Формула
1. Пептид, который связывается с молекулой(ами) главного комплекса гистосовместимости (MHC), выбранный из группы:
(а) пептид, состоящий из аминокислотной последовательности в соответствии с любой из SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 29 или SEQ ID NO: 31 по SEQ ID NO: 162, необязательно удлиненной на 1 аминокислоту на его N- и/или C-концевом участке;
(б) пептид в соответствии с (а), где указанный пептид включает непептидные связи.
2. Пептид по п. 1, где указанный пептид имеет способность связываться с молекулой MHC I класса, и где указанный пептид, когда он связан с указанной молекулой MHC, в состоянии распознаваться Т-клетками CD8.
3. Пептид по п.1 или 2, где указанный пептид состоит или состоит по существу из аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 29 или SEQ ID NO: 31 по SEQ ID NO: 162.
4. Пептид по любому из пп. 1–3 для применения в медицине.
5. Слитый белок, который связывается с молекулой(ами) MHC, включающий пептид по п. 1 (а), слитый с N-терминальными аминокислотами антиген-ассоциированной инвариантной цепи (Ii) HLA-DR.
6. Применение пептида по п. 1 (а) для получения антитела, растворимого или связанного с мембраной, которое специфически связывает пептид по любому из пп. 1–4, когда он связан с молекулой MHC.
7. Нуклеиновая кислота, кодирующая пептид по любому из пп. 1–4.
8. Нуклеиновая кислота по п. 7 для применения в медицине.
9. Вектор экспрессии, экспрессирующий нуклеиновую кислоту по п. 7.
10. Вектор экспрессии по п. 9 для применения в медицине.
11. Рекомбинантная клетка-хозяин, экспрессирующая пептид по любому из пп. 1–4, или включающая нуклеиновую кислоту по п. 7 для экспрессии пептида по любому из пп. 1–4, или включающая вектор экспрессии по п. 9 для экспрессии пептида по любому из пп. 1–4, где указанная клетка-хозяин предпочтительно является антигенпрезентирующей клеткой, такой как дендритная клетка.
12. Клетка-хозяин по п. 11 для применения в медицине.
13. Способ получения пептида по любому из пп. 1–4, включающий культивацию клетки-хозяина по п. 11, которая презентирует пептид по любому из пп. 1–4 или экспрессирует нуклеиновую кислоту по п. 7 или вмещает вектор экспрессии по п. 9, и выделение пептида из клетки-хозяина или его культуральной среды.
14. Способ получения активированных T-лимфоцитов in vitro, включающий контактирование Т-клеток in vitro с нагруженными антигеном молекулами MHC человека I или II класса, экспрессированными на поверхности подходящей антигенпрезентирующей клетки или искусственной конструкции, имитирующей антигенпрезентирующую клетку, в течение периода времени, достаточного для активации указанных Т-клеток антиген-специфическим образом, где указанный антиген является пептидом по любому из пп. 1–4.
15. Применение пептида по любому из пп. 1–4, нуклеиновой кислоты по п. 7, вектора экспрессии по п. 9, или клетки по п. 11 для лечения рака.
16. Применение по п. 15, где указанный рак выбран из следующей группы: рак легких, рак головного мозга, рак молочной железы, колоректальный рак, рак пищевода, рак почки, рак печени, рак яичника, рак поджелудочной железы, рак предстательной железы, рак желудка, меланома, карцинома клеток Меркеля, лейкоз (ОМЛ, ХЛЛ) и другие опухоли, которые демонстрируют избыточную экспрессию белка, из которого образован пептид с SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 29 или SEQ ID NO: 31 по SEQ ID NO: 162.
17. Набор для лечения рака, включающий:
(а) контейнер, содержащий пептид(ы) по любому из пп. 1–4, нуклеиновую(ые) кислоту(ы) по п. 7, вектор(ы) экспрессии по п. 9 или клетку(и) по п. 11, в виде раствора или в лиофилизированной форме;
(б) второй контейнер, содержащий разбавитель или восстанавливающий раствор для лиофилизированного состава;
(в) необязательно – по меньшей мере еще один пептид, выбранный из группы, состоящей из SEQ ID NО: 1 по 162, и
(г) необязательно – инструкции по (i) применению раствора или (ii) восстановлению и/или по применению лиофилизированного состава.
18. Набор по п. 17, дополнительно включающий один или более из (iii) буфера, (iv) разбавителя, (v) фильтра, (vi) иглы или (v) шприца.
19. Набор по п. 17 или 18, где указанный пептид состоит из SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 29 или SEQ ID NO: 31 по SEQ ID NO: 162.
20. Фармацевтическая композиция для лечения рака, включающая по меньшей мере один активный ингредиент, выбранный из группы, состоящей из:
а) пептида, состоящего из SEQ ID NO: 1 по SEQ ID NO: 29 или SEQ ID NO: 31 по SEQ ID NO: 162;
б) слитого белка, включающего пептид в соответствии с a) и 1–80 N-терминальных аминокислот антиген-ассоциированной инвариантной цепи HLA-DR (Ii);
в) нуклеиновой кислоты, кодирующей любой из ингредиентов a) или б), или вектора экспрессии, включающего указанную нуклеиновую кислоту,
г) клетки-хозяина, включающей вектор экспрессии в соответствии с в),
д) конъюгированного или меченого пептида или каркаса в соответствии с любым из пунктов а)–г)
и фармацевтически приемлемый носитель и, необязательно, фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества и/или стабилизаторы.