Обработка нуклеотидных последовательностей - RU2015137824A
Код документа: RU2015137824A
Формула
1. Аппарат (100) для обработки нуклеотидных последовательностей, включающий:
- массив электродов (120a, 120b,...); и
- по меньшей мере один наношарик (NB), содержащий повторения представляющей интерес нуклеотидной последовательности (1, 2), причем упомянутый наношарик (NB) прикреплен к электроду, к которому может быть прикреплен не более чем один наношарик (NB) такого размера,
при этом к электродам (120a, 120b,...) массива избирательно приложимы электрические потенциалы для привлечения и/или отталкивания наношариков (NB) и/или других компонентов (X).
2. Способ обработки нуклеотидных последовательностей,
при котором по меньшей мере один наношарик (NB), содержащий повторения представляющей интерес нуклеотидной последовательности (1, 2), прикрепляют к тому электроду массива электродов (120a, 120b,...), к которому может быть прикреплен не более чем один наношарик (NB) такого размера,
при этом к электродам (120a, 120b,...) массива избирательно прикладывают электрические потенциалы для привлечения и/или отталкивания наношариков (NB) и/или других компонентов (X).
3. Аппарат (100) по п. 1 или способ по п. 2, отличающийся тем, что внутренний диаметр (d) наношарика (NB) больше, чем примерно 40% внутреннего диаметра (w) соответствующего электрода (120a, 120b,...).
4. Аппарат (100) по п. 1, отличающийся тем, что он содержит контейнер (110) с реакционной камерой (111), в которой расположен массив электродов (120a, 120b,...), причем упомянутый контейнер имеет вход (112), к которому могут быть избирательно подключены по меньшей мере два различных резервуара (141, 142, 143, 144) с реагентами.
5. Аппарат (100) по п. 4, отличающийся тем, что резервуары (141, 142, 143, 144) с реагентами содержат растворы (A, T, G, C) с различными диэлектрическими характеристиками.
6. Аппарат (100) по п. 1, отличающийся тем, что он содержит схему (130) обработки, которая обеспечивает избирательное приложение электрических потенциалов к электродам (120a, 120b,...).
7. Аппарат (100) по п. 1 или способ по п. 2, отличающийся тем, что электроды (120a, 120b,...) массива подвергаются воздействию множества наношариков (NB), содержащих повторения представляющих интерес нуклеотидных последовательностей (1, 2), причем упомянутые наношарики (NB) имеют такие размеры, что практически только один из них может быть прикреплен к одному электроду в одно и то же время.
8. Аппарат (100) по п. 1 или способ по п. 2, отличающийся тем, что электроды (120a, 120b,...) массива подвергаются воздействию множества наношариков (NB), содержащих повторения представляющих интерес нуклеотидных последовательностей (1, 2), при этом упомянутые электроды могут быть адресованы по отдельности или совокупностями, чтобы специфично привлечь упомянутые наношарики из раствора супернатанта.
9. Аппарат (100) по п. 1 или способ по п. 2, отличающийся тем, что наношарик (NB) получен путем амплификации по типу катящегося кольца.
10. Аппарат (100) по п. 1 или способ по п. 2, отличающийся тем, что измеряется или может быть измерена электрическая емкость электродов (120a, 120b,...).
11. Аппарат (100) или способ по п. 10, отличающийся тем, что по соответствующему изменению электрической емкости на упомянутом электроде обнаруживается или может быть обнаружено связывание наношарика (NB) с электродом (120a, 120b,...).
12. Аппарат (100) или способ по п. 10, отличающийся тем, что по соответствующему изменению электрической емкости на упомянутом электроде обнаруживаются или могут быть обнаружены добавления нуклеотидов и/или олигонуклеотидов к наношарику (NB), прикрепленному к электроду (120a, 120b,...).
13. Аппарат (100) по п. 1 или способ по п. 2, отличающийся тем, что массив электродов (120a, 120b,...) последовательно подвергается воздействию различных растворов (A, T, G, C) моно- или олигонуклеотидов.
14. Применение аппарата (100) по п. 1 для секвенирования нуклеиновых кислот, молекулярной диагностики, анализа биологического образца, анализа химического образца, анализа пищевых продуктов и/или судебно-медицинского анализа.
