Композиции антител к вич и способы их применения - RU2018115246A
Код документа: RU2018115246A
Формула
1. Антитело к ВИЧ, связывающееся или способное связываться с эпитопом N-гликана ВИЧ с аффинностью 1 нМ или менее.
2. Антитело по п. 1, причем антитело нейтрализует или способно нейтрализовать ВИЧ.
3. Антитело по п. 1 или 2, причем антитело ингибирует инфекционность двух или более штаммов или подтипов ВИЧ.
4. Антитело по любому из пп. 1-3, причем ВИЧ представляет собой ВИЧ-1.
5. Антитело по любому из пп. 1-4, причем ВИЧ представляет собой ВИЧ-1 группы М.
6. Антитело по любому из пп. 1-5, полученное с использованием гликоинженерии для модификации олигосахаридов в Fc-области и причем антитело характеризуется повышенной эффекторной функцией ADCC по сравнению с негликоинженерным антителом.
7. Антитело по любому из пп. 1-6, причем антитело представляет собой моноклональное антитело.
8. Антитело по любому из пп. 1-7, причем антитело представляет собой человеческое антитело, гуманизированное антитело или химерное антитело.
9. Антитело по п. 8, причем антитело представляет собой полноразмерное антитело класса IgG.
10. Антитело по любому из пп. 1-5, причем антитело представляет собой фрагмент антитела.
11. Антитело по п. 10, причем антитело представляет собой одноцепочечный вариабельный фрагмент (scFv).
12. Антитело по любому из пп. 1-11, причем антитело содержит
(a) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 19, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 20, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 21, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 22;
(b) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 23, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 24, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 25, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28;
(c) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 29, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 30, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 31, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 32, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 33, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 34;
(d) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 35, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 36, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 37, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 38, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 39, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40;
(e) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 54, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 55, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 56, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 58;
(f) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 26, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 27, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 28;
(g) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 63, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 64, CDR-L1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 66, CDR-L2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 67, и CDR-L3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 68;
(h) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 41, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 42, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 43, и последовательность VL, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 10; или
(i) CDR-H1, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 17, CDR-H2, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 18, CDR-H3, содержащую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 16, и последовательность VL, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 12.
13. Антитело по любому из пп. 1-11, содержащее
(a) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1, и последовательность VL, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 2;
(b) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 3, и последовательность VL, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 4;
(c) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 5, и последовательность VL, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 6;
(d) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 7, и последовательность VL, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 8;
(e) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 9, и последовательность VL, характеризующуюся аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 10;
(f) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 11, и последовательность VL, характеризующуюся аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 12; или
(g) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 13, и последовательность VL, характеризующуюся аминокислотной последовательностью SEQ ID NO: 14.
14. Антитело по любому из пп. 1-11, содержащее
(a) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 15, или
(b) последовательность VH, как в (а), и последовательность VL, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 и 65.
15. Антитело по любому из пп. 1-11, содержащее
(a) последовательность VH, характеризующуюся идентичностью последовательности, составляющей по меньшей мере 95% по отношению к аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 16, или
(b) последовательность VH, как в (а), и последовательность VL, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 и 65.
16. Антитело по любому из пп. 1-15, причем антитело не содержит
(a) CDR-H1 таблицы 4, CDR-H2 таблицы 4, CDR-H3 таблицы 4 или любую их комбинацию;
(b) CDR-L1 таблицы 5, CDR-L2 таблицы 5, CDR-L3 таблицы 5 или любую их комбинацию;
(c) последовательность VH таблицы 4, последовательность VL таблицы 5 или обе; или
(d) любую комбинацию (а), (b) или (с).
17. Выделенная нуклеиновая кислота, кодирующая антитело по любому из пп. 1-16.
18. Вектор, содержащий нуклеиновую кислоту по п. 17.
19. Клетка-хозяин, содержащая вектор по п. 18.
20. Иммуноконъюгат, содержащий антитело по любому из пп. 1-16 и терапевтическое средство.
21. Фармацевтическая композиция, содержащая антитело по любому из пп. 1-16 и фармацевтически приемлемый носитель.
