Объединение процессов хранения образцов и управление образцами в медико-биологических науках - RU2006139035A

Реферат

1. Устройство для хранения биологических образцов для одного или нескольких биологических образцов, содержащее:

(а) крышку;

(b) планшету для образцов, содержащую одну или несколько лунок для образцов, которая выполнена с возможностью содержания биологического образца, причем одна или несколько из указанных лунок содержат материал матрицы; и

(с) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции.

2. Устройство для хранения биологических образцов по п.1, в котором материал матрицы растворяется или диссоциирует в растворителе.

3. Устройство для хранения биологических образцов по п.1, которое содержит запорное средство для запирания крышки на планшете для образцов.

4. Устройство для хранения биологических образцов по п.3, в котором запорное средство содержит магнитный запорный элемент.

5. Устройство для хранения биологических образцов по п.1, которое содержит герметичную прокладку запорного элемента.

6. Устройство для хранения биологических образцов по п.1, содержащее герметичную прокладку запорного элемента вокруг каждой лунки.

7. Устройство для хранения биологических образцов по п.1, содержащее магнитный запорный элемент и герметичную прокладку запорного элемента вокруг каждой лунки.

8. Устройство для хранения биологических образцов по п.1, в котором материал матрицы выполнен с возможностью сухого хранения образца без охлаждения.

9. Устройство для хранения биологических образцов для одного или нескольких биологических образцов, содержащее:

(а) крышку;

(b) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которая выполнена с возможностью содержания биологического образца, причем одна или несколько из указанных лунок содержат материал матрицы, который растворяется или диссоциирует в растворителе; и

(с) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции.

10. Устройство для хранения биологических образцов по п.1 или 9, в котором, по меньшей мере, одна лунка содержит, по меньшей мере, один детектируемый индикатор.

11. Устройство для хранения биологических образцов по п.10, в котором детектируемый индикатор содержит колориметрический индикатор.

12. Устройство для хранения биологических образцов по п.10, в котором детектируемый индикатор выбирают из группы, состоящей из флуоресцентного индикатора, люминесцентного индикатора, фосфоресцентного индикатора, радиометрического индикатора, красителя, фермента, субстрата фермента, переносящей энергию молекулы и аффинной метки.

13. Устройство для хранения биологических образцов по п.10, в котором детектируемый индикатор выполнен с возможностью детектирования с указанием на наличие, по меньшей мере, одного из следующего: амина, спирта, альдегида, воды, тиола, сульфида, нитрита, авидина, биотина, иммуноглобулина, олигосахарида, нуклеиновой кислоты, полипептида, фермента, цитоскелетного белка, реакционно-способных видов кислорода, ионов металла, рН, Na⁺, K⁺, Cl^-, цианида, фосфата и селена.

14. Устройство для хранения биологических образцов по п.10, в котором детектируемый индикатор выбирают из группы, состоящей из фенолового красного, этидиум бромида, ДНК-полимеразы, рестрикционной эндонуклеазы, хлорида кобальта, красителя Рейхардта и флуорогенного субстрата протеаз.

15. Устройство для хранения биологических образцов по п.1 или 9, в котором, по меньшей мере, одна лунка содержит, по меньшей мере, один ингибитор, который представляет собой биологический ингибитор или биохимический ингибитор.

16. Устройство для хранения биологических образцов по п.15, в котором ингибитор выбирают из группы, состоящей из валидамицина A, TL-3, ортованадата натрия, фторида натрия, N-α-тозил-Phe-хлорметилкетона, N-α-тозил-Lys-хлорметилкетона, апротинина, фенилметилсульфонил фторида и диизопропил-фторфосфата.

17. Устройство для хранения биологических образцов по п.15, в котором ингибитор выбирают из группы, состоящей из ингибитора киназ, ингибитора фосфатаз, ингибитора каспаз, ингибитора гранзимов, ингибитора клеточной адгезии, ингибитора клеточного деления, ингибитора клеточного цикла, ингибитора сигнальных липидов и ингибитора протеаз.

18. Устройство для хранения биологических образцов по п.15, в котором ингибитор выбирают из группы, состоящей из восстановителя, алкилирующего агента и противомикробного агента.

19. Устройство для хранения биологических образцов по п.9, в котором материал матрицы выполнен с возможностью сухого хранения образца без охлаждения.

20. Устройство для хранения биологических образцов по п.9, в котором материал матрицы содержит поливиниловый спирт.

