Алгоритм разработки необратимо действующих ингибиторов - RU2011108531A

Реферат

1. Способ разработки ингибитора, ковалентно связывающего целевой полипептид, включающий: ! A) представление структурной модели обратимого ингибитора, привязанного к сайту связывания в целевом полипептиде, где обратимый ингибитор образует не-ковалентные контакты с сайтом связывания; ! B) идентификацию Цис-остатка в сайте связывания целевого полипептида, смежного с обратимым ингибитором, когда обратимый ингибитор связан с сайтом связывания; ! C) построение структурных моделей предполагаемых ингибиторов, которые ковалентно связываются с целевым полипептидом, где каждый предполагаемый ингибитор содержит «боеголовку», связанную с замещаемой позицией обратимого ингибитора, «боеголовку», содержащую реакционный химический функционал и, опционально, линкер, который позиционирует реакционный химический функционал в пределах длины связи Цис-остатка в сайте связывания целевого полипептида; ! D) определение замещаемых позиций обратимого ингибитора, что позволяет реакционному химическому функционалу «боеголовки» находиться в пределах длины связи Цис-остатка в сайте связывания целевого полипептида, когда предполагаемый ингибитор связан с сайтом связывания; ! Е) для предполагаемого ингибитора, который содержит «боеголовку», находящуюся в пределах длины связи Цис-остатка в сайте связывания целевого полипептида, когда предполагаемый ингибитор связан с сайтом связывания, формирование ковалентной связи между атомом серы Цис-остатка в сайте связывания и реакционным химическим функционалом «боеголовки», когда предполагаемый ингибитор связан с сайтом связывания, где длина ковалентной связи менее 2Å указывает на