22. Антитело по любому из пп. 1-16 или иммуноконъюгат по п. 20 для применения в качестве лекарственного средства.
23. Применение антитела по любому из пп. 1-16 или иммуноконъюгата по п. 20 для лечения ВИЧ-инфекции или СПИДа.
24. Применение антитела по любому из пп. 1-16 или иммуноконъюгата по п. 20 в изготовлении лекарственного средства.
25. Применение по п. 24, в котором лекарственное средство предназначено для лечения ВИЧ-инфекции или СПИДа.
26. Применение по п. 24 или 25, в котором лекарственное средство предназначено для нейтрализации ВИЧ.
27. Применение по любому из пп. 24-26, в котором антитело ингибирует инфекционность двух или более штаммов или подтипов ВИЧ.
28. Применение по любому из пп. 24-27, в котором ВИЧ представляет собой ВИЧ-1.
29. Применение по любому из пп. 24-28, в котором ВИЧ представляет собой ВИЧ-1 группы М.
30. Способ лечения индивидуума, характеризующегося наличием ВИЧ-инфекции или СПИДа, включающий введение индивидууму эффективного количества антитела по любому из пп. 1-16 или иммуноконъюгата по п. 20.
31. Способ по п. 30, дополнительно включающий введение терапевтического средства.
32. Способ по п. 30, в котором терапевтическое средство представляет собой противовирусное средство.
33. Иммуногистохимический анализ ВИЧ, включающий
(a) контактирование образца с антителом по любому из пп. 1-16 в условиях, допускающих образование комплекса антитело-ВИЧ между антителом и ВИЧ, присутствующим в образце, и
(b) обнаружение наличия или отсутствия комплекса методом иммунообнаружения.
34. Анализ по п. 33, в котором образец представляет собой образец крови или образец ткани.
35. Способ получения антитела к ВИЧ или его фрагмента, включающий
(a) культивирование клетки по п. 19 в среде в условиях, допускающих экспрессию полипептида, кодируемого вектором, и сборку антитела или его фрагмента, и
(b) очистку антитела или фрагмента из культивируемой клетки или среды клетки.
36. Набор, содержащий
фармацевтически приемлемую единицу дозирования фармацевтически эффективного количества по меньшей мере одного выделенного антитела к ВИЧ по любому из пп. 1-16.
37. Набор по п. 36, дополнительно содержащий фармацевтически приемлемую единицу дозирования фармацевтически эффективного количества средства против ВИЧ.
38. Набор по п. 36, в котором средство против ВИЧ представляет собой средство, выбранное из группы, состоящей из ненуклеозидного ингибитора обратной транскриптазы, ингибитора протеазы, ингибитора введения или слияния и ингибитора интегразы.
39. Набор для диагностики, прогнозирования или мониторинга лечения ВИЧ-инфекции или СПИДа у субъекта, содержащий по меньшей мере одно выделенное антитело к ВИЧ по любому из пп. 1-16 и один или несколько реагентов обнаружения, которые специфически связываются с антителами к ВИЧ.
40. Набор по п. 39, дополнительно содержащий реагенты для проведения ПЦР.
41. Набор по п. 39, дополнительно содержащий реагенты для проведения масс-спектрометрии.
42. Слитый белок или конъюгат, содержащий антитело по любому из пп. 1-16.
43. Слитый белок или конъюгат по п. 42, который представляет собой или содержит химерный рецептор, который необязательно представляет собой химерный антигенный рецептор (CAR).
44. Химерный антигенный рецептор (CAR), содержащий антитело по любому из пп. 1-16.
45. Химерный антигенный рецептор по п. 44, причем CAR дополнительно содержит внутриклеточный сигнальный домен, содержащий мотив IT AM.
46. Химерный антигенный рецептор по п. 44 или 45, причем CAR дополнительно содержит внутриклеточный сигнальный домен из CD3 ζ.
47. Химерный антигенный рецептор по любому из пп. 44-46, причем CAR дополнительно содержит внутриклеточный сигнальный домен из костимулирующей молекулы, выбранной из группы, состоящей из CD28, CD137, ICOS и ОХ40.