21. Устройство для хранения биологических образцов по п.9, в котором материал матрицы содержит, по меньшей мере, один материал, выбранный из группы, состоящей из полиэтиленгликоля, агарозы, поли-N-винилацетамида, поливинилпирролидона, поли(4-винилпиридина), полифениленоксида, сшитого акриламида, полиметакрилата, углеродной нанотрубки, полилактида, сополимера лактид/гликолид, сополимера гидроксиметакрилата, пектината кальция, гидроксипропилметилцеллюлозы ацетата сукцината, гепарин сульфат протеогликана, гиалуроновой кислоты, глюкуроновой кислоты, тромбоспондина-1 N-терминального гепаринсвязывающего домена, фибронектина, коньюгата белок/водорастворимый полимерный модификатор и коллагена.

22. Устройство для хранения биологических образцов по п.9, в котором материал матрицы содержит, по меньшей мере, один материал, выбранный из группы, состоящей из гидроксиэктоина, полистерена или трегалозы.

23. Набор, содержащий

(I) устройство для хранения биологических образцов для одного или множества биологических образцов, содержащее:

(a) крышку;

(b) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которые выполнены с возможностью содержания биологического образца, причем одна или несколько из указанных лунок содержат материал матрицы; и

(c) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции; и

(II) один или несколько дополнительных реагентов.

24. Набор по п.23, в котором материал матрицы растворяется или диссоциирует в растворителе.

25. Способ хранения одного или множества биологических образцов, содержащий приведение в контакт одного или множества биологических образцов с устройством для хранения биологических образцов, причем указанное устройство для хранения биологических образцов содержит (i) крышку, (ii) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которая выполнена с возможностью содержания биологического образца, причем одна или несколько из указанных лунок содержат материал матрицы, и (iii) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции, и хранения, тем самым, указанных биологических образцов.

26. Способ по п.25, содержащий поддержание устройства для хранения биологических образцов без охлаждения после этапа приведения в контакт.

27. Способ хранения одного или множества биологических образцов, содержащий:

(а) приведение в контакт одного или множества биологических образцов с устройством для хранения биологических образцов, причем указанное устройство для хранения биологических образцов содержит (i) крышку, (ii) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которая выполнена с возможностью содержания биологического образца, причем одна или несколько из указанных лунок содержат материал матрицы, который растворяется или диссоциирует в растворителе, и (iii) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции; и

(b) сушку одной или нескольких лунок для образцов, и хранения, тем самым, указанных биологических образцов.

28. Способ по п.27, содержащий поддержание устройства для хранения биологического образца без охлаждения, следующее за этапами приведения в контакт и сушки.

29. Способ по п.28, в котором биологическая активность образца после этапа поддержания остается по существу такой же, что и до этапа приведения в контакт.

30. Способ по п.28, в котором деградация биологического образца уменьшается относительно деградации контрольного биологического образца, содержащегося без охлаждения в отсутствии материала матрицы.

31. Способ по п.27, в котором этап приведения в контакт содержит одновременное растворение или диссоциацию материала матрицы в растворителе.

32. Способ по п.27, в котором растворение или диссоциация материала матрицы в растворителе предшествуют этапу приведения в контакт.

33. Способ по п.27, в котором растворение или диссоциация материала матрицы в растворителе следуют за этапом приведения в контакт.

34. Способ подготовки устройства для хранения образцов для одного или множества биологических образцов, содержащий:

(a) введение материала матрицы, который растворяется или диссоциирует в растворителе, в одну или множество лунок для образцов устройства для хранения биологических образцов, причем указанное устройство для хранения биологических образцов содержит (i) крышку, (ii) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которые выполнены с возможностью содержания биологического образца, и (iii) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции; и

(b) сушку одной или нескольких лунок для образцов, и подготовки, тем самым, устройства для хранения биологических образцов.

35. Способ по п.34, в котором этап введения содержит введение жидкого раствора или жидкой суспензии, которая содержит материал матрицы и растворитель.

36. Способ по п.34, в котором, по меньшей мере, одна лунка содержит, по меньшей мере, один детектируемый индикатор.

37. Способ по п.34, в котором, по меньшей мере, одна лунка содержит, по меньшей мере, один ингибитор, который представляет собой биологический ингибитор или биохимический ингибитор.

38. Способ восстановления сохраненного биологического образца, содержащий:

(a) приведение в контакт, одновременное или последовательное и в каком-либо ином порядке, в устройстве для хранения биологических образцов одного или множества биологических образцов с материалом матрицы, причем указанное устройство для хранения биологических образцов содержит (i) крышку, (ii) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которые выполнены с возможностью содержания биологического образца, причем одна или множество указанных лунок содержат материал матрицы, и при этом материал матрицы растворяется или диссоциирует в первом растворителе, и (iii) по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции;

(b) сушку одной или нескольких лунок;

(с) поддержание устройства для хранения биологических образцов без охлаждения, которое следует за этапами приведения в контакт и сушки; и

(d) ресуспендирование или повторное растворение биологического образца во втором растворителе, и на основании этого восстановление сохраненного биологического образца.

