболевания, диагностического агента в количестве, которое достаточно для диагностики указанного заболевания, и/или агента для визуализации в количестве, которое достаточно для визуализации эпителиальной ткани; и
b) мультимера фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10-14 или 19-24, или его функционального эквивалента, или фармацевтической композиции по п. 28 в количестве, которое достаточно для увеличения эффективности указанных одного или более терапевтических, диагностических и/или агентов для визуализации.
30. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанное заболевания, связанное с эпителиальной тканью, выбрано из группы, состоящей из солидных опухолей, синдрома раздраженного кишечника, воспалительного заболевания кишечника, болезни Крона, неспецифического язвенного колита, запора, гастроэзофагеальной рефлюксной болезни, пищевода Барретта, хронического обструктивной болезни легких, астмы, бронхита, эмфиземы легких, кистозного фиброза, интерстициальной болезни легких, пневмонии, первичной легочной гипертензии, легочной эмболии, легочного саркоидоза, туберкулеза, панкреатита, заболеваний протоков поджелудочной железы, непроходимости желчных путей, холецистита, холедохолитиаза, заболеваний головного мозга, псориаза, дерматита, гломерулонефрита, гепатита, сахарного диабета, заболеваний щитовидной железы, целлюлита, инфекции, пиелонефрита и камней в желчном пузыре.
31. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанное заболевания, связанное с эпителиальной тканью, представляет собой солидную опухоль.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что указанная солидная опухоль выбрана из группы, состоящей из опухолей молочной железы, опухолей легких, опухолей толстой кишки, опухолей прямой кишки, опухолей желудка, опухолей предстательной железы, опухолей яичников, опухолей матки, опухолей кожи, эндокринных опухолей, опухолей шейки матки, опухолей почек, меланом, опухолей поджелудочной железы, опухолей печени, опухолей головного мозга, опухолей головы и шеи, опухолей носоглотки, опухолей желудка, плоскоклеточных карцином, аденокарцином, опухолей мочевого пузыря и опухолей пищевода.
33. Способ по любому из пп. 29-32, отличающийся тем, что указанный мультимер фибриллы АВВ-2/3 выбран из группы, состоящей из вирионов АВВ-2/3, капсидов АВВ-2/3, додекаэдрических частиц АВВ-2/3 (PtDd), рекомбинантных мультимеров фибриллы АВВ-2/3 и их функциональных эквивалентов.
34. Способ по любому из пп. 29-32, отличающийся тем, что одно или более соединений включают по меньшей мере один терапевтический агент, при этом указанный терапевтический агент выбран из группы, состоящей из антител, иммуноконъюгатов, вирусов, наночастиц, химиотерапевтических агентов, радиоактивной частицы, вакцин, клеточных иммунотерапевтических агентов, конструкций для генной терапии, терапевтических агентов на основе нуклеиновых кислот, и их комбинаций.
35. Способ по п. 33, отличающийся тем, что одно или более соединений включают по меньшей мере один терапевтический агент, при этом указанный терапевтический агент выбран из группы, состоящей из антител, иммуноконъюгатов, вирусов, наночастиц, химиотерапевтических агентов, радиоактивной частицы, вакцин, клеточных иммунотерапевтических агентов, конструкций для генной терапии, терапевтических агентов на основе нуклеиновых кислот, и их комбинаций.
36. Способ по любому из пп. 29-32, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает химиотерапевтический агент или моноклональное антитело.
37. Способ по п. 35, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает химиотерапевтический агент или моноклональное антитело.
38. Способ по любому из пп. 29-32, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает противоопухолевое моноклональное антитело.
39. Способ по п. 38, отличающийся тем, что указанное противоопухолевое моноклональное антитело включает антитело, выбранное из группы, состоящей из трастузумаба, цетумиксимаба, петузумаба, апомаба, конатумумаба, лексатумумаба, бевацизумаба, деносумаба, занолимумаба, линтузумаба, эдреколомаба, ритуксимаба, тицилимумаба, тозитумомаба, алемтузумаба, эпратузумаба, митумомаба, гемтузумаба озогамицина, ореговомаба, пемтумомаба, даклизумаба, панитумумаба, катумаксомаба, офатумумаба и ибритумомаба.
40. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанное заболевание, связанное с эпителиальной тканью, включает HER-2-положительную опухоль.
41. Способ по п. 40, отличающийся тем, что указанная HER-2-положительная опухоль выбрана из группы, состоящей из опухоли молочной железы, опухоли желудка, опухоли толстой кишки и опухоли яичников.
42. Способ по п. 40 или 41, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает трастузумаб.
43. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает химиотерапевтический агент, облучение или их комбинации.
44. Способ по любому из пп. 40 и 41, отличающийся тем, что указанный субъект не отвечает на терапию трастузумабом.
45. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанное заболевание, связанное с эпителиальной тканью, включает EGFR-положительную опухоль.
46. Способ по п. 45, отличающийся тем, что указанная EGFR-положительная опухоль выбрана из группы, состоящей из опухоли легкого, опухоли толстой кишки, опухоли молочной железы, опухоли прямой кишки, опухоли головы и шеи и опухоли поджелудочной железы.
