Пептиды, связывающие cd44 - RU2016126425A
Код документа: RU2016126425A
Формула
1. Белок, связывающийся с полипептидом, кодируемым экзоном 9 CD44 человека (CD44ex9), где указанный белок содержит следующие последовательности или состоит из них:
(1) аминокислотная последовательность в соответствии с SEQ ID No. 1-5 и SEQ ID No. 39-52; или
(2) аминокислотная последовательность, обладающая по меньшей мере 90% идентичности с аминокислотной последовательностью, приведенной в SEQ ID No. 1-5 и SEQ ID No. 39-52; или
(3) аминокислотная последовательность, обладающая 100% идентичности с CD44-связывающим мотивом, определенным последовательностью: «PYYGKXLX3YLQPSFAVQVX2SXQX10-14AIE», как показано в SEQ ID No. 6-10, или определенным последовательностью: «PGLQPSFAVQVX2S/AXQX10-14AIE», как показано в SEQ ID No. 53-62, где X обозначает произвольную аминокислоту; и
где указанный белок имеет длину 100 аминокислот или менее.
2. CD44ex9-связывающий белок по п. 1, который связывается с изоформой CD44, содержащей домен, кодируемый экзоном 9.
3. CD44ex9-связывающий белок по п. 2, где изоформа CD44 выбрана из перечня, состоящего из:
а) CD44 v5,
б) CD44 v5-v6,
в) CD44 v3-v6,
г) CD44 v3-v6,
д) CD44 v2-v10,
е) CD44 v3-v10,
ж) CD44 v4-v7,
з) CD44 v4-v10.
4. CD44ex9-связывающий белок по п. 1, конъюгированный или слитый с гетерологичным белком или полипептидом, который предпочтительно представляет собой фермент, катализирующий образование цитотоксического
или цитостатического агента из молекулы-предшественника или присоединение метки к белку.
5. Конъюгат, содержащий
а) CD44ex9-связывающий белок по любому из п.п. 1-4;
б) соединение, выбранное из группы, состоящей из углевода, молекулы красителя, радиоактивного изотопа, токсина, цитостатического агента, цитокина, иммуномодуляторного агента или их пролекарства,
где указанное соединение связано с CD44ex9-связывающим белком непосредственно или посредством линкерной молекулы.
6. Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая CD44ex9-связывающий белок по любому из п.п. 1-4.
7. Экспрессионный вектор, содержащий нуклеотидную последовательность по п. 6.
8. Клетка-хозяин, содержащая экспрессионный вектор по п. 7.
9. Способ продуцирования CD44ex9-связывающего белка по любому из п.п. 1-4, включающий:
а) трансформацию клетки-хозяина экспрессионной конструкцией, содержащей молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую белок по любому из п.п. 1-4; и
б) культивирование клетки-хозяина в условиях, подходящих для продуцирования CD44ex9-связывающего белка или соответствующего слитого белка.
10. Наночастица, конъюгированная с CD44ex9-связывающим белком по любому из п.п. 1-3.
11. Наночастица, конъюгированная с конъюгатом или слитым белком по п. 4 или п. 5.
12. Наночастица по п. 10 или п. 11, дополнительно конъюгированная с по меньшей мере одним веществом, связывающим опухолевые антигены, и/или цитотоксическим агентом.
13. Наночастица по п. 12, где указанное вещество, связывающее опухолевые антигены, выбрано из перечня, состоящего из антитела к СЕА (карциноэмбриональный антиген), антитела к СА-19-9 (углеводный антиген 19-9), адгезина, который предпочтительно модифицирован, и их комбинаций.
14. Наночастица по п. 10 или п. 11, которая выбрана из группы, состоящей из квантовых точек, кластеров благородных металлов, суперпарамагнитных наночастиц оксида железа (IONP), блок-сополимерных мицелл, наноклеток, дендримеров, нанотрубок, полимерсом, наночастиц XPclad®, наночастиц, состоящих из аморфного диоксида кремния, окруженного кристаллическим люминесцентным слоем фосфата кальция, наночастиц SiO2/Zn2SiO4:Mn2+ и SiO2/Ca10(PO4)6OH:Eu3+, состоящих из ядра и оболочки, диаметром менее 100 нм, и гибридных наночастиц, меченных люминесцентным красителем.
15. Наночастица по п. 10 или п. 11, которая имеет неорганическое ядро и слой покрытия, содержащий имидазольный компонент, при этом наименьший диаметр неорганического ядра, включая слой покрытия, составляет не более 15 нм.
16. Наночастица по п. 15, где имидазольный компонент представляет собой пептид, содержащий по меньшей мере один гистидильный остаток, и предпочтительно дипептид.
17. Наночастица по п. 16, где имидазольный компонент представляет собой смесь различных гистидилсодержащих дипептидов.
18. Наночастица по п. 10 или п. 11, которая не является инертной.
19. CD44ex9-связывающий белок по любому из п.п. 1-4 или наночастица по п. 10 или п. 11 для применения в диагностике или лечении заболевания, выбранного из группы, состоящей из аутоиммунных заболеваний, таких как инсулинозависимый диабет, рассеянный склероз, синдром Шегрена или системная красная волчанка (SLE); кожных заболеваний, таких как псориаз или атопический дерматит; хронических воспалительных заболеваний, таких как ревматоидный артрит или воспалительное заболевание кишечника; повреждения ткани; аллергических заболеваний и ракового заболевания.
20. CD44ex9-связывающий белок или наночастица по п. 19 для применения для получения контрастного агента.
21. CD44ex9-связывающий белок или наночастица по п. 20, где контрастный агент применяют для идентификации раковых клеток или клеток карциномы in situ.
22. CD44ex9-связывающий белок или наночастица по п. 21, где
идентифицируемые раковые клетки выбраны из перечня, состоящего из:
а) клеток аденокарциномы;
б) клеток эпителиальной опухоли тимуса;
в) клеток карциномы шейки матки;
г) клеток неходжкинской лимфомы;
д) клеток карциномы легкого;
е) клеток карциномы поджелудочной железы; и
ж) раковых стволовых клеток.
23. Фармацевтическая композиция, содержащая CD44ex9-связывающий белок по любому из п.п. 1-4 или наночастицу по любому из п.п. 10-18 и фармацевтически приемлемый эксципиент.
24. Комбинированная упаковка лекарственного средства и средства для измерения дозы, содержащая:
а) лекарственное средство для индивидуального дозирования и
б) диагностическую индикаторную систему для специфичного для пациента свойства, значимого для действия, побочного эффекта, взаимодействия, метаболизма, всасывания, распределения, метаболизма и удаления лекарственного средства для введения пациенту,
где специфичное для пациента свойство выбрано из группы, состоящей из эндогенного вещества, механизма регуляции, гена или индикаторной системы, и
где лекарственное средство или диагностическая индикаторная система содержит CD44ex9-связывающий белок по любому из п.п. 1-4 или наночастицу по любому из п.п. 10-18.