39. Способ по п.38, в котором биологическая активность образца после этапа содержания по существу представляет собой такую же биологическую активность образца, что и до этапа приведения в контакт.

40. Способ по п.38, в котором второй растворитель выбирают из (i) растворителя, который является тем же самым, что и первый растворитель, и (ii) растворителя, который отличается от первого растворителя.

41. Способ по п.38, в котором, по меньшей мере, один из первого и второго растворителей представляет собой буфер активности.

42. Система обработки данных, относящихся к хранению, организации, отслеживанию, восстановлению и анализу биологических образцов, причем указанная система содержит:

устройство для биологических образцов;

реализованную на базе компьютера систему для приема и передачи данных, относящихся к устройству для образцов; и

радиочастотный интерфейс между устройством для образцов и реализованной на базе компьютера системой для обеспечения связи между реализованной на базе компьютера системой и устройством для образцов.

43. Система по п.42, в которой реализованная на базе компьютера система содержит связанную с устройством для образцов структуру данных для поддержания данных, относящихся к хранению, организации, отслеживанию, восстановлению и анализу биологических образцов.

44. Система по п.42, в которой радиочастотный интерфейс содержит радиочастотное устройство запроса, соединенное с реализованной на базе компьютера системой, и, по меньшей мере, одно ассоциированное с устройством для образцов устройство ретрансляции для радиочастотной связи с устройством запроса.

45. Способ обработки данных, относящихся к хранению, организации, отслеживанию, восстановлению и анализу биологических образцов, причем способ содержит: предоставление устройства для хранения одного или нескольких биологических образцов; предоставление реализованной на базе компьютера системы для приема, хранения и передачи данных, относящихся к устройству для образцов или биологическим образцам или и к тому и к другому; предоставление радиочастотного интерфейса для обмена данными между устройством для образцов и реализованной на базе компьютера системой.

46. Способ по п.45, содержащий генерацию управляющих сигналов в реализованной на базе компьютера системе, которые заставляют радиочастотный интерфейс извлекать данные из устройства для образцов.

47. Способ по п.45, содержащий генерацию управляющих сигналов реализованной на базе компьютера системой для передачи данных в устройство для образцов через радиочастотный интерфейс.

48. Система обработки данных, относящихся к хранению, организации, отслеживанию, восстановлению и анализу биологических образцов, причем система содержит: устройство для хранения биологических образцов, причем указанное устройство для хранения образцов содержит крышку; планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которые выполнены с возможностью содержания биологического образца; и, по меньшей мере, одно радиочастотное устройство ретрансляции; реализованную на базе компьютера систему для приема и передачи данных, относящихся к устройству для хранения образцов; и радиочастотный интерфейс между устройством для образцов и реализованной на базе компьютера системой для обеспечения связи между реализованной на базе компьютера системой и устройством для образцов.

49. Система по п.48, в которой реализованная на базе компьютера система содержит 3-уровневую архитектуру, содержащую веб-браузер, программу веб-сервера, сервер базы данных и приложение со стороны клиента, которое управляет работой радиочастотного интерфейса.

50. Система по п.49, дополнительно содержащая USB-интерфейс между веб-браузером и устройством считывания RFID меток.

51. Система по п.48, в которой реализованная на базе компьютера система содержит 2-уровневую архитектуру, имеющую макропрограмму Excel со стороны клиента и сервер базы данных.

52. Система по п.48, в которой реализованная на базе компьютера система содержит 2-уровневую архитектуру, имеющую независимое клиентское приложение и сервер базы данных для обмена данными с клиентским приложением.

53. Система по п.52, в которой клиентское приложение представляет собой скомпилированное приложение.

54. Устройство для хранения биологических образцов для одного или множества биологических образцов, содержащее:

(a) крышку;

(b) планшету для образцов, содержащую одну или множество лунок для образцов, которые выполнены с возможностью содержания биологического образца; и

(c) по меньшей мере, одно устройство ретрансляции.

55. Устройство для хранения биологических образцов по п.54, которое содержит запорное средство для запирания крышки на планшете для образцов.

56. Устройство для хранения биологических образцов по п.55, в котором запорное средство содержит магнитный запорный элемент.

57. Устройство для хранения биологических образцов по п.54, которое содержит герметичную прокладку запорного элемента.

58. Устройство для хранения биологических образцов по п.54, содержащее герметичную прокладку запорного элемента вокруг каждой лунки.

59. Устройство для хранения биологических образцов по п.54, содержащее магнитный запорный элемент и герметичную прокладку запорного элемента вокруг каждой лунки.