47. Способ по любому из пп. 45 или 46, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает цетуксимаб.
48. Способ по п. 29, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает ингибитор VEGF.
49. Способ по любому из пп. 45-46, отличающийся тем, что указанный терапевтический агент включает химиотерапевтический агент, облучение или их комбинации.
50. Способ по любому из пп. 45-46, отличающийся тем, что указанный субъект не отвечает на терапию цетуксимабом.
51. Способ лечения заболевания, связанного с эпителиальной тканью, включающий введение субъекту, нуждающемуся в этом, такого количества мультимера фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10-14 или пп. 19-24, или его функционального эквивалента, или фармацевтической композиции по п. 28, которое будет достаточно для лечения указанного заболевания.
52. Способ по п. 51, отличающийся тем, что указанное заболевание представляет собой вирусную инфекцию АВВ-2/3 или солидную опухоль.
53. Способ по п. 52, отличающийся тем, что указанное заболевание представляет собой солидную опухоль, выбранную из группы, состоящей из опухолей молочной железы, опухолей легких, опухолей толстой кишки, опухолей прямой кишки, опухолей желудка, опухолей предстательной железы, опухолей яичников, опухолей матки, опухолей кожи, эндокринных опухолей, опухолей шейки матки, опухолей почек, опухолей поджелудочной железы, меланом, опухолей печени, опухолей головного мозга, опухолей головы и шеи, опухолей носоглотки, опухолей желудка, плоскоклеточных карцином, аденокарцином, опухолей мочевого пузыря и опухолей пищевода.
54. Способ улучшения доставки соединения к эпителиальной ткани, включающий приведение указанной эпителиальной ткани в контакт с:
а) одним или более соединениями, которые необходимо доставить к указанной эпителиальной ткани; и
b) таким количеством мультимера фибриллы АВВ-2/3 любому из пп. 10-14 или 19-24, или его функционального эквивалента, или фармацевтической композиции по п. 28, которое достаточно для улучшения доставки одного или более указанных соединений к указанной эпителиальной ткани.
55. Способ по п. 54, отличающийся тем, что одно или более указанных соединений содержат диагностический агент или агент для визуализации.
56. Способ по п. 54 или 55, отличающийся тем, что указанная эпителиальная ткань содержит солидную опухоль.
57. Способ по п. 56, отличающийся тем, что указанная солидная опухоль выбрана из группы, состоящей из опухолей молочной железы, опухолей легких, опухолей толстой кишки, опухолей прямой кишки, опухолей желудка, опухолей предстательной железы, опухолей яичников, опухолей матки, опухолей кожи, эндокринных опухолей, опухолей шейки матки, опухолей почек, опухолей поджелудочной железы, меланом, опухолей печени, опухолей головного мозга, опухолей головы и шеи, опухолей носоглотки, опухолей желудка, плоскоклеточных карцином, аденокарцином, опухолей мочевого пузыря и опухолей пищевода.
58. Способ улучшения доставки вещества к ткани, экспрессирующей десмоглеин 2 (DSG2), включающий приведение указанной ткани, экспрессирующей DSG2, в контакт с:
a) одним или более соединениями, которые необходимо доставить к указанной ткани; и
b) таким количеством мультимера фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10-14 или 19-24, или его функционального эквивалента, или фармацевтической композиции по п. 28, которое будет достаточно для улучшения доставки одного или более указанных соединений к указанной ткани.
59. Способ индукции эпителиально-мезенхимального перехода (ЭМП) в ткани, включающий приведение указанной эпителиальной ткани в контакт с таким количеством мультимера фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10-14 или пп. 19-24, или его функционального эквивалента, или фармацевтической композиции по п. 28, которое достаточно для индукции ЭМП.
60. Способ выявления соединений-кандидатов для одного или более из: лечения заболевания, связанного с эпителиальной тканью, улучшения доставки вещества к эпителиальной ткани, улучшения доставки вещества к ткани, экспрессирующей DSG2, индукции ЭМП в ткани, и/или лечения инфекции АВВ-2/3, включающий:
a) приведение мультимера фибриллы АВВ-2/3 по любому из пп. 10-14 или 19-24, или его функционального эквивалента, в контакт с DSG2 при условиях, которые способствуют связыванию мультимеров с DSG2, при этом указанное приведение в контакт осуществляют в присутствии одного или более испытываемых соединений; и
b) выявление положительных испытываемых соединений, которые конкурируют с указанным мультимером фибриллы АВВ-2/3 за связывание с DSG2 по сравнению с контролем;
причем положительные испытываемые соединения являются соединениями-кандидатами для одного или более из следующих: лечения заболевания, связанного с эпителиальной тканью, улучшения доставки вещества к эпителиальной ткани, улучшения доставки вещества к ткани, экспрессирующей DSG2, индукции ЭМП в ткани и/или лечения инфекции АВВ-2/3.
61. Фармацевтическая композиция по п. 28, дополнительно содержащая один или более терапевтических агентов в количестве, которого достаточно для лечения заболевания, связанного с эпителиальной тканью, диагностический агент в количестве, которого достаточно для диагностики заболевания, связанного с эпителиальной тканью, и/или агент для визуализации в количестве, которого достаточно для визуализации эпителиальной ткани.
