Пробирка для ударной обработки шариками и способ экстракции дезорибонуклеиновой кислоты и/или рибонуклеиновой кислоты из микроорганизмов - RU2019126453A
Код документа: RU2019126453A
Формула
1. Способ лизиса клеток, которые содержатся в крови, включающий встряхивание крови или образца, полученного из нее путем обработки, экстракции или фракционирования, в системе для ударной обработки шариками, которая включает (I) пробирку для образца или пробирку для сбора крови и (II) шарики, в отсутствии буфера для лизиса.
2. Способ по п. 1, в котором шарики приспособлены для лизиса бактерий, дрожжей, нитчатых грибов, спор, клеток растений или клеток животных.
3. Способ по п. 1 или 2, в котором шарики включают минеральные шарики, керамические шарики, стеклянные шарики, металлические шарики или их комбинацию.
4. Способ по п. 1 или 2, в котором шарики включают шарики из циркония, шарики из силиката циркония, шарики из диоксида циркония, шарики из кварца, шарики из оксида алюминия, шарики из карбида кремния, керамические шарики, стеклянные шарики из диоксида кремния, шарики из нержавеющей стали, шарики из хромистой стали или их комбинацию.
5. Способ по одному из пп. 1-4, в котором шарики имеют диаметр в пределах от 50 мкм до 3 мм.
6. Способ по одному из пп. 1-5, дополнительно включающий стадию, на которой собирают кровь в пробирку для сбора крови.
7. Способ по одному из пп. 1-6, который включает внесение крови или образца, полученного из нее путем обработки, экстракции или фракционирования, в пробирку для образца перед осуществлением встряхивания.
8. Способ по одному из пп. 1-7, в котором встряхивание включает приведение системы для ударной обработки шариками в колебательное движение.
9. Способ по одному из пп. 1-8, в котором кровь содержит антикоагулянт.
10. Способ по п. 9, в котором антикоагулянт представляет собой ЭДТК.
11. Способ по п. 9, в котором антикоагулянт представляет собой цитрат (например, цитрат натрия).
12. Способ по п. 9, в котором антикоагулянт представляет собой оксалат (например, оксалат калия).
13. Способ по п. 9, в котором антикоагулянт представляет собой гепарин.
14. Способ по одному из пп. 1-13, в котором кровь встряхивают.
15. Способ по одному из пп. 1-13, в котором образец, полученный из крови путем обработки, экстракции или фракционирования, встряхивают.
16. Способ по одному из пп. 1-15, в котором система для ударной обработки шариками включает пробирку для образца и шарики.
17. Способ по одному из пп. 1-15, в котором система для ударной обработки шариками включает пробирку для сбора крови и шарики.
18. Способ по одному из пп. 1-17, в котором клетки содержат один или несколько патогенов.
19. Способ по одному из пп. 1-18, в котором кровь содержит клетки из нескольких видов.
20. Способ по одному из пп. 1-19, дополнительно включающий извлечение лизата из пробирки для образца после лизиса клеток.
21. Способ по п. 20, дополнительно включающий очистку нуклеиновых кислот из лизата.
22. Способ по п. 21, дополнительно включающий проведение анализа нуклеиновых кислот, в котором необязательно:
(а) анализ осуществляют с использованием микромассива или путем секвенирования одной или нескольких нуклеиновых кислот;
(б) перед осуществлением анализа амплифицируют последовательность-мишень, необязательно с помощью ПЦР.
23. Способ по п. 21 или 22, в котором нуклеиновые кислоты включают ДНК и/или РНК.
24. Набор для лизиса клеток, которые присутствуют в образце крови, включающий пробирку для сбора крови и шарики, пригодные для ударной обработки шариками.
25. Набор по п. 24, в котором пробирка для сбора крови содержит антикоагулянт.
26. Набор по п. 25, в котором антикоагулянт представляет собой ЭДТК.
27. Набор по п. 25, в котором антикоагулянт представляет собой цитрат.
28. Набор по п. 25, в котором антикоагулянт представляет собой оксалат.
29. Набор по п. 25, в котором антикоагулянт представляет собой гепарин.
30. Набор по одному из пп. 24-29, в котором шарики упакованы отдельно от пробирки для сбора крови.
31. Способ лизиса клеток, которые содержатся в крови, включающий объединение крови с шариками и пробиркой для сбора крови, входящими в набор по п. 30, и встряхивание пробирки до тех пор, пока не будет осуществлен лизис клеток, содержащихся в крови.
32. Набор по одному из пп. 24-29, в котором шарики находятся в пробирке для сбора крови.
33. Способ лизиса клеток, которые содержатся в крови, включающий объединение крови с шариками и пробиркой для сбора крови, входящими в набор по п. 32, и встряхивание пробирки до тех пор, пока не будет осуществлен лизис клеток, содержащихся в крови.
