Способ конструирования, основанный на определении последовательностей, способ оптимизации одноцепочечных антител - RU2010102064A

Реферат

1. Способ идентификации одного или более аминокислотных остатков для замены в определенном положении в иммунобиндере, который включает: ! a) обеспечение первой базы данных аминокислотных последовательностей VH и/или VL, сгруппированных в соответствии с подтипом; ! b) обеспечение второй базы данных аминокислотных последовательностей VH и/или VL, сгруппированных в соответствии с подтипом и выбранных, как имеющие, по меньшей мере, одно желаемое функциональное свойство; ! c) определение частоты встречаемости аминокислот для аминокислотного остатка в каркасном положении первой базы данных и в соответствующем каркасном положении второй базы данных; ! d) идентификация аминокислотного остатка (i) как предпочтительного аминокислотного остатка для замены в соответствующем аминокислотном положении иммунобиндера, если аминокислота имеет фактор обогащения более 1, или (ii) как аминокислотного остатка, который должен быть исключен из соответствующего аминокислотного положения иммунобиндера, если аминокислотный остаток имел фактор обогащения менее 1. ! 2. Способ по п.1, в котором аминокислотный остаток стадии d) имеет фактор обогащения от 4 до 6. ! 3. Способ по любому из вышеуказанных пунктов, в котором первая базы данных включает эмбриональные аминокислотные последовательности VH, VL или VH и VL. ! 4. Способ по п.1, в котором первая база данных состоит из эмбриональных аминокислотных последовательностей VH, VL или VH и VL. ! 5. Способ по п.1, в котором первая база данных включает зрелые аминокислотные последовательности VH, VL или VH и VL. !6. Способ по п.1, в котором первая база данных состоит из зрелых аминокислотных последовательностей VH, VL или VH и V