Иммунотерапия полиомавирусов - RU2019110269A
Код документа: RU2019110269A
Формула
1. Выделенный белок, содержащий один или более из эпитопов, приведенных в таблицах 1-3.
2. Выделенный белок по п. 1, где один или более эпитопов содержат эпитоп вируса BK (BKV), приведенный в таблице 1, один или более эпитопов содержат эпитоп вируса JC (JCV), приведенный в таблице 2, или один или более эпитопов содержат гибридный эпитоп, приведенный в таблице 3.
3. Выделенный белок по п. 1 или 2, где пептид содержит множество эпитопов, приведенных в таблицах 1-3.
4. Выделенный белок по п. 3, где множество эпитопов содержит эпитоп BKV, приведенный в таблице 1, и эпитоп JCV, приведенный в таблице 2.
5. Выделенный белок по любому из пп. 1-4, где белок способен вызывать иммунный ответ после введения индивидууму.
6. Выделенный белок по любому из пп. 1-5, где эпитопы имеют рестрикцию по HLA класса I по HLA-A1, -A2, -A3, -A11, -A23, -A24, -A26, -A29, - A30, -B7, -B8, -B27, - B35, -B38, -B40, -B41, -B44, -B51, -B56, -B57 или -B58.
7. Выделенный белок по любому из пп. 1-6, где эпитопы имеют рестрикцию по HLA класса II по HLA-DP, -DM, -DOA, -DOB, -DQ, -DRB, или -DQB, или -DR.
8. Выделенный белок по любому из пп. 1-7, где выделенный белок содержит аминокислотные последовательности эпитопов, приведенные в SEQ ID NO: 5, 6, 36, 41 и 42.
9. Выделенный белок по любому из пп. 1-8, где выделенный белок дополнительно содержит один или более эпитопов вируса клеток Меркеля (MCV).
10. Выделенный белок по любому из пп. 1-9, дополнительно содержащий один или более эпитопов не из полиомавируса, таких как один или более эпитопов из аденовируса (ADV), вируса Эпштейна-Барр (EBV) или цитомегаловируса (CMV).
11. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая выделенный белок по любому из пп. 1-10.
12. Фармацевтическая композиция, содержащая выделенный белок по любому из пп. 1-10 или выделенную нуклеиновую кислоту по п. 11 и фармацевтически приемлемый носитель.
13. Способ лечения или профилактики полиомавирусной инфекции или полиомавирус-ассоциированного злокачественного новообразования у индивидуума, включающий введение индивидууму фармацевтической композиции по п. 12.
14. Способ по п. 13, где полиомавирус является BKV, JCV или MCV.
15. Способ выращивания BK вирус-специфических T-лимфоцитов для адоптивной иммунотерапии, включающий:
(i) приведение одной или нескольких клеток, выделенных из индивидуума, в контакт с выделенным белком по любому из пп. 1-10; и
(ii) культивирование одной или нескольких клеток в таких условиях, что вирус BK-специфические T-лимфоциты выращивают из указанной одной или нескольких клеток.
16. Способ выращивания JC вирус-специфических T-лимфоцитов для адоптивной иммунотерапии, включающий:
(i) приведение одной или нескольких клеток, выделенных из индивидуума, в контакт с выделенным белком по любому из пп. 1-10; и
(ii) культивирование одной или нескольких клеток в таких условиях, что вирус JC-специфические T-лимфоциты выращивают из указанной одной или нескольких клеток.
17. Способ лечения или профилактики полиомавирусной инфекции или злокачественного новообразования у индивидуума, включающий введение индивидууму выращенных T-лимфоцитов по п. 15 или 16.
18. Способ по п. 17, где полиомавирус является вирусом BKV вирусом JCV или вирусом MCV.
19. Способ лечения или профилактики злокачественного новообразования у индивидуума, включающий введение индивидууму фармацевтической композиции, содержащей цитотоксические T-клетки (CTL), содержащие T-клеточные рецепторы (TCR), распознающие один или более эпитопов, приведенных в таблицах 1-3.
20. Способ по п. 19, где злокачественное новообразование является полиомавирус-ассоциированным злокачественным новообразованием, таким как BK-ассоциированное злокачественное новообразование, JCV-ассоциированное злокачественное новообразование или MCV-ассоциированное злокачественное новообразование.
21. Способ лечения или профилактики полиомавирусной инфекции у индивидуума, включающий введение индивидууму фармацевтической композиции, содержащей цитотоксические T-клетки (CTL), содержащие T-клеточные рецепторы (TCR), распознающие один или более эпитопов, приведенных в таблицах 1-3.
22. Способ по п. 21, где полиомавирус является вирусом BK (BKV), вирусом JC (JCV) или вирусом клеток Меркеля (MCV).
23. Способ по любому из пп. 19-22, где TCR распознают эпитоп, общий для двух или более полиомавирусов.
24. Способ по п. 23, где общий эпитоп содержит область гомологии последовательности между по меньшей мере двумя полиомавирусами, и область гомологии последовательностей составляет по меньшей мере три аминокислоты по всей длине последовательности эпитопа.
25. Способ по п. 23 или 24, где два полиомавируса являются BKV и JCV.
26. Способ по любому из пп. 19-25, где по меньшей мере один из TCR распознает эпитоп VP1, эпитоп LTA или эпитоп STA из BKV или JCV.
27. Способ по любому из пп. 19-26, где CTL в совокупности содержат TCR, распознающие по меньшей мере два, по меньшей мере пять, по меньшей мере десять, по меньшей мере пятнадцать из эпитопов, приведенных в таблицах 1-3.
28. Способ по любому из пп. 19-27, где TCR в совокупности распознают эпитопы из по меньшей мере двух разных вирусов, трех разных вирусов, четырех разных вирусов, пяти разных вирусов.
29. Способ по любому из пп. 19-28, где TCR в совокупности распознают один или более эпитопов не из полиомавируса, например, эпитопы из аденовируса (ADV), вируса Эпштейна-Барр (EBV) или цитомегаловируса (CMV).
30. Способ по любому из пп. 19-29, где CTL являются аутологичными для индивидуума.
31. Способ по любому из пп. 19-29, где CTL не являются аутологичными для индивидуума.
