Способы нахождения лигандов - RU2004119036A

Реферат

1. Конъюгат мишень-соединение, выбранный из

где

R и R' каждый независимо означает незамещенную (С₁-С₂₀)алифатическую группу, замещенную (С₁-С₂₀)алифатическую группу, незамещенный арил или замещенный арил;

m означает 0, 1 или 2; и

n означает 1 или 2.

2. Конъюгат мишень-соединение по п.1, где мишенью является полипептид.

3. Конъюгат мишень-соединение по п.2, где ковалентная связь между группой -S-S-и мишенью

4. Конъюгат мишень-соединение по п.2, где ковалентная связь между группой -S-S-и мишенью

5. Конъюгат мишень-соединение по п.2, где мишень выбирается из группы, состоящей из ферментов, рецепторов, факторов транскрипции, лигандов

рецепторов, факторов роста, цитокинов, иммуноглобулинов, ядерных белков, компонентов трансдукции сигнала и аллостерических регуляторных ферментов.

6. Библиотека соединений, где каждый член имеет формулу, выбранную из группы, состоящей из

или замещенный арил;

m означает 0, 1 или 2 и

n означает 1 или 2.

7. Библиотека по п.6, содержащая, как минимум, 5 членов.

8. Библиотека по п.6, содержащая, как минимум, 100 членов.

9. Библиотека по п.6, где каждый член имеет разную массу.

10. Библиотека по п.9, где каждый член имеет массу, которая отличается от массы другого члена библиотеки, как минимум, на 5 атомных единиц массы.

11. Библиотека по п.9, где каждый член имеет массу, которая отличается от массы другого члена библиотеки, как минимум, на 10 атомных единиц массы.

12. Способ, включающий:

а) идентификацию первого соединения формулы R^DSSR¹, которое связывается с белком-мишенью;

б) идентификацию второго соединения формулы R^ESSR¹, которое связывается с белком-мишенью и

в) образование конъюгированного соединения, включающего R^D и R^E, где R^D и R^E каждый независимо означает незамещенную (С₁-С₂₀)алифатическую группу, замещенную (С₁-С₂₀)алифатическую группу, незамещенный арил и замещенный арил; и R¹ означает незамещенную (С₁-С₁₀)алифатическую группу, замещенную (С₁-С₁₀)-алифатическую группу, незамещенный арил.

13. Способ по п.12, где идентификация второго соединения, которое связывается с мишенью, осуществляется в присутствии первого соединения.

14. Способ по п.12, где R^DSSR¹ и R^ESSR¹ каждый независимо выбираются из группы, состоящей из

или замещенный арил;

m означает 0, 1 или 2 и

n означает 1 или 2.

15. Способ, включающий

а) предоставление мишени с анкерной группой, способной образовывать ковалентную связь или образовывать координационную связь с металлом в интересующем сайте или близко к интересующему сайту;

б) связывание мишени с удлинителем с образованием при этом комплекса мишень-удлинитель, где удлинитель включает первую функциональную группу, которая образует либо ковалентную связь, либо координационную связь с металлом, и вторую функциональную группу, способную образовывать ковалентную связь;

в) связывание комплекса мишень-удлинитель с потенциальным лигандом, который включает группу, способную образовывать ковалентную связь с второй функциональной группой;

г) образование ковалентной связи между комплексом мишень-удлинитель и потенциальным лигандом и

д) идентификацию потенциального лиганда, присутствующего в конъюгате мишень-удлинитель-лиганд.

16. Способ по п.15, где анкерная группа выбирается из группы, состоящей из реакционно-способного электрофила, реакционно-способного нуклеофила и сайта координации с металлом.

17. Способ, включающий:

а) предоставление мишени с реакционно-способным нуклеофилом в интересующем сайте или близко к интересующему сайту;

б) связывание мишени с удлинителем с образованием при этом комплекса мишень-удлинитель, где удлинитель включает первую функциональную группу, которая реагирует с нуклеофилом в мишени с образованием ковалентной связи, и вторую функциональную группу, способную образовывать дисульфидную связь;

в) связывание комплекса мишень-удлинитель с потенциальным лигандом, который способен образовывать дисульфидную связь;

г) образование дисульфидной связи между комплексом мишень-удлинитель и потенциальным лигандом с образованием при этом конъюгата мишень-удлинитель-лиганд и

д) идентификацию потенциального лиганда, присутствующего в конъюгате мишень-удлинитель-лиганд.

18. Способ по п.17, где реакционно-способным нуклеофилом на мишени является тиол или замаскированный тиол.

19. Способ по п.17, где удлинитель имеет формулу:

или

где

R означает незамещенную (С₁-С₂₀)алифатическую группу, замещенную (C₁-С₂₀)-алифатическую группу, незамещенный арил и замещенный арил;

R' означает Н, -SR¹, где R¹ означает незамещенную (С₁-С₁₀)алифатическую группу, замещенную (С₁-С₁₀)алифатическую группу, незамещенный арил и замещенный арил;

Х является уходящей группой и прямоугольники в каждой формуле представляют связующую детерминанту.

20. Способ по п.17, где удлинитель представлен формулой:

где R' означает водород, -SR¹, где R¹ означает незамещенную (C₁-С₁₀)алифатическую группу, замещенную (С₁-С₁₀)алифатическую группу, незамещенный арил и замещенный арил, и прямоугольники представляют связующую детерминанту.